SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1301 PGA1_c13170 sorbitol dehydrogenase PolS to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
73% identity, 100% coverage: 1:257/257 of query aligns to 1:257/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
M
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
N
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
D
T
 
I
A
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
R
A
 
Q
T
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
I
G
 
G
A
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
V
 
V
E
 
Q
L
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
R
Q
 
Q
A
 
D
S
 
S
I
 
I
D
 
D
R
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
E
C
 
H
F
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
L
F
 
F
T
 
D
A
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
V
 
V
E
 
E
V
 
I
T
 
T
R
 
R
E
 
E
A
 
S
Y
 
Y
Q
 
E
R
 
K
T
 
L
F
 
F
D
 
A
I
 
I
N
 
N
V
 
V
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
M
 
T
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
T
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
|
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
|
E
P
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
A
V
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
I
 
I
S
 
K
H
 
H
G
 
R
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
|
H
W
|
W
D
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
L
F
|
F
A
 
A
K
 
R
Y
 
Y
E
 
E
G
 
N
K
 
R
A
 
P
P
 
R
G
 
G
Q
 
E
K
 
K
K
 
K
A
 
R
E
 
L
V
 
V
A
 
G
Q
 
E
S
 
A
V
 
V
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
A
V
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
A
D
 
E
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
A
 
S
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
W
 
W
M
 
M
S
 
S

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 3:252/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
R
Y
 
L
A
 
V
N
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
A
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
Y
D
 
N
T
 
D
A
 
A
R
 
T
A
 
A
E
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
E
I
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
K
L
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Q
x
R
A
x
D
S
 
Q
I
 
V
D
x
F
R
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
E
R
 
Q
T
 
A
V
 
R
E
 
K
C
 
T
F
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
V
 
V
F
 
A
T
 
P
A
 
S
A
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
E
E
 
S
V
 
I
T
 
T
R
 
P
E
 
E
A
 
I
Y
 
V
Q
 
D
R
 
K
T
 
V
F
 
Y
D
 
N
I
|
I
N
 
N
V
 
V
S
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
I
F
 
W
M
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
Q
x
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
T
 
K
Q
 
E
G
 
G
T
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
C
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
P
 
P
L
 
E
V
 
L
S
 
A
V
 
V
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
D
L
 
L
I
 
A
S
 
P
H
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
K
G
x
T
E
 
P
H
x
M
W
 
W
D
 
A
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
R
F
 
Q
F
x
V
A
 
S
K
 
E
Y
 
A
E
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
P
P
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
G
K
 
T
A
 
A
E
 
E
V
 
F
A
 
A
Q
 
K
S
 
R
V
 
I
P
 
T
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
S
T
 
E
A
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
A
M
 
C
A
 
V
V
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
P
D
 
D
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 3:252/256 of Q48436

query
sites
Q48436
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
A
x
K
A
|
A
F
x
I
A
|
A
E
x
L
A
x
R
Y
x
L
A
x
V
N
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
R
x
A
V
|
V
V
x
A
I
|
I
A
|
A
D
|
D
I
 
Y
D
 
N
T
 
D
A
 
A
R
 
T
A
 
A
E
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
E
I
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
V
 
V
E
 
K
L
 
V
D
|
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
R
A
 
D
S
 
Q
I
 
V
D
 
F
R
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
E
R
 
Q
T
 
A
V
 
R
E
 
K
C
 
T
F
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
G
V
 
V
F
 
A
T
 
P
A
 
S
A
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
E
E
 
S
V
 
I
T
 
T
R
 
P
E
 
E
A
 
I
Y
 
V
Q
 
D
R
 
K
T
 
V
F
 
Y
D
 
N
I
 
I
N
 
N
V
 
V
S
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
I
F
 
W
M
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
T
 
K
Q
 
E
G
 
G
T
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
C
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
P
 
P
L
 
E
V
 
L
S
 
A
V
 
V
Y
 
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
D
L
 
L
I
 
A
S
 
P
H
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
K
G
 
T
E
 
P
H
 
M
W
 
W
D
 
A
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
R
F
 
Q
F
 
V
A
 
S
K
 
E
Y
 
A
E
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
P
P
 
L
G
 
G
Q
 
Y
K
 
G
K
 
T
A
 
A
E
 
E
V
 
F
A
 
A
Q
 
K
S
 
R
V
 
I
P
 
T
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
S
T
 
E
A
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
A
M
 
C
A
 
V
V
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
P
D
 
D
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3wyeA Crystal structure of chimeric engineered (2s,3s)-butanediol dehydrogenase complexed with NAD+
40% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 2:251/255 of 3wyeA

query
sites
3wyeA
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
R
Y
 
L
A
 
V
N
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
A
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
Y
D
 
N
T
 
D
A
 
A
R
 
T
A
 
A
E
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
E
I
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
K
L
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
R
A
 
D
S
 
Q
I
 
V
D
 
F
R
 
A
A
 
A
L
 
V
S
 
E
R
 
Q
T
 
A
V
 
R
E
 
K
C
 
T
F
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
V
 
I
F
 
A
T
 
Q
A
 
I
A
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
R
 
E
E
 
E
A
 
D
Y
 
L
Q
 
K
R
 
Q
T
 
I
F
 
Y
D
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
V
S
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
F
M
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
T
 
K
Q
 
E
G
 
G
T
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
P
 
P
L
 
I
V
 
L
S
 
S
V
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
D
L
 
L
I
 
A
S
 
P
H
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
G
x
T
E
 
G
H
x
M
W
|
W
D
 
E
G
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
E
F
x
L
A
 
S
K
 
K
Y
 
I
E
 
N
G
 
G
K
 
K
A
 
P
P
 
I
G
 
G
Q
 
E
K
 
N
K
 
F
A
 
K
E
 
E
V
 
Y
A
 
S
Q
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
A
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
T
 
V
A
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
P
D
 
D
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
38% identity, 98% coverage: 4:256/257 of query aligns to 5:257/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
K
 
R
R
 
K
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
S
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
R
A
 
A
Y
 
L
A
 
D
N
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
D
T
 
V
A
 
M
R
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
V
A
 
A
Q
 
G
I
 
L
G
 
E
A
 
N
A
 
G
A
 
G
I
 
F
A
 
A
V
 
V
E
 
E
L
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
Q
 
R
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
D
R
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
Q
R
 
K
T
 
A
V
 
I
E
 
D
C
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
L
L
 
L
I
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
A
x
G
V
 
V
F
 
S
T
 
T
A
 
M
A
 
R
P
 
P
L
 
A
V
 
V
E
 
D
V
 
I
T
 
T
R
 
D
E
 
E
A
 
E
Y
 
W
Q
 
D
R
 
F
T
 
N
F
 
F
D
 
D
I
 
V
N
 
N
V
 
A
S
 
R
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
L
M
 
A
M
 
N
Q
 
Q
A
 
I
A
 
A
A
 
C
Q
 
R
Q
 
H
M
 
F
I
 
L
T
 
A
Q
 
S
G
 
N
T
 
T
G
 
K
G
 
G
K
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
T
A
 
A
S
|
S
Q
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
K
R
 
V
G
 
G
E
 
A
P
 
P
L
 
L
V
x
L
S
 
A
V
 
H
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
F
S
 
G
L
 
W
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
R
N
 
E
L
 
M
I
 
A
S
 
P
H
 
K
G
 
N
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
V
 
F
V
|
V
D
 
K
G
x
T
E
 
A
H
x
M
W
 
Q
D
 
E
G
 
R
V
 
E
D
 
I
A
 
I
F
 
W
F
x
E
A
 
A
K
 
E
Y
 
L
E
 
R
G
 
G
K
 
M
A
 
T
P
 
P
G
 
E
Q
 
A
K
 
V
K
 
R
A
 
A
E
 
E
V
 
Y
A
 
V
Q
 
S
S
 
L
V
 
T
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
I
G
 
E
T
 
E
A
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
D
M
 
V
A
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
A
A
 
A
D
 
R
Y
 
F
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
G
Y
 
I
N
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
W
 
R
M
 
M

Q9ZNN8 L-2,3-butanediol dehydrogenase; L-BDH; (S,S)-butanediol dehydrogenase; Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; EC 1.1.1.76; EC 1.1.1.304 from Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium saccharolyticum) (see paper)
41% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 3:254/258 of Q9ZNN8

query
sites
Q9ZNN8
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
G
F
 
I
A
 
S
E
 
E
A
 
K
Y
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
D
V
 
I
V
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
L
D
 
P
T
 
Q
A
x
Q
R
 
E
A
 
E
E
 
Q
A
 
A
-
 
A
-
 
E
T
 
T
A
 
I
A
 
K
Q
 
L
I
 
I
G
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
F
V
 
V
E
 
G
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
S
 
N
I
 
F
D
 
D
R
 
S
A
 
A
L
 
I
S
 
D
R
 
E
T
 
A
V
 
A
E
 
E
C
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
V
 
I
F
 
A
T
 
Q
A
 
I
A
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
R
 
E
E
 
E
A
 
D
Y
 
L
Q
 
K
R
 
Q
T
 
I
F
 
Y
D
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
V
S
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
F
M
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
S
Q
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
D
T
 
E
Q
 
L
G
 
G
T
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
 
S
Q
x
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
x
F
P
 
P
L
 
I
V
 
L
S
 
S
V
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
Q
N
 
E
L
 
L
I
 
A
S
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
H
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
|
V
D
x
G
G
x
T
E
 
G
H
 
M
W
 
W
D
 
E
G
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
E
F
 
L
A
 
S
K
 
K
Y
 
I
E
 
N
G
 
G
K
 
K
A
 
P
P
 
I
G
 
G
Q
 
E
K
 
N
K
 
F
A
 
K
E
 
E
V
 
Y
A
 
S
Q
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
A
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
T
 
V
A
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
D
 
N
A
 
S
D
 
N
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
Y
 
M
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3a28C Crystal structure of l-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
41% identity, 96% coverage: 7:253/257 of query aligns to 2:253/257 of 3a28C

query
sites
3a28C
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
G
F
 
I
A
 
S
E
 
E
A
 
K
Y
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
D
V
 
I
V
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
P
T
 
Q
A
x
Q
R
 
E
A
 
E
E
 
Q
A
 
A
-
 
A
-
 
E
T
 
T
A
 
I
A
 
K
Q
 
L
I
 
I
G
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
F
V
 
V
E
 
G
L
|
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
S
 
N
I
 
F
D
 
D
R
 
S
A
 
A
L
 
I
S
 
D
R
 
E
T
 
A
V
 
A
E
 
E
C
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
V
 
I
F
 
A
T
 
Q
A
 
I
A
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
R
 
E
E
 
E
A
 
D
Y
 
L
Q
 
K
R
 
Q
T
 
I
F
 
Y
D
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
V
S
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
F
M
 
G
M
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
S
Q
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
D
T
 
E
Q
 
L
G
 
G
T
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
P
 
P
L
 
I
V
 
L
S
 
S
V
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
Q
N
 
E
L
 
L
I
 
A
S
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
H
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
G
x
T
E
 
G
H
x
M
W
|
W
D
 
E
G
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
E
F
x
L
A
 
S
K
 
K
Y
 
I
E
 
N
G
 
G
K
 
K
A
 
P
P
 
I
G
 
G
Q
 
E
K
 
N
K
 
F
A
 
K
E
 
E
V
 
Y
A
 
S
Q
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
A
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
T
 
V
A
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
V
V
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
D
 
N
A
 
S
D
 
N
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
Y
 
M
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
38% identity, 100% coverage: 1:256/257 of query aligns to 2:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
K
 
S
R
 
R
L
 
L
S
 
Q
G
 
D
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
E
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
V
Y
 
F
A
 
M
N
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
F
D
 
N
T
 
E
A
 
A
R
 
-
A
 
A
E
 
G
A
 
K
T
 
E
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
I
 
A
G
 
N
A
 
P
A
 
G
A
 
V
I
 
V
A
 
F
V
 
I
E
 
R
L
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
R
A
 
E
S
 
S
I
 
V
D
 
H
R
 
R
A
 
L
L
 
V
S
 
E
R
 
N
T
 
V
V
 
A
E
 
E
C
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
V
x
I
F
 
T
T
 
R
A
x
D
A
 
S
P
 
M
L
 
L
V
 
S
E
x
K
V
 
M
T
 
T
R
 
V
E
 
D
A
 
Q
Y
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
T
 
V
F
 
I
D
 
N
I
 
V
N
|
N
V
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
H
M
 
C
M
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
L
Q
 
P
Q
 
Y
M
 
M
I
 
A
T
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
K
G
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
T
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
R
 
Y
G
 
G
E
x
N
P
x
V
L
 
G
V
x
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
W
G
 
A
L
 
K
N
 
E
L
 
L
I
 
A
S
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
F
V
x
T
D
 
E
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
x
T
A
 
A
F
x
M
F
 
V
A
 
A
K
 
E
Y
 
V
E
 
P
G
 
E
K
 
K
A
 
V
P
 
I
G
 
E
Q
x
K
K
 
M
K
 
K
A
 
A
E
 
Q
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
V
 
V
P
 
P
Y
 
M
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
M
 
A
A
 
Y
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
H
D
 
E
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
N
A
 
G
Q
 
H
T
 
V
Y
 
L
N
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
I
W
 
M
M
 
M

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
39% identity, 98% coverage: 1:253/257 of query aligns to 6:251/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
M
 
M
K
 
S
R
 
K
L
 
L
S
 
A
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
K
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
N
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
-
D
 
N
I
 
Y
D
x
A
T
x
S
A
x
S
R
 
K
A
 
A
E
 
G
A
 
A
T
 
D
A
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
I
A
 
T
Q
 
E
I
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
G
L
x
G
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
K
Q
 
A
A
 
A
S
 
D
I
 
A
D
 
Q
R
 
R
A
 
I
L
 
V
S
 
D
R
 
T
T
 
A
V
 
I
E
 
E
C
 
T
F
 
Y
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
A
x
G
V
 
V
F
x
Y
T
 
E
A
 
F
A
 
A
P
 
P
L
 
I
V
 
E
E
 
A
V
 
I
T
 
T
R
 
E
E
 
E
A
 
H
Y
 
Y
Q
 
R
R
 
R
T
 
Q
F
 
F
D
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
V
S
 
F
G
 
G
T
 
V
L
 
L
F
 
L
M
 
T
M
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
Q
 
K
Q
 
H
M
 
L
I
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
G
T
 
E
G
 
G
G
 
A
K
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
T
R
 
S
R
 
I
G
 
T
E
 
P
P
 
P
L
 
A
V
 
S
S
 
A
V
 
V
Y
|
Y
C
 
S
A
 
G
T
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
D
S
 
A
L
 
I
T
 
T
Q
 
G
S
 
V
A
 
L
G
 
A
L
 
L
N
 
E
L
 
L
I
 
G
S
 
P
H
 
R
G
 
K
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
N
P
|
P
G
|
G
-
x
M
-
x
I
V
 
V
V
x
T
D
 
E
G
|
G
E
x
T
H
 
H
W
 
S
D
 
A
G
 
G
V
x
I
D
 
-
A
 
-
F
 
I
F
 
G
A
 
S
K
 
D
Y
 
L
E
 
E
G
 
A
K
 
Q
A
 
V
P
 
L
G
 
G
Q
 
Q
K
 
-
K
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
V
 
T
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
A
 
N
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
S
M
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
R
Y
 
W
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
E
T
 
H
Y
 
L
N
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
38% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 6:254/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
K
 
K
R
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
E
Y
 
C
A
 
A
N
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
H
A
x
S
D
 
G
I
 
S
D
 
D
T
 
E
A
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
G
A
 
A
T
 
L
A
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
Q
 
A
I
 
F
G
 
G
A
 
G
A
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
L
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
D
 
D
Q
 
L
A
 
D
S
 
S
I
 
G
D
 
E
R
 
K
A
 
L
L
 
V
S
 
A
R
 
A
T
 
A
V
 
V
E
 
E
C
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
V
x
I
F
 
C
T
 
P
A
x
F
A
 
H
P
 
S
L
 
F
V
 
L
E
 
D
V
 
M
T
 
P
R
 
R
E
 
E
A
 
L
Y
 
Y
Q
 
L
R
 
K
T
 
T
F
 
V
D
 
G
I
 
T
N
 
N
V
 
L
S
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
F
 
F
M
 
T
M
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
T
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
A
x
S
S
|
S
Q
 
I
A
x
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
P
 
A
L
 
M
V
x
Q
S
 
T
V
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
G
 
A
L
 
I
N
 
A
L
 
L
I
 
G
S
 
P
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
A
F
x
T
F
 
D
A
x
I
K
x
N
Y
 
K
E
 
E
G
 
D
K
 
L
A
 
S
P
 
D
G
 
L
Q
 
E
K
 
K
K
 
R
A
 
E
E
 
R
V
 
M
A
 
T
Q
 
S
S
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
x
D
D
x
M
A
 
A
D
x
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
W
 
F
M
 
V
S
 
N

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
38% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 6:254/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
K
 
K
R
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
E
Y
 
C
A
 
A
N
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
H
A
 
S
D
 
G
I
 
S
D
 
D
T
 
E
A
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
G
A
 
A
T
 
L
A
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
Q
 
A
I
 
F
G
 
G
A
 
G
A
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
L
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
D
 
D
Q
 
L
A
 
D
S
 
S
I
 
G
D
 
E
R
 
K
A
 
L
L
 
V
S
 
A
R
 
A
T
 
A
V
 
V
E
 
E
C
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
V
x
I
F
 
C
T
 
P
A
 
F
A
 
H
P
 
S
L
 
F
V
 
L
E
 
D
V
 
M
T
 
P
R
 
R
E
 
E
A
 
L
Y
 
Y
Q
 
L
R
 
K
T
 
T
F
 
V
D
 
G
I
x
T
N
 
N
V
 
L
S
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
F
 
F
M
 
T
M
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
T
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
P
 
A
L
 
M
V
 
Q
S
 
T
V
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
G
 
A
L
 
I
N
 
A
L
 
L
I
 
G
S
 
P
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
A
F
x
T
F
 
D
A
x
I
K
 
N
Y
 
K
E
 
E
G
 
D
K
 
L
A
 
S
P
 
D
G
 
L
Q
 
E
K
 
K
K
 
R
A
 
E
E
 
R
V
 
M
A
 
T
Q
 
S
S
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
M
A
 
A
D
 
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
W
 
F
M
 
V
S
 
N

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:253/257 of query aligns to 4:251/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
R
 
N
L
 
L
S
 
T
G
 
D
K
 
K
R
 
T
A
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
F
 
A
A
 
V
E
 
Q
A
 
A
Y
 
F
A
 
L
N
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
R
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
T
 
E
A
 
A
R
 
Q
A
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
M
A
 
V
A
 
R
Q
 
K
I
 
E
G
 
N
A
 
N
A
 
D
A
 
R
I
 
L
A
 
H
-
 
F
V
 
V
E
 
Q
L
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
D
 
D
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
I
 
C
D
 
Q
R
 
H
A
 
A
L
 
V
S
 
E
R
 
S
T
 
A
V
 
V
E
 
H
C
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
V
 
I
F
 
E
T
 
I
A
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
I
V
 
H
E
 
E
V
 
M
T
 
E
R
 
L
E
 
S
A
 
D
Y
 
W
Q
 
N
R
 
K
T
 
V
F
 
L
D
 
Q
I
 
V
N
 
N
V
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
M
L
 
F
F
 
L
M
 
M
M
 
S
Q
 
K
A
 
H
A
 
A
A
 
L
Q
 
K
Q
 
H
M
 
M
I
 
L
T
 
A
Q
 
A
G
 
G
T
 
K
G
 
-
G
 
G
K
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
T
A
 
C
S
|
S
Q
 
V
A
 
G
G
 
G
R
 
L
R
 
V
G
 
A
E
 
W
P
 
P
L
 
D
V
 
I
S
 
P
V
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
L
S
 
Q
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
M
G
 
A
L
 
V
N
 
D
L
 
Y
I
 
A
S
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
x
I
D
 
D
G
 
T
E
 
P
H
 
L
W
 
N
D
 
E
G
 
-
V
 
-
D
 
K
A
 
S
F
 
F
F
 
L
A
 
E
K
 
N
Y
 
N
E
 
E
G
 
G
K
 
T
A
 
L
P
 
E
G
 
E
Q
 
I
K
 
K
K
 
K
A
 
-
E
 
E
V
 
K
A
 
A
Q
 
K
S
 
V
V
 
N
P
 
P
Y
 
L
G
 
L
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
P
A
 
E
D
 
E
L
 
I
T
 
A
G
 
N
M
 
V
A
 
M
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
L
A
 
S
D
 
S
Y
 
Y
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
S
T
 
A
Y
 
I
N
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 6:245/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
K
 
K
R
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
E
Y
 
C
A
 
A
N
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
x
H
A
x
S
D
 
G
I
 
S
D
 
D
T
 
E
A
x
G
R
 
R
A
 
A
E
 
G
A
 
A
T
 
L
A
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
Q
 
A
I
 
F
G
 
G
A
 
G
A
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
G
L
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
D
 
D
Q
 
L
A
 
D
S
 
S
I
 
G
D
 
E
R
 
K
A
 
L
L
 
V
S
 
A
R
 
A
T
 
A
V
 
V
E
 
E
C
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
V
x
I
F
 
C
T
 
P
A
 
F
A
 
H
P
 
S
L
 
F
V
 
L
E
 
D
V
 
M
T
 
P
R
 
R
E
 
E
A
 
L
Y
 
Y
Q
 
L
R
 
K
T
 
T
F
 
V
D
 
G
I
x
T
N
 
N
V
 
L
S
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
F
 
F
M
 
T
M
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
T
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
 
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
P
 
A
L
 
M
V
 
Q
S
 
T
V
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
G
 
A
L
 
I
N
 
A
L
 
L
I
 
G
S
 
P
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
A
P
 
D
G
 
L
Q
 
E
K
 
K
K
 
R
A
 
E
E
 
R
V
 
M
A
 
T
Q
 
S
S
 
R
V
 
V
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
M
A
 
A
D
 
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
W
 
F
M
 
V
S
 
N

3pk0B Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr from mycobacterium smegmatis (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:256/257 of query aligns to 5:253/262 of 3pk0B

query
sites
3pk0B
M
 
M
K
 
F
R
 
D
L
 
L
S
 
Q
G
 
G
K
 
R
R
 
S
A
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
T
R
 
K
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
G
F
 
I
A
 
A
E
 
T
A
 
V
Y
 
F
A
 
A
N
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
V
V
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
G
I
 
R
D
 
S
T
 
T
A
 
A
R
 
D
A
 
I
E
 
D
A
 
A
T
 
C
A
 
V
A
 
A
-
 
D
-
 
L
-
x
D
Q
 
Q
I
 
L
G
|
G
A
 
S
A
x
G
-
 
K
A
 
V
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
Q
L
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
S
 
Q
I
 
C
D
 
D
R
 
A
A
 
L
L
 
A
S
 
G
R
 
R
T
 
A
V
 
V
E
 
E
C
 
E
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
I
 
C
N
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
G
V
 
V
F
 
F
T
 
P
A
 
D
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
A
E
 
T
V
 
M
T
 
T
R
 
P
E
 
E
A
 
Q
Y
 
L
Q
 
N
R
 
G
T
 
I
F
 
F
D
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
S
 
N
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
Y
M
 
A
M
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
A
 
L
Q
 
D
Q
 
A
M
 
L
I
 
I
T
 
A
Q
 
S
G
 
G
T
 
S
G
 
G
G
 
R
K
 
V
I
 
V
I
 
L
N
 
T
M
 
S
A
x
S
S
 
I
Q
 
T
A
 
G
G
 
P
R
 
I
R
 
T
G
 
G
E
 
Y
P
 
P
L
 
G
V
x
W
S
 
S
V
 
H
Y
|
Y
C
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
Q
I
 
L
S
 
G
L
 
F
T
 
M
Q
 
R
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
I
N
 
E
L
 
L
I
 
A
S
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
N
V
 
I
D
 
M
G
 
T
E
 
E
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
G
F
 
L
F
 
L
A
 
E
K
 
N
Y
 
G
E
 
E
G
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
E
K
 
Y
K
 
I
A
 
A
E
 
S
V
 
M
A
 
A
Q
 
R
S
 
S
V
 
I
P
 
P
Y
 
A
G
 
G
R
 
A
M
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
G
G
 
H
M
 
L
A
 
A
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
E
 
K
D
 
E
A
 
A
D
 
G
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
A
Y
 
I
N
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
W
 
V
M
 
L

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
35% identity, 98% coverage: 3:253/257 of query aligns to 2:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
R
 
R
L
 
L
S
 
A
G
 
N
K
 
R
R
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
I
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
N
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
I
D
 
N
T
 
E
A
 
P
R
 
K
A
 
A
E
 
T
A
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
T
-
 
S
-
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
A
E
 
A
L
 
V
D
 
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
V
A
 
E
S
 
S
I
 
V
D
 
N
R
 
R
A
 
M
L
 
V
S
 
D
R
 
S
T
 
A
V
 
V
E
 
E
C
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
|
A
V
 
I
F
 
F
T
x
S
A
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
M
A
 
K
P
 
P
L
 
F
V
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
S
R
 
G
E
 
D
A
 
E
Y
 
W
Q
 
D
R
 
K
T
 
L
F
 
F
D
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
A
S
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
L
M
 
C
M
 
C
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
S
Q
 
P
Q
 
V
M
 
M
I
 
-
T
 
R
Q
 
K
G
 
N
T
 
Q
G
 
Y
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
x
S
S
|
S
Q
 
S
A
 
V
G
 
V
R
 
V
R
 
T
G
 
G
E
 
R
P
 
P
L
 
N
V
 
Y
S
 
A
V
 
H
Y
|
Y
C
 
I
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
W
S
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
H
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
T
N
 
E
L
 
M
I
 
G
S
 
T
H
 
D
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
x
H
G
 
G
V
x
I
D
 
I
A
 
T
F
 
E
F
x
I
A
 
P
K
 
R
Y
 
E
E
 
T
G
 
I
K
 
S
A
 
E
P
 
E
G
 
G
Q
 
W
K
 
R
K
 
R
A
 
N
E
 
L
V
 
E
A
 
E
Q
 
Q
S
 
A
V
 
L
P
 
K
Y
 
-
G
 
-
R
 
R
M
 
K
G
 
G
T
 
D
A
 
A
A
 
S
D
 
D
L
 
L
T
 
V
G
 
G
M
 
I
A
 
L
V
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
E
A
 
S
D
 
K
Y
 
F
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
V
N
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
37% identity, 98% coverage: 3:253/257 of query aligns to 5:244/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
R
 
K
L
 
L
S
 
A
G
 
S
K
 
K
R
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
F
A
 
G
F
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
V
Y
 
L
A
 
A
N
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
R
D
 
D
T
 
-
A
 
A
R
 
H
A
 
G
E
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
I
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
F
V
 
I
E
 
S
L
x
C
D
 
N
V
x
I
T
 
A
D
 
E
Q
 
K
A
 
T
S
 
Q
I
 
V
D
 
E
R
 
A
A
 
L
L
 
F
S
 
S
R
 
Q
T
 
A
V
 
E
E
 
E
C
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
V
x
I
F
 
N
T
 
R
A
 
D
A
 
A
P
 
M
L
 
L
V
 
H
E
 
K
V
 
L
T
 
T
R
 
E
E
 
A
A
 
D
Y
 
W
Q
 
D
R
 
T
T
 
V
F
 
I
D
 
D
I
x
V
N
 
N
V
 
L
S
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
L
M
 
C
M
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
Q
 
I
Q
 
R
M
 
M
I
 
R
T
 
E
Q
 
R
G
 
G
T
 
A
G
 
-
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
I
A
 
A
S
 
S
Q
 
-
A
 
A
G
 
S
R
 
W
R
 
L
G
 
G
E
 
N
P
 
V
L
 
G
V
 
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
G
L
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
A
G
 
C
L
 
R
N
 
E
L
 
L
I
 
A
S
 
K
H
 
K
G
 
G
I
 
V
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
D
 
D
G
x
T
E
 
D
H
 
M
W
x
T
D
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
-
A
 
-
F
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
P
G
 
E
Q
 
N
K
 
V
K
 
W
A
 
Q
E
 
I
V
 
M
A
 
V
Q
 
S
S
 
K
V
 
I
P
 
P
Y
 
A
G
 
G
R
 
Y
M
 
A
G
 
G
T
 
E
A
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
V
T
 
G
G
 
E
M
 
C
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
G
A
 
A
D
 
R
Y
 
Y
V
 
I
V
 
N
A
 
G
Q
 
E
T
 
V
Y
 
I
N
 
N
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
35% identity, 97% coverage: 7:256/257 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
F
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
Q
Y
 
L
A
 
A
N
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
V
 
A
I
 
V
A
 
N
D
 
Y
I
 
A
D
 
G
T
 
S
A
 
K
-
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
V
A
 
E
Q
 
E
I
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
A
 
V
A
 
D
A
 
S
I
 
F
A
 
A
V
 
I
E
 
Q
L
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
D
 
D
Q
 
A
A
 
D
S
 
E
I
 
V
D
 
K
R
 
A
A
 
M
L
 
I
S
 
K
R
 
E
T
 
V
V
 
V
E
 
S
C
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
V
 
I
F
 
T
T
 
R
A
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
V
 
M
E
 
R
V
 
M
T
 
K
R
 
E
E
 
Q
A
 
E
Y
 
W
Q
 
D
R
 
D
T
 
V
F
 
I
D
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
L
S
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
N
M
 
C
M
 
I
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
A
 
T
Q
 
P
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
T
 
R
Q
 
Q
G
 
R
T
 
S
G
 
G
G
 
A
K
 
-
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
R
 
V
G
 
G
E
 
N
P
 
P
L
 
G
V
x
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
E
L
 
L
I
 
A
S
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
D
 
V
G
 
S
E
 
D
H
 
M
W
 
T
D
 
D
G
 
A
V
 
L
D
 
-
A
 
-
F
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
S
G
 
D
Q
 
E
K
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
Q
V
 
M
A
 
L
Q
 
T
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
A
 
T
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
M
 
T
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
K
A
 
A
D
 
K
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
I
N
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
W
 
Y
M
 
M

Q5P5I4 (S)-1-Phenylethanol dehydrogenase; EC 1.1.1.311 from Aromatoleum aromaticum (strain EbN1) (Azoarcus sp. (strain EbN1)) (see 2 papers)
37% identity, 98% coverage: 2:253/257 of query aligns to 3:245/249 of Q5P5I4

query
sites
Q5P5I4
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
K
G
 
D
K
 
K
R
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
N
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
V
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
 
L
D
 
V
T
 
P
A
 
A
-
 
P
R
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
I
A
 
R
Q
 
N
I
 
L
G
 
G
A
 
R
A
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
T
V
 
V
E
 
K
L
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
Q
Q
 
P
A
 
G
S
 
D
I
 
V
D
 
E
R
 
A
A
 
F
L
 
G
S
 
K
R
 
Q
T
 
V
V
 
I
E
 
S
C
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
V
 
I
F
x
Y
T
 
P
A
 
L
A
 
I
P
 
P
L
 
F
V
 
D
E
 
E
V
 
L
T
 
T
R
 
F
E
 
E
A
 
Q
Y
 
W
Q
 
K
R
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
E
I
 
I
N
 
N
V
 
V
S
 
D
G
 
S
T
 
G
L
 
F
F
 
L
M
 
M
M
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
V
Q
 
P
Q
 
G
M
 
M
I
 
K
T
 
R
Q
 
N
G
 
G
T
 
-
G
 
W
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
T
S
 
S
Q
 
T
A
 
T
G
 
Y
R
 
W
R
 
L
G
 
K
E
 
I
P
 
E
L
 
A
V
 
Y
S
 
T
V
 
H
Y
 
Y
C
 
I
A
 
S
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
N
I
 
I
S
 
G
L
 
F
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
S
N
 
D
L
 
L
I
 
G
S
 
K
H
 
D
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
x
S
V
x
L
V
|
V
D
 
R
G
 
T
E
 
A
H
x
T
W
 
T
D
 
E
G
 
A
V
 
-
D
 
S
A
 
A
F
 
L
F
 
S
A
 
A
K
 
M
Y
 
F
E
 
D
G
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
V
K
 
L
A
 
P
E
 
N
V
 
M
A
 
L
Q
 
Q
S
 
A
V
 
I
P
 
P
Y
 
-
G
 
-
R
 
R
M
 
L
G
 
Q
T
 
V
A
 
P
A
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
A
A
 
A
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
S
Y
 
F
V
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
L
N
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2ewmB Crystal structure of the (s)-specific 1-phenylethanol dehydrogenase of the denitrifying bacterium strain ebn1 (see paper)
37% identity, 98% coverage: 2:253/257 of query aligns to 1:243/247 of 2ewmB

query
sites
2ewmB
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
K
G
 
D
K
 
K
R
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
N
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
I
V
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
V
T
 
P
A
 
A
-
 
P
R
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
I
A
 
R
Q
 
N
I
 
L
G
 
G
A
 
R
A
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
T
V
 
V
E
 
K
L
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
Q
Q
 
P
A
 
G
S
 
D
I
 
V
D
 
E
R
 
A
A
 
F
L
 
G
S
 
K
R
 
Q
T
 
V
V
 
I
E
 
S
C
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
V
 
I
F
 
Y
T
 
P
A
 
L
A
 
I
P
 
P
L
 
F
V
 
D
E
 
E
V
 
L
T
 
T
R
 
F
E
 
E
A
 
Q
Y
 
W
Q
 
K
R
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
E
I
 
I
N
 
N
V
 
V
S
 
D
G
 
S
T
 
G
L
 
F
F
 
L
M
 
M
M
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
F
A
 
V
Q
 
P
Q
 
G
M
 
M
I
 
K
T
 
R
Q
 
N
G
 
G
T
 
-
G
 
W
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
T
S
|
S
Q
 
T
A
 
T
G
 
Y
R
 
W
R
 
L
G
 
K
E
 
I
P
 
E
L
 
A
V
x
Y
S
 
T
V
 
H
Y
|
Y
C
 
I
A
 
S
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
N
I
 
I
S
 
G
L
 
F
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
S
N
 
D
L
 
L
I
 
G
S
 
K
H
 
D
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
x
S
V
x
L
V
|
V
D
 
R
G
 
T
E
 
A
H
x
T
W
 
T
D
 
E
G
 
A
V
 
-
D
 
S
A
 
A
F
 
L
F
 
S
A
 
A
K
 
M
Y
 
F
E
 
D
G
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
K
 
V
K
 
L
A
 
P
E
 
N
V
 
M
A
 
L
Q
 
Q
S
 
A
V
 
I
P
 
P
Y
 
-
G
 
-
R
 
R
M
 
L
G
 
Q
T
 
V
A
 
P
A
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
A
A
 
A
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
S
Y
 
F
V
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
L
N
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
35% identity, 97% coverage: 7:256/257 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
F
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
Q
Y
 
L
A
 
A
N
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
V
 
A
I
 
V
A
x
N
D
x
Y
I
x
A
D
x
G
T
x
S
A
 
K
-
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
V
A
 
E
Q
 
E
I
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
A
 
V
A
 
D
A
 
S
I
 
F
A
 
A
V
 
I
E
 
Q
L
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
D
Q
 
A
A
 
D
S
 
E
I
 
V
D
 
K
R
 
A
A
 
M
L
 
I
S
 
K
R
 
E
T
 
V
V
 
V
E
 
S
C
 
Q
F
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
V
 
I
F
 
T
T
 
R
A
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
V
 
M
E
 
R
V
 
M
T
 
K
R
 
E
E
 
Q
A
 
E
Y
 
W
Q
 
D
R
 
D
T
 
V
F
 
I
D
 
D
I
x
T
N
 
N
V
 
L
S
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
N
M
 
C
M
 
I
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
A
 
T
Q
 
P
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
T
 
R
Q
 
Q
G
 
R
T
 
S
G
 
G
G
 
A
K
 
-
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
R
 
V
G
 
G
E
 
N
P
 
P
L
 
G
V
x
Q
S
 
A
V
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
E
L
 
L
I
 
A
S
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
F
V
 
I
D
 
V
G
 
S
E
 
D
H
 
M
W
 
T
D
 
D
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
E
K
 
L
K
 
K
A
 
E
E
 
Q
V
 
M
A
 
L
Q
 
T
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
A
 
T
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
M
 
T
A
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
K
A
 
A
D
 
K
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
I
N
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
W
 
Y
M
 
M

Query Sequence

>GFF1301 PGA1_c13170 sorbitol dehydrogenase PolS
MKRLSGKRALITGAARGIGAAFAEAYANEGARVVIADIDTARAEATAAQIGAAAIAVELD
VTDQASIDRALSRTVECFGGLDILINNAAVFTAAPLVEVTREAYQRTFDINVSGTLFMMQ
AAAQQMITQGTGGKIINMASQAGRRGEPLVSVYCATKAAVISLTQSAGLNLISHGINVNA
IAPGVVDGEHWDGVDAFFAKYEGKAPGQKKAEVAQSVPYGRMGTAADLTGMAVFLASEDA
DYVVAQTYNVDGGQWMS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory