SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF220 FitnessBrowser__WCS417:GFF220 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

3p47A Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-cysteine (see paper)
40% identity, 85% coverage: 35:295/308 of query aligns to 26:268/270 of 3p47A

query
sites
3p47A
H
 
H
G
 
S
G
 
K
R
 
R
E
 
D
L
 
Y
P
 
P
S
 
H
R
 
K
E
 
K
A
 
V
V
 
F
A
 
T
Q
 
E
I
 
-
L
 
L
E
 
Q
S
 
K
L
 
L
C
 
R
G
 
K
A
 
I
L
 
F
F
 
F
P
 
P
M
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
D
F
 
F
Y
 
F
V
 
M
G
 
K
H
 
H
T
 
Q
L
 
K
D
 
I
V
 
T
A
 
E
L
 
S
N
 
H
A
 
I
L
 
A
L
 
S
G
 
E
Q
 
L
A
 
T
R
 
K
L
 
L
E
 
V
L
 
D
R
 
Y
Y
 
I
A
 
K
A
 
D
R
 
S
Q
 
V
G
 
T
A
 
A
K
 
Y
D
 
N
D
 
D
S
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
E
V
 
L
L
 
F
A
 
A
I
 
H
R
 
Q
L
 
C
I
 
V
Q
 
M
D
 
A
F
 
I
A
 
L
L
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
P
S
 
S
L
 
I
R
 
K
S
 
R
L
 
T
L
 
L
D
 
K
T
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
H
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
P
S
 
G
V
 
L
D
 
S
E
 
L
V
 
I
L
 
I
L
 
R
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
F
L
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
H
 
V
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
A
H
 
H
H
 
V
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
A
 
C
G
 
G
L
 
E
P
 
R
L
 
Y
L
 
Y
A
 
C
R
 
R
I
 
E
S
 
M
A
 
M
E
 
E
I
 
S
A
 
V
H
 
H
S
 
S
A
 
Y
T
 
T
G
 
S
I
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
I
 
I
G
 
K
P
 
G
S
 
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
D
 
D
H
 
H
G
 
G
T
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
W
V
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
|
A
K
 
M
R
x
H
F
 
F
P
 
-
A
 
Q
D
 
E
E
 
E
D
 
G
G
 
G
Q
 
V
L
 
I
Q
 
K
K
 
R
G
 
G
H
 
T
P
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
T
V
 
V
E
 
G
D
 
D
D
 
Y
V
 
V
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
I
I
 
V
G
 
G
K
 
S
G
 
H
S
 
V
T
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
N
V
 
C
W
 
W
L
 
I
T
 
D
R
 
R
S
 
D
V
 
V
P
 
D
A
 
S
G
 
N
A
 
Q
N
 
T
I
 
V

3q1xA Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-serine (see paper)
40% identity, 85% coverage: 35:295/308 of query aligns to 24:266/267 of 3q1xA

query
sites
3q1xA
H
 
H
G
 
S
G
 
K
R
 
R
E
 
D
L
 
Y
P
 
P
S
 
H
R
 
K
E
 
K
A
 
V
V
 
F
A
 
T
Q
 
E
I
 
-
L
 
L
E
 
Q
S
 
K
L
 
L
C
 
R
G
 
K
A
 
I
L
 
F
F
 
F
P
 
P
M
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
D
F
 
F
Y
 
F
V
 
M
G
 
K
H
 
H
T
 
Q
L
 
K
D
 
I
V
 
T
A
 
E
L
 
S
N
 
H
A
 
I
L
 
A
L
 
S
G
 
E
Q
 
L
A
 
T
R
 
K
L
 
L
E
 
V
L
 
D
R
 
Y
Y
 
I
A
 
K
A
 
D
R
 
S
Q
 
V
G
 
T
A
 
A
K
 
Y
D
 
N
D
 
D
S
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
E
V
 
L
L
 
F
A
 
A
I
 
H
R
 
Q
L
 
C
I
 
V
Q
 
M
D
 
A
F
 
I
A
 
L
L
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
P
S
 
S
L
 
I
R
 
K
S
 
R
L
 
T
L
 
L
D
 
K
T
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
H
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
P
S
 
G
V
 
L
D
 
S
E
 
L
V
 
I
L
 
I
L
 
R
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
F
L
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
H
 
V
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
A
H
 
H
H
 
V
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
A
 
C
G
 
G
L
 
E
P
 
R
L
 
Y
L
 
Y
A
 
C
R
 
R
I
 
E
S
 
M
A
 
M
E
 
E
I
 
S
A
 
V
H
 
H
S
 
S
A
 
Y
T
 
T
G
 
S
I
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
I
 
I
G
 
K
P
 
G
S
 
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
D
 
D
H
 
H
G
 
G
T
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
W
V
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
|
A
K
 
M
R
x
H
F
 
F
P
 
-
A
 
Q
D
 
E
E
 
E
D
 
G
G
 
G
Q
 
V
L
 
I
Q
 
K
K
 
R
G
 
G
H
 
T
P
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
T
V
 
V
E
 
G
D
 
D
D
 
Y
V
 
V
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
I
I
 
V
G
 
G
K
 
S
G
 
H
S
 
V
T
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
N
V
 
C
W
 
W
L
 
I
T
 
D
R
 
R
S
 
D
V
 
V
P
 
D
A
 
S
G
 
N
A
 
Q
N
 
T
I
 
V

7bw9A Crystal structure of serine acetyltransferase isoform 3 in complex with cysteine from entamoeba histolytica
40% identity, 82% coverage: 38:289/308 of query aligns to 27:252/280 of 7bw9A

query
sites
7bw9A
R
 
K
E
 
Q
L
 
F
P
 
P
S
 
E
R
 
K
E
 
K
A
 
S
V
 
F
A
 
L
Q
 
E
I
 
-
L
 
L
E
 
E
S
 
L
L
 
I
C
 
Q
G
 
K
A
 
I
L
 
L
F
 
F
P
 
P
M
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
D
F
 
F
Y
 
F
V
 
T
G
 
R
H
 
R
T
 
D
L
 
K
D
 
R
V
 
T
A
 
F
L
 
N
N
 
N
A
 
V
L
 
L
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
S
L
 
L
R
 
L
Y
 
V
A
 
Y
A
 
H
R
 
I
Q
 
Q
G
 
N
A
 
S
K
 
I
D
 
E
D
 
A
S
 
Y
E
 
Y
V
 
N
D
 
Q
V
 
Q
L
 
L
A
 
A
I
 
E
R
 
K
L
 
C
I
 
I
Q
 
T
D
 
A
F
 
L
A
 
L
L
 
S
A
 
Q
L
 
F
P
 
V
S
 
T
L
 
I
R
 
R
S
 
E
L
 
L
L
 
V
D
 
K
T
 
Q
D
 
D
V
 
I
L
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
H
 
T
G
 
G
D
|
D
P
|
P
A
|
A
A
 
A
R
 
S
S
 
S
V
 
L
D
 
A
E
 
M
V
 
I
L
 
I
L
 
R
C
 
S
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
I
L
 
H
A
 
V
V
 
M
I
 
M
H
 
I
H
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
H
 
H
H
 
I
L
 
L
Y
 
Y
R
 
M
A
 
N
G
 
G
L
 
D
P
 
I
L
 
E
L
 
Y
A
 
S
R
 
R
I
 
E
S
 
L
A
 
M
E
 
E
I
 
N
A
 
I
H
 
H
S
 
S
A
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
T
Q
 
S
I
 
I
G
 
G
P
 
N
S
 
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
D
|
D
H
|
H
G
 
G
T
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
N
R
 
W
V
 
C
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
|
A
K
 
M
R
 
S
F
 
F
P
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
Q
 
-
K
 
K
G
 
G
H
 
N
P
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
T
V
 
I
E
 
G
D
 
D
D
 
F
V
 
V
V
 
V
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
S
G
 
N
S
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
N
V
 
C
W
 
W
L
 
I
T
 
T
R
 
Q
S
 
N
V
 
I

4n69A Soybean serine acetyltransferase complexed with serine (see paper)
45% identity, 54% coverage: 125:290/308 of query aligns to 74:230/243 of 4n69A

query
sites
4n69A
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
R
S
 
S
L
 
A
L
 
A
D
 
V
T
 
A
D
 
D
V
 
L
L
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
R
H
 
E
G
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
C
R
 
V
S
 
S
V
 
Y
D
 
S
E
 
H
V
 
C
L
 
L
L
 
L
C
 
N
Y
 
Y
P
 
K
G
 
G
V
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
C
I
 
Q
H
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
V
A
 
A
H
 
H
H
 
L
L
 
L
Y
 
W
R
 
R
A
 
Q
G
 
S
L
 
R
-
 
R
P
 
P
L
 
L
L
 
A
A
 
L
R
 
A
I
 
L
S
 
H
A
 
S
E
 
R
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
-
A
 
V
T
 
F
G
 
A
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
G
 
G
P
 
K
S
 
G
F
 
I
F
 
L
I
 
F
D
 
D
H
 
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
N
R
 
N
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
A
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
A
 
-
K
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
G
|
G
Q
 
T
L
 
G
Q
 
K
K
 
V
G
 
G
H
 
G
P
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
K
V
 
I
E
 
G
D
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
E
G
 
G
S
 
A
T
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
I
S
 
D
V
 
V
P
 
P

4n6bA Soybean serine acetyltransferase complexed with coa (see paper)
43% identity, 54% coverage: 125:290/308 of query aligns to 70:220/233 of 4n6bA

query
sites
4n6bA
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
R
S
 
S
L
 
A
L
 
A
D
 
V
T
 
A
D
 
D
V
 
L
L
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
R
H
 
E
G
 
R
D
 
D
P
 
V
A
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
S
V
 
Y
D
 
S
E
 
H
V
 
C
L
 
L
L
 
L
C
 
N
Y
 
Y
P
 
K
G
 
G
V
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
C
I
 
Q
H
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
V
A
 
A
H
 
H
H
 
L
L
 
L
Y
 
W
R
 
R
A
 
Q
G
 
S
L
 
R
-
 
R
P
 
P
L
 
L
L
 
A
A
 
L
R
 
A
I
 
L
S
 
H
A
 
S
E
 
R
I
 
I
A
 
A
H
 
-
S
 
N
A
 
V
T
 
F
G
 
A
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
G
 
G
P
 
K
S
 
G
F
 
I
F
 
L
I
 
F
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
N
R
 
N
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
x
L
Q
 
H
A
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
A
x
G
K
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
Q
 
-
K
x
T
G
 
G
H
 
G
P
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
I
 
K
V
 
I
E
 
G
D
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Y
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
|
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
E
G
 
G
S
 
A
T
x
K
I
 
V
G
|
G
G
x
A
N
 
G
V
 
S
W
x
V
L
 
V
T
x
L
R
 
I
S
 
D
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4hzdA Crystal structure of serine acetyltransferase in complex with coenzyme a from brucella abortus strain s19 (see paper)
37% identity, 69% coverage: 87:300/308 of query aligns to 35:239/250 of 4hzdA

query
sites
4hzdA
L
 
I
L
 
L
G
 
N
Q
 
Q
A
 
P
R
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
M
-
 
H
R
 
R
Y
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
H
K
 
P
D
 
D
D
 
V
S
 
S
E
 
-
V
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
L
A
 
-
I
 
-
R
 
R
L
 
Q
I
 
T
Q
 
F
D
 
D
F
 
T
A
 
M
L
 
L
-
 
E
A
 
A
L
 
N
P
 
P
S
 
E
L
 
W
R
 
S
S
 
H
L
 
V
L
 
L
D
 
R
T
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
Y
H
 
D
G
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
Y
R
 
S
S
 
R
V
 
F
D
 
M
E
 
D
V
 
P
L
 
V
L
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
V
 
F
L
 
H
A
 
A
V
 
I
I
 
Q
H
 
T
H
 
H
R
 
R
L
 
L
A
 
A
H
 
H
H
 
W
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
A
 
Q
G
 
G
L
 
R
P
 
K
L
 
D
L
 
F
A
 
A
R
 
Y
I
 
Y
S
 
L
A
 
Q
E
 
S
I
 
R
A
 
S
H
 
S
S
 
S
A
 
I
T
 
F
G
 
Q
I
 
T
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
G
 
G
P
 
S
S
 
G
F
 
L
F
 
F
I
 
L
D
 
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
E
E
 
D
R
 
N
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
x
L
Q
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
-
K
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
G
Q
 
T
L
 
G
Q
 
K
K
 
S
G
 
S
H
 
G
P
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
I
 
K
V
 
I
E
 
R
D
 
Q
D
 
G
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Y
x
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
Q
I
 
V
G
 
G
K
 
Q
G
 
C
S
 
S
T
 
K
I
 
I
G
x
A
G
x
A
N
 
G
V
x
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
K
S
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
-
G
 
-
A
 
H
N
 
N
I
 
V
T
|
T
Q
 
V
A
|
A
N
x
G
L
 
V

Sites not aligning to the query:

4h7oA Crystal structure of serine acetyltransferase from vibrio cholerae o1 biovar el tor n16961
35% identity, 60% coverage: 105:290/308 of query aligns to 50:227/258 of 4h7oA

query
sites
4h7oA
D
 
N
D
x
T
S
x
A
E
x
S
V
 
M
D
 
P
V
 
A
L
 
M
A
 
A
I
 
V
R
 
R
-
 
E
L
 
V
I
 
I
Q
 
E
D
 
E
F
 
A
A
 
F
L
 
A
A
 
A
L
 
D
P
 
P
S
 
S
L
 
I
R
 
S
S
 
E
L
 
A
L
 
A
D
 
A
T
 
C
D
 
D
V
 
I
L
 
C
A
 
A
A
 
T
Y
 
V
H
 
N
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
|
A
A
 
V
R
 
S
S
 
M
V
 
Y
D
 
S
E
 
M
V
 
P
L
 
L
L
 
L
C
x
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
V
 
Y
L
 
H
A
 
A
V
 
L
I
 
Q
H
 
G
H
 
Y
R
 
R
L
 
V
A
 
A
H
 
N
H
 
W
L
 
L
Y
 
W
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
L
 
R
P
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
I
x
Y
S
 
F
A
 
Q
E
x
N
I
x
Q
A
 
I
H
 
S
S
 
V
A
 
A
T
 
C
G
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
G
 
G
P
 
R
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
E
E
 
D
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
D
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
-
K
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
G
|
G
Q
 
T
L
 
G
Q
 
K
K
 
E
G
 
C
H
 
G
P
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
K
V
 
I
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
K
 
E
G
 
G
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
S
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
Q
S
 
A
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6wyeA Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) (see paper)
36% identity, 59% coverage: 109:290/308 of query aligns to 59:232/261 of 6wyeA

query
sites
6wyeA
V
 
M
D
 
D
V
 
V
L
 
R
A
 
A
I
 
L
R
 
F
L
 
E
I
 
I
Q
 
Y
D
 
Q
F
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
S
P
 
D
S
 
T
-
 
Q
L
 
I
R
 
S
S
 
K
L
 
C
L
 
V
D
 
E
T
 
A
D
 
D
V
 
L
L
 
K
A
 
A
A
 
I
Y
 
Y
H
 
E
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
|
A
A
 
C
R
 
D
S
 
E
V
 
Y
D
 
S
E
 
L
V
 
P
L
 
L
L
 
L
C
 
Y
Y
 
F
P
 
K
G
 
G
V
 
F
L
 
H
A
 
A
V
 
I
I
 
Q
H
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
N
H
 
H
H
 
R
L
 
L
Y
 
Y
R
 
L
A
 
D
G
 
G
L
 
R
P
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
I
 
F
S
 
L
A
 
Q
E
 
N
I
 
R
A
 
M
H
 
S
S
 
E
A
 
V
T
 
F
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
G
 
G
P
 
Y
S
 
G
F
 
L
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
V
I
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
V
I
 
L
G
 
G
E
 
N
R
 
N
V
 
I
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
A
 
-
K
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
G
|
G
Q
 
S
L
 
G
Q
 
K
K
 
E
G
 
G
H
 
G
P
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
K
V
 
I
E
 
G
D
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
T
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
S
G
 
N
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
V
R
 
S
S
 
D
V
 
V
P
 
P

7ra4A Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) in complex with serine (see paper)
36% identity, 59% coverage: 109:290/308 of query aligns to 57:230/243 of 7ra4A

query
sites
7ra4A
V
 
M
D
 
D
V
 
V
L
 
R
A
 
A
I
 
L
R
 
F
L
 
E
I
 
I
Q
 
Y
D
 
Q
F
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
S
P
 
D
S
 
T
-
 
Q
L
 
I
R
 
S
S
 
K
L
 
C
L
 
V
D
 
E
T
 
A
D
 
D
V
 
L
L
 
K
A
 
A
A
 
I
Y
 
Y
H
 
E
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
C
R
 
D
S
 
E
V
 
Y
D
 
S
E
 
L
V
 
P
L
 
L
L
 
L
C
 
Y
Y
 
F
P
 
K
G
 
G
V
 
F
L
 
H
A
 
A
V
 
I
I
 
Q
H
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
N
H
 
H
H
 
R
L
 
L
Y
 
Y
R
 
L
A
 
D
G
 
G
L
 
R
P
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
I
 
F
S
 
L
A
 
Q
E
 
N
I
 
R
A
 
M
H
 
S
S
 
E
A
 
V
T
 
F
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
G
 
G
P
 
Y
S
 
G
F
 
L
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
V
I
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
V
I
 
L
G
 
G
E
 
N
R
 
N
V
 
I
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
-
K
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
G
|
G
Q
 
S
L
 
G
Q
 
K
K
 
E
G
 
G
H
 
G
P
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
K
V
 
I
E
 
G
D
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
T
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
S
G
 
N
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
V
R
 
S
S
 
D
V
 
V
P
 
P

1ssqD Serine acetyltransferase- complex with cysteine (see paper)
35% identity, 63% coverage: 115:308/308 of query aligns to 61:247/257 of 1ssqD

query
sites
1ssqD
R
 
E
L
 
I
I
 
I
Q
 
E
D
 
E
F
 
A
A
 
Y
L
 
Q
A
 
S
L
 
N
P
 
P
S
 
S
L
 
I
R
 
I
S
 
D
L
 
C
L
 
A
D
 
A
T
 
C
D
 
D
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
H
 
H
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
|
A
A
 
V
R
 
E
S
 
L
V
 
W
D
 
S
E
 
T
V
 
P
L
 
L
L
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
V
 
F
L
 
H
A
 
A
V
 
I
I
 
Q
H
 
S
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
T
H
 
H
H
 
Y
L
 
L
Y
 
W
R
 
N
A
 
Q
G
 
N
L
 
R
P
 
K
L
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
I
 
Y
S
 
L
A
 
Q
E
 
N
I
 
Q
A
 
I
H
 
S
S
 
V
A
 
A
T
 
F
G
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
G
 
G
P
 
H
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
F
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
S
I
 
V
I
 
I
G
 
E
E
 
N
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
-
K
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
G
Q
 
T
L
 
G
Q
 
K
K
 
E
G
 
S
H
 
G
P
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
I
 
K
V
 
V
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
Y
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
N
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
N
S
 
P
V
 
V
P
 
P
-
 
E
-
 
Y
A
 
A
G
 
T
A
 
A
N
 
A
I
 
G
T
 
V
Q
 
P
A
 
A
N
 
R
L
 
I
Q
 
V
H
 
S
E
 
Q
D
 
D
G
 
K
A
 
A
Q
 
A
K
 
K

3gvdI Crystal structure of serine acetyltransferase cyse from yersinia pestis
39% identity, 51% coverage: 134:291/308 of query aligns to 87:235/272 of 3gvdI

query
sites
3gvdI
D
 
D
V
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
H
 
L
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
|
A
A
 
V
R
 
D
S
 
K
V
 
Y
D
 
S
E
 
T
V
 
P
L
 
L
L
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
V
 
F
L
 
H
A
 
A
V
 
L
I
 
Q
H
 
A
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
G
H
 
H
H
 
W
L
 
L
Y
 
W
R
 
A
A
 
Q
G
 
D
L
 
R
P
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
I
 
Y
S
 
L
A
 
Q
E
 
N
I
 
Q
A
 
V
H
 
S
S
 
V
A
 
A
T
 
F
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
Q
 
T
I
 
I
G
 
G
P
 
C
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
E
E
 
N
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
A
 
-
K
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
G
|
G
Q
 
T
L
 
G
Q
 
K
K
 
T
G
 
S
H
 
G
P
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
K
V
 
I
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
K
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
A

1t3dA Crystal structure of serine acetyltransferase from e.Coli at 2.2a (see paper)
36% identity, 58% coverage: 112:290/308 of query aligns to 61:231/262 of 1t3dA

query
sites
1t3dA
L
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
-
 
E
L
 
V
I
 
V
Q
 
E
D
 
E
F
 
A
A
 
Y
L
 
A
A
 
A
L
 
D
P
 
P
S
 
E
L
 
M
R
 
I
S
 
A
L
 
S
L
 
A
D
 
A
T
 
C
D
 
D
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
H
 
T
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
|
A
A
 
V
R
 
D
S
 
K
V
 
Y
D
 
S
E
 
T
V
 
P
L
 
L
L
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
V
 
F
L
 
H
A
 
A
V
 
L
I
 
Q
H
 
A
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
G
H
 
H
H
 
W
L
 
L
Y
 
W
R
 
N
A
 
Q
G
 
G
L
 
R
P
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
I
 
F
S
 
L
A
 
Q
E
 
N
I
 
Q
A
 
V
H
 
S
S
 
V
A
 
T
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
G
 
G
P
 
R
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
A
I
 
V
I
 
I
G
 
E
E
 
N
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
A
 
-
K
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
G
|
G
Q
 
T
L
 
G
Q
 
K
K
 
S
G
 
G
H
 
G
P
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
K
V
 
I
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
K
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
Q
S
 
P
V
 
V
P
 
P

1sstA Serine acetyltransferase- complex with coa (see paper)
35% identity, 57% coverage: 115:290/308 of query aligns to 61:220/233 of 1sstA

query
sites
1sstA
R
 
E
L
 
I
I
 
I
Q
 
E
D
 
E
F
 
A
A
 
Y
L
 
Q
A
 
S
L
 
N
P
 
P
S
 
S
L
 
I
R
 
I
S
 
D
L
 
C
L
 
A
D
 
A
T
 
C
D
 
D
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
H
 
H
G
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
V
R
 
E
S
 
L
V
 
W
D
 
S
E
 
T
V
 
P
L
 
L
L
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
V
 
F
L
 
H
A
 
A
V
 
I
I
 
Q
H
 
S
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
T
H
 
H
H
 
Y
L
 
L
Y
 
W
R
 
N
A
 
Q
G
 
N
L
 
R
P
 
K
L
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
I
 
Y
S
 
L
A
 
Q
E
 
N
I
 
Q
A
 
I
H
 
S
S
 
V
A
 
A
T
 
F
G
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
G
 
G
P
 
H
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
F
D
 
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
S
I
 
V
I
 
I
G
 
E
E
 
N
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
x
L
Q
|
Q
A
 
G
V
 
V
T
|
T
L
 
L
G
 
G
A
x
G
K
x
T
R
 
-
F
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
H
 
H
P
 
P
I
 
K
V
 
V
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
x
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
|
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
Y
S
 
A
T
x
K
I
 
I
G
|
G
G
x
A
N
 
N
V
 
S
W
x
V
L
 
V
T
x
L
R
 
N
S
 
P
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF220 FitnessBrowser__WCS417:GFF220
MSERSSHWQLQTIVSQLRSARDQWRTRNGRLSGEHGGRELPSREAVAQILESLCGALFPM
RLGPVDLREESEDFYVGHTLDVALNALLGQARLELRYAARQGAKDDSEVDVLAIRLIQDF
ALALPSLRSLLDTDVLAAYHGDPAARSVDEVLLCYPGVLAVIHHRLAHHLYRAGLPLLAR
ISAEIAHSATGIDIHPGAQIGPSFFIDHGTGVVIGETAIIGERVRIYQAVTLGAKRFPAD
EDGQLQKGHPRHPIVEDDVVIYAGATILGRITIGKGSTIGGNVWLTRSVPAGANITQANL
QHEDGAQK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory