SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2295 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2295 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
45% identity, 89% coverage: 6:311/344 of query aligns to 2:306/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
K
 
K
L
 
I
S
 
K
C
 
I
R
 
E
N
 
H
I
 
L
W
 
T
K
 
K
L
 
I
Y
x
F
G
 
G
A
 
K
N
 
R
A
 
I
E
 
K
A
 
T
F
 
A
L
 
L
N
 
T
A
 
M
-
 
V
-
 
E
N
 
K
P
 
G
T
 
E
P
 
P
S
 
K
G
 
N
E
 
E
D
 
I
I
 
L
R
 
K
K
 
K
A
 
T
G
 
G
I
 
A
I
x
T
G
x
V
A
x
G
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
A
 
T
R
 
N
I
 
F
D
 
E
I
 
I
A
 
N
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
F
I
 
V
I
 
I
M
 
M
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
C
 
L
L
 
L
S
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
L
 
F
F
 
I
D
 
D
G
 
N
V
 
Q
D
 
D
L
 
V
L
 
A
T
 
T
A
 
L
S
 
N
E
 
K
Q
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
L
E
 
Q
I
 
V
R
 
R
R
 
R
H
 
K
K
 
T
M
 
M
G
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
F
A
 
G
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
L
Q
 
E
N
 
N
V
 
T
M
 
E
F
 
Y
P
 
G
L
 
L
T
 
E
V
 
V
Q
 
Q
A
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
K
S
 
E
E
 
E
A
 
R
E
 
R
V
 
K
K
 
R
A
 
A
R
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
L
E
 
D
L
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
D
R
 
F
E
 
K
D
 
D
Y
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
N
E
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
I
W
 
L
F
 
L
L
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
R
E
 
E
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
F
 
L
L
 
L
R
 
E
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
K
L
 
F
H
 
Q
K
 
K
T
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
F
 
L
E
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
R
L
 
I
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
H
 
K
I
 
I
I
 
M
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
T
 
T
P
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
L
L
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
A
 
K
E
 
T
F
 
F
T
 
V
R
 
E
H
 
D
I
 
T
P
 
A
R
 
E
S
 
N
K
 
I
V
 
M
L
 
I
T
 
P
V
 
A
G
 
-
G
 
-
I
 
-
M
x
L
A
 
T
S
 
T
G
 
N
T
 
I
D
 
D
G
 
V
E
 
D
G
 
G
T
 
P
P
 
S
V
 
V
P
 
A
Q
 
L
T
 
K
A
 
K
R
 
M
V
 
K
S
 
T
D
 
E
V
 
E
A
 
V
E
x
S
Q
x
S
I
 
L
I
 
M
A
 
A
A
 
V
D
 
D
A
 
K
P
 
K
R
 
R

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
45% identity, 89% coverage: 6:311/344 of query aligns to 2:306/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
K
 
K
L
 
I
S
 
K
C
 
I
R
 
E
N
 
H
I
 
L
W
 
T
K
 
K
L
 
I
Y
 
F
G
 
G
A
 
K
N
 
R
A
 
I
E
 
K
A
 
T
F
 
A
L
 
L
N
 
T
A
 
M
-
 
V
-
 
E
N
 
K
P
 
G
T
 
E
P
 
P
S
 
K
G
 
N
E
 
E
D
 
I
I
 
L
R
 
K
K
 
K
A
 
T
G
 
G
I
 
A
I
 
T
G
 
V
A
 
G
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
A
 
T
R
 
N
I
 
F
D
 
E
I
 
I
A
 
N
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
F
I
 
V
I
 
I
M
 
M
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
C
 
L
L
 
L
S
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
L
 
F
F
 
I
D
 
D
G
 
N
V
 
Q
D
 
D
L
 
V
L
 
A
T
 
T
A
 
L
S
 
N
E
 
K
Q
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
L
E
 
Q
I
 
V
R
 
R
R
 
R
H
 
K
K
 
T
M
 
M
G
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
F
A
 
G
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
L
Q
 
E
N
 
N
V
 
T
M
 
E
F
 
Y
P
 
G
L
 
L
T
 
E
V
 
V
Q
 
Q
A
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
K
S
 
E
E
 
E
A
 
R
E
 
R
V
 
K
K
 
R
A
 
A
R
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
L
E
 
D
L
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
D
R
 
F
E
 
K
D
 
D
Y
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
N
E
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
I
W
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
R
E
 
E
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
F
 
L
L
 
L
R
 
E
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
K
L
 
F
H
 
Q
K
 
K
T
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
F
 
L
E
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
R
L
 
I
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
H
 
K
I
 
I
I
 
M
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
T
 
T
P
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
L
L
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
A
 
K
E
 
T
F
 
F
T
 
V
R
 
E
H
 
D
I
 
T
P
 
A
R
 
E
S
 
N
K
 
I
V
 
M
L
 
I
T
 
P
V
 
A
G
 
-
G
 
-
I
 
-
M
x
L
A
 
T
S
 
T
G
 
N
T
 
I
D
 
D
G
 
V
E
 
D
G
 
G
T
 
P
P
 
S
V
 
V
P
 
A
Q
 
L
T
 
K
A
 
K
R
 
M
V
 
K
S
 
T
D
 
E
V
 
E
A
 
V
E
x
S
Q
x
S
I
 
L
I
 
M
A
 
A
A
 
V
D
 
D
A
 
K
P
 
K
R
 
R

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
50% identity, 74% coverage: 6:261/344 of query aligns to 2:259/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
K
 
K
L
 
I
S
 
K
C
 
I
R
 
E
N
 
H
I
 
L
W
 
T
K
 
K
L
 
I
Y
x
F
G
 
G
A
 
K
N
 
R
A
 
I
E
 
K
A
 
T
F
 
A
L
 
L
N
 
T
A
 
M
-
 
V
-
 
E
N
 
K
P
 
G
T
 
E
P
 
P
S
 
K
G
 
N
E
 
E
D
 
I
I
 
L
R
 
K
K
 
K
A
 
T
G
 
G
I
 
A
I
x
T
G
 
V
A
 
G
V
 
V
R
 
Y
D
 
D
A
 
T
R
 
N
I
 
F
D
 
E
I
 
I
A
 
N
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
F
I
 
V
I
 
I
M
 
M
G
 
G
L
 
L
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
C
 
L
L
 
L
S
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
L
 
F
F
 
I
D
 
D
G
 
N
V
 
Q
D
 
D
L
 
V
L
 
A
T
 
T
A
 
L
S
 
N
E
 
K
Q
 
E
E
 
D
L
 
L
I
 
L
E
 
Q
I
 
V
R
 
R
R
 
R
H
 
K
K
 
T
M
 
M
G
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
N
F
 
F
A
 
G
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
L
Q
 
E
N
 
N
V
 
T
M
 
E
F
 
Y
P
 
G
L
 
L
T
 
E
V
 
V
Q
 
Q
A
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
K
S
 
E
E
 
E
A
 
R
E
 
R
V
 
K
K
 
R
A
 
A
R
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
L
E
 
D
L
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
D
R
 
F
E
 
K
D
 
D
Y
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
R
x
K
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
x
M
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
N
E
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
I
W
 
L
F
 
L
L
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
R
E
 
E
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
E
 
E
F
 
L
L
 
L
R
 
E
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
K
L
 
F
H
 
Q
K
 
K
T
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
S
H
|
H
D
 
D
F
 
L
E
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
R
L
 
I
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
H
 
K
I
 
I
I
 
M
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
T
 
T
P
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
L
L
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
N
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V

2d62A Crystal structure of multiple sugar binding transport atp-binding protein
40% identity, 67% coverage: 36:264/344 of query aligns to 14:242/375 of 2d62A

query
sites
2d62A
R
 
K
K
 
R
A
 
F
G
 
G
I
 
D
I
 
V
G
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
K
D
 
D
A
 
L
R
 
S
I
 
L
D
 
E
I
 
I
A
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
L
I
 
V
I
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
P
S
 
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
V
 
L
R
 
R
C
 
M
L
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
R
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
L
 
Y
F
 
I
D
 
E
G
 
-
V
 
-
D
 
D
L
 
N
L
 
L
T
 
V
A
 
A
S
 
D
E
 
P
Q
 
E
E
 
K
-
 
G
-
 
V
L
 
F
I
 
V
E
 
P
I
 
P
R
 
K
R
 
E
H
 
R
K
 
D
M
 
V
G
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
Q
 
D
N
 
N
V
 
I
M
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
K
V
 
L
Q
 
R
A
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
K
S
 
Q
E
 
E
A
 
I
E
 
D
V
 
K
K
 
R
A
 
V
R
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
A
E
 
E
L
 
M
V
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
T
G
 
E
R
 
L
E
 
L
D
 
N
Y
 
R
Y
 
K
P
 
P
R
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
G
R
 
R
S
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
R
E
 
R
P
 
P
D
 
K
L
 
V
W
 
F
F
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
I
 
L
R
 
R
R
 
V
E
 
K
M
 
M
Q
 
R
D
 
A
E
 
E
F
 
L
L
 
K
R
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
R
R
 
Q
L
 
L
H
 
G
K
 
V
T
 
T
I
 
T
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
F
 
Q
E
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
L
 
M
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
V
M
 
M
K
 
N
D
 
K
G
 
G
H
 
E
I
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
A
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
L
 
V
V
 
Y
L
 
Y
N
 
K
P
 
P
A
 
V
T
 
N
D
 
T
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
G
F
 
F

1g291 Malk (see paper)
40% identity, 67% coverage: 39:269/344 of query aligns to 14:244/372 of 1g291

query
sites
1g291
G
 
G
I
 
E
I
 
V
G
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
M
R
 
S
I
 
L
D
 
E
I
 
V
A
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
M
I
 
I
I
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
V
 
L
R
 
R
C
 
M
L
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
E
P
 
P
T
 
S
G
 
R
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
L
 
Y
F
 
I
D
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
D
L
 
K
L
 
L
T
 
V
A
 
A
S
x
D
E
 
P
Q
x
E
E
x
K
L
 
G
I
 
I
E
 
F
I
 
V
-
 
P
-
 
P
R
x
K
R
x
D
H
 
R
K
 
D
M
 
I
G
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
Q
 
D
N
 
N
V
 
I
M
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
K
V
 
L
Q
 
R
A
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
R
S
 
Q
E
 
E
A
 
I
E
 
D
V
 
Q
K
 
R
A
 
V
R
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
T
G
 
E
R
 
L
E
 
L
D
 
N
Y
 
R
Y
 
K
P
 
P
R
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
G
R
 
R
S
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
R
E
 
K
P
 
P
D
 
Q
L
 
V
W
 
F
F
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
I
 
L
R
 
R
R
 
V
E
 
R
M
 
M
Q
 
R
D
 
A
E
 
E
F
 
L
L
 
K
R
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
R
R
 
Q
L
 
L
H
 
G
K
 
V
T
 
T
I
 
T
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
F
 
Q
E
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
L
 
M
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
V
M
 
M
K
 
N
D
 
R
G
 
G
H
 
V
I
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
A
 
G
T
 
S
P
 
P
E
 
D
E
 
E
L
 
V
V
 
Y
L
 
D
N
 
K
P
 
P
A
 
A
T
 
N
D
 
T
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
G
F
 
F
T
 
I
R
 
G
H
 
S
I
 
P
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
37% identity, 78% coverage: 41:307/344 of query aligns to 18:299/343 of P30750

query
sites
P30750
I
 
I
G
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
N
D
 
N
A
 
V
R
 
S
I
 
L
D
 
H
I
 
V
A
 
P
E
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
Y
I
 
G
I
 
V
M
 
I
G
 
G
L
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
I
R
 
R
C
 
C
L
 
V
S
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
T
G
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
F
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
L
 
L
L
 
T
T
 
T
A
 
L
S
 
S
E
 
E
Q
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
T
E
 
K
I
 
A
R
 
R
R
 
R
H
 
-
K
 
Q
M
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
A
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
E
V
 
L
Q
 
D
A
 
N
V
 
T
P
 
P
K
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
K
V
 
R
K
 
R
A
 
V
R
 
T
E
 
E
V
 
L
V
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
G
 
D
R
 
K
E
 
H
D
 
D
Y
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
S
E
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
V
W
 
L
F
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
I
 
T
R
 
T
R
 
R
E
 
S
M
 
I
Q
 
L
D
 
E
E
 
L
F
 
L
L
 
K
R
 
D
L
 
I
Q
 
N
A
 
R
R
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
L
F
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
E
F
 
M
E
 
D
E
 
V
A
 
V
V
 
K
R
 
R
L
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
I
 
V
A
 
A
I
 
V
M
 
I
K
 
S
D
 
N
G
 
G
H
 
E
I
 
L
I
 
I
Q
 
E
I
 
Q
A
 
D
T
 
T
P
 
V
E
 
S
E
 
E
L
 
V
V
 
F
L
 
S
N
 
H
P
 
P
A
 
K
T
 
T
D
 
P
Y
 
L
V
 
A
A
 
Q
E
 
K
F
 
F
-
 
I
-
 
Q
-
 
S
T
 
T
R
 
L
H
 
H
I
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
Y
-
 
Q
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
-
 
E
P
 
P
R
 
F
S
 
T
K
 
D
V
 
C
L
 
V
T
 
P
V
 
M
G
 
L
G
 
R
I
 
L
M
 
E
A
 
F
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
D
 
S
G
x
V
E
x
D
G
x
A
T
x
P
P
x
L
V
x
L
P
 
S
Q
 
E
T
 
T
A
 
A
R
 
R
V
 
R
S
 
F
D
 
N
V
 
V
A
 
N
E
 
N
Q
x
N
I
|
I
I
 
I
A
 
S
A
 
A

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
41% identity, 65% coverage: 41:264/344 of query aligns to 19:241/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
I
 
I
G
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
N
D
 
N
A
 
V
R
 
S
I
 
L
D
 
H
I
 
V
A
 
P
E
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
Y
I
 
G
I
 
V
M
 
I
G
 
G
L
 
A
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
I
R
 
R
C
 
C
L
 
V
S
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
T
G
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
F
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
L
 
L
L
 
T
T
 
T
A
 
L
S
 
S
E
 
E
Q
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
T
E
 
K
I
 
A
R
 
R
R
 
R
H
 
-
K
 
Q
M
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
A
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
E
V
 
L
Q
 
D
A
 
N
V
 
T
P
 
P
K
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
K
V
 
R
K
 
R
A
 
V
R
 
T
E
 
E
V
 
L
V
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
G
 
D
R
 
K
E
 
H
D
 
D
Y
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
S
E
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
V
W
 
L
F
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
I
 
T
R
 
T
R
 
R
E
 
S
M
 
I
Q
 
L
D
 
E
E
 
L
F
 
L
L
 
K
R
 
D
L
 
I
Q
 
N
A
 
R
R
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
L
F
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
E
F
 
M
E
 
D
E
 
V
A
 
V
V
 
K
R
 
R
L
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
I
 
V
A
 
A
I
 
V
M
 
I
K
 
S
D
 
N
G
 
G
H
 
E
I
 
L
I
 
I
Q
 
E
I
 
Q
A
 
D
T
 
T
P
 
V
E
 
S
E
 
E
L
 
V
V
 
F
L
 
S
N
 
H
P
 
P
A
 
K
T
 
T
D
 
P
Y
 
L
V
 
A
A
 
Q
E
 
K
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
41% identity, 65% coverage: 41:264/344 of query aligns to 19:241/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
I
 
I
G
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
N
D
 
N
A
 
V
R
 
S
I
 
L
D
 
H
I
 
V
A
 
P
E
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
Y
I
 
G
I
 
V
M
 
I
G
 
G
L
 
A
S
 
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
I
R
 
R
C
 
C
L
 
V
S
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
T
G
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
F
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
L
 
L
L
 
T
T
 
T
A
 
L
S
 
S
E
 
E
Q
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
T
E
 
K
I
 
A
R
 
R
R
 
R
H
 
-
K
 
Q
M
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
A
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
E
V
 
L
Q
 
D
A
 
N
V
 
T
P
 
P
K
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
K
V
 
R
K
 
R
A
 
V
R
 
T
E
 
E
V
 
L
V
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
G
 
D
R
 
K
E
 
H
D
 
D
Y
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
S
E
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
V
W
 
L
F
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
I
 
T
R
 
T
R
 
R
E
 
S
M
 
I
Q
 
L
D
 
E
E
 
L
F
 
L
L
 
K
R
 
D
L
 
I
Q
 
N
A
 
R
R
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
L
F
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
E
F
 
M
E
 
D
E
 
V
A
 
V
V
 
K
R
 
R
L
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
I
 
V
A
 
A
I
 
V
M
 
I
K
 
S
D
 
N
G
 
G
H
 
E
I
 
L
I
 
I
Q
 
E
I
 
Q
A
 
D
T
 
T
P
 
V
E
 
S
E
 
E
L
 
V
V
 
F
L
 
S
N
 
H
P
 
P
A
 
K
T
 
T
D
 
P
Y
 
L
V
 
A
A
 
Q
E
 
K
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
41% identity, 65% coverage: 41:264/344 of query aligns to 19:241/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
I
|
I
G
 
Q
A
 
A
V
 
L
R
 
N
D
 
N
A
 
V
R
 
S
I
 
L
D
 
H
I
 
V
A
 
P
E
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
Y
I
 
G
I
 
V
M
 
I
G
 
G
L
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
I
R
 
R
C
 
C
L
 
V
S
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
E
 
R
P
 
P
T
 
T
G
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
F
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
L
 
L
L
 
T
T
 
T
A
 
L
S
 
S
E
 
E
Q
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
T
E
 
K
I
 
A
R
 
R
R
 
R
H
 
-
K
 
Q
M
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
A
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
Q
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
E
V
 
L
Q
 
D
A
 
N
V
 
T
P
 
P
K
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
K
V
 
R
K
 
R
A
 
V
R
 
T
E
 
E
V
 
L
V
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
G
 
D
R
 
K
E
 
H
D
 
D
Y
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
S
E
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
S
E
 
N
P
 
P
D
 
K
L
 
V
W
 
L
F
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
I
 
T
R
 
T
R
 
R
E
 
S
M
 
I
Q
 
L
D
 
E
E
 
L
F
 
L
L
 
K
R
 
D
L
 
I
Q
 
N
A
 
R
R
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
L
F
 
L
I
 
I
T
 
T
H
|
H
D
 
E
F
 
M
E
 
D
E
 
V
A
 
V
V
 
K
R
 
R
L
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
I
 
V
A
 
A
I
 
V
M
 
I
K
 
S
D
 
N
G
 
G
H
 
E
I
 
L
I
 
I
Q
 
E
I
 
Q
A
 
D
T
 
T
P
 
V
E
 
S
E
 
E
L
 
V
V
 
F
L
 
S
N
 
H
P
 
P
A
 
K
T
 
T
D
 
P
Y
 
L
V
 
A
A
 
Q
E
 
K
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
41% identity, 68% coverage: 36:268/344 of query aligns to 9:239/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
R
 
K
K
 
N
A
x
F
G
 
G
I
 
S
I
 
L
G
 
E
A
x
V
V
 
L
R
 
K
D
 
G
A
 
V
R
 
T
I
 
L
D
 
K
I
 
V
A
 
N
E
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
V
F
 
V
I
 
V
I
 
I
M
 
I
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
I
S
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
K
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
F
F
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
K
L
 
I
L
 
N
T
 
N
A
 
G
S
 
K
E
 
V
Q
 
N
E
 
-
L
 
-
I
 
I
E
 
N
I
 
K
R
 
V
R
 
R
H
 
Q
K
 
K
M
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
A
 
N
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
I
Q
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
T
F
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
V
T
 
K
V
 
V
Q
 
K
A
 
K
V
 
M
P
 
N
K
 
K
S
 
K
E
 
E
A
 
A
E
 
E
V
 
E
K
 
L
A
 
A
R
 
V
E
 
D
V
 
L
V
 
L
E
 
A
L
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
L
G
 
D
R
 
K
E
 
K
D
 
D
Y
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
R
 
I
E
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
M
E
 
Q
P
 
P
D
 
E
L
 
V
W
 
M
F
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
E
M
 
M
Q
 
V
D
 
K
E
 
E
F
 
V
L
 
L
R
 
N
L
 
V
Q
 
M
A
 
K
R
 
Q
L
 
L
H
 
A
K
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
F
 
V
I
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
E
F
 
M
E
 
G
E
 
F
A
 
A
V
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
I
I
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
D
G
 
G
H
 
V
I
 
I
I
 
V
Q
 
E
I
 
E
A
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
F
L
 
Y
N
 
R
P
 
A
A
 
K
T
 
N
D
 
E
Y
 
R
V
 
T
A
 
R
E
 
E
F
 
F
T
 
L
R
 
S
H
 
K
I
 
I

8hprC Lpqy-sugabc in state 4 (see paper)
40% identity, 69% coverage: 29:264/344 of query aligns to 9:233/363 of 8hprC

query
sites
8hprC
T
 
T
P
 
K
S
 
S
G
x
Y
E
 
P
D
 
D
I
 
V
R
 
R
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
-
I
 
-
G
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
K
D
 
E
A
 
F
R
 
S
I
 
M
D
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
I
I
 
I
I
 
L
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
T
V
 
L
R
 
N
C
 
M
L
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
E
P
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
L
 
R
F
 
I
D
 
G
G
 
G
V
 
E
D
 
R
L
 
V
L
 
N
T
 
E
A
 
K
S
 
A
E
 
P
Q
 
K
E
 
D
L
 
-
I
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
R
K
 
D
M
 
I
G
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
R
Q
 
Q
N
 
N
V
 
I
M
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
L
Q
 
A
A
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
K
S
 
A
E
 
E
A
 
I
E
 
A
V
 
A
K
 
K
A
 
V
R
 
E
E
 
E
V
 
T
V
 
A
E
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
S
G
 
E
R
 
L
E
 
L
D
 
D
Y
 
R
Y
 
K
P
 
P
R
 
G
E
x
Q
L
 
L
S
 
S
G
|
G
G
|
G
Q
|
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
M
A
 
G
R
 
R
S
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
R
E
 
S
P
 
P
D
 
K
L
 
A
W
 
F
F
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
I
 
L
R
 
R
R
 
V
E
 
Q
M
 
M
Q
 
R
D
 
A
E
 
E
F
 
I
L
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
A
 
D
R
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
T
T
 
T
I
 
T
V
 
V
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
F
 
Q
E
 
T
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
L
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
V
I
 
V
M
 
M
K
 
L
D
 
A
G
 
G
H
 
E
I
 
V
I
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
Y
L
 
S
N
 
S
P
 
P
A
 
A
T
 
N
D
 
L
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
G
F
 
F

8hplC Lpqy-sugabc in state 1 (see paper)
41% identity, 65% coverage: 42:264/344 of query aligns to 15:231/384 of 8hplC

query
sites
8hplC
G
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
K
D
 
E
A
 
F
R
 
S
I
 
M
D
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
I
I
 
I
I
 
L
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
 
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
T
V
 
L
R
 
N
C
 
M
L
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
E
P
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
L
 
R
F
 
I
D
 
G
G
 
G
V
 
E
D
 
R
L
 
V
L
 
N
T
 
E
A
 
K
S
 
A
E
 
P
Q
 
K
E
 
D
L
 
-
I
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
R
K
 
D
M
 
I
G
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
R
Q
 
Q
N
 
N
V
 
I
M
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
L
Q
 
A
A
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
K
S
 
A
E
 
E
A
 
I
E
 
A
V
 
A
K
 
K
A
 
V
R
 
E
E
 
E
V
 
T
V
 
A
E
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
S
G
 
E
R
 
L
E
 
L
D
 
D
Y
 
R
Y
 
K
P
 
P
R
 
G
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
M
A
 
G
R
 
R
S
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
R
E
 
S
P
 
P
D
 
K
L
 
A
W
 
F
F
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
I
 
L
R
 
R
R
 
V
E
 
Q
M
 
M
Q
 
R
D
 
A
E
 
E
F
 
I
L
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
A
 
D
R
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
T
T
 
T
I
 
T
V
 
V
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
F
 
Q
E
 
T
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
L
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
V
I
 
V
M
 
M
K
 
L
D
 
A
G
 
G
H
 
E
I
 
V
I
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
Y
L
 
S
N
 
S
P
 
P
A
 
A
T
 
N
D
 
L
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

8hprD Lpqy-sugabc in state 4 (see paper)
40% identity, 69% coverage: 29:264/344 of query aligns to 9:233/362 of 8hprD

query
sites
8hprD
T
 
T
P
 
K
S
 
S
G
x
Y
E
 
P
D
 
D
I
 
V
R
 
R
K
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
-
I
 
-
G
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
K
D
 
E
A
 
F
R
 
S
I
 
M
D
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
I
I
 
I
I
 
L
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
 
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
T
V
 
L
R
 
N
C
 
M
L
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
E
P
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
L
 
R
F
 
I
D
 
G
G
 
G
V
 
E
D
 
R
L
 
V
L
 
N
T
 
E
A
 
K
S
 
A
E
 
P
Q
 
K
E
 
D
L
 
-
I
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
R
K
 
D
M
 
I
G
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
S
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
R
Q
 
Q
N
 
N
V
 
I
M
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
L
Q
 
A
A
 
K
V
 
V
P
 
P
K
 
K
S
 
A
E
 
E
A
 
I
E
 
A
V
 
A
K
 
K
A
 
V
R
 
E
E
 
E
V
 
T
V
 
A
E
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
K
 
S
G
 
E
R
 
L
E
 
L
D
 
D
Y
x
R
Y
 
K
P
 
P
R
 
G
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
M
A
 
G
R
 
R
S
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
R
E
 
S
P
 
P
D
 
K
L
 
A
W
 
F
F
 
L
L
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
I
 
L
R
 
R
R
 
V
E
 
Q
M
 
M
Q
 
R
D
 
A
E
 
E
F
 
I
L
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
A
 
D
R
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
T
T
 
T
I
 
T
V
 
V
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
F
 
Q
E
 
T
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
L
 
L
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
V
I
 
V
M
 
M
K
 
L
D
 
A
G
 
G
H
 
E
I
 
V
I
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
Y
L
 
S
N
 
S
P
 
P
A
 
A
T
 
N
D
 
L
Y
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
G
F
 
F

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
40% identity, 67% coverage: 37:268/344 of query aligns to 14:244/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
K
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
K
I
 
V
G
 
V
A
 
A
V
 
L
R
 
D
D
 
N
A
 
V
R
 
N
I
 
I
D
 
N
I
 
I
A
 
E
E
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
F
 
F
I
 
G
I
 
I
M
 
L
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
V
 
M
R
 
R
C
 
I
L
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
D
E
 
V
P
 
P
T
 
S
G
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
L
 
Y
F
 
F
D
 
D
G
 
-
V
 
-
D
 
D
L
 
R
L
 
L
T
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
N
Q
 
G
E
 
K
L
 
L
I
 
I
-
 
V
E
 
P
I
 
P
R
 
E
R
 
D
H
 
R
K
 
K
M
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
T
F
 
W
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
Q
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
N
Q
 
M
A
 
K
V
 
M
P
 
S
K
 
K
S
 
E
E
 
E
A
 
I
E
 
R
V
 
K
K
 
R
A
 
V
R
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
A
E
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
I
K
 
H
G
 
H
R
 
V
E
 
L
D
 
N
Y
 
H
Y
 
F
P
 
P
R
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
K
E
 
D
P
 
P
D
 
S
L
 
L
W
 
L
F
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
F
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
D
E
 
S
M
 
A
Q
 
R
D
 
A
E
 
L
F
 
V
L
 
K
R
 
E
L
 
V
Q
 
Q
A
 
S
R
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
V
I
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
F
 
P
E
 
A
E
 
D
A
 
I
V
 
F
R
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
G
I
 
V
M
 
L
K
 
V
D
 
K
G
 
G
H
 
K
I
 
L
I
 
V
Q
 
Q
I
 
V
A
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
Y
L
 
D
N
 
N
P
 
P
A
 
V
T
 
S
D
 
I
Y
 
Q
V
 
V
A
 
A
E
 
S
F
 
L
T
 
I
R
 
G
H
 
E
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
40% identity, 67% coverage: 37:268/344 of query aligns to 14:244/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
K
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
K
I
 
V
G
 
V
A
 
A
V
 
L
R
 
D
D
 
N
A
 
V
R
 
N
I
 
I
D
 
N
I
 
I
A
 
E
E
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
F
 
F
I
 
G
I
 
I
M
 
L
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
V
 
M
R
 
R
C
 
I
L
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
D
E
 
V
P
 
P
T
 
S
G
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
L
 
Y
F
 
F
D
 
D
G
 
-
V
 
-
D
 
D
L
 
R
L
 
L
T
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
N
Q
 
G
E
 
K
L
 
L
I
 
I
-
 
V
E
 
P
I
 
P
R
 
E
R
 
D
H
 
R
K
 
K
M
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
F
 
W
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
Q
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
N
Q
 
M
A
 
K
V
 
M
P
 
S
K
 
K
S
 
E
E
 
E
A
 
I
E
 
R
V
 
K
K
 
R
A
 
V
R
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
A
E
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
I
K
 
H
G
 
H
R
 
V
E
 
L
D
 
N
Y
 
H
Y
 
F
P
 
P
R
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
K
E
 
D
P
 
P
D
 
S
L
 
L
W
 
L
F
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
F
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
D
E
 
S
M
 
A
Q
 
R
D
 
A
E
 
L
F
 
V
L
 
K
R
 
E
L
 
V
Q
 
Q
A
 
S
R
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
V
I
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
F
 
P
E
 
A
E
 
D
A
 
I
V
 
F
R
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
G
I
 
V
M
 
L
K
 
V
D
 
K
G
 
G
H
 
K
I
 
L
I
 
V
Q
 
Q
I
 
V
A
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
Y
L
 
D
N
 
N
P
 
P
A
 
V
T
 
S
D
 
I
Y
 
Q
V
 
V
A
 
A
E
 
S
F
 
L
T
 
I
R
 
G
H
 
E
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
40% identity, 67% coverage: 37:268/344 of query aligns to 14:244/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
K
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
K
I
 
V
G
 
V
A
|
A
V
 
L
R
 
D
D
 
N
A
 
V
R
 
N
I
 
I
D
 
N
I
 
I
A
 
E
E
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
F
 
F
I
 
G
I
 
I
M
 
L
G
 
G
L
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
V
 
M
R
 
R
C
 
I
L
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
D
E
 
V
P
 
P
T
 
S
G
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
L
 
Y
F
 
F
D
 
D
G
 
-
V
 
-
D
 
D
L
 
R
L
 
L
T
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
N
Q
 
G
E
 
K
L
 
L
I
 
I
-
 
V
E
 
P
I
 
P
R
 
E
R
 
D
H
 
R
K
 
K
M
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
F
 
W
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
Q
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
N
Q
 
M
A
 
K
V
 
M
P
 
S
K
 
K
S
 
E
E
 
E
A
 
I
E
 
R
V
 
K
K
 
R
A
 
V
R
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
A
E
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
I
K
 
H
G
 
H
R
 
V
E
 
L
D
 
N
Y
 
H
Y
 
F
P
 
P
R
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
K
E
 
D
P
 
P
D
 
S
L
 
L
W
 
L
F
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
D
E
 
S
M
 
A
Q
 
R
D
 
A
E
 
L
F
 
V
L
 
K
R
 
E
L
 
V
Q
 
Q
A
 
S
R
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
V
I
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
F
 
P
E
 
A
E
 
D
A
 
I
V
 
F
R
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
G
I
 
V
M
 
L
K
 
V
D
 
K
G
 
G
H
 
K
I
 
L
I
 
V
Q
 
Q
I
 
V
A
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
Y
L
 
D
N
 
N
P
 
P
A
 
V
T
 
S
D
 
I
Y
 
Q
V
 
V
A
 
A
E
 
S
F
 
L
T
 
I
R
 
G
H
 
E
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
40% identity, 67% coverage: 37:268/344 of query aligns to 14:244/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
K
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
K
I
 
V
G
 
V
A
 
A
V
 
L
R
 
D
D
 
N
A
 
V
R
 
N
I
 
I
D
 
N
I
 
I
A
 
E
E
 
N
G
 
G
E
 
E
I
 
R
F
 
F
I
 
G
I
 
I
M
 
L
G
 
G
L
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
F
V
 
M
R
 
R
C
 
I
L
 
I
S
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
D
E
 
V
P
 
P
T
 
S
G
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
L
 
Y
F
 
F
D
 
D
G
 
-
V
 
-
D
 
D
L
 
R
L
 
L
T
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
N
Q
 
G
E
 
K
L
 
L
I
 
I
-
 
V
E
 
P
I
 
P
R
 
E
R
 
D
H
 
R
K
 
K
M
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
F
 
W
A
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
F
Q
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
N
Q
 
M
A
 
K
V
 
M
P
 
S
K
 
K
S
 
E
E
 
E
A
 
I
E
 
R
V
 
K
K
 
R
A
 
V
R
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
A
E
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
I
K
 
H
G
 
H
R
 
V
E
 
L
D
 
N
Y
 
H
Y
 
F
P
 
P
R
 
R
E
 
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
K
E
 
D
P
 
P
D
 
S
L
 
L
W
 
L
F
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
F
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
D
E
 
S
M
 
A
Q
 
R
D
 
A
E
 
L
F
 
V
L
 
K
R
 
E
L
 
V
Q
 
Q
A
 
S
R
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
V
T
 
T
I
 
L
V
 
L
F
 
V
I
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
F
 
P
E
 
A
E
 
D
A
 
I
V
 
F
R
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
G
I
 
V
M
 
L
K
 
V
D
 
K
G
 
G
H
 
K
I
 
L
I
 
V
Q
 
Q
I
 
V
A
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
Y
L
 
D
N
 
N
P
 
P
A
 
V
T
 
S
D
 
I
Y
 
Q
V
 
V
A
 
A
E
 
S
F
 
L
T
 
I
R
 
G
H
 
E
I
 
I

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
40% identity, 68% coverage: 36:268/344 of query aligns to 11:241/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
R
 
K
K
 
S
A
x
F
G
 
G
I
 
S
I
 
L
G
 
E
A
x
V
V
 
L
R
 
K
D
 
G
A
 
I
R
 
N
I
 
V
D
 
H
I
 
I
A
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
F
 
V
I
 
V
I
 
V
M
 
I
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
V
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
S
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
D
G
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
-
T
 
K
A
 
A
S
 
K
E
 
D
Q
 
T
E
 
N
L
 
L
I
 
N
E
 
K
I
 
V
R
 
R
R
 
E
H
 
-
K
 
E
M
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
A
 
N
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
F
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
T
 
K
V
 
V
Q
 
R
A
 
K
V
 
W
P
 
P
K
 
R
S
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
A
K
 
K
A
 
A
R
 
M
E
 
E
V
 
L
V
 
L
E
 
D
L
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
D
R
 
K
E
 
A
D
 
H
Y
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
M
E
 
E
P
 
P
D
 
K
L
 
I
W
 
M
F
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
E
M
 
M
Q
 
V
D
 
G
E
 
E
F
 
V
L
 
L
R
 
S
L
 
V
Q
 
M
A
 
K
R
 
Q
L
 
L
H
 
A
K
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
F
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
F
 
M
E
 
G
E
 
F
A
 
A
V
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
L
I
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
I
 
I
Q
 
E
I
 
E
A
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
F
L
 
D
N
 
R
P
 
P
A
 
Q
T
 
H
D
 
E
Y
 
R
V
 
T
A
 
K
E
 
A
F
 
F
T
 
L
R
 
S
H
 
K
I
 
V

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
40% identity, 68% coverage: 36:268/344 of query aligns to 11:241/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
R
 
K
K
 
S
A
x
F
G
 
G
I
 
S
I
 
L
G
 
E
A
x
V
V
 
L
R
 
K
D
 
G
A
 
I
R
 
N
I
 
V
D
 
H
I
 
I
A
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
F
 
V
I
 
V
I
 
V
M
 
I
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
V
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
S
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
D
G
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
-
T
 
K
A
 
A
S
 
K
E
 
D
Q
 
T
E
 
N
L
 
L
I
 
N
E
 
K
I
 
V
R
 
R
R
 
E
H
 
-
K
 
E
M
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
A
 
N
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
F
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
T
 
K
V
 
V
Q
 
R
A
 
K
V
 
W
P
 
P
K
 
R
S
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
A
K
 
K
A
 
A
R
 
M
E
 
E
V
 
L
V
 
L
E
 
D
L
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
D
R
 
K
E
 
A
D
 
H
Y
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
M
E
 
E
P
 
P
D
 
K
L
 
I
W
 
M
F
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
E
M
 
M
Q
 
V
D
 
G
E
 
E
F
 
V
L
 
L
R
 
S
L
 
V
Q
 
M
A
 
K
R
 
Q
L
 
L
H
 
A
K
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
F
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
F
 
M
E
 
G
E
 
F
A
 
A
V
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
L
I
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
I
 
I
Q
 
E
I
 
E
A
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
F
L
 
D
N
 
R
P
 
P
A
 
Q
T
 
H
D
 
E
Y
 
R
V
 
T
A
 
K
E
 
A
F
 
F
T
 
L
R
 
S
H
 
K
I
 
V

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
40% identity, 68% coverage: 36:268/344 of query aligns to 11:241/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
R
 
K
K
 
S
A
x
F
G
 
G
I
 
S
I
 
L
G
 
E
A
x
V
V
 
L
R
 
K
D
 
G
A
 
I
R
 
N
I
 
V
D
 
H
I
 
I
A
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
F
 
V
I
 
V
I
 
V
M
 
I
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
V
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
S
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
E
 
D
P
 
F
T
 
D
G
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
-
T
 
K
A
 
A
S
 
K
E
 
D
Q
 
T
E
 
N
L
 
L
I
 
N
E
 
K
I
 
V
R
 
R
R
 
E
H
 
-
K
 
E
M
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
A
 
N
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
N
N
 
N
V
 
I
M
 
T
F
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
T
 
K
V
 
V
Q
 
R
A
 
K
V
 
W
P
 
P
K
 
R
S
 
E
E
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
A
K
 
K
A
 
A
R
 
M
E
 
E
V
 
L
V
 
L
E
 
D
L
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
G
 
D
R
 
K
E
 
A
D
 
H
Y
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
V
 
A
T
 
M
E
 
E
P
 
P
D
 
K
L
 
I
W
 
M
F
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
E
M
 
M
Q
 
V
D
 
G
E
 
E
F
 
V
L
 
L
R
 
S
L
 
V
Q
 
M
A
 
K
R
 
Q
L
 
L
H
 
A
K
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
F
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
F
 
M
E
 
G
E
 
F
A
 
A
V
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
L
I
 
F
M
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
I
 
I
Q
 
E
I
 
E
A
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
F
L
 
D
N
 
R
P
 
P
A
 
Q
T
 
H
D
 
E
Y
 
R
V
 
T
A
 
K
E
 
A
F
 
F
T
 
L
R
 
S
H
 
K
I
 
V

Query Sequence

>GFF2295 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2295
MTPKTKLSCRNIWKLYGANAEAFLNANPTPSGEDIRKAGIIGAVRDARIDIAEGEIFIIM
GLSGSGKSTLVRCLSRLIEPTGGQVLFDGVDLLTASEQELIEIRRHKMGMVFQHFALLPH
LTVLQNVMFPLTVQAVPKSEAEVKAREVVELVGLKGREDYYPRELSGGQQQRVGIARSLV
TEPDLWFLDEPFSALDPLIRREMQDEFLRLQARLHKTIVFITHDFEEAVRLADRIAIMKD
GHIIQIATPEELVLNPATDYVAEFTRHIPRSKVLTVGGIMASGTDGEGTPVPQTARVSDV
AEQIIAADAPRPVCDDSGRIIGSINRQAVARVLFGAGETSGGIE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory