SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1119 FitnessBrowser__Marino:GFF1119 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
32% identity, 95% coverage: 6:248/255 of query aligns to 4:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
I
 
I
L
 
L
E
 
R
T
 
T
E
 
E
S
 
N
L
 
I
S
 
V
K
 
K
H
 
Y
W
x
F
G
 
G
G
 
E
I
x
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
L
 
I
Q
 
S
F
 
V
Q
 
N
D
 
K
K
 
G
H
 
D
L
 
V
H
 
T
G
 
L
V
 
I
V
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
M
 
V
L
 
I
C
 
T
G
 
G
T
 
F
L
 
L
K
 
K
P
 
A
T
 
D
S
 
E
G
 
G
C
 
R
I
 
V
F
 
Y
H
 
F
K
 
E
G
 
N
D
 
K
Q
 
D
I
 
I
E
 
T
G
 
N
M
 
K
K
 
E
P
 
P
W
 
A
E
 
E
F
 
L
V
 
Y
H
 
H
R
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
V
R
 
R
S
 
T
F
 
F
Q
 
Q
K
 
T
T
 
P
N
 
Q
I
 
P
Y
 
L
V
 
K
D
 
E
V
 
M
T
 
T
C
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
L
A
 
L
I
 
I
A
 
G
A
 
E
Q
 
I
R
 
C
R
 
P
F
 
G
T
 
E
G
 
S
S
 
P
F
 
L
N
 
N
-
 
S
L
 
L
F
 
F
A
 
Y
S
 
K
R
 
K
H
 
W
S
 
I
N
 
P
K
 
K
-
 
E
-
 
E
L
 
E
V
 
M
R
 
V
E
 
E
G
 
K
A
 
A
E
 
F
K
 
K
A
 
I
L
 
L
C
 
E
Q
 
F
V
 
L
G
 
K
L
 
L
E
 
S
N
 
H
R
 
L
V
 
Y
H
 
D
T
 
R
V
 
K
A
 
A
A
 
G
E
 
E
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
M
R
 
K
Q
 
L
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
G
M
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
T
D
 
N
P
 
P
C
 
K
I
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
A
H
 
P
E
 
G
E
 
L
S
 
A
Q
 
H
R
 
D
I
 
I
I
 
F
E
 
N
L
 
H
M
 
V
N
 
L
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
-
 
A
Q
 
K
T
 
G
Y
 
I
S
 
T
I
 
F
V
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
D
 
D
A
 
I
I
 
V
F
 
L
E
 
N
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
Q
 
H
L
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
Q
H
 
I
L
 
I
I
 
A
T
 
E
G
 
G
T
 
R
V
 
G
D
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
R
 
L
N
 
S
D
 
D
T
 
P
R
 
K
V
 
V
K
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
K
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
32% identity, 95% coverage: 6:247/255 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
I
 
I
L
 
L
E
 
R
T
 
T
E
 
E
S
 
N
L
 
I
S
 
V
K
 
K
H
 
Y
W
x
F
G
 
G
G
 
E
I
x
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
G
I
 
V
S
 
S
L
 
I
Q
 
S
F
 
V
Q
 
C
D
 
K
K
 
G
H
 
D
L
 
V
H
 
T
G
 
L
V
 
I
V
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
M
 
V
L
 
I
C
 
T
G
 
G
T
 
F
L
 
L
K
 
K
P
 
A
T
 
D
S
 
E
G
 
G
C
 
R
I
 
V
F
 
Y
H
 
F
K
 
E
G
 
N
D
 
K
Q
 
D
I
 
I
E
 
T
G
 
N
M
 
K
K
 
E
P
 
P
W
 
A
E
 
E
F
 
L
V
 
Y
H
 
H
R
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
V
R
 
R
S
 
T
F
 
F
Q
 
Q
K
 
T
T
 
P
N
 
Q
I
 
P
Y
 
L
V
 
K
D
 
E
V
 
M
T
 
T
C
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
L
A
 
L
I
 
I
A
 
G
A
 
E
Q
 
I
R
 
N
R
 
P
F
 
G
T
 
E
G
 
S
S
 
P
F
 
L
N
 
N
-
 
S
L
 
L
F
 
F
A
 
Y
S
 
K
R
 
K
H
 
W
S
 
I
N
 
P
K
 
K
-
 
E
-
 
E
L
 
E
V
 
M
R
 
V
E
 
E
G
 
K
A
 
A
E
 
F
K
 
K
A
 
I
L
 
L
C
 
E
Q
 
F
V
 
L
G
 
K
L
 
L
E
 
S
N
 
H
R
 
L
V
 
Y
H
 
D
T
 
R
V
 
K
A
 
A
A
 
G
E
 
E
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
M
R
 
K
Q
 
L
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
G
M
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
T
D
 
N
P
 
P
C
 
K
I
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
A
H
 
P
E
 
G
E
 
L
S
 
A
Q
 
H
R
 
D
I
 
I
I
 
F
E
 
N
L
 
H
M
 
V
N
 
L
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
-
 
A
Q
 
K
T
 
G
Y
 
I
S
 
T
I
 
F
V
 
L
L
 
I
V
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
D
 
D
A
 
I
I
 
V
F
 
L
E
 
N
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
Q
 
H
L
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
D
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
Q
H
 
I
L
 
I
I
 
A
T
 
E
G
 
G
T
 
R
V
 
G
D
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
R
 
L
N
 
S
D
 
D
T
 
P
R
 
K
V
 
V
K
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
27% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 2:245/501 of P04983

query
sites
P04983
E
 
E
I
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
Q
T
 
L
E
 
K
S
 
G
L
 
I
S
 
D
K
 
K
H
 
A
W
 
F
G
 
P
G
 
G
I
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
S
D
 
G
I
 
A
S
 
A
L
 
L
Q
 
N
F
 
V
Q
 
Y
D
 
P
K
 
G
H
 
R
L
 
V
H
 
M
G
 
A
V
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
M
L
 
M
N
 
K
M
 
V
L
 
L
C
 
T
G
 
G
T
 
I
L
 
Y
K
 
T
P
 
R
T
 
D
S
 
A
G
 
G
C
 
T
I
 
L
F
 
L
H
 
W
K
 
L
G
 
G
D
 
K
Q
 
E
I
 
T
E
 
T
G
 
F
M
 
T
K
 
G
P
 
P
W
 
K
E
 
S
F
 
S
V
 
Q
H
 
E
R
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
I
S
 
I
F
 
H
Q
 
Q
K
 
E
T
 
L
N
 
N
I
 
L
Y
 
I
V
 
P
D
 
Q
V
 
L
T
 
T
C
 
I
L
 
A
E
 
E
N
 
N
C
 
I
A
 
F
I
 
L
A
 
G
A
 
-
Q
 
-
R
 
R
R
 
E
F
 
F
T
 
V
G
 
N
S
 
R
F
 
F
N
 
G
L
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
K
H
 
I
S
 
D
N
 
W
K
 
K
L
 
T
V
 
M
R
 
Y
E
 
A
G
 
E
A
 
A
E
 
D
K
 
K
A
 
L
L
 
L
C
 
A
Q
 
K
V
 
L
G
 
N
L
 
L
E
 
R
N
 
F
R
 
K
V
 
S
H
 
D
T
 
K
V
 
L
A
 
V
A
 
G
E
 
D
I
 
L
S
 
S
Y
 
I
G
 
G
E
 
D
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
M
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
M
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
S
T
 
F
D
 
E
P
 
S
C
 
K
I
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
D
G
 
A
M
 
L
G
 
T
H
 
D
E
 
T
E
 
E
S
 
T
Q
 
E
R
 
S
I
 
L
I
 
F
E
 
R
L
 
V
M
 
I
N
 
R
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
-
 
S
Q
 
Q
T
 
G
Y
 
R
S
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
Y
V
 
I
E
 
S
H
 
H
D
 
R
M
 
M
D
 
K
A
 
E
I
 
I
F
 
F
E
 
E
L
 
I
S
 
C
D
 
D
Q
 
D
L
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
R
N
 
D
G
 
G
T
 
Q
H
 
F
L
 
I
I
 
A
T
 
E
G
 
R
T
 
E
V
 
V
D
 
A
E
 
S
V
 
L
R
 
T
N
 
E
D
 
D
T
 
S
R
 
L
V
 
I
K
 
-
E
 
E
A
 
M
Y
 
M
L
 
V
G
 
G
K
 
R
E
 
K
K
 
L
E
 
E
E
 
D
E
 
Q

8w6iD Cryo-em structure of escherichia coli str k12 ftsex complex with atp- gamma-s in peptidisc
29% identity, 86% coverage: 6:224/255 of query aligns to 1:213/219 of 8w6iD

query
sites
8w6iD
I
 
M
L
 
I
E
 
R
T
 
F
E
 
E
S
 
H
L
 
V
S
 
S
K
 
K
H
 
A
W
x
Y
-
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
R
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
D
 
G
I
 
V
S
 
T
L
 
F
Q
 
H
F
 
M
Q
 
Q
D
 
P
K
 
G
H
 
E
L
 
M
H
 
A
G
 
F
V
 
L
V
 
T
G
 
G
P
 
H
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
K
M
 
L
L
 
I
C
 
C
G
 
G
T
 
I
L
 
E
K
 
R
P
 
P
T
 
S
S
 
A
G
 
G
C
 
K
I
 
I
F
 
W
H
 
F
K
 
S
G
 
G
D
 
H
Q
 
D
I
 
I
E
 
T
G
 
R
M
 
L
K
 
K
P
 
N
W
 
R
E
 
E
-
 
V
-
 
P
F
 
F
V
 
L
H
 
R
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
M
S
 
I
F
 
F
Q
|
Q
K
 
D
T
 
H
N
 
H
I
 
L
Y
 
L
V
 
M
D
 
D
V
 
R
T
 
T
C
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
C
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
P
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
L
F
 
I
A
 
I
S
 
A
R
 
G
H
 
A
S
 
S
N
 
G
K
 
D
L
 
D
V
 
I
R
 
R
E
 
R
G
 
R
A
 
V
E
 
S
K
 
A
A
 
A
L
 
L
C
 
D
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
L
N
 
D
R
x
K
V
 
A
H
 
K
T
 
N
V
 
F
A
 
P
A
 
I
E
x
Q
I
 
L
S
|
S
Y
x
G
G
|
G
E
|
E
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
R
L
 
V
E
 
G
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
L
 
V
A
 
V
T
 
N
D
 
K
P
 
P
C
 
A
I
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
G
G
 
N
M
 
L
G
 
D
H
 
D
E
 
A
E
 
L
S
 
S
Q
 
E
R
 
G
I
 
I
I
 
L
E
 
R
L
 
L
M
 
F
N
 
E
Q
 
E
L
 
F
K
 
N
Q
 
R
T
 
V
-
 
G
Y
 
V
S
 
T
I
 
V
V
 
L
L
 
M
V
 
A
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
I
D
 
N
A
 
L
I
 
I
F
 
S
E
 
R
L
 
R
S
 
S
D
 
Y
Q
 
R
L
 
M
T
 
L
V
 
T
L
 
L
D
 
S
N
 
D
G
 
G

P0A9R7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
30% identity, 90% coverage: 6:234/255 of query aligns to 1:222/222 of P0A9R7

query
sites
P0A9R7
I
 
M
L
 
I
E
 
R
T
 
F
E
 
E
S
 
H
L
 
V
S
 
S
K
 
K
H
 
A
W
 
Y
-
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
R
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
D
 
G
I
 
V
S
 
T
L
 
F
Q
 
H
F
 
M
Q
 
Q
D
 
P
K
 
G
H
 
E
L
 
M
H
 
A
G
 
F
V
 
L
V
 
T
G
 
G
P
 
H
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
K
M
 
L
L
 
I
C
|
C
G
 
G
T
 
I
L
 
E
K
 
R
P
 
P
T
 
S
S
 
A
G
 
G
C
 
K
I
 
I
F
 
W
H
 
F
K
 
S
G
 
G
D
 
H
Q
 
D
I
 
I
E
 
T
G
 
R
M
 
L
K
 
K
P
 
N
W
 
R
E
 
E
-
 
V
-
 
P
F
 
F
V
 
L
H
 
R
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
M
S
 
I
F
 
F
Q
 
Q
K
 
D
T
 
H
N
 
H
I
 
L
Y
 
L
V
 
M
D
 
D
V
 
R
T
 
T
C
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
C
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
P
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
L
F
 
I
A
 
I
S
 
A
R
 
G
H
 
A
S
 
S
N
 
G
K
 
D
L
 
D
V
 
I
R
 
R
E
 
R
G
 
R
A
 
V
E
 
S
K
 
A
A
 
A
L
 
L
C
 
D
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
L
N
 
D
R
 
K
V
 
A
H
 
K
T
 
N
V
 
F
A
 
P
A
 
I
E
 
Q
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
R
L
 
V
E
 
G
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
L
 
V
A
 
V
T
 
N
D
 
K
P
 
P
C
 
A
I
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
G
G
 
N
M
 
L
G
 
D
H
 
D
E
 
A
E
 
L
S
 
S
Q
 
E
R
 
G
I
 
I
I
 
L
E
 
R
L
 
L
M
 
F
N
 
E
Q
 
E
L
 
F
K
 
N
Q
 
R
T
 
V
-
 
G
Y
 
V
S
 
T
I
 
V
V
 
L
L
 
M
V
 
A
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
I
D
 
N
A
 
L
I
 
I
F
 
S
E
 
R
L
 
R
S
 
S
D
 
Y
Q
 
R
L
 
M
T
 
L
V
 
T
L
 
L
D
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
-
H
 
H
L
 
L
I
 
H
T
 
G
G
 
G
T
 
V
V
 
G
D
 
H
E
 
E

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
28% identity, 87% coverage: 14:235/255 of query aligns to 9:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
K
 
K
H
 
N
W
x
F
G
 
G
G
 
S
I
 
L
K
 
E
A
x
V
L
 
L
D
 
K
D
 
G
I
 
V
S
 
T
L
 
L
Q
 
K
F
 
V
Q
 
N
D
 
K
K
 
G
H
 
E
L
 
V
H
 
V
G
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
M
 
C
L
 
I
C
 
N
G
 
L
T
 
L
L
 
E
K
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
K
G
 
G
C
 
E
I
 
V
F
 
F
H
 
I
K
 
D
G
 
G
D
 
V
Q
 
K
I
 
I
E
 
N
-
 
N
G
 
G
M
 
K
K
 
V
P
 
N
W
 
I
E
 
N
F
 
K
V
 
V
H
 
R
R
 
Q
G
 
K
I
 
V
G
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
H
T
 
F
N
 
N
I
 
L
Y
 
F
V
 
P
D
 
H
V
 
L
T
 
T
C
 
A
L
 
I
E
 
E
N
 
N
C
 
I
A
 
T
I
 
L
A
 
A
A
 
P
Q
 
V
R
 
K
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
V
S
 
K
R
 
K
H
 
M
S
 
N
N
 
K
K
 
K
L
 
E
V
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
L
A
 
A
E
 
V
K
 
D
A
 
L
L
 
L
C
 
A
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
L
N
 
D
R
 
K
V
 
K
H
 
D
T
 
Q
V
 
Y
A
 
P
A
 
I
E
 
K
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
Q
 
R
L
 
L
E
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
Q
P
 
P
C
 
E
I
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
G
 
D
H
 
P
E
 
E
E
 
M
S
 
V
Q
 
K
R
 
E
I
 
V
I
 
L
E
 
N
L
 
V
M
 
M
N
 
K
Q
 
Q
L
 
L
-
 
A
K
 
N
Q
 
E
T
 
G
Y
 
M
S
 
T
I
 
M
V
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
D
 
G
A
 
F
I
 
A
F
 
R
E
 
E
L
 
V
S
 
G
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
T
 
I
V
 
F
L
 
M
D
 
D
N
 
D
G
 
G
T
 
V
H
 
I
L
 
V
I
 
E
T
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I

8hd0A Cell divisome spg hydrolysis machinery ftsex-envc
29% identity, 86% coverage: 6:224/255 of query aligns to 1:213/218 of 8hd0A

query
sites
8hd0A
I
 
M
L
 
I
E
 
R
T
 
F
E
 
E
S
 
H
L
 
V
S
 
S
K
 
K
H
 
A
W
x
Y
-
 
L
G
 
G
G
 
G
I
x
R
K
 
Q
A
|
A
L
 
L
D
 
Q
D
 
G
I
 
V
S
 
T
L
 
F
Q
 
H
F
 
M
Q
 
Q
D
 
P
K
 
G
H
 
E
L
 
M
H
 
A
G
 
F
V
 
L
V
 
T
G
 
G
P
 
H
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
K
M
 
L
L
 
I
C
 
C
G
 
G
T
 
I
L
 
E
K
 
R
P
 
P
T
 
S
S
 
A
G
 
G
C
 
K
I
 
I
F
 
W
H
 
F
K
 
S
G
 
G
D
 
H
Q
 
D
I
 
I
E
 
T
G
 
R
M
 
L
K
 
K
P
 
N
W
 
R
E
 
E
-
 
V
-
 
P
F
 
F
V
 
L
H
 
R
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
G
 
G
R
 
M
S
 
I
F
 
F
Q
 
Q
K
 
D
T
 
H
N
 
H
I
 
L
Y
 
L
V
 
M
D
 
D
V
 
R
T
 
T
C
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
C
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
P
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
L
F
 
I
A
 
I
S
 
A
R
 
G
H
 
A
S
 
S
N
 
G
K
 
D
L
 
D
V
 
I
R
 
R
E
 
R
G
 
R
A
 
V
E
 
S
K
 
A
A
 
A
L
 
L
C
 
D
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
L
N
 
D
R
 
K
V
 
A
H
 
K
T
 
N
V
 
F
A
 
P
A
 
I
E
 
Q
I
 
L
S
|
S
Y
 
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
R
L
 
V
E
 
G
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
L
 
V
A
 
V
T
 
N
D
 
K
P
 
P
C
 
A
I
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
M
 
T
A
 
G
G
 
N
M
 
L
G
 
D
H
 
D
E
 
A
E
 
L
S
 
S
Q
 
E
R
 
G
I
 
I
I
 
L
E
 
R
L
 
L
M
 
F
N
 
E
Q
 
E
L
 
F
K
 
N
Q
 
R
T
 
V
-
 
G
Y
 
V
S
 
T
I
 
V
V
 
L
L
 
M
V
 
A
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
I
D
 
N
A
 
L
I
 
I
F
 
S
E
 
R
L
 
R
S
 
S
D
 
Y
Q
 
R
L
 
M
T
 
L
V
 
T
L
 
L
D
 
S
N
 
D
G
 
G

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
27% identity, 97% coverage: 1:247/255 of query aligns to 1:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
M
 
M
A
 
V
N
 
S
E
 
D
I
 
I
I
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
V
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
S
 
H
K
 
V
H
 
Y
W
x
Y
G
 
G
G
 
A
I
 
I
K
 
H
A
 
A
L
 
I
D
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
D
L
 
L
Q
 
K
F
 
V
Q
 
P
D
 
R
K
 
G
H
 
Q
L
 
I
H
 
V
G
 
T
V
 
L
V
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
N
 
S
M
 
A
L
 
I
C
 
A
G
 
G
T
 
L
L
 
V
K
 
R
P
 
A
T
 
Q
S
 
K
G
 
G
C
 
K
I
 
I
F
 
I
H
 
F
K
 
N
G
 
G
D
 
Q
Q
 
D
I
 
I
E
 
T
G
 
N
M
 
-
K
 
K
P
 
P
W
 
A
E
 
H
F
 
V
V
 
I
H
 
N
R
 
R
-
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
A
R
 
L
S
 
V
F
 
P
Q
x
E
K
 
G
T
 
R
N
 
R
I
 
I
Y
 
F
V
 
P
D
 
E
V
 
L
T
 
T
C
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
C
 
L
A
 
M
I
 
M
A
 
G
A
 
A
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
S
 
Y
N
 
N
K
 
R
L
 
K
V
 
D
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
I
E
 
K
K
 
R
A
 
D
L
 
L
C
 
E
Q
 
W
V
 
I
-
 
F
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
P
G
 
R
L
 
L
E
 
K
N
 
E
R
 
R
V
 
L
H
 
K
T
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
E
 
T
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
M
L
 
L
E
 
A
L
 
I
A
 
G
M
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
S
D
 
R
P
 
P
C
 
K
I
 
L
L
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
S
A
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
A
H
 
P
E
 
I
E
 
L
S
 
V
Q
 
S
R
 
E
I
 
V
I
 
F
E
 
E
L
 
V
M
 
I
N
 
Q
Q
 
K
L
 
I
K
 
N
Q
 
Q
T
 
E
-
 
G
Y
 
T
S
 
T
I
 
I
V
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
H
 
Q
D
 
N
M
 
A
D
 
L
A
 
G
I
 
A
F
 
L
E
 
K
L
 
V
S
 
A
D
 
H
Q
 
Y
L
 
G
T
 
Y
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
T
G
 
G
T
 
Q
H
 
I
L
 
V
I
 
L
T
 
E
G
 
G
T
 
K
V
 
A
D
 
S
E
 
E
V
 
L
R
 
L
N
 
D
D
 
N
T
 
E
R
 
M
V
 
V
K
 
R
E
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

4hluA Structure of the ecfa-a' heterodimer bound to adp (see paper)
29% identity, 83% coverage: 20:231/255 of query aligns to 21:221/265 of 4hluA

query
sites
4hluA
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
D
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
V
F
 
I
Q
 
N
D
 
E
K
 
G
H
 
E
L
 
C
H
 
L
G
 
L
V
 
V
V
 
A
G
 
G
P
 
N
N
 
T
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
M
 
I
L
 
V
C
 
A
G
 
G
T
 
L
L
 
I
K
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
C
 
D
I
 
V
F
 
L
H
 
Y
K
 
D
G
 
G
D
 
E
Q
 
R
I
 
K
E
 
K
G
 
G
M
 
Y
K
 
E
P
 
-
W
 
-
E
 
-
F
 
-
V
 
I
H
 
R
R
 
R
G
 
N
I
 
I
G
 
G
R
 
I
S
 
A
F
 
F
Q
 
Q
-
 
Y
K
 
P
T
 
E
N
 
D
I
 
Q
Y
 
F
V
 
F
D
 
A
V
 
E
T
 
R
C
 
V
L
 
F
E
 
D
N
 
E
C
 
V
A
 
A
I
 
F
A
 
A
A
 
V
Q
 
K
R
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
N
L
 
F
F
 
Y
A
 
P
S
 
D
R
 
R
H
 
D
S
 
P
N
 
V
K
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
K
G
 
A
A
 
M
E
 
E
K
 
-
A
 
-
L
 
F
C
 
V
Q
 
G
V
 
L
G
 
D
L
 
F
E
 
D
N
 
S
R
 
F
V
 
K
H
 
D
T
 
R
V
 
V
A
 
P
A
 
F
E
 
F
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
R
 
R
Q
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
H
D
 
E
P
 
P
C
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
V
G
 
G
M
 
L
-
 
D
-
 
R
-
 
E
G
 
G
H
 
K
E
 
T
E
 
D
S
 
L
Q
 
L
R
 
R
I
 
I
I
 
V
E
 
E
L
 
K
M
 
W
N
 
K
Q
 
T
L
 
L
K
 
G
Q
 
K
T
 
T
Y
 
-
S
 
-
I
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
I
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
I
D
 
E
A
 
T
I
 
V
F
 
I
E
 
N
L
 
H
S
 
V
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
K
G
 
G
T
 
K
H
 
K
L
 
V
I
 
F
T
 
D
G
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
28% identity, 93% coverage: 6:243/255 of query aligns to 2:229/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
I
L
 
I
E
 
R
T
 
I
E
 
R
S
 
N
L
 
L
S
 
H
K
 
K
H
 
W
W
x
F
G
 
G
G
 
P
I
 
L
K
 
H
A
x
V
L
 
L
D
 
K
D
 
G
I
 
I
S
 
H
L
 
L
Q
 
E
F
 
V
Q
 
A
D
 
P
K
 
G
H
 
E
L
 
K
H
 
L
G
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
R
M
 
T
L
 
I
C
 
N
G
 
R
T
 
L
L
 
E
K
 
D
P
 
F
T
 
Q
S
 
E
G
 
G
C
 
E
I
 
V
F
 
V
H
 
V
K
 
D
G
 
G
D
 
L
Q
 
S
I
 
V
E
 
K
G
 
D
M
 
D
K
 
R
P
 
A
W
 
L
E
 
R
F
 
E
V
 
I
H
 
R
R
 
R
G
 
E
I
 
V
G
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
T
 
F
N
 
N
I
 
L
Y
 
F
V
 
P
D
 
H
V
 
M
T
 
T
C
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
V
A
 
T
I
 
L
A
 
A
A
 
P
Q
 
M
R
 
R
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
H
 
-
S
 
V
N
 
R
K
 
R
L
 
W
V
 
P
R
 
R
E
 
E
G
 
K
A
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
L
L
 
L
C
 
E
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
L
N
 
D
R
 
Q
V
 
A
H
 
R
T
 
K
V
 
Y
A
 
P
A
 
A
E
 
Q
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
D
 
E
P
 
P
C
 
K
I
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
G
 
D
H
 
P
E
 
E
E
 
M
S
 
V
Q
 
G
R
 
E
I
 
V
I
 
L
E
 
D
L
 
V
M
 
M
N
 
R
Q
 
D
L
 
L
K
 
A
Q
 
Q
-
 
G
T
 
G
Y
 
M
S
 
T
I
 
M
V
 
V
L
 
V
V
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
D
 
G
A
 
F
I
 
A
F
 
R
E
 
E
L
 
V
S
 
A
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
T
 
V
V
 
F
L
 
M
D
 
D
N
 
G
G
 
G
T
 
Q
H
 
I
L
 
V
I
 
E
T
 
E
G
 
G
T
 
R
V
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
-
N
 
-
D
 
F
T
 
T
R
 
R
V
 
P
K
 
K
E
 
E

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
30% identity, 91% coverage: 6:238/255 of query aligns to 4:230/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
I
 
I
L
 
L
E
 
A
T
 
A
E
 
E
S
 
A
L
 
L
S
 
T
K
 
Y
H
 
A
W
x
F
-
 
P
G
 
G
G
 
G
I
x
V
K
 
K
A
|
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
I
 
L
S
 
S
L
 
L
Q
 
A
F
 
V
Q
 
P
D
 
K
K
 
G
H
 
E
L
 
S
H
 
L
G
 
A
V
 
I
V
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
L
M
 
H
L
 
L
C
 
N
G
 
G
T
 
T
L
 
L
K
 
R
P
 
P
T
 
Q
S
 
S
G
 
G
C
 
R
I
 
V
F
 
L
H
 
L
K
 
G
G
 
G
D
 
T
Q
 
A
I
 
T
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
R
E
 
K
G
 
D
M
 
L
K
 
T
P
 
G
W
 
W
E
 
-
F
 
-
V
 
-
H
 
R
R
 
R
G
 
R
I
 
V
G
 
G
R
 
L
S
 
V
F
 
L
Q
|
Q
K
 
D
T
 
A
N
 
D
I
 
D
Y
 
Q
V
 
L
-
 
F
D
 
A
V
 
T
T
 
T
C
 
V
L
 
F
E
 
E
N
 
D
C
 
V
A
 
S
I
 
F
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
G
S
 
P
F
 
L
N
 
N
L
 
L
F
 
G
A
 
L
S
 
S
R
 
E
H
 
A
S
 
E
N
 
A
K
 
R
L
 
A
V
 
R
R
 
V
E
 
E
G
 
E
A
 
A
E
 
L
K
 
A
A
 
A
L
 
L
C
 
S
Q
 
I
V
 
S
G
 
D
L
 
L
E
 
R
N
 
D
R
 
R
V
 
P
H
 
T
T
x
H
V
x
M
A
 
-
A
 
-
E
 
-
I
x
L
S
|
S
Y
 
G
G
|
G
E
x
Q
Q
 
K
R
 
R
Q
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
G
V
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
M
D
 
R
P
 
P
C
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
M
 
T
A
 
A
G
 
G
M
 
L
G
 
D
H
 
L
E
 
A
E
 
G
S
 
T
Q
 
E
R
 
Q
I
 
L
I
 
L
E
 
T
L
 
L
M
 
L
N
 
R
Q
 
G
L
 
L
K
 
R
Q
 
A
T
 
A
-
 
G
Y
 
M
S
 
T
I
 
L
V
 
V
L
 
F
V
 
S
E
 
T
H
|
H
D
 
D
M
 
V
D
 
E
A
 
L
I
 
A
F
 
A
E
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
T
 
A
V
 
L
L
 
F
D
 
R
N
 
T
G
 
G
T
 
R
H
 
V
L
 
L
I
 
A
T
 
E
G
 
G
T
 
A
V
 
A
D
 
E
E
 
A
V
 
V
R
 
L
N
 
S
D
 
D

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
29% identity, 92% coverage: 4:237/255 of query aligns to 2:225/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
E
 
E
I
 
D
I
 
I
L
 
I
E
 
V
T
 
V
E
 
E
S
 
N
L
 
L
S
 
V
K
 
K
H
 
K
W
x
F
G
 
G
G
 
D
I
x
F
K
 
E
A
 
A
L
 
V
D
 
K
D
 
G
I
 
V
S
 
S
L
 
F
Q
 
S
F
 
V
Q
 
K
D
 
K
K
 
G
H
 
E
L
 
I
H
 
F
G
 
A
V
 
F
V
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
I
N
 
H
M
 
M
L
 
L
C
 
T
G
 
T
T
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
C
 
K
I
 
A
F
 
W
H
 
V
K
 
A
G
 
G
D
 
H
Q
 
D
I
 
V
E
 
-
G
 
-
M
 
L
K
 
K
P
 
E
W
 
P
E
 
R
F
 
E
V
 
V
H
 
R
R
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
I
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
D
T
 
Q
N
 
S
I
 
L
Y
 
D
V
 
R
D
 
E
V
 
L
T
 
T
C
 
A
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
C
 
M
A
 
Y
I
 
I
A
 
H
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
G
S
 
K
F
 
I
N
 
Y
L
 
G
F
 
Y
A
 
G
S
 
G
R
 
E
H
 
K
S
 
L
N
 
K
K
 
K
L
 
R
V
 
I
R
 
L
E
 
E
G
 
L
A
 
L
E
 
E
K
 
F
A
 
V
L
 
E
C
 
L
Q
 
L
V
 
E
G
 
F
L
 
K
E
 
D
N
 
K
R
 
P
V
 
V
H
 
K
T
|
T
V
x
F
A
x
S
A
 
G
E
 
-
I
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
G
E
 
M
Q
 
A
R
 
R
Q
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
S
L
 
L
A
 
I
T
 
H
D
 
E
P
 
P
C
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
T
A
 
I
G
 
G
M
 
L
G
 
D
H
 
P
E
 
H
E
 
T
S
 
R
Q
 
A
R
 
H
I
 
M
I
 
W
E
 
E
L
 
Y
M
 
I
N
 
S
Q
 
K
L
 
M
K
 
K
Q
 
K
T
 
E
Y
 
H
-
 
N
-
 
M
S
 
T
I
 
I
V
 
F
L
 
L
V
 
T
E
 
T
H
 
H
D
 
Y
M
 
M
D
 
D
A
 
E
I
 
A
F
 
E
E
 
Q
L
 
L
S
 
A
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
T
 
A
V
 
I
L
 
I
D
 
D
N
 
H
G
 
G
T
 
K
H
 
I
L
 
I
I
 
A
T
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
P
D
 
T
E
 
E
V
 
L
R
 
K
N
 
R

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
27% identity, 93% coverage: 7:243/255 of query aligns to 4:237/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
L
 
V
E
 
E
T
 
L
E
 
K
S
 
G
L
 
L
S
 
T
K
 
F
H
 
K
W
x
R
G
 
G
G
 
S
I
 
R
K
 
A
A
 
I
L
 
F
D
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
D
L
 
V
Q
 
R
F
 
I
Q
 
P
D
 
R
K
 
G
H
 
K
L
 
V
H
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
M
 
L
L
 
I
C
 
A
G
 
S
T
 
Q
L
 
L
K
 
R
P
 
P
T
 
S
S
 
K
G
 
G
C
 
E
I
 
V
F
 
W
H
 
V
K
 
N
G
 
G
D
 
Q
Q
 
N
I
 
L
E
 
P
G
 
Q
M
 
L
K
 
S
P
 
R
W
 
G
E
 
D
F
 
L
-
 
F
-
 
D
V
 
M
H
 
R
R
 
K
G
 
Q
I
 
F
G
 
G
R
 
V
S
 
L
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
T
 
G
N
 
A
I
 
L
Y
 
F
V
 
T
D
 
D
V
 
L
T
 
D
C
 
V
L
 
F
E
 
E
N
 
N
C
 
V
A
 
A
I
 
F
A
 
P
A
 
L
Q
 
R
R
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
V
A
 
H
S
 
T
R
 
Q
H
 
L
S
 
P
N
 
E
K
 
E
L
 
M
V
 
I
R
 
R
E
 
D
G
 
I
A
 
V
E
 
L
K
 
M
A
 
K
L
 
L
C
 
Q
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
R
N
 
G
R
 
A
V
 
V
H
 
E
T
 
L
V
 
M
A
 
P
A
 
D
E
 
E
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
M
Q
 
K
R
 
R
Q
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
L
D
 
D
P
 
P
C
 
Q
I
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
V
G
 
G
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
M
 
I
G
 
A
H
 
M
E
 
G
E
 
V
S
 
L
Q
 
V
R
 
R
I
 
L
I
 
I
E
 
R
L
 
L
M
 
L
N
 
N
Q
 
D
L
 
A
K
 
L
Q
 
G
T
 
I
Y
 
T
S
 
S
I
 
I
V
 
V
L
 
-
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
L
D
 
A
A
 
E
I
 
T
F
 
A
E
 
S
L
 
I
S
 
A
D
 
D
Q
 
Y
L
 
I
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
G
N
 
D
G
 
G
T
 
R
H
 
V
L
 
L
I
 
G
T
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
P
D
 
D
E
 
V
V
 
L
R
 
K
-
 
E
-
 
T
N
 
D
D
 
D
T
 
P
R
 
R
V
 
I
K
 
R
E
 
Q

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
26% identity, 96% coverage: 6:249/255 of query aligns to 2:237/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
I
 
I
L
 
L
E
 
K
T
 
A
E
 
Q
S
 
H
L
 
L
S
 
A
K
 
K
H
 
S
W
 
Y
G
 
K
G
 
K
I
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
V
D
 
S
D
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
F
 
V
Q
 
E
D
 
S
K
 
G
H
 
Q
L
 
I
H
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
S
L
 
F
N
 
Y
M
 
M
L
 
I
C
 
V
G
 
G
T
 
L
L
 
V
K
 
A
P
 
R
T
 
D
S
 
E
G
 
G
C
 
T
I
 
I
F
 
T
H
 
I
K
 
D
G
 
D
D
 
N
Q
 
D
I
 
I
E
 
S
G
 
I
M
 
L
K
 
P
P
 
M
W
 
H
E
 
S
F
 
R
V
 
S
H
 
R
R
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
Y
S
 
L
F
 
P
Q
 
Q
K
 
E
T
 
A
N
 
S
I
 
I
Y
 
F
V
 
R
D
 
K
V
 
L
T
 
S
C
 
V
L
 
E
E
 
D
N
 
N
C
 
I
A
 
M
I
 
A
A
 
V
A
 
L
Q
 
Q
R
 
T
R
 
R
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
E
N
 
E
L
 
L
F
 
T
A
 
H
S
x
E
R
 
E
H
 
R
S
 
Q
N
x
D
K
 
K
L
 
L
V
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
K
 
D
A
 
L
L
 
L
C
 
E
Q
 
E
V
 
F
G
 
H
L
 
I
E
 
Q
N
 
H
R
 
I
V
 
R
H
 
K
T
 
S
V
 
A
A
 
G
A
 
M
E
 
A
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
R
 
R
Q
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
M
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
C
 
Q
I
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
D
H
 
P
E
 
I
E
 
S
S
 
V
Q
 
I
R
 
D
I
 
I
I
 
K
E
 
K
L
 
I
M
 
I
N
 
E
Q
 
H
L
 
L
K
 
R
-
 
D
Q
 
R
T
 
G
Y
 
L
S
 
G
I
 
V
V
 
L
L
 
I
V
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
D
 
R
A
 
E
I
 
T
F
 
L
E
 
D
L
 
V
S
 
C
D
 
E
Q
 
K
L
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
D
 
S
N
 
Q
G
 
G
T
 
R
H
 
L
L
 
I
I
 
A
T
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
P
D
 
Q
E
 
D
V
 
V
R
 
L
N
 
N
D
 
N
T
 
E
R
 
Q
V
 
V
K
 
K
E
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
E
E
 
Q

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
28% identity, 91% coverage: 6:236/255 of query aligns to 2:227/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
I
 
L
L
 
I
E
 
E
T
 
V
E
 
K
S
 
N
L
 
L
S
 
S
K
 
F
H
 
N
W
x
R
G
 
G
G
 
E
I
 
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
D
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
L
 
L
Q
 
N
F
 
I
Q
 
R
D
 
R
K
 
G
H
 
Q
L
 
I
H
 
T
G
 
A
V
 
I
V
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
M
 
L
L
 
I
C
 
G
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
K
 
V
P
 
P
T
 
D
S
 
Q
G
 
G
C
 
E
I
 
V
F
 
L
H
 
L
K
 
D
G
 
G
D
 
K
Q
 
D
I
 
I
E
 
A
G
 
Q
M
 
M
K
 
S
P
 
R
W
 
Q
E
 
E
-
 
L
F
 
F
V
 
A
H
 
A
R
 
R
G
 
A
-
 
R
I
 
M
G
 
G
R
 
M
S
 
L
F
 
F
Q
|
Q
K
 
S
T
 
G
N
 
A
I
 
L
Y
 
F
V
 
T
D
 
D
V
 
M
T
 
S
C
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
C
 
V
A
 
A
I
 
F
A
 
P
A
 
I
Q
 
R
R
 
A
R
 
H
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
T
R
 
K
H
 
L
S
 
S
N
 
E
K
 
N
L
 
L
V
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
A
 
V
E
 
A
K
 
L
A
 
K
L
 
L
C
 
E
Q
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
R
N
 
G
R
 
T
V
 
E
H
 
Q
T
 
L
V
 
M
A
 
P
A
 
T
E
 
E
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
M
Q
 
N
R
 
R
Q
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
L
D
 
D
P
 
P
C
 
D
I
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
G
 
D
H
 
P
E
 
I
E
 
V
S
 
K
Q
 
G
R
 
V
I
 
L
I
 
T
E
 
R
L
 
L
M
 
I
N
 
R
Q
 
S
L
 
L
K
 
R
Q
 
E
T
 
A
Y
 
L
S
 
D
I
 
L
-
 
T
-
 
T
V
 
I
L
 
I
V
 
V
E
 
S
H
|
H
D
 
D
M
 
V
D
 
P
A
 
E
I
 
T
F
 
L
E
 
S
L
 
I
S
 
A
D
 
D
Q
 
Y
L
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
K
H
 
I
L
 
Q
I
 
G
T
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
Q

4zirA Crystal structure of ecfaa' heterodimer bound to amppnp (see paper)
30% identity, 83% coverage: 20:231/255 of query aligns to 21:219/263 of 4zirA

query
sites
4zirA
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
D
 
N
I
 
V
S
 
S
L
 
L
Q
 
V
F
 
I
Q
 
N
D
 
E
K
 
G
H
 
E
L
 
C
H
 
L
G
 
L
V
 
V
V
 
A
G
 
G
P
 
N
N
x
T
G
 
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
M
 
I
L
 
V
C
 
A
G
 
G
T
 
L
L
 
I
K
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
C
 
D
I
 
V
F
 
L
H
 
Y
K
 
D
G
 
G
D
 
E
Q
 
-
I
 
-
E
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
K
P
 
G
W
 
Y
E
 
E
F
 
-
V
 
I
H
 
R
R
 
R
G
 
N
I
 
I
G
 
G
R
 
I
S
 
A
F
 
F
Q
|
Q
-
 
Y
K
 
P
T
 
E
N
 
D
I
 
Q
Y
 
F
V
 
F
D
 
A
V
 
E
T
 
R
C
 
V
L
 
F
E
 
D
N
 
E
C
 
V
A
 
A
I
 
F
A
 
A
A
 
V
Q
 
K
R
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
N
L
 
F
F
 
Y
A
 
P
S
 
D
R
 
R
H
 
D
S
 
P
N
 
V
K
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
K
G
 
A
A
 
M
E
 
E
K
 
-
A
 
-
L
 
F
C
 
V
Q
 
G
V
 
L
G
 
D
L
 
F
E
 
D
N
 
S
R
 
F
V
 
K
H
 
D
T
x
R
V
 
V
A
 
P
A
 
F
E
x
F
I
 
L
S
|
S
Y
x
G
G
|
G
E
|
E
Q
 
K
R
 
R
Q
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
I
A
 
A
M
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
H
D
 
E
P
 
P
C
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
M
 
L
A
 
V
G
 
G
M
 
L
-
 
D
-
 
R
-
 
E
G
 
G
H
 
K
E
 
T
E
 
D
S
 
L
Q
 
L
R
 
R
I
 
I
I
 
V
E
 
E
L
 
K
M
 
W
N
 
K
Q
 
T
L
 
L
K
 
G
Q
 
K
T
 
T
Y
 
-
S
 
-
I
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
I
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
I
D
 
E
A
 
T
I
 
V
F
 
I
E
 
N
L
 
H
S
 
V
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
T
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
K
G
 
G
T
 
K
H
 
K
L
 
V
I
 
F
T
 
D
G
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
28% identity, 91% coverage: 6:236/255 of query aligns to 4:229/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
I
 
L
L
 
I
E
 
E
T
 
V
E
 
K
S
 
N
L
 
L
S
 
S
K
 
F
H
 
N
W
 
R
G
 
G
G
 
E
I
 
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
D
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
L
 
L
Q
 
N
F
 
I
Q
 
R
D
 
R
K
 
G
H
 
Q
L
 
I
H
 
T
G
 
A
V
 
I
V
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
S
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
M
 
L
L
 
I
C
 
G
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
K
 
V
P
 
P
T
 
D
S
 
Q
G
 
G
C
 
E
I
 
V
F
 
L
H
 
L
K
 
D
G
 
G
D
 
K
Q
 
D
I
 
I
E
 
A
G
 
Q
M
 
M
K
 
S
P
 
R
W
 
Q
E
 
E
-
 
L
F
 
F
V
 
A
H
 
A
R
 
R
G
 
A
-
 
R
I
 
M
G
 
G
R
 
M
S
 
L
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
T
 
G
N
 
A
I
 
L
Y
 
F
V
 
T
D
 
D
V
 
M
T
 
S
C
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
C
 
V
A
 
A
I
 
F
A
 
P
A
 
I
Q
 
R
R
 
A
R
 
H
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
T
R
 
K
H
 
L
S
 
S
N
 
E
K
 
N
L
 
L
V
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
A
 
V
E
 
A
K
 
L
A
 
K
L
 
L
C
 
E
Q
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
R
N
 
G
R
 
T
V
 
E
H
 
Q
T
 
L
V
 
M
A
 
P
A
 
T
E
|
E
I
 
L
S
|
S
Y
 
G
G
 
G
E
x
M
Q
 
N
R
 
R
Q
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
L
D
 
D
P
 
P
C
 
D
I
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
G
 
D
H
 
P
E
 
I
E
 
V
S
 
K
Q
 
G
R
 
V
I
 
L
I
 
T
E
 
R
L
 
L
M
 
I
N
 
R
Q
 
S
L
 
L
K
 
R
Q
 
E
T
 
A
Y
 
L
S
 
D
I
 
L
-
 
T
-
 
T
V
 
I
L
 
I
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
D
 
P
A
 
E
I
 
T
F
 
L
E
 
S
L
 
I
S
 
A
D
 
D
Q
 
Y
L
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
K
H
 
I
L
 
Q
I
 
G
T
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
Q

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
28% identity, 91% coverage: 6:236/255 of query aligns to 4:229/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
I
 
L
L
 
I
E
 
E
T
 
V
E
 
K
S
 
N
L
 
L
S
 
S
K
 
F
H
 
N
W
x
R
G
 
G
G
 
E
I
x
R
K
 
V
A
 
I
L
 
Y
D
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
L
 
L
Q
 
N
F
 
I
Q
 
R
D
 
R
K
 
G
H
 
Q
L
 
I
H
 
T
G
 
A
V
 
I
V
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
M
 
L
L
 
I
C
 
G
G
 
G
T
 
Q
L
 
L
K
 
V
P
 
P
T
 
D
S
 
Q
G
 
G
C
 
E
I
 
V
F
 
L
H
 
L
K
 
D
G
 
G
D
 
K
Q
 
D
I
 
I
E
 
A
G
 
Q
M
 
M
K
 
S
P
 
R
W
 
Q
E
 
E
-
 
L
F
 
F
V
 
A
H
 
A
R
 
R
G
 
A
-
 
R
I
 
M
G
 
G
R
 
M
S
 
L
F
 
F
Q
 
Q
K
 
S
T
 
G
N
 
A
I
 
L
Y
 
F
V
 
T
D
 
D
V
 
M
T
 
S
C
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
C
 
V
A
 
A
I
 
F
A
 
P
A
 
I
Q
 
R
R
 
A
R
 
H
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
T
R
 
K
H
 
L
S
 
S
N
 
E
K
 
N
L
 
L
V
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
L
A
 
V
E
 
A
K
 
L
A
 
K
L
 
L
C
 
E
Q
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
R
N
 
G
R
 
T
V
 
E
H
 
Q
T
 
L
V
 
M
A
 
P
A
 
T
E
 
E
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
M
Q
 
N
R
 
R
Q
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
L
D
 
D
P
 
P
C
 
D
I
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
G
 
D
H
 
P
E
 
I
E
 
V
S
 
K
Q
 
G
R
 
V
I
 
L
I
 
T
E
 
R
L
 
L
M
 
I
N
 
R
Q
 
S
L
 
L
K
 
R
Q
 
E
T
 
A
Y
 
L
S
 
D
I
 
L
-
 
T
-
 
T
V
 
I
L
 
I
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
D
 
P
A
 
E
I
 
T
F
 
L
E
 
S
L
 
I
S
 
A
D
 
D
Q
 
Y
L
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
D
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
K
H
 
I
L
 
Q
I
 
G
T
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
L
R
 
Q

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
26% identity, 92% coverage: 5:238/255 of query aligns to 4:231/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
I
 
I
I
 
I
L
 
V
E
 
K
T
 
N
E
 
V
S
 
S
L
 
K
S
 
V
K
x
F
H
 
K
W
 
K
G
 
G
G
 
K
I
 
V
K
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
N
I
 
V
S
 
N
L
 
I
Q
 
N
F
 
I
Q
 
E
D
 
N
K
 
G
H
 
E
L
 
R
H
 
F
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
M
 
I
L
 
I
C
 
A
G
 
G
T
 
L
L
 
D
K
 
V
P
 
P
T
 
S
S
 
T
G
 
G
C
 
E
I
 
L
F
 
Y
H
 
F
K
 
D
G
 
D
D
 
R
Q
 
L
I
 
V
E
 
A
G
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
M
 
I
K
 
V
P
 
P
W
 
P
E
 
E
F
 
-
V
 
-
H
 
D
R
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
|
Q
K
 
T
T
 
W
N
 
A
I
 
L
Y
 
Y
V
 
P
D
 
N
V
 
L
T
 
T
C
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
C
 
I
A
 
A
I
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
F
N
 
P
L
 
L
F
 
T
A
 
N
S
 
M
R
 
K
H
 
M
S
 
S
N
 
K
K
 
E
L
 
E
V
 
I
R
 
R
E
 
K
G
 
R
A
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
V
L
 
A
C
 
K
Q
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
I
E
 
H
N
 
H
R
 
V
V
 
L
H
 
N
T
 
H
V
 
F
A
 
P
A
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
D
 
D
P
 
P
C
 
S
I
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
G
 
D
-
 
A
-
 
R
H
 
M
E
 
R
E
 
D
S
 
S
Q
 
A
R
 
R
I
 
A
I
 
L
E
 
V
L
 
K
M
 
E
N
 
V
Q
 
Q
L
 
S
K
 
R
Q
 
L
T
 
G
Y
 
V
S
 
T
I
 
L
V
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
D
 
A
A
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
A
L
 
I
S
 
A
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
N
 
K
G
 
G
T
 
K
H
 
L
L
 
V
I
 
Q
T
 
V
G
 
G
T
 
K
V
 
P
D
 
E
E
 
D
V
 
L
R
 
Y
N
 
D
D
 
N

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
26% identity, 92% coverage: 5:238/255 of query aligns to 4:231/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
I
 
I
I
 
I
L
 
V
E
 
K
T
 
N
E
 
V
S
 
S
L
 
K
S
 
V
K
x
F
H
 
K
W
 
K
G
 
G
G
 
K
I
 
V
K
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
N
I
 
V
S
 
N
L
 
I
Q
 
N
F
 
I
Q
 
E
D
 
N
K
 
G
H
 
E
L
 
R
H
 
F
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
M
 
I
L
 
I
C
 
A
G
 
G
T
 
L
L
 
D
K
 
V
P
 
P
T
 
S
S
 
T
G
 
G
C
 
E
I
 
L
F
 
Y
H
 
F
K
 
D
G
 
D
D
 
R
Q
 
L
I
 
V
E
 
A
G
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
M
 
I
K
 
V
P
 
P
W
 
P
E
 
E
F
 
-
V
 
-
H
 
D
R
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
K
 
T
T
 
W
N
 
A
I
 
L
Y
 
Y
V
 
P
D
 
N
V
 
L
T
 
T
C
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
C
 
I
A
 
A
I
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
F
N
 
P
L
 
L
F
 
T
A
 
N
S
 
M
R
 
K
H
 
M
S
 
S
N
 
K
K
 
E
L
 
E
V
 
I
R
 
R
E
 
K
G
 
R
A
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
V
L
 
A
C
 
K
Q
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
I
E
 
H
N
 
H
R
 
V
V
 
L
H
 
N
T
 
H
V
 
F
A
 
P
A
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
S
Y
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
R
L
 
V
E
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
D
 
D
P
 
P
C
 
S
I
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
M
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
G
 
D
-
 
A
-
 
R
H
 
M
E
 
R
E
 
D
S
 
S
Q
 
A
R
 
R
I
 
A
I
 
L
E
 
V
L
 
K
M
 
E
N
 
V
Q
 
Q
L
 
S
K
 
R
Q
 
L
T
 
G
Y
 
V
S
 
T
I
 
L
V
 
L
L
 
V
V
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
D
 
A
A
 
D
I
 
I
F
 
F
E
 
A
L
 
I
S
 
A
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
V
N
 
K
G
 
G
T
 
K
H
 
L
L
 
V
I
 
Q
T
 
V
G
 
G
T
 
K
V
 
P
D
 
E
E
 
D
V
 
L
R
 
Y
N
 
D
D
 
N

Query Sequence

>GFF1119 FitnessBrowser__Marino:GFF1119
MANEIILETESLSKHWGGIKALDDISLQFQDKHLHGVVGPNGAGKSTLLNMLCGTLKPTS
GCIFHKGDQIEGMKPWEFVHRGIGRSFQKTNIYVDVTCLENCAIAAQRRFTGSFNLFASR
HSNKLVREGAEKALCQVGLENRVHTVAAEISYGEQRQLELAMVLATDPCILLLDEPMAGM
GHEESQRIIELMNQLKQTYSIVLVEHDMDAIFELSDQLTVLDNGTHLITGTVDEVRNDTR
VKEAYLGKEKEEEAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory