SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2280 PGA1_c23120 putative sorbitol dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
36% identity, 97% coverage: 4:265/269 of query aligns to 2:253/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
N
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
S
I
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
R
 
R
G
|
G
M
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
N
 
F
A
 
A
E
 
E
S
 
A
F
 
Y
A
 
V
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
T
V
 
V
C
 
A
L
 
I
G
 
A
D
 
D
L
 
I
D
 
D
G
 
I
D
 
E
E
 
R
A
 
A
Q
 
R
K
 
Q
V
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
E
I
 
I
N
 
G
A
 
P
A
 
A
G
 
-
N
 
-
G
 
-
M
 
-
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
M
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
S
 
R
R
 
Q
A
 
D
D
 
S
N
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
E
A
 
H
F
 
A
G
 
G
S
 
G
I
 
L
N
 
D
V
 
I
G
 
L
L
 
V
F
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
A
L
 
L
N
 
F
K
 
D
P
 
L
R
 
A
F
 
P
F
 
I
M
 
V
D
 
E
I
 
I
D
 
T
E
 
R
D
 
E
N
 
S
W
 
Y
D
 
E
M
 
K
I
 
L
M
 
F
N
 
A
V
 
I
N
 
N
T
 
V
K
 
A
A
 
G
M
 
T
W
 
L
L
 
F
G
 
T
M
 
L
Q
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
P
 
-
M
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
R
P
 
G
Y
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
M
G
 
A
S
|
S
I
x
Q
A
 
A
S
 
G
K
 
R
K
 
R
P
 
G
L
x
E
V
 
A
D
 
L
V
 
V
T
 
A
V
 
I
Y
|
Y
C
 
C
T
 
A
S
 
T
K
 
K
Y
 
A
G
 
A
C
 
V
L
 
I
A
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
C
 
S
G
 
A
A
 
G
L
 
L
G
 
D
L
 
L
A
 
I
E
 
K
H
 
H
N
 
R
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
Y
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
V
 
D
T
 
G
P
 
E
L
x
H
W
|
W
E
 
D
Q
 
G
L
 
V
D
 
D
K
 
A
D
 
L
L
x
F
V
 
A
D
 
R
I
 
-
G
 
-
F
 
Y
K
 
E
E
 
N
R
 
R
E
 
P
G
 
R
Q
 
G
A
 
E
Y
 
K
E
 
K
D
 
R
I
 
L
V
 
V
D
 
G
S
 
E
A
 
A
L
 
V
V
 
P
I
 
F
K
 
G
R
 
R
L
 
M
S
 
G
Y
 
T
P
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
L
V
 
T
G
 
G
T
 
M
A
 
A
S
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
A
D
 
E
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
M
 
I
T
 
V
G
 
S
Q
 
Q
M
 
T
I
 
Y
S
 
N
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3wyeA Crystal structure of chimeric engineered (2s,3s)-butanediol dehydrogenase complexed with NAD+
38% identity, 96% coverage: 9:265/269 of query aligns to 2:251/255 of 3wyeA

query
sites
3wyeA
K
 
K
N
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
N
 
I
A
 
A
E
 
L
S
 
R
F
 
L
A
 
V
A
 
K
Q
 
D
G
 
G
A
 
F
N
 
A
V
 
V
C
 
A
L
 
I
G
 
A
D
|
D
L
x
Y
D
 
N
G
 
D
D
 
A
E
 
T
A
 
A
Q
 
K
K
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
S
A
 
E
I
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
-
G
 
G
M
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
S
 
D
R
 
R
A
 
D
D
 
Q
N
 
V
A
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
Q
T
 
A
V
 
R
E
 
K
A
 
T
F
 
L
G
 
G
S
 
G
I
 
F
N
 
D
V
 
V
G
 
I
L
 
V
F
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
N
 
A
K
 
Q
P
 
I
R
 
K
F
 
P
F
 
L
M
 
L
D
 
E
I
 
V
D
 
T
E
 
E
D
 
E
N
 
D
W
 
L
D
 
K
M
 
Q
I
 
I
M
 
Y
N
 
S
V
 
V
N
 
N
T
 
V
K
 
F
A
 
S
M
 
V
W
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
I
Q
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
V
R
 
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
A
 
K
Q
 
E
G
 
G
P
 
-
M
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
H
P
 
G
Y
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
A
G
 
A
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
A
K
 
I
K
 
Q
P
 
G
L
 
F
V
 
P
D
 
I
V
 
L
T
 
S
V
 
A
Y
|
Y
C
 
S
T
 
T
S
 
T
K
|
K
Y
 
F
G
 
A
C
 
V
L
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
C
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
R
G
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
P
H
 
L
N
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
 
I
V
|
V
V
 
G
T
|
T
P
 
G
L
x
M
W
|
W
E
 
E
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
K
 
A
D
 
E
L
|
L
V
 
S
D
 
K
I
 
I
G
 
N
F
 
G
K
 
K
E
 
P
R
 
I
E
 
-
G
 
G
Q
 
E
A
 
N
Y
 
F
E
 
K
D
 
E
I
 
-
V
 
Y
D
 
S
S
 
S
A
 
S
L
 
I
V
 
A
I
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
P
S
 
S
Y
 
V
P
 
P
K
 
E
D
 
D
I
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
L
A
 
V
S
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
I
 
L
S
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
37% identity, 96% coverage: 9:265/269 of query aligns to 3:252/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
K
 
K
N
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
N
 
I
A
 
A
E
 
L
S
 
R
F
 
L
A
 
V
A
 
K
Q
 
D
G
 
G
A
 
F
N
 
A
V
 
V
C
 
A
L
 
I
G
 
A
D
|
D
L
x
Y
D
 
N
G
 
D
D
 
A
E
 
T
A
 
A
Q
 
K
K
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
S
A
 
E
I
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
-
G
 
G
M
 
H
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
M
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
S
 
D
R
|
R
A
x
D
D
 
Q
N
 
V
A
x
F
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
Q
T
 
A
V
 
R
E
 
K
A
 
T
F
 
L
G
 
G
S
 
G
I
 
F
N
 
D
V
 
V
G
 
I
L
 
V
F
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
V
N
 
A
K
 
P
P
 
S
R
 
T
F
 
P
F
 
I
M
 
E
D
 
S
I
 
I
D
 
T
E
 
P
D
 
E
N
 
I
W
 
V
D
 
D
M
 
K
I
 
V
M
 
Y
N
 
N
V
x
I
N
 
N
T
 
V
K
 
K
A
 
G
M
 
V
W
 
I
L
 
W
G
 
G
M
 
I
Q
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
V
R
x
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
A
 
K
Q
 
E
G
 
G
P
 
-
M
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
H
P
 
G
Y
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
A
G
 
C
S
|
S
I
 
Q
A
 
A
S
 
G
K
 
H
K
 
V
P
 
G
L
 
N
V
 
P
D
 
E
V
 
L
T
 
A
V
 
V
Y
|
Y
C
 
S
T
 
S
S
 
S
K
|
K
Y
 
F
G
 
A
C
 
V
L
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
C
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
R
G
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
P
H
 
L
N
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
V
 
K
T
|
T
P
 
P
L
x
M
W
 
W
E
 
A
Q
 
E
L
 
I
D
 
D
K
 
R
D
 
Q
L
x
V
V
 
S
D
 
E
I
 
A
G
 
A
F
 
G
K
 
K
E
 
P
R
 
L
E
 
-
G
 
G
Q
 
Y
A
 
G
Y
 
T
E
 
A
D
 
E
I
 
F
V
 
A
D
 
K
S
 
R
A
 
-
L
 
I
V
 
T
I
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Y
 
E
P
 
P
K
 
E
D
 
D
I
 
V
V
 
A
G
 
A
T
 
C
A
 
V
S
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
I
 
L
S
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
37% identity, 96% coverage: 9:265/269 of query aligns to 3:252/256 of Q48436

query
sites
Q48436
K
 
K
N
 
V
I
 
A
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
R
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
|
G
Q
x
K
A
|
A
N
x
I
A
|
A
E
x
L
S
x
R
F
x
L
A
x
V
A
x
K
Q
x
D
G
|
G
A
x
F
N
x
A
V
|
V
C
x
A
L
x
I
G
x
A
D
|
D
L
 
Y
D
 
N
G
 
D
D
 
A
E
 
T
A
 
A
Q
 
K
K
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
S
A
 
E
I
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
N
 
-
G
 
G
M
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
V
 
V
K
 
K
M
 
V
D
|
D
V
 
V
T
 
S
S
 
D
R
 
R
A
 
D
D
 
Q
N
 
V
A
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
Q
T
 
A
V
 
R
E
 
K
A
 
T
F
 
L
G
 
G
S
 
G
I
 
F
N
 
D
V
 
V
G
 
I
L
 
V
F
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
A
K
 
P
P
 
S
R
 
T
F
 
P
F
 
I
M
 
E
D
 
S
I
 
I
D
 
T
E
 
P
D
 
E
N
 
I
W
 
V
D
 
D
M
 
K
I
 
V
M
 
Y
N
 
N
V
 
I
N
 
N
T
 
V
K
 
K
A
 
G
M
 
V
W
 
I
L
 
W
G
 
G
M
 
I
Q
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
V
R
 
E
Q
 
A
M
 
F
I
 
K
A
 
K
Q
 
E
G
 
G
P
 
-
M
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
H
P
 
G
Y
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
A
G
 
C
S
 
S
I
 
Q
A
 
A
S
 
G
K
 
H
K
 
V
P
 
G
L
 
N
V
 
P
D
 
E
V
 
L
T
 
A
V
 
V
Y
 
Y
C
 
S
T
 
S
S
 
S
K
|
K
Y
 
F
G
 
A
C
 
V
L
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
C
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
R
G
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
P
H
 
L
N
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
V
V
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
M
W
 
W
E
 
A
Q
 
E
L
 
I
D
 
D
K
 
R
D
 
Q
L
 
V
V
 
S
D
 
E
I
 
A
G
 
A
F
 
G
K
 
K
E
 
P
R
 
L
E
 
-
G
 
G
Q
 
Y
A
 
G
Y
 
T
E
 
A
D
 
E
I
 
F
V
 
A
D
 
K
S
 
R
A
 
-
L
 
I
V
 
T
I
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
S
Y
 
E
P
 
P
K
 
E
D
 
D
I
 
V
V
 
A
G
 
A
T
 
C
A
 
V
S
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
I
 
L
S
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3a28C Crystal structure of l-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
34% identity, 96% coverage: 9:265/269 of query aligns to 2:253/257 of 3a28C

query
sites
3a28C
K
 
K
N
 
V
I
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
G
N
 
I
A
 
S
E
 
E
S
 
K
F
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
G
 
G
A
 
F
N
 
D
V
 
I
C
 
A
L
 
V
G
 
A
D
|
D
L
|
L
D
 
P
G
 
Q
D
x
Q
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
K
 
-
V
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
T
I
 
I
N
 
K
-
 
L
-
 
I
A
 
E
A
 
A
G
 
A
N
 
D
G
 
Q
M
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
F
V
 
V
K
 
G
M
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
S
 
D
R
 
K
A
 
A
D
 
N
N
 
F
A
 
D
A
 
S
A
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
E
T
 
A
V
 
A
E
 
E
A
 
K
F
 
L
G
 
G
S
 
G
I
 
F
N
 
D
V
 
V
G
 
L
L
 
V
F
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
N
 
A
K
 
Q
P
 
I
R
 
K
F
 
P
F
 
L
M
 
L
D
 
E
I
 
V
D
 
T
E
 
E
D
 
E
N
 
D
W
 
L
D
 
K
M
 
Q
I
 
I
M
 
Y
N
 
S
V
 
V
N
 
N
T
 
V
K
 
F
A
 
S
M
 
V
W
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
I
Q
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
S
R
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
D
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
P
 
V
M
 
K
E
 
G
D
 
-
H
 
-
P
 
-
Y
 
-
K
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
A
G
 
A
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
A
K
 
I
K
 
Q
P
 
G
L
 
F
V
 
P
D
 
I
V
 
L
T
 
S
V
 
A
Y
|
Y
C
 
S
T
 
T
S
 
T
K
|
K
Y
 
F
G
 
A
C
 
V
L
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
C
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
Q
G
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
P
H
 
K
N
 
G
I
 
H
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
V
 
G
T
|
T
P
 
G
L
x
M
W
|
W
E
 
E
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
K
 
A
D
 
E
L
|
L
V
 
S
D
 
K
I
 
I
G
 
N
F
 
G
K
 
K
E
 
P
R
 
I
E
 
-
G
 
G
Q
 
E
A
 
N
Y
 
F
E
 
K
D
 
E
I
 
-
V
 
Y
D
 
S
S
 
S
A
 
S
L
 
I
V
 
A
I
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
P
S
 
S
Y
 
V
P
 
P
K
 
E
D
 
D
I
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
L
A
 
V
S
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
N
S
 
S
D
 
N
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
I
 
M
S
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9ZNN8 L-2,3-butanediol dehydrogenase; L-BDH; (S,S)-butanediol dehydrogenase; Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; EC 1.1.1.76; EC 1.1.1.304 from Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium saccharolyticum) (see paper)
34% identity, 96% coverage: 9:265/269 of query aligns to 3:254/258 of Q9ZNN8

query
sites
Q9ZNN8
K
 
K
N
 
V
I
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
G
N
 
I
A
 
S
E
 
E
S
 
K
F
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
G
 
G
A
 
F
N
 
D
V
 
I
C
 
A
L
 
V
G
 
A
D
|
D
L
 
L
D
 
P
G
 
Q
D
x
Q
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
K
 
-
V
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
T
I
 
I
N
 
K
-
 
L
-
 
I
A
 
E
A
 
A
G
 
A
N
 
D
G
 
Q
M
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
F
V
 
V
K
 
G
M
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
S
 
D
R
 
K
A
 
A
D
 
N
N
 
F
A
 
D
A
 
S
A
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
E
T
 
A
V
 
A
E
 
E
A
 
K
F
 
L
G
 
G
S
 
G
I
 
F
N
 
D
V
 
V
G
 
L
L
 
V
F
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
N
 
A
K
 
Q
P
 
I
R
 
K
F
 
P
F
 
L
M
 
L
D
 
E
I
 
V
D
 
T
E
 
E
D
 
E
N
 
D
W
 
L
D
 
K
M
 
Q
I
 
I
M
 
Y
N
 
S
V
 
V
N
 
N
T
 
V
K
 
F
A
 
S
M
 
V
W
 
F
L
 
F
G
 
G
M
 
I
Q
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
S
R
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
D
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
P
 
V
M
 
K
E
 
G
D
 
-
H
 
-
P
 
-
Y
 
-
K
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
A
G
 
A
S
 
S
I
|
I
A
 
A
S
 
A
K
 
I
K
 
Q
P
 
G
L
x
F
V
 
P
D
 
I
V
 
L
T
 
S
V
 
A
Y
|
Y
C
 
S
T
 
T
S
 
T
K
|
K
Y
 
F
G
 
A
C
 
V
L
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
C
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
Q
G
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
P
H
 
K
N
 
G
I
 
H
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
|
V
V
x
G
T
|
T
P
 
G
L
 
M
W
 
W
E
 
E
Q
 
Q
L
 
I
D
 
D
K
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
S
D
 
K
I
 
I
G
 
N
F
 
G
K
 
K
E
 
P
R
 
I
E
 
-
G
 
G
Q
 
E
A
 
N
Y
 
F
E
 
K
D
 
E
I
 
-
V
 
Y
D
 
S
S
 
S
A
 
S
L
 
I
V
 
A
I
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
P
S
 
S
Y
 
V
P
 
P
K
 
E
D
 
D
I
 
V
V
 
A
G
 
G
T
 
L
A
 
V
S
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
N
S
 
S
D
 
N
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
I
 
M
S
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
33% identity, 97% coverage: 6:265/269 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
K
 
Q
G
 
N
K
 
R
N
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
R
x
S
G
 
G
M
 
M
G
 
G
Q
 
K
A
 
Q
N
 
T
A
 
A
E
 
L
S
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
I
G
 
N
D
|
D
L
 
I
D
 
D
G
 
A
D
 
E
E
 
K
A
 
V
Q
 
R
K
 
A
V
 
T
A
 
V
D
 
D
A
 
E
I
 
F
N
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
N
 
H
G
 
R
M
 
V
A
 
L
I
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
A
M
 
-
D
|
D
V
x
I
T
 
G
S
 
N
R
 
K
A
 
A
D
 
A
N
 
V
A
 
D
A
 
G
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
V
 
I
E
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
R
I
 
I
N
 
D
V
 
I
G
 
L
L
 
V
F
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
M
N
 
E
K
 
R
P
 
A
R
 
G
F
 
A
F
 
L
M
 
R
D
 
K
I
 
L
D
 
S
E
 
E
D
 
A
N
 
D
W
 
W
D
 
D
M
 
V
I
 
T
M
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
T
 
L
K
 
K
A
 
G
M
 
T
W
 
F
L
 
L
G
 
C
M
 
T
Q
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
H
R
 
G
Q
 
H
M
 
M
I
 
V
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
P
 
-
M
 
-
E
 
E
D
 
N
H
 
K
P
 
H
Y
 
G
K
 
R
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
I
A
 
A
S
 
S
K
 
R
K
 
A
P
 
W
L
 
L
-
 
G
-
 
G
V
 
A
D
 
G
V
 
Q
T
 
T
V
 
P
Y
|
Y
C
 
S
T
 
S
S
 
A
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
C
 
V
L
 
V
A
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
R
C
 
A
G
 
L
A
 
A
L
 
I
G
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
R
H
 
A
N
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
C
Y
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
L
V
 
I
V
 
H
T
 
T
P
 
P
L
 
M
W
 
W
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
-
 
P
D
 
E
K
 
K
D
 
D
L
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
Q
D
 
Q
I
 
F
V
 
L
D
 
L
S
 
S
A
 
R
L
 
Q
V
 
P
I
 
T
K
 
G
R
 
K
L
 
L
S
 
G
Y
 
E
P
 
P
K
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
A
G
 
N
T
 
T
A
 
L
S
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
S
 
S
D
 
G
Y
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
I
 
L
S
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
33% identity, 97% coverage: 6:265/269 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
K
 
Q
G
 
N
K
 
R
N
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
R
 
S
G
 
G
M
|
M
G
 
G
Q
 
K
A
 
Q
N
 
T
A
 
A
E
 
L
S
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
A
V
 
V
C
 
V
L
 
I
G
 
N
D
|
D
L
x
I
D
 
D
G
 
A
D
 
E
E
 
K
A
 
V
Q
 
R
K
 
A
V
 
T
A
 
V
D
 
D
A
 
E
I
 
F
N
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
N
 
H
G
 
R
M
 
V
A
 
L
I
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
A
M
 
-
D
 
D
V
x
I
T
 
G
S
 
N
R
 
K
A
 
A
D
 
A
N
 
V
A
 
D
A
 
G
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
V
 
I
E
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
R
I
 
I
N
 
D
V
 
I
G
 
L
L
 
V
F
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
L
 
M
N
 
E
K
 
R
P
 
A
R
 
G
F
 
A
F
 
L
M
 
R
D
 
K
I
 
L
D
 
S
E
 
E
D
 
A
N
 
D
W
 
W
D
 
D
M
 
V
I
 
T
M
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
T
 
L
K
 
K
A
 
G
M
 
T
W
 
F
L
 
L
G
 
C
M
 
T
Q
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
H
R
 
G
Q
 
H
M
 
M
I
 
V
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
P
 
-
M
 
-
E
 
E
D
 
N
H
 
K
P
 
H
Y
 
G
K
 
R
L
 
I
I
 
V
N
 
N
V
 
-
G
 
-
S
 
-
I
|
I
A
 
A
S
|
S
K
 
R
K
 
A
P
 
W
L
 
L
-
 
G
-
 
G
V
 
A
D
 
G
V
 
Q
T
 
T
V
 
P
Y
|
Y
C
 
S
T
 
S
S
 
A
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
C
 
V
L
 
V
A
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
R
C
 
A
G
 
L
A
 
A
L
 
I
G
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
R
H
 
A
N
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
C
Y
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
L
V
x
I
V
 
H
T
 
T
P
 
P
L
 
M
W
 
W
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
-
 
P
D
 
E
K
 
K
D
 
D
L
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
Q
D
 
Q
I
 
F
V
 
L
D
 
L
S
 
S
A
 
R
L
 
Q
V
 
P
I
 
T
K
 
G
R
 
K
L
 
L
S
 
G
Y
 
E
P
 
P
K
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
A
G
 
N
T
 
T
A
 
L
S
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
S
 
S
D
 
G
Y
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
I
 
L
S
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
33% identity, 97% coverage: 6:266/269 of query aligns to 5:252/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
L
 
L
K
 
T
G
 
D
K
 
K
N
 
T
I
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
R
x
S
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
Y
A
 
A
N
 
A
A
 
V
E
 
Q
S
 
A
F
 
F
A
 
L
A
 
G
Q
 
Q
G
 
Q
A
 
A
N
 
N
V
 
V
C
 
V
L
 
V
G
 
A
D
|
D
L
x
I
D
 
D
G
 
-
D
 
-
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
K
 
G
V
 
E
A
 
A
D
 
-
A
 
M
I
 
V
N
 
R
A
 
K
A
 
E
G
 
N
N
 
N
G
 
D
M
 
R
A
 
L
I
 
H
A
 
F
V
 
V
K
 
Q
M
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
S
 
D
R
 
E
A
 
A
D
 
A
N
 
C
A
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
S
T
 
A
V
 
V
E
 
H
A
 
T
F
 
F
G
 
G
S
 
G
I
 
L
N
 
D
V
 
V
G
 
L
L
 
I
F
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
L
 
I
N
 
E
K
 
I
P
 
V
R
 
A
F
 
P
F
 
I
M
 
H
D
 
E
I
 
M
D
 
E
E
 
L
D
 
S
N
 
D
W
 
W
D
 
N
M
 
K
I
 
V
M
 
L
N
 
Q
V
 
V
N
 
N
T
 
L
K
 
T
A
 
G
M
 
M
W
 
F
L
 
L
G
 
M
M
 
S
Q
 
K
E
 
H
V
 
A
A
 
L
R
 
K
Q
 
H
M
 
M
I
 
L
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
P
 
K
M
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
Y
 
G
K
 
N
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
T
G
 
C
S
|
S
I
 
V
A
 
G
S
 
G
K
 
L
K
 
V
P
 
A
L
 
W
V
 
P
D
 
D
V
 
I
T
 
P
V
 
A
Y
|
Y
C
 
N
T
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
G
G
 
G
C
 
V
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
T
 
T
E
 
K
C
 
S
G
 
M
A
 
A
L
 
V
G
 
D
L
 
Y
A
 
A
E
 
K
H
 
H
N
 
Q
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
C
Y
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
x
I
V
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
L
W
 
N
E
 
E
Q
 
K
L
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
S
F
 
F
K
 
L
E
 
E
R
 
N
E
 
N
G
 
E
Q
 
G
A
 
T
Y
 
L
E
 
E
D
 
E
I
 
I
V
 
K
D
 
K
S
 
E
A
 
K
L
 
A
V
 
K
I
 
V
K
 
N
-
 
P
-
 
L
-
 
L
R
 
R
L
 
L
S
 
G
Y
 
K
P
 
P
K
 
E
D
 
E
I
 
I
V
 
A
G
 
N
T
 
V
A
 
M
S
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
L
S
 
S
D
 
S
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
M
 
A
I
 
I
S
 
T
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
34% identity, 96% coverage: 9:266/269 of query aligns to 6:251/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
K
 
K
N
 
T
I
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
S
R
|
R
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
N
 
A
A
 
A
E
 
R
S
 
E
F
 
C
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
V
C
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
H
L
x
S
D
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
A
 
A
Q
 
L
K
 
S
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
E
I
 
I
N
 
A
A
 
A
A
 
F
G
 
G
N
 
-
G
 
G
M
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
G
M
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
S
 
D
R
 
L
A
 
D
D
 
S
N
 
G
A
 
E
A
 
K
A
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
S
I
 
V
N
 
D
V
 
V
G
 
L
L
 
V
F
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
I
N
 
C
K
 
P
P
x
F
R
 
H
F
 
S
F
 
F
M
 
L
D
 
D
I
 
M
D
 
P
E
 
R
D
 
E
N
 
L
W
 
Y
D
 
L
M
 
K
I
 
T
M
 
V
N
 
G
V
 
T
N
 
N
T
 
L
K
 
N
A
 
G
M
 
A
W
 
Y
L
 
F
G
 
T
M
 
V
Q
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
P
 
-
M
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
R
P
 
G
Y
 
G
K
 
A
L
 
I
I
 
I
N
 
A
V
|
V
G
x
S
S
|
S
I
 
I
A
x
S
S
 
A
K
 
L
K
 
V
P
 
G
L
 
G
V
 
A
D
 
M
V
x
Q
T
 
T
V
 
H
Y
|
Y
C
 
T
T
 
P
S
 
T
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
C
 
L
L
 
L
A
 
S
L
 
L
T
 
M
E
 
Q
C
 
S
G
 
C
A
 
A
L
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
P
H
 
Y
N
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
C
N
 
N
G
 
A
Y
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
V
 
A
T
|
T
P
 
D
L
x
I
W
x
N
E
 
K
Q
 
E
L
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
D
L
 
L
V
 
S
D
 
D
I
 
L
G
 
E
F
 
K
K
 
R
E
 
E
R
 
R
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
M
D
 
T
S
 
S
A
 
R
L
 
V
V
 
P
I
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
G
Y
 
E
P
 
P
K
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
A
G
 
G
T
 
P
A
 
I
S
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
|
D
D
x
M
S
 
A
D
x
R
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
M
 
S
I
 
L
S
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
L

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
34% identity, 96% coverage: 9:266/269 of query aligns to 6:251/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
K
 
K
N
 
T
I
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
N
 
A
A
 
A
E
 
R
S
 
E
F
 
C
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
V
C
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
H
L
 
S
D
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
A
 
A
Q
 
L
K
 
S
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
E
I
 
I
N
 
A
A
 
A
A
 
F
G
 
G
N
 
-
G
 
G
M
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
G
M
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
S
 
D
R
 
L
A
 
D
D
 
S
N
 
G
A
 
E
A
 
K
A
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
S
I
 
V
N
 
D
V
 
V
G
 
L
L
 
V
F
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
I
N
 
C
K
 
P
P
 
F
R
 
H
F
 
S
F
 
F
M
 
L
D
 
D
I
 
M
D
 
P
E
 
R
D
 
E
N
 
L
W
 
Y
D
 
L
M
 
K
I
 
T
M
 
V
N
 
G
V
x
T
N
 
N
T
 
L
K
 
N
A
 
G
M
 
A
W
 
Y
L
 
F
G
 
T
M
 
V
Q
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
I
 
K
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
P
 
-
M
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
R
P
 
G
Y
 
G
K
 
A
L
 
I
I
 
I
N
 
A
V
|
V
G
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
S
S
 
A
K
 
L
K
 
V
P
 
G
L
 
G
V
 
A
D
 
M
V
 
Q
T
 
T
V
 
H
Y
|
Y
C
 
T
T
 
P
S
 
T
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
C
 
L
L
 
L
A
 
S
L
 
L
T
 
M
E
 
Q
C
 
S
G
 
C
A
 
A
L
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
G
E
 
P
H
 
Y
N
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
C
N
 
N
G
 
A
Y
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
V
 
A
T
|
T
P
 
D
L
x
I
W
 
N
E
 
K
Q
 
E
L
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
D
L
 
L
V
 
S
D
 
D
I
 
L
G
 
E
F
 
K
K
 
R
E
 
E
R
 
R
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
M
D
 
T
S
 
S
A
 
R
L
 
V
V
 
P
I
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
G
Y
 
E
P
 
P
K
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
A
G
 
G
T
 
P
A
 
I
S
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
M
S
 
A
D
 
R
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
M
 
S
I
 
L
S
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
L

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
31% identity, 98% coverage: 4:266/269 of query aligns to 4:249/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
N
 
N
R
 
R
L
 
L
K
 
R
G
 
S
K
 
A
N
 
L
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
R
x
S
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
N
 
V
A
 
S
E
 
V
S
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
T
V
 
V
C
 
A
L
 
A
G
 
C
D
|
D
L
|
L
D
 
D
G
 
R
D
 
A
E
 
A
A
 
A
Q
 
Q
K
 
E
V
 
T
A
 
V
D
 
R
A
 
L
I
 
L
N
 
G
A
 
G
A
 
P
G
 
G
N
 
S
G
 
N
M
 
H
A
 
A
I
 
-
A
 
A
V
 
F
K
 
Q
M
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
-
S
 
S
R
 
E
A
 
A
D
 
R
N
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
C
V
 
L
A
 
L
A
 
E
T
 
Q
V
 
V
E
 
Q
A
 
A
F
 
C
G
 
F
S
 
S
I
 
R
-
 
P
-
 
P
N
 
S
V
 
V
G
 
V
L
 
V
F
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
L
x
I
N
 
T
K
 
Q
P
 
D
R
 
E
F
 
F
F
 
L
M
 
L
D
 
H
I
 
M
D
 
S
E
 
E
D
 
D
N
 
D
W
 
W
D
 
D
M
 
K
I
 
V
M
 
I
N
 
A
V
|
V
N
 
N
T
 
L
K
 
K
A
 
G
M
 
T
W
 
F
L
 
L
G
 
V
M
 
T
Q
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
Q
Q
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
S
Q
 
N
G
 
G
P
 
C
M
 
R
E
 
G
D
 
S
H
 
-
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
V
S
 
G
K
 
K
K
 
V
P
 
G
L
 
N
V
 
V
D
 
G
V
 
Q
T
 
T
V
 
N
Y
|
Y
C
 
A
T
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
C
 
V
L
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
C
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
R
G
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
R
H
 
H
N
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
C
N
 
N
G
 
S
Y
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
F
V
x
I
V
 
A
T
|
T
P
 
P
L
x
M
W
 
T
E
 
Q
Q
 
K
L
 
V
D
 
P
K
 
Q
D
 
K
L
 
V
V
 
V
D
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
D
I
 
K
V
 
I
D
 
T
S
 
E
A
 
M
L
 
I
V
 
P
I
 
M
K
 
G
R
 
H
L
 
L
S
 
G
Y
 
D
P
 
P
K
 
E
D
 
D
I
 
V
V
 
A
G
 
D
T
 
V
A
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
S
 
S
D
 
G
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
M
 
S
I
 
V
S
 
E
I
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
W
 
L

4cqmA Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
31% identity, 98% coverage: 4:266/269 of query aligns to 2:246/248 of 4cqmA

query
sites
4cqmA
N
 
N
R
 
R
L
 
L
K
 
R
G
 
S
K
 
A
N
 
L
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
x
S
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
N
 
V
A
 
S
E
 
V
S
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
T
V
 
V
C
 
A
L
 
A
G
 
C
D
|
D
L
|
L
D
 
D
G
 
R
D
 
A
E
 
A
A
 
A
Q
 
Q
K
 
E
V
 
T
A
 
V
D
 
R
A
 
L
I
 
L
N
 
P
A
 
P
A
 
R
G
 
G
N
 
N
G
 
H
M
 
A
A
 
A
I
 
F
A
 
-
V
 
-
K
 
Q
M
x
A
D
 
D
V
|
V
T
 
-
S
 
S
R
 
E
A
 
A
D
 
R
N
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
C
V
 
L
A
 
L
A
 
E
T
 
Q
V
 
V
E
 
Q
A
 
A
F
 
C
G
 
F
S
 
S
-
 
R
-
 
P
I
 
P
N
 
S
V
 
V
G
 
V
L
 
V
F
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
L
x
I
N
 
T
K
 
Q
P
 
D
R
 
E
F
 
F
F
 
L
M
 
L
D
 
H
I
 
M
D
 
S
E
 
E
D
 
D
N
 
D
W
 
W
D
 
D
M
 
K
I
 
V
M
 
I
N
 
A
V
|
V
N
 
N
T
 
L
K
 
K
A
 
G
M
 
T
W
 
F
L
 
L
G
 
V
M
 
T
Q
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
Q
Q
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
S
Q
 
N
G
 
G
P
 
C
M
 
R
E
 
G
D
 
S
H
 
-
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
V
S
 
G
K
 
K
K
 
V
P
 
G
L
 
N
V
 
V
D
 
G
V
 
Q
T
 
T
V
 
N
Y
|
Y
C
 
A
T
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
C
 
V
L
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
C
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
R
G
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
R
H
 
H
N
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
C
N
 
N
G
 
S
Y
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
F
V
x
I
V
 
A
T
|
T
P
|
P
L
x
M
W
x
T
E
 
Q
Q
 
K
L
 
V
D
 
P
K
 
Q
D
 
K
L
 
V
V
 
V
D
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
D
I
 
K
V
 
I
D
 
T
S
 
E
A
 
M
L
 
I
V
 
P
I
 
M
K
 
G
R
 
H
L
 
L
S
 
G
Y
 
D
P
 
P
K
 
E
D
 
D
I
 
V
V
 
A
G
 
D
T
 
V
A
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
S
 
S
D
 
G
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
M
 
S
I
 
V
S
 
E
I
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
W
 
L

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
31% identity, 97% coverage: 6:266/269 of query aligns to 8:244/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
C
A
x
D
R
 
T
G
 
G
M
x
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
G
N
 
M
A
 
A
E
 
I
S
 
G
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
A
 
C
N
 
D
V
 
I
C
 
V
L
 
-
G
 
-
D
 
G
L
 
V
D
 
N
G
x
I
D
 
V
E
 
E
A
 
P
Q
 
K
K
 
D
V
 
T
A
 
I
D
 
E
A
 
K
I
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
L
G
 
G
N
 
R
G
 
R
M
 
F
A
 
-
I
 
L
A
 
S
V
 
L
K
 
T
M
 
A
D
|
D
V
x
M
T
 
S
S
 
N
R
 
V
A
 
S
D
 
G
N
 
H
A
 
A
A
 
E
A
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
K
T
 
A
V
 
V
E
 
A
A
 
E
F
 
F
G
 
G
S
 
H
I
 
V
N
 
D
V
 
I
G
 
L
L
 
V
F
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
N
 
I
K
 
R
P
 
R
R
 
E
F
 
D
F
 
A
M
 
I
D
 
E
I
 
F
D
 
S
E
 
E
D
 
K
N
 
N
W
 
W
D
 
D
M
 
D
I
 
V
M
 
M
N
 
N
V
x
L
N
 
N
T
 
I
K
 
K
A
 
S
M
 
V
W
 
F
L
 
F
G
 
M
M
 
S
Q
 
Q
E
 
T
V
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
M
 
F
I
 
I
A
 
K
Q
 
Q
G
 
G
P
 
-
M
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
K
P
 
G
Y
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
G
 
A
S
|
S
I
 
M
A
 
L
S
 
S
K
 
F
K
 
Q
P
 
G
L
 
G
V
 
I
D
 
R
V
 
V
T
 
P
V
 
S
Y
|
Y
C
 
T
T
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
S
G
 
A
C
 
V
L
 
M
A
 
G
L
 
V
T
 
T
E
 
R
C
 
L
G
 
M
A
 
A
L
 
N
G
 
E
L
 
W
A
 
A
E
 
K
H
 
H
N
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
Y
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
V
 
Y
V
x
M
V
 
A
T
|
T
P
 
N
L
x
N
W
 
T
E
 
Q
Q
 
E
L
 
R
D
 
S
K
 
K
D
 
E
L
 
I
V
 
L
D
 
D
I
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
R
L
 
I
V
 
P
I
 
A
K
 
G
R
 
R
L
 
W
S
 
G
Y
 
L
P
 
P
K
 
Q
D
 
D
I
 
L
V
 
M
G
 
G
T
 
P
A
 
S
S
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
D
 
A
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
M
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
Y
M
 
T
I
 
I
S
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W

5ojiA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
32% identity, 97% coverage: 4:265/269 of query aligns to 6:255/260 of 5ojiA

query
sites
5ojiA
N
 
R
R
 
R
L
 
F
K
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
V
I
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
A
A
x
T
R
 
K
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
N
 
I
A
 
A
E
 
E
S
 
R
F
 
L
A
 
L
A
 
D
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
S
V
 
V
C
 
V
L
 
I
G
 
G
D
x
S
L
x
R
D
x
N
G
 
Q
D
 
K
E
x
N
A
 
V
Q
 
D
K
 
E
V
 
A
A
 
I
D
 
E
A
 
Y
I
 
L
N
 
K
A
 
N
A
 
K
G
 
G
N
 
L
G
 
T
M
 
K
A
 
V
I
 
A
A
 
G
V
 
I
K
 
A
M
 
G
D
 
H
V
x
I
T
 
A
S
 
S
R
 
T
A
 
D
D
 
D
N
 
Q
A
 
K
A
 
K
A
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
F
T
 
T
V
 
L
E
 
Q
A
 
K
F
 
F
G
 
G
S
 
K
I
 
I
N
 
N
V
 
I
G
 
L
L
 
V
F
 
N
N
|
N
A
x
H
G
|
G
L
 
I
N
 
N
K
 
-
P
 
P
R
 
A
F
 
F
-
 
G
-
 
H
F
 
I
M
 
L
D
 
E
I
 
V
D
 
S
E
 
D
D
 
Q
N
 
V
W
 
W
D
 
D
M
 
K
I
 
L
M
 
F
N
 
E
V
 
V
N
 
N
T
 
V
K
 
K
A
 
A
M
 
G
W
 
F
L
 
Q
G
 
-
M
 
M
Q
 
T
E
 
K
V
 
L
A
 
V
R
 
H
Q
 
P
M
 
H
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
G
 
-
P
 
-
M
 
-
E
 
E
D
 
G
H
 
G
P
 
G
Y
 
A
K
 
I
L
 
I
I
 
F
N
|
N
V
 
A
G
x
S
S
 
Y
I
x
S
A
 
A
S
 
Y
K
 
K
K
 
S
P
 
P
L
 
-
V
 
P
D
 
G
V
 
I
T
 
A
V
 
A
Y
|
Y
C
 
G
T
 
V
S
 
T
K
|
K
Y
 
T
G
 
T
C
 
L
L
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
R
C
 
A
G
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
K
H
 
D
N
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
V
|
V
V
x
I
V
 
K
T
|
T
P
 
K
-
x
M
-
x
S
-
 
Q
-
 
V
L
|
L
W
 
W
-
 
D
-
 
G
-
 
G
E
 
E
Q
 
D
L
 
A
D
 
E
K
 
K
D
 
E
L
 
L
V
 
T
D
 
D
I
 
I
G
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
S
 
Q
A
 
E
L
 
I
V
 
A
I
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
G
Y
 
V
P
 
P
K
 
D
D
 
D
I
 
C
V
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
V
S
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
S
 
S
D
 
S
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
M
 
M
I
 
I
S
 
I
I
 
I
D
 
A
G
 
G
G
 
G

5ojgA Crystal structure of the dehydrogenase/reductase sdr family member 4 (dhrs4) from caenorhabditis elegans (see paper)
32% identity, 97% coverage: 4:265/269 of query aligns to 6:255/260 of 5ojgA

query
sites
5ojgA
N
 
R
R
 
R
L
 
F
K
 
E
G
 
G
K
 
K
N
 
V
I
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
x
A
A
 
A
A
x
T
R
 
K
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
N
 
I
A
 
A
E
 
E
S
 
R
F
 
L
A
 
L
A
 
D
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
S
V
 
V
C
 
V
L
 
I
G
 
G
D
x
S
L
x
R
D
x
N
G
 
Q
D
 
K
E
x
N
A
 
V
Q
 
D
K
 
E
V
 
A
A
 
I
D
 
E
A
 
Y
I
 
L
N
 
K
A
 
N
A
 
K
G
 
G
N
 
L
G
 
T
M
 
K
A
 
V
I
 
A
A
 
G
V
 
I
K
 
A
M
 
G
D
 
H
V
x
I
T
 
A
S
 
S
R
 
T
A
 
D
D
 
D
N
 
Q
A
 
K
A
 
K
A
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
F
T
 
T
V
 
L
E
 
Q
A
 
K
F
 
F
G
 
G
S
 
K
I
 
I
N
 
N
V
 
I
G
 
L
L
 
V
F
 
N
N
|
N
A
x
H
G
|
G
L
 
I
N
 
N
K
 
-
P
 
P
R
 
A
F
 
F
-
 
G
-
 
H
F
 
I
M
 
L
D
 
E
I
 
V
D
 
S
E
 
D
D
 
Q
N
 
V
W
 
W
D
 
D
M
 
K
I
 
L
M
 
F
N
 
E
V
 
V
N
 
N
T
 
V
K
 
K
A
 
A
M
 
G
W
 
F
L
 
Q
G
 
-
M
 
M
Q
 
T
E
 
K
V
 
L
A
 
V
R
 
H
Q
 
P
M
 
H
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
G
 
-
P
 
-
M
 
-
E
 
E
D
 
G
H
 
G
P
 
G
Y
 
A
K
 
I
L
 
I
I
 
F
N
|
N
V
 
A
G
x
S
S
 
Y
I
 
S
A
 
A
S
 
Y
K
 
K
K
 
S
P
 
P
L
 
-
V
 
P
D
 
G
V
 
I
T
 
A
V
 
A
Y
|
Y
C
 
G
T
 
V
S
 
T
K
|
K
Y
 
T
G
 
T
C
 
L
L
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
R
C
 
A
G
 
L
A
 
A
L
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
K
H
 
D
N
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
I
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
V
V
x
I
V
 
K
T
|
T
P
 
K
-
x
M
-
 
S
-
 
Q
-
 
V
L
 
L
W
 
W
-
 
D
-
 
G
-
 
G
E
 
E
Q
 
D
L
 
A
D
 
E
K
 
K
D
 
E
L
 
L
V
 
T
D
 
D
I
 
I
G
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
S
 
Q
A
 
E
L
 
I
V
 
A
I
 
L
K
 
G
R
 
R
L
 
L
S
 
G
Y
 
V
P
 
P
K
 
D
D
 
D
I
 
C
V
 
A
G
 
G
T
 
T
A
 
V
S
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
S
 
S
D
 
S
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
M
 
M
I
 
I
S
 
I
I
 
I
D
 
A
G
 
G
G
 
G

Q92506 (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 8; 17-beta-HSD 8; HSD17B8; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase alpha subunit; KAR alpha subunit; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; Estradiol 17-beta-dehydrogenase 8; Protein Ke6; Ke6; Short chain dehydrogenase/reductase family 30C member 1; Testosterone 17-beta-dehydrogenase 8; EC 1.1.1.n12; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.239 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
31% identity, 98% coverage: 4:266/269 of query aligns to 7:259/261 of Q92506

query
sites
Q92506
N
 
N
R
 
R
L
 
L
K
 
R
G
 
S
K
 
A
N
 
L
I
 
A
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
R
x
S
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
N
 
V
A
 
S
E
 
V
S
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
T
V
 
V
C
 
A
L
 
A
G
 
C
D
|
D
L
|
L
D
 
D
G
 
R
D
 
A
E
 
A
A
 
A
Q
 
Q
K
 
E
V
 
T
A
 
V
D
 
R
A
 
L
I
 
L
N
 
G
A
 
G
A
 
P
G
 
G
N
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
P
-
 
R
G
 
G
M
 
N
A
 
H
I
 
A
A
 
A
V
 
F
K
 
Q
M
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
-
S
 
S
R
 
E
A
 
A
D
 
R
N
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
C
V
 
L
A
 
L
A
 
E
T
 
Q
V
 
V
E
 
Q
A
 
A
F
 
C
G
 
F
S
 
S
-
 
R
-
 
P
I
 
P
N
 
S
V
 
V
G
 
V
L
 
V
F
 
S
N
 
C
A
 
A
G
 
G
L
 
I
N
 
T
K
 
Q
P
 
D
R
 
E
F
 
F
F
 
L
M
 
L
D
 
H
I
 
M
D
 
S
E
 
E
D
 
D
N
 
D
W
 
W
D
 
D
M
 
K
I
 
V
M
 
I
N
 
A
V
 
V
N
 
N
T
 
L
K
 
K
A
 
G
M
 
T
W
 
F
L
 
L
G
 
V
M
 
T
Q
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
Q
Q
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
S
Q
 
N
G
 
G
P
 
C
M
x
R
E
 
G
D
 
S
H
 
-
P
 
-
Y
 
-
K
 
-
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
I
G
 
S
S
 
S
I
 
I
A
x
V
S
 
G
K
 
K
K
 
V
P
 
G
L
 
N
V
 
V
D
 
G
V
 
Q
T
 
T
V
 
N
Y
|
Y
C
x
A
T
x
A
S
|
S
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
C
 
V
L
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
C
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
R
G
 
E
L
 
L
A
 
G
E
x
R
H
 
H
N
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
C
N
 
N
G
 
S
Y
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
V
x
A
T
|
T
P
 
P
L
 
M
W
 
T
E
 
Q
Q
 
K
L
 
V
D
 
P
K
 
Q
D
 
K
L
 
V
V
 
V
D
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
E
 
-
D
 
D
I
 
K
V
 
I
D
 
T
S
 
E
A
 
M
L
 
I
V
 
P
I
 
M
K
 
G
R
 
H
L
 
L
S
 
G
Y
 
D
P
 
P
K
 
E
D
 
D
I
 
V
V
 
A
G
 
D
T
 
V
A
 
V
S
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
D
 
D
S
 
S
D
 
G
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
M
 
S
I
 
V
S
 
E
I
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
W
 
L

6zzpA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
33% identity, 97% coverage: 6:266/269 of query aligns to 8:262/265 of 6zzpA

query
sites
6zzpA
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
x
S
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
D
N
 
I
A
 
A
E
 
E
S
 
T
F
 
Y
A
 
A
A
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
A
V
 
V
C
 
G
L
 
I
G
 
A
D
|
D
L
x
I
D
 
N
G
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
V
 
T
A
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
-
G
 
G
M
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
I
K
 
A
M
|
M
D
|
D
V
|
V
T
 
T
S
 
S
R
 
E
A
 
A
D
 
A
N
 
V
A
 
N
A
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
Q
A
 
R
T
 
L
V
 
V
E
 
D
A
 
T
F
 
F
G
 
G
S
 
G
I
 
I
N
 
D
V
 
I
G
 
L
L
 
V
F
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
N
x
Q
K
 
I
P
 
I
R
 
D
F
 
P
F
 
I
M
 
H
D
 
K
I
 
M
D
 
A
E
 
F
D
 
E
N
 
D
W
 
W
D
 
K
M
 
K
I
 
M
M
 
L
N
 
A
V
 
I
N
 
H
T
 
L
K
 
D
A
 
G
M
 
A
W
 
F
L
 
L
G
 
T
M
 
T
Q
 
K
E
 
A
V
 
A
A
 
I
R
 
Q
Q
 
H
M
 
M
I
 
Y
A
 
K
Q
 
-
G
 
-
P
 
-
M
 
-
E
 
D
D
 
D
H
 
K
P
 
G
Y
 
G
K
 
T
L
 
V
I
 
I
N
 
Y
V
x
M
G
 
G
S
|
S
I
 
V
A
x
H
S
 
S
K
 
H
K
 
E
P
 
A
L
 
S
V
 
L
D
 
F
V
x
K
T
 
A
V
 
P
Y
|
Y
C
 
V
T
 
T
S
 
A
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
C
 
L
L
 
L
A
 
G
L
 
L
T
 
C
E
 
R
C
 
V
G
 
L
A
 
A
L
 
K
G
 
E
L
 
G
A
 
A
E
 
V
H
 
H
N
 
N
I
 
V
T
 
R
V
 
S
N
 
H
G
 
V
Y
 
I
A
 
C
P
|
P
G
 
G
V
x
F
V
|
V
V
 
K
T
|
T
P
 
P
L
|
L
W
x
V
E
 
E
-
 
K
Q
|
Q
L
 
I
D
 
P
K
 
Q
D
 
Q
L
 
A
V
 
A
D
 
E
I
 
K
G
 
G
F
 
I
K
 
S
E
 
E
R
 
E
E
 
S
G
 
-
Q
 
-
A
 
V
Y
 
V
E
 
N
D
 
D
I
 
I
V
 
M
D
 
L
S
 
V
A
 
N
L
 
T
V
 
V
I
 
D
K
 
K
R
 
E
L
 
F
S
 
T
Y
 
T
P
 
V
K
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
A
G
 
Q
T
 
L
A
 
A
S
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
F
D
 
P
S
 
T
D
 
N
Y
 
V
M
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
I
 
I
S
 
V
I
 
A
D
 
S
G
 
H
G
 
G
W
 
W

6zzoC Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
33% identity, 97% coverage: 6:266/269 of query aligns to 8:262/265 of 6zzoC

query
sites
6zzoC
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
x
S
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
D
N
 
I
A
 
A
E
 
E
S
 
T
F
 
Y
A
 
A
A
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
A
V
 
V
C
 
G
L
 
I
G
 
A
D
|
D
L
x
I
D
 
N
G
 
L
D
 
E
E
 
A
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
V
 
T
A
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
N
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
-
G
 
G
M
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
I
K
 
A
M
|
M
D
|
D
V
|
V
T
 
T
S
 
S
R
 
E
A
 
A
D
 
A
N
 
V
A
 
N
A
 
D
A
 
G
V
 
V
A
 
Q
A
 
R
T
 
L
V
 
V
E
 
D
A
 
T
F
 
F
G
 
G
S
 
G
I
 
I
N
 
D
V
 
I
G
 
L
L
 
V
F
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
N
x
Q
K
 
I
P
 
I
R
 
D
F
 
P
F
 
I
M
 
H
D
 
K
I
 
M
D
 
A
E
 
F
D
 
E
N
 
D
W
 
W
D
 
K
M
 
K
I
 
M
M
 
L
N
 
A
V
 
I
N
 
H
T
 
L
K
 
D
A
 
G
M
 
A
W
 
F
L
 
L
G
 
T
M
 
T
Q
 
K
E
 
A
V
 
A
A
 
I
R
 
Q
Q
 
H
M
 
M
I
 
Y
A
 
K
Q
 
-
G
 
-
P
 
-
M
 
-
E
 
D
D
 
D
H
 
K
P
 
G
Y
 
G
K
 
T
L
 
V
I
 
I
N
 
Y
V
x
M
G
 
G
S
 
S
I
 
V
A
x
H
S
 
S
K
 
H
K
 
E
P
 
A
L
 
S
V
 
L
D
 
F
V
x
K
T
 
A
V
 
P
Y
|
Y
C
 
V
T
 
T
S
 
A
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
C
 
L
L
 
L
A
 
G
L
 
L
T
 
C
E
 
R
C
 
V
G
 
L
A
 
A
L
 
K
G
 
E
L
 
G
A
 
A
E
 
V
H
 
H
N
 
N
I
 
V
T
 
R
V
 
S
N
 
H
G
 
V
Y
 
I
A
 
C
P
|
P
G
 
G
V
x
F
V
|
V
V
 
K
T
|
T
P
 
P
L
|
L
W
x
V
E
 
E
-
 
K
Q
|
Q
L
 
I
D
 
P
K
 
Q
D
 
Q
L
 
A
V
 
A
D
 
E
I
 
K
G
 
G
F
 
I
K
 
S
E
 
E
R
 
E
E
 
S
G
 
-
Q
 
-
A
 
V
Y
 
V
E
 
N
D
 
D
I
 
I
V
 
M
D
 
L
S
 
V
A
 
N
L
 
T
V
 
V
I
 
D
K
 
K
R
 
E
L
 
F
S
 
T
Y
 
T
P
 
V
K
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
A
G
 
Q
T
 
L
A
 
A
S
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
F
D
 
P
S
 
T
D
 
N
Y
 
V
M
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
S
I
 
I
S
 
V
I
 
A
D
 
S
G
 
H
G
 
G
W
 
W

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
31% identity, 97% coverage: 6:265/269 of query aligns to 3:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
V
I
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
R
|
R
G
|
G
M
x
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
D
N
 
I
A
 
A
E
 
I
S
 
N
F
 
L
A
 
A
A
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
N
V
 
I
C
 
F
L
 
F
G
 
-
D
x
N
L
x
Y
D
x
N
G
|
G
D
x
S
E
 
P
A
 
E
Q
 
A
K
 
A
V
 
E
A
 
E
D
 
T
A
 
A
I
 
K
N
 
L
A
 
V
A
 
A
G
 
E
N
 
H
G
 
G
M
 
V
A
 
E
I
 
V
-
 
E
A
 
A
V
 
M
K
 
K
M
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
S
 
I
R
 
A
A
 
E
D
 
D
N
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
F
V
 
F
A
 
K
A
 
Q
T
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
S
 
R
I
 
V
N
 
D
V
 
I
G
 
L
L
 
V
F
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
x
I
N
 
T
K
 
R
P
 
D
R
 
N
F
 
L
F
 
L
M
 
M
D
 
R
I
 
M
D
 
K
E
 
E
D
 
D
N
 
E
W
 
W
D
 
D
M
 
D
I
 
V
M
 
I
N
 
N
V
x
I
N
 
N
T
 
L
K
 
K
A
 
G
M
 
T
W
 
F
L
 
L
G
 
C
M
 
T
Q
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
S
R
 
R
Q
 
T
M
 
M
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
P
 
-
M
 
M
E
 
K
D
 
Q
H
 
R
P
 
A
Y
 
G
K
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
M
G
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
V
S
 
G
K
 
L
K
 
I
P
 
G
L
 
N
V
 
A
D
 
G
V
x
Q
T
 
A
V
 
N
Y
|
Y
C
 
V
T
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
C
 
V
L
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
C
 
T
G
 
T
A
 
A
L
 
R
G
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
Y
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
V
 
T
T
|
T
P
 
D
L
 
M
W
 
T
E
 
D
Q
 
K
L
 
L
D
 
D
K
 
E
D
 
K
L
 
T
V
 
K
D
 
E
I
 
A
G
 
M
F
 
L
K
 
A
E
 
Q
R
 
I
E
 
P
G
 
L
Q
 
G
A
 
A
Y
 
Y
-
 
G
-
 
T
-
 
T
E
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
A
D
 
N
S
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
-
I
 
-
K
 
-
R
 
-
L
 
-
S
 
-
Y
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
A
S
 
S
D
 
K
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
M
 
T
I
 
L
S
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>GFF2280 PGA1_c23120 putative sorbitol dehydrogenase
MDPNRLKGKNILITGAARGMGQANAESFAAQGANVCLGDLDGDEAQKVADAINAAGNGMA
IAVKMDVTSRADNAAAVAATVEAFGSINVGLFNAGLNKPRFFMDIDEDNWDMIMNVNTKA
MWLGMQEVARQMIAQGPMEDHPYKLINVGSIASKKPLVDVTVYCTSKYGCLALTECGALG
LAEHNITVNGYAPGVVVTPLWEQLDKDLVDIGFKEREGQAYEDIVDSALVIKRLSYPKDI
VGTASFLASDDSDYMTGQMISIDGGWATT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory