SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2697 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2697 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4hp8B Crystal structure of a putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase from agrobacterium tumefaciens (target efi-506435) with bound NADP
43% identity, 97% coverage: 9:257/258 of query aligns to 4:245/246 of 4hp8B

query
sites
4hp8B
F
 
F
R
 
S
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
R
R
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
N
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
C
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
E
V
 
V
T
 
V
I
 
C
A
 
A
A
 
A
R
|
R
R
|
R
I
 
-
E
 
A
P
 
P
L
 
D
E
 
E
A
 
T
L
 
L
V
 
-
A
 
-
E
 
D
M
 
I
Q
 
I
A
 
A
A
 
K
D
 
D
M
 
G
-
 
G
Q
 
N
A
 
A
E
 
S
V
 
A
M
 
L
V
 
L
L
 
I
D
|
D
V
x
F
A
 
A
D
 
D
I
 
P
A
 
L
A
 
A
T
 
A
R
 
K
A
 
D
S
 
S
I
 
F
S
 
T
E
 
D
R
 
-
I
 
-
T
 
-
Q
 
-
N
 
-
G
 
A
A
 
G
F
 
F
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
|
G
L
x
I
A
 
I
R
 
R
H
 
R
S
 
A
P
 
D
A
 
S
S
 
V
D
 
E
T
 
F
T
 
S
E
 
E
G
 
L
D
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
D
L
 
V
N
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
A
A
 
L
Y
 
F
F
 
F
L
 
T
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
F
A
 
A
K
 
K
G
 
E
L
 
L
M
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
G
K
 
R
P
 
S
G
 
G
S
 
K
L
 
V
I
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
Q
 
L
M
 
L
A
 
S
K
 
F
V
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
R
R
x
V
A
 
P
V
 
S
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
E
 
A
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
L
M
 
L
A
 
A
I
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
A
K
 
A
S
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
I
C
 
A
P
|
P
T
x
G
F
 
Y
I
|
I
V
 
E
T
|
T
P
 
N
L
x
N
T
|
T
Q
 
E
S
 
A
T
 
L
F
 
R
D
 
A
R
 
D
P
 
A
E
 
A
R
 
R
R
 
N
A
 
K
W
 
A
I
 
I
E
 
L
S
 
E
K
 
R
I
 
I
Q
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
W
G
 
G
E
 
H
V
 
S
E
 
E
D
 
D
I
 
I
M
 
A
G
 
G
G
 
A
V
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
S
 
A
S
 
D
L
 
Y
I
 
V
T
 
H
G
 
G
T
 
A
A
 
I
L
 
L
M
 
N
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
L
A
 
A

Q920P0 L-xylulose reductase; XR; Dicarbonyl/L-xylulose reductase; EC 1.1.1.10 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
38% identity, 96% coverage: 11:257/258 of query aligns to 5:243/244 of Q920P0

query
sites
Q920P0
L
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
G
S
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
C
 
T
A
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
V
 
V
T
 
V
I
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
R
R
 
T
I
 
R
E
 
E
P
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
R
E
 
E
M
 
C
Q
 
P
A
 
G
A
 
V
D
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
V
 
P
M
 
V
V
 
C
L
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
W
A
 
E
A
 
A
T
 
T
R
 
E
A
 
Q
S
 
A
I
 
L
S
 
S
E
 
N
R
 
V
I
 
-
T
 
-
Q
 
-
N
 
-
G
 
G
A
 
P
F
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
T
H
 
L
S
 
Q
P
 
P
A
 
F
S
 
L
D
 
E
T
 
V
T
 
T
E
 
K
G
 
E
D
 
A
F
 
C
D
 
D
A
 
T
V
 
S
I
 
F
D
 
N
L
 
V
N
 
N
I
 
F
K
 
R
G
 
A
A
 
V
Y
 
V
F
 
Q
L
 
V
T
 
S
Q
 
Q
A
 
I
V
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
G
L
 
M
M
 
I
A
 
A
A
 
R
G
 
G
K
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
V
S
 
S
S
|
S
Q
|
Q
M
 
A
A
 
S
K
 
Q
V
 
R
G
 
A
G
x
L
L
 
T
D
 
N
R
x
H
A
 
T
V
 
V
Y
|
Y
S
 
C
A
 
S
T
 
T
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
L
E
 
D
G
 
M
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
E
W
 
L
G
 
G
K
 
P
S
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
C
 
N
P
 
P
T
 
T
F
 
V
I
 
V
V
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
M
T
 
G
Q
 
R
S
 
A
T
x
N
F
x
W
D
 
S
R
 
D
P
 
P
E
 
H
R
 
K
R
 
A
A
 
K
W
 
V
I
 
M
E
 
L
S
 
D
K
 
R
I
 
I
Q
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
K
I
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
D
 
N
I
 
V
M
 
V
G
 
D
G
 
T
V
 
I
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
N
A
 
R
S
 
S
S
 
S
L
 
M
I
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
A
L
 
L
M
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
F
T
 
L
A
 
A

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
38% identity, 97% coverage: 8:257/258 of query aligns to 5:246/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
S
 
S
F
 
F
R
 
D
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
C
S
x
D
S
 
T
G
 
G
I
x
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
G
C
 
M
A
 
A
V
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
C
H
 
D
V
 
I
T
 
-
I
 
V
A
 
G
A
 
V
R
 
N
R
x
I
I
 
V
E
 
E
P
 
P
L
 
K
E
 
D
A
 
T
L
 
-
V
 
I
A
 
E
E
 
K
M
 
V
Q
 
T
A
 
A
A
 
L
D
 
G
M
 
R
Q
 
R
A
 
F
E
 
L
V
 
S
M
 
L
V
 
T
L
 
A
D
|
D
V
x
M
A
 
S
D
 
N
I
 
V
A
 
S
A
 
G
T
 
H
R
 
A
A
 
E
S
 
L
I
 
V
S
 
E
E
 
K
R
 
A
I
 
V
T
 
A
Q
 
E
N
 
F
G
 
G
A
 
H
F
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
A
 
I
R
 
R
H
 
R
S
 
E
P
 
D
A
 
A
S
 
I
D
 
E
T
 
F
T
 
S
E
 
E
G
 
K
D
 
N
F
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
M
D
 
N
L
|
L
N
 
N
I
 
I
K
 
K
G
 
S
A
 
V
Y
 
F
F
 
F
L
 
M
T
 
S
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
Q
L
 
F
M
 
I
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
G
G
 
G
S
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
Q
 
M
M
 
L
A
 
S
K
 
F
V
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
R
R
 
V
A
 
P
V
 
S
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
T
 
S
K
|
K
H
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
M
G
 
G
F
 
V
T
 
T
K
 
R
S
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
A
K
 
K
S
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
I
C
 
A
P
 
P
T
x
G
F
 
Y
I
x
M
V
 
A
T
|
T
P
 
N
L
x
N
T
 
T
Q
 
Q
S
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
E
R
 
R
R
 
S
A
 
K
W
 
E
I
 
I
E
 
L
S
 
D
K
 
R
I
 
I
Q
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
W
G
 
G
E
 
L
V
 
P
E
 
Q
D
 
D
I
 
L
M
 
M
G
 
G
G
 
P
V
 
S
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
A
S
 
S
S
 
D
L
 
Y
I
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
Y
A
 
T
L
 
I
M
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
L
A
 
A

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
38% identity, 97% coverage: 9:257/258 of query aligns to 12:259/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
F
 
F
R
 
R
L
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
 
G
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
T
C
 
L
A
 
A
V
 
R
A
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
A
V
 
I
T
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
D
R
|
R
R
 
N
I
 
E
E
 
E
P
 
K
L
 
A
E
 
A
A
 
T
L
 
L
V
 
A
A
 
R
E
 
R
M
 
F
Q
 
R
A
 
D
A
 
E
D
 
G
M
 
F
Q
 
A
A
 
A
E
 
D
V
 
H
M
 
A
V
 
V
L
 
F
D
|
D
V
|
V
A
 
A
D
 
E
I
 
H
A
 
A
A
 
Q
T
 
V
R
 
R
A
 
A
S
 
A
I
 
I
S
 
D
E
 
E
R
 
F
I
 
E
T
 
A
Q
 
R
N
 
V
G
 
G
A
 
A
F
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
A
 
Q
R
 
R
H
 
R
S
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
D
D
 
A
T
 
F
T
 
E
E
 
P
G
 
D
D
 
D
F
 
W
D
 
H
A
 
A
V
 
L
I
 
M
D
 
R
L
 
V
N
 
N
I
 
L
K
 
D
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
F
 
N
L
 
V
T
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
H
L
 
M
M
 
I
A
 
A
A
 
R
G
 
G
K
 
H
P
 
-
G
 
G
S
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
C
S
|
S
Q
 
V
M
 
Q
A
 
S
K
 
E
V
 
L
G
 
A
G
 
R
L
 
P
D
 
T
R
 
I
A
 
A
V
 
P
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
R
G
 
M
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
G
M
 
M
A
 
C
I
 
A
E
 
D
W
 
W
G
 
A
K
 
R
S
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
Q
V
 
A
N
 
N
T
 
G
I
 
L
C
 
A
P
|
P
T
 
G
F
 
Y
I
x
F
V
 
E
T
|
T
P
 
E
L
|
L
T
x
N
Q
 
R
S
 
A
T
 
L
F
 
V
D
 
D
R
 
D
P
 
A
E
 
A
R
 
F
R
 
S
A
 
D
W
 
W
I
 
L
E
 
C
S
 
K
K
 
R
I
 
T
Q
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
W
G
 
G
E
 
Q
V
 
V
E
 
D
D
 
E
I
 
L
M
 
C
G
 
G
G
 
A
V
 
A
V
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
D
L
 
F
I
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
Q
A
 
T
L
 
L
M
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
L
T
 
T
A
 
S

3uf0A Crystal structure of a putative NAD(p) dependent gluconate 5- dehydrogenase from beutenbergia cavernae(efi target efi-502044) with bound NADP (low occupancy)
38% identity, 97% coverage: 9:257/258 of query aligns to 3:248/249 of 3uf0A

query
sites
3uf0A
F
 
F
R
 
S
L
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
R
R
 
T
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
I
A
 
A
V
 
H
A
 
G
L
 
Y
A
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
H
V
 
V
T
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
W
R
 
G
R
|
R
I
 
T
E
 
D
P
 
G
L
 
V
E
 
K
A
 
E
L
 
V
V
 
A
A
 
D
E
 
E
M
 
I
Q
 
A
A
 
D
A
 
G
D
 
G
M
 
G
Q
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
A
M
 
V
V
 
V
L
 
A
D
|
D
V
x
L
A
 
A
D
 
D
I
 
L
A
 
E
A
 
G
T
 
A
R
 
-
A
 
A
S
 
N
I
 
V
S
 
A
E
 
E
R
 
E
I
 
L
T
 
A
Q
 
A
N
 
T
G
 
R
A
 
R
F
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
|
G
L
x
I
A
 
I
R
 
A
H
 
R
S
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
E
D
 
E
T
 
V
T
 
S
E
 
L
G
 
G
D
 
R
F
 
W
D
 
R
A
 
E
V
 
V
I
 
L
D
 
T
L
 
V
N
 
N
I
 
L
K
 
D
G
 
A
A
 
A
Y
 
W
F
 
V
L
 
L
T
 
S
Q
 
R
A
 
S
V
 
F
A
 
G
K
 
T
G
 
A
L
 
M
M
 
L
A
 
A
A
 
H
G
 
G
K
 
S
P
 
-
G
 
G
S
 
R
L
 
I
I
 
V
N
 
T
I
|
I
S
x
A
S
|
S
Q
 
M
M
 
L
A
 
S
K
 
F
V
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
R
D
 
N
R
x
V
A
 
A
V
 
A
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
E
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
A
M
 
L
A
 
A
I
 
S
E
 
E
W
 
W
G
 
A
K
 
G
S
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
G
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
L
C
 
A
P
|
P
T
x
G
F
 
Y
I
x
V
V
 
V
T
|
T
P
 
A
L
x
N
T
|
T
Q
 
A
S
 
A
T
 
L
F
 
R
D
 
A
R
 
D
P
 
D
E
 
E
R
 
R
R
 
A
A
 
A
W
 
E
I
 
I
E
 
T
S
 
A
K
 
R
I
 
I
Q
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
W
G
 
A
E
 
T
V
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
M
M
 
V
G
 
G
G
 
P
V
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
S
 
A
S
 
S
L
 
Y
I
 
V
T
 
H
G
 
G
T
 
Q
A
 
V
L
 
L
M
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
L
A
 
A

3d3wA Structure of l-xylulose reductase with bound coenzyme, phosphate and hydroxide. (see paper)
36% identity, 96% coverage: 11:257/258 of query aligns to 5:243/244 of 3d3wA

query
sites
3d3wA
L
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
C
 
T
A
 
V
V
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
H
E
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
A
H
 
R
V
 
V
T
 
V
I
 
A
A
 
V
A
x
S
R
|
R
R
x
T
I
 
Q
E
 
A
P
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
R
E
 
E
M
 
C
Q
 
P
A
 
G
A
 
I
D
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
V
 
P
M
 
V
V
 
C
L
x
V
D
 
D
V
x
L
A
 
G
D
 
D
I
 
W
A
 
E
A
 
A
T
 
T
R
 
E
A
 
R
S
 
A
I
 
L
S
 
G
E
 
S
R
 
V
I
 
-
T
 
-
Q
 
-
N
 
-
G
 
G
A
 
P
F
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
x
A
L
 
V
A
 
A
R
 
L
H
 
L
S
 
Q
P
 
P
A
 
F
S
 
L
D
 
E
T
 
V
T
 
T
E
 
K
G
 
E
D
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
R
V
 
S
I
 
F
D
 
E
L
x
V
N
 
N
I
 
L
K
 
R
G
 
A
A
 
V
Y
 
I
F
 
Q
L
 
V
T
 
S
Q
 
Q
A
 
I
V
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
I
A
 
A
A
 
R
G
 
G
K
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
V
S
|
S
S
|
S
Q
 
Q
M
 
C
A
 
S
K
 
Q
V
 
R
G
 
A
G
 
V
L
 
T
D
 
N
R
x
H
A
 
S
V
 
V
Y
|
Y
S
 
C
A
 
S
T
 
T
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
L
E
 
D
G
 
M
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
E
W
 
L
G
 
G
K
 
P
S
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
C
 
N
P
|
P
T
|
T
F
 
V
I
x
V
V
 
M
T
|
T
P
x
S
L
x
M
T
x
G
Q
 
Q
S
 
A
T
 
T
F
 
W
D
 
S
R
 
D
P
 
P
E
 
H
R
 
K
R
 
A
A
 
K
W
 
T
I
 
M
E
 
L
S
 
N
K
 
R
I
 
I
Q
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
K
I
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
D
 
H
I
 
V
M
 
V
G
 
N
G
 
A
V
 
I
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
R
S
 
S
S
 
G
L
 
M
I
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
T
L
 
L
M
 
P
I
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
F
T
 
W
A
 
A

1pr9A Human l-xylulose reductase holoenzyme (see paper)
36% identity, 96% coverage: 11:257/258 of query aligns to 5:243/244 of 1pr9A

query
sites
1pr9A
L
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
C
 
T
A
 
V
V
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
H
E
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
A
H
 
R
V
 
V
T
 
V
I
 
A
A
 
V
A
x
S
R
|
R
R
x
T
I
 
Q
E
 
A
P
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
R
E
 
E
M
 
C
Q
 
P
A
 
G
A
 
I
D
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
V
 
P
M
 
V
V
 
C
L
 
V
D
 
D
V
x
L
A
 
G
D
 
D
I
 
W
A
 
E
A
 
A
T
 
T
R
 
E
A
 
R
S
 
A
I
 
L
S
 
G
E
 
S
R
 
V
I
 
-
T
 
-
Q
 
-
N
 
-
G
 
G
A
 
P
F
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
x
A
L
 
V
A
 
A
R
 
L
H
 
L
S
 
Q
P
 
P
A
 
F
S
 
L
D
 
E
T
 
V
T
 
T
E
 
K
G
 
E
D
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
R
V
 
S
I
 
F
D
 
E
L
x
V
N
 
N
I
 
L
K
 
R
G
 
A
A
 
V
Y
 
I
F
 
Q
L
 
V
T
 
S
Q
 
Q
A
 
I
V
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
I
A
 
A
A
 
R
G
 
G
K
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
V
S
 
S
S
|
S
Q
 
Q
M
x
C
A
 
S
K
 
Q
V
 
R
G
 
A
G
 
V
L
 
T
D
 
N
R
x
H
A
 
S
V
 
V
Y
|
Y
S
 
C
A
 
S
T
 
T
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
L
E
 
D
G
 
M
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
E
W
 
L
G
 
G
K
 
P
S
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
C
 
N
P
 
P
T
|
T
F
 
V
I
x
V
V
 
M
T
|
T
P
 
S
L
x
M
T
 
G
Q
 
Q
S
 
A
T
 
T
F
 
W
D
 
S
R
 
D
P
 
P
E
 
H
R
 
K
R
 
A
A
 
K
W
 
T
I
 
M
E
 
L
S
 
N
K
 
R
I
 
I
Q
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
K
I
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
D
 
H
I
 
V
M
 
V
G
 
N
G
 
A
V
 
I
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
R
S
 
S
S
 
G
L
 
M
I
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
T
L
 
L
M
 
P
I
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
F
T
 
W
A
 
A

Q7Z4W1 L-xylulose reductase; XR; Carbonyl reductase II; Dicarbonyl/L-xylulose reductase; Kidney dicarbonyl reductase; kiDCR; Short chain dehydrogenase/reductase family 20C member 1; Sperm surface protein P34H; EC 1.1.1.10 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
36% identity, 96% coverage: 11:257/258 of query aligns to 5:243/244 of Q7Z4W1

query
sites
Q7Z4W1
L
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
R
R
 
R
A
 
V
L
|
L
V
|
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
S
x
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
|
R
A
x
G
C
x
T
A
x
V
V
x
Q
A
|
A
L
|
L
A
x
H
E
x
A
A
x
T
G
|
G
A
|
A
H
x
R
V
|
V
T
x
V
I
x
A
A
x
V
A
x
S
R
|
R
R
x
T
I
 
Q
E
 
A
P
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
R
E
 
E
M
 
C
Q
 
P
A
 
G
A
 
I
D
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
V
 
P
M
 
V
V
 
C
L
 
V
D
 
D
V
 
L
A
 
G
D
 
D
I
 
W
A
 
E
A
 
A
T
 
T
R
 
E
A
 
R
S
 
A
I
 
L
S
 
G
E
 
S
R
 
V
I
 
-
T
 
-
Q
 
-
N
 
-
G
 
G
A
 
P
F
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
L
H
 
L
S
 
Q
P
 
P
A
 
F
S
 
L
D
 
E
T
 
V
T
 
T
E
 
K
G
 
E
D
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
R
V
 
S
I
 
F
D
 
E
L
 
V
N
|
N
I
 
L
K
 
R
G
 
A
A
 
V
Y
 
I
F
 
Q
L
 
V
T
 
S
Q
 
Q
A
 
I
V
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
G
L
 
L
M
 
I
A
 
A
A
 
R
G
 
G
K
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
V
S
 
S
S
|
S
Q
 
Q
M
 
C
A
 
S
K
 
Q
V
 
R
G
 
A
G
 
V
L
 
T
D
 
N
R
 
H
A
 
S
V
 
V
Y
 
Y
S
 
C
A
 
S
T
 
T
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
L
E
 
D
G
 
M
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
L
E
 
E
W
 
L
G
 
G
K
 
P
S
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
C
 
N
P
 
P
T
 
T
F
 
V
I
 
V
V
 
M
T
 
T
P
 
S
L
 
M
T
 
G
Q
 
Q
S
 
A
T
 
T
F
 
W
D
 
S
R
 
D
P
 
P
E
 
H
R
 
K
R
 
A
A
 
K
W
 
T
I
 
M
E
 
L
S
 
N
K
 
R
I
 
I
Q
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
K
I
 
F
G
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
D
 
H
I
 
V
M
 
V
G
 
N
G
 
A
V
 
I
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
R
S
 
S
S
 
G
L
 
M
I
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
T
L
 
L
M
 
P
I
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
F
T
 
W
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
36% identity, 97% coverage: 9:257/258 of query aligns to 2:251/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
F
 
F
R
 
D
L
 
L
D
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
S
S
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
F
A
 
G
C
 
I
A
 
A
V
 
Q
A
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
C
H
 
S
V
 
V
T
 
V
I
 
V
A
 
A
A
x
S
R
|
R
R
 
N
I
 
L
E
 
E
P
 
E
L
 
A
-
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
A
V
 
Q
A
 
K
E
 
L
M
 
T
Q
 
E
A
 
K
A
 
Y
D
 
G
M
 
V
Q
 
E
A
 
T
E
 
M
V
 
A
M
 
F
V
 
R
L
x
C
D
|
D
V
|
V
A
 
S
D
 
N
I
 
Y
A
 
E
A
 
E
T
 
V
R
 
K
A
 
K
S
 
L
I
 
L
S
 
E
E
 
A
R
 
V
I
 
K
T
 
E
Q
 
K
N
 
F
G
 
G
A
 
K
F
 
L
D
 
D
I
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
L
x
I
A
 
N
R
 
R
H
 
R
S
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
E
D
 
E
T
 
F
T
 
P
E
 
L
G
 
D
D
 
E
F
 
F
D
 
R
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
E
L
x
V
N
 
N
I
 
L
K
 
F
G
 
G
A
 
T
Y
 
Y
F
 
Y
L
 
V
T
 
C
Q
 
R
A
 
E
V
 
A
A
 
F
K
 
S
G
 
L
L
 
L
M
 
R
A
 
E
A
 
S
G
 
D
K
 
N
P
 
P
G
 
-
S
 
S
L
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
G
S
|
S
-
 
L
Q
 
T
M
 
V
A
 
E
K
 
E
V
 
V
G
 
T
G
 
M
L
 
P
D
 
N
R
x
I
A
 
S
V
 
A
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
G
V
 
V
E
 
A
G
 
S
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
A
M
 
L
A
 
A
I
 
K
E
 
E
W
 
W
G
 
G
K
 
R
S
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
V
I
 
I
C
 
A
P
|
P
T
x
G
F
 
W
I
x
Y
V
 
R
T
|
T
P
 
K
L
x
M
T
|
T
Q
 
E
S
 
A
T
 
V
F
 
F
D
 
S
R
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
K
R
 
L
A
 
D
W
 
Y
I
 
M
E
 
L
S
 
K
K
 
R
I
 
I
Q
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
T
G
 
G
E
 
V
V
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
L
M
 
K
G
 
G
G
 
V
V
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
E
S
 
A
S
 
K
L
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
I
L
 
I
M
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
T
 
T
A
 
A

3o03A Quaternary complex structure of gluconate 5-dehydrogenase from streptococcus suis type 2 (see paper)
38% identity, 97% coverage: 8:257/258 of query aligns to 6:248/254 of 3o03A

query
sites
3o03A
S
 
Q
F
 
F
R
 
S
L
 
L
D
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
S
S
x
Y
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
F
A
 
A
C
 
I
A
 
A
V
 
S
A
 
A
L
 
Y
A
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
T
V
 
I
T
 
V
I
 
F
A
 
N
A
x
D
R
x
I
R
 
N
I
 
Q
E
 
E
P
x
L
L
 
V
E
 
D
A
 
R
L
 
G
V
 
M
A
 
A
E
 
A
M
 
Y
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
G
M
 
I
Q
 
N
A
 
A
E
 
H
V
 
G
M
 
Y
V
 
V
L
 
C
D
|
D
V
|
V
A
 
T
D
 
D
I
 
E
A
 
D
A
 
G
T
 
I
R
 
Q
A
 
A
S
 
M
I
 
V
S
 
A
E
 
Q
R
 
I
I
 
E
T
 
S
Q
 
E
N
 
V
G
 
G
A
 
I
F
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
A
x
I
R
 
R
H
x
R
S
 
V
P
 
P
A
 
M
S
 
I
D
 
E
T
 
M
T
 
T
E
 
A
G
 
A
D
 
Q
F
 
F
D
 
R
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
I
N
 
D
I
 
L
K
 
N
G
 
A
A
 
P
Y
 
F
F
 
I
L
 
V
T
 
S
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
I
K
 
P
G
 
S
L
 
M
M
 
I
A
 
K
A
 
K
G
 
G
K
 
H
P
 
-
G
 
G
S
 
K
L
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
C
S
|
S
Q
x
M
M
|
M
A
 
S
K
 
E
V
 
L
G
 
G
G
x
R
L
 
E
D
 
T
R
x
V
A
 
S
V
 
A
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
G
A
 
G
V
 
L
E
 
K
G
 
M
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
N
M
 
I
A
 
A
I
 
S
E
 
E
W
 
Y
G
 
G
K
 
E
S
 
A
G
 
N
I
 
I
R
 
Q
V
 
C
N
 
N
T
 
G
I
 
I
C
 
G
P
|
P
T
 
G
F
 
Y
I
 
I
V
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
Q
T
 
T
Q
 
H
S
 
P
T
 
-
F
 
F
D
 
D
R
 
Q
P
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
W
 
F
I
 
I
E
 
I
S
 
A
K
 
K
I
 
T
Q
 
P
L
 
A
G
 
A
R
 
R
I
 
W
G
 
G
E
 
E
V
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
L
M
 
M
G
 
G
G
 
P
V
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
S
 
S
S
 
N
L
 
F
I
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
H
A
 
I
L
 
L
M
 
Y
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
I
T
 
L
A
 
A

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
40% identity, 93% coverage: 14:254/258 of query aligns to 5:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
C
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
H
 
N
V
 
V
T
 
A
I
 
V
A
 
N
-
 
Y
A
 
A
R
 
G
R
 
S
I
 
K
E
 
E
P
 
K
L
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
M
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
K
D
 
G
M
 
V
Q
 
D
A
 
S
E
 
F
V
 
A
M
 
I
V
 
Q
L
 
A
D
 
N
V
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
A
A
 
D
A
 
E
T
 
V
R
 
K
A
 
A
S
 
M
I
 
I
S
 
K
E
 
E
R
 
V
I
 
V
T
 
S
Q
 
Q
N
 
F
G
 
G
A
 
S
F
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
T
R
 
R
H
 
D
S
 
N
P
 
L
A
 
L
S
 
M
D
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
E
G
 
Q
D
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
T
N
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
F
 
N
L
 
C
T
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
-
A
 
A
K
 
T
G
 
P
L
 
Q
M
 
M
A
 
L
A
 
R
G
 
Q
K
 
R
P
 
S
G
 
G
S
 
A
L
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
Q
 
V
M
 
V
A
 
G
K
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
N
L
 
P
D
 
G
R
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
E
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
M
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
W
 
L
G
 
A
K
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
C
 
A
P
 
P
T
 
G
F
 
F
I
 
I
V
 
V
T
 
S
P
 
D
L
 
M
T
 
T
Q
 
D
S
 
A
T
 
L
F
 
S
D
 
D
R
 
-
P
 
-
E
 
E
R
 
L
R
 
K
A
 
E
W
 
Q
I
 
M
E
 
L
S
 
T
K
 
Q
I
 
I
Q
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
I
 
F
G
 
G
E
 
Q
V
 
D
E
 
T
D
 
D
I
 
I
M
 
A
G
 
N
G
 
T
V
 
V
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
K
S
 
A
S
 
K
L
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
T
L
 
I
M
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
40% identity, 93% coverage: 14:254/258 of query aligns to 2:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
R
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
C
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
H
 
N
V
 
V
T
 
A
I
 
V
A
x
N
-
x
Y
A
|
A
R
x
G
R
x
S
I
 
K
E
 
E
P
 
K
L
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
M
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
K
D
 
G
M
 
V
Q
 
D
A
 
S
E
 
F
V
 
A
M
 
I
V
 
Q
L
x
A
D
x
N
V
|
V
A
 
A
D
 
D
I
 
A
A
 
D
A
 
E
T
 
V
R
 
K
A
 
A
S
 
M
I
 
I
S
 
K
E
 
E
R
 
V
I
 
V
T
 
S
Q
 
Q
N
 
F
G
 
G
A
 
S
F
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
A
 
T
R
 
R
H
 
D
S
 
N
P
 
L
A
 
L
S
 
M
D
 
R
T
 
M
T
 
K
E
 
E
G
 
Q
D
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
L
x
T
N
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
F
 
N
L
 
C
T
 
I
Q
 
Q
A
 
K
V
 
-
A
 
A
K
 
T
G
 
P
L
 
Q
M
 
M
A
 
L
A
 
R
G
 
Q
K
 
R
P
 
S
G
 
G
S
 
A
L
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
Q
 
V
M
 
V
A
 
G
K
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
N
L
 
P
D
 
G
R
x
Q
A
 
A
V
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
E
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
M
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
W
 
L
G
 
A
K
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
T
x
G
F
 
F
I
 
I
V
 
V
T
 
S
P
 
D
L
 
M
T
 
T
Q
 
D
S
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
E
R
 
L
R
 
K
A
 
E
W
 
Q
I
 
M
E
 
L
S
 
T
K
 
Q
I
 
I
Q
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
I
 
F
G
 
G
E
 
Q
V
 
D
E
 
T
D
 
D
I
 
I
M
 
A
G
 
N
G
 
T
V
 
V
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
K
S
 
A
S
 
K
L
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
T
L
 
I
M
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
38% identity, 95% coverage: 9:254/258 of query aligns to 3:254/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
F
 
F
R
 
D
L
 
L
D
 
S
G
 
G
K
 
R
R
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
S
 
S
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
C
 
I
A
 
A
V
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
T
V
 
V
T
 
A
I
 
I
A
 
A
A
x
D
R
x
L
R
 
D
I
 
V
E
 
M
P
 
A
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
A
E
 
G
M
 
L
Q
 
E
A
 
N
A
 
G
D
 
G
M
 
F
Q
 
A
A
 
V
E
 
E
V
|
V
M
 
-
V
 
-
L
 
-
D
|
D
V
|
V
A
 
T
D
 
K
I
 
R
A
 
A
A
 
S
T
 
V
R
 
D
A
 
A
S
 
A
I
 
M
S
 
Q
E
 
K
R
 
A
I
 
I
T
 
D
Q
 
A
N
 
L
G
 
G
A
 
G
F
 
F
D
 
D
I
 
L
L
 
L
V
 
C
N
 
A
S
x
N
A
|
A
G
|
G
L
 
V
A
 
S
R
 
T
H
 
M
S
 
R
P
 
P
A
 
A
S
 
V
D
 
D
T
 
I
T
 
T
E
 
D
G
 
E
D
 
E
F
 
W
D
 
D
A
 
F
V
 
N
I
 
F
D
 
D
L
 
V
N
 
N
I
 
A
K
 
R
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
F
 
L
L
 
A
T
 
N
Q
 
Q
A
 
I
V
 
A
A
 
C
K
 
R
G
 
H
L
 
F
M
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
N
K
 
T
P
 
K
G
 
G
S
 
V
L
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
Q
 
L
M
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
V
G
 
G
G
 
A
L
 
P
D
 
L
R
x
L
A
 
A
V
 
H
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
H
 
F
A
 
A
V
 
V
E
 
F
G
 
G
F
 
W
T
 
T
K
 
Q
S
 
A
M
 
L
A
 
A
I
 
R
E
 
E
W
 
M
G
 
A
K
 
P
S
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
T
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
T
x
G
F
 
F
I
x
V
V
 
K
T
|
T
P
 
A
L
x
M
T
 
Q
Q
 
E
S
 
R
T
 
E
F
 
I
-
 
I
-
 
W
-
x
E
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
G
D
 
M
R
 
T
P
 
P
E
 
E
R
 
A
-
 
V
R
 
R
A
 
A
W
 
E
I
 
Y
E
 
V
S
 
S
K
 
L
I
 
T
Q
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
E
E
 
E
V
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
V
M
 
A
G
 
D
G
 
V
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
S
 
A
S
 
R
L
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
G
L
 
I
M
 
N
I
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G

A7DY56 Tropinone reductase; EC 1.1.1.206; EC 1.1.1.236 from Cochlearia officinalis (Common scurvygrass) (see paper)
35% identity, 96% coverage: 9:256/258 of query aligns to 14:261/273 of A7DY56

query
sites
A7DY56
F
 
W
R
 
S
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
M
R
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
S
 
S
S
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
E
A
 
A
C
 
V
A
 
V
V
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
M
A
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
R
V
 
V
T
 
H
I
 
T
A
 
C
A
 
A
R
 
R
R
 
D
I
 
E
E
 
T
P
 
Q
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
S
V
 
L
A
 
R
E
 
E
M
 
W
Q
 
Q
A
 
A
A
 
K
D
 
G
M
 
F
Q
 
Q
A
 
V
E
 
T
V
 
T
M
 
S
V
 
V
L
 
C
D
 
D
V
 
V
A
 
S
D
 
S
I
 
-
A
 
R
A
 
D
T
 
Q
R
 
R
A
 
E
S
 
K
I
 
L
S
 
M
E
 
E
R
 
T
I
 
V
T
 
S
Q
 
S
-
 
L
-
 
F
N
 
Q
G
 
G
A
 
K
F
 
L
D
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
T
A
 
C
R
 
I
H
 
T
S
 
K
P
 
P
A
 
T
S
 
I
D
 
D
T
 
Y
T
 
T
E
 
S
G
 
E
D
 
D
F
 
F
D
 
S
A
 
F
V
 
L
I
 
M
D
 
S
L
 
T
N
 
N
I
 
L
K
 
E
G
 
S
A
 
S
Y
 
F
F
 
H
L
 
L
T
 
S
Q
 
Q
A
 
-
V
 
L
A
 
A
K
 
H
G
 
P
L
 
L
M
 
L
A
 
K
A
 
S
G
 
S
K
 
G
P
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
I
I
 
V
N
 
L
I
 
I
S
 
S
S
 
S
Q
 
V
M
 
A
A
 
S
K
 
V
V
 
V
G
 
H
G
 
V
L
 
N
D
 
V
R
 
G
A
 
S
V
 
I
Y
 
Y
S
 
G
A
 
A
T
 
T
K
 
K
H
 
G
A
 
A
V
 
M
E
 
N
G
 
Q
F
 
L
T
 
A
K
 
R
S
 
N
M
 
L
A
 
A
I
 
C
E
 
E
W
 
W
G
 
A
K
 
S
S
 
D
G
 
S
I
 
I
R
 
K
V
 
V
N
 
N
T
 
S
I
 
V
C
 
C
P
 
P
T
 
G
F
 
F
I
 
I
V
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
T
 
A
Q
 
S
S
 
N
T
x
Y
F
 
F
D
 
R
R
 
N
P
 
E
E
 
E
R
 
F
R
 
K
A
 
K
W
 
E
I
 
V
E
 
E
S
 
N
K
 
I
I
 
I
Q
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
A
E
 
N
D
 
E
I
 
V
M
 
S
G
 
S
G
 
L
V
 
V
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
C
S
 
L
D
 
P
A
 
A
S
 
A
S
 
S
L
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
T
L
 
I
M
 
C
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
F
T
 
S

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
36% identity, 95% coverage: 11:254/258 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
D
 
Q
G
 
N
K
 
R
R
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
 
A
S
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
C
 
T
A
 
A
V
 
L
A
 
R
L
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
A
V
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
N
A
x
D
R
x
I
R
 
D
I
 
A
E
 
E
P
 
K
L
 
V
E
 
R
A
 
A
L
 
T
V
 
V
A
 
D
E
 
E
M
 
F
Q
 
S
A
 
A
A
 
R
D
 
G
M
 
H
Q
 
R
A
 
V
E
 
L
V
 
G
M
 
A
V
 
V
L
 
A
D
 
D
V
x
I
A
 
G
D
 
N
I
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
V
R
 
D
A
 
G
S
 
M
I
 
V
S
 
K
E
 
Q
R
 
T
I
 
I
T
 
D
Q
 
A
N
 
F
G
 
G
A
 
R
F
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
|
G
L
 
M
A
 
E
R
 
R
H
 
A
S
 
G
P
 
A
A
 
L
S
 
R
D
 
K
T
 
L
T
 
S
E
 
E
G
 
A
D
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
L
 
V
N
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
T
Y
 
F
F
 
L
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
-
K
 
H
G
 
G
L
 
H
M
 
M
A
 
V
A
 
E
G
 
N
K
 
K
P
 
H
G
 
G
S
 
R
L
 
I
I
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
Q
 
R
M
 
-
A
 
A
K
 
W
V
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
A
D
 
G
R
 
Q
A
 
T
V
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
T
 
A
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
E
 
V
G
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
R
S
 
A
M
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
G
K
 
R
S
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
C
I
 
V
C
 
A
P
 
P
T
 
G
F
 
L
I
|
I
V
 
H
T
 
T
P
 
P
L
 
M
T
 
W
Q
 
D
S
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
E
R
 
L
P
 
P
E
 
E
R
 
K
-
 
D
R
 
Q
A
 
Q
W
 
F
I
 
L
E
 
L
S
 
S
K
 
R
I
 
Q
Q
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
M
 
A
G
 
N
G
 
T
V
 
L
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
D
S
 
S
S
 
G
L
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
V
L
 
L
M
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
36% identity, 95% coverage: 11:254/258 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
D
 
Q
G
 
N
K
 
R
R
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
C
 
T
A
 
A
V
 
L
A
 
R
L
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
A
V
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
N
A
x
D
R
 
I
R
 
D
I
 
A
E
 
E
P
 
K
L
 
V
E
 
R
A
 
A
L
 
T
V
 
V
A
 
D
E
 
E
M
 
F
Q
 
S
A
 
A
A
 
R
D
 
G
M
 
H
Q
 
R
A
 
V
E
 
L
V
 
G
M
 
A
V
 
V
L
 
A
D
|
D
V
x
I
A
 
G
D
 
N
I
 
K
A
 
A
A
 
A
T
 
V
R
 
D
A
 
G
S
 
M
I
 
V
S
 
K
E
 
Q
R
 
T
I
 
I
T
 
D
Q
 
A
N
 
F
G
 
G
A
 
R
F
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
E
R
 
R
H
 
A
S
 
G
P
 
A
A
 
L
S
 
R
D
 
K
T
 
L
T
 
S
E
 
E
G
 
A
D
 
D
F
 
W
D
 
D
A
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
L
 
V
N
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
T
Y
 
F
F
 
L
L
 
C
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
-
K
 
H
G
 
G
L
 
H
M
 
M
A
 
V
A
 
E
G
 
N
K
 
K
P
 
H
G
 
G
S
 
R
L
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
S
Q
 
R
M
 
-
A
 
A
K
 
W
V
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
A
D
 
G
R
 
Q
A
 
T
V
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
T
 
A
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
E
 
V
G
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
R
S
 
A
M
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
W
 
L
G
 
G
K
 
R
S
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
C
I
 
V
C
 
A
P
 
P
T
 
G
F
 
L
I
 
I
V
 
H
T
 
T
P
 
P
L
 
M
T
 
W
Q
 
D
S
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
E
R
 
L
P
 
P
E
 
E
R
 
K
-
 
D
R
 
Q
A
 
Q
W
 
F
I
 
L
E
 
L
S
 
S
K
 
R
I
 
Q
Q
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
G
E
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
M
 
A
G
 
N
G
 
T
V
 
L
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
D
S
 
S
S
 
G
L
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
V
L
 
L
M
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5gwrA 4-hydroxyisoleucine dehydrogenase complexed with nadh (see paper)
36% identity, 95% coverage: 13:257/258 of query aligns to 1:241/243 of 5gwrA

query
sites
5gwrA
G
 
N
K
 
K
R
 
I
A
 
I
L
 
M
V
 
I
T
 
S
G
|
G
A
 
A
S
 
N
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
H
A
 
A
C
 
C
A
 
I
V
 
K
A
 
Y
L
 
F
A
 
L
E
 
E
A
 
K
G
 
S
A
 
F
H
 
H
V
 
V
T
 
I
I
 
-
A
 
-
A
 
A
R
 
L
R
x
D
I
|
I
E
 
N
P
 
N
L
 
-
E
 
N
A
 
N
L
 
L
V
 
I
A
 
D
E
 
Y
M
 
M
Q
 
K
A
 
T
A
 
-
D
 
D
M
 
M
Q
 
P
A
 
L
E
 
K
V
 
V
M
 
V
V
 
Q
L
x
I
D
 
D
V
x
L
A
 
S
D
 
N
I
 
S
A
 
E
A
 
A
T
 
I
R
 
H
A
 
N
S
 
L
I
 
F
S
 
T
E
 
Q
R
 
L
I
 
D
T
 
L
Q
 
E
N
 
K
G
 
L
A
 
S
F
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
S
x
A
A
 
A
G
|
G
L
x
I
A
 
R
R
 
E
H
 
I
S
 
T
P
 
P
A
 
V
S
 
L
D
 
H
T
 
L
T
 
S
E
 
D
G
 
D
D
 
M
F
 
F
D
 
K
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
V
N
 
N
I
 
L
K
 
V
G
 
A
A
 
P
Y
 
F
F
 
I
L
 
L
T
 
S
Q