SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2133 PS417_10880 alcohol dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

Q47945 Alcohol dehydrogenase (quinone), cytochrome c subunit; ADH; Alcohol dehydrogenase (quinone), subunit II; Cytochrome c-553; Cytochrome c553; Ethanol:Q2 reductase; G3-ADH subunit II; Quinohemoprotein-cytochrome c complex; Ubiquinol oxidase; EC 1.1.5.5 from Gluconobacter oxydans (strain 621H) (Gluconobacter suboxydans) (see paper)
47% identity, 88% coverage: 46:440/447 of query aligns to 40:443/478 of Q47945

query
sites
Q47945
E
 
D
P
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
I
S
 
K
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
D
 
D
C
 
C
V
 
I
A
 
A
C
 
C
H
 
H
S
 
T
L
 
A
A
 
L
G
 
H
K
 
G
A
 
Q
P
 
P
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
I
A
 
K
T
 
S
P
 
P
L
 
I
G
 
G
A
 
T
I
 
I
H
 
Y
A
 
S
T
 
T
N
 
N
I
 
I
T
 
T
P
 
P
D
 
D
K
 
P
S
 
E
T
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
N
Y
 
Y
S
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
F
 
F
D
 
T
R
 
K
A
 
A
V
 
L
R
 
R
H
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
R
P
 
K
G
 
D
G
 
G
R
 
A
R
 
T
L
 
V
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
M
 
M
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
S
 
E
Y
 
F
V
 
A
K
 
R
L
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
D
D
 
D
I
 
I
K
 
R
A
 
A
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
F
 
F
M
 
M
Q
 
H
G
 
G
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
V
N
 
A
Q
 
L
P
 
Q
N
 
N
I
 
K
P
 
A
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
S
W
 
W
P
 
P
L
 
L
N
 
S
M
 
M
R
 
R
W
 
W
P
 
P
I
 
L
A
 
G
L
 
M
W
 
W
N
 
R
G
 
A
V
 
M
F
 
F
A
 
V
P
 
P
T
 
S
A
 
M
T
 
T
Y
 
P
A
 
G
A
 
V
-
 
D
K
 
K
P
 
S
D
 
I
Q
 
S
D
 
D
A
 
P
L
 
E
W
 
V
N
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
E
Y
 
Y
I
 
L
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
 
H
C
 
C
G
 
G
S
 
E
C
 
C
H
 
H
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
L
 
F
A
 
G
F
 
M
N
 
Q
E
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
Y
D
 
G
E
 
T
A
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
N
A
 
A
P
 
Y
F
 
L
L
 
A
A
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
P
L
 
I
D
 
D
G
 
N
W
 
W
Y
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
R
Q
 
S
D
 
N
P
 
S
N
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
W
 
W
S
 
S
E
 
E
P
 
D
Q
 
D
I
 
I
V
 
V
Q
 
T
F
 
F
L
 
L
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
N
 
I
A
 
D
H
 
H
A
 
S
V
 
A
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
S
 
G
M
 
M
T
 
A
E
 
D
A
 
V
F
 
V
N
 
A
N
 
Y
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
F
 
H
M
 
W
Q
 
S
D
 
D
D
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
A
I
 
T
A
 
A
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
S
 
S
L
 
M
P
 
P
G
 
A
D
 
V
P
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
G
Q
 
Q
R
 
D
D
 
D
G
 
G
A
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
-
Y
 
-
Q
 
Q
A
 
T
V
 
T
A
 
A
A
 
L
V
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
G
Q
 
Q
D
 
G
A
 
N
P
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
E
T
 
V
Y
 
Y
A
 
L
T
 
H
R
 
N
C
 
C
A
 
A
S
 
I
C
 
C
H
 
H
G
 
M
L
 
N
D
 
D
G
 
G
K
 
T
G
 
G
Q
 
V
P
 
N
E
 
R
W
 
M
M
 
F
P
 
P
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
N
T
 
P
S
 
V
A
 
V
L
 
I
A
 
T
K
 
D
E
 
D
S
 
P
A
 
T
S
 
S
A
 
L
I
 
A
N
 
N
I
 
V
T
 
V
L
 
A
N
 
F
G
 
G
S
 
G
Q
 
I
R
 
L
V
 
P
V
 
P
A
 
T
S
 
N
G
 
S
V
 
A
P
 
P
D
 
S
A
 
A
Y
 
V
R
 
A
M
 
M
P
 
P
A
 
G
F
 
F
R
 
K
E
 
N
Q
 
H
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
Q
E
 
E
I
 
M
A
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
N
Y
 
F
V
 
M
R
 
R
S
 
K
T
 
G
W
 
W
G
 
G
N
 
N
N
 
N
G
 
A
-
 
P
G
 
G
A
 
T
V
 
V
D
 
S
A
 
A
N
 
S
A
 
D
V
 
I
G
 
Q
K
 
K
L
 
L
R
 
R
G
 
T
H
 
T
T
 
G
D
 
A
P
 
P
A
 
V
S
 
S
S
 
T
S
 
A

Sites not aligning to the query:

8gy2B Cryo-em structure of membrane-bound alcohol dehydrogenase from gluconobacter oxydans
47% identity, 88% coverage: 46:440/447 of query aligns to 2:405/433 of 8gy2B

query
sites
8gy2B
E
 
D
P
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
I
S
 
K
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
D
 
D
C
|
C
V
 
I
A
 
A
C
|
C
H
|
H
S
 
T
L
 
A
A
 
L
G
 
H
K
 
G
A
 
Q
P
 
P
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
|
L
E
 
E
M
 
I
A
 
K
T
 
S
P
|
P
L
 
I
G
 
G
A
 
T
I
 
I
H
 
Y
A
 
S
T
|
T
N
 
N
I
|
I
T
 
T
P
 
P
D
 
D
K
 
P
S
 
E
T
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
N
Y
|
Y
S
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
F
 
F
D
 
T
R
 
K
A
 
A
V
x
L
R
 
R
H
 
K
G
 
G
V
 
I
A
x
R
P
 
K
G
 
D
G
 
G
R
 
A
R
 
T
L
x
V
Y
|
Y
P
|
P
A
 
A
M
|
M
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
S
 
E
Y
x
F
V
 
A
K
 
R
L
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
D
D
 
D
I
 
I
K
 
R
A
 
A
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
F
 
F
M
 
M
Q
 
H
G
 
G
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
V
N
 
A
Q
 
L
P
 
Q
N
 
N
I
 
K
P
 
A
S
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
S
W
 
W
P
 
P
L
 
L
N
 
S
M
 
M
R
|
R
W
 
W
P
 
P
I
x
L
A
 
G
L
 
M
W
|
W
N
 
R
G
 
A
V
 
M
F
 
F
A
 
V
P
 
P
T
 
S
A
 
M
T
 
T
Y
 
P
A
 
G
A
 
V
-
 
D
K
 
K
P
 
S
D
 
I
Q
 
S
D
 
D
A
 
P
L
 
E
W
 
V
N
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
E
Y
 
Y
I
 
L
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
P
 
P
G
 
G
H
|
H
C
|
C
G
 
G
S
x
E
C
|
C
H
|
H
T
 
T
P
 
P
R
|
R
G
 
G
L
 
F
A
 
G
F
 
M
N
 
Q
E
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
Y
D
 
G
E
 
T
A
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
N
A
 
A
P
 
Y
F
 
L
L
 
A
A
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
P
L
x
I
D
 
D
G
 
N
W
 
W
Y
x
I
A
|
A
P
|
P
S
 
S
L
|
L
R
 
R
Q
 
S
D
 
N
P
 
S
N
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
W
|
W
S
 
S
E
 
E
P
 
D
Q
 
D
I
 
I
V
 
V
Q
 
T
F
|
F
L
 
L
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
N
 
I
A
 
D
H
 
H
A
 
S
V
x
A
V
|
V
Y
x
F
G
 
G
S
 
G
M
|
M
T
 
A
E
x
D
A
 
V
F
 
V
N
 
A
N
 
Y
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
F
 
H
M
 
W
Q
 
S
D
 
D
D
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
A
I
 
T
A
 
A
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
S
 
S
L
 
M
P
 
P
G
 
A
D
 
V
P
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
G
Q
 
Q
R
 
D
D
 
D
G
 
G
A
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
-
Y
 
-
Q
 
Q
A
 
T
V
 
T
A
 
A
A
 
L
V
 
L
-
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
G
Q
 
Q
D
 
G
A
 
N
P
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
E
T
 
V
Y
 
Y
A
 
L
T
 
H
R
x
N
C
|
C
A
 
A
S
 
I
C
|
C
H
|
H
G
 
M
L
 
N
D
 
D
G
 
G
K
 
T
G
 
G
Q
 
V
P
 
N
E
 
R
W
x
M
M
x
F
P
|
P
P
 
P
L
|
L
A
 
A
G
 
G
A
 
N
T
x
P
S
 
V
A
 
V
L
 
I
A
 
T
K
 
D
E
 
D
S
 
P
A
 
T
S
 
S
A
 
L
I
 
A
N
 
N
I
 
V
T
 
V
L
 
A
N
 
F
G
 
G
S
x
G
Q
 
I
R
 
L
V
 
P
V
 
P
A
 
T
S
 
N
G
 
S
V
 
A
P
 
P
D
x
S
A
 
A
Y
x
V
R
 
A
M
|
M
P
 
P
A
 
G
F
|
F
R
 
K
E
 
N
Q
 
H
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
Q
E
 
E
I
 
M
A
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
N
Y
 
F
V
x
M
R
 
R
S
 
K
T
 
G
W
 
W
G
 
G
N
 
N
N
 
N
G
 
A
-
 
P
G
 
G
A
 
T
V
 
V
D
 
S
A
 
A
N
 
S
A
 
D
V
 
I
G
 
Q
K
 
K
L
 
L
R
 
R
G
 
T
H
 
T
T
 
G
D
 
A
P
 
P
A
 
V
S
 
S
S
 
T
S
 
A

Sites not aligning to the query:

7w2jC Cryo-em structure of membrane-bound fructose dehydrogenase from gluconobacter japonicus
38% identity, 85% coverage: 50:431/447 of query aligns to 1:386/418 of 7w2jC

query
sites
7w2jC
V
 
I
S
 
S
R
 
R
G
 
G
E
 
H
Y
 
Y
V
 
L
A
 
A
R
 
I
L
 
A
S
 
A
D
 
D
C
|
C
V
 
A
A
 
A
C
|
C
H
|
H
S
 
T
L
 
N
A
 
G
G
 
R
K
 
D
A
 
G
P
 
Q
F
 
F
-
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
E
 
A
M
 
I
A
 
S
T
 
S
P
 
P
L
 
M
G
 
G
A
 
N
I
 
I
H
 
Y
A
 
S
T
|
T
N
 
N
I
|
I
T
 
T
P
 
P
D
 
S
K
 
K
S
 
T
T
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
N
Y
|
Y
S
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
Q
F
 
F
D
 
S
R
 
K
A
 
A
V
 
L
R
 
R
H
 
H
G
 
G
V
 
I
A
 
R
P
 
A
G
 
D
G
 
G
R
 
A
R
 
Q
L
|
L
Y
|
Y
P
 
P
A
|
A
M
|
M
P
 
P
Y
 
Y
P
 
D
S
 
A
Y
 
Y
V
 
N
K
 
R
L
 
L
S
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
K
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
F
 
Y
F
 
I
M
 
M
Q
 
T
G
 
E
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
V
N
 
D
Q
 
A
P
 
P
N
 
S
I
 
P
P
 
K
S
 
T
D
 
Q
I
 
L
P
 
P
W
 
F
P
 
P
L
 
F
N
 
S
M
 
I
R
|
R
W
 
A
P
 
S
I
 
L
A
 
G
L
 
I
W
 
W
N
 
K
-
 
I
G
 
A
V
 
A
F
 
R
A
 
I
P
 
E
T
 
G
A
 
K
T
 
P
Y
 
Y
A
 
V
A
 
F
K
 
D
P
 
H
D
 
T
Q
 
H
D
 
N
A
 
D
L
 
D
W
 
W
N
 
N
R
 
R
G
 
G
A
 
R
Y
 
Y
I
 
L
V
 
V
Q
 
D
G
 
E
P
 
L
G
 
A
H
|
H
C
|
C
G
 
G
S
 
E
C
|
C
H
|
H
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
N
-
 
F
-
 
L
L
 
L
A
 
A
F
 
P
N
 
N
E
 
Q
K
 
S
A
 
A
L
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
D
L
 
I
D
 
G
G
 
S
W
 
W
Y
 
R
A
|
A
P
|
P
S
 
N
L
 
I
R
 
T
Q
 
N
D
 
A
P
 
P
N
 
Q
T
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
S
W
 
W
S
 
S
E
 
D
P
 
Q
Q
 
D
I
 
L
V
 
F
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
K
N
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
V
x
R
V
 
A
Y
 
A
G
 
G
S
x
P
M
|
M
T
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
I
N
 
E
N
 
H
S
 
S
T
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
M
 
L
Q
 
P
D
 
D
D
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
V
R
 
T
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
S
 
S
L
 
V
P
 
P
G
 
A
D
 
K
P
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
V
-
 
A
-
 
N
-
 
F
Q
 
E
R
 
H
D
 
A
G
 
G
A
 
R
P
 
P
W
 
S
Q
 
S
Y
 
Y
Q
 
S
A
 
V
V
 
T
A
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
T
P
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
A
T
 
L
Y
 
Y
A
 
E
T
 
A
R
x
V
C
|
C
A
 
A
S
 
S
C
|
C
H
|
H
G
 
Q
L
 
S
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
S
P
 
K
E
 
D
-
 
G
W
x
Y
M
x
Y
P
|
P
P
 
S
L
|
L
A
 
V
G
 
G
A
x
N
T
|
T
S
x
T
A
 
T
L
 
G
A
 
Q
K
 
L
E
 
N
S
 
P
A
 
N
S
x
D
A
 
L
I
 
I
N
 
A
I
 
S
T
x
I
L
 
L
N
 
Y
G
 
G
S
x
V
Q
 
D
R
|
R
V
 
T
V
 
T
A
 
D
S
 
N
G
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
H
A
 
E
Y
x
I
R
 
L
M
|
M
P
|
P
A
 
A
F
|
F
-
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
S
-
 
L
R
 
V
E
 
Q
Q
 
P
L
 
L
S
 
T
D
 
D
T
 
E
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
T
V
 
I
L
 
A
S
 
D
Y
 
Y
V
 
V
R
 
L
S
 
S
T
 
H
W
 
F
G
 
G
N
 
N
N
 
A
G
 
Q
G
 
A
A
 
T
V
 
V
D
 
S
A
 
A
N
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
K
K
 
Q
L
 
V
R
 
R

8jejC Cryo-em structure of na-dithionite reduced membrane-bound fructose dehydrogenase from gluconobacter japonicus
37% identity, 85% coverage: 50:431/447 of query aligns to 1:400/413 of 8jejC

query
sites
8jejC
V
 
I
S
 
S
R
 
R
G
 
G
E
 
H
Y
 
Y
V
 
L
A
 
A
R
 
I
L
 
A
S
 
A
D
 
D
C
|
C
V
 
A
A
 
A
C
|
C
H
|
H
S
 
T
L
 
N
A
 
G
G
 
R
K
 
D
A
 
G
P
 
Q
F
 
F
-
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
E
 
A
M
 
I
A
 
S
T
 
S
P
 
P
L
x
M
G
 
G
A
 
N
I
 
I
H
 
Y
A
 
S
T
|
T
N
 
N
I
|
I
T
 
T
P
 
P
D
 
S
K
 
K
S
 
T
T
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
N
Y
 
Y
S
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
Q
F
|
F
D
 
S
R
 
K
A
 
A
V
x
L
R
 
R
H
 
H
G
 
G
V
 
I
A
 
R
P
 
A
G
 
D
G
 
G
R
 
A
R
 
Q
L
|
L
Y
|
Y
P
|
P
A
 
A
M
|
M
P
|
P
Y
 
Y
P
 
D
S
 
A
Y
|
Y
V
 
N
K
 
R
L
 
L
S
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
D
I
 
V
K
 
K
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
F
 
Y
F
 
I
M
 
M
Q
 
T
G
 
E
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
V
N
 
D
Q
 
A
P
 
P
N
 
S
I
 
P
P
 
K
S
 
T
D
 
Q
I
 
L
P
 
P
W
 
F
P
 
P
L
 
F
N
 
S
M
 
I
R
|
R
W
 
A
P
x
S
I
 
L
A
 
G
L
 
I
W
|
W
N
 
K
-
 
I
G
 
A
V
 
A
F
 
R
A
 
I
P
 
E
T
 
G
A
 
K
T
 
P
Y
 
Y
A
 
V
A
 
F
K
 
D
P
 
H
D
 
T
Q
 
H
D
 
N
A
 
D
L
 
D
W
 
W
N
 
N
R
 
R
G
 
G
A
 
R
Y
 
Y
I
 
L
V
 
V
Q
 
D
G
 
E
P
 
L
G
 
A
H
 
H
C
|
C
G
 
G
S
 
E
C
|
C
H
|
H
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
N
-
 
F
-
 
L
L
|
L
A
 
A
F
 
P
N
 
N
E
 
Q
K
 
S
A
 
A
L
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
D
L
x
I
D
 
G
G
 
S
W
|
W
Y
 
R
A
|
A
P
|
P
S
 
N
L
x
I
R
 
T
Q
 
N
D
 
A
P
 
P
N
 
Q
T
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
S
W
|
W
S
 
S
E
 
D
P
 
Q
Q
 
D
I
 
L
V
 
F
Q
 
Q
F
x
Y
L
 
L
K
 
K
T
 
T
G
 
G
R
 
K
N
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
V
x
R
V
 
A
Y
 
A
G
 
G
S
 
P
M
|
M
T
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
I
N
 
E
N
 
H
S
 
S
T
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
M
 
L
Q
 
P
D
 
D
D
 
A
D
 
D
L
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
V
R
 
T
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
S
 
S
L
 
V
P
 
P
G
 
A
D
 
K
P
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
V
-
 
A
-
 
N
-
 
F
Q
 
E
R
 
H
D
 
A
G
 
G
A
 
R
P
 
P
W
 
S
Q
 
S
Y
 
Y
Q
 
S
A
 
V
V
 
A
A
 
N
A
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
R
-
 
S
-
 
N
-
 
S
-
 
T
-
 
L
V
 
T
Q
 
K
D
 
T
A
 
T
P
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
A
T
 
L
Y
 
Y
A
 
E
T
 
A
R
x
V
C
|
C
A
 
A
S
 
S
C
|
C
H
|
H
G
 
Q
L
 
S
D
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
S
P
 
K
E
 
D
-
 
G
W
 
Y
M
x
Y
P
|
P
P
 
S
L
|
L
A
 
V
G
 
G
A
 
N
T
|
T
S
x
T
A
 
T
L
 
G
A
 
Q
K
 
L
E
 
N
S
 
P
A
 
N
S
x
D
A
 
L
I
 
I
N
 
A
I
 
S
T
x
I
L
 
L
N
 
Y
G
 
G
S
x
V
Q
 
D
R
|
R
V
 
T
V
 
T
A
 
D
S
 
N
G
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
H
A
 
E
Y
x
I
R
 
L
M
|
M
P
 
P
A
 
A
F
|
F
-
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
S
-
 
L
R
 
V
E
 
Q
Q
 
P
L
 
L
S
 
T
D
 
D
T
 
E
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
T
V
x
I
L
 
A
S
 
D
Y
 
Y
V
 
V
R
 
L
S
 
S
T
 
H
W
 
F
G
 
G
N
 
N
N
 
A
G
 
Q
G
 
A
A
 
T
V
 
V
D
 
S
A
 
A
N
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
K
K
 
Q
L
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

8gy3A Cryo-em structure of membrane-bound aldehyde dehydrogenase from gluconobacter oxydans
34% identity, 87% coverage: 25:414/447 of query aligns to 20:410/440 of 8gy3A

query
sites
8gy3A
A
 
A
W
 
W
Y
 
Y
V
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
P
A
 
A
T
 
I
P
 
A
F
 
P
E
 
I
Q
 
P
E
 
R
Q
 
P
A
 
A
G
 
A
A
 
S
T
 
S
F
 
F
E
 
S
P
 
A
A
 
D
L
 
A
V
 
I
S
 
S
R
 
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
N
L
 
G
S
 
G
D
x
Y
C
|
C
V
 
A
A
x
E
C
|
C
H
|
H
S
 
T
L
 
R
A
 
V
G
 
D
K
 
G
A
 
K
P
 
P
-
 
G
-
 
P
-
 
E
F
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
D
L
 
F
E
 
K
M
 
M
A
 
A
T
|
T
P
 
P
L
x
F
G
 
G
A
 
D
I
 
I
H
 
F
A
 
S
T
x
S
N
 
N
I
|
I
T
 
T
P
 
P
D
 
D
K
 
E
S
 
E
T
 
W
G
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
N
Y
x
W
S
 
S
L
 
L
A
 
A
D
 
A
F
|
F
D
 
K
R
 
R
A
 
A
V
 
M
R
 
N
H
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
P
 
R
G
 
D
G
 
G
R
 
S
R
 
Q
L
|
L
Y
|
Y
P
|
P
A
 
A
M
x
F
P
 
P
Y
 
F
P
 
D
S
 
H
Y
x
F
V
 
T
K
 
K
L
 
V
S
 
S
D
 
D
D
 
Q
D
 
D
I
 
V
K
 
S
A
 
D
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
F
 
Y
F
 
L
M
 
M
Q
 
-
G
 
-
I
 
T
K
 
R
P
 
P
A
 
A
N
 
V
Q
 
H
P
 
L
N
 
K
I
 
-
P
 
P
S
 
R
D
 
D
-
 
N
-
 
T
I
 
V
P
 
P
W
 
F
P
 
P
L
x
I
N
 
N
M
 
I
R
|
R
W
 
L
P
 
I
-
x
G
I
x
Q
A
 
G
L
x
F
W
|
W
N
 
K
G
 
L
V
 
L
F
 
F
A
 
F
P
 
T
T
 
P
A
 
G
T
 
R
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
N
K
 
D
P
 
P
D
 
K
Q
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
Q
W
 
W
N
 
N
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
V
 
A
Q
 
E
G
 
G
P
 
N
G
 
E
H
|
H
C
|
C
G
 
G
S
 
A
C
|
C
H
|
H
T
 
T
P
 
P
R
|
R
G
 
N
L
 
L
A
x
L
F
 
G
N
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
M
L
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
S
P
 
S
F
 
V
L
 
Y
A
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
V
L
 
I
D
 
D
G
 
G
W
 
W
Y
 
I
A
|
A
P
|
P
S
 
P
L
|
L
R
 
-
Q
 
N
D
 
D
P
 
H
N
 
N
T
 
P
G
 
T
L
 
P
G
 
V
R
 
V
W
|
W
S
 
T
E
 
E
P
 
D
Q
 
E
I
 
L
V
 
F
Q
 
Q
F
x
Y
L
|
L
K
 
R
T
 
F
G
 
G
R
 
V
N
 
A
-
 
P
A
 
L
H
 
H
A
x
G
V
x
S
V
 
A
Y
 
A
G
 
G
S
 
P
M
|
M
T
 
S
E
 
P
A
 
V
F
 
P
N
 
H
N
 
R
S
 
F
T
 
L
Q
 
S
F
 
K
M
 
I
Q
 
P
D
 
E
D
 
E
D
 
D
L
 
V
A
 
H
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
H
Y
 
Y
L
x
Y
K
 
A
S
 
D
L
 
V
P
 
D
G
 
K
D
 
A
P
 
A
Q
 
Q
R
 
R
-
 
S
-
 
S
-
 
G
D
 
D
G
 
Q
A
 
A
P
 
A
W
 
I
Q
 
T
Y
 
R
Q
 
A
A
 
M
V
 
Q
A
 
M
A
 
S
V
 
G
Q
 
R
D
 
D
A
 
L
P
 
T
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
D
A
 
A
H
 
R
T
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
T
 
G
R
 
A
C
|
C
A
 
G
S
 
A
C
|
C
H
|
H
G
 
Y
L
 
N
D
 
S
G
 
G
K
 
P
G
 
N
Q
 
P
P
 
V
E
 
L
W
 
G
M
 
R
P
|
P
P
 
E
L
|
L
A
 
A
G
 
L
A
x
N
T
x
N
S
 
A
A
 
L
L
 
W
A
 
L
K
 
D
E
 
E
S
 
P
A
 
N
S
 
N
A
 
L
I
 
Y
N
 
Q
I
x
V
T
 
M
L
 
L
N
 
H
G
 
G
S
 
-
Q
 
-
R
 
-
V
x
I
V
 
T
A
 
A
S
 
E
G
 
E
V
x
G
P
x
Q
D
 
D
A
 
H
Y
x
I
R
 
S
M
|
M
P
 
P
A
 
S
F
|
F
R
 
Y
E
 
S
Q
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
H
E
 
D
I
 
M
A
 
A
E
 
R
V
 
I
L
 
A
S
 
A
Y
 
Y
V
 
L
R
 
R
S
 
R
T
 
T

8hddB Complex structure of catalytic, small, and a partial electron transfer subunits from burkholderia cepacia fad glucose dehydrogenase
35% identity, 28% coverage: 308:431/447 of query aligns to 1:121/121 of 8hddB

query
sites
8hddB
G
 
G
D
 
K
P
 
P
Q
 
A
R
 
E
D
 
D
G
 
G
A
 
L
P
 
K
W
 
L
Q
 
R
Y
 
G
Q
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
S
V
 
S
Q
 
G
D
 
I
A
 
D
P
 
P
G
 
-
A
 
A
H
 
R
T
 
L
Y
 
Y
A
 
L
T
 
G
R
 
N
C
|
C
A
 
A
S
 
T
C
|
C
H
|
H
G
 
Q
L
 
M
D
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
D
-
 
G
W
 
Y
M
x
Y
P
|
P
P
 
S
L
 
L
A
 
F
G
 
H
A
 
N
T
 
S
S
x
T
A
 
V
L
 
G
A
 
A
K
 
S
E
 
N
S
 
P
A
 
S
S
 
N
A
 
L
I
 
V
N
 
Q
I
x
V
T
x
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
S
 
V
Q
 
Q
R
|
R
V
 
K
V
 
I
A
 
G
S
 
S
G
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
E
A
 
D
Y
x
I
R
 
G
M
|
M
P
|
P
A
 
A
F
 
F
R
 
R
E
 
Y
Q
 
D
L
 
L
S
 
N
D
 
D
T
 
A
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
A
V
 
L
L
 
T
S
 
N
Y
 
Y
V
 
V
R
 
T
S
 
A
T
 
Q
W
 
F
G
 
G
N
 
N
N
 
P
G
 
A
G
 
A
A
 
K
V
 
V
D
 
T
A
 
E
N
 
Q
A
 
D
V
 
V
G
 
A
K
 
K
L
 
L
R
 
R

6fjaA Crystal structure of t2d three-domain heme-cu nitrite reductase from ralstonia pickettii
38% identity, 24% coverage: 325:431/447 of query aligns to 345:452/455 of 6fjaA

query
sites
6fjaA
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
A
 
Q
-
 
V
-
 
Q
P
 
A
G
 
G
A
 
R
H
 
A
T
 
L
Y
 
F
A
 
A
T
 
G
R
x
T
C
|
C
A
 
S
S
 
V
C
|
C
H
|
H
G
 
Q
L
 
G
D
 
N
G
 
G
K
 
A
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
W
 
V
M
 
F
P
|
P
P
|
P
L
|
L
A
 
A
G
 
-
A
 
K
T
 
S
S
 
D
A
x
F
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
D
S
 
P
A
 
K
S
 
R
A
 
A
I
 
M
N
 
N
I
 
I
T
 
V
L
 
L
N
 
H
G
 
G
-
 
L
S
x
N
Q
x
G
R
 
K
V
 
I
V
 
K
A
 
V
S
 
N
G
 
G
V
 
Q
P
 
E
D
x
Y
A
 
D
Y
x
S
R
 
V
M
|
M
P
 
P
A
 
P
F
x
M
R
 
T
E
 
-
Q
 
Q
L
 
L
S
 
N
D
 
D
T
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
N
V
 
I
L
 
L
S
 
T
Y
 
Y
V
 
V
R
 
L
S
 
N
T
 
S
W
 
W
G
 
D
N
 
N
N
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
R
V
 
V
D
 
S
A
 
A
N
 
E
A
 
D
V
 
V
G
 
K
K
 
K
L
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4ax3D Structure of three-domain heme-cu nitrite reductase from ralstonia pickettii at 1.6 a resolution (see paper)
38% identity, 24% coverage: 325:431/447 of query aligns to 348:455/457 of 4ax3D

query
sites
4ax3D
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
A
 
Q
-
 
V
-
 
Q
P
 
A
G
 
G
A
 
R
H
 
A
T
 
L
Y
 
F
A
 
A
T
 
G
R
 
T
C
|
C
A
 
S
S
 
V
C
|
C
H
|
H
G
 
Q
L
 
G
D
 
N
G
 
G
K
 
A
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
W
 
V
M
 
F
P
|
P
P
|
P
L
|
L
A
 
A
G
 
-
A
 
K
T
x
S
S
 
D
A
x
F
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
D
S
 
P
A
 
K
S
 
R
A
 
A
I
 
M
N
 
N
I
 
I
T
 
V
L
 
L
N
 
H
G
 
G
-
 
L
S
x
N
Q
x
G
R
 
K
V
 
I
V
 
K
A
 
V
S
 
N
G
 
G
V
 
Q
P
 
E
D
 
Y
A
 
D
Y
x
S
R
 
V
M
|
M
P
 
P
A
 
P
F
x
M
R
 
T
E
 
-
Q
 
Q
L
 
L
S
 
N
D
 
D
T
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
N
V
 
I
L
 
L
S
 
T
Y
 
Y
V
 
V
R
 
L
S
 
N
T
 
S
W
 
W
G
 
D
N
 
N
N
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
R
V
 
V
D
 
S
A
 
A
N
 
E
A
 
D
V
 
V
G
 
K
K
 
K
L
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5oboA Crystal structure of nitrite bound d97n mutant of three-domain heme-cu nitrite reductase from ralstonia pickettii
38% identity, 24% coverage: 325:431/447 of query aligns to 346:453/456 of 5oboA

query
sites
5oboA
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
A
 
Q
-
 
V
-
 
Q
P
 
A
G
 
G
A
 
R
H
 
A
T
 
L
Y
 
F
A
 
A
T
 
G
R
x
T
C
|
C
A
 
S
S
 
V
C
|
C
H
|
H
G
 
Q
L
 
G
D
 
N
G
 
G
K
 
A
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
G
W
 
V
M
 
F
P
|
P
P
|
P
L
|
L
A
 
A
G
 
-
A
 
K
T
x
S
S
 
D
A
x
F
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
D
S
 
P
A
 
K
S
 
R
A
 
A
I
 
M
N
 
N
I
|
I
T
 
V
L
 
L
N
 
H
G
 
G
-
 
L
S
x
N
Q
x
G
R
 
K
V
 
I
V
 
K
A
 
V
S
 
N
G
 
G
V
 
Q
P
 
E
D
 
Y
A
 
D
Y
x
S
R
 
V
M
|
M
P
 
P
A
 
P
F
x
M
R
 
T
E
 
-
Q
 
Q
L
 
L
S
 
N
D
 
D
T
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
N
V
 
I
L
 
L
S
 
T
Y
 
Y
V
 
V
R
 
L
S
 
N
T
 
S
W
 
W
G
 
D
N
 
N
N
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
R
V
 
V
D
 
S
A
 
A
N
 
E
A
 
D
V
 
V
G
 
K
K
 
K
L
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

2zooA Crystal structure of nitrite reductase from pseudoalteromonas haloplanktis tac125
34% identity, 23% coverage: 330:431/447 of query aligns to 339:438/438 of 2zooA

query
sites
2zooA
G
 
G
A
 
Q
H
 
R
T
 
V
Y
 
Y
A
 
E
T
 
A
R
 
N
C
|
C
A
 
M
S
 
A
C
|
C
H
|
H
G
 
Q
L
 
A
D
 
N
G
 
G
K
 
E
G
 
G
Q
 
I
P
 
P
E
 
G
W
 
A
M
x
F
P
|
P
P
|
P
L
|
L
A
 
A
G
 
-
A
 
K
T
x
S
S
 
D
A
x
Y
L
 
L
A
 
N
K
 
N
E
 
N
S
 
P
A
 
L
S
 
L
A
 
G
I
 
V
N
 
N
I
 
A
T
x
I
L
 
I
N
 
K
G
 
G
-
x
L
S
|
S
Q
x
G
R
 
P
V
x
I
V
 
K
A
x
V
S
 
N
G
 
N
V
 
V
P
 
N
D
x
Y
A
x
N
Y
x
G
R
x
V
M
|
M
P
 
P
A
 
A
F
 
M
R
 
-
E
 
-
Q
 
N
L
 
L
S
 
N
D
 
D
T
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
N
V
 
V
L
 
I
S
 
T
Y
 
F
V
 
V
R
 
L
S
 
N
T
 
N
W
 
W
G
 
D
N
 
N
N
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
K
V
 
V
D
 
S
A
 
A
N
 
E
A
 
Q
V
 
V
G
 
A
K
 
K
L
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1r0qA Characterization of the conversion of the malformed, recombinant cytochrome rc552 to a 2-formyl-4-vinyl (spirographis) heme (see paper)
40% identity, 20% coverage: 328:417/447 of query aligns to 1:92/130 of 1r0qA

query
sites
1r0qA
A
 
A
P
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
K
T
 
I
Y
 
Y
A
 
A
T
 
-
R
 
Q
C
 
C
A
 
A
S
 
G
C
|
C
H
|
H
G
 
Q
L
 
Q
D
 
N
G
 
G
K
 
Q
G
 
G
Q
 
I
P
 
P
E
 
G
W
 
A
M
 
F
P
|
P
P
 
P
L
|
L
A
 
A
G
 
G
A
x
H
T
 
V
S
 
A
A
 
E
-
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
S
 
G
A
 
G
S
 
R
A
 
E
-
x
Y
-
 
L
I
 
I
N
 
L
I
x
V
T
 
L
L
 
L
N
 
Y
G
 
G
S
 
L
Q
|
Q
-
x
G
R
 
Q
V
 
I
V
 
E
A
 
V
S
 
K
G
 
G
V
 
M
P
 
K
D
 
Y
A
 
N
Y
x
G
R
 
V
M
|
M
P
 
S
A
 
S
F
 
F
R
 
-
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
K
D
 
D
T
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
N
Y
 
H
V
 
I
R
 
A
S
 
T
T
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
D

Sites not aligning to the query:

1qyzA Characterization of the malformed, recombinant cytochrome rc552 (see paper)
40% identity, 20% coverage: 328:417/447 of query aligns to 1:92/130 of 1qyzA

query
sites
1qyzA
A
 
A
P
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
K
T
 
I
Y
|
Y
A
 
A
T
 
-
R
 
Q
C
|
C
A
 
A
S
 
G
C
|
C
H
|
H
G
 
Q
L
 
Q
D
 
N
G
 
G
K
 
Q
G
 
G
Q
 
I
P
 
P
E
 
G
W
 
A
M
 
F
P
|
P
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
x
H
T
 
V
S
 
A
A
 
E
-
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
S
 
G
A
 
G
S
 
R
A
 
E
-
x
Y
-
 
L
I
 
I
N
 
L
I
 
V
T
 
L
L
 
L
N
 
Y
G
 
G
S
 
L
Q
|
Q
-
x
G
R
 
Q
V
 
I
V
 
E
A
 
V
S
 
K
G
 
G
V
 
M
P
 
K
D
 
Y
A
 
N
Y
x
G
R
 
V
M
|
M
P
 
S
A
 
S
F
|
F
R
 
-
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
K
D
 
D
T
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
N
Y
 
H
V
 
I
R
 
A
S
 
T
T
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
D

Sites not aligning to the query:

1c52A Thermus thermophilus cytochrome-c552: a new highly thermostable cytochromE-C structure obtained by mad phasing (see paper)
40% identity, 20% coverage: 328:417/447 of query aligns to 2:93/131 of 1c52A

query
sites
1c52A
A
 
A
P
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
K
T
 
I
Y
 
Y
A
 
A
T
 
-
R
 
Q
C
|
C
A
 
A
S
 
G
C
|
C
H
|
H
G
 
Q
L
 
Q
D
 
N
G
 
G
K
 
Q
G
 
G
Q
 
I
P
 
P
E
 
G
W
 
A
M
x
F
P
|
P
P
 
P
L
|
L
A
 
A
G
 
G
A
x
H
T
 
V
S
 
A
A
 
E
-
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
S
 
G
A
 
G
S
 
R
A
 
E
-
x
Y
-
 
L
I
 
I
N
 
L
I
 
V
T
 
L
L
 
L
N
 
Y
G
 
G
S
x
L
Q
|
Q
-
x
G
R
 
Q
V
 
I
V
 
E
A
 
V
S
 
K
G
 
G
V
 
M
P
 
K
D
 
Y
A
 
N
Y
x
G
R
 
V
M
|
M
P
 
S
A
 
S
F
|
F
R
 
-
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
K
D
 
D
T
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
N
Y
 
H
V
 
I
R
 
A
S
 
T
T
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
D

Sites not aligning to the query:

1dt1A Thermus thermophilus cytochrome c552 synthesized by escherichia coli (see paper)
40% identity, 20% coverage: 330:417/447 of query aligns to 2:91/129 of 1dt1A

query
sites
1dt1A
G
 
G
A
 
A
H
 
K
T
 
I
Y
 
Y
A
 
A
T
 
-
R
 
Q
C
|
C
A
 
A
S
 
G
C
|
C
H
|
H
G
 
Q
L
 
Q
D
 
N
G
 
G
K
 
Q
G
 
G
Q
 
I
P
 
P
E
 
G
W
 
A
M
 
F
P
|
P
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
x
H
T
 
V
S
 
A
A
 
E
-
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
S
 
G
A
 
G
S
 
R
A
 
E
-
x
Y
-
 
L
I
 
I
N
 
L
I
x
V
T
 
L
L
 
L
N
 
Y
G
 
G
S
 
L
Q
|
Q
-
x
G
R
 
Q
V
 
I
V
 
E
A
 
V
S
 
K
G
 
G
V
 
M
P
 
K
D
 
Y
A
 
N
Y
x
G
R
 
V
M
|
M
P
 
S
A
 
S
F
|
F
R
 
-
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
K
D
 
D
T
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
N
Y
 
H
V
 
I
R
 
A
S
 
T
T
 
A
W
 
W
G
 
G
N
 
D

Sites not aligning to the query:

Q03075 Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit FixP; Cbb3-Cox subunit FixP; C-type cytochrome FixP; Cyt c(FixP); Cytochrome c oxidase subunit III from Bradyrhizobium diazoefficiens (strain JCM 10833 / BCRC 13528 / IAM 13628 / NBRC 14792 / USDA 110) (see paper)
28% identity, 35% coverage: 261:416/447 of query aligns to 152:288/290 of Q03075

query
sites
Q03075
Q
 
Q
I
 
I
V
 
M
Q
 
Q
F
 
T
L
 
I
K
 
Q
T
 
F
G
 
G
-
 
A
R
 
R
N
 
S
A
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
K
V
 
T
Y
 
H
G
 
E
S
 
G
M
 
Q
T
 
M
E
 
L
A
 
A
F
 
F
N
 
G
N
 
K
S
 
D
T
 
-
Q
 
G
F
 
V
M
 
L
Q
 
K
D
 
G
D
 
D
D
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
T
I
 
V
A
 
A
R
 
N
Y
 
Y
L
 
V
K
 
R
S
 
S
L
 
L
P
 
S
G
 
G
D
 
L
P
 
P
Q
 
T
R
 
R
D
 
K
G
 
G
A
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
-
Y
 
Y
Q
 
D
A
 
A
V
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
A
P
 
K
G
 
G
A
 
E
H
 
K
T
 
I
Y
 
F
A
 
V
T
 
E
R
 
N
C
|
C
A
 
V
S
 
A
C
|
C
H
 
H
G
 
G
L
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
N
P
 
Q
E
 
E
W
 
M
-
 
G
M
 
A
P
 
P
P
 
N
L
 
L
A
 
T
G
 
D
A
 
K
T
 
I
S
 
W
A
 
L
L
 
Y
A
 
G
K
 
S
E
 
D
S
 
E
A
 
A
S
 
A
A
 
L
I
 
I
N
 
E
I
 
T
T
 
I
L
 
S
N
 
Q
G
 
G
S
 
R
Q
 
A
R
 
G
V
 
V
V
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
-
M
 
M
P
 
P
A
 
A
F
 
W
R
 
E
E
 
G
Q
 
R
L
 
L
S
 
D
D
 
P
T
 
S
E
 
T
I
 
I
A
 
K
E
 
A
V
 
M
L
 
A
S
 
V
Y
 
Y
V
 
V
R
 
H
S
 
S
T
 
L
W
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF2133 PS417_10880 alcohol dehydrogenase
MNNRRFARTAGWLALPCLVAAGLLAWYVTREPATPFEQEQAGATFEPALVSRGEYVARLS
DCVACHSLAGKAPFAGGLEMATPLGAIHATNITPDKSTGIGTYSLADFDRAVRHGVAPGG
RRLYPAMPYPSYVKLSDDDIKALYAFFMQGIKPANQPNIPSDIPWPLNMRWPIALWNGVF
APTATYAAKPDQDALWNRGAYIVQGPGHCGSCHTPRGLAFNEKALDEAGAPFLAGALLDG
WYAPSLRQDPNTGLGRWSEPQIVQFLKTGRNAHAVVYGSMTEAFNNSTQFMQDDDLAAIA
RYLKSLPGDPQRDGAPWQYQAVAAVQDAPGAHTYATRCASCHGLDGKGQPEWMPPLAGAT
SALAKESASAINITLNGSQRVVASGVPDAYRMPAFREQLSDTEIAEVLSYVRSTWGNNGG
AVDANAVGKLRGHTDPASSSPIILHMR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory