SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2666 FitnessBrowser__Marino:GFF2666 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7cyxA Crystal strcuture of glycine oxidase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
25% identity, 95% coverage: 13:417/427 of query aligns to 4:348/363 of 7cyxA

query
sites
7cyxA
I
 
V
L
 
A
V
 
I
L
x
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
V
|
V
V
x
I
G
 
G
T
 
S
T
 
S
T
 
V
A
 
A
W
 
H
Y
 
F
L
 
L
Q
 
A
K
 
E
Q
 
R
G
 
G
H
 
H
Q
 
K
V
 
V
T
 
A
V
 
I
V
|
V
D
x
E
R
x
K
Q
 
Q
N
 
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
S
L
 
-
E
|
E
T
x
A
S
|
S
Y
 
K
A
 
A
N
x
A
G
 
A
G
|
G
Q
x
L
I
 
L
S
 
G
V
 
V
S
 
A
H
 
Y
A
 
-
E
 
-
P
 
-
W
 
-
A
 
-
N
 
N
P
 
P
S
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
M
 
-
K
 
-
W
 
-
L
 
L
F
 
F
Q
 
E
P
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
R
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
C
 
-
T
 
-
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
S
H
 
R
N
 
A
I
 
I
R
 
-
Q
 
-
M
 
-
V
 
-
N
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
S
 
-
C
 
F
S
 
P
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
A
 
A
-
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
K
A
 
T
G
 
G
I
 
V
E
 
D
Y
 
I
N
 
G
H
 
Y
L
 
E
E
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
Y
H
 
R
F
 
I
Y
 
A
T
 
Q
N
 
N
P
 
E
A
 
D
E
 
E
F
 
K
D
 
E
G
 
R
A
 
I
M
 
L
E
 
H
P
 
I
T
 
M
R
 
D
I
 
W
M
 
Q
Q
 
Q
D
 
K
L
 
T
G
 
G
C
 
E
D
 
D
R
 
S
Q
 
Y
I
 
F
I
 
L
D
 
T
A
 
G
D
 
D
R
 
H
A
 
V
V
 
R
E
 
E
L
 
K
E
 
E
P
 
P
A
 
Y
L
 
L
K
 
S
P
 
-
I
 
-
R
 
-
N
 
E
R
 
S
I
 
I
A
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
V
Y
 
Y
T
 
Y
S
 
P
E
 
K
D
 
D
E
 
G
S
 
H
G
 
V
D
 
I
A
 
A
R
 
P
M
 
E
F
 
L
T
 
T
Q
 
K
N
 
A
L
 
F
A
 
A
K
 
H
R
 
S
C
 
A
A
 
A
E
 
I
A
 
S
G
 
G
V
 
A
E
 
D
F
 
I
R
 
Y
Y
 
E
G
 
Q
T
 
T
E
 
E
I
x
V
L
 
F
S
 
D
F
 
I
E
 
R
R
 
I
A
 
E
G
 
N
E
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
V
Q
 
I
T
 
T
L
 
S
R
 
E
D
 
G
G
 
-
H
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
I
L
 
V
R
 
T
A
 
C
D
 
E
A
 
K
Y
 
V
V
 
V
L
 
I
S
 
A
M
x
G
G
|
G
S
 
S
F
x
W
S
 
S
A
 
T
A
 
K
L
 
L
A
 
L
S
 
S
Q
 
Y
L
 
F
G
 
H
I
 
R
F
 
D
L
 
W
N
 
G
I
 
T
Y
 
Y
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
-
I
 
-
T
 
V
V
 
V
P
 
A
V
 
V
K
 
R
N
 
S
E
 
R
E
 
K
A
 
Q
A
 
L
F
 
L
N
 
K
V
 
A
S
 
P
L
 
I
T
 
F
D
 
Q
D
 
E
E
 
R
Y
 
F
K
 
Y
L
 
I
V
 
T
Y
 
P
S
 
K
R
 
R
L
 
-
G
 
G
D
 
G
R
 
R
M
 
Y
R
 
V
V
 
I
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
L
 
P
N
 
H
G
 
T
Y
 
F
S
 
N
R
 
K
K
 
T
L
 
V
N
 
Q
Y
 
P
T
 
E
R
 
S
C
 
I
R
 
T
A
 
S
I
 
I
V
 
L
R
 
E
R
 
R
T
 
A
A
 
Y
E
 
T
V
 
I
M
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
L
G
 
K
Y
 
E
W
 
A
D
 
E
Q
 
W
A
 
E
E
 
S
F
 
T
W
 
W
T
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
|
P
A
 
Q
T
 
S
P
 
N
S
 
H
N
 
E
V
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
M
G
 
G
K
 
E
-
 
H
S
 
E
H
 
E
F
 
I
A
 
K
N
 
G
L
 
L
Y
 
Y
L
 
A
N
 
C
T
 
T
G
 
G
H
 
H
G
x
Y
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
 
L
H
 
L
S
 
S
C
 
P
G
 
I
S
 
S
A
 
G
A
 
Q
A
 
Y
L
 
M
A
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
I
D
 
E
G
 
G
R
 
K
K
 
Q

4yshB Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
24% identity, 69% coverage: 130:422/427 of query aligns to 77:360/368 of 4yshB

query
sites
4yshB
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
R
A
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
D
Y
 
I
N
 
G
H
 
L
L
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
L
L
 
I
H
 
K
F
 
L
Y
 
A
T
 
T
N
 
T
P
 
E
A
 
E
E
 
E
F
 
A
D
 
D
G
 
D
A
 
L
M
 
Y
E
 
R
P
 
H
T
 
Y
R
 
T
I
 
F
M
 
W
Q
 
R
D
 
G
L
 
I
G
 
G
C
 
E
D
 
P
R
 
V
Q
 
Q
I
 
W
I
 
L
D
 
T
A
 
K
D
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
K
 
A
P
 
-
I
 
-
R
 
-
N
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
M
Y
 
Y
T
 
I
S
 
P
E
 
G
D
 
D
E
 
G
S
 
Q
G
 
V
D
 
S
A
 
A
R
 
P
M
 
D
F
 
L
T
 
A
Q
 
A
N
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
Y
R
 
A
C
 
A
A
 
A
E
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
C
F
 
L
R
 
Y
Y
 
E
G
 
Y
T
 
T
E
 
E
I
x
V
L
 
F
S
 
D
F
 
I
E
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
R
V
 
S
L
 
D
G
 
S
I
 
S
Q
 
G
T
 
H
L
 
V
R
 
L
D
 
D
G
 
T
H
 
T
H
 
G
E
 
G
T
 
T
L
 
F
R
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
Y
 
V
V
 
V
L
 
I
S
 
A
M
x
S
G
 
G
S
 
A
F
x
W
S
 
A
A
 
A
A
 
R
L
 
L
A
 
G
S
 
A
Q
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
L
F
 
S
L
 
L
N
 
S
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
I
 
V
T
 
M
V
 
V
P
 
R
V
 
A
K
 
P
N
 
V
E
 
P
E
 
L
A
 
L
A
 
Q
F
 
T
N
 
T
V
 
V
S
 
F
L
 
A
T
 
K
D
 
N
D
x
G
E
 
C
Y
|
Y
K
 
-
L
 
-
V
 
I
Y
 
V
S
 
P
R
 
K
L
 
S
G
 
G
D
 
N
R
 
R
M
 
L
R
 
L
V
x
I
A
 
G
G
x
A
T
 
T
A
 
S
E
 
T
L
 
P
N
 
G
G
 
T
Y
 
F
S
 
D
R
 
R
K
 
R
L
 
V
N
 
S
Y
 
A
T
 
G
R
 
G
C
 
V
R
 
M
A
 
N
I
x
L
V
 
L
R
 
H
R
 
R
T
 
A
A
 
A
E
 
H
V
 
L
M
 
V
P
 
P
E
 
D
A
 
I
G
 
E
Y
 
Q
W
 
A
D
 
E
Q
 
W
A
 
V
E
 
A
F
 
S
W
 
W
T
 
S
G
|
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
A
 
Q
T
 
T
P
 
E
S
 
D
N
 
G
V
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
K
 
E
-
 
H
S
 
P
H
 
E
F
 
R
A
 
R
N
 
G
L
 
L
Y
 
F
L
 
V
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
Y
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
x
L
H
 
L
S
 
S
C
 
P
G
 
L
S
 
T
A
 
G
A
 
L
A
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
V
D
 
E
G
 
R
R
 
K
K
 
E
P
 
T
E
 
A
V
 
F
D
 
D
F
 
L

Sites not aligning to the query:

4yshA Crystal structure of glycine oxidase from geobacillus kaustophilus
24% identity, 69% coverage: 130:422/427 of query aligns to 77:360/370 of 4yshA

query
sites
4yshA
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
R
A
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
D
Y
 
I
N
 
G
H
 
L
L
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
L
L
 
I
H
 
K
F
 
L
Y
 
A
T
 
T
N
 
T
P
 
E
A
 
E
E
 
E
F
 
A
D
 
D
G
 
D
A
 
L
M
 
Y
E
 
R
P
 
H
T
 
Y
R
 
T
I
 
F
M
 
W
Q
 
R
D
 
G
L
 
I
G
 
G
C
 
E
D
 
P
R
 
V
Q
 
Q
I
 
W
I
 
L
D
 
T
A
 
K
D
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
K
 
A
P
 
-
I
 
-
R
 
-
N
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
M
Y
 
Y
T
 
I
S
 
P
E
 
G
D
 
D
E
 
G
S
 
Q
G
 
V
D
 
S
A
 
A
R
 
P
M
 
D
F
 
L
T
 
A
Q
 
A
N
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
Y
R
 
A
C
 
A
A
 
A
E
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
C
F
 
L
R
 
Y
Y
 
E
G
 
Y
T
 
T
E
 
E
I
x
V
L
 
F
S
 
D
F
 
I
E
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
R
V
 
S
L
 
D
G
 
S
I
 
S
Q
 
G
T
 
H
L
 
V
R
 
L
D
 
D
G
 
T
H
 
T
H
 
G
E
 
G
T
 
T
L
 
F
R
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
Y
 
V
V
 
V
L
 
I
S
 
A
M
x
S
G
|
G
S
 
A
F
x
W
S
 
A
A
 
A
A
 
R
L
 
L
A
 
G
S
 
A
Q
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
L
F
 
S
L
 
L
N
 
S
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
I
 
V
T
 
M
V
 
V
P
 
R
V
 
A
K
 
P
N
 
V
E
 
P
E
 
L
A
 
L
A
 
Q
F
 
T
N
 
T
V
 
V
S
 
F
L
 
A
T
 
K
D
 
N
D
 
G
E
 
C
Y
 
Y
K
 
-
L
 
-
V
 
I
Y
 
V
S
 
P
R
 
K
L
 
S
G
 
G
D
 
N
R
 
R
M
 
L
R
 
L
V
x
I
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
S
E
 
T
L
 
P
N
 
G
G
 
T
Y
 
F
S
 
D
R
 
R
K
 
R
L
 
V
N
 
S
Y
 
A
T
 
G
R
 
G
C
 
V
R
 
M
A
 
N
I
x
L
V
 
L
R
 
H
R
 
R
T
 
A
A
 
A
E
 
H
V
 
L
M
 
V
P
 
P
E
 
D
A
 
I
G
 
E
Y
 
Q
W
 
A
D
 
E
Q
 
W
A
 
V
E
 
A
F
 
S
W
 
W
T
 
S
G
|
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
A
 
Q
T
 
T
P
 
E
S
 
D
N
 
G
V
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
K
 
E
-
 
H
S
 
P
H
 
E
F
 
R
A
 
R
N
 
G
L
 
L
Y
 
F
L
 
V
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
Y
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
x
L
H
 
L
S
 
S
C
 
P
G
 
L
S
 
T
A
 
G
A
 
L
A
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
V
D
 
E
G
 
R
R
 
K
K
 
E
P
 
T
E
 
A
V
 
F
D
 
D
F
 
L

Sites not aligning to the query:

Q5L2C2 Glycine oxidase; GO; GOX; GOXK; EC 1.4.3.19 from Geobacillus kaustophilus (strain HTA426)
24% identity, 69% coverage: 130:422/427 of query aligns to 78:362/377 of Q5L2C2

query
sites
Q5L2C2
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
R
A
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
D
Y
 
I
N
 
G
H
 
L
L
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
L
L
 
I
H
 
K
F
 
L
Y
 
A
T
 
T
N
 
T
P
 
E
A
 
E
E
 
E
F
 
A
D
 
D
G
 
D
A
 
L
M
 
Y
E
 
R
P
 
H
T
 
Y
R
 
T
I
 
F
M
 
W
Q
 
R
D
 
G
L
 
I
G
 
G
C
 
E
D
 
P
R
 
V
Q
 
Q
I
 
W
I
 
L
D
 
T
A
 
K
D
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
M
E
 
E
P
 
P
A
 
R
L
 
L
K
 
A
P
 
A
I
 
-
R
 
-
N
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
M
Y
 
Y
T
 
I
S
 
P
E
 
G
D
 
D
E
 
G
S
 
Q
G
 
V
D
 
S
A
 
A
R
 
P
M
 
D
F
 
L
T
 
A
Q
 
A
N
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
Y
R
 
A
C
 
A
A
 
A
E
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
C
F
 
L
R
 
Y
Y
 
E
G
 
Y
T
 
T
E
 
E
I
x
V
L
 
F
S
 
D
F
 
I
E
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
R
V
 
S
L
 
D
G
 
S
I
 
S
Q
 
G
T
 
H
L
 
V
R
 
L
D
 
D
G
 
T
H
 
T
H
 
G
E
 
G
T
 
T
L
 
F
R
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
Y
 
V
V
 
V
L
 
I
S
 
A
M
 
S
G
 
G
S
 
A
F
 
W
S
 
A
A
 
A
A
 
R
L
 
L
A
 
G
S
 
A
Q
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
L
F
 
S
L
 
L
N
 
S
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
I
 
V
T
 
M
V
 
V
P
 
R
V
 
A
K
 
P
N
 
V
E
 
P
E
 
L
A
 
L
A
 
Q
F
 
T
N
 
T
V
 
V
S
 
F
L
 
A
T
 
K
D
 
N
D
 
G
E
 
C
Y
 
Y
K
 
-
L
 
-
V
 
I
Y
 
V
S
 
P
R
 
K
L
 
S
G
 
G
D
 
N
R
 
R
M
 
L
R
 
L
V
 
I
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
S
E
 
T
L
 
P
N
 
G
G
 
T
Y
 
F
S
 
D
R
 
R
K
 
R
L
 
V
N
 
S
Y
 
A
T
 
G
R
 
G
C
 
V
R
 
M
A
 
N
I
 
L
V
 
L
R
 
H
R
 
R
T
 
A
A
 
A
E
 
H
V
 
L
M
 
V
P
 
P
E
 
D
A
 
I
G
 
E
Y
 
Q
W
 
A
D
 
E
Q
 
W
A
 
V
E
 
A
F
 
S
W
 
W
T
 
S
G
 
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
A
 
Q
T
 
T
P
 
E
S
 
D
N
 
G
V
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
K
 
E
-
 
H
S
 
P
H
 
E
F
 
R
A
 
R
N
 
G
L
 
L
Y
 
F
L
 
V
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
x
Y
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
x
L
H
 
L
S
 
S
C
 
P
G
 
L
S
 
T
A
 
G
A
 
L
A
 
L
L
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
V
D
 
E
G
 
R
R
 
K
K
 
E
P
 
T
E
 
A
V
 
F
D
 
D
F
 
L

Sites not aligning to the query:

2gagB Heteroteterameric sarcosine: structure of a diflavin metaloenzyme at 1.85 a resolution (see paper)
23% identity, 67% coverage: 138:425/427 of query aligns to 94:383/403 of 2gagB

query
sites
2gagB
I
 
L
E
 
E
Y
 
Y
N
 
D
H
 
F
L
 
L
-
 
F
-
 
S
E
 
Q
K
 
R
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
N
F
 
L
Y
 
A
T
 
H
N
 
T
P
 
L
A
 
G
E
 
D
F
 
V
D
 
R
G
 
E
A
 
S
M
 
V
E
 
R
P
 
R
T
 
V
R
 
E
I
 
A
M
 
N
Q
 
K
D
 
L
L
 
N
G
 
G
C
 
V
D
 
D
R
 
A
Q
 
E
I
 
W
I
 
L
D
 
D
A
 
P
D
 
S
R
 
Q
A
 
V
V
 
K
E
 
E
L
 
A
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
K
 
N
P
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
D
I
 
I
R
 
R
N
 
Y
R
 
P
I
 
V
A
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
Y
 
W
T
 
Q
S
 
P
E
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
x
K
A
x
H
R
 
D
M
 
H
F
 
V
T
 
A
Q
 
W
N
 
A
L
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
K
C
 
A
A
 
N
E
 
E
A
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D
F
 
I
R
 
I
Y
 
Q
G
 
N
T
 
C
E
 
E
I
x
V
L
 
T
S
 
G
F
 
F
E
 
I
R
 
K
A
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
T
L
 
T
R
 
R
D
 
G
G
 
-
H
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
T
L
 
I
R
 
H
A
 
A
D
 
G
A
 
K
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
S
 
A
M
x
G
G
x
A
S
 
G
F
x
H
S
 
S
A
 
S
A
 
V
L
|
L
A
 
A
S
 
E
Q
 
M
L
 
A
G
 
G
I
 
F
F
 
E
L
 
L
N
 
-
I
 
-
Y
 
-
P
 
P
A
 
I
K
 
Q
G
 
S
Y
 
H
S
 
P
I
x
L
T
 
Q
V
 
A
P
 
L
V
|
V
K
 
S
N
 
E
E
 
L
E
 
F
A
 
E
A
 
P
F
 
V
N
 
H
V
 
P
S
 
T
L
 
V
T
 
V
D
x
M
D
 
S
E
 
N
Y
 
H
K
 
I
L
 
H
V
 
V
Y
|
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
x
K
G
 
G
D
x
E
R
 
L
M
 
V
R
 
M
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
L
 
Y
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
S
 
G
R
 
Q
K
 
R
L
 
G
N
 
A
Y
 
F
T
 
H
R
 
V
C
 
I
R
 
Q
A
 
E
I
 
Q
V
 
M
R
 
A
R
 
A
T
 
A
A
 
V
E
 
E
V
 
L
M
 
F
P
 
P
E
 
I
A
 
F
G
 
A
Y
 
R
W
 
A
D
 
H
Q
 
V
A
 
L
E
x
R
F
 
T
W
|
W
T
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
A
 
T
T
 
T
P
 
M
S
 
D
N
 
A
V
 
S
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
K
 
K
S
 
T
H
 
P
F
 
I
A
 
Q
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
|
T
L
x
G
G
|
G
W
x
F
T
x
K
H
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
G
A
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
H
I
 
T
I
 
I
D
 
A
G
 
N
R
 
D
K
 
E
P
 
P
-
 
H
E
 
E
V
 
L
D
 
N
F
 
K
T
 
P
F
 
F
S
 
S

Sites not aligning to the query:

P40875 Sarcosine oxidase subunit beta; Sarcosine oxidase subunit B; Sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming) subunit beta; Tetrameric sarcosine oxidase subunit beta; TSOX subunit beta; EC 1.5.3.24 from Corynebacterium sp. (strain P-1) (see 3 papers)
22% identity, 68% coverage: 125:413/427 of query aligns to 85:372/405 of P40875

query
sites
P40875
S
 
S
C
 
L
S
 
K
Q
 
L
L
 
W
Q
 
E
A
 
Q
L
 
L
R
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
L
G
 
D
I
 
Y
E
 
D
Y
 
F
N
 
L
H
 
F
L
 
S
E
 
Q
K
 
R
G
 
G
I
 
V
L
 
L
H
 
N
F
 
L
Y
 
A
T
 
H
N
 
T
P
 
L
A
 
G
E
 
D
F
 
V
D
 
R
G
 
E
A
 
S
M
 
V
E
 
R
P
 
R
T
 
V
R
 
E
I
 
A
M
 
N
Q
 
K
D
 
F
L
 
N
G
 
G
C
 
V
D
 
D
R
 
A
Q
 
E
I
 
W
I
 
L
D
 
T
A
 
P
D
 
E
R
 
Q
A
 
V
V
 
K
E
 
E
L
 
V
E
x
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
K
 
N
-
 
I
-
 
G
-
 
D
P
 
D
I
 
I
R
 
R
N
 
Y
R
 
P
I
 
V
A
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
S
 
P
E
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
 
K
A
x
H
R
 
D
M
x
H
F
 
V
T
 
A
Q
 
W
N
 
A
L
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
K
C
 
A
A
 
N
E
 
E
A
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D
F
 
I
R
 
I
Y
 
Q
G
 
N
T
x
C
E
 
E
I
 
V
L
 
T
S
 
G
F
 
F
E
 
L
R
 
K
A
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
T
L
 
T
R
 
R
D
 
G
G
 
-
H
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
T
L
 
I
R
 
H
A
 
A
D
 
G
A
 
K
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
G
G
 
A
S
 
G
F
 
H
S
 
S
A
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
E
Q
 
L
L
 
A
G
 
G
I
 
F
F
 
E
L
 
L
N
 
-
I
 
-
Y
 
-
P
 
P
A
 
I
K
 
Q
G
 
S
Y
 
H
S
 
P
I
 
L
T
 
Q
V
 
A
P
 
L
V
 
V
K
 
S
N
 
E
E
 
L
E
 
F
A
 
E
A
 
P
F
 
V
N
 
H
V
 
P
S
 
T
L
 
V
T
 
V
D
 
M
D
 
S
E
 
N
Y
 
H
K
 
I
L
 
H
V
 
V
Y
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
 
K
G
 
G
D
 
E
R
 
L
M
 
V
R
 
M
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
L
 
Y
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
S
 
G
R
 
Q
K
 
R
L
 
G
N
 
A
Y
 
F
T
 
H
R
 
V
C
 
I
R
 
E
A
 
E
I
 
Q
V
 
M
R
 
A
R
 
A
T
 
A
A
 
V
E
 
E
V
 
L
M
 
F
P
 
P
E
 
I
A
 
F
G
 
A
Y
 
R
W
 
A
D
 
H
Q
 
V
A
 
L
E
 
R
F
 
T
W
 
W
T
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
A
 
T
T
 
T
P
 
M
S
 
D
N
 
A
V
 
S
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
K
 
K
S
 
T
H
 
P
F
 
I
A
 
Q
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
x
C
G
 
G
H
 
W
G
 
G
T
 
T
L
 
G
G
 
G
W
 
F
T
 
K
H
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
G
A
 
F
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
H
I
 
T
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1vrqB Crystal structure of heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with folinic acid (see paper)
24% identity, 58% coverage: 171:418/427 of query aligns to 130:376/402 of 1vrqB

query
sites
1vrqB
G
 
G
C
 
V
D
 
D
R
 
A
Q
 
E
I
 
W
I
 
L
D
 
T
A
 
P
D
 
E
R
 
Q
A
 
V
V
 
K
E
 
E
L
 
V
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
K
 
N
P
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
N
I
 
I
R
 
R
N
 
Y
R
 
P
I
 
V
A
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
S
 
P
E
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
 
K
A
x
H
R
 
D
M
 
H
F
 
V
T
 
A
Q
 
W
N
 
A
L
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
K
C
 
A
A
 
N
E
 
E
A
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D
F
 
I
R
 
I
Y
 
Q
G
 
N
T
 
C
E
 
E
I
x
V
L
 
T
S
 
G
F
 
F
E
 
L
R
 
K
A
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
T
L
 
T
R
 
R
D
 
G
G
 
-
H
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
T
L
 
I
R
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
K
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
S
x
A
M
x
G
G
 
A
S
 
G
F
x
H
S
 
S
A
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
E
Q
 
L
L
 
A
G
 
G
I
 
F
F
 
E
L
 
L
N
 
-
I
 
-
Y
 
-
P
 
P
A
 
I
K
 
Q
G
 
S
Y
 
H
S
 
P
I
x
L
T
 
Q
V
 
A
P
 
L
V
|
V
K
 
S
N
 
E
E
 
L
E
 
F
A
 
E
A
 
P
F
 
V
N
 
H
V
 
P
S
 
T
L
 
V
T
 
V
D
 
M
D
 
S
E
 
N
Y
 
H
K
 
I
L
 
H
V
 
V
Y
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
 
K
G
 
G
D
x
E
R
 
L
M
 
V
R
 
M
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
L
 
Y
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
S
 
G
R
 
Q
K
 
R
L
 
G
N
 
A
Y
 
F
T
 
H
R
 
V
C
 
I
R
 
E
A
 
E
I
 
Q
V
 
M
R
 
A
R
 
A
T
 
A
A
 
V
E
 
E
V
 
L
M
 
F
P
 
P
E
 
I
A
 
F
G
 
A
Y
 
R
W
 
A
D
 
H
Q
 
V
A
 
L
E
x
R
F
 
T
W
|
W
T
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
A
 
T
T
 
T
P
 
M
S
 
D
N
 
A
V
 
S
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
K
 
K
S
 
T
H
 
P
F
 
I
A
 
Q
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
|
T
L
x
G
G
|
G
W
x
F
T
x
K
H
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
H
I
 
T
I
 
I
D
 
A
G
 
H
R
 
D
K
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3ad8B Heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with pyrrole 2-carboxylate (see paper)
24% identity, 58% coverage: 171:419/427 of query aligns to 130:377/404 of 3ad8B

query
sites
3ad8B
G
 
G
C
 
V
D
 
D
R
 
A
Q
 
E
I
 
W
I
 
L
D
 
T
A
 
P
D
 
E
R
 
Q
A
 
V
V
 
K
E
 
E
L
 
V
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
K
 
N
P
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
N
I
 
I
R
 
R
N
 
Y
R
 
P
I
 
V
A
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
S
 
P
E
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
 
K
A
x
H
R
 
D
M
 
H
F
 
V
T
 
A
Q
 
W
N
 
A
L
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
K
C
 
A
A
 
N
E
 
E
A
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D
F
 
I
R
 
I
Y
 
Q
G
 
N
T
 
C
E
 
E
I
x
V
L
 
T
S
 
G
F
 
F
E
 
L
R
 
K
A
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
T
L
 
T
R
 
R
D
 
G
G
 
-
H
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
T
L
 
I
R
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
K
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
S
 
A
M
x
G
G
x
A
S
 
G
F
x
H
S
 
S
A
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
E
Q
 
L
L
 
A
G
 
G
I
 
F
F
 
E
L
 
L
N
 
-
I
 
-
Y
 
-
P
 
P
A
 
I
K
 
Q
G
 
S
Y
 
H
S
 
P
I
x
L
T
 
Q
V
 
A
P
 
L
V
|
V
K
 
S
N
 
E
E
 
L
E
 
F
A
 
E
A
 
P
F
 
V
N
 
H
V
 
P
S
 
T
L
 
V
T
 
V
D
x
M
D
 
S
E
 
N
Y
 
H
K
 
I
L
 
H
V
 
V
Y
|
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
 
K
G
 
G
D
x
E
R
 
L
M
 
V
R
 
M
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
L
 
Y
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
S
 
G
R
 
Q
K
 
R
L
 
G
N
 
A
Y
 
F
T
 
H
R
 
V
C
 
I
R
 
E
A
 
E
I
 
Q
V
 
M
R
 
A
R
 
A
T
 
A
A
 
V
E
 
E
V
 
L
M
 
F
P
 
P
E
 
I
A
 
F
G
 
A
Y
 
R
W
 
A
D
 
H
Q
 
V
A
 
L
E
x
R
F
 
T
W
|
W
T
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
A
 
T
T
 
T
P
 
M
S
 
D
N
 
A
V
 
S
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
K
 
K
S
 
T
H
 
P
F
 
I
A
 
Q
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
|
T
L
x
G
G
|
G
W
x
F
T
x
K
H
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
H
I
 
T
I
 
I
D
 
A
G
 
H
R
 
D
K
 
E
P
 
P
E
 
H

Sites not aligning to the query:

3ad7B Heterotetrameric sarcosine oxidase from corynebacterium sp. U-96 in complex with methylthio acetate (see paper)
24% identity, 58% coverage: 171:419/427 of query aligns to 130:377/404 of 3ad7B

query
sites
3ad7B
G
 
G
C
 
V
D
 
D
R
 
A
Q
 
E
I
 
W
I
 
L
D
 
T
A
 
P
D
 
E
R
 
Q
A
 
V
V
 
K
E
 
E
L
 
V
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
K
 
N
P
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
N
I
 
I
R
 
R
N
 
Y
R
 
P
I
 
V
A
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
S
 
P
E
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
 
K
A
x
H
R
 
D
M
 
H
F
 
V
T
 
A
Q
 
W
N
 
A
L
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
K
C
 
A
A
 
N
E
 
E
A
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D
F
 
I
R
 
I
Y
 
Q
G
 
N
T
 
C
E
 
E
I
x
V
L
 
T
S
 
G
F
 
F
E
 
L
R
 
K
A
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
T
L
 
T
R
 
R
D
 
G
G
 
-
H
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
T
L
 
I
R
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
K
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
S
 
A
M
x
G
G
x
A
S
 
G
F
x
H
S
 
S
A
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
E
Q
 
L
L
 
A
G
 
G
I
 
F
F
 
E
L
 
L
N
 
-
I
 
-
Y
 
-
P
 
P
A
 
I
K
 
Q
G
 
S
Y
 
H
S
 
P
I
x
L
T
 
Q
V
 
A
P
 
L
V
|
V
K
 
S
N
 
E
E
 
L
E
 
F
A
 
E
A
 
P
F
 
V
N
 
H
V
 
P
S
 
T
L
 
V
T
 
V
D
x
M
D
 
S
E
 
N
Y
 
H
K
 
I
L
 
H
V
 
V
Y
|
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
x
K
G
 
G
D
x
E
R
 
L
M
 
V
R
 
M
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
L
 
Y
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
S
 
G
R
 
Q
K
 
R
L
 
G
N
 
A
Y
 
F
T
 
H
R
 
V
C
 
I
R
 
E
A
 
E
I
 
Q
V
 
M
R
 
A
R
 
A
T
 
A
A
 
V
E
 
E
V
 
L
M
 
F
P
 
P
E
 
I
A
 
F
G
 
A
Y
 
R
W
 
A
D
 
H
Q
 
V
A
 
L
E
x
R
F
 
T
W
|
W
T
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
A
 
T
T
 
T
P
 
M
S
 
D
N
 
A
V
 
S
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
K
 
K
S
 
T
H
 
P
F
 
I
A
 
Q
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
|
T
L
x
G
G
|
G
W
x
F
T
x
K
H
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
H
I
 
T
I
 
I
D
 
A
G
 
H
R
 
D
K
 
E
P
 
P
E
 
H

Sites not aligning to the query:

Q50LF2 Sarcosine oxidase subunit beta; Sarcosine oxidase subunit B; Sarcosine oxidase (5,10-methylenetetrahydrofolate-forming) subunit beta; Tetrameric sarcosine oxidase subunit beta; TSOX subunit beta; EC 1.5.3.24 from Corynebacterium sp. (strain U-96) (see 4 papers)
24% identity, 58% coverage: 171:419/427 of query aligns to 131:378/405 of Q50LF2

query
sites
Q50LF2
G
 
G
C
 
V
D
 
D
R
 
A
Q
 
E
I
 
W
I
 
L
D
 
T
A
 
P
D
 
E
R
 
Q
A
 
V
V
 
K
E
 
E
L
 
V
E
 
C
P
 
P
A
 
I
L
 
I
K
 
N
P
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
N
I
 
I
R
 
R
N
 
Y
R
 
P
I
 
V
A
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
Y
 
Y
T
 
Q
S
 
P
E
 
R
D
 
A
E
 
G
S
 
I
G
 
A
D
x
K
A
x
H
R
 
D
M
 
H
F
 
V
T
 
A
Q
 
W
N
 
A
L
 
F
A
 
A
K
 
R
R
 
K
C
 
A
A
 
N
E
 
E
A
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
D
F
 
I
R
 
I
Y
 
Q
G
 
N
T
 
C
E
 
E
I
x
V
L
 
T
S
 
G
F
 
F
E
 
L
R
 
K
A
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
T
L
 
T
R
 
R
D
 
G
G
 
-
H
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
T
L
 
I
R
 
L
A
 
A
D
 
G
A
 
K
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
G
G
 
A
S
 
G
F
 
H
S
 
S
A
 
S
A
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
E
Q
 
L
L
 
A
G
 
G
I
 
F
F
 
E
L
 
L
N
 
-
I
 
-
Y
 
-
P
 
P
A
 
I
K
 
Q
G
 
S
Y
 
H
S
 
P
I
 
L
T
 
Q
V
 
A
P
 
L
V
 
V
K
 
S
N
 
E
E
 
L
E
 
F
A
 
E
A
 
P
F
 
V
N
 
H
V
 
P
S
 
T
L
 
V
T
 
V
D
 
M
D
 
S
E
 
N
Y
 
H
K
 
I
L
x
H
V
 
V
Y
|
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
Q
S
 
A
R
 
H
L
 
K
G
 
G
D
 
E
R
 
L
M
 
V
R
 
M
V
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
D
E
 
S
L
 
Y
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
S
 
G
R
 
Q
K
 
R
L
 
G
N
 
A
Y
 
F
T
 
H
R
 
V
C
 
I
R
 
E
A
 
E
I
 
Q
V
 
M
R
 
A
R
 
A
T
 
A
A
 
V
E
 
E
V
 
L
M
 
F
P
 
P
E
 
I
A
 
F
G
 
A
Y
 
R
W
 
A
D
 
H
Q
 
V
A
 
L
E
 
R
F
 
T
W
 
W
T
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
D
A
 
T
T
 
T
P
 
M
S
 
D
N
 
A
V
 
S
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
G
 
S
K
 
K
S
 
T
H
 
P
F
 
I
A
 
Q
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
N
 
N
T
 
C
G
 
G
H
 
W
G
|
G
T
 
T
L
 
G
G
|
G
W
 
F
T
x
K
H
 
G
S
 
T
C
 
P
G
 
G
S
 
A
A
 
G
A
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
H
I
 
T
I
 
I
D
 
A
G
 
H
R
 
D
K
 
E
P
 
P
E
 
H

Sites not aligning to the query:

1ng3A Complex of thio (glycine oxidase) with acetyl-glycine (see paper)
24% identity, 53% coverage: 196:422/427 of query aligns to 136:355/364 of 1ng3A

query
sites
1ng3A
I
 
I
A
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
S
Y
 
F
T
 
I
S
 
Q
E
 
D
D
 
D
E
 
V
S
 
H
G
 
V
D
 
E
A
 
P
R
 
Y
M
 
F
F
 
V
T
 
C
Q
 
K
N
 
A
L
 
Y
A
 
V
K
 
K
R
 
A
C
 
A
A
 
K
E
 
M
A
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
E
F
 
I
R
 
F
Y
 
E
G
 
H
T
 
T
E
 
P
I
x
V
L
 
L
S
 
H
F
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
-
V
 
A
L
 
L
G
 
F
I
 
I
Q
 
K
T
 
T
L
 
P
R
 
S
D
 
G
G
 
-
H
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
D
L
 
V
R
 
W
A
 
A
D
 
N
A
 
H
Y
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
A
M
x
S
G
|
G
S
 
V
F
x
W
S
 
S
A
 
G
A
 
M
L
x
F
A
 
F
S
 
K
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
F
 
N
L
 
N
N
 
A
I
 
F
Y
 
L
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
I
 
L
T
 
S
V
 
V
P
 
-
V
 
-
K
 
W
N
 
N
E
 
D
E
 
D
A
 
I
A
 
P
F
 
L
N
 
T
V
 
K
S
 
T
L
 
L
T
 
Y
D
 
H
D
 
D
E
 
H
Y
 
C
K
x
Y
L
 
I
V
 
V
Y
 
P
S
 
R
R
 
K
L
 
S
G
 
G
D
 
-
R
|
R
M
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
L
 
P
N
 
G
G
 
D
Y
 
W
S
 
S
R
 
E
K
 
T
L
 
P
N
 
D
Y
 
L
T
 
G
R
 
G
C
 
L
R
 
E
A
 
S
I
 
V
V
 
M
R
 
K
R
 
K
T
 
A
A
 
K
E
 
T
V
 
M
M
 
L
P
 
P
E
 
P
A
 
I
G
 
Q
Y
 
N
W
 
M
D
 
K
Q
 
V
A
 
D
E
 
R
F
 
F
W
 
W
T
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
A
 
G
T
 
T
P
 
K
S
 
D
N
 
G
V
 
K
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
K
 
R
S
 
H
-
 
P
H
 
E
F
 
D
A
 
S
N
 
R
L
 
I
Y
 
L
L
 
F
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
 
F
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
 
L
H
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
S
D
 
D
I
 
L
I
 
I
D
 
M
G
 
N
R
 
K
K
 
E
P
 
V
E
 
N
V
 
Q
D
 
D
F
 
W

Sites not aligning to the query:

O31616 Glycine oxidase; GO; EC 1.4.3.19 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 3 papers)
24% identity, 53% coverage: 196:422/427 of query aligns to 136:355/369 of O31616

query
sites
O31616
I
 
I
A
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
S
Y
 
F
T
 
I
S
 
Q
E
 
D
D
 
D
E
 
V
S
 
H
G
 
V
D
 
E
A
 
P
R
 
Y
M
 
F
F
 
V
T
 
C
Q
 
K
N
 
A
L
 
Y
A
 
V
K
 
K
R
 
A
C
 
A
A
 
K
E
 
M
A
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
E
F
 
I
R
 
F
Y
 
E
G
 
H
T
 
T
E
 
P
I
x
V
L
 
L
S
 
H
F
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
-
V
 
A
L
 
L
G
 
F
I
 
I
Q
 
K
T
 
T
L
 
P
R
 
S
D
 
G
G
 
-
H
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
D
L
 
V
R
 
W
A
 
A
D
 
N
A
 
H
Y
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
A
M
 
S
G
 
G
S
 
V
F
 
W
S
 
S
A
 
G
A
 
M
L
 
F
A
 
F
S
 
K
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
F
 
N
L
 
N
N
 
A
I
 
F
Y
 
L
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
I
 
L
T
 
S
V
 
V
P
 
-
V
 
-
K
 
W
N
 
N
E
 
D
E
 
D
A
 
I
A
 
P
F
 
L
N
 
T
V
 
K
S
 
T
L
 
L
T
 
Y
D
 
H
D
 
D
E
x
H
Y
 
C
K
 
Y
L
 
I
V
 
V
Y
 
P
S
 
R
R
 
K
L
 
S
G
 
G
D
 
-
R
 
R
M
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
L
 
P
N
 
G
G
 
D
Y
 
W
S
 
S
R
 
E
K
 
T
L
 
P
N
 
D
Y
 
L
T
 
G
R
 
G
C
 
L
R
 
E
A
 
S
I
 
V
V
 
M
R
 
K
R
 
K
T
 
A
A
 
K
E
 
T
V
 
M
M
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
I
G
 
Q
Y
 
N
W
 
M
D
 
K
Q
 
V
A
 
D
E
 
R
F
 
F
W
 
W
T
 
A
G
 
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
A
 
G
T
 
T
P
 
K
S
 
D
N
 
G
V
 
K
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
K
 
R
S
 
H
-
 
P
H
 
E
F
 
D
A
 
S
N
 
R
L
 
I
Y
 
L
L
 
F
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
x
F
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
x
L
H
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
S
D
 
D
I
 
L
I
 
I
D
 
M
G
 
N
R
 
K
K
 
E
P
 
V
E
 
N
V
 
Q
D
 
D
F
 
W

Sites not aligning to the query:

3if9A Crystal structure of glycine oxidase g51s/a54r/h244a mutant in complex with inhibitor glycolate (see paper)
24% identity, 53% coverage: 196:422/427 of query aligns to 136:355/364 of 3if9A

query
sites
3if9A
I
 
I
A
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
S
Y
 
F
T
 
I
S
 
Q
E
 
D
D
 
D
E
 
V
S
 
H
G
 
V
D
 
E
A
 
P
R
 
Y
M
 
F
F
 
V
T
 
C
Q
 
K
N
 
A
L
 
Y
A
 
V
K
 
K
R
 
A
C
 
A
A
 
K
E
 
M
A
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
E
F
 
I
R
 
F
Y
 
E
G
 
H
T
 
T
E
x
P
I
x
V
L
 
L
S
 
H
F
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
D
G
 
G
E
 
E
R
 
-
V
 
A
L
 
L
G
 
F
I
 
I
Q
 
K
T
 
T
L
 
P
R
 
S
D
 
G
G
 
-
H
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
D
L
 
V
R
 
W
A
 
A
D
 
N
A
 
H
Y
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
A
M
x
S
G
|
G
S
 
V
F
x
W
S
 
S
A
 
G
A
 
M
L
x
F
A
 
F
S
 
K
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
F
 
N
L
 
N
N
 
A
I
 
F
Y
 
L
P
 
P
A
 
V
K
 
K
G
 
G
Y
 
E
S
 
C
I
 
L
T
 
S
V
 
V
P
 
-
V
 
-
K
 
W
N
 
N
E
 
D
E
 
D
A
 
I
A
 
P
F
 
L
N
 
T
V
 
K
S
 
T
L
 
L
T
 
Y
D
 
H
D
 
D
E
 
A
Y
 
C
K
x
Y
L
 
I
V
 
V
Y
 
P
S
 
R
R
 
K
L
 
S
G
 
G
D
 
-
R
 
R
M
 
L
R
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
A
 
M
E
 
K
L
 
P
N
 
G
G
 
D
Y
 
W
S
 
S
R
 
E
K
 
T
L
 
P
N
 
D
Y
 
L
T
 
G
R
 
G
C
 
L
R
 
E
A
 
S
I
 
V
V
 
M
R
 
K
R
 
K
T
 
A
A
 
K
E
 
T
V
 
M
M
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
I
G
 
Q
Y
 
N
W
 
M
D
 
K
Q
 
V
A
 
D
E
 
R
F
 
F
W
 
W
T
 
A
G
|
G
L
 
L
R
|
R
P
 
P
A
 
G
T
 
T
P
 
K
S
 
D
N
 
G
V
 
K
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
K
 
R
S
 
H
-
 
P
H
 
E
F
 
D
A
 
S
N
 
R
L
 
I
Y
 
L
L
 
F
N
 
A
T
 
A
G
 
G
H
|
H
G
x
F
T
x
R
L
x
N
G
|
G
W
x
I
T
 
L
H
 
L
S
 
A
C
 
P
G
 
A
S
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
L
L
 
I
A
 
S
D
 
D
I
 
L
I
 
I
D
 
M
G
 
N
R
 
K
K
 
E
P
 
V
E
 
N
V
 
Q
D
 
D
F
 
W

Sites not aligning to the query:

3gsiA Crystal structure of d552a dimethylglycine oxidase mutant of arthrobacter globiformis in complex with tetrahydrofolate (see paper)
23% identity, 96% coverage: 13:422/427 of query aligns to 4:382/827 of 3gsiA

query
sites
3gsiA
I
 
I
L
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
V
x
I
V
|
V
G
 
G
T
 
T
T
 
N
T
 
L
A
 
A
W
 
D
Y
 
E
L
 
L
Q
 
V
K
 
T
Q
 
R
G
 
G
-
 
W
H
 
N
Q
 
N
V
 
I
T
 
T
V
 
V
V
 
L
D
|
D
R
x
Q
Q
 
G
-
 
P
-
 
L
N
 
N
Q
 
M
A
 
P
G
 
G
L
x
G
E
x
S
T
|
T
S
 
S
Y
x
H
A
 
A
N
x
P
G
 
G
G
x
L
Q
 
V
I
 
F
S
 
Q
V
 
T
S
 
-
H
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
W
 
-
A
 
-
N
 
N
P
 
P
S
 
S
A
 
-
P
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
M
 
-
K
 
-
W
 
-
L
 
-
F
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
R
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
C
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
N
 
-
I
 
-
R
 
K
Q
 
T
M
 
M
V
 
A
N
 
S
L
 
F
G
 
A
T
 
K
Y
 
Y
S
 
T
C
 
V
S
 
E
Q
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
R
 
T
E
 
E
E
 
D
A
 
G
G
 
V
I
 
S
E
 
C
Y
 
F
N
 
N
H
 
Q
L
 
V
E
 
-
K
 
-
G
 
G
I
 
G
L
 
L
H
 
E
F
 
V
Y
 
A
T
 
T
N
 
T
P
 
E
A
 
T
E
 
R
F
 
L
D
 
A
G
 
D
A
 
L
M
 
K
E
 
R
P
 
K
T
 
L
R
 
G
I
 
Y
M
 
A
Q
 
A
D
 
A
L
 
W
G
 
G
C
 
I
D
 
E
R
 
G
Q
 
R
I
 
L
I
 
L
D
 
S
A
 
P
D
 
A
R
 
E
A
 
C
V
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
Y
P
 
P
A
 
L
L
 
L
K
 
D
P
 
-
I
 
-
R
 
G
N
 
E
R
 
N
I
 
I
A
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
L
Y
 
H
T
 
V
S
 
P
E
 
S
D
 
D
E
 
G
S
 
L
G
 
A
D
 
S
A
 
A
R
 
A
M
 
R
F
 
A
T
 
V
Q
 
Q
N
 
L
L
 
L
A
 
I
K
 
K
R
 
R
C
 
T
A
 
E
E
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
T
F
 
Y
R
 
R
Y
 
G
G
 
S
T
 
T
E
x
T
I
x
V
L
 
T
S
 
G
F
 
I
E
 
E
R
 
Q
A
 
S
G
 
G
E
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
T
G
 
G
I
 
V
Q
 
Q
T
 
T
L
 
-
R
 
A
D
 
D
G
 
G
H
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
V
L
 
I
R
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
I
Y
 
V
V
 
V
L
 
S
S
 
C
M
x
A
G
|
G
S
 
F
F
x
W
S
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
I
A
 
G
S
 
A
Q
 
M
L
 
I
G
 
G
I
 
M
F
 
A
L
 
V
N
 
P
I
 
L
Y
 
L
P
 
P
-
 
L
A
 
A
K
x
H
G
 
Q
Y
 
Y
S
 
V
I
 
K
T
 
T
V
 
T
P
 
P
V
 
V
K
 
P
N
 
A
E
 
Q
E
 
Q
A
 
G
A
 
R
F
 
N
N
 
D
V
 
Q
S
 
P
-
 
N
-
 
G
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
I
L
 
L
T
 
R
D
 
H
D
 
Q
E
 
D
Y
 
Q
K
x
D
L
 
L
V
x
Y
Y
 
Y
S
 
R
R
 
E
L
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
R
M
 
Y
R
 
G
V
 
I
A
 
G
G
 
S
T
 
Y
A
 
A
E
 
H
-
 
R
-
 
P
-
 
M
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
T
L
 
L
N
 
G
G
 
A
Y
 
Y
S
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
H
-
 
H
-
 
M
-
 
P
R
 
S
K
 
R
L
 
L
N
 
D
Y
 
F
T
 
T
R
 
L
C
 
E
R
 
D
A
 
F
I
 
L
V
 
P
-
 
A
-
 
W
R
 
E
R
 
A
T
 
T
A
 
K
E
 
Q
V
 
L
M
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
L
G
 
A
Y
 
D
W
 
S
D
 
E
Q
 
I
A
 
E
E
 
D
F
 
G
W
 
F
T
 
N
G
|
G
L
x
I
R
x
F
P
 
S
A
 
F
T
 
T
P
 
P
S
 
D
N
 
G
V
 
G
P
 
P
Y
 
L
I
 
L
G
 
G
K
 
E
S
 
S
-
 
K
H
 
E
F
 
L
A
 
D
N
 
G
L
 
F
Y
 
Y
L
 
V
N
 
A
T
 
E
G
 
A
H
x
V
G
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
W
|
W
-
x
V
T
|
T
H
 
H
S
 
S
C
 
A
G
 
G
S
 
V
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
A
D
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
T
G
 
T
R
 
G
K
 
R
P
 
S
E
 
E
V
 
T
D
 
D
F
 
L

Sites not aligning to the query:

1pj7A Structure of dimethylglycine oxidase of arthrobacter globiformis in complex with folinic acid (see paper)
23% identity, 96% coverage: 13:422/427 of query aligns to 4:382/827 of 1pj7A

query
sites
1pj7A
I
 
I
L
 
V
V
 
I
L
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
x
I
V
|
V
G
 
G
T
 
T
T
 
N
T
 
L
A
 
A
W
 
D
Y
 
E
L
 
L
Q
 
V
K
 
T
Q
 
R
G
 
G
-
 
W
H
 
N
Q
 
N
V
 
I
T
 
T
V
 
V
V
 
L
D
|
D
R
x
Q
Q
 
G
-
 
P
-
 
L
N
 
N
Q
 
M
A
 
P
G
 
G
L
x
G
E
x
S
T
|
T
S
 
S
Y
x
H
A
 
A
N
x
P
G
 
G
G
x
L
Q
 
V
I
 
F
S
 
Q
V
 
T
S
 
-
H
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
W
 
-
A
 
-
N
 
N
P
 
P
S
 
S
A
 
-
P
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
M
 
-
K
 
-
W
 
-
L
 
-
F
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
F
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
R
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
F
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
C
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
N
 
-
I
 
-
R
 
K
Q
 
T
M
 
M
V
 
A
N
 
S
L
 
F
G
 
A
T
 
K
Y
 
Y
S
 
T
C
 
V
S
 
E
Q
 
K
L
 
L
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
R
 
T
E
 
E
E
 
D
A
 
G
G
 
V
I
 
S
E
 
C
Y
 
F
N
 
N
H
 
Q
L
 
V
E
 
-
K
 
-
G
 
G
I
 
G
L
 
L
H
 
E
F
 
V
Y
 
A
T
 
T
N
 
T
P
 
E
A
 
T
E
 
R
F
 
L
D
 
A
G
 
D
A
 
L
M
 
K
E
 
R
P
 
K
T
 
L
R
 
G
I
 
Y
M
 
A
Q
 
A
D
 
A
L
 
W
G
 
G
C
 
I
D
 
E
R
 
G
Q
 
R
I
 
L
I
 
L
D
 
S
A
 
P
D
 
A
R
 
E
A
 
C
V
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
Y
P
 
P
A
 
L
L
 
L
K