SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1428 FitnessBrowser__WCS417:GFF1428 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 5 hits to proteins with known functional sites (download)

Q5EXK5 3-hydroxybenzoate transporter MhbT from Klebsiella oxytoca (see paper)
23% identity, 67% coverage: 15:307/440 of query aligns to 19:314/452 of Q5EXK5

query
sites
Q5EXK5
H
 
R
S
 
Q
W
 
W
V
 
R
S
 
V
L
 
I
L
 
I
V
 
C
C
 
C
W
 
F
M
 
L
I
 
V
W
 
V
I
 
M
L
 
L
N
 
D
A
 
G
Y
 
F
D
 
D
R
 
T
E
 
A
I
 
A
V
 
I
L
 
G
R
 
F
L
 
I
G
 
A
P
 
P
T
 
D
I
 
I
S
 
R
K
 
S
H
 
H
F
 
W
D
 
Q
L
 
L
S
 
T
A
 
A
D
 
G
Q
 
D
W
 
L
G
 
A
T
 
P
V
 
L
A
 
F
T
 
G
V
 
A
V
 
G
M
 
L
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
T
L
 
A
L
 
G
D
 
A
I
 
L
P
 
L
G
 
C
S
 
G
M
 
P
W
 
L
S
 
S
D
|
D
R
 
R
Y
 
F
G
 
G
G
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
R
 
R
A
 
K
R
 
R
F
 
V
Q
 
I
V
 
E
P
 
F
L
 
C
V
 
V
L
 
A
G
 
L
Y
 
F
T
 
G
A
 
L
I
 
F
S
 
S
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
A
F
 
F
K
 
A
A
 
P
L
 
-
S
 
-
G
 
-
N
 
D
L
 
L
A
 
Q
T
 
M
F
 
L
I
 
V
A
 
F
L
 
L
R
 
R
V
 
F
G
 
L
V
 
T
N
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
W
 
G
G
 
A
E
 
M
P
 
P
V
 
N
G
 
T
V
 
I
S
 
T
N
 
M
T
 
T
A
 
S
E
 
E
W
 
Y
W
 
L
P
 
P
V
 
A
E
 
R
R
 
R
R
 
R
G
 
G
F
 
A
A
 
L
L
 
V
G
 
T
A
 
L
H
 
M
H
 
F
T
 
C
G
 
G
Y
 
F
P
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
S
M
 
A
L
 
F
S
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
V
A
 
S
S
 
A
F
 
Q
V
 
L
I
 
V
T
 
P
V
 
L
F
 
I
G
 
G
E
 
-
E
 
-
N
 
-
W
 
W
R
 
H
Y
 
G
V
 
I
F
 
L
Y
 
V
F
 
L
A
 
G
F
 
G
V
 
V
V
 
L
A
 
P
L
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
L
I
 
P
F
 
E
W
 
S
A
 
P
R
 
R
Y
 
W
S
 
Q
T
 
I
A
 
R
E
 
R
R
 
Q
I
 
L
S
 
P
A
 
Q
L
 
A
Y
 
T
V
 
I
D
 
A
I
 
R
A
 
T
A
 
V
K
 
G
G
 
A
M
 
I
T
 
T
P
 
G
P
 
E
D
 
R
-
 
Y
-
 
N
-
 
D
-
 
T
-
 
H
-
 
F
-
 
W
-
 
L
N
 
D
A
 
E
P
 
P
A
 
A
S
 
A
S
 
G
V
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
S
A
 
I
W
 
S
R
 
Q
T
 
L
F
 
F
V
 
A
A
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
G
R
 
R
N
 
Q
I
 
L
A
 
A
L
 
I
T
 
T
A
 
-
G
 
-
N
 
-
T
 
L
M
 
M
L
 
L
T
 
W
Q
 
V
V
 
V
V
 
F
Y
 
F
M
 
M
G
 
S
V
 
L
N
 
L
I
 
I
V
 
I
-
 
Y
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
W
L
 
M
P
 
P
A
 
T
Y
 
-
L
 
L
Y
 
L
N
 
N
I
 
H
A
 
R
G
 
G
L
 
I
S
 
D
L
 
L
A
 
Q
E
 
H
S
 
A
A
 
S
G
 
W
M
 
V
S
 
T
V
 
A
V
 
A
F
 
F
T
 
Q
L
 
I
T
 
G
G
 
G
I
 
T
L
 
F
G
 
G
Q
 
A
L
 
L
V
 
L
W
 
L
P
 
G
S
x
V
L
 
L
S
 
M
D
|
D

P0AA76 D-galactonate transporter; D-galactonate/H(+) symporter from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
21% identity, 93% coverage: 14:423/440 of query aligns to 12:417/430 of P0AA76

query
sites
P0AA76
R
 
R
H
 
R
S
 
R
W
 
Y
V
 
L
S
 
T
L
 
L
L
 
V
V
 
M
C
 
I
W
 
F
M
 
I
I
 
T
W
 
V
I
 
V
L
 
I
N
 
C
A
x
Y
Y
 
V
D
|
D
R
|
R
E
 
A
I
 
N
V
 
L
L
 
A
R
 
V
L
 
A
G
 
S
P
 
A
T
 
H
I
 
I
S
 
Q
K
 
E
H
 
E
F
 
F
D
 
G
L
 
I
S
 
T
A
 
K
D
 
A
Q
 
E
W
 
M
G
 
G
T
 
Y
V
 
V
A
 
F
T
 
S
V
 
A
V
 
F
M
 
A
L
 
W
A
 
L
L
x
Y
A
 
T
L
 
L
L
 
C
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
G
 
G
S
 
G
M
 
W
W
 
F
S
 
L
D
 
D
R
 
R
Y
 
V
G
 
G
G
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
S
R
 
R
A
 
V
R
 
T
F
 
Y
Q
 
F
V
 
I
P
 
A
L
 
-
V
 
I
L
 
F
G
 
G
Y
 
W
T
 
S
A
 
V
I
 
A
S
 
T
F
 
L
L
 
F
S
 
Q
G
 
G
F
 
F
K
 
A
A
 
T
L
 
-
S
 
-
G
 
-
N
 
G
L
 
L
A
 
M
T
 
S
F
 
L
I
 
I
A
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
A
G
 
I
V
 
T
N
 
G
L
 
I
G
 
F
A
x
E
G
 
A
W
 
P
G
 
A
E
 
F
P
 
P
V
 
T
G
 
N
V
 
N
S
 
R
N
 
M
T
 
V
A
 
T
E
 
S
W
 
W
W
 
F
P
 
P
V
 
E
E
 
H
R
 
E
R
 
R
G
 
A
F
 
S
A
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
F
H
 
Y
H
 
T
T
 
S
G
 
G
Y
 
Q
P
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
L
M
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
A
I
 
F
V
 
L
A
 
T
S
 
P
F
 
L
V
 
L
I
 
I
T
 
W
V
 
I
F
 
Q
G
 
E
E
 
M
E
 
L
N
 
S
W
 
W
R
 
H
Y
 
W
V
 
V
F
 
F
Y
 
I
F
 
V
A
 
T
F
 
G
V
 
G
V
 
I
A
 
G
L
 
I
P
 
I
L
 
W
M
 
S
I
 
L
F
 
I
W
 
W
A
 
F
R
 
K
Y
 
V
S
 
Y
T
 
Q
A
 
P
E
 
P
R
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
G
I
 
I
S
 
S
A
 
K
L
 
A
Y
 
E
V
 
L
D
 
D
I
 
Y
A
 
I
A
 
R
K
 
D
G
 
G
M
 
G
T
 
G
P
 
L
P
 
V
D
 
D
-
 
G
N
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
-
S
 
-
S
 
-
V
 
V
K
 
K
G
 
K
E
 
E
A
 
A
W
 
R
R
 
Q
T
 
P
F
 
L
V
 
T
A
 
A
T
 
K
-
 
D
-
 
W
-
 
K
-
 
L
-
 
V
L
 
F
R
 
H
N
 
R
R
 
K
N
 
L
I
 
I
A
 
G
L
 
V
T
 
Y
A
 
L
G
 
G
N
 
Q
T
 
F
M
 
A
L
 
V
T
 
A
Q
 
S
V
 
T
V
 
L
Y
 
W
M
 
F
G
 
F
V
 
L
N
 
T
I
 
W
V
 
-
L
 
F
P
 
P
A
 
N
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
T
N
 
Q
I
 
E
A
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
K
S
 
A
A
 
G
G
 
F
M
 
M
S
 
T
V
 
T
V
 
V
F
 
P
T
 
F
L
 
L
T
 
A
G
 
A
I
 
F
L
 
V
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
V
 
L
W
 
S
P
 
G
S
 
W
L
 
V
S
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
L
G
 
V
R
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
A
R
 
R
T
 
K
T
 
T
L
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
G
 
G
L
 
L
W
 
L
M
 
I
A
 
S
A
 
T
S
 
C
V
 
I
-
 
M
G
 
G
A
 
A
F
 
N
Y
 
Y
F
 
T
A
 
N
N
 
D
T
 
P
L
 
M
T
 
M
L
 
I
I
 
M
V
 
C
V
 
L
V
 
M
Q
 
A
L
 
L
L
 
A
F
 
F
G
 
-
L
 
-
V
 
F
A
 
G
N
 
N
A
 
G
V
 
F
W
 
A
P
 
S
I
 
I
Y
 
T
Y
x
W
A
 
S
V
 
L
A
 
V
C
 
S
D
 
S
S
 
L
A
 
A
E
 
P
P
 
M
S
 
R
A
 
L
T
 
I
S
 
G
T
 
L
A
 
T
N
 
G
G
 
G
I
 
V
I
 
F
T
 
N
T
 
F
A
 
A
M
 
G
F
 
G
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
I
L
 
T
A
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
V
M
 
V
G
 
G
S
 
Y
L
 
L
I
 
-
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
G
 
-
G
 
-
W
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
H
 
Y
G
 
G
Y
 
F
T
 
A
V
 
P
C
 
A
F
 
L
F
 
V
V
 
Y
M
 
I
A
 
S
G
 
A
C
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L

6e9nA E. Coli d-galactonate:proton symporter in the inward open form (see paper)
21% identity, 93% coverage: 14:423/440 of query aligns to 1:398/409 of 6e9nA

query
sites
6e9nA
R
 
R
H
 
R
S
 
R
W
 
Y
V
 
L
S
 
T
L
 
L
L
 
V
V
 
M
C
 
I
W
 
F
M
 
I
I
 
T
W
 
V
I
 
V
L
 
I
N
 
C
A
 
Y
Y
 
V
D
 
D
R
 
R
E
 
A
I
 
N
V
 
L
L
 
A
R
 
V
L
 
A
G
 
S
P
 
A
T
 
H
I
 
I
S
 
Q
K
 
E
H
 
E
F
 
F
D
 
G
L
 
I
S
 
T
A
 
K
D
 
A
Q
 
E
W
 
M
G
 
G
T
 
Y
V
 
V
A
 
F
T
 
S
V
 
A
V
 
F
M
 
A
L
 
W
A
 
L
L
 
Y
A
 
T
L
 
L
L
 
C
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
G
 
G
S
 
G
M
 
W
W
 
F
S
 
L
D
 
D
R
 
R
Y
 
V
G
 
G
G
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
S
R
 
R
A
 
V
R
 
T
F
 
Y
Q
 
F
V
 
I
P
 
A
L
 
-
V
 
I
L
 
F
G
 
G
Y
 
W
T
 
S
A
 
V
I
 
A
S
 
T
F
 
L
L
 
F
S
 
Q
G
 
G
F
 
F
K
 
A
A
 
T
L
 
-
S
 
-
G
 
-
N
 
G
L
 
L
A
 
M
T
 
S
F
 
L
I
 
I
A
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
A
G
 
I
V
 
T
N
 
G
L
 
I
G
 
F
A
 
E
G
 
A
W
 
P
G
 
A
E
x
F
P
 
P
V
 
T
G
 
N
V
 
N
S
 
R
N
 
M
T
 
V
A
 
T
E
 
S
W
 
W
W
 
F
P
 
P
V
 
E
E
 
H
R
 
E
R
 
R
G
 
A
F
 
S
A
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
F
H
 
Y
H
 
T
T
 
S
G
 
G
Y
 
Q
P
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
L
M
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
A
I
 
F
V
 
L
A
 
T
S
 
P
F
 
L
V
 
L
I
 
I
T
 
W
V
 
I
F
 
Q
G
 
E
E
 
M
E
 
L
N
 
S
W
 
W
R
 
H
Y
 
W
V
 
V
F
 
F
Y
 
I
F
 
V
A
 
T
F
 
G
V
 
G
V
 
I
A
 
G
L
 
I
P
 
I
L
 
W
M
 
S
I
 
L
F
 
I
W
 
W
A
 
F
R
 
K
Y
 
V
S
 
Y
T
 
Q
A
 
P
E
 
P
R
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
G
I
 
I
S
 
S
A
 
K
L
 
A
Y
 
E
V
 
L
D
 
D
I
 
Y
A
 
I
A
 
R
K
 
D
G
 
G
M
 
G
T
 
G
P
 
L
P
 
V
D
 
D
-
 
G
N
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
T
S
 
A
V
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
K
A
 
D
W
 
W
R
 
K
T
 
L
F
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
V
L
 
F
R
 
H
N
 
R
R
 
K
N
 
L
I
 
I
A
 
G
L
 
V
T
 
Y
A
 
L
G
 
G
N
 
Q
T
 
F
M
 
A
L
 
V
T
 
A
Q
 
S
V
 
T
V
 
L
Y
 
W
M
 
F
G
 
F
V
 
L
N
 
T
I
 
W
V
 
-
L
 
F
P
 
P
A
 
N
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
T
N
 
Q
I
 
E
A
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
K
S
 
A
A
 
G
G
 
F
M
 
M
S
 
T
V
 
T
V
 
V
F
 
P
T
 
F
L
 
L
T
 
A
G
 
A
I
 
F
L
 
V
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
V
 
L
W
 
S
P
 
G
S
 
W
L
 
V
S
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
L
G
 
V
R
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
A
R
 
R
T
 
K
T
 
T
L
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
G
 
G
L
 
L
W
 
L
M
 
I
A
 
S
A
 
T
S
 
C
V
 
I
-
 
M
G
 
G
A
 
A
F
 
N
Y
 
Y
F
 
T
A
 
N
N
 
D
T
 
P
L
 
M
T
 
M
L
 
I
I
 
M
V
 
C
V
 
L
V
 
M
Q
 
A
L
 
L
L
 
A
F
 
F
G
 
-
L
 
-
V
 
F
A
 
G
N
 
N
A
 
G
V
 
F
W
 
A
P
 
S
I
 
I
Y
 
T
Y
 
W
A
 
S
V
 
L
A
 
V
C
 
S
D
 
S
S
 
L
A
 
A
E
 
P
P
 
M
S
 
R
A
 
L
T
 
I
S
 
G
T
 
L
A
 
T
N
 
G
G
 
G
I
 
V
I
 
F
T
x
N
T
 
F
A
 
A
M
 
G
F
 
G
I
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
I
L
 
T
A
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
V
M
 
V
G
 
G
S
 
Y
L
 
L
I
 
-
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
G
 
-
G
 
-
W
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
H
 
Y
G
 
G
Y
 
F
T
 
A
V
 
P
C
 
A
F
 
L
F
 
V
V
 
Y
M
 
I
A
 
S
G
 
A
C
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L

Q51955 4-hydroxybenzoate transporter PcaK from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 2 papers)
21% identity, 38% coverage: 10:177/440 of query aligns to 21:181/448 of Q51955

query
sites
Q51955
R
 
Q
S
 
P
I
 
L
H
 
S
R
 
R
H
 
Y
S
 
Q
W
 
W
V
 
R
S
 
V
L
 
V
L
 
L
V
 
L
C
 
C
W
 
F
M
 
L
I
 
I
W
 
V
I
 
F
L
 
L
N
x
D
A
 
G
Y
 
L
D
|
D
R
 
T
E
 
A
I
 
A
V
 
M
L
 
G
R
 
F
L
 
I
G
 
A
P
 
P
T
 
A
I
 
L
S
 
S
K
 
Q
H
 
E
F
 
W
D
 
G
L
 
I
S
 
D
A
 
R
D
 
A
Q
 
S
W
 
L
G
 
G
T
 
P
V
 
V
A
 
M
T
 
S
V
 
A
V
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
M
A
 
V
L
 
F
L
 
G
D
 
A
I
 
L
P
 
G
G
 
S
S
x
G
M
 
P
W
 
L
S
 
A
D
|
D
R
 
R
Y
 
F
G
|
G
G
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
R
 
R
A
 
K
R
 
G
F
 
V
Q
 
L
V
 
V
P
 
G
L
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
V
Y
 
F
T
 
G
A
 
G
I
 
F
S
 
S
F
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
A
F
 
Y
K
 
A
A
 
T
L
 
-
S
 
-
G
 
-
N
 
N
L
 
V
A
 
D
T
 
Q
F
 
L
I
 
L
A
 
V
L
 
L
R
|
R
V
 
F
G
 
L
V
 
T
N
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
W
 
A
G
 
G
E
 
M
P
 
P
V
 
N
G
 
A
V
 
T
S
 
T
N
 
L
T
 
L
A
 
S
E
|
E
W
 
Y
W
 
T
P
 
P
V
 
E
E
 
R
R
 
L
R
 
K
G
 
S
F
 
L
A
 
L
L
 
V
G
 
T
A
 
S
H
 
M
H
 
F
T
 
C
G
 
G
Y
 
F
P
 
N
I
 
L
G
 
G
A
 
M
M
 
A
L
 
G
S
 
G
G
 
G
I
 
F
V
 
I
A
 
S
S
 
A
F
 
K
V
 
M
I
 
I
T
 
P
V
 
A
F
 
Y
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P77589 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate transporter; 3HPP transporter; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate:H(+) symporter; 3HPP:H(+) symporter from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
24% identity, 86% coverage: 22:400/440 of query aligns to 19:368/403 of P77589

query
sites
P77589
V
 
L
C
 
C
W
 
F
M
 
L
I
 
V
W
 
A
I
 
L
L
 
M
N
x
E
A
 
G
Y
 
L
D
 
D
R
 
L
E
 
Q
I
 
A
V
 
A
L
 
G
R
 
I
L
 
A
G
 
A
P
 
G
T
 
G
I
 
I
S
 
A
K
 
Q
H
 
A
F
 
F
D
 
A
L
 
L
S
 
D
A
 
K
D
 
M
Q
 
Q
W
 
M
G
 
G
T
 
W
V
 
I
A
 
F
T
 
S
V
 
A
V
 
G
M
 
I
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
L
L
 
P
L
 
G
D
 
A
I
 
L
P
 
V
G
 
G
S
 
G
M
 
M
W
 
L
S
 
A
D
|
D
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
G
 
-
G
 
-
W
 
-
K
 
-
R
 
R
A
 
K
R
 
R
F
 
-
Q
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
I
V
 
L
L
 
I
G
 
G
Y
 
S
T
 
V
A
 
A
I
 
L
-
 
F
S
 
G
F
 
L
L
 
F
S
 
S
G
 
L
F
 
A
K
 
T
A
 
A
L
 
I
S
 
A
G
 
W
N
 
D
L
 
F
A
 
P
T
 
S
F
 
L
I
 
V
A
 
F
L
 
A
R
 
R
V
 
L
G
 
M
V
 
T
N
 
G
L
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
G
W
 
A
G
 
A
E
 
L
P
 
P
V
 
N
G
 
L
V
 
I
S
 
A
N
 
L
T
 
T
A
 
S
E
 
E
W
 
A
W
 
A
P
 
G
V
 
P
E
 
R
R
 
F
R
 
R
G
 
G
F
 
T
A
 
A
L
 
V
G
 
S
A
 
L
H
 
M
H
 
Y
T
 
C
G
 
G
Y
 
V
P
 
P
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
A
L
 
L
S
 
A
G
 
A
I
 
T
V
 
L
A
 
G
S
 
-
F
 
-
V
 
-
I
 
-
T
 
-
V
 
-
F
 
F
G
 
A
E
 
G
E
 
A
N
 
N
-
 
L
-
 
A
W
 
W
R
 
Q
Y
 
T
V
 
V
F
 
F
Y
 
W
F
 
V
A
 
G
F
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
P
L
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
V
P
 
P
L
 
L
M
 
L
I
 
M
F
 
R
W
 
W
A
 
L
R
 
P
Y
 
E
S
 
S
T
 
A
-
 
V
-
 
F
-
 
A
A
 
G
E
 
E
R
 
K
I
 
Q
S
 
S
A
 
A
L
 
P
Y
 
P
V
 
L
D
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
R
G
 
A
M
 
L
T
 
F
P
 
A
P
 
P
D
 
E
N
 
T
A
 
A
P
 
T
A
 
A
S
 
T
S
 
L
V
 
L
K
 
L
G
 
-
E
 
-
A
 
-
W
 
W
R
 
L
T
 
C
F
 
Y
V
 
F
A
 
F
T
 
T
L
 
L
R
 
L
N
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
M
 
M
G
 
L
V
 
I
N
 
N
I
 
W
V
 
-
L
 
L
P
 
P
A
 
L
Y
 
L
L
 
L
Y
 
V
N
 
E
I
 
-
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
S
 
Q
L
 
P
A
 
S
E
 
Q
S
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
V
S
 
M
V
 
F
V
 
A
F
 
L
T
 
Q
L
 
M
T
 
G
G
 
A
I
 
A
L
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
V
 
M
W
 
L
P
 
G
S
x
A
L
 
L
S
 
M
D
 
D
I
x
K
I
 
L
G
 
R
R
 
P
R
 
V
T
 
T
T
 
M
L
 
S
I
 
L
I
 
L
C
 
I
G
 
Y
L
 
S
W
 
G
M
 
M
A
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
L
G
 
L
A
 
A
F
 
L
Y
 
G
F
 
T
A
 
V
N
 
S
T
 
S
L
 
F
T
 
N
L
 
G
I
 
M
V
 
L
V
 
L
V
 
A
Q
 
G
L
 
F
L
 
V
F
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
F
A
 
A
N
 
T
A
 
G
V
 
G
W
 
Q
P
 
S
I
 
V
Y
 
L
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
A
 
A
C
 
P
D
 
L
S
 
F
A
 
Y
E
 
S
P
 
S
S
 
Q
A
 
I
T
 
R
S
 
A
T
 
T
A
 
G
N
 
V
G
 
G
I
 
T
I
 
A
T
 
V
T
 
A
A
 
V
M
 
G
F
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
M
L
 
S
A
 
G
P
 
P
V
 
L
L
 
L
M
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
M
I
 
L
A
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
T
G
 
G

Query Sequence

>GFF1428 FitnessBrowser__WCS417:GFF1428
MATIKKASLRSIHRHSWVSLLVCWMIWILNAYDREIVLRLGPTISKHFDLSADQWGTVAT
VVMLALALLDIPGSMWSDRYGGGWKRARFQVPLVLGYTAISFLSGFKALSGNLATFIALR
VGVNLGAGWGEPVGVSNTAEWWPVERRGFALGAHHTGYPIGAMLSGIVASFVITVFGEEN
WRYVFYFAFVVALPLMIFWARYSTAERISALYVDIAAKGMTPPDNAPASSVKGEAWRTFV
ATLRNRNIALTAGNTMLTQVVYMGVNIVLPAYLYNIAGLSLAESAGMSVVFTLTGILGQL
VWPSLSDIIGRRTTLIICGLWMAASVGAFYFANTLTLIVVVQLLFGLVANAVWPIYYAVA
CDSAEPSATSTANGIITTAMFIGGGLAPVLMGSLIAMGGGWTTLHGYTVCFFVMAGCALG
GALLQLFSHRPQALVVQLDS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory