SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2263 FitnessBrowser__Marino:GFF2263 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
64% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 4:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
S
 
N
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
|
T
S
 
S
E
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
S
 
A
I
 
I
T
 
S
N
 
D
D
 
Y
L
 
L
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
G
Y
 
D
K
 
N
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
M
 
M
V
 
A
M
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
D
 
N
P
 
P
A
 
E
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
V
L
 
L
K
 
K
E
 
A
L
 
I
T
 
T
E
 
D
K
 
E
S
 
F
G
 
G
A
 
G
P
 
V
L
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
M
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
E
D
 
E
D
 
E
W
 
W
A
 
S
S
 
D
V
 
I
L
 
M
E
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
T
S
 
S
V
 
I
Y
 
F
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
A
 
M
K
 
K
A
 
K
K
 
R
W
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
T
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
A
N
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
D
 
E
T
|
T
D
 
D
M
|
M
T
 
T
K
 
K
K
 
A
L
 
L
D
 
N
D
 
D
K
 
E
Q
 
Q
R
 
R
G
 
T
A
 
A
M
 
T
L
 
L
E
 
A
I
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
L
N
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
65% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 8:253/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
|
T
S
 
S
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
K
I
 
I
T
 
A
N
 
E
D
 
T
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
V
K
 
E
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
V
M
x
L
N
x
D
V
|
V
A
 
S
D
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
S
I
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
H
L
 
I
T
 
Q
E
 
Q
K
 
H
S
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
V
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
D
 
E
W
 
W
A
 
F
S
 
D
V
 
V
L
 
V
E
 
N
T
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
N
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
A
 
T
K
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
G
N
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
|
F
I
|
I
D
 
D
T
|
T
D
 
D
M
|
M
T
|
T
K
 
R
K
 
E
L
 
L
D
 
P
D
 
E
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
G
 
E
A
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
G
I
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
T
I
 
V
N
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
64% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 1:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
M
 
M
S
 
S
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
|
T
S
 
S
E
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
S
 
A
I
 
I
T
 
S
N
 
D
D
 
Y
L
 
L
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
G
Y
 
A
K
 
N
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
M
M
x
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
V
L
 
L
K
 
E
E
 
N
L
 
V
T
 
R
E
 
A
K
 
E
S
 
F
G
 
G
A
 
E
P
 
V
L
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
M
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
D
 
E
W
 
W
A
 
N
S
 
D
V
 
I
L
 
I
E
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
F
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
R
 
R
G
 
A
M
 
M
A
 
M
K
 
K
A
 
K
K
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
T
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
A
N
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
A
L
 
L
D
 
T
D
 
D
K
 
E
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
A
 
G
M
 
T
L
 
L
E
 
A
I
 
A
I
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
T
P
 
P
E
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
L
N
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
63% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 1:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
M
 
M
S
 
S
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
K
S
 
N
I
 
I
T
 
S
N
 
D
D
 
Y
L
 
L
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
G
Y
 
A
K
 
N
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
M
M
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
V
L
 
L
K
 
E
E
 
N
L
 
I
T
 
R
E
 
A
K
 
E
S
 
F
G
 
G
A
 
E
P
 
V
L
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
M
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
D
 
E
W
 
W
A
 
N
S
 
D
V
 
I
L
 
I
E
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
F
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
R
 
R
G
 
A
M
|
M
A
 
M
K
 
K
A
 
K
K
 
R
W
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
T
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
N
 
N
Y
 
Y
C
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
A
N
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
A
L
 
L
D
 
S
D
 
D
K
 
D
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
A
 
G
M
 
I
L
 
L
E
 
A
I
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
|
A
S
|
S
D
 
D
A
 
E
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
L
N
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
63% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 4:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
M
 
M
S
 
N
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
|
T
S
 
S
E
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
S
 
A
I
 
I
T
 
S
N
 
D
D
 
Y
L
 
L
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
G
Y
 
D
K
 
N
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
M
 
M
V
 
A
M
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
D
 
N
P
 
P
A
 
E
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
V
L
 
L
K
 
K
E
 
A
L
 
I
T
 
T
E
 
D
K
 
E
S
 
F
G
 
G
A
 
G
P
 
V
L
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
M
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
E
D
 
E
D
 
E
W
 
W
A
 
S
S
 
D
V
 
I
L
 
M
E
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
S
 
T
S
 
S
V
 
I
Y
 
F
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
A
 
M
K
 
K
A
 
K
K
 
R
W
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
V
S
x
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
T
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
G
 
A
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
K
S
 
S
L
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
A
N
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
D
 
E
T
|
T
D
 
D
M
 
M
T
 
-
K
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
N
D
 
D
K
 
E
Q
 
Q
R
 
R
G
 
T
A
 
A
M
 
T
L
 
L
E
 
A
I
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
L
N
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
63% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 1:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
M
 
M
S
 
N
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
T
x
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
|
T
S
 
S
E
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
S
 
A
I
 
I
T
 
S
N
 
D
D
 
Y
L
 
L
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
G
Y
 
A
K
 
N
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
M
M
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
V
L
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
I
T
 
R
E
 
A
K
 
E
S
 
F
G
 
G
A
 
E
P
 
V
L
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
M
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
E
D
 
E
W
 
W
A
 
N
S
 
D
V
 
I
L
 
I
E
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
F
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
R
 
R
G
 
A
M
 
M
A
 
M
K
 
K
A
 
K
K
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
T
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
G
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
N
 
N
Y
|
Y
C
x
A
A
|
A
A
|
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
A
N
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
D
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
A
L
 
L
D
 
S
D
 
D
K
 
D
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
A
 
G
M
 
I
L
 
L
E
 
A
I
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
|
E
T
 
T
I
 
L
N
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4bo4C Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2-methoxyphenyl)-3,4- dihydro-2h-quinoline-1-carboxamide at 2.7a resolution (see paper)
64% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 14:254/255 of 4bo4C

query
sites
4bo4C
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
K
I
 
I
T
 
A
N
 
E
D
 
T
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
V
K
 
E
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
S
I
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
H
L
 
I
T
 
Q
E
 
Q
K
 
H
S
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
V
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
D
 
E
W
 
W
A
 
F
S
 
D
V
 
V
L
x
V
E
 
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
S
 
N
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
A
 
T
K
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
-
M
 
-
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
V
 
L
E
 
E
G
|
G
F
|
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
G
N
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
E
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
G
 
E
A
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
G
I
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
T
I
 
V
N
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
62% identity, 99% coverage: 2:246/247 of query aligns to 1:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
S
 
N
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
|
T
S
 
S
E
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
S
 
A
I
 
I
T
 
S
N
 
D
D
 
Y
L
 
L
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
G
Y
 
A
K
 
N
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
M
M
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
V
L
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
I
T
 
R
E
 
A
K
 
E
S
 
F
G
 
G
A
 
E
P
 
V
L
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
M
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
E
D
x
E
W
 
W
A
 
N
S
 
D
V
 
I
L
 
I
E
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
F
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
R
 
R
G
 
A
M
 
M
A
 
M
K
 
K
A
 
K
K
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
T
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
G
G
 
G
Q
|
Q
G
 
A
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
A
N
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
V
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
D
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
A
L
 
L
D
 
S
D
 
D
K
 
D
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
A
 
G
M
 
I
L
 
L
E
 
A
I
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
|
E
T
|
T
I
 
L
N
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
62% identity, 99% coverage: 2:246/247 of query aligns to 1:242/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
S
 
N
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
|
A
T
|
T
S
 
S
E
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
S
 
A
I
 
I
T
 
S
N
 
D
D
 
Y
L
 
L
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
G
Y
 
A
K
 
N
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
M
M
x
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
V
L
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
I
T
 
R
E
 
A
K
 
E
S
 
F
G
 
G
A
 
E
P
 
V
L
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
M
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
E
D
 
E
W
 
W
A
 
N
S
 
D
V
 
I
L
 
I
E
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
F
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
R
 
R
G
 
A
M
 
M
A
 
M
K
 
K
A
 
K
K
 
R
W
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
T
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
G
G
 
G
Q
|
Q
G
 
A
N
 
N
Y
x
F
C
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
A
N
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
A
L
 
L
D
 
S
D
 
D
K
 
D
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
A
 
G
M
 
I
L
 
L
E
 
A
I
 
Q
I
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
L
N
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4bnzA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 1-methyl-n-phenylindole- 3-carboxamide at 2.5a resolution (see paper)
62% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 3:240/241 of 4bnzA

query
sites
4bnzA
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
K
I
 
I
T
 
A
N
 
E
D
 
T
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
V
K
 
E
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
S
I
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
H
L
 
I
T
 
Q
E
 
Q
K
 
H
S
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
D
 
E
W
 
W
A
x
F
S
 
D
V
 
V
L
x
V
E
 
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
S
 
N
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
A
 
T
K
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
V
 
L
E
 
E
G
 
G
F
|
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
G
N
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
E
L
 
L
D
 
P
D
 
E
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
G
 
E
A
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
G
I
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
T
I
 
V
N
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4bnyA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 4-(2-phenylthieno(3,2-d) pyrimidin-4-yl)morpholine at 1.8a resolution (see paper)
61% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 2:238/239 of 4bnyA

query
sites
4bnyA
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
K
I
 
I
T
 
A
N
 
E
D
 
T
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
V
K
 
E
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
S
I
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
H
L
 
I
T
 
Q
E
 
Q
K
 
H
S
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
-
I
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
D
 
E
W
|
W
A
 
F
S
 
D
V
 
V
L
 
V
E
 
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
S
 
N
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
A
 
T
K
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
E
G
|
G
F
|
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
G
N
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
E
L
 
L
D
 
P
D
 
E
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
G
 
E
A
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
G
I
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
T
I
 
V
N
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4bnxA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 6-(4-(2-chloroanilino)- 1h-quinazolin-2-ylidene)cyclohexa-2, 4-dien-1-one at 2.3a resolution (see paper)
61% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 3:239/239 of 4bnxA

query
sites
4bnxA
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
K
I
 
I
T
 
A
N
 
E
D
 
T
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
V
K
 
E
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
S
I
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
H
L
 
I
T
 
Q
E
 
Q
K
 
H
S
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
-
I
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
D
 
E
W
 
W
A
 
F
S
 
D
V
 
V
L
x
V
E
x
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
S
 
N
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
A
 
T
K
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
V
 
L
E
 
E
G
|
G
F
|
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
G
N
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
E
L
 
L
D
 
P
D
 
E
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
G
 
E
A
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
G
I
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
T
I
 
V
N
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4bnuA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 2-phenyl-4-(1,2,4- triazol-4-yl)quinazoline at 2.0a resolution (see paper)
61% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 3:238/239 of 4bnuA

query
sites
4bnuA
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
K
I
 
I
T
 
A
N
 
E
D
 
T
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
V
K
 
E
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
S
I
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
H
L
 
I
T
 
Q
E
 
Q
K
 
H
S
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
D
 
E
W
|
W
A
 
F
S
 
D
V
 
V
L
x
V
E
 
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
S
 
N
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
A
 
T
K
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
V
 
L
E
 
E
G
|
G
F
 
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
G
N
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
E
L
 
L
D
 
P
D
 
E
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
G
 
E
A
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
G
I
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
T
I
 
V
N
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
60% identity, 99% coverage: 2:246/247 of query aligns to 1:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
S
 
S
L
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
A
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
T
x
S
R
|
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
T
L
 
F
A
 
V
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
|
T
S
 
S
E
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
A
I
 
I
T
 
S
N
 
G
D
 
Y
L
 
L
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
G
Y
 
A
K
 
N
G
 
G
Y
 
K
G
 
G
M
 
F
V
 
M
M
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
K
D
 
D
P
 
A
A
 
Q
S
 
S
I
 
I
E
 
D
A
 
S
G
 
V
L
 
L
K
 
A
E
 
S
L
 
I
T
 
R
E
 
A
K
 
E
S
 
F
G
 
G
A
 
E
P
 
I
L
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
N
 
N
L
 
L
L
 
L
M
 
M
R
 
R
L
 
M
K
 
K
D
 
D
D
 
D
D
 
E
W
 
W
A
 
E
S
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
T
S
 
S
V
 
V
Y
 
F
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
M
R
 
C
G
 
A
M
 
M
A
 
M
K
 
K
A
 
K
K
 
R
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
T
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
N
 
N
Y
 
Y
C
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
I
G
 
G
F
 
F
T
 
S
R
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
A
N
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
D
 
E
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
A
L
 
L
D
 
T
D
 
D
K
 
D
Q
 
Q
R
 
R
G
 
A
A
 
G
M
 
I
L
 
L
E
 
S
I
 
S
I
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
N
R
 
R
L
 
P
G
 
G
E
 
D
P
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
L
N
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4bo7A Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2,3-dihydro-1h-inden- 5-yl)tetrazolo(1,5-b)pyridazin-6-amine at 2.6a resolution (see paper)
61% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 3:237/238 of 4bo7A

query
sites
4bo7A
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
K
I
 
I
T
 
A
N
 
E
D
 
T
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
V
K
 
E
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
S
I
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
H
L
 
I
T
 
Q
E
 
Q
K
 
H
S
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
-
I
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
K
D
 
D
D
 
D
D
 
E
W
 
W
A
x
F
S
 
D
V
 
V
L
x
V
E
 
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
S
 
N
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
A
 
T
K
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
E
G
 
G
F
|
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
G
N
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
E
L
 
L
D
 
P
D
 
E
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
G
 
E
A
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
G
I
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
T
I
 
V
N
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4bo8A Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 1-(2-amino-4- phenylimidazol-1-yl)-3-(2-fluorophenyl)urea at 2.7a resolution (see paper)
60% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 3:235/236 of 4bo8A

query
sites
4bo8A
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
K
I
 
I
T
 
A
N
 
E
D
 
T
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
V
K
 
E
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
S
I
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
H
L
 
I
T
 
Q
E
 
Q
K
 
H
S
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
E
W
|
W
A
 
F
S
 
D
V
 
V
L
x
V
E
x
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
S
 
N
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
A
 
T
K
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
E
G
|
G
F
|
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
G
N
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
E
L
 
L
D
 
P
D
 
E
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
G
 
E
A
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
G
I
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
T
I
 
V
N
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4bo2A Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 1-(1-ethylbenzimidazol-2- yl)-3-(2-methoxyphenyl)urea at 1.9a resolution (see paper)
60% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 5:237/238 of 4bo2A

query
sites
4bo2A
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
K
I
 
I
T
 
A
N
 
E
D
 
T
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
V
K
 
E
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
S
I
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
H
L
 
I
T
 
Q
E
 
Q
K
 
H
S
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
E
W
|
W
A
 
F
S
 
D
V
 
V
L
x
V
E
x
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
S
 
N
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
M
 
M
A
 
T
K
 
K
A
 
A
K
 
R
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
M
 
M
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
T
N
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
|
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
E
G
|
G
F
|
F
T
 
T
R
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
S
 
G
N
 
S
R
 
R
G
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
M
T
 
T
K
 
R
K
 
E
L
 
L
D
 
P
D
 
E
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
G
 
E
A
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
G
I
 
Q
I
 
I
P
 
P
A
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
A
T
 
T
I
 
V
N
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M

4bo0A Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 1-(4-methoxy-1- methylindazol-3-yl)-3-(2-methoxyphenyl)urea at 2.4a resolution (see paper)
60% identity, 100% coverage: 1:246/247 of query aligns to 2:234/235 of 4bo0A

query
sites
4bo0A
M
 
M
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
T
S
 
S
E
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
K
I
 
I
T
 
A
N
 
E
D
 
T
L
 
L
Q
 
K
S
 
A
A
 
N
G
 
G
Y
 
V
K
 
E
G
 
G
Y
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
V
M
 
L
N
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
S
P
 
D
A
 
E
S
 
S
I
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
T
L
 
L
K
 
E
E
 
H
L
 
I
T
 
Q
E
 
Q
K
 
H
S
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
-
T
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
E
W
|
W
A
 
F
S
 
D
V
 
V
L
x
V
E
 
N
T
 
T
N
 
N
L
|
L
S
 
N
S
 
S
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
T
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V