SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2033 FitnessBrowser__psRCH2:GFF2033 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q62651 Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial; EC 5.3.3.- from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
48% identity, 97% coverage: 4:264/270 of query aligns to 54:317/327 of Q62651

query
sites
Q62651
Y
 
Y
K
 
E
A
 
S
F
 
I
R
 
Q
V
 
V
E
 
T
L
 
S
A
 
A
D
 
Q
K
 
K
-
 
H
I
 
V
A
 
L
R
 
H
V
 
V
V
 
Q
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
K
 
K
I
 
R
N
 
N
A
 
A
M
 
M
D
 
N
A
 
R
A
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
R
E
 
E
I
 
L
I
 
V
D
 
E
I
 
C
F
 
F
N
 
Q
W
 
K
V
 
I
D
 
S
A
 
K
T
 
D
D
 
S
E
 
D
V
 
C
R
 
R
V
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
K
H
 
M
F
 
F
S
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
I
D
 
D
L
 
L
Q
 
M
L
 
D
L
 
M
A
 
A
S
 
S
-
 
D
V
 
I
G
 
L
S
 
Q
Q
 
P
L
 
P
G
 
G
N
 
D
D
 
D
V
 
V
G
 
A
R
 
R
N
 
I
A
 
A
E
 
W
R
 
Y
L
 
L
R
 
R
R
 
D
K
 
L
I
 
I
L
 
S
S
 
R
L
 
Y
Q
 
Q
A
 
K
S
 
T
F
 
F
N
 
T
A
 
V
V
 
I
D
 
E
H
 
K
C
 
C
R
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Q
 
H
G
 
G
Y
 
G
C
 
C
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
V
D
|
D
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
I
R
 
R
Y
 
Y
S
 
C
T
 
T
A
 
Q
S
 
D
A
 
A
K
 
F
F
 
F
S
 
Q
I
 
V
K
 
K
E
|
E
I
 
V
D
 
D
M
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
A
A
 
A
D
|
D
V
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
K
I
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
-
 
R
G
 
S
M
 
L
M
 
V
R
 
N
E
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
A
R
 
R
T
 
K
I
 
M
D
 
M
G
 
A
E
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
L
S
 
D
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
T
 
V
Y
 
F
A
 
P
D
 
D
Q
 
K
Q
 
D
A
 
V
L
 
M
M
 
L
D
 
N
G
 
A
V
 
A
L
 
F
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
S
R
 
S
K
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
A
I
 
V
R
 
Q
G
 
G
T
 
S
K
 
K
E
 
I
M
 
N
I
 
L
R
 
I
Y
 
Y
M
 
S
R
 
R
D
 
D
H
 
H
R
 
S
V
 
V
D
 
D
D
 
E
G
 
S
L
 
L
E
 
D
Y
 
Y
I
 
M
A
 
A
T
 
T
W
 
W
N
 
N
A
 
M
A
 
S
M
 
M
L
 
L
Q
 
Q
S
 
T
A
 
Q
D
 
D
I
 
I
K
 
I
V
 
K
A
 
S
I
 
V
A
 
Q
A
 
A
H
 
A
M
 
M
S
 
E
K
 
K
Q
 
K

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
29% identity, 99% coverage: 3:268/270 of query aligns to 2:256/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
E
 
E
Y
 
F
K
 
E
A
 
T
F
 
I
R
 
E
V
 
T
E
 
K
L
 
K
A
 
E
D
 
G
K
 
N
I
 
L
A
 
F
R
 
W
V
 
I
V
 
T
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
D
K
|
K
I
x
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
D
 
N
A
 
A
A
 
K
F
 
L
W
 
L
S
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
D
D
 
R
I
 
A
F
 
V
N
 
S
W
 
Q
V
 
A
D
 
E
A
 
S
T
 
D
D
 
P
E
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
K
G
 
G
E
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
C
S
x
A
G
|
G
I
x
A
D
|
D
L
x
I
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
T
Q
 
Q
L
x
F
G
 
N
N
 
Q
D
 
L
V
 
T
G
 
P
R
 
A
N
 
E
A
 
A
E
 
W
R
 
K
L
 
F
R
x
S
R
 
K
K
 
K
I
 
G
L
x
R
S
 
E
L
 
I
Q
 
-
A
 
-
S
 
-
F
 
M
N
 
D
A
 
K
V
 
I
D
 
E
H
 
A
C
 
L
R
 
S
K
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
I
 
I
Q
 
N
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
L
D
x
E
L
 
L
I
 
A
S
 
L
A
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
I
R
 
R
Y
 
I
S
 
A
T
 
A
A
 
E
S
 
E
A
 
A
K
 
Q
F
 
L
S
 
G
I
 
L
K
x
P
E
|
E
I
 
I
D
 
N
M
 
L
G
 
G
M
x
I
A
 
Y
A
x
P
D
x
G
V
 
Y
G
 
G
T
 
G
L
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
G
M
 
R
M
 
A
R
 
L
E
 
E
L
 
M
A
 
M
F
 
M
T
 
T
G
 
G
R
 
D
T
x
R
I
 
I
D
 
P
G
 
G
E
 
K
E
 
D
A
 
A
R
 
E
S
 
K
I
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
R
T
 
V
Y
 
V
A
 
P
D
 
L
Q
 
A
Q
 
N
A
 
-
L
 
L
M
 
E
D
 
Q
G
 
E
V
 
T
L
 
R
E
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
E
D
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
K
K
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
I
A
 
S
I
 
L
R
 
A
G
 
L
T
 
I
K
 
K
E
 
E
M
 
V
I
 
V
R
 
N
Y
 
R
M
 
G
R
 
L
D
 
D
H
 
S
R
 
P
V
 
L
D
 
L
D
 
S
G
 
G
L
 
L
E
x
A
Y
 
L
I
 
E
A
 
S
T
 
V
W
 
G
N
 
W
A
 
G
A
 
V
M
 
V
L
x
F
Q
 
S
S
 
T
A
 
E
D
 
D
I
 
K
K
 
K
V
 
E
A
 
G
I
 
V
A
 
S
A
 
A
H
x
F
M
 
L
S
 
E
K
|
K
Q
 
R
K
 
E
P
 
P
D
 
T
F
 
F

Q4WF54 Mevalonyl-coenzyme A hydratase sidH; Siderophore biosynthesis protein H; EC 4.2.1.- from Aspergillus fumigatus (strain ATCC MYA-4609 / CBS 101355 / FGSC A1100 / Af293) (Neosartorya fumigata) (see paper)
30% identity, 94% coverage: 15:268/270 of query aligns to 21:265/270 of Q4WF54

query
sites
Q4WF54
I
 
I
A
 
L
R
 
L
V
 
L
V
 
T
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
K
 
K
I
 
R
N
 
N
A
 
C
M
 
I
D
 
S
A
 
L
A
 
A
F
 
T
W
 
S
S
 
A
E
 
E
I
 
I
I
 
Q
D
 
R
I
 
L
F
 
W
N
 
T
W
 
W
V
 
F
D
 
D
A
 
T
T
 
Q
D
 
P
E
 
A
V
 
L
R
 
Y
V
 
V
V
 
A
V
 
I
L
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
T
G
 
G
E
 
E
H
 
S
F
 
F
S
 
C
S
 
A
G
 
G
I
 
A
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
L
 
E
L
 
W
A
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
N
D
 
D
V
 
L
G
 
-
R
 
-
N
 
N
A
 
A
E
 
R
R
 
G
L
 
I
R
 
T
R
 
N
K
 
E
I
 
M
L
 
T
S
 
A
L
 
P
Q
 
G
A
 
L
S
 
A
F
 
G
N
 
L
A
 
P
V
 
R
D
 
R
H
 
R
C
 
G
R
 
S
K
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
N
G
 
G
Y
 
Y
C
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
F
D
 
E
L
 
M
I
 
V
S
 
A
A
 
N
C
 
C
D
 
D
M
 
I
R
 
V
Y
 
V
S
 
A
T
 
S
A
 
E
S
 
N
A
 
A
K
 
T
F
 
F
S
 
G
I
 
L
K
 
P
E
 
E
I
 
V
D
 
Q
M
 
R
G
 
G
M
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
S
L
 
L
Q
 
P
R
 
R
L
 
L
P
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
G
D
 
K
G
 
Q
M
 
R
M
 
A
R
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
L
T
 
S
G
 
G
R
 
L
T
 
S
I
 
F
D
 
S
G
 
A
E
 
S
E
 
Q
A
 
L
R
 
E
S
 
R
I
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
R
T
 
V
Y
 
V
A
 
E
D
 
H
Q
 
D
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
M
 
A
D
 
T
G
 
A
V
 
V
L
 
-
E
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
T
D
 
A
I
 
I
A
 
S
R
 
R
K
 
N
S
 
S
P
 
P
V
 
D
A
 
S
I
 
V
R
 
R
G
 
V
T
 
T
K
 
M
E
 
E
M
 
G
I
 
L
R
 
H
Y
 
Y
M
 
G
R
 
W
D
 
E
H
 
M
-
 
A
R
 
S
V
 
V
D
 
E
D
 
E
G
 
A
L
 
S
E
 
S
Y
 
A
I
 
L
A
 
V
-
 
D
T
 
Q
W
 
W
N
 
Y
A
 
A
A
 
K
M
 
L
L
 
M
Q
 
A
S
 
G
A
 
E
D
 
N
I
 
F
K
 
H
V
 
E
A
 
G
I
 
V
A
 
R
A
 
A
H
 
F
M
 
V
S
 
E
K
 
K
Q
 
R
K
 
K
P
 
P
D
 
Q
F
 
W

Sites not aligning to the query:

2vssB Wild-type hydroxycinnamoyl-coa hydratase lyase in complex with acetyl- coa and vanillin (see paper)
31% identity, 88% coverage: 4:240/270 of query aligns to 5:235/247 of 2vssB

query
sites
2vssB
Y
 
W
K
 
K
A
 
T
F
 
V
R
 
K
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
E
D
 
D
K
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
F
V
 
V
V
 
I
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
|
E
K
|
K
I
x
R
N
 
N
A
|
A
M
 
M
D
 
S
A
 
P
A
 
T
F
 
L
W
 
N
S
 
R
E
 
E
I
 
M
I
 
I
D
 
D
I
 
V
F
 
L
N
 
E
W
 
T
V
 
L
D
 
E
A
 
Q
T
 
D
D
 
P
E
 
A
V
 
A
R
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
H
 
A
F
 
W
S
 
T
S
x
A
G
 
G
I
x
M
D
|
D
L
 
L
Q
 
K
L
 
E
L
x
Y
-
 
F
-
 
R
-
 
E
A
 
V
S
x
D
V
 
A
G
 
G
S
 
P
Q
 
E
-
 
I
L
 
L
G
 
Q
N
 
E
D
 
K
V
 
I
G
 
R
R
|
R
N
 
E
A
 
A
E
 
S
R
x
Q
L
 
W
R
 
Q
R
 
W
K
 
K
I
 
L
L
 
L
S
 
R
L
 
M
Q
 
Y
A
 
A
S
 
-
F
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
C
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
I
 
V
Q
 
N
G
 
G
Y
x
W
C
 
C
L
x
F
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
F
D
x
S
L
 
P
I
 
L
S
 
V
A
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
A
Y
 
I
S
 
C
T
 
A
A
 
D
S
 
E
A
 
A
K
 
T
F
 
F
S
 
G
I
 
L
K
x
S
E
|
E
I
 
I
D
 
N
M
 
W
G
 
G
M
x
I
A
 
P
A
x
P
D
x
G
V
 
N
G
 
L
T
 
V
L
 
S
Q
 
K
R
 
A
L
 
M
P
 
A
R
 
D
I
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
H
G
 
R
M
 
Q
M
 
S
R
 
L
E
 
Y
L
 
Y
A
 
I
F
 
M
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
I
 
F
D
 
G
G
 
G
E
 
Q
E
 
K
A
 
A
R
 
A
S
 
E
I
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
E
T
 
S
Y
 
V
A
 
P
D
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
-
L
 
L
M
 
R
D
 
E
G
 
V
V
 
T
L
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
N
I
 
L
A
 
L
R
 
E
K
 
K
S
 
N
P
 
P
V
 
V
A
 
V
I
 
L
R
 
R
G
 
A
T
 
A
K
 
K
E
 
H
M
 
G
I
 
F
R
 
K
Y
 
R
M
 
C
R
 
R
D
 
E
H
 
L
R
 
T
V
 
W
D
 
E
D
 
Q
G
 
N
L
 
E
E
 
D
Y
 
Y
I
 
L

Sites not aligning to the query:

2vssD Wild-type hydroxycinnamoyl-coa hydratase lyase in complex with acetyl- coa and vanillin (see paper)
31% identity, 88% coverage: 4:240/270 of query aligns to 6:236/246 of 2vssD

query
sites
2vssD
Y
 
W
K
 
K
A
 
T
F
 
V
R
 
K
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
E
D
 
D
K
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
F
V
 
V
V
 
I
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
|
E
K
|
K
I
x
R
N
 
N
A
|
A
M
 
M
D
 
S
A
 
P
A
 
T
F
 
L
W
 
N
S
 
R
E
 
E
I
 
M
I
 
I
D
 
D
I
 
V
F
 
L
N
 
E
W
 
T
V
 
L
D
 
E
A
 
Q
T
 
D
D
 
P
E
 
A
V
 
A
R
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
H
 
A
F
 
W
S
 
T
S
x
A
G
 
G
I
x
M
D
|
D
L
|
L
Q
 
K
L
 
E
L
x
Y
-
x
F
-
 
R
-
 
E
A
 
V
S
x
D
V
 
A
G
 
G
S
 
P
Q
 
E
-
 
I
L
 
L
G
 
Q
N
 
E
D
 
K
V
 
I
G
 
R
R
|
R
N
 
E
A
 
A
E
 
S
R
x
Q
L
 
W
R
x
Q
R
 
W
K
 
K
I
 
L
L
 
L
S
 
R
L
 
M
Q
 
Y
A
 
A
S
 
-
F
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
C
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
I
 
V
Q
 
N
G
 
G
Y
x
W
C
 
C
L
x
F
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
F
D
x
S
L
 
P
I
 
L
S
 
V
A
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
A
Y
 
I
S
 
C
T
 
A
A
 
D
S
 
E
A
 
A
K
 
T
F
 
F
S
 
G
I
 
L
K
x
S
E
|
E
I
 
I
D
 
N
M
 
W
G
 
G
M
x
I
A
 
P
A
x
P
D
x
G
V
x
N
G
 
L
T
 
V
L
 
S
Q
 
K
R
 
A
L
 
M
P
 
A
R
 
D
I
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
H
G
 
R
M
 
Q
M
 
S
R
 
L
E
 
Y
L
 
Y
A
 
I
F
 
M
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
I
 
F
D
 
G
G
 
G
E
 
Q
E
 
K
A
 
A
R
 
A
S
 
E
I
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
E
T
 
S
Y
 
V
A
 
P
D
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
-
L
 
L
M
 
R
D
 
E
G
 
V
V
 
T
L
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
N
I
 
L
A
 
L
R
 
E
K
 
K
S
 
N
P
 
P
V
 
V
A
 
V
I
 
L
R
 
R
G
 
A
T
 
A
K
 
K
E
 
H
M
 
G
I
 
F
R
 
K
Y
 
R
M
 
C
R
 
R
D
 
E
H
 
L
R
 
T
V
 
W
D
 
E
D
 
Q
G
 
N
L
 
E
E
 
D
Y
 
Y
I
 
L

Sites not aligning to the query:

O69762 Hydroxycinnamoyl-CoA hydratase-lyase; HCHL; P-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase; Trans-feruloyl-CoA hydratase/vanillin synthase; EC 4.1.2.61 from Pseudomonas fluorescens (see 2 papers)
31% identity, 88% coverage: 4:240/270 of query aligns to 8:238/276 of O69762

query
sites
O69762
Y
 
W
K
 
K
A
 
T
F
 
V
R
 
K
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
E
D
 
D
K
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
F
V
 
V
V
 
I
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
K
|
K
I
 
R
N
 
N
A
 
A
M
 
M
D
 
S
A
 
P
A
 
T
F
 
L
W
 
N
S
 
R
E
 
E
I
 
M
I
 
I
D
 
D
I
 
V
F
 
L
N
 
E
W
 
T
V
 
L
D
 
E
A
 
Q
T
 
D
D
 
P
E
 
A
V
 
A
R
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
H
 
A
F
 
W
S
 
T
S
x
A
G
 
G
I
x
M
D
 
D
L
|
L
Q
 
K
L
 
E
L
x
Y
-
 
F
-
 
R
-
 
E
A
 
V
S
 
D
V
 
A
G
 
G
S
 
P
Q
 
E
-
 
I
L
 
L
G
 
Q
N
 
E
D
 
K
V
 
I
G
 
R
R
 
R
N
 
E
A
 
A
E
 
S
R
 
Q
L
 
W
R
 
Q
R
 
W
K
 
K
I
 
L
L
 
L
S
 
R
L
 
M
Q
 
Y
A
 
A
S
 
-
F
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
C
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
I
 
V
Q
 
N
G
 
G
Y
 
W
C
 
C
L
 
F
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
F
D
x
S
L
 
P
I
 
L
S
 
V
A
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
A
Y
 
I
S
 
C
T
 
A
A
 
D
S
 
E
A
 
A
K
 
T
F
 
F
S
 
G
I
 
L
K
x
S
E
|
E
I
 
I
D
 
N
M
x
W
G
 
G
M
 
I
A
 
P
A
 
P
D
x
G
V
 
N
G
 
L
T
 
V
L
 
S
Q
 
K
R
 
A
L
 
M
P
 
A
R
 
D
I
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
H
G
 
R
M
 
Q
M
 
S
R
 
L
E
 
Y
L
 
Y
A
 
I
F
 
M
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
I
 
F
D
 
G
G
 
G
E
 
Q
E
 
K
A
 
A
R
 
A
S
 
E
I
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
E
T
 
S
Y
 
V
A
 
P
D
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
-
L
 
L
M
 
R
D
 
E
G
 
V
V
 
T
L
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
N
I
 
L
A
 
L
R
 
E
K
 
K
S
 
N
P
 
P
V
 
V
A
 
V
I
 
L
R
 
R
G
 
A
T
 
A
K
 
K
E
 
H
M
 
G
I
 
F
R
 
K
Y
 
R
M
 
C
R
 
R
D
 
E
H
 
L
R
 
T
V
 
W
D
 
E
D
 
Q
G
 
N
L
 
E
E
 
D
Y
 
Y
I
 
L

Sites not aligning to the query:

6l3pA Crystal strcuture of feruloyl-coa hydratase lyase(fchl) complexed with coa
30% identity, 88% coverage: 4:240/270 of query aligns to 7:232/244 of 6l3pA

query
sites
6l3pA
Y
 
W
K
 
T
A
 
T
F
 
V
R
 
K
V
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
E
D
 
A
K
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
W
V
 
V
V
 
T
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
K
|
K
I
x
R
N
 
N
A
|
A
M
 
M
D
 
S
A
 
P
A
 
T
F
 
L
W
 
N
S
 
R
E
 
E
I
 
M
I
 
V
D
 
D
I
 
V
F
 
L
N
 
E
W
 
T
V
 
L
D
 
E
A
 
Q
T
 
D
D
 
A
E
 
D
V
 
A
R
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
H
 
S
F
 
W
S
 
T
S
x
A
G
 
G
I
x
M
D
|
D
L
|
L
Q
 
K
L
 
E
L
x
Y
A
 
F
S
 
R
V
 
-
G
 
E
S
 
E
Q
 
I
L
 
L
G
 
Q
N
 
E
D
 
K
V
 
I
G
 
R
R
|
R
N
 
E
A
 
A
E
 
S
R
x
Q
L
 
W
R
 
Q
R
 
W
K
 
K
I
 
L
L
 
L
S
 
R
L
 
L
Q
 
Y
A
 
A
S
 
-
F
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
-
C
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
I
 
V
Q
 
N
G
 
G
Y
 
W
C
 
C
L
 
F
G
|
G
G
|
G
A
 
G
I
 
F
D
x
S
L
 
P
I
 
L
S
 
V
A
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
A
Y
 
I
S
 
C
T
 
A
A
 
N
S
 
E
A
 
A
K
 
T
F
 
F
S
 
G
I
 
L
K
x
S
E
|
E
I
 
I
D
 
N
M
 
W
G
 
G
M
x
I
A
 
P
A
x
P
D
x
G
V
 
N
G
 
L
T
 
V
L
 
S
Q
 
K
R
 
A
L
 
M
P
 
A
R
 
D
I
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
H
G
 
R
M
 
Q
M
 
S
R
 
L
E
 
Y
L
 
Y
A
 
I
F
 
M
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
I
 
F
D
 
D
G
 
G
E
 
R
E
 
K
A
 
A
R
 
A
S
 
E
I
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
D
T
 
S
Y
 
V
A
 
P
D
 
L
Q
 
A
Q
 
E
A
 
-
L
 
L
M
 
R
D
 
E
G
 
T
V
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
N
I
 
L
A
 
L
R
 
E
K
 
K
S
 
N
P
 
P
V
 
V
A
 
V
I
 
L
R
 
R
G
 
A
T
 
A
K
 
K
E
 
N
M
 
G
I
 
F
R
 
K
Y
 
R
M
 
C
R
 
R
D
 
E
H
 
L
R
 
T
V
 
W
D
 
E
D
 
Q
G
 
N
L
 
E
E
 
D
Y
 
Y
I
 
L

Sites not aligning to the query:

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
28% identity, 98% coverage: 4:268/270 of query aligns to 2:253/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
Y
 
Y
K
 
E
A
 
T
F
 
I
R
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
R
A
 
D
D
 
Q
K
 
R
I
 
V
A
 
G
R
 
I
V
 
I
V
 
T
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
K
 
A
I
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
D
 
N
A
 
S
A
 
Q
F
 
V
W
 
M
S
 
N
E
 
E
I
 
V
I
 
T
D
 
S
I
 
A
F
 
A
N
 
T
W
 
E
V
 
L
D
 
D
A
 
D
T
 
D
D
 
P
E
 
D
V
 
I
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
E
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
A
S
 
A
G
 
G
I
x
A
D
 
D
L
 
I
Q
 
K
L
 
E
L
x
M
A
 
A
S
 
D
V
 
L
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
T
N
 
F
A
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
F
R
x
T
R
 
A
K
 
D
I
 
F
L
x
F
S
 
A
L
 
T
Q
 
W
A
 
G
S
 
K
F
 
L
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
-
H
 
-
C
 
-
R
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
A
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
C
D
x
E
L
 
L
I
 
A
S
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
R
 
L
Y
 
I
S
 
A
T
 
A
A
 
D
S
 
T
A
 
A
K
 
K
F
 
F
S
 
G
I
 
Q
K
x
P
E
|
E
I
 
I
D
 
K
M
 
L
G
 
G
M
x
V
A
 
L
A
x
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
T
 
G
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
A
M
 
K
M
 
A
R
 
M
E
 
D
L
 
L
A
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
M
D
 
D
G
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
E
S
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
T
 
V
Y
 
V
-
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
D
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
M
 
L
D
 
T
G
 
E
V
 
A
L
 
R
E
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
T
D
 
T
I
 
I
A
 
S
R
 
Q
K
 
M
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
A
I
 
A
R
 
R
G
 
M
T
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
A
I
 
V
R
 
N
Y
 
R
M
 
A
R
 
F
D
 
E
H
 
S
R
 
S
V
 
L
D
 
S
D
 
E
G
 
G
L
 
L
E
x
L
Y
 
Y
I
 
E
A
 
R
T
 
R
W
 
L
N
 
F
A
 
H
A
 
S
M
 
A
L
x
F
Q
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
D
I
x
Q
K
 
S
V
 
E
A
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
A
H
 
F
M
 
I
S
 
E
K
 
K
Q
 
R
K
 
A
P
 
P
D
 
Q
F
 
F

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
28% identity, 98% coverage: 4:268/270 of query aligns to 3:254/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
Y
 
Y
K
 
E
A
 
T
F
 
I
R
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
R
A
 
D
D
 
Q
K
 
R
I
 
V
A
 
G
R
 
I
V
 
I
V
 
T
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
Q
K
x
A
I
x
L
N
 
N
A
|
A
M
 
L
D
 
N
A
 
S
A
 
Q
F
 
V
W
 
M
S
 
N
E
 
E
I
 
V
I
 
T
D
 
S
I
 
A
F
 
A
N
 
T
W
 
E
V
 
L
D
 
D
A
 
D
T
 
D
D
 
P
E
 
D
V
 
I
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
E
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
A
S
x
A
G
|
G
I
x
A
D
|
D
L
x
I
Q
x
K
L
 
E
L
x
M
A
 
A
S
 
D
V
 
L
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
T
N
 
F
A
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
F
R
x
T
R
 
A
K
 
D
I
 
F
L
x
F
S
 
A
L
 
T
Q
 
W
A
 
G
S
 
K
F
 
L
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
-
H
 
-
C
 
-
R
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
A
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
A
 
G
I
 
C
D
x
E
L
 
L
I
 
A
S
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
R
 
L
Y
 
I
S
 
A
T
 
A
A
 
D
S
 
T
A
 
A
K
 
K
F
 
F
S
 
G
I
 
Q
K
x
P
E
|
E
I
 
I
D
 
K
M
 
L
G
 
G
M
x
V
A
 
L
A
x
P
D
x
G
V
x
M
G
 
G
T
 
G
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
A
M
 
K
M
 
A
R
 
M
E
 
D
L
 
L
A
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
M
D
 
D
G
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
E
S
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
T
 
V
Y
 
V
-
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
D
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
M
 
L
D
 
T
G
 
E
V
 
A
L
 
R
E
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
T
D
 
T
I
 
I
A
 
S
R
 
Q
K
 
M
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
A
I
 
A
R
 
R
G
 
M
T
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
A
I
 
V
R
 
N
Y
 
R
M
 
A
R
 
F
D
 
E
H
 
S
R
 
S
V
 
L
D
 
S
D
 
E
G
 
G
L
 
L
E
x
L
Y
 
Y
I
 
E
A
 
R
T
 
R
W
 
L
N
 
F
A
 
H
A
 
S
M
 
A
L
x
F
Q
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
D
I
 
Q
K
 
S
V
 
E
A
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
A
H
 
F
M
 
I
S
 
E
K
 
K
Q
 
R
K
 
A
P
 
P
D
 
Q
F
 
F

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
28% identity, 98% coverage: 4:268/270 of query aligns to 3:254/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
Y
 
Y
K
 
E
A
 
T
F
 
I
R
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
R
A
 
D
D
 
Q
K
 
R
I
 
V
A
 
G
R
 
I
V
 
I
V
 
T
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
K
 
A
I
x
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
D
 
N
A
 
S
A
 
Q
F
 
V
W
 
M
S
 
N
E
 
E
I
 
V
I
 
T
D
 
S
I
 
A
F
 
A
N
 
T
W
 
E
V
 
L
D
 
D
A
 
D
T
 
D
D
 
P
E
 
D
V
 
I
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
E
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
A
S
x
A
G
 
G
I
x
A
D
 
D
L
x
I
Q
x
K
L
 
E
L
x
M
A
 
A
S
 
D
V
 
L
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
T
N
 
F
A
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
F
R
x
T
R
 
A
K
 
D
I
 
F
L
x
F
S
 
A
L
 
T
Q
 
W
A
 
G
S
 
K
F
 
L
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
-
H
 
-
C
 
-
R
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
A
G
 
G
Y
|
Y
C
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
C
D
x
E
L
 
L
I
 
A
S
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
R
 
L
Y
 
I
S
 
A
T
 
A
A
 
D
S
 
T
A
 
A
K
 
K
F
 
F
S
 
G
I
 
Q
K
x
P
E
|
E
I
 
I
D
 
K
M
x
L
G
 
G
M
x
V
A
 
L
A
x
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
T
 
G
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
A
M
 
K
M
 
A
R
 
M
E
 
D
L
 
L
A
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
M
D
 
D
G
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
E
S
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
T
 
V
Y
 
V
-
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
D
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
M
 
L
D
 
T
G
 
E
V
 
A
L
 
R
E
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
T
D
 
T
I
 
I
A
 
S
R
 
Q
K
 
M
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
A
I
 
A
R
 
R
G
 
M
T
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
A
I
 
V
R
 
N
Y
 
R
M
 
A
R
 
F
D
 
E
H
 
S
R
 
S
V
 
L
D
 
S
D
 
E
G
 
G
L
 
L
E
x
L
Y
 
Y
I
 
E
A
 
R
T
 
R
W
 
L
N
 
F
A
 
H
A
 
S
M
 
A
L
x
F
Q
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
D
I
 
Q
K
 
S
V
 
E
A
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
A
H
 
F
M
 
I
S
 
E
K
 
K
Q
 
R
K
 
A
P
 
P
D
 
Q
F
 
F

6p5uE Structure of an enoyl-coa hydratase/aldolase isolated from a lignin- degrading consortium (see paper)
29% identity, 87% coverage: 8:241/270 of query aligns to 9:236/246 of 6p5uE

query
sites
6p5uE
R
 
K
V
 
V
E
 
Q
L
 
F
A
 
D
D
 
E
K
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
W
V
 
V
V
 
S
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
D
K
|
K
I
x
R
N
 
N
A
|
A
M
 
M
D
 
S
A
 
P
A
 
T
F
 
L
W
 
N
S
 
R
E
 
E
I
 
M
I
 
L
D
 
Q
I
 
V
F
 
L
N
 
E
W
 
A
V
 
L
D
 
E
A
 
F
T
 
D
D
 
D
E
 
R
V
 
C
R
 
G
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
A
 
E
G
 
G
E
 
D
H
 
S
F
 
F
S
 
S
S
x
A
G
 
G
I
x
M
D
|
D
L
|
L
Q
 
K
L
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
E
V
x
Y
G
 
F
S
 
R
Q
 
E
L
 
T
G
x
D
N
 
N
D
 
A
V
 
P
G
 
A
R
 
L
N
 
I
A
 
K
E
 
A
R
 
Q
L
 
I
R
 
R
R
|
R
K
 
A
I
 
A
L
 
G
S
x
A
L
 
W
Q
 
Q
A
 
-
S
 
-
F
 
W
N
 
R
A
 
K
V
 
L
D
 
R
H
 
F
C
 
Y
R
 
A
K
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
I
 
V
Q
 
N
G
 
G
Y
x
W
C
 
C
L
x
F
G
 
G
G
|
G
A
 
A
I
 
F
D
x
T
L
 
P
I
 
L
S
 
I
A
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
A
Y
 
V
S
 
A
T
 
A
A
 
D
S
 
E
A
 
A
K
 
T
F
 
F
S
 
G
I
 
L
K
x
S
E
|
E
I
 
I
D
 
N
M
x
W
G
 
G
M
x
I
A
 
I
A
x
P
D
x
A
V
 
G
G
 
N
T
 
V
L
 
T
Q
 
K
R
 
A
L
 
V
P
 
S
R
 
Q
I
 
V
I
 
C
G
 
G
D
 
E
G
 
R
M
 
A
M
 
A
R
 
L
E
 
Y
L
 
Y
A
 
I
F
 
M
T
 
S
G
 
G
R
 
E
T
 
P
I
 
F
D
 
G
G
 
G
E
 
Q
E
 
K
A
 
A
R
 
R
S
 
E
I
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
E
T
 
S
Y
 
-
A
 
V
D
 
P
Q
 
L
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
R
D
 
E
G
 
R
V
 
T
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
T
I
 
L
A
 
L
R
 
G
K
 
K
S
 
N
P
 
P
V
 
T
A
 
V
I
 
L
R
 
R
G
 
Q
T
 
A
K
 
K
E
 
H
M
 
A
I
 
L
R
 
R
Y
 
R
M
 
V
R
 
E
D
 
P
H
 
M
R
 
D
V
 
W
D
 
D
D
 
L
G
 
S
L
 
E
E
 
E
Y
 
Y
I
 
L
A
|
A

Sites not aligning to the query:

Q9P4U9 Enoyl-CoA hydratase AKT3-1; AF-toxin biosynthesis protein 3-1; EC 4.2.1.17 from Alternaria alternata (Alternaria rot fungus) (Torula alternata) (see paper)
30% identity, 96% coverage: 12:270/270 of query aligns to 22:270/296 of Q9P4U9

query
sites
Q9P4U9
A
 
A
D
 
D
K
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
V
V
 
I
V
 
V
I
 
L
N
 
A
R
 
R
P
 
S
E
 
Q
K
 
S
I
 
R
N
 
N
A
 
A
M
 
L
D
 
T
A
 
L
A
 
P
F
 
M
W
 
L
S
 
T
E
 
D
I
 
M
I
 
V
D
 
Q
I
 
L
F
 
L
N
 
S
W
 
A
V
 
M
D
 
D
A
 
A
T
 
D
D
 
D
E
 
S
V
 
V
R
 
K
V
 
C
V
 
I
V
 
V
L
 
F
S
 
T
G
 
G
A
 
E
G
 
G
E
 
P
H
 
F
F
 
F
S
 
C
S
 
S
G
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
T
Q
 
E
L
 
G
L
 
F
A
 
G
S
 
E
V
 
I
G
 
G
S
 
K
Q
 
T
L
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
R
N
 
D
A
 
T
E
 
H
R
 
R
L
 
D
R
 
A
R
 
G
K
 
G
I
 
K
L
 
L
S
 
A
L
 
L
Q
 
-
A
 
-
S
 
-
F
 
-
N
 
-
A
 
A
V
 
I
D
 
H
H
 
N
C
 
C
R
 
R
K
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Q
 
N
G
 
G
Y
 
T
C
 
A
L
 
V
G
 
G
G
 
V
A
 
G
I
 
I
D
 
T
L
 
M
I
 
T
S
 
L
A
 
P
C
 
M
D
 
S
M
 
I
R
 
R
Y
 
I
S
 
A
T
 
A
A
 
K
S
 
T
A
 
A
K
 
K
F
 
I
S
 
S
I
 
F
K
 
P
E
 
F
I
 
V
D
 
R
M
 
R
G
 
G
M
 
I
A
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
A
G
 
A
T
 
S
L
 
S
Q
 
F
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
R
 
R
I
 
L
I
 
V
G
 
G
D
 
Y
G
 
G
M
 
R
M
 
A
R
 
L
E
 
H
L
 
L
A
 
F
F
 
T
T
 
T
G
 
G
R
 
A
T
 
L
I
 
Y
D
 
P
G
 
A
E
 
E
E
 
S
A
 
G
R
 
L
S
 
L
I
 
H
G
 
G
L
 
L
V
 
F
N
 
S
R
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
N
D
 
P
Q
 
A
Q
 
S
A
 
S
L
 
T
M
 
L
D
 
P
G
 
R
V
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
A
-
 
V
R
 
N
K
 
A
S
 
S
P
 
Q
V
 
V
A
 
G
I
 
V
R
 
Y
G
 
L
T
 
T
K
 
R
E
 
D
M
 
L
I
 
V
-
 
Y
R
 
R
Y
 
S
M
 
P
R
 
R
D
 
S
H
 
P
R
 
E
V
 
Q
D
 
A
D
 
H
G
 
L
L
 
L
E
 
E
Y
 
S
I
 
A
A
 
A
T
 
L
W
 
Y
N
 
T
A
 
-
A
 
-
M
 
R
L
 
Y
Q
 
Q
S
 
S
A
 
R
D
 
D
I
 
F
K
 
E
V
 
E
A
 
G
I
 
V
A
 
K
A
 
S
H
 
F
M
 
L
S
 
E
K
 
K
Q
 
R
K
 
K
P
 
P
D
 
R
F
 
F
A
 
Q
D
 
D

Sites not aligning to the query:

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
28% identity, 98% coverage: 4:268/270 of query aligns to 2:249/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
Y
 
Y
K
 
E
A
 
T
F
 
I
R
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
R
A
 
D
D
 
Q
K
 
R
I
 
V
A
 
G
R
 
I
V
 
I
V
 
T
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
K
 
A
I
 
L
N
 
N
A
 
A
M
 
L
D
 
N
A
 
S
A
 
Q
F
 
V
W
 
M
S
 
N
E
 
E
I
 
V
I
 
T
D
 
S
I
 
A
F
 
A
N
 
T
W
 
E
V
 
L
D
 
D
A
 
D
T
 
D
D
 
P
E
 
D
V
 
I
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
E
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
A
S
 
A
G
 
G
I
x
A
D
 
D
L
 
I
Q
 
K
L
 
E
L
x
M
A
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
F
A
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
F
R
x
T
R
 
A
K
 
D
I
 
F
L
x
F
S
 
A
L
 
T
Q
 
W
A
 
G
S
 
K
F
 
L
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
-
H
 
-
C
 
-
R
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
Q
 
A
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
C
D
x
E
L
 
L
I
 
A
S
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
R
 
L
Y
 
I
S
 
A
T
 
A
A
 
D
S
 
T
A
 
A
K
 
K
F
 
F
S
 
G
I
 
Q
K
x
P
E
|
E
I
 
I
D
 
K
M
 
L
G
 
G
M
x
V
A
 
L
A
x
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
T
 
G
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
I
 
A
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
A
M
 
K
M
 
A
R
 
M
E
 
D
L
 
L
A
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
M
D
 
D
G
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
E
S
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
T
 
V
Y
 
V
-
 
P
A
 
A
D
 
D
Q
 
D
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
M
 
L
D
 
T
G
 
E
V
 
A
L
 
R
E
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
T
D
 
T
I
 
I
A
 
S
R
 
Q
K
 
M
S
 
S
P
 
A
V
 
S
A
 
A
I
 
A
R
 
R
G
 
M
T
 
A
K
 
K
E
 
E
M
 
A
I
 
V
R
 
N
Y
 
R
M
 
A
R
 
F
D
 
E
H
 
S
R
 
S
V
 
L
D
 
S
D
 
E
G
 
G
L
 
L
E
x
L
Y
 
Y
I
 
E
A
 
R
T
 
R
W
 
L
N
x
F
A
 
H
A
 
S
M
 
A
L
x
F
Q
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
D
I
 
Q
K
 
S
V
 
E
A
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
A
H
x
F
M
 
I
S
 
E
K
 
K
Q
 
R
K
 
A
P
 
P
D
 
Q
F
 
F

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
29% identity, 97% coverage: 7:268/270 of query aligns to 7:258/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
F
 
F
R
 
K
V
 
V
E
 
D
L
 
A
A
 
R
D
 
G
K
 
P
I
 
I
A
 
E
R
 
I
V
 
W
V
 
T
I
 
I
N
 
D
R
 
G
P
 
E
E
x
S
K
x
R
I
x
R
N
 
N
A
|
A
M
 
I
D
 
S
A
 
R
A
 
A
F
 
M
W
 
L
S
 
K
E
 
E
I
 
L
I
 
G
D
 
E
I
 
L
F
 
V
N
 
T
W
 
R
V
 
V
D
 
S
A
 
S
T
 
S
D
 
R
E
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
D
H
 
K
-
 
A
F
 
F
S
 
C
S
x
A
G
 
G
I
x
A
D
|
D
L
|
L
Q
x
K
L
 
E
L
x
R
A
 
A
S
 
T
V
 
M
G
 
A
S
 
E
Q
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
-
E
 
D
R
 
E
L
 
V
R
 
R
R
 
A
K
 
F
I
x
L
L
 
D
S
 
G
L
 
L
Q
x
R
A
 
R
S
 
T
F
 
F
N
 
R
A
 
A
V
 
I
D
 
E
H
 
K
C
 
S
R
 
D
K
 
C
P
 
V
V
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
Q
 
N
G
 
G
Y
 
A
C
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
A
 
G
I
 
T
D
x
E
L
 
L
I
 
A
S
 
L
A
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
R
 
R
Y
 
V
S
 
A
T
 
A
A
 
P
S
 
A
A
 
A
K
 
E
F
 
L
S
 
G
I
 
L
K
x
T
E
|
E
I
 
V
D
 
K
M
x
L
G
 
G
M
x
I
A
 
I
A
x
P
D
x
G
V
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
A
R
 
R
I
 
L
I
 
V
G
 
G
D
 
P
G
 
G
M
 
R
M
 
A
R
 
K
E
 
D
L
 
L
A
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
A
R
 
R
T
x
R
I
 
I
D
 
N
G
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
F
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
A
N
 
N
R
 
R
T
 
-
Y
 
L
A
 
A
D
 
P
Q
 
E
Q
 
G
A
 
H
L
 
L
M
 
L
D
 
A
G
 
V
V
 
A
L
 
Y
E
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
E
D
 
S
I
 
V
A
 
V
R
 
E
K
 
N
S
 
A
P
 
P
V
 
I
A
 
A
I
 
V
R
 
A
G
 
T
T
 
A
K
 
K
E
 
H
M
 
A
I
 
I
R
 
D
Y
 
E
M
 
G
R
 
T
D
 
G
H
 
L
R
 
E
V
 
L
D
 
D
D
 
D
G
 
A
L
 
L
E
x
A
Y
 
L
I
 
E
A
 
L
T
 
R
W
 
K
N
 
Y
A
 
E
A
 
E
M
 
I
L
|
L
Q
 
K
S
 
T
A
 
E
D
 
D
I
 
R
K
 
L
V
 
E
A
 
G
I
 
L
A
 
R
A
 
A
H
 
F
M
 
A
S
 
E
K
 
K
Q
 
R
K
 
A
P
 
P
D
 
V
F
 
Y

Q5LLW6 Methylthioacryloyl-CoA hydratase; EC 4.2.1.155 from Ruegeria pomeroyi (strain ATCC 700808 / DSM 15171 / DSS-3) (Silicibacter pomeroyi) (see paper)
31% identity, 84% coverage: 4:230/270 of query aligns to 9:225/267 of Q5LLW6

query
sites
Q5LLW6
Y
 
Y
K
 
S
A
 
N
F
 
L
R
 
D
V
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
R
D
 
D
K
 
N
-
 
G
I
 
V
A
 
C
R
 
V
V
 
V
V
 
T
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
D
K
|
K
I
x
R
N
 
N
A
 
A
M
 
L
D
 
D
A
 
V
A
 
A
F
 
T
W
 
I
S
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
V
D
 
T
I
 
F
F
 
F
N
 
S
W
 
T
V
 
A
D
 
H
A
 
R
T
 
K
D
 
G
E
 
-
V
 
V
R
 
R
V
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
D
H
 
H
F
 
F
S
 
C
S
x
A
G
 
G
I
x
L
D
 
D
L
|
L
Q
 
V
L
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
E
Q
 
H
L
 
W
G
 
K
N
 
A
D
 
D
V
 
-
G
 
-
R
 
R
N
 
S
A
 
A
E
 
D
R
 
D
L
 
F
R
 
M
R
 
H
K
 
V
I
 
C
L
 
L
S
 
R
L
 
W
Q
 
H
A
 
E
S
 
A
F
 
F
N
 
N
A
 
K
V
 
M
D
 
E
H
 
Y
C
 
G
R
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
L
Q
 
R
G
 
G
Y
 
A
C
 
V
L
 
V
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
L
D
x
E
L
 
L
I
 
A
S
 
S
A
 
A
C
 
A
D
 
H
M
 
L
R
 
R
Y
 
V
S
 
M
T
 
D
A
 
Q
S
 
S
A
 
T
K
 
Y
F
 
F
S
 
A
I
 
L
K
 
P
E
|
E
I
 
G
D
 
Q
M
x
R
G
 
G
M
 
I
A
 
F
A
 
T
D
x
G
V
 
G
G
 
G
T
 
A
L
 
T
Q
 
I
R
 
R
L
 
V
P
 
S
R
 
D
I
 
M
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
Y
M
 
R
M
 
M
R
 
I
E
 
D
L
 
M
A
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
V
I
 
Y
D
 
Q
G
 
G
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
A
S
 
D
I
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
A
N
 
Q
R
 
-
T
 
-
Y
 
Y
A
 
I
D
 
T
Q
 
E
Q
 
G
A
 
S
L
 
S
M
 
F
D
 
D
G
 
K
V
 
A
L
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
D
D
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
S
K
 
N
S
 
L
P
 
P
V
 
L
A
 
T
I
 
N
R
 
F
G
 
A
T
 
I
K
 
C
E
 
S
M
 
A
I
 
I
R
 
S
Y
 
H
M
 
M
R
 
Q
D
 
N

4izdA Crystal structure of dmdd e121a in complex with mmpa-coa (see paper)
31% identity, 84% coverage: 4:230/270 of query aligns to 8:224/253 of 4izdA

query
sites
4izdA
Y
 
Y
K
 
S
A
 
N
F
 
L
R
 
D
V
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
R
D
 
D
K
 
N
-
 
G
I
 
V
A
 
C
R
 
V
V
 
V
V
 
T
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
D
K
|
K
I
x
R
N
 
N
A
|
A
M
 
L
D
 
D
A
 
V
A
 
A
F
 
T
W
 
I
S
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
V
D
 
T
I
 
F
F
 
F
N
 
S
W
 
T
V
 
A
D
 
H
A
 
R
T
 
K
D
 
G
E
 
-
V
 
V
R
 
R
V
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
D
H
 
H
F
 
F
S
 
C
S
x
A
G
 
G
I
x
L
D
|
D
L
|
L
Q
 
V
L
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
E
Q
x
H
L
 
W
G
 
K
N
 
A
D
 
D
V
 
-
G
 
-
R
 
R
N
 
S
A
 
A
E
 
D
R
 
D
L
 
F
R
 
M
R
 
H
K
 
V
I
x
C
L
 
L
S
 
R
L
 
W
Q
x
H
A
 
E
S
 
A
F
 
F
N
 
N
A
 
K
V
 
M
D
 
E
H
 
Y
C
 
G
R
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
L
Q
 
R
G
 
G
Y
 
A
C
 
V
L
 
V
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
L
D
x
A
L
 
L
I
 
A
S
 
S
A
 
A
C
 
A
D
 
H
M
 
L
R
 
R
Y
 
V
S
 
M
T
 
D
A
 
Q
S
 
S
A
 
T
K
 
Y
F
 
F
S
 
A
I
 
L
K
 
P
E
|
E
I
 
G
D
 
Q
M
 
R
G
 
G
M
 
I
A
 
F
A
 
T
D
x
G
V
 
G
G
 
G
T
 
A
L
 
T
Q
 
I
R
 
R
L
 
V
P
 
S
R
 
D
I
 
M
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
Y
M
 
R
M
 
M
R
 
I
E
 
D
L
 
M
A
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
V
I
 
Y
D
 
Q
G
 
G
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
A
S
 
D
I
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
A
N
 
Q
R
 
-
T
 
-
Y
 
Y
A
 
I
D
 
T
Q
 
E
Q
 
G
A
 
S
L
 
S
M
 
F
D
 
D
G
 
K
V
 
A
L
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
D
D
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
S
K
 
N
S
 
L
P
 
P
V
 
L
A
 
T
I
 
N
R
 
F
G
 
A
T
 
I
K
 
C
E
 
S
M
 
A
I
 
I
R
 
S
Y
 
H
M
 
M
R
 
Q
D
 
N

Sites not aligning to the query:

4izcB Crystal structure of dmdd e121a in complex with mta-coa (see paper)
31% identity, 84% coverage: 4:230/270 of query aligns to 8:224/266 of 4izcB

query
sites
4izcB
Y
 
Y
K
 
S
A
 
N
F
 
L
R
 
D
V
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
R
D
 
D
K
 
N
-
 
G
I
 
V
A
 
C
R
 
V
V
 
V
V
 
T
I
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
D
K
|
K
I
x
R
N
 
N
A
|
A
M
 
L
D
 
D
A
 
V
A
 
A
F
 
T
W
 
I
S
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
V
D
 
T
I
 
F
F
 
F
N
 
S
W
 
T
V
 
A
D
 
H
A
 
-
T
 
R
D
 
K
E
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
D
H
 
H
F
 
F
S
 
C
S
x
A
G
 
G
I
x
L
D
|
D
L
|
L
Q
 
V
L
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
E
Q
x
H
L
 
W
G
 
K
N
 
A
D
 
D
V
 
-
G
 
-
R
 
R
N
 
S
A
 
A
E
 
D
R
 
D
L
 
F
R
 
M
R
 
H
K
 
V
I
x
C
L
 
L
S
 
R
L
x
W
Q
x
H
A
 
E
S
 
A
F
 
F
N
 
N
A
 
K
V
 
M
D
 
E
H
 
Y
C
 
G
R
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
L
Q
 
R
G
 
G
Y
 
A
C
 
V
L
 
V
G
 
G
G
|
G
A
 
G
I
 
L
D
x
A
L
 
L
I
 
A
S
 
S
A
 
A
C
 
A
D
 
H
M
 
L
R
 
R
Y
 
V
S
 
M
T
 
D
A
 
Q
S
 
S
A
 
T
K
 
Y
F
 
F
S
 
A
I
 
L
K
x
P
E
|
E
I
 
G
D
 
Q
M
x
R
G
 
G
M
 
I
A
 
F
A
 
T
D
x
G
V
 
G
G
 
G
T
 
A
L
 
T
Q
 
I
R
 
R
L
 
V
P
 
S
R
 
D
I
 
M
I
 
I
G
 
G
D
 
K
G
 
Y
M
 
R
M
 
M
R
 
I
E
 
D
L
 
M
A
 
I
F
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T