SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF1959 FitnessBrowser__Phaeo:GFF1959 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3nioA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa guanidinobutyrase (see paper)
62% identity, 99% coverage: 3:315/315 of query aligns to 1:316/316 of 3nioA

query
sites
3nioA
D
 
N
F
 
L
N
 
H
Q
 
Q
P
 
P
I
 
L
S
 
G
G
 
G
N
 
N
D
 
E
L
 
M
A
 
P
R
 
R
F
 
F
S
 
G
G
 
G
P
 
I
N
 
A
T
 
T
F
 
M
M
 
M
R
 
R
L
 
L
P
 
P
Q
 
H
A
 
V
T
 
Q
S
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
E
L
 
L
D
 
D
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
A
A
 
A
I
 
F
L
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
T
 
T
S
 
S
W
 
L
R
 
R
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
P
K
 
R
Q
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
A
 
V
M
 
M
I
 
I
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
N
 
N
M
 
M
T
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
N
 
N
I
 
V
G
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
A
I
 
I
N
 
N
T
 
T
F
 
F
S
 
N
L
 
L
P
 
L
D
 
E
S
 
A
L
 
V
R
 
R
I
 
I
I
 
I
Q
 
E
E
 
Q
S
 
E
Y
 
Y
S
 
D
A
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
G
S
 
H
D
 
G
V
 
I
T
 
L
P
 
P
V
 
L
A
 
T
M
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
S
 
T
I
 
I
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
K
E
 
K
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
P
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
H
V
 
V
D
|
D
A
 
A
H
|
H
A
 
A
D
|
D
V
 
V
N
 
N
D
 
D
D
 
H
M
 
M
F
 
F
G
 
G
E
 
E
R
 
K
E
 
I
T
 
A
H
|
H
G
 
G
T
 
T
V
 
T
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
Y
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
I
 
L
V
 
D
A
 
C
D
 
D
K
 
R
T
 
V
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
A
T
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
G
 
T
A
 
A
D
 
E
D
 
D
F
 
F
K
 
N
E
 
W
A
 
S
Q
 
R
R
 
K
W
 
Q
G
 
G
F
 
F
Q
 
R
H
 
V
F
 
V
P
 
Q
A
 
A
S
 
E
E
 
E
L
 
C
W
 
W
N
 
H
R
 
K
S
 
S
L
 
L
H
 
E
G
 
P
M
 
L
G
 
M
A
 
A
E
 
E
I
 
V
R
 
R
R
 
E
D
 
K
I
 
V
G
 
G
N
 
G
R
 
G
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
L
S
 
S
Y
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
S
 
G
L
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Y
 
W
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
T
P
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
M
E
 
E
L
 
I
I
 
I
R
 
R
A
 
G
L
 
C
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
N
 
D
I
 
L
V
 
I
G
 
G
C
 
C
D
 
D
M
 
L
V
 
V
E
|
E
V
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
A
 
S
L
 
L
T
 
L
A
 
G
A
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
L
 
M
L
 
L
C
 
C
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
V
T
 
R
K
 
R

Q9I3S3 Guanidinobutyrase; EC 3.5.3.7 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
62% identity, 99% coverage: 3:315/315 of query aligns to 4:319/319 of Q9I3S3

query
sites
Q9I3S3
D
 
N
F
 
L
N
 
H
Q
 
Q
P
 
P
I
 
L
S
 
G
G
 
G
N
 
N
D
 
E
L
 
M
A
 
P
R
 
R
F
 
F
S
 
G
G
 
G
P
 
I
N
 
A
T
 
T
F
 
M
M
 
M
R
 
R
L
 
L
P
 
P
Q
 
H
A
 
V
T
 
Q
S
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
E
L
 
L
D
 
D
G
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
A
A
 
A
I
 
F
L
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
T
 
T
S
 
S
W
 
L
R
 
R
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
P
K
 
R
Q
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
E
 
E
S
 
S
A
 
V
M
 
M
I
 
I
R
 
R
P
 
P
Y
 
Y
N
 
N
M
 
M
T
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
N
 
N
I
 
V
G
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
V
A
 
A
I
 
I
N
 
N
T
 
T
F
 
F
S
 
N
L
 
L
P
 
L
D
 
E
S
 
A
L
 
V
R
 
R
I
 
I
I
 
I
Q
 
E
E
 
Q
S
 
E
Y
 
Y
S
 
D
A
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
G
S
 
H
D
 
G
V
 
I
T
 
L
P
 
P
V
 
L
A
 
T
M
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
S
 
T
I
 
I
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
K
E
 
K
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
P
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
H
V
 
V
D
|
D
A
 
A
H
|
H
A
 
A
D
|
D
V
 
V
N
 
N
D
 
D
D
 
H
M
|
M
F
 
F
G
 
G
E
 
E
R
 
K
E
 
I
T
 
A
H
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
T
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
Y
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
I
 
L
V
 
D
A
 
C
D
 
D
K
 
R
T
 
V
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
A
T
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
G
 
T
A
 
A
D
 
E
D
 
D
F
 
F
K
 
N
E
 
W
A
 
S
Q
 
R
R
 
K
W
 
Q
G
 
G
F
 
F
Q
 
R
H
 
V
F
 
V
P
 
Q
A
 
A
S
 
E
E
 
E
L
 
C
W
 
W
N
 
H
R
 
K
S
 
S
L
 
L
H
 
E
G
 
P
M
 
L
G
 
M
A
 
A
E
 
E
I
 
V
R
 
R
R
 
E
D
 
K
I
 
V
G
 
G
N
 
G
R
 
G
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
L
S
 
S
Y
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
S
 
G
L
 
I
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Y
 
W
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
T
P
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
M
E
 
E
L
 
I
I
 
I
R
 
R
A
 
G
L
 
C
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
N
 
D
I
 
L
V
 
I
G
 
G
C
 
C
D
 
D
M
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
A
 
S
L
 
L
T
 
L
A
 
G
A
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
L
 
M
L
 
L
C
 
C
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
V
T
 
R
K
 
R

Q9I6K2 Guanidinopropionase; EC 3.5.3.17 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
48% identity, 98% coverage: 2:309/315 of query aligns to 3:310/318 of Q9I6K2

query
sites
Q9I6K2
T
 
N
D
 
D
F
 
H
N
 
P
Q
 
Q
P
 
P
I
 
L
S
 
D
G
 
A
N
 
A
D
 
E
L
 
I
A
 
P
R
 
R
F
 
F
S
 
A
G
 
G
P
 
I
N
 
P
T
 
T
F
 
F
M
 
M
R
 
R
L
 
L
P
 
P
Q
 
A
A
 
F
T
 
T
S
 
D
L
 
P
D
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
I
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
W
D
 
D
I
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
T
W
 
N
R
 
R
S
 
A
G
 
G
T
 
A
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
K
 
R
Q
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
N
E
 
L
S
 
S
A
 
S
M
 
L
I
 
M
R
 
R
P
 
K
Y
 
V
N
 
H
M
 
H
T
 
V
S
 
S
G
 
R
A
 
I
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
S
 
L
L
 
V
N
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
A
A
 
P
I
 
V
N
 
N
T
 
P
F
 
I
S
 
D
L
 
L
P
 
L
D
 
D
S
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
R
I
 
I
Q
 
E
E
 
G
S
 
F
Y
 
Y
S
 
R
A
 
Q
I
 
V
L
 
H
A
 
A
S
 
A
D
 
G
V
 
T
T
 
L
P
 
P
V
 
L
A
 
S
M
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
S
 
L
I
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
F
R
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
R
K
 
E
Y
 
R
G
 
-
P
 
P
V
 
L
A
 
G
L
 
M
V
 
V
H
 
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
A
 
S
D
|
D
V
 
T
N
 
N
D
 
D
D
 
R
M
x
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
D
R
 
N
E
 
P
-
 
Y
T
 
T
H
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
P
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
Y
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
L
V
 
D
A
 
P
D
 
L
K
 
R
T
 
T
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
G
 
G
T
 
S
G
 
V
Y
 
Y
G
 
S
A
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
D
K
 
A
E
 
F
A
 
A
Q
 
R
R
 
E
W
 
C
G
 
G
F
 
I
Q
 
R
H
 
V
F
 
I
P
 
H
A
 
M
S
 
E
E
 
E
L
 
F
W
 
V
N
 
E
R
 
L
S
 
G
L
 
V
H
 
E
G
 
A
M
 
T
G
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
V
I
 
V
G
 
G
N
 
A
R
 
G
P
 
P
V
 
T
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Y
 
F
D
|
D
I
 
V
D
|
D
S
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
T
T
 
S
P
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
Q
E
 
Q
L
 
L
I
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
N
 
D
I
 
L
V
 
V
G
 
G
C
 
A
D
 
D
M
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
P
Y
 
F
D
 
D
T
 
V
S
 
G
G
 
G
N
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
V
A
 
G
A
 
A
N
 
T
L
 
M
L
 
M
Y
 
F
E
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
C
V
 
L
L
 
L

3niqA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa guanidinopropionase (see paper)
48% identity, 97% coverage: 3:309/315 of query aligns to 1:307/315 of 3niqA

query
sites
3niqA
D
 
D
F
 
H
N
 
P
Q
 
Q
P
 
P
I
 
L
S
 
D
G
 
A
N
 
A
D
 
E
L
 
I
A
 
P
R
 
R
F
 
F
S
 
A
G
 
G
P
 
I
N
 
P
T
 
T
F
 
F
M
 
M
R
 
R
L
 
L
P
 
P
Q
 
A
A
 
F
T
 
T
S
 
D
L
 
P
D
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
I
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
W
D
 
D
I
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
T
W
 
N
R
 
R
S
 
A
G
 
G
T
 
A
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
K
 
R
Q
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
N
E
 
L
S
 
S
A
 
S
M
 
L
I
 
M
R
 
R
P
 
K
Y
 
V
N
 
H
M
 
H
T
 
V
S
 
S
G
 
R
A
 
I
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
S
 
L
L
 
V
N
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
A
A
 
P
I
 
V
N
 
N
T
 
P
F
 
I
S
 
D
L
 
L
P
 
L
D
 
D
S
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
R
I
 
I
Q
 
E
E
 
G
S
 
F
Y
 
Y
S
 
R
A
 
Q
I
 
V
L
 
H
A
 
A
S
 
A
D
 
G
V
 
T
T
 
L
P
 
P
V
 
L
A
 
S
M
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
S
 
L
I
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
F
R
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
R
K
 
E
Y
 
R
G
 
-
P
 
P
V
 
L
A
 
G
L
 
M
V
 
V
H
 
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
A
 
S
D
|
D
V
 
T
N
 
N
D
 
D
D
 
R
M
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
D
R
 
N
E
 
P
-
 
Y
T
 
T
H
|
H
G
 
G
T
 
T
V
 
P
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
Y
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
L
V
 
D
A
 
P
D
 
L
K
 
R
T
 
T
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
G
 
G
T
 
S
G
 
V
Y
 
Y
G
 
S
A
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
D
K
 
A
E
 
F
A
 
A
Q
 
R
R
 
E
W
 
C
G
 
G
F
 
I
Q
 
R
H
 
V
F
 
I
P
 
H
A
 
M
S
 
E
E
 
E
L
 
F
W
 
V
N
 
E
R
 
L
S
 
G
L
 
V
H
 
E
G
 
A
M
 
T
G
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
V
I
 
V
G
 
G
N
 
A
R
 
G
P
 
P
V
 
T
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Y
 
F
D
|
D
I
 
V
D
|
D
S
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
T
T
 
S
P
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
Q
E
 
Q
L
 
L
I
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
N
 
D
I
 
L
V
 
V
G
 
G
C
 
A
D
 
D
M
 
V
V
 
V
E
|
E
V
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
P
Y
 
F
D
 
D
T
 
V
S
 
G
G
 
G
N
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
V
A
 
G
A
 
A
N
 
T
L
 
M
L
 
M
Y
 
F
E
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
C
V
 
L
L
 
L

3nipB Crystal structure of pseudomonas aeruginosa guanidinopropionase complexed with 1,6-diaminohexane (see paper)
48% identity, 98% coverage: 2:309/315 of query aligns to 1:308/316 of 3nipB

query
sites
3nipB
T
 
N
D
 
D
F
 
H
N
 
P
Q
 
Q
P
 
P
I
 
L
S
 
D
G
 
A
N
 
A
D
 
E
L
 
I
A
 
P
R
 
R
F
 
F
S
 
A
G
 
G
P
 
I
N
 
P
T
 
T
F
 
F
M
 
M
R
 
R
L
 
L
P
 
P
Q
 
A
A
 
F
T
 
T
S
 
D
L
 
P
D
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
Q
V
 
V
A
 
G
I
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
W
D
 
D
I
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
T
W
 
N
R
|
R
S
 
A
G
 
G
T
 
A
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
K
 
R
Q
 
E
I
 
V
R
 
R
A
 
N
E
 
L
S
 
S
A
 
S
M
 
L
I
 
M
R
 
R
P
 
K
Y
 
V
N
 
H
M
 
H
T
 
V
S
 
S
G
 
R
A
 
I
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
D
 
D
S
 
L
L
 
V
N
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
A
A
 
P
I
 
V
N
 
N
T
 
P
F
 
I
S
 
D
L
 
L
P
 
L
D
 
D
S
 
S
L
 
L
R
 
R
I
 
R
I
 
I
Q
 
E
E
 
G
S
 
F
Y
 
Y
S
 
R
A
 
Q
I
 
V
L
 
H
A
 
A
S
 
A
D
 
G
V
 
T
T
 
L
P
 
P
V
 
L
A
 
S
M
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
S
 
L
I
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
F
R
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
R
K
 
E
Y
 
R
G
 
-
P
 
P
V
 
L
A
 
G
L
 
M
V
 
V
H
 
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
A
 
S
D
|
D
V
 
T
N
 
N
D
 
D
D
 
R
M
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
D
R
 
N
E
 
P
-
 
Y
T
 
T
H
|
H
G
 
G
T
 
T
V
 
P
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
Y
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
L
V
 
D
A
 
P
D
 
L
K
 
R
T
 
T
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
G
 
G
T
 
S
G
 
V
Y
 
Y
G
 
S
A
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
D
K
 
A
E
 
F
A
 
A
Q
 
R
R
 
E
W
 
C
G
 
G
F
 
I
Q
 
R
H
 
V
F
 
I
P
 
H
A
 
M
S
 
E
E
 
E
L
 
F
W
 
V
N
 
E
R
 
L
S
 
G
L
 
V
H
 
E
G
 
A
M
 
T
G
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
V
I
 
V
G
 
G
N
 
A
R
 
G
P
 
P
V
 
T
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Y
 
F
D
|
D
I
 
V
D
|
D
S
 
V
L
 
L
D
 
D
P
|
P
A
 
A
Y
x
F
A
 
A
P
|
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
|
P
E
 
E
I
|
I
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
T
T
 
S
P
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
Q
E
 
Q
L
 
L
I
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
N
 
D
I
 
L
V
 
V
G
 
G
C
 
A
D
 
D
M
 
V
V
 
V
E
|
E
V
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
P
Y
 
F
D
 
D
T
 
V
S
x
G
G
 
G
N
x
A
T
 
T
A
 
A
L
|
L
T
x
V
A
 
G
A
 
A
N
 
T
L
 
M
L
 
M
Y
 
F
E
 
E
L
 
L
L
 
L
C
 
C
V
 
L
L
 
L

P0DJQ3 Proclavaminate amidinohydrolase; Proclavaminic acid amidino hydrolase; EC 3.5.3.22 from Streptomyces clavuligerus (see paper)
43% identity, 93% coverage: 15:306/315 of query aligns to 11:302/313 of P0DJQ3

query
sites
P0DJQ3
R
 
R
F
 
Y
S
 
A
G
 
Q
P
 
I
N
 
P
T
 
T
F
 
F
M
 
M
R
 
R
L
 
L
P
 
P
Q
 
H
A
 
D
T
 
P
S
 
Q
L
 
P
D
 
R
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
V
 
A
P
 
P
M
 
Y
D
 
D
I
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
W
 
Y
R
 
R
S
 
P
G
 
G
T
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
P
K
 
Q
Q
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
S
E
 
E
S
 
S
A
 
G
M
 
L
I
 
I
R
 
H
P
 
G
Y
 
V
N
 
G
M
 
I
T
 
D
S
 
R
G
 
G
A
 
P
A
 
G
P
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
L
L
 
I
N
 
N
I
 
C
G
 
V
D
 
D
I
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
A
 
N
I
 
L
N
 
T
T
 
P
F
 
F
S
 
D
L
 
M
P
 
N
D
 
I
S
 
A
L
 
I
R
 
D
I
 
T
I
 
A
Q
 
Q
E
 
S
S
 
H
Y
 
L
S
 
S
A
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
K
S
 
A
D
 
N
V
 
A
T
 
A
P
 
F
V
 
L
A
 
M
M
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
S
 
S
I
 
L
T
 
T
L
 
V
P
 
A
I
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
Q
Y
 
H
G
 
G
P
 
P
V
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
V
H
 
H
V
 
L
D
|
D
A
 
A
H
|
H
A
 
S
D
|
D
V
 
T
N
 
N
D
 
P
D
 
A
M
 
F
F
 
Y
G
 
G
E
 
G
R
 
R
E
 
Y
T
 
H
H
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
P
F
 
F
R
 
R
R
 
H
A
 
G
Y
 
I
E
 
D
E
 
E
G
 
K
L
 
L
I
 
I
V
 
D
A
 
P
D
 
A
K
 
A
T
 
M
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
G
 
G
T
 
H
G
 
N
Y
 
P
G
 
K
A
 
P
D
 
D
D
 
S
F
 
L
K
 
D
E
 
Y
A
 
A
Q
 
R
R
 
G
W
 
H
G
 
G
F
 
V
Q
 
R
H
 
V
F
 
V
P
 
T
A
 
A
S
 
D
E
 
E
L
 
F
W
 
G
N
 
E
R
 
L
S
 
G
L
 
V
H
 
G
G
 
G
M
 
T
G
 
A
A
 
D
E
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
E
D
 
K
I
 
V
G
 
G
N
 
Q
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Y
 
V
D
|
D
I
 
I
D
|
D
S
 
V
L
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
A
I
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
L
T
 
S
P
 
R
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
C
L
 
V
R
 
G
G
 
D
L
 
L
N
 
K
I
 
P
V
 
V
G
 
G
C
 
F
D
 
D
M
 
V
V
 
M
E
 
E
V
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
L
Y
 
Y
D
 
D
T
 
H
S
 
G
G
 
G
N
 
I
T
 
T
A
 
S
L
 
I
T
 
L
A
 
A
A
 
T
N
 
E
L
 
I
L
 
G
Y
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L

1gq6B Proclavaminate amidino hydrolase from streptomyces clavuligerus (see paper)
43% identity, 93% coverage: 15:306/315 of query aligns to 3:294/301 of 1gq6B

query
sites
1gq6B
R
 
R
F
 
Y
S
 
A
G
 
Q
P
 
I
N
 
P
T
 
T
F
 
F
M
 
M
R
 
R
L
 
L
P
 
P
Q
 
H
A
 
D
T
 
P
S
 
Q
L
 
P
D
 
R
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
V
 
A
P
 
P
M
 
Y
D
 
D
I
 
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
W
 
Y
R
 
R
S
 
P
G
 
G
T
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
P
K
 
Q
Q
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
S
E
 
E
S
 
S
A
 
G
M
 
L
I
 
I
R
 
H
P
 
G
Y
 
V
N
 
G
M
 
I
T
 
D
S
 
R
G
 
G
A
 
P
A
 
G
P
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
L
L
 
I
N
 
N
I
 
C
G
 
V
D
 
D
I
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
A
 
N
I
 
L
N
 
T
T
 
P
F
 
F
S
 
D
L
 
M
P
 
N
D
 
I
S
 
A
L
 
I
R
 
D
I
 
T
I
 
A
Q
 
Q
E
 
S
S
 
H
Y
 
L
S
 
S
A
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
K
S
 
A
D
 
N
V
 
A
T
 
A
P
 
F
V
 
L
A
 
M
M
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
S
 
S
I
 
L
T
 
T
L
 
V
P
 
A
I
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
Q
Y
 
H
G
 
G
P
 
P
V
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
V
H
 
H
V
 
L
D
|
D
A
 
A
H
|
H
A
 
S
D
|
D
V
 
T
N
 
N
D
 
P
D
 
A
M
 
F
F
 
Y
G
 
G
E
 
G
R
 
R
E
 
Y
T
 
H
H
|
H
G
 
G
T
 
T
V
 
P
F
 
F
R
 
R
R
 
H
A
 
G
Y
 
I
E
 
D
E
 
E
G
 
K
L
 
L
I
 
I
V
 
D
A
 
P
D
 
A
K
 
A
T
 
M
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
G
 
G
T
 
H
G
 
N
Y
 
P
G
 
K
A
 
P
D
 
D
D
 
S
F
 
L
K
 
D
E
 
Y
A
 
A
Q
 
R
R
 
G
W
 
H
G
 
G
F
 
V
Q
 
R
H
 
V
F
 
V
P
 
T
A
 
A
S
 
D
E
 
E
L
 
F
W
 
G
N
 
E
R
 
L
S
 
G
L
 
V
H
 
G
G
 
G
M
 
T
G
 
A
A
 
D
E
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
E
D
 
K
I
 
V
G
 
G
N
 
Q
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
Y
 
V
D
|
D
I
 
I
D
|
D
S
 
V
L
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
A
I
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
L
T
 
S
P
 
R
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
C
L
 
V
R
 
G
G
 
D
L
 
L
N
 
K
I
 
P
V
 
V
G
 
G
C
 
F
D
 
D
M
 
V
V
 
M
E
|
E
V
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
L
Y
 
Y
D
 
D
T
 
H
S
 
G
G
 
G
N
 
I
T
 
T
A
 
S
L
 
I
T
 
L
A
 
A
A
 
T
N
 
E
L
 
I
L
 
G
Y
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L

4dz4B X-ray crystal structure of a hypothetical agmatinase from burkholderia thailandensis (see paper)
41% identity, 93% coverage: 16:308/315 of query aligns to 28:314/323 of 4dz4B

query
sites
4dz4B
F
 
Y
S
 
A
G
 
G
P
 
V
N
 
L
T
 
S
F
 
F
M
 
M
R
 
R
L
 
R
P
 
N
Q
 
Y
A
 
T
T
 
R
S
 
D
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
L
D
 
D
I
 
L
G
 
A
T
 
T
S
 
T
W
 
F
R
 
R
S
 
S
G
 
G
T
 
A
R
 
R
F
 
L
G
 
G
P
 
P
K
 
S
Q
 
A
I
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
A
S
 
S
A
 
V
M
 
Q
I
 
L
R
 
A
P
 
E
Y
 
L
N
 
N
-
 
P
M
 
Y
T
 
P
S
 
W
G
 
G
A
 
F
A
 
D
P
 
P
F
 
F
D
 
D
S
 
D
L
 
L
N
 
A
I
 
V
G
 
I
D
 
D
I
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
C
A
 
W
I
 
F
N
 
D
T
 
A
F
 
H
S
 
H
L
 
-
P
 
P
D
 
L
S
 
S
L
 
I
R
 
K
-
 
P
I
 
A
I
 
I
Q
 
V
E
 
E
S
 
H
Y
 
A
S
 
R
A
 
T
I
 
I
L
 
L
A
 
Q
S
 
S
D
 
D
V
 
A
T
 
R
P
 
M
V
 
L
A
 
T
M
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
L
 
Y
P
 
P
I
 
L
L
 
L
R
 
I
A
 
A
V
 
H
A
 
A
E
 
Q
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
-
 
K
P
 
P
V
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
I
H
 
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
A
 
C
D
|
D
V
 
T
N
 
W
D
 
A
D
 
D
M
 
D
F
 
A
G
 
P
E
 
D
R
 
S
E
 
L
T
 
N
H
|
H
G
 
G
T
 
T
V
 
M
F
 
F
R
 
Y
R
 
K
A
 
A
Y
 
V
E
 
K
E
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
D
A
 
P
D
 
K
K
 
A
T
 
S
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
L
 
I
R
 
R
G
 
T
T
 
W
G
 
N
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
D
D
 
D
F
 
Y
K
 
L
E
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
W
 
-
G
 
G
F
 
I
Q
 
N
H
 
V
F
 
L
P
 
D
A
 
A
S
 
A
E
 
W
L
 
V
W
 
H
N
 
E
R
 
H
S
 
G
L
 
A
H
 
R
G
 
A
M
 
T
G
 
L
A
 
E
E
 
R
I
 
I
R
 
E
R
 
S
D
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
V
 
L
S
 
T
Y
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
S
 
C
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
E
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
S
T
 
S
P
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
I
I
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
R
 
G
G
 
G
L
 
V
N
 
N
I
 
L
V
 
I
G
 
G
C
 
A
D
 
D
M
 
V
V
 
V
E
|
E
V
 
V
S
 
A
P
 
P
P
 
A
Y
 
Y
D
 
D
T
 
Q
S
 
S
G
 
E
N
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
H
L
 
V
L
 
A
Y
 
C
E
 
D
L
 
L
L
 
L
C
 
C
V
 
L

7lolA The structure of agmatinase from e. Coli at 1.8 a displaying urea and agmatine (see paper)
41% identity, 86% coverage: 22:291/315 of query aligns to 9:272/294 of 7lolA

query
sites
7lolA
F
 
F
M
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
F
Q
 
Q
A
 
P
T
 
Y
S
 
D
L
 
S
D
 
D
G
 
A
L
 
-
D
 
D
V
 
W
A
 
V
I
 
I
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
F
D
 
D
I
 
M
G
 
A
T
 
T
S
 
S
W
 
G
R
 
R
S
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
K
 
A
Q
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
E
 
V
S
 
S
A
 
T
M
 
N
I
 
L
R
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
H
-
 
N
-
 
R
-
 
F
P
 
P
Y
 
W
N
 
N
M
 
F
T
 
D
S
 
M
G
 
R
A
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
D
 
E
S
 
R
L
 
L
N
 
N
I
 
V
G
 
V
D
 
D
I
 
C
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
V
I
 
Y
N
 
A
T
 
F
F
 
G
S
 
D
L
 
A
P
 
R
D
 
E
S
 
M
L
 
S
R
 
E
I
 
K
I
 
L
Q
 
Q
E
 
A
S
 
H
Y
 
A
S
 
E
A
 
K
I
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
G
V
 
K
T
 
R
P
 
M
V
 
L
A
 
S
M
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
S
 
F
I
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
H
A
 
A
E
 
K
K
 
H
Y
 
F
G
 
G
P
 
K
V
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
V
H
 
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
A
 
T
D
|
D
V
 
T
N
x
Y
D
 
A
D
 
N
M
 
-
F
 
-
G
 
G
E
 
C
R
 
E
E
 
F
T
 
D
H
|
H
G
 
G
T
 
T
V
 
M
F
 
F
R
 
Y
R
 
T
A
 
A
Y
 
P
E
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
D
A
 
P
D
 
N
K
 
H
T
 
S
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
G
 
-
T
 
T
G
 
E
Y
 
F
G
 
D
A
 
K
D
 
D
D
 
N
F
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
W
 
-
G
 
G
F
 
F
Q
 
T
H
 
V
F
 
L
P
 
D
A
 
A
S
 
C
E
 
Q
L
 
V
W
 
N
N
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
V
H
 
D
G
 
D
M
 
V
G
 
I
A
 
A
E
 
Q
I
 
V
R
 
K
R
 
Q
D
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
D
R
 
M
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
L
S
 
T
Y
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
S
 
C
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
E
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
S
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
I
E
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
D
L
 
L
N
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
C
 
M
D
 
D
M
 
V
V
 
V
E
|
E
V
 
V
S
 
A
P
 
P
P
 
A
Y
 
Y
D
 
D
T
 
Q
S
 
S

7lbaB E. Coli agmatinase (see paper)
41% identity, 86% coverage: 22:291/315 of query aligns to 26:289/310 of 7lbaB

query
sites
7lbaB
F
 
F
M
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
F
Q
 
Q
A
 
P
T
 
Y
S
 
D
L
 
S
D
 
D
G
 
A
L
 
-
D
 
D
V
 
W
A
 
V
I
 
I
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
F
D
 
D
I
 
M
G
 
A
T
 
T
S
 
S
W
 
G
R
 
R
S
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
K
 
A
Q
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
E
 
V
S
 
S
A
 
T
M
 
N
I
 
L
R
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
H
-
 
N
-
 
R
-
 
F
P
 
P
Y
 
W
N
 
N
M
 
F
T
 
D
S
 
M
G
 
R
A
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
D
 
E
S
 
R
L
 
L
N
 
N
I
 
V
G
 
V
D
 
D
I
 
C
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
V
I
 
Y
N
 
A
T
 
F
F
 
G
S
 
D
L
 
A
P
 
R
D
 
E
S
 
M
L
 
S
R
 
E
I
 
K
I
 
L
Q
 
Q
E
 
A
S
 
H
Y
 
A
S
 
E
A
 
K
I
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
G
V
 
K
T
 
R
P
 
M
V
 
L
A
 
S
M
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
S
 
F
I
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
H
A
 
A
E
 
K
K
 
H
Y
 
F
G
 
G
P
 
K
V
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
V
H
 
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
A
 
T
D
|
D
V
 
T
N
 
Y
D
 
A
D
 
N
M
 
-
F
 
-
G
 
G
E
 
C
R
 
E
E
 
F
T
 
D
H
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
M
F
 
F
R
 
Y
R
 
T
A
 
A
Y
 
P
E
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
D
A
 
P
D
 
N
K
 
H
T
 
S
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
G
 
-
T
 
T
G
 
E
Y
 
F
G
 
D
A
 
K
D
 
D
D
 
N
F
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
W
 
-
G
 
G
F
 
F
Q
 
T
H
 
V
F
 
L
P
 
D
A
 
A
S
 
C
E
 
Q
L
 
V
W
 
N
N
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
V
H
 
D
G
 
D
M
 
V
G
 
I
A
 
A
E
 
Q
I
 
V
R
 
K
R
 
Q
D
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
D
R
 
M
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
L
S
 
T
Y
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
S
 
C
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
S
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
I
E
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
D
L
 
L
N
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
C
 
M
D
 
D
M
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
P
P
 
A
Y
 
Y
D
 
D
T
 
Q
S
 
S

P60651 Agmatinase; Agmatine ureohydrolase; AUH; EC 3.5.3.11 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
41% identity, 86% coverage: 22:291/315 of query aligns to 19:282/306 of P60651

query
sites
P60651
F
 
F
M
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
F
Q
 
Q
A
 
P
T
 
Y
S
 
D
L
 
S
D
 
D
G
 
A
L
 
-
D
 
D
V
 
W
A
 
V
I
 
I
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
F
D
 
D
I
 
M
G
 
A
T
 
T
S
 
S
W
 
G
R
 
R
S
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
K
 
A
Q
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
E
 
V
S
 
S
A
 
T
M
 
N
I
 
L
R
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
H
-
 
N
-
 
R
-
 
F
P
 
P
Y
 
W
N
 
N
M
 
F
T
 
D
S
 
M
G
 
R
A
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
D
 
E
S
 
R
L
 
L
N
 
N
I
 
V
G
 
V
D
 
D
I
 
C
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
V
I
 
Y
N
 
A
T
 
F
F
 
G
S
 
D
L
 
A
P
 
R
D
 
E
S
 
M
L
 
S
R
 
E
I
 
K
I
 
L
Q
 
Q
E
 
A
S
 
H
Y
 
A
S
 
E
A
 
K
I
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
G
V
 
K
T
 
R
P
 
M
V
 
L
A
 
S
M
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
 
H
S
 
F
I
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
H
A
 
A
E
 
K
K
 
H
Y
 
F
G
 
G
P
 
K
V
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
V
H
 
H
V
 
F
D
 
D
A
 
A
H
 
H
A
 
T
D
 
D
V
 
T
N
 
Y
D
 
A
D
 
N
M
 
-
F
 
-
G
 
G
E
 
C
R
 
E
E
 
F
T
 
D
H
|
H
G
 
G
T
 
T
V
 
M
F
 
F
R
 
Y
R
 
T
A
 
A
Y
 
P
E
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
D
A
 
P
D
 
N
K
 
H
T
 
S
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
G
 
-
T
 
T
G
 
E
Y
 
F
G
 
D
A
 
K
D
 
D
D
 
N
F
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
W
 
-
G
 
G
F
 
F
Q
 
T
H
 
V
F
 
L
P
 
D
A
 
A
S
 
C
E
 
Q
L
 
V
W
 
N
N
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
V
H
 
D
G
 
D
M
 
V
G
 
I
A
 
A
E
 
Q
I
 
V
R
 
K
R
 
Q
D
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
D
R
 
M
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
L
S
 
T
Y
 
F
D
 
D
I
 
I
D
 
D
S
 
C
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
S
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
I
E
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
D
L
 
L
N
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
C
 
M
D
 
D
M
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
P
P
 
A
Y
 
Y
D
 
D
T
 
Q
S
 
S

7loxA The structure of agmatinase from e. Coli at 3.2 a displaying guanidine in the active site (see paper)
40% identity, 86% coverage: 22:291/315 of query aligns to 5:262/284 of 7loxA

query
sites
7loxA
F
 
F
M
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
F
Q
 
Q
A
 
P
T
 
Y
S
 
D
L
 
S
D
 
D
G
 
A
L
 
-
D
 
D
V
 
W
A
 
V
I
 
I
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
F
D
 
D
I
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
-
W
 
-
R
 
-
S
 
A
G
 
G
T
 
G
R
 
R
F
 
H
G
 
G
P
 
P
K
 
A
Q
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
E
 
V
S
 
S
A
 
T
M
 
N
I
 
L
R
 
A
-
 
W
-
 
E
-
 
H
-
 
N
-
 
R
-
 
F
P
 
P
Y
 
W
N
 
N
M
 
F
T
 
D
S
 
M
G
 
R
A
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
D
 
E
S
 
R
L
 
L
N
 
N
I
 
V
G
 
V
D
 
D
I
 
C
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
V
I
 
Y
N
 
A
T
 
F
F
 
G
S
 
D
L
 
A
P
 
R
D
 
E
S
 
M
L
 
S
R
 
E
I
 
K
I
 
L
Q
 
Q
E
 
A
S
 
H
Y
 
A
S
 
E
A
 
K
I
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
G
V
 
K
T
 
R
P
 
M
V
 
L
A
 
S
M
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
S
 
F
I
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
H
A
 
A
E
 
K
K
 
H
Y
 
F
G
 
G
P
 
K
V
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
V
H
 
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
A
x
T
D
|
D
V
 
T
N
x
Y
D
 
A
D
 
N
M
 
-
F
 
-
G
 
G
E
 
C
R
 
E
E
 
F
T
 
D
H
|
H
G
 
G
T
 
T
V
 
M
F
 
F
R
 
Y
R
 
T
A
 
A
Y
 
P
E
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
D
A
 
P
D
 
N
K
 
H
T
 
S
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
G
 
-
T
 
T
G
 
E
Y
 
F
G
 
D
A
 
K
D
 
D
D
 
N
F
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
W
 
-
G
 
G
F
 
F
Q
 
T
H
 
V
F
 
L
P
 
D
A
 
A
S
 
C
E
 
Q
L
 
V
W
 
N
N
 
D
R
 
R
S
 
S
L
 
V
H
 
D
G
 
D
M
 
V
G
 
I
A
 
A
E
 
Q
I
 
V
R
 
K
R
 
Q
D
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
D
R
 
M
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
L
S
 
T
Y
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
S
 
C
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
S
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
I
E
 
K
L
 
L
I
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
L
R
 
K
G
 
D
L
 
L
N
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
C
 
M
D
 
D
M
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
P
P
 
A
Y
 
Y
D
 
D
T
 
Q
S
 
S

7esrA Crystal structure of synechocystis sp pcc6803 guanidinium hydrolase (r32) (see paper)
33% identity, 96% coverage: 8:309/315 of query aligns to 46:354/378 of 7esrA

query
sites
7esrA
I
 
F
S
 
S
G
 
R
N
 
G
D
 
E
L
 
L
A
 
P
R
 
H
F
 
Y
S
 
A
G
 
G
P
 
I
N
 
N
T
 
T
F
 
F
M
 
M
R
 
K
L
 
A
P
 
P
-
 
Y
-
 
L
-
 
E
Q
 
D
A
 
V
T
 
R
S
 
E
L
 
V
D
 
G
G
 
K
L
 
Y
D
 
D
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
M
 
H
D
 
D
I
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
T
W
 
Y
R
 
R
S
 
P
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
G
P
 
P
K
 
Q
Q
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
R
E
 
I
S
 
S
A
 
A
M
 
L
I
 
Y
R
 
T
P
 
P
Y
 
Y
N
 
N
M
 
F
T
 
E
S
 
M
G
 
G
A
 
V
A
 
D
P
 
L
F
 
R
D
 
E
S
 
Q
L
 
I
N
 
S
I
 
L
G
 
C
D
 
D
I
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
I
A
 
-
I
 
-
N
 
-
T
 
-
F
 
F
S
 
T
L
 
I
P
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
N
-
 
E
D
 
K
S
 
S
L
 
F
R
 
D
I
 
Q
I
 
I
Q
 
S
E
 
K
S
 
G
Y
 
I
S
 
A
A
 
H
I
 
I
L
 
F
A
 
S
S
 
S
D
 
G
V
 
A
T
 
F
P
 
P
V
 
I
A
 
I
M
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
D
H
|
H
S
 
S
I
 
I
T
 
G
L
 
F
P
 
P
I
 
T
L
 
V
R
 
R
A
 
G
V
 
I
A
 
C
E
 
R
K
 
H
Y
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
K
P
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
I
V
 
I
H
 
H
V
 
F
D
|
D
A
 
R
H
|
H
A
 
V
D
|
D
V
 
T
N
 
Q
D
 
E
D
 
T
M
 
D
F
 
L
G
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
-
T
 
M
H
 
H
G
 
T
T
 
C
V
 
P
F
 
W
R
 
F
R
 
H
A
 
A
Y
 
T
E
 
N
E
 
M
G
 
A
L
 
N
I
 
A
V
 
P
A
 
A
D
 
K
K
 
N
T
 
L
Y
 
V
Q
 
Q
I
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
G
G
 
G
T
 
W
G
 
Q
Y
 
V
G
 
P
A
 
R
D
 
Q
D
 
G
F
 
V
K
 
K
E
 
V
A
 
C
Q
 
R
R
 
E
W
 
R
G
 
A
F
 
T
Q
 
N
H
 
I
F
 
L
P
 
T
A
 
V
S
 
T
E
 
D
L
 
I
W
 
T
N
 
E
R
 
M
S
 
S
L
 
L
H
 
D
G
 
A
M
 
A
G
 
A
A
 
D
E
 
F
I
 
A
R
 
I
R
 
A
D
 
R
I
 
A
-
 
T
-
 
D
G
 
G
N
 
T
R
 
D
P
 
C
V
 
V
Y
 
W
V
 
I
S
 
S
Y
 
F
D
|
D
I
 
I
D
|
D
S
 
C
L
 
I
D
 
D
P
 
A
A
 
G
Y
 
F
A
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
W
P
 
P
E
 
E
I
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
L
T
 
P
P
 
R
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
Y
L
 
L
I
 
L
-
 
K
R
 
R
A
 
I
L
 
I
R
 
R
G
 
E
L
 
T
N
 
N
I
 
V
V
 
C
G
 
G
C
 
M
D
 
E
M
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
T
 
I
S
 
S
G
 
D
N
 
M
T
 
T
A
 
S
L
 
L
T
 
M
A
 
A
A
 
T
N
 
R
L
 
V
L
 
I
Y
 
C
E
 
D
L
 
T
L
 
M
C
 
A
V
 
H
L
 
L

3lhlA Crystal structure of a putative agmatinase from clostridium difficile
32% identity, 87% coverage: 35:309/315 of query aligns to 6:271/276 of 3lhlA

query
sites
3lhlA
D
 
N
V
 
L
A
 
I
I
 
V
L
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
G
M
 
F
D
 
D
I
 
G
G
 
T
T
 
T
S
 
S
W
 
N
R
 
R
S
 
P
G
 
G
T
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
A
P
 
S
K
 
S
Q
 
S
I
 
M
R
 
R
A
 
K
E
 
E
S
 
F
A
 
Y
M
 
G
I
 
L
R
 
E
P
 
T
Y
 
Y
N
 
-
M
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
S
P
 
P
F
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
L
D
 
E
S
 
D
L
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
C
D
 
D
I
 
Y
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
E
I
 
I
N
 
S
T
 
V
F
 
G
S
 
S
L
 
T
P
 
E
D
 
Q
S
 
V
L
 
L
R
 
K
-
 
E
I
 
I
I
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
S
 
T
Y
 
Y
S
 
K
A
 
I
I
 
V
L
 
R
A
 
D
S
 
S
D
 
K
V
 
V
T
 
-
P
 
P
V
 
F
A
 
M
M
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
E
H
|
H
S
 
L
I
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
A
L
 
F
R
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
H
E
 
E
K
 
K
Y
 
Y
G
 
N
P
 
D
V
 
I
A
 
Y
L
 
V
V
 
I
H
 
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
A
 
T
D
|
D
V
 
L
N
 
R
D
 
E
D
 
E
M
 
Y
F
 
N
G
 
N
E
 
S
R
 
K
E
 
N
T
 
S
H
|
H
G
 
A
T
 
T
V
 
V
F
 
I
R
 
K
R
 
R
A
 
I
Y
 
W
E
 
D
E
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
I
V
 
V
A
 
G
D
 
D
-
 
N
K
 
K
T
 
I
Y
 
F
Q
 
Q
I
 
F
G
 
G
L
 
I
R
 
R
G
 
S
T
 
G
G
 
T
Y
 
K
G
 
E
A
 
E
D
 
F
D
 
K
F
 
F
K
 
A
E
 
T
A
 
E
Q
 
E
R
 
K
W
 
H
G
 
T
F
 
Y
Q
 
M
H
 
E
F
 
I
P
 
G
A
 
G
S
 
I
E
 
D
L
 
T
W
 
F
N
 
E
R
 
N
S
 
I
L
 
V
H
 
N
G
 
M
M
 
L
G
 
N
A
 
G
E
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
N
 
-
R
 
K
P
 
N
V
 
I
Y
 
Y
V
 
L
S
 
T
Y
 
I
D
|
D
I
 
L
D
|
D
S
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
A
A
 
S
Y
 
V
A
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
N
T
 
Y
P
 
R
Q
 
E
A
 
F
L
 
Q
E
 
E
L
 
I
I
 
F
R
 
K
A
 
I
L
 
I
R
 
K
-
 
N
-
 
S
G
 
N
L
 
I
N
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
C
 
C
D
 
D
M
 
I
V
 
V
E
|
E
V
 
L
S
 
S
P
 
P
P
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
S
 
T
G
 
G
N
 
V
T
 
S
A
 
T
L
 
V
T
 
I
A
 
A
A
 
C
N
 
K
L
 
I
L
 
L
Y
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
C
C
 
L
V
 
I
L
 
I

Q57757 Agmatinase; EC 3.5.3.11 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) (see paper)
32% identity, 87% coverage: 37:309/315 of query aligns to 24:283/284 of Q57757

query
sites
Q57757
A
 
V
I
 
I
L
 
F
G
 
S
V
 
I
P
 
P
M
 
Y
D
 
D
I
 
E
G
 
T
T
 
T
S
 
S
W
 
F
R
 
K
S
 
P
G
 
G
T
 
A
R
 
R
F
 
E
G
 
G
P
 
G
K
 
N
Q
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
T
E
 
A
S
 
S
A
 
W
M
 
G
I
 
L
R
 
E
P
 
T
Y
 
Y
N
 
S
M
 
P
T
 
I
S
 
L
G
 
D
A
 
R
A
 
-
P
 
D
F
 
L
D
 
A
S
 
E
L
 
L
N
 
K
I
 
Y
G
x
C
D
 
D
I
 
L
G
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
D
I
 
L
N
 
Y
T
 
G
F
 
-
S
 
S
L
 
Q
P
 
E
D
 
E
S
 
I
L
 
F
R
 
G
I
 
T
I
 
I
Q
 
H
E
 
S
S
 
V
Y
 
S
S
 
R
A
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
K
S
 
E
D
 
N
V
 
K
T
 
K
P
 
I
V
 
I
A
 
V
M
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
E
H
 
H
S
 
S
I
 
I
T
 
T
L
 
Y
P
 
P
I
 
I
L
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
K
E
 
D
K
 
I
Y
 
Y
G
 
D
P
 
D
V
 
F
A
 
I
L
 
V
V
 
I
H
 
Q
V
 
F
D
 
D
A
 
A
H
 
H
A
x
C
D
 
D
V
 
L
N
 
R
D
 
D
D
 
E
M
 
Y
F
 
L
G
 
G
E
 
N
R
 
K
E
 
L
T
 
S
H
 
H
G
 
A
T
x
C
V
 
V
F
 
M
R
 
R
R
 
R
A
 
V
Y
 
Y
E
 
E
E
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
V
 
L
A
 
T
D
 
K
K
 
N
T
 
I
Y
 
F
Q
 
Q
I
 
F
G
 
G
L
 
I
R
 
R
G
 
S
T
 
G
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
D
A
 
K
Q
 
E
R
 
E
W
 
W
G
 
D
F
 
L
Q
 
A
H
 
R
F
 
K
P
 
N
A
 
N
S
 
L
E
 
Y
L
 
L
W
 
K
N
 
M
R
 
D
S
 
L
L
 
M
H
 
N
G
 
K
M
 
D
G
 
D
A
 
L
E
 
E
I
 
Y
R
 
I
R
 
K
D
 
S
I
 
L
G
 
-
N
 
D
R
 
K
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
Y
 
I
D
 
D
I
 
I
D
 
D
S
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
P
G
x
C
G
 
G
L
 
F
T
 
S
T
 
T
P
 
R
Q
 
E
A
 
L
L
 
F
E
 
N
L
 
S
I
 
L
R
 
Y
A
 
L
L
 
L
R
 
E
G
 
E
L
 
V
-
 
K
-
 
D
N
 
K
I
 
I
V
 
I
G
 
G
C
 
F
D
 
D
M
 
I
V
 
V
E
 
E
V
 
V
S
 
S
P
 
P
P
 
I
Y
 
Y
D
 
D
T
 
I
S
 
A
G
 
N
N
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
N
 
K
L
 
I
L
 
A
Y
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
M
C
 
L
V
 
M
L
 
I

1wogA Crystal structure of agmatinase reveals structural conservation and inhibition mechanism of the ureohydrolase superfamily (see paper)
33% identity, 93% coverage: 16:307/315 of query aligns to 7:296/303 of 1wogA

query
sites
1wogA
F
 
Y
S
 
G
G
 
G
P
 
I
N
 
P
T
 
T
F
 
F
M
 
A
R
 
R
L
 
A
P
 
P
Q
 
L
A
 
V
T
 
Q
S
 
P
L
 
-
D
 
D
G
 
G
-
 
D
-
 
W
-
 
Q
L
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
A
I