SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1325 FitnessBrowser__WCS417:GFF1325 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2xuaH Crystal structure of the enol-lactonase from burkholderia xenovorans lb400 (see paper)
48% identity, 99% coverage: 1:260/263 of query aligns to 1:259/261 of 2xuaH

query
sites
2xuaH
M
 
M
A
 
P
F
 
Y
V
 
A
Q
 
A
L
 
V
A
 
N
E
 
G
G
 
T
E
 
E
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Q
 
R
L
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
E
E
 
R
-
 
H
-
 
G
G
 
N
A
 
A
P
 
P
V
 
W
L
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
S
N
 
N
S
 
S
L
|
L
G
 
G
T
 
T
D
 
D
L
 
L
H
 
S
M
 
M
W
 
W
D
 
A
L
 
P
Q
 
Q
I
 
V
P
 
A
A
 
A
F
 
L
T
 
S
Q
 
K
H
 
H
F
 
F
R
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
R
F
 
Y
D
 
D
T
 
T
R
 
R
G
 
G
H
 
H
G
 
G
K
 
H
S
 
S
L
 
E
V
 
A
T
 
P
P
 
K
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
S
 
T
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
T
Q
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
L
A
 
G
L
 
L
L
 
M
D
 
D
A
 
T
L
 
L
D
 
K
I
 
I
Q
 
A
R
 
R
A
 
A
H
 
N
F
 
F
C
 
C
G
 
G
L
 
L
S
 
S
M
|
M
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
T
G
 
G
Q
 
V
W
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
A
N
 
R
A
 
H
G
 
A
Q
 
D
R
 
R
L
 
I
Q
 
E
R
 
R
L
 
V
V
 
A
V
 
L
C
 
C
N
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
S
P
 
P
E
 
E
V
 
V
W
 
W
N
 
V
P
 
P
R
|
R
I
 
A
E
 
V
M
 
K
V
 
A
L
 
R
R
 
T
D
 
E
G
 
G
A
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
M
V
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
D
A
 
A
S
x
V
I
 
L
A
 
P
R
|
R
W
|
W
F
 
F
T
 
T
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
A
 
M
A
 
E
A
 
R
N
 
E
P
 
P
Y
 
V
Q
 
V
A
 
L
K
 
A
Q
 
M
I
 
I
T
 
R
D
 
D
M
 
V
L
 
F
A
 
V
A
 
H
T
 
T
S
 
D
P
 
K
E
 
E
G
 
G
Y
|
Y
A
 
A
A
 
S
N
 
N
C
 
C
A
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
D
D
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
L
R
 
R
E
 
P
Q
 
E
L
 
A
A
 
P
S
 
G
I
 
I
T
 
K
V
 
V
P
 
P
T
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
S
G
 
G
T
 
T
E
 
H
D
|
D
A
 
L
V
x
A
T
 
A
P
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
Q
S
 
G
H
 
R
F
 
E
I
 
L
Q
 
A
N
 
Q
H
 
A
V
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
R
Y
 
Y
A
 
V
E
 
E
F
 
L
Y
 
D
A
 
A
A
 
S
H
|
H
L
 
I
S
 
S
N
 
N
V
 
I
Q
 
E
A
 
R
G
 
A
A
 
D
A
 
A
F
 
F
S
 
T
D
 
K
C
 
T
V
 
V
I
 
V
E
 
D
F
 
F
L
 
L

6eb3B Structural and enzymatic characterization of an esterase from a metagenomic library
32% identity, 99% coverage: 1:260/263 of query aligns to 1:263/268 of 6eb3B

query
sites
6eb3B
M
 
M
A
 
L
F
 
Y
V
 
A
Q
 
Q
L
 
V
A
 
N
E
 
G
G
 
I
E
 
N
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
I
D
 
E
G
 
G
P
 
-
E
 
Q
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
L
L
 
L
V
 
L
L
 
I
S
 
M
N
 
G
S
 
-
L
 
L
G
 
G
T
 
A
D
 
P
L
 
A
H
 
A
M
 
A
W
 
W
D
 
D
-
 
P
L
 
I
Q
 
F
I
 
V
P
 
Q
A
 
T
F
 
L
T
 
T
Q
 
K
H
 
T
F
 
H
R
 
Q
V
 
V
L
 
I
R
 
I
F
 
Y
D
 
D
T
 
N
R
 
R
G
 
G
H
 
T
G
 
G
K
 
L
S
 
S
L
 
D
V
 
K
T
 
P
P
 
D
G
 
M
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
E
x
A
Q
 
M
L
 
F
G
 
A
Q
 
S
D
 
D
V
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
N
I
 
I
Q
 
P
R
 
R
A
 
A
H
 
H
F
 
V
C
 
F
G
 
G
L
 
V
S
 
S
M
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
M
I
 
I
G
 
A
Q
 
Q
W
x
E
L
 
L
G
 
A
I
 
I
N
x
H
A
 
Y
G
 
P
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
Q
 
A
R
 
S
L
 
L
V
 
I
V
 
L
-
 
G
C
 
C
N
 
T
T
 
T
A
 
P
A
 
G
K
 
-
I
 
-
G
 
G
T
 
K
P
 
H
E
 
A
V
 
V
W
 
P
N
 
A
P
 
P
R
 
P
I
 
E
E
 
S
M
 
L
V
 
K
L
 
A
R
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
R
A
 
A
A
 
G
M
 
L
V
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
D
 
E
A
 
G
S
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
W
 
W
-
 
K
-
 
L
-
 
S
F
 
F
T
 
S
A
 
E
D
 
E
F
 
F
A
 
I
A
 
H
A
 
T
N
 
H
P
 
K
Y
 
A
Q
 
E
A
 
L
K
 
E
-
 
A
Q
 
H
I
 
I
T
 
P
D
 
R
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
T
 
L
S
 
T
P
 
P
E
 
R
-
 
F
G
 
A
Y
 
Y
A
 
E
A
 
R
N
 
H
C
 
F
A
 
Q
A
 
A
V
 
T
R
 
M
D
x
T
A
 
L
D
x
R
F
 
V
R
 
F
E
 
K
Q
|
Q
L
 
L
A
 
K
S
 
E
I
 
I
T
 
Q
V
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
A
A
 
T
G
 
G
T
 
R
E
 
D
D
 
D
A
 
M
V
 
L
T
 
I
P
 
P
P
 
A
A
 
V
G
 
N
S
 
S
H
 
E
F
 
I
I
 
L
Q
 
A
N
 
R
H
 
E
V
 
I
Q
 
P
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
E
 
I
F
 
F
Y
 
E
A
 
S
A
 
A
-
 
G
H
 
H
L
 
G
S
 
F
N
 
V
V
 
T
Q
 
S
A
 
A
G
 
R
A
 
E
A
 
P
F
 
F
S
 
L
D
 
K
C
 
V
V
 
L
I
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L

6eb3A Structural and enzymatic characterization of an esterase from a metagenomic library
32% identity, 99% coverage: 1:260/263 of query aligns to 1:260/265 of 6eb3A

query
sites
6eb3A
M
 
M
A
 
L
F
 
Y
V
 
A
Q
 
Q
L
 
V
A
 
N
E
 
G
G
 
I
E
 
N
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
I
D
 
E
G
|
G
P
 
-
E
 
Q
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
L
L
 
L
V
 
L
L
 
I
S
 
M
N
 
G
S
 
-
L
 
L
G
 
G
T
 
A
D
 
P
L
 
A
H
 
A
M
 
A
W
 
W
D
 
D
-
 
P
L
 
I
Q
 
F
I
 
V
P
 
Q
A
 
T
F
 
L
T
 
T
Q
 
K
H
 
T
F
 
H
R
x
Q
V
 
V
L
 
I
R
 
I
F
 
Y
D
 
D
T
 
N
R
 
R
G
 
G
H
 
T
G
 
G
K
 
L
S
 
S
L
 
D
V
 
K
T
 
P
P
 
D
G
 
M
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
E
 
A
Q
 
M
L
 
F
G
 
A
Q
 
S
D
 
D
V
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
N
I
 
I
Q
 
P
R
 
R
A
 
A
H
 
H
F
 
V
C
 
F
G
 
G
L
 
V
S
 
S
M
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
M
I
 
I
G
 
A
Q
 
Q
W
 
E
L
 
L
G
 
A
I
 
I
N
 
H
A
 
Y
G
 
P
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
Q
 
A
R
 
S
L
 
L
V
 
I
V
 
L
-
 
G
C
 
C
N
 
T
T
 
T
A
 
P
A
 
G
K
 
-
I
 
-
G
 
G
T
 
K
P
 
H
E
 
A
V
 
V
W
 
P
N
 
A
P
 
P
R
 
P
I
 
E
E
 
S
M
 
L
V
 
K
L
 
A
R
 
L
D
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
T
A
 
P
M
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
D
 
E
A
 
G
S
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
W
 
W
-
 
K
-
 
L
-
 
S
F
 
F
T
 
S
A
 
E
D
 
E
F
 
F
A
 
I
A
 
H
A
 
T
N
 
H
P
 
K
Y
 
A
Q
 
E
A
 
L
K
 
E
-
 
A
Q
 
H
I
 
I
T
 
P
D
 
R
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
T
 
L
S
 
T
P
 
P
E
 
R
-
 
F
G
 
A
Y
 
Y
A
 
E
A
 
R
N
 
H
C
 
F
A
 
Q
A
 
A
V
 
T
R
 
M
D
 
T
A
 
L
D
 
R
F
 
V
R
 
F
E
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
K
S
 
E
I
 
I
T
 
Q
V
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
A
A
 
T
G
 
G
T
 
R
E
 
D
D
 
D
A
 
M
V
 
L
T
 
I
P
 
P
P
 
A
A
 
V
G
 
N
S
 
S
H
 
E
F
 
I
I
 
L
Q
 
A
N
 
R
H
 
E
V
 
I
Q
 
P
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
E
 
I
F
 
F
Y
 
E
A
 
S
A
 
A
-
 
G
H
 
H
L
 
G
S
 
F
N
 
V
V
 
T
Q
 
S
A
 
A
G
 
R
A
 
E
A
 
P
F
 
F
S
 
L
D
 
K
C
 
V
V
 
L
I
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L

6eb3C Structural and enzymatic characterization of an esterase from a metagenomic library
32% identity, 99% coverage: 1:260/263 of query aligns to 1:257/262 of 6eb3C

query
sites
6eb3C
M
 
M
A
 
L
F
 
Y
V
 
A
Q
 
Q
L
 
V
A
 
N
E
 
G
G
 
I
E
 
N
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
I
D
 
E
G
 
G
P
 
-
E
 
Q
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
L
L
 
L
V
 
L
L
 
I
S
 
M
N
 
G
S
 
-
L
|
L
G
 
G
T
 
A
D
 
P
L
 
A
H
 
A
M
 
A
W
 
W
D
 
D
-
 
P
L
 
I
Q
 
F
I
 
V
P
 
Q
A
 
T
F
 
L
T
 
T
Q
 
K
H
 
T
F
 
H
R
 
Q
V
 
V
L
 
I
R
 
I
F
 
Y
D
 
D
T
 
N
R
 
R
G
 
G
H
 
T
G
 
G
K
 
L
S
 
S
L
 
D
V
 
K
T
 
P
P
 
D
G
 
M
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
E
 
A
Q
 
M
L
 
F
G
 
A
Q
 
S
D
 
D
V
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
N
I
 
I
Q
 
P
R
 
R
A
 
A
H
 
H
F
 
V
C
 
F
G
 
G
L
 
V
S
|
S
M
|
M
G
 
G
G
 
G
L
 
M
I
 
I
G
 
A
Q
 
Q
W
 
E
L
 
L
G
 
A
I
 
I
N
 
H
A
 
Y
G
 
P
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
Q
 
A
R
 
S
L
 
L
V
 
I
V
 
L
-
 
G
C
 
C
N
 
T
T
 
T
A
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
H
A
 
A
K
 
V
I
 
P
G
 
A
T
 
P
P
 
P
E
 
E
V
 
S
W
 
L
N
 
K
P
 
A
R
 
L
I
 
T
-
 
P
E
 
E
M
 
E
V
 
A
L
 
I
R
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
R
 
-
W
 
W
-
 
K
-
 
L
-
 
S
F
 
F
T
 
S
A
 
E
D
 
E
F
 
F
A
 
I
A
 
H
A
 
T
N
 
H
P
 
K
Y
 
A
Q
 
E
A
 
L
K
 
E
-
 
A
Q
 
H
I
 
I
T
 
P
D
 
R
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
T
 
L
S
 
T
P
 
P
E
 
R
-
 
F
G
 
A
Y
 
Y
A
 
E
A
 
R
N
 
H
C
 
F
A
 
Q
A
 
A
V
 
T
R
 
M
D
 
T
A
 
L
D
 
R
F
 
V
R
 
F
E
 
K
Q
 
Q
L
 
L
A
 
K
S
 
E
I
 
I
T
 
Q
V
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
A
A
 
T
G
 
G
T
 
R
E
 
D
D
 
D
A
 
M
V
 
L
T
 
I
P
 
P
P
 
A
A
 
V
G
 
N
S
 
S
H
 
E
F
 
I
I
 
L
Q
 
A
N
 
R
H
 
E
V
 
I
Q
 
P
G
 
G
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
E
 
I
F
 
F
Y
 
E
A
 
S
A
 
A
-
 
G
H
 
H
L
 
G
S
 
F
N
 
V
V
 
T
Q
 
S
A
 
A
G
 
R
A
 
E
A
 
P
F
 
F
S
 
L
D
 
K
C
 
V
V
 
L
I
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L

4uheA Structural studies of a thermophilic esterase from thermogutta terrifontis (malate bound) (see paper)
27% identity, 96% coverage: 8:260/263 of query aligns to 14:267/272 of 4uheA

query
sites
4uheA
E
 
E
G
 
I
E
 
E
L
 
L
H
 
A
Y
 
F
Q
 
E
L
 
D
D
 
T
G
 
G
P
 
-
E
 
T
G
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
-
L
 
L
S
 
V
N
 
H
S
 
G
L
x
F
G
 
P
T
 
L
D
 
D
L
 
R
H
 
T
M
 
M
W
 
W
D
 
K
L
 
A
Q
 
Q
I
 
R
P
 
E
A
 
E
F
 
L
T
 
C
Q
 
D
H
 
E
F
 
F
R
 
R
V
 
V
L
 
I
R
 
V
F
 
P
D
 
D
T
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
F
G
 
G
K
 
E
S
 
S
L
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
V
Y
 
A
S
 
T
I
 
M
E
 
E
Q
 
A
L
 
M
G
 
A
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
C
D
 
N
A
 
H
L
 
L
D
 
G
I
 
L
Q
 
T
-
 
G
R
 
K
A
 
I
H
 
V
F
 
L
C
 
G
G
 
G
L
|
L
S
|
S
M
|
M
G
 
G
G
 
G
L
x
Y
I
 
V
G
 
A
Q
 
F
W
 
A
L
 
F
G
 
A
I
 
R
N
 
K
A
 
Y
G
 
R
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
Q
 
A
R
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
L
C
 
C
N
x
D
T
 
T
A
 
R
A
 
A
K
 
R
I
 
P
G
 
D
T
 
S
P
 
P
E
 
E
V
 
A
W
 
K
N
 
E
P
 
N
R
|
R
I
 
R
E
 
R
M
 
V
V
 
A
L
 
E
R
 
R
D
 
V
G
 
R
A
 
R
A
 
E
A
 
G
M
 
P
V
 
G
A
 
F
L
 
I
R
 
A
D
 
E
A
 
E
S
 
M
I
 
I
A
 
P
R
 
R
W
 
L
F
 
C
T
 
C
A
x
E
D
 
S
F
 
T
A
 
F
A
 
R
A
 
N
N
 
H
P
 
P
Y
 
E
Q
 
V
A
 
I
K
 
E
Q
 
K
I
 
I
T
 
R
D
 
Q
M
 
M
L
 
I
A
 
L
A
 
S
T
 
A
S
 
P
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
A
C
 
A
A
 
L
A
 
G
V
 
M
R
 
A
D
 
E
-
 
R
A
 
P
D
 
D
F
 
S
R
 
T
E
 
D
Q
 
L
L
 
L
A
 
P
S
 
A
I
 
L
T
 
S
V
 
C
P
 
P
T
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
V
G
 
G
T
 
Q
E
 
F
D
|
D
A
 
A
V
 
I
T
 
S
P
 
P
P
 
P
A
 
E
G
 
E
S
 
M
H
 
E
F
 
A
I
 
M
Q
 
A
N
 
R
H
 
T
V
 
I
Q
 
P
G
 
Q
A
 
S
E
 
Q
Y
 
F
A
 
V
E
 
V
F
 
I
Y
 
P
-
 
D
A
 
A
A
 
G
H
|
H
L
|
L
S
 
P
N
 
P
V
 
M
Q
 
E
A
 
Q
G
 
P
A
 
E
A
 
R
F
 
V
S
 
T
D
 
Q
C
 
A
V
 
I
I
 
R
E
 
E
F
 
W
L
 
L

4uhfA Structural studies of a thermophilic esterase from thermogutta terrifontis (l37a mutant with butyrate bound) (see paper)
27% identity, 96% coverage: 8:260/263 of query aligns to 14:267/278 of 4uhfA

query
sites
4uhfA
E
 
E
G
 
I
E
 
E
L
 
L
H
 
A
Y
 
F
Q
 
E
L
 
D
D
 
T
G
 
G
P
 
-
E
 
T
G
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
-
L
 
L
S
 
V
N
 
H
S
x
G
L
x
F
G
 
P
T
 
L
D
 
D
L
 
R
H
 
T
M
 
M
W
 
W
D
 
K
L
 
A
Q
 
Q
I
 
R
P
 
E
A
 
E
F
 
L
T
 
C
Q
 
D
H
 
E
F
 
F
R
 
R
V
 
V
L
 
I
R
 
V
F
 
P
D
 
D
T
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
F
G
 
G
K
 
E
S
 
S
L
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
V
Y
 
A
S
 
T
I
 
M
E
 
E
Q
 
A
L
 
M
G
 
A
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
C
D
 
N
A
 
H
L
 
L
D
 
G
I
 
L
Q
 
T
-
 
G
R
 
K
A
 
I
H
 
V
F
 
L
C
 
G
G
 
G
L
|
L
S
|
S
M
|
M
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
I
 
V
G
 
A
Q
 
F
W
 
A
L
 
F
G
 
A
I
 
R
N
 
K
A
 
Y
G
 
R
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
Q
 
A
R
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
L
C
 
C
N
x
D
T
 
T
A
 
R
A
 
A
K
 
R
I
 
P
G
 
D
T
 
S
P
 
P
E
 
E
V
 
A
W
 
K
N
 
E
P
 
N
R
 
R
I
 
R
E
 
R
M
 
V
V
 
A
L
 
E
R
 
R
D
 
V
G
 
R
A
 
R
A
 
E
A
 
G
M
 
P
V
 
G
A
 
F
L
 
I
R
 
A
D
 
E
A
 
E
S
 
M
I
 
I
A
 
P
R
 
R
W
 
L
F
 
C
T
 
C
A
x
E
D
 
S
F
 
T
A
 
F
A
 
R
A
 
N
N
 
H
P
 
P
Y
 
E
Q
 
V
A
 
I
K
 
E
Q
 
K
I
 
I
T
 
R
D
 
Q
M
 
M
L
 
I
A
 
L
A
 
S
T
 
A
S
 
P
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
A
C
 
A
A
 
L
A
 
G
V
 
M
R
 
A
D
 
E
-
 
R
A
 
P
D
 
D
F
 
S
R
 
T
E
 
D
Q
 
L
L
 
L
A
 
P
S
 
A
I
 
L
T
 
S
V
 
C
P
 
P
T
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
V
G
 
G
T
 
Q
E
 
F
D
|
D
A
 
A
V
 
I
T
 
S
P
 
P
P
 
P
A
 
E
G
 
E
S
 
M
H
 
E
F
 
A
I
 
M
Q
 
A
N
 
R
H
 
T
V
 
I
Q
 
P
G
 
Q
A
 
S
E
 
Q
Y
 
F
A
 
V
E
 
V
F
 
I
Y
 
P
-
 
D
A
 
A
A
 
G
H
|
H
L
|
L
S
 
P
N
 
P
V
 
M
Q
 
E
A
 
Q
G
 
P
A
 
E
A
 
R
F
 
V
S
 
T
D
 
Q
C
 
A
V
 
I
I
 
R
E
 
E
F
 
W
L
 
L

4uhdA Structural studies of a thermophilic esterase from thermogutta terrifontis (acetate bound) (see paper)
27% identity, 96% coverage: 8:260/263 of query aligns to 14:267/274 of 4uhdA

query
sites
4uhdA
E
 
E
G
 
I
E
 
E
L
 
L
H
 
A
Y
 
F
Q
 
E
L
 
D
D
 
T
G
 
G
P
 
-
E
 
T
G
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
-
L
 
L
S
 
V
N
 
H
S
x
G
L
x
F
G
 
P
T
 
L
D
 
D
L
 
R
H
 
T
M
 
M
W
 
W
D
 
K
L
 
A
Q
 
Q
I
 
R
P
 
E
A
 
E
F
 
L
T
 
C
Q
 
D
H
 
E
F
 
F
R
 
R
V
 
V
L
 
I
R
 
V
F
 
P
D
 
D
T
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
F
G
 
G
K
 
E
S
 
S
L
 
Q
V
 
V
T
 
I
P
 
P
G
 
G
P
 
V
Y
 
A
S
 
T
I
 
M
E
 
E
Q
 
A
L
 
M
G
 
A
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
C
D
 
N
A
 
H
L
 
L
D
 
G
I
 
L
Q
 
T
-
 
G
R
 
K
A
 
I
H
 
V
F
 
L
C
 
G
G
 
G
L
|
L
S
|
S
M
|
M
G
 
G
G
 
G
L
x
Y
I
 
V
G
 
A
Q
 
F
W
 
A
L
 
F
G
 
A
I
 
R
N
 
K
A
 
Y
G
 
R
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
Q
 
A
R
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
L
C
 
C
N
x
D
T
 
T
A
 
R
A
 
A
K
 
R
I
 
P
G
 
D
T
 
S
P
 
P
E
 
E
V
 
A
W
 
K
N
 
E
P
 
N
R
|
R
I
 
R
E
 
R
M
 
V
V
 
A
L
 
E
R
 
R
D
 
V
G
 
R
A
 
R
A
 
E
A
 
G
M
 
P
V
 
G
A
 
F
L
 
I
R
 
A
D
 
E
A
 
E
S
 
M
I
 
I
A
 
P
R
 
R
W
 
L
F
 
C
T
 
C
A
x
E
D
 
S
F
 
T
A
 
F
A
 
R
A
 
N
N
 
H
P
 
P
Y
 
E
Q
 
V
A
 
I
K
 
E
Q
 
K
I
 
I
T
 
R
D
 
Q
M
 
M
L
 
I
A
 
L
A
 
S
T
 
A
S
 
P
P
 
P
E
 
E
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
A
C
 
A
A
 
L
A
 
G
V
 
M
R
 
A
D
 
E
-
 
R
A
 
P
D
 
D
F
 
S
R
 
T
E
 
D
Q
 
L
L
 
L
A
 
P
S
 
A
I
 
L
T
 
S
V
 
C
P
 
P
T
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
V
G
 
G
T
 
Q
E
 
F
D
|
D
A
 
A
V
 
I
T
 
S
P
 
P
P
 
P
A
 
E
G
 
E
S
 
M
H
 
E
F
 
A
I
 
M
Q
x
A
N
 
R
H
 
T
V
x
I
Q
 
P
G
 
Q
A
x
S
E
 
Q
Y
 
F
A
 
V
E
 
V
F
 
I
Y
 
P
-
 
D
A
 
A
A
 
G
H
|
H
L
|
L
S
 
P
N
 
P
V
 
M
Q
 
E
A
 
Q
G
 
P
A
 
E
A
 
R
F
 
V
S
 
T
D
 
Q
C
 
A
V
 
I
I
 
R
E
 
E
F
 
W
L
 
L

Q9SQR3 Strigolactone esterase D14; Protein DWARF 14; AtD14; EC 3.1.-.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 4 papers)
24% identity, 83% coverage: 20:237/263 of query aligns to 18:240/267 of Q9SQR3

query
sites
Q9SQR3
G
 
G
A
 
D
P
 
R
V
 
I
L
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
A
N
 
H
S
 
G
L
 
F
G
 
G
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
H
 
S
M
 
A
W
 
W
D
 
H
L
 
L
Q
 
I
I
 
L
P
 
P
A
 
Y
F
 
F
T
 
T
Q
 
Q
H
 
N
F
 
Y
R
 
R
V
 
V
L
 
V
R
 
L
F
 
Y
D
 
D
T
 
L
R
 
V
G
 
C
H
 
A
G
 
G
K
 
S
S
 
-
L
 
-
V
 
V
T
 
N
P
 
P
G
 
D
P
 
Y
Y
 
F
-
 
D
-
 
F
-
 
N
-
 
R
-
 
Y
-
 
T
S
 
T
I
 
L
E
 
D
Q
 
P
L
 
Y
G
 
V
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
L
A
 
N
L
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
L
D
 
G
I
 
I
Q
 
Q
R
 
N
A
 
C
H
 
A
F
 
Y
C
 
V
G
 
G
L
 
H
S
|
S
M
 
V
G
 
S
G
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
G
Q
 
I
W
 
I
L
 
A
G
 
S
I
 
I
N
 
R
A
 
R
G
 
P
Q
 
E
R
 
L
L
 
F
Q
 
S
R
 
K
L
 
L
V
 
I
V
 
L
C
 
I
N
 
G
T
 
F
A
 
S
A
 
P
K
 
R
I
 
F
G
 
L
T
 
N
P
 
D
E
 
E
V
 
D
W
 
Y
N
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
E
P
 
G
R
 
E
I
 
I
E
 
E
M
 
K
V
 
V
L
 
F
R
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
S
A
 
A
M
 
M
V
 
E
A
 
A
L
 
N
R
 
Y
D
 
E
A
 
A
S
 
W
I
 
V
A
 
H
R
x
G
W
 
F
F
 
A
T
 
P
A
 
L
D
 
A
F
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
D
N
 
V
P
|
P
Y
 
A
Q
 
A
A
 
V
K
 
R
Q
 
E
I
 
F
T
 
S
D
 
R
M
 
T
L
 
L
A
 
F
A
 
N
T
 
M
S
 
R
P
 
P
E
 
D
G
 
I
Y
 
S
A
 
L
A
 
F
N
 
V
C
 
S
A
 
R
A
 
T
V
 
V
R
 
F
D
 
N
A
 
S
D
 
D
F
 
L
R
 
R
E
 
G
Q
 
V
L
 
L
A
 
G
S
 
L
I
 
V
T
 
R
V
 
V
P
 
P
T
 
T
L
 
C
V
 
V
I
 
I
A
 
Q
G
 
T
T
 
A
E
 
K
D
 
D
A
 
V
V
 
S
T
 
V
P
 
P
P
 
A
A
 
S
G
 
V
S
 
A
H
 
E
F
 
Y
I
 
L
Q
 
R
N
 
S
H
 
H
V
 
L
Q
 
G
G
 
G
A
 
D
E
 
T
Y
 
T
A
 
V
E
 
E

5h3hB Esterase (eaest) from exiguobacterium antarcticum (see paper)
23% identity, 98% coverage: 2:260/263 of query aligns to 3:266/269 of 5h3hB

query
sites
5h3hB
A
 
T
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q
L
 
A
A
 
V
E
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
K
H
 
I
Y
 
Y
Q
 
V
L
 
E
D
 
D
G
 
I
P
 
G
E
 
S
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
V
L
 
V
V
 
M
L
 
L
S
 
-
N
 
H
S
 
G
L
x
W
G
 
P
T
 
A
D
 
N
L
 
N
H
 
N
M
 
M
W
 
F
D
 
E
L
 
Y
Q
 
Q
I
 
K
P
 
N
A
 
R
F
 
L
T
 
L
Q
 
E
H
 
E
-
 
G
F
 
Y
R
 
R
V
 
Y
L
 
I
R
 
G
F
 
V
D
 
D
T
 
Y
R
 
R
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
D
V
 
A
T
 
P
P
 
A
G
 
T
P
 
G
Y
 
Y
S
 
D
I
 
Y
E
 
T
Q
 
T
L
 
M
G
 
A
Q
 
S
D
 
D
V
 
I
I
 
N
A
 
E
L
 
V
L
 
I
D
 
Q
A
 
Q
L
 
L
D
 
K
I
 
L
Q
 
T
R
 
N
A
 
V
H
 
T
F
 
L
C
 
L
G
 
G
L
 
F
S
|
S
M
|
M
G
 
G
G
 
G
L
 
G
I
 
I
G
 
A
Q
 
L
W
 
K
L
 
Y
G
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
H
G
 
G
Q
 
E
-
 
S
R
 
N
L
 
V
Q
 
S
R
 
K
L
 
L
V
 
I
V
 
L
C
 
A
N
x
G
T
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
P
I
 
V
G
x
F
T
 
T
P
 
Q
E
 
R
V
 
D
W
 
G
N
 
Y
P
 
P
R
 
Y
I
 
-
E
 
-
M
 
G
V
 
M
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
E
A
 
V
A
 
D
A
 
A
M
 
L
V
 
I
A
 
E
L
 
D
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
D
R
 
R
D
 
P
A
 
S
S
 
M
I
 
L
A
 
K
R
 
G
W
 
F
F
 
G
T
 
E
A
 
I
D
 
F
F
 
F
A
 
A
A
 
K
A
 
E
N
 
H
P
 
P
Y
 
E
Q
 
P
A
 
L
K
 
Q
Q
 
Q
-
 
W
I
 
F
T
 
H
D
 
N
M
 
L
L
 
S
A
 
V
A
 
D
T
 
A
S
 
S
P
 
S
E
 
H
G
 
G
Y
 
T
A
 
I
A
 
Q
N
 
S
C
 
A
A
 
I
A
 
A
V
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
E
D
 
D
F
 
L
R
 
R
E
 
D
Q
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
K
I
 
I
T
 
T
V
 
V
P
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
M
A
 
H
G
 
G
T
 
K
E
 
K
D
|
D
A
 
Q
V
 
V
T
 
C
P
 
P
P
 
F
A
 
E
G
 
F
S
 
A
H
 
E
F
 
V
I
 
M
Q
 
H
N
 
E
H
 
N
V
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
S
E
 
R
Y
 
L
A
 
E
E
 
V
F
 
F
-
 
E
Y
 
E
A
 
S
A
 
G
H
|
H
L
 
G
S
 
M
N
 
F
V
 
L
Q
 
D
A
 
E
G
 
R
A
 
E
A
 
K
F
 
F
S
 
T
D
 
E
C
 
T
V
 
L
I
 
V
E
 
S
F
 
Y
L
 
V

1iunB Meta-cleavage product hydrolase from pseudomonas fluorescens ip01 (cumd) s103a mutant hexagonal (see paper)
27% identity, 97% coverage: 6:260/263 of query aligns to 10:269/276 of 1iunB

query
sites
1iunB
L
 
L
A
 
A
E
 
A
G
 
G
E
 
V
L
 
L
H
 
T
Y
 
N
Q
 
Y
L
 
H
D
 
D
G
 
V
P
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
I
S
 
H
N
 
G
S
|
S
-
x
G
L
 
P
G
|
G
T
 
V
D
 
S
L
 
A
H
 
Y
M
 
A
-
 
N
W
 
W
D
 
R
L
 
L
Q
 
T
I
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
L
T
 
S
Q
 
K
H
 
F
F
 
Y
R
 
R
V
 
V
L
 
I
R
 
A
F
 
P
D
 
D
T
 
M
R
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
K
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
F
T
 
T
P
 
D
G
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
N
Y
 
Y
S
 
S
I
 
K
E
 
D
Q
 
S
L
 
W
G
 
V
Q
 
D
D
 
H
V
 
I
I
 
I
A
 
G
L
 
I
L
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
H
 
H
F
 
I
C
 
V
G
 
G
L
x
N
S
x
A
M
x
F
G
 
G
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
A
Q
 
I
W
 
A
L
 
T
G
 
A
I
 
L
N
 
R
A
 
Y
G
 
S
Q
 
E
R
 
R
L
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
V
 
L
C
 
M
N
x
G
T
 
A
A
 
A
A
 
G
K
 
T
I
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
E
G
 
G
T
 
L
P
 
N
E
 
A
V
|
V
W
 
W
-
 
G
-
 
Y
N
 
T
P
 
P
R
 
S
I
 
I
E
 
E
M
 
N
V
 
M
-
 
R
-
 
N
L
 
L
R
 
L
D
 
D
G
 
I
A
 
F
A
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
T
-
 
D
A
 
E
M
 
L
V
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
-
 
Y
D
 
E
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
Q
R
 
P
W
 
G
F
 
F
T
 
Q
A
 
E
D
 
S
F
|
F
A
 
S
A
 
S
A
 
M
N
 
F
P
 
P
Y
 
E
Q
 
P
A
 
R
K
 
Q
Q
 
R
I
 
W
T
 
I
D
 
D
M
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
T
 
S
S
 
D
P
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
A
 
K
S
 
T
I
 
L
T
 
P
V
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
H
G
 
G
T
 
R
E
 
E
D
|
D
A
 
Q
V
 
V
T
 
V
P
 
P
P
 
L
A
 
S
G
 
S
S
 
S
H
 
L
F
 
R
I
 
L
Q
 
G
N
 
E
H
 
L
V
 
I
Q
 
D
G
 
R
A
 
A
E
 
Q
Y
 
L
A
x
H
E
 
V
F
 
F
-
 
G
Y
 
R
A
 
C
A
 
G
H
|
H
L
x
W
S
 
T
N
 
Q
V
 
I
Q
 
E
A
 
Q
G
 
T
A
 
D
A
x
R
F
 
F
S
 
N
D
 
R
C
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
F

2d0dA Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) a129v mutant (see paper)
27% identity, 97% coverage: 6:260/263 of query aligns to 9:268/271 of 2d0dA

query
sites
2d0dA
L
 
L
A
 
A
E
 
A
G
 
G
E
 
V
L
 
L
H
 
T
Y
 
N
Q
 
Y
L
 
H
D
 
D
G
 
V
P
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
I
S
 
H
N
 
G
S
|
S
-
x
G
L
 
P
G
|
G
T
 
V
D
 
S
L
 
A
H
 
Y
M
 
A
-
 
N
W
 
W
D
 
R
L
 
L
Q
 
T
I
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
L
T
 
S
Q
 
K
H
 
F
F
 
Y
R
 
R
V
 
V
L
 
I
R
 
A
F
 
P
D
 
D
T
 
M
R
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
K
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
F
T
 
T
P
 
D
G
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
N
Y
 
Y
S
 
S
I
 
K
E
 
D
Q
 
S
L
 
W
G
 
V
Q
 
D
D
 
H
V
 
I
I
 
I
A
 
G
L
 
I
L
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
H
 
H
F
 
I
C
 
V
G
 
G
L
x
N
S
|
S
M
x
F
G
 
G
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
A
Q
 
I
W
 
A
L
 
T
G
 
A
I
 
L
N
 
R
A
 
Y
G
 
S
Q
 
E
R
 
R
L
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
V
 
L
C
 
M
N
x
G
T
 
A
A
 
V
A
 
G
K
 
T
I
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
E
G
 
G
T
 
L
P
 
N
E
 
A
V
|
V
W
 
W
-
 
G
-
 
Y
N
 
T
P
 
P
R
 
S
I
 
I
E
 
E
M
 
N
V
 
M
-
 
R
-
 
N
L
 
L
R
 
L
D
 
D
G
 
I
A
 
F
A
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
T
-
 
D
A
 
E
M
 
L
V
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
-
 
Y
D
 
E
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
Q
R
 
P
W
 
G
F
 
F
T
 
Q
A
 
E
D
 
S
F
|
F
A
 
S
A
 
S
A
 
M
N
 
F
P
 
P
Y
 
E
Q
 
P
A
 
R
K
 
Q
Q
 
R
I
 
W
T
 
I
D
 
D
M
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
T
 
S
S
 
D
P
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
A
 
K
S
 
T
I
 
L
T
 
P
V
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
H
G
 
G
T
 
R
E
 
E
D
|
D
A
 
Q
V
 
V
T
 
V
P
 
P
P
 
L
A
 
S
G
 
S
S
 
S
H
 
L
F
 
R
I
 
L
Q
 
G
N
 
E
H
 
L
V
 
I
Q
 
D
G
 
R
A
 
A
E
 
Q
Y
 
L
A
 
H
E
 
V
F
 
F
-
 
G
Y
 
R
A
 
C
A
 
G
H
|
H
L
x
W
S
 
T
N
 
Q
V
 
I
Q
 
E
A
 
Q
G
 
T
A
 
D
A
 
R
F
 
F
S
 
N
D
 
R
C
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
F

1ukaA Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) complexed with (s)-2-methylbutyrate (see paper)
27% identity, 97% coverage: 6:260/263 of query aligns to 9:268/271 of 1ukaA

query
sites
1ukaA
L
 
L
A
 
A
E
 
A
G
 
G
E
 
V
L
 
L
H
 
T
Y
 
N
Q
 
Y
L
 
H
D
 
D
G
 
V
P
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
I
S
 
H
N
 
G
S
|
S
-
x
G
L
 
P
G
|
G
T
 
V
D
 
S
L
 
A
H
 
Y
M
 
A
-
 
N
W
 
W
D
 
R
L
 
L
Q
 
T
I
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
L
T
 
S
Q
 
K
H
 
F
F
 
Y
R
 
R
V
 
V
L
 
I
R
 
A
F
 
P
D
 
D
T
 
M
R
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
K
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
F
T
 
T
P
 
D
G
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
N
Y
 
Y
S
 
S
I
 
K
E
 
D
Q
 
S
L
 
W
G
 
V
Q
 
D
D
 
H
V
 
I
I
 
I
A
 
G
L
 
I
L
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
H
 
H
F
 
I
C
 
V
G
 
G
L
x
N
S
x
A
M
x
F
G
 
G
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
A
Q
 
I
W
 
A
L
 
T
G
 
A
I
 
L
N
 
R
A
 
Y
G
 
S
Q
 
E
R
 
R
L
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
V
 
L
C
 
M
N
x
G
T
 
A
A
 
A
A
 
G
K
 
T
I
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
E
G
 
G
T
 
L
P
 
N
E
 
A
V
|
V
W
|
W
-
 
G
-
 
Y
N
 
T
P
 
P
R
 
S
I
 
I
E
 
E
M
 
N
V
 
M
-
 
R
-
 
N
L
 
L
R
 
L
D
 
D
G
 
I
A
 
F
A
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
T
-
 
D
A
 
E
M
 
L
V
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
-
 
Y
D
 
E
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
Q
R
 
P
W
 
G
F
 
F
T
 
Q
A
 
E
D
 
S
F
|
F
A
 
S
A
 
S
A
 
M
N
 
F
P
 
P
Y
 
E
Q
 
P
A
 
R
K
 
Q
Q
 
R
I
 
W
T
 
I
D
 
D
M
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
T
 
S
S
 
D
P
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
A
 
K
S
 
T
I
 
L
T
 
P
V
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
H
G
 
G
T
 
R
E
 
E
D
|
D
A
 
Q
V
|
V
T
 
V
P
 
P
P
 
L
A
 
S
G
 
S
S
 
S
H
 
L
F
 
R
I
 
L
Q
 
G
N
 
E
H
 
L
V
 
I
Q
 
D
G
 
R
A
 
A
E
 
Q
Y
 
L
A
 
H
E
 
V
F
 
F
-
 
G
Y
 
R
A
 
C
A
 
G
H
|
H
L
x
W
S
 
T
N
 
Q
V
 
I
Q
 
E
A
 
Q
G
 
T
A
 
D
A
 
R
F
 
F
S
 
N
D
 
R
C
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
F

1uk9A Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) complexed with isovalerate (see paper)
27% identity, 97% coverage: 6:260/263 of query aligns to 9:268/271 of 1uk9A

query
sites
1uk9A
L
 
L
A
 
A
E
 
A
G
 
G
E
 
V
L
 
L
H
 
T
Y
 
N
Q
 
Y
L
 
H
D
 
D
G
 
V
P
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
I
S
 
H
N
 
G
S
|
S
-
x
G
L
 
P
G
|
G
T
 
V
D
 
S
L
 
A
H
 
Y
M
 
A
-
 
N
W
 
W
D
 
R
L
 
L
Q
 
T
I
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
L
T
 
S
Q
 
K
H
 
F
F
 
Y
R
 
R
V
 
V
L
 
I
R
 
A
F
 
P
D
 
D
T
 
M
R
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
K
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
F
T
 
T
P
 
D
G
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
N
Y
 
Y
S
 
S
I
 
K
E
 
D
Q
 
S
L
 
W
G
 
V
Q
 
D
D
 
H
V
 
I
I
 
I
A
 
G
L
 
I
L
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
H
 
H
F
 
I
C
 
V
G
 
G
L
x
N
S
x
A
M
x
F
G
 
G
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
A
Q
 
I
W
 
A
L
 
T
G
 
A
I
 
L
N
 
R
A
 
Y
G
 
S
Q
 
E
R
 
R
L
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
V
 
L
C
 
M
N
x
G
T
 
A
A
 
A
A
 
G
K
 
T
I
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
E
G
 
G
T
 
L
P
 
N
E
 
A
V
|
V
W
|
W
-
 
G
-
 
Y
N
 
T
P
 
P
R
 
S
I
 
I
E
 
E
M
 
N
V
 
M
-
 
R
-
 
N
L
 
L
R
 
L
D
 
D
G
 
I
A
 
F
A
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
T
-
 
D
A
 
E
M
 
L
V
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
-
 
Y
D
 
E
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
Q
R
 
P
W
 
G
F
 
F
T
 
Q
A
 
E
D
 
S
F
|
F
A
 
S
A
 
S
A
 
M
N
 
F
P
 
P
Y
 
E
Q
 
P
A
 
R
K
 
Q
Q
 
R
I
 
W
T
 
I
D
 
D
M
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
T
 
S
S
 
D
P
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
A
 
K
S
 
T
I
 
L
T
 
P
V
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
H
G
 
G
T
 
R
E
 
E
D
|
D
A
 
Q
V
 
V
T
 
V
P
 
P
P
 
L
A
 
S
G
 
S
S
 
S
H
 
L
F
 
R
I
 
L
Q
 
G
N
 
E
H
 
L
V
 
I
Q
 
D
G
 
R
A
 
A
E
 
Q
Y
 
L
A
 
H
E
 
V
F
 
F
-
 
G
Y
 
R
A
 
C
A
 
G
H
|
H
L
x
W
S
 
T
N
 
Q
V
 
I
Q
 
E
A
 
Q
G
 
T
A
 
D
A
 
R
F
 
F
S
 
N
D
 
R
C
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
F

1uk8A Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) complexed with n-valerate (see paper)
27% identity, 97% coverage: 6:260/263 of query aligns to 9:268/271 of 1uk8A

query
sites
1uk8A
L
 
L
A
 
A
E
 
A
G
 
G
E
 
V
L
 
L
H
 
T
Y
 
N
Q
 
Y
L
 
H
D
 
D
G
 
V
P
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
I
S
 
H
N
 
G
S
|
S
-
x
G
L
 
P
G
|
G
T
 
V
D
 
S
L
 
A
H
 
Y
M
 
A
-
 
N
W
 
W
D
 
R
L
 
L
Q
 
T
I
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
L
T
 
S
Q
 
K
H
 
F
F
 
Y
R
 
R
V
 
V
L
 
I
R
 
A
F
 
P
D
 
D
T
 
M
R
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
K
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
F
T
 
T
P
 
D
G
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
N
Y
 
Y
S
 
S
I
 
K
E
 
D
Q
 
S
L
 
W
G
 
V
Q
 
D
D
 
H
V
 
I
I
 
I
A
 
G
L
 
I
L
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
H
 
H
F
 
I
C
 
V
G
 
G
L
x
N
S
x
A
M
x
F
G
 
G
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
A
Q
 
I
W
 
A
L
 
T
G
 
A
I
 
L
N
 
R
A
 
Y
G
 
S
Q
 
E
R
 
R
L
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
V
 
L
C
 
M
N
x
G
T
 
A
A
 
A
A
 
G
K
 
T
I
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
E
G
 
G
T
x
L
P
 
N
E
 
A
V
|
V
W
|
W
-
 
G
-
 
Y
N
 
T
P
 
P
R
 
S
I
 
I
E
 
E
M
 
N
V
 
M
-
 
R
-
 
N
L
 
L
R
 
L
D
 
D
G
 
I
A
 
F
A
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
T
-
 
D
A
 
E
M
 
L
V
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
-
 
Y
D
 
E
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
Q
R
 
P
W
 
G
F
 
F
T
 
Q
A
 
E
D
 
S
F
|
F
A
 
S
A
 
S
A
 
M
N
 
F
P
 
P
Y
 
E
Q
 
P
A
 
R
K
 
Q
Q
 
R
I
 
W
T
 
I
D
 
D
M
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
T
 
S
S
 
D
P
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
A
 
K
S
 
T
I
 
L
T
 
P
V
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
H
G
 
G
T
 
R
E
 
E
D
|
D
A
 
Q
V
 
V
T
 
V
P
 
P
P
 
L
A
 
S
G
 
S
S
 
S
H
x
L
F
 
R
I
 
L
Q
x
G
N
x
E
H
 
L
V
 
I
Q
 
D
G
 
R
A
 
A
E
 
Q
Y
 
L
A
 
H
E
 
V
F
 
F
-
 
G
Y
 
R
A
 
C
A
 
G
H
|
H
L
x
W
S
 
T
N
 
Q
V
 
I
Q
 
E
A
 
Q
G
 
T
A
 
D
A
 
R
F
 
F
S
 
N
D
 
R
C
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
F

1uk7A Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) complexed with n-butyrate (see paper)
27% identity, 97% coverage: 6:260/263 of query aligns to 9:268/271 of 1uk7A

query
sites
1uk7A
L
 
L
A
 
A
E
 
A
G
 
G
E
 
V
L
 
L
H
 
T
Y
 
N
Q
 
Y
L
 
H
D
 
D
G
 
V
P
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
I
S
 
H
N
 
G
S
|
S
-
x
G
L
 
P
G
|
G
T
 
V
D
 
S
L
 
A
H
 
Y
M
 
A
-
 
N
W
 
W
D
 
R
L
 
L
Q
 
T
I
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
L
T
 
S
Q
 
K
H
 
F
F
 
Y
R
 
R
V
 
V
L
 
I
R
 
A
F
 
P
D
 
D
T
 
M
R
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
K
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
F
T
 
T
P
 
D
G
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
N
Y
 
Y
S
 
S
I
 
K
E
 
D
Q
 
S
L
 
W
G
 
V
Q
 
D
D
 
H
V
 
I
I
 
I
A
 
G
L
 
I
L
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
H
 
H
F
 
I
C
 
V
G
 
G
L
x
N
S
x
A
M
x
F
G
 
G
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
A
Q
 
I
W
 
A
L
 
T
G
 
A
I
 
L
N
 
R
A
 
Y
G
 
S
Q
 
E
R
 
R
L
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
V
 
L
C
 
M
N
x
G
T
 
A
A
 
A
A
 
G
K
 
T
I
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
E
G
 
G
T
x
L
P
 
N
E
 
A
V
|
V
W
 
W
-
 
G
-
 
Y
N
 
T
P
 
P
R
 
S
I
 
I
E
 
E
M
 
N
V
 
M
-
 
R
-
 
N
L
 
L
R
 
L
D
 
D
G
 
I
A
 
F
A
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
T
-
 
D
A
 
E
M
 
L
V
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
-
 
Y
D
 
E
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
Q
R
 
P
W
 
G
F
 
F
T
 
Q
A
 
E
D
 
S
F
|
F
A
 
S
A
 
S
A
 
M
N
 
F
P
 
P
Y
 
E
Q
 
P
A
 
R
K
 
Q
Q
 
R
I
 
W
T
 
I
D
 
D
M
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
T
 
S
S
 
D
P
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
A
 
K
S
 
T
I
 
L
T
 
P
V
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
H
G
 
G
T
 
R
E
 
E
D
|
D
A
 
Q
V
 
V
T
 
V
P
 
P
P
 
L
A
 
S
G
 
S
S
 
S
H
 
L
F
 
R
I
 
L
Q
 
G
N
 
E
H
 
L
V
 
I
Q
 
D
G
 
R
A
 
A
E
 
Q
Y
 
L
A
 
H
E
 
V
F
 
F
-
 
G
Y
 
R
A
 
C
A
 
G
H
|
H
L
x
W
S
 
T
N
 
Q
V
 
I
Q
 
E
A
 
Q
G
 
T
A
 
D
A
 
R
F
 
F
S
 
N
D
 
R
C
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
F

1iupA Meta-cleavage product hydrolase from pseudomonas fluorescens ip01 (cumd) s103a mutant complexed with isobutyrates (see paper)
27% identity, 97% coverage: 6:260/263 of query aligns to 9:268/271 of 1iupA

query
sites
1iupA
L
 
L
A
 
A
E
 
A
G
 
G
E
 
V
L
 
L
H
 
T
Y
 
N
Q
 
Y
L
 
H
D
 
D
G
 
V
P
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
L
L
 
I
S
 
H
N
 
G
S
|
S
-
x
G
L
 
P
G
|
G
T
 
V
D
 
S
L
 
A
H
 
Y
M
x
A
-
x
N
W
 
W
D
 
R
L
 
L
Q
 
T
I
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
L
T
 
S
Q
 
K
H
 
F
F
 
Y
R
 
R
V
 
V
L
 
I
R
 
A
F
 
P
D
 
D
T
 
M
R
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
K
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
F
T
 
T
P
 
D
G
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
N
Y
|
Y
S
 
S
I
 
K
E
 
D
Q
 
S
L
x
W
G
 
V
Q
 
D
D
 
H
V
 
I
I
 
I
A
 
G
L
 
I
L
 
M
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
H
 
H
F
 
I
C
 
V
G
 
G
L
x
N
S
x
A
M
x
F
G
 
G
G
 
G
L
 
G
I
 
L
G
 
A
Q
 
I
W
 
A
L
 
T
G
 
A
I
 
L
N
 
R
A
 
Y
G
 
S
Q
 
E
R
 
R
L
 
V
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
V
 
L
C
 
M
N
x
G
T
 
A
A
 
A
A
 
G
K
 
T
I
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
T
-
 
E
G
 
G
T
x
L
P
 
N
E
 
A
V
|
V
W
|
W
-
 
G
-
 
Y
N
 
T
P
 
P
R
 
S
I
 
I
E
 
E
M
 
N
V
 
M
-
 
R
-
 
N
L
 
L
R
 
L
D
 
D
G
 
I
A
 
F
A
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
T
-
 
D
A
 
E
M
 
L
V
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
-
 
Y
D
 
E
A
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
Q
R
 
P
W
 
G
F
 
F
T
 
Q
A
 
E
D
 
S
F
|
F
A
 
S
A
 
S
A
x
M
N
 
F
P
 
P
Y
 
E
Q
 
P
A
 
R
K
 
Q
Q
 
R
I
x
W
T
 
I
D
 
D
M
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
T
 
S
S
 
D
P
 
-
E
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
E
Q
 
D
L
 
I
A
 
K
S
 
T
I
 
L
T
 
P
V
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
H
G
 
G
T
 
R
E
 
E
D
|
D
A
 
Q
V
|
V
T
 
V
P
 
P
P
 
L
A
 
S
G
 
S
S
 
S
H
 
L
F
 
R
I
 
L
Q
 
G
N
 
E
H
 
L
V
 
I
Q
 
D
G
 
R
A
 
A
E
 
Q
Y
 
L
A
 
H
E
 
V
F
 
F
-
 
G
Y
 
R
A
 
C
A
 
G
H
|
H
L
x
W
S
 
T
N
 
Q
V
 
I
Q
 
E
A
 
Q
G
 
T
A
 
D
A
 
R
F
 
F
S
 
N
D
 
R
C
 
L
V
 
V
I
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
F

6ap8A Crystal structure of rice d14 bound to 2-(2-methyl-3-nitroanilino) benzoic acid (see paper)
25% identity, 87% coverage: 19:248/263 of query aligns to 15:251/266 of 6ap8A

query
sites
6ap8A
E
 
S
G
 
G
A
 
E
P
 
R
V
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
L
S
 
S
N
 
H
S
 
G
L
x
F
G
 
G
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
H
 
S
M
 
A
W
 
W
D
 
S
L
 
R
Q
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
Y
F
 
L
T
 
T
Q
 
R
H
 
D
F
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
V
R
 
L
F
 
Y
D
 
D
T
 
L
R
 
V
G
 
C
H
 
A
G
 
G
K
 
S
S
 
-
L
 
-
V
 
V
T
 
N
P
 
P
G
 
D
P
 
H
Y
 
F
S
 
D
I
 
F
E
 
R
Q
 
R
L
 
Y
G
 
D
Q
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
R
I
 
I
Q
 
P
R
 
R
A
 
C
H
 
A
F
 
F
C
 
V
G
 
G
L
 
H
S
|
S
M
 
V
G
 
S
G
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
G
Q
 
I
W
 
L
L
 
A
G
 
S
I
 
I
N
 
R
A
 
R
G
 
P
Q
 
D
R
 
L
L
 
F
Q
 
A
R
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
L
C
 
I
N
 
G
T
 
A
A
 
S
A
 
P
K
 
R
I
x
F
G
 
L
T
 
N
P
 
D
E
 
S
V
 
D
W
 
Y
N
 
H
P
 
G
R
 
G
I
x
F
E
 
E
M
 
L
-
 
E
V
 
E
L
 
I
R
 
Q
D
 
Q
G
x
V
A
 
F
A
 
D
A
 
A
M
 
M
V
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
Y
D
 
S
A
 
A
S
 
W
I
 
A
A
 
T
R
 
G
W
 
Y
F
 
A
T
 
P
A
 
L
D
 
A
F
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
D
N
 
V
P
 
P
Y
 
A
Q
 
A
A
 
V
K
 
Q
Q
 
E
I
 
F
T
 
S
D
 
R
M
 
T
L
 
L
A
 
F
A
 
N
T
 
M
S
 
R
P
 
P
E
 
D
G
 
I
Y
 
S
A
 
L
A
 
H
N
 
V
C
|
C
A
 
Q
A
 
T
V
|
V
R
 
F
D
 
K
A
 
T
D
 
D
F
 
L
R
 
R
E
 
G
Q
 
V
L
 
L
A
 
G
S
 
M
I
 
V
T
 
R
V
 
A
P
 
P
T
 
C
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
Q
G
 
T
T
 
T
E
 
R
D
 
D
A
 
V
V
x
S
T
 
V
P
 
P
P
 
A
A
 
S
G
 
V
S
 
A
H
 
A
F
 
Y
I
 
L
Q
 
K
N
 
A
H
 
H
V
 
L
Q
 
G
G
 
G
A
 
R
E
 
T
Y
 
T
A
 
V
E
 
E
F
 
F
Y
 
L
-
 
Q
-
 
T
A
 
E
A
 
G
H
|
H
L
 
L
S
 
P
N
 
H
V
 
L
Q
 
S
A
 
A

5dj5A Crystal structure of rice dwarf14 in complex with synthetic strigolactone gr24 (see paper)
25% identity, 87% coverage: 19:248/263 of query aligns to 15:251/266 of 5dj5A

query
sites
5dj5A
E
 
S
G
 
G
A
 
E
P
 
R
V
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
L
S
 
S
N
 
H
S
 
G
L
x
F
G
 
G
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
H
 
S
M
 
A
W
 
W
D
 
S
L
 
R
Q
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
Y
F
 
L
T
 
T
Q
 
R
H
 
D
F
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
V
R
 
L
F
 
Y
D
 
D
T
 
L
R
 
V
G
 
C
H
 
A
G
 
G
K
 
S
S
 
-
L
 
-
V
 
V
T
 
N
P
 
P
G
 
D
P
 
H
Y
 
F
S
 
D
I
 
F
E
 
R
Q
 
R
L
 
Y
G
 
D
Q
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
R
I
 
I
Q
 
P
R
 
R
A
 
C
H
 
A
F
 
F
C
 
V
G
 
G
L
 
H
S
|
S
M
x
V
G
 
S
G
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
G
Q
 
I
W
 
L
L
 
A
G
 
S
I
 
I
N
 
R
A
 
R
G
 
P
Q
 
D
R
 
L
L
 
F
Q
 
A
R
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
L
C
 
I
N
 
G
T
 
A
A
 
S
A
 
P
K
 
R
I
 
F
G
 
L
T
 
N
P
 
D
E
 
S
V
 
D
W
 
Y
N
 
H
P
 
G
R
 
G
I
x
F
E
 
E
M
 
L
-
 
E
V
 
E
L
 
I
R
 
Q
D
 
Q
G
x
V
A
 
F
A
 
D
A
 
A
M
 
M
V
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
Y
D
 
S
A
 
A
S
 
W
I
 
A
A
 
T
R
 
G
W
x
Y
F
 
A
T
 
P
A
 
L
D
 
A
F
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
D
N
 
V
P
 
P
Y
 
A
Q
 
A
A
 
V
K
 
Q
Q
 
E
I
 
F
T
 
S
D
 
R
M
 
T
L
 
L
A
 
F
A
 
N
T
 
M
S
 
R
P
 
P
E
 
D
G
 
I
Y
 
S
A
 
L
A
 
H
N
 
V
C
|
C
A
 
Q
A
 
T
V
 
V
R
x
F
D
 
K
A
 
T
D
 
D
F
 
L
R
 
R
E
 
G
Q
 
V
L
 
L
A
 
G
S
 
M
I
 
V
T
 
R
V
 
A
P
 
P
T
 
C
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
Q
G
 
T
T
 
T
E
 
R
D
 
D
A
 
V
V
x
S
T
 
V
P
 
P
P
 
A
A
 
S
G
 
V
S
 
A
H
 
A
F
 
Y
I
 
L
Q
 
K
N
 
A
H
 
H
V
 
L
Q
 
G
G
 
G
A
 
R
E
 
T
Y
 
T
A
 
V
E
 
E
F
 
F
Y
 
L
-
 
Q
-
 
T
A
 
E
A
 
G
H
|
H
L
 
L
S
 
P
N
 
H
V
 
L
Q
 
S
A
 
A

5zhsA Crystal structure of osd14 in complex with covalently bound kk052 (see paper)
25% identity, 87% coverage: 19:248/263 of query aligns to 13:249/264 of 5zhsA

query
sites
5zhsA
E
 
S
G
 
G
A
 
E
P
 
R
V
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
L
S
 
S
N
 
H
S
 
G
L
x
F
G
 
G
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
H
 
S
M
 
A
W
 
W
D
 
S
L
 
R
Q
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
Y
F
 
L
T
 
T
Q
 
R
H
 
D
F
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
V
R
 
L
F
 
Y
D
 
D
T
 
L
R
 
V
G
 
C
H
 
A
G
 
G
K
 
S
S
 
-
L
 
-
V
 
V
T
 
N
P
 
P
G
 
D
P
 
H
Y
 
F
S
 
D
I
 
F
E
 
R
Q
 
R
L
 
Y
G
 
D
Q
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
R
I
 
I
Q
 
P
R
 
R
A
 
C
H
 
A
F
 
F
C
 
V
G
 
G
L
 
H
S
|
S
M
x
V
G
 
S
G
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
G
Q
 
I
W
 
L
L
 
A
G
 
S
I
 
I
N
 
R
A
 
R
G
 
P
Q
 
D
R
 
L
L
 
F
Q
 
A
R
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
L
C
 
I
N
 
G
T
 
A
A
 
S
A
 
P
K
 
R
I
x
F
G
 
L
T
 
N
P
 
D
E
 
S
V
 
D
W
 
Y
N
 
H
P
 
G
R
 
G
I
 
F
E
 
E
M
 
L
-
 
E
V
 
E
L
 
I
R
 
Q
D
 
Q
G
 
V
A
 
F
A
 
D
A
 
A
M
 
M
V
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
Y
D
 
S
A
 
A
S
 
W
I
 
A
A
 
T
R
 
G
W
 
Y
F
 
A
T
 
P
A
 
L
D
 
A
F
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
D
N
 
V
P
 
P
Y
 
A
Q
 
A
A
 
V
K
 
Q
Q
 
E
I
 
F
T
 
S
D
 
R
M
 
T
L
 
L
A
 
F
A
 
N
T
 
M
S
 
R
P
 
P
E
 
D
G
 
I
Y
 
S
A
 
L
A
 
H
N
 
V
C
 
C
A
 
Q
A
 
T
V
 
V
R
x
F
D
 
K
A
 
T
D
 
D
F
 
L
R
 
R
E
 
G
Q
 
V
L
 
L
A
 
G
S
 
M
I
 
V
T
 
R
V
 
A
P
 
P
T
 
C
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
Q
G
 
T
T
 
T
E
 
R
D
 
D
A
 
V
V
x
S
T
 
V
P
 
P
P
 
A
A
 
S
G
 
V
S
 
A
H
 
A
F
 
Y
I
 
L
Q
 
K
N
 
A
H
 
H
V
 
L
Q
 
G
G
 
G
A
 
R
E
 
T
Y
 
T
A
 
V
E
 
E
F
 
F
Y
 
L
-
 
Q
-
 
T
A
 
E
A
 
G
H
 
H
L
 
L
S
 
P
N
 
H
V
 
L
Q
 
S
A
 
A

6brtA F-box protein cth with hydrolase (see paper)
25% identity, 87% coverage: 19:248/263 of query aligns to 34:270/285 of 6brtA

query
sites
6brtA
E
 
S
G
 
G
A
 
E
P
 
R
V
 
V
L
 
V
V
 
V
L
 
L
S
 
S
N
 
H
S
 
G
L
x
F
G
 
G
T
 
T
D
 
D
L
 
Q
H
 
S
M
 
A
W
 
W
D
 
S
L
 
R
Q
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
Y
F
 
L
T
 
T
Q
 
R
H
 
D
F
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
V
R
 
L
F
 
Y
D
 
D
T
 
L
R
 
V
G
 
C
H
 
A
G
 
G
K
 
S
S
 
-
L
 
-
V
 
V
T
 
N
P
 
P
G
 
D
P
 
H
Y
 
F
S
 
D
I
 
F
E
 
R
Q
 
R
L
 
Y
G
 
D
Q
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
R
I
 
I
Q
 
P
R
 
R
A
 
C
H
 
A
F
 
F
C
 
V
G
 
G
L
 
H
S
 
S
M
 
V
G
 
S
G
 
A
L
 
M
I
 
I
G
 
G
Q
 
I
W
 
L
L
 
A
G
 
S
I
 
I
N
 
R
A
 
R
G
 
P
Q
 
D
R
 
L
L
 
F
Q
 
A
R
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
L
C
 
I
N
 
G
T
 
A
A
 
S
A
 
P
K
 
R
I
 
F
G
 
L
T
 
N
P
 
D
E
 
S
V
 
D
W
 
Y
N
 
H
P
 
G
R
 
G
I
 
F
E
 
E
M
 
L
-
 
E
V
 
E
L
 
I
R
 
Q
D
 
Q
G
 
V
A
 
F
A
 
D
A
 
A
M
 
M
V
 
G
A
 
A
L
 
N
R
 
Y
D
 
S
A
 
A
S
 
W
I
 
A
A
 
T
R
 
G
W
x
Y
F
 
A
T
 
P
A
 
L
D
 
A
F
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
D
N
 
V
P
 
P
Y
 
A
Q
 
A
A
 
V
K
 
Q
Q
 
E
I
 
F
T
 
S
D
 
R
M
 
T
L
 
L
A
 
F
A
 
N
T
 
M
S
 
R
P
 
P
E
 
D
G
 
I
Y
 
S
A
 
L
A
 
H
N
 
V
C
 
C
A
 
Q
A
 
T
V
 
V
R
 
F
D
 
K
A
 
T
D
 
D
F
 
L
R
 
R
E
 
G
Q
 
V
L
 
L
A
 
G
S
 
M
I
 
V
T
 
R
V
 
A
P
 
P
T
 
C
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
Q
G
 
T
T
 
T
E
 
R
D
 
D
A
 
V
V
 
S
T
 
V
P
 
P
P
 
A
A
 
S
G
 
V
S
 
A
H
 
A
F
 
Y
I
 
L
Q
 
K
N
 
A
H
 
H
V
 
L
Q
 
G
G
 
G
A
 
R
E
 
T
Y
 
T
A
 
V
E
 
E
F
 
F
Y
 
L
-
 
Q
-
 
T
A
 
E
A
 
G
H
 
H
L
 
L
S
 
P
N
 
H
V
 
L
Q
 
S
A
 
A

Query Sequence

>GFF1325 FitnessBrowser__WCS417:GFF1325
MAFVQLAEGELHYQLDGPEGAPVLVLSNSLGTDLHMWDLQIPAFTQHFRVLRFDTRGHGK
SLVTPGPYSIEQLGQDVIALLDALDIQRAHFCGLSMGGLIGQWLGINAGQRLQRLVVCNT
AAKIGTPEVWNPRIEMVLRDGAAAMVALRDASIARWFTADFAAANPYQAKQITDMLAATS
PEGYAANCAAVRDADFREQLASITVPTLVIAGTEDAVTPPAGSHFIQNHVQGAEYAEFYA
AHLSNVQAGAAFSDCVIEFLLGH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory