SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_3849 FitnessBrowser__Cola:Echvi_3849 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1js1X Crystal structure of a new transcarbamylase from the anaerobic bacterium bacteroides fragilis at 2.0 a resolution (see paper)
46% identity, 100% coverage: 1:313/313 of query aligns to 1:315/324 of 1js1X

query
sites
1js1X
M
 
M
K
 
K
Y
 
K
Y
 
F
T
 
T
Q
 
C
F
 
V
E
 
Q
N
 
D
K
 
I
S
 
G
L
 
D
A
 
L
D
 
K
Q
 
S
L
 
A
I
 
L
Q
 
A
K
 
E
A
 
S
L
 
F
E
 
E
Y
 
I
K
 
K
K
 
K
A
 
D
P
 
R
L
 
F
S
 
K
D
 
Y
N
 
V
N
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
N
K
 
K
R
 
T
I
 
L
G
 
L
L
 
M
L
 
I
F
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
S
S
|
S
L
|
L
R
|
R
T
 
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
I
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
L
N
 
N
L
 
L
G
 
G
M
 
M
E
 
N
S
 
V
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
D
M
 
I
D
 
N
K
 
Q
E
 
G
S
 
A
W
 
W
A
 
K
L
 
L
E
 
E
M
 
T
E
 
E
D
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
M
 
M
N
 
D
Q
 
G
G
 
D
K
 
K
A
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
L
R
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
I
G
 
P
V
 
V
L
 
M
G
 
G
S
 
C
Y
 
Y
F
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
G
L
 
V
R
|
R
A
 
S
F
 
F
P
 
A
S
 
R
L
 
F
T
 
E
N
 
N
K
 
R
D
 
E
E
 
Y
D
 
D
S
 
Y
E
 
N
D
 
E
F
 
V
I
 
I
L
 
I
H
 
N
Q
 
Q
F
 
F
A
 
I
K
 
Q
H
 
H
S
 
S
G
 
G
L
 
R
P
 
P
L
 
V
I
 
F
S
 
S
L
 
M
E
 
E
S
 
A
A
 
A
I
 
T
R
 
R
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
L
 
F
A
 
A
D
 
D
M
 
L
V
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
H
 
Y
K
 
K
Q
 
K
K
 
T
E
 
A
K
 
R
P
 
P
K
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
M
T
 
T
W
 
W
A
 
A
P
 
P
H
 
H
I
 
P
K
 
R
A
 
P
I
 
L
P
 
P
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
P
N
 
N
S
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
E
W
 
W
S
 
M
I
 
N
G
 
A
C
 
T
G
 
D
H
 
Y
D
 
E
V
 
F
T
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
D
 
D
E
 
P
R
 
K
F
 
F
T
 
V
Q
 
G
G
 
N
A
 
A
T
 
R
I
 
V
E
 
E
H
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
D
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
E
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
Y
 
Y
V
 
A
K
|
K
N
 
N
W
 
W
S
 
A
A
 
A
F
 
Y
-
 
T
-
 
G
N
 
D
E
 
N
Y
 
Y
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
L
 
L
C
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
R
S
 
N
W
 
W
M
 
T
L
 
V
N
 
G
E
 
D
Q
 
R
K
 
Q
L
 
M
S
 
A
Q
 
V
A
 
T
P
 
N
N
 
N
A
 
A
K
 
Y
V
 
F
M
 
M
H
 
H
C
 
C
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
R
R
 
R
N
 
N
V
 
M
E
 
I
L
 
V
S
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
V
L
 
I
D
 
E
G
 
S
P
 
P
R
 
Q
S
 
S
L
 
I
V
 
V
Q
 
I
H
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
A
N
 
N
R
 
R
V
 
E
F
 
I
A
 
S
A
 
A
Q
 
T
A
 
V
A
 
V
L
 
L
S
 
K
E
 
R
L
 
L
L
 
L
K
 
E

E1WKT5 N-succinylornithine carbamoyltransferase; N-succinyl-L-ornithine transcarbamylase; SOTCase; EC 2.1.3.11 from Bacteroides fragilis (strain 638R) (see 2 papers)
46% identity, 100% coverage: 1:313/313 of query aligns to 1:315/318 of E1WKT5

query
sites
E1WKT5
M
 
M
K
 
K
Y
 
K
Y
 
F
T
 
T
Q
 
C
F
 
V
E
 
Q
N
 
D
K
 
I
S
 
G
L
 
D
A
 
L
D
 
K
Q
 
S
L
 
A
I
 
L
Q
 
A
K
 
E
A
 
S
L
 
F
E
 
E
Y
 
I
K
 
K
K
 
K
A
 
D
P
 
R
L
 
F
S
 
K
D
 
Y
N
 
V
N
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
N
K
 
K
R
 
T
I
 
L
G
 
L
L
 
M
L
 
I
F
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
S
S
|
S
L
|
L
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
I
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
L
N
 
N
L
 
L
G
 
G
M
 
M
E
 
N
S
 
V
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
D
M
 
I
D
 
N
K
 
Q
E
 
G
S
 
A
W
|
W
A
 
K
L
 
L
E
 
E
M
 
T
E
 
E
D
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
M
 
M
N
 
D
Q
 
G
G
 
D
K
 
K
A
x
P
E
 
E
H
 
H
I
 
L
R
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
I
G
 
P
V
 
V
L
 
M
G
 
G
S
 
C
Y
 
Y
F
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
G
L
 
V
R
|
R
A
 
S
F
 
F
P
 
A
S
 
R
L
 
F
T
 
E
N
 
N
K
 
R
D
 
E
E
 
Y
D
 
D
S
 
Y
E
 
N
D
 
E
F
 
V
I
 
I
L
 
I
H
 
N
Q
 
Q
F
 
F
A
 
I
K
 
Q
H
 
H
S
 
S
G
 
G
L
 
R
P
 
P
L
 
V
I
 
F
S
 
S
L
 
M
E
 
E
S
 
A
A
 
A
I
 
T
R
 
R
H
|
H
P
|
P
L
|
L
Q
|
Q
S
 
S
L
 
F
A
 
A
D
 
D
M
 
L
V
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
H
 
Y
K
 
K
Q
 
K
K
 
T
E
 
A
K
 
R
P
 
P
K
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
M
T
 
T
W
 
W
A
 
A
P
 
P
H
 
H
I
 
P
K
 
R
A
 
P
I
 
L
P
 
P
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
P
N
 
N
S
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
E
W
 
W
S
 
M
I
 
N
G
 
A
C
 
T
G
 
D
H
 
Y
D
 
E
V
 
F
T
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
D
 
D
E
 
P
R
 
K
F
 
F
T
 
V
Q
 
G
G
 
N
A
 
A
T
 
R
I
 
V
E
 
E
H
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
D
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
E
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
Y
 
Y
V
 
A
K
 
K
N
 
N
W
 
W
S
 
A
A
 
A
F
 
Y
-
 
T
-
 
G
N
 
D
E
 
N
Y
 
Y
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
L
 
L
C
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
R
S
 
N
W
 
W
M
 
T
L
 
V
N
 
G
E
 
D
Q
 
R
K
 
Q
L
 
M
S
 
A
Q
 
V
A
 
T
P
 
N
N
 
N
A
 
A
K
 
Y
V
 
F
M
 
M
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
V
 
V
R
 
R
R
 
R
N
 
N
V
 
M
E
 
I
L
 
V
S
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
V
L
 
I
D
 
E
G
 
S
P
 
P
R
 
Q
S
 
S
L
 
I
V
 
V
Q
 
I
H
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
A
N
 
N
R
|
R
V
 
E
F
 
I
A
 
S
A
 
A
Q
 
T
A
 
V
A
 
V
L
 
L
S
 
K
E
 
R
L
 
L
L
 
L
K
 
E

2g7mC Crystal structure of b. Fragilis n-succinylornithine transcarbamylase p90e mutant complexed with carbamoyl phosphate and n-acetylnorvaline (see paper)
46% identity, 100% coverage: 1:313/313 of query aligns to 3:317/320 of 2g7mC

query
sites
2g7mC
M
 
M
K
 
K
Y
 
K
Y
 
F
T
 
T
Q
 
C
F
 
V
E
 
Q
N
 
D
K
 
I
S
 
G
L
 
D
A
 
L
D
 
K
Q
 
S
L
 
A
I
 
L
Q
 
A
K
 
E
A
 
S
L
 
F
E
 
E
Y
 
I
K
 
K
K
 
K
A
 
D
P
 
R
L
 
F
S
 
K
D
 
Y
N
 
V
N
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
N
K
 
K
R
 
T
I
 
L
G
 
L
L
 
M
L
 
I
F
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
S
S
|
S
L
|
L
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
I
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
L
N
 
N
L
 
L
G
 
G
M
 
M
E
 
N
S
 
V
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
D
M
 
I
D
 
N
K
 
Q
E
 
G
S
 
A
W
|
W
A
 
K
L
 
L
E
 
E
M
 
T
E
 
E
D
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
M
 
M
N
 
D
Q
 
G
G
 
D
K
 
K
A
x
E
E
 
E
H
 
H
I
 
L
R
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
I
G
 
P
V
 
V
L
 
M
G
 
G
S
 
C
Y
 
Y
F
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
G
L
 
V
R
|
R
A
 
S
F
|
F
P
 
A
S
 
R
L
 
F
T
 
E
N
 
N
K
 
R
D
 
E
E
 
Y
D
 
D
S
 
Y
E
 
N
D
 
E
F
 
V
I
 
I
L
 
I
H
 
N
Q
 
Q
F
 
F
A
 
I
K
 
Q
H
 
H
S
 
S
G
 
G
L
 
R
P
 
P
L
 
V
I
 
F
S
 
S
L
 
M
E
|
E
S
 
A
A
 
A
I
 
T
R
 
R
H
|
H
P
 
P
L
 
L
Q
|
Q
S
 
S
L
 
F
A
 
A
D
 
D
M
 
L
V
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
H
 
Y
K
 
K
Q
 
K
K
 
T
E
 
A
K
 
R
P
 
P
K
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
M
T
 
T
W
 
W
A
 
A
P
 
P
H
 
H
I
 
P
K
 
R
A
 
P
I
x
L
P
|
P
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
P
N
 
N
S
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
E
W
 
W
S
 
M
I
 
N
G
 
A
C
 
T
G
 
D
H
 
Y
D
 
E
V
 
F
T
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
D
 
D
E
 
P
R
 
K
F
 
F
T
 
V
Q
 
G
G
 
N
A
 
A
T
 
R
I
 
V
E
 
E
H
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
D
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
E
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
Y
 
Y
V
 
A
K
|
K
N
 
N
W
 
W
S
 
A
A
 
A
F
 
Y
-
 
L
-
 
G
N
 
D
E
 
N
Y
 
Y
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
L
 
L
C
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
R
S
 
N
W
 
W
M
 
T
L
 
V
N
 
G
E
 
D
Q
 
R
K
 
Q
L
 
M
S
 
A
Q
 
V
A
 
T
P
 
N
N
 
N
A
 
A
K
 
Y
V
 
F
M
 
M
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
V
 
V
R
 
R
R
 
R
N
 
N
V
 
M
E
 
I
L
 
V
S
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
V
L
 
I
D
 
E
G
 
S
P
 
P
R
 
Q
S
 
S
L
 
I
V
 
V
Q
 
I
H
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
A
N
 
N
R
|
R
V
 
E
F
 
I
A
 
S
A
 
A
Q
 
T
A
 
V
A
 
V
L
 
L
S
 
K
E
 
R
L
 
L
L
 
L
K
 
E

2fg7C N-succinyl-l-ornithine transcarbamylase from b. Fragilis complexed with carbamoyl phosphate and n-succinyl-l-norvaline (see paper)
46% identity, 100% coverage: 1:313/313 of query aligns to 3:317/320 of 2fg7C

query
sites
2fg7C
M
 
M
K
 
K
Y
 
K
Y
 
F
T
 
T
Q
 
C
F
 
V
E
 
Q
N
 
D
K
 
I
S
 
G
L
 
D
A
 
L
D
 
K
Q
 
S
L
 
A
I
 
L
Q
 
A
K
 
E
A
 
S
L
 
F
E
 
E
Y
 
I
K
 
K
K
 
K
A
 
D
P
 
R
L
 
F
S
 
K
D
 
Y
N
 
V
N
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
N
K
 
K
R
 
T
I
 
L
G
 
L
L
 
M
L
 
I
F
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
S
S
|
S
L
|
L
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
I
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
L
N
 
N
L
 
L
G
 
G
M
 
M
E
 
N
S
 
V
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
D
M
 
I
D
 
N
K
 
Q
E
 
G
S
 
A
W
|
W
A
 
K
L
 
L
E
 
E
M
 
T
E
 
E
D
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
M
 
M
N
 
D
Q
 
G
G
 
D
K
 
K
A
x
P
E
 
E
H
 
H
I
 
L
R
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
I
G
 
P
V
 
V
L
 
M
G
 
G
S
 
C
Y
 
Y
F
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
G
L
 
V
R
|
R
A
 
S
F
|
F
P
 
A
S
 
R
L
 
F
T
 
E
N
 
N
K
 
R
D
 
E
E
 
Y
D
 
D
S
 
Y
E
 
N
D
 
E
F
 
V
I
 
I
L
 
I
H
 
N
Q
 
Q
F
 
F
A
 
I
K
 
Q
H
 
H
S
 
S
G
 
G
L
 
R
P
 
P
L
 
V
I
 
F
S
 
S
L
 
M
E
|
E
S
 
A
A
 
A
I
 
T
R
 
R
H
|
H
P
 
P
L
 
L
Q
|
Q
S
 
S
L
 
F
A
 
A
D
 
D
M
 
L
V
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
H
 
Y
K
 
K
Q
 
K
K
 
T
E
 
A
K
 
R
P
 
P
K
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
M
T
 
T
W
 
W
A
 
A
P
 
P
H
|
H
I
 
P
K
x
R
A
 
P
I
x
L
P
|
P
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
P
N
 
N
S
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
E
W
 
W
S
 
M
I
 
N
G
 
A
C
 
T
G
 
D
H
 
Y
D
 
E
V
 
F
T
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
D
 
D
E
 
P
R
 
K
F
 
F
T
 
V
Q
 
G
G
 
N
A
 
A
T
 
R
I
 
V
E
 
E
H
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
D
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
E
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
Y
 
Y
V
 
A
K
|
K
N
 
N
W
 
W
S
 
A
A
 
A
F
 
Y
-
 
L
-
 
G
N
 
D
E
 
N
Y
 
Y
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
L
 
L
C
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
R
S
 
N
W
 
W
M
 
T
L
 
V
N
 
G
E
 
D
Q
 
R
K
 
Q
L
 
M
S
 
A
Q
 
V
A
 
T
P
 
N
N
 
N
A
 
A
K
 
Y
V
 
F
M
 
M
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
V
 
V
R
|
R
R
 
R
N
 
N
V
 
M
E
 
I
L
 
V
S
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
V
L
 
I
D
 
E
G
 
S
P
 
P
R
 
Q
S
 
S
L
 
I
V
 
V
Q
 
I
H
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
A
N
 
N
R
|
R
V
 
E
F
 
I
A
 
S
A
 
A
Q
 
T
A
 
V
A
 
V
L
 
L
S
 
K
E
 
R
L
 
L
L
 
L
K
 
E

2fg6C N-succinyl-l-ornithine transcarbamylase from b. Fragilis complexed with sulfate and n-succinyl-l-norvaline (see paper)
46% identity, 100% coverage: 1:313/313 of query aligns to 4:318/321 of 2fg6C

query
sites
2fg6C
M
 
M
K
 
K
Y
 
K
Y
 
F
T
 
T
Q
 
C
F
 
V
E
 
Q
N
 
D
K
 
I
S
 
G
L
 
D
A
 
L
D
 
K
Q
 
S
L
 
A
I
 
L
Q
 
A
K
 
E
A
 
S
L
 
F
E
 
E
Y
 
I
K
 
K
K
 
K
A
 
D
P
 
R
L
 
F
S
 
K
D
 
Y
N
 
V
N
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
R
G
 
N
K
 
K
R
 
T
I
 
L
G
 
L
L
 
M
L
 
I
F
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
S
S
|
S
L
|
L
R
|
R
T
 
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
I
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
L
N
 
N
L
 
L
G
 
G
M
 
M
E
 
N
S
 
V
I
 
I
V
 
V
L
 
L
N
 
D
M
 
I
D
 
N
K
 
Q
E
 
G
S
 
A
W
 
W
A
 
K
L
 
L
E
 
E
M
 
T
E
 
E
D
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
M
 
M
N
 
D
Q
 
G
G
 
D
K
 
K
A
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
L
R
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
I
G
 
P
V
 
V
L
 
M
G
 
G
S
 
C
Y
 
Y
F
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
G
L
 
V
R
|
R
A
 
S
F
|
F
P
 
A
S
 
R
L
 
F
T
 
E
N
 
N
K
 
R
D
 
E
E
 
Y
D
 
D
S
 
Y
E
 
N
D
 
E
F
 
V
I
 
I
L
 
I
H
 
N
Q
 
Q
F
 
F
A
 
I
K
 
Q
H
 
H
S
 
S
G
 
G
L
 
R
P
 
P
L
 
V
I
 
F
S
 
S
L
 
M
E
|
E
S
 
A
A
 
A
I
 
T
R
 
R
H
|
H
P
 
P
L
 
L
Q
|
Q
S
 
S
L
 
F
A
 
A
D
 
D
M
 
L
V
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
H
 
Y
K
 
K
Q
 
K
K
 
T
E
 
A
K
 
R
P
 
P
K
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
M
T
 
T
W
 
W
A
 
A
P
 
P
H
|
H
I
 
P
K
x
R
A
 
P
I
x
L
P
|
P
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
P
N
 
N
S
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
E
W
 
W
S
 
M
I
 
N
G
 
A
C
 
T
G
 
D
H
 
Y
D
 
E
V
 
F
T
 
V
I
 
I
T
 
T
H
 
H
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
D
 
D
E
 
P
R
 
K
F
 
F
T
 
V
Q
 
G
G
 
N
A
 
A
T
 
R
I
 
V
E
 
E
H
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
D
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
E
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
Y
 
Y
V
 
A
K
|
K
N
 
N
W
 
W
S
 
A
A
 
A
F
 
Y
-
 
L
-
 
G
N
 
D
E
 
N
Y
 
Y
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
L
 
L
C
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
R
S
 
N
W
 
W
M
 
T
L
 
V
N
 
G
E
 
D
Q
 
R
K
 
Q
L
 
M
S
 
A
Q
 
V
A
 
T
P
 
N
N
 
N
A
 
A
K
 
Y
V
 
F
M
 
M
H
 
H
C
|
C
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
|
R
R
 
R
N
 
N
V
 
M
E
 
I
L
 
V
S
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
V
L
 
I
D
 
E
G
 
S
P
 
P
R
 
Q
S
 
S
L
 
I
V
 
V
Q
 
I
H
 
P
Q
 
E
A
 
A
K
 
A
N
 
N
R
|
R
V
 
E
F
 
I
A
 
S
A
 
A
Q
 
T
A
 
V
A
 
V
L
 
L
S
 
K
E
 
R
L
 
L
L
 
L
K
 
E

3l02A Crystal structure of n-acetyl-l-ornithine transcarbamylase e92a mutant complexed with carbamyl phosphate and n-succinyl-l-norvaline (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:312/313 of query aligns to 7:332/332 of 3l02A

query
sites
3l02A
T
 
T
Q
 
Q
F
 
D
E
 
W
N
 
S
K
 
R
S
 
A
L
 
E
A
 
L
D
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
T
K
 
Q
A
 
A
L
 
A
E
 
L
Y
 
F
K
 
K
K
 
R
A
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
N
 
N
N
 
K
L
 
L
G
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
I
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
V
F
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
P
S
|
S
L
x
M
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
T
S
 
S
T
 
F
Q
 
E
I
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
F
N
 
Q
L
 
L
G
 
G
M
 
G
E
 
H
S
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
N
 
Q
M
 
P
D
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
A
W
 
W
A
 
P
L
 
I
E
 
E
M
 
F
E
 
N
D
 
L
G
 
G
V
 
T
I
 
V
M
 
M
N
 
D
Q
 
G
G
 
D
K
 
T
A
 
A
E
 
E
H
 
H
I
 
I
R
 
A
D
 
E
A
 
V
A
 
A
G
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
R
Y
 
Y
F
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
V
R
|
R
A
 
A
F
|
F
P
 
P
S
 
K
L
 
F
T
 
V
N
 
D
K
 
W
D
 
S
E
 
K
D
 
D
S
 
R
E
 
E
D
 
D
F
 
Q
I
 
V
L
 
L
H
 
K
Q
 
S
F
 
F
A
 
A
K
 
K
H
 
Y
S
 
S
G
 
P
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
N
L
 
M
E
|
E
S
 
T
A
 
-
I
 
I
R
 
T
H
|
H
P
 
P
L
 
C
Q
|
Q
S
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
H
M
 
A
V
 
L
T
 
A
I
 
L
Q
 
Q
E
 
E
H
 
H
-
 
F
-
 
G
-
 
T
K
 
P
Q
 
D
K
 
L
E
 
R
K
 
G
P
 
K
K
 
K
V
 
Y
V
 
V
L
 
L
T
 
T
W
 
W
A
 
T
P
 
Y
H
|
H
I
 
P
K
 
K
A
 
P
I
 
L
P
 
N
H
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
S
F
 
A
A
 
L
E
 
T
W
 
I
S
 
A
I
 
T
G
 
R
C
 
M
G
 
G
H
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
I
 
L
T
 
L
H
 
C
P
 
P
E
 
T
-
 
P
G
 
D
Y
 
Y
E
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
T
 
M
Q
 
D
G
 
W
A
 
A
T
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
Q
 
I
D
 
D
K
 
S
A
 
A
L
 
Y
A
 
A
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
V
V
 
V
Y
 
Y
V
 
A
K
|
K
N
 
S
W
 
W
S
 
G
A
 
A
F
 
L
N
 
P
E
 
F
Y
 
F
G
 
G
K
 
N
-
 
W
-
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
P
I
 
I
L
 
R
C
 
D
T
 
Q
D
 
Y
E
 
Q
S
 
H
W
 
F
M
 
I
L
 
V
N
 
D
E
 
E
Q
 
R
K
 
K
L
 
M
S
 
A
Q
 
L
A
 
T
P
 
N
N
 
N
A
 
G
K
 
V
V
 
F
M
 
S
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
V
 
L
R
|
R
R
 
R
N
 
N
V
 
V
E
 
K
L
 
A
S
 
T
D
 
D
E
 
A
I
 
V
L
 
M
D
 
D
G
 
S
P
 
P
R
 
N
S
 
C
L
 
I
V
 
A
Q
 
I
H
 
D
Q
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
N
R
|
R
V
 
L
F
 
H
A
 
V
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
I
L
 
M
S
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
V

Q8P8J2 N-acetylornithine carbamoyltransferase; N-acetyl-L-ornithine transcarbamylase; AOTCase; Acetylornithine transcarbamylase; EC 2.1.3.9 from Xanthomonas campestris pv. campestris (strain ATCC 33913 / DSM 3586 / NCPPB 528 / LMG 568 / P 25) (see 3 papers)
36% identity, 98% coverage: 5:312/313 of query aligns to 9:334/339 of Q8P8J2

query
sites
Q8P8J2
T
 
T
Q
 
Q
F
 
D
E
 
W
N
 
S
K
 
R
S
 
A
L
 
E
A
 
L
D
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
T
K
 
Q
A
 
A
L
 
A
E
 
L
Y
 
F
K
 
K
K
 
R
A
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
N
 
N
N
 
K
L
 
L
G
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
I
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
V
F
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
P
S
|
S
L
x
M
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
T
S
 
S
T
 
F
Q
 
E
I
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
F
N
 
Q
L
 
L
G
 
G
M
 
G
E
 
H
S
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
N
 
Q
M
 
P
D
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
A
W
|
W
A
 
P
L
 
I
E
 
E
M
 
F
E
 
N
D
 
L
G
 
G
V
 
T
I
 
V
M
 
M
N
 
D
Q
 
G
G
 
D
K
 
T
A
x
E
E
 
E
H
 
H
I
 
I
R
 
A
D
 
E
A
 
V
A
 
A
G
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
R
Y
 
Y
F
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
V
R
|
R
A
 
A
F
 
F
P
 
P
S
 
K
L
 
F
T
 
V
N
 
D
K
 
W
D
 
S
E
 
K
D
 
D
S
 
R
E
 
E
D
 
D
F
 
Q
I
 
V
L
 
L
H
 
K
Q
 
S
F
 
F
A
 
A
K
 
K
H
 
Y
S
 
S
G
 
P
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
N
L
 
M
E
|
E
S
 
T
A
 
-
I
 
I
R
 
T
H
|
H
P
|
P
L
x
C
Q
|
Q
S
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
H
M
 
A
V
 
L
T
 
A
I
 
L
Q
 
Q
E
 
E
H
 
H
-
 
F
-
 
G
-
 
T
K
 
P
Q
 
D
K
 
L
E
 
R
K
 
G
P
 
K
K
 
K
V
 
Y
V
 
V
L
 
L
T
 
T
W
 
W
A
 
T
P
 
Y
H
 
H
I
 
P
K
 
K
A
 
P
I
 
L
P
 
N
H
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
S
F
 
A
A
 
L
E
 
T
W
 
I
S
 
A
I
 
T
G
 
R
C
 
M
G
 
G
H
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
I
 
L
T
 
L
H
 
C
P
 
P
E
 
T
-
 
P
G
 
D
Y
 
Y
E
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
T
 
M
Q
 
D
G
 
W
A
 
A
T
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
Q
 
I
D
 
D
K
 
S
A
 
A
L
 
Y
A
 
A
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
V
V
 
V
Y
 
Y
V
 
A
K
|
K
N
 
S
W
 
W
S
 
G
A
 
A
F
 
L
N
 
P
E
 
F
Y
 
F
G
 
G
K
 
N
-
 
W
-
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
P
I
 
I
L
 
R
C
 
D
T
 
Q
D
 
Y
E
 
Q
S
 
H
W
 
F
M
 
I
L
 
V
N
 
D
E
 
E
Q
 
R
K
 
K
L
 
M
S
 
A
Q
 
L
A
 
T
P
 
N
N
 
N
A
 
G
K
 
V
V
 
F
M
 
S
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
V
 
L
R
 
R
R
 
R
N
 
N
V
 
V
E
x
K
L
 
A
S
 
T
D
 
D
E
 
A
I
 
V
L
 
M
D
 
D
G
 
S
P
 
P
R
 
N
S
 
C
L
 
I
V
 
A
Q
 
I
H
 
D
Q
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
N
R
|
R
V
 
L
F
 
H
A
 
V
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
I
L
 
M
S
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
V

3kzkA Crystal structure of acetylornithine transcarbamylase complexed with acetylcitrulline (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:312/313 of query aligns to 7:332/334 of 3kzkA

query
sites
3kzkA
T
 
T
Q
 
Q
F
 
D
E
 
W
N
 
S
K
 
R
S
 
A
L
 
E
A
 
L
D
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
T
K
 
Q
A
 
A
L
 
A
E
 
L
Y
 
F
K
 
K
K
 
R
A
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
N
 
N
N
 
K
L
 
L
G
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
I
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
V
F
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
P
S
 
S
L
 
M
R
 
R
T
 
T
R
 
R
V
 
T
S
 
S
T
 
F
Q
 
E
I
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
F
N
 
Q
L
 
L
G
 
G
M
 
G
E
 
H
S
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
N
 
Q
M
 
P
D
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
A
W
 
W
A
 
P
L
 
I
E
 
E
M
 
F
E
 
N
D
 
L
G
 
G
V
 
T
I
 
V
M
 
M
N
 
D
Q
 
G
G
 
D
K
 
T
A
 
E
E
 
E
H
 
H
I
 
I
R
 
A
D
 
E
A
 
V
A
 
A
G
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
R
Y
 
Y
F
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
V
R
|
R
A
 
A
F
 
F
P
 
P
S
 
K
L
 
F
T
 
V
N
 
D
K
 
W
D
 
S
E
 
K
D
 
D
S
 
R
E
 
E
D
 
D
F
 
Q
I
 
V
L
 
L
H
 
K
Q
 
S
F
 
F
A
 
A
K
 
K
H
 
Y
S
 
S
G
 
P
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
N
L
 
M
E
|
E
S
 
T
A
 
-
I
 
I
R
 
T
H
|
H
P
 
P
L
 
C
Q
|
Q
S
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
H
M
 
A
V
 
L
T
 
A
I
 
L
Q
 
Q
E
 
E
H
 
H
-
 
F
-
 
G
-
 
T
K
 
P
Q
 
D
K
 
L
E
 
R
K
 
G
P
 
K
K
 
K
V
 
Y
V
 
V
L
 
L
T
 
T
W
 
W
A
 
T
P
 
Y
H
 
H
I
 
P
K
 
K
A
 
P
I
 
L
P
 
N
H
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
S
F
 
A
A
 
L
E
 
T
W
 
I
S
 
A
I
 
T
G
 
R
C
 
M
G
 
G
H
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
I
 
L
T
 
L
H
 
C
P
 
P
E
 
T
-
 
P
G
 
D
Y
 
Y
E
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
T
 
M
Q
 
D
G
 
W
A
 
A
T
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
Q
 
I
D
 
D
K
 
S
A
 
A
L
 
Y
A
 
A
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
V
V
 
V
Y
 
Y
V
 
A
K
|
K
N
 
S
W
 
W
S
 
G
A
 
A
F
 
L
N
 
P
E
 
F
Y
 
F
G
 
G
K
 
N
-
 
W
-
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
P
I
 
I
L
 
R
C
 
D
T
 
Q
D
 
Y
E
 
Q
S
 
H
W
 
F
M
 
I
L
 
V
N
 
D
E
 
E
Q
 
R
K
 
K
L
 
M
S
 
A
Q
 
L
A
 
T
P
 
N
N
 
N
A
 
G
K
 
V
V
 
F
M
 
S
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
V
 
L
R
 
R
R
 
R
N
 
N
V
 
V
E
 
K
L
 
A
S
 
T
D
 
D
E
 
A
I
 
V
L
 
M
D
 
D
G
 
S
P
 
P
R
 
N
S
 
C
L
 
I
V
 
A
Q
 
I
H
 
D
Q
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
N
R
|
R
V
 
L
F
 
H
A
 
V
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
I
L
 
M
S
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
V

3m4jA Crystal structure of n-acetyl-l-ornithine transcarbamylase complexed with palao (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:312/313 of query aligns to 7:332/332 of 3m4jA

query
sites
3m4jA
T
 
T
Q
 
Q
F
 
D
E
 
W
N
 
S
K
 
R
S
 
A
L
 
E
A
 
L
D
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
T
K
 
Q
A
 
A
L
 
A
E
 
L
Y
 
F
K
 
K
K
 
R
A
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
N
 
N
N
 
K
L
 
L
G
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
I
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
V
F
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
P
S
|
S
L
x
M
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
T
S
 
S
T
 
F
Q
 
E
I
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
F
N
 
Q
L
 
L
G
 
G
M
 
G
E
 
H
S
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
N
 
Q
M
 
P
D
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
A
W
 
W
A
 
P
L
 
I
E
 
E
M
 
F
E
 
N
D
 
L
G
 
G
V
 
T
I
 
V
M
 
M
N
 
D
Q
 
G
G
 
D
K
 
T
A
 
E
E
 
E
H
 
H
I
 
I
R
 
A
D
 
E
A
 
V
A
 
A
G
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
R
Y
 
Y
F
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
V
R
|
R
A
 
A
F
 
F
P
 
P
S
 
K
L
 
F
T
 
V
N
 
D
K
 
W
D
 
S
E
 
K
D
 
D
S
 
R
E
 
E
D
 
D
F
 
Q
I
 
V
L
 
L
H
 
K
Q
 
S
F
 
F
A
 
A
K
 
K
H
 
Y
S
 
S
G
 
P
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
N
L
 
M
E
|
E
S
 
T
A
 
-
I
 
I
R
 
T
H
|
H
P
 
P
L
 
C
Q
|
Q
S
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
H
M
 
A
V
 
L
T
 
A
I
 
L
Q
 
Q
E
 
E
H
 
H
-
 
F
-
 
G
-
 
T
K
 
P
Q
 
D
K
 
L
E
 
R
K
 
G
P
 
K
K
 
K
V
 
Y
V
 
V
L
 
L
T
 
T
W
 
W
A
 
T
P
 
Y
H
 
H
I
 
P
K
 
K
A
 
P
I
x
L
P
 
N
H
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
S
F
 
A
A
 
L
E
 
T
W
 
I
S
 
A
I
 
T
G
 
R
C
 
M
G
 
G
H
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
I
 
L
T
 
L
H
 
C
P
 
P
E
 
T
-
 
P
G
 
D
Y
 
Y
E
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
T
 
M
Q
 
D
G
 
W
A
 
A
T
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
Q
 
I
D
 
D
K
 
S
A
 
A
L
 
Y
A
 
A
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
V
V
 
V
Y
 
Y
V
 
A
K
|
K
N
 
S
W
 
W
S
 
G
A
 
A
F
 
L
N
 
P
E
 
F
Y
 
F
G
 
G
K
 
N
-
 
W
-
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
P
I
 
I
L
 
R
C
 
D
T
 
Q
D
 
Y
E
 
Q
S
 
H
W
 
F
M
 
I
L
 
V
N
 
D
E
 
E
Q
 
R
K
 
K
L
 
M
S
 
A
Q
 
L
A
 
T
P
 
N
N
 
N
A
 
G
K
 
V
V
 
F
M
 
S
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
V
 
L
R
 
R
R
 
R
N
 
N
V
 
V
E
 
K
L
 
A
S
 
T
D
 
D
E
 
A
I
 
V
L
 
M
D
 
D
G
 
S
P
 
P
R
 
N
S
 
C
L
 
I
V
 
A
Q
 
I
H
 
D
Q
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
N
R
|
R
V
 
L
F
 
H
A
 
V
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
I
L
 
M
S
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
V

3kzoA Crystal structure of n-acetyl-l-ornithine transcarbamylase complexed with carbamyl phosphate and n-acetyl-l-norvaline (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:312/313 of query aligns to 7:332/332 of 3kzoA

query
sites
3kzoA
T
 
T
Q
 
Q
F
 
D
E
 
W
N
 
S
K
 
R
S
 
A
L
 
E
A
 
L
D
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
T
K
 
Q
A
 
A
L
 
A
E
 
L
Y
 
F
K
 
K
K
 
R
A
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
N
 
N
N
 
K
L
 
L
G
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
I
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
V
F
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
P
S
|
S
L
x
M
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
T
S
 
S
T
 
F
Q
 
E
I
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
F
N
 
Q
L
 
L
G
 
G
M
 
G
E
 
H
S
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
N
 
Q
M
 
P
D
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
A
W
 
W
A
 
P
L
 
I
E
 
E
M
 
F
E
 
N
D
 
L
G
 
G
V
 
T
I
 
V
M
 
M
N
 
D
Q
 
G
G
 
D
K
 
T
A
 
E
E
 
E
H
 
H
I
 
I
R
 
A
D
 
E
A
 
V
A
 
A
G
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
R
Y
 
Y
F
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
V
R
|
R
A
 
A
F
 
F
P
 
P
S
 
K
L
 
F
T
 
V
N
 
D
K
 
W
D
 
S
E
 
K
D
 
D
S
 
R
E
 
E
D
 
D
F
 
Q
I
 
V
L
 
L
H
 
K
Q
 
S
F
 
F
A
 
A
K
 
K
H
 
Y
S
 
S
G
 
P
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
N
L
 
M
E
|
E
S
 
T
A
 
-
I
 
I
R
 
T
H
|
H
P
 
P
L
 
C
Q
|
Q
S
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
H
M
 
A
V
 
L
T
 
A
I
 
L
Q
 
Q
E
 
E
H
 
H
-
 
F
-
 
G
-
 
T
K
 
P
Q
 
D
K
 
L
E
 
R
K
 
G
P
 
K
K
 
K
V
 
Y
V
 
V
L
 
L
T
 
T
W
 
W
A
 
T
P
 
Y
H
 
H
I
 
P
K
 
K
A
 
P
I
x
L
P
 
N
H
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
S
F
 
A
A
 
L
E
 
T
W
 
I
S
 
A
I
 
T
G
 
R
C
 
M
G
 
G
H
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
I
 
L
T
 
L
H
 
C
P
 
P
E
 
T
-
 
P
G
 
D
Y
 
Y
E
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
T
 
M
Q
 
D
G
 
W
A
 
A
T
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
Q
 
I
D
 
D
K
 
S
A
 
A
L
 
Y
A
 
A
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
V
V
 
V
Y
 
Y
V
 
A
K
|
K
N
 
S
W
 
W
S
 
G
A
 
A
F
 
L
N
 
P
E
 
F
Y
 
F
G
 
G
K
 
N
-
 
W
-
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
P
I
 
I
L
 
R
C
 
D
T
 
Q
D
 
Y
E
 
Q
S
 
H
W
 
F
M
 
I
L
 
V
N
 
D
E
 
E
Q
 
R
K
 
K
L
 
M
S
 
A
Q
 
L
A
 
T
P
 
N
N
 
N
A
 
G
K
 
V
V
 
F
M
 
S
H
 
H
C
|
C
L
 
L
P
 
P
V
 
L
R
 
R
R
 
R
N
 
N
V
 
V
E
 
K
L
 
A
S
 
T
D
 
D
E
 
A
I
 
V
L
 
M
D
 
D
G
 
S
P
 
P
R
 
N
S
 
C
L
 
I
V
 
A
Q
 
I
H
 
D
Q
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
N
R
|
R
V
 
L
F
 
H
A
 
V
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
I
L
 
M
S
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
V

3kznA Crystal structure of n-acetyl-l-ornithine transcarbamylase complexed with n-acetyl-l-ornirthine (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:312/313 of query aligns to 7:332/332 of 3kznA

query
sites
3kznA
T
 
T
Q
 
Q
F
 
D
E
 
W
N
 
S
K
 
R
S
 
A
L
 
E
A
 
L
D
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
T
K
 
Q
A
 
A
L
 
A
E
 
L
Y
 
F
K
 
K
K
 
R
A
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
N
 
N
N
 
K
L
 
L
G
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
I
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
V
F
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
P
S
 
S
L
 
M
R
 
R
T
 
T
R
 
R
V
 
T
S
 
S
T
 
F
Q
 
E
I
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
F
N
 
Q
L
 
L
G
 
G
M
 
G
E
 
H
S
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
N
 
Q
M
 
P
D
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
A
W
 
W
A
 
P
L
 
I
E
 
E
M
 
F
E
 
N
D
 
L
G
 
G
V
 
T
I
 
V
M
 
M
N
 
D
Q
 
G
G
 
D
K
 
T
A
 
E
E
 
E
H
 
H
I
 
I
R
 
A
D
 
E
A
 
V
A
 
A
G
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
R
Y
 
Y
F
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
V
R
|
R
A
 
A
F
|
F
P
 
P
S
 
K
L
 
F
T
 
V
N
 
D
K
 
W
D
 
S
E
 
K
D
 
D
S
 
R
E
 
E
D
 
D
F
 
Q
I
 
V
L
 
L
H
 
K
Q
 
S
F
 
F
A
 
A
K
 
K
H
 
Y
S
 
S
G
 
P
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
N
L
 
M
E
|
E
S
 
T
A
 
-
I
 
I
R
 
T
H
|
H
P
 
P
L
 
C
Q
|
Q
S
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
H
M
 
A
V
 
L
T
 
A
I
 
L
Q
 
Q
E
 
E
H
 
H
-
 
F
-
 
G
-
 
T
K
 
P
Q
 
D
K
 
L
E
 
R
K
 
G
P
 
K
K
 
K
V
 
Y
V
 
V
L
 
L
T
 
T
W
 
W
A
 
T
P
 
Y
H
 
H
I
 
P
K
 
K
A
 
P
I
x
L
P
 
N
H
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
S
F
 
A
A
 
L
E
 
T
W
 
I
S
 
A
I
 
T
G
 
R
C
 
M
G
 
G
H
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
I
 
L
T
 
L
H
 
C
P
 
P
E
 
T
-
 
P
G
 
D
Y
 
Y
E
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
T
 
M
Q
 
D
G
 
W
A
 
A
T
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
Q
 
I
D
 
D
K
 
S
A
 
A
L
 
Y
A
 
A
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
V
V
 
V
Y
 
Y
V
 
A
K
|
K
N
 
S
W
 
W
S
 
G
A
 
A
F
 
L
N
 
P
E
 
F
Y
 
F
G
 
G
K
 
N
-
 
W
-
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
P
I
 
I
L
 
R
C
 
D
T
 
Q
D
 
Y
E
 
Q
S
 
H
W
 
F
M
 
I
L
 
V
N
 
D
E
 
E
Q
 
R
K
 
K
L
 
M
S
 
A
Q
 
L
A
 
T
P
 
N
N
 
N
A
 
G
K
 
V
V
 
F
M
 
S
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
V
 
L
R
 
R
R
 
R
N
 
N
V
 
V
E
 
K
L
 
A
S
 
T
D
 
D
E
 
A
I
 
V
L
 
M
D
 
D
G
 
S
P
 
P
R
 
N
S
 
C
L
 
I
V
 
A
Q
 
I
H
 
D
Q
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
N
R
|
R
V
 
L
F
 
H
A
 
V
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
I
L
 
M
S
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
V

3kzmA Crystal structure of n-acetyl-l-ornithine transcarbamylase complexed with carbamyl phosphate (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:312/313 of query aligns to 7:332/332 of 3kzmA

query
sites
3kzmA
T
 
T
Q
 
Q
F
 
D
E
 
W
N
 
S
K
 
R
S
 
A
L
 
E
A
 
L
D
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
T
K
 
Q
A
 
A
L
 
A
E
 
L
Y
 
F
K
 
K
K
 
R
A
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
N
 
N
N
 
K
L
 
L
G
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
L
R
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
I
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
V
F
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
P
S
 
S
L
x
M
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
T
S
 
S
T
 
F
Q
 
E
I
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
F
N
 
Q
L
 
L
G
 
G
M
 
G
E
 
H
S
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
N
 
Q
M
 
P
D
 
G
K
 
K
E
 
D
S
 
A
W
 
W
A
 
P
L
 
I
E
 
E
M
 
F
E
 
N
D
 
L
G
 
G
V
 
T
I
 
V
M
 
M
N
 
D
Q
 
G
G
 
D
K
 
T
A
 
E
E
 
E
H
 
H
I
 
I
R
 
A
D
 
E
A
 
V
A
 
A
G
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
R
Y
 
Y
F
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
V
R
|
R
A
 
A
F
 
F
P
 
P
S
 
K
L
 
F
T
 
V
N
 
D
K
 
W
D
 
S
E
 
K
D
 
D
S
 
R
E
 
E
D
 
D
F
 
Q
I
 
V
L
 
L
H
 
K
Q
 
S
F
 
F
A
 
A
K
 
K
H
 
Y
S
 
S
G
 
P
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
N
L
 
M
E
 
E
S
 
T
A
 
-
I
 
I
R
 
T
H
|
H
P
 
P
L
 
C
Q
|
Q
S
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
H
M
 
A
V
 
L
T
 
A
I
 
L
Q
 
Q
E
 
E
H
 
H
-
 
F
-
 
G
-
 
T
K
 
P
Q
 
D
K
 
L
E
 
R
K
 
G
P
 
K
K
 
K
V
 
Y
V
 
V
L
 
L
T
 
T
W
 
W
A
 
T
P
 
Y
H
 
H
I
 
P
K
 
K
A
 
P
I
 
L
P
 
N
H
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
S
F
 
A
A
 
L
E
 
T
W
 
I
S
 
A
I
 
T
G
 
R
C
 
M
G
 
G
H
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
I
 
L
T
 
L
H
 
C
P
 
P
E
 
T
-
 
P
G
 
D
Y
 
Y
E
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
T
 
M
Q
 
D
G
 
W
A
 
A
T
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
Q
 
I
D
 
D
K
 
S
A
 
A
L
 
Y
A
 
A
N
 
G
A
 
A
D
 
D
F
 
V
V
 
V
Y
 
Y
V
 
A
K
|
K
N
 
S
W
 
W
S
 
G
A
 
A
F
 
L
N
 
P
E
 
F
Y
 
F
G
 
G
K
 
N
-
 
W
-
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
P
I
 
I
L
 
R
C
 
D
T
 
Q
D
 
Y
E
 
Q
S
 
H
W
 
F
M
 
I
L
 
V
N
 
D
E
 
E
Q
 
R
K
 
K
L
 
M
S
 
A
Q
 
L
A
 
T
P
 
N
N
 
N
A
 
G
K
 
V
V
 
F
M
 
S
H
 
H
C
|
C
L
|
L
P
 
P
V
 
L
R
 
R
R
 
R
N
 
N
V
 
V
E
 
K
L
 
A
S
 
T
D
 
D
E
 
A
I
 
V
L
 
M
D
 
D
G
 
S
P
 
P
R
 
N
S
 
C
L
 
I
V
 
A
Q
 
I
H
 
D
Q
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
N
R
|
R
V
 
L
F
 
H
A
 
V
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
I
L
 
M
S
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
V

Q51742 Ornithine carbamoyltransferase, anabolic; OTCase; EC 2.1.3.3 from Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1) (see 3 papers)
32% identity, 90% coverage: 31:312/313 of query aligns to 41:310/315 of Q51742

query
sites
Q51742
N
 
H
N
 
R
L
 
L
G
 
L
R
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
T
I
 
L
G
 
A
L
 
M
L
 
I
F
 
F
L
 
Q
N
 
K
P
 
P
S
 
S
L
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
V
 
V
S
 
S
T
 
F
Q
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
M
S
 
A
N
 
H
L
 
L
G
 
G
M
 
G
E
 
H
S
 
A
I
 
L
V
 
Y
L
 
L
N
 
N
M
 
A
D
 
Q
K
 
D
E
 
-
S
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
Q
M
 
L
E
 
R
D
 
R
G
 
G
V
 
-
I
 
-
M
 
-
N
 
-
Q
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
E
 
E
H
 
T
I
 
I
R
 
A
D
 
D
A
 
T
A
 
A
G
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
S
S
 
R
Y
 
Y
F
 
V
D
 
D
I
 
A
L
 
I
A
 
M
L
 
A
R
 
R
A
 
V
F
 
Y
P
 
D
S
 
H
L
 
-
T
 
-
N
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
K
D
 
D
S
 
V
E
 
E
D
 
D
F
 
L
I
 
-
L
 
-
H
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
A
K
 
K
H
 
Y
S
 
A
G
 
T
L
 
V
P
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
N
L
 
G
E
 
L
S
 
S
A
 
D
I
 
F
R
 
S
H
 
H
P
 
P
L
 
C
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
Y
V
 
M
T
 
T
I
 
I
Q
 
W
E
 
E
H
 
K
K
 
K
Q
 
G
K
 
T
E
 
I
K
 
K
P
 
G
-
 
V
K
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
Y
T
 
V
W
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
G
I
 
D
P
 
G
H
 
N
A
 
N
V
 
V
A
 
A
N
 
H
S
 
S
F
 
L
A
 
M
E
 
I
W
 
A
S
 
G
I
 
T
G
 
K
C
 
L
G
 
G
H
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
V
I
 
V
T
 
A
H
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
L
 
P
D
 
D
E
 
E
R
 
K
F
 
V
T
 
I
Q
 
K
-
 
W
-
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
S
G
 
G
A
 
G
T
 
S
I
 
F
E
 
E
-
 
L
-
 
L
H
 
H
D
 
D
Q
 
P
D
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
K
N
 
D
A
 
A
D
 
D
F
 
V
V
 
I
Y
|
Y
V
 
T
K
 
D
N
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
S
F
 
M
N
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
A
-
 
E
-
x
A
-
 
E
E
 
E
Y
 
R
G
 
R
K
 
K
I
 
I
L
 
F
C
 
-
T
 
-
D
 
-
E
 
R
S
 
P
W
 
F
M
 
Q
L
 
V
N
 
N
E
 
K
Q
 
D
K
 
L
L
 
V
S
 
K
Q
 
H
A
 
A
-
 
K
P
 
P
N
 
D
A
 
Y
K
 
M
V
 
F
M
 
M
H
 
H
C
 
C
L
 
L
P
 
P
V
 
A
R
 
H
R
 
R
N
 
G
V
 
E
E
|
E
L
 
V
S
 
T
D
 
D
E
 
D
I
 
V
L
 
I
D
 
D
G
 
S
P
 
P
R
 
N
S
 
S
L
 
V
V
 
V
Q
 
W
H
 
D
Q
 
Q
A
 
A
K
 
E
N
 
N
R
 
R
V
 
L
F
 
H
A
 
A
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
L
S
 
A
E
 
L
L
 
V
L
 
M

Sites not aligning to the query:

Q81M99 Ornithine carbamoyltransferase; OTCase; EC 2.1.3.3 from Bacillus anthracis
30% identity, 95% coverage: 16:313/313 of query aligns to 28:310/316 of Q81M99

query
sites
Q81M99
L
 
L
I
 
I
Q
 
E
K
 
F
A
 
A
L
 
I
E
 
Y
Y
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
N
P
 
-
L
 
-
S
 
K
D
 
Q
N
 
E
N
 
P
L
 
L
G
 
L
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
I
I
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
I
F
 
F
L
 
D
N
 
K
P
 
H
S
|
S
L
x
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
V
S
 
S
T
 
F
Q
 
E
I
 
A
A
 
G
A
 
M
S
 
V
N
 
Q
L
 
L
G
 
G
M
 
G
E
 
H
S
 
G
I
 
M
V
 
F
L
 
L
N
 
N
M
 
-
D
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
G
V
 
K
I
 
E
M
 
M
N
x
Q
Q
 
M
G
 
G
K
 
R
A
 
G
E
 
E
H
 
T
I
 
V
R
 
S
D
 
D
A
 
T
A
 
A
G
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
S
S
 
H
Y
 
Y
F
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
I
A
 
M
L
 
I
R
|
R
A
 
T
F
 
F
P
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
S
N
 
H
K
 
A
D
 
D
E
 
-
D
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
-
F
 
-
I
 
-
L
 
V
H
 
E
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
K
 
K
H
 
E
S
 
S
G
 
S
L
 
I
P
 
P
L
 
V
I
 
I
S
 
N
L
 
G
E
 
L
S
 
T
A
 
D
I
 
D
R
 
H
H
|
H
P
|
P
L
x
C
Q
|
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
L
V
 
M
T
 
T
I
 
I
Q
 
Y
E
 
E
H
 
E
K
 
T
Q
 
N
K
 
T
E
 
F
K
 
K
P
 
-
K
 
G
V
 
I
V
 
K
L
 
L
T
 
A
W
 
Y
A
 
V
P
 
G
H
 
D
I
 
G
K
 
N
A
x
N
I
 
V
P
 
C
H
 
H
A
 
S
V
 
L
A
 
L
N
 
L
S
 
A
F
 
S
A
 
A
E
 
K
W
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
C
 
V
G
 
G
H
 
M
D
 
H
V
 
M
T
 
T
I
 
V
T
 
A
H
 
T
P
 
P
E
 
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
K
L
 
P
D
 
N
E
 
E
R
 
E
F
 
I
T
 
V
Q
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
E
I
 
I
E
 
E
-
 
I
-
 
L
H
 
H
D
 
N
Q
 
P
D
 
E
K
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
N
N
 
E
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
Y
 
Y
V
 
T
K
x
D
N
 
V
W
 
W
S
 
M
A
x
S
F
x
M
N
 
G
E
 
Q
Y
 
E
G
 
G
K
 
E
-
 
E