SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2286 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2286 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P06959 Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex; Dihydrolipoamide acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex; E2; EC 2.3.1.12 from Escherichia coli (strain K12) (see 6 papers)
41% identity, 98% coverage: 6:292/292 of query aligns to 329:630/630 of P06959

query
sites
P06959
A
 
A
P
 
T
P
 
P
S
 
L
V
 
I
R
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
K
 
F
G
 
G
I
 
V
D
 
N
L
 
L
E
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
K
K
 
G
E
 
T
L
 
G
G
 
R
R
 
K
T
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
L
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
V
E
 
Q
S
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
P
G
 
A
K
 
A
T
 
T
T
 
G
S
 
G
G
 
G
P
 
I
A
 
P
G
 
G
D
 
M
T
 
L
S
 
P
Y
 
W
W
 
P
D
 
K
V
 
V
D
 
D
H
 
F
S
 
S
Q
x
K
F
 
F
G
 
G
S
 
E
V
 
I
G
 
E
E
 
E
E
 
V
L
 
E
M
 
L
S
 
G
R
 
R
F
 
I
A
 
Q
Q
 
K
V
 
I
A
 
S
A
 
G
A
 
A
N
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
R
A
 
N
N
 
W
A
 
V
L
 
M
I
 
I
P
 
P
Q
 
H
V
 
V
T
 
T
H
 
H
H
 
F
D
 
D
R
 
K
A
 
T
D
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
E
I
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
R
K
 
K
E
 
Q
L
 
Q
K
 
N
P
 
E
E
 
E
A
 
A
Q
 
A
A
 
K
R
 
R
G
 
K
-
 
L
-
 
D
V
 
V
K
 
K
L
 
I
T
 
T
A
 
P
L
 
V
A
 
V
F
 
F
Q
 
I
A
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
F
 
M
P
 
P
R
 
R
F
 
F
N
 
N
A
 
S
S
 
S
L
 
L
S
 
S
P
 
E
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
T
 
R
L
 
L
T
 
T
L
 
L
K
 
K
G
 
K
Y
 
Y
V
 
I
H
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
H
 
N
G
 
G
L
 
L
M
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
F
H
 
K
D
 
D
V
 
V
D
 
N
R
 
K
K
 
K
G
 
G
L
 
I
W
 
I
Q
 
E
I
 
L
A
 
S
A
 
R
E
 
E
I
 
L
S
 
M
D
 
T
L
 
I
A
 
S
S
 
K
R
 
K
A
 
A
Q
 
R
N
 
D
R
 
G
K
 
K
V
 
L
G
 
T
P
 
A
D
 
G
E
 
E
M
 
M
G
 
Q
G
 
G
A
 
G
S
 
C
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
 
S
N
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
L
G
 
G
G
 
T
I
 
T
G
 
H
F
 
F
T
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
N
 
N
P
 
A
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
S
R
 
K
T
 
S
E
 
A
T
 
M
V
 
E
T
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
N
D
 
G
D
 
K
T
 
E
P
 
F
R
 
V
P
 
P
V
 
R
T
 
L
M
 
M
V
 
L
P
 
P
L
 
I
D
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
H
|
H
R
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
I
S
 
T
Y
 
I
F
 
I
A
 
N
G
 
N
L
 
T
I
 
L
A
 
S
D
 
D
P
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
L
M
 
V
V
 
M

Sites not aligning to the query:

1eafA Atomic structure of the cubic core of the pyruvate dehydrogenase multienzyme complex (see paper)
50% identity, 81% coverage: 56:292/292 of query aligns to 7:243/243 of 1eafA

query
sites
1eafA
V
 
V
D
 
D
H
 
F
S
 
A
Q
 
K
F
 
Y
G
 
G
S
 
E
V
 
I
G
 
E
E
 
E
E
 
V
L
 
P
M
 
M
S
 
T
R
 
R
F
 
L
A
 
M
Q
 
Q
V
 
I
A
 
G
A
 
A
A
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
H
A
 
R
A
 
S
N
 
W
A
 
L
L
 
N
I
 
V
P
 
P
Q
 
H
V
 
V
T
 
T
H
 
Q
H
 
F
D
 
E
R
 
S
A
 
A
D
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
E
I
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
R
K
 
V
E
 
A
L
 
Q
K
 
K
P
 
A
E
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
K
R
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
V
L
 
L
A
 
P
F
 
L
Q
 
L
A
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
C
A
 
A
R
 
Y
A
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
F
 
L
P
 
P
R
 
D
F
 
F
N
 
N
A
 
S
S
 
S
L
 
L
S
 
A
P
 
P
D
 
S
G
 
G
K
 
Q
T
 
A
L
 
L
T
 
I
L
 
R
K
 
K
G
 
K
Y
 
Y
V
 
V
H
 
H
I
 
I
G
 
G
I
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
H
 
D
G
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
R
D
 
N
V
 
V
D
 
D
R
 
Q
K
 
K
G
 
S
L
 
L
W
 
L
Q
 
Q
I
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
A
S
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
R
N
 
S
R
 
K
K
 
K
V
 
L
G
 
G
P
 
A
D
 
D
E
 
A
M
 
M
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
S
 
C
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
x
S
N
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
H
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
T
G
 
A
F
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
N
 
N
P
 
A
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
S
R
 
K
T
 
A
E
 
S
T
 
M
V
 
Q
T
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
D
D
 
G
D
 
K
T
 
A
P
 
F
R
 
Q
P
 
P
V
 
R
T
 
L
M
 
M
V
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
H
|
H
R
 
R
V
 
V
I
 
I
N
|
N
G
|
G
A
 
A
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
T
S
 
K
Y
 
R
F
 
L
A
 
G
G
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
I
R
 
R
R
 
A
I
 
I
M
 
L
V
 
L

1eadA Atomic structure of the cubic core of the pyruvate dehydrogenase multienzyme complex (see paper)
50% identity, 81% coverage: 56:292/292 of query aligns to 7:243/243 of 1eadA

query
sites
1eadA
V
 
V
D
 
D
H
 
F
S
 
A
Q
 
K
F
 
Y
G
 
G
S
 
E
V
 
I
G
 
E
E
 
E
E
 
V
L
 
P
M
 
M
S
 
T
R
 
R
F
 
L
A
 
M
Q
 
Q
V
 
I
A
 
G
A
 
A
A
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
H
A
 
R
A
 
S
N
 
W
A
 
L
L
 
N
I
 
V
P
 
P
Q
 
H
V
 
V
T
 
T
H
 
Q
H
 
F
D
 
E
R
 
S
A
 
A
D
 
D
V
 
I
T
 
T
A
 
E
I
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
R
K
 
V
E
 
A
L
 
Q
K
 
K
P
 
A
E
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
K
R
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
V
L
 
L
A
 
P
F
 
L
Q
 
L
A
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
C
A
 
A
R
 
Y
A
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
F
 
L
P
 
P
R
 
D
F
 
F
N
 
N
A
 
S
S
 
S
L
 
L
S
 
A
P
 
P
D
 
S
G
 
G
K
 
Q
T
 
A
L
 
L
T
 
I
L
 
R
K
 
K
G
 
K
Y
 
Y
V
 
V
H
 
H
I
 
I
G
 
G
I
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
H
 
D
G
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
R
D
 
N
V
 
V
D
 
D
R
 
Q
K
 
K
G
 
S
L
 
L
W
 
L
Q
 
Q
I
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
A
S
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
R
N
 
S
R
 
K
K
 
K
V
 
L
G
 
G
P
 
A
D
 
D
E
 
A
M
 
M
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
S
 
C
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
x
S
N
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
H
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
T
G
 
A
F
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
N
 
N
P
 
A
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
S
R
 
K
T
 
A
E
 
S
T
 
M
V
 
Q
T
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
D
D
 
G
D
 
K
T
 
A
P
 
F
R
 
Q
P
 
P
V
 
R
T
 
L
M
 
M
V
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
H
|
H
R
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
|
G
A
|
A
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
T
S
 
K
Y
 
R
F
 
L
A
 
G
G
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
I
R
 
R
R
 
A
I
 
I
M
 
L
V
 
L

P21883 Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex; Dihydrolipoamide acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex; E2; S complex, 48 kDa subunit; EC 2.3.1.12 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
38% identity, 99% coverage: 4:292/292 of query aligns to 140:440/442 of P21883

query
sites
P21883
I
 
V
I
 
I
A
 
A
P
 
M
P
 
P
S
 
S
V
 
V
R
 
R
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
R
K
 
K
L
 
V
A
 
T
K
 
G
E
 
S
L
 
G
G
 
N
R
 
N
T
 
G
S
 
R
I
 
V
V
 
V
R
 
K
E
 
E
D
 
D
L
 
I
E
 
D
S
 
S
-
 
F
-
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
Q
-
 
E
-
 
A
-
 
A
G
 
P
K
 
Q
T
 
E
T
 
T
S
 
A
G
 
A
P
 
P
A
 
Q
G
 
E
D
 
T
T
 
A
S
 
A
Y
 
K
W
 
P
D
 
A
V
 
A
D
 
A
H
 
P
S
 
A
Q
 
P
F
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
F
G
 
P
E
 
E
-
 
T
-
 
R
E
 
E
L
 
K
M
 
M
S
 
S
R
 
G
F
 
I
A
 
R
Q
 
K
V
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
K
N
 
A
L
 
M
S
 
V
A
 
N
A
 
S
N
 
K
A
 
H
L
 
T
I
 
A
P
 
P
Q
 
H
V
 
V
T
 
T
H
 
L
H
 
M
D
 
D
R
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
N
I
 
L
E
 
V
A
 
A
L
 
H
R
 
R
K
 
K
E
 
Q
L
 
F
K
 
K
P
 
Q
E
 
V
A
 
A
Q
 
A
A
 
D
R
 
Q
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
Y
L
 
L
A
 
P
F
 
Y
Q
 
V
A
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
K
F
 
F
P
 
P
R
 
V
F
 
L
N
 
N
A
 
T
S
 
S
L
 
I
S
 
D
P
 
D
D
 
K
G
 
T
K
 
D
T
 
E
L
 
V
T
 
I
L
 
Q
K
 
K
G
 
H
Y
 
Y
V
 
F
H
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
H
 
K
D
 
N
V
 
A
D
 
D
R
 
R
K
 
K
G
 
S
L
 
V
W
 
F
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
N
D
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
T
R
 
K
A
 
A
Q
 
R
N
 
E
R
 
G
K
 
K
V
 
L
G
 
A
P
 
P
D
 
A
E
 
E
M
 
M
G
 
K
G
 
G
A
 
A
S
 
S
M
 
C
T
 
T
I
 
I
T
 
T
N
 
N
L
 
I
G
 
G
G
 
S
I
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
Q
G
 
W
F
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
I
N
 
N
P
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
G
R
 
R
T
 
I
E
 
A
T
 
E
V
 
K
T
 
A
V
 
I
W
 
V
D
 
R
D
 
D
D
 
G
T
 
E
P
 
I
R
 
V
P
 
A
V
 
A
T
 
P
M
 
V
V
 
L
P
 
A
L
 
L
D
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
H
 
H
R
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
Q
R
 
N
F
 
A
V
 
L
S
 
N
Y
 
H
F
 
I
A
 
K
G
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
N
D
 
D
P
 
P
R
 
Q
R
 
L
I
 
I
M
 
L
V
 
M

Sites not aligning to the query:

P11961 Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex; Dihydrolipoamide acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex; E2; EC 2.3.1.12 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
38% identity, 99% coverage: 4:292/292 of query aligns to 129:426/428 of P11961

query
sites
P11961
I
 
V
I
 
I
A
 
A
P
 
M
P
 
P
S
 
S
V
 
V
R
 
R
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
-
K
 
R
L
 
L
A
 
V
K
 
Q
E
 
G
L
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
N
S
 
G
-
 
R
I
 
V
V
 
L
R
 
K
E
 
E
D
 
D
L
 
I
E
 
D
S
 
A
-
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
P
G
 
A
K
 
A
T
 
A
T
 
E
S
 
E
G
 
K
P
 
A
A
 
A
G
 
P
D
 
A
T
 
A
S
 
A
Y
 
K
W
 
P
D
 
A
V
 
T
D
 
T
H
 
E
S
 
G
Q
 
E
F
 
F
G
 
P
S
 
E
V
 
T
G
 
R
E
 
E
E
 
K
L
 
-
M
 
M
S
 
S
R
 
G
F
 
I
A
 
R
Q
 
R
V
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
K
N
 
A
L
 
M
S
 
V
A
 
H
A
 
S
N
 
K
A
 
H
L
 
T
I
 
A
P
 
P
Q
 
H
V
 
V
T
 
T
H
 
L
H
 
M
D
 
D
R
 
E
A
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
K
I
 
L
E
 
V
A
 
A
L
 
H
R
 
R
K
 
K
E
 
K
L
 
F
K
 
K
P
 
A
E
 
I
A
 
A
Q
 
A
A
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
T
 
T
A
 
F
L
 
L
A
 
P
F
 
Y
Q
 
V
A
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
V
R
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
F
 
Y
P
 
P
R
 
V
F
 
L
N
 
N
A
 
T
S
 
S
L
 
I
S
 
D
P
 
D
D
 
E
G
 
T
K
 
E
T
 
E
L
 
I
T
 
I
L
 
Q
K
 
K
G
 
H
Y
 
Y
V
 
Y
H
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
D
H
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
K
D
 
H
V
 
A
D
 
D
R
 
R
K
 
K
G
 
P
L
 
I
W
 
F
Q
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
I
 
I
S
 
N
D
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
R
N
 
D
R
 
G
K
 
K
V
 
L
G
 
T
P
 
P
D
 
G
E
 
E
M
 
M
G
 
K
G
 
G
A
 
A
S
 
S
M
 
C
T
 
T
I
 
I
T
 
T
N
 
N
L
 
I
G
 
G
G
 
S
I
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
Q
G
 
W
F
 
F
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
I
N
 
N
P
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
G
R
 
R
T
 
I
E
 
A
T
 
E
V
 
K
T
 
P
V
 
I
W
 
V
D
 
R
D
 
D
D
 
G
T
 
E
P
 
I
R
 
V
P
 
A
V
 
A
T
 
P
M
 
M
V
 
L
P
 
A
L
 
L
D
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
F
D
 
D
H
 
H
R
 
R
V
 
M
I
 
I
N
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
Q
R
 
K
F
 
A
V
 
L
S
 
N
Y
 
H
F
 
I
A
 
K
G
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
E
R
 
L
I
 
L
M
 
L
V
 
M

Sites not aligning to the query:

6zzmB Crystal structure of the catalytic domain of corynebacterium mustelae predicted acetyltransferase acef (e2p). (see paper)
40% identity, 72% coverage: 69:278/292 of query aligns to 7:221/238 of 6zzmB

query
sites
6zzmB
M
 
V
S
 
N
R
 
R
F
 
I
A
 
R
Q
 
E
V
 
I
A
 
T
A
 
A
A
 
A
N
 
K
L
 
M
S
 
V
A
 
E
A
 
A
N
 
L
A
 
Q
L
 
I
I
 
S
P
 
A
Q
 
Q
V
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
L
D
 
Q
R
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
M
T
 
T
A
 
K
I
 
I
E
 
A
A
 
E
L
 
L
R
|
R
K
 
K
E
 
E
L
 
S
K
|
K
P
 
P
E
 
A
A
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
R
 
K
-
 
Y
G
 
G
V
 
V
K
x
N
L
 
L
T
|
T
A
x
Y
L
|
L
A
 
P
F
 
F
Q
 
F
A
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
V
R
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
V
E
 
S
F
 
H
P
 
P
R
 
N
F
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
Y
S
 
N
P
 
A
D
 
E
G
 
T
K
 
K
T
 
E
L
 
M
T
 
T
L
 
Y
K
 
H
G
 
A
Y
 
D
V
 
V
H
 
N
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
|
A
V
|
V
D
|
D
T
 
T
A
 
P
H
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
H
D
 
K
V
 
A
D
 
Q
R
 
E
K
 
L
G
 
T
L
 
F
W
 
P
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
Q
E
 
A
I
 
I
S
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
D
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
N
 
N
R
 
N
K
 
K
V
 
L
G
 
K
P
 
P
D
 
Q
E
 
D
M
 
L
G
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
|
T
N
|
N
L
x
I
G
|
G
G
x
S
I
 
E
G
 
G
G
 
A
I
 
L
G
 
S
F
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
L
N
 
V
P
 
P
P
 
P
E
 
Q
V
 
A
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
T
T
x
A
-
x
A
-
x
I
R
 
Q
T
 
K
E
 
R
T
 
A
V
 
V
T
 
V
V
 
V
W
 
T
D
 
E
D
 
D
-
 
G
-
 
V
D
 
D
T
 
A
P
 
I
R
 
A
P
 
I
V
 
R
T
 
Q
M
 
M
V
 
C
P
 
Y
L
 
M
D
 
P
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
D
 
D
H
 
H
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
N
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
F
V
 
T
S
 
T

6zzkA Crystal structure of the catalytic domain of c. Glutamicum acef (e2p) in ternary complex with coa and dihydrolipoamide. (see paper)
38% identity, 72% coverage: 69:278/292 of query aligns to 9:223/240 of 6zzkA

query
sites
6zzkA
M
 
V
S
 
N
R
 
R
F
 
I
A
 
R
Q
 
E
V
 
I
A
x
T
A
 
A
A
 
M
N
 
K
L
x
T
S
 
V
A
 
E
A
 
A
N
 
L
A
 
Q
L
 
I
I
 
S
P
 
A
Q
 
Q
V
 
L
T
 
T
H
 
Q
H
 
L
D
 
H
R
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
M
T
 
T
A
 
R
I
 
V
E
 
A
A
 
E
L
 
L
R
|
R
K
 
K
E
 
K
L
 
N
K
|
K
P
 
P
E
 
A
-
 
F
A
 
I
Q
 
E
A
 
K
R
 
H
G
 
G
V
 
V
K
x
N
L
 
L
T
|
T
A
x
Y
L
|
L
A
 
P
F
 
F
Q
 
F
A
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
V
E
 
S
F
 
H
P
 
P
R
 
N
F
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
F
S
 
N
P
 
A
D
 
K
G
 
T
K
 
K
T
 
E
L
 
M
T
 
T
L
 
Y
K
 
H
G
 
S
Y
 
S
V
 
V
H
 
N
I
 
L
G
 
S
I
 
I
A
|
A
V
|
V
D
|
D
T
 
T
A
 
P
H
 
A
G
 
G
L
|
L
M
 
L
V
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
H
D
 
D
V
 
A
D
 
Q
R
 
D
K
 
L
G
 
S
L
 
I
W
 
P
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
E
 
A
I
 
I
S
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
D
R
 
R
A
 
S
Q
x
R
N
 
N
R
 
N
K
 
K
V
 
L
G
 
K
P
 
P
D
 
N
E
 
D
M
 
L
G
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
|
T
N
|
N
L
x
I
G
|
G
G
x
S
I
 
E
G
 
G
G
 
A
I
 
L
G
 
S
F
 
D
T
 
T
P
|
P
I
|
I
V
 
L
N
x
V
P
 
P
P
 
P
E
 
Q
V
 
A
A
 
G
I
|
I
L
 
L
G
 
G
-
 
T
-
x
G
-
x
A
-
x
I
I
 
V
T
 
K
R
 
R
T
 
P
E
 
V
T
 
V
V
 
I
T
 
T
V
 
E
W
 
D
D
 
G
D
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
I
R
 
A
P
 
I
V
 
R
T
 
Q
M
 
M
V
 
V
P
 
F
L
 
L
D
 
P
L
 
L
S
 
T
Y
 
Y
D
 
D
H
 
H
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
N
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
F
V
 
L
S
 
T

6zzjA Crystal structure of the catalytic domain of corynebacterium glutamicum acetyltransferase acef (e2p) in complex with oxidized coa. (see paper)
38% identity, 72% coverage: 69:278/292 of query aligns to 9:223/240 of 6zzjA

query
sites
6zzjA
M
 
V
S
 
N
R
 
R
F
 
I
A
 
R
Q
 
E
V
 
I
A
 
T
A
 
A
A
 
M
N
 
K
L
 
T
S
 
V
A
 
E
A
 
A
N
 
L
A
 
Q
L
 
I
I
 
S
P
 
A
Q
 
Q
V
 
L
T
 
T
H
 
Q
H
 
L
D
 
H
R
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
M
T
 
T
A
 
R
I
 
V
E
 
A
A
 
E
L
 
L
R
|
R
K
 
K
E
 
K
L
 
N
K
|
K
P
 
P
E
 
A
-
 
F
A
 
I
Q
 
E
A
 
K
R
 
H
G
 
G
V
 
V
K
x
N
L
 
L
T
|
T
A
x
Y
L
|
L
A
 
P
F
 
F
Q
 
F
A
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
V
E
 
S
F
 
H
P
 
P
R
 
N
F
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
F
S
 
N
P
 
A
D
 
K
G
 
T
K
 
K
T
 
E
L
 
M
T
 
T
L
 
Y
K
 
H
G
 
S
Y
 
S
V
 
V
H
 
N
I
 
L
G
 
S
I
 
I
A
|
A
V
|
V
D
|
D
T
 
T
A
 
P
H
 
A
G
 
G
L
|
L
M
 
L
V
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
H
D
 
D
V
 
A
D
 
Q
R
 
D
K
 
L
G
 
S
L
 
I
W
 
P
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
E
 
A
I
 
I
S
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
D
R
 
R
A
 
S
Q
x
R
N
 
N
R
 
N
K
 
K
V
 
L
G
 
K
P
 
P
D
 
N
E
 
D
M
 
L
G
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
|
T
N
|
N
L
x
I
G
|
G
G
x
S
I
 
E
G
 
G
G
 
A
I
 
L
G
 
S
F
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
L
N
 
V
P
 
P
P
 
P
E
 
Q
V
 
A
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
-
 
T
-
x
G
-
x
A
-
x
I
I
 
V
T
 
K
R
 
R
T
 
P
E
 
V
T
 
V
V
 
I
T
 
T
V
 
E
W
 
D
D
 
G
D
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
I
R
 
A
P
 
I
V
 
R
T
 
Q
M
 
M
V
 
V
P
 
F
L
 
L
D
 
P
L
 
L
S
 
T
Y
 
Y
D
 
D
H
 
H
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
N
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
F
V
 
L
S
 
T

6zzkB Crystal structure of the catalytic domain of c. Glutamicum acef (e2p) in ternary complex with coa and dihydrolipoamide. (see paper)
38% identity, 72% coverage: 69:278/292 of query aligns to 10:224/241 of 6zzkB

query
sites
6zzkB
M
 
V
S
 
N
R
 
R
F
 
I
A
 
R
Q
 
E
V
 
I
A
 
T
A
 
A
A
 
M
N
 
K
L
 
T
S
 
V
A
 
E
A
 
A
N
 
L
A
 
Q
L
 
I
I
 
S
P
 
A
Q
 
Q
V
 
L
T
 
T
H
 
Q
H
 
L
D
 
H
R
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
M
T
 
T
A
 
R
I
 
V
E
 
A
A
 
E
L
 
L
R
|
R
K
 
K
E
 
K
L
 
N
K
|
K
P
 
P
E
 
A
-
 
F
A
 
I
Q
 
E
A
 
K
R
 
H
G
 
G
V
 
V
K
x
N
L
 
L
T
|
T
A
x
Y
L
|
L
A
 
P
F
 
F
Q
 
F
A
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
V
E
 
S
F
 
H
P
 
P
R
 
N
F
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
F
S
 
N
P
 
A
D
 
K
G
 
T
K
 
K
T
 
E
L
 
M
T
 
T
L
 
Y
K
 
H
G
 
S
Y
 
S
V
 
V
H
 
N
I
 
L
G
 
S
I
 
I
A
|
A
V
|
V
D
|
D
T
 
T
A
 
P
H
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
H
D
 
D
V
 
A
D
 
Q
R
 
D
K
 
L
G
 
S
L
 
I
W
 
P
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
E
 
A
I
 
I
S
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
D
R
 
R
A
 
S
Q
x
R
N
 
N
R
 
N
K
 
K
V
 
L
G
 
K
P
 
P
D
 
N
E
 
D
M
 
L
G
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
|
T
N
|
N
L
x
I
G
|
G
G
x
S
I
 
E
G
 
G
G
 
A
I
 
L
G
 
S
F
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
L
N
 
V
P
 
P
P
 
P
E
 
Q
V
 
A
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
-
 
T
-
x
G
-
x
A
-
x
I
I
 
V
T
 
K
R
 
R
T
 
P
E
 
V
T
 
V
V
 
I
T
 
T
V
 
E
W
 
D
D
 
G
D
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
I
R
 
A
P
 
I
V
 
R
T
 
Q
M
 
M
V
 
V
P
 
F
L
 
L
D
 
P
L
 
L
S
 
T
Y
 
Y
D
 
D
H
 
H
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
N
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
F
V
 
L
S
 
T

Q8NNJ2 Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex; Dihydrolipoamide acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex; Pyruvate dehydrogenase complex component E2; PDH component E2; EC 2.3.1.12 from Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / BCRC 11384 / JCM 1318 / LMG 3730 / NCIMB 10025) (see paper)
38% identity, 73% coverage: 69:280/292 of query aligns to 444:660/675 of Q8NNJ2

query
sites
Q8NNJ2
M
 
V
S
 
N
R
 
R
F
 
I
A
 
R
Q
 
E
V
 
I
A
 
T
A
 
A
A
 
M
N
 
K
L
 
T
S
 
V
A
 
E
A
 
A
N
 
L
A
 
Q
L
 
I
I
 
S
P
 
A
Q
 
Q
V
 
L
T
 
T
H
 
Q
H
 
L
D
 
H
R
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
M
T
 
T
A
 
R
I
 
V
E
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
K
 
K
E
 
K
L
 
N
K
 
K
P
 
P
E
 
A
-
 
F
A
 
I
Q
 
E
A
 
K
R
 
H
G
 
G
V
 
V
K
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
Y
L
 
L
A
 
P
F
 
F
Q
 
F
A
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
V
E
 
S
F
 
H
P
 
P
R
 
N
F
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
F
S
 
N
P
 
A
D
 
K
G
 
T
K
 
K
T
 
E
L
 
M
T
 
T
L
 
Y
K
 
H
G
 
S
Y
 
S
V
 
V
H
 
N
I
 
L
G
 
S
I
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
H
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
H
D
 
D
V
 
A
D
 
Q
R
 
D
K
 
L
G
 
S
L
 
I
W
 
P
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
E
 
A
I
 
I
S
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
S
 
D
R
 
R
A
 
S
Q
 
R
N
 
N
R
 
N
K
 
K
V
 
L
G
 
K
P
 
P
D
 
N
E
 
D
M
 
L
G
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
 
T
N
 
N
L
 
I
G
 
G
G
 
S
I
 
E
G
 
G
G
 
A
I
 
L
G
 
S
F
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
L
N
 
V
P
 
P
P
 
P
E
 
Q
V
 
A
A
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
I
I
 
V
T
 
K
R
 
R
T
 
P
E
 
V
T
 
V
V
 
I
T
 
T
V
 
E
W
 
D
D
 
G
D
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
I
R
 
A
P
 
I
V
 
R
T
 
Q
M
 
M
V
 
V
P
 
F
L
 
L
D
 
P
L
 
L
S
 
T
Y
 
Y
D
 
D
H
 
H
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
N
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
G
R
 
R
F
 
F
V
 
L
S
 
T
Y
 
T
F
 
I

Sites not aligning to the query:

2ii5A Crystal structure of a cubic core of the dihydrolipoamide acyltransferase (e2b) component in the branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase complex (bckdc), isobutyryl-coenzyme a-bound form (see paper)
32% identity, 76% coverage: 72:292/292 of query aligns to 11:231/234 of 2ii5A

query
sites
2ii5A
F
 
F
A
 
H
Q
 
K
V
 
A
A
 
M
A
 
V
A
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
N
 
-
A
 
L
L
 
K
I
 
I
P
 
P
Q
 
H
V
 
F
T
 
G
H
 
Y
H
 
C
D
 
D
R
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
T
A
 
E
I
 
L
E
 
V
A
 
K
L
 
L
R
|
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
I
A
 
A
Q
 
F
A
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
T
x
S
A
x
F
L
x
M
A
 
P
F
 
F
Q
 
F
A
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
S
R
 
L
A
 
G
L
 
L
R
 
L
E
 
Q
F
 
F
P
 
P
R
 
I
F
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
V
S
 
D
P
 
E
D
 
N
G
 
C
K
 
Q
T
 
N
L
 
I
T
 
T
L
 
Y
K
 
K
G
 
A
Y
 
S
V
 
H
H
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
M
D
 
D
T
 
T
A
 
E
H
 
Q
G
 
G
L
 
L
M
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
N
V
 
V
H
 
K
D
 
N
V
 
V
D
 
Q
R
 
I
K
 
R
G
 
S
L
 
I
W
 
F
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
T
E
 
E
I
 
L
S
 
N
D
 
R
L
 
L
A
 
Q
S
 
K
R
 
L
A
 
G
Q
 
S
N
 
A
R
 
G
K
 
Q
V
 
L
G
 
S
P
 
T
D
 
N
E
 
D
M
 
L
G
 
I
G
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
L
T
x
S
N
|
N
L
 
I
G
|
G
G
x
S
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
T
G
 
Y
F
 
A
T
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
N
 
L
P
 
P
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
G
G
 
A
I
 
L
T
x
G
R
x
T
T
x
I
E
 
K
T
 
A
V
 
L
T
 
P
V
 
R
W
 
F
D
 
N
D
 
E
D
 
K
T
 
G
P
 
E
-
 
V
R
 
C
P
 
K
V
 
A
T
 
Q
M
 
I
V
 
M
P
 
N
L
 
V
D
 
S
L
 
W
S
 
S
Y
 
A
D
 
D
H
|
H
R
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
T
A
 
V
A
 
S
R
 
R
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Y
 
L
F
 
W
A
 
K
G
 
S
L
 
Y
I
 
L
A
 
E
D
 
N
P
 
P
R
 
A
R
 
F
I
 
M
M
 
L
V
 
L

2ii4A Crystal structure of a cubic core of the dihydrolipoamide acyltransferase (e2b) component in the branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase complex (bckdc), coenzyme a-bound form (see paper)
32% identity, 76% coverage: 72:292/292 of query aligns to 11:231/234 of 2ii4A

query
sites
2ii4A
F
 
F
A
 
H
Q
 
K
V
 
A
A
 
M
A
 
V
A
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
N
 
-
A
 
L
L
 
K
I
 
I
P
 
P
Q
 
H
V
 
F
T
 
G
H
 
Y
H
 
C
D
 
D
R
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
T
A
 
E
I
 
L
E
 
V
A
 
K
L
 
L
R
|
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
I
A
 
A
Q
 
F
A
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
T
x
S
A
x
F
L
x
M
A
 
P
F
 
F
Q
 
F
A
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
S
R
 
L
A
 
G
L
 
L
R
 
L
E
 
Q
F
 
F
P
 
P
R
 
I
F
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
V
S
 
D
P
 
E
D
 
N
G
 
C
K
 
Q
T
 
N
L
 
I
T
 
T
L
 
Y
K
 
K
G
 
A
Y
 
S
V
 
H
H
 
N
I
 
I
G
 
G
I
|
I
A
|
A
V
x
M
D
|
D
T
 
T
A
 
E
H
 
Q
G
 
G
L
|
L
M
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
N
V
 
V
H
 
K
D
 
N
V
 
V
D
 
Q
R
 
I
K
 
R
G
 
S
L
 
I
W
 
F
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
T
E
 
E
I
 
L
S
 
N
D
 
R
L
 
L
A
x
Q
S
 
K
R
 
L
A
 
G
Q
 
S
N
 
A
R
 
G
K
 
Q
V
 
L
G
 
S
P
 
T
D
 
N
E
 
D
M
 
L
G
 
I
G
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
L
T
x
S
N
|
N
L
x
I
G
|
G
G
x
S
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
T
G
 
Y
F
 
A
T
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
N
 
L
P
 
P
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
G
G
 
A
I
 
L
T
x
G
R
x
T
T
x
I
E
 
K
T
 
A
V
 
L
T
 
P
V
 
R
W
 
F
D
 
N
D
 
E
D
 
K
T
 
G
P
 
E
-
 
V
R
 
C
P
 
K
V
 
A
T
 
Q
M
 
I
V
 
M
P
 
N
L
 
V
D
 
S
L
 
W
S
 
S
Y
 
A
D
 
D
H
|
H
R
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
D
G
|
G
A
|
A
D
 
T
A
 
V
A
 
S
R
 
R
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Y
 
L
F
 
W
A
 
K
G
 
S
L
 
Y
I
 
L
A
 
E
D
 
N
P
 
P
R
 
A
R
 
F
I
 
M
M
 
L
V
 
L

2ii3A Crystal structure of a cubic core of the dihydrolipoamide acyltransferase (e2b) component in the branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase complex (bckdc), oxidized coenzyme a-bound form (see paper)
32% identity, 76% coverage: 72:292/292 of query aligns to 11:231/234 of 2ii3A

query
sites
2ii3A
F
 
F
A
 
H
Q
 
K
V
 
A
A
 
M
A
 
V
A
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
N
 
-
A
 
L
L
 
K
I
 
I
P
 
P
Q
 
H
V
 
F
T
 
G
H
 
Y
H
 
C
D
 
D
R
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
T
A
 
E
I
 
L
E
 
V
A
 
K
L
 
L
R
|
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
I
A
 
A
Q
 
F
A
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
T
x
S
A
x
F
L
x
M
A
 
P
F
 
F
Q
 
F
A
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
S
R
 
L
A
 
G
L
 
L
R
 
L
E
 
Q
F
 
F
P
 
P
R
 
I
F
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
V
S
 
D
P
 
E
D
 
N
G
 
C
K
 
Q
T
 
N
L
 
I
T
 
T
L
 
Y
K
 
K
G
 
A
Y
 
S
V
 
H
H
 
N
I
 
I
G
 
G
I
|
I
A
|
A
V
x
M
D
|
D
T
 
T
A
 
E
H
 
Q
G
 
G
L
 
L
M
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
N
V
 
V
H
 
K
D
 
N
V
 
V
D
 
Q
R
 
I
K
 
R
G
 
S
L
 
I
W
 
F
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
T
E
 
E
I
 
L
S
 
N
D
 
R
L
 
L
A
x
Q
S
 
K
R
 
L
A
 
G
Q
 
S
N
 
A
R
 
G
K
 
Q
V
 
L
G
 
S
P
 
T
D
 
N
E
 
D
M
 
L
G
 
I
G
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
L
T
x
S
N
|
N
L
x
I
G
|
G
G
x
S
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
T
G
 
Y
F
 
A
T
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
N
 
L
P
 
P
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
G
G
 
A
I
 
L
T
x
G
R
x
T
T
x
I
E
 
K
T
 
A
V
 
L
T
 
P
V
 
R
W
 
F
D
 
N
D
 
E
D
 
K
T
 
G
P
 
E
-
 
V
R
 
C
P
 
K
V
 
A
T
 
Q
M
 
I
V
 
M
P
 
N
L
 
V
D
 
S
L
 
W
S
 
S
Y
 
A
D
 
D
H
|
H
R
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
T
A
 
V
A
 
S
R
 
R
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Y
 
L
F
 
W
A
 
K
G
 
S
L
 
Y
I
 
L
A
 
E
D
 
N
P
 
P
R
 
A
R
 
F
I
 
M
M
 
L
V
 
L

P11181 Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial; Branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex component E2; BCKAD-E2; BCKADE2; Dihydrolipoamide acetyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex; Dihydrolipoamide branched chain transacylase; Dihydrolipoyllysine-residue (2-methylpropanoyl)transferase; EC 2.3.1.168 from Bos taurus (Bovine) (see paper)
32% identity, 76% coverage: 72:292/292 of query aligns to 259:479/482 of P11181

query
sites
P11181
F
 
F
A
 
H
Q
 
K
V
 
A
A
 
M
A
 
V
A
 
K
N
 
T
L
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
N
 
-
A
 
L
L
 
K
I
 
I
P
 
P
Q
 
H
V
 
F
T
 
G
H
 
Y
H
 
C
D
 
D
R
 
E
A
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
T
A
 
E
I
 
L
E
 
V
A
 
K
L
 
L
R
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
I
A
 
A
Q
 
F
A
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
I
K
 
K
L
 
L
T
 
S
A
 
F
L
 
M
A
 
P
F
 
F
Q
 
F
A
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
S
R
 
L
A
 
G
L
 
L
R
 
L
E
 
Q
F
 
F
P
 
P
R
 
I
F
 
L
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
V
S
 
D
P
 
E
D
 
N
G
 
C
K
 
Q
T
 
N
L
 
I
T
 
T
L
 
Y
K
 
K
G
 
A
Y
 
S
V
 
H
H
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
M
D
 
D
T
 
T
A
 
E
H
 
Q
G
 
G
L
 
L
M
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
N
V
 
V
H
 
K
D
 
N
V
 
V
D
 
Q
R
 
I
K
 
R
G
 
S
L
 
I
W
 
F
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
T
E
 
E
I
 
L
S
 
N
D
 
R
L
 
L
A
 
Q
S
 
K
R
 
L
A
 
G
Q
 
S
N
 
A
R
 
G
K
 
Q
V
 
L
G
 
S
P
 
T
D
 
N
E
 
D
M
 
L
G
 
I
G
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
L
T
 
S
N
 
N
L
 
I
G
 
G
G
 
S
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
T
G
 
Y
F
 
A
T
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
N
 
L
P
 
P
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
G
G
 
A
I
 
L
T
 
G
R
 
T
T
 
I
E
 
K
T
 
A
V
 
L
T
 
P
V
 
R
W
 
F
D
 
N
D
 
E
D
 
K
T
 
G
P
 
E
-
 
V
R
 
C
P
 
K
V
 
A
T
 
Q
M
 
I
V
 
M
P
 
N
L
 
V
D
 
S
L
 
W
S
 
S
Y
 
A
D
 
D
H
 
H
R
 
R
V
 
I
I
 
I
N
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
T
A
 
V
A
 
S
R
 
R
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Y
 
L
F
 
W
A
 
K
G
 
S
L
 
Y
I
 
L
A
 
E
D
 
N
P
 
P
R
 
A
R
 
F
I
 
M
M
 
L
V
 
L

Sites not aligning to the query:

P0AFG6 Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex; 2-oxoglutarate dehydrogenase complex component E2; OGDC-E2; Dihydrolipoamide succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex; EC 2.3.1.61 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
32% identity, 77% coverage: 69:292/292 of query aligns to 181:403/405 of P0AFG6

query
sites
P0AFG6
M
 
M
S
 
T
R
 
R
F
 
L
A
 
R
Q
 
K
V
 
R
A
 
V
A
 
A
A
 
E
N
 
R
L
 
L
S
 
L
A
 
E
A
 
A
N
 
K
A
 
N
L
 
S
I
 
T
P
 
A
Q
 
M
V
 
L
T
 
T
H
 
T
H
 
F
D
 
N
R
 
E
A
 
V
D
 
N
V
 
M
T
 
K
A
 
P
I
 
I
E
 
M
A
 
D
L
 
L
R
 
R
K
 
K
E
 
Q
L
 
Y
K
 
G
P
 
E
E
 
A
A
 
F
Q
 
E
A
 
K
R
 
R
-
 
H
G
 
G
V
 
I
K
 
R
L
 
L
T
 
G
A
 
F
L
 
M
A
 
S
F
 
F
Q
 
Y
A
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
R
F
 
Y
P
 
P
R
 
E
F
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
S
L
 
I
S
 
-
P
 
-
D
 
D
G
 
G
K
 
D
T
 
D
L
 
V
T
 
V
L
 
Y
K
 
H
G
 
N
Y
 
Y
V
 
F
H
 
D
I
 
V
G
 
S
I
 
M
A
 
A
V
 
V
D
 
S
T
 
T
A
 
P
H
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
V
V
 
T
P
 
P
V
 
V
V
 
L
H
 
R
D
 
D
V
 
V
D
 
D
R
 
T
K
 
L
G
 
G
L
 
M
W
 
A
Q
 
D
I
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
K
I
 
I
S
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
V
R
 
K
A
 
G
Q
 
R
N
 
D
R
 
G
K
 
K
V
 
L
G
 
T
P
 
V
D
 
E
E
 
D
M
 
L
G
 
T
G
 
G
A
 
G
S
 
N
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
 
T
N
 
N
L
 
G
G
 
G
G
 
V
I
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
L
G
 
M
F
 
S
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
N
P
 
P
P
 
P
E
 
Q
V
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
M
T
 
H
R
 
A
T
 
I
E
 
K
T
 
D
V
 
R
T
 
P
V
 
M
W
 
A
D
 
V
D
 
N
D
 
G
T
 
Q
P
 
V
R
 
E
P
 
I
V
 
L
T
 
P
M
 
M
V
 
M
P
 
Y
L
 
L
D
 
A
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
H
 
H
R
 
R
V
 
L
I
 
I
N
 
D
G
 
G
A
 
R
D
 
E
A
 
S
A
 
V
R
 
G
F
 
F
V
 
L
S
 
V
Y
 
T
F
 
I
A
 
K
G
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
T
R
 
R
I
 
L
M
 
L
V
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9N0F1 Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial; 2-oxoglutarate dehydrogenase complex component E2; OGDC-E2; Dihydrolipoamide succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex; E2K; E2o; PE2o; EC 2.3.1.61 from Sus scrofa (Pig) (see paper)
33% identity, 77% coverage: 67:292/292 of query aligns to 227:453/455 of Q9N0F1

query
sites
Q9N0F1
E
 
E
L
 
K
M
 
M
S
 
N
R
 
R
F
 
M
A
 
R
Q
 
Q
V
 
R
A
 
I
A
 
A
A
 
Q
N
 
R
L
 
L
S
 
K
A
 
E
A
 
A
N
 
Q
A
 
N
L
 
T
I
 
C
P
 
A
Q
 
M
V
 
L
T
 
T
H
 
T
H
 
F
D
 
N
R
 
E
A
 
I
D
 
D
V
 
M
T
 
S
A
 
N
I
 
I
E
 
Q
A
 
D
L
 
M
R
 
R
K
 
A
E
 
R
L
 
H
K
 
K
P
 
-
E
 
E
A
 
A
-
 
F
-
 
L
Q
 
K
A
 
K
R
 
H
G
 
N
V
 
L
K
 
K
L
 
L
T
 
G
A
 
F
L
 
M
A
 
S
F
 
A
Q
 
F
A
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
S
A
 
A
R
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
F
 
Q
P
 
P
R
 
V
F
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
V
L
 
I
S
 
D
P
 
D
D
 
T
G
 
T
K
 
K
T
 
E
L
 
V
T
 
V
L
 
Y
K
 
R
G
 
D
Y
 
Y
V
 
I
H
 
D
I
 
I
G
 
S
I
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
A
T
 
T
A
 
P
H
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
R
D
 
N
V
 
V
D
 
E
R
 
T
K
 
M
G
 
N
L
 
Y
W
 
A
Q
 
D
I
 
I
A
 
E
A
 
R
E
 
T
I
 
I
S
 
S
D
 
E
L
 
L
A
 
G
S
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
R
N
 
K
R
 
N
K
 
E
V
 
L
G
 
A
P
 
I
D
 
E
E
 
D
M
 
M
G
 
D
G
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
x
S
N
 
N
L
 
G
G
 
G
G
 
V
I
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
L
G
 
F
F
 
G
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
N
P
 
P
P
 
P
E
 
Q
V
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
M
T
 
H
R
 
A
T
 
I
-
 
V
-
 
D
E
 
R
T
 
P
V
 
V
T
 
A
V
 
V
W
 
G
D
 
G
D
 
K
D
 
V
T
 
E
P
 
I
R
 
R
P
 
P
V
 
-
T
 
-
M
 
M
V
 
M
P
 
Y
L
 
V
D
 
A
L
 
L
S
 
T
Y
 
Y
D
 
D
H
|
H
R
 
R
V
 
L
I
 
I
N
x
D
G
 
G
A
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
T
F
 
F
V
 
L
S
 
R
Y
 
K
F
 
I
A
 
K
G
 
A
L
 
A
I
 
V
A
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
R
R
 
V
I
x
L
M
x
L
V
x
L

P36957 Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial; 2-oxoglutarate dehydrogenase complex component E2; OGDC-E2; Dihydrolipoamide succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex; E2K; EC 2.3.1.61 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
32% identity, 77% coverage: 67:292/292 of query aligns to 225:451/453 of P36957

query
sites
P36957
E
|
E
L
x
K
M
 
M
S
 
N
R
 
R
F
 
M
A
x
R
Q
 
Q
V
 
R
A
 
I
A
 
A
A
 
Q
N
 
R
L
 
L
S
 
K
A
 
E
A
 
A
N
 
Q
A
 
N
L
 
T
I
 
C
P
 
A
Q
 
M
V
 
L
T
 
T
H
 
T
H
 
F
D
 
N
R
 
E
A
 
I
D
 
D
V
 
M
T
 
S
A
 
N
I
 
I
E
 
Q
A
 
E
L
 
M
R
 
R
K
 
A
E
 
R
L
 
H
K
 
K
P
 
-
E
 
E
A
 
A
-
 
F
-
 
L
Q
 
K
A
 
K
R
 
H
G
 
N
V
 
L
K
 
K
L
 
L
T
 
G
A
 
F
L
 
M
A
 
S
F
 
A
Q
 
F
A
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
S
A
 
A
R
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
F
 
Q
P
 
P
R
 
V
F
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
V
L
 
I
S
 
D
P
x
D
D
 
T
G
 
T
K
 
K
T
 
E
L
 
V
T
 
V
L
 
Y
K
 
R
G
 
D
Y
 
Y
V
 
I
H
 
D
I
 
I
G
 
S
I
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
A
T
 
T
A
 
P
H
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
R
D
 
N
V
 
V
D
 
E
R
 
A
K
 
M
G
 
N
L
 
F
W
 
A
Q
 
D
I
 
I
A
 
E
A
 
R
E
 
T
I
 
I
S
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
G
S
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
R
N
 
K
R
 
N
K
 
E
V
 
L
G
 
A
P
 
I
D
 
E
E
 
D
M
 
M
G
 
D
G
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
 
S
N
 
N
L
x
G
G
 
G
G
 
V
I
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
L
G
 
F
F
 
G
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
N
P
 
P
P
 
P
E
 
Q
V
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
M
-
 
H
-
 
G
T
 
I
R
 
F
T
 
D
E
 
R
T
 
P
V
 
V
T
 
A
V
 
I
W
 
G
D
 
G
D
 
K
D
 
V
T
 
E
P
 
V
R
 
R
P
 
P
V
 
-
T
 
-
M
 
M
V
 
M
P
 
Y
L
 
V
D
 
A
L
 
L
S
 
T
Y
|
Y
D
 
D
H
|
H
R
 
R
V
 
L
I
 
I
N
 
D
G
 
G
A
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
T
F
 
F
V
 
L
S
 
R
Y
 
K
F
 
I
A
 
K
G
 
A
L
 
A
I
 
V
A
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
R
R
 
V
I
 
L
M
 
L
V
 
L

Sites not aligning to the query:

P11179 Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial; 2-oxoglutarate dehydrogenase complex component E2; OGDC-E2; Dihydrolipoamide succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex; E2K; EC 2.3.1.61 from Bos taurus (Bovine) (see paper)
32% identity, 77% coverage: 67:292/292 of query aligns to 227:453/455 of P11179

query
sites
P11179
E
 
E
L
 
K
M
 
M
S
 
N
R
 
R
F
 
M
A
 
R
Q
 
Q
V
 
R
A
 
I
A
 
A
A
 
Q
N
 
R
L
 
L
S
 
K
A
 
E
A
 
A
N
 
Q
A
 
N
L
 
T
I
 
C
P
 
A
Q
 
M
V
 
L
T
 
T
H
 
T
H
 
F
D
 
N
R
 
E
A
 
I
D
 
D
V
 
M
T
 
S
A
 
N
I
 
I
E
 
Q
A
 
E
L
 
M
R
 
R
K
 
A
E
 
R
L
 
H
K
 
K
P
 
D
E
 
A
-
 
F
A
 
L
Q
 
K
A
 
K
R
 
H
G
 
N
V
 
L
K
 
K
L
 
L
T
 
G
A
 
F
L
 
M
A
 
S
F
 
A
Q
 
F
A
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
S
A
 
A
R
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
F
 
Q
P
 
P
R
 
V
F
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
V
L
 
I
S
 
D
P
 
D
D
 
A
G
 
T
K
 
K
T
 
E
L
 
V
T
 
V
L
 
Y
K
 
R
G
 
D
Y
 
Y
V
 
I
H
 
D
I
 
I
G
 
S
I
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
A
T
 
T
A
 
P
H
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
R
D
 
N
V
 
V
D
 
E
R
 
T
K
 
M
G
 
N
L
 
Y
W
 
A
Q
 
D
I
 
I
A
 
E
A
 
R
E
 
T
I
 
I
S
 
S
D
 
E
L
 
L
A
 
G
S
 
E
R
 
K
A
 
A
Q
 
R
N
 
K
R
 
N
K
 
E
V
 
L
G
 
A
P
 
I
D
 
E
E
 
D
M
 
M
G
 
D
G
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
F
T
 
T
I
 
I
T
 
S
N
 
N
L
 
G
G
 
G
G
 
V
I
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
L
G
 
F
F
 
G
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
I
N
 
N
P
 
P
P
 
P
E
 
Q
V
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
M
T
 
H
R
 
A
T
 
I
-
 
V
-
 
D
E
 
R
T
 
P
V
 
V
T
 
V
V
 
I
W
 
G
D
 
G
D
 
K
D
 
V
T
 
E
P
 
V
R
 
R
P
 
P
V
 
-
T
 
-
M
 
M
V
 
M
P
 
Y
L
 
V
D
 
A
L
 
L
S
 
T
Y
 
Y
D
 
D
H
 
H
R
 
R
V
 
L
I
 
I
N
 
D
G
 
G
A
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
T
F
 
F
V
 
L
S
 
R
Y
 
K
F
 
I
A
 
K
G
 
A
L
 
A
I
 
V
A
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
R
R
 
V
I
 
L
M
 
L
V
 
L

Sites not aligning to the query:

O00330 Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial; Dihydrolipoamide dehydrogenase-binding protein of pyruvate dehydrogenase complex; E3-binding protein; E3BP; Lipoyl-containing pyruvate dehydrogenase complex component X; proX from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
28% identity, 78% coverage: 62:290/292 of query aligns to 273:500/501 of O00330

query
sites
O00330
G
 
G
S
 
T
V
 
F
G
 
T
E
 
E
E
 
I
L
 
P
M
 
A
S
 
S
R
 
N
F
 
I
A
 
R
Q
 
R
V
 
V
A
 
I
A
 
A
A
 
K
N
 
R
L
 
L
S
 
T
A
 
E
A
 
S
N
 
K
A
 
S
L
 
T
I
 
V
P
 
P
Q
 
H
V
 
A
T
 
Y
H
 
A
H
 
T
D
 
A
R
 
D
A
 
C
D
 
D
V
 
L
T
 
G
A
 
A
I
 
V
E
 
L
A
 
K
L
 
V
R
 
R
K
 
Q
E
 
D
L
 
L
K
 
V
P
 
K
E
 
D
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
D
V
 
I
K
 
K
L
 
V
T
 
S
A
 
V
L
 
N
A
 
D
F
 
F
Q
 
I
A
 
I
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
R
 
V
A
 
T
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
F
 
M
P
 
P
R
 
D
F
 
V
N
 
N
A
 
V
S
 
S
L
 
W
S
 
-
P
 
-
D
 
D
G
 
G
K
 
E
T
 
G
L
 
P
T
 
K
L
 
Q
K
 
L
G
 
P
Y
 
F
V
 
I
H
 
D
I
 
I
G
 
S
I
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
A
T
 
T
A
x
D
H
 
K
G
 
G
L
 
L
M
 
L
V
 
T
P
 
P
V
 
I
V
 
I
H
 
K
D
 
D
V
 
A
D
 
A
R
 
A
K
 
K
G
 
G
L
 
I
W
 
Q
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
D
E
 
S
I
 
V
S
 
K
D
 
A
L
 
L
A
 
S
S
 
K
R
 
K
A
 
A
Q
 
R
N
 
D
R
 
G
K
 
K
V
 
L
G
 
L
P
 
P
D
 
E
E
 
E
M
 
Y
G
 
Q
G
 
G
A
 
G
S
 
S
M
 
F
T
 
S
I
 
I
T
 
S
N
 
N
L