SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF179 FitnessBrowser__WCS417:GFF179 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1sffA Structure of gamma-aminobutyrate aminotransferase complex with aminooxyacetate (see paper)
74% identity, 99% coverage: 3:424/425 of query aligns to 1:422/425 of 1sffA

query
sites
1sffA
K
 
N
T
 
S
N
 
N
A
 
K
S
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
R
 
R
E
 
S
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
H
 
H
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
A
E
 
D
S
 
R
A
 
A
K
 
E
N
 
N
A
 
C
T
 
R
V
 
V
T
 
W
D
 
D
V
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
E
F
 
Y
I
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
N
T
 
T
G
 
G
H
 
H
V
 
L
H
 
H
P
 
P
K
 
K
I
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
E
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
N
 
K
K
 
K
L
 
L
T
 
S
H
 
H
T
 
T
C
 
C
F
 
F
Q
|
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
V
 
L
E
 
E
L
 
L
C
 
C
E
 
E
K
 
I
I
 
M
N
 
N
A
 
Q
K
 
K
V
 
V
P
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
|
T
G
|
G
S
|
S
E
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
K
R
 
R
A
 
S
G
 
G
V
 
T
I
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
R
|
R
T
 
T
M
 
H
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
V
V
x
N
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
L
 
L
M
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
H
V
 
V
F
 
Y
R
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
N
 
C
E
 
P
L
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
D
 
E
D
 
D
D
 
D
A
 
A
I
|
I
A
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
H
R
 
R
I
 
I
F
 
F
K
 
K
N
 
N
D
 
D
A
 
A
E
 
A
P
 
P
R
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
I
 
V
I
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
V
 
A
A
 
S
P
 
S
K
 
P
S
 
A
F
 
F
M
 
M
K
 
Q
R
|
R
L
 
L
R
 
R
E
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
D
K
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
M
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
T
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
L
F
 
F
A
 
A
M
 
M
E
 
E
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
P
D
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
|
K
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
V
C
 
T
G
 
G
K
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
M
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
S
 
N
P
 
P
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
K
V
 
V
F
 
F
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
H
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
R
 
K
C
 
A
K
 
N
A
 
D
V
 
L
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
V
 
K
T
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
L
A
 
A
I
 
I
Q
 
A
A
 
E
K
 
K
Y
 
H
P
 
P
V
 
E
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
H
H
 
N
K
 
K
P
 
P
N
 
D
A
 
A
A
 
K
A
 
L
V
 
T
A
 
A
S
 
E
V
 
I
V
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
R
 
R
E
 
D
K
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
S
C
 
C
G
 
G
T
 
P
Y
 
Y
G
x
Y
N
 
N
V
 
V
L
 
L
R
|
R
V
 
I
L
 
L
V
 
V
P
 
P
L
 
L
T
 
T
S
 
I
P
 
E
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
I
D
 
R
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
S
E
 
Q
C
 
C
F
 
F
S
 
D
E
 
E

1sf2A Structure of e. Coli gamma-aminobutyrate aminotransferase (see paper)
74% identity, 99% coverage: 3:424/425 of query aligns to 1:422/425 of 1sf2A

query
sites
1sf2A
K
 
N
T
 
S
N
 
N
A
 
K
S
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
R
 
R
E
 
S
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
H
 
H
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
A
E
 
D
S
 
R
A
 
A
K
 
E
N
 
N
A
 
C
T
 
R
V
 
V
T
 
W
D
 
D
V
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
E
F
 
Y
I
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
N
T
 
T
G
 
G
H
 
H
V
 
L
H
 
H
P
 
P
K
 
K
I
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
E
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
N
 
K
K
 
K
L
 
L
T
 
S
H
 
H
T
 
T
C
 
C
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
V
 
L
E
 
E
L
 
L
C
 
C
E
 
E
K
 
I
I
 
M
N
 
N
A
 
Q
K
 
K
V
 
V
P
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
|
T
G
|
G
S
|
S
E
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
K
R
 
R
A
 
S
G
 
G
V
 
T
I
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
R
 
R
T
 
T
M
 
H
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
x
N
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
L
 
L
M
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
H
V
 
V
F
 
Y
R
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
N
 
C
E
 
P
L
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
D
 
E
D
 
D
D
 
D
A
 
A
I
|
I
A
 
A
S
 
S
I
 
I
E
x
H
R
 
R
I
 
I
F
 
F
K
 
K
N
 
N
D
 
D
A
 
A
E
 
A
P
 
P
R
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
I
 
V
I
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
V
 
A
A
 
S
P
 
S
K
 
P
S
 
A
F
 
F
M
 
M
K
 
Q
R
|
R
L
 
L
R
 
R
E
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
D
K
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
M
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
T
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
L
F
 
F
A
 
A
M
 
M
E
 
E
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
P
D
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
|
K
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
V
C
 
T
G
 
G
K
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
M
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
S
 
N
P
 
P
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
K
V
 
V
F
 
F
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
H
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
R
 
K
C
 
A
K
 
N
A
 
D
V
 
L
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
V
 
K
T
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
L
A
 
A
I
 
I
Q
 
A
A
 
E
K
 
K
Y
 
H
P
 
P
V
 
E
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
H
H
 
N
K
 
K
P
 
P
N
 
D
A
 
A
A
 
K
A
 
L
V
 
T
A
 
A
S
 
E
V
 
I
V
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
R
 
R
E
 
D
K
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
S
C
 
C
G
 
G
T
 
P
Y
 
Y
G
x
Y
N
 
N
V
 
V
L
 
L
R
|
R
V
 
I
L
 
L
V
 
V
P
 
P
L
 
L
T
 
T
S
 
I
P
 
E
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
I
D
 
R
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
S
E
 
Q
C
 
C
F
 
F
S
 
D
E
 
E

P22256 4-aminobutyrate aminotransferase GabT; 5-aminovalerate transaminase; GABA aminotransferase; GABA-AT; Gamma-amino-N-butyrate transaminase; GABA transaminase; Glutamate:succinic semialdehyde transaminase; L-AIBAT; EC 2.6.1.19; EC 2.6.1.48 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
74% identity, 99% coverage: 3:424/425 of query aligns to 2:423/426 of P22256

query
sites
P22256
K
 
N
T
 
S
N
 
N
A
 
K
S
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
R
 
R
E
 
S
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
H
 
H
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
A
E
 
D
S
 
R
A
 
A
K
 
E
N
 
N
A
 
C
T
 
R
V
 
V
T
 
W
D
 
D
V
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
E
F
 
Y
I
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
|
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
N
T
 
T
G
 
G
H
 
H
V
 
L
H
 
H
P
 
P
K
 
K
I
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
E
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
N
 
K
K
 
K
L
 
L
T
 
S
H
 
H
T
 
T
C
 
C
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
V
 
L
E
 
E
L
 
L
C
 
C
E
 
E
K
 
I
I
 
M
N
 
N
A
 
Q
K
 
K
V
 
V
P
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
 
T
G
|
G
S
|
S
E
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
K
R
 
R
A
 
S
G
 
G
V
 
T
I
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
H
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
N
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
L
 
L
M
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
H
V
 
V
F
 
Y
R
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
N
 
C
E
 
P
L
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
D
 
E
D
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
H
R
 
R
I
 
I
F
 
F
K
 
K
N
 
N
D
 
D
A
 
A
E
 
A
P
 
P
R
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
I
 
V
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
V
 
A
A
 
S
P
 
S
K
 
P
S
 
A
F
 
F
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
D
K
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
M
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
T
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
L
F
 
F
A
 
A
M
 
M
E
 
E
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
P
D
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
|
K
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
V
C
 
T
G
 
G
K
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
M
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
S
 
N
P
 
P
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
K
V
 
V
F
 
F
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
H
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
R
 
K
C
 
A
K
 
N
A
 
D
V
 
L
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
V
 
K
T
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
L
A
 
A
I
 
I
Q
 
A
A
 
E
K
 
K
Y
 
H
P
 
P
V
 
E
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
H
H
 
N
K
 
K
P
 
P
N
 
D
A
 
A
A
 
K
A
 
L
V
 
T
A
 
A
S
 
E
V
 
I
V
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
R
 
R
E
 
D
K
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
S
C
 
C
G
 
G
T
 
P
Y
 
Y
G
 
Y
N
 
N
V
 
V
L
 
L
R
 
R
V
 
I
L
 
L
V
 
V
P
 
P
L
 
L
T
 
T
S
 
I
P
 
E
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
I
D
 
R
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
S
E
 
Q
C
 
C
F
 
F
S
 
D
E
 
E

1szkA The structure of gamma-aminobutyrate aminotransferase mutant: e211s (see paper)
73% identity, 99% coverage: 3:424/425 of query aligns to 1:422/425 of 1szkA

query
sites
1szkA
K
 
N
T
 
S
N
 
N
A
 
K
S
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
R
 
R
E
 
S
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
H
 
H
P
 
P
I
 
I
F
 
F
A
 
A
E
 
D
S
 
R
A
 
A
K
 
E
N
 
N
A
 
C
T
 
R
V
 
V
T
 
W
D
 
D
V
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
E
F
 
Y
I
 
L
D
 
D
F
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
N
T
 
T
G
 
G
H
 
H
V
 
L
H
 
H
P
 
P
K
 
K
I
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
E
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
N
 
K
K
 
K
L
 
L
T
 
S
H
 
H
T
 
T
C
 
C
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
V
 
L
E
 
E
L
 
L
C
 
C
E
 
E
K
 
I
I
 
M
N
 
N
A
 
Q
K
 
K
V
 
V
P
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
F
A
 
A
K
 
K
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
T
|
T
G
|
G
S
|
S
E
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
K
R
 
R
A
 
S
G
 
G
V
 
T
I
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
R
 
R
T
 
T
M
 
H
M
 
Y
T
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
N
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
L
 
L
M
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
H
V
 
V
F
 
Y
R
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
N
 
C
E
 
P
L
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
D
 
E
D
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
H
R
 
R
I
 
I
F
 
F
K
 
K
N
 
N
D
 
D
A
 
A
E
 
A
P
 
P
R
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
I
 
V
I
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
V
 
A
A
 
S
P
 
S
K
 
P
S
 
A
F
 
F
M
 
M
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
D
K
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
M
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
T
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
T
F
 
L
F
 
F
A
 
A
M
 
M
E
 
E
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
P
D
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
|
K
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
V
C
 
T
G
 
G
K
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
V
M
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
S
 
N
P
 
P
I
 
I
A
 
A
C
 
C
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
K
V
 
V
F
 
F
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
H
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
R
 
K
C
 
A
K
 
N
A
 
D
V
 
L
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
V
 
K
T
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
L
A
 
A
I
 
I
Q
 
A
A
 
E
K
 
K
Y
 
H
P
 
P
V
 
E
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
F
D
 
E
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
H
H
 
N
K
 
K
P
 
P
N
 
D
A
 
A
A
 
K
A
 
L
V
 
T
A
 
A
S
 
E
V
 
I
V
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
R
 
R
E
 
D
K
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
S
 
S
C
 
C
G
 
G
T
 
P
Y
 
Y
G
 
Y
N
 
N
V
 
V
L
 
L
R
|
R
V
 
I
L
 
L
V
 
V
P
 
P
L
 
L
T
 
T
S
 
I
P
 
E
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
I
D
 
R
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
S
E
 
Q
C
 
C
F
 
F
S
 
D
E
 
E

P50457 4-aminobutyrate aminotransferase PuuE; GABA aminotransferase; GABA-AT; Gamma-amino-N-butyrate transaminase; GABA transaminase; Glutamate:succinic semialdehyde transaminase; EC 2.6.1.19 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
55% identity, 99% coverage: 4:424/425 of query aligns to 2:421/421 of P50457

query
sites
P50457
T
 
S
N
 
N
A
 
N
S
 
E
L
 
F
M
 
H
K
 
Q
R
 
R
R
 
R
E
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Q
 
V
I
 
M
H
 
C
P
 
N
I
 
F
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
S
 
S
A
 
A
K
 
E
N
 
N
A
 
A
T
 
T
V
 
L
T
 
K
D
 
D
V
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
N
E
 
E
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
A
G
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
N
T
 
T
G
 
G
H
 
H
V
 
R
H
 
H
P
 
P
K
 
D
I
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
E
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
N
 
Q
K
 
Q
L
 
F
T
 
T
H
 
H
T
 
T
C
 
A
F
 
Y
Q
 
Q
V
 
I
L
 
V
A
 
P
Y
 
Y
E
 
E
P
 
S
Y
 
Y
V
 
V
E
 
T
L
 
L
C
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
I
N
 
N
A
 
A
K
 
L
V
 
A
P
 
P
G
 
V
D
 
S
F
 
G
A
 
Q
K
 
A
K
 
K
T
 
T
L
 
A
L
 
F
V
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
P
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
S
G
 
G
A
 
G
Y
 
F
H
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
Y
M
 
M
T
 
T
L
 
M
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
P
 
P
Y
 
Y
S
 
K
A
 
I
G
 
G
M
 
F
G
 
G
L
 
P
M
 
F
P
 
P
G
 
G
G
 
S
V
 
V
F
 
Y
R
 
H
A
 
V
L
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
S
E
 
D
L
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
D
 
T
D
 
Q
D
 
D
A
 
S
I
 
L
A
 
D
S
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
R
I
 
L
F
 
F
K
 
K
N
 
S
D
 
D
A
 
I
E
 
E
P
 
A
R
 
K
D
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
F
E
 
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Y
 
N
V
 
V
A
 
A
P
 
P
K
 
K
S
 
E
F
 
L
M
 
V
K
 
A
R
 
A
L
 
I
R
 
R
E
 
R
L
 
L
C
 
C
D
 
D
K
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
V
L
 
M
I
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
A
 
F
G
 
A
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
F
 
L
F
 
F
A
 
A
M
 
M
E
 
D
Q
 
H
M
 
Y
G
 
A
V
 
D
A
 
K
A
 
P
D
 
D
L
 
L
T
 
M
T
 
T
F
 
M
A
 
A
K
|
K
S
 
S
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
M
P
 
P
L
 
L
A
 
S
G
 
G
V
 
V
C
 
V
G
 
G
K
 
N
A
 
A
E
 
N
Y
 
I
M
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
P
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
S
 
N
P
 
P
I
 
L
A
 
A
C
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
H
A
 
A
V
 
V
M
 
L
E
 
N
V
 
I
F
 
I
E
 
D
E
 
K
E
 
E
H
 
S
L
 
L
L
 
C
D
 
E
R
 
R
C
 
A
K
 
N
A
 
Q
V
 
L
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
V
 
K
T
 
N
G
 
T
L
 
L
K
 
I
A
 
D
I
 
A
Q
 
K
A
 
E
K
 
S
Y
 
V
P
 
P
V
 
A
I
 
I
G
 
A
E
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
S
M
 
M
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
-
F
 
F
D
 
N
D
 
D
G
 
P
D
 
Q
T
 
T
H
 
G
K
 
E
P
 
P
N
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
I
V
 
A
A
 
Q
S
 
K
V
 
I
V
 
Q
A
 
Q
K
 
R
A
 
A
R
 
L
E
 
A
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
T
C
 
C
G
 
G
T
 
A
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
F
L
 
L
V
 
Y
P
 
P
L
 
L
T
 
T
S
 
I
P
 
P
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
F
D
 
D
K
 
A
G
 
A
L
 
M
A
 
K
I
 
I
I
 
L
E
 
Q
E
 
D
C
 
A
F
 
L
S
 
S
E
 
D

3q8nC Crystal structure of 4-aminobutyrate transaminase from mycobacterium smegmatis (see paper)
46% identity, 98% coverage: 8:425/425 of query aligns to 20:438/439 of 3q8nC

query
sites
3q8nC
L
 
L
M
 
Q
K
 
A
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
V
 
V
P
 
A
R
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Q
 
V
I
 
T
H
 
L
P
 
P
I
 
V
F
 
Y
A
 
V
E
 
V
S
 
A
A
 
A
K
 
G
N
 
G
A
 
G
T
 
V
V
 
L
T
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
D
G
 
G
R
 
N
E
 
Q
F
 
L
I
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
G
G
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
T
N
 
T
T
 
V
G
 
G
H
 
N
V
 
S
H
 
A
P
 
P
K
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
V
N
 
A
K
 
A
L
 
F
T
 
T
H
 
H
T
 
T
C
 
C
F
 
F
Q
 
M
V
 
V
L
 
T
A
 
P
Y
 
Y
E
 
E
P
 
G
Y
 
Y
V
 
V
E
 
K
L
 
V
C
 
A
E
 
E
K
 
H
I
 
L
N
 
N
A
 
R
K
 
L
V
 
T
P
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
H
A
 
E
K
 
K
K
 
R
T
 
T
L
 
A
L
 
L
V
 
F
T
 
N
T
x
S
G
|
G
S
x
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
Y
T
 
T
G
 
R
R
 
R
A
 
Q
G
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
V
F
 
F
T
 
D
G
 
H
A
 
A
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
N
M
 
L
T
 
T
L
 
M
G
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
A
K
 
K
V
 
N
V
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
S
 
K
A
 
H
G
 
G
M
 
F
G
 
G
L
 
P
M
 
F
P
 
A
G
 
N
G
 
E
V
 
V
F
 
Y
R
 
R
-
 
V
-
 
P
A
 
T
L
 
S
F
 
Y
P
 
P
N
 
F
E
 
R
L
 
D
H
 
G
G
 
E
V
 
T
S
 
D
D
 
G
D
 
A
D
 
A
A
 
A
I
 
A
A
 
A
S
 
H
I
 
A
E
 
L
R
 
D
I
 
L
F
 
I
K
 
N
N
 
K
D
 
Q
A
 
V
E
 
G
P
 
A
R
 
D
D
 
N
I
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
V
I
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
H
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Y
 
V
V
 
V
A
 
P
P
 
A
K
 
P
S
 
G
F
 
F
M
 
L
K
 
G
R
 
A
L
 
L
R
 
Q
E
 
K
L
 
W
C
 
C
D
 
T
K
 
D
H
 
N
G
 
G
I
 
A
L
 
V
L
 
F
I
 
V
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
F
G
 
A
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
A
F
 
L
F
 
F
A
 
A
M
 
C
E
 
E
Q
 
H
M
 
E
G
 
N
V
 
V
A
 
V
A
 
P
D
 
D
L
 
L
T
 
I
T
 
V
F
 
T
A
 
A
K
|
K
S
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
S
G
 
A
V
 
V
C
 
T
G
 
G
K
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
I
M
 
M
D
 
D
A
 
G
I
 
P
A
 
Q
P
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
|
T
Y
 
Y
A
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
I
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
M
 
I
E
 
D
V
 
T
F
 
I
E
 
E
E
 
R
E
 
E
H
 
N
L
 
L
L
 
V
D
 
A
R
 
R
C
 
A
K
 
R
A
 
A
V
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
T
L
 
M
V
 
L
T
 
S
G
 
R
L
 
L
K
 
G
A
 
A
I
 
L
Q
 
A
A
 
A
K
 
A
Y
 
D
P
 
P
V
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
R
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
V
D
 
K
D
 
P
G
 
G
D
 
T
T
 
T
H
 
-
K
 
E
P
 
P
N
 
D
A
 
A
A
 
D
A
 
L
V
 
T
A
 
K
S
 
R
V
 
V
V
 
A
A
 
A
K
 
A
A
 
A
R
 
H
E
 
A
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
T
C
 
C
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
L
R
|
R
V
 
F
L
 
L
V
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
S
S
 
M
P
 
P
D
 
D
E
 
H
Q
 
L
L
 
L
D
 
D
K
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
D
I
 
I
I
 
L
E
 
A
E
 
A
C
 
V
F
 
F
S
 
A
E
 
E
L
 
V

6j2vA Gaba aminotransferase from corynebacterium glutamicum (see paper)
43% identity, 97% coverage: 7:418/425 of query aligns to 22:431/440 of 6j2vA

query
sites
6j2vA
S
 
A
L
 
L
M
 
D
K
 
E
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
V
 
V
P
 
A
R
 
R
G
 
A
V
x
L
G
 
A
Q
 
P
I
 
G
H
 
L
P
 
P
I
 
G
F
 
Y
A
 
V
E
 
V
S
 
D
A
 
A
K
 
D
N
 
G
A
 
G
T
 
I
V
 
L
T
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
D
G
 
G
R
 
N
E
 
R
F
 
F
I
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
T
N
 
T
T
 
V
G
 
G
H
 
G
V
 
S
H
 
N
P
 
A
K
 
A
I
 
V
I
 
A
A
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
G
E
 
A
Q
 
A
L
 
A
N
 
A
K
 
R
L
 
F
T
 
T
H
 
H
T
 
T
C
 
C
F
 
F
Q
 
M
V
 
V
L
 
S
A
 
P
Y
 
Y
E
 
E
P
 
T
Y
 
Y
V
 
V
E
 
A
L
 
M
C
 
A
E
 
E
K
 
R
I
 
L
N
 
N
A
 
A
K
 
L
V
 
T
P
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
H
A
 
D
K
 
K
K
 
K
T
 
S
L
 
A
L
 
L
V
 
F
T
 
N
T
x
S
G
|
G
S
x
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
Y
T
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
G
G
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
V
F
 
F
T
 
D
G
 
N
A
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
R
|
R
T
 
T
M
 
N
M
 
L
T
 
T
L
 
M
G
 
A
L
 
M
T
 
T
G
 
A
K
 
K
V
 
N
V
 
R
P
 
P
Y
 
Y
S
 
K
A
 
S
G
 
G
M
 
F
G
 
G
L
 
P
M
 
L
P
 
A
G
 
A
G
 
D
V
 
V
F
 
Y
R
 
R
A
 
A
L
 
P
F
 
M
P
 
S
N
 
Y
E
 
P
L
 
L
H
 
R
-
 
D
G
 
G
V
 
L
S
 
S
D
 
G
D
 
P
D
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
E
S
 
R
I
 
A
E
 
I
R
 
S
I
 
V
F
 
I
K
 
E
N
 
S
D
 
Q
A
 
V
E
 
G
P
 
A
R
 
E
D
 
N
I
 
L
A
 
A
A
 
C
I
 
V
I
 
V
I
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Y
 
I
V
 
V
A
 
P
P
 
A
K
 
P
S
 
G
F
 
F
M
 
L
K
 
A
R
 
A
L
 
I
R
 
S
E
 
T
L
 
W
C
 
C
D
 
R
K
 
E
H
 
N
G
 
D
I
 
V
L
 
V
L
 
F
I
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
x
I
Q
|
Q
T
 
S
G
 
G
A
 
F
G
 
L
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
D
F
 
W
F
 
F
A
 
A
M
 
S
E
 
D
Q
 
A
M
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
P
D
 
D
L
 
V
T
 
I
T
 
T
F
 
T
A
 
A
K
|
K
S
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
M
P
 
P
L
 
L
A
 
S
G
 
A
V
 
V
C
 
T
G
 
G
K
 
R
A
 
A
E
 
E
Y
 
I
M
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
P
A
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
Y
 
Y
A
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
A
M
 
I
E
 
E
V
 
V
F
 
M
E
 
E
E
 
Q
E
 
A
H
 
D
L
 
L
L
 
K
D
 
T
R
 
R
C
 
A
K
 
Q
A
 
E
V
 
I
G
 
-
E
 
E
R
 
T
L
 
I
V
 
I
T
 
R
G
 
D
L
 
E
K
 
F
A
 
A
I
 
Q
Q
 
L
A
 
S
K
 
A
Y
 
F
P
 
P
V
 
E
I
 
V
G
 
A
E
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
G
L
 
R
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
M
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
I
D
 
D
D
 
-
G
 
-
D
 
A
T
 
T
H
 
G
K
 
R
P
 
P
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
L
V
 
T
A
 
A
S
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
A
R
 
K
E
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
T
C
 
C
G
 
G
T
 
T
Y
 
D
G
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
V
S
 
I
P
 
A
D
 
E
E
 
D
Q
 
T
L
 
L
D
 
R
K
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
Q
I
 
V
I
 
L

4atqF Gaba-transaminase a1r958 in complex with external aldimine plp-gaba adduct (see paper)
45% identity, 97% coverage: 7:418/425 of query aligns to 22:437/444 of 4atqF

query
sites
4atqF
S
 
A
L
 
L
M
 
A
K
 
E
R
 
R
R
 
R
E
 
S
A
 
A
A
 
V
V
 
V
P
 
A
R
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
A
Q
 
S
I
 
G
H
 
V
P
 
P
I
 
V
F
 
Y
A
 
V
E
 
E
S
 
D
A
 
A
K
 
D
N
 
G
A
 
G
T
 
I
V
 
I
T
 
R
D
 
D
V
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
N
E
 
S
F
 
F
I
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
G
G
 
S
G
 
G
I
|
I
A
 
A
V
 
V
L
 
T
N
 
S
T
 
V
G
 
G
H
 
A
V
 
S
H
 
D
P
 
P
K
 
A
I
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
T
 
Q
E
 
E
Q
 
A
L
 
A
N
 
A
K
 
H
L
 
F
T
 
T
H
 
H
T
 
T
C
 
C
F
 
F
Q
x
M
V
 
V
L
 
T
A
 
P
Y
 
Y
E
 
E
P
 
G
Y
 
Y
V
 
V
E
 
A
L
 
V
C
 
T
E
 
E
K
 
Q
I
 
L
N
 
N
A
 
R
K
 
L
V
 
T
P
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
H
A
 
A
K
 
K
K
 
R
T
 
T
L
 
V
L
 
L
V
 
F
T
 
N
T
x
S
G
|
G
S
x
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
K
I
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
D
G
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
F
 
F
T
 
D
G
 
H
A
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
R
|
R
T
 
T
M
 
N
M
 
L
T
 
T
L
 
M
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
A
K
 
K
V
 
A
V
 
M
P
 
P
Y
 
Y
S
 
K
A
 
T
G
 
N
M
 
F
G
 
G
-
 
P
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
Y
L
 
R
M
 
M
P
 
P
G
 
M
G
 
S
V
 
Y
-
 
P
F
 
F
R
 
R
A
 
E
L
 
E
F
 
N
P
 
P
N
 
E
E
 
I
L
 
T
H
 
G
G
 
A
V
 
E
S
 
A
D
 
A
D
 
K
D
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
T
S
 
M
I
 
I
E
 
E
R
 
K
I
 
Q
F
 
I
K
 
G
N
 
G
D
 
D
A
 
-
E
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Y
 
I
V
 
V
A
 
P
P
 
A
K
 
E
S
 
G
F
 
F
M
 
L
K
 
P
R
 
A
L
 
L
R
 
S
E
 
E
L
 
W
C
 
A
D
 
K
K
 
E
H
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
V
L
 
F
I
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
|
Q
T
 
S
G
 
G
A
 
F
G
 
C
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
E
F
 
W
F
 
F
A
 
A
M
 
V
E
 
D
Q
 
H
M
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
P
D
 
D
L
 
I
T
 
I
T
 
T
F
 
M
A
 
A
K
|
K
S
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
F
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
S
G
 
A
V
 
I
C
 
T
G
 
G
K
 
R
A
 
A
E
 
D
Y
 
L
M
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
V
A
 
H
P
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
G
|
G
T
|
T
Y
 
Y
A
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
I
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
A
M
 
I
E
 
D
V
 
T
F
 
M
E
 
E
E
 
Q
E
 
H
H
 
D
L
 
L
L
 
N
D
 
G
R
 
R
C
 
A
K
 
R
A
 
H
V
 
I
G
 
E
E
 
E
R
 
L
L
 
A
V
 
L
T
 
G
G
 
K
L
 
L
K
 
R
A
 
E
I
 
L
Q
 
A
A
 
A
K
 
E
-
 
G
Y
 
G
P
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
D
V
 
I
R
 
R
A
 
G
L
 
R
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
L
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
V
D
 
Q
D
 
P
G
 
G
D
 
-
T
 
S
H
 
K
K
 
E
P
 
P
N
 
N
A
 
A
A
 
E
A
 
L
V
 
T
A
 
K
S
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
K
 
A
A
 
C
R
 
L
E
 
K
K
 
E
G
 
G
L
 
V
I
 
I
L
 
I
L
 
L
S
 
T
C
 
C
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
I
R
|
R
V
 
L
L
 
L
V
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
V
S
 
I
P
 
S
D
 
D
E
 
E
Q
 
L
L
 
L
D
 
I
K
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
V
I
 
L

O58478 Alanine/serine racemase; ASR; Ala/Ser racemase; EC 5.1.1.-; EC 5.1.1.1 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) (see paper)
35% identity, 98% coverage: 8:424/425 of query aligns to 35:460/474 of O58478

query
sites
O58478
L
 
L
M
 
I
K
 
E
R
 
R
R
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
V
V
 
L
P
 
S
R
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
-
 
V
Q
 
K
I
 
L
H
 
F
P
 
P
I
 
L
F
 
V
A
 
P
E
 
K
S
 
R
A
 
G
K
 
F
N
 
G
A
 
P
T
 
F
V
 
I
T
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
N
E
 
V
F
 
F
I
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
A
N
 
S
T
 
T
G
 
G
H
 
Y
V
 
A
H
 
H
P
 
P
K
 
K
I
 
L
I
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
V
T
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
V
N
 
E
K
 
L
L
 
I
T
 
Q
H
 
H
T
 
S
C
 
M
F
 
I
Q
 
G
V
 
Y
L
 
T
A
 
H
Y
 
S
E
 
E
P
 
R
Y
 
A
V
 
I
E
 
R
L
 
V
C
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
V
A
 
E
K
 
I
V
 
S
P
 
P
G
 
I
D
 
E
F
 
-
A
 
N
K
 
S
K
 
K
T
 
V
L
 
I
L
 
F
V
 
G
T
 
L
T
 
S
G
 
G
S
 
S
E
 
D
A
 
A
V
 
V
E
 
D
N
 
M
A
 
A
V
 
I
K
 
K
I
 
V
A
 
S
R
 
K
A
 
F
A
 
S
T
 
T
G
 
R
R
 
R
A
 
P
G
 
W
V
 
I
I
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
I
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
R
 
Q
T
 
T
M
 
L
M
 
G
T
 
A
L
 
T
G
 
S
L
 
V
T
 
A
G
 
S
K
 
F
V
 
Q
V
 
V
P
 
S
Y
 
Q
S
 
K
A
 
R
G
 
G
M
 
Y
G
 
S
L
 
P
M
 
L
P
 
M
G
 
P
G
 
N
V
 
V
F
 
F
R
 
W
A
 
I
L
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
N
E
 
P
L
 
F
H
 
R
G
 
N
V
 
I
-
 
W
-
 
G
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
S
 
E
D
 
P
D
 
D
D
 
E
A
 
L
I
 
I
A
 
N
S
 
R
I
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
E
E
 
Y
R
 
Y
I
 
V
F
 
F
K
 
S
N
 
H
D
 
V
A
 
V
E
 
P
P
 
P
R
 
D
D
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
L
I
 
F
I
 
A
E
 
E
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
x
D
G
 
A
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
V
 
V
A
 
P
P
 
P
K
 
E
S
 
N
F
 
F
M
 
F
K
 
K
R
 
E
L
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
L
C
 
L
D
 
E
K
 
E
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
M
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
F
 
W
F
 
F
A
 
A
M
 
S
E
 
E
Q
 
W
M
 
F
G
 
N
V
 
V
A
 
K
A
 
P
D
 
D
L
 
M
T
 
I
T
 
I
F
 
F
A
 
G
K
|
K
S
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
S
G
 
G
F
 
M
P
 
G
L
 
L
A
 
S
G
 
G
V
 
V
C
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
K
E
 
E
Y
 
I
M
 
M
D
 
D
A
 
-
I
 
I
A
 
T
P
 
S
G
 
G
G
 
S
L
 
A
G
 
L
G
 
L
T
 
T
Y
 
P
A
 
A
G
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
V
A
 
I
C
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
E
A
 
A
V
 
T
M
 
L
E
 
E
V
 
I
F
 
I
E
 
E
E
 
E
E
 
E
H
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
R
 
N
C
 
A
K
 
L
A
 
E
V
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
F
L
 
I
V
 
M
T
 
G
G
 
R
L
 
L
K
 
K
A
 
E
I
 
I
Q
 
K
A
 
E
K
 
R
Y
 
F
P
 
E
V
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
L
M
 
M
I
 
I
A
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
I
F
 
V
D
 
K
D
 
E
G
 
N
D
 
G
T
 
-
H
 
-
K
 
R
P
 
P
N
 
D
A
 
P
A
 
E
A
 
M
V
 
T
A
 
G
S
 
K
V
 
I
V
 
C
A
 
W
K
 
R
A
 
A
R
 
F
E
 
E
K
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
P
S
 
S
C
 
Y
G
 
G
T
 
M
Y
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
I
L
 
T
V
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
V
S
 
L
P
 
T
D
 
K
E
 
E
Q
 
V
L
 
A
D
 
E
K
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
E
 
R
C
 
A
F
 
I
S
 
K
E
 
D

5wyfA Structure of amino acid racemase, 2.12 a (see paper)
34% identity, 93% coverage: 29:423/425 of query aligns to 32:432/446 of 5wyfA

query
sites
5wyfA
E
 
D
S
 
H
A
 
A
K
 
H
N
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
L
T
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
N
E
 
K
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
L
G
 
A
G
 
S
I
x
A
A
 
S
V
 
A
L
 
I
N
 
N
T
 
V
G
 
G
H
 
H
V
 
T
H
 
H
P
 
E
K
 
K
I
 
V
I
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
A
E
 
D
Q
 
Q
L
 
A
N
 
Q
K
 
K
L
 
L
T
 
I
H
 
H
T
 
Y
C
 
T
F
 
P
Q
 
A
V
x
Y
L
 
F
A
 
H
Y
 
H
E
 
V
P
 
P
Y
 
G
V
 
M
E
 
E
L
 
L
C
 
S
E
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
A
A
 
K
K
 
I
V
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
N
F
 
S
A
 
P
K
 
K
K
 
M
T
 
V
L
 
S
L
 
F
V
 
G
T
 
N
T
x
S
G
|
G
S
|
S
E
 
D
A
 
A
V
x
N
E
 
D
N
 
A
A
 
I
V
 
I
K
 
K
I
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
Y
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
G
 
Y
V
 
I
I
 
V
A
 
S
F
 
Y
T
 
M
G
 
G
A
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
R
 
S
T
 
T
M
 
Y
M
 
G
T
 
S
L
 
Q
G
 
T
L
 
L
T
 
S
G
 
G
K
 
S
V
 
S
V
 
L
P
 
N
Y
 
M
S
 
T
A
 
R
G
 
K
M
 
I
G
 
G
L
 
P
M
 
M
P
 
L
G
 
P
G
 
S
V
 
V
F
 
V
R
 
H
A
 
V
L
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
D
E
 
S
L
 
Y
H
 
R
-
 
T
-
 
Y
-
 
P
G
 
G
V
 
E
S
 
T
D
 
E
D
 
H
D
 
D
A
 
V
I
 
S
A
 
L
S
 
R
I
 
Y
E
 
F
R
 
N
I
 
E
F
 
F
K
 
K
N
 
K
D
 
P
A
 
F
E
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
L
P
 
P
R
 
A
D
 
D
-
 
E
I
 
T
A
 
A
A
 
C
I
 
V
I
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
x
D
G
 
G
G
 
G
F
 
I
Y
 
I
V
 
K
A
 
A
P
 
P
K
 
E
S
 
E
F
 
Y
M
 
M
K
 
Q
R
 
L
L
 
V
R
 
Y
E
 
K
L
 
F
C
 
C
D
 
H
K
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
F
I
 
A
A
 
I
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
x
N
T
 
Q
G
 
G
A
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
F
 
M
F
 
W
A
 
A
M
 
I
E
 
Q
Q
 
Q
M
 
F
-
 
K
G
 
D
V
 
I
A
 
E
A
 
P
D
 
D
L
 
L
T
 
M
T
 
S
F
 
V
A
 
G
K
|
K
S
 
S
I
 
L
A
 
A
G
 
S
G
 
G
F
 
M
P
 
P
L
 
L
A
 
S
G
 
A
V
 
V
C
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
K
E
 
E
Y
 
V
M
 
M
D
 
Q
A
 
S
I
 
L
-
 
D
A
 
A
P
 
P
G
 
A
G
 
H
L
 
L
G
x
F
G
x
T
T
 
T
Y
 
-
A
 
A
G
 
G
S
 
N
P
 
P
I
 
V
A
 
C
C
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
T
M
 
L
E
 
D
V
 
V
F
 
I
E
 
E
E
 
Y
E
 
E
H
 
G
L
 
L
L
 
V
D
 
E
R
 
K
C
 
S
K
 
A
A
 
T
V
 
D
G
 
G
E
 
A
R
 
Y
L
 
A
V
 
K
T
 
Q
G
 
R
L
 
F
K
 
L
A
 
E
I
 
M
Q
 
Q
A
 
Q
K
 
R
Y
 
H
P
 
P
V
 
M
I
 
I
G
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
M
L
 
W
G
 
G
A
 
L
M
 
N
I
 
G
A
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
V
D
 
K
D
 
D
G
 
P
D
 
K
T
 
T
H
 
K
K
 
E
P
 
P
N
 
D
A
 
S
A
 
D
A
 
A
V
 
A
A
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
Y
K
 
Y
A
 
A
R
 
F
E
 
A
K
 
H
G
 
G
L
 
V
I
 
V
L
 
I
L
 
I
S
 
T
C
 
L
G
 
A
T
 
-
Y
 
-
G
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
L
R
|
R
V
 
F
L
 
Q
V
 
P
P
 
P
L
 
L
T
 
V
S
 
I
P
 
P
D
 
R
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
K
 
Q
G
 
A
L
 
L
A
 
Q
I
 
V
I
 
L
E
 
D
E
 
D
C
 
A
F
 
F
S
 
T

Sites not aligning to the query:

4ysnC Structure of aminoacid racemase in complex with plp (see paper)
34% identity, 93% coverage: 29:423/425 of query aligns to 39:439/448 of 4ysnC

query
sites
4ysnC
E
 
D
S
 
H
A
 
A
K
 
H
N
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
L
T
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
N
E
 
K
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
L
G
 
A
G
 
S
I
 
A
A
 
S
V
 
A
L
 
I
N
 
N
T
 
V
G
 
G
H
 
H
V
 
T
H
 
H
P
 
E
K
 
K
I
 
V
I
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
A
E
 
D
Q
 
Q
L
 
A
N
 
Q
K
 
K
L
 
L
T
 
I
H
 
H
T
 
Y
C
 
T
F
 
P
Q
 
A
V
 
Y
L
 
F
A
 
H
Y
 
H
E
 
V
P
 
P
Y
 
G
V
 
M
E
 
E
L
 
L
C
 
S
E
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
A
A
 
K
K
 
I
V
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
N
F
 
S
A
 
P
K
 
K
K
 
M
T
 
V
L
 
S
L
 
F
V
 
G
T
 
N
T
x
S
G
|
G
S
|
S
E
 
D
A
 
A
V
x
N
E
 
D
N
 
A
A
 
I
V
 
I
K
 
K
I
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
Y
T
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
Q
G
 
Y
V
 
I
I
 
V
A
 
S
F
 
Y
T
 
M
G
 
G
A
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
R
 
S
T
 
T
M
 
Y
M
 
G
T
 
S
L
 
Q
G
 
T
L
 
L
T
 
S
G
 
G
K
 
S
V
 
S
V
 
L
P
 
N
Y
 
M
S
 
T
A
 
R
G
 
K
M
 
I
G
 
G
L
 
P
M
 
M
P
 
L
G
 
P
G
 
S
V
 
V
F
 
V
R
 
H
A
 
V
L
 
P
F
 
Y
P
 
P
N
 
D
E
 
S
L
 
Y
H
 
R
-
 
T
-
 
Y
-
 
P
G
 
G
V
 
E
S
 
T
D
 
E
D
 
H
D
 
D
A
 
V
I
 
S
A
 
L
S
 
R
I
 
Y
E
 
F
R
 
N
I
 
E
F
 
F
K
 
K
N
 
K
D
 
P
A
 
F
E
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
L
P
 
P
R
 
A
D
 
D
-
 
E
I
 
T
A
 
A
A
 
C
I
 
V
I
 
L
I
 
I
E
|
E
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
E
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
I
Y
 
I
V
 
K
A
 
A
P
 
P
K
 
E
S
 
E
F
 
Y
M
 
M
K
 
Q
R
 
L
L
 
V
R
 
Y
E
 
K
L
 
F
C
 
C
D
 
H
K
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
L
L
 
F
I
 
A
A
 
I
D
|
D
E
 
E
V
|
V
Q
x
N
T
 
Q
G
 
G
A
 
L
G