SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2781 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2781 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8jdtA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketobutanoic acid (see paper)
50% identity, 96% coverage: 18:465/467 of query aligns to 6:455/455 of 8jdtA

query
sites
8jdtA
I
 
V
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
G
E
 
S
-
 
P
Q
 
H
L
 
V
Q
 
S
T
 
T
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
D
T
 
E
T
 
S
W
 
M
I
 
H
T
 
R
N
 
C
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
W
P
 
P
T
 
Q
S
 
N
T
 
V
D
 
D
E
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
R
I
 
V
V
 
A
R
 
S
T
 
L
C
 
C
A
 
Y
D
 
N
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
P
|
P
Y
 
F
G
|
G
T
|
T
G
|
G
T
|
T
S
x
G
L
 
V
E
 
E
G
 
G
H
x
G
V
|
V
N
 
C
A
 
A
P
 
V
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
C
 
C
V
 
I
D
 
N
M
x
L
M
 
T
R
 
H
M
 
M
D
 
D
K
 
Q
I
 
I
L
 
T
A
 
E
V
 
L
H
 
N
A
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
K
Q
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
T
Y
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
F
 
F
P
 
P
I
 
V
D
 
D
P
|
P
G
|
G
A
|
A
N
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
|
A
T
|
T
R
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
M
 
M
K
 
R
D
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
V
V
 
V
M
 
L
A
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
R
V
 
L
I
 
L
R
 
H
T
 
T
A
 
A
Q
 
G
R
 
R
A
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
K
 
R
K
 
K
S
 
S
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
L
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
H
G
 
P
I
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
T
R
 
V
S
 
A
A
 
A
R
 
T
C
 
C
A
 
A
F
 
F
R
 
P
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
D
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
D
A
 
S
V
 
T
M
 
V
M
 
Q
T
 
I
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
E
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
M
 
V
S
 
M
V
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
C
N
 
N
A
 
R
Y
 
H
S
 
S
G
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
C
P
 
P
E
 
V
M
 
A
P
 
P
L
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
H
 
H
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
L
D
 
Q
T
 
R
F
 
T
A
 
E
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
Q
E
 
D
F
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
S
D
 
H
I
 
F
A
 
-
A
 
-
T
 
-
S
 
S
T
 
W
A
 
A
E
 
E
E
 
K
R
 
R
S
 
N
K
 
E
L
 
L
W
 
W
Q
 
A
A
 
A
R
|
R
H
 
H
D
 
N
M
 
A
Y
x
W
W
 
Y
A
 
A
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
R
 
S
P
 
P
G
 
G
A
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
Y
S
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
I
 
I
S
 
S
K
 
R
L
 
L
A
 
P
E
 
E
C
 
I
V
 
L
S
 
V
A
 
E
A
 
T
R
 
K
S
 
E
K
 
E
A
 
I
E
 
K
E
 
A
M
 
S
N
 
K
L
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
H
|
H
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
H
|
H
A
 
C
L
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
D
M
 
P
D
 
D
S
 
D
A
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
Q
E
 
R
A
 
R
A
 
V
D
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
A
G
 
E
W
 
N
L
 
L
N
 
G
E
 
R
L
 
R
A
 
A
I
 
L
S
 
A
I
 
L
E
 
G
G
 
G
T
 
T
C
 
C
T
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
L
G
 
G
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
E
 
P
T
 
V
-
 
G
T
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
A
 
R
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
L
 
L

8jdvA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketohexanoic acid (see paper)
50% identity, 96% coverage: 18:465/467 of query aligns to 6:454/454 of 8jdvA

query
sites
8jdvA
I
 
V
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
G
E
 
S
-
 
P
Q
 
H
L
 
V
Q
 
S
T
 
T
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
D
T
 
E
T
 
S
W
 
M
I
 
H
T
 
R
N
 
C
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
W
P
 
P
T
 
Q
S
 
N
T
 
V
D
 
D
E
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
R
I
 
V
V
 
A
R
 
S
T
 
L
C
 
C
A
 
Y
D
 
N
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
P
|
P
Y
 
F
G
|
G
T
|
T
G
|
G
T
|
T
S
x
G
L
x
V
E
 
E
G
 
G
H
x
G
V
|
V
N
 
C
A
 
A
P
 
V
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
C
 
C
V
 
I
D
 
N
M
x
L
M
 
T
R
 
H
M
 
M
D
 
D
K
 
Q
I
 
I
L
 
T
A
 
E
V
 
L
H
 
N
A
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
K
Q
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
T
Y
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
F
 
F
P
 
P
I
 
V
D
 
D
P
|
P
G
|
G
A
|
A
N
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
|
A
T
|
T
R
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
M
 
M
K
 
R
D
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
V
V
 
V
M
 
L
A
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
R
V
 
L
I
 
L
R
 
H
T
 
T
A
 
A
Q
 
G
R
 
R
A
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
K
 
R
K
 
K
S
 
S
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
L
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
H
G
 
P
I
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
T
R
 
V
S
 
A
A
 
A
R
 
T
C
 
C
A
 
A
F
 
F
R
 
P
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
D
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
D
A
 
S
V
 
T
M
 
V
M
 
Q
T
 
I
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
E
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
M
 
V
S
 
M
V
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
C
N
 
N
A
 
R
Y
 
H
S
 
S
G
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
C
P
 
P
E
 
V
M
 
A
P
 
P
L
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
H
 
H
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
L
D
 
Q
T
 
R
F
 
T
A
 
E
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
Q
E
 
D
F
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
S
D
 
H
I
 
F
A
 
-
A
 
-
T
 
-
S
 
-
T
 
S
A
 
A
E
 
E
E
 
K
R
 
R
S
 
N
K
 
E
L
 
L
W
 
W
Q
 
A
A
 
A
R
|
R
H
 
H
D
 
N
M
 
A
Y
x
W
W
x
Y
A
 
A
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
R
 
S
P
 
P
G
 
G
A
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
Y
S
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
I
 
I
S
 
S
K
 
R
L
 
L
A
 
P
E
 
E
C
 
I
V
 
L
S
 
V
A
 
E
A
 
T
R
 
K
S
 
E
K
 
E
A
 
I
E
 
K
E
 
A
M
 
S
N
 
K
L
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
H
|
H
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
H
|
H
A
 
C
L
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
D
M
 
P
D
 
D
S
 
D
A
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
Q
E
 
R
A
 
R
A
 
V
D
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
A
G
 
E
W
 
N
L
 
L
N
 
G
E
 
R
L
 
R
A
 
A
I
 
L
S
 
A
I
 
L
E
 
G
G
 
G
T
 
T
C
 
C
T
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
L
G
 
G
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
E
 
P
T
 
V
-
 
G
T
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
A
 
R
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
L
 
L

8jdsA Crystal structure of mldhd in complex with pyruvate (see paper)
50% identity, 96% coverage: 18:465/467 of query aligns to 6:456/456 of 8jdsA

query
sites
8jdsA
I
 
V
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
G
E
 
S
-
 
P
Q
 
H
L
 
V
Q
 
S
T
 
T
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
D
T
x
E
T
 
S
W
 
M
I
 
H
T
 
R
N
 
C
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
W
P
 
P
T
 
Q
S
 
N
T
 
V
D
 
D
E
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
R
I
 
V
V
 
A
R
 
S
T
 
L
C
 
C
A
 
Y
D
 
N
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
P
|
P
Y
 
F
G
|
G
T
|
T
G
|
G
T
|
T
S
x
G
L
 
V
E
 
E
G
 
G
H
x
G
V
|
V
N
 
C
A
 
A
P
 
V
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
C
 
C
V
 
I
D
 
N
M
x
L
M
 
T
R
 
H
M
 
M
D
 
D
K
 
Q
I
 
I
L
 
T
A
 
E
V
 
L
H
 
N
A
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
K
Q
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
T
Y
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
F
 
F
P
 
P
I
 
V
D
 
D
P
|
P
G
|
G
A
|
A
N
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
|
A
T
|
T
R
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
M
 
M
K
 
R
D
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
V
V
 
V
M
 
L
A
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
R
V
 
L
I
 
L
R
 
H
T
 
T
A
 
A
Q
 
G
R
 
R
A
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
K
 
R
K
 
K
S
 
S
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
L
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
H
G
 
P
I
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
T
R
 
V
S
 
A
A
 
A
R
 
T
C
 
C
A
 
A
F
 
F
R
 
P
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
D
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
D
A
 
S
V
 
T
M
 
V
M
 
Q
T
 
I
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
E
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
M
 
V
S
 
M
V
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
C
N
 
N
A
 
R
Y
 
H
S
 
S
G
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
C
P
 
P
E
 
V
M
 
A
P
 
P
L
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
H
 
H
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
L
D
 
Q
T
 
R
F
 
T
A
 
E
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
Q
E
 
D
F
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
S
D
 
H
I
 
F
A
 
-
A
 
-
T
 
S
S
 
W
T
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
K
R
 
R
S
 
N
K
 
E
L
 
L
W
 
W
Q
 
A
A
 
A
R
|
R
H
 
H
D
 
N
M
 
A
Y
x
W
W
 
Y
A
 
A
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
R
 
S
P
 
P
G
 
G
A
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
Y
S
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
I
 
I
S
 
S
K
 
R
L
 
L
A
 
P
E
 
E
C
 
I
V
 
L
S
 
V
A
 
E
A
 
T
R
 
K
S
 
E
K
 
E
A
 
I
E
 
K
E
 
A
M
 
S
N
 
K
L
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
H
|
H
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
H
|
H
A
 
C
L
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
D
M
 
P
D
 
D
S
 
D
A
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
Q
E
 
R
A
 
R
A
 
V
D
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
A
G
 
E
W
 
N
L
 
L
N
 
G
E
 
R
L
 
R
A
 
A
I
 
L
S
 
A
I
 
L
E
 
G
G
 
G
T
 
T
C
 
C
T
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
L
G
 
G
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
E
 
P
T
 
V
-
 
G
T
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
A
 
R
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
L
 
L

8jdeA Crystal structure of mldhd in complex with d-lactate (see paper)
50% identity, 96% coverage: 18:465/467 of query aligns to 6:455/455 of 8jdeA

query
sites
8jdeA
I
 
V
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
G
E
 
S
-
 
P
Q
 
H
L
 
V
Q
 
S
T
 
T
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
D
T
 
E
T
 
S
W
 
M
I
 
H
T
 
R
N
 
C
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
W
P
 
P
T
 
Q
S
 
N
T
 
V
D
 
D
E
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
R
I
 
V
V
 
A
R
 
S
T
 
L
C
 
C
A
 
Y
D
 
N
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
P
|
P
Y
 
F
G
|
G
T
|
T
G
|
G
T
|
T
S
x
G
L
 
V
E
 
E
G
 
G
H
x
G
V
|
V
N
 
C
A
 
A
P
 
V
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
C
 
C
V
 
I
D
 
N
M
x
L
M
 
T
R
 
H
M
 
M
D
 
D
K
 
Q
I
 
I
L
 
T
A
 
E
V
 
L
H
 
N
A
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
K
Q
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
T
Y
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
F
 
F
P
 
P
I
 
V
D
 
D
P
|
P
G
|
G
A
|
A
N
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
|
A
T
|
T
R
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
M
 
M
K
 
R
D
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
V
V
 
V
M
 
L
A
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
R
V
 
L
I
 
L
R
 
H
T
 
T
A
 
A
Q
 
G
R
 
R
A
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
K
 
R
K
 
K
S
 
S
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
L
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
H
G
 
P
I
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
T
R
 
V
S
 
A
A
 
A
R
 
T
C
 
C
A
 
A
F
 
F
R
 
P
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
D
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
D
A
 
S
V
 
T
M
 
V
M
 
Q
T
 
I
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
E
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
M
 
V
S
 
M
V
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
C
N
 
N
A
 
R
Y
 
H
S
 
S
G
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
C
P
 
P
E
 
V
M
 
A
P
 
P
L
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
H
 
H
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
L
D
 
Q
T
 
R
F
 
T
A
 
E
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
Q
E
 
D
F
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
S
D
 
H
I
 
F
A
 
-
A
 
-
T
 
-
S
 
S
T
 
W
A
 
A
E
 
A
E
 
E
R
 
K
S
 
N
K
 
E
L
 
L
W
 
W
Q
 
A
A
 
A
R
|
R
H
 
H
D
 
N
M
 
A
Y
x
W
W
 
Y
A
 
A
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
R
 
S
P
 
P
G
 
G
A
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
Y
S
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
I
 
I
S
 
S
K
 
R
L
 
L
A
 
P
E
 
E
C
 
I
V
 
L
S
 
V
A
 
E
A
 
T
R
 
K
S
 
E
K
 
E
A
 
I
E
 
K
E
 
A
M
 
S
N
 
K
L
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
H
|
H
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
H
|
H
A
 
C
L
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
D
M
 
P
D
 
D
S
 
D
A
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
Q
E
 
R
A
 
R
A
 
V
D
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
A
G
 
E
W
 
N
L
 
L
N
 
G
E
 
R
L
 
R
A
 
A
I
 
L
S
 
A
I
 
L
E
 
G
G
 
G
T
 
T
C
 
C
T
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
L
G
 
G
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
E
 
P
T
 
V
-
 
G
T
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
A
 
R
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
L
 
L

8jduA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketovaleric acid (see paper)
50% identity, 96% coverage: 18:465/467 of query aligns to 6:455/455 of 8jduA

query
sites
8jduA
I
 
V
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
G
E
 
S
-
 
P
Q
 
H
L
 
V
Q
 
S
T
 
T
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
D
T
 
E
T
 
S
W
 
M
I
 
H
T
 
R
N
 
C
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
W
P
 
P
T
 
Q
S
 
N
T
 
V
D
 
D
E
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
R
I
 
V
V
 
A
R
 
S
T
 
L
C
 
C
A
 
Y
D
 
N
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
P
|
P
Y
 
F
G
|
G
T
|
T
G
|
G
T
|
T
S
x
G
L
 
V
E
 
E
G
 
G
H
x
G
V
|
V
N
 
C
A
 
A
P
 
V
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
C
 
C
V
 
I
D
 
N
M
x
L
M
 
T
R
 
H
M
 
M
D
 
D
K
 
Q
I
 
I
L
 
T
A
 
E
V
 
L
H
 
N
A
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
K
Q
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
T
Y
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
F
 
F
P
 
P
I
 
V
D
 
D
P
|
P
G
|
G
A
|
A
N
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
|
A
T
|
T
R
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
M
 
M
K
 
R
D
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
V
V
 
V
M
 
L
A
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
R
V
 
L
I
 
L
R
 
H
T
 
T
A
 
A
Q
 
G
R
 
R
A
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
K
 
R
K
 
K
S
 
S
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
L
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
H
G
 
P
I
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
T
R
 
V
S
 
A
A
 
A
R
 
T
C
 
C
A
 
A
F
 
F
R
 
P
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
D
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
D
A
 
S
V
 
T
M
 
V
M
 
Q
T
 
I
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
E
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
M
 
V
S
 
M
V
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
C
N
 
N
A
 
R
Y
 
H
S
 
S
G
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
C
P
 
P
E
 
V
M
 
A
P
 
P
L
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
H
 
H
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
L
D
 
Q
T
 
R
F
 
T
A
 
E
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
Q
E
 
N
F
 
G
G
 
G
G
 
S
-
 
H
F
 
F
D
 
S
I
 
W
A
 
A
A
 
-
T
 
-
S
 
-
T
 
-
A
 
A
E
 
E
E
 
K
R
 
R
S
 
N
K
 
E
L
 
L
W
 
W
Q
 
A
A
 
A
R
|
R
H
 
H
D
 
N
M
 
A
Y
x
W
W
 
Y
A
 
A
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
R
 
S
P
 
P
G
 
G
A
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
Y
S
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
I
 
I
S
 
S
K
 
R
L
 
L
A
 
P
E
 
E
C
 
I
V
 
L
S
 
V
A
 
E
A
 
T
R
 
K
S
 
E
K
 
E
A
 
I
E
 
K
E
 
A
M
 
S
N
 
K
L
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
H
|
H
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
H
|
H
A
 
C
L
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
D
M
 
P
D
 
D
S
 
D
A
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
Q
E
 
R
A
 
R
A
 
V
D
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
A
G
 
E
W
 
N
L
 
L
N
 
G
E
 
R
L
 
R
A
 
A
I
 
L
S
 
A
I
 
L
E
 
G
G
 
G
T
 
T
C
 
C
T
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
L
G
 
G
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
E
 
P
T
 
V
-
 
G
T
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
A
 
R
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
L
 
L

8jdxA Crystal structure of mldhd in complex with 2-ketoisovaleric acid (see paper)
50% identity, 96% coverage: 18:465/467 of query aligns to 6:455/455 of 8jdxA

query
sites
8jdxA
I
 
V
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
G
E
 
S
-
 
P
Q
 
H
L
 
V
Q
 
S
T
 
T
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
D
T
x
E
T
 
S
W
 
M
I
 
H
T
 
R
N
 
C
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
W
P
 
P
T
 
Q
S
 
N
T
 
V
D
 
D
E
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
R
I
 
V
V
 
A
R
 
S
T
 
L
C
 
C
A
 
Y
D
 
N
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
P
|
P
Y
 
F
G
|
G
T
|
T
G
|
G
T
|
T
S
x
G
L
 
V
E
 
E
G
 
G
H
x
G
V
|
V
N
 
C
A
 
A
P
 
V
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
C
 
C
V
 
I
D
 
N
M
x
L
M
 
T
R
 
H
M
 
M
D
 
D
K
 
Q
I
 
I
L
 
T
A
 
E
V
 
L
H
 
N
A
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
K
Q
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
T
Y
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
F
 
F
P
 
P
I
 
V
D
 
D
P
|
P
G
|
G
A
|
A
N
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
|
A
T
|
T
R
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
M
 
M
K
 
R
D
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
V
V
 
V
M
 
L
A
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
R
V
 
L
I
 
L
R
 
H
T
 
T
A
 
A
Q
 
G
R
 
R
A
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
K
 
R
K
 
K
S
 
S
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
L
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
H
G
 
P
I
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
T
R
 
V
S
 
A
A
 
A
R
 
T
C
 
C
A
 
A
F
 
F
R
 
P
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
D
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
D
A
 
S
V
 
T
M
 
V
M
 
Q
T
 
I
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
E
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
M
 
V
S
 
M
V
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
C
N
 
N
A
 
R
Y
 
H
S
 
S
G
 
-
L
 
L
D
 
N
L
 
C
P
 
P
E
 
V
M
 
A
P
 
P
L
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
H
 
H
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
L
D
 
Q
T
 
R
F
 
T
A
 
E
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
Q
E
 
D
F
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
S
D
 
H
I
 
F
A
 
-
A
 
-
T
 
S
S
 
W
T
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
K
R
 
R
S
 
N
K
 
E
L
 
L
W
 
W
Q
 
A
A
 
A
R
|
R
H
 
H
D
 
N
M
 
A
Y
x
W
W
 
Y
A
 
A
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
R
 
S
P
 
P
G
 
G
A
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
Y
S
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
I
 
I
S
 
S
K
 
R
L
 
L
A
 
P
E
 
E
C
 
I
V
 
L
S
 
V
A
 
E
A
 
T
R
 
K
S
 
E
K
 
E
A
 
I
E
 
K
E
 
A
M
 
S
N
 
K
L
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
H
|
H
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
H
|
H
A
 
C
L
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
D
M
 
P
D
 
D
S
 
D
A
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
Q
E
 
R
A
 
R
A
 
V
D
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
A
G
 
E
W
 
N
L
 
L
N
 
G
E
 
R
L
 
R
A
 
A
I
 
L
S
 
A
I
 
L
E
 
G
G
 
G
T
 
T
C
 
C
T
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
L
G
 
G
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
E
 
P
T
 
V
-
 
G
T
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
A
 
R
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
L
 
L

8jdrA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxy-3-methyl- valeric acid (see paper)
49% identity, 96% coverage: 18:465/467 of query aligns to 6:456/456 of 8jdrA

query
sites
8jdrA
I
 
V
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
G
E
 
S
-
 
P
Q
 
H
L
 
V
Q
 
S
T
 
T
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
D
T
 
E
T
 
S
W
 
M
I
 
H
T
 
R
N
 
C
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
W
P
 
P
T
 
Q
S
 
N
T
 
V
D
 
D
E
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
R
I
 
V
V
 
A
R
 
S
T
 
L
C
 
C
A
 
Y
D
 
N
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
P
|
P
Y
 
F
G
|
G
T
|
T
G
|
G
T
|
T
S
x
G
L
 
V
E
 
E
G
 
G
H
x
G
V
|
V
N
 
C
A
 
A
P
 
V
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
C
 
C
V
 
I
D
 
N
M
x
L
M
 
T
R
 
H
M
 
M
D
 
D
K
 
Q
I
 
I
L
 
T
A
 
E
V
 
L
H
 
N
A
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
K
Q
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
T
Y
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
F
 
F
P
 
P
I
 
V
D
 
D
P
|
P
G
|
G
A
|
A
N
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
|
A
T
|
T
R
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
M
 
M
K
 
R
D
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
V
V
 
V
M
 
L
A
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
R
V
 
L
I
 
L
R
 
H
T
 
T
A
 
A
Q
 
G
R
 
R
A
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
K
 
R
K
 
K
S
 
S
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
L
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
H
G
 
P
I
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
T
R
 
V
S
 
A
A
 
A
R
 
T
C
 
C
A
 
A
F
 
F
R
 
P
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
D
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
D
A
 
S
V
 
T
M
 
V
M
 
Q
T
 
I
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
E
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
M
 
V
S
 
M
V
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
C
N
 
N
A
 
R
Y
 
H
S
 
S
G
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
C
P
 
P
E
 
V
M
 
A
P
 
P
L
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
H
 
H
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
L
D
 
Q
T
 
R
F
 
T
A
 
E
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
Q
E
 
D
F
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
S
D
 
H
I
 
F
A
 
-
A
 
-
T
 
S
S
 
W
T
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
K
R
 
R
S
 
N
K
 
E
L
 
L
W
 
W
Q
 
A
A
 
A
R
|
R
H
 
H
D
 
N
M
 
A
Y
x
W
W
x
Y
A
 
A
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
R
 
S
P
 
P
G
 
G
A
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
Y
S
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
I
 
I
S
 
S
K
 
R
L
 
L
A
 
P
E
 
E
C
 
I
V
 
L
S
 
V
A
 
E
A
 
T
R
 
K
S
 
E
K
 
E
A
 
I
E
 
K
E
 
A
M
 
S
N
 
K
L
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
H
|
H
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
H
 
A
A
 
C
L
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
D
M
 
P
D
 
D
S
 
D
A
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
Q
E
 
R
A
 
R
A
 
V
D
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
A
G
 
E
W
 
N
L
 
L
N
 
G
E
 
R
L
 
R
A
 
A
I
 
L
S
 
A
I
 
L
E
 
G
G
 
G
T
 
T
C
 
C
T
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
L
G
 
G
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
E
 
P
T
 
V
-
 
G
T
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
A
 
R
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
L
 
L

8jdqA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyisocaproic acid (see paper)
49% identity, 96% coverage: 18:465/467 of query aligns to 6:456/456 of 8jdqA

query
sites
8jdqA
I
 
V
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
G
E
 
S
-
 
P
Q
 
H
L
 
V
Q
 
S
T
 
T
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
D
T
 
E
T
 
S
W
 
M
I
 
H
T
 
R
N
 
C
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
W
P
 
P
T
 
Q
S
 
N
T
 
V
D
 
D
E
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
R
I
 
V
V
 
A
R
 
S
T
 
L
C
 
C
A
 
Y
D
 
N
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
P
|
P
Y
 
F
G
|
G
T
|
T
G
|
G
T
|
T
S
x
G
L
 
V
E
 
E
G
 
G
H
x
G
V
|
V
N
 
C
A
 
A
P
 
V
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
C
 
C
V
 
I
D
 
N
M
x
L
M
 
T
R
 
H
M
 
M
D
 
D
K
 
Q
I
 
I
L
 
T
A
 
E
V
 
L
H
 
N
A
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
K
Q
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
T
Y
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
F
 
F
P
 
P
I
 
V
D
 
D
P
|
P
G
|
G
A
|
A
N
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
|
A
T
|
T
R
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
M
 
M
K
 
R
D
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
V
V
 
V
M
 
L
A
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
R
V
 
L
I
 
L
R
 
H
T
 
T
A
 
A
Q
 
G
R
 
R
A
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
K
 
R
K
 
K
S
 
S
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
L
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
H
G
 
P
I
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
T
R
 
V
S
 
A
A
 
A
R
 
T
C
 
C
A
 
A
F
 
F
R
 
P
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
D
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
D
A
 
S
V
 
T
M
 
V
M
 
Q
T
 
I
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
E
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
M
 
V
S
 
M
V
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
C
N
 
N
A
 
R
Y
 
H
S
 
S
G
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
C
P
 
P
E
 
V
M
 
A
P
 
P
L
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
H
 
H
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
L
D
 
Q
T
 
R
F
 
T
A
 
E
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
Q
E
 
D
F
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
S
D
 
H
I
 
F
A
 
-
A
 
-
T
 
S
S
 
W
T
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
K
R
 
R
S
 
N
K
 
E
L
 
L
W
 
W
Q
 
A
A
 
A
R
|
R
H
 
H
D
 
N
M
 
A
Y
x
W
W
 
Y
A
 
A
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
R
 
S
P
 
P
G
 
G
A
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
Y
S
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
I
 
I
S
 
S
K
 
R
L
 
L
A
 
P
E
 
E
C
 
I
V
 
L
S
 
V
A
 
E
A
 
T
R
 
K
S
 
E
K
 
E
A
 
I
E
 
K
E
 
A
M
 
S
N
 
K
L
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
H
|
H
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
H
 
A
A
 
C
L
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
D
M
 
P
D
 
D
S
 
D
A
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
Q
E
 
R
A
 
R
A
 
V
D
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
A
G
 
E
W
 
N
L
 
L
N
 
G
E
 
R
L
 
R
A
 
A
I
 
L
S
 
A
I
 
L
E
 
G
G
 
G
T
 
T
C
 
C
T
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
L
G
 
G
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
E
 
P
T
 
V
-
 
G
T
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
A
 
R
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
L
 
L

8jdoA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyhexanoic acid (see paper)
49% identity, 96% coverage: 18:465/467 of query aligns to 6:456/456 of 8jdoA

query
sites
8jdoA
I
 
V
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
G
E
 
S
-
 
P
Q
 
H
L
 
V
Q
 
S
T
 
T
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
D
T
 
E
T
 
S
W
 
M
I
 
H
T
 
R
N
 
C
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
W
P
 
P
T
 
Q
S
 
N
T
 
V
D
 
D
E
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
R
I
 
V
V
 
A
R
 
S
T
 
L
C
 
C
A
 
Y
D
 
N
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
P
|
P
Y
 
F
G
|
G
T
|
T
G
|
G
T
|
T
S
x
G
L
 
V
E
 
E
G
 
G
H
x
G
V
|
V
N
 
C
A
 
A
P
 
V
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
C
 
C
V
 
I
D
 
N
M
x
L
M
 
T
R
 
H
M
 
M
D
 
D
K
 
Q
I
 
I
L
 
T
A
 
E
V
 
L
H
 
N
A
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
K
Q
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
T
Y
 
H
L
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
W
F
 
F
P
 
P
I
 
V
D
 
D
P
|
P
G
|
G
A
|
A
N
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
C
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
|
A
T
|
T
R
 
G
A
|
A
S
|
S
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
M
 
M
K
 
R
D
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
V
V
 
V
M
 
L
A
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
R
V
 
L
I
 
L
R
 
H
T
 
T
A
 
A
Q
 
G
R
 
R
A
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
Y
K
 
R
K
 
K
S
 
S
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
G
L
 
L
L
 
F
V
 
V
G
 
G
S
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
|
I
T
 
T
E
 
S
L
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
H
G
 
P
I
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
T
R
 
V
S
 
A
A
 
A
R
 
T
C
 
C
A
 
A
F
 
F
R
 
P
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
D
 
A
A
 
A
C
 
V
R
 
D
A
 
S
V
 
T
M
 
V
M
 
Q
T
 
I
I
 
L
Q
 
Q
Y
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
V
S
 
A
R
 
R
I
 
I
E
 
E
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
D
M
 
V
S
 
M
V
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
C
N
 
N
A
 
R
Y
 
H
S
 
S
G
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
C
P
 
P
E
 
V
M
 
A
P
 
P
L
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
H
 
H
G
 
G
S
 
S
D
 
Q
A
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
L
D
 
Q
T
 
R
F
 
T
A
 
E
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
Q
E
 
D
F
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
S
D
 
H
I
 
F
A
 
-
A
 
-
T
 
S
S
 
W
T
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
K
R
 
R
S
 
N
K
 
E
L
 
L
W
 
W
Q
 
A
A
 
A
R
|
R
H
 
H
D
 
N
M
 
A
Y
x
W
W
x
Y
A
 
A
S
 
A
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
R
 
S
P
 
P
G
 
G
A
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
Y
S
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
V
 
V
P
 
P
I
 
I
S
 
S
K
 
R
L
 
L
A
 
P
E
 
E
C
 
I
V
 
L
S
 
V
A
 
E
A
 
T
R
 
K
S
 
E
K
 
E
A
 
I
E
 
K
E
 
A
M
 
S
N
 
K
L
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
A
M
 
I
V
 
V
G
 
G
H
|
H
V
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
F
 
F
H
 
A
A
 
C
L
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
V
N
 
D
M
 
P
D
 
D
S
 
D
A
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
Q
E
 
R
A
 
R
A
 
V
D
 
K
A
 
A
Y
 
F
V
 
A
G
 
E
W
 
N
L
 
L
N
 
G
E
 
R
L
 
R
A
 
A
I
 
L
S
 
A
I
 
L
E
 
G
G
 
G
T
 
T
C
 
C
T
 
T
G
 
G
E
|
E
H
|
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
L
G
 
G
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
Y
 
L
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
E
 
P
T
 
V
-
 
G
T
 
V
R
 
E
Y
 
T
M
 
M
A
 
R
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
A
 
N
A
 
T
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
R
N
 
G
I
 
L
L
 
M
N
|
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
V
L
 
L

8jdnA Crystal structure of h405a mldhd in complex with d-2-hydroxyvaleric acid (see paper)
49% identity, 96% coverage: 18:465/467 of query aligns to 6:456/456 of 8jdnA

query
sites
8jdnA
I
 
V
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
K
Q
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
G
E
 
S
-
 
P
Q
 
H
L
 
V
Q
 
S
T
 
T
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
V
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
D
T
 
E
T
 
S
W
 
M
I
 
H
T
 
R
N
 
C
Q
 
Q
P
 
P
P
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
W
P
 
P
T
 
Q
S
 
N
T
 
V
D
 
D
E
 
Q
V
 
V
A
 
S
D
 
R
I
 
V
V
 
A
R
 
S
T
 
L
C
 
C
A
 
Y
D
 
N
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
P
|
P
Y
 
F
G
|
G
T
|
T
G
|
G
T
|
T
S
x
G
L
 
V
E
 
E
G
 
G
H
x
G
V
|
V
N
 
C
A
 
A
P
 
V
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
V
C
 
C
V
 
I
D
 
N
M
x
L
M
 
T
R
 
H
M
 
M
D
 
D
K
 
Q
I
 
I
L
 
T
A
 
E
V
 
L
H
 
N
A
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
F
D
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
P
 
P