SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2259 FitnessBrowser__WCS417:GFF2259 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
82% identity, 100% coverage: 1:257/257 of query aligns to 1:257/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
M
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
I
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
T
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
P
Q
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
A
 
Q
M
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
R
Q
 
Q
A
 
D
S
 
S
I
 
I
D
 
D
G
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
V
A
 
E
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
K
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
D
 
E
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
E
S
 
S
Y
 
Y
D
 
E
R
 
K
L
 
L
F
 
F
S
 
A
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
F
 
F
T
 
T
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
H
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
|
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
|
E
P
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
S
 
S
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
I
 
I
K
 
K
Q
 
H
G
 
R
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
|
H
W
|
W
D
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
|
F
A
 
A
K
 
R
H
 
Y
E
 
E
G
 
N
L
 
R
A
 
P
P
 
R
G
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
K
Q
 
R
R
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
E
E
 
A
V
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
A
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
A
E
 
E
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
A
 
S
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
M
 
M
N
 
S

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
37% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 3:256/256 of Q48436

query
sites
Q48436
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
S
x
A
A
x
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
x
K
A
|
A
F
x
I
A
|
A
Q
x
L
A
x
R
Y
x
L
I
x
V
A
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
T
x
A
V
|
V
A
|
A
I
|
I
A
|
A
D
|
D
I
 
Y
D
 
N
L
 
D
Q
 
A
R
 
T
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
E
L
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
P
 
G
Q
 
R
A
 
A
Y
 
M
A
 
A
V
 
V
A
 
K
M
 
V
D
|
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
R
A
 
D
S
 
Q
I
 
V
D
 
F
G
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
E
A
 
Q
V
 
A
V
 
R
A
 
K
Q
 
T
A
 
L
G
 
G
K
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
G
L
 
V
F
 
A
D
 
P
L
 
S
A
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
E
D
 
S
I
 
I
T
 
T
R
 
P
D
 
E
S
 
I
Y
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
V
F
 
Y
S
 
N
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
I
F
 
W
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
H
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
C
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
P
 
P
L
 
E
V
 
L
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
D
L
 
L
I
 
A
K
 
P
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
K
G
 
T
E
 
P
H
 
M
W
 
W
D
 
A
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
R
L
 
Q
F
 
V
A
 
S
K
 
E
H
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
K
A
 
P
P
 
L
G
 
G
E
 
Y
K
 
G
K
 
T
Q
 
A
R
 
E
V
 
F
G
 
A
A
 
K
E
 
R
V
 
I
P
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
S
T
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
A
M
 
C
A
 
V
I
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
P
E
 
D
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
V
M
 
F
N
 
N

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
37% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 3:256/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
L
A
 
R
Y
 
L
I
 
V
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
T
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
Y
D
 
N
L
 
D
Q
 
A
R
 
T
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
E
L
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
P
 
G
Q
 
H
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
K
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Q
x
R
A
x
D
S
 
Q
I
 
V
D
x
F
G
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
E
A
 
Q
V
 
A
V
 
R
A
 
K
Q
 
T
A
 
L
G
 
G
K
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
V
F
 
A
D
 
P
L
 
S
A
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
E
D
 
S
I
 
I
T
 
T
R
 
P
D
 
E
S
 
I
Y
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
V
F
 
Y
S
 
N
I
|
I
N
 
N
V
 
V
A
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
I
F
 
W
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
x
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
H
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
C
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
P
 
P
L
 
E
V
 
L
A
 
A
I
 
V
Y
|
Y
C
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
D
L
 
L
I
 
A
K
 
P
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
K
G
x
T
E
 
P
H
x
M
W
 
W
D
 
A
G
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
R
L
 
Q
F
x
V
A
 
S
K
 
E
H
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
K
A
 
P
P
 
L
G
 
G
E
 
Y
K
 
G
K
 
T
Q
 
A
R
 
E
V
 
F
G
 
A
A
 
K
E
 
R
V
 
I
P
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
S
T
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
A
M
 
C
A
 
V
I
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
P
E
 
D
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
V
M
 
F
N
 
N

3wyeA Crystal structure of chimeric engineered (2s,3s)-butanediol dehydrogenase complexed with NAD+
37% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 2:255/255 of 3wyeA

query
sites
3wyeA
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
L
A
 
R
Y
 
L
I
 
V
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
T
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
Y
D
 
N
L
 
D
Q
 
A
R
 
T
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
T
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
E
L
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
P
 
G
Q
 
H
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
K
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
R
A
 
D
S
 
Q
I
 
V
D
 
F
G
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
E
A
 
Q
V
 
A
V
 
R
A
 
K
Q
 
T
A
 
L
G
 
G
K
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
I
F
 
A
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
L
D
 
E
I
 
V
T
 
T
R
 
E
D
 
E
S
 
D
Y
 
L
D
 
K
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
S
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
H
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
P
 
P
L
 
I
V
 
L
A
 
S
I
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
D
L
 
L
I
 
A
K
 
P
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
G
x
T
E
 
G
H
x
M
W
|
W
D
 
E
G
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
E
F
x
L
A
 
S
K
 
K
H
 
I
E
 
N
G
 
G
L
 
K
A
 
P
P
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
Q
 
K
R
 
E
V
 
Y
G
 
S
A
 
S
E
 
S
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
T
 
V
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
P
E
 
D
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
V
M
 
F
N
 
N

3a28C Crystal structure of l-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
38% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 2:257/257 of 3a28C

query
sites
3a28C
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
F
 
I
A
 
S
Q
 
E
A
 
K
Y
 
L
I
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
T
 
D
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
P
L
 
Q
Q
|
Q
R
 
E
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
T
 
A
A
 
E
A
 
T
-
 
I
-
 
K
-
 
L
-
 
I
E
 
E
L
 
A
G
 
A
P
 
D
Q
 
Q
-
 
K
A
 
A
Y
 
V
A
 
F
V
 
V
A
 
G
M
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
S
 
N
I
 
F
D
 
D
G
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
D
A
 
E
V
 
A
V
 
A
A
 
E
Q
 
K
A
 
L
G
 
G
K
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
A
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
L
D
 
E
I
 
V
T
 
T
R
 
E
D
 
E
S
 
D
Y
 
L
D
 
K
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
S
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
S
R
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
D
R
 
E
Q
 
L
G
 
G
H
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
P
 
P
L
 
I
V
 
L
A
 
S
I
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
Q
N
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
P
Q
 
K
G
 
G
I
 
H
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
G
x
T
E
 
G
H
x
M
W
|
W
D
 
E
G
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
E
F
x
L
A
 
S
K
 
K
H
 
I
E
 
N
G
 
G
L
 
K
A
 
P
P
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
Q
 
K
R
 
E
V
 
Y
G
 
S
A
 
S
E
 
S
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
T
 
V
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
E
E
 
N
A
 
S
D
 
N
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
Y
 
M
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
L
M
 
Y
N
 
N

Q9ZNN8 L-2,3-butanediol dehydrogenase; L-BDH; (S,S)-butanediol dehydrogenase; Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; EC 1.1.1.76; EC 1.1.1.304 from Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium saccharolyticum) (see paper)
38% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 3:258/258 of Q9ZNN8

query
sites
Q9ZNN8
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
F
 
I
A
 
S
Q
 
E
A
 
K
Y
 
L
I
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
T
 
D
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
L
D
 
P
L
 
Q
Q
|
Q
R
 
E
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
T
 
A
A
 
E
A
 
T
-
 
I
-
 
K
-
 
L
-
 
I
E
 
E
L
 
A
G
 
A
P
 
D
Q
 
Q
-
 
K
A
 
A
Y
 
V
A
 
F
V
 
V
A
 
G
M
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
S
 
N
I
 
F
D
 
D
G
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
D
A
 
E
V
 
A
V
 
A
A
 
E
Q
 
K
A
 
L
G
 
G
K
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
A
D
 
Q
L
 
I
A
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
L
D
 
E
I
 
V
T
 
T
R
 
E
D
 
E
S
 
D
Y
 
L
D
 
K
R
 
Q
L
 
I
F
 
Y
S
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
F
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
S
R
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
D
R
 
E
Q
 
L
G
 
G
H
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
 
S
Q
x
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
x
F
P
 
P
L
 
I
V
 
L
A
 
S
I
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
Q
N
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
P
Q
 
K
G
 
G
I
 
H
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
|
V
D
x
G
G
x
T
E
 
G
H
 
M
W
 
W
D
 
E
G
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
E
F
 
L
A
 
S
K
 
K
H
 
I
E
 
N
G
 
G
L
 
K
A
 
P
P
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
Q
 
K
R
 
E
V
 
Y
G
 
S
A
 
S
E
 
S
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
P
G
 
S
T
 
V
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
E
E
 
N
A
 
S
D
 
N
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
Y
 
M
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
L
M
 
Y
N
 
N

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
38% identity, 100% coverage: 1:256/257 of query aligns to 2:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
K
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
F
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
V
Y
 
F
I
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
F
D
 
N
L
 
-
Q
 
E
R
 
A
A
 
A
Q
 
G
A
 
K
T
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
A
G
 
N
P
 
P
Q
 
G
A
 
V
Y
 
V
A
 
F
V
 
I
A
 
R
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
R
A
 
E
S
 
S
I
 
V
D
 
H
G
 
R
A
 
L
I
 
V
T
 
E
A
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
E
Q
 
R
A
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
T
D
 
R
L
x
D
A
 
S
P
 
M
I
 
L
V
 
S
D
x
K
I
 
M
T
 
T
R
 
V
D
 
D
S
 
Q
Y
 
F
D
 
Q
R
 
Q
L
 
V
F
 
I
S
 
N
I
 
V
N
|
N
V
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
H
T
 
C
L
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
L
R
 
P
Q
 
Y
M
 
M
I
 
A
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
H
 
K
G
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
T
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
R
 
Y
G
 
G
E
x
N
P
x
V
L
 
G
V
x
Q
A
 
T
I
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
W
G
 
A
L
 
K
N
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
R
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
F
V
x
T
D
 
E
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
x
T
A
 
A
L
x
M
F
 
V
A
 
A
K
 
E
H
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
V
P
 
P
G
 
E
E
 
K
K
 
V
K
 
I
Q
 
E
R
x
K
V
 
M
G
 
K
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
M
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
M
 
A
A
 
Y
I
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
H
E
 
E
A
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
N
A
 
G
Q
 
H
T
 
V
Y
 
L
N
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
I
W
 
M
M
 
M

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
37% identity, 99% coverage: 4:257/257 of query aligns to 5:258/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
E
 
S
G
 
G
K
 
R
S
 
K
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
S
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
Y
 
L
I
 
D
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
D
L
 
V
Q
 
M
R
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
T
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
G
L
 
L
G
 
E
P
 
N
Q
 
G
A
 
G
Y
 
F
A
 
A
V
 
V
A
 
E
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
Q
 
R
A
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
A
A
 
A
I
 
M
T
 
Q
A
 
K
V
 
A
V
 
I
A
 
D
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
K
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
L
L
 
L
I
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
 
V
F
 
S
D
 
T
L
 
M
A
 
R
P
 
P
I
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
T
 
T
R
 
D
D
 
E
S
 
E
Y
 
W
D
 
D
R
 
F
L
 
N
F
 
F
S
 
D
I
 
V
N
 
N
V
 
A
A
 
R
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
L
T
 
A
L
 
N
Q
 
Q
A
 
I
A
 
A
A
 
C
R
 
R
Q
 
H
M
 
F
I
 
L
R
 
A
Q
 
S
G
 
N
H
 
T
G
 
K
G
 
G
K
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
T
A
 
A
S
|
S
Q
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
K
R
 
V
G
 
G
E
 
A
P
 
P
L
 
L
V
x
L
A
 
A
I
 
H
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
F
S
 
G
L
 
W
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
R
N
 
E
L
 
M
I
 
A
K
 
P
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
V
 
F
V
|
V
D
 
K
G
x
T
E
 
A
H
x
M
W
 
Q
D
 
E
G
 
R
V
 
E
D
 
I
A
 
I
L
 
W
F
x
E
A
 
A
K
 
E
H
 
L
E
 
R
G
 
G
L
 
M
A
 
T
P
 
P
G
 
E
E
 
A
K
 
V
K
 
R
Q
 
A
R
 
E
V
 
Y
G
 
V
A
 
S
E
 
L
V
 
T
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
I
G
 
E
T
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
D
M
 
V
A
 
V
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
D
E
 
A
A
 
A
D
 
R
Y
 
F
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
G
Y
 
I
N
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
V
W
 
R
M
 
M
N
 
D

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
37% identity, 97% coverage: 7:256/257 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
F
 
I
A
 
A
Q
 
L
A
 
Q
Y
 
L
I
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
T
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
N
D
 
Y
I
 
A
-
 
G
D
 
S
L
 
K
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
V
A
 
E
E
 
E
L
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
P
 
V
Q
 
D
A
 
S
Y
 
F
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
M
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
D
 
D
Q
 
A
A
 
D
S
 
E
I
 
V
D
 
K
G
 
A
A
 
M
I
 
I
T
 
K
A
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
S
Q
 
Q
A
 
F
G
 
G
K
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
L
 
I
F
 
T
D
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
I
 
L
V
 
M
D
 
R
I
 
M
T
 
K
R
 
E
D
 
Q
S
 
E
Y
 
W
D
 
D
R
 
D
L
 
V
F
 
I
S
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
L
A
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
N
T
 
C
L
 
I
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
A
 
T
R
 
P
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
R
 
R
Q
 
Q
G
 
-
H
 
R
G
 
S
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
R
 
V
G
 
G
E
 
N
P
 
P
L
 
G
V
x
Q
A
 
A
I
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
D
 
V
G
 
S
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
D
G
 
M
V
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
S
G
 
D
E
 
E
K
 
L
K
 
K
Q
 
E
R
 
Q
V
 
M
G
 
L
A
 
T
E
 
Q
V
 
I
P
 
P
F
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
E
 
T
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
M
 
T
A
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
D
E
 
K
A
 
A
D
 
K
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
I
N
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
Y
M
 
M

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 6:254/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
K
 
K
S
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
E
Y
 
C
I
 
A
A
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
H
A
x
S
D
 
G
I
 
S
D
 
D
L
 
E
Q
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
G
A
 
A
T
 
L
A
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
E
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
G
Q
 
T
A
 
A
Y
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
G
M
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
D
 
D
Q
 
L
A
 
D
S
 
S
I
 
G
D
 
E
G
 
K
A
 
L
I
 
V
T
 
A
A
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
A
A
 
F
G
 
G
K
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
C
D
 
P
L
x
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
V
 
L
D
 
D
I
 
M
T
 
P
R
 
R
D
 
E
S
 
L
Y
 
Y
D
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
S
 
G
I
 
T
N
 
N
V
 
L
A
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
F
 
F
T
 
T
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
H
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
A
x
S
S
|
S
Q
 
I
A
x
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
P
 
A
L
 
M
V
x
Q
A
 
T
I
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
G
 
A
L
 
I
N
 
A
L
 
L
I
 
G
K
 
P
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
A
L
x
T
F
 
D
A
x
I
K
x
N
H
 
K
E
 
E
G
 
D
L
 
L
A
 
S
P
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
Q
 
E
R
 
R
V
 
M
G
 
T
A
 
S
E
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
x
D
E
x
M
A
 
A
D
x
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V
N
 
N

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 6:254/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
K
 
K
S
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
E
Y
 
C
I
 
A
A
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
H
A
 
S
D
 
G
I
 
S
D
 
D
L
 
E
Q
 
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
G
A
 
A
T
 
L
A
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
E
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
G
Q
 
T
A
 
A
Y
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
G
M
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
D
 
D
Q
 
L
A
 
D
S
 
S
I
 
G
D
 
E
G
 
K
A
 
L
I
 
V
T
 
A
A
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
A
A
 
F
G
 
G
K
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
C
D
 
P
L
 
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
V
 
L
D
 
D
I
 
M
T
 
P
R
 
R
D
 
E
S
 
L
Y
 
Y
D
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
S
 
G
I
x
T
N
 
N
V
 
L
A
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
F
 
F
T
 
T
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
H
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
P
 
A
L
 
M
V
 
Q
A
 
T
I
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
G
 
A
L
 
I
N
 
A
L
 
L
I
 
G
K
 
P
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
A
L
x
T
F
 
D
A
x
I
K
 
N
H
 
K
E
 
E
G
 
D
L
 
L
A
 
S
P
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
Q
 
E
R
 
R
V
 
M
G
 
T
A
 
S
E
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
D
E
 
M
A
 
A
D
 
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V
N
 
N

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:256/257 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
F
 
I
A
 
A
Q
 
L
A
 
Q
Y
 
L
I
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
T
 
N
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
x
N
D
x
Y
I
x
A
-
x
G
D
x
S
L
 
K
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
V
A
 
E
E
 
E
L
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
P
 
V
Q
 
D
A
 
S
Y
 
F
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
M
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
D
Q
 
A
A
 
D
S
 
E
I
 
V
D
 
K
G
 
A
A
 
M
I
 
I
T
 
K
A
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
S
Q
 
Q
A
 
F
G
 
G
K
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
I
F
 
T
D
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
I
 
L
V
 
M
D
 
R
I
 
M
T
 
K
R
 
E
D
 
Q
S
 
E
Y
 
W
D
 
D
R
 
D
L
 
V
F
 
I
S
 
D
I
x
T
N
 
N
V
 
L
A
 
K
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
N
T
 
C
L
 
I
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
A
 
T
R
 
P
Q
 
Q
M
 
M
I
 
L
R
 
R
Q
 
Q
G
 
-
H
 
R
G
 
S
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
R
 
V
G
 
G
E
 
N
P
 
P
L
 
G
V
x
Q
A
 
A
I
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
F
V
 
I
D
 
V
G
 
S
E
 
D
H
 
M
W
 
T
D
 
D
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
L
K
 
K
Q
 
E
R
 
Q
V
 
M
G
 
L
A
 
T
E
 
Q
V
 
I
P
 
P
F
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
E
 
T
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
M
 
T
A
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
D
E
 
K
A
 
A
D
 
K
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
I
N
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
Y
M
 
M

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
36% identity, 98% coverage: 3:253/257 of query aligns to 2:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
R
 
R
L
 
L
E
 
A
G
 
N
K
 
R
S
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
I
F
 
Y
A
 
A
Q
 
E
A
 
R
Y
 
F
I
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
I
D
 
N
L
 
E
Q
 
P
R
 
K
A
 
A
Q
 
T
A
 
E
T
 
V
A
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
I
-
 
T
E
 
S
L
 
L
G
 
G
P
 
G
Q
 
R
A
 
A
Y
 
I
A
 
A
V
 
A
A
 
A
M
 
V
D
 
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Q
 
V
A
 
E
S
 
S
I
 
V
D
 
N
G
 
R
A
 
M
I
 
V
T
 
D
A
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
A
A
 
F
G
 
G
K
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
|
A
L
 
I
F
 
F
D
x
S
-
 
T
-
 
L
-
 
K
L
 
M
A
 
K
P
 
P
I
 
F
V
 
E
D
 
E
I
 
I
T
 
S
R
 
G
D
 
D
S
 
E
Y
 
W
D
 
D
R
 
K
L
 
L
F
 
F
S
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
A
A
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
L
T
 
C
L
 
C
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
P
Q
 
V
M
 
M
I
 
-
R
 
R
Q
 
K
G
 
N
H
 
Q
G
 
Y
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
x
S
S
|
S
Q
 
S
A
 
V
G
 
V
R
 
V
R
 
T
G
 
G
E
 
R
P
 
P
L
 
N
V
 
Y
A
 
A
I
 
H
Y
|
Y
C
 
I
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
W
S
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
H
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
T
N
 
E
L
 
M
I
 
G
K
 
T
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
x
H
V
 
G
V
x
I
D
 
I
G
 
T
E
 
E
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
x
I
K
 
P
H
 
R
E
 
E
G
 
T
L
 
I
A
 
S
P
 
E
G
 
-
E
 
E
K
 
G
K
 
W
Q
 
R
R
 
R
V
 
N
G
 
L
A
 
E
E
 
E
V
 
Q
P
 
A
F
 
L
G
 
K
R
 
R
M
 
K
G
 
G
T
 
D
A
 
A
E
 
S
D
 
D
L
 
L
T
 
V
G
 
G
M
 
I
A
 
L
I
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
D
E
 
E
A
 
S
D
 
K
Y
 
F
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
V
N
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G

1zemA Crystal structure of NAD+-bound xylitol dehydrogenase (see paper)
35% identity, 98% coverage: 2:253/257 of query aligns to 1:260/260 of 1zemA

query
sites
1zemA
K
 
K
R
 
K
L
 
F
E
 
N
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
C
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
G
R
x
G
G
x
N
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
F
 
T
A
 
A
Q
 
L
A
 
R
Y
 
L
I
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
T
T
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
L
A
 
L
D
|
D
I
x
M
D
 
N
-
 
R
-
 
E
-
 
A
L
 
L
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
V
A
 
R
E
 
E
L
 
K
G
 
G
P
 
V
Q
 
E
A
 
A
Y
 
R
A
 
S
V
 
Y
A
 
V
M
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
S
Q
 
E
A
 
E
S
 
A
I
 
V
D
 
I
G
 
G
A
 
T
I
 
V
T
 
D
A
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
R
Q
 
D
A
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
F
L
 
L
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
 
Y
F
 
Q
D
 
G
-
 
A
L
 
F
A
 
A
P
 
P
I
 
V
V
 
Q
D
 
D
I
 
Y
T
 
P
R
 
S
D
 
D
S
 
D
Y
 
F
D
 
A
R
 
R
L
 
V
F
 
L
S
 
T
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
T
G
 
G
T
 
A
L
 
F
F
 
H
T
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
R
 
T
Q
 
Q
G
 
N
H
 
Y
G
 
G
G
 
-
K
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
T
A
 
A
S
|
S
Q
 
M
A
 
A
G
 
G
R
 
V
R
 
K
G
 
G
E
 
P
P
 
P
L
 
N
V
 
M
A
 
A
I
 
A
Y
|
Y
C
 
G
A
 
T
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
S
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
E
S
 
T
A
 
A
G
 
A
L
 
L
N
 
D
L
 
L
I
 
A
K
 
P
Q
 
Y
G
 
N
I
 
I
N
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
S
P
|
P
G
 
G
V
 
Y
V
x
M
-
 
G
D
 
P
G
 
G
E
 
F
H
 
M
W
 
W
D
 
E
G
 
R
V
 
Q
D
 
V
A
 
E
L
 
L
F
 
Q
A
 
A
K
 
K
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
Q
H
 
Y
E
 
F
G
 
S
L
 
T
A
x
D
P
 
P
G
 
K
E
 
V
K
 
V
K
 
A
Q
 
Q
R
 
Q
V
 
M
G
 
I
A
 
G
E
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
M
G
 
R
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
T
 
D
A
 
I
E
 
N
D
 
E
L
 
I
T
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
G
K
 
D
E
 
D
A
 
S
D
 
S
Y
 
F
V
 
M
V
 
T
A
 
G
Q
 
V
T
 
N
Y
 
L
N
 
P
V
 
I
D
 
A
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
36% identity, 98% coverage: 4:256/257 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
F
 
I
A
 
A
Q
 
I
A
 
N
Y
 
L
I
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
N
V
 
I
A
 
F
I
 
F
A
x
N
-
x
Y
D
x
N
I
x
G
D
x
S
L
 
P
Q
 
E
R
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
T
 
T
A
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
H
G
 
G
P
 
V
Q
 
E
A
 
V
Y
 
E
A
 
A
V
 
M
A
 
K
M
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
I
Q
 
A
A
 
E
S
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
A
A
 
F
I
 
F
T
 
K
A
 
Q
V
 
A
V
 
I
A
 
E
Q
 
R
A
 
F
G
 
G
K
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
x
I
F
 
T
D
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
I
 
L
V
 
M
D
 
R
I
 
M
T
 
K
R
 
E
D
 
D
S
 
E
Y
 
W
D
 
D
R
 
D
L
 
V
F
 
I
S
 
N
I
|
I
N
 
N
V
 
L
A
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
L
T
 
C
L
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
R
Q
 
T
M
 
M
I
 
M
R
 
K
Q
 
Q
G
 
-
H
 
R
G
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
L
R
 
I
G
 
G
E
 
N
P
 
A
L
 
G
V
x
Q
A
 
A
I
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
T
G
 
A
L
 
R
N
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
P
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
D
 
T
G
x
T
E
 
D
H
 
M
W
 
T
D
 
D
G
 
K
V
 
L
D
 
D
A
 
E
L
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
K
K
 
T
K
 
K
Q
 
E
R
 
A
V
 
M
G
 
L
A
 
A
E
 
Q
V
 
I
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
A
M
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
M
 
A
A
 
V
I
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
D
E
 
A
A
 
S
D
 
K
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
L
N
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
V
M
 
M

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
36% identity, 98% coverage: 7:257/257 of query aligns to 6:245/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
K
 
K
S
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
E
Y
 
C
I
 
A
A
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
R
V
 
V
A
 
V
I
 
I
-
 
G
-
x
H
A
x
S
D
 
G
I
 
S
D
 
D
L
 
E
Q
x
G
R
 
R
A
 
A
Q
 
G
A
 
A
T
 
L
A
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
E
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
G
Q
 
T
A
 
A
Y
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
G
M
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
D
 
D
Q
 
L
A
 
D
S
 
S
I
 
G
D
 
E
G
 
K
A
 
L
I
 
V
T
 
A
A
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
E
Q
 
A
A
 
F
G
 
G
K
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
C
D
 
P
L
 
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
V
 
L
D
 
D
I
 
M
T
 
P
R
 
R
D
 
E
S
 
L
Y
 
Y
D
 
L
R
 
K
L
 
T
F
 
V
S
 
G
I
x
T
N
 
N
V
 
L
A
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
Y
F
 
F
T
 
T
L
 
V
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
H
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
 
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
P
 
A
L
 
M
V
 
Q
A
 
T
I
 
H
Y
|
Y
C
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
G
 
A
L
 
I
N
 
A
L
 
L
I
 
G
K
 
P
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
A
P
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
Q
 
E
R
 
R
V
 
M
G
 
T
A
 
S
E
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
M
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
D
E
 
M
A
 
A
D
 
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
Y
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V
N
 
N

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
37% identity, 98% coverage: 3:253/257 of query aligns to 13:256/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
R
 
R
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
R
S
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
A
 
G
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
T
F
 
L
A
 
A
Q
 
R
A
 
G
Y
 
L
I
 
A
A
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
A
V
 
I
A
 
V
I
 
I
A
 
N
D
 
D
I
x
R
D
 
N
L
 
E
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
A
A
 
T
T
 
L
A
 
A
A
 
R
E
 
R
L
 
F
G
 
R
P
 
D
Q
 
E
A
 
G
Y
 
F
A
 
A
V
 
A
-
 
D
-
 
H
-
 
A
A
 
V
M
 
F
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
E
Q
 
H
A
 
A
S
 
Q
I
 
V
D
 
R
G
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
D
A
 
E
V
 
F
V
 
E
A
 
A
Q
 
R
A
 
V
G
 
G
K
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
L
 
I
F
 
Q
D
 
R
L
 
R
A
 
A
P
 
P
I
 
L
V
 
D
D
 
A
I
 
F
T
 
E
R
 
P
D
 
D
S
 
D
Y
 
W
D
 
H
R
 
A
L
 
L
F
 
M
S
 
R
I
 
V
N
 
N
V
 
L
A
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
N
T
 
V
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
H
M
 
M
I
 
I
R
 
A
Q
 
R
G
 
G
H
 
H
G
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
 
C
S
|
S
Q
 
V
A
 
Q
G
 
S
R
 
E
R
 
L
G
 
A
E
 
R
P
 
P
L
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
P
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
R
S
 
M
L
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
G
A
 
M
G
 
C
L
 
A
N
 
D
L
 
W
I
 
A
K
 
R
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
N
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
G
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
Y
V
x
F
D
 
E
G
x
T
E
 
E
H
x
L
W
x
N
D
 
R
G
 
A
V
 
L
-
 
V
-
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
A
F
 
F
A
 
S
K
 
-
H
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
Q
 
D
R
 
W
V
 
L
G
 
C
A
 
K
E
 
R
V
 
T
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
R
M
 
W
G
 
G
T
 
Q
A
 
V
E
 
D
D
 
E
L
 
L
T
 
C
G
 
G
M
 
A
A
 
A
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
A
E
 
A
A
 
S
D
 
D
Y
 
F
V
 
V
V
 
N
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
L
N
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:256/257 of query aligns to 3:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
T
Y
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
K
V
 
V
A
 
I
I
 
G
A
 
T
D
 
A
I
x
T
D
 
S
L
 
E
Q
 
S
R
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
S
A
 
D
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
A
Q
 
N
A
 
G
Y
 
K
A
 
G
V
 
L
A
 
M
M
x
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
Q
 
P
A
 
A
S
 
S
I
 
I
D
 
E
G
 
S
A
 
V
I
 
L
T
 
E
A
 
N
V
 
V
V
 
R
A
 
A
Q
 
E
A
 
F
G
 
G
K
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
A
x
G
L
x
I
F
 
T
D
 
R
L
 
D
A
 
N
P
 
L
I
 
L
V
 
M
D
 
R
I
 
M
T
 
K
R
 
D
D
 
D
S
 
E
Y
 
W
D
 
N
R
 
D
L
 
I
F
 
I
S
 
E
I
 
T
N
 
N
V
 
L
A
 
S
G
 
S
T
 
V
L
 
F
F
 
R
T
 
L
L
 
S
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
M
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
I
 
M
R
 
K
Q
 
K
G
 
R
H
 
H
G
 
-
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
M
 
I
A
 
G
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
R
 
M
G
 
G
E
 
N
P
 
A
L
 
G
V
 
Q
A
 
A
I
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
I
S
 
G
L
 
F
T
 
S
Q
 
K
S
 
S
A
 
L
G
 
A
L
 
R
N
 
E
L
 
V
I
 
A
K
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
N
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
D
 
E
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
T
D
 
D
G
 
M
V
 
T
D
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
T
K
 
D
K
 
E
Q
 
Q
R
 
R
V
 
A
G
 
G
-
 
T
-
 
L
A
 
A
E
 
A
V
 
V
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
P
E
 
N
D
 
E
L
 
I
T
 
A
G
 
S
M
 
A
A
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
D
E
 
E
A
 
A
D
 
S
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
E
T
 
T
Y
 
L
N
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
Y
M
 
M

3rwbA Crystal structure of complex of 4pal (4-pyridoxolactone) and pldh (tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase) from mesorhizobium loti
35% identity, 98% coverage: 2:253/257 of query aligns to 2:243/247 of 3rwbA

query
sites
3rwbA
K
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
A
A
 
R
Y
 
L
I
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
I
I
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
N
L
 
A
Q
 
E
R
 
G
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
K
Q
 
K
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
M
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
D
 
D
Q
 
P
A
 
G
S
 
S
I
 
V
D
 
K
G
 
A
A
 
L
I
 
F
T
 
A
A
 
E
V
 
I
V
 
Q
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
G
 
G
K
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
S
L
 
I
F
 
V
D
 
P
L
 
F
A
 
V
P
 
A
I
 
W
V
 
D
D
 
D
I
 
V
T
 
D
R
 
L
D
 
D
S
 
H
Y
 
W
D
 
R
R
 
K
L
 
I
F
 
I
S
 
D
I
 
V
N
 
N
V
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
I
T
 
V
L
 
T
Q
 
R
A
 
A
A
 
G
A
 
T
R
 
D
Q
 
Q
M
 
M
I
 
R
R
 
A
Q
 
A
G
 
G
H
 
K
G
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
I
N
 
S
M
x
I
A
 
A
S
|
S
Q
x
N
A
x
T
G
 
F
R
 
F
R
 
A
G
 
G
E
 
T
P
 
P
L
 
N
V
x
M
A
 
A
I
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
F
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
T
N
 
E
L
 
L
I
 
G
K
 
K
Q
 
Y
G
 
N
I
 
I
N
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
T
P
|
P
G
 
G
V
x
L
V
x
I
D
 
E
G
x
S
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
D
G
|
G
V
|
V
D
 
K
A
 
A
L
 
-
F
 
S
A
 
P
K
x
H
H
 
N
E
 
E
G
 
A
L
 
F
A
 
G
P
 
F
G
 
V
E
 
E
K
 
M
K
 
L
Q
 
Q
R
 
A
V
 
M
G
 
K
A
 
G
E
 
K
V
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
G
T
 
Q
A
 
P
E
 
E
D
 
H
L
 
I
T
 
A
G
 
D
M
 
V
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
D
E
 
D
A
 
A
D
 
R
Y
 
W
V
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G

3ndrA Crystal structure of tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase from mesorhizobium loti
35% identity, 98% coverage: 2:253/257 of query aligns to 2:243/247 of 3ndrA

query
sites
3ndrA
K
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
A
Q
 
A
A
 
R
Y
 
L
I
 
A
A
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
I
I
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
N
L
 
A
Q
 
E
R
 
G
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
T
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
S
L
 
I
G
 
G
P
 
K
Q
 
K
A
 
A
Y
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
M
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
D
 
D
Q
 
P
A
 
G
S
 
S
I
 
V
D
 
K
G
 
A
A
 
L
I
 
F
T
 
A
A
 
E
V
 
I
V
 
Q
A
 
A
Q
 
L
A
 
T
G
 
G
K
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
S
L
 
I
F
 
V
D
 
P
L
 
F
A
 
V
P
 
A
I
 
W
V
 
D
D
 
D
I
 
V
T
 
D
R
 
L
D
 
D
S
 
H
Y
 
W
D
 
R
R
 
K
L
 
I
F
 
I
S
 
D
I
x
V
N
 
N
V
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
F
F
 
I
T
 
V
L
 
T
Q
 
R
A
 
A
A
 
G
A
 
T
R
 
D
Q
 
Q
M
 
M
I
 
R
R
 
A
Q
 
A
G
 
G
H
 
K
G
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
I
 
I
N
 
S
M
x
I
A
 
A
S
|
S
Q
 
N
A
 
T
G
 
F
R
 
F
R
 
A
G
 
G
E
 
T
P
 
P
L
 
N
V
 
M
A
 
A
I
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
G
L
 
F
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
G
 
A
L
 
T
N
 
E
L
 
L
I
 
G
K
 
K
Q
 
Y
G
 
N
I
 
I
N
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
T
P
|
P
G
 
G
V
x
L
V
x
I
D
 
E
G
x
S
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
D
G
|
G
V
|
V
D
 
K
A
 
A
L
 
-
F
 
S
A
 
P
K
 
H
H
 
N
E
 
E
G
 
A
L
 
F
A
 
G
P
 
F
G
 
V
E
 
E
K
 
M
K
 
L
Q
 
Q
R
 
A
V
 
M
G
 
K
A
 
G
E
 
K
V
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
G
T
 
Q
A
 
P
E
 
E
D
 
H
L
 
I
T
 
A
G
 
D
M
 
V
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
K
 
D
E
 
D
A
 
A
D
 
R
Y
 
W
V
 
I
V
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
A
G
 
G

Query Sequence

>GFF2259 FitnessBrowser__WCS417:GFF2259
MKRLEGKSALITGSARGIGRAFAQAYIAEGATVAIADIDLQRAQATAAELGPQAYAVAMD
VTDQASIDGAITAVVAQAGKLDILINNAALFDLAPIVDITRDSYDRLFSINVAGTLFTLQ
AAARQMIRQGHGGKIINMASQAGRRGEPLVAIYCATKAAVISLTQSAGLNLIKQGINVNA
IAPGVVDGEHWDGVDALFAKHEGLAPGEKKQRVGAEVPFGRMGTAEDLTGMAIFLASKEA
DYVVAQTYNVDGGNWMN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory