SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2032 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2032 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:245/250 of query aligns to 4:250/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
R
 
R
R
 
K
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
 
L
S
 
E
A
 
S
L
 
I
T
 
K
E
 
A
L
 
L
G
 
V
N
 
E
L
 
T
A
 
L
Y
 
N
S
 
S
C
 
A
K
 
Q
-
 
L
S
 
D
A
 
P
K
 
N
A
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
A
T
 
I
L
 
Y
L
 
L
-
 
P
Y
 
F
R
 
A
A
 
R
A
 
S
N
 
K
V
 
L
C
 
K
V
 
K
D
 
P
S
 
K
K
 
E
V
 
I
S
 
Q
I
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
D
 
T
A
 
K
T
 
P
Y
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
E
M
 
M
L
 
L
H
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
P
A
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
D
 
I
H
 
F
D
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
T
 
L
V
 
I
R
 
A
A
 
E
K
 
K
A
 
V
K
 
K
T
 
Y
A
 
A
I
 
L
A
 
D
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
K
A
 
V
I
 
I
I
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
M
D
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
A
A
 
R
Q
 
Q
L
 
I
A
 
L
G
 
K
S
 
A
L
 
I
P
 
A
D
 
D
D
 
K
-
 
I
A
 
K
S
 
D
G
 
W
T
 
S
T
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
A
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
N
 
A
D
 
A
M
 
L
R
 
R
A
 
K
S
 
W
L
 
L
V
 
K
K
 
E
R
 
N
F
 
V
G
 
S
G
 
P
E
 
E
T
 
V
A
 
A
N
 
E
A
 
S
I
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
A
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
C
K
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
A
 
K
V
 
Q
A
 
P
H
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
P
D
 
E
F
 
F
A
 
V
P
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
N
A
 
A

P00942 Triosephosphate isomerase; TIM; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
44% identity, 97% coverage: 2:243/250 of query aligns to 3:244/248 of P00942

query
sites
P00942
R
 
R
R
 
T
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
K
S
 
Q
A
 
S
L
 
I
T
 
K
E
 
E
L
 
I
-
 
V
G
 
E
N
 
R
L
 
L
A
 
N
Y
 
T
S
 
A
C
 
S
K
 
I
S
 
P
A
 
E
K
 
N
A
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
I
C
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
Y
L
 
L
Y
 
D
R
 
Y
A
 
S
A
 
V
N
 
S
V
 
L
C
 
V
V
 
K
D
 
K
S
 
P
K
 
Q
V
 
V
S
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
A
H
 
Y
D
 
L
A
 
K
T
 
A
Y
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
N
S
 
S
A
 
V
E
 
D
M
 
Q
L
 
I
H
 
K
D
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
K
A
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
S
D
 
Y
H
 
F
D
 
H
E
 
E
T
 
D
D
 
D
E
 
K
T
 
F
V
 
I
R
 
A
A
 
D
K
 
K
A
 
T
K
 
K
T
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
E
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
N
G
 
A
S
 
V
L
 
L
P
 
E
D
 
E
D
 
V
A
 
K
S
 
D
G
 
W
T
 
T
T
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
L
V
 
A
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
E
Q
 
D
I
 
A
A
 
Q
E
 
D
V
 
I
H
 
H
N
 
A
D
 
S
M
 
I
R
 
R
A
 
K
S
 
F
L
 
L
V
 
A
K
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
D
E
 
K
T
 
A
A
 
A
N
 
S
A
 
E
I
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
A
K
 
N
A
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
K
 
V
E
 
T
I
 
F
F
 
K
A
 
D
V
 
K
A
 
A
H
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
A
 
P
D
 
E
F
 
F
A
 
V
P
 
D
I
 
I
V
 
I

Sites not aligning to the query:

5eywA Crystal structure of litopenaeus vannamei triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
43% identity, 98% coverage: 2:245/250 of query aligns to 1:243/244 of 5eywA

query
sites
5eywA
R
 
R
R
 
K
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
D
A
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
I
T
 
D
E
 
G
L
 
I
G
 
I
N
 
S
L
 
F
A
 
M
Y
 
K
S
 
T
C
 
G
K
 
P
-
 
L
S
 
S
A
 
P
K
 
N
A
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
V
-
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
Q
A
 
C
T
 
Y
L
 
L
L
 
M
Y
 
Y
R
 
T
A
 
R
A
 
E
N
 
H
V
 
M
C
 
-
V
 
-
D
 
P
S
 
A
K
 
N
V
 
I
S
 
G
I
 
I
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
D
 
K
A
 
V
T
 
A
Y
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
L
 
V
H
 
K
D
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
C
T
 
E
A
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
N
D
 
V
H
 
F
D
 
G
E
 
E
T
 
P
D
 
D
E
 
Q
T
 
L
V
 
I
R
 
S
A
 
E
K
 
K
A
 
V
K
 
G
T
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
K
A
 
V
I
 
I
I
 
P
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
N
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
E
A
 
G
G
 
N
K
 
R
T
 
T
L
 
Q
D
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
F
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
G
 
A
S
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
N
D
 
I
A
 
S
S
 
D
G
 
W
T
 
S
T
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
P
 
A
T
 
S
V
 
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
A
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
N
 
A
D
 
D
M
 
L
R
 
R
A
 
Q
S
 
W
L
 
L
V
 
R
K
 
D
R
 
N
F
 
V
G
 
N
G
 
A
E
 
E
T
 
V
A
 
A
N
 
E
A
 
S
I
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
S
A
 
A
S
 
G
N
 
N
A
 
C
K
 
Q
E
 
E
I
 
L
F
 
A
A
 
K
V
 
K
A
 
G
H
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
-
A
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
V
P
 
Q
I
 
I
V
 
I
A
 
N
A
 
A

A0A1L5YRA2 Triosephosphate isomerase; TIM; Allergen Scy p 8; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; Allergen Scy p 8.0101; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Scylla paramamosain (Mud crab) (see paper)
42% identity, 98% coverage: 2:245/250 of query aligns to 5:246/248 of A0A1L5YRA2

query
sites
A0A1L5YRA2
R
 
R
R
 
K
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
D
A
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
I
T
 
D
E
 
G
L
 
I
G
 
I
N
 
S
L
 
F
A
 
M
Y
 
K
S
 
G
C
 
P
K
 
L
S
 
N
A
 
A
K
 
D
A
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
V
-
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
Q
A
 
C
T
 
Y
L
 
L
L
 
M
Y
 
Y
R
 
T
A
 
R
A
 
E
N
 
H
V
 
M
C
 
-
V
 
-
D
 
P
S
 
A
K
 
N
V
 
I
S
 
G
I
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
D
 
K
A
 
T
T
 
A
Y
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
L
 
I
H
 
K
D
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
C
T
 
E
A
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
N
D
 
V
H
 
F
D
 
G
E
 
E
T
 
P
D
 
D
E
 
Q
T
 
L
V
 
I
R
 
S
A
 
E
K
 
K
A
 
V
K
 
G
T
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
K
A
 
V
I
 
I
I
 
P
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
N
 
E
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
N
K
 
R
T
 
T
L
 
E
D
 
E
V
 
V
V
 
V
R
 
F
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
A
 
K
G
 
A
S
 
L
L
 
V
P
 
P
D
 
N
D
 
I
A
 
S
S
 
D
G
 
W
T
 
S
T
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
|
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
|
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
E
Q
|
Q
I
 
A
A
 
Q
E
 
D
V
 
V
H
 
H
N
 
A
D
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
Q
S
 
W
L
 
L
V
 
R
K
 
D
R
 
N
F
 
V
G
 
S
G
 
P
E
 
Q
T
 
V
A
 
A
N
 
E
A
 
S
I
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
S
A
 
A
S
 
G
N
 
N
A
 
C
K
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
A
 
K
V
 
T
A
 
G
H
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
|
K
A
 
-
A
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
V
P
 
T
I
 
I
V
 
I
A
 
N
A
 
A

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
45% identity, 98% coverage: 1:245/250 of query aligns to 1:249/253 of P00943

query
sites
P00943
M
 
M
R
 
R
R
 
K
K
 
P
L
 
I
A
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
x
H
G
x
K
T
 
T
-
 
L
A
 
A
S
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
Q
E
 
F
L
 
V
G
 
E
N
 
D
L
 
V
A
 
K
Y
 
G
S
 
H
C
 
V
K
 
P
S
 
P
A
 
A
K
 
D
A
 
E
E
 
V
V
 
I
-
 
S
L
 
V
I
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
F
T
 
L
L
 
F
L
 
L
Y
 
D
R
 
R
A
 
L
A
 
V
N
 
Q
V
 
A
C
 
A
V
 
D
D
 
G
S
 
T
K
 
D
V
 
L
S
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
T
C
 
M
H
 
H
D
 
F
A
 
A
T
 
D
Y
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
V
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
M
L
 
L
H
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
T
A
 
Y
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
Q
D
 
M
H
 
F
D
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
N
A
 
K
K
 
K
A
 
V
K
 
L
T
 
A
A
 
A
I
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
I
A
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
N
 
E
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
T
 
T
L
 
N
D
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
A
A
 
S
Q
 
Q
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
L
L
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
Q
A
 
V
S
 
K
G
 
-
T
 
-
T
 
Q
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
S
P
 
S
T
 
T
V
 
P
E
 
E
Q
 
D
I
 
A
A
 
N
E
 
S
V
 
V
H
 
C
N
 
G
D
 
H
M
 
I
R
 
R
A
 
S
S
 
V
L
 
V
V
 
S
K
 
R
R
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
P
E
 
E
T
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
S
 
D
N
 
N
A
 
I
K
 
R
E
 
D
I
 
F
F
 
L
A
 
A
V
 
Q
A
 
Q
H
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
P
A
 
A
D
 
S
F
 
F
A
 
L
P
 
Q
I
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
A

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
44% identity, 97% coverage: 1:243/250 of query aligns to 1:247/253 of P27876

query
sites
P27876
M
 
M
R
 
R
R
 
K
K
 
P
L
 
I
A
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
T
 
T
-
 
L
A
 
G
S
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
S
E
 
F
L
 
V
G
 
E
N
 
E
L
 
V
A
 
K
Y
 
S
S
 
S
C
 
I
K
 
P
S
 
A
A
 
A
-
 
D
K
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
V
I
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
L
L
 
F
L
 
L
Y
 
E
R
 
K
A
 
L
A
 
A
N
 
S
V
 
A
C
 
V
V
 
K
D
 
G
S
 
T
K
 
D
V
 
L
S
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
M
H
 
H
D
 
F
A
 
E
T
 
E
Y
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
L
 
L
H
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
D
A
 
Y
V
 
C
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
D
 
M
H
 
F
D
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
N
A
 
K
K
 
K
A
 
A
K
 
H
T
 
A
A
 
A
I
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
I
T
 
V
A
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
N
D
 
D
V
 
L
V
 
V
R
 
A
A
 
D
Q
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
L
L
 
S
P
 
E
D
 
E
D
 
Q
A
 
V
S
 
A
G
 
A
T
 
S
T
 
-
V
 
-
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
S
P
 
S
T
 
T
V
 
A
E
 
K
Q
 
D
I
 
A
A
 
N
E
 
D
V
 
V
H
 
C
N
 
A
D
 
H
M
 
I
R
 
R
A
 
K
S
 
T
L
 
V
V
 
A
K
 
E
R
 
S
F
 
F
G
 
S
G
 
Q
E
 
E
T
 
A
A
 
A
N
 
D
A
 
K
I
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
S
 
A
N
 
N
A
 
I
K
 
K
E
 
E
I
 
Y
F
 
M
A
 
A
V
 
E
A
 
S
H
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
P
A
 
Q
D
 
S
F
 
F
A
 
V
P
 
Q
I
 
L
V
 
L

3ypiA Electrophilic catalysis in triosephosphase isomerase: the role of histidine-95 (see paper)
43% identity, 97% coverage: 2:243/250 of query aligns to 2:243/247 of 3ypiA

query
sites
3ypiA
R
 
R
R
 
T
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
K
S
 
Q
A
 
S
L
 
I
T
 
K
E
 
E
L
 
I
-
 
V
G
 
E
N
 
R
L
 
L
A
 
N
Y
 
T
S
 
A
C
 
S
K
 
I
S
 
P
A
 
E
K
 
N
A
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
I
C
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
Y
L
 
L
Y
 
D
R
 
Y
A
 
S
A
 
V
N
 
S
V
 
L
C
 
V
V
 
K
D
 
K
S
 
P
K
 
Q
V
 
V
S
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
A
H
 
Y
D
 
L
A
 
K
T
 
A
Y
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
N
S
 
S
A
 
V
E
 
D
M
 
Q
L
 
I
H
 
K
D
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
K
A
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
x
Q
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
S
D
 
Y
H
 
F
D
 
H
E
 
E
T
 
D
D
 
D
E
 
K
T
 
F
V
 
I
R
 
A
A
 
D
K
 
K
A
 
T
K
 
K
T
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
E
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
N
G
 
A
S
 
V
L
 
L
P
 
E
D
 
E
D
 
V
A
 
K
S
 
D
G
 
W
T
 
T
T
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
L
V
 
A
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
E
Q
 
D
I
 
A
A
 
Q
E
 
D
V
 
I
H
 
H
N
 
A
D
 
S
M
 
I
R
 
R
A
 
K
S
 
F
L
 
L
V
 
A
K
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
D
E
 
K
T
 
A
A
 
A
N
 
S
A
 
E
I
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
K
 
N
A
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
K
 
V
E
 
T
I
 
F
F
 
K
A
 
D
V
 
K
A
 
A
H
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
A
 
P
D
 
E
F
 
F
A
 
V
P
 
D
I
 
I
V
 
I

4ff7B Structure of c126s mutant of saccharomyces cerevisiae triosephosphate isomerase (see paper)
43% identity, 97% coverage: 2:243/250 of query aligns to 2:243/247 of 4ff7B

query
sites
4ff7B
R
 
R
R
 
T
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
K
S
 
Q
A
 
S
L
 
I
T
 
K
E
 
E
L
 
I
-
 
V
G
 
E
N
 
R
L
 
L
A
 
N
Y
 
T
S
 
A
C
 
S
K
 
I
S
 
P
A
 
E
K
 
N
A
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
I
C
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
Y
L
 
L
Y
 
D
R
 
Y
A
 
S
A
 
V
N
 
S
V
 
L
C
 
V
V
 
K
D
 
K
S
 
P
K
 
Q
V
 
V
S
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
A
H
 
Y
D
 
L
A
 
K
T
x
A
Y
x
S
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
N
S
 
S
A
 
V
E
 
D
M
 
Q
L
 
I
H
 
K
D
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
K
A
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
S
D
 
Y
H
 
F
D
 
H
E
 
E
T
 
D
D
 
D
E
 
K
T
 
F
V
 
I
R
 
A
A
 
D
K
 
K
A
 
T
K
 
K
T
x
F
A
 
A
I
 
L
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
L
C
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
E
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
N
G
 
A
S
 
V
L
 
L
P
 
E
D
 
E
D
 
V
A
 
K
S
 
D
G
 
W
T
 
T
T
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
L
V
 
A
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
E
Q
 
D
I
 
A
A
 
Q
E
 
D
V
 
I
H
 
H
N
 
A
D
 
S
M
 
I
R
 
R
A
 
K
S
 
F
L
 
L
V
 
A
K
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
D
E
 
K
T
 
A
A
 
A
N
 
S
A
 
E
I
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
K
 
N
A
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
K
 
V
E
 
T
I
 
F
F
 
K
A
 
D
V
 
K
A
 
A
H
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
A
 
P
D
 
E
F
 
F
A
 
V
P
 
D
I
 
I
V
 
I

4ff7A Structure of c126s mutant of saccharomyces cerevisiae triosephosphate isomerase (see paper)
43% identity, 97% coverage: 2:243/250 of query aligns to 2:243/247 of 4ff7A

query
sites
4ff7A
R
 
R
R
 
T
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
K
S
 
Q
A
 
S
L
 
I
T
 
K
E
 
E
L
 
I
-
 
V
G
 
E
N
 
R
L
 
L
A
 
N
Y
 
T
S
 
A
C
 
S
K
 
I
S
 
P
A
 
E
K
 
N
A
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
I
C
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
Y
L
 
L
Y
 
D
R
 
Y
A
 
S
A
 
V
N
 
S
V
 
L
C
 
V
V
 
K
D
 
K
S
 
P
K
 
Q
V
 
V
S
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
A
H
 
Y
D
 
L
A
 
K
T
 
A
Y
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
N
S
 
S
A
 
V
E
 
D
M
 
Q
L
 
I
H
 
K
D
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
K
A
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
S
D
 
Y
H
 
F
D
 
H
E
 
E
T
 
D
D
 
D
E
 
K
T
 
F
V
 
I
R
 
A
A
 
D
K
 
K
A
 
T
K
 
K
T
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
T
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
L
C
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
E
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
N
G
 
A
S
 
V
L
 
L
P
 
E
D
 
E
D
 
V
A
 
K
S
 
D
G
 
W
T
 
T
T
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
L
V
 
A
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
E
Q
 
D
I
 
A
A
 
Q
E
 
D
V
 
I
H
 
H
N
 
A
D
 
S
M
 
I
R
 
R
A
 
K
S
 
F
L
 
L
V
 
A
K
 
S
R
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
D
E
 
K
T
 
A
A
 
A
N
 
S
A
 
E
I
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
K
 
N
A
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
K
 
V
E
 
T
I
 
F
F
 
K
A
 
D
V
 
K
A
 
A
H
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
A
 
P
D
 
E
F
 
F
A
 
V
P
 
D
I
 
I
V
 
I

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
45% identity, 98% coverage: 2:245/250 of query aligns to 1:248/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
R
 
R
R
 
K
K
 
P
L
 
I
A
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
H
G
 
K
T
 
T
-
 
L
A
 
A
S
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
Q
E
 
F
L
 
V
G
 
E
N
 
D
L
 
V
A
 
K
Y
 
G
S
 
H
C
 
V
K
 
P
S
 
P
A
 
A
K
 
D
A
 
E
E
 
V
V
 
I
-
 
S
L
 
V
I
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
F
T
 
L
L
 
F
L
 
L
Y
 
D
R
 
R
A
 
L
A
 
V
N
 
Q
V
 
A
C
 
A
V
 
D
D
 
G
S
 
T
K
 
D
V
 
L
S
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
T
C
 
M
H
 
H
D
 
F
A
 
A
T
 
D
Y
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
V
S
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
M
L
 
L
H
 
K
D
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
T
A
 
Y
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
Q
D
 
M
H
 
F
D
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
E
 
E
T
 
T
V
 
V
R
 
N
A
 
K
K
 
K
A
 
V
K
 
L
T
 
A
A
 
A
I
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
I
A
 
P
I
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
N
 
E
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
T
 
T
L
 
N
D
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
A
A
 
S
Q
 
Q
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
L
L
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
Q
A
 
V
S
 
K
G
 
-
T
 
-
T
 
Q
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
S
P
 
S
T
 
T
V
 
P
E
 
E
Q
 
D
I
 
A
A
 
N
E
 
S
V
 
V
H
 
C
N
 
G
D
 
H
M
 
I
R
 
R
A
 
S
S
 
V
L
 
V
V
 
S
K
 
R
R
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
P
E
 
E
T
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
S
 
D
N
 
N
A
 
I
K
 
R
E
 
D
I
 
F
F
 
L
A
 
A
V
 
Q
A
 
Q
H
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
P
A
 
A
D
 
S
F
 
F
A
 
L
P
 
Q
I
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
A

1htiB Crystal structure of recombinant human triosephosphate isomerase at 2.8 angstroms resolution. Triosephosphate isomerase related human genetic disorders and comparison with the trypanosomal enzyme (see paper)
44% identity, 98% coverage: 2:245/250 of query aligns to 4:246/248 of 1htiB

query
sites
1htiB
R
 
R
R
 
K
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
R
A
 
K
S
 
Q
A
 
S
L
 
L
T
 
G
E
 
E
L
 
L
-
 
I
G
 
G
N
 
T
L
 
L
A
 
N
Y
 
A
S
 
A
C
 
K
K
 
V
S
 
P
A
 
A
K
 
D
A
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
-
I
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
P
T
 
T
L
 
A
L
 
Y
Y
 
I
R
 
D
A
 
F
A
 
A
N
 
R
V
 
Q
C
 
K
V
 
L
D
 
D
S
 
P
K
 
K
V
 
I
S
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
D
 
K
A
 
V
T
 
T
Y
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
G
M
 
M
L
 
I
H
 
K
D
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
D
 
V
H
 
F
D
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
T
 
L
V
 
I
R
 
G
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
K
 
A
T
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
N
 
D
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
E
D
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
F
A
 
E
Q
 
Q
L
 
T
A
 
K
G
 
V
S
 
I
L
 
A
P
 
D
D
 
N
D
 
V
A
 
K
S
 
D
G
 
W
T
 
S
T
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
A
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
N
 
E
D
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
G
S
 
W
L
 
L
V
 
K
K
 
S
R
 
N
F
 
V
G
 
S
G
 
D
E
 
A
T
 
V
A
 
A
N
 
Q
A
 
S
I
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
G
S
 
A
N
 
T
A
 
C
K
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
A
 
S
V
 
Q
A
 
P
H
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
A
 
P
D
 
E
F
 
F
A
 
V
P
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
N
A
 
A

4pocB Structure of triosephosphate isomerase wild type human enzyme. (see paper)
44% identity, 98% coverage: 2:245/250 of query aligns to 3:245/247 of 4pocB

query
sites
4pocB
R
 
R
R
 
K
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
R
A
 
K
S
 
Q
A
 
S
L
 
L
T
 
G
E
 
E
L
 
L
-
 
I
G
 
G
N
 
T
L
 
L
A
 
N
Y
 
A
S
 
A
C
 
K
K
 
V
S
 
P
A
 
A
K
 
D
A
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
-
I
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
P
T
 
T
L
 
A
L
 
Y
Y
 
I
R
 
D
A
 
F
A
 
A
N
 
R
V
 
Q
C
 
K
V
 
L
D
 
D
S
 
P
K
 
K
V
 
I
S
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
D
 
K
A
 
V
T
 
T
Y
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
G
M
 
M
L
 
I
H
 
K
D
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
D
 
V
H
 
F
D
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
T
 
L
V
 
I
R
 
G
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
K
 
A
T
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
N
 
D
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
E
D
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
F
A
 
E
Q
 
Q
L
 
T
A
 
K
G
 
V
S
 
I
L
 
A
P
 
D
D
 
N
D
 
V
A
 
K
S
 
D
G
 
W
T
 
S
T
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
A
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
N
 
E
D
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
G
S
 
W
L
 
L
V
 
K
K
 
S
R
 
N
F
 
V
G
 
S
G
 
D
E
 
A
T
 
V
A
 
A
N
 
Q
A
 
S
I
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
G
S
 
A
N
 
T
A
 
C
K
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
A
 
S
V
 
Q
A
 
P
H
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
A
 
P
D
 
E
F
 
F
A
 
V
P
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
N
A
 
A

P60174 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
44% identity, 98% coverage: 2:245/250 of query aligns to 5:247/249 of P60174

query
sites
P60174
R
 
R
R
 
K
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
R
A
 
K
S
 
Q
A
 
S
L
 
L
T
 
G
E
 
E
L
 
L
-
 
I
G
 
G
N
 
T
L
 
L
A
 
N
Y
 
A
S
 
A
C
 
K
K
 
V
S
 
P
A
 
A
K
 
D
A
 
T
E
 
E
V
 
V
L
 
-
I
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
P
T
 
T
L
 
A
L
 
Y
Y
 
I
R
 
D
A
 
F
A
 
A
N
 
R
V
 
Q
C
 
K
V
 
L
D
 
D
S
 
P
K
 
K
V
 
I
S
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
D
 
K
A
 
V
T
 
T
Y
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
G
M
 
M
L
 
I
H
 
K
D
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
D
 
V
H
 
F
D
 
G
E
|
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
T
 
L
V
 
I
R
 
G
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
K
 
A
T
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
x
G
A
 
V
I
 
I
I
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
N
 
D
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
E
D
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
F
A
 
E
Q
 
Q
L
 
T
A
 
K
G
 
V
S
 
I
L
 
A
P
 
D
D
 
N
D
 
V
A
 
K
S
 
D
G
 
W
T
 
S
T
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
A
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
N
 
E
D
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
G
S
 
W
L
 
L
V
 
K
K
 
S
R
 
N
F
 
V
G
 
S
G
 
D
E
 
A
T
 
V
A
 
A
N
 
Q
A
 
S
I
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
A
 
G
S
 
A
N
 
T
A
 
C
K
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
A
 
S
V
 
Q
A
 
P
H
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
A
 
P
D
 
E
F
|
F
A
 
V
P
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
N
A
 
A

6oogA Crystal structure of triosephosphate isomerase from taenia solium in complex with 2pg (see paper)
46% identity, 98% coverage: 1:245/250 of query aligns to 3:250/252 of 6oogA

query
sites
6oogA
M
 
M
R
 
T
R
 
R
K
 
K
L
 
L
-
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
Y
S
 
S
A
 
H
L
 
I
-
 
N
T
 
T
E
 
F
L
 
F
G
 
D
N
 
T
L
 
L
A
 
Q
Y
 
K
S
 
A
C
 
D
K
 
T
S
 
D
A
 
P
K
 
N
A
 
A
E
 
D
V
 
I
L
 
V
I
 
I
C
 
G
P
 
V
P
 
P
A
 
A
T
 
C
L
 
Y
L
 
L
Y
 
K
R
 
Y
A
 
A
A
 
Q
N
 
D
V
 
K
C
 
-
V
 
A
D
 
P
S
 
K
K
 
G
V
 
I
S
 
K
I
 
I
G
 
A
A
 
A
Q
 
E
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
D
 
K
A
 
V
T
 
G
Y
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
T
E
 
E
M
 
M
L
 
I
H
 
K
D
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
C
T
 
E
A
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
D
 
I
H
 
F
D
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
N
E
 
E
T
 
L
V
 
I
R
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
V
K
 
K
T
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
N
A
 
V
I
 
I
I
 
P
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
L
L
 
L
N
 
S
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
N
D
 
D
V
 
V
V
 
C
R
 
F
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
-
 
D
-
 
A
-
 
I
A
 
A
G
 
K
S
 
N
L
 
V
P
 
P
D
 
S
D
 
K
A
 
E
S
 
A
G
 
W
T
 
D
T
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
A
Q
 
Q
I
 
A
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
N
 
K
D
 
V
M
 
V
R
 
R
A
 
D
S
 
W
L
 
I
V
 
R
K
 
K
R
 
H
F
 
V
G
 
D
G
 
A
E
 
G
T
 
I
A
 
A
N
 
D
A
 
K
I
 
V
R
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
A
S
 
S
N
 
N
A
 
A
K
 
K
E
 
D
I
 
L
F
 
G
A
 
T
V
 
Q
A
 
P
H
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
A
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
I
P
 
T
I
 
I
V
 
I
A
 
N
A
 
A

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
42% identity, 94% coverage: 2:237/250 of query aligns to 402:641/654 of P36204

query
sites
P36204
R
 
R
R
 
K
K
 
L
L
 
I
A
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
H
G
 
K
T
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
V
T
 
S
E
 
L
L
 
L
G
 
V
N
 
N
L
 
E
A
 
L
Y
 
H
S
 
D
C
 
V
K
 
K
S
 
-
A
 
-
K
 
E
A
 
F
E
 
E
V
 
I
L
 
V
I
 
V
C
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
F
T
 
T
L
 
A
L
 
L
Y
 
S
R
 
E
A
 
V
A
 
G
N
 
E
V
 
I
C
 
L
V
 
S
D
 
G
S
 
R
K
 
N
V
 
I
S
 
K
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
V
H
 
F
D
 
Y
A
 
E
T
 
D
Y
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
L
M
 
M
L
 
L
H
 
Q
D
 
E
A
 
I
G
 
G
A
 
V
T
 
E
A
 
Y
V
 
V
I
 
I
L
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
R
D
 
I
H
 
F
D
 
K
E
 
E
T
 
D
D
 
D
E
 
E
T
 
F
V
 
I
R
 
N
A
 
R
K
 
K
A
 
V
K
 
K
T
 
A
A
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
K
G
 
G
L
 
M
T
 
T
A
 
P
I
 
I
I
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
E
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
K
 
L
T
 
T
L
 
F
D
 
C
V
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
K
Q
 
Q
L
 
V
A
 
R
G
 
E
S
 
G
L
 
F
P
 
Y
-
 
G
-
 
L
D
 
D
D
 
K
A
 
E
S
 
E
G
 
A
T
 
K
T
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
V
 
V
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
A
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
N
 
A
D
 
F
M
 
I
R
 
R
A
 
K
S
 
L
L
 
L
V
 
S
K
 
E
R
 
M
F
 
Y
G
 
D
G
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
N
 
G
A
 
S
I
 
I
R
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
P
S
 
D
N
 
N
A
 
F
K
 
L
E
 
G
I
 
L
F
 
I
A
 
V
V
 
Q
A
 
K
H
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
S

Sites not aligning to the query:

1r2rB Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase (see paper)
43% identity, 98% coverage: 2:245/250 of query aligns to 3:245/247 of 1r2rB

query
sites
1r2rB
R
 
R
R
 
K
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
R
A
 
K
S
 
K
A
 
N
L
 
L
T
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
I
N
 
T
L
 
T
A
 
L
Y
 
N
S
 
A
C
 
A
K
 
K
S
 
V
A
 
P
K
 
A
A
 
D
E
 
T
V
 
E
L
 
V
I
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
P
T
 
T
L
 
A
L
 
Y
Y
 
I
R
 
D
A
 
F
A
 
A
N
 
R
V
 
Q
C
 
K
V
 
L
D
 
D
S
 
P
K
 
K
V
 
I
S
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
D
 
K
A
 
V
T
 
T
Y
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
G
M
 
M
L
 
I
H
 
K
D
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
D
 
V
H
 
F
D
 
G
E
 
E
T
 
S
D
|
D
E
 
E
T
 
L
V
 
I
R
 
G
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
K
 
A
T
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
N
 
D
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
E
D
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
F
A
 
E
Q
|
Q
L
 
T
A
 
K
G
 
V
S
 
I
L
 
A
P
 
D
D
 
N
D
 
V
A
 
K
S
 
D
G
 
W
T
 
S
T
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
A
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
N
 
E
D
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
G
S
 
W
L
 
L
V
 
K
K
 
S
R
 
N
F
 
V
G
 
S
G
 
D
E
 
A
T
 
V
A
 
A
N
 
Q
A
 
S
I
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
G
S
 
A
N
 
T
A
 
C
K
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
A
 
S
V
 
Q
A
 
P
H
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
A
 
P
D
 
E
F
 
F
A
 
V
P
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
N
A
 
A

4owgA Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-pep complex
43% identity, 98% coverage: 2:245/250 of query aligns to 2:244/246 of 4owgA

query
sites
4owgA
R
 
R
R
 
K
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
R
A
 
K
S
 
K
A
 
N
L
 
L
T
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
I
N
 
T
L
 
T
A
 
L
Y
 
N
S
 
A
C
 
A
K
 
K
S
 
V
A
 
P
K
 
A
A
 
D
E
 
T
V
 
E
L
 
V
I
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
P
T
 
T
L
 
A
L
 
Y
Y
 
I
R
 
D
A
 
F
A
 
A
N
 
R
V
 
Q
C
 
K
V
 
L
D
 
D
S
 
P
K
 
K
V
 
I
S
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
D
 
K
A
 
V
T
 
T
Y
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
G
M
 
M
L
 
I
H
 
K
D
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
D
 
V
H
 
F
D
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
T
 
L
V
 
I
R
 
G
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
K
 
A
T
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
N
 
D
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
E
D
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
F
A
 
E
Q
 
Q
L
 
T
A
 
K
G
 
V
S
 
I
L
 
A
P
 
D
D
 
N
D
 
V
A
 
K
S
 
D
G
 
W
T
 
S
T
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
A
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
N
 
E
D
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
G
S
 
W
L
 
L
V
 
K
K
 
S
R
 
N
F
 
V
G
 
S
G
 
D
E
 
A
T
 
V
A
 
A
N
 
Q
A
 
S
I
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
G
S
 
A
N
 
T
A
 
C
K
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
A
 
S
V
 
Q
A
 
P
H
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
A
 
P
D
 
E
F
 
F
A
 
V
P
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
N
A
 
A

P00939 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Oryctolagus cuniculus (Rabbit) (see 2 papers)
43% identity, 98% coverage: 2:245/250 of query aligns to 5:247/249 of P00939

query
sites
P00939
R
 
R
R
 
K
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
|
N
G
 
G
T
 
R
A
 
K
S
 
K
A
 
N
L
 
L
T
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
I
N
 
T
L
 
T
A
 
L
Y
 
N
S
 
A
C
 
A
K
 
K
S
 
V
A
 
P
K
 
A
A
 
D
E
 
T
V
 
E
L
 
V
I
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
P
T
 
T
L
 
A
L
 
Y
Y
 
I
R
 
D
A
 
F
A
 
A
N
 
R
V
 
Q
C
 
K
V
 
L
D
 
D
S
 
P
K
 
K
V
 
I
S
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
D
 
N
C
 
C
H
 
Y
D
 
K
A
 
V
T
 
T
Y
x
N
G
 
G
A
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
P
E
 
G
M
 
M
L
 
I
H
 
K
D
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
H
D
 
V
H
 
F
D
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
T
 
L
V
 
I
R
 
G
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
K
 
A
T
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
N
 
D
D
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
E
D
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
F
A
 
E
Q
 
Q
L
 
T
A
 
K
G
 
V
S
 
I
L
 
A
P
 
D
D
 
N
D
 
V
A
 
K
S
 
D
G
 
W
T
 
S
T
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
P
 
A
T
 
T
V
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
A
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
N
 
E
D
 
K
M
 
L
R
 
R
A
 
G
S
 
W
L
 
L
V
 
K
K
 
S
R
 
N
F
 
V
G
 
S
G
 
D
E
 
A
T
 
V
A
 
A
N
 
Q
A
 
S
I
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
A
 
G
S
 
A
N
 
T
A
 
C
K
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
A
 
S
V
 
Q
A
 
P
H
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
A
 
P
D
 
E
F
 
F
A
 
V
P
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
N
A
 
A

P17751 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
43% identity, 98% coverage: 2:245/250 of query aligns to 5:247/249 of P17751

query
sites
P17751
R
 
R
R
 
K
K
 
F
L
 
F
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W