SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1056 Psest_1089 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
30% identity, 94% coverage: 6:247/258 of query aligns to 4:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
V
 
I
L
 
L
E
 
R
T
 
T
R
 
E
G
 
N
L
 
I
T
 
V
K
 
K
E
 
Y
F
|
F
R
 
G
G
 
E
F
|
F
T
 
K
A
 
A
V
 
L
D
 
D
S
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
I
K
 
S
V
 
V
R
 
N
Q
 
K
G
 
G
H
 
D
I
 
V
H
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
L
 
I
T
 
T
K
 
G
F
 
F
L
 
L
T
 
K
P
 
A
T
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
R
I
 
V
L
 
Y
Y
 
F
R
 
E
G
 
N
K
 
K
N
 
D
I
 
I
T
 
T
S
 
N
M
 
K
K
 
E
A
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
L
A
 
Y
R
 
H
L
 
Y
G
 
G
L
 
I
V
 
V
R
 
R
S
 
T
F
 
F
Q
 
Q
I
 
T
S
 
P
A
 
Q
V
 
P
F
 
L
G
 
K
H
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
G
R
 
E
V
 
I
A
 
C
L
 
P
Q
 
G
Q
 
E
K
 
S
M
 
P
G
 
L
N
 
N
S
 
S
F
 
L
H
 
F
F
 
Y
W
 
K
R
 
K
S
 
W
E
 
I
R
 
P
S
 
K
L
 
E
R
 
E
E
 
E
L
 
M
D
 
V
D
 
E
Q
 
K
V
 
A
M
 
F
Q
 
K
L
 
I
L
 
L
A
 
E
E
 
F
V
 
L
D
 
K
L
 
L
Q
 
S
S
 
H
F
 
L
A
 
Y
Q
 
D
T
 
R
L
 
K
A
 
A
V
 
G
E
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
Q
K
 
M
R
 
K
A
 
L
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
G
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
T
D
 
N
P
 
P
F
 
K
V
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
I
Q
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
L
S
 
A
E
 
H
D
 
D
V
 
I
-
 
F
D
 
N
M
 
H
V
 
V
V
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
K
R
 
A
K
 
K
A
 
G
A
 
I
A
 
-
N
 
-
R
 
-
T
 
T
V
 
F
L
 
L
M
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
N
 
R
L
 
L
S
 
D
V
 
I
V
 
V
S
 
L
R
 
N
L
 
Y
C
 
I
D
 
D
R
 
H
I
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
A
 
F
R
 
N
G
 
G
S
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
D
 
E
Y
 
I
E
 
K
S
 
N
V
 
V
S
 
L
A
 
S
N
 
D
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
R
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
30% identity, 94% coverage: 6:247/258 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
V
 
I
L
 
L
E
 
R
T
 
T
R
 
E
G
 
N
L
 
I
T
 
V
K
 
K
E
 
Y
F
|
F
R
 
G
G
 
E
F
|
F
T
 
K
A
 
A
V
 
L
D
 
D
S
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
I
K
 
S
V
 
V
R
 
C
Q
 
K
G
 
G
H
 
D
I
 
V
H
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
L
 
I
T
 
T
K
 
G
F
 
F
L
 
L
T
 
K
P
 
A
T
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
R
I
 
V
L
 
Y
Y
 
F
R
 
E
G
 
N
K
 
K
N
 
D
I
 
I
T
 
T
S
 
N
M
 
K
K
 
E
A
 
P
N
 
A
E
 
E
I
 
L
A
 
Y
R
 
H
L
 
Y
G
 
G
L
 
I
V
 
V
R
 
R
S
 
T
F
 
F
Q
 
Q
I
 
T
S
 
P
A
 
Q
V
 
P
F
 
L
G
 
K
H
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
G
R
 
E
V
 
I
A
 
N
L
 
P
Q
 
G
Q
 
E
K
 
S
M
 
P
G
 
L
N
 
N
S
 
S
F
 
L
H
 
F
F
 
Y
W
 
K
R
 
K
S
 
W
E
 
I
R
 
P
S
 
K
L
 
E
R
 
E
E
 
E
L
 
M
D
 
V
D
 
E
Q
 
K
V
 
A
M
 
F
Q
 
K
L
 
I
L
 
L
A
 
E
E
 
F
V
 
L
D
 
K
L
 
L
Q
 
S
S
 
H
F
 
L
A
 
Y
Q
 
D
T
 
R
L
 
K
A
 
A
V
 
G
E
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
Q
K
 
M
R
 
K
A
 
L
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
G
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
T
D
 
N
P
 
P
F
 
K
V
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
I
Q
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
L
S
 
A
E
 
H
D
 
D
V
 
I
-
 
F
D
 
N
M
 
H
V
 
V
V
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
K
R
 
A
K
 
K
A
 
G
A
 
I
A
 
-
N
 
-
R
 
-
T
 
T
V
 
F
L
 
L
M
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
N
 
R
L
 
L
S
 
D
V
 
I
V
 
V
S
 
L
R
 
N
L
 
Y
C
 
I
D
 
D
R
 
H
I
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
A
 
F
R
 
N
G
 
G
S
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
D
 
E
Y
 
I
E
 
K
S
 
N
V
 
V
S
 
L
A
 
S
N
 
D
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
R
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
29% identity, 95% coverage: 6:249/258 of query aligns to 2:237/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
V
 
I
L
 
L
E
 
K
T
 
A
R
 
Q
G
 
H
L
 
L
T
 
A
K
 
K
E
 
S
F
 
Y
R
 
K
G
 
K
F
 
R
T
 
K
A
 
V
V
 
V
D
 
S
S
 
D
V
 
V
D
 
S
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
R
 
E
Q
 
S
G
 
G
H
 
Q
I
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
V
 
S
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
L
 
I
T
 
V
K
 
G
F
 
L
L
 
V
T
 
A
P
 
R
T
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
T
I
 
I
L
 
T
Y
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
N
N
 
D
I
 
I
T
 
S
S
 
I
M
 
L
K
 
P
A
 
M
N
 
H
E
 
S
I
 
R
A
 
S
R
 
R
L
 
M
G
 
G
L
 
I
V
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
 
Q
I
 
E
S
 
A
A
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
R
H
 
K
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
D
N
 
N
V
 
I
R
 
M
V
 
A
A
 
V
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
H
 
-
F
 
-
W
 
T
R
 
R
S
 
E
E
 
E
R
 
L
S
 
T
L
 
H
R
x
E
E
 
E
L
 
R
D
 
Q
D
|
D
Q
 
K
V
 
L
M
 
E
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
H
L
 
I
Q
 
Q
S
 
H
F
 
I
A
 
R
Q
 
K
T
 
S
L
 
A
A
 
G
V
 
M
E
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
E
K
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
N
P
 
P
F
 
Q
V
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
Q
 
A
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
M
 
I
G
 
S
S
 
V
E
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
K
M
 
K
V
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
H
V
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
R
A
 
G
A
 
L
N
 
G
R
 
-
T
 
-
V
 
V
L
 
L
M
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
N
 
N
L
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
S
 
L
R
 
D
L
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
K
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
G
 
G
S
 
R
V
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
E
 
Q
S
 
D
V
 
V
S
 
L
A
 
N
N
 
N
P
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
S
 
E
E
 
Q

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
34% identity, 90% coverage: 23:254/258 of query aligns to 19:247/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
D
 
D
S
 
N
V
 
I
D
 
S
L
 
L
K
 
N
V
 
I
R
 
R
Q
 
R
G
 
G
H
 
Q
I
 
I
H
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
L
L
 
I
T
 
G
K
 
G
F
 
Q
L
 
L
T
 
V
P
 
P
T
 
D
R
 
Q
G
 
G
E
 
E
I
 
V
L
 
L
Y
 
L
R
 
D
G
 
G
K
 
K
N
 
D
I
 
I
T
 
A
S
 
Q
M
 
M
K
 
S
A
 
R
N
 
Q
E
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
M
G
 
G
L
 
M
V
 
L
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
|
Q
I
 
S
S
 
G
A
 
A
V
 
L
F
 
F
G
 
T
H
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
A
V
 
F
A
 
P
L
 
I
Q
 
R
Q
 
A
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
H
 
H
F
 
T
W
 
K
R
 
L
S
 
S
E
 
E
R
 
N
S
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
-
D
 
-
Q
 
-
V
 
V
M
 
A
Q
 
L
L
 
K
L
 
L
A
 
E
E
 
S
V
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
R
S
 
G
F
 
T
A
 
E
Q
 
Q
T
 
L
L
 
M
A
 
P
V
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
M
K
 
N
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
F
 
D
V
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
Q
 
A
G
 
G
M
 
Q
G
 
D
S
 
P
E
 
I
D
 
V
V
 
K
D
 
G
M
 
V
V
 
L
V
 
T
E
 
R
L
 
L
V
 
I
R
 
R
-
 
S
-
 
L
K
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
L
N
 
D
R
 
L
T
 
T
V
 
T
L
 
I
M
 
I
V
 
V
E
 
S
H
|
H
N
 
D
L
 
V
S
 
P
V
 
E
V
 
T
S
 
L
R
 
S
L
 
I
C
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
R
 
E
G
 
G
S
 
K
V
 
I
L
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
E
 
E
S
 
E
V
 
L
S
 
Q
-
 
A
-
 
Y
A
 
A
N
 
S
P
 
P
Q
 
F
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
A
 
E
A
 
G
A
 
P
L
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
34% identity, 90% coverage: 23:254/258 of query aligns to 21:249/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
D
 
D
S
 
N
V
 
I
D
 
S
L
 
L
K
 
N
V
 
I
R
 
R
Q
 
R
G
 
G
H
 
Q
I
 
I
H
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
L
L
 
I
T
 
G
K
 
G
F
 
Q
L
 
L
T
 
V
P
 
P
T
 
D
R
 
Q
G
 
G
E
 
E
I
 
V
L
 
L
Y
 
L
R
 
D
G
 
G
K
 
K
N
 
D
I
 
I
T
 
A
S
 
Q
M
 
M
K
 
S
A
 
R
N
 
Q
E
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
M
G
 
G
L
 
M
V
 
L
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
 
Q
I
 
S
S
 
G
A
 
A
V
 
L
F
 
F
G
 
T
H
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
A
V
 
F
A
 
P
L
 
I
Q
 
R
Q
 
A
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
H
 
H
F
 
T
W
 
K
R
 
L
S
 
S
E
 
E
R
 
N
S
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
-
D
 
-
Q
 
-
V
 
V
M
 
A
Q
 
L
L
 
K
L
 
L
A
 
E
E
 
S
V
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
R
S
 
G
F
 
T
A
 
E
Q
 
Q
T
 
L
L
 
M
A
 
P
V
 
T
E
|
E
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
R
x
M
K
 
N
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
F
 
D
V
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
Q
 
A
G
 
G
M
 
Q
G
 
D
S
 
P
E
 
I
D
 
V
V
 
K
D
 
G
M
 
V
V
 
L
V
 
T
E
 
R
L
 
L
V
 
I
R
 
R
-
 
S
-
 
L
K
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
L
N
 
D
R
 
L
T
 
T
V
 
T
L
 
I
M
 
I
V
 
V
E
 
S
H
 
H
N
 
D
L
 
V
S
 
P
V
 
E
V
 
T
S
 
L
R
 
S
L
 
I
C
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
R
 
E
G
 
G
S
 
K
V
 
I
L
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
E
 
E
S
 
E
V
 
L
S
 
Q
-
 
A
-
 
Y
A
 
A
N
 
S
P
 
P
Q
 
F
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
A
 
E
A
 
G
A
 
P
L
 
V
E
 
E

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
34% identity, 90% coverage: 23:254/258 of query aligns to 21:249/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
D
 
D
S
 
N
V
 
I
D
 
S
L
 
L
K
 
N
V
 
I
R
 
R
Q
 
R
G
 
G
H
 
Q
I
 
I
H
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
L
L
 
I
T
 
G
K
 
G
F
 
Q
L
 
L
T
 
V
P
 
P
T
 
D
R
 
Q
G
 
G
E
 
E
I
 
V
L
 
L
Y
 
L
R
 
D
G
 
G
K
 
K
N
 
D
I
 
I
T
 
A
S
 
Q
M
 
M
K
 
S
A
 
R
N
 
Q
E
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
M
G
 
G
L
 
M
V
 
L
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
 
Q
I
 
S
S
 
G
A
 
A
V
 
L
F
 
F
G
 
T
H
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
A
V
 
F
A
 
P
L
 
I
Q
 
R
Q
 
A
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
H
 
H
F
 
T
W
 
K
R
 
L
S
 
S
E
 
E
R
 
N
S
 
L
L
 
I
R
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
-
D
 
-
Q
 
-
V
 
V
M
 
A
Q
 
L
L
 
K
L
 
L
A
 
E
E
 
S
V
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
R
S
 
G
F
 
T
A
 
E
Q
 
Q
T
 
L
L
 
M
A
 
P
V
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
M
K
 
N
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
F
 
D
V
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
Q
 
A
G
 
G
M
 
Q
G
 
D
S
 
P
E
 
I
D
 
V
V
 
K
D
 
G
M
 
V
V
 
L
V
 
T
E
 
R
L
 
L
V
 
I
R
 
R
-
 
S
-
 
L
K
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
L
N
 
D
R
 
L
T
 
T
V
 
T
L
 
I
M
 
I
V
 
V
E
 
S
H
 
H
N
 
D
L
 
V
S
 
P
V
 
E
V
 
T
S
 
L
R
 
S
L
 
I
C
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
R
 
E
G
 
G
S
 
K
V
 
I
L
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
E
 
E
S
 
E
V
 
L
S
 
Q
-
 
A
-
 
Y
A
 
A
N
 
S
P
 
P
Q
 
F
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
A
 
E
A
 
G
A
 
P
L
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q9AT00 Protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic; ABC transporter I family member 13; ABC transporter ABCI.13; AtABCI13; Non-intrinsic ABC protein 11; AtNAP11 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
31% identity, 96% coverage: 2:248/258 of query aligns to 80:338/345 of Q9AT00

query
sites
Q9AT00
E
 
D
P
 
S
E
 
D
F
 
V
V
 
L
L
 
I
E
 
E
T
 
C
R
 
R
G
 
D
L
 
V
T
 
Y
K
 
K
E
 
S
F
|
F
R
 
G
G
 
E
F
 
K
T
 
H
A
 
I
V
 
L
D
 
K
S
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
F
K
 
K
V
 
I
R
 
R
Q
 
H
G
 
G
H
 
E
I
 
A
H
 
V
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
V
 
I
F
 
L
N
 
K
L
 
I
L
 
M
T
 
A
K
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
P
T
 
D
R
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
V
L
 
Y
Y
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
K
N
 
K
I
 
R
T
 
A
S
 
G
M
 
L
K
 
I
A
 
S
N
 
D
E
 
E
I
 
E
A
 
I
-
 
S
-
 
G
-
 
L
R
 
R
L
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
V
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
 
Q
I
 
S
S
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
F
G
 
D
H
 
S
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
G
V
 
F
A
 
L
L
 
L
Q
 
-
Q
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
H
 
-
F
 
Y
W
 
E
R
 
R
S
 
S
E
 
K
R
 
M
S
 
S
L
 
E
R
 
N
E
 
Q
L
 
I
D
 
S
D
 
E
Q
 
L
V
 
V
M
 
T
Q
 
Q
L
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
A
V
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
K
S
 
G
F
 
V
A
 
E
Q
 
N
T
 
R
L
 
L
A
 
P
V
 
S
E
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
M
K
 
K
R
 
K
A
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
I
L
 
F
D
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
I
-
 
E
P
 
P
F
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
Q
 
A
G
 
G
M
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
I
D
 
A
V
 
S
D
 
T
M
 
V
V
 
V
V
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
I
R
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
H
-
 
M
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
G
K
 
K
A
 
P
A
 
G
A
 
K
N
 
I
R
 
A
T
 
S
V
 
Y
L
 
L
M
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
N
 
Q
L
 
H
S
 
S
V
 
T
V
 
I
S
 
Q
R
 
R
L
 
A
C
 
V
D
 
D
R
 
R
I
 
L
T
 
L
V
 
F
L
 
L
A
 
Y
R
 
E
G
 
G
S
 
K
V
 
I
L
 
V
A
 
W
E
 
Q
G
 
G
-
 
M
D
 
T
Y
 
H
E
 
E
-
 
F
S
 
T
V
 
T
S
 
S
A
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
I
V
 
V
R
 
Q
E
 
Q
A
 
F
Y
 
A
L
 
T
G
 
G
S
 
S

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
30% identity, 93% coverage: 5:243/258 of query aligns to 2:237/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
F
 
Y
V
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
L
R
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
F
E
 
K
F
 
-
R
|
R
G
 
G
F
 
S
T
 
R
A
 
A
V
 
I
-
 
F
D
 
D
S
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
V
K
 
R
V
 
I
R
 
P
Q
 
R
G
 
G
H
 
K
I
 
V
H
 
T
A
 
G
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
L
L
 
I
T
 
A
K
 
S
F
 
Q
L
 
L
T
 
R
P
 
P
T
 
S
R
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
V
L
 
W
Y
 
V
R
 
N
G
 
G
K
 
Q
N
 
N
I
 
L
T
 
P
S
 
Q
M
 
L
K
 
S
A
 
R
N
 
G
E
 
D
I
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
M
-
 
R
A
 
K
R
 
Q
L
 
F
G
 
G
L
 
V
V
 
L
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
 
Q
I
 
S
S
 
G
A
 
A
V
 
L
F
 
F
G
 
T
H
 
D
M
 
L
S
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
A
V
 
F
A
 
P
L
 
L
Q
 
R
Q
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
V
H
 
H
F
 
T
W
 
Q
R
 
L
S
 
P
E
 
E
R
 
E
S
 
M
L
 
I
R
 
R
E
 
D
L
 
I
D
 
-
D
 
-
Q
 
-
V
 
V
M
 
L
Q
 
M
L
 
K
L
 
L
A
 
Q
E
 
A
V
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
R
S
 
G
F
 
A
A
 
V
Q
 
E
T
 
L
L
 
M
A
 
P
V
 
D
E
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
M
K
 
K
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
F
 
Q
V
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
Q
 
V
G
 
G
M
 
Q
G
 
D
S
 
P
E
 
I
D
 
A
V
 
M
D
 
G
M
 
V
V
 
L
V
 
V
E
 
R
L
 
L
V
 
I
R
 
R
-
 
L
-
 
L
K
 
N
A
 
D
A
 
A
A
 
L
N
 
G
R
 
I
T
 
T
V
 
S
L
 
I
M
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
N
 
D
L
 
L
S
 
A
V
 
E
V
 
T
S
 
A
R
 
S
L
 
I
C
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
G
R
 
D
G
 
G
S
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
G
E
 
H
G
 
G
-
 
T
-
 
P
D
 
D
Y
 
V
E
 
L
S
 
K
V
 
E
S
 
T
A
 
D
N
 
D
P
 
P
Q
 
R
V
 
I
R
 
R
E
 
Q

Q8N139 ATP-binding cassette sub-family A member 6; EC 7.6.2.- from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
29% identity, 88% coverage: 3:230/258 of query aligns to 470:695/1617 of Q8N139

query
sites
Q8N139
P
 
P
E
 
E
F
 
F
-
 
Q
-
 
G
-
 
K
-
 
E
V
 
A
L
 
I
E
 
R
T
 
I
R
 
R
G
 
N
L
 
V
T
 
K
K
 
K
E
 
E
F
 
Y
R
 
K
G
 
G
F
 
K
T
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
E
A
 
A
V
 
L
D
 
K
S
 
G
V
 
L
D
 
L
L
 
F
K
 
D
V
 
I
R
 
Y
Q
 
E
G
 
G
H
 
Q
I
 
I
H
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
S
V
 
L
F
 
L
N
 
N
L
 
I
L
 
L
T
 
N
K
 
G
F
 
L
L
 
S
T
 
V
P
 
P
T
 
T
R
 
E
G
 
G
E
 
S
I
 
V
L
 
T
Y
 
I
R
 
Y
G
 
N
K
 
K
N
 
N
I
 
L
T
 
S
S
 
E
M
 
M
K
 
Q
A
 
D
N
 
L
E
 
E
I
 
E
A
 
I
R
 
R
-
 
K
-
 
I
L
 
T
G
 
G
L
 
V
V
 
C
R
 
P
S
 
Q
F
 
F
Q
 
N
I
 
V
S
 
Q
A
 
-
V
 
-
F
 
F
G
 
D
H
 
I
M
 
L
S
 
T
V
 
V
L
 
K
E
 
E
N
 
N
V
 
L
R
 
S
V
 
L
A
 
F
L
 
A
Q
 
K
Q
 
I
K
 
K
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
G
F
 
I
H
 
H
F
 
-
W
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
V
D
 
E
D
 
Q
Q
 
E
V
 
V
M
 
Q
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
A
 
L
E
 
E
V
 
L
D
 
D
L
 
M
Q
 
Q
S
 
N
F
 
I
A
 
Q
Q
 
D
T
 
N
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
H
L
 
L
P
 
S
Y
 
E
G
 
G
R
 
Q
K
 
K
R
 
R
A
 
K
L
 
L
E
 
T
L
 
F
A
 
G
T
 
I
T
 
T
L
 
I
A
 
L
L
 
G
D
 
D
P
 
P
F
 
Q
V
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
Q
 
T
G
 
G
M
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
F
D
 
S
V
 
R
D
 
D
M
 
Q
V
 
V
V
 
W
E
 
S
L
 
L
V
 
L
R
 
R
K
 
E
A
 
R
A
 
R
A
 
A
N
 
D
R
 
H
T
 
V
V
 
I
L
 
L
M
 
F
V
 
S
E
 
T
H
 
Q
N
 
S
L
 
M
S
 
D
V
 
E
V
 
A
S
 
D
R
 
I
L
 
L
C
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
K
T
 
V
V
 
I
L
 
M
A
 
S
R
 
N
G
 
G
S
 
R
V
 
L
L
 
K
A
 
C
E
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
28% identity, 94% coverage: 7:249/258 of query aligns to 3:237/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
E
 
T
T
 
A
R
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
K
E
 
A
F
 
Y
R
 
K
G
 
G
F
 
R
T
 
R
A
 
V
V
 
V
D
 
E
S
 
D
V
 
V
D
 
S
L
 
L
K
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
H
 
E
I
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
L
 
V
T
 
V
K
 
G
F
 
I
L
 
V
T
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
L
 
I
Y
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
N
 
D
I
 
I
T
 
S
S
 
L
M
 
L
K
 
P
A
 
L
N
 
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
 
Q
I
 
E
S
 
A
A
 
S
V
 
I
F
 
F
G
x
R
H
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
R
 
M
V
 
A
A
 
V
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
H
 
-
F
 
-
W
 
I
R
 
R
S
 
D
E
 
D
R
 
L
S
 
S
L
 
A
R
 
E
E
 
Q
L
 
R
D
 
E
D
 
D
Q
 
R
V
 
A
M
 
N
Q
 
E
L
 
L
L
 
M
A
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
H
L
 
I
Q
 
E
S
 
H
F
 
L
A
 
R
Q
 
D
T
 
S
L
x
M
A
x
G
V
x
Q
E
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
E
K
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
N
P
 
P
F
 
K
V
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
Q
 
A
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
M
 
I
G
 
S
S
 
V
E
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
K
M
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
H
V
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
S
A
 
G
A
 
L
N
 
G
R
 
-
T
 
-
V
 
V
L
 
L
M
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
N
 
N
L
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
S
 
L
R
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
G
 
G
S
 
H
V
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
E
 
T
S
 
E
V
 
I
S
 
L
A
 
Q
N
 
D
P
 
E
Q
 
H
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
S
 
E
E
 
D

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
28% identity, 94% coverage: 7:249/258 of query aligns to 3:237/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
E
 
T
T
 
A
R
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
K
E
 
A
F
x
Y
R
 
K
G
 
G
F
x
R
T
 
R
A
 
V
V
 
V
D
 
E
S
 
D
V
 
V
D
 
S
L
 
L
K
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
H
 
E
I
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
L
 
V
T
 
V
K
 
G
F
 
I
L
 
V
T
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
L
 
I
Y
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
N
 
D
I
 
I
T
 
S
S
 
L
M
 
L
K
 
P
A
 
L
N
 
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
|
Q
I
 
E
S
 
A
A
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
R
H
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
R
 
M
V
 
A
A
 
V
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
H
 
-
F
 
-
W
 
I
R
 
R
S
 
D
E
 
D
R
 
L
S
 
S
L
 
A
R
 
E
E
 
Q
L
 
R
D
 
E
D
 
D
Q
 
R
V
 
A
M
 
N
Q
 
E
L
 
L
L
 
M
A
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
H
L
 
I
Q
 
E
S
 
H
F
 
L
A
 
R
Q
 
D
T
 
S
L
 
M
A
 
G
V
 
Q
E
x
S
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
R
x
E
K
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
N
P
 
P
F
 
K
V
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
Q
 
A
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
M
 
I
G
 
S
S
 
V
E
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
K
M
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
H
V
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
S
A
 
G
A
 
L
N
 
G
R
 
-
T
 
-
V
 
V
L
 
L
M
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
N
 
N
L
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
S
 
L
R
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
G
 
G
S
 
H
V
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
E
 
T
S
 
E
V
 
I
S
 
L
A
 
Q
N
 
D
P
 
E
Q
 
H
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
S
 
E
E
 
D

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
28% identity, 93% coverage: 7:247/258 of query aligns to 3:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
E
 
T
T
 
A
R
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
K
E
 
A
F
x
Y
R
 
K
G
 
G
F
 
R
T
 
R
A
 
V
V
 
V
D
 
E
S
 
D
V
 
V
D
 
S
L
 
L
K
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
H
 
E
I
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
L
 
V
T
 
V
K
 
G
F
 
I
L
 
V
T
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
L
 
I
Y
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
N
 
D
I
 
I
T
 
S
S
 
L
M
 
L
K
 
P
A
 
L
N
 
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
|
Q
I
 
E
S
 
A
A
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
R
H
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
R
 
M
V
 
A
A
 
V
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
H
 
-
F
 
-
W
 
I
R
 
R
S
 
D
E
 
D
R
 
L
S
 
S
L
 
A
R
 
E
E
 
Q
L
 
R
D
 
E
D
 
D
Q
 
R
V
 
A
M
 
N
Q
 
E
L
 
L
L
 
M
A
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
H
L
 
I
Q
 
E
S
 
H
F
 
L
A
 
R
Q
 
D
T
 
S
L
 
M
A
 
G
V
 
Q
E
x
S
L
 
L
P
x
S
Y
x
G
G
|
G
R
 
E
K
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
N
P
 
P
F
 
K
V
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
Q
 
A
G
|
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
M
 
I
G
 
S
S
 
V
E
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
K
M
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
H
V
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
S
A
 
G
A
 
L
N
 
G
R
 
-
T
 
-
V
 
V
L
 
L
M
 
I
V
 
T
E
 
D
H
|
H
N
 
N
L
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
S
 
L
R
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
G
 
G
S
 
H
V
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
E
 
T
S
 
E
V
 
I
S
 
L
A
 
Q
N
 
D
P
 
E
Q
 
H
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
28% identity, 94% coverage: 7:249/258 of query aligns to 4:238/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
L
 
L
E
 
T
T
 
A
R
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
K
E
 
A
F
x
Y
R
 
K
G
 
G
F
x
R
T
 
R
A
x
V
V
 
V
D
 
E
S
 
D
V
 
V
D
 
S
L
 
L
K
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
H
 
E
I
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
L
 
V
T
 
V
K
 
G
F
 
I
L
 
V
T
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
L
 
I
Y
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
N
 
D
I
 
I
T
 
S
S
 
L
M
 
L
K
 
P
A
 
L
N
 
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
 
Q
I
 
E
S
 
A
A
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
R
H
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
R
 
M
V
 
A
A
 
V
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
H
 
-
F
 
-
W
 
I
R
 
R
S
 
D
E
 
D
R
 
L
S
 
S
L
 
A
R
 
E
E
 
Q
L
 
R
D
 
E
D
 
D
Q
 
R
V
 
A
M
 
N
Q
 
E
L
 
L
L
 
M
A
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
H
L
 
I
Q
 
E
S
 
H
F
 
L
A
 
R
Q
 
D
T
 
S
L
 
M
A
 
G
V
 
Q
E
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
E
K
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
N
P
 
P
F
 
K
V
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
Q
 
A
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
M
 
I
G
 
S
S
 
V
E
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
K
M
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
H
V
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
S
A
 
G
A
 
L
N
 
G
R
 
-
T
 
-
V
 
V
L
 
L
M
 
I
V
 
T
E
 
D
H
|
H
N
 
N
L
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
S
 
L
R
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
G
 
G
S
 
H
V
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
E
 
T
S
 
E
V
 
I
S
 
L
A
 
Q
N
 
D
P
 
E
Q
 
H
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
S
 
E
E
 
D

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
28% identity, 93% coverage: 7:246/258 of query aligns to 3:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
L
 
L
E
 
T
T
 
A
R
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
K
E
 
A
F
x
Y
R
 
K
G
 
G
F
x
R
T
 
R
A
x
V
V
 
V
D
 
E
S
 
D
V
 
V
D
 
S
L
 
L
K
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
H
 
E
I
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
L
 
V
T
 
V
K
 
G
F
 
I
L
 
V
T
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
L
 
I
Y
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
N
 
D
I
 
I
T
 
S
S
 
L
M
 
L
K
 
P
A
x
L
N
x
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
x
P
Q
|
Q
I
 
E
S
x
A
A
x
S
V
 
I
F
|
F
G
x
R
H
x
R
M
x
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
R
 
M
V
 
A
A
x
V
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
H
 
-
F
 
-
W
 
I
R
 
R
S
 
D
E
 
D
R
 
L
S
 
S
L
 
A
R
 
E
E
 
Q
L
 
R
D
 
E
D
 
D
Q
 
R
V
 
A
M
 
N
Q
 
E
L
 
L
L
 
M
A
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
H
L
 
I
Q
 
E
S
 
H
F
 
L
A
 
R
Q
 
D
T
 
S
L
 
M
A
 
G
V
x
Q
E
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
E
K
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
x
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
N
P
 
P
F
 
K
V
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
Q
 
A
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
M
 
I
G
 
S
S
 
V
E
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
K
M
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
H
V
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
S
A
 
G
A
 
L
N
 
G
R
 
-
T
 
-
V
 
V
L
 
L
M
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
N
 
N
L
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
S
 
L
R
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
G
 
G
S
 
H
V
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
E
 
T
S
 
E
V
 
I
S
 
L
A
 
Q
N
 
D
P
 
E
Q
 
H
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
28% identity, 93% coverage: 7:246/258 of query aligns to 3:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
L
 
L
E
 
T
T
 
A
R
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
K
E
 
A
F
x
Y
R
 
K
G
 
G
F
x
R
T
 
R
A
x
V
V
 
V
D
 
E
S
 
D
V
 
V
D
 
S
L
 
L
K
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
H
 
E
I
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
L
 
V
T
 
V
K
 
G
F
 
I
L
 
V
T
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
L
 
I
Y
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
N
 
D
I
 
I
T
 
S
S
 
L
M
 
L
K
 
P
A
 
L
N
 
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
|
Q
I
 
E
S
 
A
A
 
S
V
 
I
F
 
F
G
 
R
H
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
R
 
M
V
 
A
A
 
V
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
H
 
-
F
 
-
W
 
I
R
 
R
S
 
D
E
 
D
R
 
L
S
 
S
L
 
A
R
 
E
E
 
Q
L
 
R
D
 
E
D
 
D
Q
 
R
V
 
A
M
 
N
Q
 
E
L
 
L
L
 
M
A
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
H
L
 
I
Q
 
E
S
 
H
F
 
L
A
 
R
Q
 
D
T
 
S
L
 
M
A
 
G
V
 
Q
E
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
E
K
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
N
P
 
P
F
 
K
V
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
Q
 
A
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
M
 
I
G
 
S
S
 
V
E
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
K
M
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
H
V
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
S
A
 
G
A
 
L
N
 
G
R
 
-
T
 
-
V
 
V
L
 
L
M
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
N
 
N
L
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
S
 
L
R
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
G
 
G
S
 
H
V
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
E
 
T
S
 
E
V
 
I
S
 
L
A
 
Q
N
 
D
P
 
E
Q
 
H
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
28% identity, 93% coverage: 7:245/258 of query aligns to 3:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
E
 
T
T
 
A
R
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
A
K
 
K
E
 
A
F
x
Y
R
 
K
G
 
G
F
x
R
T
 
R
A
x
V
V
 
V
D
 
E
S
 
D
V
 
V
D
 
S
L
 
L
K
 
T
V
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
H
 
E
I
 
I
H
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
L
 
V
T
 
V
K
 
G
F
 
I
L
 
V
T
 
P
P
 
R
T
 
D
R
 
A
G
 
G
E
 
N
I
 
I
L
 
I
Y
 
I
R
 
D
G
 
D
K
 
D
N
 
D
I
 
I
T
 
S
S
 
L
M
 
L
K
 
P
A
 
L
N
 
H
E
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
 
Q
I
 
E
S
 
A
A
 
S
V
 
I
F
|
F
G
x
R
H
x
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
L
R
 
M
V
 
A
A
 
V
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
-
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
H
 
-
F
 
-
W
 
I
R
 
R
S
 
D
E
 
D
R
 
L
S
 
S
L
 
A
R
 
E
E
 
Q
L
 
R
D
 
E
D
 
D
Q
 
R
V
 
A
M
 
N
Q
 
E
L
 
L
L
 
M
A
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
H
L
 
I
Q
 
E
S
 
H
F
 
L
A
 
R
Q
 
D
T
 
S
L
 
M
A
 
G
V
 
Q
E
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
E
K
 
R
R
 
R
A
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
N
P
 
P
F
 
K
V
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
Q
 
A
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
M
 
I
G
 
S
S
 
V
E
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
K
M
 
R
V
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
H
V
 
L
R
 
R
K
 
D
A
 
S
A
 
G
A
 
L
N
 
G
R
 
-
T
 
-
V
 
V
L
 
L
M
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
N
 
N
L
 
V
S
 
R
V
 
E
V
 
T
S
 
L
R
 
A
L
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
G
 
G
S
 
H
V
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
E
 
T
S
 
E
V
 
I
S
 
L
A
 
Q
N
 
D
P
 
E
Q
 
H
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
29% identity, 96% coverage: 1:247/258 of query aligns to 1:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
M
 
M
E
 
V
P
 
S
E
 
D
F
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
V
R
 
Q
G
 
S
L
 
L
T
 
H
K
 
V
E
 
Y
F
x
Y
R
 
G
G
 
A
F
 
I
T
 
H
A
 
A
V
 
I
D
 
K
S
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
V
R
 
P
Q
 
R
G
 
G
H
 
Q
I
 
I
H
 
V
A
 
T
L
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
L
N
 
S
L
 
A
L
 
I
T
 
A
K
 
G
F
 
L
L
 
V
T
 
R
P
 
A
T
 
Q
R
 
K
G
 
G
E
 
K
I
 
I
L
 
I
Y
 
F
R
 
N
G
 
G
K
 
Q
N
 
D
I
 
I
T
 
T
S
 
N
M
 
K
K
 
P
A
 
A
N
 
H
E
 
V
I
 
I
A
 
N
R
 
R
L
 
M
G
 
G
L
 
I
V
 
A
R
 
L
S
 
V
F
 
P
Q
x
E
I
 
G
S
 
R
A
 
R
V
 
I
F
 
F
G
 
P
H
 
E
M
 
L
S
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
L
R
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
Q
 
-
K
 
-
M
 
M
G
 
M
N
 
G
S
 
A
F
 
Y
H
 
N
F
 
R
W
 
K
R
 
D
S
 
K
E
 
E
R
 
G
S
 
I
L
 
K
R
 
R
E
 
D
L
 
L
D
 
-
D
 
E
Q
 
W
V
 
I
M
 
F
Q
 
S
L
 
L
L
 
F
A
 
P
E
 
R
V
 
-
D
 
-
L
 
L
Q
 
K
S
 
E
F
 
R
A
 
L
Q
 
K
T
 
Q
L
 
L
A
 
G
V
 
G
E
 
T
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
E
K
 
Q
R
 
Q
A
 
M
L
 
L
E
 
A
L
 
I
A
 
G
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
S
D
 
R
P
 
P
F
 
K
V
 
L
L
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
S
Q
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
A
S
 
P
E
 
I
D
 
L
V
 
V
D
 
S
M
 
E
V
 
V
V
 
F
E
 
E
L
 
V
V
 
I
R
 
Q
K
 
K
A
 
I
-
 
N
A
 
Q
A
 
E
N
 
G
R
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
L
M
 
L
V
 
V
E
 
E
H
 
Q
N
 
N
L
 
A
S
 
L
V
 
G
V
 
A
S
 
L
R
 
K
L
 
V
C
 
A
D
 
H
R
 
Y
I
 
G
T
 
Y
V
 
V
L
 
L
A
 
E
R
 
T
G
 
G
S
 
Q
V
 
I
L
 
V
A
 
L
E
 
E
G
 
G
D
 
K
Y
 
A
E
 
S
S
 
E
V
 
L
S
 
L
A
 
D
N
 
N
P
 
E
Q
 
M
V
 
V
R
 
R
E
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
29% identity, 89% coverage: 14:243/258 of query aligns to 9:234/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
K
 
K
E
 
N
F
|
F
R
 
G
G
 
S
F
 
L
T
 
E
A
x
V
V
 
L
D
 
K
S
 
G
V
 
V
D
 
T
L
 
L
K
 
K
V
 
V
R
 
N
Q
 
K
G
 
G
H
 
E
I
 
V
H
 
V
A
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
C
L
 
I
T
 
N
K
 
L
F
 
L
L
 
E
T
 
E
P
 
P
T
 
T
R
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
V
L
 
F
Y
 
I
R
 
D
G
 
G
K
 
V
N
 
K
I
 
I
T
 
N
S
 
N
M
 
G
K
 
K
A
 
V
N
 
N
E
 
I
I
 
N
A
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
Q
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
M
V
 
V
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
 
Q
I
 
H
S
 
F
A
 
N
V
 
L
F
 
F
G
 
P
H
 
H
M
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
I
E
 
E
N
 
N
V
 
I
R
 
T
V
 
L
A
 
A
-
 
P
L
 
V
Q
 
K
Q
 
V
K
 
K
M
 
K
G
 
M
N
 
N
S
 
K
F
 
-
H
 
-
F
 
-
W
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
K
E
 
E
L
 
A
D
 
E
D
 
E
Q
 
L
V
 
A
M
 
V
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
K
V
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
L
S
 
D
F
 
K
A
 
K
Q
 
D
T
 
Q
L
 
Y
A
 
P
V
 
I
E
 
K
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
Q
K
 
K
R
 
Q
A
 
R
L
 
L
E
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
Q
P
 
P
F
 
E
V
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
Q
 
S
G
 
A
M
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
E
D
 
M
V
 
V
D
 
K
M
 
E
V
 
V
V
 
L
E
 
N
L
 
V
V
 
M
R
 
K
K
 
Q
-
 
L
A
 
A
A
 
N
A
 
E
N
 
G
R
 
M
T
 
T
V
 
M
L
 
V
M
 
V
V
 
V
E
 
T
H
|
H
N
 
E
L
 
M
S
 
G
V
 
F
V
 
A
S
 
R
R
 
E
L
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
I
V
 
F
L
 
M
A
 
D
R
 
D
G
 
G
S
 
V
V
 
I
L
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
E
 
E
S
 
E
V
 
I
-
 
F
-
 
Y
-
 
R
S
 
A
A
 
K
N
 
N
P
 
E
Q
 
R
V
 
T
R
 
R
E
 
E

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
28% identity, 91% coverage: 6:240/258 of query aligns to 2:228/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
V
 
I
L
 
I
E
 
R
T
 
I
R
 
R
G
 
N
L
 
L
T
 
H
K
 
K
E
 
W
F
|
F
R
 
G
G
 
P
F
 
L
T
 
H
A
x
V
V
 
L
D
 
K
S
 
G
V
 
I
D
 
H
L
 
L
K
 
E
V
 
V
R
 
A
Q
 
P
G
 
G
H
 
E
I
 
K
H
 
L
A
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
T
L
 
I
T
 
N
K
 
R
F
 
L
L
 
E
T
 
D
P
 
F
T
 
Q
R
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
L
 
V
Y
 
V
R
 
D
G
 
G
K
 
L
N
 
S
I
 
V
T
 
K
S
 
D
M
 
D
K
 
R
A
 
A
-
 
L
N
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
R
R
 
R
-
 
E
L
 
V
G
 
G
L
 
M
V
 
V
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
 
Q
I
 
Q
S
 
F
A
 
N
V
 
L
F
 
F
G
 
P
H
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
P
Q
 
M
Q
 
R
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
V
H
 
R
F
 
R
W
 
W
R
 
P
S
 
R
E
 
E
R
 
K
S
 
A
L
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
E
D
 
K
Q
 
K
V
 
A
M
 
L
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
R
V
 
V
D
 
G
L
 
I
Q
 
L
S
 
D
F
 
Q
A
 
A
Q
 
R
T
 
K
L
 
Y
A
 
P
V
 
A
E
 
Q
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
Q
K
 
Q
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
E
P
 
P
F
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
Q
 
S
G
 
A
M
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
E
D
 
M
V
 
V
D
 
G
M
 
E
V
 
V
V
 
L
E
 
D
L
 
V
V
 
M
R
 
R
K
 
D
-
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
G
N
 
G
R
 
M
T
 
T
V
 
M
L
 
V
M
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
N
 
E
L
 
M
S
 
G
V
 
F
V
 
A
S
 
R
R
 
E
L
 
V
C
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
V
V
 
F
L
 
M
A
 
D
R
 
G
G
 
G
S
 
Q
V
 
I
L
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
D
 
R
Y
 
P
E
 
E
S
 
E
V
 
I
S
 
F
A
 
T
N
 
R
P
 
P
Q
 
K

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
28% identity, 91% coverage: 6:240/258 of query aligns to 3:230/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
V
 
M
L
 
I
E
 
D
T
 
V
R
 
H
G
 
Q
L
 
L
T
 
K
K
 
K
E
 
S
F
|
F
R
 
G
G
 
S
F
 
L
T
 
E
A
x
V
V
 
L
D
 
K
S
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
K
 
H
V
 
I
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
H
 
E
I
 
V
H
 
V
A
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
-
 
F
-
 
L
-
 
R
V
 
C
F
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
T
 
E
K
 
D
F
 
F
L
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
L
 
I
Y
 
I
R
 
D
G
 
G
K
 
I
N
 
N
I
 
L
T
 
K
S
 
A
M
 
K
K
 
D
A
 
T
N
 
N
E
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
G
 
N
L
 
K
V
 
V
R
 
R
S
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
 
V
F
 
F
Q
 
Q
I
 
R
S
 
F
A
 
N
V
 
L
F
 
F
G
 
P
H
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
R
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
P
Q
 
M
Q
 
K
K
 
-
M
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
V
H
 
R
F
 
K
W
 
W
R
 
P
S
 
R
E
 
E
R
 
K
S
 
A
L
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
E
D
 
A
Q
 
K
V
 
A
M
 
M
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
D
E
 
K
V
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
K
S
 
D
F
 
K
A
 
A
Q
 
H
T
 
A
L
 
Y
A
 
P
V
 
D
E
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
R
 
Q
K
 
A
R
 
Q
A
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
E
P
 
P
F
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
Q
 
S
G
 
A
M
 
L
G
 
D
S
 
P
E
 
E
D
 
M
V
 
V
D
 
G
M
 
E
V
 
V
V
 
L
E
 
S
L
 
V
V
 
M
R
 
K
K
 
Q
-
 
L
A
 
A
A
 
N
A
 
E
N
 
G
R
 
M
T
 
T
V
 
M
L
 
V
M
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
N
 
E
L
 
M
S
 
G
V
 
F
V
 
A
S
 
R
R
 
E
L
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
L
V
 
F
L
 
M
A
 
D
R
 
G
G
 
G
S
 
Y
V
 
I
L
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
D
 
K
Y
 
P
E
 
E
S
 
D
V
 
L
S
 
F
A
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q

Query Sequence

>GFF1056 Psest_1089 ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component
MEPEFVLETRGLTKEFRGFTAVDSVDLKVRQGHIHALIGPNGAGKTTVFNLLTKFLTPTR
GEILYRGKNITSMKANEIARLGLVRSFQISAVFGHMSVLENVRVALQQKMGNSFHFWRSE
RSLRELDDQVMQLLAEVDLQSFAQTLAVELPYGRKRALELATTLALDPFVLLLDEPTQGM
GSEDVDMVVELVRKAAANRTVLMVEHNLSVVSRLCDRITVLARGSVLAEGDYESVSANPQ
VREAYLGSEAAALEEAHA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory