SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2243 FitnessBrowser__Marino:GFF2243 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
67% identity, 94% coverage: 15:254/256 of query aligns to 2:240/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
I
I
 
I
R
 
R
V
 
I
E
 
R
G
 
N
M
 
L
H
 
H
K
 
K
W
 
W
Y
x
F
G
 
G
D
 
P
F
 
L
H
 
H
V
|
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
L
 
I
N
 
H
L
 
L
T
 
E
V
 
V
D
 
A
Q
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
K
I
 
L
V
 
V
I
 
I
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
L
 
L
E
 
E
E
 
D
H
 
F
Q
 
Q
Q
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
V
I
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
L
E
 
S
L
 
V
T
 
K
D
 
D
D
 
D
V
 
-
R
 
R
H
 
A
I
 
L
D
 
R
T
 
E
V
 
I
R
 
R
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
V
C
 
T
L
 
L
S
 
A
P
 
P
I
 
M
W
 
R
V
 
V
R
 
R
K
 
R
T
 
W
P
 
P
R
 
R
K
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
K
S
 
K
A
 
A
M
 
L
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
K
 
G
I
 
I
P
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
N
 
R
K
 
K
F
 
Y
P
 
P
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
I
 
V
K
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
M
 
M
I
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
Q
S
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
A
 
G
P
 
R
P
 
P
H
 
E
E
 
E
F
 
I
F
 
F
T
 
T
N
 
R
P
 
P
Q
 
K
E
 
E
A
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
R
K
 
S
F
 
F
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
R
I
 
V
L
 
L

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
58% identity, 94% coverage: 15:254/256 of query aligns to 3:242/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
I
 
M
I
 
I
R
 
D
V
 
V
E
 
H
G
 
Q
M
 
L
H
 
K
K
 
K
W
 
S
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
F
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
D
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
I
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
D
H
 
F
Q
 
D
Q
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
I
I
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
N
L
 
L
T
 
K
D
 
A
D
 
K
V
 
D
R
 
T
H
 
N
I
 
L
D
 
N
T
 
K
V
 
V
R
 
R
R
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
C
 
I
C
 
T
L
 
L
S
 
A
P
 
P
I
 
M
W
 
K
V
 
V
R
 
R
K
 
K
T
 
W
P
 
P
R
 
R
K
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
S
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
K
 
G
I
 
L
P
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
N
 
H
K
 
A
F
 
Y
P
 
P
G
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
I
 
V
K
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
S
V
 
V
M
 
M
I
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
N
S
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
L
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
E
A
 
G
P
 
K
P
 
P
H
 
E
E
 
D
F
 
L
F
 
F
T
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q
E
 
H
A
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
K
K
 
A
F
 
F
L
 
L
Q
 
S
Q
 
K
I
 
V
L
 
F

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
58% identity, 94% coverage: 15:254/256 of query aligns to 3:242/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
I
 
M
I
 
I
R
 
D
V
 
V
E
 
H
G
 
Q
M
 
L
H
 
K
K
 
K
W
 
S
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
F
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
D
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
I
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
D
H
 
F
Q
 
D
Q
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
I
I
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
N
L
 
L
T
 
K
D
 
A
D
 
K
V
 
D
R
 
T
H
 
N
I
 
L
D
 
N
T
 
K
V
 
V
R
 
R
R
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
C
 
I
C
 
T
L
 
L
S
 
A
P
 
P
I
 
M
W
 
K
V
 
V
R
 
R
K
 
K
T
 
W
P
 
P
R
 
R
K
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
S
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
K
 
G
I
 
L
P
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
N
 
H
K
 
A
F
 
Y
P
 
P
G
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
I
 
V
K
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
S
V
 
V
M
 
M
I
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
N
S
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
L
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
E
A
 
G
P
 
K
P
 
P
H
 
E
E
 
D
F
 
L
F
 
F
T
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q
E
 
H
A
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
K
K
 
A
F
 
F
L
 
L
Q
 
S
Q
 
K
I
 
V
L
 
F

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
58% identity, 94% coverage: 15:254/256 of query aligns to 3:242/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
I
 
M
I
 
I
R
 
D
V
 
V
E
 
H
G
 
Q
M
 
L
H
 
K
K
 
K
W
 
S
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
F
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
D
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
I
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
D
H
 
F
Q
 
D
Q
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
I
I
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
N
L
 
L
T
 
K
D
 
A
D
 
K
V
 
D
R
 
T
H
 
N
I
 
L
D
 
N
T
 
K
V
 
V
R
 
R
R
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
C
 
I
C
 
T
L
 
L
S
 
A
P
 
P
I
 
M
W
 
K
V
 
V
R
 
R
K
 
K
T
 
W
P
 
P
R
 
R
K
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
S
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
K
 
G
I
 
L
P
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
N
 
H
K
 
A
F
 
Y
P
 
P
G
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
I
 
V
K
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
S
V
 
V
M
 
M
I
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
N
S
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
L
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
E
A
 
G
P
 
K
P
 
P
H
 
E
E
 
D
F
 
L
F
 
F
T
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q
E
 
H
A
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
K
K
 
A
F
 
F
L
 
L
Q
 
S
Q
 
K
I
 
V
L
 
F

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
58% identity, 94% coverage: 15:254/256 of query aligns to 3:242/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
I
 
M
I
 
I
R
 
D
V
 
V
E
 
H
G
 
Q
M
 
L
H
 
K
K
 
K
W
 
S
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
F
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
D
 
R
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
I
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
D
H
 
F
Q
 
D
Q
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
I
I
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
N
L
 
L
T
 
K
D
 
A
D
 
K
V
 
D
R
 
T
H
 
N
I
 
L
D
 
N
T
 
K
V
 
V
R
 
R
R
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
N
N
 
N
C
 
I
C
 
T
L
 
L
S
 
A
P
 
P
I
 
M
W
 
K
V
 
V
R
 
R
K
 
K
T
 
W
P
 
P
R
 
R
K
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
S
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
K
 
G
I
 
L
P
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
N
 
H
K
 
A
F
 
Y
P
 
P
G
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
K
I
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
I
 
V
K
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
S
V
 
V
M
 
M
I
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
N
S
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
L
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Y
I
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
E
A
 
G
P
 
K
P
 
P
H
 
E
E
 
D
F
 
L
F
 
F
T
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q
E
 
H
A
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
K
K
 
A
F
 
F
L
 
L
Q
 
S
Q
 
K
I
 
V
L
 
F

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
56% identity, 94% coverage: 15:254/256 of query aligns to 1:240/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
I
 
M
I
 
I
R
 
F
V
 
V
E
 
N
G
 
D
M
 
V
H
 
Y
K
 
K
W
 
N
Y
x
F
G
 
G
D
 
S
F
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
L
 
V
N
 
T
L
 
L
T
 
K
V
 
V
D
 
N
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
I
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
I
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
I
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
H
 
P
Q
 
T
Q
 
K
G
 
G
K
 
E
I
 
V
I
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
K
L
 
I
T
 
N
D
 
N
D
 
G
V
 
K
R
 
V
H
 
N
I
 
I
D
 
N
T
 
K
V
 
V
R
 
R
R
 
Q
E
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
I
E
 
E
N
 
N
C
 
I
C
 
T
L
 
L
S
 
A
P
 
P
I
 
V
W
 
K
V
 
V
R
 
K
K
 
K
T
 
M
P
 
N
R
 
K
K
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
E
S
 
L
A
 
A
M
 
V
E
 
D
Y
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
K
V
 
V
K
 
G
I
 
L
P
 
L
D
 
D
Q
 
K
A
 
K
N
 
D
K
 
Q
F
 
Y
P
 
P
G
 
I
Q
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
M
K
 
Q
P
 
P
K
 
E
I
 
V
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
I
 
V
K
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
N
V
 
V
M
 
M
I
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
N
S
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
R
T
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
I
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
D
G
 
G
E
 
V
I
 
I
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
A
 
G
P
 
T
P
 
P
H
 
E
E
 
E
F
 
I
F
 
F
T
 
Y
N
 
R
P
 
A
Q
 
K
E
 
N
A
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
R
K
 
E
F
 
F
L
 
L
Q
 
S
Q
 
K
I
 
I
L
 
L

P02915 Histidine/lysine/arginine/ornithine transport ATP-binding protein HisP; EC 7.4.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
49% identity, 92% coverage: 16:251/256 of query aligns to 7:254/258 of P02915

query
sites
P02915
I
 
L
R
 
H
V
 
V
E
 
I
G
 
D
M
 
L
H
 
H
K
 
K
W
 
R
Y
 
Y
G
 
G
D
 
G
F
 
H
H
 
E
V
 
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
L
 
V
N
 
S
L
 
L
T
 
Q
V
 
A
D
 
R
Q
 
A
G
 
G
E
 
D
R
 
V
I
 
I
V
 
S
I
 
I
C
 
I
G
 
G
P
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
I
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
I
N
 
N
R
 
F
L
 
L
E
 
E
E
 
K
H
 
P
Q
 
S
Q
 
E
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
N
G
 
G
I
 
Q
E
 
N
L
 
I
T
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
V
D
 
A
D
 
D
V
 
K
R
 
N
H
 
Q
I
 
L
D
 
R
T
 
L
V
 
L
R
 
R
R
 
T
E
 
R
V
 
L
G
 
T
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
W
P
 
S
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
V
C
 
M
L
 
E
S
 
A
P
 
P
I
 
I
W
 
Q
V
 
V
R
 
L
K
 
G
T
 
L
P
 
S
R
 
K
K
 
H
E
 
D
A
 
A
E
 
R
A
 
E
S
 
R
A
 
A
M
 
L
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
A
R
 
K
V
 
V
K
 
G
I
 
I
P
 
D
D
 
E
Q
 
R
A
 
A
N
 
Q
-
 
G
K
 
K
F
 
Y
P
 
P
G
 
V
Q
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
D
I
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
L
I
 
V
K
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
R
V
 
I
M
 
M
I
 
Q
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
E
S
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
R
T
 
H
V
 
V
A
 
S
D
 
S
R
 
H
V
 
V
I
 
I
F
 
F
M
 
L
D
 
H
G
 
Q
G
 
G
E
 
K
I
 
I
V
 
E
E
 
E
Q
 
E
A
 
G
P
 
D
P
 
P
H
 
E
E
 
Q
F
 
V
F
 
F
T
 
G
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
E
 
S
A
 
P
R
 
R
T
 
L
Q
 
Q
K
 
Q
F
 
F
L
 
L
Q
 
K

1b0uA Atp-binding subunit of the histidine permease from salmonella typhimurium (see paper)
49% identity, 92% coverage: 16:251/256 of query aligns to 3:250/258 of 1b0uA

query
sites
1b0uA
I
 
L
R
 
H
V
 
V
E
 
I
G
 
D
M
 
L
H
 
H
K
 
K
W
 
R
Y
|
Y
G
 
G
D
 
G
F
x
H
H
 
E
V
 
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
L
 
V
N
 
S
L
 
L
T
 
Q
V
 
A
D
 
R
Q
 
A
G
 
G
E
 
D
R
 
V
I
 
I
V
 
S
I
 
I
C
 
I
G
 
G
P
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
I
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
I
N
 
N
R
 
F
L
 
L
E
 
E
E
 
K
H
 
P
Q
 
S
Q
 
E
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
V
D
 
N
G
 
G
I
 
Q
E
 
N
L
 
I
T
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
V
D
 
A
D
 
D
V
 
K
R
 
N
H
 
Q
I
 
L
D
 
R
T
 
L
V
 
L
R
 
R
R
 
T
E
 
R
V
 
L
G
 
T
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
W
P
 
S
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
V
C
 
M
L
 
E
S
 
A
P
 
P
I
 
I
W
 
Q
V
 
V
R
 
L
K
 
G
T
 
L
P
 
S
R
 
K
K
 
H
E
 
D
A
 
A
E
 
R
A
 
E
S
 
R
A
 
A
M
 
L
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
A
R
 
K
V
 
V
K
 
G
I
 
I
P
 
D
D
 
E
Q
 
R
A
 
A
N
 
Q
-
 
G
K
 
K
F
 
Y
P
 
P
G
 
V
Q
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
D
I
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
L
I
 
V
K
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
R
V
 
I
M
 
M
I
 
Q
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
E
S
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
K
 
R
T
 
H
V
 
V
A
 
S
D
 
S
R
 
H
V
 
V
I
 
I
F
 
F
M
 
L
D
 
H
G
 
Q
G
 
G
E
 
K
I
 
I
V
 
E
E
 
E
Q
 
E
A
 
G
P
 
D
P
 
P
H
 
E
E
 
Q
F
 
V
F
 
F
T
 
G
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
E
 
S
A
 
P
R
 
R
T
 
L
Q
 
Q
K
 
Q
F
 
F
L
 
L
Q
 
K

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
41% identity, 91% coverage: 22:254/256 of query aligns to 12:245/343 of P30750

query
sites
P30750
H
 
H
K
 
Q
W
 
G
Y
 
T
G
 
R
D
 
T
F
 
I
H
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
N
D
 
N
L
 
V
N
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
D
 
P
Q
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
I
I
 
Y
V
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
R
H
 
P
Q
 
T
Q
 
E
G
 
G
K
 
S
I
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
T
-
 
L
D
 
S
V
 
E
R
 
S
H
 
E
I
 
L
D
 
T
T
 
K
V
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
C
 
V
C
 
A
L
 
L
S
 
-
P
 
P
I
 
L
W
 
E
V
 
L
R
 
D
K
 
N
T
 
T
P
 
P
R
 
K
K
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
K
A
 
R
S
 
R
A
 
V
M
 
T
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
K
 
G
I
 
L
P
 
G
D
 
D
Q
 
K
A
 
H
N
 
D
K
 
S
F
 
Y
P
 
P
G
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
S
K
 
N
P
 
P
K
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
M
 
T
I
 
T
K
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
E
V
 
L
M
 
L
I
 
K
E
 
D
L
 
I
A
 
N
G
 
R
S
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
L
 
L
C
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
A
 
V
K
 
K
T
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
I
 
A
F
 
V
M
 
I
D
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
A
 
D
P
 
T
P
 
V
H
 
S
E
 
E
F
 
V
F
 
F
T
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
E
 
T
A
 
P
R
 
L
T
 
A
Q
 
Q
K
 
K
F
 
F
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
S
I
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
40% identity, 91% coverage: 22:254/256 of query aligns to 13:246/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
H
 
H
K
x
Q
W
 
G
Y
 
T
G
 
R
D
 
T
F
x
I
H
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
N
D
 
N
L
 
V
N
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
D
 
P
Q
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
I
I
 
Y
V
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
R
H
 
P
Q
 
T
Q
 
E
G
 
G
K
 
S
I
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
T
-
 
L
D
 
S
V
 
E
R
 
S
H
 
E
I
 
L
D
 
T
T
 
K
V
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
C
 
V
C
 
A
L
 
L
S
 
-
P
 
P
I
 
L
W
 
E
V
 
L
R
 
D
K
 
N
T
 
T
P
 
P
R
 
K
K
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
K
A
 
R
S
 
R
A
 
V
M
 
T
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
K
 
G
I
 
L
P
 
G
D
 
D
Q
 
K
A
 
H
N
 
D
K
 
S
F
 
Y
P
 
P
G
 
S
Q
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
S
K
 
N
P
 
P
K
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
M
 
T
I
 
T
K
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
E
V
 
L
M
 
L
I
 
K
E
 
D
L
 
I
A
 
N
G
 
R
S
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
L
 
L
C
 
L
V
 
I
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
A
 
V
K
 
K
T
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
I
 
A
F
 
V
M
 
I
D
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
A
 
D
P
 
T
P
 
V
H
 
S
E
 
E
F
 
V
F
 
F
T
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
E
 
T
A
 
P
R
 
L
T
 
A
Q
 
Q
K
 
K
F
 
F
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
S
I
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
40% identity, 91% coverage: 22:254/256 of query aligns to 13:246/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
H
 
H
K
x
Q
W
 
G
Y
 
T
G
 
R
D
 
T
F
 
I
H
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
N
D
 
N
L
 
V
N
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
D
 
P
Q
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
I
I
 
Y
V
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
R
H
 
P
Q
 
T
Q
 
E
G
 
G
K
 
S
I
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
T
-
 
L
D
 
S
V
 
E
R
 
S
H
 
E
I
 
L
D
 
T
T
 
K
V
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
C
 
V
C
 
A
L
 
L
S
 
-
P
 
P
I
 
L
W
 
E
V
 
L
R
 
D
K
 
N
T
 
T
P
 
P
R
 
K
K
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
K
A
 
R
S
 
R
A
 
V
M
 
T
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
K
 
G
I
 
L
P
 
G
D
 
D
Q
 
K
A
 
H
N
 
D
K
 
S
F
 
Y
P
 
P
G
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
S
K
 
N
P
 
P
K
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
M
 
T
I
 
T
K
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
E
V
 
L
M
 
L
I
 
K
E
 
D
L
 
I
A
 
N
G
 
R
S
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
L
 
L
C
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
A
 
V
K
 
K
T
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
I
 
A
F
 
V
M
 
I
D
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
A
 
D
P
 
T
P
 
V
H
 
S
E
 
E
F
 
V
F
 
F
T
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
E
 
T
A
 
P
R
 
L
T
 
A
Q
 
Q
K
 
K
F
 
F
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
S
I
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
40% identity, 91% coverage: 22:254/256 of query aligns to 13:246/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
H
 
H
K
 
Q
W
 
G
Y
 
T
G
 
R
D
 
T
F
 
I
H
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
N
D
 
N
L
 
V
N
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
D
 
P
Q
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
I
I
 
Y
V
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
R
H
 
P
Q
 
T
Q
 
E
G
 
G
K
 
S
I
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
T
-
 
L
D
 
S
V
 
E
R
 
S
H
 
E
I
 
L
D
 
T
T
 
K
V
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
V
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
C
 
V
C
 
A
L
 
L
S
 
-
P
 
P
I
 
L
W
 
E
V
 
L
R
 
D
K
 
N
T
 
T
P
 
P
R
 
K
K
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
K
A
 
R
S
 
R
A
 
V
M
 
T
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
K
 
G
I
 
L
P
 
G
D
 
D
Q
 
K
A
 
H
N
 
D
K
 
S
F
 
Y
P
 
P
G
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
S
K
 
N
P
 
P
K
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
M
 
T
I
 
T
K
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
E
V
 
L
M
 
L
I
 
K
E
 
D
L
 
I
A
 
N
G
 
R
S
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
L
 
L
C
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
A
 
V
K
 
K
T
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
I
 
A
F
 
V
M
 
I
D
 
S
G
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
A
 
D
P
 
T
P
 
V
H
 
S
E
 
E
F
 
V
F
 
F
T
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
E
 
T
A
 
P
R
 
L
T
 
A
Q
 
Q
K
 
K
F
 
F
L
 
I
Q
 
Q
Q
 
S
I
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
37% identity, 96% coverage: 8:253/256 of query aligns to 10:251/378 of P69874

query
sites
P69874
Q
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
S
K
 
L
P
 
S
G
 
P
I
 
L
I
 
V
R
 
Q
V
 
L
E
 
A
G
 
G
M
 
I
H
 
R
K
 
K
W
x
C
Y
x
F
G
 
D
D
 
G
F
 
K
H
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
P
D
 
Q
L
 
L
N
 
D
L
 
L
T
 
T
V
 
I
D
 
N
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
R
x
F
I
 
L
V
 
T
I
 
L
C
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
F
 
V
I
x
L
R
 
R
C
 
L
I
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
T
H
 
V
Q
 
D
Q
 
S
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
M
V
x
L
D
 
D
G
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
N
D
 
E
D
 
D
V
 
I
R
 
T
H
 
H
I
 
V
D
 
P
T
 
A
V
 
E
R
 
N
R
 
R
E
 
Y
V
 
V
G
 
N
M
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
F
E
 
E
N
 
N
C
 
V
C
 
A
L
 
F
S
 
G
P
 
-
I
 
L
W
 
R
V
 
M
R
 
Q
K
 
K
T
 
T
P
 
P
R
 
A
K
 
A
E
 
E
A
 
I
E
 
T
A
 
P
S
 
R
A
 
V
M
 
M
E
 
E
Y
 
A
L
 
L
E
 
R
R
 
M
V
|
V
K
 
Q
I
 
L
P
 
E
D
 
T
Q
 
F
A
 
A
N
 
Q
K
 
R
F
 
K
P
 
P
G
 
H
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
C
 
V
M
 
N
K
 
K
P
 
P
K
 
R
I
 
L
M
 
L
L
 
L
F
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
T
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
K
M
 
L
I
 
R
K
 
K
E
 
Q
V
 
M
L
 
Q
D
 
N
V
 
E
M
 
L
I
 
K
E
 
A
L
 
L
A
 
Q
G
 
R
S
 
K
-
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
T
M
 
F
L
 
V
C
 
F
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
G
 
E
F
 
E
A
 
A
K
 
L
T
 
T
V
 
M
A
 
S
D
 
D
R
 
R
V
 
I
I
 
V
F
 
V
M
 
M
D
 
R
G
 
D
G
 
G
E
 
R
I
 
I
V
 
E
E
 
Q
Q
 
D
A
 
G
P
 
T
P
 
P
H
 
R
E
 
E
F
 
I
F
 
Y
T
 
E
N
 
E
P
 
P
Q
 
K
E
 
N
A
 
L
R
 
F
T
 
V
Q
 
A
K
 
G
F
 
F
L
 
I
Q
 
G
Q
 
E
I
 
I

Sites not aligning to the query:

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
40% identity, 86% coverage: 33:251/256 of query aligns to 44:264/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
D
 
D
L
 
T
N
 
N
L
 
F
T
 
E
V
 
I
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
I
I
 
F
V
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
P
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
F
 
L
I
 
L
R
 
R
C
 
L
I
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
L
E
 
I
E
 
E
H
 
P
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
N
I
 
Q
E
 
D
L
 
V
-
 
A
T
 
T
D
 
L
D
 
N
V
 
K
R
 
E
H
 
D
I
 
L
D
 
L
T
 
Q
V
 
V
R
 
R
R
 
R
E
 
K
-
 
T
V
 
M
G
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
T
C
 
E
L
 
Y
S
 
G
P
 
-
I
 
L
W
 
E
V
 
V
R
 
Q
K
 
N
T
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
E
E
 
E
A
 
R
E
 
R
A
 
K
S
 
R
A
 
A
M
 
E
E
 
K
Y
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
N
V
 
A
K
 
N
I
 
L
P
 
L
D
 
D
Q
 
F
A
 
K
N
 
D
K
 
Q
F
 
Y
P
 
P
G
 
K
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
N
K
 
D
P
 
P
K
 
E
I
 
I
M
 
L
L
 
L
F
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
L
M
 
I
I
 
R
K
 
R
E
 
E
V
 
M
L
 
Q
D
 
D
V
 
E
M
 
L
I
 
L
E
 
E
L
 
L
-
 
Q
A
 
A
G
 
K
S
 
F
G
 
Q
M
 
K
T
 
T
M
 
I
L
 
I
C
 
F
V
 
V
T
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
G
 
N
F
 
E
A
 
A
K
 
L
T
 
R
V
 
I
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
I
 
A
F
 
I
M
 
M
D
 
K
G
 
D
G
 
G
E
 
K
I
 
I
V
 
M
E
 
Q
Q
 
I
A
 
G
P
 
T
P
 
G
H
 
E
E
 
E
F
 
I
F
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
E
 
N
A
 
D
R
 
Y
T
 
V
Q
 
K
K
 
T
F
 
F
L
 
V
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
40% identity, 86% coverage: 33:251/256 of query aligns to 44:264/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
D
 
D
L
 
T
N
 
N
L
 
F
T
 
E
V
 
I
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
I
I
 
F
V
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
P
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
F
 
L
I
 
L
R
 
R
C
 
L
I
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
L
E
 
I
E
 
E
H
 
P
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
N
I
 
Q
E
 
D
L
 
V
-
 
A
T
 
T
D
 
L
D
 
N
V
 
K
R
 
E
H
 
D
I
 
L
D
 
L
T
 
Q
V
 
V
R
 
R
R
 
R
E
 
K
-
 
T
V
 
M
G
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
T
C
 
E
L
 
Y
S
 
G
P
 
-
I
 
L
W
 
E
V
 
V
R
 
Q
K
 
N
T
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
E
E
 
E
A
 
R
E
 
R
A
 
K
S
 
R
A
 
A
M
 
E
E
 
K
Y
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
N
V
 
A
K
 
N
I
 
L
P
 
L
D
 
D
Q
 
F
A
 
K
N
 
D
K
 
Q
F
 
Y
P
 
P
G
 
K
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
N
K
 
D
P
 
P
K
 
E
I
 
I
M
 
L
L
 
L
F
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
L
M
 
I
I
 
R
K
 
R
E
 
E
V
 
M
L
 
Q
D
 
D
V
 
E
M
 
L
I
 
L
E
 
E
L
 
L
-
 
Q
A
 
A
G
 
K
S
 
F
G
 
Q
M
 
K
T
 
T
M
 
I
L
 
I
C
 
F
V
 
V
T
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
G
 
N
F
 
E
A
 
A
K
 
L
T
 
R
V
 
I
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
I
 
A
F
 
I
M
 
M
D
 
K
G
 
D
G
 
G
E
 
K
I
 
I
V
 
M
E
 
Q
Q
 
I
A
 
G
P
 
T
P
 
G
H
 
E
E
 
E
F
 
I
F
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
E
 
N
A
 
D
R
 
Y
T
 
V
Q
 
K
K
 
T
F
 
F
L
 
V
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
41% identity, 82% coverage: 33:241/256 of query aligns to 44:254/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
D
 
D
L
 
T
N
 
N
L
 
F
T
 
E
V
 
I
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
I
I
 
F
V
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
P
 
L
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
I
 
L
R
 
R
C
 
L
I
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
L
E
 
I
E
 
E
H
 
P
Q
 
T
Q
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
N
I
 
Q
E
 
D
L
 
V
-
 
A
T
 
T
D
 
L
D
 
N
V
 
K
R
 
E
H
 
D
I
 
L
D
 
L
T
 
Q
V
 
V
R
 
R
R
 
R
E
 
K
-
 
T
V
 
M
G
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
F
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
T
C
 
E
L
 
Y
S
 
G
P
 
-
I
 
L
W
 
E
V
 
V
R
 
Q
K
 
N
T
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
E
E
 
E
A
 
R
E
 
R
A
 
K
S
 
R
A
 
A
M
 
E
E
 
K
Y
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
N
V
 
A
K
 
N
I
 
L
P
 
L
D
 
D
Q
 
F
A
 
K
N
 
D
K
 
Q
F
 
Y
P
 
P
G
x
K
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
x
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
N
K
 
D
P
 
P
K
 
E
I
 
I
M
 
L
L
 
L
F
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
L
M
 
I
I
 
R
K
 
R
E
 
E
V
 
M
L
 
Q
D
 
D
V
 
E
M
 
L
I
 
L
E
 
E
L
 
L
-
 
Q
A
 
A
G
 
K
S
 
F
G
 
Q
M
 
K
T
 
T
M
 
I
L
 
I
C
 
F
V
 
V
T
 
S
H
|
H
E
 
D
M
 
L
G
 
N
F
 
E
A
 
A
K
 
L
T
 
R
V
 
I
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
I
 
A
F
 
I
M
 
M
D
 
K
G
 
D
G
 
G
E
 
K
I
 
I
V
 
M
E
 
Q
Q
 
I
A
 
G
P
 
T
P
 
G
H
 
E
E
 
E
F
 
I
F
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2d62A Crystal structure of multiple sugar binding transport atp- binding protein
35% identity, 93% coverage: 14:250/256 of query aligns to 3:243/375 of 2d62A

query
sites
2d62A
G
 
G
I
 
M
I
 
A
R
 
E
V
 
V
E
 
K
G
 
L
M
 
I
H
 
N
K
 
I
W
 
W
-
 
K
-
 
R
Y
 
F
G
 
G
D
 
D
F
 
V
H
 
T
V
 
A
L
 
V
K
 
K
D
 
D
L
 
L
N
 
S
L
 
L
T
 
E
V
 
I
D
 
K
Q
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
F
I
 
L
V
 
V
I
 
L
C
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
F
 
T
I
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
E
 
E
E
 
E
H
 
P
Q
 
T
Q
 
R
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
I
 
Y
V
 
I
D
 
E
G
 
D
I
 
N
E
 
L
L
 
V
T
 
A
D
 
D
D
 
P
V
 
E
R
 
K
-
 
G
-
 
V
H
 
F
I
 
V
D
 
P
T
 
P
V
 
K
R
 
E
R
 
R
E
 
D
V
 
V
G
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
C
 
I
C
 
A
L
 
F
S
 
-
P
 
P
I
 
L
W
 
K
V
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
Q
E
 
E
A
 
I
E
 
D
A
 
K
S
 
R
A
 
V
M
 
R
E
 
E
Y
 
V
L
 
A
E
 
E
R
 
M
V
 
L
K
 
G
I
 
L
P
 
T
D
 
E
Q
 
L
A
 
L
N
 
N
K
 
R
F
 
K
P
 
P
G
 
R
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
C
 
I
M
 
R
K
 
R
P
 
P
K
 
K
I
 
V
M
 
F
L
 
L
F
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
K
M
 
L
I
 
R
K
 
V
E
 
K
V
 
M
L
 
R
D
 
A
V
 
E
M
 
L
I
 
K
E
 
K
L
 
L
A
 
Q
G
 
R
S
 
Q
-
 
L
G
 
G
M
 
V
T
 
T
M
 
T
L
 
I
C
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
G
 
V
F
 
E
A
 
A
K
 
M
T
 
T
V
 
M
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
I
 
A
F
 
V
M
 
M
D
 
N
G
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
Q
E
 
Q
Q
 
V
A
 
G
P
 
T
P
 
P
H
 
D
E
 
E
F
 
V
F
 
Y
T
 
Y
N
 
K
P
 
P
Q
 
V
E
 
N
A
 
T
R
 
F
T
 
V
Q
 
A
K
 
G
F
 
F
L
 
I

P0AAH0 Phosphate import ATP-binding protein PstB; ABC phosphate transporter; Phosphate-transporting ATPase; EC 7.3.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
32% identity, 93% coverage: 13:250/256 of query aligns to 8:252/257 of P0AAH0

query
sites
P0AAH0
P
 
P
G
 
S
I
 
K
I
 
I
R
 
Q
V
 
V
E
 
R
G
 
N
M
 
L
H
 
N
K
 
F
W
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
K
F
 
F
H
 
H
V
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
N
L
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
D
V
 
I
D
 
A
Q
 
K
G
 
N
E
 
Q
R
 
V
I
 
T
V
 
A
I
 
F
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
F
 
L
I
 
L
R
 
R
C
 
T
I
 
F
N
 
N
R
 
K
L
 
M
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
P
E
 
E
E
 
Q
H
 
R
Q
 
A
Q
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
I
I
 
L
V
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
D
E
 
N
L
 
I
T
 
L
D
 
T
D
 
N
V
 
S
R
 
Q
H
 
D
I
 
I
D
 
A
T
 
L
V
 
L
R
 
R
R
 
A
E
 
K
V
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
K
F
 
P
N
 
T
L
 
P
F
 
F
P
 
P
H
 
-
L
 
M
T
 
S
V
 
I
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
C
 
I
C
 
A
L
 
F
S
 
G
P
 
V
I
 
R
W
 
L
V
 
F
R
 
E
K
 
K
T
 
L
P
 
S
R
 
R
K
 
A
E
 
D
A
 
M
E
 
D
A
 
E
S
 
R
A
 
V
M
 
Q
E
 
W
Y
 
A
L
 
L
E
 
T
R
 
K
V
 
A
K
 
A
I
 
L
-
 
W
-
 
N
-
 
E
-
 
T
P
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
L
N
 
H
K
 
Q
F
 
S
P
 
G
G
 
Y
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
G
L
 
I
C
 
A
M
 
I
K
 
R
P
 
P
K
 
E
I
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
C
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
I
M
 
S
I
 
T
K
 
G
E
 
R
V
 
I
L
 
E
D
 
E
V
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
K
G
 
-
S
 
Q
G
 
D
M
 
Y
T
 
T
M
 
V
L
 
V
C
 
I
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
M
G
 
Q
F
 
Q
A
 
A
K
 
A
T
 
R
V
 
C
A
 
S
D
 
D
R
 
H
V
 
T
I
 
A
F
 
F
M
 
M
D
 
Y
G
 
L
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
I
E
 
E
Q
 
F
A
 
S
P
 
N
P
 
T
H
 
D
E
 
D
F
 
L
F
 
F
T
 
T
N
 
K
P
 
P
Q
 
A
E
 
K
A
 
K
R
 
Q
T
 
T
Q
 
E
K
 
D
F
 
Y
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
39% identity, 84% coverage: 15:228/256 of query aligns to 1:223/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
I
 
M
I
 
I
R
 
K
V
 
L
E
 
K
G
 
N
M
 
V
H
 
T
K
 
K
W
 
T
Y
|
Y
-
 
K
-
 
M
G
 
G
D
 
E
-
 
E
-
 
I
F
 
I
H
 
Y
V
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
N
L
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
N
V
 
I
D
 
K
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
F
I
 
V
V
 
S
I
 
I
C
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
M
I
 
L
R
 
N
C
 
I
I
 
I
N
 
G
R
 
C
L
 
L
E
 
D
E
 
K
H
 
P
Q
 
T
Q
 
E
G
 
G
K
 
E
I
 
V
I
 
Y
V
 
I
D
 
D
G
 
N
I
 
I
E
 
K
L
 
T
T
 
N
D
 
D
-
 
L
D
 
D
V
 
D
R
 
D
H
 
E
I
 
L
D
 
T
T
 
K
V
 
I
R
 
R
R
 
R
E
 
D
-
 
K
V
 
I
G
 
G
M
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
I
P
 
P
H
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
C
 
V
C
 
E
L
 
L
S
 
P
P
 
L
I
 
I
W
 
F
V
 
K
R
 
Y
K
 
R
-
 
G
-
 
A
T
 
M
P
 
S
R
 
G
K
 
E
E
 
E
A
 
R
E
 
R
A
 
K
S
 
R
A
 
A
M
 
L
E
 
E
Y
 
C
L
 
L
E
 
K
R
 
M
V
 
A
K
 
E
I
 
L
P
 
E
D
 
E
Q
 
R
-
 
F
A
 
A
N
 
N
K
 
H
F
 
K
P
 
P
G
 
N
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
A
M
 
N
K
 
N
P
 
P
K
 
P
I
 
I
M
 
I
L
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
K
M
 
T
I
 
G
K
 
E
E
 
K
V
 
I
L
 
M
D
 
Q
V
 
L
M
 
L
I
 
K
E
 
K
L
 
L
-
 
N
A
 
E
G
 
E
S
 
D
G
 
G
M
 
K
T
 
T
M
 
V
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
I
G
 
N
F
 
V