SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1874 FitnessBrowser__Marino:GFF1874 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bntC X-ray crystal structure of a aspartate-semialdehyde dehydrogenase bound to NADP from pseudomonas aeruginosa
70% identity, 100% coverage: 1:360/360 of query aligns to 13:371/371 of 5bntC

query
sites
5bntC
M
|
M
V
|
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
R
 
L
E
 
E
E
 
E
N
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
D
D
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
|
T
S
|
S
Q
 
N
A
 
V
G
 
G
K
 
G
P
 
Q
A
 
G
P
 
P
D
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
D
 
-
V
 
I
P
 
A
P
 
P
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
A
 
A
F
 
Y
D
 
S
V
 
I
E
 
D
I
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
T
M
 
L
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
L
T
 
T
C
 
C
Q
|
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
G
 
S
A
 
E
V
 
V
Y
 
F
Q
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
R
D
 
E
A
 
A
G
 
G
W
 
W
E
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
S
L
 
L
R
 
R
M
 
M
V
 
E
D
 
D
H
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
N
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
D
K
 
A
G
 
G
V
 
T
K
 
R
D
 
N
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
N
 
N
C
|
C
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F
E
 
D
Q
 
A
D
 
G
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
V
 
M
S
 
S
P
 
A
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
K
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
E
 
A
L
 
A
N
 
H
K
 
A
S
 
S
V
 
V
K
 
A
S
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
A
D
 
N
P
 
P
S
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
D
 
D
R
 
R
K
 
K
V
 
V
T
 
A
E
 
E
T
 
T
M
 
L
R
 
R
S
 
S
D
 
E
G
 
A
F
 
F
P
 
P
T
 
T
E
 
E
H
 
H
F
 
F
Q
 
G
V
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
W
I
 
I
D
 
D
K
 
K
Q
 
E
L
 
L
D
 
P
N
 
N
G
 
G
M
 
Q
S
 
S
K
 
R
E
 
E
E
 
E
W
 
W
K
 
K
A
 
A
G
 
Q
V
 
A
E
 
E
T
 
T
N
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
A
R
 
R
S
 
F
D
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
I
C
 
C
V
 
V
R
|
R
I
 
V
G
 
G
A
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
C
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
N
K
 
K
D
 
D
L
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
T
E
 
D
I
 
I
E
 
E
S
 
G
I
 
L
L
 
I
A
 
S
K
 
Q
A
 
H
N
 
N
D
 
P
W
 
W
V
 
V
K
 
K
V
 
L
I
 
V
P
 
P
N
 
N
D
 
H
R
 
R
D
 
E
A
 
V
T
 
S
I
 
V
E
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
N
M
 
M
G
 
G
P
 
S
E
 
Q
Y
 
Y
I
 
L
S
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
R
M
 
M
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Q
 
L
E
 
E
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P44801 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase; ASA dehydrogenase; ASADH; Aspartate-beta-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.11 from Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) (see 2 papers)
68% identity, 99% coverage: 1:357/360 of query aligns to 12:369/371 of P44801

query
sites
P44801
M
|
M
V
|
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
D
R
 
R
M
 
M
R
 
S
E
 
Q
E
 
E
N
 
N
D
 
D
F
 
F
A
 
E
D
 
N
I
 
L
E
 
N
P
 
P
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
|
T
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
P
 
K
A
 
A
P
 
P
D
 
V
V
 
F
G
 
G
K
 
G
D
 
K
D
 
D
V
 
A
P
 
G
P
 
D
L
 
L
Q
 
K
D
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
K
M
 
L
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
V
T
 
T
C
 
C
Q
|
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
G
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
A
A
 
T
G
 
G
W
 
W
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
A
L
 
L
R
|
R
M
 
M
V
 
K
D
 
D
H
 
D
S
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
Q
N
 
H
V
 
V
I
 
I
D
 
S
A
 
E
A
 
G
L
 
L
E
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
I
K
 
K
D
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
N
C
|
C
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F
E
 
E
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
V
 
I
S
 
S
P
 
V
M
 
A
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
|
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
S
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
E
 
L
L
 
L
N
 
E
K
 
Q
S
 
A
V
 
V
K
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
K
D
 
D
P
 
P
S
 
A
S
 
S
A
 
S
I
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
D
 
E
R
 
R
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
T
 
K
M
 
M
R
 
R
S
 
A
D
 
D
G
 
N
F
 
F
P
 
P
T
 
T
E
 
D
H
 
N
F
 
F
Q
 
G
V
 
A
P
 
A
L
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
W
I
 
I
D
 
D
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
-
 
P
D
 
E
N
 
T
G
 
G
M
 
Q
S
 
T
K
 
K
E
|
E
E
 
E
W
 
W
K
|
K
A
 
G
G
 
Y
V
 
A
E
 
E
T
 
T
N
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
L
S
 
S
D
 
D
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
L
C
 
C
V
 
V
R
|
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
L
R
 
R
S
 
C
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
A
 
A
K
 
S
A
 
H
N
 
N
D
 
E
W
 
W
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
D
R
 
K
D
 
E
A
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
I
 
L
S
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
V
R
 
R
R
 
R
M
 
I
L
 
L
R
 
K
I
 
Q
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1pquA Crystal structure of the h277n mutant of aspartate semialdehyde dehydrogenase from haemophilus influenzae bound with NADP, s-methyl cysteine sulfoxide and cacodylate (see paper)
68% identity, 99% coverage: 1:357/360 of query aligns to 12:369/371 of 1pquA

query
sites
1pquA
M
|
M
V
|
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
D
R
 
R
M
 
M
R
 
S
E
 
Q
E
 
E
N
 
N
D
 
D
F
 
F
A
 
E
D
 
N
I
 
L
E
 
N
P
 
P
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
|
T
T
|
T
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
P
 
K
A
 
A
P
 
P
D
 
V
V
 
F
G
 
G
K
 
G
D
 
K
D
 
D
V
 
A
P
 
G
P
 
D
L
 
L
Q
 
K
D
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
K
M
 
L
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
V
T
 
T
C
|
C
Q
|
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
G
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
A
A
 
T
G
 
G
W
 
W
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
|
A
S
 
S
T
 
A
L
 
L
R
 
R
M
 
M
V
 
K
D
 
D
H
 
D
S
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
Q
N
 
H
V
 
V
I
 
I
D
 
S
A
 
E
A
 
G
L
 
L
E
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
I
K
 
K
D
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
N
C
|
C
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F
E
 
E
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
V
 
I
S
 
S
P
 
V
M
 
A
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
S
|
S
G
|
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
S
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
E
 
L
L
 
L
N
 
E
K
 
Q
S
 
A
V
 
V
K
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
K
D
 
D
P
 
P
S
 
A
S
 
S
A
 
S
I
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
D
 
E
R
 
R
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
T
 
K
M
 
M
R
 
R
S
 
A
D
 
D
G
 
N
F
 
F
P
 
P
T
 
T
E
 
D
H
 
N
F
 
F
Q
 
G
V
 
A
P
 
A
L
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
W
I
 
I
D
 
D
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
-
 
P
D
 
E
N
 
T
G
 
G
M
 
Q
S
 
T
K
 
K
E
|
E
E
 
E
W
 
W
K
 
K
A
 
G
G
 
Y
V
 
A
E
 
E
T
 
T
N
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
L
S
 
S
D
 
D
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
L
C
 
C
V
 
V
R
|
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
L
R
 
R
S
 
C
H
x
N
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
A
 
A
K
 
S
A
 
H
N
 
N
D
 
E
W
 
W
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
D
R
 
K
D
 
E
A
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
I
 
L
S
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
L
|
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
A
|
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
V
R
 
R
R
 
R
M
 
I
L
 
L
R
 
K
I
 
Q
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3pzrA Crystals structure of aspartate beta-semialdehyde dehydrogenase from vibrio cholerae with NADP and product of s-carbamoyl-l-cysteine (see paper)
69% identity, 99% coverage: 1:357/360 of query aligns to 11:366/370 of 3pzrA

query
sites
3pzrA
M
|
M
V
|
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
R
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
D
D
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
x
S
T
|
T
S
|
S
Q
 
Q
A
 
I
G
 
G
K
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
N
V
 
F
G
 
G
K
 
K
D
 
D
D
 
-
V
 
A
P
 
G
P
 
M
L
 
L
Q
 
H
D
 
D
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
S
L
 
L
K
 
K
T
 
Q
M
 
L
D
 
D
V
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
C
 
C
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
E
A
 
K
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
P
K
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
W
 
W
E
 
K
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
M
 
M
V
 
D
D
 
K
H
 
E
S
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
L
N
 
K
V
 
Q
I
 
I
D
 
L
A
 
H
A
 
G
L
 
I
E
 
H
K
 
H
G
 
G
V
 
T
K
 
K
D
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
N
C
|
C
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
E
 
E
Q
 
R
D
 
G
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
V
 
M
S
 
S
P
 
A
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
I
N
 
S
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
E
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
D
S
 
A
V
 
V
K
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
A
D
 
N
P
 
P
S
 
A
S
 
S
A
 
S
I
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
D
 
D
R
 
K
K
 
K
V
 
V
T
 
A
E
 
E
T
 
T
M
 
M
R
 
R
S
 
S
D
 
G
G
 
S
F
 
F
P
 
P
T
 
T
E
 
D
H
 
N
F
 
F
Q
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
W
I
 
I
D
 
D
K
 
V
Q
 
K
L
 
R
D
 
D
N
 
N
G
 
G
M
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
|
E
E
 
E
W
 
W
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
L
S
 
Q
D
 
D
N
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
T
C
 
C
V
 
V
R
|
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
C
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
Q
D
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
E
I
 
M
L
 
I
A
 
A
K
 
T
A
 
H
N
 
N
D
 
D
W
 
W
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
I
T
 
T
I
 
A
E
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
M
T
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
D
E
 
D
Y
 
F
I
 
L
S
 
N
A
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
R
M
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Q9KQG2 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase 1; ASA dehydrogenase 1; ASADH 1; Aspartate-beta-semialdehyde dehydrogenase 1; EC 1.2.1.11 from Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961) (see paper)
69% identity, 99% coverage: 1:357/360 of query aligns to 11:366/370 of Q9KQG2

query
sites
Q9KQG2
M
|
M
V
|
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
R
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
D
D
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
S
T
|
T
S
|
S
Q
 
Q
A
 
I
G
 
G
K
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
N
V
 
F
G
 
G
K
 
K
D
 
D
D
 
-
V
 
A
P
 
G
P
 
M
L
 
L
Q
 
H
D
 
D
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
S
L
 
L
K
 
K
T
 
Q
M
 
L
D
 
D
V
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
C
 
C
Q
|
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
E
A
 
K
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
P
K
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
W
 
W
E
 
K
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
M
 
M
V
 
D
D
 
K
H
 
E
S
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
L
N
 
K
V
 
Q
I
 
I
D
 
L
A
 
H
A
 
G
L
 
I
E
 
H
K
 
H
G
 
G
V
 
T
K
 
K
D
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
N
C
|
C
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
E
 
E
Q
 
R
D
 
G
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
V
 
M
S
 
S
P
 
A
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
|
S
G
|
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
I
N
 
S
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
E
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
D
S
 
A
V
 
V
K
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
A
D
 
N
P
|
P
S
 
A
S
 
S
A
 
S
I
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
D
 
D
R
 
K
K
 
K
V
 
V
T
 
A
E
 
E
T
 
T
M
 
M
R
 
R
S
 
S
D
 
G
G
 
S
F
 
F
P
 
P
T
 
T
E
 
D
H
 
N
F
 
F
Q
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
W
I
 
I
D
 
D
K
 
V
Q
 
K
L
 
R
D
 
D
N
 
N
G
 
G
M
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
E
 
E
W
 
W
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
L
S
 
Q
D
 
D
N
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
T
C
 
C
V
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
C
H
 
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
Q
D
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
E
I
 
M
L
 
I
A
 
A
K
 
T
A
 
H
N
 
N
D
 
D
W
 
W
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
I
T
 
T
I
 
A
E
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
M
T
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
D
E
 
D
Y
 
F
I
 
L
S
 
N
A
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
R
M
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
I

Sites not aligning to the query:

4r5mA Crystal structure of vc-aspartate beta-semialdehyde-dehydrogenase with NADP and 4-nitro-2-phosphono-benzoic acid (see paper)
69% identity, 99% coverage: 1:357/360 of query aligns to 11:366/369 of 4r5mA

query
sites
4r5mA
M
|
M
V
|
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
R
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
D
D
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
S
T
|
T
S
|
S
Q
 
Q
A
 
I
G
 
G
K
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
N
V
 
F
G
 
G
K
 
K
D
 
D
D
 
-
V
 
A
P
 
G
P
 
M
L
 
L
Q
 
H
D
 
D
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
S
L
 
L
K
 
K
T
 
Q
M
 
L
D
 
D
V
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
C
|
C
Q
|
Q
G
|
G
G
|
G
D
 
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
E
A
 
K
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
P
K
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
W
 
W
E
 
K
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
I
D
 
D
A
|
A
A
|
A
S
|
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
M
 
M
V
 
D
D
 
K
H
 
E
S
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
L
N
 
K
V
 
Q
I
 
I
D
 
L
A
 
H
A
 
G
L
 
I
E
 
H
K
 
H
G
 
G
V
 
T
K
 
K
D
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
N
C
|
C
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
E
 
E
Q
 
R
D
 
G
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
V
 
M
S
 
S
P
 
A
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
I
N
 
S
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
E
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
D
S
 
A
V
 
V
K
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
A
D
 
N
P
 
P
S
 
A
S
 
S
A
 
S
I
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
D
 
D
R
 
K
K
 
K
V
 
V
T
 
A
E
 
E
T
 
T
M
 
M
R
 
R
S
 
S
D
 
G
G
 
S
F
 
F
P
 
P
T
 
T
E
 
D
H
 
N
F
 
F
Q
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
W
I
 
I
D
 
D
K
 
V
Q
 
K
L
 
R
D
 
D
N
 
N
G
 
G
M
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
E
 
E
W
 
W
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
L
S
 
Q
D
 
D
N
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
T
C
 
C
V
 
V
R
|
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
C
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
Q
D
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
E
I
 
M
L
 
I
A
 
A
K
 
T
A
 
H
N
 
N
D
 
D
W
 
W
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
I
T
 
T
I
 
A
E
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
M
T
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
D
E
 
D
Y
 
F
I
 
L
S
 
N
A
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
R
M
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1mb4A Crystal structure of aspartate semialdehyde dehydrogenase from vibrio cholerae with NADP and s-methyl-l-cysteine sulfoxide (see paper)
69% identity, 99% coverage: 1:357/360 of query aligns to 11:366/369 of 1mb4A

query
sites
1mb4A
M
|
M
V
|
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
R
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
D
D
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
S
T
|
T
S
|
S
Q
 
Q
A
 
I
G
 
G
K
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
N
V
 
F
G
 
G
K
 
K
D
 
D
D
 
-
V
 
A
P
 
G
P
 
M
L
 
L
Q
 
H
D
 
D
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
S
L
 
L
K
 
K
T
 
Q
M
 
L
D
 
D
V
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
C
|
C
Q
|
Q
G
|
G
G
 
G
D
 
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
E
A
 
K
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
P
K
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
A
 
A
G
 
G
W
 
W
E
 
K
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
|
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
M
 
M
V
 
D
D
 
K
H
 
E
S
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
L
N
 
K
V
 
Q
I
 
I
D
 
L
A
 
H
A
 
G
L
 
I
E
 
H
K
 
H
G
 
G
V
 
T
K
 
K
D
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
|
N
C
|
C
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
E
 
E
Q
 
R
D
 
G
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
V
 
M
S
 
S
P
 
A
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
S
|
S
G
|
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
I
N
 
S
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
E
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
D
S
 
A
V
 
V
K
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
A
D
 
N
P
 
P
S
 
A
S
 
S
A
 
S
I
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
D
 
D
R
 
K
K
 
K
V
 
V
T
 
A
E
 
E
T
 
T
M
 
M
R
 
R
S
 
S
D
 
G
G
 
S
F
 
F
P
 
P
T
 
T
E
 
D
H
 
N
F
 
F
Q
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
W
I
 
I
D
 
D
K
 
V
Q
 
K
L
 
R
D
 
D
N
 
N
G
 
G
M
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
|
E
E
 
E
W
 
W
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
L
S
 
Q
D
 
D
N
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
T
C
 
C
V
 
V
R
|
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
C
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
Q
D
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
E
I
 
M
L
 
I
A
 
A
K
 
T
A
 
H
N
 
N
D
 
D
W
 
W
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
E
R
 
R
D
 
D
A
 
I
T
 
T
I
 
A
E
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
M
T
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
D
E
 
D
Y
 
F
I
 
L
S
 
N
A
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
Q
|
Q
L
|
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
A
|
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
R
M
 
T
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
I

Sites not aligning to the query:

7tcmA Crystal structure of aspartate-semialdehyde dehydrogenase from acinetobacter baumannii in complex with NADP
67% identity, 100% coverage: 1:359/360 of query aligns to 13:370/373 of 7tcmA

query
sites
7tcmA
M
|
M
V
|
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
R
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
N
D
 
D
F
 
F
A
 
A
D
 
H
I
 
I
E
 
E
P
 
P
V
 
F
F
 
Y
F
 
F
T
 
S
T
|
T
S
|
S
Q
 
N
A
 
A
G
 
G
K
 
G
P
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
S
V
 
F
G
 
G
K
 
G
D
 
K
D
 
T
V
 
A
P
 
P
P
 
A
L
 
L
Q
 
M
D
 
E
A
 
A
F
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
T
I
 
S
L
 
L
K
 
K
T
 
Q
M
 
M
D
 
D
V
 
V
I
 
I
V
 
I
T
 
T
C
|
C
Q
|
Q
G
|
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
G
 
S
A
 
E
V
 
V
Y
 
F
Q
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
A
A
 
T
G
 
G
W
 
W
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
|
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
M
 
M
V
 
T
D
 
D
H
 
D
S
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
L
N
 
N
V
 
V
I
 
I
D
 
K
A
 
D
A
 
G
L
 
L
E
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
T
K
 
K
D
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
N
C
 
C
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
G
L
 
V
G
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
F
E
 
Q
Q
 
N
D
 
N
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
V
 
M
S
 
T
P
 
A
M
 
M
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
|
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
T
Q
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
Y
L
 
L
N
 
Y
K
 
N
S
 
N
V
 
T
K
 
K
S
 
T
E
 
L
L
 
L
D
 
D
D
 
D
P
 
P
S
 
K
S
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
D
 
D
R
 
R
K
 
Q
V
 
V
T
 
A
E
 
E
T
 
L
M
 
Q
R
 
R
S
 
G
D
 
E
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
S
E
 
A
H
 
N
F
 
F
Q
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
D
 
D
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
D
 
E
N
 
S
G
 
G
M
 
Q
S
 
S
K
 
K
E
 
E
E
 
E
W
 
W
K
 
K
A
 
G
G
 
Q
V
 
V
E
 
E
T
 
T
N
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
S
 
S
D
 
-
N
 
Q
P
 
I
I
 
V
P
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
H
C
 
C
V
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
C
H
 
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
D
L
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
D
I
 
M
L
 
I
A
 
R
K
 
N
A
 
S
N
 
N
D
 
Q
W
 
W
V
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
V
P
 
P
N
 
N
D
 
T
R
 
R
D
 
E
A
 
A
T
 
S
I
 
M
E
 
T
E
 
D
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
V
K
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
N
M
 
M
G
 
G
P
 
K
E
 
E
Y
 
Y
I
 
L
S
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
A
|
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
R
M
 
M
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Q
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1tb4A Crystal structure of aspartate-semialdehyde dehydrogenase from haemophilus influenzae with a bound periodate (see paper)
67% identity, 99% coverage: 1:357/360 of query aligns to 12:355/357 of 1tb4A

query
sites
1tb4A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
D
R
 
R
M
 
M
R
 
S
E
 
Q
E
 
E
N
 
N
D
 
D
F
 
F
A
 
E
D
 
N
I
 
L
E
 
N
P
 
P
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
-
K
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
L
Q
 
K
D
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
K
M
 
L
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
V
T
 
T
C
 
C
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
G
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
A
A
 
T
G
 
G
W
 
W
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
A
L
 
L
R
|
R
M
 
M
V
 
K
D
 
D
H
 
D
S
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
Q
N
 
H
V
 
V
I
 
I
D
 
S
A
 
E
A
 
G
L
 
L
E
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
I
K
 
K
D
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
|
N
C
|
C
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F
E
 
E
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
V
 
I
S
 
S
P
 
V
M
 
A
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
S
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
E
 
L
L
 
L
N
 
E
K
 
Q
S
 
A
V
 
V
K
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
K
D
 
D
P
 
P
S
 
A
S
 
S
A
 
S
I
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
D
 
E
R
 
R
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
T
 
K
M
 
M
R
 
R
S
 
A
D
 
D
G
 
N
F
 
F
P
 
P
T
 
T
E
 
D
H
 
N
F
 
F
Q
 
G
V
 
A
P
 
A
L
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
W
I
 
I
D
 
D
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
-
 
P
D
 
E
N
 
T
G
 
G
M
 
Q
S
 
T
K
 
K
E
 
E
E
 
E
W
 
W
K
|
K
A
 
G
G
 
Y
V
 
A
E
 
E
T
 
T
N
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
L
S
 
S
D
 
D
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
L
C
 
C
V
 
V
R
|
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
L
R
 
R
S
 
C
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
A
 
A
K
 
S
A
 
H
N
 
N
D
 
E
W
 
W
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
D
R
 
K
D
 
E
A
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
I
 
L
S
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
V
R
 
R
R
 
R
M
 
I
L
 
L
R
 
K
I
 
Q
L
 
L

1ta4A Crystal structure of aspartate-semialdehyde dehydrogenase from haemophilus influenzae with a bound arsenate (see paper)
67% identity, 99% coverage: 1:357/360 of query aligns to 12:355/357 of 1ta4A

query
sites
1ta4A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
D
R
 
R
M
 
M
R
 
S
E
 
Q
E
 
E
N
 
N
D
 
D
F
 
F
A
 
E
D
 
N
I
 
L
E
 
N
P
 
P
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
-
K
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
L
Q
 
K
D
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
K
M
 
L
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
V
T
 
T
C
 
C
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
G
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
A
A
 
T
G
 
G
W
 
W
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
|
S
T
 
A
L
 
L
R
|
R
M
 
M
V
 
K
D
 
D
H
 
D
S
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
Q
N
 
H
V
 
V
I
 
I
D
 
S
A
 
E
A
 
G
L
 
L
E
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
I
K
 
K
D
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
|
N
C
|
C
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F
E
 
E
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
V
 
I
S
 
S
P
 
V
M
 
A
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
S
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
E
 
L
L
 
L
N
 
E
K
 
Q
S
 
A
V
 
V
K
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
K
D
 
D
P
 
P
S
 
A
S
 
S
A
 
S
I
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
D
 
E
R
 
R
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
T
 
K
M
 
M
R
 
R
S
 
A
D
 
D
G
 
N
F
 
F
P
 
P
T
 
T
E
 
D
H
 
N
F
 
F
Q
 
G
V
 
A
P
 
A
L
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
W
I
 
I
D
 
D
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
-
 
P
D
 
E
N
 
T
G
 
G
M
 
Q
S
 
T
K
|
K
E
 
E
E
 
E
W
 
W
K
|
K
A
 
G
G
 
Y
V
 
A
E
 
E
T
 
T
N
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
L
S
 
S
D
 
D
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
L
C
 
C
V
 
V
R
|
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
L
R
 
R
S
 
C
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
A
 
A
K
 
S
A
 
H
N
 
N
D
 
E
W
 
W
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
D
R
 
K
D
 
E
A
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
I
 
L
S
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
V
R
 
R
R
 
R
M
 
I
L
 
L
R
 
K
I
 
Q
L
 
L

1nx6A Crystal structure of aspartate semialdehyde dehydrogenase from haemophilus influenzae as a tetrahedral hemithiocetal reaction intermediate with phosphate at 2.15 a (see paper)
67% identity, 99% coverage: 1:357/360 of query aligns to 12:355/357 of 1nx6A

query
sites
1nx6A
M
 
M
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
D
R
 
R
M
 
M
R
 
S
E
 
Q
E
 
E
N
 
N
D
 
D
F
 
F
A
 
E
D
 
N
I
 
L
E
 
N
P
 
P
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
-
K
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
L
Q
 
K
D
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
K
M
 
L
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
V
T
 
T
C
 
C
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
G
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
A
A
 
T
G
 
G
W
 
W
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
|
S
T
 
A
L
 
L
R
|
R
M
 
M
V
 
K
D
 
D
H
 
D
S
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
Q
N
 
H
V
 
V
I
 
I
D
 
S
A
 
E
A
 
G
L
 
L
E
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
I
K
 
K
D
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
|
N
C
|
C
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F
E
 
E
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
V
 
I
S
 
S
P
 
V
M
 
A
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
S
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
E
 
L
L
 
L
N
 
E
K
 
Q
S
 
A
V
 
V
K
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
K
D
 
D
P
 
P
S
 
A
S
 
S
A
 
S
I
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
D
 
E
R
 
R
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
T
 
K
M
 
M
R
 
R
S
 
A
D
 
D
G
 
N
F
 
F
P
 
P
T
 
T
E
 
D
H
 
N
F
 
F
Q
 
G
V
 
A
P
 
A
L
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
W
I
 
I
D
|
D
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
-
 
P
D
 
E
N
 
T
G
 
G
M
 
Q
S
 
T
K
|
K
E
 
E
E
 
E
W
 
W
K
|
K
A
 
G
G
 
Y
V
 
A
E
 
E
T
 
T
N
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
L
S
 
S
D
 
D
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
L
C
 
C
V
 
V
R
|
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
L
R
 
R
S
 
C
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
A
 
A
K
 
S
A
 
H
N
 
N
D
 
E
W
 
W
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
D
R
 
K
D
 
E
A
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
I
 
L
S
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
V
R
 
R
R
 
R
M
 
I
L
 
L
R
 
K
I
 
Q
L
 
L

1pqpA Crystal structure of the c136s mutant of aspartate semialdehyde dehydrogenase from haemophilus influenzae bound with aspartate semialdehyde and phosphate (see paper)
66% identity, 99% coverage: 1:357/360 of query aligns to 12:355/357 of 1pqpA

query
sites
1pqpA
M
 
M
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
D
R
 
R
M
 
M
R
 
S
E
 
Q
E
 
E
N
 
N
D
 
D
F
 
F
A
 
E
D
 
N
I
 
L
E
 
N
P
 
P
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
T
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
-
K
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
L
Q
 
K
D
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
K
M
 
L
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
V
T
 
T
C
 
C
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
G
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
A
A
 
T
G
 
G
W
 
W
E
 
D
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
A
L
 
L
R
|
R
M
 
M
V
 
K
D
 
D
H
 
D
S
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
Q
N
 
H
V
 
V
I
 
I
D
 
S
A
 
E
A
 
G
L
 
L
E
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
I
K
 
K
D
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
|
N
C
x
S
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F
E
 
E
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
E
W
 
W
V
 
I
S
 
S
P
 
V
M
 
A
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
N
 
N
M
 
M
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
S
Q
 
Q
M
 
M
G
 
G
E
 
L
L
 
L
N
 
E
K
 
Q
S
 
A
V
 
V
K
 
S
S
 
S
E
 
E
L
 
L
D
 
K
D
 
D
P
 
P
S
 
A
S
 
S
A
 
S
I
 
I
L
 
L
E
 
D
I
 
I
D
 
E
R
 
R
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
T
 
K
M
 
M
R
 
R
S
 
A
D
 
D
G
 
N
F
 
F
P
 
P
T
 
T
E
 
D
H
 
N
F
 
F
Q
 
G
V
 
A
P
 
A
L
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
W
I
 
I
D
 
D
K
 
K
Q
 
L
L
 
L
-
 
P
D
 
E
N
 
T
G
 
G
M
 
Q
S
 
T
K
 
K
E
 
E
E
 
E
W
 
W
K
|
K
A
 
G
G
 
Y
V
 
A
E
 
E
T
 
T
N
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
L
S
 
S
D
 
D
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
L
C
 
C
V
 
V
R
|
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
L
R
 
R
S
 
C
H
|
H
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
Q
I
 
I
L
 
I
A
 
A
K
 
S
A
 
H
N
 
N
D
 
E
W
 
W
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
N
 
N
D
 
D
R
 
K
D
 
E
A
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
K
 
K
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
G
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
I
 
L
S
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
L
 
V
R
 
R
R
 
R
M
 
I
L
 
L
R
 
K
I
 
Q
L
 
L

1gl3A Aspartate beta-semialdehyde dehydrogenase in complex with NADP and substrate analogue s-methyl cysteine sulfoxide (see paper)
66% identity, 99% coverage: 1:357/360 of query aligns to 12:366/367 of 1gl3A

query
sites
1gl3A
M
|
M
V
|
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
M
 
M
R
 
V
E
 
E
E
 
E
N
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
D
D
 
A
I
 
I
E
 
R
P
 
P
V
 
V
F
 
F
F
 
F
T
 
S
T
|
T
S
|
S
Q
 
Q
A
 
L
G
 
G
K
 
Q
P
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
S
V
 
F
G
 
G
K
 
-
D
 
G
D
 
T
V
 
T
P
 
G
P
 
T
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
F
 
F
D
 
D
V
 
L
E
 
E
I
 
A
L
 
L
K
 
K
T
 
A
M
 
L
D
 
D
V
 
I
I
 
I
V
 
V
T
 
T
C
|
C
Q
|
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
G
 
N
A
 
E
V
 
I
Y
 
Y
Q
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
R
D
 
E
A
 
S
G
 
G
W
 
W
E
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
|
A
S
 
S
T
 
S
L
 
L
R
 
R
M
 
M
V
 
K
D
 
D
H
 
D
S
 
A
V
 
I
I
 
I
V
 
I
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
Q
N
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
T
A
 
D
A
 
G
L
 
L
E
 
N
K
 
N
G
 
G
V
 
I
K
 
R
D
 
T
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
N
C
|
C
T
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
M
M
 
L
L
 
M
A
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
F
E
 
A
Q
 
N
D
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
D
W
 
W
V
 
V
S