SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2696 FitnessBrowser__WCS417:GFF2696 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6ihhA Crystal structure of rasadh f12 from ralstonia.Sp in complex with NADPH and a6o
53% identity, 100% coverage: 1:249/249 of query aligns to 1:249/249 of 6ihhA

query
sites
6ihhA
M
 
M
S
 
Y
R
 
R
L
 
L
N
 
L
G
 
N
K
 
K
I
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
|
N
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
K
R
 
R
F
 
F
A
 
V
T
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
Y
V
 
V
V
 
F
I
 
I
V
 
V
G
 
G
R
|
R
R
|
R
Q
 
R
D
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
K
 
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
E
I
 
I
G
 
G
H
 
R
E
 
N
A
 
V
I
 
T
A
 
A
I
 
V
Q
 
K
G
 
A
D
|
D
I
x
V
S
 
T
K
 
K
L
 
L
D
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
R
I
 
L
F
 
Y
T
 
A
Q
 
I
I
 
V
K
 
R
A
 
E
D
 
Q
K
 
R
G
 
G
R
 
S
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
A
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
L
 
A
G
 
V
D
 
E
F
 
Q
Q
 
K
P
 
T
I
 
L
G
 
E
S
 
E
I
 
I
T
 
T
E
 
P
E
 
E
S
 
H
F
 
Y
D
 
D
R
 
R
T
 
T
F
 
F
G
 
D
I
x
V
N
 
N
V
 
V
K
 
R
G
 
G
T
 
L
L
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
Q
 
Q
N
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
L
H
 
R
A
 
D
G
 
G
S
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
I
L
 
L
T
|
T
G
 
S
S
|
S
T
 
V
T
 
A
G
 
G
T
 
V
M
 
L
G
 
G
T
 
L
P
 
Q
A
 
A
F
x
H
S
 
D
V
 
T
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
S
F
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
T
W
 
W
A
 
T
L
 
T
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
A
L
 
V
S
 
S
P
|
P
G
|
G
P
x
A
I
|
I
S
 
D
T
|
T
P
 
P
G
x
S
L
|
L
D
 
E
L
 
N
A
 
N
L
 
V
S
 
S
G
 
T
T
 
Q
G
 
E
Q
 
E
K
 
A
E
 
D
A
 
E
I
 
L
I
 
R
D
 
A
D
 
K
M
 
A
T
 
A
A
 
A
Q
 
A
V
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
K
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
S
 
S
S
 
S
F
 
Y
M
 
V
T
 
A
G
 
G
S
 
I
E
 
E
M
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
x
L
A
 
T
Q
 
Q
V
 
V

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
53% identity, 100% coverage: 1:249/249 of query aligns to 1:249/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
M
 
M
S
 
Y
R
 
R
L
 
L
N
 
L
G
 
N
K
 
K
I
 
T
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
|
N
S
|
S
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
I
 
K
R
 
R
F
 
F
A
 
V
T
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
Y
V
 
V
V
 
F
I
 
I
V
 
V
G
 
G
R
|
R
R
|
R
Q
 
R
D
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
K
 
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
E
I
 
I
G
 
G
H
 
R
E
 
N
A
 
V
I
 
T
A
 
A
I
 
V
Q
 
K
G
x
A
D
|
D
I
x
V
S
 
T
K
 
K
L
 
L
D
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
R
I
 
L
F
 
Y
T
 
A
Q
 
I
I
 
V
K
 
R
A
 
E
D
 
Q
K
 
R
G
 
G
R
 
S
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
A
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
L
 
A
G
 
I
D
 
E
F
 
Q
Q
 
K
P
 
T
I
 
L
G
 
E
S
 
E
I
 
I
T
 
T
E
 
P
E
 
E
S
 
H
F
 
Y
D
 
D
R
 
R
T
 
T
F
 
F
G
 
D
I
x
V
N
 
N
V
 
V
K
 
R
G
 
G
T
 
L
L
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
Q
 
Q
N
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
M
 
L
H
 
R
A
 
D
G
 
G
S
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
S
S
|
S
T
 
V
T
 
A
G
 
G
T
 
V
M
 
L
G
 
G
T
 
L
P
 
Q
A
 
A
F
x
H
S
 
D
V
 
T
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
S
F
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
T
W
 
W
A
 
T
L
 
T
D
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
G
S
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
A
L
 
V
S
 
S
P
 
P
G
|
G
P
 
A
I
|
I
S
 
D
T
|
T
P
 
P
G
x
I
L
 
I
D
 
E
L
 
N
A
 
Q
L
 
V
S
 
S
G
 
T
T
x
Q
G
 
E
Q
 
E
K
 
A
E
 
D
A
 
E
I
 
L
I
 
R
D
 
A
D
 
K
M
 
F
T
 
A
A
 
A
Q
 
A
V
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
K
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
S
 
S
S
 
S
F
 
Y
M
 
V
T
 
A
G
 
G
S
 
I
E
 
E
M
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
L
A
 
T
Q
 
Q
V
 
V

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
41% identity, 99% coverage: 1:246/249 of query aligns to 6:252/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
M
 
M
S
 
S
R
 
K
L
 
L
N
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
x
S
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
T
 
I
A
 
A
I
 
K
R
 
A
F
 
L
A
 
A
T
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
N
G
 
Y
R
x
A
R
x
S
Q
x
S
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
A
D
 
D
E
 
A
L
 
V
D
 
V
K
 
S
A
 
A
L
 
I
A
 
T
L
 
E
I
 
A
G
 
G
H
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
A
I
 
V
Q
 
G
G
|
G
D
|
D
I
x
V
S
 
S
K
 
K
L
 
A
D
 
A
D
 
D
L
 
A
A
 
Q
R
 
R
I
 
I
F
 
V
T
 
D
Q
 
T
I
 
A
K
 
I
A
 
E
D
 
T
K
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
L
 
V
G
x
Y
D
 
E
F
 
F
Q
 
A
P
 
P
I
 
I
G
 
E
S
 
A
I
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
E
S
 
H
F
 
Y
D
 
R
R
 
R
T
 
Q
F
 
F
G
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
V
K
 
F
G
 
G
T
 
V
L
 
L
F
 
L
T
 
T
V
 
T
Q
 
Q
N
 
A
A
 
A
L
 
V
P
 
K
L
 
H
M
 
L
H
 
G
A
 
E
G
 
G
S
 
A
S
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
N
T
x
I
G
 
S
S
|
S
T
 
V
T
 
V
G
 
T
T
 
S
M
 
I
G
 
T
T
 
P
P
 
P
A
 
A
F
 
S
S
 
A
V
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
G
T
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
D
N
 
A
F
 
I
A
 
T
R
 
G
S
 
V
W
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
L
K
 
G
G
 
P
S
 
R
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
A
L
 
I
S
 
N
P
|
P
G
|
G
P
x
M
I
|
I
S
 
V
T
|
T
P
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
E
G
|
G
T
|
T
G
 
H
Q
 
S
K
 
A
E
 
G
A
x
I
I
 
I
I
 
G
D
 
S
D
 
D
M
 
L
T
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
S
 
A
S
 
R
F
 
W
M
 
M
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
H
M
 
L
F
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
L

4esoB Crystal structure of a putative oxidoreductase protein from sinorhizobium meliloti 1021 in complex with NADP
39% identity, 98% coverage: 5:248/249 of query aligns to 4:246/251 of 4esoB

query
sites
4esoB
N
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
I
G
|
G
G
 
G
N
x
T
S
x
H
G
|
G
I
x
M
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
R
R
 
R
F
 
L
A
 
V
T
 
E
E
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
V
 
L
I
 
L
V
 
T
G
 
G
R
|
R
R
x
N
Q
 
E
D
 
S
E
x
N
L
 
I
D
 
A
K
 
R
A
 
I
L
 
R
A
 
E
L
 
E
I
 
F
G
 
G
H
 
P
E
 
R
A
 
V
I
 
H
A
 
A
I
 
L
Q
 
R
G
x
S
D
|
D
I
|
I
S
 
A
K
 
D
L
 
L
D
 
N
D
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
V
I
 
L
F
 
G
T
 
A
Q
 
A
I
 
A
K
 
G
A
 
Q
D
 
T
K
 
L
G
 
G
R
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
L
F
 
H
A
 
I
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
V
G
 
S
D
 
E
F
 
L
Q
 
E
P
 
P
I
 
F
G
 
D
S
 
Q
I
 
V
T
 
S
E
 
E
E
 
A
S
 
S
F
 
Y
D
 
D
R
 
R
T
 
Q
F
 
F
G
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
T
K
 
K
G
 
G
T
 
A
L
 
F
F
 
F
T
 
T
V
 
V
Q
 
Q
N
 
R
A
 
L
L
 
T
P
 
P
L
 
L
M
 
I
H
 
R
A
 
E
G
 
G
S
 
G
S
 
S
V
 
I
I
 
V
L
 
F
T
|
T
G
 
S
S
|
S
T
 
V
T
 
A
G
 
D
T
 
E
M
 
G
G
 
G
T
 
H
P
 
P
A
 
G
F
x
M
S
 
S
V
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
V
N
 
S
F
 
F
A
 
A
R
 
S
S
 
V
W
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
E
L
 
L
K
 
L
G
 
P
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
S
L
 
V
S
 
S
P
|
P
G
|
G
P
 
F
I
|
I
S
 
D
T
|
T
P
 
P
G
x
T
L
x
K
D
x
G
L
 
V
A
 
A
L
 
G
S
 
I
G
 
T
T
 
E
G
 
A
Q
 
E
K
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
F
E
 
K
A
 
T
I
 
L
I
 
G
D
 
D
D
 
N
M
 
I
T
 
T
A
 
-
Q
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
M
G
 
K
R
 
R
I
 
N
G
 
G
K
 
T
P
 
A
E
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
F
D
 
-
E
 
E
S
 
A
S
 
T
F
 
F
M
 
T
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
K
M
 
L
F
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
L
A
 
G
Q
 
Q

5t2uA Short chain dehydrogenase/reductase family protein (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:245/249 of query aligns to 3:237/241 of 5t2uA

query
sites
5t2uA
R
 
E
L
 
L
N
 
E
G
 
G
K
 
L
I
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
 
T
S
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
T
 
S
A
 
A
I
 
R
R
 
L
F
 
M
A
 
A
T
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
G
 
G
R
|
R
R
x
D
Q
 
A
D
 
Q
E
x
R
L
 
G
D
 
E
K
 
Q
A
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
D
I
 
I
G
 
G
H
 
H
E
 
G
A
 
A
I
 
R
A
 
F
I
 
V
Q
 
Q
G
 
A
D
|
D
I
x
L
S
 
G
K
 
D
L
 
L
D
 
D
D
 
S
L
 
V
A
 
A
R
 
D
I
 
L
F
 
A
T
 
A
Q
 
Q
I
 
A
K
 
P
A
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
D
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
G
 
-
D
 
-
F
 
-
Q
x
Y
P
 
P
I
 
Q
G
 
A
S
 
S
I
 
T
T
 
F
E
 
D
E
 
Q
S
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
G
F
 
F
D
 
Q
R
 
Q
T
 
L
F
 
F
G
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
V
K
 
R
G
 
G
T
 
T
L
 
Y
F
 
F
T
 
L
V
 
V
Q
 
A
N
 
A
A
 
A
L
 
A
P
 
K
L
 
G
M
 
M
H
 
V
A
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
H
G
 
G
S
 
S
S
 
I
V
 
V
I
 
N
L
x
I
T
 
T
G
 
-
S
x
T
T
 
L
T
 
A
G
 
A
T
 
H
M
 
K
G
 
G
T
 
F
P
 
P
A
 
G
F
x
T
S
 
S
V
 
V
Y
|
Y
S
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
E
N
 
S
F
 
L
A
 
T
R
 
R
S
 
T
W
 
W
A
 
A
L
 
A
D
 
E
L
 
F
K
 
G
G
 
A
S
 
N
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
S
L
 
V
S
 
S
P
|
P
G
 
G
P
|
P
I
x
T
S
 
R
T
|
T
P
 
P
G
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
x
T
G
x
T
T
 
L
G
 
E
Q
 
Q
K
 
L
E
 
G
A
 
D
I
 
F
I
 
I
D
 
D
D
 
D
M
 
V
T
 
A
A
 
A
Q
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
R
R
 
R
I
 
T
G
 
A
K
 
A
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
R
S
 
A
S
 
S
F
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
T
M
 
L
F
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6ci9D Rmm microcompartment-associated aminopropanol dehydrogenase NADP + aminoacetone holo-structure (see paper)
37% identity, 98% coverage: 1:245/249 of query aligns to 4:248/259 of 6ci9D

query
sites
6ci9D
M
 
F
S
 
T
R
 
S
L
 
L
N
 
E
G
 
G
K
 
R
I
 
S
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
x
S
S
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
G
T
 
I
A
 
A
I
 
E
R
 
T
F
 
F
A
 
A
T
 
N
E
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
G
|
G
R
|
R
R
x
N
Q
 
Q
D
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
D
K
 
R
A
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
D
I
 
L
G
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
R
H
 
G
E
 
K
A
 
V
I
 
T
A
 
A
I
 
V
Q
 
R
G
 
A
D
|
D
I
x
V
S
 
T
K
 
D
L
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
A
A
 
R
R
 
R
I
 
T
F
 
V
T
 
A
Q
 
E
I
 
T
K
 
V
A
 
S
D
 
R
K
 
H
G
 
G
R
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
V
F
 
C
A
 
A
N
|
N
A
 
A
G
|
G
L
 
I
G
x
F
D
 
P
F
 
S
Q
 
G
P
 
R
I
 
L
G
 
E
S
 
D
I
 
L
T
 
T
E
 
P
E
 
D
S
 
D
F
 
I
D
 
E
R
 
Q
T
 
V
F
 
L
G
 
G
I
 
V
N
 
N
V
 
F
K
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
V
F
 
Y
T
 
I
V
 
V
Q
 
Q
N
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
Q
L
 
A
M
 
L
H
 
T
A
 
A
G
 
S
S
 
G
S
 
H
-
 
G
-
 
R
V
 
V
I
 
V
L
 
V
T
|
T
G
 
S
S
|
S
T
 
I
T
|
T
G
 
G
T
 
P
M
 
I
-
 
T
G
 
G
T
 
Y
P
 
P
A
 
G
F
x
W
S
 
S
V
 
H
Y
|
Y
S
 
G
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
R
 
L
N
 
G
F
 
F
A
 
L
R
 
R
S
 
T
W
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
E
L
 
L
K
 
A
G
 
P
S
 
K
G
 
K
I
 
I
R
 
T
V
 
I
N
 
N
V
 
A
L
 
V
S
 
L
P
|
P
G
|
G
P
x
N
I
|
I
S
 
M
T
|
T
P
 
E
G
|
G
L
|
L
D
 
D
L
 
E
A
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
M
G
 
G
Q
 
Q
K
 
D
E
 
-
A
 
-
I
 
Y
I
 
L
D
 
D
D
 
Q
M
 
M
T
 
A
A
 
S
Q
 
A
V
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
S
P
 
V
E
 
A
E
 
D
V
 
I
A
 
G
A
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
A
S
 
T
D
 
D
E
 
E
S
 
A
S
 
A
F
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
Q
E
 
T
M
 
L
F
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7ejiB Crystal structure of kred f147l/l153q/y190p/l199a/m205f/m206f variant and methyl methacrylate complex
38% identity, 98% coverage: 3:246/249 of query aligns to 3:248/251 of 7ejiB

query
sites
7ejiB
R
 
R
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
x
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
I
 
D
R
 
K
F
 
F
A
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
G
 
G
R
|
R
R
x
H
Q
 
A
D
 
D
E
 
V
L
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
G
E
 
T
A
 
D
I
 
V
A
 
I
-
 
R
-
 
F
I
 
V
Q
 
Q
G
 
H
D
|
D
I
x
A
S
 
S
K
 
D
L
 
E
D
 
A
D
 
G
L
 
W
A
 
T
R
 
K
I
 
L
F
 
F
T
 
D
Q
 
T
I
 
T
K
 
E
A
 
E
D
 
A
K
 
F
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
T
V
 
T
L
 
V
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
G
 
A
D
 
V
F
 
S
Q
 
K
P
 
S
I
 
V
G
 
E
S
 
D
I
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
E
S
 
E
F
 
W
D
 
R
R
 
K
T
 
L
F
 
L
G
 
S
I
x
V
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
V
 
T
Q
 
R
N
 
L
A
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
M
 
M
H
 
K
A
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
L
G
 
G
S
 
A
S
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
N
T
x
M
G
 
S
S
|
S
T
x
I
T
 
E
G
 
G
T
 
L
M
 
V
G
 
G
T
 
D
P
 
P
A
 
T
F
 
Q
S
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
I
F
 
M
A
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
D
S
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
T
L
 
V
S
 
H
P
|
P
G
 
G
P
|
P
I
|
I
S
 
K
T
|
T
P
|
P
G
x
L
L
 
V
D
 
D
L
 
D
A
 
A
L
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
E
G
 
G
Q
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
F
I
x
F
I
 
-
D
 
-
D
 
S
M
 
Q
T
 
R
A
 
T
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
I
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
W
A
 
I
A
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
K
F
 
F
M
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
E
M
 
F
F
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y

7ejhA Crystal structure of kred mutant-f147l/l153q/y190p/l199a/m205f/m206f and 2-hydroxyisoindoline-1,3-dione complex
38% identity, 98% coverage: 3:246/249 of query aligns to 5:250/253 of 7ejhA

query
sites
7ejhA
R
 
R
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
x
T
S
 
L
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
I
 
D
R
 
K
F
 
F
A
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
G
 
G
R
|
R
R
x
H
Q
 
A
D
 
D
E
 
V
L
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
G
E
 
T
A
 
D
I
 
V
A
 
I
-
 
R
-
 
F
I
 
V
Q
 
Q
G
 
H
D
|
D
I
x
A
S
 
S
K
 
D
L
 
E
D
 
A
D
 
G
L
 
W
A
 
T
R
 
K
I
 
L
F
 
F
T
 
D
Q
 
T
I
 
T
K
 
E
A
 
E
D
 
A
K
 
F
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
T
V
 
T
L
 
V
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
G
 
A
D
 
V
F
 
S
Q
 
K
P
 
S
I
 
V
G
 
E
S
 
D
I
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
E
S
 
E
F
 
W
D
 
R
R
 
K
T
 
L
F
 
L
G
 
S
I
x
V
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
V
 
T
Q
 
R
N
 
L
A
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
M
 
M
H
 
K
A
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
L
G
 
G
S
 
A
S
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
N
T
x
M
G
 
S
S
|
S
T
x
I
T
x
E
G
 
G
T
 
L
M
 
V
G
 
G
T
 
D
P
 
P
A
 
T
F
 
Q
S
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
I
F
 
M
A
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
D
S
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
T
L
 
V
S
 
H
P
|
P
G
|
G
P
|
P
I
|
I
S
 
K
T
|
T
P
|
P
G
x
L
L
x
V
D
 
D
L
 
D
A
 
A
L
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
E
G
 
G
Q
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
F
I
x
F
I
 
-
D
 
-
D
 
S
M
 
Q
T
 
R
A
 
T
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
I
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
W
A
 
I
A
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
K
F
 
F
M
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
E
M
 
F
F
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y

1zk4A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (wildtype) from lactobacillus brevis in complex with acetophenone and NADP (see paper)
37% identity, 98% coverage: 2:246/249 of query aligns to 2:248/251 of 1zk4A

query
sites
1zk4A
S
 
N
R
 
R
L
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
x
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
I
 
T
R
 
K
F
 
F
A
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
M
I
 
I
V
x
T
G
|
G
R
|
R
R
 
H
Q
 
S
D
 
D
E
 
V
L
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
S
I
 
V
G
 
G
-
 
T
-
 
P
H
 
D
E
 
Q
A
 
I
I
 
Q
A
 
F
I
 
F
Q
 
Q
G
x
H
D
|
D
I
 
S
S
 
S
K
 
D
L
 
E
D
 
D
D
 
G
L
 
W
A
 
T
R
 
K
I
 
L
F
 
F
T
 
D
Q
 
A
I
 
T
K
 
E
A
 
K
D
 
A
K
 
F
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
S
V
 
T
L
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
I
G
x
A
D
 
V
F
 
N
Q
 
K
P
 
S
I
 
V
G
 
E
S
 
E
I
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
A
S
 
E
F
 
W
D
 
R
R
 
K
T
 
L
F
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
V
 
T
Q
 
R
N
 
L
A
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
M
 
M
H
 
K
A
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
L
G
 
G
S
 
A
S
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
N
T
 
M
G
 
S
S
|
S
T
 
I
T
 
E
G
 
G
T
 
F
M
 
V
G
 
G
T
 
D
P
 
P
A
 
S
F
 
L
S
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
I
F
 
M
A
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
D
S
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
T
L
 
V
S
 
H
P
 
P
G
|
G
P
x
Y
I
|
I
S
 
K
T
|
T
P
 
P
G
x
L
L
 
V
D
 
D
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
D
G
 
L
T
 
P
G
 
G
Q
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
M
I
 
-
D
 
-
D
 
S
M
 
Q
T
 
R
A
 
T
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
I
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
A
 
I
A
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
S
 
S
S
 
K
F
 
F
M
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
F
F
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 99% coverage: 1:246/249 of query aligns to 2:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
Q
G
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
I
 
R
R
 
V
F
 
F
A
 
M
T
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
A
G
 
-
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
E
x
D
L
x
F
D
 
N
K
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
G
H
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
E
-
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
F
I
 
I
Q
 
R
G
x
V
D
|
D
I
x
V
S
 
S
K
 
D
L
 
R
D
 
E
D
 
S
L
 
V
A
 
H
R
 
R
I
 
L
F
 
V
T
 
E
Q
 
N
I
 
V
K
 
A
A
 
E
D
 
R
K
 
F
G
 
G
R
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
I
G
 
T
D
 
R
F
x
D
Q
 
S
P
 
M
I
 
L
G
 
S
S
x
K
I
 
M
T
 
T
E
 
V
E
 
D
S
 
Q
F
 
F
D
 
Q
R
 
Q
T
 
V
F
 
I
G
 
N
I
 
V
N
|
N
V
 
L
K
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
H
T
 
C
V
 
T
Q
 
Q
N
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
Y
M
 
M
-
 
A
-
 
E
H
 
Q
A
 
G
G
 
K
S
 
G
S
 
K
V
 
I
I
 
I
L
 
N
T
|
T
G
 
S
S
|
S
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
Y
G
 
G
T
x
N
P
x
V
A
 
G
F
x
Q
S
 
T
V
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
L
 
V
R
 
I
N
 
G
F
 
M
A
 
T
R
 
K
S
 
T
W
 
W
A
 
A
L
 
K
D
 
E
L
 
L
K
 
A
G
 
R
S
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
A
L
 
V
S
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
I
x
T
S
 
E
T
|
T
P
 
A
G
x
M
L
 
V
D
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
A
G
 
E
Q
 
V
K
 
P
E
 
E
A
 
K
I
 
V
I
 
I
D
 
E
D
x
K
M
 
M
T
 
K
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
S
 
S
S
 
D
F
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
G
S
 
H
E
 
V
M
 
L
F
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
I

Q6WVP7 NADP-dependent (R)-specific alcohol dehydrogenase; (R)-specific ADH; Ketoreductase; KRED; EC 1.1.1.- from Lentilactobacillus kefiri (Lactobacillus kefiri) (see paper)
38% identity, 98% coverage: 3:246/249 of query aligns to 4:249/252 of Q6WVP7

query
sites
Q6WVP7
R
 
R
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
N
x
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
I
 
D
R
 
K
F
 
F
A
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
G
 
G
R
|
R
R
x
H
Q
 
A
D
 
D
E
 
V
L
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
S
I
 
I
G
 
G
H
 
G
E
 
T
A
 
D
I
 
V
A
 
I
-
 
R
-
 
F
I
 
V
Q
 
Q
G
 
H
D
|
D
I
x
A
S
 
S
K
 
D
L
 
E
D
 
A
D
 
G
L
 
W
A
 
T
R
 
K
I
 
L
F
 
F
T
 
D
Q
 
T
I
 
T
K
 
E
A
 
E
D
 
A
K
 
F
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
T
V
 
T
L
 
V
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
A
D
 
V
F
 
S
Q
 
K
P
 
S
I
 
V
G
 
E
S
 
D
I
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
E
S
 
E
F
 
W
D
 
R
R
 
K
T
 
L
F
 
L
G
 
S
I
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
V
 
T
Q
 
R
N
 
L
A
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
M
 
M
H
 
K
A
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
L
G
 
G
S
 
A
S
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
N
T
 
M
G
 
S
S
 
S
T
 
I
T
 
E
G
 
G
T
 
F
M
 
V
G
 
G
T
 
D
P
 
P
A
 
T
F
 
L
S
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
I
F
 
M
A
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
D
S
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
T
L
 
V
S
 
H
P
 
P
G
 
G
P
 
Y
I
|
I
S
x
K
T
|
T
P
|
P
G
x
L
L
 
V
D
 
D
L
 
-
A
 
D
L
 
L
S
 
E
G
 
G
T
 
A
G
 
-
Q
 
-
K
 
-
E
 
E
A
 
E
I
 
M
I
 
M
D
 
S
D
 
Q
M
 
R
T
 
T
A
 
-
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
I
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
W
A
 
I
A
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
S
 
K
F
 
F
M
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
E
M
 
F
F
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

6y0sAAA R-specific alcohol dehydrogenase (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:246/249 of query aligns to 2:248/251 of 6y0sAAA

query
sites
6y0sAAA
S
 
N
R
 
R
L
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
N
x
T
S
 
L
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
I
 
T
R
 
K
F
 
F
A
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
M
I
 
I
V
 
T
G
|
G
R
 
R
R
x
H
Q
 
S
D
 
D
E
x
V
L
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
S
I
 
V
G
 
G
-
 
T
-
 
P
H
 
D
E
 
Q
A
 
I
I
 
Q
A
 
F
I
 
F
Q
 
Q
G
 
H
D
 
D
I
 
S
S
 
S
K
 
D
L
 
E
D
 
D
D
 
G
L
 
W
A
 
T
R
 
K
I
 
L
F
 
F
T
 
D
Q
 
A
I
 
T
K
 
E
A
 
K
D
 
A
K
 
F
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
S
V
 
T
L
 
L
F
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
A
D
 
V
F
 
N
Q
 
K
P
 
S
I
 
V
G
 
E
S
 
E
I
 
T
T
 
E
E
 
T
E
 
A
S
 
E
F
 
W
D
 
R
R
 
K
T
 
L
F
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
V
 
T
Q
 
R
N
 
L
A
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
M
 
M
H
 
K
A
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
L
G
|
G
S
x
A
S
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
N
T
 
M
G
 
S
S
|
S
T
 
I
T
 
E
G
 
G
T
 
F
M
 
V
G
 
G
T
 
D
P
 
P
A
 
S
F
 
L
S
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
 
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
I
F
 
M
A
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
D
S
 
Y
G
x
D
I
 
V
R
|
R
V
 
V
N
 
N
V
 
T
L
 
V
S
 
H
P
 
P
G
 
G
P
 
Y
I
 
I
S
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
D
G
 
L
T
 
P
G
 
G
Q
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
M
I
 
-
D
 
-
D
 
S
M
 
Q
T
 
R
A
 
T
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
I
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
A
 
I
A
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
S
 
S
S
 
K
F
 
F
M
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
F
F
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y

1zk1A Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:246/249 of query aligns to 2:248/251 of 1zk1A

query
sites
1zk1A
S
 
N
R
 
R
L
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
 
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
I
 
T
R
 
K
F
 
F
A
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
M
I
 
I
V
 
T
G
x
D
R
 
R
R
 
H
Q
 
S
D
 
D
E
 
V
L
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
S
I
 
V
G
 
G
-
 
T
-
 
P
H
 
D
E
 
Q
A
 
I
I
 
Q
A
 
F
I
 
F
Q
 
Q
G
x
H
D
|
D
I
x
S
S
 
S
K
 
D
L
 
E
D
 
D
D
 
G
L
 
W
A
 
T
R
 
K
I
 
L
F
 
F
T
 
D
Q
 
A
I
 
T
K
 
E
A
 
K
D
 
A
K
 
F
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
S
V
 
T
L
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
x
I
G
x
A
D
 
V
F
x
N
Q
 
K
P
 
S
I
 
V
G
 
E
S
 
E
I
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
A
S
 
E
F
 
W
D
 
R
R
 
K
T
 
L
F
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
V
 
T
Q
 
R
N
 
L
A
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
M
 
M
H
 
K
A
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
L
G
 
G
S
 
A
S
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
N
T
x
M
G
 
S
S
|
S
T
 
I
T
 
E
G
 
G
T
 
F
M
 
V
G
 
G
T
 
D
P
 
P
A
 
S
F
 
L
S
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
I
F
 
M
A
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
D
S
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
T
L
 
V
S
 
H
P
 
P
G
|
G
P
x
Y
I
|
I
S
 
K
T
 
T
P
 
P
G
x
L
L
 
V
D
 
D
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
D
G
 
L
T
 
P
G
 
G
Q
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
M
I
 
-
D
 
-
D
 
S
M
 
Q
T
 
R
A
 
T
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
I
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
A
 
I
A
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
S
 
S
S
 
K
F
 
F
M
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
F
F
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y

1zjzA Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and NAD (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:246/249 of query aligns to 2:248/251 of 1zjzA

query
sites
1zjzA
S
 
N
R
 
R
L
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
 
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
I
 
T
R
 
K
F
 
F
A
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
M
I
 
I
V
 
T
G
x
D
R
 
R
R
 
H
Q
 
S
D
 
D
E
 
V
L
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
S
I
 
V
G
 
G
-
 
T
-
 
P
H
 
D
E
 
Q
A
 
I
I
 
Q
A
 
F
I
 
F
Q
 
Q
G
 
H
D
|
D
I
 
S
S
 
S
K
 
D
L
 
E
D
 
D
D
 
G
L
 
W
A
 
T
R
 
K
I
 
L
F
 
F
T
 
D
Q
 
A
I
 
T
K
 
E
A
 
K
D
 
A
K
 
F
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
S
V
 
T
L
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
I
G
x
A
D
 
V
F
x
N
Q
 
K
P
 
S
I
 
V
G
 
E
S
 
E
I
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
A
S
 
E
F
 
W
D
 
R
R
 
K
T
 
L
F
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
V
 
T
Q
 
R
N
 
L
A
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
M
 
M
H
 
K
A
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
L
G
 
G
S
 
A
S
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
N
T
 
M
G
 
S
S
|
S
T
 
I
T
 
E
G
 
G
T
 
F
M
 
V
G
 
G
T
 
D
P
 
P
A
 
S
F
x
L
S
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
I
F
 
M
A
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
D
S
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
T
L
 
V
S
 
H
P
 
P
G
|
G
P
 
Y
I
|
I
S
 
K
T
 
T
P
 
P
G
x
L
L
 
V
D
 
D
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
D
G
 
L
T
 
P
G
 
G
Q
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
M
I
 
-
D
 
-
D
 
S
M
 
Q
T
 
R
A
 
T
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
I
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
A
 
I
A
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
S
 
S
S
 
K
F
 
F
M
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
F
F
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y

1zjyA Structure of r-specific alcohol dehydrogenase (mutant g37d) from lactobacillus brevis in complex with phenylethanol and nadh (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:246/249 of query aligns to 2:248/251 of 1zjyA

query
sites
1zjyA
S
 
N
R
 
R
L
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
N
 
T
S
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
I
 
T
R
 
K
F
 
F
A
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
M
I
 
I
V
 
T
G
x
D
R
 
R
R
 
H
Q
 
S
D
 
D
E
 
V
L
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
S
I
 
V
G
 
G
-
 
T
-
 
P
H
 
D
E
 
Q
A
 
I
I
 
Q
A
 
F
I
 
F
Q
 
Q
G
 
H
D
|
D
I
 
S
S
 
S
K
 
D
L
 
E
D
 
D
D
 
G
L
 
W
A
 
T
R
 
K
I
 
L
F
 
F
T
 
D
Q
 
A
I
 
T
K
 
E
A
 
K
D
 
A
K
 
F
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
S
V
 
T
L
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
I
G
x
A
D
 
V
F
x
N
Q
 
K
P
 
S
I
 
V
G
 
E
S
 
E
I
 
T
T
 
T
E
 
T
E
 
A
S
 
E
F
 
W
D
 
R
R
 
K
T
 
L
F
 
L
G
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
L
K
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
F
F
 
F
T
 
G
V
 
T
Q
 
R
N
 
L
A
 
G
L
 
I
P
 
Q
L
 
R
M
 
M
H
 
K
A
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
L
G
 
G
S
 
A
S
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
N
T
 
M
G
 
S
S
|
S
T
 
I
T
 
E
G
 
G
T
 
F
M
 
V
G
 
G
T
 
D
P
 
P
A
 
S
F
x
L
S
 
G
V
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
I
F
 
M
A
 
S
R
 
K
S
 
S
W
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
-
 
C
-
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
D
S
 
Y
G
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
T
L
 
V
S
 
H
P
 
P
G
|
G
P
x
Y
I
|
I
S
 
K
T
 
T
P
 
P
G
x
L
L
 
V
D
 
D
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
D
G
 
L
T
 
P
G
 
G
Q
 
A
K
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
M
I
 
-
D
 
-
D
 
S
M
 
Q
T
 
R
A
 
T
Q
 
K
V
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
H
I
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
Y
A
 
I
A
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
E
 
E
S
 
S
S
 
K
F
 
F
M
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
F
F
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y

3r3sA Structure of the ygha oxidoreductase from salmonella enterica
38% identity, 98% coverage: 3:245/249 of query aligns to 44:288/292 of 3r3sA

query
sites
3r3sA
R
 
R
L
 
L
N
 
K
G
 
D
K
 
R
I
 
K
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
N
x
D
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
T
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
V
 
A
I
 
I
-
 
N
-
 
Y
V
x
L
G
 
P
R
 
A
R
x
E
Q
 
E
D
 
E
E
 
D
L
 
A
D
 
Q
K
 
Q
A
 
V
L
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
C
G
 
G
H
 
R
E
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
L
I
 
L
Q
 
P
G
 
G
D
|
D
I
x
L
S
 
S
K
 
D
L
 
E
D
 
S
D
 
F
L
 
A
A
 
R
R
 
S
I
 
L
F
 
V
T
 
H
Q
 
K
I
 
A
K
 
R
A
 
E
D
 
A
K
 
L
G
 
G
R
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
A
A
 
L
N
x
V
A
|
A
G
|
G
L
 
K
G
 
Q
D
 
T
F
 
A
Q
 
I
P
 
P
-
 
E
I
 
I
G
 
K
S
 
D
I
 
L
T
 
T
E
 
S
E
 
E
S
 
Q
F
 
F
D
 
Q
R
 
Q
T
 
T
F
 
F
G
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
F
G
 
A
T
 
L
L
 
F
F
 
W
T
 
I
V
 
T
Q
 
Q
N
 
E
A
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
L
H
 
P
A
 
K
G
 
G
S
 
A
S
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
T
T
 
T
G
 
S
S
|
S
T
 
I
T
 
Q
G
 
A
T
 
Y
M
 
Q
G
 
P
T
 
S
P
 
P
A
 
H
F
x
L
S
 
L
V
 
D
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
L
N
 
N
F
 
Y
A
 
S
R
 
R
S
 
G
W
 
L
A
 
A
L
 
K
D
 
Q
L
 
V
K
 
A
G
 
E
S
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
I
L
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
P
I
|
I
S
 
W
T
|
T
P
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
A
L
|
L
A
x
Q
L
 
I
S
 
S
G
 
G
T
 
-
G
 
G
Q
 
Q
K
 
T
E
x
Q
A
 
D
I
 
K
I
 
I
D
 
P
D
 
Q
M
 
F
T
 
G
A
 
Q
Q
 
Q
V
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
K
R
 
R
I
 
A
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
E
 
A
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
P
A
 
V
A
 
Y
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
Q
E
 
E
S
 
S
S
 
S
F
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
A
S
 
E
E
 
V
M
 
H
F
 
G
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

P0AG84 Uncharacterized oxidoreductase YghA; EC 1.-.-.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:245/249 of query aligns to 46:290/294 of P0AG84

query
sites
P0AG84
R
 
R
L
 
L
N
 
K
G
 
D
K
 
R
I
 
K
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
D
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
T
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
S
G
 
Y
R
 
L
R
 
P
Q
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
E
D
 
D
-
 
A
-
 
Q
-
 
D
-
 
V
-
 
K
K
 
K
A
 
I
L
 
I
A
 
E
L
 
E
I
 
C
G
 
G
H
 
R
E
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
L
I
 
L
Q
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
S
 
S
K
 
D
L
 
-
D
 
E
D
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
R
I
 
S
F
 
L
T
 
V
Q
 
H
I
 
-
K
 
E
A
 
A
D
 
H
K
 
K
-
 
A
-
 
L
G
 
G
R
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
M
F
 
A
A
 
L
N
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
K
G
 
Q
D
 
V
F
 
A
Q
 
I
P
 
P
-
 
D
I
 
I
G
 
A
S
 
D
I
 
L
T
 
T
E
 
S
E
 
E
S
 
Q
F
 
F
D
 
Q
R
 
K
T
 
T
F
 
F
G
 
A
I
 
I
N
 
N
V
 
V
K
 
F
G
 
A
T
 
L
L
 
F
F
 
W
T
 
L
V
 
T
Q
 
Q
N
 
E
A
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
L
H
 
P
A
 
K
G
 
G
S
 
A
S
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
T
T
 
T
G
 
S
S
 
S
T
 
I
T
 
Q
G
 
A
T
 
Y
M
 
Q
G
 
P
T
 
S
P
 
P
A
 
H
F
 
L
S
 
L
V
 
D
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
L
N
 
N
F
 
Y
A
 
S
R
 
R
S
 
G
W
 
L
A
 
A
L
 
K
D
 
Q
L
 
V
K
 
A
G
 
E
S
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
I
L
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
P
I
 
I
S
 
W
T
 
T
P
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
A
L
 
L
A
 
Q
L
 
I
S
 
S
G
 
G
T
 
-
G
 
G
Q
 
Q
K
 
T
E
 
Q
A
 
D
I
 
K
I
 
I
D
 
P
D
 
Q
M
 
F
T
 
G
A
 
Q
Q
 
Q
V
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
K
R
 
R
I
 
A
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
E
 
A
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
P
A
 
V
A
 
Y
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
Q
E
 
E
S
 
S
S
 
S
F
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
A
S
 
E
E
 
V
M
 
H
F
 
G
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:245/249 of query aligns to 2:240/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
R
 
R
L
 
F
N
 
D
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
L
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
I
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
T
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
A
G
x
D
R
x
W
R
x
A
Q
 
K
D
 
E
E
 
A
L
 
V
D
 
D
K
 
K
-
 
V
A
 
A
L
 
A
A
 
S
L
 
L
I
 
P
G
 
K
H
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
I
 
V
Q
 
H
G
x
I
D
|
D
I
x
V
S
 
S
K
 
D
L
 
H
D
 
V
D
 
A
L
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
M
F
 
M
T
 
N
Q
 
E
I
 
V
K
 
A
A
 
E
D
 
K
K
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
L
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
V
G
 
-
D
 
-
F
 
-
Q
 
H
P
 
V
I
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
V
T
 
L
E
 
E
E
 
T
S
 
S
F
 
I
D
 
D
-
 
D
-
 
W
-
 
R
R
 
R
T
 
I
F
 
A
G
 
G
I
x
V
N
 
D
V
 
I
K
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
V
F
 
F
T
 
C
V
 
S
Q
 
K
N
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
-
 
H
L
 
L
M
 
L
H
 
K
A
 
T
G
 
K
S
 
G
S
 
C
V
 
I
I
 
V
L
 
N
T
|
T
G
 
A
S
|
S
T
 
V
T
x
S
G
 
G
T
 
L
M
 
G
G
 
G
T
 
D
P
 
W
A
 
G
F
 
A
S
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
V
N
 
N
F
 
L
A
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
H
K
 
G
G
 
G
S
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
L
 
V
S
 
C
P
 
P
G
x
S
P
x
L
I
x
V
S
 
K
T
|
T
P
x
N
G
x
M
L
x
T
D
 
N
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
G
Q
 
W
K
 
P
E
 
Q
A
 
E
I
 
I
I
 
R
D
 
D
D
 
K
M
 
F
T
 
N
A
 
E
Q
 
R
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
K
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
S
 
A
S
 
S
F
 
F
M
 
I
T
 
N
G
 
G
S
 
A
E
 
N
M
 
I
F
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:245/249 of query aligns to 2:240/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
R
 
R
L
 
F
N
 
D
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
N
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
L
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
I
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
T
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
A
G
x
D
R
x
W
R
x
A
Q
 
K
D
 
E
E
 
A
L
 
V
D
 
D
K
 
K
-
 
V
A
 
A
L
 
A
A
 
S
L
 
L
I
 
P
G
 
K
H
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
I
 
V
Q
 
H
G
x
I
D
|
D
I
x
V
S
 
S
K
 
D
L
 
H
D
 
V
D
 
A
L
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
M
F
 
M
T
 
N
Q
 
E
I
 
V
K
 
A
A
 
E
D
 
K
K
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
L
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
V
G
 
-
D
 
-
F
 
-
Q
 
H
P
 
V
I
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
V
T
 
L
E
 
E
E
 
T
S
 
S
F
 
I
D
 
D
-
 
D
-
 
W
-
 
R
R
 
R
T
 
I
F
 
A
G
 
G
I
x
V
N
 
D
V
 
I
K
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
V
F
 
F
T
 
C
V
 
S
Q
 
K
N
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
-
 
H
L
 
L
M
 
L
H
 
K
A
 
T
G
 
K
S
 
G
S
 
C
V
 
I
I
 
V
L
 
N
T
|
T
G
 
A
S
|
S
T
 
V
T
 
S
G
 
G
T
 
L
M
 
G
G
 
G
T
 
D
P
 
W
A
 
G
F
 
A
S
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
V
N
 
N
F
 
L
A
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
H
K
 
G
G
 
G
S
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
L
 
V
S
 
C
P
|
P
G
x
S
P
x
L
I
x
V
S
 
K
T
|
T
P
x
N
G
x
M
L
x
T
D
 
N
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
G
Q
 
W
K
 
P
E
 
Q
A
 
E
I
 
I
I
 
R
D
 
D
D
 
K
M
 
F
T
 
N
A
 
E
Q
 
R
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
K
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
S
 
A
S
 
S
F
 
F
M
 
I
T
 
N
G
 
G
S
 
A
E
 
N
M
 
I
F
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:245/249 of query aligns to 2:240/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
R
 
R
L
 
F
N
 
D
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
G
S
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
L
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
I
 
R
R
 
R
F
 
F
A
 
S
T
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
A
G
x
D
R
 
W
R
 
A
Q
 
K
D
 
E
E
 
A
L
 
V
D
 
D
K
 
K
-
 
V
A
 
A
L
 
A
A
 
S
L
 
L
I
 
P
G
 
K
H
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
I
 
V
Q
 
H
G
 
I
D
|
D
I
x
V
S
 
S
K
 
D
L
 
H
D
 
V
D
 
A
L
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
M
F
 
M
T
 
N
Q
 
E
I
 
V
K
 
A
A
 
E
D
 
K
K
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
L
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
-
D
 
-
F
 
-
Q
 
H
P
 
V
I
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
V
T
 
L
E
 
E
E
 
T
S
 
S
F
 
I
D
 
D
-
 
D
-
 
W
-
 
R
R
 
R
T
 
I
F
 
A
G
 
G
I
 
V
N
 
D
V
 
I
K
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
V
F
 
F
T
 
C
V
 
S
Q
 
K
N
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
-
 
H
L
 
L
M
 
L
H
 
K
A
 
T
G
 
K
S
 
G
S
 
C
V
 
I
I
 
V
L
 
N
T
 
T
G
 
A
S
|
S
T
x
V
T
x
S
G
 
G
T
 
L
M
 
G
G
 
G
T
 
D
P
 
W
A
 
G
F
 
A
S
 
A
V
 
Y
Y
|
Y
S
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
L
 
V
R
 
V
N
 
N
F
 
L
A
 
T
R
 
R
S
 
A
W
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
H
K
 
G
G
 
G
S
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
L
 
V
S
 
C
P
 
P
G
 
S
P
 
L
I
x
V
S
 
K
T
|
T
P
 
N
G
 
M
L
 
T
D
 
N
L
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
G
Q
 
W
K
 
P
E
 
Q
A
 
E
I
 
I
I
x
R
D
|
D
D
x
K
M
 
F
T
 
N
A
 
E
Q
 
R
V
 
I
P
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
A
G
 
A
K
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
S
 
A
S
 
S
F
 
F
M
 
I
T
 
N
G
 
G
S
 
A
E
 
N
M
 
I
F
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF2696 FitnessBrowser__WCS417:GFF2696
MSRLNGKIAVVTGGNSGIGLATAIRFATEGAQVVIVGRRQDELDKALALIGHEAIAIQGD
ISKLDDLARIFTQIKADKGRVDVLFANAGLGDFQPIGSITEESFDRTFGINVKGTLFTVQ
NALPLMHAGSSVILTGSTTGTMGTPAFSVYSATKAALRNFARSWALDLKGSGIRVNVLSP
GPISTPGLDLALSGTGQKEAIIDDMTAQVPLGRIGKPEEVAAAALFLASDESSFMTGSEM
FVDGGFAQV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory