SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Echvi_4411 FitnessBrowser__Cola:Echvi_4411 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
33% identity, 84% coverage: 44:287/292 of query aligns to 2:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
K
 
Q
G
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
S
 
A
G
 
S
A
 
G
I
x
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
I
 
T
C
 
A
C
 
L
R
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
E
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
C
 
N
G
x
D
M
x
I
S
 
D
H
 
A
D
 
E
K
 
K
M
 
V
Q
 
R
G
 
A
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
F
G
 
S
A
 
A
N
 
R
G
 
G
G
 
H
K
 
R
A
 
V
V
 
L
K
 
G
R
 
A
Q
 
V
L
 
A
D
 
D
I
|
I
S
 
G
S
 
N
E
 
K
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
D
E
 
G
F
 
M
Y
 
V
Q
 
K
W
 
Q
L
 
T
K
 
I
E
 
D
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
G
 
M
S
 
E
A
 
R
R
 
A
Q
 
G
A
 
A
S
 
L
R
 
R
P
 
K
I
 
L
Y
 
S
E
 
E
L
 
A
E
 
D
T
 
W
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
I
H
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
F
L
 
L
V
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
V
S
 
H
K
 
G
I
 
H
M
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
N
K
 
K
R
 
H
G
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
V
S
 
N
V
x
I
T
 
A
S
|
S
V
 
R
I
 
-
G
 
A
E
 
W
H
 
L
G
 
G
K
 
G
A
 
A
K
 
G
F
 
Q
S
 
T
E
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
R
S
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
C
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
L
V
x
I
Q
 
H
R
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
T
 
T
P
 
P
A
 
M
Q
 
W
M
 
D
A
 
E
K
 
L
L
 
P
K
 
E
K
 
K
T
 
D
N
 
Q
Y
 
Q
M
 
F
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
R
-
 
Q
-
 
P
-
 
T
N
 
G
D
 
K
Y
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
S
 
A
E
 
N
M
 
T
V
 
L
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
D
E
 
D
E
 
D
G
 
S
K
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
N
 
V
F
 
L
K
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
33% identity, 84% coverage: 44:287/292 of query aligns to 3:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
K
 
Q
G
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
S
 
A
G
x
S
A
 
G
I
 
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
I
 
T
C
 
A
C
 
L
R
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
E
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
I
C
 
N
G
x
D
M
 
I
S
 
D
H
 
A
D
 
E
K
 
K
M
 
V
Q
 
R
G
 
A
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
F
G
 
S
A
 
A
N
 
R
G
 
G
G
 
H
K
 
R
A
 
V
V
 
L
K
 
G
R
 
A
Q
 
V
L
 
A
D
|
D
I
|
I
S
 
G
S
 
N
E
 
K
E
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
D
E
 
G
F
 
M
Y
 
V
Q
 
K
W
 
Q
L
 
T
K
 
I
E
 
D
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
G
 
M
S
 
E
A
 
R
R
 
A
Q
 
G
A
 
A
S
 
L
R
 
R
P
 
K
I
 
L
Y
 
S
E
 
E
L
 
A
E
 
D
T
 
W
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
I
H
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
F
L
 
L
V
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
V
S
 
H
K
 
G
I
 
H
M
 
M
V
 
V
A
 
E
A
 
N
K
 
K
R
 
H
G
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
V
S
 
N
V
 
I
T
 
A
S
 
S
V
 
R
I
 
-
G
 
A
E
 
W
H
 
L
G
 
G
K
 
G
A
 
A
K
 
G
F
 
Q
S
 
T
E
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
R
S
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
C
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
L
V
 
I
Q
 
H
R
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
T
 
T
P
 
P
A
 
M
Q
 
W
M
 
D
A
 
E
K
 
L
L
 
P
K
 
E
K
 
K
T
 
D
N
 
Q
Y
 
Q
M
 
F
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
R
-
 
Q
-
 
P
-
 
T
N
 
G
D
 
K
Y
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
S
 
A
E
 
N
M
 
T
V
 
L
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
D
E
 
D
E
 
D
G
 
S
K
 
G
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
N
 
V
F
 
L
K
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
35% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 4:243/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
K
 
T
G
 
A
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
x
A
S
 
S
G
 
R
A
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
T
C
 
A
C
 
L
R
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
T
G
 
G
A
 
M
L
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
-
 
N
C
 
Y
G
 
A
M
 
Q
S
 
S
H
 
S
D
 
T
K
 
A
M
 
A
Q
 
D
G
 
A
V
 
V
V
 
V
D
 
A
E
 
E
I
 
I
G
 
I
A
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
K
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
A
R
 
V
Q
 
Q
L
 
A
D
 
N
I
 
V
S
 
A
S
 
N
E
 
A
E
 
D
K
 
E
I
 
V
I
 
D
E
 
Q
F
 
L
Y
 
I
Q
 
K
W
 
T
L
 
T
K
 
L
E
 
D
S
 
K
Y
 
F
G
 
S
Q
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
I
S
 
T
A
 
R
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
D
R
 
T
P
 
L
I
 
L
Y
 
L
E
 
R
L
 
M
E
 
K
T
 
L
E
 
E
T
 
D
I
 
W
D
 
Q
T
 
A
T
 
V
L
 
I
H
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
V
I
 
F
L
 
L
V
 
C
T
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
V
S
 
S
K
 
K
I
 
L
M
 
M
V
 
L
A
 
K
A
 
Q
K
 
K
R
 
S
G
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
N
V
 
I
T
 
T
S
 
S
V
 
V
I
 
A
G
 
G
E
 
M
H
 
M
G
 
G
K
 
N
A
x
P
K
 
G
F
 
Q
S
 
A
E
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
A
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
T
I
 
V
A
 
A
M
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
I
x
F
V
 
I
Q
 
A
R
 
T
G
 
D
T
 
M
I
 
T
T
 
E
P
 
N
A
 
L
Q
x
N
M
 
A
A
 
E
K
 
P
L
 
I
K
 
L
K
 
Q
T
 
F
N
 
I
Y
 
P
M
 
L
N
 
A
D
 
R
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
S
 
A
E
 
G
M
 
T
V
 
I
A
 
R
Y
 
F
L
 
L
-
 
A
T
 
T
R
 
D
E
 
P
E
 
A
G
 
A
K
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
N
 
T
F
 
F
K
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
34% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 3:240/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
F
K
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
G
x
R
A
x
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
C
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
G
C
 
T
G
 
A
M
x
T
S
 
S
H
 
E
D
 
S
K
 
G
M
 
A
Q
 
Q
G
 
A
V
 
I
V
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
K
K
 
G
A
 
L
V
 
M
K
x
L
R
x
N
Q
x
V
L
 
T
D
 
D
I
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
I
E
 
E
K
 
S
I
 
V
I
 
L
E
 
E
F
 
N
Y
 
-
Q
 
-
W
 
-
L
 
V
K
 
R
E
 
A
S
 
E
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
 
N
A
|
A
G
|
G
G
x
I
S
 
T
A
 
R
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
D
R
 
N
P
 
L
I
 
L
Y
 
M
E
 
R
L
 
M
E
 
K
T
 
D
E
 
D
T
 
E
I
 
W
D
 
N
T
 
D
T
 
I
L
 
I
H
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
A
 
V
I
 
F
L
 
R
V
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
S
 
M
K
 
R
I
 
A
M
 
M
V
 
M
A
 
K
A
 
K
K
 
R
R
 
H
G
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
T
V
 
I
T
 
G
S
|
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
T
H
 
M
G
 
G
K
 
N
A
 
A
K
 
G
F
 
Q
S
 
A
E
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
I
 
L
A
 
A
M
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
F
V
 
I
Q
 
E
R
 
T
G
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
T
 
A
I
 
L
T
 
T
P
 
D
A
 
E
Q
 
Q
M
 
R
A
 
A
K
 
G
L
 
T
K
 
L
K
 
A
T
 
A
N
 
V
Y
 
P
M
 
A
N
 
G
D
 
R
Y
 
L
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
N
D
 
E
I
 
I
S
 
A
E
 
S
M
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
D
E
 
E
G
 
A
K
 
S
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
N
 
T
F
 
L
K
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
33% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 2:239/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
L
 
F
K
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
G
x
R
A
x
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
C
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
G
C
 
T
G
 
A
M
x
T
S
 
S
H
 
E
D
 
N
K
 
G
M
 
A
Q
 
Q
G
 
A
V
 
I
V
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
K
K
 
G
A
 
L
V
 
M
K
 
L
R
x
N
Q
x
V
L
 
T
D
 
D
I
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
I
E
 
E
K
 
S
I
 
V
I
 
L
E
 
E
F
 
-
Y
 
-
Q
 
-
W
 
K
L
 
I
K
 
R
E
 
A
S
 
E
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
G
x
I
S
 
T
A
 
R
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
D
R
 
N
P
 
L
I
 
L
Y
 
M
E
 
R
L
 
M
E
 
K
T
 
D
E
 
E
T
x
E
I
 
W
D
 
N
T
 
D
T
 
I
L
 
I
H
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
A
 
V
I
 
F
L
 
R
V
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
S
 
M
K
 
R
I
 
A
M
 
M
V
 
M
A
 
K
A
 
K
K
 
R
R
 
H
G
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
T
V
 
I
T
 
G
S
|
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
T
H
 
M
G
 
G
K
 
N
A
 
G
K
 
G
F
x
Q
S
 
A
E
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
I
 
L
A
 
A
M
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
V
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
F
V
x
I
Q
 
E
R
 
T
G
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
T
 
A
I
 
L
T
 
S
P
 
D
A
 
D
Q
 
Q
M
 
R
A
 
A
K
 
G
L
 
I
K
 
L
K
 
A
T
 
Q
N
 
V
Y
 
P
M
 
A
N
 
G
D
 
R
Y
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
I
S
 
A
E
 
N
M
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
D
E
 
E
G
 
A
K
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
N
x
T
F
 
L
K
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
33% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 3:240/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
L
 
F
K
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
S
|
S
G
x
R
A
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
C
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
G
C
 
T
G
 
A
M
x
T
S
 
S
H
 
E
D
 
N
K
 
G
M
 
A
Q
 
Q
G
 
A
V
 
I
V
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
K
K
 
G
A
 
L
V
 
M
K
 
L
R
x
N
Q
x
V
L
 
T
D
 
D
I
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
I
E
 
E
K
 
S
I
 
V
I
 
L
E
 
E
F
 
-
Y
 
-
Q
 
-
W
 
K
L
 
I
K
 
R
E
 
A
S
 
E
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
G
 
I
S
 
T
A
 
R
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
D
R
 
N
P
 
L
I
 
L
Y
 
M
E
 
R
L
 
M
E
 
K
T
 
D
E
 
E
T
 
E
I
 
W
D
 
N
T
 
D
T
 
I
L
 
I
H
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
A
 
V
I
 
F
L
 
R
V
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
S
 
M
K
 
R
I
 
A
M
 
M
V
 
M
A
 
K
A
 
K
K
 
R
R
 
H
G
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
T
V
 
I
T
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
T
H
 
M
G
 
G
K
 
N
A
 
G
K
 
G
F
 
Q
S
 
A
E
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
A
|
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
I
 
L
A
 
A
M
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
F
V
x
I
Q
 
E
R
 
T
G
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
T
 
A
I
 
L
T
 
S
P
 
D
A
 
D
Q
 
Q
M
 
R
A
 
A
K
 
G
L
 
I
K
 
L
K
 
A
T
 
Q
N
 
V
Y
 
P
M
 
A
N
 
G
D
 
R
Y
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
I
S
 
A
E
 
N
M
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
D
E
 
E
G
 
A
K
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
x
E
N
 
T
F
 
L
K
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
32% identity, 84% coverage: 44:287/292 of query aligns to 5:253/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
L
 
L
K
 
K
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
G
G
x
S
A
x
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
C
 
K
R
 
K
L
 
F
A
 
A
A
 
L
D
 
N
G
 
D
A
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
A
C
 
V
G
x
E
M
x
L
S
 
L
H
 
E
D
 
D
K
x
R
M
 
L
Q
 
N
G
 
Q
V
 
I
V
 
V
D
 
Q
E
 
E
I
 
L
G
 
R
A
 
G
N
 
M
G
 
G
G
 
K
K
 
E
A
 
V
V
 
L
K
 
G
R
 
V
Q
 
K
L
x
A
D
|
D
I
x
V
S
 
S
S
 
K
E
 
K
E
 
K
K
 
D
I
 
V
I
 
E
E
 
E
F
 
F
Y
 
V
Q
 
R
W
 
R
L
 
T
K
 
F
E
 
E
S
 
T
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
C
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
G
 
-
S
 
-
A
x
I
R
 
M
Q
 
D
A
 
G
S
 
V
R
 
T
P
 
P
I
 
V
Y
 
A
E
 
E
L
 
V
E
 
S
T
 
D
E
 
E
T
 
L
I
 
W
D
 
E
T
 
R
T
 
V
L
 
L
H
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
Y
G
 
S
A
 
A
I
 
F
L
 
Y
V
 
S
T
 
S
R
 
R
E
 
A
A
 
V
S
 
I
K
 
P
I
 
I
M
 
M
V
 
L
A
 
K
A
 
Q
K
 
G
R
 
K
G
 
G
T
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
N
V
x
T
T
 
A
S
|
S
V
 
I
I
 
A
G
 
G
E
 
I
H
 
R
G
 
G
K
 
G
A
 
F
K
 
A
F
 
G
S
 
A
E
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
V
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
A
M
 
A
E
 
H
L
 
Y
G
 
G
K
 
D
L
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
R
A
 
A
N
 
V
C
 
A
V
 
V
S
 
L
P
|
P
G
 
G
I
 
T
V
|
V
Q
 
K
R
x
T
-
x
N
-
x
I
-
 
G
-
 
L
G
 
G
T
 
S
I
 
S
T
 
K
P
 
P
A
x
S
Q
 
E
M
 
L
A
 
G
K
 
M
L
 
R
K
 
T
K
 
L
T
 
T
N
 
K
Y
 
L
M
 
M
N
 
S
D
 
L
Y
 
S
G
 
S
R
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
S
 
A
E
 
N
M
 
V
V
 
I
A
 
V
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
D
E
 
E
G
 
A
K
 
S
F
 
F
I
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
D
N
 
A
F
 
V
K
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
S
 
T
L
 
V

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
34% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 3:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
G
x
R
A
x
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
I
 
I
C
 
A
C
 
I
R
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
K
D
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
N
V
 
I
V
 
F
V
 
F
-
x
N
C
x
Y
G
x
N
M
x
G
S
|
S
H
 
P
D
 
E
K
 
A
M
 
A
Q
 
E
G
 
E
V
 
T
V
 
A
D
 
K
E
 
L
I
 
V
G
 
A
A
 
E
N
 
H
G
 
G
G
 
V
K
 
E
A
 
V
V
 
E
K
 
A
R
 
M
Q
 
K
L
 
A
D
x
N
I
x
V
S
 
A
S
 
I
E
 
A
E
 
E
K
 
D
I
 
V
I
 
D
E
 
A
F
 
F
Y
 
F
Q
 
K
W
 
Q
L
 
A
K
 
I
E
 
E
S
 
R
Y
 
F
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
G
x
I
S
 
T
A
 
R
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
D
R
 
N
P
 
L
I
 
L
Y
 
M
E
 
R
L
 
M
E
 
K
T
 
E
E
 
D
T
 
E
I
 
W
D
 
D
T
 
D
T
 
V
L
 
I
H
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
F
L
 
L
V
 
C
T
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
V
S
 
S
K
 
R
I
 
T
M
 
M
V
 
M
A
 
K
A
 
Q
K
 
R
R
 
A
G
 
G
T
 
K
I
 
I
V
 
I
S
 
N
V
 
M
T
 
A
S
|
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
L
H
 
I
G
 
G
K
 
N
A
 
A
K
 
G
F
x
Q
S
 
A
E
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
I
 
T
A
 
A
M
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
K
 
P
L
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
N
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
 
G
I
 
F
V
x
I
Q
 
T
R
x
T
G
 
-
T
 
D
I
 
M
T
 
T
P
 
D
A
 
K
Q
 
L
M
 
D
A
 
E
K
 
K
L
 
T
K
 
K
K
 
E
T
 
A
N
 
M
Y
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
M
 
L
N
 
G
D
 
A
Y
 
Y
G
 
G
R
 
T
P
 
T
E
 
E
D
 
D
I
 
I
S
 
A
E
 
N
M
 
A
V
 
V
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
D
E
 
A
G
 
S
K
 
K
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
N
 
T
F
 
L
K
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
33% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 2:239/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
L
 
F
K
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
G
x
R
A
x
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
C
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
G
C
 
T
G
x
A
M
x
T
S
 
S
H
 
E
D
 
N
K
 
G
M
 
A
Q
 
Q
G
 
A
V
 
I
V
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
K
K
 
G
A
 
L
V
 
M
K
x
L
R
x
N
Q
x
V
L
 
T
D
 
D
I
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
I
E
 
E
K
 
S
I
 
V
I
 
L
E
 
E
F
 
-
Y
 
-
Q
 
-
W
 
K
L
 
I
K
 
R
E
 
A
S
 
E
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
|
G
G
x
I
S
 
T
A
 
R
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
D
R
 
N
P
 
L
I
 
L
Y
 
M
E
 
R
L
 
M
E
 
K
T
 
D
E
 
E
T
 
E
I
 
W
D
 
N
T
 
D
T
 
I
L
 
I
H
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
A
 
V
I
 
F
L
 
R
V
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
S
 
M
K
 
R
I
 
A
M
 
M
V
 
M
A
 
K
A
 
K
K
 
R
R
 
H
G
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
T
V
 
I
T
 
G
S
|
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
T
H
 
M
G
 
G
K
 
N
A
 
G
K
 
G
F
x
Q
S
 
A
E
 
N
Y
x
F
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
I
 
L
A
 
A
M
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
F
V
 
I
Q
 
E
R
 
T
G
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
T
 
A
I
 
L
T
 
S
P
 
D
A
 
D
Q
 
Q
M
 
R
A
 
A
K
 
G
L
 
I
K
 
L
K
 
A
T
 
Q
N
 
V
Y
 
P
M
 
A
N
 
G
D
 
R
Y
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
I
S
 
A
E
 
N
M
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
D
E
 
E
G
 
A
K
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
N
 
T
F
 
L
K
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3rwbA Crystal structure of complex of 4pal (4-pyridoxolactone) and pldh (tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase) from mesorhizobium loti
35% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 4:243/247 of 3rwbA

query
sites
3rwbA
L
 
L
K
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
A
G
x
Q
A
x
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
C
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
T
V
 
V
V
 
I
V
 
V
C
 
S
G
x
D
M
x
I
S
 
N
H
 
A
D
 
E
K
 
G
M
 
A
Q
 
K
G
 
A
V
 
A
V
 
A
D
 
A
E
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
K
N
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
K
A
 
A
V
 
R
K
 
A
R
 
I
Q
 
A
L
 
A
D
|
D
I
|
I
S
 
S
S
 
D
E
 
P
E
 
G
K
 
S
I
 
V
I
 
K
E
 
A
F
 
L
Y
 
F
Q
 
A
W
 
E
L
 
I
K
 
Q
E
 
A
S
 
L
Y
 
T
G
 
G
Q
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
A
x
S
S
 
I
R
 
V
P
 
P
I
 
F
Y
 
V
E
 
A
L
 
W
E
 
D
T
 
D
E
 
V
T
 
D
I
 
L
D
 
D
-
 
H
-
 
W
-
 
R
T
 
K
T
 
I
L
 
I
H
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
F
L
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
A
A
 
G
S
 
T
K
 
D
I
 
Q
M
 
M
V
 
R
A
 
A
A
 
A
-
 
G
K
 
K
R
 
A
G
 
G
T
 
R
I
 
V
V
 
I
S
 
S
V
x
I
T
 
A
S
|
S
V
x
N
I
x
T
G
 
F
E
 
F
H
 
A
G
 
G
K
 
T
A
 
P
K
 
N
F
x
M
S
 
A
E
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
G
I
 
V
I
 
I
A
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
R
S
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
T
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
Y
G
 
N
I
 
I
T
 
T
A
 
A
N
 
N
C
 
A
V
 
V
S
 
T
P
|
P
G
 
G
I
x
L
V
x
I
Q
 
E
R
x
S
G
 
D
T
x
G
I
x
V
-
 
K
-
 
A
T
 
S
P
 
P
A
x
H
Q
 
N
M
 
E
A
 
A
-
 
F
-
 
G
K
 
F
L
 
V
K
 
E
K
 
M
T
 
L
N
 
Q
Y
 
A
M
 
M
N
 
K
D
 
G
Y
 
K
G
 
G
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
D
 
H
I
 
I
S
 
A
E
 
D
M
 
V
V
 
V
A
 
S
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
D
E
 
D
G
 
A
K
 
R
F
 
W
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
N
 
T
F
 
L
K
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G

3ndrA Crystal structure of tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase from mesorhizobium loti
35% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 4:243/247 of 3ndrA

query
sites
3ndrA
L
 
L
K
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
A
G
x
Q
A
x
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
C
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
T
V
 
V
V
 
I
V
 
V
C
 
S
G
x
D
M
x
I
S
 
N
H
 
A
D
 
E
K
 
G
M
 
A
Q
 
K
G
 
A
V
 
A
V
 
A
D
 
A
E
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
K
N
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
K
A
 
A
V
 
R
K
 
A
R
 
I
Q
 
A
L
 
A
D
|
D
I
|
I
S
 
S
S
 
D
E
 
P
E
 
G
K
 
S
I
 
V
I
 
K
E
 
A
F
 
L
Y
 
F
Q
 
A
W
 
E
L
 
I
K
 
Q
E
 
A
S
 
L
Y
 
T
G
 
G
Q
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
A
x
S
S
 
I
R
 
V
P
 
P
I
 
F
Y
 
V
E
 
A
L
 
W
E
 
D
T
 
D
E
 
V
T
 
D
I
 
L
D
 
D
-
 
H
-
 
W
-
 
R
T
 
K
T
 
I
L
 
I
H
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
F
L
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
A
A
 
G
S
 
T
K
 
D
I
 
Q
M
 
M
V
 
R
A
 
A
A
 
A
-
 
G
K
 
K
R
 
A
G
 
G
T
 
R
I
 
V
V
 
I
S
 
S
V
x
I
T
 
A
S
|
S
V
 
N
I
 
T
G
 
F
E
 
F
H
 
A
G
 
G
K
 
T
A
 
P
K
 
N
F
 
M
S
 
A
E
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
G
I
 
V
I
 
I
A
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
R
S
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
T
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
Y
G
 
N
I
 
I
T
 
T
A
 
A
N
 
N
C
 
A
V
 
V
S
 
T
P
|
P
G
 
G
I
x
L
V
x
I
Q
 
E
R
x
S
G
 
D
T
x
G
I
x
V
-
 
K
-
 
A
T
 
S
P
 
P
A
 
H
Q
 
N
M
 
E
A
 
A
-
 
F
-
 
G
K
 
F
L
 
V
K
 
E
K
 
M
T
 
L
N
 
Q
Y
 
A
M
 
M
N
 
K
D
 
G
Y
 
K
G
 
G
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
D
 
H
I
 
I
S
 
A
E
 
D
M
 
V
V
 
V
A
 
S
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
D
E
 
D
G
 
A
K
 
R
F
 
W
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
N
 
T
F
 
L
K
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
32% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 6:248/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
L
 
L
K
 
R
G
 
S
K
 
A
V
 
L
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
S
 
G
G
x
S
A
x
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
V
C
 
S
C
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
T
V
 
V
V
 
A
V
 
A
C
 
C
G
x
D
M
x
L
S
 
D
H
 
R
D
 
A
K
 
A
M
 
A
Q
 
Q
G
 
E
V
 
T
V
 
V
D
 
R
E
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
G
N
 
P
G
 
G
G
 
S
K
 
N
A
 
H
V
 
A
K
 
A
R
 
F
Q
 
Q
L
x
A
D
|
D
I
x
V
S
 
S
S
 
E
E
 
A
E
 
R
K
 
A
I
 
A
I
 
R
E
 
C
F
 
L
Y
 
L
Q
 
E
W
 
Q
L
 
V
K
 
Q
E
 
A
S
 
C
Y
 
F
G
 
S
Q
 
R
L
 
P
-
 
P
D
 
S
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
C
|
C
A
|
A
G
|
G
G
x
I
S
 
T
A
 
Q
R
 
D
Q
 
E
A
 
F
S
 
-
R
 
-
P
 
-
I
 
L
Y
 
L
E
 
H
L
 
M
E
 
S
T
 
E
E
 
D
T
 
D
I
 
W
D
 
D
T
 
K
T
 
V
L
 
I
H
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
F
L
 
L
V
 
V
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
Q
I
 
A
M
 
L
V
 
V
A
 
S
-
 
N
A
 
G
K
 
C
R
 
R
G
 
G
T
 
S
I
 
I
V
 
I
S
 
N
V
x
I
T
 
S
S
|
S
V
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
K
H
 
V
G
 
G
K
 
N
A
 
V
K
 
G
F
 
Q
S
 
T
E
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
Q
S
 
T
I
 
A
A
 
A
M
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
H
G
 
G
I
 
I
T
 
R
A
 
C
N
 
N
C
 
S
V
 
V
S
 
L
P
|
P
G
|
G
I
 
F
V
x
I
Q
 
A
R
x
T
G
 
P
T
x
M
I
 
T
-
 
Q
-
 
K
T
 
V
P
 
P
A
 
Q
Q
 
K
M
 
V
A
 
V
-
 
D
K
 
K
L
 
I
K
 
T
K
 
E
T
 
M
N
 
I
Y
 
P
M
 
M
N
 
G
D
 
H
Y
 
L
G
 
G
R
 
D
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
A
E
 
D
M
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
E
E
 
D
G
 
S
K
 
G
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
N
 
S
F
 
V
K
 
E
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
35% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 6:239/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
G
x
R
A
x
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
C
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
G
C
 
T
G
 
A
M
x
T
S
 
S
H
 
E
D
 
S
K
 
G
M
 
A
Q
 
Q
G
 
A
V
 
I
V
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
D
N
 
N
G
 
G
-
 
K
G
 
G
K
 
M
A
 
A
V
 
-
K
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
L
D
x
N
I
x
V
S
 
T
S
 
N
E
 
P
E
 
E
K
 
S
I
 
I
I
 
E
E
 
A
F
 
V
Y
 
L
Q
 
K
W
 
A
L
 
I
K
 
T
E
 
D
S
 
E
Y
 
F
G
 
G
Q
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
G
 
I
S
 
T
A
 
R
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
D
R
 
N
P
 
L
I
 
L
Y
 
M
E
 
R
L
 
M
E
 
K
T
 
E
E
 
E
T
 
E
I
 
W
D
 
S
T
 
D
T
 
I
L
 
M
H
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
R
 
T
G
 
S
A
 
I
I
 
F
L
 
R
V
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
S
 
L
K
 
R
I
 
G
M
 
M
V
 
M
A
 
K
A
 
K
K
 
R
R
 
Q
G
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
N
V
 
V
T
x
G
S
|
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
T
H
 
M
G
 
G
K
 
N
A
 
A
K
 
G
F
x
Q
S
 
A
E
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
A
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
S
I
 
M
A
 
A
M
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
F
V
 
I
Q
 
E
R
x
T
G
 
D
T
 
M
I
 
N
T
 
D
P
 
E
A
 
Q
Q
 
R
M
 
T
A
 
A
K
 
T
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
T
 
V
N
 
P
Y
 
A
M
 
-
N
 
G
D
 
R
Y
 
L
G
 
G
R
 
D
P
 
P
E
 
R
D
 
E
I
 
I
S
 
A
E
 
S
M
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
P
E
 
E
G
 
A
K
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
N
 
T
F
 
L
K
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

6zyzA Structure of the borneol dehydrogenases of salvia rosmarinus with NAD+ (see paper)
32% identity, 84% coverage: 44:287/292 of query aligns to 3:248/259 of 6zyzA

query
sites
6zyzA
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
 
A
G
x
S
A
x
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
S
I
 
T
C
 
V
C
 
R
R
 
L
L
 
F
A
 
H
A
 
D
D
 
H
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
C
 
A
G
x
D
M
x
I
S
x
Q
H
 
D
D
 
D
K
 
L
M
 
G
Q
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
A
D
 
D
E
 
R
I
 
L
G
 
G
A
 
R
N
 
N
G
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
I
V
 
S
K
 
Y
R
 
T
Q
 
H
L
x
C
D
|
D
I
x
V
S
 
T
S
 
D
E
 
E
E
 
D
K
 
Q
I
 
V
I
 
R
E
 
A
F
 
L
Y
 
V
Q
 
D
W
 
A
L
 
A
K
 
V
E
 
A
S
 
K
Y
 
H
G
 
G
Q
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
M
V
 
F
N
 
S
C
x
N
A
|
A
G
 
G
G
 
-
S
 
-
A
 
I
R
x
V
Q
 
E
A
 
G
S
x
P
R
x
N
P
x
S
I
 
I
Y
 
F
E
x
D
L
 
V
E
 
D
T
 
K
E
 
D
T
 
E
I
 
L
D
 
E
T
 
R
T
 
L
L
 
M
H
 
G
V
x
I
N
 
N
L
 
L
R
 
V
G
 
G
A
 
A
I
 
F
L
 
L
V
 
A
T
 
A
R
 
K
E
 
H
A
 
A
S
 
A
K
 
R
I
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
P
A
 
A
K
 
K
R
 
K
G
 
G
T
 
C
I
 
I
V
 
I
S
 
F
V
x
T
T
 
A
S
 
S
V
 
A
I
 
C
G
 
T
E
 
E
H
 
I
G
 
A
K
 
G
A
 
I
K
 
A
F
 
G
S
 
H
E
 
S
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
I
 
V
A
 
G
F
 
L
T
 
M
K
 
K
S
 
S
I
 
L
A
 
A
M
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
S
L
 
H
G
 
G
I
 
I
T
 
R
A
 
A
N
 
N
C
 
C
V
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
F
I
 
G
V
|
V
Q
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
I
I
 
V
T
 
P
P
 
D
A
 
D
Q
 
E
M
 
A
A
 
S
K
 
K
L
 
L
K
 
M
K
 
F
T
 
E
N
 
G
Y
 
I
M
 
M
N
 
S
D
 
K
Y
 
V
G
 
G
R
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
K
-
 
I
-
 
L
-
 
T
P
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
V
S
 
A
E
 
V
M
 
T
V
 
V
A
 
L
Y
 
Y
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
E
E
 
E
G
 
A
K
 
S
F
 
Y
I
 
V
T
 
S
G
 
G
Q
 
V
N
 
N
F
 
L
K
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
S
 
T
L
 
V

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
31% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 3:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
L
 
L
K
 
A
G
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
A
G
x
Q
A
x
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
I
I
 
Y
C
 
A
C
 
E
R
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
E
D
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
V
C
 
A
G
x
D
M
 
I
S
 
N
H
 
E
D
 
P
K
 
K
M
 
A
Q
 
T
G
 
E
V
 
V
V
 
A
D
 
S
E
 
S
I
 
I
G
 
T
A
 
S
N
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
V
 
I
K
 
A
R
 
A
Q
 
A
L
 
V
D
 
D
I
x
V
S
 
S
S
 
D
E
 
V
E
 
E
K
 
S
I
 
V
I
 
N
E
 
R
F
 
M
Y
 
V
Q
 
D
W
 
S
L
 
A
K
 
V
E
 
E
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
Q
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
x
A
G
 
I
S
 
F
A
x
S
R
 
T
Q
 
L
A
 
K
S
 
M
R
 
K
P
 
P
I
 
F
Y
 
E
E
 
E
L
 
I
E
 
S
T
 
G
E
 
D
T
 
E
I
 
W
D
 
D
T
 
K
T
 
L
L
 
F
H
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
F
L
 
L
V
 
C
T
 
C
R
 
Q
E
 
A
A
 
V
S
 
S
K
 
P
I
 
V
M
 
M
V
 
R
A
 
K
A
 
N
K
 
Q
R
 
Y
G
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
N
V
x
I
T
x
S
S
|
S
V
 
S
I
 
V
G
 
V
E
 
V
H
 
T
G
 
G
K
 
R
A
 
P
K
 
N
F
 
Y
S
 
A
E
 
H
Y
|
Y
A
 
I
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
I
 
V
I
 
W
A
 
A
F
 
L
T
 
T
K
 
H
S
 
A
I
 
L
A
 
A
M
 
T
E
 
E
L
 
M
G
 
G
K
 
T
L
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
S
 
S
P
|
P
-
x
H
G
 
G
I
|
I
V
 
I
Q
 
T
-
 
E
-
x
I
-
 
P
R
 
R
G
 
E
T
 
T
I
 
I
T
 
S
P
 
E
A
 
E
Q
 
G
M
 
W
A
 
R
K
 
R
L
 
N
K
 
L
K
 
E
T
 
E
N
 
Q
Y
 
A
M
 
L
N
 
K
D
 
R
Y
 
K
G
 
G
R
 
D
P
 
A
E
 
S
D
 
D
I
 
L
S
 
V
E
 
G
M
 
I
V
 
L
A
 
L
Y
 
Y
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
D
E
 
E
G
 
S
K
 
K
F
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
N
 
T
F
 
V
K
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
32% identity, 83% coverage: 43:284/292 of query aligns to 2:244/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
L
 
L
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
x
G
G
x
N
A
x
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
I
 
I
C
 
A
C
 
L
R
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
C
 
S
G
x
D
M
x
I
S
 
S
H
 
D
D
 
E
K
 
W
M
 
G
Q
 
R
G
 
E
V
 
T
V
 
L
D
 
A
E
 
L
I
 
I
G
 
E
A
 
G
N
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
F
R
 
Q
Q
 
H
L
 
A
D
|
D
I
x
T
S
 
A
S
 
H
E
 
P
E
 
E
K
 
D
I
 
H
I
 
D
E
 
E
F
 
L
Y
 
I
Q
 
A
W
 
A
L
 
A
K
 
K
E
 
R
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
G
x
I
S
 
S
A
x
G
R
 
E
Q
 
-
A
 
-
S
 
F
R
 
T
P
 
P
I
 
T
Y
 
A
E
 
E
L
 
T
E
 
T
T
 
D
E
 
A
T
 
Q
I
 
W
D
 
Q
T
x
R
T
 
V
L
 
I
H
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
G
A
 
V
I
 
F
L
 
Y
V
 
G
T
 
V
R
 
R
E
 
A
A
 
Q
S
 
I
K
 
R
I
 
A
M
 
M
V
 
L
A
 
E
A
 
T
K
 
G
R
 
G
G
 
G
T
 
A
I
 
I
V
 
V
S
 
N
V
x
I
T
 
S
S
|
S
V
 
I
I
 
A
G
 
G
E
 
Q
H
 
I
G
 
G
K
 
I
A
 
E
K
 
G
F
x
I
S
 
T
E
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
I
 
V
A
 
A
M
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
K
 
S
L
 
K
G
 
G
I
 
I
T
x
R
A
 
I
N
 
N
C
 
S
V
 
V
S
 
G
P
|
P
G
x
A
I
 
F
V
x
I
Q
 
N
R
x
T
G
 
T
T
 
L
I
 
V
T
 
Q
P
 
N
A
 
V
Q
 
P
M
 
L
A
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
R
K
 
Q
L
 
L
K
 
E
K
 
Q
T
 
M
N
 
H
Y
 
A
M
x
L
N
x
R
D
x
R
Y
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
V
S
 
A
E
 
N
M
 
L
V
 
V
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
T
 
S
R
x
S
E
 
D
E
 
K
G
 
A
K
 
S
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
N
 
Y
F
 
Y
K
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
32% identity, 83% coverage: 43:284/292 of query aligns to 2:244/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
L
 
L
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
x
G
G
x
N
A
x
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
I
 
I
C
 
A
C
 
L
R
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
C
 
S
G
x
D
M
x
I
S
 
S
H
 
D
D
 
E
K
x
W
M
 
G
Q
 
R
G
 
E
V
 
T
V
 
L
D
 
A
E
 
L
I
 
I
G
 
E
A
 
G
N
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
F
R
 
Q
Q
 
H
L
 
A
D
|
D
I
x
T
S
 
A
S
 
H
E
 
P
E
 
E
K
 
D
I
 
H
I
 
D
E
 
E
F
 
L
Y
 
I
Q
 
A
W
 
A
L
 
A
K
 
K
E
 
R
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
G
x
I
S
|
S
A
x
G
R
x
E
Q
 
-
A
 
-
S
 
F
R
x
T
P
 
P
I
 
T
Y
 
A
E
|
E
L
 
T
E
x
T
T
 
D
E
 
A
T
x
Q
I
 
W
D
 
Q
T
x
R
T
 
V
L
 
I
H
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
G
A
 
V
I
 
F
L
 
Y
V
 
G
T
 
V
R
 
R
E
 
A
A
 
Q
S
 
I
K
 
R
I
 
A
M
 
M
V
 
L
A
 
E
A
 
T
K
 
G
R
 
G
G
 
G
T
 
A
I
 
I
V
 
V
S
 
N
V
x
I
T
 
S
S
|
S
V
 
I
I
 
A
G
 
G
E
 
Q
H
 
I
G
 
G
K
 
I
A
 
E
K
 
G
F
x
I
S
 
T
E
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
I
 
V
A
 
A
M
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
K
x
S
L
 
K
G
|
G
I
 
I
T
 
R
A
 
I
N
 
N
C
 
S
V
 
V
S
 
G
P
|
P
G
 
A
I
 
F
V
x
I
Q
 
N
R
x
T
G
 
T
T
 
L
I
 
V
T
 
Q
P
 
N
A
 
V
Q
 
P
M
 
L
A
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
R
K
 
Q
L
 
L
K
 
E
K
 
Q
T
 
M
N
 
H
Y
 
A
M
 
L
N
 
R
D
 
R
Y
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
V
S
 
A
E
 
N
M
 
L
V
 
V
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
T
 
S
R
 
S
E
 
D
E
 
K
G
 
A
K
 
S
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
x
S
N
x
Y
F
 
Y
K
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
32% identity, 83% coverage: 43:284/292 of query aligns to 2:244/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
L
 
L
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
S
 
G
G
x
N
A
x
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
I
 
I
C
 
A
C
 
L
R
 
T
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
C
 
S
G
 
D
M
 
I
S
 
S
H
 
D
D
 
E
K
 
W
M
 
G
Q
 
R
G
 
E
V
 
T
V
 
L
D
 
A
E
 
L
I
 
I
G
 
E
A
 
G
N
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
F
R
 
Q
Q
 
H
L
 
A
D
 
D
I
 
T
S
 
A
S
 
H
E
 
P
E
 
E
K
 
D
I
 
H
I
 
D
E
 
E
F
 
L
Y
 
I
Q
 
A
W
 
A
L
 
A
K
 
K
E
 
R
S
 
A
Y
 
F
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
G
 
I
S
 
S
A
 
G
R
 
E
Q
 
-
A
 
-
S
 
F
R
 
T
P
 
P
I
 
T
Y
 
A
E
 
E
L
 
T
E
 
T
T
 
D
E
 
A
T
 
Q
I
 
W
D
 
Q
T
 
R
T
 
V
L
 
I
H
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
G
A
 
V
I
 
F
L
 
Y
V
 
G
T
 
V
R
 
R
E
 
A
A
 
Q
S
 
I
K
 
R
I
 
A
M
 
M
V
 
L
A
 
E
A
 
T
K
 
G
R
 
G
G
 
G
T
 
A
I
 
I
V
 
V
S
 
N
V
 
I
T
 
S
S
|
S
V
 
I
I
 
A
G
 
G
E
 
Q
H
 
I
G
 
G
K
 
I
A
 
E
K
 
G
F
x
I
S
 
T
E
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
I
 
V
A
 
A
M
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
K
 
S
L
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
R
A
 
I
N
 
N
C
 
S
V
 
V
S
 
G
P
|
P
G
x
A
I
 
F
V
 
I
Q
 
N
R
 
T
G
 
T
T
 
L
I
 
V
T
 
Q
P
 
N
A
 
V
Q
 
P
M
 
L
A
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
R
K
 
Q
L
 
L
K
 
E
K
 
Q
T
 
M
N
 
H
Y
 
A
M
 
L
N
 
R
D
 
R
Y
 
L
G
 
G
R
 
E
P
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
V
S
 
A
E
 
N
M
 
L
V
 
V
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
T
 
S
R
 
S
E
 
D
E
 
K
G
 
A
K
 
S
F
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
N
 
Y
F
 
Y
K
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
32% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 3:240/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
L
 
F
K
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
S
 
S
G
 
R
A
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
C
 
A
C
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
G
C
 
T
G
 
A
M
 
T
S
 
S
H
 
E
D
 
N
K
 
G
M
 
A
Q
 
K
G
 
N
V
 
I
V
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
K
K
 
G
A
 
L
V
 
M
K
 
L
R
 
N
Q
 
V
L
 
T
D
 
D
I
 
P
S
 
A
S
 
S
E
 
I
E
 
E
K
 
S
I
 
V
I
 
L
E
 
E
F
 
N
Y
 
-
Q
 
-
W
 
-
L
 
I
K
 
R
E
 
A
S
 
E
Y
 
F
G
 
G
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
I
S
 
T
A
 
R
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
D
R
 
N
P
 
L
I
 
L
Y
 
M
E
 
R
L
 
M
E
 
K
T
 
D
E
 
D
T
 
E
I
 
W
D
 
N
T
 
D
T
 
I
L
 
I
H
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
S
G
 
S
A
 
V
I
 
F
L
 
R
V
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
S
 
M
K
 
R
I
 
A
M
|
M
V
 
M
A
 
K
A
 
K
K
 
R
R
 
C
G
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
T
V
 
I
T
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
T
H
 
M
G
 
G
K
 
N
A
 
A
K
 
G
F
 
Q
S
 
A
E
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
G
F
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
I
 
L
A
 
A
M
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
F
V
 
I
Q
 
E
R
 
T
G
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
T
 
A
I
 
L
T
 
S
P
 
D
A
 
D
Q
 
Q
M
 
R
A
 
A
K
 
G
L
 
I
K
 
L
K
 
A
T
 
Q
N
 
V
Y
 
P
M
 
A
N
 
G
D
 
R
Y
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
I
S
 
A
E
 
S
M
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
T
x
A
R
x
S
E
 
D
E
 
E
G
 
A
K
 
S
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
N
 
T
F
 
L
K
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
34% identity, 83% coverage: 44:284/292 of query aligns to 6:243/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
G
x
R
A
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
C
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
D
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
G
C
 
T
G
 
A
M
x
T
S
 
S
H
 
E
D
 
S
K
 
G
M
 
A
Q
 
Q
G
 
A
V
 
I
V
 
S
D
 
D
E
 
Y
I
 
L
G
 
G
A
 
D
N
 
N
G
 
G
-
 
K
G
 
G
K
 
M
A
 
A
V
 
-
K
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
L
D
x
N
I
x
V
S
 
T
S
 
N
E
 
P
E
 
E
K
 
S
I
 
I
I
 
E
E
 
A
F
 
V
Y
 
L
Q
 
K
W
 
A
L
 
I
K
 
T
E
 
D
S
 
E
Y
 
F
G
 
G
Q
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
G
x
I
S
 
T
A
 
R
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
D
R
 
N
P
 
L
I
 
L
Y
 
M
E
 
R
L
 
M
E
 
K
T
 
E
E
 
E
T
 
E
I
 
W
D
 
S
T
 
D
T
 
I
L
 
M
H
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
S
A
 
I
I
 
F
L
 
R
V
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
S
 
L
K
 
R
I
 
G
M
 
M
V
 
M
A
 
K
A
 
K
K
 
R
R
 
Q
G
 
G
T
 
R
I
 
I
V
 
I
S
 
N
V
|
V
T
 
G
S
|
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
T
H
 
M
G
 
G
K
 
N
A
 
A
K
 
G
F
 
Q
S
 
A
E
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
A
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
S
I
 
M
A
 
A
M
 
R
E
 
E
L
 
V
G
 
A
K
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
F
V
x
I
-
 
E
-
x
T
-
 
D
-
x
M
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
D
Q
 
E
R
 
Q
G
 
R
T
 
T
I
 
A
T
 
T
P
 
L
A
 
A
Q
 
Q
M
 
V
A
 
P
K
 
A
L
 
G
K
 
R
K
 
-
T
 
-
N
 
-
Y
 
-
M
 
-
N
 
-
D
 
-
Y
 
L
G
 
G
R
 
D
P
 
P
E
 
R
D
 
E
I
 
I
S
 
A
E
 
S
M
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
R
 
S
E
 
P
E
 
E
G
 
A
K
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
N
 
T
F
 
L
K
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>Echvi_4411 FitnessBrowser__Cola:Echvi_4411
MKSLIKRLVPKGMRNKLKGMAPGNSGGQAVAVPYTIQVSTPGLLKGKVAVVTGGSGAIGR
AICCRLAADGALVVVCGMSHDKMQGVVDEIGANGGKAVKRQLDISSEEKIIEFYQWLKES
YGQLDILVNCAGGSARQASRPIYELETETIDTTLHVNLRGAILVTREASKIMVAAKRGTI
VSVTSVIGEHGKAKFSEYAAAKAGIIAFTKSIAMELGKLGITANCVSPGIVQRGTITPAQ
MAKLKKTNYMNDYGRPEDISEMVAYLTREEGKFITGQNFKVDGGRSLGLKGD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory