SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1093 FitnessBrowser__WCS417:GFF1093 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
59% identity, 99% coverage: 1:242/244 of query aligns to 2:240/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
M
 
I
I
 
I
S
 
R
I
 
I
K
 
R
N
 
N
I
 
L
N
 
H
K
 
K
W
 
W
Y
x
F
G
 
G
D
 
P
F
 
L
Q
 
H
V
|
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
C
 
I
S
 
H
T
 
L
D
 
E
V
 
V
K
 
A
K
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
K
I
 
L
V
 
V
V
 
I
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
K
 
R
C
 
T
V
 
I
N
 
N
A
 
R
L
 
L
E
 
E
P
 
D
F
 
F
Q
 
Q
K
 
E
G
 
G
D
 
E
I
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
T
 
L
S
 
S
I
 
V
A
 
K
D
 
D
P
 
D
K
 
R
T
 
A
N
 
-
L
 
L
P
 
R
Q
 
E
L
 
I
R
 
R
S
 
R
R
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
Q
F
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
I
 
V
T
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
T
 
T
I
 
L
A
 
A
Q
 
P
I
 
M
K
 
R
V
 
V
L
 
R
G
 
R
R
 
W
S
 
P
K
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
T
 
E
K
 
K
K
 
K
G
 
A
L
 
L
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
S
 
L
A
 
D
H
 
Q
A
 
A
H
 
R
K
 
K
H
 
Y
P
 
P
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
P
 
P
I
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
M
 
M
V
 
R
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
M
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
F
M
 
M
D
 
D
A
 
G
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
I
 
V
E
 
E
D
 
E
C
 
G
P
 
R
K
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
I
F
 
F
G
 
-
D
 
-
I
 
T
S
 
R
A
 
P
R
 
K
S
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
T
Q
 
R
H
 
S
F
 
F
L
 
L
E
 
Q
K
 
R
I
 
V
L
 
L

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
57% identity, 99% coverage: 1:242/244 of query aligns to 1:240/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
M
 
M
I
 
I
S
 
F
I
 
V
K
 
N
N
 
D
I
 
V
N
 
Y
K
 
K
W
 
N
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
F
 
L
Q
 
E
V
|
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
C
 
V
S
 
T
T
 
L
D
 
K
V
 
V
K
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
I
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
C
 
C
V
 
I
N
 
N
A
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
E
F
 
P
Q
 
T
K
 
K
G
 
G
D
 
E
I
 
V
V
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
G
T
 
V
S
 
K
I
 
I
A
 
N
D
 
N
P
 
G
K
 
K
T
 
V
N
 
N
L
 
I
P
 
N
Q
 
K
L
 
V
R
 
R
S
 
Q
R
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
L
T
 
T
I
 
A
T
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
I
T
 
T
I
 
L
A
 
A
Q
 
P
I
 
V
K
 
K
V
 
V
L
 
K
G
 
K
R
 
M
S
 
N
K
 
K
E
 
K
E
 
E
A
 
A
T
 
E
K
 
E
K
 
L
G
 
A
L
 
V
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
A
 
D
H
 
K
A
 
K
H
 
D
K
 
Q
H
 
Y
P
 
P
G
 
I
Q
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
Q
P
 
P
I
 
E
V
 
V
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
V
N
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
N
V
 
V
M
 
M
V
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
M
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
I
F
 
F
M
 
M
D
 
D
A
 
D
G
 
G
K
 
V
I
 
I
I
 
V
E
 
E
D
 
E
C
 
G
P
 
T
K
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
I
F
 
F
G
 
-
D
 
-
I
 
Y
S
 
R
A
 
A
R
 
K
S
 
N
E
 
E
R
 
R
A
 
T
Q
 
R
H
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
S
K
 
K
I
 
I
L
 
L

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
55% identity, 99% coverage: 1:242/244 of query aligns to 3:242/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
M
 
M
I
 
I
S
 
D
I
 
V
K
 
H
N
 
Q
I
 
L
N
 
K
K
 
K
W
 
S
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
F
 
L
Q
 
E
V
|
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
C
 
I
S
 
N
T
 
V
D
 
H
V
 
I
K
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
C
 
C
V
 
L
N
 
N
A
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
D
F
 
F
Q
 
D
K
 
E
G
 
G
D
 
E
I
 
I
V
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
T
 
I
S
 
N
I
 
L
A
 
K
D
 
A
P
 
K
K
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
P
 
N
Q
 
K
L
 
V
R
 
R
S
 
E
R
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
I
 
V
T
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
T
 
T
I
 
L
A
 
A
Q
 
P
I
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
R
G
 
K
R
 
W
S
 
P
K
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
T
 
E
K
 
A
K
 
K
G
 
A
L
 
M
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
D
H
 
K
A
 
A
H
 
H
K
 
A
H
 
Y
P
 
P
G
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
P
 
P
I
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
S
V
 
V
M
 
M
V
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
M
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
L
F
 
F
M
 
M
D
 
D
A
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
E
C
 
G
P
 
K
K
 
P
E
 
E
E
 
D
F
 
L
F
 
F
G
 
D
D
 
-
I
 
-
S
 
R
A
 
P
R
 
Q
S
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
T
Q
 
K
H
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
F

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
55% identity, 99% coverage: 1:242/244 of query aligns to 3:242/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
M
 
M
I
 
I
S
 
D
I
 
V
K
 
H
N
 
Q
I
 
L
N
 
K
K
 
K
W
 
S
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
F
 
L
Q
 
E
V
|
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
C
 
I
S
 
N
T
 
V
D
 
H
V
 
I
K
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
C
 
C
V
 
L
N
 
N
A
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
D
F
 
F
Q
 
D
K
 
E
G
 
G
D
 
E
I
 
I
V
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
T
 
I
S
 
N
I
 
L
A
 
K
D
 
A
P
 
K
K
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
P
 
N
Q
 
K
L
 
V
R
 
R
S
 
E
R
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
I
 
V
T
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
T
 
T
I
 
L
A
 
A
Q
 
P
I
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
R
G
 
K
R
 
W
S
 
P
K
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
T
 
E
K
 
A
K
 
K
G
 
A
L
 
M
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
D
H
 
K
A
 
A
H
 
H
K
 
A
H
 
Y
P
 
P
G
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
P
 
P
I
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
S
V
 
V
M
 
M
V
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
M
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
L
F
 
F
M
 
M
D
 
D
A
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
E
C
 
G
P
 
K
K
 
P
E
 
E
E
 
D
F
 
L
F
 
F
G
 
D
D
 
-
I
 
-
S
 
R
A
 
P
R
 
Q
S
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
T
Q
 
K
H
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
F

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
55% identity, 99% coverage: 1:242/244 of query aligns to 3:242/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
M
 
M
I
 
I
S
 
D
I
 
V
K
 
H
N
 
Q
I
 
L
N
 
K
K
 
K
W
 
S
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
F
 
L
Q
 
E
V
|
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
C
 
I
S
 
N
T
 
V
D
 
H
V
 
I
K
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
C
 
C
V
 
L
N
 
N
A
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
D
F
 
F
Q
 
D
K
 
E
G
 
G
D
 
E
I
 
I
V
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
T
 
I
S
 
N
I
 
L
A
 
K
D
 
A
P
 
K
K
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
P
 
N
Q
 
K
L
 
V
R
 
R
S
 
E
R
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
I
 
V
T
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
T
 
T
I
 
L
A
 
A
Q
 
P
I
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
R
G
 
K
R
 
W
S
 
P
K
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
T
 
E
K
 
A
K
 
K
G
 
A
L
 
M
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
D
H
 
K
A
 
A
H
 
H
K
 
A
H
 
Y
P
 
P
G
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
P
 
P
I
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
S
V
 
V
M
 
M
V
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
M
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
L
F
 
F
M
 
M
D
 
D
A
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
E
C
 
G
P
 
K
K
 
P
E
 
E
E
 
D
F
 
L
F
 
F
G
 
D
D
 
-
I
 
-
S
 
R
A
 
P
R
 
Q
S
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
T
Q
 
K
H
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
F

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
55% identity, 99% coverage: 1:242/244 of query aligns to 3:242/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
M
 
M
I
 
I
S
 
D
I
 
V
K
 
H
N
 
Q
I
 
L
N
 
K
K
 
K
W
 
S
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
F
 
L
Q
 
E
V
|
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
C
 
I
S
 
N
T
 
V
D
 
H
V
 
I
K
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
C
 
C
V
 
L
N
 
N
A
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
D
F
 
F
Q
 
D
K
 
E
G
 
G
D
 
E
I
 
I
V
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
T
 
I
S
 
N
I
 
L
A
 
K
D
 
A
P
 
K
K
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
P
 
N
Q
 
K
L
 
V
R
 
R
S
 
E
R
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
I
 
V
T
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
T
 
T
I
 
L
A
 
A
Q
 
P
I
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
R
G
 
K
R
 
W
S
 
P
K
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
A
T
 
E
K
 
A
K
 
K
G
 
A
L
 
M
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
D
H
 
K
A
 
A
H
 
H
K
 
A
H
 
Y
P
 
P
G
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
P
 
P
I
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
S
V
 
V
M
 
M
V
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
M
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
L
F
 
F
M
 
M
D
 
D
A
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
E
C
 
G
P
 
K
K
 
P
E
 
E
E
 
D
F
 
L
F
 
F
G
 
D
D
 
-
I
 
-
S
 
R
A
 
P
R
 
Q
S
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
T
Q
 
K
H
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
F

P02915 Histidine/lysine/arginine/ornithine transport ATP-binding protein HisP; EC 7.4.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
50% identity, 99% coverage: 2:243/244 of query aligns to 7:258/258 of P02915

query
sites
P02915
I
 
L
S
 
H
I
 
V
K
 
I
N
 
D
I
 
L
N
 
H
K
 
K
W
 
R
Y
 
Y
G
 
G
D
 
G
F
 
H
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
C
 
V
S
 
S
T
 
L
D
 
Q
V
 
A
K
 
R
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
I
C
 
I
G
 
G
P
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
C
 
C
V
 
I
N
 
N
A
 
F
L
 
L
E
 
E
P
 
K
F
 
P
Q
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
A
I
 
I
V
 
I
V
 
V
D
 
N
G
 
G
T
 
Q
S
 
N
I
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
V
A
 
A
D
 
D
P
 
-
K
 
K
T
 
N
N
 
Q
L
 
L
P
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
R
S
 
T
R
 
R
V
 
L
G
 
T
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
W
P
 
S
H
 
H
L
 
M
T
 
T
I
 
V
T
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
T
 
M
I
 
E
A
 
A
Q
 
P
I
 
I
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
L
S
 
S
K
 
K
E
 
H
E
 
D
A
 
A
T
 
R
K
 
E
K
 
R
G
 
A
L
 
L
Q
 
K
L
 
Y
L
 
L
E
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
I
S
 
D
A
 
E
H
 
R
A
 
A
H
 
Q
-
 
G
K
 
K
H
 
Y
P
 
P
G
 
V
Q
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
P
 
P
I
 
D
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
L
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
R
V
 
I
M
 
M
V
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
M
 
M
M
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
H
V
 
V
A
 
S
D
 
S
R
 
H
V
 
V
I
 
I
F
 
F
M
 
L
D
 
H
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
E
E
 
E
D
 
E
C
 
G
P
 
D
K
 
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
V
F
 
F
G
 
G
D
 
N
I
 
-
S
 
-
A
 
P
R
 
Q
S
 
S
E
 
P
R
 
R
A
 
L
Q
 
Q
H
 
Q
F
 
F
L
 
L
E
 
K
K
 
G
I
 
S
L
 
L
Q
 
K

1b0uA Atp-binding subunit of the histidine permease from salmonella typhimurium (see paper)
50% identity, 100% coverage: 2:244/244 of query aligns to 3:258/258 of 1b0uA

query
sites
1b0uA
I
 
L
S
 
H
I
 
V
K
 
I
N
 
D
I
 
L
N
 
H
K
 
K
W
 
R
Y
|
Y
G
 
G
D
 
G
F
x
H
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
K
D
 
G
C
 
V
S
 
S
T
 
L
D
 
Q
V
 
A
K
 
R
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
I
C
 
I
G
 
G
P
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
C
 
C
V
 
I
N
 
N
A
 
F
L
 
L
E
 
E
P
 
K
F
 
P
Q
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
A
I
 
I
V
 
I
V
 
V
D
 
N
G
 
G
T
 
Q
S
 
N
I
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
V
A
 
A
D
 
D
P
 
-
K
 
K
T
 
N
N
 
Q
L
 
L
P
 
R
Q
 
L
L
 
L
R
 
R
S
 
T
R
 
R
V
 
L
G
 
T
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
W
P
 
S
H
 
H
L
 
M
T
 
T
I
 
V
T
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
T
 
M
I
 
E
A
 
A
Q
 
P
I
 
I
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
L
S
 
S
K
 
K
E
 
H
E
 
D
A
 
A
T
 
R
K
 
E
K
 
R
G
 
A
L
 
L
Q
 
K
L
 
Y
L
 
L
E
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
I
S
 
D
A
 
E
H
 
R
A
 
A
H
 
Q
-
 
G
K
 
K
H
 
Y
P
 
P
G
 
V
Q
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
P
 
P
I
 
D
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
L
V
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
R
V
 
I
M
 
M
V
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
M
 
M
M
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
K
 
H
V
 
V
A
 
S
D
 
S
R
 
H
V
 
V
I
 
I
F
 
F
M
 
L
D
 
H
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
E
E
 
E
D
 
E
C
 
G
P
 
D
K
 
P
E
 
E
E
 
Q
F
 
V
F
 
F
G
 
G
D
 
N
I
 
-
S
 
-
A
 
P
R
 
Q
S
 
S
E
 
P
R
 
R
A
 
L
Q
 
Q
H
 
Q
F
 
F
L
 
L
E
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
L
K
 
K
I
 
K
L
 
L
Q
 
E
H
 
H

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
37% identity, 100% coverage: 1:243/244 of query aligns to 1:246/343 of P30750

query
sites
P30750
M
 
M
I
 
I
S
 
K
I
 
L
K
 
S
N
 
N
I
 
I
N
 
T
K
 
K
W
 
V
Y
 
F
G
 
H
D
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
F
 
I
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
T
 
N
D
 
N
C
 
V
S
 
S
T
 
L
D
 
H
V
 
V
K
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
I
 
Y
V
 
G
V
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
K
 
R
C
 
C
V
 
V
N
 
N
A
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
R
F
 
P
Q
 
T
K
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
S
 
E
I
 
L
A
 
T
D
 
T
-
 
L
P
 
S
K
 
E
T
 
S
N
 
E
L
 
L
P
 
T
Q
 
K
L
 
A
R
 
R
S
 
R
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
I
 
V
T
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
T
 
A
I
 
L
A
 
P
Q
 
-
I
 
L
K
 
E
V
 
L
L
 
D
G
 
N
R
 
T
S
 
P
K
 
K
E
 
D
E
 
E
A
 
V
T
 
K
K
 
R
K
 
R
G
 
V
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
A
 
D
H
 
K
A
 
H
H
 
D
K
 
S
H
 
Y
P
 
P
G
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
D
 
N
P
 
P
I
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
M
 
T
V
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
E
V
 
L
M
 
L
V
 
K
Q
 
D
L
 
I
A
 
N
Q
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
M
 
L
C
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
K
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
I
 
A
F
 
V
M
 
I
D
 
S
A
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
C
 
D
P
 
T
K
 
V
E
 
S
E
 
E
F
 
V
F
 
F
G
 
S
D
 
-
I
 
-
S
 
H
A
 
P
R
 
K
S
 
T
E
 
P
R
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
K
F
 
F
L
 
I
E
 
Q
K
 
S
I
 
T
L
 
L
Q
 
H

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:243/244 of query aligns to 2:247/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
M
 
M
I
 
I
S
 
K
I
 
L
K
 
S
N
 
N
I
 
I
N
 
T
K
 
K
W
 
V
Y
x
F
G
 
H
D
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
F
x
I
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
T
 
N
D
 
N
C
 
V
S
 
S
T
 
L
D
 
H
V
 
V
K
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
I
 
Y
V
 
G
V
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
K
 
R
C
 
C
V
 
V
N
 
N
A
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
R
F
 
P
Q
 
T
K
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
S
 
E
I
 
L
A
 
T
D
 
T
-
 
L
P
 
S
K
 
E
T
 
S
N
 
E
L
 
L
P
 
T
Q
 
K
L
 
A
R
 
R
S
 
R
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
I
 
V
T
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
T
 
A
I
 
L
A
 
P
Q
 
-
I
 
L
K
 
E
V
 
L
L
 
D
G
 
N
R
 
T
S
 
P
K
 
K
E
 
D
E
 
E
A
 
V
T
 
K
K
 
R
K
 
R
G
 
V
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
A
 
D
H
 
K
A
 
H
H
 
D
K
 
S
H
 
Y
P
 
P
G
 
S
Q
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
D
 
N
P
 
P
I
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
M
 
T
V
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
E
V
 
L
M
 
L
V
 
K
Q
 
D
L
 
I
A
 
N
Q
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
M
 
L
C
 
L
V
 
I
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
K
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
I
 
A
F
 
V
M
 
I
D
 
S
A
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
C
 
D
P
 
T
K
 
V
E
 
S
E
 
E
F
 
V
F
 
F
G
 
S
D
 
-
I
 
-
S
 
H
A
 
P
R
 
K
S
 
T
E
 
P
R
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
K
F
 
F
L
 
I
E
 
Q
K
 
S
I
 
T
L
 
L
Q
 
H

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:243/244 of query aligns to 2:247/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
M
 
M
I
 
I
S
 
K
I
 
L
K
 
S
N
 
N
I
 
I
N
 
T
K
 
K
W
 
V
Y
x
F
G
 
H
D
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
F
 
I
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
T
 
N
D
 
N
C
 
V
S
 
S
T
 
L
D
 
H
V
 
V
K
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
I
 
Y
V
 
G
V
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
K
 
R
C
 
C
V
 
V
N
 
N
A
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
R
F
 
P
Q
 
T
K
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
S
 
E
I
 
L
A
 
T
D
 
T
-
 
L
P
 
S
K
 
E
T
 
S
N
 
E
L
 
L
P
 
T
Q
 
K
L
 
A
R
 
R
S
 
R
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
I
 
V
T
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
T
 
A
I
 
L
A
 
P
Q
 
-
I
 
L
K
 
E
V
 
L
L
 
D
G
 
N
R
 
T
S
 
P
K
 
K
E
 
D
E
 
E
A
 
V
T
 
K
K
 
R
K
 
R
G
 
V
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
A
 
D
H
 
K
A
 
H
H
 
D
K
 
S
H
 
Y
P
 
P
G
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
D
 
N
P
 
P
I
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
M
 
T
V
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
E
V
 
L
M
 
L
V
 
K
Q
 
D
L
 
I
A
 
N
Q
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
M
 
L
C
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
K
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
I
 
A
F
 
V
M
 
I
D
 
S
A
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
C
 
D
P
 
T
K
 
V
E
 
S
E
 
E
F
 
V
F
 
F
G
 
S
D
 
-
I
 
-
S
 
H
A
 
P
R
 
K
S
 
T
E
 
P
R
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
K
F
 
F
L
 
I
E
 
Q
K
 
S
I
 
T
L
 
L
Q
 
H

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:243/244 of query aligns to 2:247/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
M
 
M
I
 
I
S
 
K
I
 
L
K
 
S
N
 
N
I
 
I
N
 
T
K
 
K
W
 
V
Y
x
F
G
 
H
D
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
F
 
I
Q
 
Q
V
 
A
L
 
L
T
 
N
D
 
N
C
 
V
S
 
S
T
 
L
D
 
H
V
 
V
K
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
I
 
Y
V
 
G
V
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
K
 
R
C
 
C
V
 
V
N
 
N
A
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
R
F
 
P
Q
 
T
K
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
S
 
E
I
 
L
A
 
T
D
 
T
-
 
L
P
 
S
K
 
E
T
 
S
N
 
E
L
 
L
P
 
T
Q
 
K
L
 
A
R
 
R
S
 
R
R
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
I
 
V
T
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
T
 
A
I
 
L
A
 
P
Q
 
-
I
 
L
K
 
E
V
 
L
L
 
D
G
 
N
R
 
T
S
 
P
K
 
K
E
 
D
E
 
E
A
 
V
T
 
K
K
 
R
K
 
R
G
 
V
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
A
 
D
H
 
K
A
 
H
H
 
D
K
 
S
H
 
Y
P
 
P
G
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
D
 
N
P
 
P
I
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
M
 
T
V
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
E
V
 
L
M
 
L
V
 
K
Q
 
D
L
 
I
A
 
N
Q
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
M
 
L
C
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
K
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
I
 
A
F
 
V
M
 
I
D
 
S
A
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
C
 
D
P
 
T
K
 
V
E
 
S
E
 
E
F
 
V
F
 
F
G
 
S
D
 
-
I
 
-
S
 
H
A
 
P
R
 
K
S
 
T
E
 
P
R
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
K
F
 
F
L
 
I
E
 
Q
K
 
S
I
 
T
L
 
L
Q
 
H

P19566 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
36% identity, 91% coverage: 2:224/244 of query aligns to 4:222/369 of P19566

query
sites
P19566
I
 
V
S
 
Q
I
 
L
K
 
R
N
 
N
I
 
V
N
 
T
K
 
K
W
 
A
Y
 
W
G
 
G
D
 
D
F
 
V
Q
 
V
V
 
V
L
 
S
T
 
K
D
 
D
C
 
I
S
 
N
T
 
L
D
 
D
V
 
I
K
 
H
K
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
F
I
 
V
V
 
V
V
 
F
C
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
C
 
M
V
 
I
N
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
E
P
 
T
F
 
I
Q
 
T
K
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
F
V
 
I
D
 
G
G
 
E
T
 
T
S
 
R
I
 
M
A
 
N
D
 
D
P
 
-
K
 
-
T
 
-
N
 
-
L
 
I
P
 
P
Q
 
P
L
 
A
R
 
E
S
 
R
R
 
G
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
F
 
Y
E
 
A
L
|
L
F
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
V
T
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
M
T
 
S
I
 
F
A
 
G
Q
 
-
I
 
L
K
 
K
V
 
L
L
 
A
G
 
G
R
 
A
S
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
A
 
M
T
 
N
K
 
Q
K
 
R
G
 
V
L
 
N
Q
 
Q
L
 
V
L
 
A
E
 
E
R
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
A
A
 
H
H
 
L
A
 
L
H
 
E
K
 
R
H
 
K
P
 
P
G
 
K
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
M
 
A
D
 
E
P
 
P
I
 
R
V
 
V
M
 
F
L
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
|
P
T
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
|
D
P
 
A
E
 
A
M
 
L
-
 
R
V
 
V
N
 
Q
E
 
M
V
 
R
L
 
I
D
 
E
V
 
I
M
 
S
V
 
R
Q
 
L
L
 
H
A
 
K
Q
 
R
E
 
L
G
 
G
M
 
R
T
 
T
M
 
M
M
 
I
C
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
G
 
V
F
 
E
A
 
A
R
 
M
K
 
T
V
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
I
 
V
F
 
V
M
 
L
D
 
D
A
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
A
E
 
Q
D
 
V
C
 
G
P
 
K
K
 
P
E
 
L
E
 
E
F
 
L
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

2pclA Crystal structure of abc transporter with complex (aq_297) from aquifex aeolicus vf5
37% identity, 90% coverage: 1:220/244 of query aligns to 3:222/223 of 2pclA

query
sites
2pclA
M
 
I
I
 
L
S
 
R
I
 
A
K
 
E
N
 
N
I
 
I
N
 
K
K
 
K
W
 
V
Y
 
I
G
 
R
D
 
G
F
 
Y
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
K
D
 
G
C
 
I
S
 
S
T
 
L
D
 
S
V
 
V
K
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
F
I
 
V
V
 
S
V
 
I
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
Y
C
 
I
V
 
L
N
 
G
A
 
L
L
 
L
E
 
D
P
 
A
F
 
P
Q
 
T
K
 
E
G
 
G
D
 
K
I
 
V
V
 
F
V
 
L
D
 
E
G
 
G
T
 
K
S
 
E
I
 
V
-
 
D
A
 
Y
D
 
T
P
 
N
K
 
E
T
 
K
N
 
E
L
 
L
P
 
S
Q
 
L
L
 
L
R
 
R
S
 
N
R
 
R
-
 
K
V
 
L
G
 
G
M
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
F
F
 
H
E
 
Y
L
 
L
F
 
I
P
 
P
H
 
E
L
 
L
T
 
T
I
 
A
T
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
T
 
I
I
 
V
A
 
P
Q
 
M
I
 
L
K
 
K
V
 
-
L
 
M
G
 
G
R
 
K
S
 
P
K
 
K
E
 
K
E
 
E
A
 
A
T
 
K
K
 
E
K
 
R
G
 
G
L
 
E
Q
 
Y
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
G
A
 
D
H
 
K
A
 
L
H
 
S
K
 
R
H
 
K
P
 
P
G
 
Y
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
N
D
 
E
P
 
P
I
 
I
V
 
L
M
 
L
L
 
F
F
 
A
D
 
D
E
|
E
P
|
P
T
|
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
A
M
 
N
V
 
T
N
 
K
E
 
R
V
 
V
L
 
M
D
 
D
V
 
I
M
 
F
V
 
L
Q
 
K
L
 
I
A
 
N
Q
 
E
E
 
G
G
 
G
M
 
T
T
 
S
M
 
I
M
 
V
C
 
M
V
 
V
T
|
T
H
 
H
E
 
E
M
 
R
G
 
E
F
 
L
A
 
A
R
 
-
K
 
E
V
 
L
A
 
T
D
 
H
R
 
R
V
 
T
I
 
L
F
 
E
M
 
M
D
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
V
E
 
G
D
 
E
C
 
I
P
 
T
K
 
R

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
34% identity, 93% coverage: 1:226/244 of query aligns to 3:229/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
M
 
I
I
 
I
S
 
E
I
 
M
K
 
R
N
 
D
I
 
V
N
 
V
K
 
K
W
 
K
Y
|
Y
G
 
D
D
 
N
-
 
G
F
x
T
Q
 
T
V
x
A
L
 
L
T
 
R
D
 
G
C
 
V
S
 
S
T
 
V
D
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
F
I
 
A
V
 
Y
V
 
I
C
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
I
K
 
R
C
 
S
V
 
L
N
 
Y
A
 
R
L
 
E
E
 
V
P
 
K
F
 
I
Q
 
D
K
 
K
G
 
G
D
 
S
I
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
A
G
 
G
T
 
F
S
 
N
I
 
L
A
 
V
D
 
K
-
 
I
P
 
K
K
 
K
T
 
K
N
 
D
L
 
V
P
 
P
Q
 
L
L
 
L
R
 
R
S
 
R
R
 
S
V
 
V
G
 
G
M
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
F
 
L
P
 
P
H
 
K
L
 
K
T
 
T
I
 
V
T
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
T
 
A
I
 
Y
A
 
A
Q
 
-
I
 
M
K
 
E
V
 
V
L
 
I
G
 
G
R
 
E
S
 
N
K
 
R
E
 
R
E
 
N
A
 
I
T
 
K
K
 
R
K
 
R
G
 
V
L
 
M
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
H
H
 
K
A
 
V
H
 
R
K
 
S
H
 
F
P
 
P
G
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
N
D
 
N
P
 
P
I
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
I
F
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
D
M
 
N
V
 
S
N
 
W
E
 
E
V
 
I
L
 
M
D
 
N
V
 
L
M
 
L
V
 
E
Q
 
R
L
 
I
A
 
N
Q
 
L
E
 
Q
G
 
G
M
 
T
T
 
T
M
 
I
M
 
L
C
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
S
G
 
Q
F
 
I
A
 
V
R
 
N
K
 
T
V
 
L
A
 
R
D
 
H
R
 
R
V
 
V
I
 
I
F
 
A
M
 
I
D
 
E
A
 
N
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
V
E
 
R
D
 
D
C
 
E
P
 
S
K
 
K
E
 
G
E
 
E
F
 
Y
F
 
G
G
 
Y
D
 
D

A0A0H2ZM82 Cell division ATP-binding protein FtsE from Streptococcus pneumoniae serotype 2 (strain D39 / NCTC 7466) (see paper)
34% identity, 93% coverage: 1:226/244 of query aligns to 3:229/230 of A0A0H2ZM82

query
sites
A0A0H2ZM82
M
 
I
I
 
I
S
 
E
I
 
M
K
 
R
N
 
D
I
 
V
N
 
V
K
 
K
W
 
K
Y
 
Y
G
 
D
D
 
N
-
 
G
F
 
T
Q
 
T
V
 
A
L
 
L
T
 
R
D
 
G
C
 
V
S
 
S
T
 
V
D
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
F
I
 
A
V
 
Y
V
 
I
C
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
F
I
 
I
K
 
R
C
 
S
V
 
L
N
 
Y
A
 
R
L
 
E
E
 
V
P
 
K
F
 
I
Q
 
D
K
 
K
G
 
G
D
 
S
I
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
A
G
 
G
T
 
F
S
 
N
I
 
L
A
 
V
D
 
K
-
 
I
P
 
K
K
 
K
T
 
K
N
 
D
L
 
V
P
 
P
Q
 
L
L
 
L
R
 
R
S
 
R
R
 
S
V
 
V
G
 
G
M
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
F
 
L
P
 
P
H
 
K
L
 
K
T
 
T
I
 
V
T
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
T
 
A
I
 
Y
A
 
A
Q
 
-
I
 
M
K
 
E
V
 
V
L
 
I
G
 
G
R
 
E
S
 
N
K
 
R
E
 
R
E
 
N
A
 
I
T
 
K
K
 
R
K
 
R
G
 
V
L
 
M
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
H
H
 
K
A
 
V
H
 
R
K
 
S
H
 
F
P
 
P
G
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
N
D
 
N
P
 
P
I
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
I
F
 
A
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
D
M
 
N
V
 
S
N
 
W
E
 
E
V
 
I
L
 
M
D
 
N
V
 
L
M
 
L
V
 
E
Q
 
R
L
 
I
A
 
N
Q
 
L
E
 
Q
G
 
G
M
 
T
T
 
T
M
 
I
M
 
L
C
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
S
G
 
Q
F
 
I
A
 
V
R
 
N
K
 
T
V
 
L
A
 
R
D
 
H
R
 
R
V
 
V
I
 
I
F
 
A
M
 
I
D
 
E
A
 
N
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
V
E
 
R
D
 
D
C
 
E
P
 
S
K
 
K
E
 
G
E
 
E
F
 
Y
F
 
G
G
 
Y
D
 
D

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
34% identity, 93% coverage: 1:226/244 of query aligns to 3:229/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
M
 
I
I
 
I
S
 
E
I
 
M
K
 
R
N
 
D
I
 
V
N
 
V
K
 
K
W
 
K
Y
|
Y
G
 
D
D
 
N
-
x
G
F
 
T
Q
 
T
V
x
A
L
 
L
T
 
R
D
 
G
C
 
V
S
 
S
T
 
V
D
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
F
I
 
A
V
 
Y
V
 
I
C
 
V
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
I
K
 
R
C
 
S
V
 
L
N
 
Y
A
 
R
L
 
E
E
 
V
P
 
K
F
 
I
Q
 
D
K
 
K
G
 
G
D
 
S
I
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
A
G
 
G
T
 
F
S
 
N
I
 
L
A
 
V
D
 
K
-
 
I
P
 
K
K
 
K
T
 
K
N
 
D
L
 
V
P
 
P
Q
 
L
L
 
L
R
 
R
S
 
R
R
 
S
V
 
V
G
 
G
M
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
F
 
L
P
 
P
H
 
K
L
 
K
T
 
T
I
 
V
T
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
I
T
 
A
I
 
Y
A
 
A
Q
 
-
I
 
M
K
 
E
V
 
V
L
 
I
G
 
G
R
 
E
S
 
N
K
 
R
E
 
R
E
 
N
A
 
I
T
 
K
K
 
R
K
 
R
G
 
V
L
 
M
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
H
H
 
K
A
 
V
H
 
R
K
 
S
H
 
F
P
 
P
G
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
N
D
 
N
P
 
P
I
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
I
F
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
D
M
 
N
V
 
S
N
 
W
E
 
E
V
 
I
L
 
M
D
 
N
V
 
L
M
 
L
V
 
E
Q
 
R
L
 
I
A
 
N
Q
 
L
E
 
Q
G
 
G
M
 
T
T
 
T
M
 
I
M
 
L
C
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
S
G
 
Q
F
 
I
A
 
V
R
 
N
K
 
T
V
 
L
A
 
R
D
 
H
R
 
R
V
 
V
I
 
I
F
 
A
M
 
I
D
 
E
A
 
N
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
V
E
 
R
D
 
D
C
 
E
P
 
S
K
 
K
E
 
G
E
 
E
F
 
Y
F
 
G
G
 
Y
D
 
D

8igqA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis adp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
35% identity, 89% coverage: 1:217/244 of query aligns to 2:220/227 of 8igqA

query
sites
8igqA
M
 
M
I
 
I
S
 
T
I
 
L
K
 
D
N
 
H
I
 
V
N
 
T
K
 
K
W
 
Q
Y
|
Y
G
 
K
D
 
S
F
 
S
Q
 
A
-
 
R
-
 
P
V
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
D
C
 
I
S
 
N
T
 
V
D
 
K
V
 
I
K
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
F
I
 
V
V
 
F
V
 
L
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
F
I
 
M
K
 
R
C
 
L
V
 
L
N
 
L
A
 
A
L
 
A
E
 
E
P
 
T
F
 
P
Q
 
T
K
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
V
 
R
V
 
V
D
 
S
G
 
K
T
 
F
S
 
H
I
 
V
A
 
N
D
 
K
P
 
L
K
 
R
-
 
G
T
 
R
N
 
H
L
 
V
P
 
P
Q
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
Q
R
 
V
V
 
I
G
 
G
M
 
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
F
E
 
R
L
 
L
F
 
L
P
 
Q
H
 
Q
L
 
K
T
 
T
I
 
V
T
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
V
T
 
A
I
 
F
A
 
A
Q
 
-
I
 
L
K
 
E
V
 
V
L
 
I
G
 
G
R
 
K
S
 
R
K
 
T
E
 
D
E
 
A
A
 
I
T
 
N
K
 
R
K
 
V
G
 
V
L
 
P
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
G
H
 
K
A
 
A
H
 
N
K
 
R
H
 
L
P
 
P
G
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
M
 
N
D
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
T
V
 
S
N
 
R
E
 
D
V
 
I
L
 
M
D
 
D
V
 
L
M
 
L
V
 
E
Q
 
R
L
 
I
A
 
N
Q
 
R
E
 
T
G
 
G
M
 
T
T
 
T
M
 
V
M
 
L
C
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
H
G
 
H
F
 
I
A
 
V
R
 
D
K
 
S
V
 
M
A
 
R
D
 
Q
R
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
E
M
 
L
D
 
S
A
 
L
G
 
G
K
 
R
I
 
L
I
 
V
E
 
R
D
 
D

8iddA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis atp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
35% identity, 89% coverage: 1:217/244 of query aligns to 2:220/225 of 8iddA

query
sites
8iddA
M
 
M
I
 
I
S
 
T
I
 
L
K
 
D
N
 
H
I
 
V
N
 
T
K
 
K
W
 
Q
Y
|
Y
G
 
K
D
 
S
F
 
S
Q
 
A
-
 
R
-
 
P
V
 
A
L
 
L
T
 
D
D
 
D
C
 
I
S
 
N
T
 
V
D
 
K
V
 
I
K
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
F
I
 
V
V
 
F
V
 
L
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
F
I
 
M
K
 
R
C
 
L
V
 
L
N
 
L
A
 
A
L
 
A
E
 
E
P
 
T
F
 
P
Q
 
T
K
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
V
V
 
R
V
 
V
D
 
S
G
 
K
T
 
F
S
 
H
I
 
V
A
 
N
D
 
K
P
 
L
K
 
R
-
 
G
T
 
R
N
 
H
L
 
V
P
 
P
Q
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
Q
R
 
V
V
 
I
G
 
G
M
 
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
F
E
 
R
L
 
L
F
 
L
P
 
Q
H
 
Q
L
 
K
T
 
T
I
 
V
T
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
V
T
 
A
I
 
F
A
 
A
Q
 
-
I
 
L
K
 
E
V
 
V
L
 
I
G
 
G
R
 
K
S
 
R
K
 
T
E
 
D
E
 
A
A
 
I
T
 
N
K
 
R
K
 
V
G
 
V
L
 
P
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
G
H
 
K
A
 
A
H
 
N
K
 
R
H
 
L
P
 
P
G
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
M
 
N
D
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
T
V
 
S
N
 
R
E
 
D
V
 
I
L
 
M
D
 
D
V
 
L
M
 
L
V
 
E
Q