SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2557 FitnessBrowser__WCS417:GFF2557 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8gy3A Cryo-em structure of membrane-bound aldehyde dehydrogenase from gluconobacter oxydans
43% identity, 34% coverage: 767:1170/1175 of query aligns to 8:429/440 of 8gy3A

query
sites
8gy3A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
Y
A
 
A
W
 
W
P
 
-
F
 
-
H
 
Y
A
 
P
E
 
A
I
 
I
P
 
A
P
 
P
I
 
I
A
 
P
P
 
R
P
 
P
S
 
A
A
 
A
G
 
S
T
 
S
W
 
F
S
 
S
K
 
A
A
 
D
T
 
A
L
 
I
E
 
S
R
 
R
G
 
G
R
 
E
L
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
N
V
 
G
G
 
G
D
x
Y
C
|
C
A
 
A
V
x
E
C
|
C
H
|
H
T
 
T
A
 
R
P
 
V
G
 
D
G
 
G
A
 
K
T
 
P
N
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
D
L
 
F
A
 
K
M
 
M
Q
 
A
T
|
T
P
 
P
F
|
F
G
 
G
T
 
D
L
 
I
Y
 
F
S
 
S
S
|
S
N
 
N
I
|
I
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
E
K
 
E
T
 
W
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
N
W
|
W
S
 
S
Y
 
L
P
 
A
A
 
A
F
|
F
E
 
K
R
 
R
A
 
A
M
 
M
R
 
N
D
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
A
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
S
N
 
Q
L
|
L
Y
|
Y
P
|
P
A
 
A
F
|
F
P
 
P
Y
 
F
T
 
D
A
 
H
F
|
F
R
 
T
N
 
K
I
 
V
N
 
S
E
 
D
A
 
Q
D
 
D
M
 
V
Q
 
S
A
 
D
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
S
 
T
Q
 
R
V
 
P
P
 
A
V
 
V
S
 
H
Q
 
L
A
 
K
P
 
P
T
 
R
P
 
D
N
 
N
A
 
T
M
 
V
R
 
P
F
 
F
P
 
P
F
x
I
N
 
N
I
 
I
R
|
R
P
 
L
L
 
I
M
x
G
A
x
Q
G
 
G
-
x
F
W
|
W
N
 
K
A
 
L
L
 
L
N
 
F
L
 
F
R
 
T
R
 
P
G
 
G
E
 
R
I
 
Y
S
 
Q
P
 
N
Q
 
D
P
 
P
E
 
K
R
 
H
S
 
D
E
 
A
Q
 
Q
W
 
W
N
 
N
R
 
R
G
 
G
N
 
A
Y
 
Y
L
 
L
V
 
A
N
 
E
G
 
G
L
 
N
G
 
E
H
|
H
C
|
C
A
 
G
A
 
A
C
|
C
H
|
H
S
 
T
P
 
P
R
|
R
N
 
N
L
 
L
M
x
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
K
 
K
G
 
-
G
 
M
K
 
S
S
 
S
F
 
V
L
 
Y
A
 
D
G
 
G
G
 
A
T
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
G
W
 
W
E
 
I
A
|
A
P
|
P
A
 
P
L
|
L
N
 
N
G
 
D
L
 
H
S
 
N
K
 
P
A
 
T
S
 
P
T
 
V
P
 
V
W
|
W
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
T
 
Q
Y
|
Y
L
|
L
S
 
R
T
 
F
G
 
G
Y
 
V
S
 
A
D
 
P
A
 
L
H
 
H
G
|
G
V
x
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
|
M
G
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
P
S
 
H
E
 
R
-
 
F
L
 
L
S
 
S
K
 
K
L
 
I
P
 
P
K
 
E
A
 
E
D
 
D
I
 
V
R
 
H
A
 
A
M
 
I
A
 
A
V
 
H
Y
 
Y
L
x
Y
A
 
A
S
 
D
L
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
R
-
 
S
K
 
S
G
 
G
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
I
A
 
T
P
 
R
A
 
A
V
 
M
T
 
Q
A
 
M
A
 
S
N
 
G
V
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
T
-
 
G
P
 
P
N
 
Q
P
 
P
-
 
L
-
 
D
D
 
E
G
 
D
R
 
A
R
 
R
V
 
L
F
 
Y
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
C
|
C
K
 
G
A
 
A
C
|
C
H
|
H
A
 
Y
D
 
N
G
 
S
L
 
-
G
 
G
P
 
P
K
 
N
L
 
P
F
 
V
G
 
L
V
 
G
S
 
R
P
|
P
S
 
E
F
x
L
A
 
A
T
 
L
N
|
N
T
x
N
N
 
A
V
 
L
H
 
W
S
 
L
D
 
D
Q
 
E
P
 
P
D
 
N
N
 
N
L
 
L
I
 
Y
K
 
Q
V
|
V
I
 
M
L
 
L
Q
 
H
G
 
G
I
|
I
S
 
T
K
 
A
P
 
E
A
 
E
T
x
G
Q
|
Q
D
 
D
L
 
H
G
x
I
Y
 
S
M
|
M
P
 
P
G
 
S
F
|
F
K
 
Y
D
 
S
S
 
G
L
 
L
S
 
S
N
 
D
S
 
H
Q
 
D
V
 
M
A
 
A
D
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R
A
 
-
Q
 
R
F
 
T
A
 
R
P
 
T
N
 
T
A
 
L
P
 
P
Q
 
P
W
 
W
K
 
T
G
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
K
K
 
K
V
 
A
A
 
A
H
 
S
L
 
A
R
 
R
A
 
A

7w2jC Cryo-em structure of membrane-bound fructose dehydrogenase from gluconobacter japonicus
37% identity, 30% coverage: 797:1151/1175 of query aligns to 1:370/418 of 7w2jC

query
sites
7w2jC
L
 
I
E
 
S
R
 
R
G
 
G
R
 
H
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
A
 
I
V
 
A
G
 
A
D
 
D
C
|
C
A
 
A
V
 
A
C
|
C
H
|
H
T
 
T
-
 
N
A
 
G
P
 
R
G
 
D
G
 
G
A
 
Q
T
 
F
N
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
M
 
I
Q
 
S
T
 
S
P
 
P
F
 
M
G
 
G
T
 
N
L
 
I
Y
 
Y
S
 
S
S
x
T
N
 
N
I
|
I
T
 
T
P
 
P
D
 
S
V
 
K
K
 
T
T
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
N
W
x
Y
S
 
T
Y
 
L
P
 
E
A
 
Q
F
 
F
E
 
S
R
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
R
R
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
A
N
 
Q
L
|
L
Y
|
Y
P
 
P
A
|
A
F
x
M
P
 
P
Y
 
Y
T
 
D
A
 
A
F
 
Y
R
 
N
N
 
R
I
 
L
N
 
T
E
 
D
A
 
E
D
 
D
M
 
V
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
M
 
M
S
 
T
Q
 
E
V
 
V
P
 
K
V
 
P
S
 
V
Q
 
D
A
 
A
P
 
P
T
 
S
P
 
P
N
 
K
A
 
T
-
 
Q
M
 
L
R
 
P
F
 
F
P
 
P
F
 
F
N
 
S
I
 
I
R
|
R
P
 
A
L
 
S
M
 
L
A
 
G
G
 
I
W
 
W
N
 
K
-
 
I
A
 
A
L
 
A
N
 
R
L
 
I
R
 
E
R
 
G
G
 
K
E
 
P
I
 
Y
S
 
V
P
 
F
Q
 
D
P
 
H
E
 
T
R
 
H
S
 
N
E
 
D
Q
 
D
W
 
W
N
 
N
R
 
R
G
 
G
N
 
R
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
D
G
 
E
L
 
L
G
 
A
H
|
H
C
|
C
A
 
G
A
 
E
C
|
C
H
|
H
S
 
T
P
 
P
R
 
R
N
 
N
L
 
F
M
 
L
G
 
L
A
 
A
E
 
P
K
 
N
G
 
-
G
 
Q
K
 
S
S
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
A
T
 
D
V
 
I
D
 
G
G
 
S
W
 
W
E
 
R
A
|
A
P
|
P
A
 
N
L
 
I
N
 
T
G
 
N
L
 
A
S
 
P
K
 
Q
A
 
S
S
 
G
T
 
I
-
 
G
P
 
S
W
 
W
T
 
S
E
 
D
D
 
Q
Q
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
S
 
K
T
 
T
G
 
G
Y
 
K
S
 
T
D
 
-
A
 
A
H
 
H
G
 
A
V
x
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
P
|
P
M
|
M
G
 
A
P
 
E
V
 
A
V
 
I
S
 
E
E
 
H
-
 
S
L
 
L
S
 
Q
K
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
R
 
S
A
 
A
M
 
I
A
 
V
V
 
T
Y
 
Y
L
 
L
A
 
R
S
 
S
L
 
V
K
 
P
G
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
E
A
 
S
E
 
G
A
 
Q
P
 
T
A
 
V
V
 
A
T
 
N
A
 
F
A
 
E
N
 
H
V
 
A
P
 
G
N
 
R
P
 
P
-
 
S
-
 
S
-
 
Y
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
A
R
 
A
V
 
L
F
 
Y
E
 
E
G
 
A
A
x
V
C
|
C
K
 
A
A
 
S
C
|
C
H
|
H
-
 
Q
A
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
K
G
 
G
P
 
S
K
 
K
L
 
-
F
 
D
G
 
G
V
x
Y
S
x
Y
P
|
P
S
 
S
F
x
L
A
 
V
T
 
G
N
|
N
T
|
T
N
x
T
V
 
T
H
 
G
S
 
Q
D
 
L
Q
 
N
P
 
P
D
 
N
N
x
D
L
 
L
I
 
I
K
 
A
V
 
S
I
|
I
L
 
L
Q
 
Y
G
 
G
I
x
V
S
 
D
K
x
R
P
 
T
A
 
T
T
 
D
Q
 
N
D
 
H
L
 
E
G
x
I
Y
 
L
M
|
M
P
|
P
G
 
A
F
|
F
-
 
G
K
 
P
D
 
D
S
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
P
L
 
L
S
 
T
N
 
D
S
 
E
Q
 
Q
V
 
I
A
 
A
D
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
D
Y
 
Y
L
 
V
R
 
L
A
 
S
Q
 
H
F
 
F

8jejC Cryo-em structure of na-dithionite reduced membrane-bound fructose dehydrogenase from gluconobacter japonicus
36% identity, 30% coverage: 797:1151/1175 of query aligns to 1:384/413 of 8jejC

query
sites
8jejC
L
 
I
E
 
S
R
 
R
G
 
G
R
 
H
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
A
 
I
V
 
A
G
 
A
D
 
D
C
|
C
A
 
A
V
 
A
C
|
C
H
|
H
T
 
T
-
 
N
A
 
G
P
 
R
G
 
D
G
 
G
A
 
Q
T
 
F
N
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
M
 
I
Q
 
S
T
 
S
P
 
P
F
x
M
G
 
G
T
 
N
L
 
I
Y
 
Y
S
 
S
S
x
T
N
 
N
I
|
I
T
 
T
P
 
P
D
 
S
V
 
K
K
 
T
T
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
N
W
 
Y
S
 
T
Y
 
L
P
 
E
A
 
Q
F
|
F
E
 
S
R
 
K
A
 
A
M
x
L
R
 
R
D
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
R
R
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
A
N
 
Q
L
|
L
Y
|
Y
P
|
P
A
 
A
F
x
M
P
|
P
Y
 
Y
T
 
D
A
 
A
F
x
Y
R
 
N
N
 
R
I
 
L
N
 
T
E
 
D
A
 
E
D
 
D
M
 
V
Q
 
K
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
M
 
M
S
 
T
Q
 
E
V
 
V
P
 
K
V
 
P
S
 
V
Q
 
D
A
 
A
P
 
P
T
 
S
P
 
P
N
 
K
A
 
T
-
 
Q
M
 
L
R
 
P
F
 
F
P
 
P
F
 
F
N
 
S
I
 
I
R
|
R
P
 
A
L
x
S
M
 
L
A
 
G
G
 
I
W
|
W
N
 
K
-
 
I
A
 
A
L
 
A
N
 
R
L
 
I
R
 
E
R
 
G
G
 
K
E
 
P
I
 
Y
S
 
V
P
 
F
Q
 
D
P
 
H
E
 
T
R
 
H
S
 
N
E
 
D
Q
 
D
W
 
W
N
 
N
R
 
R
G
 
G
N
 
R
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
D
G
 
E
L
 
L
G
 
A
H
 
H
C
|
C
A
 
G
A
 
E
C
|
C
H
|
H
S
 
T
P
 
P
R
 
R
N
 
N
L
 
F
M
 
L
G
x
L
A
 
A
E
 
P
K
 
N
G
 
-
G
 
Q
K
 
S
S
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
A
T
 
D
V
x
I
D
 
G
G
 
S
W
|
W
E
 
R
A
|
A
P
|
P
A
 
N
L
x
I
-
 
T
N
 
N
G
 
A
L
 
P
S
 
Q
K
 
S
A
 
G
S
 
I
T
 
G
P
 
S
W
|
W
T
 
S
E
 
D
D
 
Q
Q
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
Q
Y
|
Y
L
 
L
S
 
K
T
 
T
G
 
G
Y
 
K
S
 
T
D
 
-
A
 
A
H
 
H
G
 
A
V
x
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
|
M
G
 
A
P
 
E
V
 
A
V
 
I
S
 
E
E
 
H
-
 
S
L
 
L
S
 
Q
K
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
R
 
S
A
 
A
M
 
I
A
 
V
V
 
T
Y
 
Y
L
 
L
A
 
R
S
 
S
L
 
V
K
 
P
G
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
E
A
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
V
-
 
A
-
 
N
-
 
F
-
 
E
E
 
H
A
 
A
P
 
G
A
 
R
V
 
P
T
 
S
A
 
S
A
 
Y
N
 
S
V
 
V
P
 
A
N
 
N
P
 
A
D
 
N
G
 
S
R
 
R
R
 
R
-
 
S
-
 
N
-
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
T
-
 
T
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
A
V
 
L
F
 
Y
E
 
E
G
 
A
A
x
V
C
|
C
K
 
A
A
 
S
C
|
C
H
|
H
-
 
Q
A
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
K
G
 
G
P
 
S
K
 
K
L
 
-
F
 
D
G
 
G
V
 
Y
S
x
Y
P
|
P
S
 
S
F
x
L
A
 
V
T
 
G
N
 
N
T
|
T
N
x
T
V
 
T
H
 
G
S
 
Q
D
 
L
Q
 
N
P
 
P
D
 
N
N
x
D
L
 
L
I
 
I
K
 
A
V
 
S
I
|
I
L
 
L
Q
 
Y
G
 
G
I
x
V
S
 
D
K
x
R
P
 
T
A
 
T
T
 
D
Q
 
N
D
 
H
L
 
E
G
x
I
Y
 
L
M
|
M
P
 
P
G
 
A
F
|
F
-
 
G
K
 
P
D
 
D
S
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
P
L
 
L
S
 
T
N
 
D
S
 
E
Q
 
Q
V
 
I
A
 
A
D
 
T
L
x
I
A
 
A
A
 
D
Y
 
Y
L
 
V
R
 
L
A
 
S
Q
 
H
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Q47945 Alcohol dehydrogenase (quinone), cytochrome c subunit; ADH; Alcohol dehydrogenase (quinone), subunit II; Cytochrome c-553; Cytochrome c553; Ethanol:Q2 reductase; G3-ADH subunit II; Quinohemoprotein-cytochrome c complex; Ubiquinol oxidase; EC 1.1.5.5 from Gluconobacter oxydans (strain 621H) (Gluconobacter suboxydans) (see paper)
35% identity, 31% coverage: 794:1156/1175 of query aligns to 41:422/478 of Q47945

query
sites
Q47945
K
 
E
A
 
A
T
 
L
L
 
I
E
 
K
R
 
R
G
 
G
R
 
E
L
 
Y
L
 
V
A
 
A
A
 
R
V
 
L
G
 
S
D
 
D
C
 
C
A
 
I
V
 
A
C
 
C
H
 
H
T
 
T
A
 
A
P
 
L
G
 
H
G
 
G
A
 
Q
T
 
P
N
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
E
M
 
I
Q
 
K
T
 
S
P
 
P
F
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
I
Y
 
Y
S
 
S
S
 
T
N
 
N
I
 
I
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
P
K
 
E
T
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
N
W
 
Y
S
 
T
Y
 
L
P
 
E
A
 
D
F
 
F
E
 
T
R
 
K
A
 
A
M
 
L
R
 
R
D
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
R
R
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
A
N
 
T
L
 
V
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
F
 
M
P
 
P
Y
 
Y
T
 
P
A
 
E
F
 
F
R
 
A
N
 
R
I
 
L
N
 
S
E
 
D
A
 
D
D
 
D
M
 
I
Q
 
R
A
 
A
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
F
L
 
F
M
 
M
S
 
H
Q
 
G
V
 
V
-
 
K
P
 
P
V
 
V
S
 
A
Q
 
L
A
 
Q
P
 
N
T
 
K
P
 
A
N
 
P
A
 
D
M
 
I
R
 
S
F
 
W
P
 
P
F
 
L
N
 
S
I
 
M
R
 
R
P
 
W
L
 
P
M
 
L
A
 
G
G
 
M
W
 
W
N
 
R
A
 
A
L
 
M
N
 
F
L
 
V
R
 
P
R
 
-
G
 
-
E
 
S
I
 
M
S
 
T
P
 
P
Q
 
G
P
 
V
E
 
D
R
 
K
S
 
S
-
 
I
-
 
S
-
 
D
E
 
P
Q
 
E
W
 
V
N
 
A
R
 
R
G
 
G
N
 
E
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
G
 
G
L
 
P
G
 
G
H
 
H
C
 
C
A
 
G
A
 
E
C
 
C
H
 
H
S
 
T
P
 
P
R
 
R
N
 
G
L
 
F
M
 
G
G
 
M
A
 
Q
E
 
V
K
 
K
-
 
A
-
 
Y
-
 
G
-
 
T
-
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
N
S
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
A
-
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
N
W
 
W
E
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
N
 
R
G
 
S
L
 
N
S
 
S
K
 
D
A
 
T
S
 
G
T
 
L
P
 
G
-
 
R
W
 
W
T
 
S
E
 
E
D
 
D
Q
 
D
L
 
I
F
 
V
T
 
T
Y
 
F
L
 
L
S
 
K
T
 
S
G
 
G
Y
 
R
S
 
I
D
 
D
A
 
H
H
 
S
G
 
A
V
 
V
A
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
M
M
 
A
G
 
D
P
 
V
V
 
V
V
 
A
S
 
Y
E
 
S
L
 
T
S
 
Q
K
 
H
L
 
W
P
 
S
K
 
D
A
 
D
D
 
D
I
 
L
R
 
R
A
 
A
M
 
T
A
 
A
V
 
K
Y
 
Y
L
 
L
A
 
K
S
 
S
L
 
M
K
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
L
G
 
G
D
 
Q
A
 
D
A
 
D
A
 
G
E
 
Q
A
 
T
P
 
T
A
 
A
V
 
L
T
 
L
A
 
N
A
 
K
N
 
G
V
 
G
P
 
Q
N
 
G
P
 
N
D
 
A
G
 
G
R
 
A
R
 
E
V
 
V
F
 
Y
E
 
L
G
 
H
A
 
N
C
 
C
K
 
A
A
 
I
C
 
C
H
 
H
A
 
M
-
 
N
D
 
D
G
 
G
L
 
T
G
 
G
-
 
V
P
 
N
K
 
R
L
 
M
F
 
F
G
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
P
S
 
P
F
 
L
A
 
A
T
 
G
N
 
N
T
 
P
N
 
V
V
 
V
H
 
I
S
 
T
D
 
D
Q
 
D
P
 
P
D
 
T
N
 
S
L
 
L
I
 
A
K
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
A
Q
 
F
G
 
G
I
 
G
S
 
I
K
 
L
P
 
P
A
 
P
T
 
T
Q
 
N
D
 
S
L
 
A
G
 
P
Y
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
A
M
 
M
P
 
P
G
 
G
F
 
F
K
 
K
D
 
N
S
 
H
L
 
L
S
 
S
N
 
D
S
 
Q
Q
 
E
V
 
M
A
 
A
D
 
D
L
 
V
A
 
V
A
 
N
Y
 
F
L
 
M
R
 
R
A
 
K
Q
 
G
F
 
W
A
 
G
P
 
N
N
 
N
A
 
A
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8gy2B Cryo-em structure of membrane-bound alcohol dehydrogenase from gluconobacter oxydans
35% identity, 31% coverage: 794:1156/1175 of query aligns to 3:384/433 of 8gy2B

query
sites
8gy2B
K
 
E
A
 
A
T
 
L
L
 
I
E
 
K
R
 
R
G
 
G
R
 
E
L
 
Y
L
 
V
A
 
A
A
 
R
V
 
L
G
 
S
D
 
D
C
|
C
A
 
I
V
 
A
C
|
C
H
|
H
T
 
T
A
 
A
P
 
L
G
 
H
G
 
G
A
 
Q
T
 
P
N
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
|
L
A
 
E
M
 
I
Q
 
K
T
 
S
P
|
P
F
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
I
Y
 
Y
S
 
S
S
x
T
N
 
N
I
|
I
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
P
K
 
E
T
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
N
W
x
Y
S
 
T
Y
 
L
P
 
E
A
 
D
F
 
F
E
 
T
R
 
K
A
 
A
M
x
L
R
 
R
D
 
K
G
 
G
I
 
I
G
x
R
R
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
A
N
 
T
L
x
V
Y
|
Y
P
|
P
A
 
A
F
x
M
P
 
P
Y
 
Y
T
 
P
A
 
E
F
|
F
R
 
A
N
 
R
I
 
L
N
 
S
E
 
D
A
 
D
D
 
D
M
 
I
Q
 
R
A
 
A
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
F
L
 
F
M
 
M
S
 
H
Q
 
G
V
 
V
-
 
K
P
 
P
V
 
V
S
 
A
Q
 
L
A
 
Q
P
 
N
T
 
K
P
 
A
N
 
P
A
 
D
M
 
I
R
 
S
F
 
W
P
 
P
F
 
L
N
 
S
I
 
M
R
|
R
P
 
W
L
 
P
M
x
L
A
 
G
G
 
M
W
|
W
N
 
R
A
 
A
L
 
M
N
 
F
L
 
V
R
 
P
R
 
-
G
 
-
E
 
S
I
 
M
S
 
T
P
 
P
Q
 
G
P
 
V
E
 
D
R
 
K
S
 
S
-
 
I
-
 
S
-
 
D
E
 
P
Q
 
E
W
 
V
N
 
A
R
 
R
G
 
G
N
 
E
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
G
 
G
L
 
P
G
 
G
H
|
H
C
|
C
A
 
G
A
x
E
C
|
C
H
|
H
S
 
T
P
 
P
R
|
R
N
 
G
L
 
F
M
 
G
G
 
M
A
 
Q
E
 
V
K
 
K
-
 
A
-
 
Y
-
 
G
-
 
T
-
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
N
S
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
A
-
 
P
V
x
I
D
 
D
G
 
N
W
 
W
E
x
I
A
|
A
P
|
P
A
 
S
L
|
L
N
 
R
G
 
S
L
 
N
S
 
S
K
 
D
A
 
T
S
 
G
T
 
L
P
 
G
-
 
R
W
|
W
T
 
S
E
 
E
D
 
D
Q
 
D
L
 
I
F
 
V
T
 
T
Y
x
F
L
 
L
S
 
K
T
 
S
G
 
G
Y
 
R
S
 
I
D
 
D
A
 
H
H
 
S
G
x
A
V
|
V
A
x
F
A
 
G
G
 
G
P
x
M
M
 
A
G
x
D
P
 
V
V
 
V
V
 
A
S
 
Y
E
 
S
L
 
T
S
 
Q
K
 
H
L
 
W
P
 
S
K
 
D
A
 
D
D
 
D
I
 
L
R
 
R
A
 
A
M
 
T
A
 
A
V
 
K
Y
 
Y
L
 
L
A
 
K
S
 
S
L
 
M
K
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
L
G
 
G
D
 
Q
A
 
D
A
 
D
A
 
G
E
 
Q
A
 
T
P
 
T
A
 
A
V
 
L
T
 
L
A
 
N
A
 
K
N
 
G
V
 
G
P
 
Q
N
 
G
P
 
N
D
 
A
G
 
G
R
 
A
R
 
E
V
 
V
F
 
Y
E
 
L
G
 
H
A
x
N
C
|
C
K
 
A
A
 
I
C
|
C
H
|
H
A
 
M
-
 
N
D
 
D
G
 
G
L
 
T
G
 
G
-
 
V
P
 
N
K
 
R
L
x
M
F
|
F
G
 
-
V
 
-
S
 
-
P
|
P
S
 
P
F
x
L
A
 
A
T
 
G
N
 
N
T
x
P
N
 
V
V
 
V
H
 
I
S
 
T
D
 
D
Q
 
D
P
 
P
D
 
T
N
 
S
L
 
L
I
 
A
K
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
A
Q
 
F
G
 
G
I
x
G
S
 
I
K
 
L
P
 
P
A
 
P
T
 
T
Q
 
N
D
 
S
L
 
A
G
 
P
Y
x
S
-
 
A
-
x
V
-
 
A
M
|
M
P
 
P
G
 
G
F
|
F
K
 
K
D
 
N
S
 
H
L
 
L
S
 
S
N
 
D
S
 
Q
Q
 
E
V
 
M
A
 
A
D
 
D
L
 
V
A
 
V
A
 
N
Y
 
F
L
x
M
R
 
R
A
 
K
Q
 
G
F
 
W
A
 
G
P
 
N
N
 
N
A
 
A
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8gy3C Cryo-em structure of membrane-bound aldehyde dehydrogenase from gluconobacter oxydans
26% identity, 60% coverage: 43:744/1175 of query aligns to 16:731/732 of 8gy3C

query
sites
8gy3C
E
 
E
L
 
P
G
 
N
L
 
I
F
 
W
I
 
C
A
 
A
V
 
I
N
 
A
D
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
S
V
 
I
Y
 
N
A
 
V
F
 
N
N
 
I
G
 
V
H
 
R
V
 
A
D
 
E
L
x
M
G
|
G
T
x
Q
G
x
H
I
x
V
R
 
G
T
 
T
S
x
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
I
 
I
V
 
I
A
 
A
E
 
D
E
 
E
L
 
M
D
 
D
L
 
A
T
 
D
M
 
W
E
 
D
Q
 
K
V
 
I
K
 
K
M
 
I
V
 
T
L
 
Q
G
 
V
D
 
D
T
 
T
E
 
A
-
 
P
R
 
K
V
 
W
P
 
A
N
 
G
Q
 
K
G
 
Y
A
 
V
T
 
T
I
x
G
A
x
G
S
|
S
A
 
W
T
x
S
L
x
V
Q
 
W
I
 
D
S
 
T
A
 
W
V
 
D
P
 
T
L
 
F
R
 
R
N
 
Q
A
 
A
A
 
G
A
 
A
E
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
S
F
 
V
L
 
M
L
 
I
A
 
E
R
 
E
A
 
G
A
 
A
G
 
K
R
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
T
S
 
T
T
 
P
A
 
D
S
 
R
L
 
C
K
 
T
V
 
A
D
 
H
A
 
E
G
 
S
V
 
V
I
 
V
H
 
S
A
 
A
A
 
G
D
 
S
G
 
-
R
 
K
T
 
S
T
 
I
T
 
S
Y
 
F
A
 
G
E
 
D
L
 
I
V
 
V
S
 
A
G
 
R
Q
 
A
H
 
K
D
 
P
Q
 
T
L
 
R
R
 
T
I
 
F
S
 
T
G
 
P
D
 
E
A
 
E
-
 
M
-
 
A
-
 
K
-
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
K
P
 
P
I
 
T
E
 
G
D
 
N
Y
 
R
R
 
R
L
 
L
V
 
I
G
 
S
K
 
K
G
 
Q
A
 
V
A
 
P
R
 
A
V
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
P
G
 
D
K
 
K
A
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
K
L
 
A
T
 
I
Y
 
Y
V
 
G
H
 
I
D
 
D
M
 
V
R
 
K
V
 
L
P
 
D
G
 
G
M
 
M
L
 
V
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
P
I
 
K
R
 
M
P
 
P
P
 
P
-
 
T
-
 
R
Y
 
Y
A
 
A
G
 
A
L
 
-
D
 
-
C
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
K
L
 
V
L
 
I
S
 
S
V
 
V
D
 
D
E
 
D
S
 
S
S
 
A
I
 
A
A
 
K
H
 
K
I
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
Y
V
 
L
A
 
R
V
 
Y
V
 
V
V
 
V
I
 
L
R
 
D
D
 
D
F
 
P
V
 
S
G
 
G
V
 
I
V
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
W
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
L
A
 
A
L
 
K
R
 
T
E
 
Y
E
 
P
Q
 
A
A
 
A
V
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
D
E
 
A
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
H
 
Q
W
 
W
K
 
N
P
 
P
-
 
G
-
 
P
-
 
T
W
 
I
N
 
N
H
 
V
G
 
S
L
 
E
P
 
A
D
 
D
M
 
I
T
 
I
D
 
E
V
 
H
E
 
G
Q
 
R
A
 
K
I
 
L
R
 
A
D
 
A
N
 
D
P
 
P
R
 
K
V
 
N
R
 
G
R
 
T
T
 
R
V
 
V
L
 
F
D
 
N
Q
 
D
G
 
K
N
 
G
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
T
-
 
I
G
 
H
A
 
P
S
 
G
Q
 
Q
R
 
V
M
 
F
P
 
E
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
L
 
T
W
 
C
P
 
A
Y
 
S
Q
 
V
M
 
A
H
 
H
G
 
Y
S
 
Q
I
 
L
G
 
E
P
 
P
S
 
V
C
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
R
Y
 
H
S
 
I
P
 
D
A
 
G
G
 
M
S
 
W
R
 
E
V
 
I
W
 
H
S
 
T
G
 
G
S
 
N
Q
 
Q
N
 
W
P
 
Q
H
 
S
L
 
L
L
 
I
R
 
L
A
 
P
D
 
Q
L
 
L
A
 
A
W
 
K
L
 
S
L
 
L
A
 
Q
C
 
V
D
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
Q
I
 
V
D
 
V
V
 
M
I
 
R
R
 
T
M
 
Y
E
 
M
A
 
L
A
 
G
G
 
G
C
x
G
Y
x
F
G
 
G
R
 
R
N
 
R
C
x
L
A
 
N
D
 
G
D
 
D
V
 
Y
C
 
C
A
 
I
D
 
P
A
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
A
S
 
S
R
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
G
-
 
G
K
 
A
P
 
P
V
 
V
R
 
K
V
 
L
Q
 
I
L
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
S
Q
 
D
E
 
D
H
 
M
L
 
E
W
 
L
E
 
D
P
 
S
K
 
I
G
 
R
T
 
S
A
 
P
Q
 
S
L
 
I
M
 
Q
D
 
T
V
 
I
D
 
K
G
 
V
G
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
N
D
 
D
-
 
R
G
 
K
S
 
K
I
 
I
A
 
V
A
 
G
Y
 
M
D
 
D
F
 
Y
E
 
-
T
 
-
S
 
-
Y
 
V
P
 
A
S
 
V
N
 
A
G
 
G
A
 
W
P
 
P
T
 
T
L
 
Q
-
 
V
-
 
M
-
 
A
-
 
P
A
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
D
E
 
G
P
 
K
V
 
K
A
 
Y
A
 
D
M
 
P
F
 
F
E
 
A
M
 
I
G
 
A
D
 
G
R
 
A
T
 
D
S
 
H
I
 
W
P
 
Y
P
 
E
Y
 
T
D
 
G
I
 
P
D
 
T
T
 
R
M
 
V
R
 
R
V
 
A
T
 
I
I
 
S
N
 
N
D
 
D
M
 
L
A
 
A
-
 
N
P
 
A
I
 
T
V
 
F
R
 
R
A
 
P
S
 
G
W
 
W
M
x
L
R
|
R
G
 
S
V
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
G
P
 
W
N
 
T
T
 
P
F
 
W
A
 
A
H
 
L
E
 
E
S
 
C
Y
 
F
I
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
H
A
 
S
A
 
T
G
 
K
V
 
Q
D
 
D
P
 
P
V
 
L
E
 
A
Y
 
F
R
 
R
L
 
L
R
 
S
Y
 
M
L
 
F
K
 
T
D
 
A
E
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
P
-
 
N
-
 
S
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
K
R
 
R
A
 
Q
I
 
A
D
 
A
L
 
V
V
 
L
K
 
Q
S
 
R
T
 
L
A
 
A
E
 
D
R
 
K
A
 
I
N
 
G
W
 
Y
T
 
A
P
 
N
R
 
K
T
 
Q
A
 
L
P
 
P
M
 
A
Q
 
D
T
 
T
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
G
R
 
I
G
 
G
F
 
I
A
 
A
Y
 
T
A
 
S
R
 
F
Y
 
G
I
 
Q
H
 
E
S
 
R
K
 
G
F
 
M
P
 
P
G
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
T
W
 
W
A
 
T
A
 
A
W
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
Q
V
 
I
A
 
H
I
 
V
D
 
D
K
 
R
Q
 
K
T
 
T
G
 
G
D
 
V
V
 
V
S
 
T
V
 
C
T
 
Q
R
 
K
V
 
L
V
 
W
I
 
L
G
 
V
H
 
L
D
 
D
S
 
A
G
 
G
M
 
T
M
 
I
I
x
V
N
x
D
P
 
P
D
 
G
G
 
G
V
 
A
Q
 
L
H
 
A
Q
|
Q
I
 
T
H
 
E
G
 
G
N
 
A
V
 
A
I
 
L
Q
 
W
S
 
G
T
 
F
S
 
S
R
 
M
V
 
A
L
 
L
K
 
F
E
 
E
R
 
G
V
 
T
T
 
E
F
 
I
E
 
V
E
 
N
S
 
G
T
 
T
V
 
I
A
 
K
S
 
D
K
 
R
E
 
N
W
 
L
G
 
N
G
 
T
Y
 
Y
P
 
T
I
 
P
L
 
L
T
 
R
F
 
I
P
 
P
E
 
D
V
 
V
P
 
P
K
 
D
I
 
I
D
 
D
V
 
I
M
 
E
M
 
F
M
 
I
P
 
-
R
 
Q
Q
 
N
D
 
T
Q
 
E
P
 
K
P
 
P
M
x
T
G
|
G
A
x
L
G
|
G
E
|
E
S
 
P
A
 
G
S
 
V
V
 
T
P
 
V
S
 
V
A
 
A
A
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
G
N
 
N
A
 
A
I
 
I
Y
 
F
D
 
N
A
 
A
T
 
V
G
 
G
I
 
I
R
 
R
F
 
L
R
 
R
E
 
H
L
 
M
P
 
P
I
 
M
T
 
R
P
 
P
E
 
A
R
 
D
V
 
V
L
 
R
A
 
R
A
 
E
L
 
L
N
 
Q
A
 
Q
G
 
H
T
 
T

3hrdB Crystal structure of nicotinate dehydrogenase (see paper)
36% identity, 12% coverage: 604:742/1175 of query aligns to 183:327/330 of 3hrdB

query
sites
3hrdB
A
 
S
W
 
Y
A
 
A
A
 
T
W
 
T
V
 
I
A
 
A
D
 
E
V
 
V
A
 
E
I
 
V
D
 
D
K
 
T
Q
 
E
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
V
S
 
D
V
 
V
T
 
L
R
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
S
G
 
A
H
 
H
D
 
D
S
 
V
G
 
G
M
 
T
M
 
P
I
|
I
N
|
N
P
 
R
D
 
S
G
x
M
V
|
V
Q
 
E
H
 
G
Q
|
Q
I
 
I
H
 
E
G
 
G
N
 
G
V
 
V
I
 
T
Q
 
M
S
 
G
T
 
Q
S
 
G
R
 
F
V
 
V
L
 
L
K
 
M
E
 
E
R
 
E
V
 
I
T
 
E
F
 
V
E
 
N
E
 
T
S
 
K
T
 
N
V
 
G
A
 
A
S
 
I
K
 
K
E
 
N
-
 
P
-
 
S
W
 
M
G
 
S
G
 
K
Y
 
Y
P
 
I
I
 
I
L
 
P
T
 
S
F
 
N
P
 
R
E
 
D
V
 
V
P
 
P
K
 
E
I
 
I
D
 
H
V
 
S
M
 
I
M
 
L
M
 
V
P
 
E
R
 
S
Q
 
E
D
 
G
Q
 
G
P
 
P
-
 
G
P
 
P
M
 
F
G
 
G
A
 
A
-
x
K
-
x
G
-
x
V
G
|
G
E
|
E
S
x
P
A
 
A
S
 
L
V
 
I
P
 
P
S
 
M
A
 
I
A
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
V
N
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
L
G
 
G
I
 
T
R
 
R
F
 
F
R
 
T
E
 
H
L
 
T
P
 
P
I
 
I
T
 
M
P
 
P
E
 
K
R
 
D
V
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V
N
 
K
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q0QLF1 Nicotinate dehydrogenase medium molybdopterin subunit; NDH; Nicotinic acid hydroxylase medium molybdopterin subunit; NAH; EC 1.17.1.5 from Eubacterium barkeri (Clostridium barkeri) (see paper)
36% identity, 12% coverage: 604:742/1175 of query aligns to 183:327/330 of Q0QLF1

query
sites
Q0QLF1
A
 
S
W
 
Y
A
 
A
A
 
T
W
 
T
V
 
I
A
 
A
D
 
E
V
 
V
A
 
E
I
 
V
D
 
D
K
 
T
Q
 
E
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
V
S
 
D
V
 
V
T
 
L
R
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
S
G
 
A
H
 
H
D
 
D
S
x
V
G
|
G
M
x
T
M
x
P
I
|
I
N
|
N
P
x
R
D
x
S
G
x
M
V
|
V
Q
x
E
H
x
G
Q
|
Q
I
 
I
H
 
E
G
 
G
N
 
G
V
 
V
I
 
T
Q
 
M
S
 
G
T
 
Q
S
 
G
R
 
F
V
 
V
L
 
L
K
 
M
E
 
E
R
 
E
V
 
I
T
 
E
F
 
V
E
 
N
E
 
T
S
 
K
T
 
N
V
 
G
A
 
A
S
 
I
K
 
K
E
 
N
-
 
P
-
 
S
W
 
M
G
 
S
G
 
K
Y
 
Y
P
 
I
I
 
I
L
 
P
T
 
S
F
 
N
P
 
R
E
 
D
V
 
V
P
 
P
K
 
E
I
 
I
D
 
H
V
 
S
M
 
I
M
 
L
M
 
V
P
 
E
R
 
S
Q
 
E
D
 
G
Q
 
G
P
 
P
-
 
G
P
 
P
M
 
F
G
 
G
A
|
A
-
x
K
-
x
G
-
x
V
G
|
G
E
|
E
S
 
P
A
 
A
S
 
L
V
 
I
P
 
P
S
 
M
A
 
I
A
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
V
N
 
A
A
 
A
I
 
I
Y
 
E
D
 
D
A
 
A
T
 
L
G
 
G
I
 
T
R
 
R
F
 
F
R
 
T
E
 
H
L
 
T
P
 
P
I
 
I
T
 
M
P
 
P
E
 
K
R
 
D
V
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V
N
 
K
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q0QLF2 Nicotinate dehydrogenase large molybdopterin subunit; NDH; Nicotinic acid hydroxylase large molybdopterin subunit; NAH; EC 1.17.1.5 from Eubacterium barkeri (Clostridium barkeri) (see 2 papers)
24% identity, 31% coverage: 183:546/1175 of query aligns to 3:382/425 of Q0QLF2

query
sites
Q0QLF2
E
x
K
D
|
D
Y
|
Y
R
x
Q
L
x
V
V
x
L
G
|
G
K
|
K
G
x
N
A
x
K
A
x
V
R
x
K
V
|
V
D
|
D
I
x
S
P
x
L
G
x
E
K
|
K
A
x
V
T
x
M
G
|
G
E
x
T
L
x
A
T
x
K
Y
x
F
V
x
A
H
x
A
D
|
D
M
x
Y
R
x
S
V
x
F
P
|
P
G
x
D
M
|
M
L
|
L
H
x
Y
G
x
A
R
x
G
V
|
V
I
x
F
R
|
R
P
x
S
-
x
T
-
x
V
P
|
P
Y
x
H
A
|
A
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
-
S
x
R
L
x
I
L
x
V
S
|
S
V
x
L
D
|
D
E
x
L
S
|
S
S
x
K
I
x
A
A
x
R
H
x
A
I
|
I
P
x
D
G
|
G
I
x
V
V
x
E
A
|
A
V
|
V
-
x
L
-
x
D
-
x
Y
-
x
H
-
x
A
-
x
I
-
x
P
-
x
G
-
x
K
-
x
N
-
x
R
-
x
F
-
x
G
V
x
I
V
x
I
I
|
I
R
x
K
D
|
D
-
x
E
-
x
P
-
x
C
-
x
L
-
x
V
-
x
D
-
x
D
-
x
K
-
x
V
-
x
R
-
x
R
-
x
Y
-
x
G
-
x
D
F
x
A
V
x
I
G
x
A
V
|
V
V
|
V
A
|
A
L
x
A
R
x
Q
E
x
T
E
x
P
Q
x
D
A
x
L
V
|
V
K
x
Q
A
x
E
A
|
A
S
x
L
E
x
D
-
x
A
L
x
I
Q
x
T
V
x
I
H
x
E
W
x
Y
K
x
E
P
x
E
W
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
-
L
|
L
P
x
E
D
x
G
M
x
I
T
x
F
D
x
T
V
x
M
E
|
E
Q
x
R
A
|
A
I
x
L
R
x
E
-
x
E
D
|
D
N
x
S
P
|
P
R
x
A
V
x
I
R
x
H
R
x
G
T
x
D
V
x
T
-
x
N
-
x
I
-
x
H
-
x
Q
-
x
V
-
x
K
-
x
H
L
|
L
D
x
E
Q
x
Y
G
|
G
N
x
D
V
|
V
D
|
D
E
x
A
A
|
A
L
x
F
A
x
K
G
x
Q
A
x
C
S
x
D
Q
x
I
R
x
V
M
x
V
P
x
E
R
x
D
S
x
T
Y
|
Y
L
x
S
W
x
T
P
x
H
Y
x
R
Q
x
L
M
x
T
H
|
H
G
x
M
S
x
F
I
|
I
G
x
E
P
|
P
S
x
D
C
x
A
G
|
G
V
|
V
A
x
S
D
x
Y
Y
|
Y
S
x
D
P
x
N
A
x
E
G
|
G
S
x
M
-
x
L
R
x
T
V
|
V
W
x
V
S
x
V
G
x
S
S
x
T
Q
|
Q
N
|
N
P
|
P
H
|
H
L
x
Y
L
x
D
R
|
R
A
x
G
D
x
E
L
x
V
A
|
A
W
x
G
L
x
M
L
|
L
A
|
A
C
x
L
D
x
P
E
x
N
A
x
S
L
x
K
I
x
V
D
x
R
V
x
I
I
|
I
R
x
Q
M
x
A
E
x
T
A
x
T
A
x
G
G
|
G
C
x
G
Y
x
F
G
|
G
R
x
G
N
x
K
C
x
L
A
x
D
D
x
L
D
x
S
V
|
V
C
x
Q
A
x
C
D
x
H
A
x
C
L
x
A
L
|
L
L
|
L
S
x
T
R
x
Y
A
x
H
V
x
T
G
x
K
K
|
K
P
|
P
V
|
V
R
x
K
V
x
M
Q
x
V
L
x
R
T
x
S
R
|
R
E
|
E
Q
x
E
E
x
S
H
x
T
L
x
T
W
x
V
E
x
S
P
x
S
K
|
K
G
x
R
T
x
H
A
x
P
Q
x
M
L
x
T
M
|
M
D
x
H
V
x
C
D
x
K
G
x
T
G
|
G
L
x
A
N
x
T
A
x
K
D
|
D
G
|
G
S
x
R
I
x
L
A
x
Q
A
|
A
Y
x
V
D
x
Q
F
x
V
E
|
E
T
x
M
-
x
F
-
x
G
-
x
D
-
x
T
-
x
G
S
x
A
Y
|
Y
P
x
A
S
|
S
N
x
Y
G
|
G
A
x
P
P
x
A
T
x
V
L
x
I
A
x
T
L
x
R
L
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
A
|
A
A
x
T
M
x
V
F
x
H
E
x
C
M
|
M
G
|
G
D
x
P
R
x
Y
T
x
V
S
 
-
I
x
V
P
|
P
P
x
N
Y
x
V
D
x
R
I
x
V
D
|
D
T
x
A
M
x
K
R
x
F
V
|
V
T
x
Y
I
x
T
N
|
N
D
x
N
M
 
-
A
 
-
P
|
P
I
x
M
V
 
-
R
 
-
A
x
S
S
x
G
W
x
A
M
x
F
R
|
R
G
|
G
V
x
F
S
x
G
A
x
V
L
x
P
P
x
Q
N
x
A
T
x
S
F
x
V
A
x
C
H
|
H
E
|
E
S
x
G
Y
x
Q
I
x
M
D
x
N
E
x
A
L
|
L
A
|
A
F
x
K
A
|
A
A
x
L
G
|
G
V
x
M
D
|
D
P
|
P
V
x
I
E
x
D
Y
x
I
R
|
R
L
x
I

Sites not aligning to the query:

3hrdE Crystal structure of nicotinate dehydrogenase (see paper)
24% identity, 31% coverage: 183:546/1175 of query aligns to 2:381/420 of 3hrdE

query
sites
3hrdE
E
 
K
D
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
L
 
V
V
 
L
G
 
G
K
 
K
G
 
N
A
 
K
A
 
V
R
 
K
V
 
V
D
 
D
I
 
S
P
 
L
G
 
E
K
 
K
A
 
V
T
 
M
G
 
G
E
 
T
L
 
A
T
 
K
Y
 
F
V
 
A
H
 
A
D
 
D
M
 
Y
R
 
S
V
 
F
P
 
P
G
 
D
M
 
M
L
 
L
H
 
Y
G
 
A
R
 
G
V
 
V
I
 
F
R
 
R
P
 
S
-
 
T
-
 
V
P
 
P
Y
 
H
A
 
A
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
-
S
 
R
L
 
I
L
 
V
S
 
S
V
 
L
D
 
D
E
 
L
S
 
S
S
 
K
I
 
A
A
 
R
H
 
A
I
 
I
P
 
D
G
 
G
I
 
V
V
 
E
A
 
A
V
 
V
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
H
-
 
A
-
 
I
-
 
P
-
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
R
-
 
F
-
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
I
R
 
K
D
 
D
-
 
E
-
 
P
-
 
C
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
D
F
 
A
V
 
I
G
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
A
R
 
Q
E
 
T
E
 
P
Q
 
D
A
 
L
V
 
V
K
 
Q
A
 
E
A
 
A
S
 
L
E
 
D
-
 
A
L
 
I
Q
 
T
V
 
I
H
 
E
W
 
Y
K
 
E
P
 
E
W
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
L
P
 
E
D
 
G
M
 
I
T
 
F
D
 
T
V
 
M
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
I
 
L
R
 
E
-
 
E
D
 
D
N
 
S
P
 
P
R
 
A
V
 
I
R
 
H
R
 
G
T
 
D
V
 
T
-
 
N
-
 
I
-
 
H
-
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
H
L
 
L
D
 
E
Q
 
Y
G
 
G
N
 
D
V
 
V
D
 
D
E
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
K
G
 
Q
A
 
C
S
 
D
Q
 
I
R
 
V
M
 
V
P
 
E
R
 
D
S
 
T
Y
 
Y
L
 
S
W
 
T
P
 
H
Y
 
R
Q
 
L
M
 
T
H
 
H
G
 
M
S
 
F
I
 
I
G
 
E
P
 
P
S
 
D
C
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
S
D
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
P
 
N
A
 
E
G
 
G
S
 
M
-
 
L
R
 
T
V
 
V
W
 
V
S
 
V
G
 
S
S
x
T
Q
|
Q
N
|
N
P
 
P
H
 
H
L
 
Y
L
x
D
R
 
R
A
 
G
D
 
E
L
 
V
A
 
A
W
 
G
L
 
M
L
 
L
A
 
A
C
 
L
D
 
P
E
 
N
A
 
S
L
 
K
I
 
V
D
 
R
V
 
I
I
 
I
R
 
Q
M
 
A
E
 
T
A
 
T
A
 
G
G
 
G
C
x
G
Y
x
F
G
 
G
R
 
G
N
x
K
C
x
L
A
x
D
D
 
L
D
 
S
V
 
V
C
 
Q
A
 
C
D
 
H
A
 
C
L
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
T
R
 
Y
A
 
H
V
 
T
G
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
R
 
K
V
 
M
Q
 
V
L
 
R
T
 
S
R
 
R
E
 
E
Q
 
E
E
 
S
H
 
T
L
 
T
W
 
V
E
 
S
P
 
S
K
 
K
G
 
R
T
 
H
A
 
P
Q
 
M
L
 
T
M
 
M
D
 
H
V
 
C
D
 
K
G
 
T
G
 
G
L
 
A
N
 
T
A
 
K
D
 
D
G
 
G
S
 
R
I
 
L
A
 
Q
A
 
A
Y
 
V
D
 
Q
F
 
V
E
 
E
T
 
M
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
T
-
 
G
S
 
A
Y
 
Y
P
 
A
S
 
S
N
 
Y
G
 
G
A
 
P
P
 
A
T
 
V
L
 
I
A
 
T
L
x
R
L
 
-
L
 
-