SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_3951 Echvi_3951 Proline racemase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 19 hits to proteins with known functional sites (download)

Q2YLF3 4-hydroxyproline epimerase; Hydroxyproline-2-epimerase; HyPRE; EC 5.1.1.8 from Brucella abortus (strain 2308) (see paper)
62% identity, 99% coverage: 2:331/332 of query aligns to 3:332/333 of Q2YLF3

query
sites
Q2YLF3
K
 
R
K
 
H
T
 
S
F
 
F
S
 
F
C
 
C
I
 
V
D
 
D
A
 
G
H
 
H
T
 
T
C
 
C
G
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
R
 
R
V
 
L
V
 
V
T
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
G
P
 
P
F
 
N
L
 
L
E
 
N
G
 
G
E
 
S
N
 
T
M
 
M
F
 
M
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
A
F
 
H
F
 
F
I
 
L
K
 
A
H
 
E
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
I
 
I
R
 
R
R
 
T
G
 
G
L
 
L
M
 
M
F
 
F
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
D
M
 
M
M
 
M
S
 
S
G
 
G
S
 
S
M
 
I
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
P
 
P
H
 
T
D
 
R
P
 
P
E
 
D
N
 
C
D
 
D
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
L
Y
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
S
 
S
G
 
G
C
 
C
L
 
L
P
 
P
M
 
M
C
 
C
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
V
T
 
T
V
 
M
A
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
V
T
 
T
P
 
P
K
 
K
V
 
T
P
 
P
G
 
G
K
 
K
L
 
L
R
 
N
L
 
L
E
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
A
V
 
I
S
 
E
Y
 
Y
T
 
E
Q
 
Q
E
 
D
G
 
G
E
 
Q
K
 
Y
V
 
V
T
 
E
S
 
R
V
 
V
K
 
R
L
 
L
T
 
T
N
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
Y
A
 
A
K
 
E
D
 
G
L
 
L
N
 
E
I
 
V
S
 
E
C
 
C
D
 
P
V
 
D
L
 
L
G
 
G
E
 
P
L
 
I
I
 
K
F
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
I
 
V
E
 
E
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
N
 
N
F
 
Y
G
 
T
G
 
D
L
 
M
Q
 
D
D
 
D
F
 
Y
T
 
S
A
 
A
E
 
L
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
T
 
A
M
 
W
S
 
S
R
 
P
K
 
V
L
 
L
R
 
R
K
 
Q
A
 
R
I
 
L
N
 
N
E
 
E
V
 
K
Y
 
Y
T
 
K
F
 
F
V
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
E
N
 
L
S
 
P
R
 
D
I
 
I
N
 
N
G
 
R
L
 
L
S
 
S
H
 
H
I
 
I
Q
 
L
W
 
W
I
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
P
L
 
K
D
 
H
E
 
P
H
 
Q
S
 
A
H
 
H
G
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
K
 
K
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
R
M
 
M
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
A
S
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
P
N
 
C
E
 
D
P
 
E
F
 
F
V
 
I
N
 
H
E
 
E
S
 
S
Y
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
L
F
 
F
T
 
H
G
 
G
E
 
R
I
 
V
I
 
E
G
 
R
E
 
A
T
 
A
N
 
E
V
 
V
G
 
A
D
 
G
Y
 
R
D
 
P
A
 
A
I
 
I
I
 
V
P
 
P
S
 
S
I
 
I
E
 
A
G
 
G
W
 
W
A
 
A
K
 
R
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
T
 
T
I
 
I
F
 
F
L
 
I
D
 
D
D
 
D
D
 
R
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
V
 
A
H
 
H
G
 
G
F
 
F
Q
 
S
V
 
M

7pb3AAA Proline racemase A (AsProR)
40% identity, 99% coverage: 3:331/332 of query aligns to 5:335/335 of 7pb3AAA

query
sites
7pb3AAA
K
 
K
T
 
G
F
 
I
S
 
H
C
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
S
H
 
H
T
 
T
C
 
M
G
 
G
N
 
E
P
 
P
V
 
T
R
 
R
V
 
I
V
 
V
T
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
I
P
 
P
F
 
Q
L
 
I
E
 
N
G
 
G
E
 
E
N
 
T
M
 
M
F
 
A
E
 
D
K
 
K
R
 
K
Q
 
K
F
 
Y
F
 
L
I
 
E
K
 
D
H
 
N
Y
 
L
D
 
D
W
 
Y
I
 
V
R
 
R
R
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
M
F
 
H
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
N
M
 
D
M
 
M
S
 
F
G
 
G
S
 
S
M
 
I
L
 
I
Y
 
T
P
 
S
P
 
S
H
 
N
D
 
N
P
 
K
E
 
E
N
 
A
D
 
D
V
 
F
A
 
G
V
 
I
L
 
I
Y
 
F
I
 
M
E
 
D
T
 
G
S
 
G
G
 
G
C
 
Y
L
 
L
P
 
N
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
G
 
G
T
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
A
V
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
E
 
E
E
 
T
G
 
G
L
 
M
I
 
V
T
 
E
P
 
M
K
 
V
V
 
E
P
 
P
-
 
V
G
 
T
K
 
N
L
 
I
R
 
N
L
 
M
E
 
E
T
 
A
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
K
V
 
A
S
 
K
Y
 
V
T
 
M
Q
 
V
E
 
E
G
 
N
E
 
E
K
 
K
V
 
V
T
 
K
S
 
E
V
 
V
K
 
S
L
 
I
T
 
T
N
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
S
F
 
F
V
 
L
I
 
Y
A
 
M
K
 
E
D
 
D
L
 
A
N
 
K
I
 
L
S
 
E
C
 
V
D
 
P
V
 
S
L
 
L
G
 
N
E
 
K
L
 
T
I
 
I
-
 
T
F
 
F
D
 
D
V
 
I
S
 
S
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
S
F
 
F
Y
 
F
A
 
A
I
 
I
I
 
I
E
 
H
P
 
A
Q
 
K
E
 
E
N
 
L
F
 
G
G
 
V
G
 
K
L
 
V
Q
 
E
D
 
T
F
 
S
T
 
Q
A
 
V
E
 
D
Q
 
V
L
 
L
I
 
K
T
 
K
M
 
L
S
 
G
R
 
I
K
 
E
L
 
I
R
 
R
K
 
D
A
 
L
I
 
I
N
 
N
E
 
E
V
 
K
Y
 
I
T
 
K
F
 
V
V
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
E
N
 
L
S
 
E
R
 
H
I
 
I
N
 
K
G
 
T
L
 
V
S
 
D
H
 
L
I
 
V
Q
 
E
W
 
I
I
 
Y
G
 
D
R
 
E
T
 
P
L
 
S
D
 
N
E
 
P
H
 
E
S
 
A
H
 
T
G
 
Y
R
 
K
N
 
N
A
 
V
V
 
V
F
 
I
Y
x
F
G
 
G
D
 
Q
K
 
G
A
 
Q
I
 
V
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
M
 
L
A
 
A
Q
 
T
L
 
L
Y
 
Y
S
 
K
R
 
K
G
 
G
L
 
H
L
 
L
K
 
K
A
 
I
N
 
D
E
 
E
P
 
K
F
 
F
V
 
V
N
 
Y
E
 
E
S
 
S
Y
 
I
I
 
T
G
 
G
S
 
T
T
 
M
F
 
F
T
 
K
G
 
G
E
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
E
E
 
E
T
 
T
N
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
E
Y
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
I
P
 
P
S
 
E
I
 
I
E
 
T
G
 
G
W
 
G
A
 
A
K
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
N
 
N
T
 
H
I
 
F
F
 
V
L
 
I
D
 
D
D
 
P
D
 
E
D
 
D
P
 
P
Y
 
L
V
 
K
H
 
Y
G
 
G
F
 
F
Q
 
T
V
 
V

1w61A Proline racemase in complex with 2 molecules of pyrrole-2- carboxylic acid (holo form) (see paper)
39% identity, 99% coverage: 2:329/332 of query aligns to 2:348/353 of 1w61A

query
sites
1w61A
K
 
K
K
 
K
T
 
S
F
 
F
S
 
T
C
 
C
I
 
I
D
 
D
A
 
M
H
 
H
T
 
T
C
 
E
G
 
G
N
 
E
P
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
S
G
 
G
L
 
L
P
 
P
F
 
H
L
 
I
E
 
P
G
 
G
E
 
S
N
 
N
M
 
M
F
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
K
Q
 
A
F
 
Y
F
 
L
I
 
Q
K
 
E
H
 
N
Y
 
M
D
 
D
W
 
Y
I
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
M
 
M
F
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
D
M
 
D
M
 
M
S
x
F
G
 
G
S
 
A
M
 
F
L
 
L
Y
 
F
P
 
D
P
 
P
H
 
I
D
 
E
P
 
E
E
 
G
N
 
A
D
 
D
V
 
L
A
 
G
V
 
I
L
 
V
Y
 
F
I
 
M
E
 
D
T
 
T
S
 
G
G
 
G
C
 
Y
L
|
L
P
 
N
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
G
 
N
T
 
S
I
 
I
G
 
A
T
 
A
V
 
V
T
 
T
V
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
E
E
 
T
G
 
G
L
 
I
I
 
V
T
 
S
P
 
-
K
 
-
V
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
P
L
 
V
R
 
V
L
 
L
E
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
R
-
 
G
V
 
T
S
 
A
Y
 
H
T
 
L
Q
 
Q
E
 
S
G
 
G
-
 
T
-
 
E
E
 
S
K
 
E
V
 
V
T
 
S
S
 
N
V
 
A
K
 
S
L
 
I
T
 
I
N
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
S
F
 
F
V
 
L
I
 
Y
A
 
Q
K
 
Q
D
 
D
L
 
V
N
 
V
I
 
V
S
 
V
C
 
L
-
 
P
D
 
K
V
 
P
L
 
Y
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
R
F
 
V
D
 
D
V
 
I
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
F
Y
 
F
A
 
A
I
 
I
I
 
V
E
 
-
P
 
P
Q
 
A
E
 
E
N
 
Q
F
 
L
G
 
G
G
 
-
L
 
-
Q
 
I
D
 
D
F
 
I
T
 
S
A
 
V
E
 
Q
Q
 
N
L
 
L
I
 
S
T
 
R
M
 
L
S
 
Q
R
 
E
K
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
T
A
 
E
I
 
I
N
 
N
E
 
R
V
 
S
Y
 
V
T
 
K
F
 
V
V
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
Q
N
 
L
S
 
P
R
 
H
I
 
I
N
 
N
G
 
T
L
 
V
S
 
D
H
 
C
I
 
V
Q
 
E
W
 
I
I
 
Y
G
 
G
R
 
P
T
 
P
L
 
T
D
 
N
E
 
P
H
 
E
S
 
A
H
 
N
G
 
Y
R
 
K
N
 
N
A
 
V
V
 
V
F
 
I
Y
x
F
G
 
G
D
 
N
K
 
R
A
 
Q
I
 
A
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
A
Q
 
T
L
 
L
Y
 
Y
S
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
R
A
 
I
N
 
G
E
 
E
P
 
T
F
 
F
V
 
V
N
 
Y
E
 
E
S
 
S
Y
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
T
 
L
F
 
F
T
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
G
E
 
E
T
 
E
N
 
R
V
 
I
G
 
P
D
 
G
Y
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
K
D
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
V
I
 
V
I
 
T
P
 
A
S
 
E
I
 
I
E
 
T
G
 
G
W
 
K
A
 
A
K
 
F
I
 
I
T
 
M
G
 
G
Y
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
M
F
 
L
L
 
F
D
 
D
D
 
P
D
 
T
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
V
 
K
H
 
N
G
 
G
F
 
F

6hjgB Trypanosoma cruzi proline racemase in complex with inhibitor oxopa (see paper)
39% identity, 99% coverage: 2:329/332 of query aligns to 23:369/376 of 6hjgB

query
sites
6hjgB
K
 
K
K
 
K
T
 
S
F
 
F
S
 
T
C
 
C
I
 
I
D
 
D
A
 
M
H
 
H
T
 
T
C
 
E
G
 
G
N
 
E
P
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
S
G
 
G
L
 
L
P
 
P
F
 
H
L
 
I
E
 
P
G
 
G
E
 
S
N
 
N
M
 
M
F
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
K
Q
 
A
F
 
Y
F
 
L
I
 
Q
K
 
E
H
 
N
Y
 
M
D
 
D
W
 
Y
I
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
M
 
M
F
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
D
M
 
D
M
 
M
S
x
F
G
 
G
S
 
A
M
 
F
L
 
L
Y
 
F
P
 
D
P
 
P
H
 
I
D
 
E
P
 
E
E
 
G
N
 
A
D
 
D
V
 
L
A
 
G
V
 
I
L
 
V
Y
 
F
I
 
M
E
 
D
T
 
T
S
 
G
G
 
G
C
 
Y
L
 
L
P
 
N
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
G
 
N
T
 
S
I
 
I
G
 
A
T
 
A
V
 
V
T
 
T
V
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
E
E
 
T
G
 
G
L
 
I
I
 
V
T
 
S
P
 
-
K
 
-
V
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
P
L
 
V
R
 
V
L
 
L
E
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
R
-
 
G
V
 
T
S
 
A
Y
 
H
T
 
L
Q
 
Q
E
 
S
G
 
G
-
 
T
-
 
E
E
 
S
K
 
E
V
 
V
T
 
S
S
 
N
V
 
A
K
 
S
L
 
I
T
 
I
N
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
S
F
 
F
V
 
L
I
 
Y
A
 
Q
K
 
Q
D
 
D
L
 
V
N
 
V
I
 
V
S
 
V
C
 
L
-
 
P
D
 
K
V
 
P
L
 
Y
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
R
F
 
V
D
 
D
V
 
I
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
F
Y
 
F
A
 
A
I
 
I
I
 
V
E
 
-
P
 
P
Q
 
A
E
 
E
N
 
Q
F
 
L
G
 
G
G
 
-
L
 
-
Q
 
I
D
 
D
F
 
I
T
 
S
A
 
V
E
 
Q
Q
 
N
L
 
L
I
 
S
T
 
R
M
 
L
S
 
Q
R
 
E
K
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
T
A
 
E
I
 
I
N
 
N
E
 
R
V
 
S
Y
 
V
T
 
K
F
 
V
V
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
Q
N
 
L
S
 
P
R
 
H
I
 
I
N
 
N
G
 
T
L
 
V
S
 
D
H
 
C
I
 
V
Q
 
E
W
 
I
I
 
Y
G
 
G
R
 
P
T
 
P
L
 
T
D
 
N
E
 
P
H
 
E
S
 
A
H
 
N
G
 
Y
R
 
K
N
 
N
A
 
V
V
 
V
F
 
I
Y
 
F
G
 
G
D
 
N
K
 
R
A
 
Q
I
 
A
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
A
Q
 
T
L
 
L
Y
 
Y
S
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
R
A
 
I
N
 
G
E
 
E
P
 
T
F
 
F
V
 
V
N
 
Y
E
 
E
S
 
S
Y
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
T
 
L
F
 
F
T
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
G
E
 
E
T
 
E
N
 
R
V
 
I
G
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
V
D
 
T
Y
 
K
D
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
V
I
 
V
I
 
T
P
 
A
S
 
E
I
 
I
E
 
T
G
 
G
W
 
K
A
 
A
K
 
F
I
 
I
T
 
M
G
 
G
Y
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
M
F
 
L
L
 
F
D
 
D
D
 
P
D
 
T
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
V
 
K
H
 
N
G
 
G
F
 
F

Q4DA80 Proline racemase A; TcPA45-A; TcPRACA; rTcPA45; EC 5.1.1.4 from Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (see 2 papers)
39% identity, 99% coverage: 2:329/332 of query aligns to 73:419/423 of Q4DA80

query
sites
Q4DA80
K
 
K
K
 
K
T
 
S
F
 
F
S
 
T
C
 
C
I
 
I
D
 
D
A
 
M
H
 
H
T
 
T
C
 
E
G
 
G
N
 
E
P
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
S
G
 
G
L
 
L
P
 
P
F
 
H
L
 
I
E
 
P
G
 
G
E
 
S
N
 
N
M
 
M
F
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
K
Q
 
A
F
 
Y
F
 
L
I
 
Q
K
 
E
H
 
N
Y
 
M
D
 
D
W
 
Y
I
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
M
 
M
F
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
D
M
 
D
M
 
M
S
 
F
G
 
G
S
 
A
M
 
F
L
 
L
Y
 
F
P
 
D
P
 
P
H
 
I
D
 
E
P
 
E
E
 
G
N
 
A
D
 
D
V
 
L
A
 
G
V
 
M
L
 
V
Y
 
F
I
 
M
E
 
D
T
 
T
S
 
G
G
 
G
C
 
Y
L
 
L
P
 
N
M
 
M
C
|
C
G
 
G
H
 
H
G
 
N
T
 
S
I
 
I
G
 
A
T
 
A
V
 
V
T
 
T
V
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
E
E
 
T
G
 
G
L
 
I
I
 
V
T
 
S
P
 
-
K
 
-
V
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
P
L
 
V
R
 
V
L
 
L
E
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
R
-
 
G
V
 
T
S
 
A
Y
 
H
T
 
L
Q
 
Q
E
 
S
G
 
G
-
 
T
-
 
E
E
 
S
K
 
E
V
 
V
T
 
S
S
 
N
V
 
A
K
 
S
L
 
I
T
 
I
N
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
S
F
 
F
V
 
L
I
 
Y
A
 
Q
K
 
Q
D
 
D
L
 
V
N
 
V
I
 
V
S
 
V
C
 
L
-
 
P
D
 
K
V
 
P
L
 
Y
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
R
F
 
V
D
 
D
V
 
I
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
F
Y
 
F
A
 
A
I
 
I
I
 
V
E
 
-
P
 
P
Q
 
A
E
 
E
N
 
Q
F
 
L
G
 
G
G
 
-
L
 
-
Q
 
I
D
 
D
F
 
I
T
 
S
A
 
V
E
 
Q
Q
 
N
L
 
L
I
 
S
T
 
R
M
 
L
S
 
Q
R
 
E
K
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
T
A
 
E
I
 
I
N
 
N
E
 
R
V
 
S
Y
 
V
T
 
K
F
 
V
V
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
Q
N
 
L
S
 
P
R
 
H
I
 
I
N
 
N
G
 
T
L
 
V
S
 
D
H
 
C
I
 
V
Q
 
E
W
 
I
I
 
Y
G
 
G
R
 
P
T
 
P
L
 
T
D
 
N
E
 
P
H
 
E
S
 
A
H
 
N
G
 
Y
R
 
K
N
 
N
A
 
V
V
 
V
F
 
I
Y
 
F
G
 
G
D
 
N
K
 
R
A
 
Q
I
 
A
D
 
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
A
Q
 
T
L
 
L
Y
 
Y
S
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
R
A
 
I
N
 
G
E
 
E
P
 
T
F
 
F
V
 
V
N
 
Y
E
 
E
S
 
S
Y
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
T
 
L
F
 
F
T
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
G
E
 
E
T
 
E
N
 
R
V
 
I
G
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
V
D
 
T
Y
 
K
D
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
V
I
 
V
I
 
T
P
 
A
S
 
E
I
 
I
E
 
T
G
 
G
W
 
K
A
 
A
K
 
F
I
 
I
T
 
M
G
 
G
Y
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
M
F
 
L
L
 
F
D
 
D
D
 
P
D
 
T
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
V
 
K
H
 
N
G
 
G
F
 
F

6hjeA Trypanosoma cruzi proline racemase in complex with inhibitor ng-p27 (see paper)
39% identity, 99% coverage: 2:329/332 of query aligns to 6:352/357 of 6hjeA

query
sites
6hjeA
K
 
K
K
 
K
T
 
S
F
 
F
S
 
T
C
 
C
I
 
I
D
 
D
A
 
M
H
 
H
T
 
T
C
 
E
G
 
G
N
 
E
P
 
A
V
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
S
G
 
G
L
 
L
P
 
P
F
 
H
L
 
I
E
 
P
G
 
G
E
 
S
N
 
N
M
 
M
F
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
K
Q
 
A
F
 
Y
F
 
L
I
 
Q
K
 
E
H
 
N
Y
 
M
D
 
D
W
 
Y
I
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
M
 
M
F
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
D
M
 
D
M
 
M
S
x
F
G
 
G
S
 
A
M
 
F
L
 
L
Y
 
F
P
 
D
P
 
P
H
 
I
D
 
E
P
 
E
E
 
G
N
 
A
D
 
D
V
 
L
A
 
G
V
 
I
L
 
V
Y
 
F
I
 
M
E
 
D
T
 
T
S
 
G
G
 
G
C
 
Y
L
|
L
P
 
N
M
|
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
G
 
N
T
 
S
I
 
I
G
 
A
T
 
A
V
 
V
T
 
T
V
 
A
A
 
A
I
 
V
E
 
E
E
 
T
G
 
G
L
 
I
I
 
V
T
 
S
P
 
-
K
 
-
V
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
P
L
 
V
R
 
V
L
 
L
E
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
R
-
 
G
V
 
T
S
 
A
Y
 
H
T
 
L
Q
 
Q
E
 
S
G
 
G
-
 
T
-
 
E
E
 
S
K
 
E
V
 
V
T
 
S
S
 
N
V
 
A
K
 
S
L
 
I
T
 
I
N
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
S
F
 
F
V
 
L
I
 
Y
A
 
Q
K
 
Q
D
 
D
L
 
V
N
 
V
I
 
V
S
 
V
C
 
L
-
 
P
D
 
K
V
 
P
L
 
Y
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
R
F
 
V
D
 
D
V
 
I
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
F
Y
 
F
A
 
A
I
 
I
I
 
V
E
 
-
P
 
P
Q
 
A
E
 
E
N
 
Q
F
 
L
G
 
G
G
 
-
L
 
-
Q
 
I
D
 
D
F
 
I
T
 
S
A
 
V
E
 
Q
Q
 
N
L
 
L
I
 
S
T
 
R
M
 
L
S
 
Q
R
 
E
K
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
T
A
 
E
I
 
I
N
 
N
E
 
R
V
 
S
Y
 
V
T
 
K
F
 
V
V
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
Q
N
 
L
S
 
P
R
 
H
I
 
I
N
 
N
G
 
T
L
 
V
S
 
D
H
 
C
I
 
V
Q
 
E
W
 
I
I
 
Y
G
 
G
R
 
P
T
 
P
L
 
T
D
 
N
E
 
P
H
 
E
S
 
A
H
 
N
G
 
Y
R
 
K
N
 
N
A
 
V
V
|
V
F
 
I
Y
x
F
G
 
G
D
 
N
K
 
R
A
 
Q
I
 
A
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
A
Q
 
T
L
 
L
Y
 
Y
S
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
K
 
R
A
 
I
N
 
G
E
 
E
P
 
T
F
 
F
V
 
V
N
 
Y
E
 
E
S
 
S
Y
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
S
T
 
L
F
 
F
T
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
G
E
 
E
T
 
E
N
 
R
V
 
I
G
 
P
D
 
G
Y
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
K
D
 
D
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
V
I
 
V
I
 
T
P
 
A
S
 
E
I
 
I
E
 
T
G
 
G
W
 
K
A
 
A
K
 
F
I
 
I
T
 
M
G
 
G
Y
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
M
F
 
L
L
 
F
D
 
D
D
 
P
D
 
T
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
V
 
K
H
 
N
G
 
G
F
 
F

6r77A Crystal structure of trans-3-hydroxy-l-proline dehydratase in complex with substrate - closed conformation (see paper)
38% identity, 98% coverage: 4:329/332 of query aligns to 19:345/348 of 6r77A

query
sites
6r77A
T
 
V
F
 
I
S
 
K
C
 
T
I
 
L
D
 
D
A
 
T
H
 
H
T
 
T
C
 
A
G
 
G
N
x
E
P
 
P
V
 
L
R
 
R
V
 
I
V
 
I
T
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
F
P
 
P
F
 
E
L
 
I
E
 
P
G
 
G
E
 
K
N
 
T
M
 
I
F
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
R
F
 
Y
F
 
L
I
 
M
K
 
E
H
 
N
Y
 
L
D
 
D
W
 
H
I
 
L
R
 
R
R
 
K
G
 
A
L
 
L
M
 
M
F
 
W
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
A
M
 
D
M
 
M
S
x
Y
G
 
G
S
 
A
M
 
I
L
 
I
Y
 
T
P
 
E
P
 
P
H
 
V
D
 
S
P
 
E
E
 
E
N
 
A
D
 
D
V
 
F
A
 
G
V
 
V
L
 
I
Y
 
F
I
 
M
E
 
H
T
 
N
S
 
E
G
 
G
C
 
Y
L
 
S
P
 
T
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
G
 
A
T
 
T
I
 
I
G
 
A
T
 
L
V
 
G
T
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
E
 
E
E
 
C
G
 
G
L
 
L
I
 
V
T
 
E
P
 
A
K
 
K
V
 
E
P
 
P
-
 
I
G
 
T
K
 
E
L
 
I
R
 
K
L
 
M
E
 
D
T
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
L
 
K
V
 
I
S
 
Y
Y
 
V
T
 
K
Q
 
V
E
 
R
G
 
D
E
 
G
K
 
K
V
 
V
T
 
E
S
 
K
V
 
V
K
 
Y
L
 
F
T
 
H
N
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
S
F
 
F
V
 
V
I
 
L
A
 
F
K
 
K
D
 
D
L
 
E
N
 
T
I
 
I
S
 
N
C
 
V
D
 
P
V
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
K
F
 
Y
D
 
D
V
 
L
S
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
N
 
A
F
 
F
Y
|
Y
A
 
A
I
 
F
I
 
V
E
 
N
P
 
A
Q
 
E
E
 
E
N
 
I
F
 
G
G
 
L
G
 
K
L
 
C
Q
 
T
D
 
P
F
 
E
T
 
Y
A
 
Y
E
 
R
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
T
 
D
M
 
V
S
 
G
R
 
M
K
 
K
L
 
I
R
 
K
K
 
R
A
 
A
I
 
I
N
 
M
E
 
S
V
 
E
Y
 
K
T
 
E
F
 
I
V
 
R
H
 
H
P
 
P
E
 
F
N
 
E
S
 
E
R
 
D
I
 
L
N
 
S
G
 
F
L
 
L
S
x
Y
H
 
G
I
 
T
Q
 
I
W
 
F
I
 
I
G
 
G
R
 
E
T
 
P
L
 
E
D
 
D
E
 
E
H
 
N
S
 
S
H
 
H
G
 
S
R
 
R
N
 
H
A
 
V
V
 
C
F
 
I
Y
x
F
G
 
A
D
 
D
K
 
G
A
 
E
I
 
V
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
x
T
G
|
G
T
|
T
G
 
G
T
 
V
S
 
S
A
 
A
R
 
R
M
 
L
A
 
A
Q
 
I
L
 
L
Y
 
Y
S
 
E
R
 
K
G
 
G
L
 
E
L
 
I
K
 
D
A
 
I
N
 
G
E
 
E
P
 
E
F
 
I
V
 
T
N
 
I
E
 
E
S
 
S
Y
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
T
T
 
K
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
K
I
 
V
I
 
V
G
 
E
E
 
E
T
 
T
N
 
R
V
 
Y
G
 
G
D
 
L
Y
 
Y
D
 
R
A
 
A
I
 
I
I
 
I
P
 
P
S
 
E
I
 
V
E
 
G
G
 
G
W
 
N
A
 
A
K
 
Y
I
 
I
T
 
V
G
 
A
Y
 
K
N
 
N
T
 
T
I
 
F
F
 
L
L
 
I
D
 
D
D
 
P
D
 
Q
D
 
D
P
 
P
Y
 
L
V
 
K
H
 
Y
G
 
G
F
 
F

6j7cA Crystal structure of proline racemase-like protein from thermococcus litoralis in complex with proline (see paper)
40% identity, 98% coverage: 5:329/332 of query aligns to 7:328/331 of 6j7cA

query
sites
6j7cA
F
 
F
S
 
H
C
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
T
H
 
H
T
 
T
C
 
E
G
 
G
N
 
E
P
 
P
V
 
T
R
 
R
V
 
I
V
 
V
T
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
V
P
 
N
F
 
-
L
 
V
E
 
K
G
 
G
E
 
E
N
 
D
M
 
I
F
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
E
F
 
Y
F
 
F
I
 
K
K
 
E
H
 
H
Y
 
Y
D
 
D
W
 
W
I
 
I
R
 
R
R
 
T
G
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
H
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
S
M
 
D
M
 
Q
S
 
F
G
 
G
S
 
A
M
 
V
L
 
L
Y
 
V
P
 
P
P
 
S
H
 
D
D
 
I
P
 
A
E
 
-
N
 
-
D
 
D
V
 
F
A
 
G
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
I
 
M
E
 
D
T
 
T
S
 
S
G
 
G
C
 
Y
L
 
L
P
 
D
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
G
 
A
T
 
T
I
 
M
G
 
G
T
 
V
V
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
L
I
 
V
E
 
E
E
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
I
T
 
E
P
 
K
K
 
K
V
 
E
P
 
P
-
 
Y
G
 
T
K
 
T
L
 
V
R
 
K
L
 
L
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
E
V
 
A
S
 
K
Y
 
A
T
 
K
Q
 
V
E
 
K
G
 
G
E
 
G
K
 
V
V
 
V
T
 
K
S
 
E
V
 
V
K
 
T
L
 
V
T
 
V
N
 
D
V
 
V
P
 
P
S
 
S
F
 
F
V
 
Y
I
 
V
A
 
G
K
 
-
D
 
E
L
 
F
N
 
V
I
 
I
S
 
E
C
 
Y
D
 
P
V
 
G
L
 
R
G
 
G
E
 
K
L
 
I
I
 
K
F
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
F
Y
 
Y
A
 
V
I
 
I
I
 
A
E
 
D
P
 
A
Q
 
R
E
 
D
N
 
L
F
 
G
G
 
L
G
 
R
L
 
V
Q
 
R
D
 
R
F
 
E
T
 
Y
A
 
I
E
 
K
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
T
 
P
M
 
T
S
 
A
R
 
L
K
 
K
L
 
L
R
 
I
K
 
K
A
 
V
I
 
A
N
 
N
E
 
E
V
 
Q
Y
 
I
T
 
K
F
 
V
V
 
Q
H
 
H
P
 
P
E
 
R
N
 
K
S
 
G
R
 
V
I
 
Q
N
 
N
G
 
R
L
 
I
S
 
N
H
 
L
I
 
A
Q
 
M
W
 
L
I
 
T
G
 
D
R
 
E
T
 
P
L
 
E
D
 
R
E
 
E
H
 
D
S
 
S
H
 
D
G
 
G
R
 
K
N
 
N
A
 
V
V
 
V
F
 
I
Y
x
W
G
 
G
D
 
E
K
 
G
A
 
S
I
 
V
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
T
 
S
S
 
A
A
 
S
R
 
R
M
 
V
A
 
A
Q
 
T
L
 
L
Y
 
Y
S
 
S
R
 
K
G
 
G
L
 
I
L
 
L
K
 
K
A
 
E
N
 
G
E
 
D
P
 
I
F
 
F
V
 
V
N
 
H
E
 
E
S
 
S
Y
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
T
T
 
Q
F
 
F
T
 
R
G
 
I
E
 
K
I
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
T
T
 
T
N
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
E
Y
 
Y
D
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
I
P
 
P
S
 
E
I
 
I
E
 
T
G
 
G
W
 
S
A
 
A
K
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
K
Y
 
I
N
 
S
T
 
Q
I
 
D
F
 
I
L
 
I
D
 
S
D
 
K
D
 
N
D
 
D
P
 
P
Y
 
L
V
 
W
H
 
K
G
 
G
F
 
F

Q96EM0 Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase; Trans-L-3-hydroxyproline dehydratase; EC 4.2.1.77 from Homo sapiens (Human) (see paper)
32% identity, 98% coverage: 5:329/332 of query aligns to 20:351/354 of Q96EM0

query
sites
Q96EM0
F
 
L
S
 
S
C
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
M
H
 
H
T
 
T
C
 
G
G
 
G
N
 
E
P
 
P
V
 
L
R
 
R
V
 
I
V
 
V
T
 
L
G
 
A
G
 
G
L
 
C
P
 
P
F
 
E
L
 
V
E
 
S
G
 
G
E
 
P
N
 
T
M
 
L
F
 
L
E
 
A
K
 
K
R
 
R
Q
 
R
F
 
Y
F
 
M
I
 
R
K
 
Q
H
 
H
Y
 
L
D
 
D
W
 
H
I
 
V
R
 
R
R
 
R
G
 
R
L
 
L
M
 
M
F
 
F
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
H
D
 
R
M
 
D
M
 
M
S
 
Y
G
 
G
S
 
A
M
 
V
L
 
L
Y
 
V
P
 
P
P
 
S
H
 
E
D
 
L
P
 
P
E
 
D
N
 
A
D
 
H
V
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
Y
 
F
I
 
L
E
 
H
T
 
N
S
 
E
G
 
G
C
 
Y
L
 
S
P
 
S
M
 
M
C
 
C
G
 
G
H
 
H
G
 
A
T
 
V
I
 
L
G
 
A
T
 
L
V
 
G
T
 
R
V
 
F
A
 
A
I
 
L
E
 
D
E
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
V
T
 
-
P
 
P
K
 
A
V
 
P
P
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
E
G
 
A
K
 
R
L
 
V
R
 
N
L
 
I
E
 
H
T
 
C
P
 
P
A
 
C
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
T
V
 
A
-
 
F
S
 
V
Y
 
A
T
 
C
Q
 
E
E
 
D
G
 
G
E
 
R
K
 
S
V
 
H
T
 
G
S
 
P
V
 
V
K
 
R
L
 
F
T
 
H
N
 
S
V
 
V
P
 
P
S
 
A
F
 
F
V
 
V
I
 
L
A
 
A
K
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
M
I
 
V
S
 
D
C
 
V
D
 
P
V
 
G
L
 
H
G
 
G
E
 
K
L
 
V
I
 
M
F
 
V
D
 
D
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
N
 
A
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
I
 
F
I
 
V
E
 
T
P
 
A
Q
 
E
E
 
K
N
 
L
F
 
G
G
 
L
G
 
D
L
 
I
Q
 
C
D
 
S
F
 
A
T
 
K
A
 
T
E
 
R
Q
 
D
L
 
L
I
 
V
T
 
D
M
 
A
S
 
A
R
 
S
K
 
A
L
 
V
R
 
T
K
 
E
A
 
A
I
 
V
N
 
K
E
 
A
V
 
Q
Y
 
F
T
 
K
F
 
I
V
 
N
H
 
H
P
 
P
E
 
D
N
 
S
S
 
E
R
 
D
I
 
L
N
 
A
G
 
F
L
 
L
-
 
Y
S
 
G
H
 
T
I
 
I
Q
 
L
W
 
T
I
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
D
L
 
A
D
 
Y
E
 
T
H
 
K
S
 
E
H
 
P
G
 
T
R
 
T
N
 
N
A
 
I
V
 
C
F
 
V
Y
 
F
G
 
A
D
 
D
K
 
E
A
 
Q
I
 
V
D
 
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
x
T
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
R
M
 
I
A
 
A
Q
 
L
L
 
Q
Y
 
Y
S
 
H
R
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
E
A
 
L
N
 
N
E
 
Q
-
 
M
P
 
R
F
 
A
V
 
F
N
 
K
E
 
S
S
 
S
Y
 
A
I
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
K
I
 
A
I
 
V
G
 
R
E
 
E
T
 
A
N
 
K
V
 
C
G
 
G
D
 
D
Y
 
F
D
 
K
A
 
A
I
 
V
I
 
I
P
 
V
S
 
E
I
 
V
E
 
S
G
 
G
W
 
Q
A
 
A
K
 
H
I
 
Y
T
 
T
G
 
G
Y
 
T
N
 
A
T
 
S
I
 
F
F
 
I
L
 
I
D
 
E
D
 
D
D
 
D
D
 
D
P
 
P
Y
 
L
V
 
R
H
 
D
G
 
G
F
 
F

Q9I476 4-hydroxyproline 2-epimerase; 4Hyp 2-epimerase; 4HypE; Hydroxyproline-2-epimerase; PaHyPRE; EC 5.1.1.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
34% identity, 97% coverage: 8:330/332 of query aligns to 7:313/314 of Q9I476

query
sites
Q9I476
I
 
I
D
 
D
A
 
S
H
 
H
T
 
T
C
 
G
G
 
G
N
 
E
P
 
P
V
 
T
R
 
R
V
 
L
V
 
V
T
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
P
F
 
D
L
 
L
E
 
G
G
 
Q
E
 
G
N
 
D
M
 
M
F
 
A
E
 
E
K
 
R
R
 
R
Q
 
R
F
 
L
F
 
L
I
 
G
K
 
E
H
 
R
Y
 
H
D
 
D
W
 
A
I
 
W
R
 
R
R
 
A
G
 
A
L
 
C
M
 
I
F
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
S
D
 
D
M
 
V
M
 
L
S
x
V
G
 
G
S
 
A
M
 
L
L
 
L
Y
 
C
P
 
A
P
 
P
H
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
E
N
 
A
D
 
C
V
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
I
Y
 
F
I
 
F
E
 
N
T
 
N
S
 
S
G
 
G
C
 
Y
L
 
L
P
 
G
M
 
M
C
|
C
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
L
V
 
V
T
 
A
V
 
S
A
 
L
I
 
A
E
 
H
E
 
L
G
 
G
L
 
R
I
 
I
T
 
G
P
 
P
K
 
G
V
 
V
P
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
H
R
 
R
L
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
V
G
 
G
L
 
E
V
 
V
L
 
E
V
 
A
S
 
T
Y
 
L
T
 
H
Q
 
E
E
 
D
G
 
G
E
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
-
S
 
S
V
 
V
K
 
S
L
 
V
T
 
R
N
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
A
F
 
Y
V
 
R
I
 
Y
A
 
R
K
 
R
D
 
Q
L
 
V
N
 
S
I
 
V
S
 
E
C
 
V
D
 
P
V
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
R
L
 
V
I
 
S
F
 
G
D
 
D
V
 
I
S
 
A
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
W
Y
 
F
A
 
F
I
 
L
I
 
V
E
 
A
P
 
G
Q
 
H
E
 
G
N
 
Q
F
 
R
G
 
-
G
 
-
L
 
L
Q
 
A
D
 
G
F
 
D
T
 
N
A
 
L
E
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
T
T
 
A
M
 
Y
S
 
T
R
 
V
K
 
A
L
 
V
R
 
Q
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
N
 
D
E
 
D
V
 
-
Y
 
-
T
 
Q
F
 
D
V
 
I
H
 
R
P
 
G
E
 
E
N
 
D
S
 
G
R
 
-
I
 
-
N
 
G
G
 
A
L
 
I
S
 
D
H
 
H
I
 
I
Q
 
E
W
 
L
I
 
F
G
 
A
R
 
D
T
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
P
H
 
H
S
 
A
H
 
D
G
 
S
R
 
R
N
 
N
A
 
F
V
 
V
F
 
L
Y
 
C
G
 
P
D
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
Y
D
 
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
M
 
L
A
 
A
Q
 
C
L
 
L
Y
 
A
S
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
K
L
 
L
K
 
L
A
 
P
N
 
G
E
 
Q
P
 
P
F
 
W
V
 
R
N
 
Q
E
 
A
S
 
S
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
F
 
F
T
 
E
G
 
G
E
 
R
-
 
Y
-
 
E
-
 
W
I
 
L
I
 
D
G
 
G
E
 
Q
T
 
P
N
 
G
V
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
G
A
 
P
I
 
I
I
 
V
P
 
P
S
 
T
I
 
I
E
 
R
G
 
G
W
 
R
A
 
A
K
 
H
I
 
V
T
 
S
G
 
A
Y
 
E
N
 
A
T
 
T
I
 
L
F
 
L
L
 
L
D
 
A
D
 
D
D
 
D
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
V
 
A
H
 
W
G
 
G
F
 
I
Q
 
R

4q2hA Crystal structure of probable proline racemase from agrobacterium radiobacter k84, target efi-506561, with bound carbonate
32% identity, 99% coverage: 2:331/332 of query aligns to 5:335/346 of 4q2hA

query
sites
4q2hA
K
 
K
K
 
R
T
 
T
F
 
I
S
 
Q
C
 
L
I
 
L
D
 
D
A
 
V
H
 
H
T
 
C
C
 
E
G
 
G
N
 
E
P
 
I
V
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
A
T
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
V
P
 
P
F
 
K
L
 
I
E
 
P
G
 
G
E
 
N
N
 
T
M
 
V
F
 
A
E
 
E
K
 
Q
R
 
L
Q
 
H
F
 
W
F
 
L
I
 
N
K
 
T
-
 
D
-
 
P
H
 
K
Y
 
G
D
 
E
W
 
E
I
 
L
R
 
R
R
 
R
G
 
F
L
 
L
M
 
V
F
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
A
D
 
P
M
 
I
M
 
G
S
 
S
G
 
V
S
 
N
M
 
L
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
P
 
A
H
 
R
D
 
H
P
 
P
E
 
D
N
 
A
D
 
D
V
 
A
A
 
A
V
 
F
L
 
I
Y
 
I
I
 
L
E
 
Q
T
 
P
S
 
D
G
 
Q
C
 
A
L
 
H
P
 
A
M
 
S
C
x
S
G
|
G
H
x
S
G
 
N
T
 
S
I
 
I
G
 
C
T
 
V
V
 
T
T
 
T
V
 
A
A
 
L
I
 
L
E
 
E
E
 
S
G
 
G
L
 
I
I
 
V
T
 
E
P
 
M
K
 
K
V
 
E
P
 
P
G
 
E
K
 
T
L
 
V
-
 
V
R
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
T
P
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
L
 
R
V
 
A
S
 
T
Y
 
A
T
 
T
Q
 
C
E
 
R
G
 
D
E
 
G
K
 
R
V
 
C
T
 
E
S
 
K
V
 
V
K
 
R
L
 
L
T
 
T
N
 
M
V
 
V
P
 
P
S
 
S
F
 
F
V
 
V
I
 
H
A
 
E
K
 
L
D
 
D
L
 
V
N
 
G
I
 
I
S
 
D
C
 
T
D
 
P
V
 
Q
L
 
W
G
 
G
E
 
R
L
 
I
I
 
K
F
 
L
D
 
D
V
 
L
S
 
C
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
N
 
I
F
 
F
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
I
 
V
E
 
D
P
 
V
Q
 
G
E
 
Q
N
 
I
F
 
G
G
 
L
G
 
T
L
 
I
Q
 
G
D
 
K
F
 
A
T
 
N
A
 
A
E
 
A
Q
 
S
L
 
L
I
 
V
T
 
Q
M
 
A
S
 
G
R
 
M
K
 
V
L
 
L
R
 
K
K
 
E
A
 
L
I
 
I
N
 
N
E
 
R
V
 
T
Y
 
V
T
 
P
F
 
V
V
 
V
H
 
H
P
 
P
E
 
E
N
 
I
S
 
P
R
 
A
I
 
I
N
 
S
G
 
G
L
 
V
S
 
A
H
 
Y
I
 
V
Q
 
M
W
 
F
I
 
-
G
 
-
R
 
R
T
 
D
L
 
I
D
 
D
E
 
A
H
 
D
S
 
G
H
 
A
G
 
I
R
 
R
N
 
T
A
 
C
V
 
T
F
 
T
Y
 
M
G
 
W
D
 
P
K
 
G
A
 
R
I
 
A
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
T
 
N
S
 
S
A
 
A
R
 
N
M
 
L
A
 
A
Q
 
T
L
 
L
Y
 
H
S
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
K
L
 
A
K
 
R
A
 
V
N
 
G
E
 
D
P
 
V
F
 
F
V
 
K
N
 
S
E
 
R
S
 
S
Y
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
E
F
 
F
T
 
E
G
 
V
E
 
G
I
 
L
I
 
Q
G
 
A
E
 
E
T
 
T
N
 
E
V
 
V
G
 
A
D
 
G
Y
 
K
D
 
P
A
 
A
I
 
I
I
 
I
P
 
P
S
 
T
I
 
I
E
 
T
G
 
G
W
 
R
A
 
G
K
 
F
I
 
T
T
 
F
G
 
G
Y
 
L
N
 
S
T
 
Q
I
 
V
F
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
P
D
 
F
D
 
D
P
 
P
Y
 
M
V
 
A
H
 
N
G
 
G
F
 
F
Q
 
A
V
 
L

4j9xA Crystal structure of the complex of a hydroxyproline epimerase (target efi-506499, pseudomonas fluorescens pf-5) with trans-4-hydroxy-l- proline
34% identity, 98% coverage: 3:329/332 of query aligns to 2:308/310 of 4j9xA

query
sites
4j9xA
K
 
K
T
 
K
F
 
I
S
 
T
C
 
V
I
 
I
D
 
D
A
 
S
H
 
H
T
 
T
C
 
G
G
 
G
N
 
E
P
 
P
V
 
T
R
 
R
V
 
L
V
 
V
T
 
I
G
 
D
G
 
G
L
 
F
P
 
P
F
 
D
L
 
L
E
 
G
G
 
R
E
 
G
N
 
S
M
 
M
F
 
A
E
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
Q
F
 
I
F
 
L
I
 
E
K
 
R
H
 
E
Y
 
H
D
 
D
W
 
Q
I
 
W
R
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
C
M
 
V
F
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
S
D
 
D
M
 
V
M
 
L
S
 
V
G
 
G
S
 
A
M
 
L
L
 
L
Y
 
C
P
 
Q
P
 
P
H
 
Q
D
 
A
P
 
G
E
 
D
N
 
A
D
 
C
V
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
I
Y
 
F
I
 
F
E
 
N
T
 
N
S
 
S
G
 
G
C
 
Y
L
|
L
P
 
G
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
L
V
 
V
T
 
R
V
 
S
A
 
L
I
 
Y
E
 
H
E
 
L
G
 
G
L
 
R
I
 
I
T
 
D
P
 
Q
K
 
G
V
 
V
P
 
H
G
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
R
L
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
V
G
 
G
L
 
T
V
 
V
L
 
E
V
 
A
S
 
T
Y
 
L
T
 
H
Q
 
E
E
 
D
G
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
L
S
 
S
V
 
V
K
 
S
L
 
V
T
 
R
N
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
A
F
 
Y
V
 
R
I
 
Y
A
 
R
K
 
T
D
 
Q
L
 
V
N
 
M
I
 
L
S
 
Q
C
 
L
D
 
P
V
 
G
L
 
H
G
 
G
E
 
K
L
 
V
I
 
H
F
 
G
D
 
D
V
 
I
S
 
A
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
W
Y
 
F
A
 
F
I
 
L
I
 
I
E
 
S
P
 
D
Q
 
H
E
 
G
N
 
Q
F
 
R
G
 
I
G
 
A
L
 
L
Q
 
D
D
 
N
F
 
V
T
 
-
A
 
-
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
I
 
T
T
 
H
M
 
Y
S
 
T
R
 
R
K
 
D
L
 
V
R
 
R
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
N
 
-
E
 
E
V
 
A
Y
 
A
T
 
G
F
 
I
V
 
T
H
 
G
P
 
A
E
 
E
N
 
G
S
 
G
R
 
V
I
 
I
N
 
D
G
 
-
L
 
-
S
 
-
H
|
H
I
 
I
Q
 
E
W
 
L
I
 
F
G
 
A
R
 
D
T
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
P
H
 
Q
S
 
A
H
 
D
G
 
S
R
 
R
N
 
N
A
 
F
V
 
V
F
 
L
Y
x
C
G
 
P
D
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
Y
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
M
 
L
A
 
A
Q
 
C
L
 
L
Y
 
A
S
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
K
L
 
L
K
 
A
A
 
P
N
 
G
E
 
Q
P
 
A
F
 
W
V
 
R
N
 
Q
E
 
A
S
 
S
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
F
 
F
T
 
S
G
 
A
-
 
H
-
 
Y
E
 
E
I
 
K
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
Q
N
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
I
I
 
L
E
 
R
G
 
G
W
 
S
A
 
A
K
 
H
I
 
I
T
 
S
G
 
A
Y
 
E
N
 
A
T
 
T
I
 
L
F
 
L
L
 
L
D
 
D
D
 
D
D
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
V
 
V
H
 
W
G
 
G
F
 
I

4j9wA Crystal structure of the complex of a hydroxyproline epimerase (target efi-506499, pseudomonas fluorescens pf-5) with the inhibitor pyrrole- 2-carboxylate
34% identity, 98% coverage: 3:329/332 of query aligns to 2:308/310 of 4j9wA

query
sites
4j9wA
K
 
K
T
 
K
F
 
I
S
 
T
C
 
V
I
 
I
D
 
D
A
 
S
H
 
H
T
 
T
C
 
G
G
 
G
N
 
E
P
 
P
V
 
T
R
 
R
V
 
L
V
 
V
T
 
I
G
 
D
G
 
G
L
 
F
P
 
P
F
 
D
L
 
L
E
 
G
G
 
R
E
 
G
N
 
S
M
 
M
F
 
A
E
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
Q
F
 
I
F
 
L
I
 
E
K
 
R
H
 
E
Y
 
H
D
 
D
W
 
Q
I
 
W
R
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
C
M
 
V
F
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
S
D
 
D
M
 
V
M
 
L
S
 
V
G
 
G
S
 
A
M
 
L
L
 
L
Y
 
C
P
 
Q
P
 
P
H
 
Q
D
 
A
P
 
G
E
 
D
N
 
A
D
 
C
V
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
I
Y
 
F
I
 
F
E
 
N
T
 
N
S
 
S
G
 
G
C
 
Y
L
 
L
P
 
G
M
 
M
C
|
C
G
|
G
H
|
H
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
L
V
 
V
T
 
R
V
 
S
A
 
L
I
 
Y
E
 
H
E
 
L
G
 
G
L
 
R
I
 
I
T
 
D
P
 
Q
K
 
G
V
 
V
P
 
H
G
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
R
L
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
V
G
 
G
L
 
T
V
 
V
L
 
E
V
 
A
S
 
T
Y
 
L
T
 
H
Q
 
E
E
 
D
G
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
L
S
 
S
V
 
V
K
 
S
L
 
V
T
 
R
N
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
A
F
 
Y
V
 
R
I
 
Y
A
 
R
K
 
T
D
 
Q
L
 
V
N
 
M
I
 
L
S
 
Q
C
 
L
D
 
P
V
 
G
L
 
H
G
 
G
E
 
K
L
 
V
I
 
H
F
 
G
D
 
D
V
 
I
S
 
A
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
W
Y
 
F
A
 
F
I
 
L
I
 
I
E
 
S
P
 
D
Q
 
H
E
 
G
N
 
Q
F
 
R
G
 
I
G
 
A
L
 
L
Q
 
D
D
 
N
F
 
V
T
 
-
A
 
-
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
I
 
T
T
 
H
M
 
Y
S
 
T
R
 
R
K
 
D
L
 
V
R
 
R
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
N
 
-
E
 
E
V
 
A
Y
 
A
T
 
G
F
 
I
V
 
T
H
 
G
P
 
A
E
 
E
N
 
G
S
 
G
R
 
V
I
 
I
N
 
D
G
 
-
L
 
-
S
 
-
H
|
H
I
 
I
Q
 
E
W
 
L
I
 
F
G
 
A
R
 
D
T
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
P
H
 
Q
S
 
A
H
 
D
G
 
S
R
 
R
N
 
N
A
 
F
V
 
V
F
 
L
Y
x
C
G
 
P
D
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
Y
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
|
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
M
 
L
A
 
A
Q
 
C
L
 
L
Y
 
A
S
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
K
L
 
L
K
 
A
A
 
P
N
 
G
E
 
Q
P
 
A
F
 
W
V
 
R
N
 
Q
E
 
A
S
 
S
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
F
 
F
T
 
S
G
 
A
-
 
H
-
 
Y
E
 
E
I
 
K
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
Q
N
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
I
I
 
L
E
 
R
G
 
G
W
 
S
A
 
A
K
 
H
I
 
I
T
 
S
G
 
A
Y
 
E
N
 
A
T
 
T
I
 
L
F
 
L
L
 
L
D
 
D
D
 
D
D
 
S
D
 
D
P
 
P
Y
 
F
V
 
V
H
 
W
G
 
G
F
 
I

Q4KGU2 4-hydroxyproline 2-epimerase; 4Hyp 2-epimerase; 4HypE; EC 5.1.1.8 from Pseudomonas fluorescens (strain ATCC BAA-477 / NRRL B-23932 / Pf-5) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 3:329/332 of query aligns to 2:308/310 of Q4KGU2

query
sites
Q4KGU2
K
 
K
T
 
K
F
 
I
S
 
T
C
 
V
I
 
I
D
 
D
A
 
S
H
 
H
T
 
T
C
 
G
G
 
G
N
 
E
P
 
P
V
 
T
R
 
R
V
 
L
V
 
V
T
 
I
G
 
D
G
 
G
L
 
F
P
 
P
F
 
D
L
 
L
E
 
G
G
 
R
E
 
G
N
 
S
M
 
M
F
 
A
E
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
Q
F
 
I
F
 
L
I
 
E
K
 
R
H
 
E
Y
 
H
D
 
D
W
 
Q
I
 
W
R
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
C
M
 
V
F
 
L
E
 
E
P
 
P
R
 
R
G
 
G
H
 
S
D
 
D
M
 
V
M
 
L
S
 
V
G
 
G
S
 
A
M
 
L
L
 
L
Y
 
C
P
 
Q
P
 
P
H
 
Q
D
 
A
P
 
G
E
 
D
N
 
A
D
 
C
V
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
I
Y
 
F
I
 
F
E
 
N
T
 
N
S
 
S
G
 
G
C
 
Y
L
 
L
P
 
G
M
 
M
C
 
C
G
|
G
H
|
H
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
L
V
 
V
T
 
R
V
 
S
A
 
L
I
 
Y
E
 
H
E
 
L
G
 
G
L
 
R
I
 
I
T
 
D
P
 
Q
K
 
G
V
 
V
P
 
H
G
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
R
L
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
V
G
 
G
L
 
T
V
 
V
L
 
E
V
 
A
S
 
T
Y
 
L
T
 
H
Q
 
E
E
 
D
G
 
-
E
 
-
K
 
-
V
 
-
T
 
L
S
 
S
V
 
V
K
 
S
L
 
V
T
 
R
N
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
A
F
 
Y
V
 
R
I
 
Y
A
 
R
K
 
T
D
 
Q
L
 
V
N
 
M
I
 
L
S
 
Q
C
 
L
D
 
P
V
 
G
L
 
H
G
 
G
E
 
K
L
 
V
I
 
H
F
 
G
D
 
D
V
 
I
S
 
A
Y
 
W
G
 
G
G
 
G
N
 
N
F
 
W
Y
 
F
A
 
F
I
 
L
I
 
I
E
 
S
P
 
D
Q
 
H
E
 
G
N
 
Q
F
 
R
G
 
I
G
 
A
L
 
L
Q
 
D
D
 
N
F
 
V
T
 
-
A
 
-
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
I
 
T
T
 
H
M
 
Y
S
 
T
R
 
R
K
 
D
L
 
V
R
 
R
K
 
Q
A
 
A
I
 
L
N
 
-
E
 
E
V
 
A
Y
 
A
T
 
G
F
 
I
V
 
T
H
 
G
P
 
A
E
 
E
N
 
G
S
 
G
R
 
V
I
 
I
N
 
D
G
 
-
L
 
-
S
 
-
H
|
H
I
 
I
Q
 
E
W
 
L
I
 
F
G
 
A
R
 
D
T
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
P
H
 
Q
S
 
A
H
 
D
G
 
S
R
 
R
N
 
N
A
 
F
V
 
V
F
 
L
Y
 
C
G
 
P
D
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
Y
D
|
D
R
 
R
S
 
S
P
 
P
C
 
C
G
|
G
T
|
T
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
M
 
L
A
 
A
Q
 
C
L
 
L
Y
 
A
S
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
K
L
 
L
K
 
A
A