SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1013 FitnessBrowser__Phaeo:GFF1013 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3eq6A Crystal structure of human acyl-coa synthetase medium-chain family member 2a (l64p mutation) in a ternary complex with products (see paper)
31% identity, 95% coverage: 20:510/516 of query aligns to 3:530/533 of 3eq6A

query
sites
3eq6A
Q
 
E
F
 
V
P
 
P
S
 
A
C
 
K
L
 
F
N
 
N
M
 
F
A
 
A
A
 
S
Q
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
D
H
 
H
-
 
W
-
 
A
-
 
D
-
 
M
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
P
P
 
P
D
 
S
E
 
P
Q
 
A
L
 
L
A
 
W
L
 
W
I
 
V
D
 
N
L
 
-
T
 
G
T
 
K
G
 
G
A
 
K
R
 
E
R
 
L
D
 
M
I
 
W
R
 
N
Y
 
F
G
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
S
Q
 
E
M
 
N
V
 
S
D
 
Q
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
N
D
 
V
L
 
L
M
 
S
Q
 
G
R
 
A
-
 
C
-
 
G
V
 
L
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
P
Q
 
R
S
 
V
V
 
P
D
 
E
C
 
W
A
 
W
V
 
L
A
 
V
H
 
I
L
 
L
A
 
G
I
 
C
W
 
I
K
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
L
I
 
I
S
 
F
V
 
M
P
 
P
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
x
Q
-
 
M
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
D
-
 
I
L
 
L
F
 
Y
K
 
R
L
 
L
F
 
Q
Q
 
M
H
 
S
D
 
K
A
 
A
L
 
K
A
 
A
S
 
I
R
 
V
I
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
E
G
 
V
L
 
I
E
 
Q
L
 
E
V
 
V
L
 
D
T
 
T
D
 
V
G
 
A
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
S
Q
 
E
L
 
C
G
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
R
Q
 
I
P
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
S
D
 
E
I
 
K
L
 
S
S
 
C
A
 
D
S
 
G
T
 
W
G
 
L
Q
 
N
S
 
F
D
 
K
H
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
N
Y
 
E
A
 
A
E
 
S
T
 
T
T
 
T
-
 
H
-
 
H
-
 
C
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
P
 
S
E
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
S
V
 
A
L
 
I
I
 
Y
Y
 
F
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
S
G
 
G
S
 
L
A
 
P
K
 
K
G
 
M
A
 
A
L
 
E
H
 
H
G
 
S
H
 
Y
R
 
S
V
 
S
L
 
L
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
G
V
 
L
A
 
K
I
 
A
S
 
K
H
 
M
D
 
D
H
 
A
L
 
G
G
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
L
Q
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
C
 
I
L
 
M
W
 
W
T
 
T
P
 
I
A
 
S
D
 
D
W
 
T
A
 
G
W
|
W
I
|
I
G
x
L
G
 
N
L
 
I
F
 
L
D
 
C
V
 
S
L
 
L
M
 
M
P
 
E
G
 
P
L
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
C
V
 
T
V
 
F
A
 
V
A
 
H
R
 
L
L
 
L
D
 
P
K
 
K
F
|
F
T
 
D
P
 
P
E
 
L
A
 
V
C
 
I
A
 
L
E
 
K
I
 
T
I
 
L
R
 
S
Q
 
S
G
 
Y
D
 
P
V
 
I
R
 
K
N
 
S
V
 
M
F
 
M
F
 
G
P
x
A
P
 
P
T
x
I
A
 
V
L
 
Y
R
 
R
L
x
M
L
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
K
 
D
A
 
L
A
 
S
G
 
S
Q
 
Y
G
 
K
L
 
F
D
 
P
G
 
H
L
 
L
R
 
Q
S
 
N
V
 
C
A
 
V
S
 
T
G
x
V
G
|
G
E
|
E
P
x
S
L
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
E
W
 
N
G
 
W
Q
 
R
R
 
A
H
 
Q
L
 
T
G
 
G
V
 
L
T
 
D
I
 
I
N
 
R
E
|
E
F
x
S
Y
|
Y
G
|
G
Q
|
Q
T
|
T
E
|
E
C
 
T
N
x
G
M
x
L
T
 
T
V
 
-
S
 
-
S
 
-
C
 
C
V
 
M
A
 
V
D
 
S
-
 
K
-
 
T
F
 
M
P
 
K
V
 
I
R
 
K
P
 
P
G
 
G
C
 
Y
I
x
M
G
 
G
R
 
T
P
 
A
V
 
A
P
 
S
G
 
C
C
 
Y
T
 
D
V
 
V
E
 
Q
V
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
K
G
 
G
T
 
N
-
 
V
-
 
L
P
 
P
T
 
P
K
 
G
D
 
T
E
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
V
G
 
K
A
 
P
A
 
I
S
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
G
M
 
I
M
 
F
L
 
S
E
 
G
Y
 
Y
W
 
V
N
 
D
R
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
K
T
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
N
F
 
I
H
 
R
A
 
G
D
 
D
W
 
F
L
 
W
I
 
L
T
 
L
G
 
G
D
|
D
R
 
R
G
 
G
I
 
I
W
 
K
E
 
D
G
 
E
D
 
D
-
 
G
Y
 
Y
L
 
F
R
 
Q
F
|
F
V
 
M
G
 
G
R
|
R
E
 
A
D
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
I
T
x
N
S
 
S
A
x
S
G
|
G
Y
|
Y
R
|
R
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
S
E
 
E
I
 
V
E
 
E
D
 
N
C
 
A
L
 
L
M
 
M
T
 
E
H
 
H
P
 
P
A
 
A
V
 
V
A
 
V
T
 
E
V
 
T
G
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
S
K
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
P
L
 
V
R
|
R
T
 
G
E
 
E
I
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
A
P
 
S
-
 
Q
-
 
F
-
 
L
G
 
S
H
 
H
S
 
D
P
 
P
S
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
T
S
 
K
D
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
Q
Y
 
H
V
 
V
K
|
K
S
 
S
R
 
V
L
 
T
A
 
A
K
x
P
Y
|
Y
S
 
K
Y
|
Y
P
 
P
R
|
R
E
 
K
V
 
I
E
 
E
F
 
F
L
 
V
D
 
L
A
 
N
L
 
L
P
 
P
M
 
K
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
I
I
 
Q
R
 
R
K
 
A
E
 
K
L
 
L
K
 
R
A
 
D
R
 
K

2wd9A Crystal structure of human acyl-coa synthetase medium-chain family member 2a (l64p mutation) in complex with ibuprofen (see paper)
31% identity, 95% coverage: 20:510/516 of query aligns to 3:530/533 of 2wd9A

query
sites
2wd9A
Q
 
E
F
 
V
P
 
P
S
 
A
C
 
K
L
 
F
N
 
N
M
 
F
A
 
A
A
 
S
Q
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
D
H
 
H
-
 
W
-
 
A
-
 
D
-
 
M
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
P
P
 
P
D
 
S
E
 
P
Q
 
A
L
 
L
A
 
W
L
 
W
I
 
V
D
 
N
L
 
-
T
 
G
T
 
K
G
 
G
A
 
K
R
 
E
R
 
L
D
 
M
I
 
W
R
 
N
Y
 
F
G
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
S
Q
 
E
M
 
N
V
 
S
D
 
Q
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
N
D
 
V
L
 
L
M
 
S
Q
 
G
R
 
A
-
 
C
-
 
G
V
 
L
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
P
Q
 
R
S
 
V
V
 
P
D
 
E
C
 
W
A
 
W
V
 
L
A
 
V
H
 
I
L
 
L
A
 
G
I
 
C
W
 
I
K
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
L
I
 
I
S
 
F
V
 
M
P
 
P
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
Q
-
 
M
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
D
-
 
I
L
 
L
F
 
Y
K
 
R
L
 
L
F
 
Q
Q
 
M
H
 
S
D
 
K
A
 
A
L
 
K
A
 
A
S
 
I
R
 
V
I
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
E
G
 
V
L
 
I
E
 
Q
L
 
E
V
 
V
L
 
D
T
 
T
D
 
V
G
 
A
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
S
Q
 
E
L
 
C
G
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
R
Q
 
I
P
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
S
D
 
E
I
 
K
L
 
S
S
 
C
A
 
D
S
 
G
T
 
W
G
 
L
Q
 
N
S
 
F
D
 
K
H
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
N
Y
 
E
A
 
A
E
 
S
T
 
T
T
 
T
-
 
H
-
 
H
-
 
C
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
P
 
S
E
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
S
V
 
A
L
 
I
I
 
Y
Y
 
F
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
S
G
 
G
S
 
L
A
 
P
K
 
K
G
 
M
A
 
A
L
 
E
H
 
H
G
 
S
H
 
Y
R
 
S
V
 
S
L
 
L
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
G
V
 
L
A
 
K
I
 
A
S
 
K
H
 
M
D
 
D
H
 
A
L
 
G
G
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
L
Q
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
C
 
I
L
 
M
W
 
W
T
 
T
P
 
I
A
 
S
D
 
D
W
 
T
A
 
G
W
 
W
I
|
I
G
x
L
G
 
N
L
 
I
F
 
L
D
 
C
V
 
S
L
 
L
M
 
M
P
 
E
G
 
P
L
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
C
V
 
T
V
 
F
A
 
V
A
 
H
R
 
L
L
 
L
D
 
P
K
 
K
F
 
F
T
 
D
P
 
P
E
 
L
A
 
V
C
 
I
A
 
L
E
 
K
I
 
T
I
 
L
R
 
S
Q
 
S
G
 
Y
D
 
P
V
 
I
R
 
K
N
 
S
V
 
M
F
 
M
F
 
G
P
 
A
P
 
P
T
 
I
A
 
V
L
 
Y
R
 
R
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
K
 
D
A
 
L
A
 
S
G
 
S
Q
 
Y
G
 
K
L
 
F
D
 
P
G
 
H
L
 
L
R
 
Q
S
 
N
V
 
C
A
 
V
S
 
T
G
x
V
G
 
G
E
 
E
P
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
E
W
 
N
G
 
W
Q
 
R
R
 
A
H
 
Q
L
 
T
G
 
G
V
 
L
T
 
D
I
 
I
N
 
R
E
 
E
F
 
S
Y
 
Y
G
|
G
Q
|
Q
T
|
T
E
|
E
C
 
T
N
x
G
M
x
L
T
 
T
V
 
-
S
 
-
S
 
-
C
 
C
V
 
M
A
 
V
D
 
S
-
 
K
-
 
T
F
 
M
P
 
K
V
 
I
R
 
K
P
 
P
G
 
G
C
 
Y
I
 
M
G
 
G
R
 
T
P
 
A
V
 
A
P
 
S
G
 
C
C
 
Y
T
 
D
V
 
V
E
 
Q
V
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
K
G
 
G
T
 
N
-
 
V
-
 
L
P
 
P
T
 
P
K
 
G
D
 
T
E
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
V
G
 
K
A
 
P
A
 
I
S
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
G
M
 
I
M
 
F
L
 
S
E
 
G
Y
 
Y
W
 
V
N
 
D
R
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
K
T
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
N
F
 
I
H
 
R
A
 
G
D
 
D
W
 
F
L
 
W
I
 
L
T
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
R
G
 
G
I
 
I
W
 
K
E
 
D
G
 
E
D
 
D
-
 
G
Y
 
Y
L
 
F
R
 
Q
F
 
F
V
 
M
G
 
G
R
 
R
E
 
A
D
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
I
T
x
N
S
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
S
E
 
E
I
 
V
E
 
E
D
 
N
C
 
A
L
 
L
M
 
M
T
 
E
H
 
H
P
 
P
A
 
A
V
 
V
A
 
V
T
 
E
V
 
T
G
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
S
K
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
P
L
 
V
R
 
R
T
 
G
E
 
E
I
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
A
P
 
S
-
 
Q
-
 
F
-
 
L
G
 
S
H
 
H
S
 
D
P
 
P
S
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
T
S
 
K
D
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
Q
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
S
 
S
R
 
V
L
 
T
A
 
A
K
 
P
Y
 
Y
S
 
K
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
E
 
K
V
 
I
E
 
E
F
 
F
L
 
V
D
 
L
A
 
N
L
 
L
P
 
P
M
 
K
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
I
I
 
Q
R
 
R
K
 
A
E
 
K
L
 
L
K
 
R
A
 
D
R
 
K

2vzeA Crystal structure of human acyl-coa synthetase medium-chain family member 2a (l64p mutation) in complex with amp (see paper)
31% identity, 95% coverage: 20:510/516 of query aligns to 3:530/533 of 2vzeA

query
sites
2vzeA
Q
 
E
F
 
V
P
 
P
S
 
A
C
 
K
L
 
F
N
 
N
M
 
F
A
 
A
A
 
S
Q
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
D
H
 
H
-
 
W
-
 
A
-
 
D
-
 
M
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
P
P
 
P
D
 
S
E
 
P
Q
 
A
L
 
L
A
 
W
L
 
W
I
 
V
D
 
N
L
 
-
T
 
G
T
 
K
G
 
G
A
 
K
R
 
E
R
 
L
D
 
M
I
 
W
R
 
N
Y
 
F
G
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
S
Q
 
E
M
 
N
V
 
S
D
 
Q
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
N
D
 
V
L
 
L
M
 
S
Q
 
G
R
 
A
-
 
C
-
 
G
V
 
L
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
P
Q
 
R
S
 
V
V
 
P
D
 
E
C
 
W
A
 
W
V
 
L
A
 
V
H
 
I
L
 
L
A
 
G
I
 
C
W
 
I
K
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
L
I
 
I
S
 
F
V
 
M
P
 
P
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
Q
-
 
M
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
D
-
 
I
L
 
L
F
 
Y
K
 
R
L
 
L
F
 
Q
Q
 
M
H
 
S
D
 
K
A
 
A
L
 
K
A
 
A
S
 
I
R
 
V
I
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
E
G
 
V
L
 
I
E
 
Q
L
 
E
V
 
V
L
 
D
T
 
T
D
 
V
G
 
A
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
S
Q
 
E
L
 
C
G
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
R
Q
 
I
P
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
S
D
 
E
I
 
K
L
 
S
S
 
C
A
 
D
S
 
G
T
 
W
G
 
L
Q
 
N
S
 
F
D
 
K
H
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
N
Y
 
E
A
 
A
E
 
S
T
 
T
T
 
T
-
 
H
-
 
H
-
 
C
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
P
 
S
E
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
S
V
 
A
L
 
I
I
 
Y
Y
 
F
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
S
G
 
G
S
 
L
A
 
P
K
 
K
G
 
M
A
 
A
L
 
E
H
 
H
G
 
S
H
 
Y
R
 
S
V
 
S
L
 
L
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
G
V
 
L
A
 
K
I
 
A
S
 
K
H
 
M
D
 
D
H
 
A
L
 
G
G
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
L
Q
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
C
 
I
L
 
M
W
 
W
T
 
T
P
 
I
A
 
S
D
 
D
W
 
T
A
 
G
W
|
W
I
 
I
G
 
L
G
 
N
L
 
I
F
 
L
D
 
C
V
 
S
L
 
L
M
 
M
P
 
E
G
 
P
L
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
C
V
 
T
V
 
F
A
 
V
A
 
H
R
 
L
L
 
L
D
 
P
K
 
K
F
 
F
T
 
D
P
 
P
E
 
L
A
 
V
C
 
I
A
 
L
E
 
K
I
 
T
I
 
L
R
 
S
Q
 
S
G
 
Y
D
 
P
V
 
I
R
 
K
N
 
S
V
 
M
F
 
M
F
 
G
P
 
A
P
 
P
T
 
I
A
 
V
L
 
Y
R
 
R
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
K
 
D
A
 
L
A
 
S
G
 
S
Q
 
Y
G
 
K
L
 
F
D
 
P
G
 
H
L
 
L
R
 
Q
S
 
N
V
 
C
A
 
V
S
 
T
G
 
V
G
|
G
E
|
E
P
x
S
L
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
E
W
 
N
G
 
W
Q
 
R
R
 
A
H
 
Q
L
 
T
G
 
G
V
 
L
T
 
D
I
 
I
N
 
R
E
|
E
F
x
S
Y
|
Y
G
|
G
Q
|
Q
T
|
T
E
|
E
C
 
T
N
 
G
M
 
L
T
 
T
V
 
-
S
 
-
S
 
-
C
 
C
V
 
M
A
 
V
D
 
S
-
 
K
-
 
T
F
 
M
P
 
K
V
 
I
R
 
K
P
 
P
G
 
G
C
 
Y
I
x
M
G
 
G
R
 
T
P
 
A
V
 
A
P
 
S
G
 
C
C
 
Y
T
 
D
V
 
V
E
 
Q
V
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
K
G
 
G
T
 
N
-
 
V
-
 
L
P
 
P
T
 
P
K
 
G
D
 
T
E
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
V
G
 
K
A
 
P
A
 
I
S
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
G
M
 
I
M
 
F
L
 
S
E
 
G
Y
 
Y
W
 
V
N
 
D
R
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
K
T
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
N
F
 
I
H
 
R
A
 
G
D
 
D
W
 
F
L
 
W
I
 
L
T
 
L
G
 
G
D
|
D
R
 
R
G
 
G
I
 
I
W
 
K
E
 
D
G
 
E
D
 
D
-
 
G
Y
 
Y
L
 
F
R
 
Q
F
|
F
V
 
M
G
 
G
R
|
R
E
 
A
D
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
I
T
x
N
S
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
S
E
 
E
I
 
V
E
 
E
D
 
N
C
 
A
L
 
L
M
 
M
T
 
E
H
 
H
P
 
P
A
 
A
V
 
V
A
 
V
T
 
E
V
 
T
G
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
S
K
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
P
L
 
V
R
 
R
T
 
G
E
 
E
I
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
A
P
 
S
-
 
Q
-
 
F
-
 
L
G
 
S
H
 
H
S
 
D
P
 
P
S
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
T
S
 
K
D
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
Q
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
S
 
S
R
 
V
L
 
T
A
 
A
K
 
P
Y
 
Y
S
 
K
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
E
 
K
V
 
I
E
 
E
F
 
F
L
 
V
D
 
L
A
 
N
L
 
L
P
 
P
M
 
K
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
I
I
 
Q
R
 
R
K
 
A
E
 
K
L
 
L
K
 
R
A
 
D
R
 
K

3b7wA Crystal structure of human acyl-coa synthetase medium-chain family member 2a, with l64p mutation (see paper)
31% identity, 96% coverage: 17:510/516 of query aligns to 4:534/537 of 3b7wA

query
sites
3b7wA
G
 
G
G
 
H
W
 
Q
Q
 
E
F
 
V
P
 
P
S
 
A
C
 
K
L
 
F
N
 
N
M
 
F
A
 
A
A
 
S
Q
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
D
H
 
H
-
 
W
-
 
A
-
 
D
-
 
M
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
P
P
 
P
D
 
S
E
 
P
Q
 
A
L
 
L
A
 
W
L
 
W
I
 
V
D
 
N
L
 
-
T
 
G
T
 
K
G
 
G
A
 
K
R
 
E
R
 
L
D
 
M
I
 
W
R
 
N
Y
 
F
G
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
S
Q
 
E
M
 
N
V
 
S
D
 
Q
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
N
D
 
V
L
 
L
M
 
S
Q
 
G
R
 
A
-
 
C
-
 
G
V
 
L
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
P
Q
 
R
S
 
V
V
 
P
D
 
E
C
 
W
A
 
W
V
 
L
A
 
V
H
 
I
L
 
L
A
 
G
I
 
C
W
 
I
K
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
L
I
 
I
S
 
F
V
 
M
P
 
P
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
Q
-
 
M
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
D
-
 
I
L
 
L
F
 
Y
K
 
R
L
 
L
F
 
Q
Q
 
M
H
 
S
D
 
K
A
 
A
L
 
K
A
 
A
S
 
I
R
 
V
I
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
E
G
 
V
L
 
I
E
 
Q
L
 
E
V
 
V
L
 
D
T
 
T
D
 
V
G
 
A
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
S
Q
 
E
L
 
C
G
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
R
Q
 
I
P
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
S
D
 
E
I
 
K
L
 
S
S
 
C
A
 
D
S
 
G
T
 
W
G
 
L
Q
 
N
S
 
F
D
 
K
H
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
N
Y
 
E
A
 
A
E
 
S
T
 
T
T
 
T
-
 
H
-
 
H
-
 
C
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
P
 
S
E
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
S
V
 
A
L
 
I
I
 
Y
Y
 
F
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
S
G
 
G
S
 
L
A
 
P
K
 
K
G
 
M
A
 
A
L
 
E
H
 
H
G
 
S
H
 
Y
R
 
S
V
 
S
L
 
L
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
G
V
 
L
A
 
K
I
 
A
S
 
K
H
 
M
D
 
D
H
 
A
L
 
G
G
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
L
Q
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
C
 
I
L
 
M
W
 
W
T
 
T
P
 
I
A
 
S
D
 
D
W
 
T
A
 
G
W
 
W
I
 
I
G
 
L
G
 
N
L
 
I
F
 
L
D
 
C
V
 
S
L
 
L
M
 
M
P
 
E
G
 
P
L
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
C
V
 
T
V
 
F
A
 
V
A
 
H
R
 
L
L
 
L
D
 
P
K
 
K
F
 
F
T
 
D
P
 
P
E
 
L
A
 
V
C
 
I
A
 
L
E
 
K
I
 
T
I
 
L
R
 
S
Q
 
S
G
 
Y
D
 
P
V
 
I
R
 
K
N
 
S
V
 
M
F
 
M
F
 
G
P
 
A
P
 
P
T
 
I
A
 
V
L
 
Y
R
 
R
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
K
 
D
A
 
L
A
 
S
G
 
S
Q
 
Y
G
 
K
L
 
F
D
 
P
G
 
H
L
 
L
R
 
Q
S
 
N
V
 
C
A
 
V
S
 
T
G
 
V
G
 
G
E
 
E
P
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
E
W
 
N
G
 
W
Q
 
R
R
 
A
H
 
Q
L
 
T
G
 
G
V
 
L
T
 
D
I
 
I
N
 
R
E
 
E
F
 
S
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
T
|
T
E
|
E
C
 
T
N
 
G
M
 
L
T
 
T
V
 
-
S
 
-
S
 
-
C
 
C
V
 
M
A
 
V
D
 
S
-
 
K
-
 
T
F
 
M
P
 
K
V
 
I
R
 
K
P
 
P
G
 
G
C
 
Y
I
 
M
G
 
G
R
 
T
P
 
A
V
 
A
P
 
S
G
 
C
C
 
Y
T
 
D
V
 
V
E
 
Q
V
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
K
G
 
G
T
 
N
-
 
V
-
 
L
P
 
P
T
 
P
K
 
G
D
 
T
E
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
V
G
 
K
A
 
P
A
 
I
S
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
G
M
 
I
M
 
F
L
 
S
E
 
G
Y
 
Y
W
 
V
N
 
D
R
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
K
T
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
N
F
 
I
H
 
R
A
 
G
D
 
D
W
 
F
L
 
W
I
 
L
T
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
R
G
 
G
I
 
I
W
 
K
E
 
D
G
 
E
D
 
D
-
 
G
Y
 
Y
L
 
F
R
 
Q
F
 
F
V
 
M
G
 
G
R
 
R
E
 
A
D
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
I
T
x
N
S
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
S
E
 
E
I
 
V
E
 
E
D
 
N
C
 
A
L
 
L
M
|
M
T
 
E
H
|
H
P
 
P
A
 
A
V
|
V
A
 
V
T
 
E
V
 
T
G
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
S
K
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
P
L
 
V
R
 
R
T
 
G
E
 
E
I
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
A
P
 
S
-
 
Q
-
 
F
-
 
L
G
 
S
H
 
H
S
 
D
P
 
P
S
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
T
S
 
K
D
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
Q
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
S
 
S
R
 
V
L
 
T
A
 
A
K
 
P
Y
 
Y
S
 
K
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
E
 
K
V
 
I
E
 
E
F
 
F
L
 
V
D
 
L
A
 
N
L
 
L
P
 
P
M
 
K
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
I
I
 
Q
R
 
R
K
 
A
E
 
K
L
 
L
K
 
R
A
 
D
R
 
K

3c5eA Crystal structure of human acyl-coa synthetase medium-chain family member 2a (l64p mutation) in complex with atp (see paper)
31% identity, 96% coverage: 17:510/516 of query aligns to 3:533/536 of 3c5eA

query
sites
3c5eA
G
 
G
G
 
H
W
 
Q
Q
 
E
F
 
V
P
 
P
S
 
A
C
 
K
L
 
F
N
 
N
M
 
F
A
 
A
A
 
S
Q
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
D
H
 
H
-
 
W
-
 
A
-
 
D
-
 
M
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
P
P
 
P
D
 
S
E
 
P
Q
 
A
L
 
L
A
 
W
L
 
W
I
 
V
D
 
N
L
 
-
T
 
G
T
 
K
G
 
G
A
 
K
R
 
E
R
 
L
D
 
M
I
 
W
R
 
N
Y
 
F
G
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
S
Q
 
E
M
 
N
V
 
S
D
 
Q
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
N
D
 
V
L
 
L
M
 
S
Q
 
G
R
 
A
-
 
C
-
 
G
V
 
L
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
P
Q
 
R
S
 
V
V
 
P
D
 
E
C
 
W
A
 
W
V
 
L
A
 
V
H
 
I
L
 
L
A
 
G
I
 
C
W
 
I
K
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
L
I
 
I
S
 
F
V
 
M
P
 
P
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
Q
-
 
M
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
D
-
 
I
L
 
L
F
 
Y
K
 
R
L
 
L
F
 
Q
Q
 
M
H
 
S
D
 
K
A
 
A
L
 
K
A
 
A
S
 
I
R
 
V
I
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
E
G
 
V
L
 
I
E
 
Q
L
 
E
V
 
V
L
 
D
T
 
T
D
 
V
G
 
A
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
S
Q
 
E
L
 
C
G
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
R
Q
 
I
P
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
S
D
 
E
I
 
K
L
 
S
S
 
C
A
 
D
S
 
G
T
 
W
G
 
L
Q
 
N
S
 
F
D
 
K
H
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
N
Y
 
E
A
 
A
E
 
S
T
 
T
T
 
T
-
 
H
-
 
H
-
 
C
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
P
 
S
E
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
S
V
 
A
L
 
I
I
 
Y
Y
 
F
T
|
T
S
|
S
G
|
G
T
|
T
T
x
S
G
 
G
S
 
L
A
 
P
K
|
K
G
 
M
A
 
A
L
 
E
H
 
H
G
 
S
H
 
Y
R
 
S
V
 
S
L
 
L
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
G
V
 
L
A
 
K
I
 
A
S
 
K
H
 
M
D
 
D
H
 
A
L
 
G
G
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
L
Q
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
C
 
I
L
 
M
W
 
W
T
 
T
P
 
I
A
 
S
D
 
D
W
 
T
A
 
G
W
 
W
I
 
I
G
 
L
G
 
N
L
 
I
F
 
L
D
 
C
V
 
S
L
 
L
M
 
M
P
 
E
G
 
P
L
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
C
V
 
T
V
 
F
A
 
V
A
 
H
R
 
L
L
 
L
D
 
P
K
 
K
F
 
F
T
 
D
P
 
P
E
 
L
A
 
V
C
 
I
A
 
L
E
 
K
I
 
T
I
 
L
R
 
S
Q
 
S
G
 
Y
D
 
P
V
 
I
R
 
K
N
 
S
V
 
M
F
 
M
F
 
G
P
 
A
P
 
P
T
 
I
A
 
V
L
 
Y
R
 
R
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
K
 
D
A
 
L
A
 
S
G
 
S
Q
 
Y
G
 
K
L
 
F
D
 
P
G
 
H
L
 
L
R
 
Q
S
 
N
V
 
C
A
 
V
S
 
T
G
 
V
G
|
G
E
|
E
P
x
S
L
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
E
W
 
N
G
 
W
Q
 
R
R
 
A
H
 
Q
L
 
T
G
 
G
V
 
L
T
 
D
I
 
I
N
 
R
E
|
E
F
x
S
Y
|
Y
G
|
G
Q
|
Q
T
|
T
E
|
E
C
 
T
N
 
G
M
 
L
T
 
T
V
 
-
S
 
-
S
 
-
C
 
C
V
 
M
A
 
V
D
 
S
-
 
K
-
 
T
F
 
M
P
 
K
V
 
I
R
 
K
P
 
P
G
 
G
C
 
Y
I
x
M
G
 
G
R
 
T
P
 
A
V
 
A
P
 
S
G
 
C
C
 
Y
T
 
D
V
 
V
E
 
Q
V
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
K
G
 
G
T
 
N
-
 
V
-
 
L
P
 
P
T
 
P
K
 
G
D
 
T
E
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
V
G
 
K
A
 
P
A
 
I
S
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
G
M
 
I
M
 
F
L
 
S
E
 
G
Y
 
Y
W
 
V
N
 
D
R
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
K
T
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
N
F
 
I
H
 
R
A
 
G
D
 
D
W
 
F
L
 
W
I
 
L
T
 
L
G
 
G
D
|
D
R
 
R
G
 
G
I
 
I
W
 
K
E
 
D
G
 
E
D
 
D
-
 
G
Y
 
Y
L
 
F
R
 
Q
F
|
F
V
 
M
G
 
G
R
|
R
E
 
A
D
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
I
T
x
N
S
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
S
E
 
E
I
 
V
E
 
E
D
 
N
C
 
A
L
 
L
M
|
M
T
 
E
H
|
H
P
 
P
A
 
A
V
|
V
A
 
V
T
 
E
V
 
T
G
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
S
K
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
P
L
 
V
R
 
R
T
 
G
E
 
E
I
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
A
P
 
S
-
 
Q
-
 
F
-
 
L
G
 
S
H
 
H
S
 
D
P
 
P
S
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
T
S
 
K
D
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
Q
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
S
 
S
R
 
V
L
 
T
A
 
A
K
 
P
Y
 
Y
S
 
K
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
E
 
K
V
 
I
E
 
E
F
 
F
L
 
V
D
 
L
A
 
N
L
 
L
P
 
P
M
 
K
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
I
I
 
Q
R
 
R
K
 
A
E
 
K
L
 
L
K
 
R
A
 
D
R
 
K

Q08AH3 Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial; Acyl-CoA synthetase medium-chain family member 2A; Benzoate--CoA ligase; Butyrate--CoA ligase 2A; Butyryl-coenzyme A synthetase 2A; Middle-chain acyl-CoA synthetase 2A; EC 6.2.1.2; EC 6.2.1.25 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
31% identity, 96% coverage: 17:510/516 of query aligns to 36:566/577 of Q08AH3

query
sites
Q08AH3
G
 
G
G
 
H
W
 
Q
Q
 
E
F
 
V
P
 
P
S
 
A
C
 
K
L
 
F
N
 
N
M
 
F
A
 
A
A
 
S
Q
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
D
H
 
H
-
 
W
-
 
A
-
 
D
-
 
M
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
L
P
 
P
D
 
S
E
 
P
Q
 
A
L
 
L
A
 
W
L
 
W
I
 
V
D
 
N
L
 
-
T
 
G
T
 
K
G
 
G
A
 
K
R
 
E
R
 
L
D
 
M
I
 
W
R
 
N
Y
 
F
G
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
S
Q
 
E
M
 
N
V
 
S
D
 
Q
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
N
D
 
V
L
 
L
M
 
S
Q
 
G
R
 
A
-
 
C
-
 
G
V
 
L
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
P
Q
 
R
S
 
V
V
 
P
D
 
E
C
 
W
A
 
W
V
 
L
A
 
V
H
 
I
L
 
L
A
 
G
I
 
C
W
 
I
K
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
L
I
 
I
S
 
F
V
 
M
P
 
P
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
x
Q
-
 
M
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
D
-
 
I
L
 
L
F
 
Y
K
 
R
L
 
L
F
 
Q
Q
 
M
H
 
S
D
 
K
A
 
A
L
 
K
A
 
A
S
 
I
R
 
V
I
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
E
G
 
V
L
 
I
E
 
Q
L
 
E
V
 
V
L
 
D
T
 
T
D
 
V
G
 
A
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
S
Q
 
E
L
 
C
G
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
R
Q
 
I
P
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
S
D
 
E
I
 
K
L
 
S
S
 
C
A
 
D
S
 
G
T
 
W
G
 
L
Q
 
N
S
 
F
D
 
K
H
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
N
Y
 
E
A
 
A
E
 
S
T
 
T
T
 
T
-
 
H
-
 
H
-
 
C
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
P
 
S
E
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
S
V
 
A
L
 
I
I
 
Y
Y
 
F
T
|
T
S
|
S
G
|
G
T
|
T
T
x
S
G
|
G
S
x
L
A
x
P
K
|
K
G
 
M
A
 
A
L
 
E
H
 
H
G
 
S
H
 
Y
R
 
S
V
 
S
L
 
L
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
G
V
 
L
A
 
K
I
 
A
S
 
K
H
 
M
D
 
D
H
 
A
L
 
G
G
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
L
Q
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
C
 
I
L
 
M
W
 
W
T
 
T
P
 
I
A
 
S
D
 
D
W
 
T
A
 
G
W
 
W
I
 
I
G
 
L
G
 
N
L
 
I
F
 
L
D
 
C
V
 
S
L
 
L
M
 
M
P
 
E
G
 
P
L
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
C
V
 
T
V
 
F
A
 
V
A
 
H
R
 
L
L
 
L
D
 
P
K
 
K
F
 
F
T
 
D
P
 
P
E
 
L
A
 
V
C
 
I
A
 
L
E
 
K
I
 
T
I
 
L
R
 
S
Q
 
S
G
 
Y
D
 
P
V
 
I
R
 
K
N
 
S
V
 
M
F
 
M
F
 
G
P
 
A
P
 
P
T
 
I
A
 
V
L
 
Y
R
 
R
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
K
 
D
A
 
L
A
 
S
G
 
S
Q
 
Y
G
 
K
L
 
F
D
 
P
G
 
H
L
 
L
R
 
Q
S
 
N
V
 
C
A
 
V
S
 
T
G
 
V
G
 
G
E
 
E
P
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
E
W
 
N
G
 
W
Q
 
R
R
 
A
H
 
Q
L
 
T
G
 
G
V
 
L
T
 
D
I
 
I
N
 
R
E
|
E
F
x
S
Y
|
Y
G
|
G
Q
|
Q
T
|
T
E
 
E
C
 
T
N
 
G
M
 
L
T
 
T
V
 
-
S
 
-
S
 
-
C
 
C
V
 
M
A
 
V
D
 
S
-
 
K
-
 
T
F
 
M
P
 
K
V
 
I
R
 
K
P
 
P
G
 
G
C
 
Y
I
 
M
G
 
G
R
 
T
P
 
A
V
 
A
P
 
S
G
 
C
C
 
Y
T
 
D
V
 
V
E
 
Q
V
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
K
G
 
G
T
 
N
-
 
V
-
 
L
P
 
P
T
 
P
K
 
G
D
 
T
E
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
V
G
 
K
A
 
P
A
 
I
S
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
G
M
 
I
M
 
F
L
 
S
E
 
G
Y
 
Y
W
 
V
N
 
D
R
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
K
T
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
N
F
 
I
H
 
R
A
 
G
D
 
D
W
 
F
L
 
W
I
 
L
T
 
L
G
 
G
D
|
D
R
 
R
G
 
G
I
 
I
W
 
K
E
 
D
G
 
E
D
 
D
-
 
G
Y
 
Y
L
 
F
R
 
Q
F
 
F
V
 
M
G
 
G
R
|
R
E
 
A
D
 
N
D
 
D
V
 
I
I
 
I
T
 
N
S
 
S
A
x
S
G
|
G
Y
|
Y
R
|
R
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
S
E
 
E
I
 
V
E
 
E
D
 
N
C
 
A
L
 
L
M
 
M
T
 
E
H
 
H
P
 
P
A
 
A
V
 
V
A
 
V
T
 
E
V
 
T
G
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
S
K
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
P
L
 
V
R
|
R
T
 
G
E
 
E
I
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
A
P
x
S
-
 
Q
-
 
F
-
 
L
G
 
S
H
 
H
S
 
D
P
 
P
S
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
T
S
 
K
D
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
Q
Y
 
H
V
 
V
K
|
K
S
 
S
R
 
V
L
 
T
A
 
A
K
 
P
Y
 
Y
S
 
K
Y
|
Y
P
|
P
R
|
R
E
 
K
V
 
I
E
 
E
F
 
F
L
 
V
D
 
L
A
 
N
L
 
L
P
 
P
M
 
K
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
I
I
 
Q
R
 
R
K
 
A
E
 
K
L
 
L
K
 
R
A
 
D
R
 
K

3dayA Crystal structure of human acyl-coa synthetase medium-chain family member 2a (l64p mutation) in complex with amp-cpp (see paper)
31% identity, 96% coverage: 17:510/516 of query aligns to 4:532/535 of 3dayA

query
sites
3dayA
G
 
G
G
 
H
W
 
Q
Q
 
E
F
 
V
P
 
P
S
 
A
C
 
K
L
 
F
N
 
N
M
 
F
A
 
A
A
 
S
Q
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
D
H
 
H
-
 
W
-
 
A
-
 
D
-
 
M
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
P
P
 
P
D
 
S
E
 
P
Q
 
A
L
 
L
A
 
W
L
 
W
I
 
V
D
 
N
L
 
-
T
 
G
T
 
K
G
 
G
A
 
K
R
 
E
R
 
L
D
 
M
I
 
W
R
 
N
Y
 
F
G
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
S
Q
 
E
M
 
N
V
 
S
D
 
Q
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
N
D
 
V
L
 
L
M
 
S
Q
 
G
R
 
A
-
 
C
-
 
G
V
 
L
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
P
Q
 
R
S
 
V
V
 
P
D
 
E
C
 
W
A
 
W
V
 
L
A
 
V
H
 
I
L
 
L
A
 
G
I
 
C
W
 
I
K
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
L
I
 
I
S
 
F
V
 
M
P
 
P
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
Q
-
 
M
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
D
-
 
I
L
 
L
F
 
Y
K
 
R
L
 
L
F
 
Q
Q
 
M
H
 
S
D
 
K
A
 
A
L
 
K
A
 
A
S
 
I
R
 
V
I
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
E
G
 
V
L
 
I
E
 
Q
L
 
E
V
 
V
L
 
D
T
 
T
D
 
V
G
 
A
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
S
Q
 
E
L
 
C
G
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
R
Q
 
I
P
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
S
D
 
E
I
 
K
L
 
S
S
 
C
A
 
D
S
 
G
T
 
W
G
 
L
Q
 
N
S
 
F
D
 
K
H
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
N
Y
 
E
A
 
A
E
 
S
T
 
T
T
 
T
-
 
H
-
 
H
-
 
C
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
P
 
S
E
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
S
V
 
A
L
 
I
I
 
Y
Y
 
F
T
|
T
S
|
S
G
|
G
T
|
T
T
x
S
G
 
G
S
 
L
A
 
P
K
|
K
G
 
M
A
 
A
L
 
E
H
 
H
G
 
S
H
 
Y
R
 
S
V
 
S
L
 
L
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
G
V
 
L
A
 
K
I
 
A
S
 
K
H
 
M
D
 
D
H
 
A
L
 
G
G
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
L
Q
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
C
 
I
L
 
M
W
 
W
T
 
T
P
 
I
A
 
S
D
 
D
W
 
T
A
 
G
W
 
W
I
 
I
G
 
L
G
 
N
L
 
I
F
 
L
D
 
C
V
 
S
L
 
L
M
 
M
P
 
E
G
 
P
L
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
C
V
 
T
V
 
F
A
 
V
A
 
H
R
 
L
L
 
L
D
 
P
K
 
K
F
 
F
T
 
D
P
 
P
E
 
L
A
 
V
C
 
I
A
 
L
E
 
K
I
 
T
I
 
L
R
 
S
Q
 
S
G
 
Y
D
 
P
V
 
I
R
 
K
N
 
S
V
 
M
F
 
M
F
 
G
P
 
A
P
 
P
T
 
I
A
 
V
L
 
Y
R
 
R
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
K
 
D
A
 
L
A
 
S
G
 
S
Q
 
Y
G
 
K
L
 
F
D
 
P
G
 
H
L
 
L
R
 
Q
S
 
N
V
 
C
A
 
V
S
 
T
G
 
V
G
|
G
E
|
E
P
x
S
L
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
E
W
 
N
G
 
W
Q
 
R
R
 
A
H
 
Q
L
 
T
G
 
G
V
 
L
T
 
D
I
 
I
N
 
R
E
|
E
F
x
S
Y
|
Y
G
|
G
Q
|
Q
T
|
T
E
|
E
C
 
T
N
 
G
M
 
L
T
 
T
V
 
-
S
 
-
S
 
-
C
 
C
V
 
M
A
 
V
D
 
S
-
 
K
-
 
T
F
 
M
P
 
K
V
 
I
R
 
K
P
 
P
G
 
G
C
 
Y
I
x
M
G
 
G
R
 
T
P
 
A
V
 
A
P
 
S
G
 
C
C
 
Y
T
 
D
V
 
V
E
 
Q
V
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
K
G
 
G
T
 
N
-
 
V
-
 
L
P
 
P
T
 
P
K
 
G
D
 
T
E
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
V
G
 
K
A
 
P
A
 
I
S
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
G
M
 
I
M
 
F
L
 
S
E
 
G
Y
 
Y
W
 
V
N
 
D
R
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
K
T
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
N
F
 
I
H
 
R
A
 
G
D
 
D
W
 
F
L
 
W
I
 
L
T
 
L
G
 
G
D
|
D
R
 
R
G
 
G
I
 
I
W
 
K
E
 
D
G
 
E
D
 
D
-
 
G
Y
 
Y
L
 
F
R
 
Q
F
|
F
V
 
M
G
 
G
R
|
R
E
 
A
D
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
I
T
x
N
S
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
S
E
 
E
I
 
V
E
 
E
D
 
N
C
 
A
L
 
L
M
|
M
T
 
E
H
|
H
P
 
P
A
 
A
V
|
V
A
 
V
T
 
E
V
 
T
G
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
S
K
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
-
L
 
-
R
 
R
T
 
G
E
 
E
I
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
A
P
 
S
-
 
Q
-
 
F
-
 
L
G
 
S
H
 
H
S
 
D
P
 
P
S
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
T
S
 
K
D
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
Q
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
S
 
S
R
 
V
L
 
T
A
 
A
K
 
P
Y
 
Y
S
 
K
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
E
 
K
V
 
I
E
 
E
F
 
F
L
 
V
D
 
L
A
 
N
L
 
L
P
 
P
M
 
K
T
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
I
I
 
Q
R
 
R
K
 
A
E
 
K
L
 
L
K
 
R
A
 
D
R
 
K

3gpcA Crystal structure of human acyl-coa synthetase medium-chain family member 2a (l64p mutation) in a complex with coa (see paper)
31% identity, 96% coverage: 17:510/516 of query aligns to 1:529/532 of 3gpcA

query
sites
3gpcA
G
 
G
G
 
H
W
 
Q
Q
 
E
F
 
V
P
 
P
S
 
A
C
 
K
L
 
F
N
 
N
M
 
F
A
 
A
A
 
S
Q
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
D
H
 
H
-
 
W
-
 
A
-
 
D
-
 
M
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
P
P
 
P
D
 
S
E
 
P
Q
 
A
L
 
L
A
 
W
L
 
W
I
 
V
D
 
N
L
 
-
T
 
G
T
 
K
G
 
G
A
 
K
R
 
E
R
 
L
D
 
M
I
 
W
R
 
N
Y
 
F
G
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
S
Q
 
E
M
 
N
V
 
S
D
 
Q
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
R
 
N
D
 
V
L
 
L
M
 
S
Q
 
G
R
 
A
-
 
C
-
 
G
V
 
L
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
P
Q
 
R
S
 
V
V
 
P
D
 
E
C
 
W
A
 
W
V
 
L
A
 
V
H
 
I
L
 
L
A
 
G
I
 
C
W
 
I
K
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
L
I
 
I
S
 
F
V
 
M
P
 
P
-
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
Q
-
 
M
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
D
-
 
I
L
 
L
F
 
Y
K
 
R
L
 
L
F
 
Q
Q
 
M
H
 
S
D
 
K
A
 
A
L
 
K
A
 
A
S
 
I
R
 
V
I
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
E
G
 
V
L
 
I
E
 
Q
L
 
E
V
 
V
L
 
D
T
 
T
D
 
V
G
 
A
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
S
Q
 
E
L
 
C
G
 
P
S
 
S
L
 
L
A
 
R
Q
 
I
P
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
S
D
 
E
I
 
K
L
 
S
S
 
C
A
 
D
S
 
G
T
 
W
G
 
L
Q
 
N
S
 
F
D
 
K
H
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
N
Y
 
E
A
 
A
E
 
S
T
 
T
T
 
T
-
 
H
-
 
H
-
 
C
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
G
P
 
S
E
 
Q
T
 
E
P
 
A
A
 
S
V
 
A
L
 
I
I
 
Y
Y
 
F
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
-
T
 
-
G
 
G
S
 
L
A
 
P
K
 
K
G
 
M
A
 
A
L
 
E
H
 
H
G
 
S
H
 
Y
R
 
S
V
 
S
L
 
L
S
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
G
V
 
L
A
 
K
I
 
A
S
 
K
H
 
M
D
 
D
H
 
A
L
 
G
G
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
L
Q
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
C
 
I
L
 
M
W
 
W
T
 
T
P
 
I
A
 
S
D
 
D
W
 
T
A
 
G
W
 
W
I
 
I
G
 
L
G
 
N
L
 
I
F
 
L
D
 
C
V
 
S
L
 
L
M
 
M
P
 
E
G
 
P
L
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
C
V
 
T
V
 
F
A
 
V
A
 
H
R
 
L
L
 
L
D
 
P
K
 
K
F
 
F
T
 
D
P
 
P
E
 
L
A
 
V
C
 
I
A
 
L
E
 
K
I
 
T
I
 
L
R
 
S
Q
 
S
G
 
Y
D
 
P
V
 
I
R
 
K
N
 
S
V
 
M
F
 
M
F
 
G
P
 
A
P
 
P
T
 
I
A
 
V
L
 
Y
R
 
R
L
 
M
L
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
Q
K
 
D
A
 
L
A
 
S
G
 
S
Q
 
Y
G
 
K
L
 
F
D
 
P
G
 
H
L
 
L
R
 
Q
S
 
N
V
 
C
A
 
V
S
 
T
G
 
V
G
|
G
E
|
E
P
x
S
L
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
E
W
 
N
G
 
W
Q
 
R
R
 
A
H
 
Q
L
 
T
G
 
G
V
 
L
T
 
D
I
 
I
N
 
R
E
|
E
F
x
S
Y
|
Y
G
|
G
Q
|
Q
T
|
T
E
|
E
C
 
T
N
 
G
M
 
L
T
 
T
V
 
-
S
 
-
S
 
-
C
 
C
V
 
M
A
 
V
D
 
S
-
 
K
-
 
T
F
 
M
P
 
K
V
 
I
R
 
K
P
 
P
G
 
G
C
 
Y
I
x
M
G
 
G
R
 
T
P
 
A
V
 
A
P
 
S
G
 
C
C
 
Y
T
 
D
V
 
V
E
 
Q
V
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
D
T
 
K
G
 
G
T
 
N
-
 
V
-
 
L
P
 
P
T
 
P
K
 
G
D
 
T
E
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
I
A
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
V
G
 
K
A
 
P
A
 
I
S
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
G
M
 
I
M
 
F
L
 
S
E
 
G
Y
 
Y
W
 
V
N
 
D
R
 
N
P
 
P
D
 
D
A
 
K
T
 
T
A
 
A
E
 
A
K
 
N
F
 
I
H
 
R
A
 
G
D
 
D
W
 
F
L
 
W
I
 
L
T
x
L
G
 
G
D
|
D
R
 
R
G
 
G
I
 
I
W
 
K
E
 
D
G
 
E
D
 
D
-
 
G
Y
 
Y
L
 
F
R
 
Q
F
|
F
V
 
M
G
 
G
R
|
R
E
 
A
D
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
I
T
x
N
S
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
R
|
R
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
S
E
 
E
I
 
V
E
 
E
D
 
N
C
 
A
L
 
L
M
|
M
T
 
E
H
|
H
P
 
P
A
 
A
V
|
V
A
 
V
T
 
E
V
 
T
G
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
S
K
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
P
L
 
V
R
 
R
T
 
G
E
 
E
I
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
L
K
 
A
P
 
S
-
 
Q
-
 
F
-
 
L
G
 
S
H
 
H
S
 
D
P
 
P
S
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
T
S
 
K
D
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
Q
Y
 
H
V
 
V
K
 
K
S
 
S
R
 
V
L
 
T
A
 
A
K
 
P
Y
 
Y
S
 
K
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
E
 
K
V
 
I
E
 
E
F
 
F
L
 
V
D
 
L
A
 
N
L
 
L
P
 
P
M
 
K
T
|
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
I
I
x
Q
R
 
R
K
 
A
E
 
K
L
 
L
K
 
R
A
 
D
R
 
K

P27550 Acetyl-coenzyme A synthetase; AcCoA synthetase; Acs; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 96% coverage: 19:513/516 of query aligns to 69:621/652 of P27550

query
sites
P27550
W
 
W
Q
 
Y
F
 
E
P
 
D
S
 
G
C
 
T
L
 
L
N
 
N
M
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
N
A
 
C
L
 
L
D
 
D
-
 
R
H
 
H
P
 
L
D
 
Q
E
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
D
Q
 
R
L
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
I
D
 
W
L
 
E
T
 
G
T
 
D
G
 
D
A
 
A
R
 
S
-
 
Q
-
 
S
R
 
K
D
 
H
I
 
I
R
 
S
Y
 
Y
G
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
H
Q
 
R
M
 
D
V
 
V
D
 
C
A
 
R
V
 
F
A
 
A
R
 
N
D
 
T
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
R
 
L
-
 
G
V
 
I
Q
 
K
P
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
L
 
M
S
 
P
Q
 
M
S
 
V
V
 
P
D
 
E
C
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
H
 
M
L
 
L
A
 
A
I
 
C
W
 
A
K
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
S
 
H
V
 
S
P
 
V
L
 
I
F
 
F
K
 
G
L
 
G
F
 
F
Q
 
S
H
 
P
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
A
S
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
I
D
 
D
A
 
S
G
 
N
L
 
S
E
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
I
T
 
T
D
 
S
G
 
D
G
 
E
G
 
G
T
 
V
A
 
R
Q
 
A
L
 
G
G
 
R
S
 
S
L
 
I
A
 
P
Q
 
L
P
 
K
L
 
K
L
 
N
V
 
V
A
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
N
-
 
P
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
H
-
 
V
-
 
V
I
 
V
L
 
L
S
 
K
A
 
R
S
 
T
T
 
G
G
 
G
Q
 
K
S
 
I
D
 
D
-
 
W
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
W
-
 
W
-
 
H
H
 
D
L
 
L
L
 
V
P
 
E
Y
 
Q
A
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
Q
-
 
H
-
 
Q