SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1132 FitnessBrowser__Marino:GFF1132 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1mpyA Structure of catechol 2,3-dioxygenase (metapyrocatechase) from pseudomonas putida mt-2 (see paper)
79% identity, 100% coverage: 1:290/290 of query aligns to 18:307/307 of 1mpyA

query
sites
1mpyA
M
 
M
D
 
S
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
H
 
H
Y
 
Y
T
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
E
 
E
T
 
M
D
 
D
R
 
R
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
W
 
W
S
 
T
E
 
E
V
 
V
D
 
D
K
 
K
F
 
F
S
 
S
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
G
 
G
C
 
M
D
 
D
F
 
F
M
 
M
A
 
G
F
 
F
K
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
D
T
 
A
L
 
L
N
 
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
T
 
A
F
 
Y
G
 
G
V
 
C
E
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
G
E
 
E
L
 
L
K
 
N
D
 
S
C
 
C
G
 
G
R
 
R
R
 
R
V
 
V
R
 
R
F
 
F
T
 
Q
V
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
H
 
H
A
 
H
F
 
F
E
 
E
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
D
 
D
K
 
K
K
 
E
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
K
W
 
W
G
 
G
L
 
L
S
 
N
S
 
D
V
 
V
N
 
N
P
 
P
E
 
E
A
 
A
W
 
W
P
 
P
R
 
R
G
 
D
L
 
L
R
 
K
G
 
G
M
 
M
K
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
R
F
 
F
D
 
D
H
|
H
C
 
A
L
 
L
F
 
M
Y
 
Y
G
 
G
P
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
P
A
 
A
V
 
T
Y
 
Y
D
 
D
I
 
L
F
 
F
V
 
T
N
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
Y
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
E
Q
 
N
G
 
G
T
 
T
R
 
R
V
 
V
S
 
A
Q
 
Q
F
|
F
L
 
L
T
 
S
V
 
L
S
 
S
M
 
T
K
 
K
E
 
A
H
|
H
D
 
D
I
 
V
A
 
A
F
 
F
I
 
I
H
 
H
H
 
H
E
 
P
E
 
E
P
 
K
G
 
G
K
 
R
F
 
L
H
 
H
H
|
H
A
 
V
S
 
S
F
 
F
H
 
H
L
 
L
E
 
E
T
 
T
W
 
W
E
 
E
D
 
D
V
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
T
 
S
M
 
M
T
 
T
D
 
D
T
 
T
S
 
S
I
 
I
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
T
 
T
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
|
L
T
|
T
H
 
H
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
I
Y
|
Y
F
 
F
F
 
F
D
 
D
P
 
P
S
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
N
 
N
E
|
E
V
 
V
F
 
F
C
 
C
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
F
 
N
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
H
 
H
K
 
K
P
 
P
V
 
V
T
 
T
W
 
W
T
 
T
T
 
T
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
F
 
F
Y
 
Y
H
 
H
D
 
D
R
 
R
T
 
I
L
 
L
N
 
N
E
 
E
R
 
R
F
 
F
M
 
M
A
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
T

3hpvA Crystal structure analysis of the 2,3-dioxygenase lapb from pseudomonas sp. Kl28 (see paper)
49% identity, 96% coverage: 1:279/290 of query aligns to 18:297/297 of 3hpvA

query
sites
3hpvA
M
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
G
L
 
I
Q
 
H
H
 
F
Y
 
Y
T
 
R
D
 
N
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
V
E
 
E
T
 
T
D
 
G
R
 
R
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
Y
L
 
F
K
 
K
A
 
C
W
 
W
S
 
D
E
 
E
V
 
R
D
 
D
K
 
H
F
 
S
S
 
C
V
 
Y
V
 
I
L
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
T
P
 
A
G
 
G
C
 
I
D
 
D
F
 
F
M
 
F
A
 
G
F
 
F
K
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
K
D
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
D
K
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
Q
T
 
A
F
 
Y
G
 
G
V
 
L
E
 
T
V
 
T
E
 
T
Q
 
R
V
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
G
E
 
E
L
 
M
K
 
L
D
 
E
C
 
T
G
 
G
R
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
F
 
F
T
 
E
V
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
H
 
H
A
 
L
F
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
D
 
E
K
 
K
K
 
T
Y
 
C
T
 
V
G
 
G
K
 
N
W
 
-
G
 
G
L
 
I
S
 
S
S
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
P
E
 
A
A
 
P
W
 
W
-
 
N
P
 
A
R
 
Q
G
 
R
L
 
E
R
 
H
G
 
G
M
 
I
K
 
A
A
 
P
V
 
I
R
 
Q
F
 
L
D
 
D
H
|
H
C
 
C
L
 
L
F
 
L
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
E
 
N
L
 
I
A
 
A
A
 
E
V
 
V
Y
 
Q
D
 
K
I
 
I
F
 
F
V
 
T
N
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
Y
L
 
L
A
 
V
E
 
E
Q
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
S
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
-
 
D
T
 
S
R
 
D
V
 
M
S
 
G
Q
 
I
F
 
W
L
 
L
T
 
S
V
 
C
S
 
S
M
 
H
K
 
K
E
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
F
I
 
V
H
 
E
H
 
Y
E
 
P
E
 
E
P
 
K
G
 
G
K
 
K
F
 
L
H
 
H
H
|
H
A
 
C
S
|
S
F
 
F
H
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
S
W
 
W
E
 
E
D
 
Q
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
M
T
 
S
M
 
M
T
 
N
D
 
E
T
 
V
S
 
N
I
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
T
 
T
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
 
V
T
 
T
H
 
R
G
 
G
K
 
C
T
 
T
I
 
I
Y
|
Y
F
 
A
F
 
W
D
 
D
P
 
P
S
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
N
 
F
E
|
E
V
 
T
F
 
F
C
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
Y
Y
 
H
F
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
H
 
Y
K
 
E
P
 
P
V
 
L
T
 
S
W
 
W
T
 
T
T
 
Y
D
 
D
E
 
N
L
 
F
G
 
A
K
 
Q
A
 
G
I
 
L
F
 
D
Y
 
Y
H
 
P
D
 
Q
R
 
R

3hq0B Crystal structure analysis of the 2,3-dioxygenase lapb from pseudomonas in complex with a product (see paper)
50% identity, 93% coverage: 1:270/290 of query aligns to 18:288/288 of 3hq0B

query
sites
3hq0B
M
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
G
L
 
I
Q
 
H
H
 
F
Y
 
Y
T
 
R
D
 
N
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
V
E
 
E
T
 
T
D
 
G
R
 
R
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
Y
L
 
F
K
 
K
A
 
C
W
 
W
S
 
D
E
 
E
V
 
R
D
 
D
K
 
H
F
 
S
S
 
C
V
 
Y
V
 
I
L
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
T
P
 
A
G
 
G
C
 
I
D
 
D
F
 
F
M
 
F
A
 
G
F
 
F
K
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
K
D
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
D
K
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
Q
T
 
A
F
 
Y
G
 
G
V
 
L
E
 
T
V
 
T
E
 
T
Q
 
R
V
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
G
E
 
E
L
 
M
K
 
L
D
 
E
C
 
T
G
 
G
R
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
F
 
F
T
 
E
V
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
H
 
H
A
 
L
F
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
D
 
E
K
 
K
K
 
T
Y
 
C
T
 
V
G
 
G
K
 
N
W
 
-
G
 
G
L
 
I
S
 
S
S
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
P
E
 
A
A
 
P
W
 
W
-
 
N
P
 
A
R
 
Q
G
 
R
L
 
E
R
 
H
G
 
G
M
 
I
K
 
A
A
 
P
V
 
I
R
 
Q
F
 
L
D
 
D
H
|
H
C
 
C
L
|
L
F
 
L
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
E
 
N
L
 
I
A
 
A
A
 
E
V
 
V
Y
 
Q
D
 
K
I
 
I
F
 
F
V
 
T
N
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
Y
L
 
L
A
 
V
E
 
E
Q
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
S
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
-
 
D
T
 
S
R
 
D
V
 
M
S
 
G
Q
 
I
F
x
W
L
 
L
T
 
S
V
 
C
S
 
S
M
 
H
K
 
K
E
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
F
I
 
V
H
 
E
H
 
Y
E
 
P
E
 
E
P
 
K
G
 
G
K
 
K
F
 
L
H
|
H
H
|
H
A
 
C
S
|
S
F
 
F
H
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
S
W
 
W
E
 
E
D
 
Q
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
M
T
 
S
M
 
M
T
 
N
D
 
E
T
 
V
S
 
N
I
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
T
 
T
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
x
V
T
|
T
H
 
R
G
 
G
K
 
C
T
 
T
I
 
I
Y
|
Y
F
 
A
F
 
W
D
 
D
P
 
P
S
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
N
 
F
E
|
E
V
 
T
F
 
F
C
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
Y
Y
 
H
F
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
H
 
Y
K
 
E
P
 
P
V
 
L
T
 
S
W
 
W
T
 
T
T
 
Y
D
 
D
E
 
N
L
 
F

3hpyA Crystal structure analysis of the 2,3-dioxygenase lapb from pseudomonas in the complex with 4-methylcatechol (see paper)
50% identity, 93% coverage: 1:270/290 of query aligns to 18:288/288 of 3hpyA

query
sites
3hpyA
M
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
G
L
 
I
Q
 
H
H
 
F
Y
 
Y
T
 
R
D
 
N
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
V
E
 
E
T
 
T
D
 
G
R
 
R
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
V
Y
 
Y
L
 
F
K
 
K
A
 
C
W
 
W
S
 
D
E
 
E
V
 
R
D
 
D
K
 
H
F
 
S
S
 
C
V
 
Y
V
 
I
L
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
A
D
 
D
E
 
T
P
 
A
G
 
G
C
 
I
D
 
D
F
 
F
M
 
F
A
 
G
F
 
F
K
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
K
D
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
D
K
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
Q
T
 
A
F
 
Y
G
 
G
V
 
L
E
 
T
V
 
T
E
 
T
Q
 
R
V
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
G
E
 
E
L
 
M
K
 
L
D
 
E
C
 
T
G
 
G
R
 
E
R
 
R
V
 
V
R
 
R
F
 
F
T
 
E
V
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
H
 
H
A
 
L
F
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
D
 
E
K
 
K
K
 
T
Y
 
C
T
 
V
G
 
G
K
 
N
W
 
-
G
 
G
L
 
I
S
 
S
S
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
P
E
 
A
A
 
P
W
 
W
-
 
N
P
 
A
R
 
Q
G
 
R
L
 
E
R
 
H
G
 
G
M
 
I
K
 
A
A
 
P
V
 
I
R
 
Q
F
 
L
D
 
D
H
|
H
C
 
C
L
 
L
F
 
L
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
E
 
N
L
 
I
A
 
A
A
 
E
V
 
V
Y
 
Q
D
 
K
I
 
I
F
 
F
V
 
T
N
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
Y
L
 
L
A
 
V
E
 
E
Q
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
S
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
-
 
D
T
 
S
R
 
D
V
 
M
S
 
G
Q
 
I
F
x
W
L
 
L
T
 
S
V
 
C
S
 
S
M
 
H
K
 
K
E
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
F
I
 
V
H
 
E
H
 
Y
E
 
P
E
 
E
P
 
K
G
 
G
K
 
K
F
 
L
H
 
H
H
|
H
A
 
C
S
|
S
F
 
F
H
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
S
W
 
W
E
 
E
D
 
Q
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
M
T
 
S
M
 
M
T
 
N
D
 
E
T
 
V
S
 
N
I
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
T
 
T
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
x
V
T
|
T
H
 
R
G
 
G
K
 
C
T
 
T
I
 
I
Y
|
Y
F
 
A
F
 
W
D
 
D
P
 
P
S
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
N
 
F
E
|
E
V
 
T
F
 
F
C
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
Y
Y
 
H
F
 
P
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
H
 
Y
K
 
E
P
 
P
V
 
L
T
 
S
W
 
W
T
 
T
T
 
Y
D
 
D
E
 
N
L
x
F

5zsxA Catechol 2,3-dioxygenase with 3-fluorocatechol from diaphorobacter sp ds2
43% identity, 100% coverage: 1:290/290 of query aligns to 16:314/314 of 5zsxA

query
sites
5zsxA
M
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
H
 
H
Y
 
Y
T
 
E
D
 
N
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
M
I
 
K
E
 
T
T
 
T
D
 
M
R
 
K
D
 
D
D
 
K
Q
 
A
G
 
G
R
 
N
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
C
W
 
W
S
 
D
E
 
E
V
 
W
D
 
D
K
 
K
F
 
Y
S
 
S
V
 
V
V
 
I
L
 
L
R
 
T
E
 
P
A
 
S
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
C
 
M
D
 
N
F
 
H
M
 
L
A
 
A
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
L
 
E
D
 
K
E
 
E
D
 
A
T
 
D
L
 
L
N
 
E
Q
 
A
L
 
L
E
 
Q
K
 
Q
D
 
K
L
 
I
V
 
E
T
 
A
F
 
W
G
 
G
V
 
V
E
 
K
V
 
T
E
 
T
Q
 
M
V
 
L
P
 
D
A
 
E
E
 
G
E
 
T
L
 
L
K
 
P
D
 
S
C
 
T
G
 
G
R
 
R
R
 
M
V
 
L
R
 
Q
F
 
F
T
 
K
V
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
H
 
H
A
 
E
F
 
M
E
 
R
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
D
 
S
K
 
K
K
 
E
Y
 
F
T
 
V
G
 
G
K
 
T
W
 
-
G
 
D
L
 
V
S
 
G
S
 
N
V
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
D
A
 
P
W
 
W
P
 
P
R
 
D
G
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
G
M
 
A
K
 
G
A
 
A
V
 
H
R
 
W
F
 
L
D
|
D
H
|
H
C
 
C
L
 
L
F
 
L
-
 
V
-
 
C
-
 
E
Y
 
M
G
 
N
P
 
P
E
 
E
-
 
A
-
 
G
L
 
I
A
 
N
A
 
T
V
 
V
Y
 
A
D
 
D
-
 
N
-
 
T
-
 
R
I
 
F
F
 
V
V
 
T
N
 
E
V
 
C
L
 
L
G
 
D
F
 
F
D
 
F
L
 
L
A
 
T
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
-
 
V
D
 
G
P
 
P
Q
 
G
G
 
G
T
 
S
-
 
I
R
 
Q
V
 
A
S
 
T
Q
 
T
F
|
F
L
 
L
T
 
A
V
 
R
S
 
T
M
 
T
K
x
T
E
 
P
H
|
H
D
|
D
I
 
I
A
 
A
F
 
F
I
 
V
H
 
G
H
 
G
E
 
P
E
 
T
P
 
S
G
 
G
K
 
-
F
 
L
H
 
H
H
|
H
A
 
I
S
 
A
F
 
F
H
 
F
L
 
L
E
 
D
T
 
S
W
 
W
E
 
H
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
V
I
 
M
T
 
A
M
 
K
T
 
N
D
 
K
T
 
V
S
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
G
 
A
P
 
P
T
 
T
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
x
I
T
|
T
H
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
I
 
I
Y
|
Y
F
 
F
F
 
F
D
 
D
P
 
P
S
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
N
 
N
E
|
E
V
 
T
F
|
F
C
 
A
G
 
G
G
 
L
D
 
G
Y
 
Y
F
 
L
Y
 
A
P
 
Q
D
 
R
H
 
D
K
 
R
P
 
P
V
 
V
-
 
T
T
 
T
W
 
W
T
 
T
T
 
E
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
S
A
 
A
I
|
I
F
 
F
Y
 
Y
H
 
H
D
 
T
R
 
G
T
 
Y
L
 
L
N
 
E
E
 
P
R
 
S
F
|
F
M
 
T
A
 
D
V
 
V
L
 
Y
T
 
T

5znhA Catechol 2,3-dioxygenase with 4-methyl catechol from diaphorobacter sp ds2
43% identity, 100% coverage: 1:290/290 of query aligns to 16:314/314 of 5znhA

query
sites
5znhA
M
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
H
 
H
Y
 
Y
T
 
E
D
 
N
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
M
I
 
K
E
 
T
T
 
T
D
 
M
R
 
K
D
 
D
D
 
K
Q
 
A
G
 
G
R
 
N
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
C
W
 
W
S
 
D
E
 
E
V
 
W
D
 
D
K
 
K
F
 
Y
S
 
S
V
 
V
V
 
I
L
 
L
R
 
T
E
 
P
A
 
S
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
G
 
G
C
 
M
D
 
N
F
 
H
M
 
L
A
 
A
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
L
 
E
D
 
K
E
 
E
D
 
A
T
 
D
L
 
L
N
 
E
Q
 
A
L
 
L
E
 
Q
K
 
Q
D
 
K
L
 
I
V
 
E
T
 
A
F
 
W
G
 
G
V
 
V
E
 
K
V
 
T
E
 
T
Q
 
M
V
 
L
P
 
D
A
 
E
E
 
G
E
 
T
L
 
L
K
 
P
D
 
S
C
 
T
G
 
G
R
 
R
R
 
M
V
 
L
R
 
Q
F
 
F
T
 
K
V
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
H
 
H
A
 
E
F
 
M
E
 
R
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
D
 
S
K
 
K
K
 
E
Y
 
F
T
 
V
G
 
G
K
 
T
W
 
-
G
 
D
L
 
V
S
 
G
S
 
N
V
 
I
N
 
N
P
 
P
E
 
D
A
 
P
W
 
W
P
 
P
R
 
D
G
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
G
M
 
A
K
 
G
A
 
A
V
 
H
R
 
W
F
 
L
D
|
D
H
|
H
C
 
C
L
 
L
F
 
L
-
 
V
-
 
C
-
 
E
Y
 
M
G
 
N
P
 
P
E
 
E
-
 
A
-
 
G
L
 
I
A
 
N
A
 
T
V
 
V
Y
 
A
D
 
D
-
 
N
-
 
T
-
 
R
I
 
F
F
 
V
V
 
T
N
 
E
V
 
C
L
 
L
G
 
D
F
 
F
D
 
F
L
 
L
A
 
T
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
-
 
V
D
 
G
P
 
P
Q
 
G
G
 
G
T
 
S
-
 
I
R
 
Q
V
 
A
S
 
T
Q
 
T
F
|
F
L
 
L
T
 
A
V
 
R
S
 
T
M
 
T
K
x
T
E
 
P
H
|
H
D
|
D
I
 
I
A
 
A
F
 
F
I
 
V
H
 
G
H
 
G
E
 
P
E
 
T
P
 
S
G
 
G
K
 
-
F
 
L
H
 
H
H
|
H
A
 
I
S
 
A
F
 
F
H
 
F
L
 
L
E
 
D
T
 
S
W
 
W
E
 
H
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
V
I
 
M
T
 
A
M
 
K
T
 
N
D
 
K
T
 
V
S
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
G
 
A
P
 
P
T
 
T
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
x
I
T
|
T
H
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
I
 
I
Y
|
Y
F
 
F
F
 
F
D
 
D
P
 
P
S
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
N
 
N
E
|
E
V
 
T
F
|
F
C
 
A
G
 
G
G
 
L
D
 
G
Y
 
Y
F
 
L
Y
 
A
P
 
Q
D
 
R
H
 
D
K
 
R
P
 
P
V
 
V
-
 
T
T
 
T
W
 
W
T
 
T
T
 
E
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
S
A
 
A
I
|
I
F
 
F
Y
 
Y
H
 
H
D
 
T
R
 
G
T
 
Y
L
 
L
N
 
E
E
 
P
R
 
S
F
 
F
M
 
T
A
 
D
V
 
V
L
 
Y
T
 
T

3lm4A Crystal structure of 2,3-dihydroxy biphenyl dioxygenase from rhodococcus sp. (Strain rha1)
28% identity, 92% coverage: 3:270/290 of query aligns to 21:290/325 of 3lm4A

query
sites
3lm4A
E
 
E
A
 
T
L
 
L
Q
 
D
H
 
F
Y
 
F
T
 
T
D
 
K
L
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
M
I
 
Y
E
 
V
T
 
T
D
 
H
R
 
R
D
 
E
D
 
G
Q
 
Q
G
 
S
R
 
-
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
A
 
G
W
 
Y
S
 
E
E
 
D
V
 
P
D
 
Y
K
 
P
F
 
W
S
 
S
V
 
L
V
 
K
L
 
I
R
 
T
E
 
E
A
 
A
D
 
P
E
 
E
P
 
A
G
 
G
C
 
M
D
 
G
F
 
H
M
 
A
A
 
A
F
 
M
K
 
R
V
 
T
L
 
S
D
 
S
E
 
P
D
 
E
T
 
A
L
 
L
N
 
E
Q
 
R
L
 
R
E
 
A
K
 
K
D
 
S
L
 
L
V
 
T
T
 
D
F
 
-
G
 
-
V
 
G
E
 
N
V
 
V
E
 
D
Q
 
G
V
 
T
P
 
W
A
 
S
E
 
E
E
 
D
L
 
Q
K
 
F
D
 
G
C
 
Y
G
 
G
R
 
K
R
 
T
V
 
F
R
 
E
F
 
Y
T
 
Q
V
 
S
P
 
P
S
 
D
G
 
G
H
 
H
A
 
N
F
 
L
E
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
W
D
 
E
-
 
A
K
 
E
K
 
K
Y
 
Y
T
 
V
G
 
A
K
 
P
W
 
P
G
 
E
L
 
L
S
 
R
S
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
L
V
 
T
N
 
R
P
 
P
E
 
S
A
 
K
W
 
K
P
 
P
R
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
I
K
 
P
A
 
V
V
 
K
R
 
R
F
 
I
D
 
D
H
|
H
C
 
L
L
 
N
F
 
L
Y
 
M
G
 
S
P
 
S
E
 
D
L
 
V
A
 
T
A
 
A
V
 
V
Y
 
K
D
 
D
I
 
S
F
 
F
V
 
E
N
 
R
V
 
H
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
R
L
 
T
A
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
V
L
 
V
D
 
D
P
 
-
Q
 
G
G
 
N
T
 
V
R
 
E
V
x
I
S
 
G
Q
 
A
F
x
W
L
 
M
T
 
S
V
 
S
S
 
N
M
 
L
K
 
L
E
 
G
H
|
H
D
 
E
I
 
V
A
 
A
F
 
C
I
x
M
H
x
R
H
 
D
E
x
M
E
 
T
P
 
G
G
 
G
-
 
H
-
 
G
K
 
K
F
 
L
H
 
H
H
|
H
A
 
L
S
 
A
F
 
F
H
 
F
L
 
Y
E
 
G
T
 
T
W
 
G
E
 
Q
D
 
H
V
 
N
L
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
V
D
 
E
L
 
M
I
 
F
T
 
R
M
 
D
T
 
Y
D
 
D
T
 
I
S
 
Q
I
 
I
D
 
E
I
 
A
G
 
G
P
 
P
T
 
D
R
 
K
H
|
H
G
 
G
L
x
I
T
|
T
H
 
Q
G
 
S
K
 
Q
T
 
F
I
 
L
Y
|
Y
F
 
V
F
 
F
D
 
E
P
 
P
S
 
G
G
 
G
N
 
N
R
 
R
N
 
I
E
|
E
V
 
L
F
 
F
C
 
G
G
 
E
G
 
A
D
 
G
Y
 
Y
F
 
L
Y
 
H
-
 
L
-
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
A
K
 
E
P
 
T
V
 
K
T
 
T
W
 
W
T
 
Q
T
 
M
D
 
S
E
 
D
L
 
I

Sites not aligning to the query:

7q2aB Crystal structure of aphc in complex with 4-ethylcatechol (see paper)
28% identity, 92% coverage: 3:270/290 of query aligns to 21:290/352 of 7q2aB

query
sites
7q2aB
E
 
E
A
 
T
L
 
L
Q
 
D
H
 
F
Y
 
F
T
 
T
D
 
K
L
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
M
I
 
Y
E
 
V
T
 
T
D
 
H
R
 
R
D
 
E
D
 
G
Q
 
Q
G
 
S
R
 
-
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
A
 
G
W
 
Y
S
 
E
E
 
D
V
 
P
D
 
Y
K
 
P
F
 
W
S
 
S
V
 
L
V
 
K
L
 
I
R
 
T
E
 
E
A
 
A
D
 
P
E
 
E
P
 
A
G
 
G
C
 
M
D
 
G
F
 
H
M
 
A
A
 
A
F
 
M
K
 
R
V
 
T
L
 
S
D
 
S
E
 
P
D
 
E
T
 
A
L
 
L
N
 
E
Q
 
R
L
 
R
E
 
A
K
 
K
D
 
S
L
 
L
V
 
T
T
 
D
F
 
-
G
 
-
V
 
G
E
 
N
V
 
V
E
 
D
Q
 
G
V
 
T
P
 
W
A
 
S
E
 
E
E
 
D
L
 
Q
K
 
F
D
 
G
C
 
Y
G
 
G
R
 
K
R
 
T
V
 
F
R
 
E
F
 
Y
T
 
Q
V
 
S
P
 
P
S
 
D
G
 
G
H
 
H
A
 
N
F
 
L
E
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
W
D
 
E
-
 
A
K
 
E
K
 
K
Y
 
Y
T
 
V
G
 
A
K
 
P
W
 
P
G
 
E
L
 
L
S
 
R
S
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
L
V
 
T
N
 
R
P
 
P
E
 
S
A
 
K
W
 
K
P
 
P
R
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
I
K
 
P
A
 
V
V
 
K
R
 
R
F
 
I
D
 
D
H
|
H
C
 
L
L
 
N
F
 
L
Y
 
M
G
 
S
P
 
S
E
 
D
L
 
V
A
 
T
A
 
A
V
 
V
Y
 
K
D
 
D
I
 
S
F
 
F
V
 
E
N
 
R
V
 
H
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
R
L
 
T
A
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
V
L
 
V
D
 
D
P
 
-
Q
 
G
G
 
N
T
 
V
R
 
E
V
 
I
S
 
G
Q
 
A
F
x
W
L
 
M
T
 
S
V
 
S
S
 
N
M
 
L
K
 
L
E
 
G
H
|
H
D
 
E
I
 
V
A
 
A
F
 
C
I
 
M
H
 
R
H
 
D
E
 
M
E
 
T
P
 
G
G
 
G
-
 
H
-
 
G
K
 
K
F
 
L
H
 
H
H
|
H
A
 
L
S
 
A
F
 
F
H
 
F
L
 
Y
E
 
G
T
 
T
W
 
G
E
 
Q
D
 
H
V
 
N
L
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
V
D
 
E
L
 
M
I
 
F
T
 
R
M
 
D
T
 
Y
D
 
D
T
 
I
S
 
Q
I
 
I
D
 
E
I
 
A
G
 
G
P
 
P
T
 
D
R
 
K
H
|
H
G
 
G
L
x
I
T
|
T
H
 
Q
G
 
S
K
 
Q
T
 
F
I
 
L
Y
|
Y
F
 
V
F
 
F
D
 
E
P
 
P
S
 
G
G
 
G
N
 
N
R
 
R
N
 
I
E
|
E
V
 
L
F
 
F
C
 
G
G
 
E
G
 
A
D
 
G
Y
 
Y
F
 
L
Y
 
H
-
 
L
-
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
A
K
 
E
P
 
T
V
 
K
T
 
T
W
 
W
T
 
Q
T
 
M
D
 
S
E
 
D
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1f1uA Crystal structure of homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase from arthrobacter globiformis (native, low temperature) (see paper)
25% identity, 91% coverage: 1:265/290 of query aligns to 27:284/322 of 1f1uA

query
sites
1f1uA
M
 
L
D
 
A
E
 
K
A
 
S
L
 
R
Q
 
E
H
 
F
Y
 
Y
T
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
H
E
 
V
T
 
T
D
 
E
R
 
-
D
 
E
D
 
D
Q
 
E
G
 
N
R
 
T
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
A
 
S
W
 
L
S
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
I
K
 
H
F
 
H
S
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
A
 
G
D
 
P
E
 
I
P
 
A
G
 
A
C
 
V
D
 
A
F
 
A
M
 
F
A
 
A
F
 
Y
K
 
R
V
 
V
L
 
K
D
 
S
E
 
P
D
 
A
T
 
E
L
 
V
N
 
D
Q
 
A
L
 
A
E
 
E
K
 
A
D
 
Y
L
 
Y
V
 
K
T
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
R
V
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
R
P
 
K
A
 
E
E
 
G
E
 
F
L
 
T
K
 
K
D
 
G
C
 
I
G
 
G
R
 
D
R
 
S
V
 
V
R
 
R
F
 
V
T
 
E
V
 
D
P
 
P
S
 
L
G
 
G
H
 
F
A
 
P
F
 
Y
E
 
E
L
 
F
F
 
F
A
 
Y
D
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
H
-
 
V
K
 
E
K
 
R
Y
 
L
T
 
T
G
 
Q
K
 
R
W
 
Y
G
 
D
L
 
L
S
 
Y
S
 
S
V
 
A
N
 
G
P
 
-
E
 
-
A
 
-
W
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
E
A
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
L
D
 
D
H
|
H
C
 
F
L
 
N
F
 
Q
Y
 
V
G
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
V
 
G
Y
 
-
D
 
R
I
 
A
F
 
Y
V
 
L
N
 
E
V
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
R
L
 
V
A
 
S
E
 
E
Q
 
D
V
 
I
L
 
K
D
 
D
P
 
S
Q
 
D
G
 
G
T
 
V
R
 
T
V
 
Y
S
 
A
Q
 
A
F
 
W
L
 
M
T
 
H
V
 
R
S
 
K
M
 
Q
K
 
T
E
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
T
A
 
A
F
 
L
I
 
T
H
 
G
H
 
G
E
 
N
E
 
G
P
 
P
G
 
-
K
 
R
F
 
M
H
 
H
H
|
H
A
 
V
S
 
A
F
 
F
H
 
A
L
 
T
E
 
H
T
 
E
W
 
K
E
 
H
D
 
N
V
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
I
A
 
C
D
 
D
L
 
K
I
 
M
T
 
G
M
 
A
T
 
L
D
 
R
T
 
I
S
 
S
-
 
D
-
 
R
I
 
I
D
 
E
I
 
R
G
 
G
P
 
P
T
 
G
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
 
V
T
 
S
H
 
N
G
 
A
K
 
F
T
 
Y
I
 
L
Y
|
Y
F
 
I
F
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
D
G
 
G
N
 
H
R
 
R
N
 
I
E
|
E
V
 
I
F
 
Y
C
 
T
G
 
-
G
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
Y
 
T
-
 
G
-
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
N
K
 
P
P
 
T
V
 
I
T
 
T
W
 
W

1f1vA Anaerobic substrate complex of homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase from arthrobacter globiformis. (Complex with 3,4- dihydroxyphenylacetate) (see paper)
25% identity, 91% coverage: 1:265/290 of query aligns to 25:282/320 of 1f1vA

query
sites
1f1vA
M
 
L
D
 
A
E
 
K
A
 
S
L
 
R
Q
 
E
H
 
F
Y
 
Y
T
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
H
E
 
V
T
 
T
D
 
E
R
 
-
D
 
E
D
 
D
Q
 
E
G
 
N
R
 
T
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
A
 
S
W
 
L
S
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
I
K
 
H
F
 
H
S
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
A
 
G
D
 
P
E
 
I
P
 
A
G
 
A
C
 
V
D
 
A
F
 
A
M
 
F
A
 
A
F
 
Y
K
 
R
V
 
V
L
 
K
D
 
S
E
 
P
D
 
A
T
 
E
L
 
V
N
 
D
Q
 
A
L
 
A
E
 
E
K
 
A
D
 
Y
L
 
Y
V
 
K
T
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
R
V
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
R
P
 
K
A
 
E
E
 
G
E
 
F
L
 
T
K
 
K
D
 
G
C
 
I
G
 
G
R
 
D
R
 
S
V
 
V
R
 
R
F
 
V
T
 
E
V
 
D
P
 
P
S
 
L
G
 
G
H
 
F
A
 
P
F
 
Y
E
 
E
L
 
F
F
 
F
A
 
Y
D
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
H
-
 
V
K
 
E
K
 
R
Y
 
L
T
 
T
G
 
Q
K
 
R
W
 
Y
G
 
D
L
 
L
S
 
Y
S
 
S
V
 
A
N
 
G
P
 
-
E
 
-
A
 
-
W
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
E
A
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
L
D
 
D
H
|
H
C
 
F
L
 
N
F
 
Q
Y
 
V
G
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
V
 
G
Y
 
-
D
 
R
I
 
A
F
 
Y
V
 
L
N
 
E
V
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
R
L
 
V
A
 
S
E
 
E
Q
 
D
V
 
I
L
 
K
D
 
D
P
 
S
Q
 
D
G
 
G
T
 
V
R
 
T
V
 
Y
S
 
A
Q
 
A
F
x
W
L
 
M
T
 
H
V
 
R
S
 
K
M
 
Q
K
 
T
E
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
T
A
 
A
F
 
L
I
 
T
H
 
G
H
 
G
E
 
N
E
 
G
P
 
P
G
 
-
K
 
R
F
 
M
H
 
H
H
|
H
A
 
V
S
 
A
F
 
F
H
 
A
L
 
T
E
 
H
T
 
E
W
 
K
E
 
H
D
 
N
V
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
I
A
 
C
D
 
D
L
 
K
I
 
M
T
 
G
M
 
A
T
 
L
D
 
R
T
 
I
S
 
S
-
 
D
-
 
R
I
 
I
D
 
E
I
x
R
G
 
G
P
 
P
T
 
G
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
x
V
T
x
S
H
 
N
G
 
A
K
 
F
T
 
Y
I
 
L
Y
|
Y
F
 
I
F
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
D
G
 
G
N
 
H
R
 
R
N
 
I
E
|
E
V
 
I
F
x
Y
C
 
T
G
 
-
G
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
Y
 
T
-
 
G
-
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
N
K
 
P
P
 
T
V
 
I
T
 
T
W
 
W

Sites not aligning to the query:

3eckC Structure of e323l homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase from brevibacterium fuscum in complex with putative o-o bond cleavage intermediate formed via in crystallo reaction with 4-sulfonyl catechol at low oxygen concentrations (see paper)
24% identity, 89% coverage: 8:266/290 of query aligns to 32:283/359 of 3eckC

query
sites
3eckC
Y
 
Y
T
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
-
E
 
H
T
 
V
D
 
S
R
 
Y
D
 
E
D
 
D
Q
 
E
G
 
N
R
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
A
 
S
W
 
F
S
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
I
K
 
H
F
 
H
S
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
T
E
 
K
A
 
G
D
 
P
E
 
V
P
 
A
G
 
A
C
 
L
D
 
K
F
 
A
M
 
M
A
 
A
F
 
F
K
 
R
V
 
V
L
 
R
D
 
T
E
 
P
D
 
E
T
 
D
L
 
V
N
 
D
Q
 
K
L
 
A
E
 
E
K
 
A
D
 
Y
L
 
Y
V
 
Q
T
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
R
V
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
R
P
 
K
A
 
D
E
 
G
E
 
F
L
 
V
K
 
K
D
 
G
C
 
I
G
 
G
R
 
D
R
 
A
V
 
L
R
 
R
F
 
V
T
 
E
V
 
D
P
 
P
S
 
L
G
 
G
H
 
F
A
 
P
F
 
Y
E
 
E
L
 
F
F
 
F
A
 
F
D
 
E
K
 
T
K
 
T
Y
 
H
T
 
V
G
 
E
K
 
R
W
 
L
G
 
H
L
 
M
S
 
R
S
 
Y
V
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
D
A
 
L
W
 
Y
P
 
S
R
 
A
G
 
G
L
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
E
A
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
L
D
 
D
H
|
H
C
 
F
L
x
N
F
 
Q
Y
 
V
G
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
V
 
G
Y
 
R
D
 
K
I
 
-
F
 
Y
V
 
L
N
 
E
V
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
R
L
 
V
A
 
T
E
 
E
Q
 
D
V
 
I
L
 
Q
D
 
D
P
 
D
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
R
 
T
V
 
Y
S
 
A
Q
 
A
F
x
W
L
 
M
T
 
H
V
 
R
S
 
K
M
 
G
K
 
T
E
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
T
A
 
A
F
 
L
I
 
T
H
 
G
H
 
G
E
 
N
E
 
G
P
 
P
G
 
-
K
 
R
F
 
L
H
 
H
H
|
H
A
 
V
S
 
A
F
 
F
H
 
S
L
 
T
E
 
H
T
 
E
W
 
K
E
 
H
D
 
N
V
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
I
A
 
C
D
 
D
L
 
K
I
 
M
T
 
G
M
 
A
T
 
L
D
 
R
T
 
I
S
 
S
-
 
D
-
 
R
I
 
I
D
 
E
I
x
R
G
 
G
P
 
P
T
 
G
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
x
V
T
x
S
H
 
N
G
 
A
K
 
F
T
 
Y
I
 
L
Y
|
Y
F
 
I
F
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
D
G
 
N
N
 
H
R
 
R
N
 
I
E
|
E
V
 
I
F
x
Y
C
 
T
G
 
-
G
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
Y
 
T
-
 
G
-
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
N
K
 
P
P
 
T
V
 
I
T
 
T
W
 
W
T
 
N

Sites not aligning to the query:

1q0cA Anerobic substrate complex of homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase from brevibacterium fuscum. (Complex with 3,4-dihydroxyphenylacetate) (see paper)
24% identity, 90% coverage: 8:267/290 of query aligns to 32:284/319 of 1q0cA

query
sites
1q0cA
Y
 
Y
T
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
-
E
 
H
T
 
V
D
 
S
R
 
Y
D
 
E
D
 
D
Q
 
E
G
 
N
R
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
A
 
S
W
 
F
S
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
I
K
 
H
F
 
H
S
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
T
E
 
K
A
 
G
D
 
P
E
 
V
P
 
A
G
 
A
C
 
L
D
 
K
F
 
A
M
 
M
A
 
A
F
 
F
K
 
R
V
 
V
L
 
R
D
 
T
E
 
P
D
 
E
T
 
D
L
 
V
N
 
D
Q
 
K
L
 
A
E
 
E
K
 
A
D
 
Y
L
 
Y
V
 
Q
T
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
R
V
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
R
P
 
K
A
 
D
E
 
G
E
 
F
L
 
V
K
 
K
D
 
G
C
 
I
G
 
G
R
 
D
R
 
A
V
 
L
R
 
R
F
 
V
T
 
E
V
 
D
P
 
P
S
 
L
G
 
G
H
 
F
A
 
P
F
 
Y
E
 
E
L
 
F
F
 
F
A
 
F
D
 
E
K
 
T
K
 
T
Y
 
H
T
 
V
G
 
E
K
 
R
W
 
L
G
 
H
L
 
M
S
 
R
S
 
Y
V
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
D
A
 
L
W
 
Y
P
 
S
R
 
A
G
 
G
L
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
E
A
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
L
D
 
D
H
|
H
C
 
F
L
x
N
F
 
Q
Y
 
V
G
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
V
 
G
Y
 
R
D
 
K
I
 
-
F
 
Y
V
 
L
N
 
E
V
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
R
L
 
V
A
 
T
E
 
E
Q
 
D
V
 
I
L
 
Q
D
 
D
P
 
D
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
R
 
T
V
 
Y
S
 
A
Q
 
A
F
x
W
L
 
M
T
 
H
V
 
R
S
 
K
M
 
G
K
 
T
E
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
T
A
 
A
F
 
L
I
 
T
H
 
G
H
 
G
E
 
N
E
 
G
P
 
P
G
 
-
K
 
R
F
 
L
H
 
H
H
|
H
A
 
V
S
 
A
F
 
F
H
 
S
L
 
T
E
 
H
T
 
E
W
 
K
E
 
H
D
 
N
V
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
I
A
 
C
D
 
D
L
 
K
I
 
M
T
 
G
M
 
A
T
 
L
D
 
R
T
 
I
S
 
S
-
 
D
-
 
R
I
 
I
D
 
E
I
x
R
G
 
G
P
 
P
T
 
G
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
x
V
T
x
S
H
 
N
G
 
A
K
 
F
T
 
Y
I
 
L
Y
|
Y
F
 
I
F
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
D
G
 
N
N
 
H
R
 
R
N
 
I
E
|
E
V
 
I
F
x
Y
C
 
T
G
 
-
G
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
Y
 
T
-
 
G
-
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
N
K
 
P
P
 
T
V
 
I
T
 
T
W
 
W
T
 
N
T
 
V

Sites not aligning to the query:

1f1xA Crystal structure of homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase from brevibacterium fuscum (see paper)
24% identity, 90% coverage: 8:267/290 of query aligns to 32:284/319 of 1f1xA

query
sites
1f1xA
Y
 
Y
T
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
-
E
 
H
T
 
V
D
 
S
R
 
Y
D
 
E
D
 
D
Q
 
E
G
 
N
R
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
A
 
S
W
 
F
S
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
I
K
 
H
F
 
H
S
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
T
E
 
K
A
 
G
D
 
P
E
 
V
P
 
A
G
 
A
C
 
L
D
 
K
F
 
A
M
 
M
A
 
A
F
 
F
K
 
R
V
 
V
L
 
R
D
 
T
E
 
P
D
 
E
T
 
D
L
 
V
N
 
D
Q
 
K
L
 
A
E
 
E
K
 
A
D
 
Y
L
 
Y
V
 
Q
T
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
R
V
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
R
P
 
K
A
 
D
E
 
G
E
 
F
L
 
V
K
 
K
D
 
G
C
 
I
G
 
G
R
 
D
R
 
A
V
 
L
R
 
R
F
 
V
T
 
E
V
 
D
P
 
P
S
 
L
G
 
G
H
 
F
A
 
P
F
 
Y
E
 
E
L
 
F
F
 
F
A
 
F
D
 
E
K
 
T
K
 
T
Y
 
H
T
 
V
G
 
E
K
 
R
W
 
L
G
 
H
L
 
M
S
 
R
S
 
Y
V
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
D
A
 
L
W
 
Y
P
 
S
R
 
A
G
 
G
L
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
E
A
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
L
D
 
D
H
|
H
C
 
F
L
x
N
F
 
Q
Y
 
V
G
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
V
 
G
Y
 
R
D
 
K
I
 
-
F
 
Y
V
 
L
N
 
E
V
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
R
L
 
V
A
 
T
E
 
E
Q
 
D
V
 
I
L
 
Q
D
 
D
P
 
D
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
R
 
T
V
 
Y
S
 
A
Q
 
A
F
x
W
L
 
M
T
 
H
V
 
R
S
 
K
M
 
G
K
 
T
E
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
T
A
 
A
F
 
L
I
 
T
H
 
G
H
 
G
E
 
N
E
 
G
P
 
P
G
 
-
K
 
R
F
 
L
H
 
H
H
|
H
A
 
V
S
 
A
F
 
F
H
 
S
L
 
T
E
 
H
T
 
E
W
 
K
E
 
H
D
 
N
V
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
I
A
 
C
D
 
D
L
 
K
I
 
M
T
 
G
M
 
A
T
 
L
D
 
R
T
 
I
S
 
S
-
 
D
-
 
R
I
 
I
D
 
E
I
 
R
G
 
G
P
 
P
T
 
G
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
 
V
T
 
S
H
 
N
G
 
A
K
 
F
T
 
Y
I
 
L
Y
|
Y
F
 
I
F
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
D
G
 
N
N
 
H
R
 
R
N
 
I
E
|
E
V
 
I
F
 
Y
C
 
T
G
 
-
G
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
Y
 
T
-
 
G
-
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
N
K
 
P
P
 
T
V
 
I
T
 
T
W
 
W
T
 
N
T
 
V

3ojkA Structure of co-substituted homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase in complex with 4-nitrocatechol at 1.68 ang resolution (see paper)
24% identity, 89% coverage: 8:266/290 of query aligns to 32:283/355 of 3ojkA

query
sites
3ojkA
Y
 
Y
T
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
-
E
 
H
T
 
V
D
 
S
R
 
Y
D
 
E
D
 
D
Q
 
E
G
 
N
R
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
A
 
S
W
 
F
S
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
I
K
 
H
F
 
H
S
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
T
E
 
K
A
 
G
D
 
P
E
 
V
P
 
A
G
 
A
C
 
L
D
 
K
F
 
A
M
 
M
A
 
A
F
 
F
K
 
R
V
 
V
L
 
R
D
 
T
E
 
P
D
 
E
T
 
D
L
 
V
N
 
D
Q
 
K
L
 
A
E
 
E
K
 
A
D
 
Y
L
 
Y
V
 
Q
T
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
R
V
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
R
P
 
K
A
 
D
E
 
G
E
 
F
L
 
V
K
 
K
D
 
G
C
 
I
G
 
G
R
 
D
R
 
A
V
 
L
R
 
R
F
 
V
T
 
E
V
 
D
P
 
P
S
 
L
G
 
G
H
 
F
A
 
P
F
 
Y
E
 
E
L
 
F
F
 
F
A
 
F
D
 
E
K
 
T
K
 
T
Y
 
H
T
 
V
G
 
E
K
 
R
W
 
L
G
 
H
L
 
M
S
 
R
S
 
Y
V
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
D
A
 
L
W
 
Y
P
 
S
R
 
A
G
 
G
L
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
E
A
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
L
D
 
D
H
|
H
C
 
F
L
 
N
F
 
Q
Y
 
V
G
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
V
 
G
Y
 
R
D
 
K
I
 
-
F
 
Y
V
 
L
N
 
E
V
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
R
L
 
V
A
 
T
E
 
E
Q
 
D
V
 
I
L
 
Q
D
 
D
P
 
D
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
R
 
T
V
 
Y
S
 
A
Q
 
A
F
x
W
L
 
M
T
 
H
V
 
R
S
 
K
M
 
G
K
 
T
E
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
T
A
 
A
F
 
L
I
 
T
H
 
G
H
 
G
E
 
N
E
 
G
P
 
P
G
 
-
K
 
R
F
 
L
H
 
H
H
|
H
A
 
V
S
 
A
F
 
F
H
 
S
L
 
T
E
 
H
T
 
E
W
 
K
E
 
H
D
 
N
V
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
I
A
 
C
D
 
D
L
 
K
I
 
M
T
 
G
M
 
A
T
 
L
D
 
R
T
 
I
S
 
S
-
 
D
-
 
R
I
 
I
D
 
E
I
x
R
G
 
G
P
 
P
T
 
G
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
x
V
T
x
S
H
 
N
G
 
A
K
 
F
T
 
Y
I
 
L
Y
|
Y
F
 
I
F
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
D
G
 
N
N
 
H
R
 
R
N
 
I
E
|
E
V
 
I
F
x
Y
C
 
T
G
 
-
G
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
Y
 
T
-
 
G
-
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
N
K
 
P
P
 
T
V
 
I
T
 
T
W
 
W
T
 
N

Sites not aligning to the query:

3ojjA Structure of co-substituted homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase from b.Fuscum at 1.72 ang resolution (see paper)
24% identity, 89% coverage: 8:266/290 of query aligns to 32:283/355 of 3ojjA

query
sites
3ojjA
Y
 
Y
T
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
-
E
 
H
T
 
V
D
 
S
R
 
Y
D
 
E
D
 
D
Q
 
E
G
 
N
R
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
A
 
S
W
 
F
S
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
I
K
 
H
F
 
H
S
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
T
E
 
K
A
 
G
D
 
P
E
 
V
P
 
A
G
 
A
C
 
L
D
 
K
F
 
A
M
 
M
A
 
A
F
 
F
K
 
R
V
 
V
L
 
R
D
 
T
E
 
P
D
 
E
T
 
D
L
 
V
N
 
D
Q
 
K
L
 
A
E
 
E
K
 
A
D
 
Y
L
 
Y
V
 
Q
T
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
R
V
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
R
P
 
K
A
 
D
E
 
G
E
 
F
L
 
V
K
 
K
D
 
G
C
 
I
G
 
G
R
 
D
R
 
A
V
 
L
R
 
R
F
 
V
T
 
E
V
 
D
P
 
P
S
 
L
G
 
G
H
 
F
A
 
P
F
 
Y
E
 
E
L
 
F
F
 
F
A
 
F
D
 
E
K
 
T
K
 
T
Y
 
H
T
 
V
G
 
E
K
 
R
W
 
L
G
 
H
L
 
M
S
 
R
S
 
Y
V
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
D
A
 
L
W
 
Y
P
 
S
R
 
A
G
 
G
L
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
E
A
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
L
D
 
D
H
|
H
C
 
F
L
 
N
F
 
Q
Y
 
V
G
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
V
 
G
Y
 
R
D
 
K
I
 
-
F
 
Y
V
 
L
N
 
E
V
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
R
L
 
V
A
 
T
E
 
E
Q
 
D
V
 
I
L
 
Q
D
 
D
P
 
D
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
R
 
T
V
 
Y
S
 
A
Q
 
A
F
 
W
L
 
M
T
 
H
V
 
R
S
 
K
M
 
G
K
 
T
E
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
T
A
 
A
F
 
L
I
 
T
H
 
G
H
 
G
E
 
N
E
 
G
P
 
P
G
 
-
K
 
R
F
 
L
H
 
H
H
|
H
A
 
V
S
 
A
F
 
F
H
 
S
L
 
T
E
 
H
T
 
E
W
 
K
E
 
H
D
 
N
V
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
I
A
 
C
D
 
D
L
 
K
I
 
M
T
 
G
M
 
A
T
 
L
D
 
R
T
 
I
S
 
S
-
 
D
-
 
R
I
 
I
D
 
E
I
 
R
G
 
G
P
 
P
T
 
G
R
 
R
H
|
H
G
 
G
L
 
V
T
 
S
H
 
N
G
 
A
K
 
F
T
 
Y
I
 
L
Y
|
Y
F
 
I
F
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
D
G
 
N
N
 
H
R
 
R
N
 
I
E
|
E
V
 
I
F
 
Y
C
 
T
G
 
-
G
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
Y
 
T
-
 
G
-
 
D
P
 
P
D
 
D
H
 
N
K
 
P
P
 
T
V
 
I
T
 
T
W
 
W
T
 
N

3bzaA Structure of mn-substituted homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase from b.Fuscum at 1.7 ang resolution (see paper)
24% identity, 89% coverage: 8:266/290 of query aligns to 32:283/359 of 3bzaA

query
sites
3bzaA
Y
 
Y
T
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
-
E
 
H
T
 
V
D
 
S
R
 
Y
D
 
E
D
 
D
Q
 
E
G
 
N
R
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
A
 
S
W
 
F
S
 
E
E
 
E
V
 
F
D
 
I
K
 
H
F
 
H
S
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
T
E
 
K
A
 
G
D
 
P
E
 
V
P
 
A
G
 
A
C
 
L
D
 
K
F
 
A
M
 
M
A
 
A
F
 
F
K
 
R
V
 
V
L
 
R
D
 
T
E
 
P
D
 
E
T
 
D
L
 
V
N
 
D
Q
 
K
L
 
A
E
 
E
K
 
A
D
 
Y
L
 
Y
V
 
Q
T
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
R
V
 
T
E
 
E
Q
 
R
V
 
R
P
 
K
A
 
D
E
 
G
E
 
F
L
 
V
K
 
K
D
 
G
C
 
I
G
 
G
R
 
D
R
 
A
V
 
L
R
 
R
F
 
V
T
 
E
V
 
D
P
 
P
S
 
L
G
 
G
H
 
F
A
 
P
F
 
Y
E
 
E
L
 
F
F
 
F
A
 
F
D
 
E
K
 
T
K
 
T
Y
 
H
T
 
V
G
 
E
K
 
R
W
 
L
G
 
H
L
 
M
S
 
R
S
 
Y
V
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
D
A
 
L
W
 
Y
P
 
S
R
 
A
G
 
G
L
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
K
 
E
A
 
L
V
 
V
R
 
R
F
 
L
D
 
D
H
|
H
C
 
F
L
 
N
F
 
Q
Y
 
V
G
 
T
P
 
P
E
 
D
L
 
V
A
 
P
A
 
R
V
 
G
Y
 
R
D
 
K
I
 
-
F
 
Y
V
 
L
N
 
E
V
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
&nb