SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1243 FitnessBrowser__psRCH2:GFF1243 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1uufA Crystal structure of a zinc-type alcohol dehydrogenase-like protein yahk
68% identity, 97% coverage: 9:348/351 of query aligns to 6:338/339 of 1uufA

query
sites
1uufA
A
 
A
L
 
Y
D
 
S
P
 
A
S
 
K
T
 
Q
P
 
P
L
 
L
A
 
E
P
 
P
Y
 
M
S
 
D
F
 
I
S
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
E
V
 
P
G
 
G
P
 
P
N
 
N
D
 
D
V
 
V
R
 
K
I
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
A
F
 
Y
C
 
C
G
 
G
V
 
V
C
|
C
H
|
H
S
|
S
D
 
D
L
 
L
H
|
H
T
 
Q
A
 
V
R
 
R
N
 
S
E
 
E
W
 
W
N
 
A
N
 
G
T
 
T
L
 
V
Y
 
Y
P
 
P
S
 
C
V
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
R
V
 
V
S
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
D
N
 
Q
V
 
V
S
 
E
K
 
K
F
 
Y
K
 
A
A
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
C
|
C
R
 
K
T
 
H
C
|
C
S
 
E
S
 
E
C
|
C
G
 
E
E
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
N
Y
 
Y
C
|
C
E
 
D
N
 
H
G
 
-
F
 
M
V
x
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
G
 
S
P
 
P
A
 
T
F
 
P
G
 
D
G
 
E
G
 
P
E
 
G
N
 
H
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
Q
N
 
Q
I
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
H
E
 
E
K
 
R
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
R
 
R
I
 
I
N
 
R
H
 
H
-
 
P
T
 
Q
D
 
E
N
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
C
|
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
|
T
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
R
Q
 
H
W
 
W
K
 
Q
V
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
K
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
M
 
M
A
 
G
V
 
I
K
 
K
I
 
L
A
 
A
N
 
H
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
A
F
 
F
T
 
T
T
 
T
S
 
S
P
 
E
D
 
A
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
K
R
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
N
S
 
S
K
 
R
N
 
N
K
 
A
D
 
D
E
 
E
M
 
M
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
L
N
 
K
S
 
S
F
 
F
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
L
N
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
P
 
P
H
 
H
N
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
D
F
 
F
V
 
T
N
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
R
D
 
D
A
 
G
T
 
T
M
 
M
T
 
T
L
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
-
A
 
-
S
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
P
S
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
N
L
 
L
I
 
I
F
 
M
K
 
K
R
 
R
R
 
R
R
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
M
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
P
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
L
 
L
D
 
D
F
 
F
C
 
C
A
 
A
E
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
V
 
V
S
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
E
M
 
M
I
 
I
R
 
R
M
 
A
Q
 
D
D
 
Q
I
 
I
N
 
N
D
 
E
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
R
 
R
M
 
M
L
 
L
K
 
R
S
 
G
D
 
D
V
 
V
K
 
K
Y
 
Y
R
|
R
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
M
 
N
A
 
R
T
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P0CH37 NADP-dependent alcohol dehydrogenase C 2; Ms-ADHC 2; EC 1.1.1.2 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
55% identity, 100% coverage: 1:350/351 of query aligns to 1:349/349 of P0CH37

query
sites
P0CH37
M
 
M
S
 
S
N
 
T
S
 
V
I
 
S
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
T
D
 
S
P
 
A
S
 
T
T
 
E
P
 
P
L
 
L
A
 
T
P
 
K
Y
 
T
S
 
T
F
 
I
S
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
A
V
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
H
D
 
D
V
 
V
R
 
A
I
 
F
E
 
D
I
 
I
L
 
H
F
 
F
C
 
A
G
 
G
V
 
I
C
 
C
H
 
H
S
 
S
D
 
D
L
 
I
H
 
H
T
 
T
A
 
V
R
 
K
N
 
A
E
 
E
W
 
W
N
 
G
N
 
V
T
 
P
L
 
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
H
 
H
E
 
E
I
 
I
V
 
A
G
 
G
R
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
S
N
 
E
V
 
V
S
 
T
K
 
K
F
 
Y
K
 
K
A
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
F
V
 
V
D
 
D
S
 
S
C
 
C
R
 
R
T
 
E
C
 
C
S
 
D
S
 
N
C
 
C
G
 
K
E
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
C
 
C
E
 
T
-
 
G
N
 
T
G
 
G
F
 
M
V
 
V
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
G
 
A
P
 
-
A
 
I
F
 
D
G
 
R
G
 
D
G
 
G
E
 
T
N
 
P
T
 
T
L
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
G
N
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
K
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
R
 
R
I
 
I
N
 
P
H
 
D
T
 
S
D
 
L
N
 
P
L
 
L
A
 
D
A
 
A
V
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
C
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
R
Q
 
H
W
 
W
K
 
N
V
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
K
 
K
V
 
V
G
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
M
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
L
A
 
A
N
 
K
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
V
 
T
L
 
V
F
 
L
T
 
S
T
 
Q
S
 
S
P
 
L
D
x
K
K
 
K
R
 
M
E
 
E
D
 
D
A
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
E
 
A
V
 
Y
V
 
Y
V
 
A
S
 
T
K
 
S
N
 
D
K
 
P
D
 
E
E
 
T
M
 
F
A
 
D
A
 
K
H
 
L
A
 
A
N
 
G
S
 
S
F
 
F
D
 
D
F
 
L
I
 
I
L
 
L
N
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
S
A
 
A
P
 
N
H
 
L
N
 
D
L
 
L
D
 
G
A
 
A
F
 
Y
V
 
L
N
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
A
M
 
L
T
 
V
L
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
E
S
 
H
P
 
P
H
 
M
P
 
E
S
 
V
P
 
P
S
 
A
V
 
-
F
 
F
G
 
P
L
 
L
I
 
L
F
 
A
K
 
Q
R
 
R
R
 
R
R
 
N
I
 
L
A
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
M
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
P
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
L
 
L
D
 
D
F
 
F
C
 
C
A
 
A
E
 
E
H
 
H
G
 
D
I
 
V
V
 
R
S
 
P
D
 
E
I
 
I
E
 
E
M
 
I
I
 
I
R
 
T
M
 
P
Q
 
D
D
 
Y
I
 
I
N
 
N
D
 
E
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
R
 
R
M
 
V
L
 
L
K
 
A
S
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
M
 
T
A
 
A
T
 
S
L
 
L
K
 
R
S
 
S

P0CH36 NADP-dependent alcohol dehydrogenase C 1; Ms-ADHC 1; EC 1.1.1.2 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
55% identity, 100% coverage: 1:350/351 of query aligns to 1:349/349 of P0CH36

query
sites
P0CH36
M
 
M
S
 
S
N
 
T
S
 
V
I
 
S
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
T
D
 
S
P
 
A
S
 
T
T
 
E
P
 
P
L
 
L
A
 
T
P
 
K
Y
 
T
S
 
T
F
 
I
S
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
A
V
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
H
D
 
D
V
 
V
R
 
A
I
 
F
E
 
D
I
 
I
L
 
H
F
 
F
C
 
A
G
 
G
V
 
I
C
 
C
H
 
H
S
 
S
D
 
D
L
 
I
H
 
H
T
 
T
A
 
V
R
 
K
N
 
A
E
 
E
W
 
W
N
 
G
N
 
V
T
 
P
L
 
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
H
 
H
E
 
E
I
 
I
V
 
A
G
 
G
R
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
S
N
 
E
V
 
V
S
 
T
K
 
K
F
 
Y
K
 
K
A
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
F
V
 
V
D
 
D
S
 
S
C
 
C
R
 
R
T
 
E
C
 
C
S
 
D
S
 
N
C
 
C
G
 
K
E
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
C
 
C
E
 
T
-
 
G
N
 
T
G
 
G
F
 
M
V
 
V
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
G
 
A
P
 
-
A
 
I
F
 
D
G
 
R
G
 
D
G
 
G
E
 
T
N
 
P
T
 
T
L
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
G
N
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
K
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
R
 
R
I
 
I
N
 
P
H
 
D
T
 
S
D
 
L
N
 
P
L
 
L
A
 
D
A
 
A
V
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
C
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
R
Q
 
H
W
 
W
K
 
N
V
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
K
 
K
V
 
V
G
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
M
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
L
A
 
A
N
 
K
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
V
 
T
L
 
V
F
 
L
T
 
S
T
 
Q
S
 
S
P
 
L
D
x
K
K
 
K
R
 
M
E
 
E
D
 
D
A
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
E
 
A
V
 
Y
V
 
Y
V
 
A
S
 
T
K
 
S
N
 
D
K
 
P
D
 
E
E
 
T
M
 
F
A
 
D
A
 
K
H
 
L
A
 
A
N
 
G
S
 
S
F
 
F
D
 
D
F
 
L
I
 
I
L
 
L
N
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
S
A
 
A
P
 
N
H
 
L
N
 
D
L
 
L
D
 
G
A
 
A
F
 
Y
V
 
L
N
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
A
M
 
L
T
 
V
L
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
E
S
 
H
P
 
P
H
 
M
P
 
E
S
 
V
P
 
P
S
 
A
V
 
-
F
 
F
G
 
P
L
 
L
I
 
L
F
 
A
K
 
Q
R
 
R
R
 
R
R
 
N
I
 
L
A
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
M
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
P
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
L
 
L
D
 
D
F
 
F
C
 
C
A
 
A
E
 
E
H
 
H
G
 
D
I
 
V
V
 
R
S
 
P
D
 
E
I
 
I
E
 
E
M
 
I
I
 
I
R
 
T
M
 
P
Q
 
D
D
 
Y
I
 
I
N
 
N
D
 
E
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
R
 
R
M
 
V
L
 
L
K
 
A
S
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
M
 
T
A
 
A
T
 
S
L
 
L
K
 
R
S
 
S

P9WQC5 NADP-dependent alcohol dehydrogenase C; EC 1.1.1.2 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
53% identity, 99% coverage: 1:348/351 of query aligns to 1:346/346 of P9WQC5

query
sites
P9WQC5
M
 
M
S
 
S
N
 
T
S
 
V
I
 
A
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
S
P
 
A
S
 
T
T
 
E
P
 
P
L
 
L
A
 
T
P
 
K
Y
 
T
S
 
T
F
 
I
S
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
D
V
 
P
G
 
G
P
 
P
N
 
H
D
 
D
V
 
V
R
 
A
I
 
I
E
 
D
I
 
I
L
 
K
F
 
F
C
 
A
G
 
G
V
 
I
C
 
C
H
 
H
S
 
S
D
 
D
L
 
I
H
 
H
T
 
T
A
 
V
R
 
K
N
 
A
E
 
E
W
 
W
N
 
G
N
 
Q
T
 
P
L
 
N
Y
 
Y
P
 
P
S
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
H
 
H
E
 
E
I
 
I
V
 
A
G
 
G
R
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
S
N
 
E
V
 
V
S
 
T
K
 
K
F
 
Y
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
I
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
F
V
 
V
D
 
D
S
 
S
C
 
C
R
 
R
T
 
E
C
 
C
S
 
N
S
 
S
C
 
C
G
 
T
E
 
R
G
 
G
L
 
I
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
C
 
C
E
 
K
N
 
P
G
 
G
F
 
A
V
 
N
G
 
F
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
G
 
S
P
 
I
A
 
G
F
 
-
G
 
K
G
 
D
G
 
G
E
 
Q
N
 
P
T
 
T
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
E
N
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
K
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
R
 
R
I
 
I
N
 
P
H
 
D
T
 
V
D
 
L
N
 
P
L
 
L
A
 
D
A
 
V
V
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
C
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
T
 
L
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
R
Q
 
H
W
 
W
K
 
N
V
 
A
G
 
G
P
 
A
G
 
N
Q
 
T
K
 
R
V
 
V
G
 
A
V
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
M
 
M
A
 
G
V
 
V
K
 
K
I
 
L
A
 
G
N
 
A
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
V
 
T
L
 
V
F
 
L
T
 
S
T
 
Q
S
 
S
P
 
L
D
x
K
K
 
K
R
 
M
E
 
E
D
 
D
A
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
K
E
 
S
V
 
Y
V
 
Y
V
 
A
S
 
T
K
 
A
N
 
D
K
 
P
D
 
D
E
 
T
M
 
F
A
 
R
A
 
K
H
 
L
A
 
R
N
 
G
S
 
G
F
 
F
D
 
D
F
 
L
I
 
I
L
 
L
N
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
S
A
 
A
P
 
N
H
 
L
N
 
D
L
 
L
D
 
G
A
 
Q
F
 
Y
V
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
D
R
 
V
D
 
D
A
 
G
T
 
T
M
 
L
T
 
V
L
 
E
V
 
L
G
 
G
A
 
I
P
 
P
A
 
E
S
 
H
P
 
P
H
 
M
P
 
A
S
 
V
P
 
P
S
 
A
V
 
-
F
 
F
G
 
A
L
 
L
I
 
A
F
 
L
K
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
S
I
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
N
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
L
 
L
D
 
N
F
 
F
C
 
C
A
 
A
E
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
V
V
 
T
S
 
P
D
 
E
I
 
I
E
 
E
M
 
L
I
 
I
R
 
E
M
 
P
Q
 
D
D
 
Y
I
 
I
N
 
N
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
R
 
R
M
 
V
L
 
L
K
 
A
S
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
M
 
I
A
 
S
T
 
A
L
 
L

5z0cA Nerol dehydrogenase from persicaria minor (see paper)
51% identity, 98% coverage: 3:345/351 of query aligns to 6:347/367 of 5z0cA

query
sites
5z0cA
N
 
K
S
 
A
I
 
V
G
 
G
Y
 
W
A
 
A
A
 
A
L
 
R
D
 
D
P
 
P
S
 
S
T
 
G
P
 
H
L
 
L
A
 
S
P
 
P
Y
 
F
S
 
T
F
 
F
S
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
A
V
 
T
G
 
G
P
 
E
N
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
T
I
 
F
E
 
K
I
 
V
L
 
L
F
 
Y
C
 
C
G
 
G
V
 
I
C
|
C
H
 
H
S
|
S
D
 
D
L
 
L
H
|
H
T
 
Y
A
 
I
R
 
K
N
 
N
E
 
E
W
 
W
N
 
S
N
 
N
T
 
T
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
S
 
A
V
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
E
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
V
S
 
T
A
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
S
N
 
K
V
 
V
S
 
N
K
 
K
F
 
F
K
 
K
A
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
K
A
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
I
V
 
V
D
 
G
S
 
S
C
|
C
R
 
H
T
 
S
C
|
C
S
 
P
S
 
N
C
|
C
G
 
N
E
 
N
G
 
H
L
 
L
E
 
E
Q
 
N
Y
 
Y
C
|
C
E
 
P
N
 
N
G
 
R
F
 
I
V
 
L
G
 
-
T
 
T
Y
 
F
N
 
G
G
 
S
P
 
R
A
 
Y
F
 
Y
G
 
D
G
 
G
G
 
T
E
 
L
N
 
N
T
 
H
L
 
-
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
N
 
L
I
 
M
V
 
V
V
 
V
D
 
Q
E
 
E
K
 
H
Y
 
F
V
 
A
L
 
V
R
 
R
I
 
I
N
 
P
H
 
D
T
 
A
D
 
L
N
 
P
L
 
L
A
 
D
A
 
S
V
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
C
|
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
T
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
R
Q
 
Y
W
 
Y
K
 
G
V
 
L
-
 
D
G
 
K
P
 
P
G
 
G
Q
 
L
K
 
H
V
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
M
 
M
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
F
A
 
A
N
 
K
A
 
A
M
 
F
G
 
G
A
 
V
K
 
K
V
 
V
V
 
T
L
 
V
F
 
V
T
 
S
T
 
T
S
 
S
P
 
P
D
 
A
K
 
K
R
 
K
E
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
S
-
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
H
E
 
S
V
 
F
V
 
I
V
 
L
S
 
S
K
 
T
N
 
D
K
 
A
D
 
E
E
 
Q
M
 
M
A
 
Q
A
 
A
H
 
A
A
 
V
N
 
G
S
 
T
F
 
M
D
 
D
F
 
G
I
 
I
L
 
I
N
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
S
A
 
A
P
 
S
H
 
H
N
 
P
L
 
L
D
 
P
A
 
P
F
 
L
V
 
I
N
 
S
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
S
D
 
H
A
 
G
T
 
K
M
 
L
T
 
V
L
 
M
V
 
V
G
 
G
A
 
D
P
 
P
A
 
P
S
 
K
P
 
P
H
 
L
P
 
E
S
 
L
P
 
P
S
 
-
V
 
V
F
 
F
G
 
P
L
 
L
I
 
L
F
 
L
K
 
G
R
 
R
R
 
K
R
 
M
I
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
A
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
M
A
 
K
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
L
 
I
D
 
D
F
 
F
C
 
A
A
 
A
E
 
K
H
 
E
G
 
G
I
 
V
V
 
R
S
 
A
D
 
D
I
 
V
E
 
E
M
 
V
I
 
I
R
 
P
M
 
M
Q
 
D
D
 
Y
I
 
V
N
 
N
D
 
T
A
 
A
Y
 
M
E
 
Q
R
 
R
M
 
V
L
 
S
K
 
K
S
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
K
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
M
 
I

1yqdA Sinapyl alcohol dehydrogenase complexed with NADP+ (see paper)
49% identity, 99% coverage: 3:351/351 of query aligns to 9:356/359 of 1yqdA

query
sites
1yqdA
N
 
K
S
 
A
I
 
F
G
 
G
Y
 
W
A
 
A
A
 
A
L
 
R
D
 
D
P
 
Q
S
 
S
T
 
G
P
 
H
L
 
L
A
 
S
P
 
P
Y
 
F
S
 
N
F
 
F
S
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
A
V
 
T
G
 
G
P
 
E
N
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
R
I
 
F
E
 
K
I
 
V
L
 
L
F
 
Y
C
 
C
G
 
G
V
 
V
C
|
C
H
|
H
S
|
S
D
 
D
L
 
L
H
|
H
T
 
S
A
 
I
R
 
K
N
 
N
E
 
D
W
 
W
N
 
G
N
 
F
T
 
S
L
 
M
Y
 
Y
P
 
P
S
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
V
S
 
T
A
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
S
N
 
K
V
 
V
S
 
K
K
 
K
F
 
V
K
 
N
A
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
K
A
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
L
V
 
V
D
 
G
S
 
A
C
|
C
R
 
H
T
 
S
C
|
C
S
 
E
S
 
S
C
|
C
G
 
A
E
 
N
G
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
N
Y
 
Y
C
|
C
E
 
P
N
 
K
G
 
-
F
 
M
V
x
I
G
 
L
T
 
T
Y
 
Y
N
 
-
G
 
A
P
 
S
A
 
I
F
 
Y
G
 
H
G
 
D
G
 
G
E
 
T
N
 
I
T
 
T
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
N
N
 
H
I
 
M
V
 
V
V
 
A
D
 
N
E
 
E
K
 
R
Y
 
Y
V
 
I
L
 
I
R
 
R
I
 
F
N
 
P
H
 
D
T
 
N
D
 
M
N
 
P
L
 
L
A
 
D
A
 
G
V
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
C
|
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
|
T
T
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
K
Q
 
Y
W
 
F
K
 
G
V
 
L
G
 
D
-
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
K
 
H
V
 
I
G
 
G
V
 
I
V
 
V
G
|
G
L
|
L
G
|
G
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
M
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
F
A
 
A
N
 
K
A
 
A
M
 
F
G
 
G
A
 
S
K
 
K
V
 
V
V
 
T
L
 
V
F
 
I
T
x
S
T
|
T
S
|
S
P
 
P
D
 
S
K
|
K
R
 
K
E
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
K
-
 
N
L
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
D
E
 
S
V
 
F
V
 
L
V
 
V
S
 
S
K
 
R
N
 
D
K
 
Q
D
 
E
E
 
Q
M
 
M
A
 
Q
A
 
A
H
 
A
A
 
A
N
 
G
S
 
T
F
 
L
D
 
D
F
 
G
I
 
I
L
 
I
N
 
D
T
|
T
V
|
V
A
x
S
A
 
A
P
 
V
H
 
H
N
 
P
L
 
L
D
 
L
A
 
P
F
 
L
V
 
F
N
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
S
D
 
H
A
 
G
T
 
K
M
 
L
T
 
I
L
 
L
V
|
V
G
|
G
A
|
A
P
 
P
A
 
E
S
 
K
P
 
P
H
 
L
P
 
E
S
 
L
P
 
P
S
 
A
V
 
-
F
 
F
G
 
S
L
 
L
I
 
I
F
 
A
K
 
G
R
 
R
R
 
K
R
 
I
I
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
x
G
I
|
I
G
 
G
G
 
G
I
 
M
A
 
K
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
L
 
I
D
 
D
F
 
F
C
 
A
A
 
A
E
 
K
H
 
H
G
 
N
I
 
I
V
 
T
S
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
E
M
 
V
I
 
I
R
 
S
M
 
T
Q
 
D
D
 
Y
I
 
L
N
 
N
D
 
T
A
 
A
Y
 
M
E
 
E
R
 
R
M
 
L
L
 
A
K
 
K
S
x
N
D
 
D
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
R
|
R
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
M
 
V
A
 
G
T
 
N
L
 
T
K
 
L
S
 
A
A
 
A

6k3gB Crystal structure of 10-hydroxygeraniol dehydrogenase from cantharanthus roseus in complex with NADP+ (see paper)
53% identity, 99% coverage: 3:350/351 of query aligns to 9:356/356 of 6k3gB

query
sites
6k3gB
N
 
K
S
 
A
I
 
F
G
 
G
Y
 
W
A
 
A
A
 
A
L
 
R
D
 
D
P
 
T
S
 
S
T
 
G
P
 
H
L
 
L
A
 
S
P
 
P
Y
 
F
S
 
H
F
 
F
S
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
A
V
 
T
G
 
G
P
 
E
N
 
H
D
 
D
V
 
V
R
 
Q
I
 
F
E
 
K
I
 
V
L
 
L
F
 
Y
C
 
C
G
 
G
V
 
I
C
|
C
H
|
H
S
|
S
D
 
D
L
 
L
H
|
H
T
 
M
A
 
I
R
 
K
N
 
N
E
 
E
W
|
W
N
 
G
N
 
F
T
 
T
L
 
K
Y
 
Y
P
 
P
S
 
I
V
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
E
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
I
V
 
V
S
 
T
A
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
S
N
 
K
V
 
V
S
 
E
K
 
K
F
 
F
K
 
K
A
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
K
A
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
L
V
 
V
D
 
G
S
 
S
C
|
C
R
 
R
T
 
K
C
|
C
S
 
D
S
 
M
C
|
C
G
 
T
E
 
K
G
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
N
Y
 
Y
C
|
C
E
 
P
N
 
-
G
 
G
F
 
Q
V
 
I
G
 
L
T
 
T
Y
 
Y
N
 
S
G
 
A
P
 
-
A
 
T
F
 
Y
G
 
T
G
 
D
G
 
G
E
 
T
N
 
T
T
 
T
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
N
 
L
I
 
M
V
 
V
V
 
A
D
 
D
E
 
E
K
 
H
Y
 
F
V
 
V
L
 
I
R
 
R
I
 
W
N
 
P
H
 
E
T
 
N
D
 
L
N
 
P
L
 
M
A
 
D
A
 
I
V
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
C
|
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
|
T
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
R
Q
 
Y
W
 
F
K
 
G
V
 
L
-
 
D
G
 
K
P
 
P
G
 
G
Q
 
T
K
 
H
V
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
|
G
L
|
L
G
|
G
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
M
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
F
A
 
A
N
 
K
A
 
A
M
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
T
L
 
V
F
 
I
T
x
S
T
|
T
S
|
S
P
 
E
D
 
S
K
|
K
R
 
K
E
 
Q
D
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
E
R
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
E
 
S
V
 
F
V
 
L
V
 
V
S
 
S
K
 
R
N
 
D
K
 
P
D
 
E
E
 
Q
M
 
M
A
 
K
A
 
A
H
 
A
A
 
A
N
 
A
S
 
S
F
 
L
D
 
D
F
 
G
I
 
I
L
 
I
N
 
D
T
|
T
V
|
V
A
x
S
A
|
A
P
 
I
H
 
H
N
 
P
L
 
I
D
 
M
A
 
P
F
 
L
V
 
L
N
 
S
L
 
I
L
 
L
K
 
K
R
 
S
D
 
H
A
 
G
T
 
K
M
 
L
T
 
I
L
 
L
V
|
V
G
|
G
A
|
A
P
 
P
A
 
E
S
 
K
P
 
P
H
 
L
P
 
E
S
 
L
P
 
P
S
 
S
V
 
-
F
 
F
G
 
P
L
 
L
I
 
I
F
 
A
K
 
G
R
 
R
R
 
K
R
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
x
A
I
|
I
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
L
 
I
D
 
D
F
 
F
C
 
A
A
 
A
E
 
K
H
 
H
G
 
N
I
 
V
V
 
L
S
 
P
D
 
D
I
 
V
E
 
E
M
 
L
I
 
V
R
 
S
M
 
M
Q
 
D
D
 
Y
I
 
V
N
 
N
D
 
T
A
 
A
Y
 
M
E
 
E
R
 
R
M
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
A
D
 
D
V
 
V
K
 
K
Y
 
Y
R
|
R
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
M
 
V
A
 
A
-
 
N
T
 
T
L
 
L
K
 
K
S
 
S

5vktA Cinnamyl alcohol dehydrogenases (sbcad4) from sorghum bicolor (l.) Moench (see paper)
50% identity, 98% coverage: 6:349/351 of query aligns to 5:349/353 of 5vktA

query
sites
5vktA
G
 
G
Y
 
W
A
 
A
A
 
A
L
 
R
D
 
D
P
 
A
S
 
S
T
 
G
P
 
H
L
 
L
A
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
F
 
F
S
 
S
R
 
A
R
 
R
E
 
I
V
 
Q
G
 
G
P
 
D
N
 
A
D
 
D
V
 
V
R
 
T
I
 
I
E
 
K
I
 
V
L
 
L
F
 
F
C
 
C
G
 
G
V
 
I
C
|
C
H
|
H
S
x
T
D
 
D
L
 
L
H
|
H
T
 
V
A
 
I
R
 
K
N
 
N
E
 
E
W
 
W
N
 
G
N
 
N
T
 
A
L
 
M
Y
 
Y
P
 
P
S
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
H
N
 
G
V
 
V
S
 
T
K
 
K
F
 
F
K
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
T
A
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
Y
L
 
F
V
 
V
D
 
D
S
 
S
C
|
C
R
 
R
T
 
T
C
|
C
S
 
E
S
 
S
C
|
C
G
 
S
E
 
T
G
 
G
L
 
H
E
 
E
Q
 
N
Y
 
Y
C
|
C
E
 
P
N
 
D
G
 
-
F
 
L
V
|
V
G
 
L
T
 
T
Y
 
S
N
 
N
G
 
G
-
 
V
P
 
D
A
 
H
F
 
H
G
 
H
G
 
H
G
 
G
E
 
A
N
 
T
T
 
T
L
 
K
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
V
I
 
L
V
 
V
V
 
V
D
 
S
E
 
Q
K
 
D
Y
 
F
V
 
V
L
 
V
R
 
R
I
 
V
N
 
P
H
 
E
T
 
S
D
 
L
N
 
P
L
 
L
A
 
D
A
 
G
V
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
C
|
C
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
|
T
T
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
M
R
 
A
Q
 
Q
W
 
Y
K
 
A
V
 
L
G
 
N
-
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
K
 
H
V
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
|
G
L
|
L
G
|
G
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
M
 
M
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
F
A
 
A
N
 
K
A
 
A
M
 
F
G
 
G
A
 
M
K
 
T
V
 
V
V
 
T
L
 
V
F
 
I
T
x
S
T
x
S
S
|
S
P
 
P
D
 
G
K
|
K
R
 
R
E
 
D
D
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
E
 
A
V
 
F
V
 
L
V
 
V
S
 
S
K
 
H
N
 
D
K
 
A
D
 
A
E
 
Q
M
 
M
A
 
K
A
 
A
H
 
A
A
 
A
N
 
A
S
 
T
F
 
L
D
 
D
F
 
G
I
 
I
L
 
I
N
 
D
T
|
T
V
|
V
A
x
S
A
|
A
P
 
G
H
 
H
N
 
Q
L
 
I
D
 
V
A
 
P
F
 
L
V
 
L
N
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
P
D
 
M
A
 
G
T
 
Q
M
 
M
T
 
V
L
 
V
V
|
V
G
|
G
A
 
A
P
 
P
A
 
S
S
 
T
P
 
P
H
 
L
P
 
E
S
 
L
P
 
P
S
 
A
V
 
-
F
 
Y
G
 
A
L
 
I
I
 
I
F
 
T
K
 
G
R
 
G
R
 
K
R
 
R
I
 
V
A
 
A
G
 
G
S
x
N
L
x
G
I
 
V
G
 
G
G
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
D
T
 
C
Q
 
Q
E
 
A
M
 
M
L
 
L
D
 
D
F
 
F
C
 
A
A
 
G
E
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
V
V
 
T
S
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
E
M
 
V
I
 
V
R
 
Q
M
 
M
Q
 
D
D
 
Y
I
 
V
N
 
N
D
 
T
A
 
A
Y
 
I
E
 
E
R
 
R
M
 
L
L
 
E
K
 
K
S
x
N
D
 
D
V
 
V
K
 
R
Y
 
Y
R
|
R
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
M
 
V
A
 
A
T
 
G
L
 
S
K
 
K

3twoB The crystal structure of cad from helicobacter pylori complexed with NADP(h) (see paper)
46% identity, 98% coverage: 3:345/351 of query aligns to 4:343/348 of 3twoB

query
sites
3twoB
N
 
Q
S
 
S
I
 
K
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
A
 
I
L
 
F
D
 
S
P
 
K
S
 
D
T
 
E
P
 
H
L
 
F
A
 
K
P
 
P
Y
 
H
S
 
D
F
 
F
S
 
S
R
 
R
R
 
H
E
 
A
V
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
R
D
 
D
V
 
V
R
 
L
I
 
I
E
 
D
I
 
I
L
 
L
F
 
Y
C
 
A
G
 
G
V
 
I
C
|
C
H
|
H
S
|
S
D
 
D
L
 
I
H
|
H
T
 
S
A
 
A
R
 
Y
N
 
S
E
 
E
W
 
W
N
 
K
N
 
E
T
 
G
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
S
 
M
V
 
I
P
 
P
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
I
V
 
A
G
 
G
R
 
I
V
 
I
S
 
K
A
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
K
N
 
G
V
 
V
S
 
K
K
 
K
F
 
F
K
 
K
A
 
I
G
 
G
D
 
D
I
 
V
A
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
F
V
 
V
D
 
N
S
 
S
C
|
C
R
 
K
T
 
A
C
|
C
S
 
K
S
 
P
C
|
C
G
 
K
E
 
E
G
 
H
L
 
Q
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
F
C
|
C
E
 
T
N
 
K
G
 
-
F
 
V
V
|
V
G
 
F
T
 
T
Y
 
Y
N
 
D
G
 
C
-
 
L
P
 
D
A
 
S
F
 
F
G
 
H
G
 
D
G
 
N
E
 
E
N
 
P
T
 
H
L
 
M
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
N
N
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
K
 
N
Y
 
Y
V
 
V
L
 
I
R
 
S
I
 
V
N
 
D
H
 
K
T
 
N
D
 
A
N
 
P
L
 
L
A
 
E
A
 
K
V
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
C
|
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
|
T
T
 
T
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
K
Q
 
F
W
 
S
K
 
K
V
 
V
G
 
T
P
 
K
G
 
G
Q
 
T
K
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
A
G
|
G
L
x
F
G
|
G
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
S
M
 
M
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
Y
A
 
A
N
 
V
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
E
V
 
V
V
 
S
L
 
V
F
 
F
T
 
A
T
x
R
S
 
N
P
 
E
D
 
H
K
 
K
R
 
K
E
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
S
L
 
M
G
 
G
A
 
V
A
 
K
E
 
H
V
 
F
V
 
Y
V
 
T
-
 
D
-
 
P
S
 
K
K
 
Q
N
 
C
K
 
K
D
 
E
E
 
E
M
 
L
A
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
D
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
I
N
 
S
T
|
T
V
x
I
A
x
P
A
x
T
P
 
H
H
 
Y
N
 
D
L
 
L
D
 
K
A
 
D
F
 
Y
V
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
L
K
 
T
R
 
Y
D
 
N
A
 
G
T
 
D
M
 
L
T
 
A
L
 
L
V
|
V
G
|
G
-
x
L
A
 
P
P
 
P
A
 
V
S
 
E
P
 
V
H
 
A
P
 
P
S
 
V
P
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
F
G
 
D
L
 
F
I
 
I
-
 
H
F
 
L
K
 
G
R
 
N
R
 
R
R
 
K
I
 
V
A
 
Y
G
 
G
S
 
S
L
|
L
I
|
I
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
K
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
L
 
V
D
 
D
F
 
F
C
 
S
A
 
I
E
 
K
H
 
H
G
 
N
I
 
I
V
 
Y
S
 
P
D
 
E
I
 
I
E
 
D
M
 
L
I
 
I
R
 
L
M
 
G
Q
 
K
D
 
D
I
 
I
N
 
D
D
 
T
A
 
A
Y
 
Y
E
 
H
R
 
N
M
x
L
L
 
T
K
 
H
S
x
G
D
 
K
V
 
A
K
 
K
Y
 
F
R
|
R
F
 
Y
V
 
V
I
 
I
D
 
D
M
 
M

7cguA Crystal structure of abhar
47% identity, 98% coverage: 3:345/351 of query aligns to 3:345/352 of 7cguA

query
sites
7cguA
N
 
N
S
 
T
I
 
F
G
 
G
Y
 
W
A
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
D
P
 
S
S
 
S
T
 
G
P
 
V
L
 
L
A
 
S
P
 
P
Y
 
F
S
 
T
F
 
F
S
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
A
V
 
T
G
 
G
P
 
E
N
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
R
I
 
L
E
 
K
I
 
V
L
 
L
F
 
Y
C
 
C
G
 
G
V
 
I
C
|
C
H
 
H
S
 
S
D
 
D
L
 
L
H
 
G
T
 
C
A
 
I
R
 
K
N
 
N
E
 
E
W
 
W
N
 
G
N
 
W
T
 
C
L
 
S
Y
 
Y
P
 
P
S
 
L
V
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
I
V
 
A
S
 
T
A
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
S
N
 
K
V
 
V
S
 
T
K
 
K
F
 
F
K
 
K
A
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
M
V
 
V
D
 
G
S
 
S
C
 
C
R
 
G
T
 
T
C
 
C
S
 
Q
S
 
N
C
 
C
G
 
T
E
 
Q
G
 
N
L
 
Q
E
 
E
Q
 
S
Y
 
Y
C
 
C
E
 
P
N
 
E
G
 
-
F
 
-
V
 
V
G
 
I
T
 
M
Y
 
T
N
 
C
G
 
A
P
 
S
A
 
A
F
 
Y
G
 
P
G
 
D
G
 
G
E
 
T
N
 
P
T
 
T
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
D
 
N
N
 
Q
I
 
M
V
 
V
V
 
A
D
 
N
E
 
E
K
 
K
Y
 
F
V
 
V
L
 
I
R
 
R
I
 
I
N
 
P
H
 
N
T
 
S
D
 
L
N
 
P
L
 
L
A
 
D
A
 
A
V
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
C
|
C
A
 
A
G
 
G
I
 
S
T
 
T
T
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
A
L
 
M
R
 
K
Q
 
F
W
 
Y
K
 
G
V
 
L
-
 
C
G
 
S
P
 
Q
G
 
G
Q
 
L
K
 
H
V
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
M
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
F
A
 
A
N
 
K
A
 
A
M
 
F
G
 
G
A
 
M
K
 
K
V
 
V
V
 
T
L
 
V
F
 
I
T
 
S
T
 
T
S
 
S
P
 
L
D
 
G
K
 
K
R
 
K
E
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
I
-
 
N
R
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
E
 
S
V
 
F
V
 
L
V
 
I
S
 
N
K
 
T
N
 
D
K
 
T
D
 
E
E
 
Q
M
 
M
A
 
Q
A
 
G
H
 
A
A
 
M
N
 
E
S
 
V
F
 
M
D
 
D
F
 
G
I
 
I
L
 
I
N
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
S
A
 
A
P
 
L
H
 
H
N
 
P
L
 
I
D
 
E
A
 
P
F
 
L
V
 
L
N
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
-
 
S
R
 
H
D
 
Q
A
 
G
T
 
K
M
 
L
T
 
I
L
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
-
S
 
N
P
 
K
H
 
Q
P
 
P
S
 
E
P
 
L
S
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
S
L
 
L
I
 
I
F
 
N
K
 
G
R
 
R
R
 
K
R
 
M
I
 
I
A
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
A
I
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
A
 
K
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
L
 
I
D
 
D
F
 
F
C
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
G
 
N
I
 
I
V
 
T
S
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
E
M
 
I
I
 
V
R
 
P
M
 
M
Q
 
D
D
 
Y
I
 
V
N
 
N
D
 
T
A
 
A
Y
 
M
E
 
E
R
 
R
M
 
L
L
 
E
K
 
K
S
 
G
D
 
D
V
 
V
K
 
K
Y
 
F
R
 
R
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
M
 
V

8a3nB Geissoschizine synthase from catharanthus roseus - binary complex with NADP+ (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:349/351 of query aligns to 6:350/352 of 8a3nB

query
sites
8a3nB
N
 
K
S
 
A
I
 
V
G
 
G
Y
 
W
A
 
G
A
 
A
L
 
A
D
 
D
P
 
A
S
 
S
T
 
G
P
 
V
L
 
L
A
 
Q
P
 
P
Y
 
I
S
 
K
F
 
F
S
 
Y
R
 
R
R
 
R
E
 
V
V
 
P
G
 
G
P
 
E
N
 
R
D
 
D
V
 
V
R
 
K
I
 
I
E
 
R
I
 
V
L
 
L
F
 
Y
C
 
S
G
 
G
V
 
V
C
|
C
H
x
N
S
 
F
D
 
D
L
 
M
H
 
E
T
 
M
A
 
V
R
 
R
N
 
N
E
 
K
W
 
W
N
 
G
N
 
F
T
 
T
L
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
Y
V
 
V
P
 
F
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
T
V
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
V
S
 
V
A
 
E
V
 
V
G
 
G
A
 
S
N
 
K
V
 
V
S
 
E
K
 
K
F
 
F
K
 
K
A
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
K
A
 
V
G
 
A
V
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
M
V
 
V
D
 
G
S
 
S
C
|
C
R
 
G
T
 
Q
C
|
C
S
 
Y
S
 
N
C
|
C
G
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
M
E
 
E
Q
 
N
Y
 
Y
C
|
C
E
 
P
N
 
E
G
 
P
F
 
N
V
 
M
G
 
A
T
 
-
Y
 
-
N
 
D
G
 
G
P
 
S
A
 
V
F
 
Y
G
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
E
N
 
R
T
 
S
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
Y
 
C
S
 
S
D
 
N
N
 
V
I
 
M
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
K
 
K
Y
 
F
V
 
V
L
 
L
R
 
R
I
 
W
N
 
P
H
 
E
T
 
N
D
 
L
N
 
P
L
 
Q
A
 
D
A
 
K
V
 
G
A
 
V
P
 
A
L
 
L
L
 
L
C
|
C
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
x
V
T
 
V
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
M
R
 
K
Q
 
H
W
 
L
K
 
G
V
 
L
-
 
D
G
 
K
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
K
 
H
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
F
G
|
G
L
|
L
G
 
G
G
 
G
L
|
L
G
 
G
H
 
S
M
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
F
A
 
I
N
 
K
A
 
A
M
 
F
G
 
G
A
 
G
K
 
K
V
 
A
V
 
T
L
 
V
F
 
I
T
x
S
T
|
T
S
 
S
P
 
R
D
 
R
K
|
K
R
 
E
E
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
E
L
 
E
-
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
D
E
 
A
V
 
F
V
 
V
V
 
V
S
 
N
K
 
T
N
 
D
K
 
S
D
 
E
E
 
Q
M
 
L
A
 
K
A
 
A
H
 
L
A
 
A
N
 
G
S
 
T
F
 
M
D
 
D
F
 
G
I
 
V
L
 
V
N
 
D
T
|
T
V
 
T
A
x
P
A
 
G
P
 
G
H
 
R
N
 
T
-
 
P
L
 
M
D
 
S
A
 
L
F
 
M
V
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
F
D
 
D
A
 
G
T
 
A
M
 
V
T
 
M
L
 
L
V
|
V
G
 
G
A
|
A
P
 
P
A
 
E
S
 
S
P
 
L
H
 
F
P
 
E
S
 
L
P
 
P
S
 
A
V
 
A
F
 
-
G
 
P
L
 
L
I
 
I
F
 
M
K
 
G
R
 
R
R
 
K
R
 
K
I
 
I
A
 
I
G
 
G
S
 
S
L
x
S
I
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
K
E
 
E
T
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
L
 
L
D
 
D
F
 
F
C
 
A
A
 
A
E
 
K
H
 
H
G
 
N
I
 
I
V
 
V
S
 
C
D
 
D
I
 
T
E
 
E
M
 
V
I
 
I
R
 
G
M
 
I
Q
 
D
D
 
Y
I
 
L
N
 
S
D
 
T
A
 
A
Y
 
M
E
 
E
R
 
R
M
 
I
L
 
K
K
 
N
S
x
L
D
 
D
V
 
V
K
 
K
Y
 
Y
R
|
R
F
 
F
V
 
A
I
 
I
D
 
D
M
 
I
A
 
G
-
 
N
T
 
T
L
 
L
K
 
K

5h81B Heteroyohimbine synthase thas2 from catharanthus roseus - complex with NADP+ (see paper)
43% identity, 98% coverage: 6:350/351 of query aligns to 6:354/354 of 5h81B

query
sites
5h81B
G
 
G
Y
 
W
A
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
D
P
 
T
S
 
S
T
 
G
P
 
L
L
 
L
A
 
S
P
 
P
Y
 
F
S
 
K
F
 
F
S
 
L
R
 
R
R
 
R
E
 
T
V
 
T
G
 
G
P
 
E
N
 
H
D
 
D
V
 
V
R
 
Q
I
 
F
E
 
K
I
 
V
L
 
L
F
 
Y
C
 
C
G
 
G
V
 
L
C
|
C
H
 
D
S
 
W
D
 
D
L
 
V
H
 
I
T
 
T
A
 
T
R
 
K
N
 
N
E
 
T
W
 
Y
N
 
G
N
 
T
T
 
T
L
 
K
Y
 
Y
P
 
P
S
 
F
V
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
E
|
E
I
 
I
V
 
M
G
 
G
R
 
I
V
 
V
S
 
T
A
 
E
V
 
I
G
 
G
A
 
N
N
 
K
V
 
V
S
 
K
K
 
K
F
 
F
K
 
K
A
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
K
A
 
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
N
L
 
F
V
 
I
D
 
G
S
 
S
C
|
C
R
 
G
T
 
K
C
|
C
S
 
E
S
 
R
C
|
C
G
 
N
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
Q
 
P
Y
 
Y
C
|
C
E
 
P
N
 
K
G
 
-
F
 
-
V
 
V
G
 
I
T
 
Y
Y
 
T
N
 
D
G
 
G
P
 
T
A
 
A
F
 
F
G
 
S
G
 
D
G
 
E
E
 
N
N
 
N
T
 
T
L
 
V
-
 
Y
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
I
-
 
Y
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
N
N
 
I
I
 
M
V
 
V
V
 
A
D
 
N
E
 
E
K
 
Y
Y
 
V
V
 
V
L
 
F
R
 
R
I
 
W
N
 
P
H
 
E
T
 
N
D
 
L
N
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
G
A
 
V
P
 
P
L
 
I
L
 
L
C
|
C
A
 
G
G
 
G
I
 
I
T
x
V
T
 
P
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
L
 
M
R
 
R
Q
 
H
W
 
F
K
 
G
V
 
L
-
 
D
G
 
K
P
 
P
G
 
G
Q
 
L
K
 
S
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
G
x
R
L
x
I
G
 
G
H
 
K
M
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
F
A
 
A
N
 
K
A
 
A
M
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
N
V
 
V
V
 
T
L
 
V
F
 
I
T
x
S
T
|
T
S
|
S
P
 
I
D
 
S
K
|
K
R
 
K
E
 
Q
D
 
E
A
 
A
L
 
I
-
 
E
R
 
K
L
 
Y
G
 
G
A
 
V
A
 
D
E
 
R
V
 
F
V
 
L
V
 
I
S
 
S
K
 
K
N
 
E
K
 
P
D
 
E
E
 
E
M
 
M
A
 
K
A
 
A
H
 
A
A
 
E
N
 
S
S
 
T
F
 
L
D
 
D
F
 
G
I
 
I
L
 
F
N
 
D
T
 
C
V
|
V
A
x
P
A
 
S
P
 
V
H
 
H
N
 
P
L
 
L
D
 
H
A
 
P
F
 
L
V
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
F
D
 
E
A
 
G
T
 
T
M
 
F
T
 
V
L
 
M
V
x
L
G
 
G
A
 
-
P
 
-
A
 
V
S
 
S
P
 
P
H
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
L
I
 
L
F
 
M
K
 
G
R
 
R
R
 
R
R
 
K
I
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
S
L
x
I
I
 
S
G
 
G
G
 
T
I
 
M
A
 
K
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
L
 
L
D
 
D
F
 
F
C
 
A
A
 
A
E
 
K
H
 
H
G
 
N
I
 
I
V
 
V
S
 
S
D
 
D
I
 
I
E
 
E
M
 
L
I
 
I
R
 
P
M
 
M
Q
 
D
D
 
Y
I
 
V
N
 
N
D
 
T
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
R
 
R
M
 
I
L
 
A
K
 
K
S
 
G
D
 
N
V
 
H
K
 
K
Y
 
D
R
x
A
F
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
D
M
 
I
A
 
E
-
 
N
T
 
T
L
 
L
K
 
K
S
 
S

5fi3A Heteroyohimbine synthase thas1 from catharanthus roseus - complex with NADP+ (see paper)
41% identity, 99% coverage: 3:350/351 of query aligns to 5:344/344 of 5fi3A

query
sites
5fi3A
N
 
K
S
 
A
I
 
F
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
D
P
 
S
S
 
S
T
 
G
P
 
L
L
 
F
A
 
S
P
 
P
Y
 
F
S
 
N
F
 
F
S
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
A
V
 
T
G
 
G
P
 
E
N
 
H
D
 
D
V
 
V
R
 
Q
I
 
L
E
 
K
I
 
V
L
 
L
F
 
Y
C
 
C
G
 
G
V
 
T
C
|
C
H
x
Q
S
x
Y
D
 
D
L
 
R
H
x
E
T
 
M
A
 
S
R
 
K
N
 
N
E
 
K
W
 
F
N