SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1425 FitnessBrowser__WCS417:GFF1425 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
34% identity, 95% coverage: 12:259/262 of query aligns to 7:255/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
G
 
G
L
 
R
R
 
K
V
 
A
L
 
I
I
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
S
A
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
V
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
R
A
 
A
Y
 
L
L
 
D
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
H
 
A
V
 
I
C
 
A
D
|
D
V
x
L
S
 
D
-
 
V
E
 
M
S
 
A
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
V
 
V
F
 
V
R
 
A
D
 
G
K
 
L
Y
 
E
P
 
N
G
 
G
T
 
G
V
 
F
A
 
A
T
 
V
R
 
E
A
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
K
A
 
R
A
 
A
Q
 
S
I
 
V
E
 
D
A
 
A
V
 
A
F
 
M
K
 
Q
V
 
K
Q
 
A
R
 
I
E
 
D
H
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
A
 
S
G
 
T
P
 
M
T
 
R
G
 
P
G
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
-
I
 
I
S
 
T
D
 
D
A
 
E
E
 
E
W
 
W
Q
 
D
A
 
F
T
 
N
I
 
F
N
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
A
T
 
R
A
 
G
Q
 
V
Y
 
F
R
 
L
F
 
A
A
 
N
H
 
Q
H
 
I
A
 
A
V
 
C
P
 
R
-
 
H
M
 
F
L
 
L
K
 
A
E
 
S
S
 
N
S
 
T
H
 
K
G
 
G
H
 
V
L
 
I
L
 
V
H
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
V
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
V
G
 
G
Y
 
A
A
 
P
W
 
L
R
x
L
T
 
A
P
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
F
A
 
A
I
 
V
V
 
F
G
 
G
L
 
W
M
 
T
K
 
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
R
E
 
E
L
 
M
G
 
A
E
 
P
S
 
K
D
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
L
 
C
P
 
P
G
|
G
I
 
F
V
|
V
E
 
K
G
x
T
P
 
A
R
x
M
M
 
Q
D
 
E
G
 
R
V
 
E
I
 
I
R
 
I
A
 
W
R
x
E
A
 
A
E
 
E
Q
 
L
V
 
R
G
 
G
V
 
M
P
 
T
E
 
P
A
 
E
E
 
A
M
 
V
R
 
R
Q
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
V
N
 
S
K
 
L
I
 
T
S
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
I
V
 
E
T
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
D
M
 
V
A
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
F
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
G
I
 
I
S
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
N
 
G
V
 
V

5t5qC Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr:glucose/ribitol dehydrogenase from brucella melitensis
34% identity, 94% coverage: 15:259/262 of query aligns to 10:242/245 of 5t5qC

query
sites
5t5qC
V
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
G
 
A
A
x
N
A
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
L
Y
 
F
L
 
H
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
L
H
 
V
V
 
L
C
 
T
D
|
D
V
x
L
S
 
D
E
 
R
S
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
D
V
 
A
F
 
F
R
 
A
D
 
A
K
 
S
Y
 
L
-
 
G
-
 
S
P
 
P
G
 
E
T
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
-
 
I
R
 
K
A
 
A
D
|
D
V
x
A
S
 
S
D
 
S
A
 
A
A
 
D
Q
 
D
I
 
A
E
 
E
A
 
K
V
 
T
F
 
V
K
 
A
V
 
L
Q
 
A
R
 
M
E
 
E
H
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
P
N
x
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
-
 
Y
-
 
Q
A
 
A
G
 
K
P
 
P
T
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
F
D
 
A
A
 
E
I
 
M
S
 
S
D
 
D
A
 
A
E
 
D
W
 
W
Q
 
H
A
 
R
T
 
T
I
 
I
N
 
S
I
|
I
N
 
N
L
 
L
T
 
D
A
 
G
Q
 
V
Y
 
F
R
 
Y
F
 
L
A
 
C
H
 
K
H
 
R
A
 
A
V
 
L
P
 
P
M
 
A
L
 
L
K
 
K
E
 
E
S
 
D
S
 
S
H
 
S
G
 
-
H
 
-
L
 
I
L
 
V
H
 
T
I
 
L
A
 
A
S
|
S
V
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
Y
L
 
R
G
 
G
Y
 
A
A
 
Y
W
 
V
R
x
N
T
 
A
P
 
H
Y
|
Y
A
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
W
 
G
A
 
A
I
 
M
V
 
V
G
 
S
L
 
M
M
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
S
S
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
P
S
 
K
D
 
-
I
 
T
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
V
L
 
S
P
|
P
G
 
G
I
 
I
V
x
I
E
 
E
G
x
T
P
 
P
R
x
M
M
 
T
D
 
S
G
 
E
V
 
L
I
 
L
R
 
K
A
 
T
R
 
R
A
 
M
E
 
D
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
-
Q
 
-
E
 
E
Y
 
T
L
 
M
N
 
T
K
 
Q
I
 
T
S
 
P
L
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
L
V
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
S
D
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
S
M
 
V
A
 
I
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
S
N
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
A
 
T
I
 
I
S
 
Q
V
 
V
D
 
N
G
 
G
N
 
G
V
 
I

5yssB Crystal structure of aminocaproic acid cyclase in complex with NAD (+) (see paper)
34% identity, 94% coverage: 12:257/262 of query aligns to 4:250/255 of 5yssB

query
sites
5yssB
G
 
G
L
 
K
R
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
S
A
x
T
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
V
 
G
L
 
I
A
 
A
A
 
Q
A
 
V
Y
 
L
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
L
H
 
I
V
 
L
-
 
N
-
x
G
-
x
F
-
 
G
-
 
D
C
 
V
D
 
D
V
 
A
S
 
A
E
 
K
S
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
A
V
 
Q
F
 
Y
R
 
-
D
 
G
K
 
K
Y
 
T
P
 
P
G
 
G
T
 
Y
V
 
H
A
 
G
T
 
-
R
 
-
A
 
A
D
 
D
V
x
L
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
E
 
A
A
 
D
V
 
M
F
 
M
K
 
R
V
 
Y
Q
 
A
R
 
E
E
 
S
H
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
A
 
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
V
G
 
S
G
 
P
I
 
I
D
 
E
A
 
T
I
 
F
S
 
P
D
 
V
A
 
D
E
 
K
W
 
W
Q
 
N
A
 
A
T
 
I
I
 
I
N
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
S
A
 
S
Q
 
V
Y
 
F
R
 
H
F
 
T
A
 
T
H
 
R
H
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
M
 
G
L
 
M
K
 
R
E
 
A
S
 
R
S
 
N
H
 
W
G
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
I
H
 
N
I
 
I
A
|
A
S
 
S
V
 
V
A
 
H
G
 
G
R
 
L
L
 
V
G
 
A
Y
 
S
A
 
K
W
 
E
R
 
K
T
 
S
P
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
W
 
H
A
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
L
E
 
E
L
 
T
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
D
 
E
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
C
P
|
P
G
|
G
I
 
W
V
|
V
E
 
L
G
x
T
P
 
P
R
 
L
M
 
V
D
 
Q
G
 
Q
V
 
Q
I
 
I
R
 
D
A
 
K
R
 
R
A
 
I
E
 
A
Q
 
E
V
 
G
G
 
A
V
 
E
P
 
P
E
 
E
A
 
A
E
 
A
M
 
R
R
 
D
Q
 
A
E
 
L
Y
 
L
L
 
A
N
 
E
K
 
K
I
 
Q
S
 
P
L
 
S
K
 
R
R
 
E
M
 
F
V
 
V
T
 
T
A
 
P
E
 
E
D
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
N
M
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
P
 
D
A
 
G
A
 
A
R
 
A
N
 
Q
V
 
V
T
 
R
G
 
G
Q
 
V
A
 
A
I
 
W
S
 
N
V
 
M
D
 
D
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
32% identity, 93% coverage: 16:259/262 of query aligns to 11:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
I
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
A
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
V
 
E
L
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
V
Y
 
F
L
 
M
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
H
 
V
V
 
I
C
 
A
D
|
D
V
x
F
S
 
N
E
 
E
S
 
A
A
 
A
L
 
G
A
 
K
V
 
E
F
 
A
R
 
V
D
 
E
K
 
A
Y
 
N
P
 
P
G
 
G
T
 
V
V
 
V
A
 
F
T
 
I
R
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
A
 
R
A
 
E
Q
 
S
I
 
V
E
 
H
A
 
R
V
 
L
F
 
V
K
 
E
V
 
N
Q
 
V
R
 
A
E
 
E
H
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
T
G
 
R
P
x
D
T
 
S
G
 
M
G
 
-
I
 
L
D
 
S
A
x
K
I
 
M
S
 
T
D
 
V
A
 
D
E
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
T
 
V
I
 
I
N
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
V
Y
 
F
R
 
H
F
 
C
A
 
T
H
 
Q
H
 
A
A
 
V
V
 
L
P
 
P
M
 
Y
L
 
M
K
 
A
E
 
E
S
 
Q
S
 
G
H
 
K
G
 
G
H
 
K
L
 
I
L
 
I
H
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
L
 
Y
G
 
G
Y
x
N
A
x
V
W
 
G
R
x
Q
T
 
T
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
W
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
M
M
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
W
A
 
A
S
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
R
S
 
K
D
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
A
P
|
P
G
 
G
I
x
F
V
x
T
E
 
E
G
x
T
P
 
A
R
x
M
M
 
V
D
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
A
E
 
E
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
-
E
 
K
M
 
V
R
 
I
Q
 
E
E
x
K
Y
 
M
L
 
K
N
 
A
K
 
Q
I
 
V
S
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
R
M
 
L
V
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
M
 
A
A
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
H
A
 
E
A
 
S
R
 
D
N
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
A
 
V
I
 
L
S
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
G
V
 
I

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
34% identity, 97% coverage: 4:257/262 of query aligns to 1:252/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
L
 
M
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
Q
 
E
P
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
G
L
 
K
R
 
S
V
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
A
A
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
V
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
E
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
H
 
A
V
 
I
C
 
A
D
 
D
V
 
I
S
 
D
-
 
I
E
 
E
S
 
R
A
 
A
L
 
R
A
 
Q
V
 
A
F
 
A
R
 
A
D
 
E
K
 
I
Y
 
G
P
 
P
G
 
A
T
 
A
V
 
Y
A
 
A
T
 
V
R
 
Q
A
 
M
D
 
D
V
 
V
S
 
T
D
 
R
A
 
Q
A
 
D
Q
 
S
I
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
A
F
 
I
K
 
A
V
 
A
Q
 
T
R
 
V
E
 
E
H
 
H
L
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
A
I
 
L
A
 
F
G
 
-
P
 
D
T
 
L
G
 
A
G
 
P
I
 
I
D
 
V
A
 
E
I
 
I
S
 
T
D
 
R
A
 
E
E
 
S
W
 
Y
Q
 
E
A
 
K
T
 
L
I
 
F
N
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
A
A
 
G
Q
 
T
-
 
L
Y
 
F
R
 
T
F
 
L
A
 
Q
H
 
A
H
 
A
A
 
A
V
 
R
P
 
Q
M
 
M
L
 
I
K
 
A
E
 
Q
S
 
G
S
 
R
H
 
G
G
 
G
H
 
K
L
 
I
L
 
I
H
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
V
x
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
R
G
 
G
Y
x
E
A
 
A
W
 
L
R
 
V
T
 
A
P
 
I
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
T
 
T
K
 
K
W
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
S
L
 
L
M
 
T
K
 
Q
S
 
S
L
 
A
A
 
G
S
 
L
E
 
D
L
 
L
G
 
I
E
 
K
S
 
H
D
 
R
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
L
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
V
V
 
V
E
 
D
G
 
G
P
 
E
R
x
H
M
x
W
D
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
D
R
 
A
A
 
L
R
x
F
A
 
A
E
 
R
Q
 
Y
V
 
E
G
 
N
V
 
R
P
 
P
E
 
R
A
 
G
E
 
E
M
 
K
R
 
K
Q
 
R
E
 
L
Y
 
V
L
 
G
N
 
E
K
 
A
I
 
V
S
 
P
L
 
F
K
 
G
R
 
R
M
 
M
V
 
G
T
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
T
A
 
G
M
 
M
A
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
A
A
 
E
A
 
S
R
 
D
N
 
Y
V
 
I
T
 
V
G
 
S
Q
 
Q
A
 
T
I
 
Y
S
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G

3toxA Crystal structure of a short chain dehydrogenase in complex with NAD(p) from sinorhizobium meliloti 1021
36% identity, 92% coverage: 16:257/262 of query aligns to 9:248/254 of 3toxA

query
sites
3toxA
L
 
I
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
V
 
A
L
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
L
Y
 
F
L
 
A
E
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
H
 
V
V
 
V
C
 
T
D
x
A
V
x
R
S
x
N
E
 
G
S
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
E
F
 
L
R
 
T
D
 
D
K
 
E
Y
 
I
P
 
A
G
 
G
T
 
G
V
 
G
A
 
G
T
 
E
R
 
A
A
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
G
D
 
D
V
|
V
S
 
G
D
 
D
A
 
E
A
 
A
Q
 
L
I
 
H
E
 
E
A
 
A
V
 
L
F
 
V
K
 
E
V
 
L
Q
 
A
R
 
V
E
 
R
H
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
T
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
A
A
 
L
G
 
G
P
 
A
T
 
M
G
 
G
G
 
E
I
 
I
D
 
S
A
 
S
I
 
L
S
 
S
D
 
V
A
 
E
E
 
G
W
 
W
Q
 
R
A
 
E
T
 
T
I
 
L
N
 
D
I
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
S
Q
 
A
Y
 
F
R
 
L
F
 
A
A
 
A
H
 
K
H
 
Y
A
 
Q
V
 
V
P
 
P
M
 
A
L
 
I
K
 
A
E
 
A
S
 
L
S
 
G
H
 
G
G
 
G
H
 
S
L
 
L
L
 
T
H
 
F
I
x
T
A
 
S
S
|
S
V
 
F
A
 
V
G
 
G
R
 
H
L
 
T
-
 
A
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
W
 
G
R
x
V
T
 
A
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
A
A
 
G
I
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
V
K
 
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
G
E
 
A
S
 
R
D
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
L
P
|
P
G
 
G
I
x
G
V
x
T
E
 
D
G
x
T
P
 
P
R
 
A
M
 
N
D
 
F
G
 
A
V
 
N
I
 
L
R
 
P
A
 
G
R
 
A
A
 
A
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
A
 
T
E
 
R
M
 
G
R
 
F
Q
 
V
E
 
E
Y
 
G
L
 
L
N
 
H
K
 
-
I
 
-
S
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
I
V
 
A
T
 
R
A
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
E
M
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
G
A
 
A
R
 
S
N
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
L
V
 
A
D
 
D
G
 
G

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
31% identity, 92% coverage: 16:257/262 of query aligns to 9:235/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
L
 
V
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
A
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
E
 
Q
V
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
H
 
I
V
 
A
C
 
G
D
|
D
V
x
L
S
 
G
E
 
D
S
 
L
A
 
T
L
 
Y
A
 
S
V
 
-
F
 
-
R
 
-
D
 
-
K
 
-
Y
 
H
P
 
P
G
 
N
T
 
V
V
 
E
A
 
G
T
 
M
R
 
Y
A
x
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
D
 
D
A
 
V
A
 
T
Q
 
G
I
 
V
E
 
E
A
 
K
V
 
F
F
 
Y
K
 
Q
V
 
S
Q
 
V
R
 
I
E
 
D
H
 
K
L
 
Y
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
 
T
G
 
-
P
 
K
T
 
D
G
 
A
G
 
M
I
 
T
D
 
R
A
 
K
I
 
M
S
 
T
D
 
E
A
 
A
E
 
Q
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
T
 
V
I
 
I
N
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
A
 
G
Q
 
V
Y
 
F
R
 
N
F
 
L
A
 
T
H
 
R
H
 
L
A
 
V
V
 
G
P
 
P
M
 
Q
L
 
M
K
 
Q
E
 
T
S
 
N
S
 
G
H
 
Y
G
 
G
H
 
S
L
 
I
L
 
I
H
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
V
L
 
F
G
 
G
Y
 
N
A
 
I
W
 
G
R
 
Q
T
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
W
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
M
S
 
T
L
 
W
A
 
A
S
 
K
E
 
E
-
 
F
-
 
A
L
 
L
G
 
K
E
 
G
S
 
A
D
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
L
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
Y
V
x
I
E
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
M
 
M
D
x
T
G
 
D
V
 
I
I
 
L
R
 
K
A
 
T
R
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
A
 
-
E
 
D
M
 
L
R
 
L
Q
 
D
E
 
K
Y
 
F
L
 
A
N
 
A
K
 
L
I
 
T
S
 
M
L
 
L
K
 
N
R
 
R
M
 
L
V
 
G
T
 
Q
A
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
K
M
 
V
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
D
A
 
A
R
 
S
N
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
I
 
I
S
 
N
V
 
V
D
 
N
G
 
G

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
33% identity, 94% coverage: 16:261/262 of query aligns to 6:255/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
L
 
L
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
A
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
V
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
R
Y
 
L
L
 
V
E
 
K
A
 
D
G
 
G
A
 
F
Q
 
A
V
 
V
H
 
A
V
 
I
C
 
A
D
|
D
V
x
Y
S
 
N
E
 
D
S
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
A
V
 
S
F
 
E
R
 
I
D
 
N
K
 
Q
Y
 
A
P
 
G
G
 
G
-
 
H
T
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
V
R
 
K
A
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
A
x
R
A
x
D
Q
 
Q
I
 
V
E
x
F
A
 
A
V
 
A
F
 
V
K
 
E
V
 
Q
Q
 
A
R
 
R
E
 
K
H
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
-
P
 
P
T
 
S
G
 
T
G
 
P
I
 
I
D
 
E
A
 
S
I
 
I
S
 
T
D
 
P
A
 
E
E
 
I
W
 
V
Q
 
D
A
 
K
T
 
V
I
 
Y
N
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
V
T
 
K
A
 
G
Q
 
V
Y
 
I
R
 
W
F
 
G
A
 
I
H
 
Q
H
 
A
A
 
A
V
 
V
P
x
E
M
 
A
L
 
F
K
 
K
E
 
K
S
 
E
S
 
G
H
 
H
G
 
G
-
 
G
H
 
K
L
 
I
L
 
I
H
 
N
I
 
A
A
 
C
S
|
S
V
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
L
 
V
G
 
G
Y
 
N
A
 
P
W
 
E
R
 
L
T
 
A
P
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
W
 
F
A
 
A
I
 
V
V
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
Q
S
 
T
L
 
A
A
 
A
S
 
R
E
 
D
L
 
L
G
 
A
E
 
P
S
 
L
D
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
Y
L
 
C
P
|
P
G
 
G
I
 
I
V
|
V
E
 
K
G
x
T
P
 
P
R
x
M
M
 
W
D
 
A
G
 
E
V
 
I
I
 
D
R
 
R
A
 
Q
R
x
V
A
 
S
E
 
E
Q
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
G
E
 
Y
M
 
G
R
 
T
Q
 
A
E
 
E
Y
 
F
L
 
A
N
 
K
K
 
R
I
 
I
S
 
T
L
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
L
V
 
S
T
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
C
A
 
V
L
 
S
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
D
A
 
S
R
 
D
N
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
S
I
 
L
S
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
N
 
G
V
 
M
E
 
V
Y
 
F

2q2qD Structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas putida (see paper)
34% identity, 94% coverage: 12:257/262 of query aligns to 4:250/255 of 2q2qD

query
sites
2q2qD
G
 
G
L
 
K
R
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
S
A
x
T
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
V
 
G
L
 
I
A
 
A
A
 
Q
A
 
V
Y
 
L
L
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
I
H
 
V
V
 
L
C
 
N
D
 
G
V
x
F
S
 
G
E
 
D
S
 
P
A
 
A
L
 
P
A
 
A
V
 
L
F
 
A
R
 
E
D
 
I
K
 
A
Y
 
R
P
 
H
G
 
G
T
 
V
V
 
K
A
 
A
T
 
V
R
 
H
-
 
H
-
 
P
A
 
A
D
|
D
V
x
L
S
 
S
D
 
D
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
L
F
 
F
K
 
A
V
 
L
Q
 
A
R
 
E
E
 
R
H
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
V
G
 
A
G
 
P
I
 
V
D
 
E
A
 
Q
I
 
F
S
 
P
D
 
L
A
 
E
E
 
S
W
 
W
Q
 
D
A
 
K
T
 
I
I
 
I
N
 
A
I
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
S
A
 
A
Q
 
V
Y
 
F
R
 
H
F
 
G
A
 
T
H
 
R
H
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
M
 
G
L
 
M
K
 
R
E
 
A
S
 
R
S
 
N
H
 
W
G
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
I
H
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
H
G
 
G
R
 
L
L
 
V
G
 
G
Y
 
S
A
 
T
W
 
G
R
 
K
T
 
A
P
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
W
 
H
A
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
K
S
 
V
L
 
V
A
 
G
S
 
L
E
 
E
L
 
T
G
 
A
E
 
T
S
 
S
D
 
N
I
 
V
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
I
L
 
C
P
|
P
G
|
G
I
x
W
V
|
V
E
 
L
G
x
T
P
 
P
R
x
L
M
x
V
D
 
Q
G
 
K
V
 
Q
I
 
I
R
 
D
A
 
D
R
|
R
A
 
A
E
 
A
Q
 
N
V
 
G
G
 
G
V
 
D
P
 
P
E
 
L
A
 
Q
E
 
A
M
 
Q
R
 
H
Q
 
D
E
 
L
Y
 
L
L
 
A
N
 
E
K
 
K
I
 
Q
S
 
P
L
 
S
K
 
L
R
 
A
M
 
F
V
 
V
T
 
T
A
 
P
E
 
E
D
 
H
V
 
L
A
 
G
A
 
E
M
 
L
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
P
 
E
A
 
A
A
 
G
R
 
S
N
 
Q
V
 
V
T
 
R
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
W
S
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G

4b79A The aeropath project and pseudomonas aeruginosa high-throughput crystallographic studies for assessment of potential targets in early stage drug discovery. (see paper)
35% identity, 95% coverage: 10:257/262 of query aligns to 8:231/236 of 4b79A

query
sites
4b79A
Y
 
Y
P
 
A
G
 
G
L
 
Q
R
 
Q
V
 
V
L
 
L
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
A
V
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
M
A
 
Q
Y
 
F
L
 
A
E
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
H
 
V
V
 
A
C
 
L
D
 
G
V
x
L
S
 
D
E
 
-
S
 
-
A
 
A
L
 
D
A
 
G
V
 
V
F
 
H
R
 
A
D
 
P
K
 
R
Y
 
H
P
 
P
G
 
R
T
 
I
V
 
R
A
 
R
T
 
E
R
 
E
A
x
L
D
|
D
V
x
I
S
 
T
D
 
D
A
 
S
A
 
Q
Q
 
R
I
 
L
E
 
Q
A
 
R
V
 
L
F
 
F
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
R
 
-
E
 
E
H
 
A
L
 
L
G
 
P
G
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
S
G
 
R
P
 
D
T
 
R
G
 
E
G
 
E
I
 
Y
D
 
D
A
 
L
I
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
A
E
 
T
W
 
F
Q
 
E
A
 
R
T
 
V
I
 
L
N
 
R
I
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
S
A
 
A
Q
 
A
Y
 
M
R
 
L
F
 
A
A
 
S
H
 
Q
H
 
L
A
 
A
V
 
R
P
 
P
M
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
Q
S
 
R
S
 
G
H
 
-
G
 
G
H
 
S
L
 
I
L
 
L
H
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
V
 
M
A
 
Y
G
 
S
R
 
T
L
 
F
G
 
G
Y
 
S
A
 
A
W
 
D
R
|
R
T
 
P
P
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
W
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
Q
L
 
L
M
 
T
K
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
C
E
 
E
L
 
Y
G
 
A
E
 
A
S
 
E
D
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
L
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
W
V
x
I
E
 
D
G
x
T
P
 
P
R
 
K
M
 
A
D
 
D
G
 
-
V
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
E
 
E
M
 
A
R
 
T
Q
 
R
E
 
R
Y
 
I
L
 
M
N
 
Q
K
 
R
I
 
T
S
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
M
 
W
V
 
G
T
 
E
A
 
A
E
 
P
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
M
 
A
A
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
G
P
 
P
A
 
G
A
 
A
R
 
S
N
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
A
 
V
I
 
L
S
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
33% identity, 94% coverage: 16:261/262 of query aligns to 6:255/256 of Q48436

query
sites
Q48436
L
|
L
I
x
V
S
x
T
G
|
G
G
x
A
A
x
G
A
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
E
x
K
V
x
A
L
x
I
A
|
A
A
x
L
A
x
R
Y
x
L
L
x
V
E
x
K
A
x
D
G
|
G
A
x
F
Q
x
A
V
|
V
H
x
A
V
x
I
C
x
A
D
|
D
V
 
Y
S
 
N
E
 
D
S
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
A
V
 
S
F
 
E
R
 
I
D
 
N
K
 
Q
Y
 
A
P
 
G
G
 
G
-
 
R
T
 
A
V
 
M
A
 
A
T
 
V
R
 
K
A
 
V
D
|
D
V
 
V
S
 
S
D
 
D
A
 
R
A
 
D
Q
 
Q
I
 
V
E
 
F
A
 
A
V
 
A
F
 
V
K
 
E
V
 
Q
Q
 
A
R
 
R
E
 
K
H
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
-
P
 
P
T
 
S
G
 
T
G
 
P
I
 
I
D
 
E
A
 
S
I
 
I
S
 
T
D
 
P
A
 
E
E
 
I
W
 
V
Q
 
D
A
 
K
T
 
V
I
 
Y
N
 
N
I
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
K
A
 
G
Q
 
V
Y
 
I
R
 
W
F
 
G
A
 
I
H
 
Q
H
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
E
M
 
A
L
 
F
K
 
K
E
 
K
S
 
E
S
 
G
H
 
H
G
 
G
-
 
G
H
 
K
L
 
I
L
 
I
H
 
N
I
 
A
A
 
C
S
 
S
V
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
L
 
V
G
 
G
Y
 
N
A
 
P
W
 
E
R
 
L
T
 
A
P
 
V
Y
 
Y
A
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
W
 
F
A
 
A
I
 
V
V
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
Q
S
 
T
L
 
A
A
 
A
S
 
R
E
 
D
L
 
L
G
 
A
E
 
P
S
 
L
D
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
Y
L
 
C
P
 
P
G
 
G
I
 
I
V
 
V
E
 
K
G
 
T
P
 
P
R
 
M
M
 
W
D
 
A
G
 
E
V
 
I
I
 
D
R
 
R
A
 
Q
R
 
V
A
 
S
E
 
E
Q
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
K
P
 
P
E
 
L
A
 
G
E
 
Y
M
 
G
R
 
T
Q
 
A
E
 
E
Y
 
F
L
 
A
N
 
K
K
 
R
I
 
I
S
 
T
L
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
L
V
 
S
T
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
C
A
 
V
L
 
S
F
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
D
A
 
S
R
 
D
N
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
S
I
 
L
S
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
N
 
G
V
 
M
E
 
V
Y
 
F

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
29% identity, 92% coverage: 16:257/262 of query aligns to 11:256/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
L
 
F
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
V
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
K
A
 
K
Y
 
F
L
 
A
E
 
Q
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
H
 
V
V
 
I
C
 
S
D
|
D
V
x
M
S
 
N
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
C
E
 
Q
S
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
N
V
 
S
F
 
L
R
 
K
D
 
E
K
 
Q
Y
 
G
P
 
F
G
 
D
T
 
A
V
 
L
A
 
S
T
 
A
R
 
P
A
 
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
D
Q
 
A
I
 
Y
E
 
K
A
 
Q
V
 
A
F
 
I
K
 
E
V
 
L
Q
 
T
R
 
Q
E
 
K
H
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
A
x
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
V
G
 
A
G
 
P
I
 
I
D
 
E
A
 
E
I
 
F
S
 
P
D
 
T
A
 
A
E
 
V
W
 
F
Q
 
Q
A
 
K
T
 
L
I
 
V
N
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
A
Y
 
F
R
 
I
F
 
G
A
 
I
H
 
K
H
 
H
A
 
V
V
 
L
P
 
P
M
 
I
L
 
M
K
 
K
E
 
A
S
 
Q
S
 
K
H
 
Y
G
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
I
H
 
N
I
x
M
A
|
A
S
|
S
V
 
I
A
x
N
G
 
G
R
 
L
L
 
I
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
W
 
G
R
x
K
T
 
A
P
 
G
Y
|
Y
A
 
N
A
 
S
T
 
A
K
|
K
W
 
H
A
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
K
S
 
V
L
 
A
A
 
A
S
 
L
E
 
E
L
 
C
G
 
A
E
 
R
S
 
D
D
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
C
P
|
P
G
|
G
I
 
Y
V
|
V
E
 
D
G
x
T
P
 
P
R
x
L
M
 
V
D
 
R
G
 
G
V
x
Q
I
 
I
R
 
A
A
 
D
R
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
T
V
 
R
G
 
N
V
 
V
P
 
S
-
 
L
E
 
D
A
 
S
E
 
A
M
 
L
R
 
E
Q
 
D
E
 
V
Y
 
I
L
 
L
N
 
A
K
 
M
I
 
V
S
 
P
L
 
Q
K
 
K
R
 
R
M
 
L
V
 
L
T
 
S
A
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
D
M
 
Y
A
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
S
A
 
K
A
 
A
R
 
G
N
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
S
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
29% identity, 92% coverage: 16:257/262 of query aligns to 10:255/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
L
 
F
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
V
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
K
A
 
K
Y
 
F
L
 
A
E
 
Q
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
H
 
V
V
 
I
C
 
S
D
|
D
V
x
M
S
 
N
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
C
E
 
Q
S
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
N
V
 
S
F
 
L
R
 
K
D
 
E
K
 
Q
Y
 
G
P
 
F
G
 
D
T
 
A
V
 
L
A
 
S
T
 
A
R
 
P
A
 
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
D
Q
 
A
I
 
Y
E
 
K
A
 
Q
V
 
A
F
 
I
K
 
E
V
 
L
Q
 
T
R
 
Q
E
 
K
H
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
A
x
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
V
G
 
A
G
 
P
I
 
I
D
 
E
A
 
E
I
 
F
S
 
P
D
 
T
A
 
A
E
 
V
W
 
F
Q
 
Q
A
 
K
T
 
L
I
 
V
N
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
A
 
G
Q
 
A
Y
 
F
R
 
I
F
 
G
A
 
I
H
 
K
H
 
H
A
 
V
V
 
L
P
 
P
M
 
I
L
 
M
K
 
K
E
 
A
S
 
Q
S
 
K
H
 
Y
G
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
I
H
 
N
I
x
M
A
|
A
S
|
S
V
 
I
A
 
N
G
 
G
R
 
L
L
 
I
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
W
 
G
R
x
K
T
 
A
P
 
G
Y
|
Y
A
 
N
A
 
S
T
 
A
K
|
K
W
 
H
A
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
T
K
 
K
S
 
V
L
 
A
A
 
A
S
 
L
E
 
E
L
 
C
G
 
A
E
 
R
S
 
D
D
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
C
P
 
P
G
 
G
I
x
Y
V
|
V
E
 
D
G
x
T
P
 
P
R
 
L
M
 
V
D
 
R
G
 
G
V
x
Q
I
 
I
R
 
A
A
 
D
R
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
T
V
 
R
G
 
N
V
 
V
P
 
S
-
 
L
E
 
D
A
 
S
E
 
A
M
 
L
R
 
E
Q
 
D
E
 
V
Y
 
I
L
 
L
N
 
A
K
 
M
I
 
V
S
 
P
L
 
Q
K
 
K
R
 
R
M
 
L
V
 
L
T
 
S
A
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
D
M
 
Y
A
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
S
A
 
K
A
 
A
R
 
G
N
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
S
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G

2ae2A Tropinone reductase-ii complexed with NADP+ and pseudotropine (see paper)
33% identity, 94% coverage: 12:257/262 of query aligns to 8:251/259 of 2ae2A

query
sites
2ae2A
G
 
G
L
 
C
R
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
Y
V
 
G
L
 
I
A
 
V
A
 
E
A
 
E
Y
 
L
L
 
A
E
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
V
 
V
H
 
Y
V
 
T
C
 
C
D
x
S
V
x
R
S
 
N
E
 
Q
S
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
D
A
 
C
L
 
L
A
 
T
V
 
Q
F
 
W
R
 
R
D
 
S
K
 
K
Y
 
G
P
 
F
G
 
K
T
 
V
V
 
E
A
 
A
T
 
S
R
 
V
A
x
C
D
 
D
V
x
L
S
 
S
D
 
S
A
 
R
A
 
S
Q
 
E
I
 
R
E
 
Q
A
 
E
V
 
L
F
 
M
K
 
N
V
 
T
Q
 
V
R
 
A
E
 
N
H
 
H
L
 
F
-
 
H
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
V
G
 
I
P
 
Y
T
 
K
G
 
E
G
 
A
I
 
K
D
 
D
A
 
Y
I
 
T
S
 
V
D
 
E
A
 
-
E
 
D
W
 
Y
Q
 
S
A
 
L
T
 
I
I
 
M
N
 
S
I
|
I
N
 
N
L
 
F
T
 
E
A
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
R
 
H
F
 
L
A
 
S
H
 
V
H
 
L
A
 
A
V
 
H
P
 
P
M
 
F
L
 
L
K
 
K
E
 
A
S
 
S
S
 
E
H
 
R
G
 
G
H
 
N
L
 
V
L
 
V
H
 
F
I
|
I
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
S
G
 
G
R
 
A
L
 
L
G
 
A
Y
 
V
A
 
P
W
 
Y
R
x
E
T
 
A
P
 
V
Y
|
Y
A
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
W
 
G
A
 
A
I
 
M
V
 
D
G
 
Q
L
 
L
M
 
T
K
 
R
S
 
C
L
 
L
A
 
A
S
 
F
E
 
E
L
 
W
G
 
A
E
 
K
S
 
D
D
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
V
L
 
G
P
|
P
G
|
G
I
x
V
V
x
I
E
 
A
G
x
T
P
x
S
R
x
L
M
x
V
D
 
E
G
 
M
V
 
T
I
 
I
R
 
Q
A
 
D
R
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
A
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
Q
Q
 
K
E
 
E
Y
 
N
L
 
L
N
 
N
K
 
K
I
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
C
S
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
M
 
M
V
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
K
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
F
P
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
S
N
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
I
I
 
I
S
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G

1ipfA Tropinone reductase-ii complexed with NADPH and tropinone (see paper)
33% identity, 94% coverage: 12:257/262 of query aligns to 8:251/259 of 1ipfA

query
sites
1ipfA
G
 
G
L
 
C
R
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
Y
V
 
G
L
 
I
A
 
V
A
 
E
A
 
E
Y
 
L
L
 
A
E
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
V
 
V
H
 
Y
V
 
T
C
 
C
D
x
S
V
x
R
S
 
N
E
 
Q
S
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
D
A
 
C
L
 
L
A
 
T
V
 
Q
F
 
W
R
 
R
D
 
S
K
 
K
Y
 
G
P
 
F
G
 
K
T
 
V
V
 
E
A
 
A
T
 
S
R
 
V
A
x
C
D
|
D
V
x
L
S
 
S
D
 
S
A
 
R
A
 
S
Q
 
E
I
 
R
E
 
Q
A
 
E
V
 
L
F
 
M
K
 
N
V
 
T
Q
 
V
R
 
A
E
 
N
H
 
H
L
 
F
-
 
H
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
V
G
 
I
P
 
Y
T
 
K
G
 
E
G
 
A
I
 
K
D
 
D
A
 
Y
I
 
T
S
 
V
D
 
E
A
 
-
E
 
D
W
 
Y
Q
 
S
A
 
L
T
 
I
I
 
M
N
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
F
T
 
E
A
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
R
 
H
F
 
L
A
 
S
H
 
V
H
 
L
A
 
A
V
 
H
P
 
P
M
 
F
L
 
L
K
 
K
E
 
A
S
 
S
S
 
E
H
 
R
G
 
G
H
 
N
L
 
V
L
 
V
H
 
F
I
 
I
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
x
S
G
 
G
R
 
A
L
 
L
G
 
A
Y
 
V
A
 
P
W
 
Y
R
x
E
T
 
A
P
 
V
Y
|
Y
A
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
W
 
G
A
 
A
I
 
M
V
 
D
G
 
Q
L
 
L
M
 
T
K
 
R
S
 
C
L
 
L
A
 
A
S
 
F
E
 
E
L
 
W
G
 
A
E
 
K
S
 
D
D
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
V
L
 
G
P
|
P
G
 
G
I
x
V
V
x
I
E
 
A
G
x
T
P
x
S
R
x
L
M
x
V
D
 
E
G
 
M
V
 
T
I
 
I
R
 
Q
A
 
D
R
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
A
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
Q
Q
 
K
E
 
E
Y
 
N
L
 
L
N
 
N
K
 
K
I
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
C
S
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
M
 
M
V
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
K
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
F
P
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
S
N
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
I
I
 
I
S
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G

1ipeA Tropinone reductase-ii complexed with NADPH (see paper)
33% identity, 94% coverage: 12:257/262 of query aligns to 8:251/259 of 1ipeA

query
sites
1ipeA
G
 
G
L
 
C
R
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
Y
V
 
G
L
 
I
A
 
V
A
 
E
A
 
E
Y
 
L
L
 
A
E
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
V
 
V
H
 
Y
V
 
T
C
 
C
D
x
S
V
x
R
S
 
N
E
 
Q
S
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
D
A
 
C
L
 
L
A
 
T
V
 
Q
F
 
W
R
 
R
D
 
S
K
 
K
Y
 
G
P
 
F
G
 
K
T
 
V
V
 
E
A
 
A
T
 
S
R
 
V
A
x
C
D
|
D
V
x
L
S
 
S
D
 
S
A
 
R
A
 
S
Q
 
E
I
 
R
E
 
Q
A
 
E
V
 
L
F
 
M
K
 
N
V
 
T
Q
 
V
R
 
A
E
 
N
H
 
H
L
 
F
-
 
H
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
V
G
 
I
P
 
Y
T
 
K
G
 
E
G
 
A
I
 
K
D
 
D
A
 
Y
I
 
T
S
 
V
D
 
E
A
 
-
E
 
D
W
 
Y
Q
 
S
A
 
L
T
 
I
I
 
M
N
 
S
I
|
I
N
 
N
L
 
F
T
 
E
A
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
R
 
H
F
 
L
A
 
S
H
 
V
H
 
L
A
 
A
V
 
H
P
 
P
M
 
F
L
 
L
K
 
K
E
 
A
S
 
S
S
 
E
H
 
R
G
 
G
H
 
N
L
 
V
L
 
V
H
 
F
I
 
I
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
S
G
 
G
R
 
A
L
 
L
G
 
A
Y
 
V
A
 
P
W
 
Y
R
 
E
T
 
A
P
 
V
Y
|
Y
A
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
W
 
G
A
 
A
I
 
M
V
 
D
G
 
Q
L
 
L
M
 
T
K
 
R
S
 
C
L
 
L
A
 
A
S
 
F
E
 
E
L
 
W
G
 
A
E
 
K
S
 
D
D
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
V
L
 
G
P
|
P
G
 
G
I
 
V
V
x
I
E
 
A
G
x
T
P
x
S
R
x
L
M
x
V
D
 
E
G
 
M
V
 
T
I
 
I
R
 
Q
A
 
D
R
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
A
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
Q
Q
 
K
E
 
E
Y
 
N
L
 
L
N
 
N
K
 
K
I
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
C
S
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
M
 
M
V
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
K
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
F
P
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
S
N
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
I
I
 
I
S
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G

P50163 Tropinone reductase 2; Tropinone reductase II; TR-II; EC 1.1.1.236 from Datura stramonium (Jimsonweed) (Common thornapple) (see paper)
33% identity, 94% coverage: 12:257/262 of query aligns to 9:252/260 of P50163

query
sites
P50163
G
 
G
L
 
C
R
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
G
 
G
G
 
G
A
x
S
A
x
R
G
|
G
I
|
I
G
|
G
E
x
Y
V
x
G
L
x
I
A
x
V
A
x
E
A
x
E
Y
x
L
L
x
A
E
x
S
A
x
L
G
|
G
A
|
A
Q
x
S
V
|
V
H
x
Y
V
x
T
C
|
C
D
x
S
V
x
R
S
 
N
E
 
Q
S
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
D
A
 
C
L
 
L
A
 
T
V
 
Q
F
 
W
R
 
R
D
 
S
K
 
K
Y
 
G
P
 
F
G
 
K
T
 
V
V
 
E
A
 
A
T
 
S
R
 
V
A
 
C
D
 
D
V
 
L
S
 
S
D
 
S
A
 
R
A
 
S
Q
 
E
I
 
R
E
 
Q
A
 
E
V
 
L
F
 
M
K
 
N
V
 
T
Q
 
V
R
 
A
E
 
N
H
 
H
L
 
F
-
 
H
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
V
G
 
I
P
 
Y
T
 
K
G
 
E
G
 
A
I
 
K
D
 
D
A
 
Y
I
 
T
S
 
V
D
 
E
A
 
-
E
 
D
W
 
Y
Q
 
S
A
 
L
T
 
I
I
 
M
N
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
F
T
 
E
A
 
A
Q
 
A
Y
 
Y
R
 
H
F
 
L
A
 
S
H
 
V
H
 
L
A
 
A
V
 
H
P
 
P
M
 
F
L
 
L
K
 
K
E
 
A
S
 
S
S
 
E
H
 
R
G
 
G
H
 
N
L
 
V
L
 
V
H
 
F
I
 
I
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
S
G
 
G
R
 
A
L
 
L
G
 
A
Y
 
V
A
 
P
W
 
Y
R
 
E
T
 
A
P
 
V
Y
 
Y
A
 
G
A
 
A
T
 
T
K
 
K
W
 
G
A
 
A
I
 
M
V
 
D
G
 
Q
L
 
L
M
 
T
K
 
R
S
 
C
L
 
L
A
 
A
S
 
F
E
 
E
L
 
W
G
 
A
E
 
K
S
 
D
D
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
L
 
V
L
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
V
V
x
I
E
x
A
G
x
T
P
x
S
R
x
L
M
 
V
D
 
E
G
 
M
V
 
T
I
 
I
R
 
Q
A
 
D
R
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
A
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
Q
Q
 
K
E
 
E
Y
 
N
L
 
L
N
 
N
K
 
K
I
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
C
S
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
M
 
M
V
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
K
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
M
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
F
P
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
S
N
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
I
I
 
I
S
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G

6qheA Alcohol dehydrogenase from arthrobacter sp. Ts-15 in complex with NAD+
34% identity, 92% coverage: 16:257/262 of query aligns to 11:252/261 of 6qheA

query
sites
6qheA
L
 
I
I
 
V
S
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
A
x
M
G
|
G
I
x
M
G
 
G
E
 
N
V
 
G
L
 
C
A
 
A
A
 
R
A
 
K
Y
 
L
L
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
H
 
Y
V
 
L
C
 
I
D
|
D
V
x
R
S
 
S
E
 
N
S
 
L
A
 
V
L
 
A
A
 
A
V
 
A
F
 
A
R
 
Q
D
 
D
-
 
M
K
 
R
Y
 
E
P
 
A
G
 
G
T
 
L
V
 
N
A
 
A
T
 
N
-
 
H
-
 
V
R
 
Q
A
 
V
D
|
D
V
x
I
S
 
T
D
 
D
A
 
Q
A
 
E
Q
 
S
I
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
A
F
 
Y
K
 
D
V
 
G
Q
 
I
R
 
A
E
 
A
H
 
E
L
 
S
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
A
 
G
G
 
D
P
 
S
T
 
R
G
 
M
G
 
F
I
 
L
D
 
D
A
 
-
I
 
V
S
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
H
W
 
Y
Q
 
K
A
 
K
T
 
V
I
 
I
N
 
D
I
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
A
 
G
Q
 
T
Y
 
W
R
 
N
F
 
S
A
 
C
H
 
R
H
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
P
M
 
H
L
 
M
K
 
L
E
 
S
S
 
N
S
 
K
H
 
H
G
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
I
H
 
N
I
 
F
A
 
G
S
|
S
V
 
I
A
 
S
G
 
G
R
 
P
L
 
I
-
 
V
-
 
A
G
 
D
Y
 
P
A
 
G
W
 
W
R
 
-
T
 
T
P
 
V
Y
|
Y
A
 
A
A
 
L
T
 
S
K
|
K
W
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
F
G
 
G
L
 
F
M
 
T
K
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
F
G
 
A
E
 
G
S
 
Q
D
 
N
I
 
I
R
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
L
 
L
P
|
P
G
|
G
I
 
S
V
x
M
E
 
D
G
x
T
P
|
P
R
x
M
M
 
M
D
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
-
R
 
R
A
 
A
R
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
D
V
 
T
G
 
N
V
 
P
P
 
A
E
 
D
A
 
P
E
 
Q
-
 
S
M
 
V
R
 
I
Q
 
D
E
 
E
Y
 
I
L
 
A
N
 
A
K
 
A
I
 
V
S
 
P
L
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
L
V
 
G
T
 
T
A
 
I
E
 
D
D
 
D
V
 
A
A
 
G
A
 
N
M
 
L
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
L
A
 
A
R
 
S
N
 
Y
V
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
S
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
G

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
31% identity, 92% coverage: 16:257/262 of query aligns to 8:240/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
L
I
 
I
S
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
A
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
E
 
K
V
 
Q
L
 
T
A
 
A
A
 
L
A
 
R
Y
 
F
L
 
A
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
V
V
 
I
C
 
N
D
|
D
V
x
I
S
 
D
E
 
A
S
 
E
A
 
K
L
 
V
A
 
R
V
 
A
F
 
T
R
 
V
D
 
D
K
 
E
Y
 
F
P
 
S
G
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
H
-
 
R
T
 
V
V
 
L
A
 
G
T
 
A
R
 
V
A
 
A
D
 
D
V
x
I
S
 
G
D
 
N
A
 
K
A
 
A
Q
 
A
I
 
V
E
 
D
A
 
G
V
 
M
F
 
V
K
 
K
V
 
Q
Q
 
T
R
 
I
E
 
D
H
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
A
 
E
G
 
-
P
 
R
T
 
A
G
 
G
G
 
A
I
 
L
D
 
R
A
 
K
I
 
L
S
 
S
D
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
A
 
G
Q
 
T
Y
 
F
R
 
L
F
 
C
A
 
T
H
 
Q
H
 
A
A
 
V
V
 
H
P
 
G
M
 
H
L
 
M
K
 
V
E
 
E
S
 
N
S
 
K
H
 
H
G
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
V
H
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
V
 
R
A
 
A
G
 
-
R
 
W
L
 
L
G
 
G
Y
 
G
A
 
A
W
 
G
R
 
Q
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
T
 
A
K
|
K
W
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
M
M
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
E
 
R
S
 
A
D
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
L
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
L
V
x
I
E
 
H
G
 
T
P
 
P
R
 
M
M
 
W
D
 
D
G
 
-
V
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
E
V
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
K
E
 
D
M
 
-
R
 
Q
Q
 
Q
E
 
F
Y
 
L
L
 
L
N
 
S
K
 
R
I
 
Q
S
 
P
L
 
T
K
 
G
R
 
K
M
 
L
V
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
M
 
T
A
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
D
A
 
S
R
 
G
N
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
V
I
 
L
S
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
31% identity, 92% coverage: 16:257/262 of query aligns to 9:241/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
L
I
 
I
S
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
A
A
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
E
 
K
V
 
Q
L
 
T
A
 
A
A
 
L
A
 
R
Y
 
F
L
 
A
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
H
 
V
V
 
I
C
 
N
D
|
D
V
 
I
S
 
D
E
 
A
S
 
E
A
 
K
L
 
V
A
 
R
V
 
A
F
 
T
R
 
V
D
 
D
K
 
E
Y
 
F
P
 
S
G
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
H
-
 
R
T
 
V
V
 
L
A
 
G
T
 
A
R
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
S
 
G
D
 
N
A
 
K
A
 
A
Q
 
A
I
 
V
E
 
D
A
 
G
V
 
M
F
 
V
K
 
K
V
 
Q
Q
 
T
R
 
I
E
 
D
H
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
E
G
 
-
P
 
R
T
 
A
G
 
G
G
 
A
I
 
L
D
 
R
A
 
K
I
 
L
S
 
S
D
 
E
A
 
A
E
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
A
 
G
Q
 
T
Y
 
F
R
 
L
F
 
C
A
 
T
H
 
Q
H
 
A
A
 
V
V
 
H
P
 
G
M
 
H
L
 
M
K
 
V
E
 
E
S
 
N
S
 
K
H
 
H
G
 
G
H
 
R
L
 
I
L
 
V
H
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
V
 
R
A
 
A
G
 
-
R
 
W
L
 
L
G
 
G
Y
 
G
A
 
A
W
 
G
R
 
Q
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
T
 
A
K
|
K
W
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
M
M
 
T
K
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
E
 
R
S
 
A
D
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
L
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
L
V
 
I
E
 
H
G
 
T
P
 
P
R
 
M
M
 
W
D
 
D
G
 
-
V
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
E
V
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
K
E
 
D
M
 
-
R
 
Q
Q
 
Q
E
 
F
Y
 
L
L
 
L
N
 
S
K
 
R
I
 
Q
S
 
P
L
 
T
K
 
G
R
 
K
M
 
L
V
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
D
D
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
M
 
T
A
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
D
A
 
S
R
 
G
N
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
V
I
 
L
S
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF1425 FitnessBrowser__WCS417:GFF1425
MSVLQRLQPYPGLRVLISGGAAGIGEVLAAAYLEAGAQVHVCDVSESALAVFRDKYPGTV
ATRADVSDAAQIEAVFKVQREHLGGLDVLVNNAGIAGPTGGIDAISDAEWQATININLTA
QYRFAHHAVPMLKESSHGHLLHIASVAGRLGYAWRTPYAATKWAIVGLMKSLASELGESD
IRVNALLPGIVEGPRMDGVIRARAEQVGVPEAEMRQEYLNKISLKRMVTAEDVAAMALFL
CSPAARNVTGQAISVDGNVEYL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory