SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1248 FitnessBrowser__Phaeo:GFF1248 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
34% identity, 99% coverage: 1:249/251 of query aligns to 2:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
M
 
M
G
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
R
V
 
T
K
 
E
N
 
N
V
 
I
G
 
V
K
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
G
V
 
V
N
 
S
L
 
I
S
 
S
V
 
V
R
 
N
E
 
K
N
 
G
T
 
D
V
 
V
H
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
C
 
V
L
 
I
V
 
T
G
 
G
K
 
F
L
 
L
I
 
K
P
 
A
D
 
D
T
 
E
G
 
G
S
 
R
V
 
V
M
 
Y
F
 
F
D
 
E
G
 
N
K
 
K
S
 
D
V
 
I
L
 
T
G
 
N
R
 
K
A
 
E
P
 
P
Y
 
A
E
 
E
I
 
L
N
 
Y
Q
 
H
M
 
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
V
R
 
R
V
 
T
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
I
 
P
F
 
L
G
 
K
D
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
M
 
L
M
 
L
I
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
C
P
 
P
C
 
G
F
 
E
A
 
S
K
 
P
R
 
L
D
 
N
G
 
S
A
 
L
F
 
F
E
 
Y
M
 
K
N
 
K
A
 
W
I
 
I
S
 
P
A
 
K
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
E
R
 
E
D
 
E
I
 
M
L
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
E
 
F
H
 
K
M
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
F
M
 
L
N
 
K
M
 
L
A
 
S
D
 
H
K
 
L
R
 
Y
H
 
D
M
 
R
N
 
K
A
 
A
A
 
G
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
M
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
M
Q
 
T
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
A
R
 
P
A
 
G
D
 
L
T
 
A
N
 
H
N
 
D
T
 
I
I
 
F
D
 
N
L
 
H
L
 
V
K
 
L
Q
 
E
I
 
L
K
 
K
S
 
A
E
 
-
R
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
F
A
 
L
I
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
H
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
Y
A
 
I
D
 
D
R
 
H
I
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
A
 
F
Q
 
N
G
 
G
T
 
Q
P
 
I
L
 
I
V
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
G
E
 
E
D
 
E
D
 
E
P
 
I
Q
 
K
N
 
N
I
 
V
K
 
L
G
 
S
N
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
R
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
E
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
34% identity, 99% coverage: 1:248/251 of query aligns to 2:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
M
 
M
G
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
R
V
 
T
K
 
E
N
 
N
V
 
I
G
 
V
K
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
G
V
 
V
N
 
S
L
 
I
S
 
S
V
 
V
R
 
C
E
 
K
N
 
G
T
 
D
V
 
V
H
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
C
 
V
L
 
I
V
 
T
G
 
G
K
 
F
L
 
L
I
 
K
P
 
A
D
 
D
T
 
E
G
 
G
S
 
R
V
 
V
M
 
Y
F
 
F
D
 
E
G
 
N
K
 
K
S
 
D
V
 
I
L
 
T
G
 
N
R
 
K
A
 
E
P
 
P
Y
 
A
E
 
E
I
 
L
N
 
Y
Q
 
H
M
 
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
V
R
 
R
V
 
T
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
I
 
P
F
 
L
G
 
K
D
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
M
 
L
M
 
L
I
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
N
P
 
P
C
 
G
F
 
E
A
 
S
K
 
P
R
 
L
D
 
N
G
 
S
A
 
L
F
 
F
E
 
Y
M
 
K
N
 
K
A
 
W
I
 
I
S
 
P
A
 
K
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
E
R
 
E
D
 
E
I
 
M
L
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
E
 
F
H
 
K
M
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
F
M
 
L
N
 
K
M
 
L
A
 
S
D
 
H
K
 
L
R
 
Y
H
 
D
M
 
R
N
 
K
A
 
A
A
 
G
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
M
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
M
Q
 
T
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
A
R
 
P
A
 
G
D
 
L
T
 
A
N
 
H
N
 
D
T
 
I
I
 
F
D
 
N
L
 
H
L
 
V
K
 
L
Q
 
E
I
 
L
K
 
K
S
 
A
E
 
-
R
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
F
A
 
L
I
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
H
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
Y
A
 
I
D
 
D
R
 
H
I
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
A
 
F
Q
 
N
G
 
G
T
 
Q
P
 
I
L
 
I
V
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
G
E
 
E
D
 
E
D
 
E
P
 
I
Q
 
K
N
 
N
I
 
V
K
 
L
G
 
S
N
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
R
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
29% identity, 99% coverage: 2:249/251 of query aligns to 1:236/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
G
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
K
V
 
A
K
 
Q
N
 
H
V
 
L
G
 
A
K
 
K
R
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
L
 
R
Q
 
K
A
 
V
L
 
V
S
 
S
D
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
Q
V
 
V
R
 
E
E
 
S
N
 
G
T
 
Q
V
 
I
H
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
S
L
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
L
L
 
V
I
 
A
P
 
R
D
 
D
T
 
E
G
 
G
S
 
T
V
 
I
M
 
T
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
N
S
 
D
V
 
I
L
 
S
G
 
I
R
 
L
A
 
P
P
 
M
Y
 
H
E
 
S
I
 
R
N
 
S
Q
 
R
M
 
M
G
 
G
I
 
I
S
 
G
R
 
Y
V
 
L
F
 
P
Q
 
Q
T
 
E
P
 
A
E
 
S
I
 
I
F
 
F
G
 
R
D
 
K
L
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
E
E
 
D
N
 
N
M
 
I
M
 
M
I
 
A
P
 
V
C
 
L
F
 
Q
A
 
T
K
 
R
R
 
E
D
 
E
G
 
L
A
 
T
F
 
H
E
|
E
M
 
E
N
 
R
A
 
Q
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
-
E
x
D
K
 
K
A
 
L
E
 
E
H
 
D
M
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
M
 
F
N
 
H
M
 
I
A
 
Q
D
 
H
K
 
I
R
 
R
H
 
K
M
 
S
N
 
A
A
 
G
A
 
M
S
 
A
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
E
K
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
T
 
P
N
 
I
N
 
S
T
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
I
L
 
K
K
 
K
Q
 
I
I
 
I
K
 
E
S
 
H
E
 
L
R
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
G
I
 
L
T
 
G
I
 
V
A
 
L
I
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
H
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
D
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
K
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
P
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
E
D
 
G
D
 
T
P
 
P
Q
 
Q
N
 
D
I
 
V
K
 
L
G
 
N
N
 
N
P
 
E
K
 
Q
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
28% identity, 98% coverage: 3:248/251 of query aligns to 6:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
I
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
V
K
 
Q
N
 
S
V
 
L
G
 
H
K
 
V
R
 
Y
F
x
Y
G
 
G
G
 
A
L
 
I
Q
 
H
A
 
A
L
 
I
S
 
K
D
 
G
V
 
I
N
 
D
L
 
L
S
 
K
V
 
V
R
 
P
E
 
R
N
 
G
T
 
Q
V
 
I
H
 
V
A
 
T
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
N
 
S
C
 
A
L
 
I
V
 
A
G
 
G
K
 
L
L
 
V
I
 
R
P
 
A
D
 
Q
T
 
K
G
 
G
S
 
K
V
 
I
M
 
I
F
 
F
D
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
D
V
 
I
L
 
T
G
 
N
R
 
K
A
 
P
P
 
A
Y
 
H
E
 
V
I
 
I
N
 
N
Q
 
R
M
 
M
G
 
G
I
 
I
S
 
A
R
 
L
V
 
V
F
 
P
Q
x
E
T
 
G
P
 
R
E
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
P
D
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
M
 
L
M
 
M
I
 
M
P
 
G
C
 
A
F
 
Y
A
 
N
K
 
R
R
 
K
D
 
D
G
 
K
A
 
-
F
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
E
G
 
G
Q
 
I
R
 
K
D
 
R
I
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
W
A
 
I
E
 
F
H
 
S
M
 
L
L
 
F
E
 
P
E
 
R
M
 
L
N
 
K
M
 
-
A
 
-
D
 
E
K
 
R
R
 
L
H
 
K
M
 
Q
N
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
E
K
 
Q
R
 
Q
R
 
M
L
 
L
E
 
A
I
 
I
G
 
G
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
M
Q
 
S
E
 
R
P
 
P
R
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
L
G
 
G
M
 
L
A
 
A
R
 
P
A
 
I
D
 
L
T
 
V
N
 
S
N
 
E
T
 
V
I
 
F
D
 
E
L
 
V
L
 
I
K
 
Q
Q
 
K
I
 
I
K
 
N
S
 
Q
E
 
E
R
 
-
D
 
G
I
 
T
T
 
T
I
 
I
A
 
L
I
 
L
I
 
V
E
 
E
H
 
Q
D
 
N
M
 
A
H
 
L
V
 
G
V
 
A
F
 
L
S
 
K
L
 
V
A
 
A
D
 
H
R
 
Y
I
 
G
T
 
Y
V
 
V
L
 
L
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
T
 
Q
P
 
I
L
 
V
V
 
L
E
 
E
D
 
G
D
 
K
P
 
A
Q
 
S
N
 
E
I
 
L
K
 
L
G
 
D
N
 
N
P
 
E
K
 
M
V
 
V
R
 
R
E
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
29% identity, 99% coverage: 3:250/251 of query aligns to 2:242/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
I
 
L
L
 
I
E
 
E
V
 
V
K
 
K
N
 
N
V
 
L
G
 
S
K
 
F
R
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
L
 
R
Q
 
V
A
 
I
L
 
Y
S
 
D
D
 
N
V
 
I
N
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
I
R
 
R
E
 
R
N
 
G
T
 
Q
V
 
I
H
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
L
 
I
V
 
G
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
I
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
Q
G
 
G
S
 
E
V
 
V
M
 
L
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
S
 
D
V
 
I
L
 
A
G
 
Q
R
 
M
A
 
S
P
 
R
Y
 
Q
E
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
N
 
A
Q
 
R
M
 
M
G
 
G
I
 
M
S
 
-
R
 
-
V
 
L
F
 
F
Q
|
Q
T
 
S
P
 
G
E
 
A
I
 
L
F
 
F
G
 
T
D
 
D
L
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
M
 
V
M
 
-
I
 
-
P
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
F
E
 
P
M
 
I
N
 
R
A
 
A
I
 
H
S
 
T
A
 
K
V
 
L
S
 
S
G
 
-
Q
 
E
R
 
N
D
 
L
I
 
I
L
 
A
E
 
E
K
 
L
A
 
V
E
 
A
H
 
L
M
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
S
M
 
V
N
 
G
M
 
L
A
 
R
D
 
G
K
 
T
R
 
E
H
 
Q
M
 
L
N
 
M
A
 
P
A
 
T
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
M
K
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
I
S
 
A
Q
 
L
E
 
D
P
 
P
R
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
A
 
D
R
 
P
A
 
I
D
 
V
T
 
K
N
 
G
N
 
V
T
 
L
I
 
T
D
 
R
L
 
L
L
 
I
K
 
R
Q
 
S
I
 
L
K
 
R
S
 
E
E
 
A
R
 
L
D
 
D
I
 
L
T
 
T
I
 
T
A
 
I
I
 
I
I
 
V
E
 
S
H
|
H
D
 
D
M
 
V
H
 
P
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
S
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
I
L
 
Q
V
 
G
E
 
E
D
 
G
D
 
T
P
 
P
Q
 
E
N
 
E
I
 
L
K
 
Q
-
 
A
-
 
Y
G
 
A
N
 
S
P
 
P
K
 
F
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
S
S
 
A

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
29% identity, 99% coverage: 3:250/251 of query aligns to 4:244/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
I
 
L
L
 
I
E
 
E
V
 
V
K
 
K
N
 
N
V
 
L
G
 
S
K
 
F
R
 
N
F
 
R
G
 
G
G
 
E
L
 
R
Q
 
V
A
 
I
L
 
Y
S
 
D
D
 
N
V
 
I
N
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
I
R
 
R
E
 
R
N
 
G
T
 
Q
V
 
I
H
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
S
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
L
 
I
V
 
G
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
I
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
Q
G
 
G
S
 
E
V
 
V
M
 
L
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
S
 
D
V
 
I
L
 
A
G
 
Q
R
 
M
A
 
S
P
 
R
Y
 
Q
E
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
N
 
A
Q
 
R
M
 
M
G
 
G
I
 
M
S
 
-
R
 
-
V
 
L
F
 
F
Q
 
Q
T
 
S
P
 
G
E
 
A
I
 
L
F
 
F
G
 
T
D
 
D
L
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
M
 
V
M
 
-
I
 
-
P
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
F
E
 
P
M
 
I
N
 
R
A
 
A
I
 
H
S
 
T
A
 
K
V
 
L
S
 
S
G
 
-
Q
 
E
R
 
N
D
 
L
I
 
I
L
 
A
E
 
E
K
 
L
A
 
V
E
 
A
H
 
L
M
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
S
M
 
V
N
 
G
M
 
L
A
 
R
D
 
G
K
 
T
R
 
E
H
 
Q
M
 
L
N
 
M
A
 
P
A
 
T
S
x
E
M
 
L
S
|
S
R
 
G
G
 
G
D
x
M
K
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
I
S
 
A
Q
 
L
E
 
D
P
 
P
R
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
A
 
D
R
 
P
A
 
I
D
 
V
T
 
K
N
 
G
N
 
V
T
 
L
I
 
T
D
 
R
L
 
L
L
 
I
K
 
R
Q
 
S
I
 
L
K
 
R
S
 
E
E
 
A
R
 
L
D
 
D
I
 
L
T
 
T
I
 
T
A
 
I
I
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
H
 
P
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
S
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
I
L
 
Q
V
 
G
E
 
E
D
 
G
D
 
T
P
 
P
Q
 
E
N
 
E
I
 
L
K
 
Q
-
 
A
-
 
Y
G
 
A
N
 
S
P
 
P
K
 
F
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
S
S
 
A

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
29% identity, 99% coverage: 3:250/251 of query aligns to 4:244/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
I
 
L
L
 
I
E
 
E
V
 
V
K
 
K
N
 
N
V
 
L
G
 
S
K
 
F
R
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
L
x
R
Q
 
V
A
 
I
L
 
Y
S
 
D
D
 
N
V
 
I
N
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
I
R
 
R
E
 
R
N
 
G
T
 
Q
V
 
I
H
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
L
 
I
V
 
G
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
I
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
Q
G
 
G
S
 
E
V
 
V
M
 
L
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
S
 
D
V
 
I
L
 
A
G
 
Q
R
 
M
A
 
S
P
 
R
Y
 
Q
E
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
N
 
A
Q
 
R
M
 
M
G
 
G
I
 
M
S
 
-
R
 
-
V
 
L
F
 
F
Q
 
Q
T
 
S
P
 
G
E
 
A
I
 
L
F
 
F
G
 
T
D
 
D
L
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
M
 
V
M
 
-
I
 
-
P
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
F
E
 
P
M
 
I
N
 
R
A
 
A
I
 
H
S
 
T
A
 
K
V
 
L
S
 
S
G
 
-
Q
 
E
R
 
N
D
 
L
I
 
I
L
 
A
E
 
E
K
 
L
A
 
V
E
 
A
H
 
L
M
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
S
M
 
V
N
 
G
M
 
L
A
 
R
D
 
G
K
 
T
R
 
E
H
 
Q
M
 
L
N
 
M
A
 
P
A
 
T
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
M
K
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
I
S
 
A
Q
 
L
E
 
D
P
 
P
R
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
A
 
D
R
 
P
A
 
I
D
 
V
T
 
K
N
 
G
N
 
V
T
 
L
I
 
T
D
 
R
L
 
L
L
 
I
K
 
R
Q
 
S
I
 
L
K
 
R
S
 
E
E
 
A
R
 
L
D
 
D
I
 
L
T
 
T
I
 
T
A
 
I
I
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
H
 
P
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
S
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
I
L
 
Q
V
 
G
E
 
E
D
 
G
D
 
T
P
 
P
Q
 
E
N
 
E
I
 
L
K
 
Q
-
 
A
-
 
Y
G
 
A
N
 
S
P
 
P
K
 
F
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
S
S
 
A

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 91% coverage: 3:230/251 of query aligns to 4:222/501 of P04983

query
sites
P04983
I
 
L
L
 
L
E
 
Q
V
 
L
K
 
K
N
 
G
V
 
I
G
 
D
K
 
K
R
 
A
F
 
F
G
 
P
G
 
G
L
 
V
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
G
V
 
A
N
 
A
L
 
L
S
 
N
V
 
V
R
 
Y
E
 
P
N
 
G
T
 
R
V
 
V
H
 
M
A
 
A
I
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
M
L
 
M
N
 
K
C
 
V
L
 
L
V
 
T
G
 
G
K
 
I
L
 
Y
I
 
T
P
 
R
D
 
D
T
 
A
G
 
G
S
 
T
V
 
L
M
 
L
F
 
W
D
 
L
G
 
G
K
 
K
S
 
E
V
 
T
L
 
T
G
 
F
R
 
T
A
 
G
P
 
P
Y
 
K
E
 
S
I
 
S
N
 
Q
Q
 
E
M
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
G
R
 
I
V
 
I
F
 
H
Q
 
Q
T
 
E
P
 
L
E
 
N
I
 
L
F
 
I
G
 
P
D
 
Q
L
 
L
S
 
T
V
 
I
L
 
A
E
 
E
N
 
N
M
 
I
M
 
F
I
 
L
P
 
G
C
 
R
-
 
E
F
 
F
A
 
V
K
 
N
R
 
R
D
 
F
G
 
G
A
 
K
F
 
I
E
 
D
M
 
W
N
 
K
A
 
T
I
 
M
S
 
Y
A
 
A
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
E
A
 
A
E
 
D
H
 
K
M
 
L
L
 
L
E
 
A
E
 
K
M
 
L
N
 
N
M
 
L
A
 
R
D
 
F
K
 
K
R
 
S
H
 
D
M
 
K
N
 
L
A
 
V
A
 
G
S
 
D
M
 
L
S
 
S
R
 
I
G
 
G
D
 
D
K
 
Q
R
 
Q
R
 
M
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
M
 
K
C
 
V
L
 
L
S
 
S
Q
 
F
E
 
E
P
 
S
R
 
K
L
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
D
G
 
A
M
 
L
A
 
T
R
 
D
A
 
T
D
 
E
T
 
T
N
 
E
N
 
S
T
 
L
I
 
F
D
 
R
L
 
V
L
 
I
K
 
R
Q
 
E
I
 
L
K
 
K
S
 
S
E
 
Q
R
 
G
D
 
R
I
 
-
T
 
G
I
 
I
A
 
V
I
 
Y
I
 
I
E
 
S
H
 
H
D
 
R
M
 
M
H
 
K
V
 
E
V
 
I
F
 
F
S
 
E
L
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
D
I
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
F
A
 
R
Q
 
D
G
 
G
T
 
Q
P
 
F
L
 
I
V
 
A
E
 
E

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
30% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 3:236/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
E
 
T
V
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
L
G
 
A
K
 
K
R
 
A
F
 
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
N
E
 
S
N
 
G
T
 
E
V
 
I
H
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
I
L
 
V
I
 
P
P
 
R
D
 
D
T
 
A
G
 
G
S
 
N
V
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
D
S
 
D
V
 
I
L
 
S
G
 
L
R
 
L
A
 
P
P
 
L
Y
 
H
E
 
A
I
 
R
N
 
A
Q
 
R
M
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
R
 
Y
V
 
L
F
 
P
Q
 
Q
T
 
E
P
 
A
E
 
S
I
 
I
F
 
F
G
x
R
D
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
M
 
L
M
 
M
I
 
A
P
 
V
C
 
L
F
 
Q
A
 
I
K
 
R
R
 
D
D
 
D
G
 
L
A
 
S
F
 
A
E
 
E
M
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
Q
R
 
R
D
 
E
I
 
-
L
 
-
E
 
D
K
 
R
A
 
A
E
 
N
H
 
E
M
 
L
L
 
M
E
 
E
E
 
E
M
 
F
N
 
H
M
 
I
A
 
E
D
 
H
K
 
L
R
 
R
H
 
D
M
 
S
N
x
M
A
x
G
A
x
Q
S
 
S
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
E
K
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
T
 
P
N
 
I
N
 
S
T
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
I
L
 
K
K
 
R
Q
 
I
I
 
I
K
 
E
S
 
H
E
 
L
R
 
R
D
 
D
-
 
S
-
 
G
I
 
L
T
 
G
I
 
V
A
 
L
I
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
H
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
A
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
H
D
 
G
D
 
T
P
 
P
Q
 
T
N
 
E
I
 
I
K
 
L
G
 
Q
N
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
30% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 3:236/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
E
 
T
V
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
L
G
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
N
E
 
S
N
 
G
T
 
E
V
 
I
H
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
I
L
 
V
I
 
P
P
 
R
D
 
D
T
 
A
G
 
G
S
 
N
V
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
D
S
 
D
V
 
I
L
 
S
G
 
L
R
 
L
A
 
P
P
 
L
Y
 
H
E
 
A
I
 
R
N
 
A
Q
 
R
M
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
R
 
Y
V
 
L
F
 
P
Q
|
Q
T
 
E
P
 
A
E
 
S
I
 
I
F
 
F
G
 
R
D
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
M
 
L
M
 
M
I
 
A
P
 
V
C
 
L
F
 
Q
A
 
I
K
 
R
R
 
D
D
 
D
G
 
L
A
 
S
F
 
A
E
 
E
M
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
Q
R
 
R
D
 
E
I
 
-
L
 
-
E
 
D
K
 
R
A
 
A
E
 
N
H
 
E
M
 
L
L
 
M
E
 
E
E
 
E
M
 
F
N
 
H
M
 
I
A
 
E
D
 
H
K
 
L
R
 
R
H
 
D
M
 
S
N
 
M
A
 
G
A
 
Q
S
|
S
M
 
L
S
|
S
R
 
G
G
 
G
D
x
E
K
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
T
 
P
N
 
I
N
 
S
T
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
I
L
 
K
K
 
R
Q
 
I
I
 
I
K
 
E
S
 
H
E
 
L
R
 
R
D
 
D
-
 
S
-
 
G
I
 
L
T
 
G
I
 
V
A
 
L
I
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
H
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
A
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
H
D
 
G
D
 
T
P
 
P
Q
 
T
N
 
E
I
 
I
K
 
L
G
 
Q
N
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
28% identity, 94% coverage: 6:240/251 of query aligns to 6:232/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
V
 
V
K
 
K
N
 
N
V
 
V
G
 
S
K
 
K
R
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
N
N
 
G
T
 
E
V
 
R
H
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
C
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
K
 
L
L
 
D
I
 
V
P
 
P
D
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
E
V
 
L
M
 
Y
F
 
F
D
 
D
G
 
D
K
 
R
S
 
L
V
 
V
L
 
A
G
 
S
R
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
A
 
V
P
 
P
Y
 
P
E
 
E
I
 
D
N
 
R
Q
 
K
M
 
I
G
 
G
I
 
M
S
 
-
R
 
-
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
T
 
T
P
 
W
E
 
A
I
 
L
F
 
Y
G
 
P
D
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
M
 
I
M
 
A
I
 
F
P
 
P
C
 
L
F
 
T
A
 
N
K
 
M
R
 
K
D
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
M
G
 
S
Q
 
K
R
 
E
D
 
E
I
 
I
L
 
R
E
 
K
K
 
R
A
 
V
E
 
E
H
 
E
M
 
V
L
 
A
E
 
K
E
 
I
M
 
L
N
 
D
M
 
I
A
 
H
D
 
H
K
 
V
R
 
L
H
 
N
M
 
H
N
 
F
A
 
P
A
 
R
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
V
Q
 
K
E
 
D
P
 
P
R
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
A
 
D
R
 
A
A
 
R
D
 
M
T
 
R
N
 
D
N
 
S
T
 
A
I
 
R
D
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
Q
 
E
I
 
V
K
 
Q
S
 
S
E
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
L
A
 
L
I
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
H
 
A
V
 
D
V
 
I
F
 
F
S
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
K
P
 
L
L
 
V
V
 
Q
E
 
V
D
 
G
D
 
K
P
 
P
Q
 
E
N
 
D
I
 
L
K
 
Y
G
 
D
N
 
N
P
 
P

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
28% identity, 94% coverage: 6:240/251 of query aligns to 6:232/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
V
 
V
K
 
K
N
 
N
V
 
V
G
 
S
K
 
K
R
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
N
N
 
G
T
 
E
V
 
R
H
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
C
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
K
 
L
L
 
D
I
 
V
P
 
P
D
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
E
V
 
L
M
 
Y
F
 
F
D
 
D
G
 
D
K
 
R
S
 
L
V
 
V
L
 
A
G
 
S
R
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
A
 
V
P
 
P
Y
 
P
E
 
E
I
 
D
N
 
R
Q
 
K
M
 
I
G
 
G
I
 
M
S
 
-
R
 
-
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
P
 
W
E
 
A
I
 
L
F
 
Y
G
 
P
D
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
M
 
I
M
 
A
I
 
F
P
 
P
C
 
L
F
 
T
A
 
N
K
 
M
R
 
K
D
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
M
G
 
S
Q
 
K
R
 
E
D
 
E
I
 
I
L
 
R
E
 
K
K
 
R
A
 
V
E
 
E
H
 
E
M
 
V
L
 
A
E
 
K
E
 
I
M
 
L
N
 
D
M
 
I
A
 
H
D
 
H
K
 
V
R
 
L
H
 
N
M
 
H
N
 
F
A
 
P
A
 
R
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
V
Q
 
K
E
 
D
P
 
P
R
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
A
 
D
R
 
A
A
 
R
D
 
M
T
 
R
N
 
D
N
 
S
T
 
A
I
 
R
D
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
Q
 
E
I
 
V
K
 
Q
S
 
S
E
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
L
A
 
L
I
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
H
 
A
V
 
D
V
 
I
F
 
F
S
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
K
P
 
L
L
 
V
V
 
Q
E
 
V
D
 
G
D
 
K
P
 
P
Q
 
E
N
 
D
I
 
L
K
 
Y
G
 
D
N
 
N
P
 
P

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
28% identity, 94% coverage: 6:240/251 of query aligns to 6:232/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
V
 
V
K
 
K
N
 
N
V
 
V
G
 
S
K
 
K
R
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
Q
 
V
A
|
A
L
 
L
S
 
D
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
N
N
 
G
T
 
E
V
 
R
H
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
C
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
K
 
L
L
 
D
I
 
V
P
 
P
D
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
E
V
 
L
M
 
Y
F
 
F
D
 
D
G
 
D
K
 
R
S
 
L
V
 
V
L
 
A
G
 
S
R
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
A
 
V
P
 
P
Y
 
P
E
 
E
I
 
D
N
 
R
Q
 
K
M
 
I
G
 
G
I
 
M
S
 
-
R
 
-
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
P
 
W
E
 
A
I
 
L
F
 
Y
G
 
P
D
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
M
 
I
M
 
A
I
 
F
P
 
P
C
 
L
F
 
T
A
 
N
K
 
M
R
 
K
D
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
M
G
 
S
Q
 
K
R
 
E
D
 
E
I
 
I
L
 
R
E
 
K
K
 
R
A
 
V
E
 
E
H
 
E
M
 
V
L
 
A
E
 
K
E
 
I
M
 
L
N
 
D
M
 
I
A
 
H
D
 
H
K
 
V
R
 
L
H
 
N
M
 
H
N
 
F
A
 
P
A
 
R
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
V
Q
 
K
E
 
D
P
 
P
R
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
A
 
D
R
 
A
A
 
R
D
 
M
T
 
R
N
 
D
N
 
S
T
 
A
I
 
R
D
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
Q
 
E
I
 
V
K
 
Q
S
 
S
E
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
L
A
 
L
I
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
H
 
A
V
 
D
V
 
I
F
 
F
S
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
K
P
 
L
L
 
V
V
 
Q
E
 
V
D
 
G
D
 
K
P
 
P
Q
 
E
N
 
D
I
 
L
K
 
Y
G
 
D
N
 
N
P
 
P

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
28% identity, 94% coverage: 6:240/251 of query aligns to 6:232/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
V
 
V
K
 
K
N
 
N
V
 
V
G
 
S
K
 
K
R
 
V
F
 
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
D
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
R
 
E
E
 
N
N
 
G
T
 
E
V
 
R
H
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
C
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
K
 
L
L
 
D
I
 
V
P
 
P
D
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
E
V
 
L
M
 
Y
F
 
F
D
 
D
G
 
D
K
 
R
S
 
L
V
 
V
L
 
A
G
 
S
R
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
A
 
V
P
 
P
Y
 
P
E
 
E
I
 
D
N
 
R
Q
 
K
M
 
I
G
 
G
I
 
M
S
 
-
R
 
-
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
P
 
W
E
 
A
I
 
L
F
 
Y
G
 
P
D
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
M
 
I
M
 
A
I
 
F
P
 
P
C
 
L
F
 
T
A
 
N
K
 
M
R
 
K
D
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
M
G
 
S
Q
 
K
R
 
E
D
 
E
I
 
I
L
 
R
E
 
K
K
 
R
A
 
V
E
 
E
H
 
E
M
 
V
L
 
A
E
 
K
E
 
I
M
 
L
N
 
D
M
 
I
A
 
H
D
 
H
K
 
V
R
 
L
H
 
N
M
 
H
N
 
F
A
 
P
A
 
R
S
 
E
M
 
L
S
|
S
R
 
G
G
|
G
D
 
Q
K
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
V
Q
 
K
E
 
D
P
 
P
R
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
A
 
D
R
 
A
A
 
R
D
 
M
T
 
R
N
 
D
N
 
S
T
 
A
I
 
R
D
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
Q
 
E
I
 
V
K
 
Q
S
 
S
E
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
L
A
 
L
I
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
H
 
A
V
 
D
V
 
I
F
 
F
S
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
K
P
 
L
L
 
V
V
 
Q
E
 
V
D
 
G
D
 
K
P
 
P
Q
 
E
N
 
D
I
 
L
K
 
Y
G
 
D
N
 
N
P
 
P

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
29% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 4:237/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
L
 
L
E
 
T
V
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
L
G
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
x
V
L
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
N
E
 
S
N
 
G
T
 
E
V
 
I
H
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
I
L
 
V
I
 
P
P
 
R
D
 
D
T
 
A
G
 
G
S
 
N
V
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
D
S
 
D
V
 
I
L
 
S
G
 
L
R
 
L
A
 
P
P
 
L
Y
 
H
E
 
A
I
 
R
N
 
A
Q
 
R
M
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
R
 
Y
V
 
L
F
 
P
Q
 
Q
T
 
E
P
 
A
E
 
S
I
 
I
F
 
F
G
 
R
D
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
M
 
L
M
 
M
I
 
A
P
 
V
C
 
L
F
 
Q
A
 
I
K
 
R
R
 
D
D
 
D
G
 
L
A
 
S
F
 
A
E
 
E
M
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
Q
R
 
R
D
 
E
I
 
-
L
 
-
E
 
D
K
 
R
A
 
A
E
 
N
H
 
E
M
 
L
L
 
M
E
 
E
E
 
E
M
 
F
N
 
H
M
 
I
A
 
E
D
 
H
K
 
L
R
 
R
H
 
D
M
 
S
N
 
M
A
 
G
A
 
Q
S
 
S
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
E
K
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
T
 
P
N
 
I
N
 
S
T
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
I
L
 
K
K
 
R
Q
 
I
I
 
I
K
 
E
S
 
H
E
 
L
R
 
R
D
 
D
-
 
S
-
 
G
I
 
L
T
 
G
I
 
V
A
 
L
I
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
M
 
V
H
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
A
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
H
D
 
G
D
 
T
P
 
P
Q
 
T
N
 
E
I
 
I
K
 
L
G
 
Q
N
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
30% identity, 98% coverage: 4:248/251 of query aligns to 3:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
E
 
T
V
 
A
K
 
K
N
 
N
V
 
L
G
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
N
E
 
S
N
 
G
T
 
E
V
 
I
H
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
I
L
 
V
I
 
P
P
 
R
D
 
D
T
 
A
G
 
G
S
 
N
V
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
D
S
 
D
V
 
I
L
 
S
G
 
L
R
 
L
A
 
P
P
 
L
Y
 
H
E
 
A
I
 
R
N
 
A
Q
 
R
M
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
R
 
Y
V
 
L
F
 
P
Q
|
Q
T
 
E
P
 
A
E
 
S
I
 
I
F
 
F
G
 
R
D
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
M
 
L
M
 
M
I
 
A
P
 
V
C
 
L
F
 
Q
A
 
I
K
 
R
R
 
D
D
 
D
G
 
L
A
 
S
F
 
A
E
 
E
M
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
Q
R
 
R
D
 
E
I
 
-
L
 
-
E
 
D
K
 
R
A
 
A
E
 
N
H
 
E
M
 
L
L
 
M
E
 
E
E
 
E
M
 
F
N
 
H
M
 
I
A
 
E
D
 
H
K
 
L
R
 
R
H
 
D
M
 
S
N
 
M
A
 
G
A
 
Q
S
|
S
M
 
L
S
|
S
R
x
G
G
|
G
D
 
E
K
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
A
E
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
|
G
M
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
T
 
P
N
 
I
N
 
S
T
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
I
L
 
K
K
 
R
Q
 
I
I
 
I
K
 
E
S
 
H
E
 
L
R
 
R
D
 
D
-
 
S
-
 
G
I
 
L
T
 
G
I
 
V
A
 
L
I
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
D
 
N
M
 
V
H
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
A
L
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
H
D
 
G
D
 
T
P
 
P
Q
 
T
N
 
E
I
 
I
K
 
L
G
 
Q
N
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
27% identity, 95% coverage: 3:241/251 of query aligns to 3:230/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
I
 
M
L
 
I
E
 
D
V
 
V
K
 
H
N
 
Q
V
 
L
G
 
K
K
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
S
 
K
D
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
H
V
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
G
T
 
E
V
 
V
H
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
C
 
C
L
 
L
V
 
N
G
 
L
K
 
L
L
 
E
I
 
D
P
 
F
D
 
D
T
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
I
S
 
N
V
 
L
L
 
K
G
 
A
R
 
K
A
 
-
P
 
D
Y
 
T
E
 
N
I
 
L
N
 
N
Q
 
K
M
 
V
-
 
R
-
 
E
G
 
E
I
 
V
S
 
G
R
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
R
P
 
F
E
 
N
I
 
L
F
 
F
G
 
P
D
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
M
 
I
M
 
T
I
 
L
P
 
A
C
 
P
F
 
M
A
 
K
K
 
V
R
 
R
D
 
K
G
 
W
A
 
P
F
 
R
E
 
E
M
 
K
N
 
A
A
 
E
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
-
E
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
M
H
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
D
E
 
K
M
 
V
N
 
G
M
 
L
A
 
K
D
 
D
K
 
K
R
 
A
H
 
H
M
 
A
N
 
Y
A
 
P
A
 
D
S
 
S
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
A
 
D
R
 
P
A
 
E
D
 
M
T
 
V
N
 
G
N
 
E
T
 
V
I
 
L
D
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
Q
I
 
L
K
 
A
S
 
N
E
 
E
R
 
-
D
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
M
A
 
V
I
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
H
 
G
V
 
F
V
 
A
F
 
R
S
 
E
L
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
L
V
 
F
L
 
M
A
 
D
Q
 
G
G
 
G
T
 
Y
P
 
I
L
 
I
V
 
E
E
 
E
D
 
G
D
 
K
P
 
P
Q
 
E
N
 
D
I
 
L
K
 
F
G
 
D
N
 
R
P
 
P
K
 
Q

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
27% identity, 95% coverage: 3:241/251 of query aligns to 3:230/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
I
 
M
L
 
I
E
 
D
V
 
V
K
 
H
N
 
Q
V
 
L
G
 
K
K
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
S
 
K
D
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
H
V
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
G
T
 
E
V
 
V
H
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
C
 
C
L
 
L
V
 
N
G
 
L
K
 
L
L
 
E
I
 
D
P
 
F
D
 
D
T
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
I
S
 
N
V
 
L
L
 
K
G
 
A
R
 
K
A
 
-
P
 
D
Y
 
T
E
 
N
I
 
L
N
 
N
Q
 
K
M
 
V
-
 
R
-
 
E
G
 
E
I
 
V
S
 
G
R
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
R
P
 
F
E
 
N
I
 
L
F
 
F
G
 
P
D
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
M
 
I
M
 
T
I
 
L
P
 
A
C
 
P
F
 
M
A
 
K
K
 
V
R
 
R
D
 
K
G
 
W
A
 
P
F
 
R
E
 
E
M
 
K
N
 
A
A
 
E
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
-
E
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
M
H
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
D
E
 
K
M
 
V
N
 
G
M
 
L
A
 
K
D
 
D
K
 
K
R
 
A
H
 
H
M
 
A
N
 
Y
A
 
P
A
 
D
S
 
S
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
A
 
D
R
 
P
A
 
E
D
 
M
T
 
V
N
 
G
N
 
E
T
 
V
I
 
L
D
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
Q
I
 
L
K
 
A
S
 
N
E
 
E
R
 
-
D
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
M
A
 
V
I
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
H
 
G
V
 
F
V
 
A
F
 
R
S
 
E
L
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
L
V
 
F
L
 
M
A
 
D
Q
 
G
G
 
G
T
 
Y
P
 
I
L
 
I
V
 
E
E
 
E
D
 
G
D
 
K
P
 
P
Q
 
E
N
 
D
I
 
L
K
 
F
G
 
D
N
 
R
P
 
P
K
 
Q

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
27% identity, 95% coverage: 3:241/251 of query aligns to 3:230/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
I
 
M
L
 
I
E
 
D
V
 
V
K
 
H
N
 
Q
V
 
L
G
 
K
K
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
S
 
K
D
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
H
V
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
G
T
 
E
V
 
V
H
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
C
 
C
L
 
L
V
 
N
G
 
L
K
 
L
L
 
E
I
 
D
P
 
F
D
 
D
T
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
I
S
 
N
V
 
L
L
 
K
G
 
A
R
 
K
A
 
-
P
 
D
Y
 
T
E
 
N
I
 
L
N
 
N
Q
 
K
M
 
V
-
 
R
-
 
E
G
 
E
I
 
V
S
 
G
R
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
R
P
 
F
E
 
N
I
 
L
F
 
F
G
 
P
D
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
M
 
I
M
 
T
I
 
L
P
 
A
C
 
P
F
 
M
A
 
K
K
 
V
R
 
R
D
 
K
G
 
W
A
 
P
F
 
R
E
 
E
M
 
K
N
 
A
A
 
E
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
-
E
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
M
H
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
D
E
 
K
M
 
V
N
 
G
M
 
L
A
 
K
D
 
D
K
 
K
R
 
A
H
 
H
M
 
A
N
 
Y
A
 
P
A
 
D
S
 
S
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
A
 
D
R
 
P
A
 
E
D
 
M
T
 
V
N
 
G
N
 
E
T
 
V
I
 
L
D
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
Q
I
 
L
K
 
A
S
 
N
E
 
E
R
 
-
D
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
M
A
 
V
I
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
H
 
G
V
 
F
V
 
A
F
 
R
S
 
E
L
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
L
V
 
F
L
 
M
A
 
D
Q
 
G
G
 
G
T
 
Y
P
 
I
L
 
I
V
 
E
E
 
E
D
 
G
D
 
K
P
 
P
Q
 
E
N
 
D
I
 
L
K
 
F
G
 
D
N
 
R
P
 
P
K
 
Q

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
27% identity, 95% coverage: 3:241/251 of query aligns to 3:230/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
I
 
M
L
 
I
E
 
D
V
 
V
K
 
H
N
 
Q
V
 
L
G
 
K
K
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
S
 
K
D
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
H
V
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
G
T
 
E
V
 
V
H
 
V
A
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
N
 
R
C
 
C
L
 
L
V
 
N
G
 
L
K
 
L
L
 
E
I
 
D
P
 
F
D
 
D
T
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
I
S
 
N
V
 
L
L
 
K
G
 
A
R
 
K
A
 
-
P
 
D
Y
 
T
E
 
N
I
 
L
N
 
N
Q
 
K
M
 
V
-
 
R
-
 
E
G
 
E
I
 
V
S
 
G
R
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
R
P
 
F
E
 
N
I
 
L
F
 
F
G
 
P
D
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
M
 
I
M
 
T
I
 
L
P
 
A
C
 
P
F
 
M
A
 
K
K
 
V
R
 
R
D
 
K
G
 
W
A
 
P
F
 
R
E
 
E
M
 
K
N
 
A
A
 
E
I
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
-
E
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
M
H
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
D
E
 
K
M
 
V
N
 
G
M
 
L
A
 
K
D
 
D
K
 
K
R
 
A
H
 
H
M
 
A
N
 
Y
A
 
P
A
 
D
S
 
S
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
I
 
I
G
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
S
 
A
Q
 
M
E
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
A
 
D
R
 
P
A
 
E
D
 
M
T
 
V
N
 
G
N
 
E
T
 
V
I
 
L
D
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
Q
I
 
L
K
 
A
S
 
N
E
 
E
R
 
-
D
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
M
A
 
V
I
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
H
 
G
V
 
F
V
 
A
F
 
R
S
 
E
L
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
L
V
 
F
L
 
M
A
 
D
Q
 
G
G
 
G
T
 
Y
P
 
I
L
 
I
V
 
E
E
 
E
D
 
G
D
 
K
P
 
P
Q
 
E
N
 
D
I
 
L
K
 
F
G
 
D
N
 
R
P
 
P
K
 
Q

Query Sequence

>GFF1248 FitnessBrowser__Phaeo:GFF1248
MGILEVKNVGKRFGGLQALSDVNLSVRENTVHAIIGPNGAGKSTLLNCLVGKLIPDTGSV
MFDGKSVLGRAPYEINQMGISRVFQTPEIFGDLSVLENMMIPCFAKRDGAFEMNAISAVS
GQRDILEKAEHMLEEMNMADKRHMNAASMSRGDKRRLEIGMCLSQEPRLLLLDEPTAGMA
RADTNNTIDLLKQIKSERDITIAIIEHDMHVVFSLADRITVLAQGTPLVEDDPQNIKGNP
KVREAYLGESA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory