SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2759 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2759 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 16 hits to proteins with known functional sites (download)

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
45% identity, 99% coverage: 1:321/323 of query aligns to 7:312/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
M
 
M
I
 
I
L
 
L
C
 
C
C
 
C
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
M
I
 
L
P
 
P
A
 
R
P
 
E
V
 
T
A
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
E
T
 
T
G
 
A
F
 
F
V
 
Q
P
 
P
H
 
F
C
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
N
T
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
T
 
P
T
 
T
G
 
G
L
 
F
F
 
F
T
 
S
G
 
G
L
 
I
S
 
S
R
 
S
D
 
D
L
 
F
F
 
F
G
 
G
Q
 
D
Q
 
V
L
 
L
A
 
R
A
 
D
A
 
T
L
 
L
V
 
A
A
 
R
S
 
S
H
 
N
V
 
V
D
 
D
H
 
Y
G
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
A
R
 
I
S
 
S
D
 
N
Q
 
R
P
 
P
S
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
F
V
 
V
H
 
R
L
 
L
R
 
V
D
 
D
G
 
G
H
 
Q
A
 
A
E
 
R
Y
 
Y
H
 
A
F
 
F
F
 
Y
D
 
D
E
 
E
N
 
N
S
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
R
S
 
M
L
 
L
R
 
S
P
 
R
D
 
N
R
 
D
L
 
M
P
 
P
E
 
Y
L
 
V
S
 
D
A
 
E
D
 
T
V
 
I
D
 
S
A
 
A
L
 
M
F
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
C
I
 
I
S
 
S
L
 
L
C
 
I
N
 
S
G
 
E
A
 
P
A
 
C
A
 
G
E
 
S
T
 
V
Y
 
Y
A
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
A
G
 
P
R
 
N
R
 
R
I
 
V
I
 
M
M
 
F
I
 
L
D
 
D
P
 
P
N
 
N
V
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
N
F
 
L
A
 
I
K
 
T
D
 
V
E
 
R
A
 
K
A
 
T
Y
 
H
R
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
M
A
 
K
A
 
R
M
 
M
V
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
A
G
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
H
 
D
W
 
W
I
 
F
Y
 
-
P
 
-
G
 
G
D
 
E
A
 
K
P
 
G
I
 
S
E
 
H
E
 
D
K
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
E
I
 
I
L
 
A
T
 
A
G
 
E
E
 
W
A
 
L
G
 
K
M
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
V
L
 
I
T
|
T
L
 
K
G
|
G
S
x
A
K
 
H
G
|
G
A
 
A
K
 
V
G
 
A
F
 
Y
L
 
T
R
 
N
S
 
H
G
 
A
P
 
-
T
 
T
V
 
V
E
 
P
V
 
V
P
 
P
A
 
G
Q
 
V
V
 
K
A
 
V
V
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
F
x
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
F
 
I
M
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
L
T
 
H
E
 
S
A
 
Q
G
 
G
V
 
L
L
 
L
A
 
T
D
 
K
A
 
D
A
 
A
S
 
L
G
 
A
E
 
N
M
 
L
D
 
S
P
 
E
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
R
 
H
V
 
S
C
 
A
L
 
V
G
 
A
Y
 
L
G
 
G
A
x
V
R
 
R
A
 
A
A
|
A
A
 
A
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
P
 
P
P
 
P
W
 
W
R
 
A
D
 
H
E
 
E
L
 
M

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
34% identity, 96% coverage: 3:313/323 of query aligns to 5:282/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
L
 
L
C
 
V
C
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
-
I
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
P
D
 
D
A
 
P
Q
 
A
T
 
E
G
 
-
F
 
-
V
 
-
P
 
-
H
 
Y
C
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
S
V
 
P
F
 
L
N
 
N
T
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
T
 
D
T
 
V
G
 
D
L
 
L
F
 
L
T
 
T
G
 
H
L
 
I
S
 
G
R
|
R
D
 
D
L
 
A
F
 
R
G
 
G
Q
 
R
Q
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
Y
L
 
I
V
 
E
A
 
S
S
 
S
H
 
G
V
 
V
D
 
Q
-
 
L
-
 
V
H
x
S
G
|
G
F
 
S
A
 
Q
E
 
T
R
 
A
S
 
D
D
 
R
Q
 
T
P
 
P
S
 
T
T
 
A
L
 
T
A
 
A
F
 
R
V
 
T
H
 
Y
L
 
A
R
 
F
D
 
D
G
 
-
H
 
-
A
 
L
E
 
E
Y
 
W
H
 
Q
F
 
I
F
 
P
D
 
D
E
 
T
N
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
P
D
 
P
R
 
V
L
 
A
P
 
P
E
 
P
L
 
L
S
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
L
L
 
V
F
 
H
F
 
T
G
 
G
G
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
A
C
 
A
N
 
R
G
 
E
A
 
P
A
 
G
A
 
C
E
 
L
T
 
A
Y
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
D
R
 
A
E
 
Y
R
 
R
G
 
A
R
 
A
R
 
A
I
 
T
I
 
V
M
 
S
I
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
V
 
V
R
 
R
A
 
P
G
 
S
F
 
L
A
 
S
K
 
A
D
 
D
E
 
P
A
 
D
A
 
L
Y
 
T
R
 
R
S
 
R
R
 
R
L
 
I
A
 
Q
A
 
R
M
 
L
V
 
V
A
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
D
I
 
I
V
 
I
K
 
K
V
 
A
S
 
S
D
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
H
 
H
W
 
W
I
 
I
Y
 
D
P
 
P
G
 
T
D
 
Q
A
 
P
P
 
P
I
 
-
E
 
E
E
 
Q
K
 
T
I
 
A
R
 
R
Q
 
A
I
 
W
L
 
L
T
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
A
M
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
A
L
 
I
V
 
V
I
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
S
 
D
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
V
G
 
A
F
 
F
L
 
C
R
 
A
S
 
A
G
 
G
P
 
P
T
 
-
V
 
A
E
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
V
 
-
A
 
-
V
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
A
F
 
F
N
 
M
A
 
A
G
 
G
F
 
L
M
 
L
A
 
D
A
 
T
A
 
L
T
 
W
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
V
 
L
L
 
L
A
 
G
D
 
A
A
 
D
A
 
R
S
 
R
G
 
T
E
 
E
M
 
L
D
 
R
P
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
V
E
 
S
Q
 
A
L
 
L
R
 
T
V
 
S
C
 
A
L
 
L
G
 
E
Y
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
L
A
 
T
A
 
S
A
 
A
V
 
L
T
 
T
V
 
V
S
 
A
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
A

3gbuA Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with atp
27% identity, 84% coverage: 1:272/323 of query aligns to 1:253/302 of 3gbuA

query
sites
3gbuA
M
 
L
I
 
I
L
 
A
C
 
S
C
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
L
I
 
I
P
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
S
V
 
V
P
 
E
V
 
E
V
 
G
D
 
D
G
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
V
Q
 
R
T
 
L
G
 
-
F
 
F
V
 
E
P
 
K
H
 
H
C
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
P
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
V
G
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
T
 
K
T
 
S
G
 
S
L
 
L
F
 
I
T
 
S
G
 
K
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
L
 
P
F
 
F
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Y
L
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
L
V
 
S
A
 
K
S
 
E
H
 
N
V
 
V
D
 
D
-
 
T
H
 
R
G
 
G
F
 
I
A
 
V
E
 
K
R
 
D
S
 
E
D
 
K
Q
 
K
P
 
H
S
 
T
T
 
G
L
 
I
A
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
Q
L
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
A
H
 
S
A
 
P
E
 
S
Y
 
F
H
 
L
F
 
L
F
 
Y
D
 
D
E
 
D
N
 
V
S
 
A
A
 
Y
G
 
F
A
 
N
S
 
M
L
 
T
R
 
L
P
 
N
D
 
D
R
 
I
L
 
N
P
 
W
E
 
D
L
 
I
S
 
V
A
 
E
D
 
E
V
 
A
D
 
K
A
 
I
L
 
V
F
 
N
F
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
V
S
 
I
L
 
L
C
 
A
N
 
R
G
 
N
A
 
P
A
 
S
A
 
R
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
M
A
 
K
L
 
V
A
 
I
A
 
K
R
 
K
E
 
I
R
 
K
G
 
G
R
 
S
R
 
S
I
 
L
I
 
I
M
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
R
A
 
L
G
 
D
F
 
L
A
 
W
K
 
R
-
 
G
D
 
Q
E
 
E
A
 
E
A
 
E
Y
 
M
R
 
I
S
 
K
R
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
E
M
 
S
V
 
I
A
 
K
R
 
L
A
 
A
G
 
D
I
 
I
V
 
V
K
|
K
V
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
V
H
 
-
W
 
-
I
 
L
Y
 
Y
P
 
L
G
 
E
D
 
N
A
 
Q
P
 
G
I
 
V
E
 
E
E
 
V
K
 
K
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
G
P
 
S
G
 
M
L
 
L
V
 
T
I
 
A
L
 
I
T
|
T
L
 
L
G
|
G
S
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
F
K
 
R
G
 
-
F
 
L
L
 
I
R
 
K
S
 
N
G
 
E
P
 
T
T
 
V
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
S
Q
 
Y
V
 
N
A
x
V
V
 
N
V
x
P
A
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
M
A
 
A
G
 
A
F
 
L
M
 
L
A
 
V

Sites not aligning to the query:

3ih0A Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with amp-pnp
27% identity, 84% coverage: 1:272/323 of query aligns to 2:254/304 of 3ih0A

query
sites
3ih0A
M
 
L
I
 
I
L
 
A
C
 
S
C
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
L
I
 
I
P
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
S
V
 
V
P
 
E
V
 
E
V
 
G
D
 
D
G
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
V
Q
 
R
T
 
L
G
 
-
F
 
F
V
 
E
P
 
K
H
 
H
C
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
P
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
V
G
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
T
 
K
T
 
S
G
 
S
L
 
L
F
 
I
T
 
S
G
 
K
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
L
 
P
F
 
F
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Y
L
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
L
V
 
S
A
 
K
S
 
E
H
 
N
V
 
V
D
 
D
-
 
T
H
 
R
G
 
G
F
 
I
A
 
V
E
 
K
R
 
D
S
 
E
D
 
K
Q
 
K
P
 
H
S
 
T
T
 
G
L
 
I
A
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
Q
L
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
A
H
 
S
A
 
P
E
 
S
Y
 
F
H
 
L
F
 
L
F
 
Y
D
 
D
E
 
D
N
 
V
S
 
A
A
 
Y
G
 
F
A
 
N
S
 
M
L
 
T
R
 
L
P
 
N
D
 
D
R
 
I
L
 
N
P
 
W
E
 
D
L
 
I
S
 
V
A
 
E
D
 
E
V
 
A
D
 
K
A
 
I
L
 
V
F
 
N
F
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
V
S
 
I
L
 
L
C
 
A
N
 
R
G
 
N
A
 
P
A
 
S
A
 
R
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
M
A
 
K
L
 
V
A
 
I
A
 
K
R
 
K
E
 
I
R
 
K
G
 
G
R
 
S
R
 
S
I
 
L
I
 
I
M
 
A
I
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
L
R
 
R
A
 
L
G
 
D
F
 
L
A
 
W
K
 
R
-
 
G
D
 
Q
E
 
E
A
 
E
A
 
E
Y
 
M
R
 
I
S
 
K
R
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
E
M
 
S
V
 
I
A
 
K
R
 
L
A
 
A
G
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
V
H
 
-
W
 
-
I
 
L
Y
 
Y
P
 
L
G
 
E
D
 
N
A
 
Q
P
 
G
I
 
V
E
 
E
E
 
V
K
 
K
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
I
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
G
P
 
S
G
 
M
L
 
L
V
 
T
I
 
A
L
 
I
T
|
T
L
 
L
G
|
G
S
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
F
K
 
R
G
 
-
F
 
L
L
 
I
R
 
K
S
 
N
G
 
E
P
 
T
T
 
V
V
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
S
Q
 
Y
V
 
N
A
x
V
V
 
N
V
 
P
A
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
M
A
 
A
G
 
A
F
 
L
M
 
L
A
 
V

Sites not aligning to the query:

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
27% identity, 84% coverage: 2:271/323 of query aligns to 4:256/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
I
 
V
L
 
W
C
 
L
C
 
T
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
|
D
M
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
G
Q
 
Q
T
 
Q
G
 
H
F
 
Y
V
 
L
P
 
K
H
 
C
C
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
V
 
P
F
 
A
N
|
N
T
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
Q
 
G
T
 
R
T
 
S
G
 
A
L
 
F
F
 
F
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
L
 
P
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
Q
 
F
L
 
M
A
 
Q
A
 
Q
A
 
T
L
 
L
V
 
T
A
 
D
S
 
E
H
 
Q
V
 
V
D
 
D
-
 
C
-
 
Q
H
 
H
G
 
L
F
 
H
A
 
F
E
 
D
R
 
P
S
 
V
D
 
H
Q
 
R
P
 
T
S
 
S
T
 
T
L
 
V
A
 
V
F
 
V
V
 
D
H
 
L
L
 
D
R
 
E
D
x
H
G
 
G
H
 
E
A
 
R
E
 
S
Y
x
F
H
 
T
F
|
F
F
 
M
D
 
V
E
 
K
N
 
P
S
 
S
A
 
A
G
 
D
A
 
Q
S
 
F
L
 
L
R
 
Q
P
 
L
D
 
S
R
 
D
L
 
I
P
 
P
E
 
S
L
 
F
S
 
Q
A
 
K
D
 
G
V
 
-
D
 
E
A
 
W
L
 
L
F
 
H
F
 
V
G
 
C
G
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
L
C
 
A
N
 
N
G
 
Q
A
 
P
A
 
S
-
 
R
A
 
S
E
 
S
T
 
T
Y
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
Q
R
 
M
E
 
K
R
 
E
G
 
V
R
 
G
R
 
G
I
 
Y
I
 
V
M
 
S
I
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
V
 
L
R
|
R
A
 
E
G
 
E
F
 
V
A
 
W
K
 
S
D
 
E
E
 
P
A
 
Q
A
 
E
Y
 
L
R
 
Q
S
 
A
R
 
T
L
 
V
A
 
M
A
 
R
M
 
A
V
 
V
A
 
G
R
 
L
A
 
A
G
 
D
I
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
H
 
Q
W
 
F
I
 
L
Y
 
-
P
 
T
G
 
G
D
 
T
A
 
Q
P
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
K
 
G
I
 
L
R
 
Q
Q
 
A
I
 
I
L
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
A
G
 
D
M
 
F
G
 
Q
P
 
I
G
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
L
 
V
T
|
T
L
 
L
G
|
G
S
x
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
L
R
 
V
S
 
A
G
 
T
P
 
P
T
 
N
V
 
S
E
 
Q
-
 
Q
-
 
I
V
 
V
P
 
S
A
 
G
Q
 
K
V
x
A
A
x
V
V
 
K
V
 
P
A
 
I
D
 
D
T
|
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
M
 
L

Sites not aligning to the query:

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
27% identity, 84% coverage: 2:271/323 of query aligns to 8:260/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
I
 
V
L
 
W
C
 
L
C
 
T
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
|
D
M
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
G
Q
 
Q
T
 
Q
G
 
H
F
 
Y
V
 
L
P
 
K
H
 
C
C
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
V
 
P
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
Q
 
G
T
 
R
T
 
S
G
 
A
L
 
F
F
 
F
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
L
 
P
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
Q
 
F
L
 
M
A
 
Q
A
 
Q
A
 
T
L
 
L
V
 
T
A
 
D
S
 
E
H
 
Q
V
 
V
D
 
D
-
 
C
-
 
Q
H
 
H
G
 
L
F
 
H
A
 
F
E
 
D
R
 
P
S
 
V
D
 
H
Q
 
R
P
 
T
S
 
S
T
 
T
L
 
V
A
 
V
F
 
V
V
 
D
H
 
L
L
 
D
R
 
E
D
 
C
G
 
G
H
 
E
A
 
R
E
 
S
Y
x
F
H
 
T
F
|
F
F
 
M
D
 
V
E
 
K
N
 
P
S
 
S
A
 
A
G
 
D
A
 
Q
S
 
F
L
 
L
R
 
Q
P
 
L
D
 
S
R
 
D
L
 
I
P
 
P
E
 
S
L
 
F
S
 
Q
A
 
K
D
 
G
V
 
-
D
 
E
A
 
W
L
 
L
F
 
H
F
 
V
G
 
C
G
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
L
C
 
A
N
 
N
G
 
Q
A
 
P
A
 
S
-
 
R
A
 
S
E
 
S
T
 
T
Y
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
Q
R
 
M
E
 
K
R
 
E
G
 
V
R
 
G
R
 
G
I
 
Y
I
 
V
M
 
S
I
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
V
 
L
R
|
R
A
 
E
G
 
E
F
 
V
A
 
W
K
 
S
D
 
E
E
 
P
A
 
Q
A
 
E
Y
 
L
R
 
Q
S
 
A
R
 
T
L
 
V
A
 
M
A
 
R
M
 
A
V
 
V
A
 
G
R
 
L
A
 
A
G
 
D
I
 
V
V
 
V
K
|
K
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
H
 
Q
W
 
F
I
 
L
Y
 
-
P
 
T
G
 
G
D
 
T
A
 
Q
P
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
E
K
 
G
I
 
L
R
 
Q
Q
 
A
I
 
I
L
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
A
G
 
D
M
 
F
G
 
Q
P
 
I
G
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
L
 
V
T
|
T
L
 
L
G
|
G
S
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
F
 
-
L
 
L
R
 
V
S
 
A
G
 
T
P
 
P
T
 
N
V
 
S
E
 
Q
-
 
Q
-
 
I
V
 
V
P
 
S
A
 
G
Q
 
K
V
x
A
A
x
V
V
 
K
V
 
P
A
 
I
D
 
D
T
 
C
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
M
 
L

Sites not aligning to the query:

3lkiB Crystal structure of fructokinase with bound atp from xylella fastidiosa
30% identity, 97% coverage: 2:313/323 of query aligns to 5:303/322 of 3lkiB

query
sites
3lkiB
I
 
I
L
 
L
C
 
C
C
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
M
I
 
L
P
 
A
A
 
Q
P
 
P
V
 
L
A
 
P
G
 
R
A
 
A
V
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
F
 
F
V
 
L
P
 
Q
H
 
C
C
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
P
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
V
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
T
 
A
T
 
V
G
 
Q
L
 
F
F
 
V
T
 
G
G
 
M
L
 
L
S
 
G
R
 
S
D
 
D
L
 
M
F
 
F
G
 
G
Q
 
D
Q
 
F
L
 
L
A
 
F
A
 
D
A
 
S
L
 
F
V
 
A
-
 
E
A
 
A
S
 
G
H
 
V
V
 
V
D
 
T
H
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
V
E
 
R
R
 
T
S
 
S
D
 
T
Q
 
A
P
 
K
S
 
T
T
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
F
V
 
V
H
 
A
L
 
L
R
 
-
D
 
D
G
 
G
H
 
E
A
 
R
E
 
S
Y
 
F
H
 
S
F
 
F
F
 
Y
D
 
R
E
 
P
N
 
P
S
 
A
A
 
A
G
 
D
A
 
L
S
 
L
L
 
F
R
 
R
P
 
V
D
 
E
R
 
H
L
 
F
P
 
Q
E
 
D
L
 
A
S
 
S
A
 
F
D
 
S
V
 
-
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
I
F
 
F
G
 
H
G
 
A
I
 
-
S
 
-
L
 
-
C
 
C
N
 
S
G
 
N
A
 
S
A
 
M
A
 
T
E
 
D
T
 
A
Y
 
D
A
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
V
A
 
T
R
 
F
E
 
E
R
 
G
G
 
M
R
 
R
R
 
R
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
A
I
 
I
I
 
V
M
 
S
I
 
F
D
 
D
P
 
L
N
 
N
V
 
F
R
 
R
A
 
P
G
 
M
F
 
L
A
 
W
K
 
P
D
 
N
E
 
G
A
 
E
A
 
N
Y
 
P
R
 
A
S
 
S
R
 
R
L
 
L
A
 
W
A
 
K
M
 
G
V
 
L
A
 
S
R
 
L
A
 
A
G
 
D
I
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
L
S
 
S
D
 
S
E
 
E
D
 
E
L
 
L
H
 
D
W
 
Y
I
 
L
-
 
A
-
 
N
-
 
T
Y
 
L
P
 
A
G
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
-
I
 
-
E
 
N
E
 
A
K
 
V
I
 
I
R
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
L
 
W
T
 
Q
G
 
G
E
 
R
A
 
A
G
 
-
M
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
Q
L
 
L
V
 
L
I
 
L
L
 
V
T
|
T
L
x
D
G
 
A
S
 
A
K
 
G
G
 
P
A
 
V
K
 
H
G
 
W
F
 
Y
L
 
T
R
 
R
S
 
T
G
 
A
P
 
G
T
 
G
V
 
-
E
 
E
V
 
V
P
 
P
A
x
T
Q
 
F
V
 
R
A
 
V
V
 
Q
V
 
V
A
 
Q
D
 
D
T
 
S
V
 
N
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
Y
-
 
T
F
 
F
M
 
A
A
 
Q
A
 
Q
A
 
F
T
 
D
E
 
D
A
 
A
G
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
I
D
 
D
A
 
F
A
 
C
S
 
H
G
 
-
E
 
-
M
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
E
Q
 
S
L
 
I
R
 
V
V
 
S
C
 
T
L
 
L
G
 
R
Y
 
F
G
 
A
A
|
A
R
 
A
A
 
V
A
 
G
A
 
A
V
 
L
T
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
R
P
 
Q
G
 
G
A
 
A

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
29% identity, 89% coverage: 36:321/323 of query aligns to 31:297/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
H
 
Y
C
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
E
F
 
V
N
 
N
T
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
T
 
K
T
 
V
G
 
G
L
 
F
F
 
V
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
E
D
 
D
L
 
E
F
 
L
G
 
G
Q
 
A
Q
 
M
L
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
R
A
 
A
S
 
E
H
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
L
G
 
T
F
 
H
A
 
F
E
 
R
R
 
R
S
 
A
D
 
P
Q
 
G
P
 
F
S
 
T
T
 
G
L
 
L
A
 
-
F
 
-
V
 
-
H
 
Y
L
 
L
R
 
R
D
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
L
G
 
G
H
 
Q
A
 
G
E
 
R
Y
 
V
H
 
F
F
 
Y
F
 
Y
D
 
R
E
 
K
N
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
S
S
 
A
L
 
L
R
 
A
P
 
P
D
 
G
R
 
A
L
 
F
-
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
Y
S
 
L
A
 
E
D
 
G
V
 
V
D
 
R
A
 
F
L
 
L
F
 
H
F
 
L
G
 
S
G
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
P
C
 
A
N
 
L
G
 
S
A
 
P
A
 
E
A
 
A
E
 
R
T
 
A
Y
 
F
A
 
S
A
 
L
L
 
W
A
 
A
A
 
M
R
 
E
E
 
E
R
 
A
G
 
K
R
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
V
I
 
R
I
 
V
M
 
S
I
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
Y
R
 
R
A
 
Q
G
 
T
F
 
L
A
 
W
K
 
S
D
 
P
E
 
E
A
 
E
A
 
A
Y
 
-
R
 
R
S
 
G
R
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
R
M
 
A
V
 
L
A
 
P
R
 
G
A
 
V
G
 
D
I
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
H
 
E
W
 
L
I
 
L
Y
 
F
P
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
G
P
 
R
I
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
A
I
 
L
L
 
S
T
 
A
G
 
P
E
 
E
A
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
x
K
L
 
R
G
|
G
S
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
W
G
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
-
S
 
D
G
 
G
P
 
R
T
 
R
V
 
V
E
 
E
V
 
G
P
 
S
A
|
A
Q
x
F
V
 
A
A
x
V
V
 
E
V
 
A
A
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
M
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
A
T
 
V
E
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
W
G
 
G
E
 
L
M
 
P
D
 
V
P
 
E
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
L
C
 
A
L
x
N
G
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
|
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
S
T
 
R
V
 
G
S
 
D
R
 
H
P
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
-
P
 
-
P
 
P
W
 
Y
R
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
L

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
29% identity, 89% coverage: 36:321/323 of query aligns to 31:297/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
H
 
Y
C
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
V
 
E
F
 
V
N
|
N
T
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
T
 
K
T
 
V
G
 
G
L
 
F
F
 
V
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
E
D
 
D
L
 
E
F
 
L
G
 
G
Q
 
A
Q
 
M
L
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
R
A
 
A
S
 
E
H
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
L
G
 
T
F
 
H
A
 
F
E
 
R
R
 
R
S
 
A
D
 
P
Q
 
G
P
 
F
S
 
T
T
 
G
L
 
L
A
 
-
F
 
-
V
 
-
H
x
Y
L
 
L
R
 
R
D
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
L
G
 
G
H
 
Q
A
 
G
E
 
R
Y
 
V
H
 
F
F
 
Y
F
 
Y
D
x
R
E
 
K
N
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
S
S
 
A
L
 
L
R
 
A
P
 
P
D
 
G
R
 
A
L
 
F
-
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
Y
S
 
L
A
 
E
D
 
G
V
 
V
D
 
R
A
 
F
L
 
L
F
 
H
F
 
L
G
 
S
G
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
P
C
 
A
N
 
L
G
 
S
A
 
P
A
 
E
A
 
A
E
 
R
T
 
A
Y
 
F
A
 
S
A
 
L
L
 
W
A
 
A
A
 
M
R
 
E
E
 
E
R
 
A
G
 
K
R
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
V
I
 
R
I
 
V
M
 
S
I
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
Y
R
|
R
A
 
Q
G
 
T
F
 
L
A
 
W
K
 
S
D
 
P
E
 
E
A
 
E
A
 
A
Y
 
-
R
 
R
S
 
G
R
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
R
M
 
A
V
 
L
A
 
P
R
 
G
A
 
V
G
 
D
I
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
H
 
E
W
 
L
I
 
L
Y
 
F
P
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
G
P
 
R
I
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
A
I
 
L
L
 
S
T
 
A
G
 
P
E
 
E
A
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
x
K
L
 
R
G
|
G
S
x
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
W
G
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
-
S
 
D
G
 
G
P
 
R
T
 
R
V
 
V
E
 
E
V
 
G
P
 
S
A
 
A
Q
 
F
V
 
A
A
 
V
V
 
E
V
 
A
A
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
M
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
A
T
 
V
E
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
W
G
 
G
E
 
L
M
 
P
D
 
V
P
 
E
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
L
C
 
A
L
x
N
G
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
|
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
S
T
 
R
V
 
G
S
x
D
R
 
H
P
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
-
P
 
-
P
 
P
W
 
Y
R
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
29% identity, 89% coverage: 36:321/323 of query aligns to 31:297/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
H
 
Y
C
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
V
x
E
F
x
V
N
|
N
T
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
V
T
 
K
T
 
V
G
 
G
L
 
F
F
 
V
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
E
D
 
D
L
 
E
F
 
L
G
 
G
Q
 
A
Q
 
M
L
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
R
A
 
A
S
 
E
H
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
L
G
 
T
F
 
H
A
 
F
E
 
R
R
 
R
S
 
A
D
 
P
Q
 
G
P
 
F
S
 
T
T
 
G
L
 
L
A
 
-
F
 
-
V
 
-
H
 
Y
L
 
L
R
 
R
D
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
L
G
 
G
H
 
Q
A
 
G
E
 
R
Y
 
V
H
 
F
F
x
Y
F
x
Y
D
x
R
E
 
K
N
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
S
S
 
A
L
 
L
R
 
A
P
 
P
D
 
G
R
 
A
L
 
F
-
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
Y
S
 
L
A
 
E
D
 
G
V
 
V
D
 
R
A
 
F
L
 
L
F
 
H
F
 
L
G
 
S
G
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
P
C
 
A
N
 
L
G
 
S
A
 
P
A
 
E
A
 
A
E
 
R
T
 
A
Y
 
F
A
 
S
A
 
L
L
 
W
A
 
A
A
 
M
R
 
E
E
 
E
R
 
A
G
 
K
R
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
V
I
 
R
I
 
V
M
 
S
I
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
Y
R
|
R
A
 
Q
G
 
T
F
 
L
A
 
W
K
 
S
D
 
P
E
 
E
A
 
E
A
 
A
Y
 
-
R
 
R
S
 
G
R
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
R
M
 
A
V
 
L
A
 
P
R
 
G
A
 
V
G
 
D
I
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
|
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
H
 
E
W
 
L
I
 
L
Y
 
F
P
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
G
P
 
R
I
 
V
E
 
E
E
 
E
K
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
A
I
 
L
L
 
S
T
 
A
G
 
P
E
 
E
A
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
x
K
L
x
R
G
|
G
S
x
A
K
|
K
G
|
G
A
|
A
K
 
W
G
 
A
F
 
F
L
 
V
R
 
-
S
 
D
G
 
G
P
 
R
T
 
R
V
 
V
E
 
E
V
 
G
P
 
S
A
 
A
Q
 
F
V
 
A
A
 
V
V
 
E
V
 
A
A
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
M
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
A
T
 
V
E
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
W
G
 
G
E
 
L
M
 
P
D
 
V
P
 
E
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
L
C
 
A
L
x
N
G
 
L
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
S
T
 
R
V
 
G
S
x
D
R
 
H
P
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
-
P
 
-
P
 
P
W
 
Y
R
 
R
D
 
E
E
 
D
L
 
L

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
25% identity, 94% coverage: 6:309/323 of query aligns to 11:319/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
G
 
G
E
 
D
A
 
A
L
 
S
I
 
V
D
|
D
M
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
E
A
 
K
Q
 
Q
T
 
N
G
 
S
F
 
Y
V
 
L
P
 
K
H
 
C
C
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
V
 
S
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
G
I
 
V
A
 
C
L
 
V
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
T
 
E
T
 
C
G
 
G
L
 
F
F
 
I
T
 
G
G
 
C
L
 
L
S
 
G
R
 
D
D
 
D
L
 
D
F
 
A
G
 
G
Q
 
R
Q
 
F
L
 
L
A
 
R
A
 
Q
A
 
V
L
 
F
V
 
Q
A
 
D
S
 
N
H
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
V
G
 
T
F
 
F
A
 
L
E
 
R
-
 
L
R
 
D
S
 
A
D
 
D
Q
 
L
P
 
T
S
 
S
T
 
A
L
 
V
A
 
L
F
 
I
V
 
V
H
 
N
L
 
L
R
 
T
-
 
A
D
 
D
G
 
G
H
 
E
A
 
R
E
 
S
Y
 
F
H
 
T
F
x
Y
F
 
L
D
 
V
E
 
H
N
 
P
S
 
G
A
 
A
G
 
D
A
 
T
S
 
Y
L
 
V
R
 
S
P
 
P
D
 
Q
R
 
D
L
 
L
P
 
P
E
 
P
L
 
F
S
 
R
A
 
-
D
 
Q
V
 
Y
D
 
E
A
 
W
L
 
F
F
 
Y
F
 
F
G
 
S
G
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
L
C
 
T
N
 
D
G
 
R
A
 
P
A
 
A
A
 
R
E
 
E
T
 
-
Y
 
-
A
 
A
A
 
C
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
A
E
 
R
R
 
R
G
 
M
R
 
R
R
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
G
I
 
Y
I
 
V
M
 
L
I
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
L
R
|
R
A
 
S
G
 
K
F
 
M
A
 
W
K
 
G
D
 
N
E
 
T
A
 
D
A
 
E
Y
 
I
R
 
P
S
 
E
R
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
R
M
 
S
V
x
A
A
|
A
R
 
L
A
|
A
G
 
S
I
 
I
V
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
-
 
C
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
S
H
 
H
W
 
W
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
K
 
D
I
 
A
R
 
R
Q
 
Y
I
 
Y
L
 
L
T
 
R
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
D
M
 
L
G
|
G
P
 
C
G
 
D
L
 
T
V
 
T
I
 
I
L
 
I
T
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
A
K
 
D
G
 
G
A
 
A
K
 
L
G
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
A
S
 
E
G
 
G
P
 
E
T
 
-
V
 
F
E
 
H
V
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
P
V
 
R
A
 
V
V
 
D
V
 
V
A
 
V
D
|
D
T
 
T
V
x
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
M
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
L
-
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
N
-
 
C
-
 
W
-
 
D
-
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
I
A
 
S
A
 
N
A
 
A
T
 
N
E
 
A
A
 
C
G
 
G
V
 
A
L
 
M
A
|
A
D
 
V
A
 
T
A
|
A
S
 
K
G
|
G
E
 
A
M
 
M
D
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
F
P
 
P
E
 
D
Q
 
Q
L
 
L
R
 
N
V
 
T
C
 
F
L
 
L
G
 
S
Y
 
S
G
 
H
A
 
S
R
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
V
 
M
T
 
T
V
 
V
S
 
K

8cqxA Ribokinase from t.Sp mutant a92g
29% identity, 99% coverage: 1:321/323 of query aligns to 1:294/300 of 8cqxA

query
sites
8cqxA
M
 
M
I
 
I
L
 
L
C
 
V
C
 
V
G
 
G
E
 
S
A
 
L
L
 
N
I
 
M
D
 
D
M
 
L
I
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
K
-
 
R
-
 
L
P
 
P
A
 
R
P
 
P
V
 
G
A
 
E
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
T
V
 
V
D
 
L
G
 
G
A
 
E
D
 
D
A
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
G
 
-
F
 
-
V
 
-
P
 
-
H
 
H
C
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
K
V
 
G
F
 
A
N
 
N
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
T
 
K
T
 
V
G
 
R
L
 
M
F
 
L
T
 
G
G
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
E
D
 
D
L
 
P
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
S
A
 
G
L
 
L
V
 
A
A
 
Q
S
 
E
H
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
V
G
 
A
F
 
W
A
 
V
E
 
L
R
 
E
S
 
T
D
 
P
Q
 
G
P
 
P
S
 
S
T
 
G
L
 
T
A
 
G
F
 
F
V
 
I
H
 
-
L
 
L
R
 
V
D
 
D
G
 
P
H
 
E
A
 
G
E
 
Q
Y
 
N
H
 
Q
F
 
I
F
 
A
D
 
V
E
 
A
N
 
P
S
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
S
 
R
L
 
L
R
 
V
P
 
P
D
 
E
R
 
D
L
 
L
P
 
P
E
 
-
L
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
T
F
 
A
F
 
F
G
 
Q
G
 
G
I
 
V
S
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
L
L
 
L
C
 
Q
N
 
L
G
 
E
A
 
I
A
 
P
A
 
L
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
V
A
 
R
L
 
A
A
 
A
A
 
A
-
 
L
-
 
G
R
 
R
E
 
K
R
 
A
G
 
G
R
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
L
M
 
L
I
 
-
D
 
-
P
 
-
N
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
N
A
 
A
K
 
A
D
 
P
E
 
A
A
 
H
A
 
A
Y
 
L
R
 
P
S
 
S
R
 
E
L
 
I
A
 
L
A
 
Q
M
 
S
V
 
V
A
 
D
R
 
L
A
 
L
G
 
L
I
 
V
V
x
N
K
 
E
V
 
V
S
 
E
D
 
A
E
 
A
D
 
Q
L
 
L
H
 
T
W
 
E
I
 
A
Y
 
S
P
 
P
G
 
P
D
 
R
A
 
T
P
 
P
I
 
E
E
 
E
E
 
A
-
 
L
K
 
A
I
 
L
R
 
A
Q
 
R
I
 
Q
L
 
L
T
 
R
G
 
G
E
 
R
A
 
A
G
 
P
M
 
Q
G
 
A
P
 
Q
G
 
-
L
 
-
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
|
T
L
 
L
G
|
G
S
x
A
K
 
Q
G
|
G
A
 
A
K
 
-
G
 
-
F
 
V
L
 
W
R
 
S
S
 
G
G
 
T
P
 
E
T
 
E
V
 
S
E
 
H
V
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
F
V
 
P
A
 
V
V
 
R
V
 
A
A
 
V
D
|
D
T
 
T
V
x
T
G
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
A
F
|
F
N
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
L
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
A
S
 
L
G
 
G
E
 
L
M
 
A
D
 
E
P
 
G
E
 
Q
Q
 
N
L
 
M
R
 
R
V
 
A
C
 
A
L
 
L
G
 
R
Y
 
F
G
 
A
A
x
N
R
 
A
A
 
A
A
x
G
A
|
A
V
 
L
T
x
A
V
x
T
S
 
T
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
P
 
P
-
x
S
-
 
L
P
 
P
W
 
F
R
 
R
D
 
D
E
 
E
L
 
V

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
25% identity, 87% coverage: 6:287/323 of query aligns to 7:264/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
S
I
 
V
D
|
D
M
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
E
A
 
K
Q
 
Q
T
 
N
G
 
S
F
 
Y
V
 
L
P
 
K
H
x
C
C
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
V
 
S
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
G
I
 
V
A
 
C
L
 
V
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
T
 
E
T
 
C
G
 
G
L
 
F
F
 
I
T
 
G
G
 
C
L
 
L
S
 
G
R
 
D
D
 
D
L
 
D
F
 
A
G
 
G
Q
 
R
Q
 
F
L
 
L
A
 
R
A
 
Q
A
 
V
L
 
F
V
 
Q
A
 
D
S
 
N
H
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
V
G
 
T
F
 
F
A
 
L
E
 
R
-
 
L
R
 
D
S
 
A
D
 
D
Q
 
L
P
 
T
S
 
S
T
 
A
L
 
V
A
 
L
F
 
I
V
 
V
H
 
N
L
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
E
 
S
Y
x
F
H
 
T
F
x
Y
F
 
L
D
 
V
E
 
H
N
 
P
S
 
G
A
 
A
G
 
D
A
 
T
S
 
Y
L
 
V
R
 
S
P
 
P
D
 
Q
R
 
D
L
 
L
P
 
P
E
 
P
L
 
F
S
 
R
A
 
-
D
 
Q
V
 
Y
D
 
E
A
 
W
L
 
F
F
 
Y
F
 
F
G
 
S
G
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
L
C
 
T
N
 
D
G
 
R
A
 
P
A
 
A
A
 
R
E
 
E
T
 
-
Y
 
-
A
 
A
A
 
C
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
A
E
 
R
R
 
R
G
 
M
R
 
R
R
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
G
I
 
Y
I
 
V
M
 
L
I
 
F
D
 
D
P
 
V
N
|
N
V
 
L
R
|
R
A
 
S
G
 
K
F
x
M
A
 
W
K
 
G
D
 
N
E
 
T
A
 
D
A
 
E
Y
 
I
R
 
P
S
 
E
R
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
R
M
 
S
V
 
A
A
 
A
R
 
L
A
 
A
G
 
S
I
 
I
V
 
C
K
|
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
x
E
L
 
L
-
 
C
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
S
H
 
H
W
 
W
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
K
 
D
I
 
A
R
 
R
Q
 
Y
I
 
Y
L
 
L
T
 
R
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
C
G
 
D
L
 
T
V
 
T
I
 
I
L
 
I
T
x
S
L
 
L
G
|
G
S
x
A
K
 
D
G
|
G
A
 
A
K
 
L
G
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
A
S
 
E
G
 
G
P
 
-
T
 
E
V
 
F
E
 
H
V
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
P
V
 
R
A
 
V
V
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
|
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
M
 
L
A
 
F
A
 
T
A
 
L
T
 
S
E
 
R
A
 
A
G
 
N
V
 
C
L
 
W
A
 
D
D
 
H
A
 
A
A
 
L
S
 
L
G
 
A
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
25% identity, 87% coverage: 6:287/323 of query aligns to 7:264/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
x
S
I
 
V
D
|
D
M
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
E
A
 
K
Q
 
Q
T
 
N
G
 
S
F
 
Y
V
 
L
P
 
K
H
x
C
C
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
V
 
S
F
 
A
N
 
N
T
 
V
A
 
G
I
 
V
A
 
C
L
 
V
G
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
T
 
E
T
 
C
G
 
G
L
 
F
F
 
I
T
 
G
G
 
C
L
 
L
S
 
G
R
 
D
D
 
D
L
 
D
F
 
A
G
 
G
Q
 
R
Q
 
F
L
 
L
A
 
R
A
 
Q
A
 
V
L
 
F
V
 
Q
A
 
D
S
 
N
H
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
V
G
 
T
F
 
F
A
 
L
E
 
R
-
 
L
R
 
D
S
 
A
D
 
D
Q
 
L
P
 
T
S
 
S
T
 
A
L
 
V
A
x
L
F
 
I
V
 
V
H
 
N
L
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
E
 
S
Y
x
F
H
 
T
F
x
Y
F
 
L
D
 
V
E
 
H
N
 
P
S
 
G
A
 
A
G
 
D
A
 
T
S
 
Y
L
 
V
R
 
S
P
 
P
D
 
Q
R
 
D
L
 
L
P
 
P
E
 
P
L
 
F
S
 
R
A
 
-
D
 
Q
V
 
Y
D
 
E
A
 
W
L
 
F
F
 
Y
F
 
F
G
 
S
G
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
L
C
 
T
N
 
D
G
 
R
A
 
P
A
 
A
A
 
R
E
 
E
T
 
-
Y
 
-
A
 
A
A
 
C
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
A
E
 
R
R
 
R
G
 
M
R
 
R
R
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
G
I
 
Y
I
 
V
M
 
L
I
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
V
 
L
R
|
R
A
 
S
G
 
K
F
x
M
A
 
W
K
 
G
D
 
N
E
 
T
A
 
D
A
 
E
Y
 
I
R
 
P
S
 
E
R
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
R
M
 
S
V
 
A
A
 
A
R
 
L
A
 
A
G
 
S
I
 
I
V
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
-
 
C
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
S
H
 
H
W
 
W
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
E
 
-
E
 
Q
K
 
D
I
 
A
R
 
R
Q
 
Y
I
 
Y
L
 
L
T
 
R
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
C
G
 
D
L
 
T
V
 
T
I
 
I
L
 
I
T
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
A
K
 
D
G
 
G
A
 
A
K
 
L
G
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
A
S
 
E
G
 
G
P
 
E
T
 
-
V
 
F
E
 
H
V
 
F
P
 
P
A
 
A
Q
 
P
V
 
R
A
 
V
V
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
A
F
 
F
N
 
V
A
 
G
G
 
G
F
 
L
M
 
L
A
 
F
A
 
T
A
 
L
T
 
S
E
 
R
A
 
A
G
 
N
V
 
C
L
 
W
A
 
D
D
 
H
A
 
A
A
 
L
S
 
L
G
 
A
E
 
E

6ilsB Structure of arabidopsis thaliana ribokinase complexed with ribose and atp (see paper)
35% identity, 34% coverage: 211:319/323 of query aligns to 205:301/313 of 6ilsB

query
sites
6ilsB
E
 
E
K
 
Q
I
 
I
R
 
S
Q
 
Q
I
 
A
L
 
V
T
 
A
G
 
K
E
 
C
A
 
H
G
 
K
M
 
L
G
 
G
P
 
V
G
 
K
L
 
Q
V
 
V
I
 
L
L
 
V
T
x
K
L
 
L
G
|
G
S
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
S
K
 
A
G
 
L
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
S
 
G
G
 
E
P
 
K
T
 
P
V
 
I
E
 
Q
-
 
Q
-
 
S
-
 
I
V
x
I
P
 
P
A
|
A
Q
 
-
V
 
-
A
 
A
V
 
Q
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
F
|
F
N
 
T
A
 
A
G
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
M
T
 
V
E
 
E
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
G
E
 
K
M
 
S
D
 
H
P
 
E
E
 
E
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
C
 
C
L
 
L
G
 
R
Y
 
F
G
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
A
A
|
A
A
x
S
V
 
L
T
 
C
V
 
V
S
 
Q
R
 
V
P
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
I
P
 
P
P
 
S
W
 
M
R
 
P
D
 
D

Sites not aligning to the query:

A1A6H3 Ribokinase; AtRBSK; RK; EC 2.7.1.15 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
35% identity, 34% coverage: 211:319/323 of query aligns to 271:367/379 of A1A6H3

query
sites
A1A6H3
E
 
E
K
 
Q
I
 
I
R
 
S
Q
 
Q
I
 
A
L
 
V
T
 
A
G
 
K
E
 
C
A
 
H
G
 
K
M
 
L
G
 
G
P
 
V
G
 
K
L
 
Q
V
 
V
I
 
L
L
 
V
T
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
S
K
 
A
G
 
L
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
S
 
G
G
 
E
P
 
K
T
 
P
V
 
I
E
 
Q
-
 
Q
-
 
S
-
 
I
V
 
I
P
 
P
A
 
A
Q
 
-
V
 
-
A
 
A
V
 
Q
V
 
V
A
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
N
 
T
A
 
A
G
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
M
T
 
V
E
 
E
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
G
E
 
K
M
 
S
D
 
H
P
 
E
E
 
E
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
C
 
C
L
 
L
G
 
R
Y
 
F
G
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
S
V
 
L
T
 
C
V
 
V
S
 
Q
R
 
V
P
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
I
P
 
P
P
 
S
W
 
M
R
 
P
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF2759 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2759
MILCCGEALIDMIPAPVAGAVPVVDGADAQTGFVPHCGGAVFNTAIALGRLGQTTGLFTG
LSRDLFGQQLAAALVASHVDHGFAERSDQPSTLAFVHLRDGHAEYHFFDENSAGASLRPD
RLPELSADVDALFFGGISLCNGAAAETYAALAARERGRRIIMIDPNVRAGFAKDEAAYRS
RLAAMVARAGIVKVSDEDLHWIYPGDAPIEEKIRQILTGEAGMGPGLVILTLGSKGAKGF
LRSGPTVEVPAQVAVVADTVGAGDTFNAGFMAAATEAGVLADAASGEMDPEQLRVCLGYG
ARAAAVTVSRPGANPPWRDELAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory