SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_4044 FitnessBrowser__Cola:Echvi_4044 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9AT00 Protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic; ABC transporter I family member 13; ABC transporter ABCI.13; AtABCI13; Non-intrinsic ABC protein 11; AtNAP11 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
39% identity, 96% coverage: 5:242/249 of query aligns to 84:334/345 of Q9AT00

query
sites
Q9AT00
V
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
C
R
 
R
G
 
D
L
 
V
K
 
Y
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
E
 
E
L
 
K
D
 
H
V
 
I
L
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
F
D
 
K
L
 
I
Y
 
R
K
 
H
G
 
G
E
 
E
N
 
A
V
 
V
V
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
K
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
V
 
T
L
 
I
I
 
L
K
 
K
I
 
I
M
 
M
V
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
Q
 
P
D
 
D
E
 
K
G
 
G
T
 
E
M
 
V
N
 
Y
V
 
I
L
 
R
G
 
G
K
 
K
E
 
K
V
 
R
S
 
A
N
 
G
L
 
L
G
 
-
A
 
I
K
 
S
D
 
D
L
 
E
N
 
E
E
 
I
L
 
S
R
 
G
L
 
L
K
 
R
I
 
I
G
 
G
F
 
L
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
M
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
R
E
 
E
N
 
N
L
 
V
E
 
G
F
 
F
P
 
L
L
 
L
V
 
Y
R
 
E
N
 
R
V
 
S
K
 
K
G
 
-
L
 
M
S
 
S
R
 
E
T
 
N
E
 
Q
K
 
I
D
 
S
K
 
E
M
 
L
V
 
V
E
 
T
E
 
Q
V
 
T
L
 
L
E
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
Q
 
G
T
 
V
I
 
E
N
 
N
Q
 
R
M
 
L
P
 
P
S
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
R
 
K
K
 
K
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
S
L
 
L
I
 
I
-
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
V
L
 
I
K
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
V
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
I
T
 
A
C
 
S
S
 
T
D
 
V
I
 
V
N
 
E
N
 
D
L
 
L
I
 
I
N
 
R
E
 
S
V
 
V
-
 
H
-
 
M
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
G
R
 
K
E
 
P
N
 
G
Y
 
K
N
 
I
T
 
A
S
 
S
S
 
Y
I
 
L
I
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
Q
L
 
H
T
 
S
C
 
T
A
 
I
R
 
Q
D
 
R
T
 
A
G
 
V
D
 
D
R
 
R
V
 
L
A
 
L
V
 
F
L
 
L
L
 
Y
D
 
E
G
 
G
Q
 
K
F
 
I
G
 
V
A
 
W
E
 
Q
G
 
G
K
 
M
F
 
T
E
 
H
E
 
E
V
 
-
F
 
F
K
 
T
T
 
T
P
 
S
E
 
T
D
 
N
Q
 
P
R
 
I
V
 
V
K
 
Q
S
 
Q
F
 
F

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
37% identity, 96% coverage: 5:242/249 of query aligns to 2:235/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
V
 
I
V
 
I
E
 
R
V
 
I
R
 
R
G
 
N
L
 
L
K
 
H
K
 
K
S
 
W
F
|
F
G
 
G
E
 
P
L
 
L
D
 
H
V
|
V
L
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
H
L
 
L
D
 
E
L
 
V
Y
 
A
K
 
P
G
 
G
E
 
E
N
 
K
V
 
L
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
T
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
L
I
 
I
K
 
R
I
 
T
M
 
I
V
 
N
G
 
R
L
 
L
L
 
E
T
 
D
Q
 
F
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
T
 
E
M
 
V
N
 
V
V
 
V
L
 
D
G
 
G
K
 
L
E
 
S
V
 
V
S
 
K
N
 
D
L
 
-
G
 
-
A
 
D
K
 
R
D
 
A
L
 
L
N
 
R
E
 
E
L
 
I
R
 
R
L
 
R
K
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
S
 
F
A
 
N
L
 
L
Y
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
E
 
T
F
 
L
P
 
A
L
 
P
V
 
M
R
 
R
N
 
-
V
 
V
K
 
R
G
 
R
L
 
W
S
 
P
R
 
R
T
 
E
E
 
K
K
 
A
D
 
E
K
 
K
M
 
K
V
 
A
E
 
L
E
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
S
 
L
Q
 
D
T
 
Q
I
 
A
N
 
R
Q
 
K
M
 
Y
P
 
P
S
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
M
K
 
E
P
 
P
E
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
E
T
 
M
C
 
V
S
 
G
D
 
E
I
 
V
N
 
L
N
 
D
L
 
V
I
 
M
N
 
R
E
 
D
V
 
L
R
 
A
E
 
Q
N
 
G
Y
 
-
N
 
G
T
 
M
S
 
T
S
 
M
I
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
T
 
G
C
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
E
T
 
V
G
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
F
L
 
M
L
 
D
D
 
G
G
 
G
Q
 
Q
F
 
I
G
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
R
F
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
K
 
T
T
 
R
P
 
P
E
 
K
D
 
E
Q
 
E
R
 
R
V
 
T
K
 
R
S
 
S
F
 
F

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
37% identity, 98% coverage: 4:247/249 of query aligns to 2:242/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
K
 
Q
V
 
M
V
 
I
E
 
D
V
 
V
R
 
H
G
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
E
 
S
L
 
L
D
 
E
V
|
V
L
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
D
 
H
L
 
I
Y
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
N
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
T
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
I
 
C
M
 
L
V
 
N
G
 
L
L
 
L
L
 
E
T
 
D
Q
 
F
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
E
M
 
I
N
 
I
V
 
I
L
 
D
G
 
G
K
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
K
A
 
A
K
 
K
D
 
D
-
 
T
-
 
N
L
 
L
N
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
E
K
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
A
 
R
S
 
F
A
 
N
L
 
L
Y
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
E
 
T
F
 
L
P
 
A
L
 
P
V
 
M
R
 
K
N
 
-
V
 
V
K
 
R
G
 
K
L
 
W
S
 
P
R
 
R
T
 
E
E
 
K
K
 
A
D
 
E
K
 
A
M
 
K
V
 
A
E
 
M
E
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
Q
 
D
T
 
K
I
 
A
N
 
H
Q
 
A
M
 
Y
P
 
P
S
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
M
K
 
E
P
 
P
E
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
E
T
 
M
C
 
V
S
 
G
D
 
E
I
 
V
N
 
L
N
 
S
L
 
V
I
 
M
N
 
K
E
 
Q
V
 
L
R
 
-
E
 
A
N
 
N
Y
 
E
N
 
G
T
 
M
S
 
T
S
 
M
I
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
T
 
G
C
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
E
T
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
F
L
 
M
L
 
D
D
 
G
G
 
G
Q
 
Y
F
 
I
G
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
F
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
F
 
F
K
 
D
T
 
R
P
 
P
E
 
Q
D
 
H
Q
 
E
R
 
R
V
 
T
K
 
K
S
 
A
F
 
F
Y
 
L
D
 
S
Y
 
K
N
 
V
F
 
F

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
37% identity, 98% coverage: 4:247/249 of query aligns to 2:242/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
K
 
Q
V
 
M
V
 
I
E
 
D
V
 
V
R
 
H
G
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
E
 
S
L
 
L
D
 
E
V
|
V
L
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
D
 
H
L
 
I
Y
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
N
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
T
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
I
 
C
M
 
L
V
 
N
G
 
L
L
 
L
L
 
E
T
 
D
Q
 
F
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
E
M
 
I
N
 
I
V
 
I
L
 
D
G
 
G
K
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
K
A
 
A
K
 
K
D
 
D
-
 
T
-
 
N
L
 
L
N
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
E
K
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
A
 
R
S
 
F
A
 
N
L
 
L
Y
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
E
 
T
F
 
L
P
 
A
L
 
P
V
 
M
R
 
K
N
 
-
V
 
V
K
 
R
G
 
K
L
 
W
S
 
P
R
 
R
T
 
E
E
 
K
K
 
A
D
 
E
K
 
A
M
 
K
V
 
A
E
 
M
E
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
Q
 
D
T
 
K
I
 
A
N
 
H
Q
 
A
M
 
Y
P
 
P
S
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
M
K
 
E
P
 
P
E
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
E
T
 
M
C
 
V
S
 
G
D
 
E
I
 
V
N
 
L
N
 
S
L
 
V
I
 
M
N
 
K
E
 
Q
V
 
L
R
 
-
E
 
A
N
 
N
Y
 
E
N
 
G
T
 
M
S
 
T
S
 
M
I
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
T
 
G
C
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
E
T
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
F
L
 
M
L
 
D
D
 
G
G
 
G
Q
 
Y
F
 
I
G
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
F
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
F
 
F
K
 
D
T
 
R
P
 
P
E
 
Q
D
 
H
Q
 
E
R
 
R
V
 
T
K
 
K
S
 
A
F
 
F
Y
 
L
D
 
S
Y
 
K
N
 
V
F
 
F

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
37% identity, 98% coverage: 4:247/249 of query aligns to 2:242/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
K
 
Q
V
 
M
V
 
I
E
 
D
V
 
V
R
 
H
G
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
E
 
S
L
 
L
D
 
E
V
|
V
L
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
D
 
H
L
 
I
Y
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
N
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
T
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
I
 
C
M
 
L
V
 
N
G
 
L
L
 
L
L
 
E
T
 
D
Q
 
F
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
E
M
 
I
N
 
I
V
 
I
L
 
D
G
 
G
K
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
K
A
 
A
K
 
K
D
 
D
-
 
T
-
 
N
L
 
L
N
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
E
K
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
A
 
R
S
 
F
A
 
N
L
 
L
Y
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
E
 
T
F
 
L
P
 
A
L
 
P
V
 
M
R
 
K
N
 
-
V
 
V
K
 
R
G
 
K
L
 
W
S
 
P
R
 
R
T
 
E
E
 
K
K
 
A
D
 
E
K
 
A
M
 
K
V
 
A
E
 
M
E
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
Q
 
D
T
 
K
I
 
A
N
 
H
Q
 
A
M
 
Y
P
 
P
S
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
M
K
 
E
P
 
P
E
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
E
T
 
M
C
 
V
S
 
G
D
 
E
I
 
V
N
 
L
N
 
S
L
 
V
I
 
M
N
 
K
E
 
Q
V
 
L
R
 
-
E
 
A
N
 
N
Y
 
E
N
 
G
T
 
M
S
 
T
S
 
M
I
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
T
 
G
C
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
E
T
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
F
L
 
M
L
 
D
D
 
G
G
 
G
Q
 
Y
F
 
I
G
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
F
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
F
 
F
K
 
D
T
 
R
P
 
P
E
 
Q
D
 
H
Q
 
E
R
 
R
V
 
T
K
 
K
S
 
A
F
 
F
Y
 
L
D
 
S
Y
 
K
N
 
V
F
 
F

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
37% identity, 98% coverage: 4:247/249 of query aligns to 2:242/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
K
 
Q
V
 
M
V
 
I
E
 
D
V
 
V
R
 
H
G
 
Q
L
 
L
K
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
G
 
G
E
 
S
L
 
L
D
 
E
V
|
V
L
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
D
 
H
L
 
I
Y
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
N
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
T
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
I
 
C
M
 
L
V
 
N
G
 
L
L
 
L
L
 
E
T
 
D
Q
 
F
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
E
M
 
I
N
 
I
V
 
I
L
 
D
G
 
G
K
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
K
A
 
A
K
 
K
D
 
D
-
 
T
-
 
N
L
 
L
N
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
E
K
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
A
 
R
S
 
F
A
 
N
L
 
L
Y
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
E
 
T
F
 
L
P
 
A
L
 
P
V
 
M
R
 
K
N
 
-
V
 
V
K
 
R
G
 
K
L
 
W
S
 
P
R
 
R
T
 
E
E
 
K
K
 
A
D
 
E
K
 
A
M
 
K
V
 
A
E
 
M
E
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
Q
 
D
T
 
K
I
 
A
N
 
H
Q
 
A
M
 
Y
P
 
P
S
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
M
K
 
E
P
 
P
E
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
E
T
 
M
C
 
V
S
 
G
D
 
E
I
 
V
N
 
L
N
 
S
L
 
V
I
 
M
N
 
K
E
 
Q
V
 
L
R
 
-
E
 
A
N
 
N
Y
 
E
N
 
G
T
 
M
S
 
T
S
 
M
I
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
T
 
G
C
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
E
T
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
F
L
 
M
L
 
D
D
 
G
G
 
G
Q
 
Y
F
 
I
G
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
F
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
F
 
F
K
 
D
T
 
R
P
 
P
E
 
Q
D
 
H
Q
 
E
R
 
R
V
 
T
K
 
K
S
 
A
F
 
F
Y
 
L
D
 
S
Y
 
K
N
 
V
F
 
F

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
37% identity, 94% coverage: 8:242/249 of query aligns to 4:235/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
V
 
V
R
 
N
G
 
D
L
 
V
K
 
Y
K
 
K
S
 
N
F
|
F
G
 
G
E
 
S
L
 
L
D
 
E
V
|
V
L
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
T
L
 
L
D
 
K
L
 
V
Y
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
N
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
T
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
I
 
C
M
 
I
V
 
N
G
 
L
L
 
L
L
 
E
T
 
E
Q
 
P
D
 
T
E
 
K
G
 
G
T
 
E
M
 
V
N
 
F
V
 
I
L
 
D
G
 
G
K
 
V
E
 
K
V
 
I
S
 
N
N
 
N
L
 
-
G
 
G
A
 
K
K
 
V
D
 
N
L
 
I
N
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
Q
K
 
K
I
 
V
G
 
G
F
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
A
 
H
S
 
F
A
 
N
L
 
L
Y
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
L
T
 
T
V
 
A
R
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
T
F
 
L
P
 
A
L
 
P
V
 
V
R
 
K
N
 
-
V
 
V
K
 
K
G
 
K
L
 
M
S
 
N
R
 
K
T
 
K
E
 
E
K
 
A
D
 
E
K
 
E
M
 
L
V
 
A
E
 
V
E
 
D
V
 
L
L
 
L
E
 
A
A
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
Q
 
D
T
 
K
I
 
K
N
 
D
Q
 
Q
M
 
Y
P
 
P
S
 
I
E
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
I
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
L
I
 
A
L
 
M
K
 
Q
P
 
P
E
 
E
I
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
E
T
 
M
C
 
V
S
 
K
D
 
E
I
 
V
N
 
L
N
 
N
L
 
V
I
 
M
N
 
K
E
 
Q
V
 
L
R
 
-
E
 
A
N
 
N
Y
 
E
N
 
G
T
 
M
S
 
T
S
 
M
I
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
E
L
 
M
T
 
G
C
 
F
A
 
A
R
 
R
D
 
E
T
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
F
L
 
M
L
 
D
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
F
 
I
G
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
T
F
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
K
 
Y
T
 
R
P
 
A
E
 
K
D
 
N
Q
 
E
R
 
R
V
 
T
K
 
R
S
 
E
F
 
F

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
34% identity, 93% coverage: 3:234/249 of query aligns to 2:234/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
E
 
Q
K
 
S
V
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
V
R
 
K
G
 
N
L
 
L
K
 
S
K
 
F
S
 
N
F
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
R
D
 
V
V
 
I
L
 
Y
M
 
D
G
 
N
V
 
I
D
 
S
L
 
L
D
 
N
L
 
I
Y
 
R
K
 
R
G
 
G
E
 
Q
N
 
I
V
 
T
V
 
A
V
 
I
L
 
M
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
 
G
T
|
T
G
|
G
K
|
K
S
 
T
V
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
I
 
L
M
 
I
V
 
G
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
T
 
V
Q
 
P
D
 
D
E
 
Q
G
 
G
T
 
E
M
 
V
N
 
L
V
 
L
L
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
D
V
 
I
S
 
A
N
 
Q
L
 
M
G
 
S
A
 
R
K
 
Q
D
 
E
L
 
L
N
 
F
E
 
A
L
 
A
R
 
R
L
 
A
K
 
R
I
 
M
G
 
G
F
 
M
S
 
L
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
S
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
D
 
T
S
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
R
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
I
V
 
R
R
 
A
N
 
H
V
 
T
K
 
K
G
 
-
L
 
L
S
 
S
R
 
E
T
 
N
E
 
L
K
 
I
D
 
A
K
 
E
M
 
L
V
 
V
E
 
A
E
 
L
V
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
R
Q
 
G
T
 
T
I
 
E
N
 
Q
Q
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
T
E
|
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
x
M
R
 
N
K
 
R
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
I
I
 
A
L
 
L
K
 
D
P
 
P
E
 
D
I
 
L
M
 
I
L
 
M
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
T
 
V
C
 
K
S
 
G
D
 
V
I
 
L
N
 
T
N
 
R
L
 
L
I
 
I
N
 
R
E
 
S
V
 
L
R
 
R
E
 
E
N
 
A
Y
 
L
N
 
D
T
 
L
S
 
T
S
 
T
I
 
I
I
 
I
I
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
V
T
 
P
C
 
E
A
 
T
R
 
L
D
 
S
T
 
I
G
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
A
 
Y
V
 
V
L
 
V
L
 
A
D
 
E
G
 
G
Q
 
K
F
 
I
G
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
K
 
T
F
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
-
 
Q
-
 
A
F
 
Y
K
 
A
T
 
S
P
 
P

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
34% identity, 93% coverage: 3:234/249 of query aligns to 2:234/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
E
 
Q
K
 
S
V
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
V
R
 
K
G
 
N
L
 
L
K
 
S
K
 
F
S
 
N
F
x
R
G
 
G
E
 
E
L
x
R
D
 
V
V
 
I
L
 
Y
M
 
D
G
 
N
V
 
I
D
 
S
L
 
L
D
 
N
L
 
I
Y
 
R
K
 
R
G
 
G
E
 
Q
N
 
I
V
 
T
V
 
A
V
 
I
L
 
M
G
 
G
K
 
P
S
 
S
G
|
G
T
|
T
G
 
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
I
 
L
M
 
I
V
 
G
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
T
 
V
Q
 
P
D
 
D
E
 
Q
G
 
G
T
 
E
M
 
V
N
 
L
V
 
L
L
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
D
V
 
I
S
 
A
N
 
Q
L
 
M
G
 
S
A
 
R
K
 
Q
D
 
E
L
 
L
N
 
F
E
 
A
L
 
A
R
 
R
L
 
A
K
 
R
I
 
M
G
 
G
F
 
M
S
 
L
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
S
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
D
 
T
S
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
R
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
I
V
 
R
R
 
A
N
 
H
V
 
T
K
 
K
G
 
-
L
 
L
S
 
S
R
 
E
T
 
N
E
 
L
K
 
I
D
 
A
K
 
E
M
 
L
V
 
V
E
 
A
E
 
L
V
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
R
Q
 
G
T
 
T
I
 
E
N
 
Q
Q
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
R
 
N
K
 
R
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
I
I
 
A
L
 
L
K
 
D
P
 
P
E
 
D
I
 
L
M
 
I
L
 
M
Y
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
T
 
V
C
 
K
S
 
G
D
 
V
I
 
L
N
 
T
N
 
R
L
 
L
I
 
I
N
 
R
E
 
S
V
 
L
R
 
R
E
 
E
N
 
A
Y
 
L
N
 
D
T
 
L
S
 
T
S
 
T
I
 
I
I
 
I
I
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
V
T
 
P
C
 
E
A
 
T
R
 
L
D
 
S
T
 
I
G
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
A
 
Y
V
 
V
L
 
V
L
 
A
D
 
E
G
 
G
Q
 
K
F
 
I
G
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
K
 
T
F
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
-
 
Q
-
 
A
F
 
Y
K
 
A
T
 
S
P
 
P

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
34% identity, 92% coverage: 5:234/249 of query aligns to 2:232/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
V
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
V
R
 
K
G
 
N
L
 
L
K
 
S
K
 
F
S
 
N
F
x
R
G
 
G
E
 
E
L
 
R
D
 
V
V
 
I
L
 
Y
M
 
D
G
 
N
V
 
I
D
 
S
L
 
L
D
 
N
L
 
I
Y
 
R
K
 
R
G
 
G
E
 
Q
N
 
I
V
 
T
V
 
A
V
 
I
L
 
M
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
T
 
T
G
|
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
I
 
L
M
 
I
V
 
G
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
T
 
V
Q
 
P
D
 
D
E
 
Q
G
 
G
T
 
E
M
 
V
N
 
L
V
 
L
L
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
D
V
 
I
S
 
A
N
 
Q
L
 
M
G
 
S
A
 
R
K
 
Q
D
 
E
L
 
L
N
 
F
E
 
A
L
 
A
R
 
R
L
 
A
K
 
R
I
 
M
G
 
G
F
 
M
S
 
L
F
 
F
Q
|
Q
A
 
S
S
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
D
 
T
S
 
D
M
 
M
T
 
S
V
 
V
R
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
I
V
 
R
R
 
A
N
 
H
V
 
T
K
 
K
G
 
-
L
 
L
S
 
S
R
 
E
T
 
N
E
 
L
K
 
I
D
 
A
K
 
E
M
 
L
V
 
V
E
 
A
E
 
L
V
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
R
Q
 
G
T
 
T
I
 
E
N
 
Q
Q
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
T
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
R
 
N
K
 
R
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
I
I
 
A
L
 
L
K
 
D
P
 
P
E
 
D
I
 
L
M
 
I
L
 
M
Y
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
T
 
V
C
 
K
S
 
G
D
 
V
I
 
L
N
 
T
N
 
R
L
 
L
I
 
I
N
 
R
E
 
S
V
 
L
R
 
R
E
 
E
N
 
A
Y
 
L
N
 
D
T
 
L
S
 
T
S
 
T
I
 
I
I
 
I
I
 
V
T
 
S
H
|
H
D
 
D
L
 
V
T
 
P
C
 
E
A
 
T
R
 
L
D
 
S
T
 
I
G
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
A
 
Y
V
 
V
L
 
V
L
 
A
D
 
E
G
 
G
Q
 
K
F
 
I
G
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
K
 
T
F
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
-
 
Q
-
 
A
F
 
Y
K
 
A
T
 
S
P
 
P

8g4cB Bceabs atpgs high res tm (see paper)
34% identity, 87% coverage: 5:220/249 of query aligns to 3:220/248 of 8g4cB

query
sites
8g4cB
V
 
I
V
 
L
E
 
E
V
 
A
R
 
N
G
 
K
L
 
I
K
 
R
K
 
K
S
 
S
F
x
Y
G
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
L
-
 
N
E
 
K
L
 
Q
D
 
E
V
 
V
L
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
I
D
 
H
L
 
I
Y
 
E
K
 
K
G
 
G
E
 
E
N
 
F
V
 
V
V
 
S
V
 
I
L
 
M
G
 
G
K
 
A
S
|
S
G
 
G
T
x
S
G
 
G
K
 
K
S
x
T
V
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
N
I
 
V
M
 
L
V
 
S
G
 
S
L
 
I
L
 
D
T
 
Q
Q
 
V
D
 
S
E
 
H
G
 
G
T
 
T
M
 
I
N
 
H
V
 
I
L
 
N
G
 
G
K
 
N
E
 
D
V
 
M
S
 
T
N
 
A
L
 
M
G
 
K
A
 
E
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
N
 
A
E
 
E
L
 
F
R
 
R
L
 
K
K
 
Q
-
 
H
I
 
L
G
 
G
F
 
F
S
 
I
F
 
F
Q
 
Q
A
 
D
S
 
Y
A
 
N
L
 
L
Y
 
L
D
 
D
S
 
T
M
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
K
E
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
L
F
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
-
R
 
-
N
 
S
V
 
I
K
 
T
G
 
K
L
 
L
S
 
S
R
 
K
T
 
K
E
 
E
K
 
A
D
 
N
K
 
R
M
 
K
V
 
F
E
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
A
E
 
K
A
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
Y
Q
 
E
T
 
L
I
 
R
N
 
D
Q
 
K
M
 
Y
P
 
P
S
 
N
E
 
E
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
I
 
T
G
 
S
I
 
A
A
 
G
R
 
R
T
 
A
L
 
F
I
 
I
L
 
H
K
 
D
P
 
P
E
 
S
I
 
I
M
 
I
L
 
F
Y
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
I
 
K
T
 
S
C
 
A
S
 
S
D
 
D
I
 
L
N
 
L
N
 
N
L
 
K
I
 
L
N
 
S
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Q
N
 
K
Y
 
R
N
 
N
T
 
A
S
 
T
S
 
I
I
 
I
I
 
M
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
P
T
 
V
C
 
A
A
 
A
R
 
S
D
 
Y
T
 
C
G
 
G
D
 
-
R
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
F
L
 
I
L
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q

7tchB Bceab e169q variant atp-bound conformation (see paper)
34% identity, 87% coverage: 5:220/249 of query aligns to 2:219/245 of 7tchB

query
sites
7tchB
V
 
I
V
 
L
E
 
E
V
 
A
R
 
N
G
 
K
L
 
I
K
 
R
K
 
K
S
 
S
F
x
Y
G
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
L
-
 
N
E
 
K
L
x
Q
D
 
E
V
|
V
L
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
I
D
 
H
L
 
I
Y
 
E
K
 
K
G
 
G
E
 
E
N
 
F
V
 
V
V
 
S
V
 
I
L
 
M
G
 
G
K
 
A
S
|
S
G
|
G
T
x
S
G
 
G
K
|
K
S
x
T
V
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
N
I
 
V
M
 
L
V
 
S
G
 
S
L
 
I
L
 
D
T
 
Q
Q
 
V
D
 
S
E
 
H
G
 
G
T
 
T
M
 
I
N
 
H
V
 
I
L
 
N
G
 
G
K
 
N
E
 
D
V
 
M
S
 
T
N
 
A
L
 
M
G
 
K
A
 
E
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
N
 
A
E
 
E
L
 
F
R
 
R
L
 
K
K
 
Q
-
 
H
I
 
L
G
 
G
F
 
F
S
 
I
F
 
F
Q
 
Q
A
 
D
S
 
Y
A
 
N
L
 
L
Y
 
L
D
 
D
S
 
T
M
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
K
E
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
L
F
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
-
R
 
-
N
 
S
V
 
I
K
 
T
G
 
K
L
 
L
S
 
S
R
 
K
T
 
K
E
 
E
K
 
A
D
 
N
K
 
R
M
 
K
V
 
F
E
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
A
E
 
K
A
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
Y
Q
 
E
T
 
L
I
 
R
N
 
D
Q
 
K
M
 
Y
P
 
P
S
 
N
E
|
E
L
 
I
S
 
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
Q
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
I
 
T
G
 
S
I
 
A
A
 
G
R
 
R
T
 
A
L
 
F
I
 
I
L
 
H
K
 
D
P
 
P
E
 
S
I
 
I
M
 
I
L
 
F
Y
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
I
 
K
T
 
S
C
 
A
S
 
S
D
 
D
I
 
L
N
 
L
N
 
N
L
 
K
I
 
L
N
 
S
E
 
Q
V
 
L
R
 
N
E
 
Q
N
 
K
Y
 
R
N
 
N
T
 
A
S
 
T
S
 
I
I
 
I
I
 
M
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
P
T
 
V
C
 
A
A
 
A
R
 
S
D
 
Y
T
 
C
G
 
G
D
 
-
R
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
F
L
 
I
L
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
32% identity, 95% coverage: 6:242/249 of query aligns to 4:238/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
V
 
V
E
 
E
V
 
L
R
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
T
K
 
F
S
 
K
F
x
R
G
 
G
E
 
S
L
 
R
D
 
A
V
 
I
L
 
F
M
 
D
G
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
R
L
 
I
Y
 
P
K
 
R
G
 
G
E
 
K
N
 
V
V
 
T
V
 
G
V
 
I
L
 
M
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
T
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
I
 
L
M
 
I
V
 
A
G
 
S
L
 
Q
L
 
L
T
 
R
Q
 
P
D
 
S
E
 
K
G
 
G
T
 
E
M
 
V
N
 
W
V
 
V
L
 
N
G
 
G
K
 
Q
E
 
N
V
 
L
S
 
P
N
 
Q
L
 
L
G
 
S
A
 
R
K
 
G
D
 
D
L
 
L
N
 
F
E
 
D
L
 
M
R
 
R
L
 
K
K
 
Q
I
 
F
G
 
G
F
 
V
S
 
L
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
S
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
D
 
T
S
 
D
M
 
L
T
 
D
V
 
V
R
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
R
R
 
V
N
 
H
V
 
T
K
 
Q
G
 
L
L
 
P
S
 
E
R
 
E
T
 
M
E
 
I
K
 
R
D
 
D
K
 
I
M
 
V
V
 
L
E
 
M
E
 
K
V
 
-
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
R
Q
 
G
T
 
A
I
 
V
N
 
E
Q
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
R
 
K
K
 
R
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
I
I
 
A
L
 
L
K
 
D
P
 
P
E
 
Q
I
 
I
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
V
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
T
 
A
C
 
M
S
 
G
D
 
V
I
 
L
N
 
V
N
 
R
L
 
L
I
 
I
N
 
R
E
 
L
V
 
L
R
 
N
E
 
D
N
 
A
Y
 
L
N
 
G
T
 
I
S
 
T
S
 
S
I
 
I
I
 
V
I
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
T
 
A
C
 
E
A
 
T
R
 
A
D
 
S
T
 
I
G
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
A
 
Y
V
 
I
L
 
V
L
 
G
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
F
 
V
G
 
L
A
 
G
E
 
H
G
 
G
K
 
T
F
 
-
E
 
P
E
 
D
V
 
V
F
 
L
K
 
K
T
 
E
P
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
P
R
 
R
V
 
I
K
 
R
S
 
Q
F
 
F

1g291 Malk (see paper)
33% identity, 92% coverage: 13:242/249 of query aligns to 11:239/372 of 1g291

query
sites
1g291
K
 
K
S
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
E
L
 
V
D
 
T
V
 
A
L
 
V
M
 
R
G
 
E
V
 
M
D
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
V
Y
 
K
K
 
D
G
 
G
E
 
E
N
 
F
V
 
M
V
 
I
V
 
L
L
 
L
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
T
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
T
I
 
L
K
 
R
I
 
M
M
 
I
V
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
E
Q
 
P
D
 
S
E
 
R
G
 
G
T
 
Q
M
 
I
N
 
Y
V
 
I
L
 
G
G
 
D
K
 
K
E
 
L
V
 
V
S
 
A
N
x
D
-
 
P
-
x
E
-
x
K
-
 
G
-
 
I
-
 
F
L
 
V
G
 
P
A
 
P
K
|
K
D
|
D
L
 
R
N
 
D
E
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
I
G
 
A
F
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
S
 
Y
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
D
 
P
S
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
I
E
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
-
R
 
-
N
 
K
V
 
L
K
 
R
G
 
K
L
 
V
S
 
P
R
 
R
T
 
Q
E
 
E
K
 
I
D
 
D
K
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
V
L
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
Q
 
E
T
 
L
I
 
L
N
 
N
Q
 
R
M
 
K
P
 
P
S
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
G
R
 
R
T
 
A
L
 
I
I
 
V
L
 
R
K
 
K
P
 
P
E
 
Q
I
 
V
M
 
F
L
 
L
Y
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
I
 
K
T
 
L
C
 
R
S
 
V
D
 
R
I
 
M
N
 
R
N
 
A
L
 
E
I
 
L
N
 
K
E
 
K
V
 
L
R
 
Q
E
 
R
N
 
Q
Y
 
L
N
 
G
T
 
V
S
 
T
S
 
T
I
 
I
I
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
T
 
V
C
 
E
A
 
A
R
 
M
D
 
T
T
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
M
L
 
N
D
 
R
G
 
G
Q
 
V
F
 
L
G
 
Q
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
K
 
S
F
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
Y
K
 
D
T
 
K
P
 
P
E
 
A
D
 
N
Q
 
T
R
 
F
V
 
V
K
 
A
S
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3d31A Modbc from methanosarcina acetivorans (see paper)
31% identity, 97% coverage: 5:245/249 of query aligns to 1:230/348 of 3d31A

query
sites
3d31A
V
 
M
V
 
I
E
 
E
V
 
I
R
 
E
G
 
S
L
 
L
K
 
S
K
 
R
S
 
K
F
 
W
G
 
K
E
 
N
L
 
F
D
 
S
V
 
-
L
 
L
M
 
D
G
 
N
V
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
K
L
 
V
Y
 
E
K
 
S
G
 
G
E
 
E
N
 
Y
V
 
F
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
K
 
P
S
 
T
G
 
G
T
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
V
 
L
L
 
F
I
 
L
K
 
E
I
 
L
M
 
I
V
 
A
G
 
G
L
 
F
L
 
H
T
 
V
Q
 
P
D
 
D
E
 
S
G
 
G
T
 
R
M
 
I
N
 
L
V
 
L
L
 
D
G
 
G
K
 
K
E
 
D
V
 
V
S
 
T
N
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
D
L
 
L
N
 
S
E
 
P
L
 
E
R
 
K
L
 
H
K
 
D
I
 
I
G
 
A
F
 
F
S
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
A
 
N
S
 
Y
A
 
S
L
 
L
Y
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
M
T
 
N
V
 
V
R
 
K
E
 
K
N
 
N
L
 
L
E
 
E
F
 
F
P
 
G
L
 
M
-
 
R
-
 
M
-
 
K
-
 
K
V
 
I
R
 
K
N
 
D
V
 
P
K
 
K
G
 
R
L
 
V
S
 
L
R
 
D
T
 
T
E
 
A
K
 
R
D
 
D
K
 
L
M
 
K
V
 
I
E
 
E
E
 
H
V
 
L
L
 
L
E
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
Q
 
-
T
 
-
I
 
-
N
 
D
Q
 
R
M
 
N
P
 
P
S
 
L
E
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
Q
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
L
I
 
V
L
 
T
K
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
I
M
 
L
L
 
L
Y
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
R
T
 
T
C
 
Q
S
 
E
D
 
N
I
 
A
N
 
R
N
 
E
L
 
M
I
 
L
N
 
S
E
 
V
V
 
L
R
 
H
E
 
K
N
 
K
Y
 
N
N
 
K
T
 
L
S
 
T
S
 
V
I
 
L
I
 
H
I
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
T
 
T
C
 
E
A
 
A
R
 
R
D
 
I
T
 
M
G
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
M
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
F
 
L
G
 
I
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
K
 
E
T
 
K
P
 
P
E
 
V
D
 
E
Q
 
G
R
 
R
V
 
V
K
 
A
S
 
S
F
 
F
Y
 
V
D
 
G
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

2d62A Crystal structure of multiple sugar binding transport atp- binding protein
32% identity, 95% coverage: 6:242/249 of query aligns to 7:242/375 of 2d62A

query
sites
2d62A
V
 
V
E
 
K
V
 
L
R
 
I
G
 
N
L
 
I
K
 
W
K
 
K
S
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
D
L
 
V
D
 
T
V
 
A
L
 
V
M
 
K
G
 
D
V
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
I
Y
 
K
K
 
D
G
 
G
E
 
E
N
 
F
V
 
L
V
 
V
V
 
L
L
 
L
G
 
G
K
 
P
S
 
S
G
|
G
T
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
T
I
 
L
K
 
R
I
 
M
M
 
I
V
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
E
Q
 
P
D
 
T
E
 
R
G
 
G
T
 
Q
M
 
I
N
 
Y
V
 
I
L
 
E
G
 
D
K
 
N
E
 
L
V
 
V
S
 
A
N
 
D
L
 
P
G
 
E
A
 
K
K
 
G
D
 
V
L
 
F
N
 
V
E
 
P
L
 
P
R
 
K
L
 
E
K
 
R
-
 
D
I
 
V
G
 
A
F
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
S
 
Y
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
D
 
P
S
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
I
E
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
-
R
 
-
N
 
K
V
 
L
K
 
R
G
 
K
L
 
V
S
 
P
R
 
K
T
 
Q
E
 
E
K
 
I
D
 
D
K
 
K
M
 
R
V
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
V
L
 
A
E
 
E
A
 
M
V
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
Q
 
E
T
 
L
I
 
L
N
 
N
Q
 
R
M
 
K
P
 
P
S
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
G
R
 
R
T
 
A
L
 
I
I
 
I
L
 
R
K
 
R
P
 
P
E
 
K
I
 
V
M
 
F
L
 
L
Y
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
I
 
K
T
 
L
C
 
R
S
 
V
D
 
K
I
 
M
N
 
R
N
 
A
L
 
E
I
 
L
N
 
K
E
 
K
V
 
L
R
 
Q
E
 
R
N
 
Q
Y
 
L
N
 
G
T
 
V
S
 
T
S
 
T
I
 
I
I
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
T
 
V
C
 
E
A
 
A
R
 
M
D
 
T
T
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
M
L
 
N
D
 
K
G
 
G
Q
 
E
F
 
L
G
 
Q
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
K
 
T
F
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
F
 
Y
K
 
Y
T
 
K
P
 
P
E
 
V
D
 
N
Q
 
T
R
 
F
V
 
V
K
 
A
S
 
G
F
 
F

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
33% identity, 96% coverage: 4:242/249 of query aligns to 3:228/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
K
 
K
V
 
M
V
 
V
E
 
E
V
 
V
R
 
K
-
 
L
-
 
E
G
 
N
L
 
L
K
 
T
K
 
K
S
 
R
F
|
F
G
 
G
E
 
N
L
x
F
D
 
T
V
 
A
L
 
V
M
 
N
G
 
K
V
 
L
D
 
N
L
 
L
D
 
T
L
 
I
Y
 
K
K
 
D
G
 
G
E
 
E
N
 
F
V
 
L
V
 
V
V
 
L
L
 
L
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
T
 
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
T
I
 
L
K
 
R
I
 
M
M
 
I
V
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
E
Q
 
P
D
 
T
E
 
E
G
 
G
T
 
R
M
 
I
N
 
Y
V
 
F
L
 
G
G
 
D
K
 
R
E
 
D
V
 
V
S
 
T
N
 
Y
L
 
L
G
 
P
A
 
P
K
 
K
D
 
D
L
 
R
N
 
N
E
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
I
S
 
S
A
 
M
L
 
V
Y
 
F
D
 
Q
S
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
K
 
K
G
 
K
L
 
F
S
 
P
R
 
K
T
 
D
E
 
E
K
 
I
D
 
D
K
 
K
M
 
R
V
 
V
E
 
R
E
 
W
V
 
A
L
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
L
G
 
Q
L
 
I
S
 
E
Q
 
E
T
 
L
I
 
L
N
 
N
Q
 
R
M
 
Y
P
 
P
S
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
I
I
 
V
L
 
V
K
 
E
P
 
P
E
 
D
I
 
V
M
 
L
L
 
L
Y
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
I
 
K
T
 
L
C
 
R
S
 
V
D
 
A
I
 
M
N
 
R
N
 
A
L
 
E
I
 
I
N
 
K
E
 
K
V
 
L
R
 
Q
E
 
Q
N
 
K
Y
 
L
N
 
K
T
 
V
S
 
T
S
 
T
I
 
I
I
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
T
 
V
C
 
E
A
 
A
R
 
M
D
 
T
T
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
M
L
 
N
D
 
R
G
 
G
Q
 
Q
F
 
L
G
 
L
A
 
Q
E
 
I
G
 
G
K
 
S
F
 
P
E
 
T
E
 
E
V
 
V
F
 
Y
K
 
L
T
 
R
P
 
P
E
 
N
D
 
S
Q
 
V
R
 
F
V
 
V
K
 
A
S
 
T
F
 
F

P19566 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
32% identity, 95% coverage: 6:242/249 of query aligns to 4:233/369 of P19566

query
sites
P19566
V
 
V
E
 
Q
V
 
L
R
 
R
G
 
N
L
 
V
K
 
T
K
 
K
S
 
A
F
 
W
G
 
G
E
 
D
L
 
V
D
 
V
V
 
V
L
 
S
M
 
K
G
 
D
V
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
I
Y
 
H
K
 
D
G
 
G
E
 
E
N
 
F
V
 
V
V
 
V
V
 
F
L
 
V
G
 
G
K
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
V
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
I
 
M
M
 
I
V
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
T
Q
 
I
D
 
T
E
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
L
N
 
-
V
 
F
L
 
I
G
 
G
K
 
E
E
 
T
V
 
R
S
 
M
N
 
N
L
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
D
L
 
I
N
 
P
E
 
P
L
 
A
R
 
E
L
 
R
K
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
S
 
Y
A
 
A
L
|
L
Y
 
Y
D
 
P
S
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
E
 
S
F
 
F
P
 
G
L
 
L
V
 
-
R
 
-
N
 
K
V
 
L
K
 
A
G
 
G
L
 
A
S
 
K
R
 
K
T
 
E
E
 
V
K
 
M
D
 
N
K
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
L
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
A
Q
 
H
T
 
L
I
 
L
N
 
E
Q
 
R
M
 
K
P
 
P
S
 
K
E
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
I
 
V
L
 
A
K
 
E
P
 
P
E
 
R
I
 
V
M
 
F
L
 
L
Y
 
L
D
 
D
E
 
E
P
|
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
L
 
L
D
|
D
P
 
A
I
 
A
T
 
L
C
 
R
S
 
V
D
 
Q
I
 
M
N
 
R
N
 
I
L
 
E
I
 
I
N
 
S
E
 
R
V
 
L
R
 
H
E
 
K
N
 
R
Y
 
L
N
 
G
T
 
R
S
 
T
S
 
M
I
 
I
I
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
T
 
V
C
 
E
A
 
A
R
 
M
D
 
T
T
 
L
G
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
D
D
 
A
G
 
G
Q
 
R
F
 
V
G
 
A
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
P
E
 
L
E
 
E
V
 
L
F
 
Y
K
 
H
T
 
Y
P
 
P
E
 
A
D
 
D
Q
 
R
R
 
F
V
 
V
K
 
A
S
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3puyA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state (see paper)
32% identity, 95% coverage: 6:242/249 of query aligns to 3:232/371 of 3puyA

query
sites
3puyA
V
 
V
E
 
Q
V
 
L
R
 
Q
G
 
N
L
 
V
K
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
E
 
E
L
 
V
D
 
V
V
 
V
L
 
S
M
 
K
G
 
D
V
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
I
Y
 
H
K
 
E
G
 
G
E
 
E
N
 
F
V
 
V
V
 
V
V
 
F
L
 
V
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
T
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
I
 
M
M
 
I
V
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
T
Q
 
I
D
 
T
E
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
L
N
 
-
V
 
F
L
 
I
G
 
G
K
 
E
E
 
K
V
 
R
S
 
M
N
 
N
L
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
D
L
 
T
N
 
P
E
 
P
L
 
A
R
 
E
L
 
R
K
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
|
Q
A
 
S
S
 
Y
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
D
 
P
S
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
E
 
S
F
 
F
P
 
G
L
 
L
V
 
-
R
 
-
N
 
K
V
 
L
K
 
A
G
 
G
L
 
A
S
 
K
R
 
K
T
 
E
E
 
V
K
 
I
D
 
N
K
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
L
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
A
Q
 
H
T
 
L
I
 
L
N
 
D
Q
x
R
M
 
K
P
 
P
S
 
K
E
x
A
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
I
 
V
L
 
A
K
 
E
P
 
P
E
 
S
I
 
V
M
 
F
L
 
L
Y
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
I
 
A
T
 
L
C
 
R
S
 
V
D
 
Q
I
 
M
N
 
R
N
 
I
L
 
E
I
 
I
N
 
S
E
 
R
V
 
L
R
 
H
E
 
K
N
 
R
Y
 
L
N
 
G
T
 
R
S
 
T
S
 
M
I
 
I
I
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
T
 
V
C
 
E
A
 
A
R
 
M
D
 
T
T
 
L
G
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
D
D
 
A
G
 
G
Q
 
R
F
 
V
G
 
A
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
P
E
 
L
E
 
E
V
 
L
F
 
Y
K
 
H
T
 
Y
P
 
P
E
 
A
D
 
D
Q
 
R
R
 
F
V
 
V
K
 
A
S
 
G
F
 
F

3puxA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3 (see paper)
32% identity, 95% coverage: 6:242/249 of query aligns to 3:232/371 of 3puxA

query
sites
3puxA
V
 
V
E
 
Q
V
 
L
R
 
Q
G
 
N
L
 
V
K
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
G
 
G
E
 
E
L
 
V
D
 
V
V
 
V
L
 
S
M
 
K
G
 
D
V
 
I
D
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
I
Y
 
H
K
 
E
G
 
G
E
 
E
N
 
F
V
 
V
V
 
V
V
 
F
L
 
V
G
 
G
K
 
P
S
|
S
G
|
G
T
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
I
 
M
M
 
I
V
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
E
T
 
T
Q
 
I
D
 
T
E
 
S
G
 
G
T
 
D
M
 
L
N
 
-
V
 
F
L
 
I
G
 
G
K
 
E
E
 
K
V
 
R
S
 
M
N
 
N
L
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
D
L
 
T
N
 
P
E
 
P
L
 
A
R
 
E
L
 
R
K
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
|
Q
A
 
S
S
 
Y
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
D
 
P
S
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
E
 
S
F
 
F
P
 
G
L
 
L
V
 
-
R
 
-
N
 
K
V
 
L
K
 
A
G
 
G
L
 
A
S
 
K
R
 
K
T
 
E
E
 
V
K
 
I
D
 
N
K
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
L
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
A
Q
 
H
T
 
L
I
 
L
N
 
D
Q
x
R
M
 
K
P
 
P
S
 
K
E
 
A
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
I
 
V
L
 
A
K
 
E
P
 
P
E
 
S
I
 
V
M
 
F
L
 
L
Y
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
G
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
I
 
A
T
 
L
C
 
R
S
 
V
D
 
Q
I
 
M
N
 
R
N
 
I
L
 
E
I
 
I
N
 
S
E
 
R
V
 
L
R
 
H
E
 
K
N
 
R
Y
 
L
N
 
G
T
 
R
S
 
T
S
 
M
I
 
I
I
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
T
 
V
C
 
E
A
 
A
R
 
M
D
 
T
T
 
L
G
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
A
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
D
D
 
A
G
 
G
Q
 
R
F
 
V
G
 
A
A
 
Q
E
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
P
E
 
L
E
 
E
V
 
L
F
 
Y
K
 
H
T
 
Y
P
 
P
E
 
A
D
 
D
Q
 
R
R
 
F
V
 
V
K
 
A
S
 
G
F
 
F

Query Sequence

>Echvi_4044 FitnessBrowser__Cola:Echvi_4044
MREKVVEVRGLKKSFGELDVLMGVDLDLYKGENVVVLGKSGTGKSVLIKIMVGLLTQDEG
TMNVLGKEVSNLGAKDLNELRLKIGFSFQASALYDSMTVRENLEFPLVRNVKGLSRTEKD
KMVEEVLEAVGLSQTINQMPSELSGGQRKRIGIARTLILKPEIMLYDEPTAGLDPITCSD
INNLINEVRENYNTSSIIITHDLTCARDTGDRVAVLLDGQFGAEGKFEEVFKTPEDQRVK
SFYDYNFIT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory