SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1114 FitnessBrowser__psRCH2:GFF1114 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
45% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 4:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
Q
 
R
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
Q
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
M
 
A
G
 
A
E
 
R
Y
 
V
L
 
F
A
 
M
G
 
K
K
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
F
N
 
N
Q
 
E
E
 
A
R
 
A
L
 
G
D
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
C
 
N
K
 
P
A
 
G
A
 
V
G
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
V
Y
 
F
L
 
I
-
 
R
C
x
V
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
D
E
 
R
E
 
E
Q
 
S
V
 
V
T
 
H
D
 
R
M
 
L
V
 
V
A
 
E
R
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
|
D
G
 
S
L
 
M
L
 
L
L
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
S
 
S
K
|
K
M
 
M
S
 
T
L
 
V
A
 
D
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
P
K
 
Y
M
 
M
V
 
A
E
 
E
L
 
-
K
 
Q
S
 
G
E
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
T
-
 
G
R
 
T
A
 
Y
G
 
G
N
|
N
M
x
V
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
S
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
K
V
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
|
F
I
x
T
E
 
E
T
|
T
E
 
A
M
|
M
V
 
V
A
 
A
S
 
E
M
 
V
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
V
L
 
I
E
 
E
K
|
K
M
 
M
T
 
K
S
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
-
V
 
-
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
F
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
H
E
 
E
N
 
S
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
V
T
 
N
G
 
G
R
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
H
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
M
L
 
M

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
46% identity, 97% coverage: 6:250/252 of query aligns to 2:249/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
K
 
R
V
 
V
I
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
Q
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
T
G
 
A
E
 
L
Y
 
E
L
 
F
A
 
A
G
 
Q
K
 
A
G
 
G
A
 
Y
R
 
H
L
 
V
A
 
V
L
 
A
V
 
W
D
|
D
L
|
L
N
 
A
Q
 
E
E
 
E
R
 
A
L
 
G
D
 
A
E
 
A
A
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
E
C
 
I
K
 
A
A
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
S
A
 
A
R
 
D
A
 
F
Y
 
A
L
 
R
C
x
V
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
A
E
 
A
E
 
E
Q
 
S
V
 
V
T
 
E
D
 
A
M
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
E
V
 
I
A
 
I
E
 
A
D
 
E
F
 
H
G
 
G
G
 
R
L
 
V
H
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
L
R
 
H
D
 
D
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
L
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
K
D
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
V
-
 
V
S
 
K
K
 
K
M
 
M
S
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
P
K
 
H
M
 
M
V
 
I
E
 
A
L
 
A
K
 
K
S
 
Y
E
 
-
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
L
N
 
N
I
 
A
S
 
S
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
Y
G
 
G
N
 
N
M
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
I
S
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
K
V
 
V
W
 
W
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
 
E
M
 
M
V
 
V
A
 
Q
S
 
Q
M
 
M
K
 
P
P
 
E
E
 
R
A
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
A
M
 
M
T
 
V
S
 
A
G
 
R
I
 
T
P
 
P
L
 
V
K
 
G
R
 
R
M
 
I
G
 
G
K
 
D
P
 
P
A
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
R
S
 
-
V
 
-
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
F
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
Y
 
I
T
 
S
G
 
G
R
 
T
I
 
T
L
 
L
E
 
S
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 4:244/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
K
 
Q
V
 
V
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
x
A
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
M
 
T
G
 
A
E
 
L
Y
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
K
 
T
G
 
G
A
 
M
R
 
K
L
 
V
A
 
-
L
 
V
V
 
V
D
 
N
L
 
Y
N
 
A
Q
 
Q
E
 
S
R
 
S
L
 
T
-
 
A
-
 
A
D
 
D
E
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
E
C
 
I
K
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
E
A
 
A
R
 
I
A
 
A
Y
 
V
L
 
Q
C
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
N
 
N
E
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
T
 
D
D
 
Q
M
 
L
V
 
I
A
 
K
R
 
T
V
 
T
A
 
L
E
 
D
D
 
K
F
 
F
G
 
S
G
 
R
L
 
I
H
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
L
A
 
E
Q
 
D
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
K
K
 
L
M
 
M
V
 
L
E
 
K
L
 
Q
K
 
K
S
 
S
E
 
-
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
T
S
 
S
I
 
V
S
 
A
-
 
G
R
 
M
A
 
M
G
 
G
N
 
N
M
x
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
S
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
K
V
 
T
W
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
|
F
I
 
I
E
 
A
T
 
T
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
E
S
 
N
M
 
L
K
x
N
P
 
A
E
 
E
A
 
P
L
 
I
E
 
L
K
 
Q
M
 
F
T
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
G
S
 
T
V
 
I
A
 
R
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
T
N
 
D
D
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
F
E
 
N
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
41% identity, 98% coverage: 6:252/252 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
V
 
S
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
Q
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
M
 
I
G
 
A
E
 
L
Y
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
E
K
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
L
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
N
D
 
Y
L
 
A
-
 
G
N
 
S
Q
 
K
E
 
E
R
 
K
L
 
A
D
 
E
E
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
E
C
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
D
 
D
A
 
S
R
 
F
A
 
A
Y
 
I
L
 
Q
C
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
N
 
D
E
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
T
 
K
D
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
R
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
S
D
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
H
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
Q
E
 
E
I
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
T
 
I
R
 
Q
E
 
K
V
 
A
A
 
T
A
 
P
K
 
Q
M
 
M
V
 
L
E
 
R
L
 
Q
K
 
R
S
 
S
E
 
-
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
R
 
G
A
 
A
-
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
S
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
K
V
 
S
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
D
S
 
A
M
 
L
K
 
S
P
 
D
E
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
E
K
 
Q
M
 
M
T
 
L
S
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
D
A
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
T
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
K
-
 
A
D
 
K
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

P73826 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
40% identity, 98% coverage: 1:248/252 of query aligns to 4:236/240 of P73826

query
sites
P73826
M
 
L
Q
 
G
L
 
L
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
N
Q
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
I
G
 
V
E
 
K
Y
 
L
L
 
L
A
 
Q
G
 
E
K
 
M
G
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
C
 
T
K
 
D
A
 
G
A
 
G
G
 
N
G
 
T
D
 
E
A
 
A
R
 
L
A
 
G
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
T
N
 
D
E
 
L
E
 
E
Q
 
S
V
 
M
T
 
T
D
 
A
M
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
E
V
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
P
L
 
V
H
 
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
V
N
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
N
L
 
F
L
 
F
L
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
S
 
P
K
 
K
M
 
L
S
 
T
L
 
P
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
L
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
A
L
 
Y
C
 
S
T
 
I
R
 
K
E
 
P
V
 
F
A
 
I
A
 
E
K
 
G
M
 
M
V
 
Y
E
 
E
L
 
R
K
 
K
S
 
A
E
 
-
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
A
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
S
-
 
G
R
 
E
A
 
R
G
 
G
N
 
N
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
S
 
G
A
 
M
T
 
M
V
 
K
V
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
A
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
E
 
E
M
 
M
V
 
T
A
 
L
S
 
A
M
 
I
K
 
R
P
 
E
E
 
D
A
 
I
L
 
R
E
 
E
K
 
K
M
 
I
T
 
T
S
 
K
G
 
E
I
 
I
P
 
P
L
 
F
K
 
R
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
W
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
L
E
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
N
 
S
D
 
S
Y
 
Y
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
V
L
 
L
E
 
R
L
 
V
D
 
N
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:252/252 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
V
 
S
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
M
 
I
G
 
A
E
 
L
Y
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
E
K
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
L
 
V
A
 
A
L
 
V
V
x
N
D
x
Y
L
x
A
-
x
G
N
x
S
Q
 
K
E
 
E
R
 
K
L
 
A
D
 
E
E
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
E
C
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
D
 
D
A
 
S
R
 
F
A
 
A
Y
 
I
L
 
Q
C
x
A
N
|
N
V
|
V
A
 
A
N
 
D
E
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
T
 
K
D
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
R
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
S
D
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
H
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
Q
E
 
E
I
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
x
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
T
 
I
R
 
Q
E
 
K
V
 
A
A
 
T
A
 
P
K
 
Q
M
 
M
V
 
L
E
 
R
L
 
Q
K
 
R
S
 
S
E
 
-
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
R
 
G
A
 
A
-
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
S
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
K
V
 
S
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
D
S
 
E
M
 
L
K
 
K
P
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
K
 
Q
M
 
M
T
 
L
S
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
D
A
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
T
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
K
-
 
A
D
 
K
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
38% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 4:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
M
Q
 
K
L
 
L
Q
 
A
D
 
S
K
 
K
V
 
T
I
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
F
A
 
G
M
 
I
G
 
A
E
 
Q
Y
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
R
K
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
L
 
V
A
 
I
L
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
R
N
 
D
Q
 
A
E
 
H
R
 
G
L
 
-
D
 
E
E
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
S
C
 
L
K
 
R
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
Q
A
 
A
R
 
L
A
 
F
Y
 
I
L
 
S
C
|
C
N
 
N
V
x
I
A
 
A
N
 
E
E
 
K
E
 
T
Q
 
Q
V
 
V
T
 
E
D
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
S
R
 
Q
V
 
A
A
 
E
E
 
E
D
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
L
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
A
L
 
M
L
 
L
L
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
S
 
H
K
 
K
M
 
L
S
 
T
L
 
E
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
T
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
M
R
 
Q
E
 
Q
V
 
A
A
 
A
A
 
I
K
 
R
M
 
M
V
 
R
E
 
E
L
 
-
K
 
R
S
 
G
E
 
A
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
A
S
 
S
R
 
W
A
 
L
G
 
G
N
 
N
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
S
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
K
V
 
T
W
 
A
A
 
C
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
D
T
|
T
E
 
D
M
 
M
V
x
T
A
 
R
S
 
G
M
 
V
K
 
P
P
 
E
E
 
N
A
 
V
L
 
W
E
 
Q
K
 
I
M
 
M
T
 
V
S
 
S
G
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
Y
M
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
A
A
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
H
 
E
S
 
C
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
G
-
 
A
D
 
R
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
V
L
 
I
E
 
N
L
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
V
L
 
L

4cqmF Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
40% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 6:239/241 of 4cqmF

query
sites
4cqmF
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
C
I
 
A
V
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
G
 
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
V
G
 
A
E
 
Q
Y
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
R
K
 
K
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
I
D
x
A
L
x
R
N
|
N
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
L
D
 
E
E
 
G
A
 
A
V
 
K
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
G
A
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
H
R
 
L
A
 
A
Y
 
F
L
 
S
C
 
C
N
x
D
V
|
V
A
 
A
N
 
K
E
 
E
E
 
H
Q
 
D
V
 
V
T
 
Q
D
 
N
M
 
T
V
 
F
A
 
E
R
 
E
V
 
L
A
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
V
H
 
N
G
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
V
K
 
R
V
 
T
K
 
K
D
 
T
G
 
E
E
 
D
I
 
M
S
 
V
K
 
S
M
 
Q
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
L
D
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
V
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
T
 
C
R
 
K
E
 
A
V
 
A
A
 
M
A
 
R
K
 
T
M
 
M
V
 
I
E
 
Q
L
 
-
K
 
Q
S
 
Q
E
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
M
 
S
G
 
G
Q
|
Q
T
 
S
N
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
S
 
G
A
 
F
T
 
S
V
 
R
V
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
x
V
E
 
H
T
|
T
E
 
D
M
|
M
V
 
T
A
 
K
S
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
M
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
E
P
 
T
A
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
H
S
 
A
V
 
V
A
 
V
Y
 
F
I
 
L
F
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
Q
L
 
L

Q8N4T8 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase beta subunit; KAR beta subunit; Carbonyl reductase family member 4; CBR4; Quinone reductase CBR4; Short chain dehydrogenase/reductase family 45C member 1; EC 1.1.1.100; EC 1.6.5.10 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
40% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 2:235/237 of Q8N4T8

query
sites
Q8N4T8
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
C
I
 
A
V
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
G
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
V
G
 
A
E
 
Q
Y
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
R
K
 
K
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
I
D
 
A
L
x
R
N
|
N
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
L
D
 
E
E
 
G
A
 
A
V
 
K
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
G
A
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
A
 
H
R
 
L
A
 
A
Y
 
F
L
 
S
C
 
C
N
x
D
V
 
V
A
 
A
N
 
K
E
 
E
E
 
H
Q
 
D
V
 
V
T
 
Q
D
 
N
M
 
T
V
 
F
A
 
E
R
 
E
V
x
L
A
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
V
H
 
N
G
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
V
K
 
R
V
 
T
K
 
K
D
 
T
G
 
E
E
 
D
I
 
M
S
 
V
K
 
S
M
 
Q
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
L
D
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
V
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
T
 
C
R
 
K
E
 
A
V
 
A
A
 
M
A
 
R
K
 
T
M
 
M
V
 
I
E
 
Q
L
 
-
K
 
Q
S
 
Q
E
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
V
S
 
G
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
M
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
N
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
S
 
G
A
 
F
T
 
S
V
 
R
V
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
|
R
Y
x
K
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
x
V
E
x
H
T
|
T
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
K
S
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
M
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
E
P
 
T
A
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
H
S
 
A
V
 
V
A
 
V
Y
 
F
I
 
L
F
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
Q
L
 
L

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 4:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
Q
 
N
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
Q
x
R
G
 
G
L
x
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
M
 
I
G
 
A
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
E
K
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
G
V
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
Q
 
E
E
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
S
E
 
G
A
 
A
V
 
Q
A
 
A
A
 
I
C
 
S
K
 
D
A
 
Y
A
 
L
G
 
G
G
 
D
D
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
M
L
 
A
C
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
N
E
 
P
E
 
E
Q
 
S
V
 
I
T
 
E
D
 
A
M
 
V
V
 
L
A
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
E
E
 
E
I
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
S
A
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
R
K
 
G
M
 
M
V
 
M
E
 
K
L
 
-
K
 
K
S
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
M
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
S
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
K
V
 
S
W
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
V
 
T
A
 
K
S
 
A
M
 
L
K
 
N
P
 
D
E
 
E
A
 
Q
L
 
R
E
 
T
K
 
A
M
 
T
T
 
L
S
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
A
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
-
 
S
-
 
P
E
 
E
N
 
A
D
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
L
 
L
E
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
40% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
Q
 
T
L
 
L
Q
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
M
 
I
G
 
A
E
 
I
Y
 
N
L
 
L
A
 
A
G
 
K
K
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
L
 
I
A
 
F
L
 
F
-
x
N
V
x
Y
D
x
N
L
x
G
N
x
S
Q
 
P
E
 
E
R
 
A
L
 
A
D
 
E
E
 
E
A
 
T
V
 
A
A
 
K
A
 
L
C
 
V
K
 
A
A
 
E
A
 
H
G
 
G
G
 
V
D
 
E
A
 
V
R
 
E
A
 
A
Y
 
M
L
 
K
C
 
A
N
|
N
V
|
V
A
 
A
N
 
I
E
 
A
E
 
E
Q
 
D
V
 
V
T
 
D
D
 
A
M
 
F
V
 
F
A
 
K
R
 
Q
V
 
A
A
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
D
E
 
E
I
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
R
K
 
T
M
 
M
V
 
M
E
 
K
L
 
Q
K
 
R
S
 
A
E
 
-
G
 
G
A
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
A
S
|
S
-
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
I
G
 
G
N
 
N
M
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
S
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
K
V
 
T
W
 
T
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
T
T
|
T
E
 
D
M
 
M
V
 
T
A
 
D
S
 
K
M
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
K
A
 
T
L
 
K
E
 
E
K
 
A
M
 
M
T
 
L
S
 
A
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
A
M
 
Y
G
 
G
K
 
T
P
 
T
A
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
A
-
 
S
D
 
K
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
E
 
S
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

5vmlA Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b with bound NADP
39% identity, 98% coverage: 6:252/252 of query aligns to 3:244/245 of 5vmlA

query
sites
5vmlA
K
 
R
V
 
I
I
 
A
I
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
M
Q
x
G
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
T
A
 
S
M
 
I
G
 
C
E
 
Q
Y
 
R
L
 
L
A
 
H
G
 
K
K
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
R
L
 
V
-
 
V
A
 
A
L
 
G
V
x
C
D
x
G
L
 
P
N
 
N
Q
 
S
E
 
P
R
|
R
L
 
R
D
 
V
E
 
K
A
 
W
V
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
Q
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
F
D
 
D
A
 
F
R
 
Y
A
 
A
Y
 
S
L
 
E
C
x
G
N
|
N
V
|
V
A
 
G
N
 
D
E
 
W
E
 
D
Q
 
S
V
 
T
T
 
K
D
 
Q
M
 
A
V
 
F
A
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
K
E
 
A
D
 
E
F
 
V
G
 
G
G
 
E
L
 
I
H
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
V
L
 
V
L
 
F
L
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
S
 
R
K
 
K
M
 
M
S
 
T
L
 
R
A
 
E
Q
 
D
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
L
 
N
C
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
Q
V
 
V
A
 
I
A
 
D
K
 
G
M
 
M
V
 
V
E
 
E
L
 
-
K
 
R
S
 
G
E
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
N
-
 
G
R
 
Q
A
 
K
G
 
G
N
 
Q
M
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
H
S
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
M
V
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
Y
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
V
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
I
|
I
E
 
G
T
 
T
E
 
D
M
 
M
V
 
V
A
 
K
S
 
A
M
 
I
K
 
R
P
 
P
E
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
M
 
I
T
 
V
S
 
A
G
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
R
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
S
P
 
P
A
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
H
 
S
S
 
I
V
 
V
A
 
A
Y
 
W
I
 
L
F
 
A
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
Y
 
S
T
 
T
G
 
G
R
 
A
I
 
D
L
 
F
E
 
S
L
 
L
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
H
L
 
M

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:250/252 of query aligns to 5:249/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
Q
 
R
L
 
L
Q
 
R
D
 
S
K
 
A
V
 
L
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
G
Q
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
V
G
 
S
E
 
V
Y
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
C
D
|
D
L
|
L
N
 
D
Q
 
R
E
 
A
R
 
A
L
 
A
D
 
Q
E
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
R
A
 
L
C
 
L
K
 
G
A
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
S
D
 
N
A
 
H
R
 
A
A
 
A
Y
 
F
L
 
Q
C
x
A
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
E
E
 
A
E
 
R
Q
 
A
V
 
A
T
 
R
D
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
R
 
Q
V
 
V
A
 
Q
E
 
A
D
 
C
F
 
F
G
 
S
G
 
R
L
 
P
H
 
P
G
 
S
L
 
V
V
 
V
-
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
Q
D
 
D
G
 
E
L
 
F
L
 
L
L
 
L
K
 
H
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
M
S
 
S
L
 
E
A
 
D
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
V
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
A
M
 
L
V
 
V
E
 
S
L
 
N
K
 
G
S
 
C
E
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
K
A
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
S
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
Q
V
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
A
 
N
G
 
S
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
 
P
M
|
M
V
 
T
A
 
Q
S
 
K
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
E
 
D
K
 
K
M
 
I
T
 
T
S
 
E
G
 
M
I
 
I
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
H
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
H
 
D
S
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
E
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
T
I
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 4:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
M
 
M
Q
 
N
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
M
 
I
G
 
A
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
E
K
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
G
V
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
Q
 
E
E
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
S
E
 
G
A
 
A
V
 
Q
A
 
A
A
 
I
C
 
S
K
 
D
A
 
Y
A
 
L
G
 
G
G
 
D
D
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
M
L
 
A
C
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
N
E
 
P
E
 
E
Q
 
S
V
 
I
T
 
E
D
 
A
M
 
V
V
 
L
A
 
K
R
 
A
V
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
E
E
 
E
I
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
S
A
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
R
K
 
G
M
 
M
V
 
M
E
 
K
L
 
-
K
 
K
S
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
V
S
x
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
M
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
S
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
K
V
 
S
W
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
M
 
M
V
 
N
A
 
D
S
 
E
M
 
Q
K
 
R
P
 
T
E
 
A
A
 
T
L
 
L
E
 
A
K
 
Q
M
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
V
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
A
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
-
 
S
-
 
P
E
 
E
N
 
A
D
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
L
 
L
E
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
38% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 2:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
Q
 
K
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
A
Q
x
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
M
 
I
G
 
A
E
 
L
Y
 
A
L
 
Y
A
 
A
G
 
E
K
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
A
V
 
G
D
|
D
L
|
L
N
 
G
Q
 
D
E
 
L
R
 
T
L
 
Y
D
 
S
E
 
H
A
 
P
V
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
N
A
 
V
R
 
E
A
 
G
Y
 
M
L
 
Y
C
x
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
D
E
 
V
E
 
T
Q
 
G
V
 
V
T
 
E
D
 
K
M
 
F
V
 
Y
A
 
Q
R
 
S
V
 
V
A
 
I
E
 
D
D
 
K
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
L
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
A
L
 
M
L
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
T
S
 
R
K
 
K
M
 
M
S
 
T
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
P
K
 
Q
M
 
M
V
 
-
E
 
Q
L
 
T
K
 
N
S
 
G
E
 
Y
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
R
 
G
A
 
V
-
 
F
G
 
G
N
 
N
M
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
S
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
M
V
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
L
Y
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
I
|
I
E
 
M
T
|
T
E
 
D
M
 
I
V
 
L
A
 
K
S
 
T
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
D
A
 
L
L
 
L
E
 
D
K
 
K
M
 
F
T
 
A
S
 
A
G
 
L
I
 
T
P
 
M
L
 
L
K
 
N
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
K
S
 
V
V
 
A
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
N
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
R
L
 
L

4cqmA Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
39% identity, 99% coverage: 2:250/252 of query aligns to 3:246/248 of 4cqmA

query
sites
4cqmA
Q
 
R
L
 
L
Q
 
R
D
 
S
K
 
A
V
 
L
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
Q
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
V
G
 
S
E
 
V
Y
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
C
D
|
D
L
|
L
N
 
D
Q
 
R
E
 
A
R
 
A
L
 
A
D
 
Q
E
 
E
A
 
T
V
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
H
A
 
A
A
 
A
C
 
F
K
 
Q
A
|
A
A
 
D
G
x
V
G
 
S
D
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
Y
 
A
L
 
R
C
 
C
N
 
L
V
 
L
A
 
-
N
 
-
E
 
-
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
T
 
Q
D
 
A
M
 
C
V
 
F
A
 
S
R
 
R
V
 
P
A
 
P
E
 
S
D
 
V
F
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
Q
D
 
D
G
 
E
L
 
F
L
 
L
L
 
L
K
 
H
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
M
S
 
S
L
 
E
A
 
D
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
V
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
A
M
 
L
V
 
V
E
 
S
L
 
N
K
 
G
S
 
C
E
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
K
A
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
S
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
Q
V
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
A
 
N
G
 
S
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
x
P
M
|
M
V
x
T
A
 
Q
S
 
K
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
E
 
D
K
 
K
M
 
I
T
 
T
S
 
E
G
 
M
I
 
I
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
H
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
H
 
D
S
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
E
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
T
I
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
44% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:237/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
M
 
L
Q
 
P
L
 
L
Q
 
T
D
 
D
K
 
R
V
 
I
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
I
G
 
A
E
 
L
Y
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
A
K
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
N
D
 
Y
L
x
A
N
x
S
Q
x
S
E