SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2438 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2438 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3triA Structure of a pyrroline-5-carboxylate reductase (proc) from coxiella burnetii (see paper)
35% identity, 96% coverage: 11:274/275 of query aligns to 5:269/272 of 3triA

query
sites
3triA
I
 
I
A
 
T
L
 
F
L
 
I
G
|
G
C
x
G
G
|
G
K
x
N
M
|
M
G
 
A
S
 
R
A
 
N
M
 
I
L
 
V
A
 
V
G
 
G
W
 
L
L
 
I
D
 
A
R
 
N
G
 
G
V
 
Y
S
 
D
P
 
P
E
 
N
A
 
R
V
 
I
W
 
C
V
 
V
I
 
T
D
x
N
P
x
R
-
x
S
-
 
L
N
 
D
P
x
K
S
 
L
D
 
D
W
 
F
L
 
F
R
 
K
Q
 
E
-
 
K
T
 
C
G
 
G
V
 
V
H
 
H
I
 
T
N
 
T
A
 
Q
P
 
D
L
 
-
P
x
N
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
L
A
 
N
P
 
A
G
 
D
I
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
M
x
Q
M
 
I
G
 
K
E
x
M
A
x
V
L
 
C
P
 
E
Q
 
E
L
 
L
Q
 
K
Q
 
D
-
 
I
L
 
L
G
 
S
N
 
E
G
 
T
E
 
K
T
 
I
L
 
L
F
 
V
I
 
I
S
 
S
V
x
L
A
|
A
A
x
V
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
T
A
 
P
T
 
L
Y
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
W
L
 
L
G
 
G
A
 
K
E
 
A
T
 
S
P
 
R
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
|
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
R
R
 
A
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
G
I
 
L
I
 
F
G
 
A
N
 
N
A
 
E
S
 
T
A
 
V
S
 
D
A
 
K
D
 
D
D
 
Q
V
 
K
I
 
N
R
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
S
L
 
I
L
 
M
K
 
R
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
L
T
 
V
V
 
I
R
 
W
L
 
V
Q
 
S
S
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
Q
M
 
I
D
 
E
A
 
K
V
 
I
T
 
A
G
 
A
V
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
F
H
 
L
L
 
I
I
 
M
E
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
Q
E
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
T
A
 
K
E
 
E
L
 
T
A
 
A
M
 
E
Q
 
L
L
 
L
A
 
T
K
 
E
A
 
Q
T
 
T
V
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
R
L
 
M
A
 
A
E
 
L
A
 
E
A
 
T
E
 
E
E
 
Q
T
 
S
P
 
V
A
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
R
V
 
Q
N
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
Q
 
E
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
E
 
K
V
 
V
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
S
N
 
G
G
 
N
F
 
L
P
 
R
P
 
E
L
 
L
L
 
F
R
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
T
A
 
A
A
 
A
S
 
V
N
 
N
R
 
R
S
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
S
R
 
K

2ag8A NADP complex of pyrroline-5-carboxylate reductase from neisseria meningitidis (see paper)
36% identity, 96% coverage: 11:274/275 of query aligns to 3:260/263 of 2ag8A

query
sites
2ag8A
I
 
V
A
 
Y
L
 
F
L
|
L
G
|
G
C
x
G
G
|
G
K
x
N
M
|
M
G
 
A
S
 
A
A
 
A
M
 
V
L
 
A
A
 
G
G
 
G
W
 
L
L
 
V
D
 
K
R
 
Q
G
 
G
V
 
-
S
 
-
P
 
G
E
 
Y
A
 
R
V
 
I
W
 
Y
V
 
I
I
x
A
D
x
N
P
x
R
N
x
G
P
 
A
S
 
E
D
x
K
W
 
R
L
 
E
R
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
K
Q
 
E
T
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
E
I
 
T
N
 
S
A
|
A
P
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
L
G
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
-
P
 
-
G
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
I
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
Q
M
 
D
M
 
M
G
 
E
E
 
A
A
|
A
L
 
C
P
 
K
Q
 
N
L
 
I
Q
 
R
Q
 
T
L
 
N
G
 
G
N
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
A
L
 
L
F
 
V
I
 
L
S
 
S
V
|
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
T
 
L
S
 
S
I
 
V
A
 
G
T
 
T
Y
 
L
E
 
S
S
 
R
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
G
E
 
T
T
 
R
P
 
R
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
V
M
|
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
G
A
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
S
A
 
G
I
 
M
I
 
Y
G
 
A
N
 
E
A
 
A
S
 
E
A
 
V
S
 
S
A
 
E
D
 
T
D
 
D
V
 
R
I
 
R
R
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
R
L
 
I
L
 
M
K
 
K
A
 
S
I
 
V
G
 
G
Q
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
W
L
 
L
Q
 
D
S
 
D
E
 
E
A
 
E
Q
 
K
M
 
M
D
 
H
A
 
G
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
I
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
H
 
Y
L
 
L
I
 
L
E
 
D
T
 
A
L
 
L
A
 
Q
A
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
I
A
 
R
E
 
Q
G
 
G
L
 
F
P
 
D
A
 
M
E
 
A
L
 
E
A
 
A
M
 
R
Q
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
L
A
 
A
T
 
T
V
 
F
A
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
A
 
T
E
 
G
E
 
E
T
 
D
P
 
F
A
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
K
N
 
N
V
 
V
T
 
T
S
 
S
P
 
K
N
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
Q
 
H
A
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
F
M
 
-
D
 
-
E
 
R
D
 
R
N
 
H
G
 
R
F
 
V
P
 
A
P
 
E
L
 
A
L
 
I
R
 
S
R
 
E
A
 
G
V
 
V
A
 
C
A
 
A
A
 
C
S
 
V
N
 
R
R
 
R
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
L
 
M
S
 
E
R
 
R

5bshA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with l-proline (see paper)
36% identity, 96% coverage: 11:273/275 of query aligns to 11:272/272 of 5bshA

query
sites
5bshA
I
 
L
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
K
M
 
M
G
 
A
S
 
E
A
 
S
M
 
I
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
A
L
 
V
D
 
R
R
 
S
G
 
G
V
 
V
-
 
L
S
 
S
P
 
P
E
 
S
A
 
R
V
 
I
W
 
K
V
 
T
-
 
A
I
 
I
D
 
H
P
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
A
D
 
R
W
 
R
-
 
T
-
 
A
L
 
F
R
 
E
Q
 
S
T
 
I
G
 
G
V
 
I
H
 
T
I
 
V
N
 
L
A
 
S
P
 
S
L
 
N
P
 
D
E
 
D
A
 
V
G
 
V
A
 
R
D
 
D
A
 
S
P
 
-
G
 
N
I
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
F
A
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
G
 
K
E
 
D
A
 
V
L
 
V
P
 
L
Q
 
K
L
 
L
Q
 
K
Q
 
P
L
 
L
G
 
L
N
 
T
G
 
K
E
 
D
T
 
K
L
 
L
F
 
L
I
 
V
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
S
 
K
I
 
M
A
 
K
T
 
D
Y
 
L
E
 
Q
S
 
E
L
 
W
L
 
A
G
 
G
A
 
H
E
 
E
T
 
R
P
 
-
I
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
A
I
 
A
T
 
S
A
 
V
I
 
M
I
 
S
G
 
L
N
 
G
A
 
G
S
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
E
D
 
D
V
 
A
I
 
N
R
 
L
A
 
I
D
 
S
A
 
Q
L
 
L
L
 
F
K
 
G
A
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
K
T
 
I
V
 
W
R
 
K
L
 
-
Q
 
A
S
 
D
E
 
D
A
 
K
Q
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
|
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
Y
H
 
L
L
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
L
Q
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
Q
T
 
T
V
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
M
A
 
A
E
 
T
A
 
Q
A
 
S
E
 
G
E
 
K
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
 
D
V
|
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
|
G
T
|
T
T
|
T
Q
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
E
 
H
V
 
E
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
K
N
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
R
P
 
G
L
 
I
L
 
L
R
 
M
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
N
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
L
 
L
S
 
S

5bsgA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NADP+ (see paper)
36% identity, 96% coverage: 11:273/275 of query aligns to 11:272/272 of 5bsgA

query
sites
5bsgA
I
 
L
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
|
K
M
|
M
G
 
A
S
 
E
A
 
S
M
 
I
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
A
L
 
V
D
 
R
R
 
S
G
 
G
V
 
V
-
 
L
S
 
S
P
 
P
E
 
S
A
 
R
V
 
I
W
 
K
V
 
T
-
 
A
I
 
I
D
x
H
P
x
S
N
|
N
P
 
P
S
 
A
D
 
R
W
 
R
-
 
T
-
 
A
L
 
F
R
 
E
Q
 
S
T
 
I
G
 
G
V
 
I
H
 
T
I
 
V
N
 
L
A
 
S
P
 
S
L
x
N
P
 
D
E
 
D
A
 
V
G
 
V
A
 
R
D
 
D
A
 
S
P
 
-
G
 
N
I
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
F
A
x
S
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
Q
M
x
L
M
 
L
G
 
K
E
 
D
A
x
V
L
 
V
P
 
L
Q
 
K
L
 
L
Q
 
K
Q
 
P
L
 
L
G
 
L
N
 
T
G
 
K
E
 
D
T
 
K
L
 
L
F
 
L
I
 
V
S
 
S
V
|
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
T
 
I
S
 
K
I
 
M
A
 
K
T
 
D
Y
 
L
E
 
Q
S
 
E
L
 
W
L
 
A
G
 
G
A
 
H
E
 
E
T
 
R
P
 
-
I
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
V
M
|
M
P
|
P
N
|
N
T
|
T
P
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
A
I
 
A
T
 
S
A
 
V
I
 
M
I
 
S
G
 
L
N
 
G
A
 
G
S
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
E
D
 
D
V
 
A
I
 
N
R
 
L
A
 
I
D
 
S
A
 
Q
L
 
L
L
 
F
K
 
G
A
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
K
T
 
I
V
 
W
R
 
K
L
 
-
Q
 
A
S
 
D
E
 
D
A
 
K
Q
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
Y
H
 
L
L
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
L
Q
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
Q
T
 
T
V
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
M
A
 
A
E
 
T
A
 
Q
A
 
S
E
 
G
E
 
K
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
Q
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
E
 
H
V
 
E
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
K
N
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
R
P
 
G
L
 
I
L
 
L
R
 
M
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
N
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
L
 
L
S
 
S

5bsfA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NAD+ (see paper)
36% identity, 96% coverage: 11:273/275 of query aligns to 11:272/272 of 5bsfA

query
sites
5bsfA
I
 
L
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
|
K
M
|
M
G
 
A
S
 
E
A
 
S
M
 
I
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
A
L
 
V
D
 
R
R
 
S
G
 
G
V
 
V
-
 
L
S
 
S
P
 
P
E
 
S
A
 
R
V
 
I
W
 
K
V
 
T
-
 
A
I
 
I
D
x
H
P
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
A
D
 
R
W
 
R
-
 
T
-
 
A
L
 
F
R
 
E
Q
 
S
T
 
I
G
 
G
V
 
I
H
 
T
I
 
V
N
 
L
A
 
S
P
 
S
L
x
N
P
 
D
E
 
D
A
 
V
G
 
V
A
 
R
D
 
D
A
 
S
P
 
-
G
 
N
I
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
F
A
x
S
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
Q
M
x
L
M
 
L
G
 
K
E
 
D
A
x
V
L
 
V
P
 
L
Q
 
K
L
 
L
Q
 
K
Q
 
P
L
 
L
G
 
L
N
 
T
G
 
K
E
 
D
T
 
K
L
 
L
F
 
L
I
 
V
S
 
S
V
|
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
T
 
I
S
 
K
I
 
M
A
 
K
T
 
D
Y
 
L
E
 
Q
S
 
E
L
 
W
L
 
A
G
 
G
A
 
H
E
 
E
T
 
R
P
 
-
I
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
|
P
N
|
N
T
|
T
P
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
A
I
 
A
T
 
S
A
 
V
I
 
M
I
 
S
G
 
L
N
 
G
A
 
G
S
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
E
D
 
D
V
 
A
I
 
N
R
 
L
A
 
I
D
 
S
A
 
Q
L
 
L
L
 
F
K
 
G
A
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
K
T
 
I
V
 
W
R
 
K
L
 
-
Q
 
A
S
 
D
E
 
D
A
 
K
Q
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
Y
H
 
L
L
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
L
Q
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
Q
T
 
T
V
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
M
A
 
A
E
 
T
A
 
Q
A
 
S
E
 
G
E
 
K
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
Q
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
E
 
H
V
 
E
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
K
N
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
R
P
 
G
L
 
I
L
 
L
R
 
M
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
N
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
L
 
L
S
 
S

5bseA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) (see paper)
36% identity, 96% coverage: 11:273/275 of query aligns to 11:272/272 of 5bseA

query
sites
5bseA
I
 
L
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
K
M
 
M
G
 
A
S
 
E
A
 
S
M
 
I
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
A
L
 
V
D
 
R
R
 
S
G
 
G
V
 
V
-
 
L
S
 
S
P
 
P
E
 
S
A
 
R
V
 
I
W
 
K
V
 
T
-
 
A
I
 
I
D
 
H
P
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
A
D
 
R
W
 
R
-
 
T
-
 
A
L
 
F
R
 
E
Q
 
S
T
 
I
G
 
G
V
 
I
H
 
T
I
 
V
N
 
L
A
 
S
P
 
S
L
 
N
P
 
D
E
 
D
A
 
V
G
 
V
A
 
R
D
 
D
A
 
S
P
 
-
G
 
N
I
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
F
A
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
G
 
K
E
 
D
A
 
V
L
 
V
P
 
L
Q
 
K
L
 
L
Q
 
K
Q
 
P
L
 
L
G
 
L
N
 
T
G
 
K
E
 
D
T
 
K
L
 
L
F
 
L
I
 
V
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
I
S
 
K
I
 
M
A
 
K
T
 
D
Y
 
L
E
 
Q
S
 
E
L
 
W
L
 
A
G
 
G
A
 
H
E
 
E
T
 
R
P
 
-
I
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
A
I
 
A
T
 
S
A
 
V
I
 
M
I
 
S
G
 
L
N
 
G
A
 
G
S
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
E
D
 
D
V
 
A
I
 
N
R
 
L
A
 
I
D
 
S
A
 
Q
L
 
L
L
 
F
K
 
G
A
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
K
T
 
I
V
 
W
R
 
K
L
 
-
Q
 
A
S
 
D
E
 
D
A
 
K
Q
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
F
 
Y
H
 
L
L
 
A
I
 
I
E
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
L
Q
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
S
A
 
Q
T
 
T
V
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
S
L
 
M
A
 
A
E
 
T
A
 
Q
A
 
S
E
 
G
E
 
K
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
Q
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
E
 
H
V
 
E
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
K
N
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
R
P
 
G
L
 
I
L
 
L
R
 
M
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
A
N
 
K
R
 
R
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
L
 
L
S
 
S

2rcyA Crystal structure of plasmodium falciparum pyrroline carboxylate reductase (mal13p1.284) with NADP bound
31% identity, 95% coverage: 10:270/275 of query aligns to 6:258/262 of 2rcyA

query
sites
2rcyA
R
 
K
I
 
L
A
 
G
L
 
F
L
 
M
G
|
G
C
x
L
G
|
G
K
x
Q
M
|
M
G
 
G
S
 
S
A
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
H
G
 
G
W
 
I
L
 
A
D
 
N
R
 
A
G
 
N
V
 
I
-
 
I
S
 
K
P
 
K
E
 
E
A
 
N
V
 
L
W
 
F
V
 
Y
I
x
Y
D
 
G
P
|
P
N
x
S
P
 
K
S
 
-
D
 
-
W
 
-
L
 
-
R
x
K
Q
 
N
T
 
T
G
 
T
V
 
L
H
 
N
I
 
Y
N
 
M
A
 
S
P
 
S
L
x
N
P
 
E
E
 
E
A
 
L
G
 
-
A
 
A
D
 
R
A
 
H
P
 
C
G
 
D
I
 
I
V
 
I
L
 
V
I
 
C
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
D
M
x
I
M
 
A
G
 
G
E
 
S
A
x
V
L
 
L
P
 
N
Q
 
N
L
 
I
Q
 
K
Q
 
P
L
 
Y
G
 
L
N
 
S
G
 
S
E
 
K
T
 
-
L
 
L
F
 
L
I
 
I
S
 
S
V
x
I
A
x
C
A
x
G
G
 
G
T
 
L
S
 
N
I
 
I
A
 
G
T
 
K
Y
 
L
E
 
E
S
 
E
L
 
M
L
 
V
G
 
G
A
 
S
E
 
E
T
 
N
P
 
K
I
 
I
V
 
V
R
 
W
A
 
V
M
|
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
C
A
 
L
V
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
G
I
 
S
T
 
F
A
 
I
I
 
Y
I
 
C
G
 
S
N
 
N
A
 
K
S
 
N
A
 
V
S
 
N
A
 
S
D
 
T
D
 
D
V
 
K
I
 
K
R
 
Y
A
 
V
D
 
N
A
 
D
L
 
I
L
 
F
K
 
N
A
 
S
I
 
C
G
 
G
Q
 
I
T
 
I
V
 
H
R
 
E
L
 
I
Q
 
K
S
 
-
E
 
E
A
 
K
Q
 
D
M
 
M
D
 
D
A
 
I
V
 
A
T
 
T
G
 
A
V
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
F
 
Y
H
 
L
L
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
S
L
 
L
A
 
I
A
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
V
A
 
K
E
 
N
G
 
G
L
 
L
P
 
S
A
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
S
M
 
K
Q
 
N
L
 
L
A
 
V
K
 
L
A
 
Q
T
 
T
V
 
I
A
x
K
G
 
G
A
 
S
G
x
V
A
 
E
L
 
M
A
 
V
E
 
K
A
 
K
A
 
S
E
 
D
E
 
Q
T
 
P
P
 
V
A
 
Q
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
|
N
V
x
I
T
 
V
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
I
T
 
T
Q
 
A
A
 
V
A
 
G
L
 
L
E
 
Y
V
 
S
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
K
N
 
N
G
 
S
F
 
F
P
 
K
P
 
Y
L
 
T
L
 
V
R
 
M
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
C
N
 
E
R
 
K
S
 
S
K
 
K

6xp1B Structure of human pycr1 complexed with l-thiazolidine-2-carboxylate (see paper)
33% identity, 95% coverage: 11:272/275 of query aligns to 9:274/281 of 6xp1B

query
sites
6xp1B
I
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
Q
M
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
D
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
S
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
I
 
M
D
 
D
P
 
L
N
 
A
P
 
T
S
 
V
D
 
S
W
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
T
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
L
N
 
T
A
 
-
P
 
P
L
 
H
P
 
N
E
 
K
A
 
E
G
 
T
A
 
V
D
 
Q
A
 
H
P
 
S
G
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
A
 
I
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
L
 
I
Q
 
G
Q
 
A
L
 
D
G
 
I
N
 
E
G
 
D
E
 
R
T
 
H
L
 
I
F
 
V
I
 
V
S
 
S
V
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
I
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
A
 
A
E
 
F
T
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
V
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
I
 
A
G
 
T
N
 
G
A
 
T
S
 
H
A
 
A
S
 
Q
A
 
V
D
 
E
D
 
D
V
 
G
I
 
R
R
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
S
A
 
S
I
 
V
G
 
G
Q
 
F
T
 
C
V
 
T
R
 
E
L
 
V
Q
 
E
S
 
-
E
 
E
A
 
D
Q
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
H
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
K
E
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
K
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
A
 
L
E
 
L
A
 
H
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
R
P
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
L
 
L

5uavA Structure of human pycr-1 complexed with NADPH and l-tetrahydrofuroic acid (see paper)
33% identity, 95% coverage: 11:272/275 of query aligns to 7:272/278 of 5uavA

query
sites
5uavA
I
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
D
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
x
S
S
|
S
P
|
P
E
x
D
A
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
I
 
M
D
 
D
P
 
L
N
 
A
P
 
T
S
 
V
D
 
S
W
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
T
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
L
N
 
T
A
 
-
P
 
P
L
 
H
P
x
N
E
 
K
A
 
E
G
 
T
A
 
V
D
 
Q
A
 
H
P
 
S
G
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
F
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
M
x
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
A
x
I
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
L
 
I
Q
 
G
Q
 
A
L
 
D
G
 
I
N
 
E
G
 
D
E
 
R
T
 
H
L
 
I
F
 
V
I
 
V
S
 
S
V
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
I
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
A
 
A
E
 
F
T
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
V
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
I
 
A
G
 
T
N
 
G
A
 
T
S
 
H
A
 
A
S
 
Q
A
 
V
D
 
E
D
 
D
V
 
G
I
 
R
R
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
S
A
 
S
I
 
V
G
 
G
Q
 
F
T
 
C
V
 
T
R
 
E
L
 
V
Q
 
E
S
 
-
E
 
E
A
 
D
Q
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
H
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
K
E
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
K
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
A
 
L
E
 
L
A
 
H
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
R
P
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
L
 
L

2izzA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase
33% identity, 95% coverage: 11:272/275 of query aligns to 4:269/272 of 2izzA

query
sites
2izzA
I
 
V
A
 
G
L
 
F
L
x
I
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
D
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
x
S
S
|
S
P
|
P
E
 
D
A
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
I
 
M
D
 
D
P
x
L
N
 
A
P
 
T
S
 
V
D
 
S
W
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
T
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
L
N
 
T
A
 
-
P
 
P
L
 
H
P
x
N
E
 
K
A
 
E
G
 
T
A
 
V
D
 
Q
A
 
H
P
 
S
G
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
F
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
M
x
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
A
x
I
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
L
 
I
Q
 
G
Q
 
A
L
 
D
G
 
I
N
 
E
G
 
D
E
 
R
T
 
H
L
 
I
F
 
V
I
 
V
S
 
S
V
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
I
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
A
 
A
E
 
F
T
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
V
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
I
 
A
G
 
T
N
 
G
A
 
T
S
 
H
A
 
A
S
 
Q
A
 
V
D
 
E
D
 
D
V
 
G
I
 
R
R
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
S
A
 
S
I
 
V
G
 
G
Q
 
F
T
 
C
V
 
T
R
 
E
L
 
V
Q
 
E
S
 
-
E
 
E
A
 
D
Q
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
H
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
K
E
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
K
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
A
 
L
E
 
L
A
 
H
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
|
N
V
|
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
R
P
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
L
 
L

5uatC Structure of human pycr-1 complexed with NADPH (see paper)
33% identity, 95% coverage: 11:272/275 of query aligns to 7:272/277 of 5uatC

query
sites
5uatC
I
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
x
Q
M
x
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
D
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
x
S
S
|
S
P
|
P
E
x
D
A
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
I
x
M
D
 
D
P
 
L
N
 
A
P
 
T
S
 
V
D
 
S
W
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
T
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
L
N
 
T
A
 
-
P
 
P
L
 
H
P
x
N
E
 
K
A
 
E
G
 
T
A
 
V
D
 
Q
A
 
H
P
 
S
G
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
F
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
M
x
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
A
x
I
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
L
 
I
Q
 
G
Q
 
A
L
 
D
G
 
I
N
 
E
G
 
D
E
 
R
T
 
H
L
 
I
F
 
V
I
 
V
S
 
S
V
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
I
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
A
 
A
E
 
F
T
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
V
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
I
 
A
G
 
T
N
 
G
A
 
T
S
 
H
A
 
A
S
 
Q
A
 
V
D
 
E
D
 
D
V
 
G
I
 
R
R
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
S
A
 
S
I
 
V
G
 
G
Q
 
F
T
 
C
V
 
T
R
 
E
L
 
V
Q
 
E
S
 
-
E
 
E
A
 
D
Q
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
H
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
K
E
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
K
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
A
 
L
E
 
L
A
 
H
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
R
P
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
L
 
L

6xp3A Structure of human pycr1 complexed with cyclopentanecarboxylic acid (see paper)
33% identity, 95% coverage: 11:272/275 of query aligns to 6:271/276 of 6xp3A

query
sites
6xp3A
I
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
Q
M
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
D
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
S
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
I
 
M
D
 
D
P
 
L
N
 
A
P
 
T
S
 
V
D
 
S
W
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
T
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
L
N
 
T
A
 
-
P
 
P
L
 
H
P
 
N
E
 
K
A
 
E
G
 
T
A
 
V
D
 
Q
A
 
H
P
 
S
G
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
A
 
I
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
L
 
I
Q
 
G
Q
 
A
L
 
D
G
 
I
N
 
E
G
 
D
E
 
R
T
 
H
L
 
I
F
 
V
I
 
V
S
 
S
V
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
I
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
A
 
A
E
 
F
T
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
V
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
I
 
A
G
 
T
N
 
G
A
 
T
S
 
H
A
 
A
S
 
Q
A
 
V
D
 
E
D
 
D
V
 
G
I
 
R
R
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
S
A
 
S
I
 
V
G
 
G
Q
 
F
T
 
C
V
 
T
R
 
E
L
 
V
Q
 
E
S
 
-
E
 
E
A
 
D
Q
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
H
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
K
E
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
K
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
A
 
L
E
 
L
A
 
H
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
R
P
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
L
 
L

5uauA Structure of human pycr-1 complexed with proline (see paper)
33% identity, 95% coverage: 11:272/275 of query aligns to 3:268/274 of 5uauA

query
sites
5uauA
I
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
Q
M
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
D
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
S
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
I
 
M
D
 
D
P
 
L
N
 
A
P
 
T
S
 
V
D
 
S
W
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
T
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
L
N
 
T
A
 
-
P
 
P
L
 
H
P
 
N
E
 
K
A
 
E
G
 
T
A
 
V
D
 
Q
A
 
H
P
 
S
G
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
A
 
I
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
L
 
I
Q
 
G
Q
 
A
L
 
D
G
 
I
N
 
E
G
 
D
E
 
R
T
 
H
L
 
I
F
 
V
I
 
V
S
 
S
V
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
I
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
A
 
A
E
 
F
T
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
V
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
I
 
A
G
x
T
N
 
G
A
 
T
S
 
H
A
 
A
S
 
Q
A
 
V
D
 
E
D
 
D
V
 
G
I
 
R
R
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
S
A
 
S
I
 
V
G
 
G
Q
 
F
T
 
C
V
 
T
R
 
E
L
 
V
Q
x
E
S
 
-
E
|
E
A
 
D
Q
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
H
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
K
E
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
K
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
A
 
L
E
 
L
A
 
H
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
R
P
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
L
 
L

2graA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase complexed with NADP (see paper)
33% identity, 95% coverage: 11:272/275 of query aligns to 5:270/277 of 2graA

query
sites
2graA
I
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
Q
M
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
D
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
S
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
I
 
M
D
 
D
P
 
L
N
 
A
P
 
T
S
 
V
D
 
S
W
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
T
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
L
N
 
T
A
 
-
P
 
P
L
 
H
P
 
N
E
 
K
A
 
E
G
 
T
A
 
V
D
 
Q
A
 
H
P
 
S
G
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
A
 
I
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
L
 
I
Q
 
G
Q
 
A
L
 
D
G
 
I
N
 
E
G
 
D
E
 
R
T
 
H
L
 
I
F
 
V
I
 
V
S
 
S
V
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
I
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
A
 
A
E
 
F
T
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
V
 
V
G
x
R
R
x
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
I
 
A
G
 
T
N
 
G
A
 
T
S
 
H
A
 
A
S
 
Q
A
 
V
D
 
E
D
 
D
V
 
G
I
 
R
R
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
x
S
A
x
S
I
 
V
G
|
G
Q
x
F
T
 
C
V
 
T
R
 
E
L
 
V
Q
 
E
S
 
-
E
 
E
A
 
D
Q
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
H
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
K
E
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
K
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
A
 
L
E
x
L
A
x
H
A
x
S
E
|
E
E
 
Q
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
R
P
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
L
 
L

2gr9A Crystal structure of p5cr complexed with nadh (see paper)
33% identity, 95% coverage: 11:272/275 of query aligns to 5:270/277 of 2gr9A

query
sites
2gr9A
I
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
Q
M
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
D
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
S
S
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
I
 
M
D
 
D
P
 
L
N
 
A
P
 
T
S
 
V
D
 
S
W
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
T
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
L
N
 
T
A
 
-
P
 
P
L
 
H
P
 
N
E
 
K
A
 
E
G
 
T
A
 
V
D
 
Q
A
 
H
P
 
S
G
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
A
 
I
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
L
 
I
Q
 
G
Q
 
A
L
 
D
G
 
I
N
 
E
G
 
D
E
 
R
T
 
H
L
 
I
F
 
V
I
 
V
S
 
S
V
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
I
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
A
 
A
E
 
F
T
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
V
 
V
G
x
R
R
x
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
I
 
A
G
 
T
N
 
G
A
 
T
S
 
H
A
 
A
S
 
Q
A
 
V
D
 
E
D
 
D
V
 
G
I
 
R
R
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
x
S
A
x
S
I
 
V
G
|
G
Q
x
F
T
 
C
V
 
T
R
 
E
L
 
V
Q
 
E
S
 
-
E
 
E
A
 
D
Q
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
H
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
K
E
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
K
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
A
 
L
E
x
L
A
x
H
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
V
 
V
L
 
L
M
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
R
P
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
S
 
C
N
 
I
R
 
R
S
 
T
K
 
R
E
 
E
L
 
L

6xp0A Structure of human pycr1 complexed with n-formyl l-proline (see paper)
33% identity, 95% coverage: 11:272/275 of query aligns to 5:267/272 of 6xp0A

query
sites
6xp0A
I
 
V
A
 
G
L
 
F
L
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
Q
M
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
F
L
 
T
D
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
S
 
A
P
 
A
E
 
H
A
 
K
V
 
I
W
 
M
V
 
A
I
 
S
D
 
S
P
 
P
N
 
L
P
 
A
S
 
T
-
 
V
D
 
S
W
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
T
 
M
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
L
N
 
T
A
 
-
P
 
P
L
 
H
P
 
N
E
 
K
A
 
E
G
 
T
A
 
V
D
 
Q
A
 
H
P
 
S
G
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
M
 
I
M
 
I
G
 
P
E
 
F
A
 
I
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
L
 
I
Q
 
G
Q
 
A
L
 
D
G
 
I
N
 
E
G
 
D
E
 
R
T
 
H
L
 
I
F
 
V
I
 
V
S
 
S
V
 
C
A
 
A
A
|
A
G
 
G
T
 
V
S
 
T
I
 
I
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
E
 
E
S
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
S
A
 
A
E
 
F
T
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
V
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
I
 
A
G
 
T
N
 
G
A
 
T
S
 
H
A
 
A
S
 
Q
A
 
V
D
 
E
D
 
D
V
 
G
I
 
R
R
 
L
A
 
M
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
K
 
S
A
 
S
I
 
V
G
 
G
Q
 
F
T
 
C
V
 
T
R
 
E
L
 
V
Q
 
E
S
 
-
E
 
E
A
 
D
Q
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
G
 
G
V
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
H
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
A
 
K
E
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
R
E
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
G
K
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
K
L
 
M
A
 
L
E
 
L
A
 
H
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
T
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
V
 
D
N
 
N
V
|
V
T