SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2249 FitnessBrowser__Marino:GFF2249 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 17 hits to proteins with known functional sites (download)

7cdyA Crystal structure of glucose dehydrogenase
46% identity, 66% coverage: 172:509/511 of query aligns to 2:343/346 of 7cdyA

query
sites
7cdyA
T
 
T
V
 
V
E
 
S
T
 
Q
L
 
L
T
 
Q
S
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
H
P
 
P
W
 
W
S
 
S
L
 
L
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
A
-
 
E
G
 
Q
G
 
G
A
 
L
L
 
L
V
 
I
T
 
T
E
 
E
R
 
R
A
 
P
G
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
R
M
 
L
I
 
W
S
 
Q
E
 
Q
E
 
D
W
 
K
E
 
G
L
 
L
G
 
-
Q
 
S
A
 
P
P
 
P
I
 
I
T
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
P
 
Q
V
 
V
F
 
Y
N
 
A
D
 
E
A
 
G
Q
 
Q
A
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
P
S
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
A
N
 
A
N
 
S
Q
 
R
L
 
R
V
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
-
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
E
A
 
G
S
 
G
A
 
K
N
 
A
H
 
G
L
 
T
C
 
A
V
 
V
A
 
G
R
 
Y
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
Q
 
S
A
 
D
E
 
D
-
 
D
-
 
A
A
 
R
L
 
L
T
 
E
E
 
N
V
 
F
V
 
K
E
 
V
I
 
I
F
 
F
R
 
R
A
 
Q
K
 
Q
P
 
P
A
 
K
K
 
L
E
 
S
G
 
V
S
 
G
A
 
N
H
 
H
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
K
M
 
L
A
 
A
W
 
F
L
 
D
P
 
R
D
 
Q
G
 
G
T
 
Y
L
 
L
I
 
F
V
 
I
T
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
E
G
 
N
F
 
-
D
 
N
Y
 
Q
R
 
R
E
 
P
Q
 
T
A
 
A
Q
 
Q
N
 
E
L
 
T
S
 
D
S
 
K
H
 
L
L
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
L
N
 
T
P
 
A
D
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
P
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
W
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
K
L
 
R
P
 
P
E
 
E
I
 
V
Y
 
W
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
R
 
R
N
 
N
V
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
A
F
 
L
D
 
N
S
 
P
V
 
W
E
 
S
N
 
G
V
 
A
L
 
I
I
 
W
A
 
E
H
 
H
E
 
E
H
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
E
|
E
I
 
L
N
 
N
I
 
I
I
 
P
E
 
L
P
 
P
G
 
G
H
 
K
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
V
 
L
I
 
A
T
 
T
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
D
 
N
Y
 
Y
T
 
S
G
 
G
A
 
Q
M
 
P
I
 
I
T
 
-
P
 
P
F
 
E
V
 
A
E
 
K
R
 
G
E
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
P
G
 
G
M
 
T
E
 
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
L
 
H
H
 
Y
W
 
W
T
 
R
P
 
V
S
 
S
I
 
P
A
 
G
P
 
L
S
 
S
G
 
G
M
 
M
T
 
A
R
 
F
Y
 
Y
R
 
D
G
 
G
E
 
Q
L
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
W
 
W
Q
 
R
G
 
H
N
 
S
L
 
L
L
 
F
V
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
K
 
K
S
 
A
V
 
L
H
 
I
R
 
R
V
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
G
G
 
D
E
 
K
A
 
V
S
 
V
D
 
A
V
 
E
E
 
E
S
 
R
L
 
L
F
 
L
E
 
G
A
 
D
M
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
D
 
E
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
Y
V
 
L
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
E
A
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
K
I
 
L
L
 
L
R
 
K
I
 
V

P75804 Aldose sugar dehydrogenase YliI; Asd; Soluble aldose sugar dehydrogenase YliI; EC 1.1.5.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
42% identity, 71% coverage: 151:511/511 of query aligns to 13:369/371 of P75804

query
sites
P75804
C
 
C
L
 
L
A
 
S
V
 
S
G
 
A
L
 
L
G
 
W
A
 
A
L
 
A
P
 
P
G
 
A
P
 
T
T
 
V
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
Y
 
-
T
 
N
V
 
V
E
 
E
T
 
V
L
 
L
T
 
Q
S
 
D
G
 
K
L
 
L
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
S
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
D
G
 
N
-
 
H
G
 
G
A
 
M
L
 
L
V
 
I
T
 
T
E
 
L
R
 
R
A
 
G
G
 
G
R
 
E
L
 
L
R
 
R
M
 
-
I
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
H
W
 
W
E
 
Q
L
 
A
G
 
G
Q
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
S
A
 
A
P
 
P
I
 
L
T
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
P
P
 
D
V
 
V
F
 
W
N
 
A
D
 
H
A
 
G
Q
|
Q
A
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
A
N
 
Q
N
 
S
Q
 
R
L
 
R
V
 
I
F
 
W
L
 
L
A
 
S
Y
 
Y
S
 
S
-
 
E
C
 
V
G
 
G
T
 
D
A
 
D
S
 
G
A
 
K
N
 
A
H
 
G
L
 
T
C
 
A
V
 
V
A
 
G
R
 
Y
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
Q
 
S
A
 
D
E
 
D
-
 
L
-
 
S
A
 
K
L
 
V
T
 
T
E
 
D
V
 
F
V
 
R
E
 
T
I
 
V
F
 
F
R
 
R
A
 
Q
K
 
M
P
 
P
A
 
K
K
 
L
E
 
S
G
 
T
S
 
G
A
 
N
H
 
H
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
V
W
 
F
L
 
D
P
 
G
D
 
K
G
 
G
T
 
Y
L
 
L
I
 
F
V
 
I
T
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
E
G
 
N
F
 
-
D
 
N
Y
 
Q
R
 
R
E
 
P
Q
 
T
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
L
 
L
S
 
D
S
 
K
H
 
L
L
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
L
N
 
T
P
 
D
D
 
Q
G
 
G
S
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
D
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
I
G
 
K
R
 
E
E
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
R
P
 
A
E
 
E
I
 
I
Y
 
W
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
I
R
 
R
N
 
N
V
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
V
 
A
F
 
M
D
 
N
S
 
P
V
 
W
E
 
S
N
 
N
V
 
A
L
 
L
I
 
W
A
 
L
H
 
N
E
 
E
H
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
I
 
I
I
 
P
E
 
Q
P
 
K
G
 
G
H
 
K
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
V
 
L
I
 
A
T
 
T
H
 
W
G
 
G
I
 
I
D
 
N
Y
|
Y
T
 
S
G
 
G
A
 
F
M
 
K
I
 
I
T
 
-
P
 
P
F
 
E
V
 
A
E
 
K
R
 
G
E
 
E
-
 
I
-
 
V
-
 
A
G
 
G
M
 
T
E
 
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
L
 
F
H
 
Y
W
 
W
T
 
K
P
 
D
S
 
S
I
 
P
A
 
A
P
 
V
S
 
S
G
 
G
M
 
M
T
 
A
R
 
F
Y
 
Y
R
 
N
G
 
S
E
 
D
L
 
K
F
 
F
P
 
P
D
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
G
 
Q
N
 
K
L
 
L
L
 
F
V
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
D
K
 
K
S
 
D
V
 
V
H
 
I
R
 
V
V
 
M
T
 
S
L
 
V
E
 
N
A
 
G
G
 
D
E
 
K
A
 
V
S
 
T
D
 
E
V
 
D
E
 
G
S
 
R
L
 
I
F
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
R
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
I
 
I
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
R
T
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
Y
V
 
L
Y
 
Y
L
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
E
A
 
S
D
 
S
G
 
G
R
 
E
I
 
L
L
 
L
R
 
K
I
 
V
L
 
S
P
 
P

2g8sA Crystal structure of the soluble aldose sugar dehydrogenase (asd) from escherichia coli in the apo-form (see paper)
42% identity, 67% coverage: 172:511/511 of query aligns to 4:347/348 of 2g8sA

query
sites
2g8sA
T
 
N
V
 
V
E
 
E
T
 
V
L
 
L
T
 
Q
S
 
D
G
 
K
L
 
L
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
S
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
D
G
 
N
-
 
H
G
 
G
A
 
M
L
 
L
V
 
I
T
 
T
E
 
L
R
 
R
A
 
G
G
 
G
R
 
E
L
 
L
R
 
R
M
 
-
I
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
H
W
 
W
E
 
Q
L
 
A
G
 
G
Q
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
S
A
 
A
P
 
P
I
 
L
T
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
P
P
 
D
V
 
V
F
 
W
N
 
A
D
 
H
A
 
G
Q
 
Q
A
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
L
S
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
A
N
 
Q
N
 
S
Q
 
R
L
 
R
V
 
I
F
 
W
L
 
L
A
 
S
Y
 
Y
S
 
S
-
 
E
C
 
V
G
 
G
T
 
D
A
 
D
S
 
G
A
 
K
N
 
A
H
 
G
L
 
T
C
 
A
V
 
V
A
 
G
R
 
Y
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
Q
 
S
A
 
D
E
 
D
-
 
L
-
 
S
A
 
K
L
 
V
T
 
T
E
 
D
V
 
F
V
 
R
E
 
T
I
 
V
F
 
F
R
 
R
A
 
Q
K
 
M
P
 
P
A
 
K
K
 
L
E
 
S
G
 
T
S
 
G
A
 
N
H
|
H
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
V
W
 
F
L
 
D
P
 
G
D
 
K
G
 
G
T
 
Y
L
 
L
I
 
F
V
 
I
T
 
A
L
 
L
G
 
G
D
x
E
G
 
N
F
 
-
D
 
N
Y
 
Q
R
 
R
E
 
P
Q
 
T
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
L
 
L
S
 
D
S
 
K
H
 
L
L
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
L
N
 
T
P
 
D
D
 
Q
G
 
G
S
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
D
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
I
G
 
K
R
 
E
E
 
S
G
 
G
A
 
V
L
 
R
P
 
A
E
 
E
I
 
I
Y
 
W
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
I
R
|
R
N
 
N
V
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
V
 
A
F
 
M
D
 
N
S
 
P
V
 
W
E
 
S
N
 
N
V
 
A
L
 
L
I
 
W
A
 
L
H
 
N
E
 
E
H
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
I
 
I
I
 
P
E
 
Q
P
 
K
G
 
G
H
 
K
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
V
 
L
I
 
A
T
|
T
H
 
W
G
|
G
I
 
I
D
x
N
Y
 
Y
T
 
S
G
 
G
A
 
F
M
 
K
I
 
I
T
 
-
P
 
P
F
 
E
V
 
A
E
 
K
R
 
G
E
 
E
-
 
I
-
 
V
-
 
A
G
 
G
M
 
T
E
 
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
L
 
F
H
 
Y
W
 
W
T
 
K
P
 
D
S
 
S
I
 
P
A
 
A
P
 
V
S
 
S
G
 
G
M
 
M
T
 
A
R
 
F
Y
 
Y
R
 
N
G
 
S
E
 
D
L
 
K
F
 
F
P
 
P
D
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
G
 
Q
N
 
K
L
 
L
L
 
F
V
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
D
K
 
K
S
 
D
V
 
V
H
 
I
R
 
V
V
 
M
T
 
S
L
 
V
E
 
N
A
 
G
G
 
D
E
 
K
A
 
V
S
 
T
D
 
E
V
 
D
E
 
G
S
 
R
L
 
I
F
 
L
E
 
T
A
 
D
M
 
R
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
I
 
I
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
R
T
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
Y
V
 
L
Y
 
Y
L
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
E
A
 
S
D
 
S
G
 
G
R
 
E
I
 
L
L
 
L
R
 
K
I
 
V
L
 
S
P
 
P

7cgzA Glucose dehydrogenase
43% identity, 66% coverage: 172:509/511 of query aligns to 2:318/321 of 7cgzA

query
sites
7cgzA
T
 
T
V
 
V
E
 
S
T
 
Q
L
 
L
T
 
Q
S
 
D
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
H
P
 
P
W
 
W
S
 
S
L
 
L
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
A
-
 
E
G
 
Q
G
 
G
A
 
L
L
 
L
V
 
I
T
 
T
E
 
E
R
 
R
A
 
P
G
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
R
M
 
L
I
 
W
S
 
Q
E
 
Q
E
 
D
W
 
K
E
 
G
L
 
L
G
 
-
Q
 
S
A
 
P
P
 
P
I
 
I
T
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
P
 
Q
V
 
V
F
 
Y
N
 
A
D
 
E
A
 
G
Q
 
Q
A
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
P
S
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
A
N
 
A
N
 
S
Q
 
R
L
 
R
V
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
S
Y
 
F
S
 
A
-
 
E
C
 
P
G
 
G
T
 
E
A
 
G
S
 
G
A
 
K
N
 
A
H
 
G
L
 
T
C
 
A
V
 
V
A
 
G
R
 
Y
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
Q
 
S
A
 
D
E
 
D
-
 
D
-
 
A
A
 
R
L
 
L
T
 
E
E
 
N
V
 
F
V
 
K
E
 
V
I
 
I
F
 
F
R
 
R
A
 
Q
K
 
Q
P
 
P
A
 
K
K
 
L
E
 
S
G
 
V
S
 
G
A
 
N
H
 
H
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
K
M
 
L
A
 
A
W
 
F
L
 
D
P
 
R
D
 
Q
G
 
G
T
 
Y
L
 
L
I
 
F
V
 
I
T
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
E
G
 
N
F
 
-
D
 
N
Y
 
Q
R
 
R
E
 
P
Q
 
T
A
 
A
Q
 
Q
N
 
E
L
 
T
S
 
D
S
 
K
H
 
L
L
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
L
N
 
T
P
 
A
D
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
P
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
W
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
K
L
 
R
P
 
P
E
 
E
I
 
V
Y
 
W
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
R
 
R
N
 
N
V
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
A
F
 
L
D
 
N
S
 
P
V
 
W
E
 
S
N
 
G
V
 
A
L
 
I
I
 
W
A
 
E
H
 
H
E
 
E
H
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
E
|
E
I
 
L
N
 
N
I
 
I
I
 
P
E
 
L
P
 
P
G
 
G
H
 
K
N
 
N
Y
|
Y
G
 
-
W
 
-
P
 
-
V
 
-
I
 
-
T
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
Y
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
M
 
-
I
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
G
M
 
T
E
 
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
L
 
H
H
 
Y
W
 
W
T
 
R
P
 
V
S
 
S
I
 
P
A
 
G
P
 
L
S
 
S
G
 
G
M
 
M
T
 
A
R
 
F
Y
 
Y
R
 
D
G
 
G
E
 
Q
L
 
R
F
 
F
P
 
P
D
 
A
W
 
W
Q
 
R
G
 
H
N
 
S
L
 
L
L
 
F
V
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
K
 
K
S
 
A
V
 
L
H
 
I
R
 
R
V
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
G
G
 
D
E
 
K
A
 
V
S
 
V
D
 
A
V
 
E
E
 
E
S
 
R
L
 
L
F
 
L
E
 
G
A
 
D
M
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
D
 
E
V
 
V
A
 
R
T
 
S
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
Y
V
 
L
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
E
A
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
K
I
 
L
L
 
L
R
 
K
I
 
V

2ismB Crystal structure of the putative oxidoreductase (glucose dehydrogenase) (ttha0570) from thermus theromophilus hb8
36% identity, 65% coverage: 173:505/511 of query aligns to 4:319/333 of 2ismB

query
sites
2ismB
V
 
V
E
 
E
T
 
E
L
 
V
T
 
V
S
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
V
P
 
P
W
 
W
S
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
M
L
 
L
V
 
I
T
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
P
G
 
G
R
 
R
L
 
I
R
 
R
M
 
L
I
 
F
S
 
R
E
 
E
E
 
-
W
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
G
Q
 
R
A
 
L
P
 
S
I
 
T
T
 
Y
G
 
A
V
 
E
P
 
L
P
 
S
V
 
V
F
 
Y
N
 
H
D
 
R
A
 
G
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
G
V
 
L
L
 
A
L
 
L
S
 
H
P
 
P
D
 
R
F
 
F
E
 
P
N
 
Q
N
 
E
Q
 
P
L
 
Y
V
 
V
F
 
Y
L
 
A
A
 
Y
Y
 
R
S
 
T
C
 
V
G
 
A
T
 
E
A
 
G
S
 
G
A
 
L
N
 
R
H
 
N
L
 
Q
C
 
V
V
 
V
A
 
R
R
 
L
G
 
R
Q
 
H
L
 
L
Q
 
G
A
 
E
E
 
R
A
 
G
L
 
V
T
 
L
E
 
D
V
 
R
V
 
V
E
 
-
I
 
V
F
 
L
R
 
D
A
 
G
K
 
I
P
 
P
A
 
A
K
 
R
E
 
P
G
 
H
S
 
G
A
 
L
H
|
H
Y
 
S
G
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
I
A
 
A
W
 
F
L
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
M
L
 
L
I
 
Y
V
 
V
T
 
T
L
 
T
G
 
G
D
x
E
G
 
V
F
 
Y
D
 
E
Y
 
-
R
 
R
E
 
E
Q
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
L
 
L
S
 
A
S
 
S
H
 
L
L
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
L
N
 
T
P
 
P
D
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
P
P
 
A
A
 
P
D
 
G
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
R
P
 
P
E
 
E
I
 
V
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
 
N
V
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
A
F
 
W
D
 
H
S
 
P
V
 
K
E
 
T
N
 
G
V
 
E
L
 
L
I
 
F
A
 
S
H
 
S
E
 
E
H
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
Y
G
 
G
G
 
H
D
 
D
E
|
E
I
 
V
N
 
N
I
 
L
I
 
I
E
 
V
P
 
P
G
 
G
H
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
-
 
R
V
 
V
I
x
V
T
 
G
H
x
R
G
 
G
I
x
N
D
 
D
Y
 
P
T
 
R
G
 
-
A
 
-
M
 
-
I
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
M
 
Y
E
 
R
Q
 
D
P
 
P
L
 
L
L
 
Y
H
 
F
W
 
W
T
 
P
P
 
Q
S
 
G
I
 
F
A
 
P
P
 
P
S
 
G
G
 
N
M
 
L
T
 
A
R
 
F
Y
 
F
R
 
R
G
 
G
E
 
D
L
 
L
F
 
Y
P
 
-
D
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
V
G
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
R
D
 
G
K
 
Q
S
 
A
V
 
L
H
 
L
R
 
R
V
 
L
T
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
G
G
 
E
E
 
R
A
 
G
S
 
R
-
 
W
-
 
R
-
 
V
-
 
L
D
 
R
V
 
V
E
 
E
S
 
T
L
 
A
F
 
L
E
 
S
A
 
G
M
 
F
G
 
G
E
 
-
R
 
R
I
 
L
R
 
R
D
 
E
V
 
V
A
 
Q
T
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
L
Y
 
Y
L
 
V
L
 
T
T
 
T
D
 
S
S
 
N
A
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R

3a9hA Crystal structure of pqq-dependent sugar dehydrogenase holo-form (see paper)
38% identity, 66% coverage: 171:505/511 of query aligns to 4:320/338 of 3a9hA

query
sites
3a9hA
Y
 
F
T
 
K
V
 
I
E
 
S
T
 
E
L
 
V
T
 
A
S
 
S
G
 
D
L
 
L
E
 
E
H
 
V
P
 
P
W
 
W
S
 
S
L
 
I
A
 
A
F
 
P
L
 
L
P
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
R
A
 
Y
L
 
L
V
 
V
T
 
T
E
 
E
R
 
R
A
 
P
G
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
V
M
 
L
I
 
I
S
 
S
E
 
P
E
 
S
W
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
G
Q
 
K
A
 
K
P
 
L
I
 
V
T
 
A
G
 
S
V
 
F
P
 
D
P
 
-
V
 
V
F
 
A
N
 
N
D
 
V
A
 
G
Q
x
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
G
V
 
L
L
 
A
L
 
L
S
 
H
P
 
P
D
 
E
F
 
F
E
 
P
N
 
K
N
 
K
Q
 
S
L
 
W
V
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
-
Y
 
Y
S
 
A
C
 
S
G
 
Y
T
 
F
A
 
A
S
 
E
A
 
G
N
 
G
H
 
H
L
 
I
C
 
R
-
 
N
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
Q
 
D
A
 
G
E
 
S
-
 
T
-
 
F
A
 
K
L
 
L
T
 
K
E
 
E
V
 
V
V
 
K
E
 
T
I
 
L
F
 
I
R
 
D
A
 
G
K
 
I
P
 
P
A
 
G
K
 
-
E
 
-
G
 
A
S
 
Y
A
 
I
H
|
H
Y
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
I
A
 
R
W
 
F
L
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
M
L
 
L
I
 
Y
V
 
I
T
 
T
L
 
T
G
 
G
D
|
D
G
 
A
F
 
A
D
 
D
Y
 
P
R
|
R
E
 
-
Q
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
x
D
L
 
L
S
 
S
S
 
S
H
 
L
L
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
V
N
 
D
P
 
E
D
 
E
G
 
G
S
 
R
V
 
P
P
 
P
A
 
A
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
P
G
 
N
R
 
S
E
 
P
G
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
I
Y
 
W
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
|
N
V
 
P
Q
|
Q
G
 
G
L
 
I
V
 
D
F
 
W
D
 
H
S
 
R
V
 
A
E
 
S
N
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
V
A
 
A
H
 
T
E
 
E
H
|
H
G
 
G
P
 
P
R
x
V
G
 
G
G
 
H
D
 
D
E
|
E
I
 
V
N
 
N
I
 
I
I
 
I
E
 
L
P
 
K
G
 
G
H
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
V
 
L
I
 
A
T
|
T
H
 
-
G
 
G
I
x
K
D
 
A
Y
x
G
T
x
R
G
|
G
A
 
E
M
x
F
I
x
V
T
x
D
P
 
P
F
 
V
V
 
I
E
 
D
R
 
-
E
 
T
G
 
G
M
 
S
E
 
E
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
-
S
x
T
I
 
W
A
|
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
M
 
A
T
 
S
R
 
F
Y
 
V
R
 
H
G
 
G
E
 
D
L
 
M
F
 
F
P
 
P
D
 
G
W
 
L
Q
 
R
G
 
G
N
 
W
L
 
L
L
 
L
V
 
I
G
 
A
A
 
C
L
|
L
A
x
R
D
 
G
K
 
S
S
 
M
V
 
L
H
 
A
R
 
A
V
 
V
T
 
N
L
 
F
-
 
G
E
 
D
A
 
N
G
 
M
E
 
E
A
 
V
S
 
R
D
 
K
V
 
I
E
 
S
S
 
T
L
 
F
F
 
F
E
 
K
A
 
N
M
 
V
G
 
F
E
 
G
R
|
R
I
 
L
R
|
R
D
 
D
V
 
V
A
 
V
T
 
I
G
 
D
P
 
D
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
I
Y
 
L
L
 
I
L
 
S
T
 
T
D
 
S
S
 
N
A
 
R
D
 
D
G
 
G
R
|
R

3a9gA Crystal structure of pqq-dependent sugar dehydrogenase apo-form (see paper)
38% identity, 66% coverage: 171:505/511 of query aligns to 4:320/338 of 3a9gA

query
sites
3a9gA
Y
 
F
T
 
K
V
 
I
E
 
S
T
 
E
L
 
V
T
 
A
S
 
S
G
 
D
L
 
L
E
 
E
H
 
V
P
 
P
W
 
W
S
 
S
L
 
I
A
 
A
F
 
P
L
 
L
P
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
R
A
 
Y
L
 
L
V
 
V
T
 
T
E
 
E
R
 
R
A
 
P
G
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
V
M
 
L
I
 
I
S
 
S
E
 
P
E
 
S
W
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
G
Q
 
K
A
 
K
P
 
L
I
 
V
T
 
A
G
 
S
V
 
F
P
 
D
P
 
-
V
 
V
F
 
A
N
 
N
D
 
V
A
 
G
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
G
V
 
L
L
 
A
L
 
L
S
 
H
P
 
P
D
 
E
F
 
F
E
 
P
N
 
K
N
 
K
Q
 
S
L
 
W
V
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
-
Y
 
Y
S
 
A
C
 
S
G
 
Y
T
 
F
A
 
A
S
 
E
A
 
G
N
 
G
H
 
H
L
 
I
C
 
R
-
 
N
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
Q
 
D
A
 
G
E
 
S
-
 
T
-
 
F
A
 
K
L
 
L
T
 
K
E
 
E
V
 
V
V
 
K
E
 
T
I
 
L
F
 
I
R
 
D
A
 
G
K
 
I
P
 
P
A
 
G
K
 
-
E
 
-
G
 
A
S
 
Y
A
 
I
H
|
H
Y
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
I
A
 
R
W
 
F
L
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
M
L
 
L
I
 
Y
V
 
I
T
 
T
L
 
T
G
 
G
D
|
D
G
 
A
F
 
A
D
 
D
Y
 
P
R
|
R
E
 
-
Q
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
x
D
L
 
L
S
 
S
S
 
S
H
 
L
L
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
V
N
 
D
P
 
E
D
 
E
G
 
G
S
 
R
V
 
P
P
 
P
A
 
A
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
P
G
 
N
R
 
S
E
 
P
G
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
I
Y
 
W
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
 
N
V
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
I
V
 
D
F
 
W
D
 
H
S
 
R
V
 
A
E
 
S
N
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
V
A
 
A
H
 
T
E
 
E
H
 
H
G
 
G
P
 
P
R
 
V
G
 
G
G
 
H
D
 
D
E
|
E
I
 
V
N
 
N
I
 
I
I
 
I
E
 
L
P
 
K
G
 
G
H
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
V
 
L
I
 
A
T
|
T
H
 
-
G
 
G
I
x
K
D
 
A
Y
x
G
T
x
R
G
|
G
A
 
E
M
x
F
I
x
V
T
x
D
P
 
P
F
 
V
V
 
I
E
 
D
R
 
-
E
 
T
G
 
G
M
 
S
E
 
E
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
W
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
T
I
 
W
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
M
 
A
T
 
S
R
 
F
Y
 
V
R
 
H
G
 
G
E
 
D
L
 
M
F
 
F
P
 
P
D
 
G
W
 
L
Q
 
R
G
 
G
N
 
W
L
 
L
L
 
L
V
 
I
G
 
A
A
 
C
L
 
L
A
 
R
D
 
G
K
 
S
S
 
M
V
 
L
H
 
A
R
 
A
V
 
V
T
 
N
L
 
F
-
 
G
E
 
D
A
 
N
G
 
M
E
 
E
A
 
V
S
 
R
D
 
K
V
 
I
E
 
S
S
 
T
L
 
F
F
 
F
E
 
K
A
 
N
M
 
V
G
 
F
E
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
V
T
 
I
G
 
D
P
 
D
D
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
I
Y
 
L
L
 
I
L
 
S
T
 
T
D
 
S
S
 
N
A
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R

3dasA Structure of the pqq-bound form of aldose sugar dehydrogenase (adh) from streptomyces coelicolor
33% identity, 65% coverage: 173:505/511 of query aligns to 11:318/334 of 3dasA

query
sites
3dasA
V
 
L
E
 
R
T
 
T
L
 
V
T
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
L
E
 
N
H
 
S
P
 
P
W
 
W
S
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
P
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
D
A
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
S
E
 
S
R
 
R
-
 
D
-
 
E
A
 
A
G
 
T
R
 
I
L
 
T
R
 
R
M
 
V
I
 
D
S
 
A
E
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
R
E
 
K
W
 
T
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
P
 
P
I
 
-
T
 
-
G
 
G
V
 
V
P
 
S
P
 
P
V
 
S
F
 
-
N
 
-
D
 
-
A
 
G
Q
x
E
A
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
G
V
 
I
L
 
A
L
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
E
 
A
N
 
S
N
 
D
Q
 
H
L
 
M
V
 
V
F
 
Y
L
 
A
A
 
Y
Y
 
F
S
 
T
C
 
-
G
 
-
T
 
S
A
 
A
S
 
S
A
 
D
N
 
N
H
 
R
L
 
I
C
 
V
-
 
R
-
 
M
-
 
L
V
 
Y
A
 
D
R
 
E
G
 
K
Q
 
K
L
 
P
Q
 
S
A
 
G
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
T
 
G
E
 
A
V
 
P
V
 
D
E
 
T
I
 
V
F
 
F
R
 
R
A
 
G
K
 
I
P
 
P
A
 
-
K
 
-
E
 
K
G
 
G
S
 
V
A
 
I
H
|
H
Y
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
I
A
 
A
W
 
F
L
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
K
T
 
M
L
 
L
I
 
Y
V
 
A
T
 
G
L
 
T
G
 
G
D
x
E
G
 
S
F
 
G
D
 
D
Y
 
T
R
 
-
E
 
G
Q
 
L
A
 
S
Q
 
Q
N
 
D
L
 
R
S
 
K
S
 
S
H
 
L
L
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
L
R
 
R
L
 
M
N
 
T
P
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
E
V
 
P
P
 
A
A
 
P
D
 
G
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
P
G
 
G
R
 
S
E
 
P
G
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
V
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
|
N
V
 
V
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
A
F
 
W
D
 
D
S
 
D
V
x
K
E
 
Q
N
x
R
V
 
-
L
 
L
I
 
F
A
 
A
H
 
S
E
 
E
H
x
F
G
|
G
P
x
Q
R
 
D
G
 
T
G
 
W
D
 
D
E
|
E
I
 
L
N
 
N
I
 
A
I
 
I
E
 
K
P
 
P
G
 
G
H
 
D
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
V
 
E
I
 
-
T
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
A
D
x
E
Y
 
G
T
x
K
G
 
G
A
x
G
M
 
G
I
 
-
T
 
-
P
 
-
F
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
S
G
 
G
M
 
F
E
 
H
Q
 
D
P
 
P
L
 
V
L
 
A
H
 
Q
W
 
W
-
 
S
T
|
T
P
x
D
S
 
E
I
 
A
A
x
S
P
 
P
S
 
S
G
 
G
M
 
I
T
 
A
R
 
Y
Y
 
A
R
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
P
 
-
D
 
-
W
 
-
Q
 
E
G
 
G
N
 
S
L
 
V
L
 
W
V
 
M
G
 
A
A
 
G
L
|
L
A
x
R
D
x
G
K
x
E
S
x
R
V
 
L
H
 
W
R
 
R
V
 
I
T
 
P
L
|
L
E
x
K
A
x
G
-
 
T
G
 
A
E
 
A
A
 
A
S
 
A
D
 
D
V
 
P
E
 
Q
S
 
A
L
 
F
F
 
L
E
|
E
A
 
G
M
 
E
G
 
Y
E
 
G
R
|
R
I
 
L
R
|
R
D
 
T
V
 
V
A
 
A
T
 
P
G
 
A
P
 
G
D
 
G
G
 
D
A
 
K
V
 
L
Y
 
W
L
 
L
L
 
V
T
 
T
D
 
S
S
 
N
A
 
T
D
 
D
G
 
G
R
|
R

1cq1A Soluble quinoprotein glucose dehydrogenase from acinetobacter calcoaceticus in complex with pqqh2 and glucose (see paper)
27% identity, 67% coverage: 170:510/511 of query aligns to 16:434/444 of 1cq1A

query
sites
1cq1A
D
 
N
Y
 
F
T
 
D
V
 
K
E
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
L
S
 
S
G
 
N
L
 
L
E
 
N
H
 
K
P
 
P
W
 
H
S
 
A
L
 
L
A
 
L
F
 
W
L
 
G
P
 
P
G
 
D
G
 
N
G
 
Q
A
 
I
L
 
W
V
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
R
A
 
A
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
I
R
 
L
M
 
R
I
 
V
S
 
N
E
 
P
E
 
E
W
 
-
E
 
S
L
 
G
G
 
S
Q
 
V
A
 
K
P
 
T
I
 
V
T
 
F
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
P
 
E
V
 
I
F
 
V
N
 
N
D
 
D
A
 
A
-
 
D
-
 
G
Q
|
Q
A
 
N
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
G
V
 
F
L
 
A
L
 
F
S
 
H
P
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
K
N
 
N
N
 
N
Q
 
P
L
 
Y
V
 
I
F
 
Y
L
 
I
A
 
S
Y
 
G
S
 
T
C
 
F
G
 
K
T
 
N
A
 
P
S
 
K
A
 
P
N
 
N
H
 
Q
L
 
T
C
 
I
V
 
I
A
 
R
R
 
R
G
 
Y
Q
 
T
L
 
Y
Q
 
N
A
 
K
-
 
S
-
 
T
E
 
D
A
 
T
L
 
L
T
 
E
E
 
K
V
 
P
V
 
V
E
 
D
I
 
L
F
 
L
R
 
A
A
 
G
K
 
L
P
 
P
A
 
S
K
 
S
E
 
K
G
x
D
S
 
-
A
 
-
H
|
H
Y
 
Q
G
 
S
G
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
V
W
 
I
L
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
Q
T
 
K
L
 
I
I
 
Y
V
 
Y
T
 
T
L
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
Q
F
 
G
D
 
R
Y
 
N
R
x
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
F
-
 
L
-
 
P
E
 
N
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
-
 
H
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
K
N
 
D
L
 
Y
S
 
H
S
 
T
H
 
Y
L
 
M
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
L
N
 
N
P
 
L
D
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
I
P
 
P
A
 
K
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
S
V
 
F
G
 
-
R
 
-
E
 
N
G
 
G
A
 
V
L
 
V
P
 
S
E
 
H
I
 
I
Y
 
Y
S
 
T
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
|
N
V
 
P
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
A
F
 
F
D
 
-
S
 
T
V
 
P
E
 
N
N
 
G
V
 
K
L
 
L
I
 
L
A
 
Q
H
 
S
E
 
E
H
x
Q
G
|
G
P
|
P
R
 
N
G
 
S
G
 
D
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
I
 
L
I
 
I
E
 
V
P
 
K
G
 
G
H
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
V
 
N
-
 
V
-
x
A
-
 
G
-
x
Y
-
 
K
-
x
D
-
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
N
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
P
I
 
V
T
 
T
H
 
K
G
x
E
I
 
S
D
 
E
Y
 
W
T
 
T
G
 
G
A
 
K
M
 
N
I
 
F
T
 
V
P
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
-
 
V
-
 
Q
-
 
D
-
 
T
-
 
Y
-
 
N
F
 
Y
V
 
N
E
 
D
R
 
P
E
 
T
G
 
C
M
 
G
E
 
E
Q
 
M
P
 
T
L
x
Y
L
 
I
H
 
C
W
|
W
T
 
-
P
 
P
S
x
T
I
 
V
A
|
A
P
 
P
S
 
S
G
 
S
M
 
A
T
 
Y
R
 
V
Y
 
Y
R
 
K
G
 
G
-
 
G
-
 
K
E
 
K
L
 
A
F
 
I
P
 
T
D
 
G
W
 
W
Q
 
E
G
 
N
N
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
V
G
 
P
A
 
S
L
|
L
A
x
K
D
 
R
K
 
G
S
 
V
V
 
I
H
 
F
R
 
R
V
 
I
T
 
K
L
 
L
E
 
D
A
 
P
G
 
T
E
 
Y
A
 
S
S
 
T
-
 
T
-
 
Y
-
 
D
D
 
D
V
 
A
E
 
V
S
 
P
L
 
M
F
 
F
E
 
K
A
 
S
M
 
-
G
 
N
E
 
N
R
|
R
I
 
Y
R
|
R
D
 
D
V
 
V
A
 
I
T
 
A
G
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
N
V
 
V
-
 
L
Y
 
Y
L
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
T
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
D
D
 
D
G
 
G
R
 
S
I
 
V
L
 
T
R
 
N
I
 
T
L
 
L

1c9uA Crystal structure of the soluble quinoprotein glucose dehydrogenase in complex with pqq (see paper)
27% identity, 67% coverage: 170:510/511 of query aligns to 16:434/444 of 1c9uA

query
sites
1c9uA
D
 
N
Y
 
F
T
 
D
V
 
K
E
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
L
S
 
S
G
 
N
L
 
L
E
 
N
H
 
K
P
 
P
W
 
H
S
 
A
L
 
L
A
 
L
F
 
W
L
 
G
P
 
P
G
 
D
G
 
N
G
 
Q
A
 
I
L
 
W
V
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
R
A
 
A
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
I
R
 
L
M
 
R
I
 
V
S
 
N
E
 
P
E
 
E
W
 
-
E
 
S
L
 
G
G
 
S
Q
 
V
A
 
K
P
 
T
I
 
V
T
 
F
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
P
 
E
V
 
I
F
 
V
N
 
N
D
 
D
A
 
A
-
 
D
-
 
G
Q
|
Q
A
 
N
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
G
V
 
F
L
 
A
L
 
F
S
 
H
P
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
K
N
 
N
N
 
N
Q
 
P
L
 
Y
V
 
I
F
 
Y
L
 
I
A
 
S
Y
 
G
S
 
T
C
 
F
G
 
K
T
 
N
A
 
P
S
 
K
A
 
P
N
 
N
H
 
Q
L
 
T
C
 
I
V
 
I
A
 
R
R
 
R
G
 
Y
Q
 
T
L
 
Y
Q
 
N
A
 
K
-
 
S
-
 
T
E
 
D
A
 
T
L
 
L
T
 
E
E
 
K
V
 
P
V
 
V
E
 
D
I
 
L
F
 
L
R
 
A
A
 
G
K
 
L
P
 
P
A
 
S
K
 
S
E
 
K
G
 
D
S
 
-
A
 
-
H
|
H
Y
 
Q
G
 
S
G
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
V
W
 
I
L
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
Q
T
 
K
L
 
I
I
 
Y
V
 
Y
T
 
T
L
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
Q
F
 
G
D
 
R
Y
 
N
R
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
F
-
 
L
-
 
P
E
 
N
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
-
 
H
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
K
N
 
D
L
 
Y
S
 
H
S
 
T
H
 
Y
L
 
M
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
L
N
 
N
P
 
L
D
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
I
P
 
P
A
 
K
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
S
V
 
F
G
 
-
R
 
-
E
 
N
G
 
G
A
 
V
L
 
V
P
 
S
E
 
H
I
 
I
Y
 
Y
S
 
T
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
|
N
V
 
P
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
A
F
 
F
D
 
-
S
 
T
V
 
P
E
 
N
N
 
G
V
 
K
L
 
L
I
 
L
A
 
Q
H
 
S
E
 
E
H
x
Q
G
|
G
P
|
P
R
 
N
G
 
S
G
 
D
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
I
 
L
I
 
I
E
 
V
P
 
K
G
 
G
H
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
V
 
N
-
 
V
-
x
A
-
 
G
-
x
Y
-
 
K
-
x
D
-
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
N
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
P
I
 
V
T
 
T
H
 
K
G
x
E
I
 
S
D
 
E
Y
 
W
T
 
T
G
 
G
A
 
K
M
 
N
I
 
F
T
 
V
P
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
-
 
V
-
 
Q
-
 
D
-
 
T
-
 
Y
-
 
N
F
 
Y
V
 
N
E
 
D
R
 
P
E
 
T
G
 
C
M
 
G
E
 
E
Q
 
M
P
 
T
L
x
Y
L
 
I
H
 
C
W
|
W
T
 
-
P
 
P
S
x
T
I
 
V
A
|
A
P
 
P
S
 
S
G
 
S
M
 
A
T
 
Y
R
 
V
Y
 
Y
R
 
K
G
 
G
-
 
G
-
 
K
E
 
K
L
 
A
F
 
I
P
 
T
D
 
G
W
 
W
Q
 
E
G
 
N
N
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
V
G
 
P
A
 
S
L
|
L
A
x
K
D
 
R
K
 
G
S
 
V
V
 
I
H
 
F
R
 
R
V
 
I
T
 
K
L
 
L
E
 
D
A
 
P
G
 
T
E
 
Y
A
 
S
S
 
T
-
 
T
-
 
Y
-
 
D
D
 
D
V
 
A
E
 
V
S
 
P
L
 
M
F
 
F
E
 
K
A
 
S
M
 
-
G
 
N
E
 
N
R
|
R
I
 
Y
R
|
R
D
 
D
V
 
V
A
 
I
T
 
A
G
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
N
V
 
V
-
 
L
Y
 
Y
L
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
T
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
D
D
 
D
G
 
G
R
 
S
I
 
V
L
 
T
R
 
N
I
 
T
L
 
L

5minB Apo form of the soluble pqq-dependent glucose dehydrogenase from acinetobacter calcoaceticus
27% identity, 67% coverage: 170:510/511 of query aligns to 16:440/453 of 5minB

query
sites
5minB
D
 
N
Y
 
F
T
 
D
V
 
K
E
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
L
S
 
S
G
 
N
L
 
L
E
 
N
H
 
K
P
 
P
W
 
H
S
 
A
L
 
L
A
 
L
F
 
W
L
 
G
P
 
P
G
 
D
G
 
N
G
 
Q
A
 
I
L
 
W
V
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
R
A
 
A
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
I
R
 
L
M
 
R
I
 
V
S
 
N
E
 
P
E
 
E
W
 
-
E
 
S
L
 
G
G
 
S
Q
 
V
A
 
K
P
 
T
I
 
V
T
 
F
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
P
 
E
V
 
I
F
 
V
N
 
N
D
 
D
A
 
A
-
 
D
-
 
G
Q
 
Q
A
 
N
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
G
V
 
F
L
 
A
L
 
F
S
 
H
P
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
K
N
 
N
N
 
N
Q
 
P
L
 
Y
V
 
I
F
 
Y
L
 
I
A
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
K
-
 
N
-
 
P
Y
 
K
S
 
S
C
 
T
G
 
D
T
 
K
A
 
A
S
 
L
A
 
P
N
 
N
H
 
Q
L
 
T
C
 
I
V
 
I
A
 
R
R
 
R
G
 
Y
Q
 
T
L
 
Y
Q
 
N
A
 
K
-
 
S
-
 
T
E
 
D
A
 
T
L
 
L
T
 
E
E
 
K
V
 
P
V
 
V
E
 
D
I
 
L
F
 
L
R
 
A
A
 
G
K
 
L
P
 
P
A
 
S
K
 
S
E
 
K
G
 
D
S
 
-
A
 
-
H
|
H
Y
 
Q
G
 
S
G
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
V
W
 
I
L
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
Q
T
 
K
L
 
I
I
 
Y
V
 
Y
T
 
T
L
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
Q
F
 
G
D
 
R
Y
 
N
R
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
F
-
 
L
-
 
P
E
 
N
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
-
 
H
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
K
N
 
D
L
 
Y
S
 
H
S
 
T
H
 
Y
L
 
M
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
L
N
 
N
P
 
L
D
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
I
P
 
P
A
 
K
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
S
V
 
F
G
 
-
R
 
-
E
 
N
G
 
G
A
 
V
L
 
V
P
 
S
E
 
H
I
 
I
Y
 
Y
S
 
T
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
 
N
V
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
A
F
 
F
D
 
-
S
 
T
V
 
P
E
 
N
N
 
G
V
 
K
L
 
L
I
 
L
A
 
Q
H
 
S
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
P
 
P
R
 
N
G
 
S
G
 
D
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
I
 
L
I
 
I
E
 
V
P
 
K
G
 
G
H
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
V
 
N
-
 
V
-
x
A
-
 
G
-
x
Y
-
 
K
-
x
D
-
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
N
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
P
I
 
V
T
 
T
H
 
K
G
x
E
I
 
S
D
 
E
Y
 
W
T
 
T
G
 
G
A
 
K
M
 
N
I
 
F
T
 
V
P
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
-
 
V
-
 
Q
-
 
D
-
 
T
-
 
Y
-
 
N
F
 
Y
V
 
N
E
 
D
R
 
P
E
 
T
G
 
C
M
 
G
E
 
E
Q
 
M
P
 
T
L
 
Y
L
 
I
H
 
C
W
 
W
T
 
-
P
 
P
S
 
T
I
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
S
M
 
A
T
 
Y
R
 
V
Y
 
Y
R
 
K
G
 
G
-
 
G
-
 
K
E
 
K
L
 
A
F
 
I
P
 
T
D
 
G
W
 
W
Q
 
E
G
 
N
N
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
V
G
 
P
A
 
S
L
 
L
A
 
K
D
 
R
K
 
G
S
 
V
V
 
I
H
 
F
R
 
R
V
 
I
T
 
K
L
 
L
E
 
D
A
 
P
G
 
T
E
 
Y
A
 
S
S
 
T
-
 
T
-
 
Y
-
 
D
D
 
D
V
 
A
E
 
V
S
 
P
L
 
M
F
 
F
E
 
K
A
 
S
M
 
-
G
 
N
E
 
N
R
 
R
I
 
Y
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
I
T
 
A
G
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
N
V
 
V
-
 
L
Y
 
Y
L
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
T
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
D
D
 
D
G
 
G
R
 
S
I
 
V
L
 
T
R
 
N
I
 
T
L
 
L

P13650 Quinoprotein glucose dehydrogenase B; Glucose dehydrogenase B [pyrroloquinoline-quinone]; Soluble glucose dehydrogenase; s-GDH; EC 1.1.5.2 from Acinetobacter calcoaceticus (see paper)
27% identity, 65% coverage: 170:502/511 of query aligns to 40:450/478 of P13650

query
sites
P13650
D
 
N
Y
 
F
T
 
D
V
 
K
E
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
L
S
 
S
G
 
N
L
 
L
E
 
N
H
 
K
P
 
P
W
 
H
S
 
A
L
 
L
A
 
L
F
 
W
L
 
G
P
 
P
G
 
D
G
 
N
G
 
Q
A
 
I
L
 
W
V
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
R
A
 
A
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
I
R
 
L
M
 
R
I
 
V
S
 
N
E
 
P
E
 
E
W
 
-
E
 
S
L
 
G
G
 
S
Q
 
V
A
 
K
P
 
T
I
 
V
T
 
F
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
P
 
E
V
 
I
F
 
V
N
 
N
D
 
D
A
 
A
-
 
D
-
 
G
Q
|
Q
A
 
N
G
 
G
L
 
L
F
 
L
D
 
G
V
 
F
L
 
A
L
 
F
S
 
H
P
 
P
D
 
D
F
 
F
E
 
K
N
 
N
N
 
N
Q
 
P
L
 
Y
V
 
I
F
 
Y
L
 
I
A
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
K
-
 
N
-
 
P
Y
 
K
S
 
S
C
 
T
G
 
D
T
 
K
A
 
E
S
 
L
A
 
P
N
 
N
H
 
Q
L
 
T
C
 
I
V
 
I
A
 
R
R
 
R
G
 
Y
Q
 
T
L
 
Y
Q
 
N
A
 
K
-
 
S
-
 
T
E
 
D
A
 
T
L
 
L
T
 
E
E
 
K
V
 
P
V
 
V
E
 
D
I
 
L
F
 
L
R
 
A
A
 
G
K
 
L
P
 
P
A
 
S
K
 
S
E
 
K
G
x
D
S
 
-
A
 
-
H
 
H
Y
 
Q
G
 
S
G
 
G
R
 
R
M
 
L
A
 
V
W
 
I
L
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
Q
T
 
K
L
 
I
I
 
Y
V
 
Y
T
 
T
L
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
Q
F
 
G
D
 
R
Y
 
N
R
x
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
F
-
 
L
-
 
P
E
 
N
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
-
 
H
-
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
K
N
 
D
L
 
Y
S
 
H
S
 
T
H
 
Y
L
 
M
G
 
G
K
 
K
I
 
V
V
 
L
R
 
R
L
 
L
N
 
N
P
 
L
D
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
I
P
 
P
A
 
K
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
S
V
 
F
G
 
N
R
 
-
E
 
-
G
 
G
A
 
V
L
 
V
P
 
S
E
 
H
I
 
I
Y
 
Y
S
 
T
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
 
N
V
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
A
F
 
F
D
 
-
S
 
T
V
 
P
E
 
N
N
 
G
V
 
K
L
 
L
I
 
L
A
 
Q
H
 
S
E
 
E
H
 
Q
G
|
G
P
|
P
R
 
N
G
 
S
G
 
D
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
I
 
L
I
 
I
E
 
V
P
 
K
G
 
G
H
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
V
 
N
-
 
V
-
x
A
-
 
G
-
x
Y
-
 
K
-
x
D
-
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
N
-
 
Y
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
N
-
 
K
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
P
I
 
V
T
 
T
H
 
K
G
x
E
I
 
S
D
 
E
Y
 
W
T
 
T
G
 
G
A
 
K
M
 
N
I
 
F
T
 
V
P
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
-
 
V
-
 
Q
-
 
D
-
 
T
-
 
Y
-
 
N
F
 
Y
V
 
N
E
 
D
R
 
P
E
 
T
G
 
C
M
 
G
E
 
E
Q
 
M
P
 
T
L
x
Y
L
 
I
H
 
C
W
 
W
T
 
-
P
 
P
S
x
T
I
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
S
M
 
A
T
 
Y
R
 
V
Y
 
Y
R
 
K
G
 
G
-
 
G
-
 
K
E
 
K
L
 
A
F
 
I
P
 
T
D
 
G
W
 
W
Q
 
E
G
 
N
N
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
V
G
 
P
A
 
S
L
 
L
A
x
K
D
 
R
K
 
G
S
 
V
V
 
I
H
 
F
R
 
R
V
 
I
T
 
K
L
 
L
E
 
D
A
 
P
G
 
T
E
 
Y
A
 
S
S
 
T
-
 
T
-
 
Y
-
 
D
D
 
D
V
 
A
E
 
V
S
 
P
L
 
M
F
 
F
E
 
K
A
 
S
M
 
-
G
 
N
E
 
N
R
 
R
I
 
Y
R
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
I
T
 
A
G
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
N
V
 
V
-
 
L
Y
 
Y
L
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
S
 
T
A
 
A

1cruA Soluble quinoprotein glucose dehydrogenase from acinetobacter calcoaceticus in complex with pqq and methylhydrazine (see paper)
27% identity, 67% coverage: 170:510/511 of query aligns to 16:438/448 of 1cruA

query
sites
1cruA
D
 
N
Y
 
F
T
 
D
V
 
K
E
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
L
S
 
S
G
 
N
L
 
L
E
 
N
H
 
K
P
 
P
W
 
H
S
 
A
L
 
L
A
 
L
F
 
W
L
 
G
P
 
P
G
 
D
G
 
N
G
 
Q
A
 
I
L
 
W
V
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
R
A
 
A
-
 
T
G
 
G
R