SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2436 PGA1_c24680 glyoxylate reductase GyaR to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
46% identity, 85% coverage: 43:312/318 of query aligns to 43:315/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
L
 
V
R
 
K
E
 
D
F
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
L
M
 
V
P
 
T
T
x
M
L
|
L
G
 
S
D
 
E
Q
 
R
F
 
I
D
 
D
A
 
Q
A
 
E
S
 
V
F
 
F
A
 
E
G
 
-
V
 
-
S
 
N
A
 
A
P
 
P
R
 
R
C
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
V
A
 
A
N
 
N
F
x
Y
G
x
A
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
N
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
E
A
 
A
K
 
T
T
 
R
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
V
x
L
T
 
T
D
 
N
A
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
T
 
H
A
 
A
L
 
F
T
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
H
A
 
V
G
 
V
E
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
K
L
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
K
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
I
G
 
A
W
 
W
H
 
H
P
 
P
T
 
K
Q
 
W
M
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
H
 
E
L
 
L
T
 
Y
G
 
G
K
 
K
H
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
F
|
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
C
 
A
H
 
K
F
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
S
 
R
V
 
I
S
 
L
Y
 
Y
L
 
Y
A
x
S
R
|
R
S
 
T
E
 
R
K
 
K
S
 
S
P
 
Q
G
 
A
F
 
E
P
 
K
A
 
E
V
 
L
R
 
G
A
 
A
D
 
E
S
 
Y
-
 
R
-
 
P
L
 
L
T
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
L
A
 
K
S
 
E
V
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
V
 
I
L
 
L
A
|
A
V
|
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
K
E
 
E
T
|
T
R
 
M
H
 
Y
L
 
M
I
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
V
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
L
M
 
M
R
 
K
P
 
P
E
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
E
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
G
 
G
Q
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
E
E
|
E
P
 
P
E
 
Y
V
 
Y
P
 
N
L
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
F
Q
 
S
M
 
L
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
T
 
S
A
 
A
T
 
T
E
 
F
E
 
E
V
 
A
R
 
R
S
 
E
D
 
A
M
 
M
G
 
A
H
 
E
L
 
L
A
 
V
L
 
A
D
 
R
N
 
N
V
 
L
A
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
K
A
 
R
G
 
G
K
 
E

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
46% identity, 85% coverage: 43:312/318 of query aligns to 42:314/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
L
 
V
R
 
K
E
 
D
F
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
L
M
 
V
P
 
T
T
 
M
L
 
L
G
 
S
D
 
E
Q
 
K
F
 
I
D
 
D
A
 
R
A
 
E
S
 
V
F
 
F
A
 
D
G
 
-
V
 
-
S
 
A
A
 
A
P
 
P
R
 
R
C
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
Y
G
 
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
N
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
E
A
 
E
A
 
A
K
 
T
T
 
K
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
V
x
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
T
 
L
A
 
A
L
 
W
T
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
H
A
 
V
G
 
V
E
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
K
L
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
I
G
 
A
W
 
W
H
 
H
P
 
P
T
 
K
Q
 
M
M
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
H
 
D
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
K
H
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
|
G
F
|
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
C
 
A
H
 
K
F
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
M
S
 
R
V
 
I
S
 
L
Y
 
Y
L
 
T
A
|
A
R
|
R
S
|
S
E
 
R
K
|
K
S
 
P
P
 
E
G
 
A
F
 
E
P
 
K
A
 
E
V
 
L
R
 
G
A
 
A
D
 
E
-
 
F
-
 
K
S
 
P
L
 
L
T
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
L
A
 
R
S
 
E
V
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
V
|
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
K
E
|
E
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
M
I
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
V
 
R
L
 
L
A
 
R
A
 
L
M
 
M
R
 
K
P
 
P
E
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
I
x
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
E
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
G
 
G
Q
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
E
E
|
E
P
 
P
E
 
Y
V
 
Y
P
 
D
L
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
F
Q
 
A
M
 
L
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
T
 
S
A
 
A
T
 
T
E
 
F
E
 
G
V
 
A
R
 
R
S
 
E
D
 
G
M
 
M
G
 
A
H
 
E
L
 
L
A
 
V
L
 
A
D
 
K
N
 
N
V
 
L
A
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
K
A
 
N
G
 
G
K
 
E

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
43% identity, 79% coverage: 68:318/318 of query aligns to 66:312/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
P
 
P
R
 
K
C
 
L
R
 
E
L
 
I
L
 
V
A
 
S
N
 
S
F
 
F
G
 
S
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
N
 
D
H
 
K
I
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
I
A
 
K
A
 
C
K
 
E
T
 
E
A
 
K
G
 
G
I
 
V
A
 
R
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
V
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
D
T
 
V
A
 
A
D
 
D
T
 
L
A
 
A
L
 
I
T
 
G
L
 
L
M
 
I
L
 
L
M
 
A
T
 
V
A
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
I
G
 
C
E
 
E
G
 
C
E
 
D
R
 
K
L
 
Y
V
 
V
R
 
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
A
W
 
W
Q
 
K
G
 
-
W
 
-
H
 
F
P
 
G
T
 
D
Q
 
F
M
 
K
L
 
L
G
 
T
L
 
T
H
 
K
L
 
F
T
 
S
G
 
G
K
 
K
H
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
R
C
 
A
H
 
E
F
 
-
G
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
S
 
P
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
L
 
F
A
x
S
R
|
R
S
|
S
E
 
K
K
 
K
S
 
-
P
 
P
G
 
N
F
 
T
P
 
N
A
 
Y
V
 
T
R
 
Y
A
 
Y
D
 
G
S
 
S
L
 
V
T
 
V
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
S
S
 
N
V
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
C
P
 
P
G
 
L
G
 
T
A
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
R
E
 
E
V
 
V
L
 
I
A
 
D
A
 
A
M
 
L
R
 
G
P
 
P
E
 
K
A
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
R
 
R
G
 
G
E
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
T
 
E
G
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
R
E
 
E
P
 
P
E
 
E
V
 
V
P
 
P
L
 
E
A
 
K
L
 
L
Q
 
F
Q
 
G
M
 
L
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
T
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
V
G
 
G
T
 
S
A
 
G
T
 
T
E
 
V
E
 
E
V
 
T
R
 
R
S
 
K
D
 
V
M
 
M
G
 
A
H
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
G
N
 
N
V
 
L
A
 
E
A
 
A
F
 
H
L
 
F
A
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
L
S
 
T
P
 
P
V
 
V

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
43% identity, 79% coverage: 68:318/318 of query aligns to 64:310/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
P
 
P
R
 
K
C
 
L
R
 
E
L
 
I
L
 
V
A
 
S
N
 
S
F
 
F
G
 
S
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
N
 
D
H
 
K
I
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
I
A
 
K
A
 
C
K
 
E
T
 
E
A
 
K
G
 
G
I
 
V
A
 
R
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
V
x
L
T
 
T
D
 
D
A
 
D
T
 
V
A
 
A
D
 
D
T
 
L
A
 
A
L
 
I
T
 
G
L
 
L
M
 
I
L
 
L
M
 
A
T
 
V
A
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
I
G
 
C
E
 
E
G
 
C
E
 
D
R
 
K
L
 
Y
V
 
V
R
 
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
A
W
 
W
Q
 
K
G
 
-
W
 
-
H
 
F
P
 
G
T
 
D
Q
 
F
M
 
K
L
 
L
G
 
T
L
 
T
H
 
K
L
 
F
T
 
S
G
 
G
K
 
K
H
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
R
C
 
A
H
 
E
F
 
-
G
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
S
 
P
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
L
 
F
A
x
S
R
|
R
S
|
S
E
 
K
K
 
K
S
 
-
P
 
P
G
 
N
F
 
T
P
 
N
A
 
Y
V
 
T
R
 
Y
A
 
Y
D
 
G
S
 
S
L
 
V
T
 
V
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
S
S
 
N
V
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
x
C
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
P
E
 
E
T
|
T
R
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
R
E
 
E
V
 
V
L
 
I
A
 
D
A
 
A
M
 
L
R
 
G
P
 
P
E
 
K
A
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
G
R
|
R
G
 
G
E
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
T
 
E
G
 
G
Q
 
R
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
R
E
|
E
P
 
P
E
 
E
V
 
V
P
 
P
L
 
E
A
 
K
L
 
L
Q
 
F
Q
 
G
M
 
L
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
T
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
L
 
V
G
|
G
T
 
S
A
 
G
T
 
T
E
 
V
E
 
E
V
 
T
R
 
R
S
 
K
D
 
V
M
 
M
G
 
A
H
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
G
N
 
N
V
 
L
A
 
E
A
 
A
F
 
H
L
 
F
A
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
L
S
 
T
P
 
P
V
 
V

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
42% identity, 98% coverage: 1:312/318 of query aligns to 1:315/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
M
 
M
S
 
K
G
 
P
K
 
K
L
 
V
W
 
F
I
 
I
T
 
T
R
 
R
P
 
E
M
 
I
T
 
P
A
 
E
A
 
V
V
 
G
E
 
I
A
 
K
R
 
M
A
 
L
R
 
E
S
 
D
E
 
E
F
 
F
G
 
E
A
 
V
E
 
E
I
 
V
R
 
W
Q
 
G
E
 
D
T
 
E
T
 
K
P
 
E
L
 
I
T
 
P
A
 
R
G
 
E
E
 
I
R
 
L
Q
 
L
R
 
K
A
 
K
L
 
V
R
 
K
E
 
E
F
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
L
M
 
V
P
 
T
T
 
M
L
 
L
G
 
S
D
 
E
Q
 
R
F
 
I
D
 
D
A
 
K
A
 
E
S
 
V
F
 
F
A
 
E
G
 
-
V
 
-
S
 
N
A
 
A
P
 
P
R
 
K
C
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
Y
G
 
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
N
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
E
A
 
E
A
 
A
K
 
T
T
 
K
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
V
x
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
T
 
L
A
 
A
L
 
F
T
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
H
A
 
V
G
 
V
E
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
R
L
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
G
 
A
W
 
W
H
 
H
P
 
P
T
 
K
Q
 
W
M
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
H
 
D
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
K
H
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
C
 
A
H
 
K
F
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
S
 
R
V
 
I
S
 
L
Y
 
Y
L
 
Y
A
x
S
R
|
R
S
x
T
E
 
R
K
 
K
S
 
E
P
 
E
G
 
V
F
 
E
P
 
R
A
 
E
V
 
L
R
 
N
A
 
A
D
 
E
-
 
F
-
 
K
S
 
P
L
 
L
T
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
L
A
 
R
S
 
E
V
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
|
A
V
|
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
R
E
 
E
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
V
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
L
M
 
M
R
 
K
P
 
K
E
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
E
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
G
 
G
Q
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
E
E
|
E
P
 
P
E
 
Y
V
 
Y
P
 
N
L
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
F
Q
 
K
M
 
L
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
T
 
S
A
 
A
T
 
S
E
 
F
E
 
G
V
 
A
R
 
R
S
 
E
D
 
G
M
 
M
G
 
A
H
 
E
L
 
L
A
 
V
L
 
A
D
 
K
N
 
N
V
 
L
A
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
K
A
 
R
G
 
G
K
 
E

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
42% identity, 98% coverage: 1:312/318 of query aligns to 1:315/334 of O58320

query
sites
O58320
M
 
M
S
 
K
G
 
P
K
 
K
L
 
V
W
 
F
I
 
I
T
 
T
R
 
R
P
 
E
M
 
I
T
 
P
A
 
E
A
 
V
V
 
G
E
 
I
A
 
K
R
 
M
A
 
L
R
 
E
S
 
D
E
 
E
F
 
F
G
 
E
A
 
V
E
 
E
I
 
V
R
 
W
Q
 
G
E
 
D
T
 
E
T
 
K
P
 
E
L
 
I
T
 
P
A
 
R
G
 
E
E
 
I
R
 
L
Q
 
L
R
 
K
A
 
K
L
 
V
R
 
K
E
 
E
F
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
L
M
 
V
P
 
T
T
 
M
L
 
L
G
 
S
D
 
E
Q
 
R
F
 
I
D
 
D
A
 
K
A
 
E
S
 
V
F
 
F
A
 
E
G
 
-
V
 
-
S
 
N
A
 
A
P
 
P
R
 
K
C
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
Y
G
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
N
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
I
D
 
E
A
 
E
A
 
A
K
 
T
T
 
K
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
V
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
T
A
 
A
D
 
D
T
 
L
A
 
A
L
 
F
T
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
H
A
 
V
G
 
V
E
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
R
L
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
G
 
A
W
 
W
H
 
H
P
 
P
T
 
K
Q
 
W
M
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
H
 
D
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
K
H
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
C
 
A
H
 
K
F
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
S
 
R
V
 
I
S
 
L
Y
 
Y
L
 
Y
A
x
S
R
|
R
S
x
T
E
 
R
K
 
K
S
 
E
P
 
E
G
 
V
F
 
E
P
 
R
A
 
E
V
 
L
R
 
N
A
 
A
D
 
E
-
 
F
-
 
K
S
 
P
L
 
L
T
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
L
A
 
R
S
 
E
V
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
L
G
 
T
A
 
R
E
 
E
T
 
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
V
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
L
M
 
M
R
 
K
P
 
K
E
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
E
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
G
 
G
Q
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
E
E
 
E
P
 
P
E
 
Y
V
 
Y
P
 
N
L
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
F
Q
 
K
M
 
L
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
L
x
I
G
|
G
T
 
S
A
 
A
T
 
S
E
 
F
E
 
G
V
 
A
R
 
R
S
 
E
D
 
G
M
 
M
G
 
A
H
 
E
L
 
L
A
 
V
L
 
A
D
 
K
N
 
N
V
 
L
A
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
K
A
 
R
G
 
G
K
 
E

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
45% identity, 79% coverage: 68:318/318 of query aligns to 62:310/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
P
 
P
R
 
S
C
 
L
R
 
E
L
 
I
L
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
N
 
D
H
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
S
A
 
R
A
 
A
K
 
A
T
 
A
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
V
x
L
T
 
T
D
 
E
A
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
N
T
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
L
A
 
L
G
 
P
E
 
Q
G
 
A
E
 
E
R
 
Q
L
 
W
V
 
L
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
-
 
V
-
 
R
Q
 
E
G
 
G
W
 
A
H
 
F
P
 
P
T
 
L
Q
 
S
M
 
P
L
 
L
G
 
S
L
 
L
H
 
R
L
 
-
T
 
-
G
 
G
K
 
R
H
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
L
V
x
F
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
C
 
L
H
 
E
F
 
-
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
S
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
L
 
H
A
x
T
R
|
R
S
 
T
E
 
P
K
 
R
S
 
E
P
 
-
G
 
G
F
 
L
P
 
G
A
 
F
V
 
T
R
 
Y
A
 
H
D
 
P
S
 
T
L
 
L
T
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
E
S
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
V
A
 
I
V
|
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
E
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
A
M
 
L
R
 
G
P
 
P
E
 
K
A
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
E
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
N
G
 
G
Q
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
N
E
|
E
P
 
P
E
 
N
V
 
V
P
 
P
L
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
Q
 
S
M
 
F
E
 
P
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
L
 
V
G
x
A
T
 
S
A
 
A
T
 
S
E
 
V
E
 
V
V
 
T
R
 
R
S
 
N
D
 
A
M
 
M
G
 
S
H
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
K
A
 
A
F
 
W
L
 
F
A
 
S
G
 
T
K
 
G
P
 
E
L
 
A
I
 
L
S
 
T
P
 
P
V
 
V

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
45% identity, 79% coverage: 68:318/318 of query aligns to 60:308/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
P
 
P
R
 
S
C
 
L
R
 
E
L
 
I
L
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
F
G
|
G
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
N
 
D
H
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
S
A
 
R
A
 
A
K
 
A
T
 
A
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
V
x
L
T
 
T
D
 
E
A
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
N
T
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
L
A
 
L
G
 
P
E
 
Q
G
 
A
E
 
E
R
 
Q
L
 
W
V
 
L
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
-
 
V
-
 
R
Q
 
E
G
 
G
W
 
A
H
 
F
P
 
P
T
 
L
Q
 
S
M
 
P
L
 
L
G
 
S
L
 
L
H
 
R
L
 
-
T
 
-
G
 
G
K
 
R
H
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
L
V
x
F
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
C
 
L
H
 
E
F
 
-
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
S
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
L
 
H
A
x
T
R
|
R
S
 
T
E
 
P
K
 
R
S
 
E
P
 
-
G
 
G
F
 
L
P
 
G
A
 
F
V
 
T
R
 
Y
A
 
H
D
 
P
S
 
T
L
 
L
T
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
E
S
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
V
A
 
I
V
|
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
E
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
A
M
 
L
R
 
G
P
 
P
E
 
K
A
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
E
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
N
G
 
G
Q
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
N
E
|
E
P
 
P
E
 
N
V
 
V
P
 
P
L
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
Q
 
S
M
 
F
E
 
P
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
L
 
V
G
x
A
T
 
S
A
 
A
T
 
S
E
 
V
E
 
V
V
 
T
R
 
R
S
 
N
D
 
A
M
 
M
G
 
S
H
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
K
A
 
A
F
 
W
L
 
F
A
 
S
G
 
T
K
 
G
P
 
E
L
 
A
I
 
L
S
 
T
P
 
P
V
 
V

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
45% identity, 79% coverage: 68:318/318 of query aligns to 61:309/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
P
 
P
R
 
S
C
 
L
R
 
E
L
 
I
L
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
F
G
|
G
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
N
 
D
H
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
S
A
 
R
A
 
A
K
 
A
T
 
A
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
V
x
L
T
 
T
D
 
E
A
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
N
T
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
L
A
 
L
G
 
P
E
 
Q
G
 
A
E
 
E
R
 
Q
L
 
W
V
 
L
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
-
 
V
-
 
R
Q
 
E
G
 
G
W
 
A
H
 
F
P
 
P
T
 
L
Q
 
S
M
 
P
L
 
L
G
 
S
L
 
L
H
 
R
L
 
-
T
 
-
G
 
G
K
 
R
H
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
F
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
C
 
L
H
 
E
F
 
-
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
S
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
L
 
H
A
x
T
R
|
R
S
 
T
E
 
P
K
 
R
S
 
E
P
 
-
G
 
G
F
 
L
P
 
G
A
 
F
V
 
T
R
 
Y
A
 
H
D
 
P
S
 
T
L
 
L
T
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
E
S
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
V
A
 
I
V
|
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
E
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
A
M
 
L
R
 
G
P
 
P
E
 
K
A
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
E
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
N
G
 
G
Q
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
N
E
|
E
P
 
P
E
 
N
V
 
V
P
 
P
L
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
Q
 
S
M
 
F
E
 
P
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
L
 
V
G
x
A
T
x
S
A
 
A
T
 
S
E
 
V
E
 
V
V
 
T
R
|
R
S
 
N
D
 
A
M
 
M
G
 
S
H
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
K
A
 
A
F
 
W
L
 
F
A
 
S
G
 
T
K
 
G
P
 
E
L
 
A
I
 
L
S
 
T
P
 
P
V
 
V

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
45% identity, 79% coverage: 68:318/318 of query aligns to 60:308/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
P
 
P
R
 
S
C
 
L
R
 
E
L
 
I
L
 
V
A
 
A
N
 
N
F
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
N
 
D
H
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
S
A
 
R
A
 
A
K
 
A
T
 
A
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
V
x
L
T
 
T
D
 
E
A
 
E
T
 
V
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
I
T
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
N
T
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
L
A
 
L
G
 
P
E
 
Q
G
 
A
E
 
E
R
 
Q
L
 
W
V
 
L
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
-
 
V
-
 
R
Q
 
E
G
 
G
W
 
A
H
 
F
P
 
P
T
 
L
Q
 
S
M
 
P
L
 
L
G
 
S
L
 
L
H
 
R
L
 
-
T
 
-
G
 
G
K
 
R
H
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
F
G
 
G
F
x
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
C
 
L
H
 
E
F
 
-
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
S
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
L
 
H
A
x
T
R
|
R
S
 
T
E
 
P
K
 
R
S
 
E
P
 
-
G
 
G
F
 
L
P
 
G
A
 
F
V
 
T
R
 
Y
A
 
H
D
 
P
S
 
T
L
 
L
T
 
V
A
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
E
S
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
V
A
 
I
V
 
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
E
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
A
M
 
L
R
 
G
P
 
P
E
 
K
A
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
 
V
A
 
G
R
|
R
G
 
G
E
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
N
G
 
G
Q
 
T
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
N
E
|
E
P
 
P
E
 
N
V
 
V
P
 
P
L
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
Q
 
S
M
 
F
E
 
P
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
L
 
V
G
 
A
T
 
S
A
 
A
T
 
S
E
 
V
E
 
V
V
 
T
R
 
R
S
 
N
D
 
A
M
 
M
G
 
S
H
 
D
L
 
L
A
 
V
L
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
L
A
 
K
A
 
A
F
 
W
L
 
F
A
 
S
G
 
T
K
 
G
P
 
E
L
 
A
I
 
L
S
 
T
P
 
P
V
 
V

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:316/318 of query aligns to 4:320/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
K
 
K
L
 
V
W
 
F
I
 
V
T
 
T
R
 
R
P
 
R
M
 
I
T
 
P
A
 
A
A
 
E
V
 
G
E
 
R
A
 
V
R
 
A
A
 
L
R
 
A
S
 
R
E
 
A
F
 
A
G
 
D
A
 
C
E
 
E
I
 
V
R
 
E
Q
 
Q
E
 
W
T
 
D
T
 
S
-
 
D
-
 
E
P
 
P
L
 
I
T
 
P
A
 
A
G
 
K
E
 
E
R
 
L
Q
 
E
R
 
R
A
 
G
L
 
V
R
 
A
E
 
G
F
 
A
D
 
H
V
 
G
V
 
L
M
 
L
P
 
C
T
 
L
L
|
L
G
 
S
D
 
D
Q
 
H
F
 
V
D
 
D
A
 
K
A
 
R
S
 
I
F
 
L
A
 
D
G
 
A
V
 
A
S
 
G
A
 
A
P
 
-
R
 
N
C
 
L
R
 
K
L
 
V
L
 
I
A
 
S
N
 
T
F
 
M
G
x
S
V
|
V
G
|
G
Y
 
I
N
 
D
H
 
H
I
 
L
D
 
A
V
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
I
K
 
K
T
 
K
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
V
S
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
V
x
L
T
 
T
D
 
D
A
 
T
T
|
T
A
 
A
D
 
E
T
 
L
A
 
A
L
 
V
T
 
S
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
T
T
 
T
A
 
C
R
 
R
R
 
R
A
 
L
G
 
P
E
 
E
G
 
A
E
 
I
R
 
E
L
 
E
V
 
V
R
 
K
S
 
N
G
 
G
Q
 
G
W
 
W
Q
 
T
G
 
S
W
 
W
H
 
K
P
 
P
T
 
L
Q
 
W
M
 
L
L
 
C
G
 
G
L
 
Y
H
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
Q
K
 
S
H
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
F
 
L
G
|
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
C
 
L
H
 
K
-
 
P
F
 
F
G
 
G
F
 
V
G
 
Q
-
 
R
-
 
F
M
 
L
S
 
Y
V
 
T
S
x
G
Y
x
R
L
 
Q
A
 
P
R
|
R
S
 
P
E
 
E
K
 
E
S
 
A
P
 
A
G
 
E
F
 
F
P
 
Q
A
 
A
V
 
E
R
 
F
A
 
V
D
 
-
S
 
S
L
 
T
T
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
V
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
I
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
x
C
P
x
S
G
 
L
G
 
T
A
 
P
E
 
A
T
|
T
R
 
E
H
 
G
L
 
L
I
 
C
N
 
N
A
 
K
E
 
D
V
 
F
L
 
F
A
 
Q
A
 
K
M
 
M
R
 
K
P
 
E
E
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
E
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
A
 
D
A
 
D
L
 
L
I
 
Y
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
T
 
S
G
 
G
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
T
E
 
S
F
 
P
E
|
E
P
 
P
E
 
-
V
 
L
P
 
P
L
 
T
-
 
N
-
 
H
A
 
P
L
 
L
Q
 
L
Q
 
T
M
 
L
E
 
K
Q
 
N
V
 
C
T
 
V
L
 
I
L
 
L
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
T
 
S
A
 
A
T
 
T
E
 
H
E
 
R
V
 
T
R
 
R
S
 
N
D
 
T
M
 
M
G
 
S
H
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
N
N
 
N
V
 
L
A
 
L
A
 
A
F
 
G
L
 
L
A
 
R
G
 
G
K
 
E
P
 
P
L
 
M
I
 
P
S
 
S

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:316/318 of query aligns to 8:324/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
K
 
K
L
 
V
W
 
F
I
 
V
T
 
T
R
 
R
P
 
R
M
 
I
T
 
P
A
 
A
A
 
E
V
 
G
E
 
R
A
 
V
R
 
A
A
 
L
R
 
A
S
 
R
E
 
A
F
 
A
G
 
D
A
 
C
E
 
E
I
 
V
R
 
E
Q
 
Q
E
 
W
T
 
D
T
 
S
-
 
D
-
 
E
P
 
P
L
 
I
T
 
P
A
 
A
G
 
K
E
 
E
R
 
L
Q
 
E
R
 
R
A
 
G
L
 
V
R
 
A
E
 
G
F
 
A
D
 
H
V
 
G
V
 
L
M
 
L
P
 
C
T
 
L
L
 
L
G
 
S
D
 
D
Q
 
H
F
 
V
D
 
D
A
 
K
A
 
R
S
 
I
F
 
L
A
 
D
G
 
A
V
 
A
S
 
G
A
 
A
P
 
-
R
 
N
C
 
L
R
 
K
L
 
V
L
 
I
A
 
S
N
 
T
F
 
M
G
 
S
V
|
V
G
|
G
Y
 
I
N
 
D
H
 
H
I
 
L
D
 
A
V
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
I
K
 
K
T
 
K
A
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
V
S
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
D
A
 
V
V
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
T
T
 
T
A
 
A
D
 
E
T
 
L
A
 
A
L
 
V
T
 
S
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
T
T
 
T
A
 
C
R
 
R
R
 
R
A
 
L
G
 
P
E
 
E
G
 
A
E
 
I
R
 
E
L
 
E
V
 
V
R
 
K
S
 
N
G
 
G
Q
 
G
W
 
W
Q
 
T
G
 
S
W
 
W
H
 
K
P
 
P
T
 
L
Q
 
W
M
 
L
L
 
C
G
 
G
L
 
Y
H
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
Q
K
 
S
H
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
C
 
L
H
 
K
-
 
P
F
 
F
G
 
G
F
 
V
G
 
Q
-
 
R
-
 
F
M
 
L
S
 
Y
V
 
T
S
 
G
Y
x
R
L
x
Q
A
x
P
R
|
R
S
 
P
E
 
E
K
 
E
S
 
A
P
 
A
G
 
E
F
 
F
P
 
Q
A
 
A
V
 
E
R
 
F
A
 
V
D
 
-
S
 
S
L
 
T
T
 
P
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
V
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
I
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
C
P
x
S
G
 
L
G
 
T
A
 
P
E
 
A
T
 
T
R
 
E
H
 
G
L
 
L
I
 
C
N
 
N
A
 
K
E
 
D
V
 
F
L
 
F
A
 
Q
A
 
K
M
 
M
R
 
K
P
 
E
E
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
E
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
A
 
D
A
 
D
L
 
L
I
 
Y
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
T
 
S
G
 
G
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
T
E
 
S
F
 
P
E
 
E
P
 
P
E
 
-
V
 
L
P
 
P
L
 
T
-
 
N
-
 
H
A
 
P
L
 
L
Q
 
L
Q
 
T
M
 
L
E
 
K
Q
 
N
V
 
C
T
 
V
L
 
I
L
 
L
P
 
P
H
|
H
L
x
I
G
|
G
T
x
S
A
 
A
T
 
T
E
 
H
E
 
R
V
 
T
R
 
R
S
 
N
D
 
T
M
 
M
G
 
S
H
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
N
N
 
N
V
 
L
A
 
L
A
 
A
F
 
G
L
 
L
A
 
R
G
 
G
K
 
E
P
 
P
L
 
M
I
 
P
S
 
S

6ih6A Phosphite dehydrogenase mutant i151r/p176r/m207a from ralstonia sp. 4506 in complex with non-natural cofactor nicotinamide cytosine dinucleotide
38% identity, 85% coverage: 44:314/318 of query aligns to 44:323/330 of 6ih6A

query
sites
6ih6A
R
 
K
E
 
D
F
 
A
D
 
D
V
 
A
V
 
L
M
 
M
P
 
A
T
 
F
L
 
M
G
 
P
D
 
D
Q
 
S
F
 
I
D
 
D
A
 
S
A
 
A
S
 
F
F
 
L
A
 
E
G
 
-
V
 
-
S
 
E
A
 
C
P
 
P
R
 
K
C
 
L
R
 
R
L
 
V
L
 
I
A
 
G
N
 
A
F
 
A
G
 
L
V
 
K
G
 
G
Y
 
Y
N
 
D
H
 
N
I
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
N
A
 
A
A
 
C
K
 
T
T
 
R
A
 
H
G
 
G
I
 
V
A
 
W
V
 
L
S
 
T
N
 
I
T
 
V
P
 
P
G
 
D
A
 
L
V
 
L
T
 
T
D
 
I
A
 
P
T
|
T
A
 
A
D
 
E
T
 
L
A
 
T
L
 
I
T
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
M
 
G
T
 
L
A
 
T
R
 
R
R
 
H
A
 
M
G
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
D
R
 
R
L
 
Q
V
 
I
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
H
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
W
 
W
H
 
R
P
 
P
T
 
T
Q
 
-
M
 
L
L
 
Y
G
 
G
L
 
S
H
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
H
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
R
G
 
G
F
 
M
G
|
G
R
x
A
I
x
V
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
C
 
L
H
 
A
F
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
E
M
 
M
S
 
N
V
 
L
S
 
L
Y
 
Y
L
 
C
A
x
D
R
 
R
-
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
N
S
 
A
E
 
E
K
 
Q
S
 
E
P
 
K
G
 
A
F
 
W
P
 
H
A
 
V
V
 
Q
R
 
R
A
 
V
D
 
-
S
 
T
L
 
L
T
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
L
A
 
E
S
 
K
V
 
C
D
 
D
V
 
Y
L
 
V
V
 
V
L
 
P
A
|
A
V
|
V
P
|
P
G
 
M
G
 
A
A
 
A
E
 
E
T
|
T
R
 
L
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
D
A
 
A
E
 
T
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
K
M
 
M
R
 
K
P
 
T
E
 
G
A
 
S
L
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
A
A
x
C
R
|
R
G
 
G
E
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
N
A
 
A
L
 
V
I
 
I
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
T
 
S
G
 
G
Q
 
K
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
A
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
M
E
 
E
-
 
E
-
 
W
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
R
P
 
P
E
 
Q
-
 
A
V
 
I
P
 
P
L
 
K
A
 
A
-
 
L
L
 
L
Q
 
D
Q
 
N
M
 
T
E
 
A
Q
 
Q
V
 
T
T
 
F
L
 
F
L
 
T
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G
T
 
S
A
 
A
T
 
V
E
 
K
E
 
E
V
 
V
R
 
R
S
 
L
D
 
E
M
 
I
G
 
E
H
 
R
L
 
Q
A
 
A
L
 
A
D
 
M
N
 
N
V
 
I
A
 
I
A
 
Q
F
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
-
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
M

2w2lA Crystal structure of the holo forms of rhodotorula graminis d- mandelate dehydrogenase at 2.5a.
38% identity, 78% coverage: 70:317/318 of query aligns to 81:337/346 of 2w2lA

query
sites
2w2lA
C
 
L
R
 
K
L
 
V
L
 
F
A
 
A
N
 
A
F
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
Y
 
F
N
 
D
H
 
W
I
 
L
D
 
D
V
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
L
K
 
N
T
 
E
A
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
F
S
 
A
N
 
N
T
 
S
P
 
R
G
 
G
A
 
A
V
x
G
T
 
D
D
 
T
A
 
A
T
|
T
A
 
S
D
 
D
T
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
Y
L
 
L
M
 
I
L
 
L
M
 
S
T
 
V
A
 
F
R
 
R
R
 
L
A
 
A
G
 
S
E
 
Y
G
 
S
E
 
E
R
 
R
L
 
A
V
 
A
R
 
R
S
 
T
G
 
G
Q
 
D
W
 
P
Q
 
E
G
 
T
W
 
F
H
 
N
P
 
R
T
 
V
Q
 
H
M
 
L
-
 
E
-
 
I
-
 
G
L
 
K
G
 
S
L
 
A
H
 
H
L
 
N
T
 
P
G
 
R
K
 
G
H
 
H
V
 
V
-
 
L
G
 
G
I
 
A
V
 
V
G
 
G
F
 
L
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
Q
E
 
K
A
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
K
C
 
A
H
 
V
F
 
H
G
 
G
F
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
K
V
 
L
S
 
V
Y
 
Y
L
 
Y
-
x
D
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
D
A
 
A
R
 
E
S
 
T
E
 
E
K
 
K
S
 
A
P
 
L
G
 
G
F
 
-
P
 
-
A
 
A
V
 
E
R
 
R
A
 
V
D
 
D
S
 
S
L
 
L
T
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
R
S
 
R
V
 
S
D
 
D
V
 
C
L
 
V
V
 
S
L
 
V
A
 
S
V
|
V
P
|
P
G
 
Y
G
 
M
A
 
K
E
 
L
T
|
T
R
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
D
A
 
E
E
 
A
V
 
F
L
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
K
P
 
P
E
 
G
A
 
S
L
 
R
L
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
E
 
P
V
 
V
V
 
I
D
 
S
E
 
Q
A
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
T
 
S
G
 
G
Q
 
K
I
 
L
A
 
L
G
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
H
E
 
E
F
 
F
E
|
E
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
P
 
S
L
 
K
A
 
E
L
 
L
Q
 
I
Q
 
E
M
 
M
E
 
K
Q
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
T
P
 
T
H
|
H
L
 
I
G
|
G
T
x
G
A
 
V
T
 
A
E
 
I
E
 
E
V
 
T
R
 
F
S
 
H
D
 
E
M
 
F
G
 
E
H
 
R
L
 
L
A
 
T
L
 
M
D
 
T
N
 
N
V
 
I
A
 
D
A
 
R
F
 
F
-
 
L
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
L
S
 
T
P
 
P

4e5pA Thermostable phosphite dehydrogenase a176r variant in complex with nad (see paper)
35% identity, 91% coverage: 29:318/318 of query aligns to 29:325/332 of 4e5pA

query
sites
4e5pA
Q
 
Q
E
 
T
T
 
D
T
 
S
P
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
R
G
 
E
E
 
E
R
 
I
Q
 
L
R
 
R
A
 
R
L
 
C
R
 
R
E
 
D
F
 
A
D
 
Q
V
 
A
V
 
M
M
 
M
P
 
A
T
 
F
L
 
M
G
 
P
D
 
D
Q
 
R
F
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
D
S
 
F
F
 
L
A
 
Q
G
 
-
V
 
-
S
 
A
A
 
C
P
 
P
R
 
E
C
 
L
R
 
R
L
 
V
L
 
I
A
 
G
N
 
C
F
 
A
G
 
L
V
x
K
G
 
G
Y
 
F
N
 
D
H
 
N
I
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
C
K
 
T
T
 
A
A
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
W
V
 
L
S
 
T
N
 
F
T
 
V
P
 
P
G
 
D
A
 
L
V
x
L
T
 
T
D
 
V
A
 
P
T
|
T
A
 
A
D
 
E
T
 
L
A
 
A
L
 
I
T
 
G
L
 
L
M
 
A
L
 
V
M
 
G
T
 
L
A
 
G
R
 
R
R
 
H
A
 
L
G
 
R
E
 
A
G
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
R
G
 
G
W
 
W
H
 
Q
P
 
P
T
 
-
Q
 
R
M
 
F
L
 
Y
G
 
G
L
 
T
H
 
G
L
 
L
T
 
D
G
 
N
K
 
A
H
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
F
V
 
L
G
 
G
F
 
M
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
M
A
 
A
R
 
D
R
 
R
C
 
L
H
 
Q
F
 
-
G
 
G
F
 
W
G
 
G
M
 
A
S
 
T
V
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
H
A
|
A
R
|
R
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
T
-
 
Q
S
 
T
E
 
E
K
 
Q
S
 
R
P
 
L
G
 
G
F
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
D
 
V
S
 
A
L
 
C
T
 
S
A
 
E
L
 
L
A
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
I
V
 
L
L
 
L
A
 
A
V
x
L
P
|
P
G
 
L
G
 
N
A
 
A
E
 
D
T
|
T
R
 
L
H
 
H
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
L
M
 
V
R
 
R
P
 
P
E
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
N
I
x
P
A
x
C
R
|
R
G
 
G
E
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
V
I
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
T
 
R
G
 
G
Q
 
Q
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
A
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
M
E
|
E
P
 
D
-
 
W
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
P
-
 
Q
E
 
Q
V
 
I
P
 
D
L
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
Q
 
A
M
 
H
E
 
P
Q
 
N
V
 
T
T
 
L
L
 
F
L
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
 
G
T
 
S
A
 
A
T
 
V
E
 
R
E
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
L
D
 
E
M
 
I
G
 
E
H
 
R
L
 
C
A
 
A
L
 
A
D
 
Q
N
 
N
V
 
I
A
 
L
A
 
Q
F
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
R
L
 
P
I
 
I
S
 
N
P
 
A
V
 
V

4e5mA Thermostable phosphite dehydrogenase e175a/a176r in complex with NADP (see paper)
35% identity, 91% coverage: 29:318/318 of query aligns to 29:325/329 of 4e5mA

query
sites
4e5mA
Q
 
Q
E
 
T
T
 
D
T
 
S
P
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
R
G
 
E
E
 
E
R
 
I
Q
 
L
R
 
R
A
 
R
L
 
C
R
 
R
E
 
D
F
 
A
D
 
Q
V
 
A
V
 
M
M
 
M
P
 
A
T
 
F
L
 
M
G
 
P
D
 
D
Q
 
R
F
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
D
S
 
F
F
 
L
A
 
Q
G
 
-
V
 
-
S
 
A
A
 
C
P
 
P
R
 
E
C
 
L
R
 
R
L
 
V
L
 
I
A
 
G
N
 
C
F
 
A
G
 
L
V
x
K
G
 
G
Y
 
F
N
 
D
H
 
N
I
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
C
K
 
T
T
 
A
A
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
W
V
 
L
S
 
T
N
 
F
T
 
V
P
 
P
G
 
D
A
 
L
V
x
L
T
 
T
D
 
V
A
 
P
T
|
T
A
 
A
D
 
E
T
 
L
A
 
A
L
 
I
T
 
G
L
 
L
M
 
A
L
 
V
M
 
G
T
 
L
A
 
G
R
 
R
R
 
H
A
 
L
G
 
R
E
 
A
G
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
R
G
 
G
W
 
W
H
 
Q
P
 
P
T
 
-
Q
 
R
M
 
F
L
 
Y
G
 
G
L
 
T
H
 
G
L
 
L
T
 
D
G
 
N
K
 
A
H
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
F
V
 
L
G
 
G
F
 
M
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
M
A
 
A
R
 
D
R
 
R
C
 
L
H
 
Q
F
 
-
G
 
G
F
 
W
G
 
G
M
 
A
S
 
T
V
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
L
 
H
A
 
A
R
|
R
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
T
-
 
Q
S
 
T
E
 
E
K
 
Q
S
 
R
P
 
L
G
 
G
F
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
D
 
V
S
 
A
L
 
C
T
 
S
A
 
E
L
 
L
A
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
I
V
 
L
L
 
L
A
 
A
V
x
L
P
|
P
G
 
L
G
 
N
A
 
A
E
 
D
T
|
T
R
 
L
H
 
H
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
L
M
 
V
R
 
R
P
 
P
E
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
N
I
x
P
A
x
C
R
|
R
G
 
G
E
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
V
I
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
T
 
R
G
 
G
Q
 
Q
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
A
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
M
E
|
E
P
 
D
-
 
W
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
P
-
 
Q
E
 
Q
V
 
I
P
 
D
L
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
Q
 
A
M
 
H
E
 
P
Q
 
N
V
 
T
T
 
L
L
 
F
L
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
T
 
S
A
 
A
T
 
V
E
 
R
E
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
L
D
 
E
M
 
I
G
 
E
H
 
R
L
 
C
A
 
A
L
 
A
D
 
Q
N
 
N
V
 
I
A
 
L
A
 
Q
F
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
R
L
 
P
I
 
I
S
 
N
P
 
A
V
 
V

4e5kA Thermostable phosphite dehydrogenase in complex with NAD and sulfite (see paper)
34% identity, 91% coverage: 29:318/318 of query aligns to 29:325/329 of 4e5kA

query
sites
4e5kA
Q
 
Q
E
 
T
T
 
D
T
 
S
P
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
R
G
 
E
E
 
E
R
 
I
Q
 
L
R
 
R
A
 
R
L
 
C
R
 
R
E
 
D
F
 
A
D
 
Q
V
 
A
V
 
M
M
 
M
P
 
A
T
 
F
L
x
M
G
 
P
D
 
D
Q
 
R
F
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
D
S
 
F
F
 
L
A
 
Q
G
 
-
V
 
-
S
 
A
A
 
C
P
 
P
R
 
E
C
 
L
R
 
R
L
 
V
L
 
I
A
 
G
N
 
C
F
 
A
G
x
L
V
x
K
G
|
G
Y
 
F
N
 
D
H
 
N
I
 
F
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
C
K
 
T
T
 
A
A
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
W
V
 
L
S
 
T
N
 
F
T
 
V
P
 
P
G
 
D
A
 
L
V
x
L
T
 
T
D
 
V
A
 
P
T
|
T
A
 
A
D
 
E
T
 
L
A
 
A
L
 
I
T
 
G
L
 
L
M
 
A
L
 
V
M
 
G
T
 
L
A
 
G
R
 
R
R
 
H
A
 
L
G
 
R
E
 
A
G
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
W
 
F
Q
 
R
G
 
G
W
 
W
H
 
Q
P
 
P
T
 
-
Q
 
R
M
 
F
L
 
Y
G
 
G
L
 
T
H
 
G
L
 
L
T
 
D
G
 
N
K
 
A
H
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
F
V
 
L
G
|
G
F
 
M
G
|
G
R
x
A
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
M
A
 
A
R
 
D
R
 
R
C
 
L
H
 
Q
F
 
-
G
 
G
F
 
W
G
 
G
M
 
A
S
 
T
V
 
L
S
 
Q
Y
 
Y
-
x
H
-
x
E
-
x
A
L
 
K
A
 
A
R
 
L
S
 
D
E
 
T
K
 
Q
S
 
T
P
 
E
G
 
Q
F
 
R
P
 
L
A
 
G
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
D
 
V
S
 
A
L
 
C
T
 
S
A
 
E
L
 
L
A
 
F
A
 
A
S
 
S
V
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
I
V
 
L
L
 
L
A
|
A
V
x
L
P
|
P
G
 
L
G
 
N
A
 
A
E
 
D
T
 
T
R
 
L
H
 
H
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
L
M
 
V
R
 
R
P
 
P
E
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
N
I
x
P
A
x
C
R
|
R
G
 
G
E
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
V
I
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
T
 
R
G
 
G
Q
 
Q
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
A
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
M
E
|
E
P
 
D
-
 
W
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
P
-
 
Q
E
 
Q
V
 
I
P
 
D
L
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
Q
 
A
M
 
H
E
 
P
Q
 
N
V
 
T
T
 
L
L
 
F
L
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
T
 
S
A
 
A
T
 
V
E
 
R
E
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
L
D
 
E
M
 
I
G
 
E
H
 
R
L
 
C
A
 
A
L
 
A
D
 
Q
N
 
N
V
 
I
A
 
L
A
 
Q
F
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
R
L
 
P
I
 
I
S
 
N
P
 
A
V
 
V

5z20F The ternary structure of d-lactate dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with nadh and oxamate (see paper)
36% identity, 84% coverage: 46:313/318 of query aligns to 52:330/336 of 5z20F

query
sites
5z20F
F
 
F
D
 
E
V
 
V
V
 
V
M
 
C
P
 
A
T
 
F
L
 
V
G
 
N
D
 
D
Q
 
D
F
 
L
D
 
S
A
 
R
A
 
P
S
 
V
F
 
L
A
 
E
G
 
R
V
 
L
S
 
A
A
 
A
P
 
G
R
 
G
C
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
V
A
 
A
N
 
L
F
 
R
G
 
S
V
 
A
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
H
 
H
I
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
E
T
 
A
A
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
P
V
 
V
S
 
V
N
 
H
T
 
V
P
 
P
G
 
A
A
x
Y
V
x
S
T
 
P
D
 
H
A
 
A
T
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
H
A
 
A
L
 
V
T
 
G
L
 
L
M
 
I
L
 
L
M
 
T
T
 
L
A
 
N
R
 
R
R
 
R
A
 
L
G
 
H
E
 
R
G
 
A
E
 
Y
R
 
N
L
 
R
V
 
T
R
 
R
S
 
E
G
 
G
Q
 
D
W
 
F
Q
 
S
G
 
-
W
 
-
H
 
-
P
 
L
T
 
H
Q
 
G
M
 
L
L
 
T
G
 
G
L
 
F
H
 
D
L
 
L
T
 
H
G
 
G
K
 
K
H
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
T
G
|
G
R
x
Q
I
|
I
G
 
G
E
 
E
A
 
T
I
 
F
A
 
A
R
 
R
R
 
-
C
 
I
H
 
M
F
 
A
G
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
C
S
 
E
V
 
L
S
 
-
Y
 
-
L
 
L
A
 
A
R
x
Y
S
x
D
E
x
P
K
 
Y
-
 
P
S
 
N
P
 
P
G
 
R
F
 
I
P
 
Q
A
 
A
V
 
L
-
 
G
-
 
G
R
 
R
A
 
Y
D
 
L
S
 
A
L
 
L
T
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
S
 
E
V
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
V
V
 
S
L
 
L
A
 
H
V
x
C
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
A
E
 
D
T
|
T
R
 
R
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
D
A
 
A
E
 
Q
V
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
T
M
 
M
R
 
K
P
 
P
E
 
G
A
 
A
L
 
M
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
x
G
R
|
R
G
 
G
E
 
A
V
 
L
V
 
V
D
 
N
E
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
I
S
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
T
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
L
A
 
G
G
 
Y
A
 
L
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
F
 
E
E
|
E
P
 
A
E
 
D
V
 
I
-
 
F
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
D
-
 
Q
P
 
P
L
 
L
A
 
Q
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
R
L
 
L
Q
 
L
Q
 
S
M
 
F
E
 
P
Q
 
N
V
 
V
T
 
V
L
 
V
L
 
T
P
 
A
H
|
H
L
 
Q
G
x
A
T
 
F
A
 
L
T
 
T
E
 
R
E
 
E
V
 
A
R
 
L
S
 
A
D
 
A
M
 
I
G
 
A
H
 
D
L
 
T
A
 
T
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
Q
A
 
D
G
 
G
K
 
T
P
 
P

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
39% identity, 77% coverage: 66:311/318 of query aligns to 60:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
S
 
S
A
 
A
P
 
P
R
 
K
C
 
L
R
 
K
L
 
V
L
 
I
A
 
A
N
 
R
F
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
N
 
D
H
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
E
A
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
E
V
 
V
S
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
G
 
A
A
 
A
V
x
S
T
 
S
D
 
R
A
 
S
T
x
V
A
 
A
D
 
E
T
 
L
A
 
A
L
 
V
T
 
G
L
 
L
M
 
M
L
 
F
M
 
S
T
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
K
A
 
I
G
 
A
E
 
F
G
 
A
E
 
D
R
 
R
L
 
K
V
 
M
R
 
R
S
 
E
G
 
G
Q
 
V
W
 
W
Q
 
A
G
 
K
W
 
-
H
 
-
P
 
-
T
 
K
Q
 
E
M
 
A
L
 
M
G
 
G
L
 
I
H
 
E
L
 
L
T
 
E
G
 
G
K
 
K
H
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
F
|
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
Y
A
 
Q
I
 
V
A
 
A
R
 
K
R
 
I
C
 
A
H
 
N
F
 
-
G
 
A
F
 
L
G
 
G
M
 
M
S
 
N
V
 
I
-
 
L
-
 
L
-
x
Y
S
x
D
Y
x
P
L
 
Y
A
 
P
R
 
N
S
 
E
E
 
E
K
 
R
S
 
A
P
 
K
G
 
E
F
 
V
P
 
N
A
 
G
V
 
K
R
 
F
A
 
V
D
 
D
S
 
L
L
 
E
T
 
T
A
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
E
S
 
S
V
 
-
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
T
L
 
I
A
 
H
V
|
V
P
|
P
G
 
L
G
 
V
A
 
E
E
 
S
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
V
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
L
M
 
M
R
 
K
P
 
K
E
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
E
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
G
 
G
Q
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
F
 
E
E
|
E
P
 
P
E
 
-
V
 
L
P
 
P
L
 
K
-
 
D
-
 
H
A
 
P
L
 
L
Q
 
T
Q
 
K
M
 
F
E
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
T
 
A
A
 
S
T
 
T
E
 
V
E
 
E
V
 
A
R
 
Q
S
 
E
D
 
R
M
 
A
G
 
G
H
 
V
L
 
E
A
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
K
V
 
V
A
 
V
A
 
K
F
 
I
L
 
L
A
 
K
G
 
G

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
33% identity, 78% coverage: 66:314/318 of query aligns to 66:312/533 of O43175

query
sites
O43175
S
 
A
A
 
A
P
 
E
R
 
K
C
 
L
R
 
Q
L
 
V
L
 
V
A
 
G
N
 
R
F
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
Y
 
V
N
 
D
H
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
T
T
 
R
A
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
V
 
N
T
 
S
D
 
L
A
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
L
A
 
T
L
 
C
T
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
M
 
C
T
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
I
G
 
P
E
 
Q
G
 
A
E
 
T
R
 
A
L
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
Q
 
E
G
 
-
W
 
-
H
 
-
P
x
R
T
 
K
Q
 
K
M
 
F
L
 
M
G
 
G
L
 
T
H
 
E
L
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
H
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
T
R
 
R
C
 
M
H
 
Q
F
 
-
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
-
 
K
S
 
T
V
 
I
S
 
G
Y
 
Y
-
x
D
-
 
P
L
 
I
A
 
I
R
 
S
S
 
P
E
 
E
K
 
V
S
 
S
P
 
A
G
 
S
F
 
F
P
 
-
A
 
G
V
 
V
R
 
Q
A
 
Q
D
 
L
S
 
P
L
 
L
T
 
E
A
 
E
L
 
I
A
 
W
A
 
P
S
 
L
V
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
V
 
T
L
 
V
A
 
H
V
x
T
P
 
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
E
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
V
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
R
 
K
P
 
K
E
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
I
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
E
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
Y
 
F
E
 
T
F
 
E
E
 
E
P
 
P
E
 
P
V
 
R
P
 
D
L
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
Q
 
D
M
 
H
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
T
 
I
L
 
S
L
 
C
P
 
P
H
|
H
L
|
L
G
|
G
T
x
A
A
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
V
 
A
R
 
Q
S
 
S
D
 
R
M
 
C
G
 
G
H
 
E
L
 
E
A
 
I
L
 
A
D
 
V
N
 
Q
V
 
F
A
 
V
A
 
D
F
 
M
L
 
V
A
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF2436 PGA1_c24680 glyoxylate reductase GyaR
MSGKLWITRPMTAAVEARARSEFGAEIRQETTPLTAGERQRALREFDVVMPTLGDQFDAA
SFAGVSAPRCRLLANFGVGYNHIDVDAAKTAGIAVSNTPGAVTDATADTALTLMLMTARR
AGEGERLVRSGQWQGWHPTQMLGLHLTGKHVGIVGFGRIGEAIARRCHFGFGMSVSYLAR
SEKSPGFPAVRADSLTALAASVDVLVLAVPGGAETRHLINAEVLAAMRPEALLINIARGE
VVDEAALISALQTGQIAGAGLDVYEFEPEVPLALQQMEQVTLLPHLGTATEEVRSDMGHL
ALDNVAAFLAGKPLISPV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory