SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_2827 FitnessBrowser__Cola:Echvi_2827 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2xf4A Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium ycbl (see paper)
38% identity, 97% coverage: 2:211/217 of query aligns to 1:208/210 of 2xf4A

query
sites
2xf4A
L
 
M
N
 
N
V
 
Y
Q
 
R
T
 
I
F
 
I
T
 
P
F
 
V
N
 
T
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
E
 
Q
N
 
N
C
 
C
Y
 
S
V
 
L
L
 
I
Y
 
W
-
 
C
D
 
E
D
 
Q
T
 
T
K
 
R
E
 
L
A
 
A
V
 
A
I
 
L
I
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
G
C
 
G
Y
 
D
A
 
A
K
 
-
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
E
 
E
T
 
K
L
 
I
K
 
K
Q
 
Q
F
 
E
L
 
V
Q
 
D
S
 
A
N
 
S
D
 
G
L
 
V
R
 
T
P
 
L
V
 
M
R
 
Q
L
 
I
L
 
L
N
 
L
T
 
T
H
 
H
C
 
G
H
 
H
I
 
L
D
|
D
H
|
H
V
 
V
L
 
G
G
 
A
N
 
A
F
 
S
F
 
E
I
 
L
N
 
A
Q
 
Q
N
 
H
Y
 
Y
G
 
G
L
 
V
P
 
P
L
 
V
E
 
-
I
 
I
H
 
G
P
 
P
K
 
E
-
 
K
-
 
E
D
 
D
E
 
E
P
 
F
V
 
W
L
 
L
M
 
Q
A
 
G
V
 
L
G
 
P
S
 
A
Y
 
Q
A
 
S
S
 
R
N
 
M
Y
 
F
G
 
G
F
 
L
P
 
D
A
 
E
Y
 
C
T
 
Q
P
 
P
C
 
L
K
 
T
A
 
P
E
 
D
K
 
R
Y
 
W
L
 
L
E
 
N
E
 
D
G
 
G
D
 
D
K
 
R
V
 
V
T
 
S
F
 
V
G
 
G
E
 
N
T
 
V
D
 
T
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
H
V
 
C
P
 
P
G
 
G
H
 
H
A
 
T
P
 
P
G
 
G
H
 
H
V
 
V
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
H
 
D
P
 
E
E
 
Q
S
 
S
K
 
Q
T
 
L
C
 
L
I
 
I
G
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
V
L
 
I
F
 
F
Q
 
K
G
 
G
S
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
S
D
 
D
L
 
F
P
 
P
G
 
R
G
 
G
D
 
D
H
 
H
Q
 
T
T
 
Q
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
R
K
 
K
L
 
L
F
 
L
T
 
P
L
 
L
P
 
G
D
 
D
D
 
D
V
 
V
K
 
T
V
 
F
H
 
I
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
A
 
L
T
 
S
L
 
T
I
 
L
G
 
G
H
 
Y
E
 
E
K
 
R
I
 
L
H
 
H
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
L

7ev5A Crystal structure of bleg-1 b3 metallo-beta-lactamase (see paper)
40% identity, 94% coverage: 9:211/217 of query aligns to 7:207/209 of 7ev5A

query
sites
7ev5A
F
 
L
N
 
G
P
 
P
F
 
I
Q
 
Q
E
 
T
N
 
N
C
 
A
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
D
 
N
D
 
D
T
 
D
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
I
I
 
F
D
 
D
P
 
P
G
 
G
C
 
G
Y
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
E
 
D
Q
 
A
E
 
E
T
 
A
L
 
L
K
 
I
Q
 
T
F
 
W
L
 
L
Q
 
K
S
 
R
N
 
E
D
 
Q
L
 
L
R
 
T
P
 
P
V
 
L
R
 
A
L
 
I
L
 
L
N
 
L
T
 
T
H
|
H
C
 
A
H
|
H
I
 
F
D
|
D
H
|
H
V
 
I
L
 
G
G
 
A
N
 
V
F
 
D
F
 
A
I
 
V
N
 
R
Q
 
D
N
 
T
Y
 
F
G
 
S
L
 
I
P
 
P
L
 
V
E
 
Y
I
 
L
H
 
H
P
 
T
K
 
K
D
 
E
E
 
R
P
 
H
V
 
W
L
 
L
M
 
E
-
 
D
-
 
P
A
 
A
V
 
L
G
 
N
S
 
G
Y
 
S
A
 
S
S
 
R
N
 
L
Y
 
T
G
 
G
F
 
R
P
 
P
A
 
I
Y
 
T
T
 
T
P
 
A
C
 
K
K
 
P
A
 
A
E
 
D
K
 
H
Y
 
L
L
 
L
E
 
T
E
 
N
G
 
E
D
 
K
K
 
S
V
 
L
T
 
T
F
 
I
G
 
G
E
 
T
T
 
F
D
 
T
L
 
F
E
 
S
V
 
V
I
 
F
W
 
H
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G
H
 
S
V
 
V
V
 
S
F
 
Y
Y
 
Y
H
 
Y
P
 
Q
E
 
K
S
 
E
K
 
A
T
 
V
C
 
L
I
 
F
G
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
V
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
G
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
 
H
Q
 
T
T
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
A
A
 
S
I
 
I
K
 
H
A
 
N
K
 
K
L
 
I
F
 
L
T
 
P
L
 
L
P
 
P
D
 
E
D
 
R
V
 
T
K
 
I
V
 
V
H
 
A
P
 
S
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
A
 
L
T
 
T
L
 
T
I
 
I
G
 
G
H
 
Q
E
 
E
K
 
M
I
 
D
H
 
H
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
L

2zwrB Crystal structure of ttha1623 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
40% identity, 97% coverage: 2:211/217 of query aligns to 1:200/207 of 2zwrB

query
sites
2zwrB
L
 
M
N
 
R
V
 
V
Q
 
F
T
 
P
F
 
V
T
 
T
F
 
L
N
 
G
P
 
P
F
 
L
Q
 
Q
E
 
E
N
 
N
C
 
A
Y
 
Y
V
 
-
L
 
L
Y
 
V
D
 
E
D
 
T
T
 
G
K
 
E
E
 
G
A
 
P
V
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
C
 
-
Y
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
D
E
 
E
Q
 
P
E
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
L
Q
 
A
F
 
L
L
 
F
Q
 
Q
S
 
T
N
 
T
D
 
G
L
 
L
R
 
I
P
 
P
V
 
L
R
 
A
L
 
I
L
 
L
N
 
L
T
 
T
H
|
H
C
 
A
H
|
H
I
 
F
D
|
D
H
|
H
V
 
V
L
 
G
G
 
A
N
 
V
F
 
A
F
 
P
I
 
L
N
 
V
Q
 
E
N
 
A
Y
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
V
E
 
Y
I
 
L
H
 
H
P
 
P
K
 
L
D
 
D
E
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
Y
M
 
E
A
 
G
V
 
A
G
 
D
S
 
L
Y
 
A
A
 
A
S
 
R
N
 
A
Y
 
W
G
 
G
F
 
L
P
 
A
A
 
I
Y
 
P
T
 
K
P
 
P
C
 
P
K
 
L
A
 
P
E
 
V
K
 
R
Y
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
D
 
M
K
 
R
V
 
L
T
 
-
F
 
F
G
 
G
E
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
F
E
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
H
V
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G
H
 
H
V
 
V
V
 
A
F
 
F
Y
 
Y
H
 
D
P
 
P
E
 
E
S
 
G
K
 
A
T
 
Q
C
 
V
I
 
F
G
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
L
L
 
L
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
Y
D
 
D
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
H
 
P
Q
 
K
T
 
A
L
 
L
L
 
F
D
 
A
A
 
S
I
 
L
K
 
K
A
 
-
K
 
R
L
 
L
F
 
L
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
D
 
E
V
 
T
K
 
R
V
 
V
H
 
H
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
A
 
G
T
 
T
L
 
T
I
 
L
G
 
G
H
 
L
E
 
E
K
 
A
I
 
R
H
 
T
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
L

2zziA Crystal structure of ttha1623 in a di-iron-bound form (see paper)
41% identity, 94% coverage: 8:211/217 of query aligns to 5:198/198 of 2zziA

query
sites
2zziA
T
 
T
F
 
L
N
 
G
P
 
P
F
 
L
Q
 
Q
E
 
E
N
 
N
C
 
A
Y
 
Y
V
 
-
L
 
L
Y
 
V
D
 
E
D
 
T
T
 
G
K
 
E
E
 
G
A
 
P
V
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
C
 
-
Y
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
D
E
 
E
Q
 
P
E
 
E
T
 
K
L
 
L
K
 
L
Q
 
A
F
 
L
L
 
F
Q
 
Q
S
 
T
N
 
T
D
 
G
L
 
L
R
 
I
P
 
P
V
 
L
R
 
A
L
 
I
L
 
L
N
 
L
T
 
T
H
|
H
C
 
A
H
|
H
I
 
F
D
|
D
H
|
H
V
 
V
L
 
G
G
 
A
N
 
V
F
 
A
F
 
P
I
 
L
N
 
V
Q
 
E
N
 
A
Y
 
L
G
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
V
E
 
Y
I
 
L
H
 
H
P
 
P
K
 
L
D
 
D
E
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
Y
M
 
E
A
 
G
V
 
A
G
 
D
S
 
L
Y
 
A
A
 
A
S
 
R
N
 
A
Y
 
W
G
 
G
F
 
L
P
 
A
A
 
I
Y
 
P
T
 
K
P
 
P
C
 
P
K
 
L
A
 
P
E
 
V
K
 
R
Y
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
D
 
M
K
 
R
V
 
L
T
 
-
F
 
F
G
 
G
E
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
F
E
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
H
V
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G
H
 
H
V
 
V
V
 
A
F
 
F
Y
 
Y
H
 
D
P
 
P
E
 
E
S
 
G
K
 
A
T
 
Q
C
 
V
I
 
F
G
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
L
L
 
L
F
 
F
Q
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
Y
D
 
D
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
H
 
P
Q
 
K
T
 
A
L
 
L
L
 
F
D
 
A
A
 
S
I
 
L
K
 
K
A
 
-
K
 
R
L
 
L
F
 
L
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
D
 
E
V
 
T
K
 
R
V
 
V
H
 
H
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
A
 
G
T
 
T
L
 
T
I
 
L
G
 
G
H
 
L
E
 
E
K
 
A
I
 
R
H
 
T
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
L

7l0bA Crystal structure of hydroxyacyl glutathione hydrolase (glob) from staphylococcus aureus, apoenzyme (see paper)
31% identity, 97% coverage: 2:211/217 of query aligns to 2:200/202 of 7l0bA

query
sites
7l0bA
L
 
M
N
 
R
V
 
I
Q
 
S
T
 
S
F
 
L
T
 
T
F
 
L
N
 
G
P
 
L
F
 
V
Q
 
D
E
 
T
N
 
N
C
 
T
Y
 
Y
V
 
F
L
 
I
Y
 
E
D
 
N
D
 
D
T
 
-
K
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
I
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
-
C
 
-
Y
 
-
A
 
S
K
 
G
E
 
E
E
 
S
Q
 
E
E
 
K
T
 
I
L
 
I
K
 
K
Q
 
K
F
 
L
L
 
N
Q
 
Q
S
 
I
N
 
N
D
 
-
L
 
-
R
 
K
P
 
P
V
 
L
R
 
K
-
 
A
L
 
I
L
 
L
N
 
L
T
 
T
H
|
H
C
 
A
H
|
H
I
 
F
D
|
D
H
|
H
V
 
I
L
 
G
G
 
A
N
 
V
F
 
D
F
 
D
I
 
I
N
 
V
Q
 
D
N
 
R
Y
 
F
G
 
D
L
 
V
P
 
P
L
 
V
E
 
Y
I
 
M
H
 
H
P
 
E
K
 
A
D
 
E
E
 
F
P
 
D
V
 
F
L
 
L
M
 
K
A
 
D
V
 
P
G
 
V
S
 
K
Y
 
N
A
 
G
S
 
A
N
 
D
Y
 
-
G
 
K
F
 
L
P
 
P
A
 
I
Y
 
T
T
 
S
P
 
K
C
 
V
K
 
T
A
 
P
E
 
E
K
 
K
Y
 
L
L
 
N
E
 
E
E
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
F
 
-
G
 
G
E
 
S
T
 
T
D
 
E
L
 
I
E
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
K
-
 
F
-
 
N
V
 
V
I
 
L
W
 
H
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G
H
 
S
V
 
L
V
 
T
F
 
Y
Y
 
V
H
 
F
P
 
D
E
 
E
S
 
-
K
 
-
T
 
F
C
 
A
I
 
V
G
 
V
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
Q
 
N
G
 
N
S
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
Y
G
 
K
G
 
G
D
 
D
H
 
Y
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
S
I
 
I
K
 
Q
A
 
D
K
 
K
L
 
I
F
 
F
T
 
E
L
 
L
P
 
E
D
 
G
D
 
D
V
 
L
K
 
P
V
 
L
H
 
F
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
A
 
Y
T
 
T
L
 
T
I
 
V
G
 
D
H
 
D
E
 
E
K
 
Q
I
 
L
H
 
-
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
L

O95571 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial; Ethylmalonic encephalopathy protein 1; Hepatoma subtracted clone one protein; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
31% identity, 89% coverage: 17:209/217 of query aligns to 38:213/254 of O95571

query
sites
O95571
Y
 
Y
V
 
L
L
 
L
Y
 
G
D
 
D
-
 
R
D
 
E
T
 
S
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
-
C
 
-
Y
 
-
A
 
V
K
x
L
E
 
E
E
 
T
Q
 
A
E
 
P
T
 
R
L
 
D
K
 
A
Q
 
Q
F
 
L
L
 
I
Q
 
K
S
 
E
N
 
L
D
 
G
L
 
L
R
 
R
P
 
L
V
 
L
R
 
Y
L
 
A
L
 
V
N
 
N
T
 
T
H
|
H
C
 
C
H
 
H
I
 
A
D
 
D
H
 
H
V
 
I
L
 
T
G
 
G
N
 
S
F
 
-
F
 
-
I
 
-
N
 
-
Q
 
-
N
 
-
Y
 
-
G
 
G
L
 
L
P
 
L
L
 
R
E
 
S
I
 
L
H
 
L
P
 
P
K
 
G
D
 
C
E
 
Q
P
 
S
V
 
V
L
 
I
M
 
S
A
 
R
V
 
L
G
 
S
S
 
G
Y
 
-
A
 
-
S
 
-
N
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
A
K
 
Q
A
 
A
E
 
D
K
 
L
Y
 
H
L
 
I
E
 
E
E
 
D
G
 
G
D
 
D
K
 
S
V
 
I
T
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
R
T
 
F
D
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
T
I
 
R
W
 
A
V
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
T
P
 
P
G
 
G
H
 
C
V
 
V
V
 
T
F
 
F
Y
 
V
H
 
L
P
 
N
E
 
D
S
 
H
K
 
S
T
 
M
C
 
A
I
 
F
G
x
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
I
G
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
|
T
D
 
D
L
 
F
P
 
Q
G
 
Q
G
 
G
D
 
C
H
 
A
Q
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
Y
D
 
H
A
 
S
I
 
V
K
 
H
A
 
E
K
 
K
L
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
G
D
 
D
V
 
C
K
 
L
V
 
I
H
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
x
D
-
 
Y
-
 
H
-
 
G
-
 
F
P
 
T
A
 
V
T
 
S
L
 
T
I
 
V
G
 
E
H
 
E
E
 
E
K
 
R
I
 
T
H
 
L
N
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4chlB Human ethylmalonic encephalopathy protein 1 (hethe1) (see paper)
31% identity, 89% coverage: 17:209/217 of query aligns to 22:197/237 of 4chlB

query
sites
4chlB
Y
 
Y
V
 
L
L
 
L
Y
 
G
D
 
D
-
 
R
D
 
E
T
 
S
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
-
C
 
-
Y
 
-
A
 
V
K
 
L
E
 
E
E
 
T
Q
 
A
E
 
P
T
 
R
L
 
D
K
 
A
Q
 
Q
F
 
L
L
 
I
Q
 
K
S
 
E
N
 
L
D
 
G
L
 
L
R
 
R
P
 
L
V
 
L
R
 
Y
L
 
A
L
 
V
N
 
N
T
 
T
H
|
H
C
 
C
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
|
H
V
 
I
L
 
T
G
 
G
N
 
S
F
 
-
F
 
-
I
 
-
N
 
-
Q
 
-
N
 
-
Y
 
-
G
 
G
L
 
L
P
 
L
L
 
R
E
 
S
I
 
L
H
 
L
P
 
P
K
 
G
D
 
C
E
 
Q
P
 
S
V
 
V
L
 
I
M
 
S
A
 
R
V
 
L
G
 
S
S
 
G
Y
 
-
A
 
-
S
 
-
N
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
A
K
 
Q
A
 
A
E
 
D
K
 
L
Y
 
H
L
 
I
E
 
E
E
 
D
G
 
G
D
 
D
K
 
S
V
 
I
T
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
R
T
 
F
D
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
T
I
 
R
W
 
A
V
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
T
P
 
P
G
 
G
H
 
C
V
 
V
V
 
T
F
 
F
Y
 
V
H
 
L
P
 
N
E
 
D
S
 
H
K
 
S
T
 
M
C
 
A
I
 
F
G
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
I
G
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
F
P
 
Q
G
 
Q
G
 
G
D
 
C
H
 
A
Q
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
Y
D
 
H
A
 
S
I
 
V
K
 
H
A
 
E
K
 
K
L
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
G
D
 
D
V
 
C
K
 
L
V
 
I
H
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
-
 
Y
-
 
H
-
 
G
-
 
F
P
 
T
A
 
V
T
 
S
L
 
T
I
 
V
G
 
E
H
 
E
E
 
E
K
 
R
I
 
T
H
 
L
N
 
N
P
 
P

5ve5A Crystal structure of persulfide dioxygenase rhodanese fusion protein with rhodanese domain inactivating mutation (c314s) from burkholderia phytofirmans in complex with glutathione (see paper)
31% identity, 90% coverage: 17:212/217 of query aligns to 19:197/350 of 5ve5A

query
sites
5ve5A
Y
 
Y
V
 
L
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
D
 
S
T
 
T
-
 
T
K
x
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
-
C
 
-
Y
 
-
A
 
V
K
 
F
E
 
E
E
 
Q
Q
 
V
E
 
R
T
 
R
L
 
D
K
 
A
Q
 
A
F
 
L
L
 
I
Q
 
E
S
 
E
N
 
L
D
 
G
L
 
L
R
 
H
P
 
L
V
 
L
R
 
Y
L
 
T
L
 
I
N
 
D
T
 
T
H
|
H
C
 
V
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
|
H
V
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
A
F
 
W
F
 
M
I
 
L
N
 
N
Q
 
R
N
 
R
Y
 
I
G
 
G
L
 
S
P
 
R
L
 
I
E
 
A
I
 
I
H
 
S
P
 
A
K
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
A
V
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
E
A
 
G
S
 
-
N
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
-
K
 
-
A
 
A
E
 
D
K
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
S
E
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
K
V
 
V
T
 
E
F
 
F
G
 
G
E
 
T
T
 
R
D
 
Y
L
 
L
E
 
T
V
 
V
I
 
R
W
 
A
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
T
P
 
D
G
 
G
H
 
C
V
 
I
V
 
T
F
 
L
Y
 
V
H
 
L
P
 
D
E
 
N
S
 
E
K
 
T
T
 
M
C
 
A
I
 
F
G
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
C
L
 
L
F
 
L
Q
 
I
G
 
R
S
 
G
I
 
T
G
|
G
R
|
R
T
 
T
D
 
D
L
 
F
P
 
Q
G
 
R
G
 
G
D
 
D
H
 
A
Q
 
H
T
 
T
L
 
M
L
 
F
D
 
R
A
 
A
I
 
V
K
 
H
A
 
G
K
 
Q
L
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
T
D
 
A
V
 
C
K
 
L
V
 
L
H
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
-
x
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
L
P
 
T
A
 
V
T
 
T
L
 
S
I
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
K
 
R
I
 
R
H
 
F
N
 
N
P
 
P
F
 
R
V
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9C8L4 Persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
30% identity, 93% coverage: 16:216/217 of query aligns to 66:257/294 of Q9C8L4

query
sites
Q9C8L4
C
 
T
Y
 
Y
V
 
L
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
D
 
V
T
 
S
-
 
H
-
 
P
-
 
D
K
 
K
E
 
P
A
 
A
V
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
-
C
 
-
Y
 
V
A
 
D
K
 
K
E
 
T
E
 
V
Q
 
D
E
 
R
T
 
D
L
 
L
K
 
K
Q
 
-
F
 
L
L
 
I
Q
 
D
S
 
E
N
 
L
D
 
G
L
 
L
R
 
K
P
 
L
V
 
I
R
 
Y
L
 
A
L
 
M
N
 
N
T
 
T
H
|
H
C
 
V
H
 
H
I
 
A
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
T
F
 
G
F
 
L
I
 
L
N
 
K
Q
 
T
N
 
K
Y
 
L
G
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
H
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
P
V
 
G
L
 
V
M
 
K
A
 
S
V
 
V
G
 
I
S
 
S
Y
 
K
A
 
A
S
 
S
N
 
G
Y
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
S
K
 
K
A
 
A
E
 
D
K
 
L
Y
 
F
L
 
L
E
 
E
E
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
V
 
V
T
 
S
F
 
I
G
 
G
E
 
D
T
 
I
D
 
Y
L
 
L
E
 
E
V
 
V
I
 
R
W
 
A
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
T
P
 
A
G
 
G
H
 
C
V
 
V
V
 
T
F
 
Y
Y
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
D
H
 
Q
P
 
P
E
 
Q
S
 
P
K
 
R
T
 
M
C
 
A
I
 
F
G
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
V
F
 
L
Q
 
I
G
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
F
P
 
Q
G
 
E
G
 
G
D
 
S
H
 
S
Q
 
D
T
 
Q
L
 
L
L
 
Y
D
 
E
A
 
S
I
 
V
K
 
H
A
 
S
K
 
Q
L
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
K
D
 
D
V
 
T
K
 
L
V
 
I
H
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
D
-
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
F
P
 
E
A
 
V
T
 
S
L
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
K
 
M
I
 
Q
H
 
H
N
 
N
P
 
P
F
 
R
V
 
L
G
 
T
K
 
K
N
 
D
A
 
K
Q
 
E

2gcuA X-ray structure of gene product from arabidopsis thaliana at1g53580 (see paper)
30% identity, 92% coverage: 17:216/217 of query aligns to 18:208/244 of 2gcuA

query
sites
2gcuA
Y
 
Y
V
 
L
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
D
 
V
T
 
S
-
 
H
-
 
P
-
 
D
K
 
K
E
 
P
A
 
A
V
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
-
C
 
-
Y
 
V
A
 
D
K
 
K
E
 
T
E
 
V
Q
 
D
E
 
R
T
 
D
L
 
L
K
 
K
Q
 
-
F
 
L
L
 
I
Q
 
D
S
 
E
N
 
L
D
 
G
L
 
L
R
 
K
P
 
L
V
 
I
R
 
Y
L
 
A
L
 
M
N
 
N
T
 
T
H
|
H
C
 
V
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
|
H
V
 
V
L
 
T
G
 
G
N
 
T
F
 
G
F
 
L
I
 
L
N
 
K
Q
 
T
N
 
K
Y
 
L
G
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
H
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
P
V
 
G
L
 
V
M
 
K
A
 
S
V
 
V
G
 
I
S
 
S
Y
 
K
A
 
A
S
 
S
N
 
G
Y
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
S
K
 
K
A
 
A
E
 
D
K
 
L
Y
 
F
L
 
L
E
 
E
E
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
V
 
V
T
 
S
F
 
I
G
 
G
E
 
D
T
 
I
D
 
Y
L
 
L
E
 
E
V
 
V
I
 
R
W
 
A
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
T
P
 
A
G
 
G
H
 
C
V
 
V
V
 
T
F
 
Y
Y
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
D
H
 
Q
P
 
P
E
 
Q
S
 
P
K
 
R
T
 
M
C
 
A
I
 
F
G
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
V
F
 
L
Q
 
I
G
 
R
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
F
P
 
Q
G
 
E
G
 
G
D
 
S
H
 
S
Q
 
D
T
 
Q
L
 
L
L
 
Y
D
 
E
A
 
S
I
 
V
K
 
H
A
 
S
K
 
Q
L
 
I
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
K
D
 
D
V
 
T
K
 
L
V
 
I
H
 
Y
P
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
-
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
F
P
 
E
A
 
V
T
 
S
L
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
K
 
M
I
 
Q
H
 
H
N
 
N
P
 
P
F
 
R
V
 
L
G
 
T
K
 
K
N
 
D
A
 
K
Q
 
E

6sg9FL uS3m (see paper)
25% identity, 92% coverage: 10:208/217 of query aligns to 60:294/320 of 6sg9FL

query
sites
6sg9FL
N
 
N
P
 
N
F
 
F
Q
x
D
E
 
S
N
 
N
C
 
Q
Y
|
Y
V
 
M
L
 
L
Y
 
I
D
 
N
D
 
K
-
 
A
T
 
T
K
 
K
E
 
R
A
 
C
V
 
L
I
 
L
I
 
V
D
 
D
P
 
A
G
 
-
C
 
-
Y
 
-
A
 
S
K
 
D
E
 
D
E
 
W
Q
 
P
E
 
D
T
 
D
L
 
W
K
 
A
Q
 
A
F
 
F
L
 
I
Q
 
G
S
 
A
N
 
S
D
 
D
L
 
L
R
 
T
P
 
L
V
 
T
R
 
H
L
 
V
L
 
F
N
 
L
T
 
T
H
|
H
C
 
C
H
|
H
I
 
I
D
|
D
H
 
N
V
 
I
L
 
I
G
 
N
-
 
L
N
 
N
F
 
A
F
 
F
I
 
L
N
 
T
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
Q
-
 
K
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
W
-
 
C
-
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
C
-
 
W
-
 
V
Q
 
Q
N
 
N
Y
 
F
G
 
K
L
 
R
P
 
S
L
 
C
E
 
E
I
 
R
H
 
Y
P
 
G
K
 
R
D
 
F
E
 
E
P
 
E
V
 
M
L
 
H
M
 
Q
A
 
V
V
 
L
G
 
P
S
 
M
Y
 
M
A
 
C
S
 
R
N
 
S
Y
 
L
G
 
Y
F
 
T
P
 
P
A
 
Q
Y
 
H
T
 
L
-
 
V
-
 
D
P
 
P
C
 
V
K
 
R
A
 
N
E
 
A
K
 
R
Y
 
H
L
 
L
E
 
R
E
 
R
G
 
N
D
 
D
K
 
V
V
 
L
T
 
L
F
 
S
G
 
A
E
 
A
T
 
T
D
 
N
-
 
R
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
F
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
L
L
 
L
E
 
Y
V
 
Y
I
 
I
W
 
F
V
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G
H
 
H
V
 
M
V
 
M
F
 
L
Y
 
H
H
 
I
P
 
P
E
 
T
S
 
E
K
 
R
T
 
I
C
 
L
I
 
F
G
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
L
L
 
L
F
 
F
Q
 
F
G
 
N
S
x
K
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
V
D
 
D
L
 
L
P
 
P
G
 
W
G
 
A
D
 
T
H
 
G
Q
 
V
T
 
R
L
 
L
L
 
A
D
 
E
A
 
S
I
 
L
K
 
R
A
 
L
K
 
-
L
 
L
F
 
E
T
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
N
V
 
T
K
 
V
V
 
V
H
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
|
G
P
x
R
A
 
M
T
 
T
L
 
T
I
 
L
G
 
G
H
 
R
E
 
E
K
 
R
I
 
R
H
 
E
N
 
N

Sites not aligning to the query:

Q9SID3 Hydroxyacylglutathione hydrolase 2, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
30% identity, 82% coverage: 17:195/217 of query aligns to 85:239/324 of Q9SID3

query
sites
Q9SID3
Y
 
Y
V
 
I
L
 
L
Y
 
H
D
 
D
-
 
E
D
 
D
T
 
T
K
 
G
E
 
T
A
 
V
V
 
G
I
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
S
C
 
-
Y
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
E
 
E
Q
 
A
E
 
E
T
 
P
L
 
I
K
 
I
Q
 
D
F
 
S
L
 
L
Q
 
K
S
 
R
N
 
S
D
 
G
L
 
R
R
 
N
P
 
L
V
 
T
R
 
Y
L
 
I
L
 
L
N
 
N
T
 
T
H
|
H
C
 
H
H
|
H
I
 
Y
D
|
D
H
|
H
V
 
T
L
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
L
F
 
E
I
 
L
N
 
K
Q
 
D
N
 
R
Y
 
Y
G
 
G
L
 
A
P
 
K
L
 
V
E
 
-
I
 
-
H
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
I
G
 
G
S
 
S
Y
 
A
A
 
M
S
 
D
N
 
K
Y
 
D
G
 
R
F
 
I
P
 
P
A
 
G
Y
 
I
T
 
-
P
 
-
C
 
-
K
 
-
A
 
-
E
 
D
K
 
M
Y
 
A
L
 
L
E
 
K
E
 
D
G
 
G
D
 
D
K
 
K
V
 
W
T
 
M
F
 
F
G
 
A
E
 
G
T
 
H
D
 
E
L
 
V
E
 
H
V
 
V
I
 
M
W
 
D
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
T
P
 
K
G
 
G
H
 
H
V
 
I
V
 
S
F
 
L
Y
 
Y
H
 
F
P
 
P
E
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
A
C
 
I
I
 
F
G
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
M
F
 
F
Q
 
S
G
 
L
S
 
S
I
 
C
G
 
G
R
 
K
T
 
-
D
 
-
L
 
L
P
 
F
G
 
E
G
 
G
D
 
T
H
 
P
Q
 
K
T
 
Q
L
 
M
L
 
L
D
 
A
A
 
S
I
 
L
K
 
Q
A
 
-
K
 
K
L
 
I
F
 
T
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
D
V
 
T
K
 
S
V
 
I
H
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H

2q42A Ensemble refinement of the protein crystal structure of glyoxalase ii from arabidopsis thaliana gene at2g31350 (see paper)
30% identity, 83% coverage: 16:195/217 of query aligns to 14:169/254 of 2q42A

query
sites
2q42A
C
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
L
Y
 
H
D
 
D
-
 
E
D
 
D
T
 
T
K
 
G
E
 
T
A
 
V
V
 
G
I
 
V
I
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
S
C
 
-
Y
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
E
 
E
Q
 
A
E
 
E
T
 
P
L
 
I
K
 
I
Q
 
D
F
 
S
L
 
L
Q
 
K
S
 
R
N
 
S
D
 
G
L
 
R
R
 
N
P
 
L
V
 
T
R
 
Y
L
 
I
L
 
L
N
 
N
T
 
T
H
|
H
C
 
H
H
|
H
I
 
Y
D
|
D
H
|
H
V
 
T
L
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
L
F
 
E
I
 
L
N
 
K
Q
 
D
N
 
R
Y
 
Y
G
 
G
L
 
A
P
 
K
L
 
V
E
 
-
I
 
-
H
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
I
G
 
G
S
 
S
Y
 
A
A
 
M
S
 
D
N
 
K
Y
 
D
G
 
R
F
 
I
P
 
P
A
 
G
Y
 
I
T
 
-
P
 
-
C
 
-
K
 
-
A
 
-
E
 
D
K
 
M
Y
 
A
L
 
L
E
 
K
E
 
D
G
 
G
D
 
D
K
 
K
V
 
W
T
 
M
F
 
F
G
 
A
E
 
G
T
 
H
D
 
E
L
 
V
E
 
H
V
 
V
I
 
M
W
 
D
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
T
P
 
K
G
 
G
H
 
H
V
 
I
V
 
S
F
 
L
Y
 
Y
H
 
F
P
 
P
E
 
G
S
 
S
K
 
R
T
 
A
C
 
I
I
 
F
G
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
M
F
 
F
Q
 
S
G
 
L
S
 
S
I
 
C
G
 
G
R
 
K
T
 
-
D
 
-
L
 
L
P
 
F
G
 
E
G
 
G
D
 
T
H
 
P
Q
 
K
T
 
Q
L
 
M
L
 
L
D
 
A
A
 
S
I
 
L
K
 
Q
A
 
-
K
 
K
L
 
I
F
 
T
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
D
V
 
T
K
 
S
V
 
I
H
 
Y
P
 
C
G
 
G
H
|
H

4ysbA Crystal structure of ethe1 from myxococcus xanthus (see paper)
28% identity, 93% coverage: 16:216/217 of query aligns to 15:195/225 of 4ysbA

query
sites
4ysbA
C
 
T
Y
 
Y
V
 
L
L
 
I
Y
 
G
D
 
D
D
 
E
-
 
A
T
 
T
K
 
R
E
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
-
C
 
-
Y
 
-
A
 
V
K
 
L
E
 
E
E
 
Q
Q
 
V
E
 
D
T
 
R
L
 
D
K
 
L
Q
 
Q
F
 
M
L
 
V
Q
 
A
S
 
E
N
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
T
P
 
L
V
 
T
R
 
H
L
 
V
L
 
F
N
 
D
T
 
T
H
|
H
C
 
V
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
|
H
V
 
I
L
 
T
G
 
A
N
 
S
F
 
G
F
 
A
I
 
L
N
 
R
Q
 
E
N
 
R
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
H
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
T
Y
 
Q
A
 
A
S
 
T
N
 
V
Y
 
V
G
 
G
F
 
S
P
 
V
A
 
N
Y
 
G
T
 
A
P
 
S
C
 
C
K
 
-
A
 
A
E
 
N
K
 
V
Y
 
Q
L
 
V
E
 
R
E
 
H
G
 
G
D
 
D
K
 
E
V
 
V
T
 
R
F
 
V
G
 
G
E
 
Q
T
 
L
D
 
V
L
 
F
E
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
A
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
T
P
 
D
G
 
D
H
 
S
V
 
I
V
 
S
F
 
Y
Y
 
L
H
 
L
P
 
G
E
 
D
S
 
R
K
 
-
T
 
-
C
 
V
I
 
F
G
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
V
G
 
R
S
 
G
I
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
F
P
 
Q
G
 
N
G
 
G
D
 
N
H
 
A
Q
 
S
T
 
Q
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
A
 
S
I
 
L
K
 
T
A
 
R
K
 
V
L
 
L
F
 
F
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
E
V
 
T
K
 
L
V
 
V
H
 
Y
P
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
D
-
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
R
P
 
T
A
 
V
T
 
T
L
 
S
I
 
I
G
 
A
H
 
E
E
 
E
K
 
K
I
 
R
H
 
H
N
 
N
P
 
P
F
 
R
V
 
V
G
 
A
K
 
G
N
 
K
A
 
S
Q
 
R

3tp9A Crystal structure of alicyclobacillus acidocaldarius protein with beta-lactamase and rhodanese domains
29% identity, 86% coverage: 22:208/217 of query aligns to 24:223/473 of 3tp9A

query
sites
3tp9A
D
 
E
T
 
T
K
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
C
I
 
V
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
C
 
R
Y
 
D
A
 
V
K
 
E
E
 
P
E
 
Y
Q
 
L
E
 
L
T
 
T
L
 
A
K
 
K
Q
 
R
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
S
 
-
N
 
E
D
 
G
L
 
L
R
 
R
P
 
I
V
 
V
R
 
A
L
 
A
L
 
L
N
 
E
T
 
T
H
|
H
C
 
I
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
x
F
V
 
V
L
 
S
G
 
G
N
 
A
F
 
R
F
 
E
I
 
M
N
 
A
Q
 
D
N
 
R
Y
 
A
G
 
G
L
 
A
P
 
A
L
 
I
E
 
C
I
 
V
H
 
S
P
 
D
K
 
E
D
 
G
E
 
P
P
 
P
V
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
E
Y
 
W
A
 
K
S
 
S
N
 
E
Y
 
Y
G
 
-
F
 
V
P
 
K
A
 
A
Y
 
Y
T
 
P
P
 
-
C
 
-
K
 
-
A
 
-
E
 
H
K
 
R
Y
 
L
L
 
L
E
 
K
E
 
D
G
 
G
D
 
D
K
 
E
V
 
L
T
 
H
F
 
F
G
 
G
E
 
N
T
 
V
D
 
R
L
 
I
E
 
V
V
 
V
I
 
M
W
 
H
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
T
P
 
P
G
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
S
F
 
Y
Y
 
L
H
 
L
P
 
Y
E
 
D
S
 
G
K
 
K
T
 
T
C
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
M
-
 
A
-
 
L
I
 
F
G
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
F
L
 
V
F
 
F
Q
 
V
G
 
G
S
 
D
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
P
D
 
D
L
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
G
P
 
E
G
 
S
G
 
G
D
 
S
H
 
S
Q
 
E
T
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
R
A
 
Q
I
 
M
-
 
F
-
 
R
-
 
S
K
 
L
A
 
R
K
 
K
L
 
F
F
 
E
T
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
H
V
 
V
K
 
Q
V
 
V
H
 
L
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
C
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
V
P
 
P
A
 
S
T
 
S
L
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
Y
E
 
E
K
 
K
I
 
L
H
 
V
N
 
N

5wcmA Crystal structure of the complex between class b3 beta-lactamase bjp-1 and 4-nitrobenzene-sulfonamide - new refinement (see paper)
38% identity, 38% coverage: 56:138/217 of query aligns to 66:149/263 of 5wcmA

query
sites
5wcmA
L
 
I
L
 
L
N
 
N
T
 
T
H
|
H
C
 
A
H
|
H
I
x
L
D
|
D
H
|
H
V
 
T
L
 
G
G
 
G
N
 
F
F
 
A
F
x
E
I
 
I
N
 
K
Q
 
K
N
x
E
Y
 
T
G
 
G
L
 
A
P
 
Q
L
 
L
E
 
V
I
 
A
H
 
G
P
 
E
K
 
R
D
 
D
E
 
K
P
 
P
V
 
L
L
 
L
M
 
E
A
 
G
V
 
-
G
 
G
S
 
Y
Y
 
Y
A
 
P
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
K
-
 
N
S
 
E
N
 
D
Y
x
L
G
 
A
F
 
F
P
 
P
A
 
A
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
V
K
 
K
A
 
V
E
 
D
K
 
R
Y
 
A
L
 
V
E
 
K
E
|
E
G
 
G
D
 
D
K
 
R
V
 
V
T
 
T
F
 
L
G
 
G
E
 
D
T
 
T
D
 
T
L
 
L
E
 
T
V
 
A
I
x
H
W
 
A
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5nggA Crystal structure of the subclass b3 metallo-beta-lactamase bjp-1 in complex with acetate anion
37% identity, 38% coverage: 56:138/217 of query aligns to 77:160/274 of 5nggA

query
sites
5nggA
L
 
I
L
 
L
N
 
N
T
 
T
H
|
H
C
 
A
H
|
H
I
 
L
D
|
D
H
|
H
V
 
T
L
 
G
G
 
G
N
 
F
F
 
A
F
 
E
I
 
I
N
 
K
Q
 
K
N
 
E
Y
 
T
G
 
G
L
 
A
P
 
Q
L
 
L
E
 
V
I
 
A
H
 
G
P
 
E
K
 
R
D
 
D
E
 
K
P
 
P
V
 
L
L
 
L
M
 
E
A
 
-
V
 
-
G
 
G
S
 
G
Y
 
Y
-
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
K
A
 
N
S
 
E
N
 
D
Y
 
L
G
 
A
F
 
F
P
 
P
A
 
A
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
V
K
 
K
A
 
V
E
 
D
K
 
R
Y
 
A
L
 
V
E
 
K
E
|
E
G
 
G
D
 
D
K
 
R
V
 
V
T
 
T
F
 
L
G
 
G
E
 
D
T
 
T
D
 
T
L
 
L
E
 
T
V
 
A
I
x
H
W
 
A
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4efzA Crystal structure of a hypothetical metallo-beta-lactamase from burkholderia pseudomallei
24% identity, 82% coverage: 17:195/217 of query aligns to 20:216/295 of 4efzA

query
sites
4efzA
Y
 
Y
V
 
L
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
D
 
S
-
 
G
T
 
S
K
 
G
E
 
E
A
 
C
V
 
A
I
 
L
I
 
I
D
 
D
P
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
K
-
 
S
G
 
G
C
 
R
Y
 
T
A
 
R
K
 
T
E
 
A
E
 
S
Q
 
A
E
 
D
T
 
Q
L
 
L
K
 
I
Q
 
A
F
 
R
L
 
V
Q
 
A
S
 
A
N
 
L
D
 
G
L
 
A
R
 
R
P
 
V
V
 
R
R
 
W
L
 
L
L
 
L
N
 
E
T
 
T
H
|
H
C
 
V
H
|
H
I
 
A
D
|
D
H
|
H
V
 
L
L
 
S
G
 
A
N
 
A
F
 
P
F
 
Y
I
 
L
N
 
K
Q
 
T
N
 
R
Y
 
V
G
 
G
L
 
G
P
 
E
L
 
I
E
 
A
I
 
I
H
 
G
P
 
R
K
 
H
D
 
V
E
 
T
P
 
R
V
 
V
L
 
Q
M
 
D
A
 
V
V
 
F
G
 
G
S
 
K
Y
 
L
A
 
F
S
 
N
N
 
A
Y
 
G
G
 
P
F
 
A
P
 
F
A
 
A
Y
 
H
T
 
D
P
 
G
C
 
S
K
 
Q
A
 
F
E
 
D
K
 
R
Y
 
L
L
 
L
E
 
D
E
 
D
G
 
G
D
 
D
K
 
T
V
 
L
T
 
A
F
 
L
G
 
G
E
 
A
T
 
L
D
 
S
L
 
I
E
 
R
V
 
A
I
 
M
W
 
H
V
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
T
P
 
P
G
 
A
H
 
C
V
 
M
V
 
T
F
 
Y
Y
 
V
H
 
V
P
 
T
E
 
E
S
 
A
K
 
H
T
 
A
C
 
A
I
 
H
G
 
D
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
F
-
 
V
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
Q
 
M
G
 
P
S
 
D
I
 
Y
G
 
G
-
 
T
-
 
A
R
 
R
T
 
C
D
 
D
L
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
 
A
Q
 
R
T
 
S
L
 
L
L
 
Y
D
 
R
A
 
S
I
 
I
K
 
R
A
 
-
K
 
K
L
 
V
F
 
L
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
P
D
 
A
V
 
T
K
 
R
V
 
L
H
 
Y
P
 
M
G
 
C
H
 
H

2p18A Crystal structure of the leishmania infantum glyoxalase ii (see paper)
35% identity, 49% coverage: 56:162/217 of query aligns to 64:162/283 of 2p18A

query
sites
2p18A
L
 
I
L
 
L
N
 
S
T
 
T
H
|
H
C
 
K
H
|
H
I
 
W
D
|
D
H
|
H
V
 
S
L
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
-
F
 
-
I
 
-
N
 
-
Q
 
-
N
 
-
Y
 
A
G
 
K
L
 
L
P
 
K
L
 
A
E
 
E
I
 
L
H
 
E
P
 
A
K
 
M
D
 
N
E
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
V
M
 
V
A
 
V
V
 
G
G
 
G
S
 
A
Y
 
-
A
 
-
S
 
-
N
 
N
Y
 
D
G
 
S
F
 
I
P
 
P
A
 
A
Y
 
V
T
 
T
P
 
-
C
 
-
K
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
K
Y
 
P
L
 
V
E
 
R
E
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
R
V
 
V
T
 
Q
F
 
V
G
 
G
E
 
D
T
 
L
D
 
S
L
 
V
E
 
E
V
 
V
I
 
I
W
 
D
V
 
A
P
 
P
G
 
C
H
|
H
A
 
T
P
 
R
G
 
G
H
 
H
V
 
V
V
 
L
F
 
Y
-
 
K
-
 
V
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
Y
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
N
S
 
D
K
 
G
T
 
V
C
 
A
I
 
L
-
 
F
G
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
M
F
 
F
Q
 
I
G
 
A
S
 
G
I
|
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8ewoA Crystal structure of putative glyoxylase ii from pseudomonas aeruginosa
36% identity, 38% coverage: 114:195/217 of query aligns to 92:171/259 of 8ewoA

query
sites
8ewoA
L
 
L
E
 
E
E
 
D
G
 
G
D
 
E
K
 
R
V
 
V
T
 
E
F
 
V
G
 
L
E
 
G
T
 
L
D
 
V
L
 
F
E
 
E
V
 
I
I
 
F
W
 
H
V
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
A
 
T
P
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
I
V
 
A
F
 
Y
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
-
 
A
E
 
E
S
 
T
K
 
P
T
 
L
C
 
L
I
 
F
G
 
C
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
Q
 
A
G
 
A
S
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
-
 
L
-
 
F
T
 
E
D
 
G
L
 
T
P
 
P
G
 
A
G
 
Q
D
 
M
H
 
H
Q
 
H
T
 
S
L
 
L
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
A
K
 
R
L
 
L
F
 
A
T
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
A
D
 
N
V
 
T
K
 
R
V
 
V
H
 
Y
P
 
C
G
 
T
H
|
H

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Echvi_2827 FitnessBrowser__Cola:Echvi_2827
MLNVQTFTFNPFQENCYVLYDDTKEAVIIDPGCYAKEEQETLKQFLQSNDLRPVRLLNTH
CHIDHVLGNFFINQNYGLPLEIHPKDEPVLMAVGSYASNYGFPAYTPCKAEKYLEEGDKV
TFGETDLEVIWVPGHAPGHVVFYHPESKTCIGGDTLFQGSIGRTDLPGGDHQTLLDAIKA
KLFTLPDDVKVHPGHGPATLIGHEKIHNPFVGKNAQF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory