SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2426 FitnessBrowser__WCS417:GFF2426 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7mh7A Crystal structure of NAD kinase from pseudomonas aeruginosa pao1
88% identity, 98% coverage: 2:291/296 of query aligns to 1:290/290 of 7mh7A

query
sites
7mh7A
E
 
E
Q
 
P
F
 
F
R
 
R
N
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
I
R
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
K
K
 
K
F
 
F
L
 
L
L
 
I
E
 
D
R
 
R
H
 
H
L
 
L
H
 
H
V
 
V
I
 
I
L
 
L
E
 
E
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
H
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
S
 
C
S
 
S
R
 
R
K
 
K
M
 
I
L
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
I
C
 
C
D
 
D
M
 
L
V
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
S
L
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
H
N
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
N
 
N
R
|
R
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
 
L
T
 
T
D
 
D
I
 
I
R
 
R
P
 
P
D
 
D
D
 
E
L
 
L
E
 
E
V
 
A
E
 
K
V
 
V
A
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
V
 
V
E
 
E
N
 
S
R
 
R
F
 
F
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
R
 
R
R
 
R
H
 
G
G
 
I
E
 
D
A
 
S
I
 
M
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
|
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
 
P
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
R
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
F
 
F
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
V
 
V
C
 
C
S
 
S
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
A
 
A
L
 
L
S
|
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
K
 
K
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
V
P
 
P
M
 
M
Y
 
Y
P
 
P
H
 
H
M
 
M
L
 
L
S
 
S
S
 
S
R
 
R
P
 
P
I
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
S
 
S
E
 
E
L
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
K
 
P
D
 
N
M
 
M
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
S
 
S
C
 
C
D
|
D
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
H
 
H
F
 
F
T
 
T
C
 
C
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
I
S
 
S
K
 
K
K
 
K
A
 
P
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
I
H
 
H
P
 
P
L
 
I
D
 
D
H
 
H
N
 
N
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
E
V
 
I
C
 
C
R
 
R
T
 
T
K
|
K
L
 
L
G
 
G
W
 
W
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
L

P0A7B3 NAD kinase; ATP-dependent NAD kinase; EC 2.7.1.23 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
46% identity, 98% coverage: 3:291/296 of query aligns to 4:291/292 of P0A7B3

query
sites
P0A7B3
Q
 
H
F
 
F
R
 
K
N
 
C
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
H
L
 
P
G
 
R
S
 
H
T
 
P
Q
 
T
V
 
A
L
 
L
D
 
T
T
 
T
V
 
H
R
 
E
R
 
M
L
 
L
K
 
Y
K
 
R
F
 
W
L
 
L
L
 
C
E
 
T
R
 
K
H
 
G
L
 
Y
H
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
V
E
 
E
D
 
Q
T
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
H
I
 
E
L
 
L
P
 
Q
G
 
L
H
 
K
G
 
N
L
 
V
Q
 
K
T
 
T
S
 
G
S
 
T
R
 
L
K
 
A
M
 
E
L
 
I
G
 
G
E
 
Q
V
 
L
C
 
A
D
 
D
M
 
L
V
 
A
I
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
N
L
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Y
N
 
D
V
 
I
P
 
K
V
 
V
L
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
N
R
 
R
G
 
G
S
 
N
L
 
L
G
 
G
F
 
F
L
 
L
T
 
T
D
 
D
I
 
L
R
 
D
P
 
P
D
 
D
D
 
N
L
 
A
E
 
Q
V
 
Q
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
E
G
 
G
H
 
H
Y
 
Y
L
 
I
V
 
S
E
 
E
N
 
K
R
 
R
F
 
F
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
R
 
C
R
 
Q
H
 
Q
G
 
D
E
 
C
A
 
Q
I
 
K
G
 
R
Q
 
I
G
 
S
D
 
T
A
 
A
L
 
I
N
 
N
D
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
H
 
H
P
 
P
G
 
G
K
 
K
S
 
V
T
 
A
R
 
H
M
 
M
I
 
I
E
 
E
F
 
F
E
 
E
L
 
V
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
E
Q
 
I
F
 
F
V
 
A
C
 
F
S
 
S
Q
 
Q
K
x
R
A
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
I
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
I
M
 
L
H
 
T
P
 
P
K
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
T
I
 
L
V
 
V
P
 
P
M
 
M
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
M
 
T
L
 
L
S
 
S
S
 
A
R
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
V
V
 
I
D
 
N
G
 
S
N
 
S
S
 
S
E
 
T
L
 
I
K
 
R
I
 
L
V
 
R
V
 
F
S
 
S
-
 
H
-
 
R
-
 
R
K
 
N
D
 
D
M
 
L
Q
 
E
I
 
I
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
-
S
 
S
C
 
C
D
 
D
G
 
S
Q
 
Q
N
 
I
H
 
A
F
 
L
T
 
P
C
 
I
A
 
Q
P
 
E
G
 
G
D
 
E
T
 
D
I
 
V
T
 
L
V
 
I
S
 
R
K
 
R
K
 
C
A
 
D
Q
 
Y
K
 
H
L
 
L
R
 
N
L
 
L
I
 
I
H
 
H
P
 
P
L
 
K
D
 
D
H
 
Y
N
 
S
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
N
V
 
T
C
 
L
R
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
G
W
 
W
G
 
S
S
 
K
R
 
K
L
 
L

P9WHV7 NAD kinase; ATP-dependent NAD kinase; Poly(P)-dependent NAD kinase; PPNK; EC 2.7.1.23 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 3 papers)
32% identity, 89% coverage: 1:262/296 of query aligns to 1:274/307 of P9WHV7

query
sites
P9WHV7
M
|
M
E
 
T
Q
 
A
F
 
H
R
 
R
N
 
S
I
 
V
G
 
L
I
 
L
I
 
V
G
 
V
R
 
H
L
 
T
G
 
G
S
 
R
T
 
D
Q
 
E
V
 
A
L
 
T
D
 
E
T
 
T
V
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
V
K
 
E
K
 
K
F
 
V
L
 
L
L
 
G
E
 
D
R
 
N
H
 
K
L
 
I
H
 
A
V
 
L
-
 
R
I
 
V
L
 
L
E
 
S
D
 
A
T
 
E
I
 
A
A
 
V
E
 
D
I
 
R
L
 
G
P
 
S
G
 
L
H
 
H
G
 
L
L
 
A
Q
 
P
T
 
D
S
 
D
S
 
M
R
 
R
K
 
A
M
 
M
L
 
G
G
 
V
E
 
E
V
 
I
-
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
H
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
G
C
 
C
D
 
E
M
 
L
V
 
V
I
 
L
V
 
V
V
 
L
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
S
 
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
L
L
 
A
A
 
R
R
 
N
H
 
A
N
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
V
N
 
N
R
 
L
G
 
G
S
 
R
L
 
I
G
 
G
F
 
F
L
 
L
T
 
A
D
 
E
I
 
A
R
 
E
P
 
A
D
 
E
D
 
A
L
 
I
E
 
D
V
 
A
E
 
V
V
 
L
A
 
E
K
 
H
V
 
V
L
 
V
D
 
A
G
 
Q
H
 
D
Y
 
Y
L
 
R
V
 
V
E
 
E
N
 
D
R
 
R
F
 
L
L
 
T
L
 
L
Q
 
D
A
 
V
E
 
V
V
 
V
R
 
R
R
 
Q
H
 
G
G
 
G
E
 
R
A
 
I
I
 
V
G
 
N
Q
 
R
G
 
G
D
 
W
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
V
 
V
V
 
S
L
 
L
H
 
E
P
 
K
G
 
G
K
 
P
S
 
R
T
 
L
R
 
G
M
 
V
I
 
L
E
 
G
F
 
V
E
 
V
L
 
V
Y
 
E
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
F
 
P
V
 
V
C
 
S
S
 
A
Q
 
F
K
 
G
A
 
C
D
 
D
G
|
G
L
 
V
I
x
L
V
 
V
A
 
S
T
|
T
P
|
P
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
A
|
A
L
x
F
S
|
S
A
 
A
G
|
G
G
|
G
P
 
P
I
 
V
M
 
L
H
 
W
P
 
P
K
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
L
I
 
V
V
 
V
P
 
P
M
 
N
Y
 
N
P
 
A
H
 
H
M
 
A
L
 
L
S
 
F
S
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
M
V
 
V
V
 
T
D
 
S
G
 
P
N
 
E
S
 
A
E
 
T
L
 
I
K
 
A
I
 
I
V
 
E
V
 
I
S
 
E
K
 
A
D
 
D
M
 
G
Q
 
H
I
 
-
Y
 
D
P
 
A
Q
 
L
V
 
V
S
 
F
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
N
 
R
H
 
E
F
 
M
T
 
L
C
 
I
A
 
P
P
 
A
G
 
G
D
 
S
T
 
R
I
 
L
T
 
E
V
 
V
S
 
T
K
 
R

1y3iA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis NAD kinase-NAD complex (see paper)
36% identity, 67% coverage: 70:268/296 of query aligns to 12:209/231 of 1y3iA

query
sites
1y3iA
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
L
L
 
A
A
 
R
R
 
N
H
 
A
N
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
V
N
 
N
R
 
L
G
 
G
S
x
R
L
 
I
G
 
G
F
|
F
L
|
L
T
 
A
D
 
E
I
 
A
R
 
E
P
 
A
D
 
E
D
 
A
L
 
I
E
 
D
V
 
A
E
 
V
V
 
L
A
 
E
K
 
H
V
 
V
L
 
V
D
 
A
G
 
Q
H
 
D
Y
 
Y
L
 
R
V
 
V
E
 
E
N
 
D
R
 
R
F
 
L
L
 
T
L
 
L
Q
 
D
A
 
V
E
 
V
V
 
V
R
 
R
R
 
Q
H
 
G
G
 
G
E
 
R
A
 
I
I
 
V
G
 
N
Q
 
R
G
 
G
D
 
W
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
V
 
V
V
 
S
L
 
L
H
 
E
P
 
K
G
 
G
K
 
P
S
 
R
T
 
L
R
 
G
M
 
V
I
 
L
E
 
G
F
 
V
E
 
V
L
 
V
Y
 
E
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
F
 
P
V
 
V
C
 
S
S
 
A
Q
 
F
K
 
G
A
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
V
I
 
L
V
 
V
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
A
 
A
L
 
F
S
|
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
V
M
 
L
H
 
W
P
 
P
K
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
L
I
 
V
V
 
V
P
 
P
M
 
N
Y
 
N
P
 
A
H
 
H
M
 
A
L
 
L
S
 
F
S
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
M
V
 
V
V
 
T
D
 
S
G
 
P
N
 
E
S
 
A
E
 
T
L
 
I
K
 
A
I
 
I
V
 
E
V
 
I
S
 
E
K
 
A
D
 
D
M
 
G
Q
 
H
I
 
-
Y
 
D
P
 
A
Q
 
L
V
 
V
S
 
F
C
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
R
N
 
R
H
 
E
F
 
M
T
 
L
C
 
I
A
 
P
P
 
A
G
 
G
D
 
S
T
 
R
I
 
L
T
 
E
V
 
V
S
 
T
K
 
R
K
 
C
A
 
V
Q
 
T
K
 
S
L
 
V
R
 
K

O13863 Uncharacterized kinase C1B1.02c; EC 2.7.1.- from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
30% identity, 90% coverage: 28:292/296 of query aligns to 235:516/537 of O13863

query
sites
O13863
F
 
F
L
 
T
L
 
P
E
 
K
R
 
N
H
 
Q
L
 
F
H
 
V
V
 
I
I
 
Y
L
 
L
E
 
E
D
 
D
T
 
T
I
 
L
A
 
A
-
 
S
-
 
L
E
 
D
I
 
V
L
 
V
P
 
E
G
 
S
H
 
L
G
 
S
L
 
P
Q
 
K
T
 
K
S
 
N
S
 
V
R
 
R
K
 
F
M
 
W
L
 
T
G
 
S
E
 
E
V
 
L
C
 
C
-
 
T
-
 
Q
-
 
C
-
 
P
-
 
N
-
 
L
-
 
F
D
 
D
M
 
C
V
 
V
I
 
I
V
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
D
D
 
D
G
 
S
S
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
R
A
 
A
A
 
S
R
 
W
A
 
L
L
 
F
A
 
Q
R
 
D
H
 
V
N
 
V
V
 
P
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
S
I
 
F
N
 
S
R
 
T
G
 
A
S
 
K
L
 
A
G
 
G
F
 
F
L
 
L
T
 
S
D
 
-
I
 
I
R
 
L
P
 
P
D
 
I
D
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
A
E
 
E
V
 
Y
A
 
T
K
 
K
V
 
T
L
 
L
D
 
D
-
 
L
-
 
I
-
 
F
-
 
H
G
 
R
H
 
G
Y
 
F
L
 
T
V
 
V
E
 
N
N
 
L
R
 
R
F
 
M
L
 
R
L
 
F
Q
 
Q
A
 
C
E
 
S
V
 
I
R
 
M
R
 
R
H
 
Y
-
 
V
G
 
G
E
 
E
-
 
H
-
 
S
-
 
T
-
 
H
-
 
I
A
 
C
I
 
E
G
 
G
Q
 
Q
G
 
Y
D
 
S
A
 
V
L
 
L
N
 
N
D
 
E
V
 
L
V
 
L
L
 
I
H
 
D
P
 
R
G
 
G
K
 
P
S
 
N
T
 
P
R
 
F
M
 
M
I
 
I
E
 
S
F
 
L
E
 
D
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
D
 
E
G
 
N
Q
 
E
F
 
Y
V
 
I
C
 
T
S
 
T
Q
 
L
K
 
Q
A
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
V
I
 
C
V
 
V
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
L
 
V
S
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
S
I
 
L
M
 
C
H
 
H
P
 
P
K
 
G
L
 
I
D
 
P
A
 
A
I
 
I
V
 
L
I
 
I
V
 
S
P
 
A
M
 
I
Y
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
F
R
 
R
P
 
P
I
 
I
V
 
I
V
 
L
D
 
P
G
 
D
N
 
S
S
 
M
E
 
T
L
 
L
K
 
R
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
P
K
 
L
D
 
D
M
 
A
Q
 
R
I
 
S
Y
 
N
P
 
A
Q
 
W
V
 
C
S
 
A
C
 
F
D
 
D
G
 
G
Q
 
H
N
 
H
H
 
R
F
 
I
T
 
E
C
 
L
A
 
G
P
 
L
G
 
G
D
 
D
T
 
Y
I
 
I
T
 
S
V
 
I
S
 
S
K
 
A
K
 
S
A
 
S
Q
 
F
K
 
P
L
 
F
R
 
P
L
 
S
I
 
V
-
 
I
-
 
R
H
 
S
P
 
K
L
 
Y
D
 
S
H
 
K
N
 
D
Y
 
W
Y
 
F
E
 
D
V
 
I
C
 
L
R
 
R
T
 
Q
K
 
T
L
 
L
G
 
N
W
 
W
G
 
N
S
 
D
R
 
R
L
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3afoA Crystal structure of yeast nadh kinase complexed with nadh
30% identity, 81% coverage: 49:287/296 of query aligns to 97:342/360 of 3afoA

query
sites
3afoA
H
 
H
G
 
I
L
 
L
Q
 
Y
T
 
T
S
 
G
S
 
P
R
 
E
K
 
Q
M
 
D
L
 
I
G
 
V
E
 
N
V
 
R
C
 
T
D
 
D
M
 
L
V
 
L
I
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
T
L
 
I
L
|
L
G
 
H
A
 
G
A
 
V
R
 
S
A
 
M
L
 
F
A
 
G
R
 
N
H
 
T
N
 
Q
V
 
V
P
 
P
-
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
A
I
 
F
N
 
A
R
 
L
G
 
G
S
 
T
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
 
L
T
 
S
D
 
P
I
 
F
R
 
D
P
 
F
D
 
K
D
 
E
L
 
H
E
 
K
V
 
K
E
 
V
V
 
F
A
 
Q
K
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
S
G
 
S
H
 
R
Y
 
A
L
 
K
V
 
C
E
 
L
N
 
H
R
 
R
F
 
T
L
 
R
L
 
L
Q
 
E
A
 
C
E
 
H
V
 
L
R
 
K
R
 
K
H
 
K
-
 
D
G
 
S
E
 
N
A
 
S
I
 
S
G
 
I
Q
 
V
G
 
T
D
 
H
A
 
A
L
 
M
N
|
N
D
|
D
V
 
I
V
 
F
L
 
L
H
 
H
P
 
R
G
 
G
K
 
N
S
 
S
T
 
P
R
 
H
M
 
L
I
 
T
E
 
N
F
 
L
E
 
D
L
 
I
Y
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
F
 
F
V
 
L
C
 
T
S
 
R
Q
 
T
K
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
V
I
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
A
 
S
L
 
L
S
|
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
S
I
 
I
M
 
V
H
 
S
P
 
P
K
 
L
L
 
V
D
 
P
A
 
A
I
 
I
V
 
L
I
 
M
V
 
T
P
 
P
M
 
I
Y
 
C
P
 
P
H
 
R
M
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
F
R
 
R
P
 
P
I
 
L
V
 
I
V
 
L
D
 
P
G
 
H
N
 
S
S
 
S
E
 
H
L
 
I
K
 
R
I
 
I
V
 
K
V
 
I
S
 
G
K
 
S
D
 
K
M
 
L
Q
 
N
I
 
Q
Y
 
K
P
 
P
-
 
V
-
 
N
-
 
S
-
 
V
-
 
V
Q
 
K
V
 
L
S
 
S
C
 
V
D
|
D
G
|
G
Q
 
I
N
 
P
H
 
Q
F
 
Q
T
 
D
C
 
L
A
 
D
P
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
E
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
S
 
I
K
 
N
K
 
E
A
 
V
Q
 
G
K
 
T
L
 
I
R
 
Y
L
 
I
I
 
D
H
 
G
P
 
T
L
 
K
D
 
R
H
 
S
N
 
G
Y
 
I
Y
 
Y
E
 
C
V
 
V
C
 
A
R
 
K
T
 
T
K
 
E
L
 
N
G
 
D
W
 
W

1z0zA Crystal structure of a NAD kinase from archaeoglobus fulgidus in complex with NAD (see paper)
34% identity, 64% coverage: 61:248/296 of query aligns to 38:212/249 of 1z0zA

query
sites
1z0zA
E
 
E
V
 
N
C
 
F
D
 
D
M
 
F
V
 
I
I
 
V
V
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
T
L
 
I
L
 
L
G
 
R
A
 
I
A
 
L
R
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
K
R
 
R
H
 
C
N
 
P
V
 
-
P
 
P
V
 
I
L
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
R
 
T
G
 
G
S
 
R
L
 
V
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
H
I
 
A
R
 
S
P
 
P
D
 
E
D
 
N
L
 
F
E
 
E
V
 
V
E
 
E
V
 
L
A
 
K
K
 
K
V
 
A
L
 
V
D
 
E
G
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
K
F
 
F
L
x
E
L
 
V
Q
 
E
A
 
R
E
 
F
V
 
P
R
 
R
R
 
V
H
 
S
G
x
C
E
 
S
A
 
A
I
 
M
G
 
P
Q
 
D
G
 
V
D
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
V
 
I
V
 
A
L
 
V
H
 
L
P
 
S
G
 
R
K
 
K
S
 
P
T
 
A
R
 
K
M
|
M
I
 
I
E
 
D
F
 
V
E
 
A
L
 
L
Y
 
R
I
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
F
 
E
V
 
V
C
 
D
S
 
R
Q
 
I
K
x
R
A
 
C
D
|
D
G
 
G
L
 
F
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
Q
T
 
I
G
 
G
S
 
S
T
|
T
A
 
G
Y
|
Y
A
 
A
L
 
F
S
|
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
V
M
 
V
H
 
E
P
 
P
K
 
Y
L
 
L
D
 
E
A
 
C
I
 
F
V
 
I
I
 
L
V
 
I
P
 
P
M
 
I
Y
 
A
P
 
P
H
x
F
M
 
R
L
 
F
S
 
G
S
 
W
R
 
K
P
 
P
I
 
Y
V
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
M
N
 
E
S
 
R
E
 
K
L
 
I
K
 
E
I
 
V
V
 
I
V
 
A
S
 
E
K
 
K
D
 
A
M
 
I
Q
 
-
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
V
S
 
V
C
 
A
D
|
D
G
|
G
Q
 
Q
N
 
K

1z0sA Crystal structure of an NAD kinase from archaeoglobus fulgidus in complex with atp (see paper)
34% identity, 64% coverage: 61:248/296 of query aligns to 38:212/249 of 1z0sA

query
sites
1z0sA
E
 
E
V
 
N
C
 
F
D
 
D
M
 
F
V
 
I
I
 
V
V
 
S
V
 
V
G
 
G
G
|
G
D
 
D
G
|
G
S
x
T
L
 
I
L
 
L
G
x
R
A
 
I
A
 
L
R
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
K
R
 
R
H
 
C
N
 
P
V
 
-
P
 
P
V
 
I
L
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
R
 
T
G
 
G
S
x
R
L
 
V
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
H
I
 
A
R
 
S
P
 
P
D
 
E
D
 
N
L
 
F
E
 
E
V
 
V
E
 
E
V
 
L
A
 
K
K
 
K
V
 
A
L
 
V
D
 
E
G
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
K
F
 
F
L
x
E
L
 
V
Q
 
E
A
 
R
E
 
F
V
 
P
R
 
R
R
 
V
H
 
S
G
x
C
E
 
S
A
 
A
I
 
M
G
 
P
Q
 
D
G
 
V
D
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
V
 
I
V
 
A
L
 
V
H
 
L
P
 
S
G
 
R
K
 
K
S
 
P
T
x
A
R
x
K
M
|
M
I
 
I
E
 
D
F
 
V
E
 
A
L
 
L
Y
 
R
I
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
F
 
E
V
 
V
C
 
D
S
 
R
Q
 
I
K
 
R
A
 
C
D
|
D
G
 
G
L
 
F
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
Q
T
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
T
A
x
G
Y
|
Y
A
 
A
L
 
F
S
|
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
V
M
 
V
H
 
E
P
 
P
K
 
Y
L
 
L
D
 
E
A
 
C
I
 
F
V
 
I
I
 
L
V
 
I
P
 
P
M
 
I
Y
x
A
P
 
P
H
x
F
M
 
R
L
 
F
S
 
G
S
 
W
R
 
K
P
 
P
I
 
Y
V
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
M
N
 
E
S
 
R
E
 
K
L
 
I
K
 
E
I
 
V
V
 
I
V
 
A
S
 
E
K
 
K
D
 
A
M
 
I
Q
 
-
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
V
S
 
V
C
 
A
D
|
D
G
 
G
Q
 
Q
N
 
K

Sites not aligning to the query:

1suwA Crystal structure of a NAD kinase from archaeoglobus fulgidus in complex with its substrate and product: insights into the catalysis of NAD kinase (see paper)
34% identity, 64% coverage: 61:248/296 of query aligns to 38:212/249 of 1suwA

query
sites
1suwA
E
 
E
V
 
N
C
 
F
D
 
D
M
 
F
V
 
I
I
 
V
V
 
S
V
 
V
G
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
S
 
T
L
 
I
L
 
L
G
 
R
A
 
I
A
 
L
R
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
K
R
 
R
H
 
C
N
 
P
V
 
-
P
 
P
V
 
I
L
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
R
 
T
G
 
G
S
 
R
L
 
V
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
H
I
 
A
R
 
S
P
 
P
D
 
E
D
 
N
L
 
F
E
 
E
V
 
V
E
 
E
V
 
L
A
 
K
K
 
K
V
 
A
L
 
V
D
 
E
G
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
K
F
 
F
L
 
E
L
 
V
Q
 
E
A
 
R
E
 
F
V
 
P
R
 
R
R
 
V
H
 
S
G
 
C
E
 
S
A
 
A
I
 
M
G
 
P
Q
 
D
G
 
V
D
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
V
 
I
V
 
A
L
 
V
H
 
L
P
 
S
G
 
R
K
 
K
S
 
P
T
x
A
R
 
K
M
|
M
I
 
I
E
 
D
F
 
V
E
 
A
L
 
L
Y
 
R
I
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
F
 
E
V
 
V
C
 
D
S
 
R
Q
 
I
K
x
R
A
 
C
D
|
D
G
 
G
L
 
F
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
Q
T
 
I
G
 
G
S
 
S
T
|
T
A
 
G
Y
|
Y
A
 
A
L
 
F
S
|
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
V
M
 
V
H
 
E
P
 
P
K
 
Y
L
 
L
D
 
E
A
 
C
I
 
F
V
 
I
I
 
L
V
 
I
P
 
P
M
 
I
Y
 
A
P
 
P
H
x
F
M
 
R
L
 
F
S
 
G
S
 
W
R
 
K
P
 
P
I
 
Y
V
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
M
N
 
E
S
 
R
E
 
K
L
 
I
K
 
E
I
 
V
V
 
I
V
 
A
S
 
E
K
 
K
D
 
A
M
 
I
Q
 
-
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
V
S
 
V
C
 
A
D
|
D
G
|
G
Q
 
Q
N
 
K

O30297 NAD kinase; ATP-dependent NAD kinase; EC 2.7.1.23 from Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126 / VC-16) (see paper)
34% identity, 64% coverage: 61:248/296 of query aligns to 38:212/249 of O30297

query
sites
O30297
E
 
E
V
 
N
C
 
F
D
 
D
M
 
F
V
 
I
I
 
V
V
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
T
L
 
I
L
 
L
G
x
R
A
 
I
A
 
L
R
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
K
R
 
R
H
 
C
N
 
P
V
 
-
P
 
P
V
 
I
L
 
F
G
 
G
I
 
I
N
 
N
R
 
T
G
 
G
S
 
R
L
 
V
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
H
I
 
A
R
 
S
P
 
P
D
 
E
D
 
N
L
 
F
E
 
E
V
 
V
E
 
E
V
 
L
A
 
K
K
 
K
V
 
A
L
 
V
D
 
E
G
 
-
H
 
-
Y
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
K
F
 
F
L
 
E
L
 
V
Q
 
E
A
 
R
E
 
F
V
 
P
R
 
R
R
 
V
H
 
S
G
 
C
E
 
S
A
 
A
I
 
M
G
 
P
Q
 
D
G
 
V
D
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
V
 
I
V
 
A
L
 
V
H
 
L
P
 
S
G
 
R
K
 
K
S
 
P
T
 
A
R
x
K
M
 
M
I
 
I
E
 
D
F
 
V
E
 
A
L
 
L
Y
 
R
I
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
F
 
E
V
 
V
C
 
D
S
 
R
Q
 
I
K
x
R
A
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
F
I
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
Q
T
x
I
G
 
G
S
 
S
T
|
T
A
x
G
Y
|
Y
A
|
A
L
x
F
S
|
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
P
I
 
V
M
 
V
H
 
E
P
 
P
K
 
Y
L
 
L
D
 
E
A
 
C
I
 
F
V
 
I
I
 
L
V
 
I
P
 
P
M
 
I
Y
 
A
P
 
P
H
 
F
M
 
R
L
 
F
S
 
G
S
 
W
R
 
K
P
 
P
I
 
Y
V
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
M
N
 
E
S
 
R
E
 
K
L
 
I
K
 
E
I
 
V
V
 
I
V
 
A
S
 
E
K
 
K
D
 
A
M
 
I
Q
 
-
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
V
S
 
V
C
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
|
Q
N
 
K

Q9P7K3 Uncharacterized kinase C24B10.02c; EC 2.7.1.- from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
26% identity, 77% coverage: 62:290/296 of query aligns to 174:409/449 of Q9P7K3

query
sites
Q9P7K3
V
 
I
C
 
F
D
 
D
M
 
L
V
 
A
I
 
I
V
 
T
V
 
I
G
 
G
G
 
D
D
 
N
G
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
Y
A
 
T
A
 
S
R
 
W
A
 
L
L
 
F
A
 
Q
R
 
K
H
 
I
N
 
G
V
 
P
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
S
I
 
F
N
 
S
R
 
D
G
 
D
S
 
D
L
 
V
-
 
P
G
 
G
F
 
F
L
 
L
T
 
T
D
 
H
I
 
F
R
 
S
P
 
L
D
 
S
D
 
N
L
 
Y
E
 
Q
V
 
Q
E
 
H
V
 
L
A
 
Y
K
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
T
G
 
Q
H
 
N
Y
 
-
L
 
-
V
 
V
E
 
S
N
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
C
-
 
S
-
 
R
L
 
L
Q
 
Q
A
 
C
E
 
S
V
 
F
R
 
H
R
 
K
H
 
Y
G
 
D
E
 
E
A
 
K
I
 
T
G
 
K
Q
 
Q
G
 
Y
D
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
T
-
 
T
-
 
Y
A
 
S
L
 
L
N
 
D
D
 
E
V
 
I
V
 
L
L
 
I
H
 
S
P
 
R
G
 
G
K
 
E
S
 
H
T
 
P
R
 
F
M
 
I
I
 
S
E
 
N
F
 
L
E
 
N
L
 
V
Y
 
Y
I
 
N
D
 
N
G
 
S
Q
 
E
F
 
L
V
 
M
C
 
T
S
 
V
Q
 
V
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
A
 
N
Y
 
I
A
 
S
L
 
A
S
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
P
 
S
I
 
L
M
 
V
H
 
H
P
 
P
K
 
A
L
 
L
D
 
N
A
 
A
I
 
I
V
 
L
I
 
V
V
 
T
P
 
P
M
 
V
Y
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
T
L
 
L
S
 
S
S
 
F
R
 
R
P
 
P
I
 
I
V
 
I
V
 
L
D
 
P
G
 
D
N
 
Y
S
 
N
E
 
V
L
 
L
K
 
N
I
 
V
V
 
E
V
 
I
S
 
P
K
 
L
D
 
D
M
 
S
Q
 
R
I
 
S
Y
 
S
P
 
A
Q
 
F
V
 
F
S
 
S
C
 
V
D
 
D
G
 
R
Q
 
H
N
 
E
H
 
S
F
 
V
T
 
E
C
 
M
A
 
H
P
 
R
G
 
G
D
 
D
T
 
Y
I
 
L
T
 
S
V
 
I
S
 
V
K
 
T
K
 
S
A
 
H
Q
 
Y
K
 
P
L
 
F
R
 
T
L
 
T
I
 
I
H
 
Q
P
 
N
L
 
P
D
 
G
H
 
Y
N
 
Q
Y
 
W
Y
 
T
E
 
K
V
 
V
C
 
L
R
 
E
T
 
D
K
 
K
L
 
F
G
 
N
W
 
W
G
 
N
S
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5ejiA Crystal structure of NAD kinase w78f mutant from listeria monocytogenes in complex with NADP/mn++/ppi
32% identity, 50% coverage: 64:210/296 of query aligns to 37:180/260 of 5ejiA

query
sites
5ejiA
D
 
E
M
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
I
G
 
G
G
|
G
D
|
D
G
|
G
S
x
T
L
 
F
L
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
H
A
 
Q
L
 
Y
A
 
E
R
 
E
H
 
R
-
 
L
-
 
D
N
 
E
V
 
I
P
 
A
V
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
R
 
T
G
 
G
S
 
H
L
|
L
G
|
G
F
|
F
L
x
Y
T
 
A
D
 
D
I
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
A
D
 
E
L
 
A
E
 
D
V
 
K
E
 
L
V
 
V
A
 
K
K
 
L
V
 
L
L
 
A
D
 
K
G
 
G
H
 
E
Y
 
Y
L
 
Q
V
 
K
E
 
V
N
 
S
R
 
Y
F
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
T
E
 
T
V
 
V
R
 
K
R
 
-
H
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
T
G
 
Y
Q
 
L
G
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
V
 
S
V
 
T
L
 
V
H
 
K
P
 
S
G
 
S
K
 
G
S
 
G
T
 
P
R
 
F
M
 
V
I
 
V
E
 
D
F
 
-
E
 
-
L
 
V
Y
 
V
I
 
I
D
 
N
G
 
D
Q
 
I
F
 
H
V
 
F
C
 
E
S
 
R
Q
 
F
K
 
R
A
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
A
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
M
 
M
H
 
H
P
 
P
K
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
M
V
 
Q
I
 
L
V
 
T
P
 
E
M
 
M

6rc0A Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
31% identity, 50% coverage: 64:210/296 of query aligns to 37:181/261 of 6rc0A

query
sites
6rc0A
D
 
E
M
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
T
L
 
F
L
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
H
A
 
Q
L
 
Y
A
 
E
R
 
E
H
 
R
-
 
L
-
 
D
N
 
E
V
 
I
P
 
A
V
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
R
 
T
G
 
G
S
 
H
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
 
Y
T
 
A
D
 
D
I
 
W
R
 
R
P
 
P
D
 
A
D
 
E
L
 
A
E
 
D
V
 
K
E
 
L
V
 
V
A
 
K
K
 
L
V
 
L
L
 
A
D
 
K
G
 
G
H
 
E
Y
 
Y
L
 
Q
V
 
K
E
 
V
N
 
S
R
 
Y
F
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
T
E
 
T
V
 
V
R
 
K
R
 
Y
H
 
K
G
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
T
G
 
Y
Q
 
L
G
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
 
E
V
 
S
V
 
T
L
 
V
H
 
K
P
 
S
G
 
S
K
 
G
S
 
G
T
 
P
R
 
F
M
 
V
I
 
V
E
 
D
F
 
-
E
 
-
L
 
V
Y
 
V
I
 
I
D
 
N
G
 
D
Q
 
I
F
 
H
V
 
F
C
 
E
S
 
R
Q
 
F
K
 
R
A
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
 
Y
A
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
M
 
M
H
 
H
P
 
P
K
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
M
V
 
Q
I
 
L
V
 
T
P
 
E
M
 
M

6rbpA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
32% identity, 50% coverage: 64:210/296 of query aligns to 37:180/260 of 6rbpA

query
sites
6rbpA
D
 
E
M
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
S
 
T
L
 
F
L
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
H
A
 
Q
L
 
Y
A
 
E
R
 
E
H
 
R
-
 
L
-
 
D
N
 
E
V
 
I
P
 
A
V
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
R
 
T
G
 
G
S
 
H
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
T
 
A
D
 
D
I
 
W
R
 
R
P
 
P
D
 
A
D
 
E
L
 
A
E
 
D
V
 
K
E
 
L
V
 
V
A
 
K
K
 
L
V
 
L
L
 
A
D
 
K
G
 
G
H
 
E
Y
 
Y
L
 
Q
V
 
K
E
 
V
N
 
S
R
 
Y
F
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
T
E
 
T
V
 
V
R
 
K
R
 
-
H
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
T
G
 
Y
Q
 
L
G
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
 
E
V
 
S
V
 
T
L
 
V
H
 
K
P
 
S
G
 
S
K
 
G
S
 
G
T
 
P
R
 
F
M
 
V
I
 
V
E
 
D
F
 
-
E
 
-
L
 
V
Y
 
V
I
 
I
D
 
N
G
 
D
Q
 
I
F
 
H
V
 
F
C
 
E
S
 
R
Q
 
F
K
 
R
A
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
 
A
Y
 
Y
A
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
M
 
M
H
 
H
P
 
P
K
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
M
V
 
Q
I
 
L
V
 
T
P
 
E
M
 
M

6rc1A Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
32% identity, 50% coverage: 64:210/296 of query aligns to 37:180/259 of 6rc1A

query
sites
6rc1A
D
 
E
M
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
S
 
T
L
 
F
L
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
H
A
 
Q
L
 
Y
A
 
E
R
 
E
H
 
R
-
 
L
-
 
D
N
 
E
V
 
I
P
 
A
V
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
R
 
T
G
 
G
S
 
H
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
 
Y
T
 
A
D
 
D
I
 
W
R
 
R
P
 
P
D
 
A
D
 
E
L
 
A
E
 
D
V
 
K
E
 
L
V
 
V
A
 
K
K
 
L
V
 
L
L
 
A
D
 
K
G
 
G
H
 
E
Y
 
Y
L
 
Q
V
 
K
E
 
V
N
 
S
R
 
Y
F
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
T
E
 
T
V
 
V
R
 
K
R
 
-
H
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
T
G
 
Y
Q
 
L
G
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
 
E
V
 
S
V
 
T
L
 
V
H
 
K
P
 
S
G
 
S
K
 
G
S
 
G
T
 
P
R
 
F
M
 
V
I
 
V
E
 
D
F
 
-
E
 
-
L
 
V
Y
 
V
I
 
I
D
 
N
G
 
D
Q
 
I
F
 
H
V
 
F
C
 
E
S
 
R
Q
 
F
K
 
R
A
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
 
Y
A
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
M
 
M
H
 
H
P
 
P
K
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
M
V
 
Q
I
 
L
V
 
T
P
 
E
M
 
M

3v8nA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with 8-bromo-5'-amino-5'-deoxyadenosine, reacted with a citrate molecule in n site (see paper)
32% identity, 50% coverage: 64:210/296 of query aligns to 37:180/257 of 3v8nA

query
sites
3v8nA
D
 
E
M
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
T
L
 
F
L
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
H
A
 
Q
L
 
Y
A
 
E
R
 
E
H
 
R
-
 
L
-
 
D
N
 
E
V
 
I
P
 
A
V
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
R
 
T
G
 
G
S
 
H
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
T
 
A
D
 
D
I
 
W
R
 
R
P
 
P
D
 
A
D
 
E
L
 
A
E
 
D
V
 
K
E
 
L
V
 
V
A
 
K
K
 
L
V
 
L
L
 
A
D
 
K
G
 
G
H
 
E
Y
 
Y
L
 
Q
V
 
K
E
 
V
N
 
S
R
 
Y
F
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
T
E
 
T
V
 
V
R
 
K
R
 
-
H
 
Y
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
T
G
 
Y
Q
 
L
G
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
V
 
S
V
 
T
L
 
V
H
 
K
P
 
S
G
 
S
K
 
G
S
 
G
T
 
P
R
 
F
M
 
V
I
 
V
E
 
D
F
 
-
E
 
-
L
 
V
Y
 
V
I
 
I
D
 
N
G
 
D
Q
 
I
F
 
H
V
 
F
C
 
E
S
 
R
Q
 
F
K
 
R
A
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
A
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
M
 
M
H
 
H
P
 
P
K
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
M
V
 
Q
I
 
L
V
 
T
P
 
E
M
 
M

6rbzA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
30% identity, 50% coverage: 64:210/296 of query aligns to 37:182/262 of 6rbzA

query
sites
6rbzA
D
 
E
M
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
T
L
 
F
L
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
H
A
 
Q
L
 
Y
A
 
E
R
 
E
H
 
R
-
 
L
-
 
D
N
 
E
V
 
I
P
 
A
V
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
R
 
T
G
 
G
S
 
H
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
 
Y
T
 
A
D
 
D
I
 
W
R
 
R
P
 
P
D
 
A
D
 
E
L
 
A
E
 
D
V
 
K
E
 
L
V
 
V
A
 
K
K
 
L
V
 
L
L
 
A
D
 
K
G
 
G
H
 
E
Y
 
Y
L
 
Q
V
 
K
E
 
V
N
 
S
R
 
Y
F
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
T
E
 
T
V
 
V
R
 
K
R
 
-
H
 
Y
G
 
G
E
 
K
A
 
K
I
 
E
G
 
A
Q
 
T
G
 
Y
D
 
L
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
 
E
V
 
S
V
 
T
L
 
V
H
 
K
P
 
S
G
 
S
K
 
G
S
 
G
T
 
P
R
 
F
M
 
V
I
 
V
E
 
D
F
 
-
E
 
-
L
 
V
Y
 
V
I
 
I
D
 
N
G
 
D
Q
 
I
F
 
H
V
 
F
C
 
E
S
 
R
Q
 
F
K
 
R
A
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
 
Y
A
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
M
 
M
H
 
H
P
 
P
K
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
M
V
 
Q
I
 
L
V
 
T
P
 
E
M
 
M

6rg8A Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an inhibitor (see paper)
31% identity, 50% coverage: 64:210/296 of query aligns to 37:181/260 of 6rg8A

query
sites
6rg8A
D
 
E
M
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
|
G
S
 
T
L
 
F
L
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
H
A
 
Q
L
 
Y
A
 
E
R
 
E
H
 
R
-
 
L
-
 
D
N
 
E
V
 
I
P
 
A
V
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
R
 
T
G
 
G
S
 
H
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
T
 
A
D
 
D
I
 
W
R
 
R
P
 
P
D
 
A
D
 
E
L
 
A
E
 
D
V
 
K
E
 
L
V
 
V
A
 
K
K
 
L
V
 
L
L
 
A
D
 
K
G
 
G
H
 
E
Y
 
Y
L
 
Q
V
 
K
E
 
V
N
 
S
R
 
Y
F
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
T
E
 
T
V
 
V
R
 
K
R
 
Y
H
 
G
G
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
T
G
 
Y
Q
 
L
G
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
V
 
S
V
 
T
L
 
V
H
 
K
P
 
S
G
 
S
K
 
G
S
 
G
T
 
P
R
 
F
M
 
V
I
 
V
E
 
D
F
 
-
E
 
-
L
 
V
Y
 
V
I
 
I
D
 
N
G
 
D
Q
 
I
F
 
H
V
 
F
C
 
E
S
 
R
Q
 
F
K
 
R
A
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
A
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
M
 
M
H
 
H
P
 
P
K
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
M
V
 
Q
I
 
L
V
 
T
P
 
E
M
 
M

Sites not aligning to the query:

6rbyA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complexe with an adenine derivative (see paper)
31% identity, 50% coverage: 64:210/296 of query aligns to 37:181/260 of 6rbyA

query
sites
6rbyA
D
 
E
M
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
S
 
T
L
 
F
L
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
H
A
 
Q
L
 
Y
A
 
E
R
 
E
H
 
R
-
 
L
-
 
D
N
 
E
V
 
I
P
 
A
V
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
R
 
T
G
 
G
S
 
H
L
 
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
T
 
A
D
 
D
I
 
W
R
 
R
P
 
P
D
 
A
D
 
E
L
 
A
E
 
D
V
 
K
E
 
L
V
 
V
A
 
K
K
 
L
V
 
L
L
 
A
D
 
K
G
 
G
H
 
E
Y
 
Y
L
 
Q
V
 
K
E
 
V
N
 
S
R
 
Y
F
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
T
E
 
T
V
 
V
R
 
K
R
 
Y
H
 
G
G
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
T
G
 
Y
Q
 
L
G
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
 
E
V
 
S
V
 
T
L
 
V
H
 
K
P
 
S
G
 
S
K
 
G
S
 
G
T
 
P
R
 
F
M
 
V
I
 
V
E
 
D
F
 
-
E
 
-
L
 
V
Y
 
V
I
 
I
D
 
N
G
 
D
Q
 
I
F
 
H
V
 
F
C
 
E
S
 
R
Q
 
F
K
 
R
A
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
 
Y
A
 
N
L
 
K
S
 
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
M
 
M
H
 
H
P
 
P
K
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
M
V
 
Q
I
 
L
V
 
T
P
 
E
M
 
M

8a9vA Crystal structure of NAD kinase 1 from listeria monocytogenes in complex with a linear di-adenosine derivative (see paper)
31% identity, 50% coverage: 64:210/296 of query aligns to 37:181/261 of 8a9vA

query
sites
8a9vA
D
 
E
M
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
|
D
G
 
G
S
 
T
L
 
F
L
|
L
G
 
S
A
 
A
A
 
F
R
 
H
A
 
Q
L
 
Y
A
 
E
R
 
E
H
 
R
-
 
L
-
 
D
N
 
E
V
 
I
P
 
A
V
 
F
L
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
H
R
 
T
G
 
G
S
 
H
L
|
L
G
 
G
F
|
F
L
x
Y
T
 
A
D
 
D
I
 
W
R
 
R
P
 
P
D
 
A
D
 
E
L
 
A
E
 
D
V
 
K
E
 
L
V
 
V
A
 
K
K
 
L
V
 
L
L
 
A
D
 
K
G
 
G
H
 
E
Y
 
Y
L
 
Q
V
 
K
E
 
V
N
 
S
R
 
Y
F
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
T
E
 
T
V
 
V
R
 
K
R
 
Y
H
 
G
G
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
T
G
 
Y
Q
 
L
G
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
L
N
|
N
D
x
E
V
 
S
V
 
T
L
 
V
H
 
K
P
 
S
G
 
S
K
 
G
S
 
G
T
 
P
R
 
F
M
 
V
I
 
V
E
 
D
F
 
-
E
 
-
L
 
V
Y
 
V
I
 
I
D
 
N
G
 
D
Q
 
I
F
 
H
V
 
F
C
 
E
S
 
R
Q
 
F
K
 
R
A
 
G
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
C
V
 
M
A
 
S
T
 
T
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
T
T
|
T
A
|
A
Y
|
Y
A
 
N
L
 
K
S
|
S
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
A
I
 
L
M
 
M
H
 
H
P
 
P
K
 
S
L
 
I
D
 
E
A
 
A
I
 
M
V
 
Q
I
 
L
V
 
T
P
 
E
M
 
M

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF2426 FitnessBrowser__WCS417:GFF2426
MEQFRNIGIIGRLGSTQVLDTVRRLKKFLLERHLHVILEDTIAEILPGHGLQTSSRKMLG
EVCDMVIVVGGDGSLLGAARALARHNVPVLGINRGSLGFLTDIRPDDLEVEVAKVLDGHY
LVENRFLLQAEVRRHGEAIGQGDALNDVVLHPGKSTRMIEFELYIDGQFVCSQKADGLIV
ATPTGSTAYALSAGGPIMHPKLDAIVIVPMYPHMLSSRPIVVDGNSELKIVVSKDMQIYP
QVSCDGQNHFTCAPGDTITVSKKAQKLRLIHPLDHNYYEVCRTKLGWGSRLGGGGD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory