SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2766 HP15_2710 L-lactate/malate dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P16115 L-lactate dehydrogenase; L-LDH; EC 1.1.1.27 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
38% identity, 100% coverage: 1:307/307 of query aligns to 1:314/319 of P16115

query
sites
P16115
M
 
M
K
 
K
V
 
I
S
 
G
V
 
I
I
 
V
G
 
G
T
 
L
G
 
G
N
x
R
V
|
V
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
T
A
 
A
F
 
F
V
 
A
L
 
L
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
G
I
 
F
I
 
A
D
 
R
E
 
E
L
 
M
V
 
V
L
 
L
V
 
I
G
x
D
R
 
V
S
 
D
K
 
K
Q
 
K
S
 
R
V
 
A
L
 
E
G
 
G
D
 
D
V
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
I
H
 
H
G
 
G
Q
 
T
L
 
P
F
 
F
V
 
T
N
 
R
T
 
R
P
 
-
A
 
A
Q
 
N
V
 
I
T
 
Y
A
 
A
G
 
G
T
 
D
I
 
Y
S
 
A
D
 
D
T
 
L
A
 
K
G
 
G
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
I
V
 
V
C
 
A
A
 
A
S
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
Q
P
 
-
K
 
K
N
 
P
M
 
G
S
 
E
S
 
T
R
 
R
L
 
L
E
 
Q
L
 
L
A
 
L
Q
 
G
G
 
R
N
 
N
V
 
A
Q
 
R
L
 
V
M
 
M
K
 
K
E
 
E
L
 
I
M
 
A
P
 
R
E
 
N
L
 
V
A
 
S
R
 
K
M
 
Y
S
 
A
P
 
P
D
 
D
C
 
S
K
 
I
I
 
V
V
 
I
M
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
F
A
 
F
L
 
L
E
 
K
F
 
E
G
 
S
G
 
G
F
 
M
R
 
D
P
 
P
N
 
R
Q
 
K
V
 
V
I
 
F
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
V
V
 
L
D
 
D
S
 
T
S
 
A
R
 
R
F
 
L
R
 
R
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
E
 
H
L
 
C
R
 
G
I
 
F
H
 
S
S
 
P
E
 
R
D
 
S
I
 
V
R
x
H
A
 
V
Y
 
Y
I
 
V
L
 
I
G
 
G
E
 
E
H
 
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
E
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
A
D
 
M
V
 
I
G
 
G
G
 
G
E
 
I
T
 
P
L
 
L
D
 
Q
A
 
N
-
 
M
-
 
C
-
 
Q
-
 
I
-
 
C
-
 
Q
-
 
K
-
 
C
-
 
D
T
 
S
P
 
K
G
 
I
R
 
L
Y
 
E
A
 
N
L
 
F
F
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
T
S
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
I
L
 
I
K
 
E
H
 
R
K
 
K
G
 
G
C
 
A
T
 
T
N
 
H
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
I
I
 
V
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
F
N
 
F
D
 
D
S
 
E
K
 
K
H
 
R
T
 
V
L
 
L
P
 
T
V
 
L
S
 
S
L
 
V
R
 
Y
V
 
L
D
 
E
G
 
D
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
K
D
 
D
V
 
L
C
 
C
L
 
I
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
R
 
K
N
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
I
L
 
L
H
 
E
P
 
L
R
 
N
L
 
L
D
 
N
E
 
E
K
 
E
E
 
E
Q
 
L
A
 
E
A
 
A
F
 
F
L
 
R
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
S
V
 
I
V
 
L
R
 
K
E
 
N
V
 
A
I
 
I
A
 
N
S
 
E
S
 
I
A
 
T
P
 
A
E
 
E
K
 
E
E
 
N
D
 
K
H
 
H

1a5zA Lactate dehydrogenase from thermotoga maritima (tmldh) (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:304/307 of query aligns to 1:311/312 of 1a5zA

query
sites
1a5zA
M
 
M
K
 
K
V
 
I
S
 
G
V
 
I
I
 
V
G
|
G
T
 
L
G
|
G
N
x
R
V
|
V
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
T
A
 
A
F
 
F
V
 
A
L
 
L
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
G
I
 
F
I
 
A
D
 
R
E
 
E
L
 
M
V
 
V
L
 
L
V
 
I
G
x
D
R
x
V
S
 
D
K
 
K
Q
 
K
S
 
R
V
 
A
L
x
E
G
 
G
D
 
D
V
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
I
H
 
H
G
 
G
Q
 
T
L
 
P
F
 
F
V
 
T
N
 
R
T
 
R
P
 
-
A
 
A
Q
 
N
V
 
I
T
x
Y
A
 
A
G
 
G
T
x
D
I
 
Y
S
 
A
D
|
D
T
 
L
A
 
K
G
 
G
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
I
V
 
V
C
 
A
A
|
A
S
x
G
V
 
V
P
 
P
T
 
Q
P
 
-
K
 
K
N
 
P
M
 
G
S
 
E
S
 
T
R
|
R
L
 
L
E
 
Q
L
 
L
A
 
L
Q
 
G
G
 
R
N
 
N
V
 
A
Q
 
R
L
 
V
M
 
M
K
 
K
E
 
E
L
 
I
M
 
A
P
 
R
E
 
N
L
 
V
A
 
S
R
 
K
M
 
Y
S
 
A
P
 
P
D
 
D
C
 
S
K
 
I
I
 
V
V
 
I
M
 
V
V
 
V
S
x
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
F
A
 
F
L
 
L
E
 
K
F
 
E
G
 
S
G
 
G
F
 
M
R
 
D
P
 
P
N
 
R
Q
 
K
V
 
V
I
 
F
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
V
V
 
L
D
|
D
S
 
T
S
 
A
R
|
R
F
 
L
R
|
R
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
E
 
H
L
 
C
R
 
G
I
 
F
H
 
S
S
 
P
E
 
R
D
x
S
I
 
V
R
x
H
A
 
V
Y
 
Y
I
 
V
L
 
I
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
E
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
A
D
 
M
V
 
I
G
|
G
G
 
G
E
 
I
T
 
P
L
 
L
D
 
Q
A
 
N
-
 
M
-
 
C
-
 
Q
-
 
V
-
 
C
-
 
Q
-
 
K
-
 
C
-
 
D
T
 
S
P
 
K
G
 
I
R
 
L
Y
 
E
A
 
N
L
 
F
F
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
T
S
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
I
L
 
I
K
 
E
H
 
R
K
 
K
G
 
G
C
x
A
T
|
T
N
 
H
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
I
I
 
V
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
F
N
 
F
D
 
D
S
 
E
K
 
K
H
 
R
T
 
V
L
 
L
P
 
T
V
 
L
S
 
S
L
 
V
R
 
Y
V
 
L
D
 
E
G
 
D
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
K
D
 
D
V
 
L
C
 
C
L
 
I
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
R
 
K
N
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
I
L
 
L
H
 
E
P
 
L
R
 
N
L
 
L
D
 
N
E
 
E
K
 
E
E
 
E
Q
 
L
A
 
E
A
 
A
F
 
F
L
 
R
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
S
V
 
I
V
 
L
R
 
K
E
 
N
V
 
A
I
 
I
A
 
N
S
 
E
S
 
I
A
 
T
P
 
A
E
 
E
K
 
E

P13714 L-lactate dehydrogenase; L-LDH; EC 1.1.1.27 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:305/307 of query aligns to 7:318/320 of P13714

query
sites
P13714
K
 
K
V
 
V
S
 
A
V
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
N
x
F
V
|
V
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
Y
A
 
A
F
 
F
V
 
A
L
 
L
T
 
I
L
 
N
K
 
Q
N
 
G
I
 
I
I
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
I
G
x
D
R
 
V
S
 
N
K
 
K
Q
 
E
S
 
K
V
 
A
L
 
M
G
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
N
H
 
H
G
 
G
Q
 
K
L
 
A
F
 
F
V
 
A
N
 
P
T
 
Q
P
 
P
A
 
V
Q
 
K
V
 
T
T
 
S
A
 
Y
G
 
G
T
 
T
I
 
Y
S
 
E
D
 
D
T
 
C
A
 
K
G
 
D
S
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
V
A
 
C
V
 
I
C
 
C
A
 
A
S
x
G
V
x
A
P
 
-
T
 
N
P
 
Q
K
 
K
N
 
P
M
 
G
S
 
E
S
 
T
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
G
 
K
N
 
N
V
 
L
Q
 
K
L
 
I
M
 
F
K
 
K
E
 
G
L
 
I
M
 
V
P
 
S
E
 
E
L
 
V
A
 
M
R
 
A
M
 
S
S
 
G
P
 
F
D
 
D
C
 
G
K
 
I
I
 
F
V
 
L
M
 
V
V
 
A
S
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
A
A
 
T
L
 
W
E
 
K
F
 
F
G
 
S
G
 
G
F
 
L
R
 
P
P
 
K
N
 
E
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
T
V
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
A
R
 
R
F
 
F
R
|
R
Q
 
F
L
 
M
L
 
L
A
 
S
E
 
E
E
 
Y
L
 
F
R
 
G
I
 
A
H
 
A
S
 
P
E
x
Q
D
x
N
I
x
V
R
x
H
A
|
A
Y
 
H
I
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
E
H
 
H
G
 
G
D
 
D
S
 
T
Q
 
E
F
 
L
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
H
A
 
A
D
 
N
V
 
V
G
 
G
G
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
V
E
 
E
T
 
K
L
 
N
D
 
D
A
 
A
T
 
Y
P
 
K
G
 
Q
R
 
E
Y
 
E
-
 
L
-
 
D
A
 
Q
L
 
I
F
 
V
E
 
D
R
 
D
A
 
V
S
 
K
R
 
N
A
 
A
G
 
A
F
x
Y
E
 
H
V
 
I
L
 
I
K
 
E
H
 
K
K
 
K
G
 
G
C
 
A
T
 
T
N
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
S
A
 
L
A
 
A
E
 
R
I
 
I
I
 
T
E
 
K
C
 
A
I
 
I
A
 
L
N
 
H
D
 
N
S
 
E
K
 
N
H
 
S
T
 
I
L
 
L
P
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
T
R
 
Y
V
 
L
D
 
D
G
 
G
F
 
Q
L
 
Y
G
 
G
V
 
A
D
 
D
D
 
D
V
 
V
C
 
Y
L
 
I
S
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
N
R
 
R
N
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
R
 
G
V
 
I
L
 
T
H
 
E
P
 
L
R
 
N
L
 
L
D
 
N
E
 
E
K
 
K
E
 
E
Q
 
K
A
 
E
A
 
Q
F
 
F
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
A
N
 
G
V
 
V
V
 
L
R
 
K
E
 
N
V
 
I
I
 
L
A
 
K
S
 
P
S
 
H
A
 
F
P
 
A
E
 
E
K
 
Q
E
 
K

3pqdB Crystal structure of l-lactate dehydrogenase from bacillus subtilis complexed with fbp and NAD+
37% identity, 96% coverage: 2:297/307 of query aligns to 4:307/312 of 3pqdB

query
sites
3pqdB
K
 
K
V
 
V
S
 
A
V
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
N
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
Y
A
 
A
F
 
F
V
 
A
L
 
L
T
 
I
L
 
N
K
 
Q
N
 
G
I
 
I
I
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
D
R
 
V
S
 
N
K
 
K
Q
 
E
S
 
K
V
 
A
L
 
M
G
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
N
H
 
H
G
 
G
Q
 
K
L
 
A
F
 
F
V
 
A
N
 
P
T
 
Q
P
 
P
A
 
V
Q
 
K
V
 
T
T
 
S
A
 
Y
G
 
G
T
 
T
I
 
Y
S
 
E
D
 
D
T
 
C
A
 
K
G
 
D
S
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
V
A
 
C
V
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
G
V
 
A
P
 
-
T
 
N
P
 
Q
K
 
K
N
 
P
M
 
G
S
 
E
S
 
T
R
 
R
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
G
 
K
N
 
N
V
 
L
Q
 
K
L
 
I
M
 
F
K
 
K
E
 
G
L
 
I
M
 
V
P
 
S
E
 
E
L
 
V
A
 
M
R
 
A
M
 
S
S
 
G
P
 
F
D
 
D
C
 
G
K
 
I
I
 
F
V
 
L
M
 
V
V
 
A
S
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
A
A
 
T
L
 
W
E
 
K
F
 
F
G
 
S
G
 
G
F
 
L
R
 
P
P
 
K
N
 
E
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
T
V
 
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
|
R
Q
 
F
L
 
M
L
 
L
A
 
S
E
 
E
E
 
Y
L
 
F
R
 
G
I
 
A
H
 
A
S
 
P
E
x
Q
D
x
N
I
 
V
R
x
H
A
 
A
Y
 
H
I
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
T
Q
 
E
F
 
L
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
H
A
 
A
D
 
N
V
 
V
G
 
G
G
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
V
E
 
E
T
 
K
L
 
N
D
 
D
A
 
A
T
 
Y
P
 
K
G
 
Q
R
 
E
Y
 
E
-
 
L
-
 
D
A
 
Q
L
 
I
F
 
V
E
 
D
R
 
D
A
 
V
S
 
K
R
 
N
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
E
 
H
V
 
I
L
 
I
K
 
E
H
 
K
K
 
K
G
 
G
C
 
A
T
 
T
N
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
S
A
 
L
A
 
A
E
 
R
I
 
I
I
 
T
E
 
K
C
 
A
I
 
I
A
 
L
N
 
H
D
 
N
S
 
E
K
 
N
H
 
S
T
 
I
L
 
L
P
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
T
R
 
Y
V
 
L
D
 
D
G
 
G
F
 
Q
L
 
Y
G
 
G
V
 
A
D
 
D
D
 
D
V
 
V
C
 
Y
L
 
I
S
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
N
R
 
R
N
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
R
 
G
V
 
I
L
 
T
H
 
E
P
 
L
R
 
N
L
 
L
D
 
N
E
 
E
K
 
K
E
 
E
Q
 
K
A
 
E
A
 
Q
F
 
F
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
A
N
 
G
V
 
V
V
 
L
R
 
K
E
 
N
V
 
I
I
 
L

8ab3A Crystal structure of the lactate dehydrogenase of cyanobacterium aponinum in complex with oxamate, nadh and fbp. (see paper)
35% identity, 95% coverage: 5:296/307 of query aligns to 25:325/330 of 8ab3A

query
sites
8ab3A
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
L
G
|
G
N
x
Q
V
|
V
G
 
G
S
 
L
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
Y
V
 
S
L
 
M
T
 
L
L
 
I
K
 
Q
N
 
D
I
 
C
I
 
F
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
Q
G
x
D
R
x
I
S
 
A
K
 
S
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
E
G
 
G
D
 
E
V
 
V
L
 
M
D
 
D
L
 
F
R
 
S
H
 
H
G
 
G
Q
 
M
L
 
P
F
 
F
V
 
I
N
 
-
T
 
P
P
 
P
A
 
T
Q
 
D
V
 
I
T
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
I
S
 
A
D
 
N
T
 
E
A
 
G
-
 
R
G
 
N
S
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
x
T
A
|
A
S
x
G
V
|
V
P
 
-
T
x
A
P
 
Q
K
 
K
N
 
E
M
 
G
S
 
E
S
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
L
Q
 
E
G
 
R
N
 
N
V
 
I
Q
 
A
L
 
I
M
 
Y
K
 
K
E
 
K
L
 
I
M
 
L
P
 
A
E
 
D
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
C
P
 
P
D
 
E
C
 
A
K
 
I
I
 
I
V
 
L
M
 
V
V
|
V
S
 
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
M
V
 
T
H
 
Y
Y
 
A
A
 
T
L
 
L
E
 
K
F
 
I
G
 
T
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
S
N
 
S
Q
 
R
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
V
V
 
L
D
 
D
S
 
T
S
 
A
R
 
R
F
 
F
R
|
R
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
E
L
 
M
R
 
D
I
 
I
H
 
D
S
 
P
E
x
R
D
 
S
I
 
V
R
x
H
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
E
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
T
A
 
A
D
 
N
V
 
V
G
 
G
G
 
G
E
 
M
T
 
K
L
 
L
D
 
-
A
 
-
T
 
V
P
 
P
G
 
N
R
 
T
Y
 
W
A
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
S
-
 
G
L
 
I
F
 
F
E
 
Q
R
 
K
A
 
V
S
 
Q
R
 
N
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
E
 
D
V
 
I
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
 
T
N
 
S
Y
 
Y
A
 
A
V
x
I
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
T
E
 
D
I
 
I
I
 
V
E
 
K
C
 
A
I
 
I
A
 
L
N
 
N
D
 
S
S
 
Q
K
 
E
H
 
R
T
 
I
L
 
L
P
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
G
R
 
L
V
 
M
D
 
T
G
 
G
F
 
M
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
C
L
 
L
S
 
S
L
 
I
P
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
V
G
 
S
R
 
E
N
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
I
R
 
K
V
 
T
L
 
V
H
 
N
P
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
S
E
 
E
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
K
A
 
L
F
 
L
L
 
Q
H
 
Q
S
 
S
A
 
A
N
 
K
V
 
M
V
 
L
R
 
K
E
 
E
V
 
V

3pqdD Crystal structure of l-lactate dehydrogenase from bacillus subtilis complexed with fbp and NAD+
36% identity, 96% coverage: 2:297/307 of query aligns to 4:297/301 of 3pqdD

query
sites
3pqdD
K
 
K
V
 
V
S
 
A
V
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
|
G
N
x
F
V
|
V
G
 
G
S
 
S
T
 
S
L
 
Y
A
 
A
F
 
F
V
 
A
L
 
L
T
 
I
L
 
N
K
 
Q
N
 
G
I
 
I
I
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
I
G
x
D
R
x
V
S
 
N
K
 
K
Q
 
E
S
 
K
V
 
A
L
 
M
G
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
N
H
 
H
G
 
G
Q
 
K
L
 
A
F
 
F
V
 
A
N
 
P
T
 
Q
P
 
P
A
 
V
Q
 
K
V
 
T
T
 
S
A
 
Y
G
 
G
T
 
T
I
 
Y
S
 
E
D
 
D
T
 
C
A
 
K
G
 
D
S
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
V
A
 
C
V
 
I
C
|
C
A
|
A
S
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
-
P
 
-
K
 
-
N
 
-
M
 
-
S
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
G
 
K
N
 
N
V
 
L
Q
 
K
L
 
I
M
 
F
K
 
K
E
 
G
L
x
I
M
 
V
P
 
S
E
 
E
L
 
V
A
 
M
R
 
A
M
 
S
S
 
G
P
 
F
D
 
D
C
 
G
K
 
I
I
 
F
V
 
L
M
 
V
V
 
A
S
x
T
N
|
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
A
A
 
T
L
 
W
E
 
K
F
 
F
G
 
S
G
 
G
F
 
L
R
 
P
P
 
K
N
 
E
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
T
V
 
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
|
R
Q
 
F
L
 
M
L
 
L
A
 
S
E
 
E
E
 
Y
L
 
F
R
 
G
I
 
A
H
 
A
S
 
P
E
x
Q
D
x
N
I
 
V
R
x
H
A
 
A
Y
 
H
I
 
I
L
 
I
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
T
Q
 
E
F
 
L
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
H
A
 
A
D
 
N
V
 
V
G
 
G
G
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
V
E
 
E
T
 
K
L
 
N
D
 
D
A
 
A
T
 
Y
P
 
K
G
 
Q
R
 
E
Y
 
E
-
 
L
-
 
D
A
 
Q
L
 
I
F
 
V
E
 
D
R
 
D
A
 
V
S
 
K
R
 
N
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
E
 
H
V
 
I
L
 
I
K
 
E
H
 
K
K
 
K
G
 
G
C
 
A
T
|
T
N
 
Y
Y
 
Y
A
 
G
V
|
V
A
 
A
L
 
M
A
 
S
A
 
L
A
 
A
E
 
R
I
 
I
I
 
T
E
 
K
C
 
A
I
 
I
A
 
L
N
 
H
D
 
N
S
 
E
K
 
N
H
 
S
T
 
I
L
 
L
P
 
T
V
 
V
S
 
S
L
 
T
R
 
Y
V
 
L
D
 
D
G
 
G
F
 
Q
L
 
Y
G
 
G
V
 
A
D
 
D
D
 
D
V
 
V
C
 
Y
L
 
I
S
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
N
R
 
R
N
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
A
R
 
G
V
 
I
L
 
T
H
 
E
P
 
L
R
 
N
L
 
L
D
 
N
E
 
E
K
 
K
E
 
E
Q
 
K
A
 
E
A
 
Q
F
 
F
L
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
A
N
 
G
V
 
V
V
 
L
R
 
K
E
 
N
V
 
I
I
 
L

5kkcA L-lactate dehydrogenase from rabbit muscle with the inhibitor 6dhnad (see paper)
37% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 18:319/328 of 5kkcA

query
sites
5kkcA
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
|
G
N
x
A
V
|
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
x
D
R
x
V
S
x
M
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
G
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
x
T
A
|
A
S
 
G
V
x
A
P
x
R
T
x
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
x
I
M
 
F
K
 
K
E
 
F
L
x
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
H
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
V
V
|
V
S
|
S
N
|
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
 
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
A
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
M
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
Q
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
|
T
N
 
S
Y
 
W
A
 
A
V
x
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
I
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
V
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
S
K
 
E
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
H
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

5nqqC Rabbit muscle l-lactate dehydrogenase in complex with nadh and oxaloacetate (see paper)
37% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 21:322/331 of 5nqqC

query
sites
5nqqC
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
|
G
N
x
A
V
|
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
x
D
R
x
V
S
x
M
K
 
E
Q
 
D
S
x
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
G
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
x
T
A
|
A
S
x
G
V
x
A
P
x
R
T
x
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
 
I
M
 
F
K
 
K
E
 
F
L
 
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
H
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
V
V
|
V
S
 
S
N
|
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
 
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
A
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
M
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
Q
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
x
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
|
T
N
 
S
Y
 
W
A
 
A
V
x
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
L
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
V
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
S
K
 
E
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
H
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

P13491 L-lactate dehydrogenase A chain; LDH-A; LDH muscle subunit; LDH-M; EC 1.1.1.27 from Oryctolagus cuniculus (Rabbit) (see paper)
37% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 22:323/332 of P13491

query
sites
P13491
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
 
G
N
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
D
R
 
V
S
 
M
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
G
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
 
T
A
 
A
S
 
G
V
 
A
P
 
R
T
 
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
 
I
M
 
F
K
 
K
E
 
F
L
 
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
H
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
A
R
 
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
A
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
M
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
Q
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
 
T
N
 
T
Y
 
W
A
 
A
V
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
L
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
V
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
S
K
 
E
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
H
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

6p6uC Crystal structure of monoclinic rabbit muscle lactate dehydrogenase with four tetramers as the asymmetric unit
37% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 21:322/331 of 6p6uC

query
sites
6p6uC
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
 
G
N
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
D
R
 
V
S
 
M
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
G
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
 
T
A
 
A
S
 
G
V
 
A
P
 
R
T
 
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
 
I
M
 
F
K
 
K
E
 
F
L
 
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
H
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
A
R
 
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
A
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
 
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
M
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
H
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
Q
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
x
V
R
x
D
A
 
S
G
 
A
F
x
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
|
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
 
T
N
 
T
Y
 
W
A
 
A
V
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
L
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
V
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
S
K
 
E
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
H
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

P04642 L-lactate dehydrogenase A chain; LDH-A; LDH muscle subunit; LDH-M; EC 1.1.1.27 from Rattus norvegicus (Rat)
36% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 22:323/332 of P04642

query
sites
P04642
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
 
G
N
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
D
R
 
V
S
 
I
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
S
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
 
T
A
 
A
S
 
G
V
 
A
P
 
R
T
 
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
 
I
M
 
F
K
 
K
E
 
F
L
 
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
Q
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
I
V
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
A
R
 
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
P
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
 
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
V
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
D
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
 
T
N
 
S
Y
 
W
A
 
A
V
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
I
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
I
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
P
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
R
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

Sites not aligning to the query:

4al4A Rat ldha in complex with 2-((4-(2-((3-((2-methyl-1,3-benzothiazol-6- yl)amino)3-oxo-propyl)carbamoylamino)ethoxy) phenyl) methylpropanedioic acid (see paper)
36% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 20:321/330 of 4al4A

query
sites
4al4A
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
|
G
N
x
A
V
|
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
x
D
R
x
V
S
 
I
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
S
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
x
T
A
|
A
S
x
G
V
x
A
P
x
R
T
 
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
x
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
x
I
M
 
F
K
 
K
E
 
F
L
x
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
Q
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
I
V
|
V
S
 
S
N
|
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
 
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
P
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
V
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
D
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
x
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
|
T
N
 
S
Y
 
W
A
 
A
V
x
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
I
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
I
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
P
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
R
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

4ajoA Rat ldha in complex with 2-((4-(4-((3-((2-methyl-1,3-benzothiazol-6yl) amino)-3-oxo-propyl)amino)-4-oxo-butyl)phenyl)methyl)propanedioic acid (see paper)
36% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 20:321/330 of 4ajoA

query
sites
4ajoA
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
 
G
N
 
A
V
|
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
x
D
R
x
V
S
 
I
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
S
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
x
T
A
|
A
S
x
G
V
 
A
P
 
R
T
 
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
x
I
M
 
F
K
 
K
E
 
F
L
 
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
Q
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
I
V
 
V
S
 
S
N
|
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
x
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
P
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
V
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
D
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
x
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
|
T
N
 
S
Y
 
W
A
 
A
V
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
I
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
I
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
P
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
R
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

4aj4A Rat ldha in complex with 4-((2-allylsulfanyl-1,3-benzothizol-6-yl) amino)-4-oxo-butanoic acid (see paper)
36% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 20:321/330 of 4aj4A

query
sites
4aj4A
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
|
G
N
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
x
D
R
x
V
S
 
I
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
S
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
 
T
A
|
A
S
x
G
V
 
A
P
 
R
T
 
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
x
I
M
 
F
K
 
K
E
x
F
L
 
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
Q
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
I
V
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
 
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
P
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
V
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
D
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
 
T
N
 
S
Y
 
W
A
 
A
V
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
I
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
I
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
P
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
R
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

4ajlA Rat ldha in complex with 3-(ethylcarbamoylamino)-n-(2-methyl-1,3- benzothiazol-6-yl)propanamide (see paper)
36% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 18:319/328 of 4ajlA

query
sites
4ajlA
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
|
G
T
 
V
G
|
G
N
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
x
D
R
x
V
S
 
I
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
S
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
x
T
A
|
A
S
x
G
V
 
A
P
 
R
T
 
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
x
I
M
 
F
K
 
K
E
 
F
L
 
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
Q
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
I
V
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
 
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
P
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
V
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
D
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
 
T
N
 
S
Y
 
W
A
 
A
V
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
I
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
I
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
P
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
R
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

4ajnA Rat ldha in complex with 2-((4-(2-((3-((2-methyl-1,3-benzothiazol-6- yl)amino)-3-oxo-propyl)carbamoylamino)ethyl)phenyl)methyl) propanedioic acid (see paper)
36% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 19:320/329 of 4ajnA

query
sites
4ajnA
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
 
G
N
 
A
V
|
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
x
D
R
x
V
S
 
I
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
S
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
x
T
A
|
A
S
x
G
V
 
A
P
 
R
T
 
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
x
I
M
 
F
K
 
K
E
 
F
L
 
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
Q
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
I
V
 
V
S
 
S
N
|
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
x
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
P
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
V
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
D
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
|
T
N
 
S
Y
 
W
A
 
A
V
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
I
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
I
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
P
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
R
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

4ajiA Rat ldha in complex with 2-((3,4-dimethoxyphenyl)methyl))propanedioic acid (see paper)
36% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 17:318/327 of 4ajiA

query
sites
4ajiA
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
 
G
N
 
A
V
|
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
D
R
 
V
S
 
I
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
S
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
x
T
A
 
A
S
 
G
V
 
A
P
x
R
T
 
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
 
I
M
 
F
K
 
K
E
 
F
L
 
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
Q
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
I
V
|
V
S
 
S
N
|
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
 
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
P
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
V
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
D
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
|
T
N
 
S
Y
 
W
A
 
A
V
x
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
I
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
I
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
P
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
R
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

4ajhA Rat ldha in complex with n-(2-methyl-1,3-benzothiazol-6-yl)-3-ureido- propanamide and 2-(4-bromophenoxy)propanedioic acid (see paper)
36% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 17:318/327 of 4ajhA

query
sites
4ajhA
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
|
G
N
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
x
D
R
x
V
S
 
I
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
S
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
 
T
A
|
A
S
x
G
V
 
A
P
 
R
T
 
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
x
I
M
 
F
K
 
K
E
 
F
L
 
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
Q
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
I
V
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
 
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
P
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
V
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
D
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
 
T
N
 
S
Y
 
W
A
 
A
V
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
I
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
I
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
P
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
R
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

4ajeA Rat ldha in complex with 2-(4-bromophenoxy)propanedioic acid (see paper)
36% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 17:318/327 of 4ajeA

query
sites
4ajeA
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
 
G
N
 
A
V
|
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
D
R
 
V
S
 
I
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
S
G
 
K
T
 
D
I
 
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
 
T
A
 
A
S
 
G
V
 
A
P
 
R
T
x
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
 
I
M
 
F
K
 
K
E
 
F
L
 
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
Q
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
I
V
|
V
S
 
S
N
|
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
x
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
P
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
V
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
D
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
|
T
N
 
S
Y
 
W
A
 
A
V
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
I
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
I
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
P
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
R
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

4aj2A Rat ldha in complex with 5-(2-chlorophenyl)-1h-tetrazole (see paper)
36% identity, 95% coverage: 2:293/307 of query aligns to 17:318/327 of 4aj2A

query
sites
4aj2A
K
 
K
V
 
I
S
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
V
G
 
G
N
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
M
T
 
A
L
 
C
A
 
A
F
 
I
V
 
S
L
 
I
T
 
L
L
 
M
K
 
K
N
 
D
I
 
L
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
x
D
R
x
V
S
 
I
K
 
E
Q
 
D
S
 
K
V
 
L
L
 
K
G
 
G
D
 
E
V
 
M
L
 
M
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
F
 
F
V
 
L
N
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
K
Q
 
I
V
 
V
T
 
S
A
 
S
G
 
K
T
 
D
I
x
Y
S
 
S
D
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
N
S
 
S
D
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
I
V
 
I
C
 
T
A
 
A
S
 
G
V
 
A
P
 
R
T
 
Q
P
 
Q
K
 
E
N
 
G
M
 
-
S
 
E
S
 
S
R
|
R
L
 
L
E
 
N
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
G
 
R
N
 
N
V
 
V
Q
 
N
L
x
I
M
 
F
K
 
K
E
x
F
L
x
I
M
 
I
P
 
P
E
 
N
L
 
V
A
 
V
R
 
K
M
 
Y
S
 
S
P
 
P
D
 
Q
C
 
C
K
 
K
I
 
L
V
 
L
M
 
I
V
 
V
S
 
S
N
 
N
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
T
H
 
Y
Y
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
K
F
 
I
G
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
P
P
 
K
N
 
N
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
C
L
 
N
V
 
L
D
|
D
S
 
S
S
 
A
R
|
R
F
 
F
R
 
R
Q
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
L
R
 
G
I
 
V
H
 
H
S
 
P
E
 
L
D
 
S
I
 
C
R
 
H
A
 
G
Y
 
W
I
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
|
H
G
 
G
D
 
D
S
 
S
Q
 
S
F
 
V
P
 
P
A
 
V
M
 
W
S
 
S
C
 
G
A
 
V
D
 
N
V
 
V
G
 
A
G
 
G
E
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
T
D
 
D
A
 
A
T
 
D
P
 
K
G
 
E
R
 
Q
Y
 
W
A
 
K
-
 
D
L
 
V
F
 
H
E
 
K
R
 
Q
A
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
K
H
 
L
K
 
K
G
 
G
C
 
Y
T
 
T
N
 
S
Y
 
W
A
 
A
V
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
I
 
L
I
 
A
E
 
E
C
 
S
I
 
I
A
 
M
N
 
K
D
 
N
S
 
L
K
 
R
H
 
R
T
 
V
L
 
H
P
 
P
V
 
I
S
 
S
L
 
T
R
 
M
V
 
I
D
 
K
G
 
G
F
 
L
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
-
 
K
D
 
E
D
 
D
V
 
V
C
 
F
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
A
 
C
V
 
I
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
S
R
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
K
P
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
T
E
 
P
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
R
F
 
L
L
 
K
H
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
D
V
 
T
V
 
L

Query Sequence

>GFF2766 HP15_2710 L-lactate/malate dehydrogenase
MKVSVIGTGNVGSTLAFVLTLKNIIDELVLVGRSKQSVLGDVLDLRHGQLFVNTPAQVTA
GTISDTAGSDVIAVCASVPTPKNMSSRLELAQGNVQLMKELMPELARMSPDCKIVMVSNP
VDVLVHYALEFGGFRPNQVIGTGTLVDSSRFRQLLAEELRIHSEDIRAYILGEHGDSQFP
AMSCADVGGETLDATPGRYALFERASRAGFEVLKHKGCTNYAVALAAAEIIECIANDSKH
TLPVSLRVDGFLGVDDVCLSLPAVVGRNGIERVLHPRLDEKEQAAFLHSANVVREVIASS
APEKEDH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory