SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2935 FitnessBrowser__WCS417:GFF2935 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
42% identity, 88% coverage: 32:310/317 of query aligns to 33:312/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
P
 
P
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
A
 
-
E
 
D
A
 
F
I
 
L
K
 
A
A
 
L
H
 
Q
G
 
A
S
 
E
Q
 
S
I
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
G
R
 
N
G
 
S
P
 
N
L
 
A
G
 
G
L
 
A
Y
 
D
A
 
A
E
 
E
E
 
L
I
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
I
 
I
I
 
V
C
 
S
V
 
S
I
 
F
G
 
S
A
 
V
G
 
G
Y
 
L
E
 
D
H
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
I
A
 
K
A
 
C
S
 
E
N
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
V
 
R
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
 
L
A
 
T
P
 
D
S
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
V
V
 
L
R
 
R
G
 
R
I
 
I
P
 
C
Q
 
E
T
 
C
D
 
D
V
 
K
A
 
Y
V
 
V
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
A
W
 
W
P
 
K
K
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
F
V
 
K
M
 
L
R
 
T
P
 
T
S
 
K
L
 
F
G
 
S
G
 
G
K
 
K
Q
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
A
S
 
-
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
E
 
P
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
H
 
F
N
x
S
R
|
R
Q
x
S
P
 
K
R
 
K
D
 
P
D
 
N
V
 
T
D
 
N
Y
 
Y
T
 
T
Y
 
Y
C
 
Y
A
 
G
T
 
S
A
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
T
 
N
S
 
S
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
L
 
V
A
 
A
T
 
C
P
 
P
G
 
L
G
 
T
A
 
P
S
 
E
T
 
T
R
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
I
D
 
N
R
 
R
H
 
E
A
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
K
G
 
G
Y
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
P
V
 
H
V
 
V
V
 
D
T
 
E
A
 
P
D
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
V
Q
 
E
R
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
R
E
 
E
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
K
L
 
L
K
 
F
K
 
G
L
 
L
S
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
L
S
 
P
H
 
H
V
 
V
A
 
G
G
 
S
L
 
G
S
 
T
P
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
R
H
 
K
D
 
V
T
 
M
V
 
A
Q
 
D
R
 
L
V
 
V
A
 
V
D
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
E
E
 
A
Y
 
H
F
 
F
A
 
S
G
 
G
R
 
K
P
 
P
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
42% identity, 88% coverage: 32:310/317 of query aligns to 31:310/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
P
 
P
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
A
 
-
E
 
D
A
 
F
I
 
L
K
 
A
A
 
L
H
 
Q
G
 
A
S
 
E
Q
 
S
I
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
G
R
 
N
G
 
S
P
 
N
L
 
A
G
 
G
L
 
A
Y
 
D
A
 
A
E
 
E
E
 
L
I
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
I
 
I
I
 
V
C
 
S
V
 
S
I
 
F
G
 
S
A
x
V
G
 
G
Y
 
L
E
 
D
H
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
I
A
 
K
A
 
C
S
 
E
N
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
V
 
R
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
P
 
D
S
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
V
V
 
L
R
 
R
G
 
R
I
 
I
P
 
C
Q
 
E
T
 
C
D
 
D
V
 
K
A
 
Y
V
 
V
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
A
W
 
W
P
 
K
K
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
F
V
 
K
M
 
L
R
 
T
P
 
T
S
 
K
L
 
F
G
 
S
G
 
G
K
 
K
Q
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
A
 
A
S
 
-
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
E
 
P
V
 
I
S
 
S
Y
 
Y
H
 
F
N
x
S
R
|
R
Q
x
S
P
 
K
R
 
K
D
 
P
D
 
N
V
 
T
D
 
N
Y
 
Y
T
 
T
Y
 
Y
C
 
Y
A
 
G
T
 
S
A
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
T
 
N
S
 
S
D
 
D
F
 
I
L
 
L
I
 
V
L
 
V
A
 
A
T
x
C
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
P
S
 
E
T
|
T
R
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
I
D
 
N
R
 
R
H
 
E
A
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
K
G
 
G
Y
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
P
V
 
H
V
 
V
V
 
D
T
 
E
A
 
P
D
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
V
Q
 
E
R
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
G
A
|
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
R
E
|
E
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
K
L
 
L
K
 
F
K
 
G
L
 
L
S
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
L
S
 
P
H
|
H
V
 
V
A
x
G
G
 
S
L
 
G
S
 
T
P
 
V
E
 
E
A
 
T
A
 
R
H
 
K
D
 
V
T
 
M
V
 
A
Q
 
D
R
 
L
V
 
V
A
 
V
D
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
E
E
 
A
Y
 
H
F
 
F
A
 
S
G
 
G
R
 
K
P
 
P
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
44% identity, 79% coverage: 64:314/317 of query aligns to 58:312/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
A
 
A
L
 
F
P
 
P
Q
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
F
G
 
G
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
V
Q
 
S
A
 
R
A
 
A
S
 
A
N
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
P
 
E
S
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
H
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
N
L
 
T
V
 
L
R
 
R
G
 
L
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
V
 
Q
A
 
W
V
 
L
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
E
 
R
W
 
W
P
 
V
K
 
R
V
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
M
 
L
R
 
S
P
 
P
-
 
L
S
 
S
L
 
L
G
 
R
G
 
G
K
 
R
Q
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
S
 
-
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
E
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
Q
 
T
P
 
P
R
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
L
D
 
G
Y
 
F
T
 
T
Y
 
Y
C
 
H
A
 
P
T
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
T
 
A
S
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
I
 
I
L
 
V
A
 
I
T
 
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
D
 
N
R
 
A
H
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
K
G
 
G
Y
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
 
V
G
 
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
V
 
D
T
 
E
A
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
N
R
 
G
R
 
T
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
L
K
 
S
L
 
F
S
 
P
N
 
N
T
 
V
V
 
S
L
 
L
T
 
L
S
 
P
H
|
H
V
 
V
A
 
A
G
 
S
L
 
A
S
 
S
P
 
V
E
 
V
A
 
T
A
 
R
H
 
N
D
 
A
T
 
M
V
 
S
Q
 
D
R
 
L
V
 
V
A
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
V
 
K
E
 
A
Y
 
W
F
 
F
A
 
S
G
 
T
R
 
G
P
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
E
P
 
T
P
 
P

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
44% identity, 79% coverage: 64:314/317 of query aligns to 59:313/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
A
 
A
L
 
F
P
 
P
Q
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
F
G
|
G
A
x
V
G
|
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
V
Q
 
S
A
 
R
A
 
A
S
 
A
N
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
P
 
E
S
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
H
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
N
L
 
T
V
 
L
R
 
R
G
 
L
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
V
 
Q
A
 
W
V
 
L
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
E
 
R
W
 
W
P
 
V
K
 
R
V
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
M
 
L
R
 
S
P
 
P
-
 
L
S
 
S
L
 
L
G
 
R
G
 
G
K
 
R
Q
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
S
 
-
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
E
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
Q
 
T
P
 
P
R
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
L
D
 
G
Y
 
F
T
 
T
Y
 
Y
C
 
H
A
 
P
T
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
T
 
A
S
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
I
 
I
L
 
V
A
 
I
T
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
D
 
N
R
 
A
H
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
K
G
 
G
Y
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
V
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
V
 
D
T
 
E
A
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
N
R
 
G
R
 
T
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
L
K
 
S
L
 
F
S
 
P
N
 
N
T
 
V
V
 
S
L
 
L
T
 
L
S
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
G
x
S
L
 
A
S
 
S
P
 
V
E
 
V
A
 
T
A
x
R
H
 
N
D
 
A
T
 
M
V
 
S
Q
 
D
R
 
L
V
 
V
A
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
V
 
K
E
 
A
Y
 
W
F
 
F
A
 
S
G
 
T
R
 
G
P
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
E
P
 
T
P
 
P

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
44% identity, 79% coverage: 64:314/317 of query aligns to 58:312/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
A
 
A
L
 
F
P
 
P
Q
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
F
G
|
G
A
x
V
G
|
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
V
Q
 
S
A
 
R
A
 
A
S
 
A
N
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
P
 
E
S
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
H
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
N
L
 
T
V
 
L
R
 
R
G
 
L
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
V
 
Q
A
 
W
V
 
L
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
E
 
R
W
 
W
P
 
V
K
 
R
V
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
M
 
L
R
 
S
P
 
P
-
 
L
S
 
S
L
 
L
G
 
R
G
 
G
K
 
R
Q
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
S
 
-
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
E
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
Q
 
T
P
 
P
R
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
L
D
 
G
Y
 
F
T
 
T
Y
 
Y
C
 
H
A
 
P
T
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
T
 
A
S
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
I
 
I
L
 
V
A
 
I
T
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
D
 
N
R
 
A
H
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
K
G
 
G
Y
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
V
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
V
 
D
T
 
E
A
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
N
R
 
G
R
 
T
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
L
K
 
S
L
 
F
S
 
P
N
 
N
T
 
V
V
 
S
L
 
L
T
 
L
S
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
G
 
S
L
 
A
S
 
S
P
 
V
E
 
V
A
 
T
A
 
R
H
 
N
D
 
A
T
 
M
V
 
S
Q
 
D
R
 
L
V
 
V
A
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
V
 
K
E
 
A
Y
 
W
F
 
F
A
 
S
G
 
T
R
 
G
P
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
E
P
 
T
P
 
P

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
44% identity, 79% coverage: 64:314/317 of query aligns to 60:314/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
A
 
A
L
 
F
P
 
P
Q
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
F
G
 
G
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
V
Q
 
S
A
 
R
A
 
A
S
 
A
N
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
P
 
E
S
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
H
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
N
L
 
T
V
 
L
R
 
R
G
 
L
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
V
 
Q
A
 
W
V
 
L
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
E
 
R
W
 
W
P
 
V
K
 
R
V
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
M
 
L
R
 
S
P
 
P
-
 
L
S
 
S
L
 
L
G
 
R
G
 
G
K
 
R
Q
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
L
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
L
S
 
-
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
E
 
S
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
H
 
H
N
x
T
R
|
R
Q
 
T
P
 
P
R
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
L
D
 
G
Y
 
F
T
 
T
Y
 
Y
C
 
H
A
 
P
T
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
T
 
A
S
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
I
 
I
L
 
V
A
 
I
T
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
D
 
N
R
 
A
H
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
K
G
 
G
Y
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
V
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
V
 
T
V
 
V
V
 
D
T
 
E
A
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
N
R
 
G
R
 
T
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
N
E
|
E
P
 
P
Q
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
L
K
 
S
L
 
F
S
 
P
N
 
N
T
 
V
V
 
S
L
 
L
T
 
L
S
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
G
 
S
L
 
A
S
 
S
P
 
V
E
 
V
A
 
T
A
 
R
H
 
N
D
 
A
T
 
M
V
 
S
Q
 
D
R
 
L
V
 
V
A
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
V
 
K
E
 
A
Y
 
W
F
 
F
A
 
S
G
 
T
R
 
G
P
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
L
 
E
P
 
T
P
 
P

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
38% identity, 75% coverage: 66:303/317 of query aligns to 66:314/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
P
 
P
Q
 
R
L
 
L
E
 
R
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
x
Y
G
x
A
A
x
V
G
|
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
V
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
S
 
T
N
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
P
 
N
S
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
H
 
H
A
 
A
M
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
T
V
 
A
R
 
R
G
 
H
I
 
V
P
 
V
Q
 
K
T
 
G
D
 
D
V
 
K
A
 
F
V
 
V
R
 
R
R
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
W
P
 
K
K
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
V
 
F
M
 
L
R
 
G
P
 
Y
S
 
E
L
 
L
G
 
Y
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
L
 
Q
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
A
S
 
-
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
E
 
R
V
 
I
S
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
Q
 
T
P
 
R
R
 
K
D
 
S
D
 
Q
V
 
A
D
 
E
Y
 
K
T
 
E
Y
 
L
C
 
G
A
 
A
T
 
E
A
 
Y
V
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
L
R
 
K
T
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
I
 
I
L
 
L
A
|
A
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
K
S
 
E
T
|
T
R
 
M
H
 
Y
L
 
M
I
 
I
D
 
N
R
 
E
H
 
E
A
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
N
 
T
G
 
A
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
I
|
I
G
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
D
T
 
T
A
 
K
D
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
Y
V
 
Y
P
 
N
D
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
F
K
 
S
L
 
L
S
 
D
N
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
G
G
 
S
L
 
A
S
 
T
P
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
R
H
 
E
D
 
A
T
 
M
V
 
A
Q
 
E
R
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
A
Y
 
F
F
 
K
A
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
38% identity, 77% coverage: 60:303/317 of query aligns to 59:313/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
E
 
E
E
 
V
I
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
A
P
 
P
Q
 
R
L
 
L
E
 
R
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
Y
G
 
A
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
S
 
T
N
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
P
 
D
S
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
W
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
A
V
 
A
R
 
R
G
 
H
I
 
V
P
 
V
Q
 
K
T
 
G
D
 
D
V
 
K
A
 
F
V
 
V
R
 
R
R
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
W
P
 
K
K
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
I
V
 
A
M
 
W
R
 
H
P
 
P
S
 
K
L
 
M
G
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
D
-
 
V
-
 
Y
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
L
x
F
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
L
 
Q
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
S
 
-
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
M
E
 
R
V
 
I
S
 
L
Y
 
Y
H
 
T
N
x
A
R
|
R
Q
x
S
P
 
R
R
x
K
D
 
P
D
 
E
V
 
A
D
 
E
Y
 
K
T
 
E
Y
 
L
C
 
G
A
 
A
T
 
E
A
 
F
V
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
L
R
 
R
T
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
I
 
V
L
 
L
A
 
A
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
K
S
x
E
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
M
I
 
I
D
 
N
R
 
E
H
 
E
A
 
R
L
 
L
D
 
R
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
N
 
T
G
 
A
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
I
x
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
D
T
 
T
A
 
K
D
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
Y
V
 
Y
P
 
D
D
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
F
K
 
A
L
 
L
S
 
D
N
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
G
G
 
S
L
 
A
S
 
T
P
 
F
E
 
G
A
 
A
A
 
R
H
 
E
D
 
G
T
 
M
V
 
A
Q
 
E
R
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
A
Y
 
F
F
 
K
A
 
N
G
 
G

2w2lA Crystal structure of the holo forms of rhodotorula graminis d- mandelate dehydrogenase at 2.5a.
33% identity, 79% coverage: 59:309/317 of query aligns to 71:337/346 of 2w2lA

query
sites
2w2lA
A
 
A
E
 
D
E
 
L
I
 
I
A
 
S
A
 
H
L
 
L
P
 
P
Q
 
S
-
 
S
L
 
L
E
 
K
I
 
V
I
 
F
C
 
A
V
 
A
I
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
E
 
D
H
 
W
V
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
A
 
L
S
 
N
N
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
A
V
 
F
T
 
A
N
 
N
G
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
A
N
x
G
A
 
D
P
 
T
S
 
A
V
x
T
A
 
S
D
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
L
A
 
Y
L
 
L
L
 
I
L
 
L
S
 
S
L
 
V
V
 
F
R
 
R
G
 
L
I
 
A
P
 
S
Q
 
Y
T
 
S
D
 
E
V
 
R
A
 
A
V
 
A
R
 
R
R
 
T
G
 
G
E
 
D
W
 
P
P
 
E
K
 
T
V
 
F
M
 
N
R
 
R
P
 
V
S
 
H
L
 
L
G
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
H
-
 
N
-
 
P
-
 
R
G
 
G
K
 
H
Q
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
A
L
 
V
G
 
G
L
 
L
G
|
G
A
|
A
V
x
I
G
 
Q
L
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
K
A
 
A
S
 
V
Q
 
H
G
 
G
F
 
L
G
 
G
M
 
M
E
 
K
V
 
L
S
 
V
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
D
R
 
V
Q
 
A
P
 
P
R
 
A
D
 
D
-
 
A
D
 
E
V
 
T
D
 
E
Y
 
K
T
 
A
Y
 
L
C
 
G
A
 
A
T
 
E
A
 
R
V
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
R
S
 
S
D
 
D
F
 
C
L
 
V
I
 
S
L
 
V
A
 
S
T
x
V
P
|
P
G
 
Y
G
 
M
A
 
K
S
 
L
T
|
T
R
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
E
H
 
A
A
 
F
L
 
F
D
 
A
A
 
A
L
 
M
G
 
K
P
 
P
N
 
G
G
 
S
Y
 
R
L
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
G
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
S
T
 
Q
A
 
D
D
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
S
R
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
H
D
 
E
D
 
F
E
|
E
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
P
 
S
D
 
K
A
 
E
L
 
L
K
 
I
K
 
E
L
 
M
S
 
K
N
 
H
T
 
V
V
 
T
L
 
L
T
 
T
S
 
T
H
|
H
V
 
I
A
x
G
G
|
G
L
 
V
S
 
A
P
 
I
E
 
E
A
 
T
A
 
F
H
 
H
D
 
E
T
 
F
V
 
E
Q
 
R
R
 
L
V
 
T
A
 
M
D
 
T
N
 
N
L
 
I
V
 
D
E
 
R
Y
 
F
-
 
L
F
 
L
A
 
Q
G
 
G
R
 
K
P
 
P
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
40% identity, 75% coverage: 66:303/317 of query aligns to 66:314/334 of O58320

query
sites
O58320
P
 
P
Q
 
K
L
 
L
E
 
R
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
Y
G
 
A
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
S
 
T
N
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
 
L
A
 
T
P
 
D
S
 
A
V
 
T
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
T
V
 
A
R
 
R
G
 
H
I
 
V
P
 
V
Q
 
K
T
 
G
D
 
D
V
 
R
A
 
F
V
 
V
R
 
R
R
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
W
P
 
K
K
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
V
 
A
M
 
W
R
 
H
P
 
P
S
 
K
-
 
W
-
 
F
L
 
L
G
 
G
-
 
Y
-
 
D
-
 
V
-
 
Y
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
L
 
Q
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
S
 
-
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
E
 
R
V
 
I
S
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
Q
x
T
P
 
R
R
 
K
D
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
E
Y
 
R
T
 
E
Y
 
L
C
 
N
A
 
A
T
 
E
A
 
F
V
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
R
T
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
I
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
L
G
 
T
A
 
R
S
 
E
T
 
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
D
 
N
R
 
E
H
 
E
A
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
N
 
T
G
 
A
Y
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
G
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
D
T
 
T
A
 
N
D
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
Y
V
 
Y
P
 
N
D
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
D
N
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
P
H
|
H
V
x
I
A
x
G
G
 
S
L
 
A
S
 
S
P
 
F
E
 
G
A
 
A
A
 
R
H
 
E
D
 
G
T
 
M
V
 
A
Q
 
E
R
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
A
Y
 
F
F
 
K
A
 
R
G
 
G

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
40% identity, 75% coverage: 66:303/317 of query aligns to 66:314/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
P
 
P
Q
 
K
L
 
L
E
 
R
I
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
N
I
 
Y
G
 
A
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
S
 
T
N
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
D
V
 
V
N
x
L
A
 
T
P
 
D
S
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
H
 
L
A
 
A
M
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
T
V
 
A
R
 
R
G
 
H
I
 
V
P
 
V
Q
 
K
T
 
G
D
 
D
V
 
R
A
 
F
V
 
V
R
 
R
R
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
W
P
 
K
K
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
V
V
 
A
M
 
W
R
 
H
P
 
P
S
 
K
-
 
W
-
 
F
L
 
L
G
 
G
-
 
Y
-
 
D
-
 
V
-
 
Y
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
L
 
Q
E
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
S
 
-
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
E
 
R
V
 
I
S
 
L
Y
 
Y
H
 
Y
N
x
S
R
|
R
Q
x
T
P
 
R
R
 
K
D
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
E
Y
 
R
T
 
E
Y
 
L
C
 
N
A
 
A
T
 
E
A
 
F
V
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
R
T
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
I
 
V
L
 
L
A
|
A
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
A
 
R
S
 
E
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
D
 
N
R
 
E
H
 
E
A
 
R
L
 
L
D
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
N
 
T
G
 
A
Y
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
G
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
D
T
 
T
A
 
N
D
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
D
 
E
E
|
E
P
 
P
Q
 
Y
V
 
Y
P
 
N
D
 
E
A
 
E
L
 
L
K
 
F
K
 
K
L
 
L
S
 
D
N
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
G
G
 
S
L
 
A
S
 
S
P
 
F
E
 
G
A
 
A
A
 
R
H
 
E
D
 
G
T
 
M
V
 
A
Q
 
E
R
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
I
E
 
A
Y
 
F
F
 
K
A
 
R
G
 
G

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
30% identity, 85% coverage: 37:306/317 of query aligns to 39:312/533 of O43175

query
sites
O43175
E
 
E
A
 
E
I
 
L
K
 
I
A
 
A
H
 
E
G
 
L
S
 
Q
Q
 
D
I
 
C
K
 
E
A
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
A
L
 
T
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
A
E
 
D
E
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
G
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
x
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
N
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
T
 
A
D
 
T
V
 
A
A
 
S
V
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
K
W
 
W
-
 
E
-
x
R
P
 
K
K
 
K
V
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
S
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
S
 
-
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
E
 
K
V
 
T
S
 
I
Y
 
G
H
 
Y
N
x
D
R
 
P
Q
 
I
P
 
I
R
 
S
D
 
P
D
 
E
V
 
V
D
 
S
Y
 
A
T
 
S
Y
 
F
C
 
G
A
 
V
T
 
Q
A
 
Q
V
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
I
 
T
L
 
V
A
 
H
T
|
T
P
 
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
D
 
N
R
 
D
H
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
N
 
G
G
 
V
Y
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
I
x
C
G
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
V
 
D
T
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
V
 
R
P
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
V
K
 
D
L
 
H
S
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
S
 
P
H
|
H
V
x
L
A
x
G
G
x
A
L
 
S
S
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
H
 
S
D
 
R
T
 
C
V
 
G
Q
 
E
R
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
V
N
 
Q
L
 
F
V
 
V
E
 
D
Y
 
M
F
 
V
A
 
K
G
 
G
R
 
K
P
 
S
V
 
L

Sites not aligning to the query:

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
31% identity, 84% coverage: 37:303/317 of query aligns to 35:305/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
E
 
E
A
 
E
I
 
L
K
 
I
A
 
A
H
 
E
G
 
L
S
 
Q
Q
 
D
I
 
C
K
 
E
A
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
A
L
 
T
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
A
E
 
D
E
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
G
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
N
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
T
 
A
D
 
T
V
 
A
A
 
S
V
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
P
 
K
K
 
K
V
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
S
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
S
 
-
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
E
 
K
V
 
T
S
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
Q
 
I
P
 
I
R
 
S
D
 
P
D
 
E
V
 
V
D
 
S
Y
 
A
T
 
S
Y
 
F
C
 
G
A
 
V
T
 
Q
A
 
Q
V
 
L
-
 
P
-
x
L
-
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
I
 
T
L
 
V
A
x
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
D
 
N
R
 
D
H
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
N
 
G
G
 
V
Y
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
C
G
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
V
 
D
T
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
V
 
R
P
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
V
K
 
D
L
 
H
S
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
S
 
P
H
 
H
V
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
S
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
H
 
S
D
 
R
T
 
C
V
 
G
Q
 
E
R
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
V
N
 
Q
L
 
F
V
 
V
E
 
D
Y
 
M
F
 
V
A
 
K
G
 
G

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
30% identity, 83% coverage: 37:300/317 of query aligns to 34:301/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
E
 
E
A
 
E
I
 
L
K
 
I
A
 
A
H
 
E
G
 
L
S
 
Q
Q
 
D
I
 
C
K
 
E
A
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
A
L
 
T
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
A
E
 
D
E
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
G
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
N
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
T
 
A
D
 
T
V
 
A
A
 
S
V
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
P
 
K
K
 
K
V
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
S
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
A
x
R
V
 
I
G
 
G
L
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
S
 
-
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
E
 
K
V
 
T
S
 
I
Y
 
G
H
 
Y
N
x
D
R
x
P
Q
x
I
P
x
I
R
 
S
D
 
P
D
 
E
V
 
V
D
 
S
Y
 
A
T
 
S
Y
 
F
C
 
G
A
 
V
T
 
Q
A
 
Q
V
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
I
 
T
L
 
V
A
x
H
T
|
T
P
 
P
G
 
L
G
x
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
D
 
N
R
 
D
H
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
N
 
G
G
 
V
Y
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
C
G
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
V
 
D
T
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
V
 
R
P
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
V
K
 
D
L
 
H
S
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
S
 
P
H
 
H
V
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
S
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
H
 
S
D
 
R
T
 
C
V
 
G
Q
 
E
R
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
V
N
 
Q
L
 
F
V
 
V
E
 
D
Y
 
M

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
30% identity, 83% coverage: 37:300/317 of query aligns to 35:302/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
E
 
E
A
 
E
I
 
L
K
 
I
A
 
A
H
 
E
G
 
L
S
 
Q
Q
 
D
I
 
C
K
 
E
A
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
A
L
 
T
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
A
E
 
D
E
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
G
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
x
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
N
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
S
 
S
V
x
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
T
 
A
D
 
T
V
 
A
A
 
S
V
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
P
 
K
K
 
K
V
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
S
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
A
x
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
S
 
-
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
E
 
K
V
 
T
S
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
Q
x
I
P
 
I
R
 
S
D
 
P
D
 
E
V
 
V
D
 
S
Y
 
A
T
 
S
Y
 
F
C
 
G
A
 
V
T
 
Q
A
 
Q
V
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
I
 
T
L
 
V
A
x
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
S
 
S
T
|
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
D
 
N
R
 
D
H
 
N
A
 
T
L
 
F
D
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
N
 
G
G
 
V
Y
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
I
x
C
G
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
G
V
 
I
V
 
V
V
 
D
T
 
E
A
 
G
D
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
T
D
 
E
E
 
E
P
 
P
Q
 
P
V
 
R
P
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
V
K
 
D
L
 
H
S
 
E
N
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
S
 
P
H
|
H
V
 
L
A
x
G
G
 
A
L
 
S
S
 
T
P
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
H
 
S
D
 
R
T
 
C
V
 
G
Q
x
E
R
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
V
N
 
Q
L
 
F
V
 
V
E
 
D
Y
 
M

Sites not aligning to the query:

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
30% identity, 83% coverage: 37:300/317 of query aligns to 31:298/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
E
 
E
A
 
E
I
 
L
K
 
I
A
 
A
H
 
E
G
 
L
S
 
Q
Q
 
D
I
 
C
K
 
E
A
 
G
V
 
L
L
 
I
T
 
V
R
 
R
G
 
S
P
 
A
L
 
T
G
 
K
L
 
V
Y
 
T
A
 
A
E
 
D
E
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
Q
I
 
V
I
 
V
C
 
G
V
 
R
I
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
E
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
N
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
M
N
 
N
G
 
T
A
 
P
G
 
N
V
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
L
A
 
T
M
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
S
 
C
L
 
L
V
 
A
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
T
 
A
D
 
T
V
 
A
A
 
S
V
 
M
R
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
K
W
 
W
-
 
E
-
 
R
P
 
K
K
 
K
V
 
F
M
 
M
R
 
G
P
 
T
S
 
E
L
 
L
G
 
N
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
A
 
R
V
x
I
G
 
G
L
 
R
E
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
A
 
M
S
 
-
Q
 
Q
G
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
E
 
K
V
 
T
S
 
I
Y
 
G
H
x
Y
N
x
D
R
x
P
Q
x
I
P
x
I
R
 
S
D
 
P
D
 
E
V
 
V
D
 
S
Y
 
A
T
 
S
Y
 
F
C
 
G
A
 
V
T
 
Q
A
 
Q
V
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
W
R
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
I
 
T
L
 
V
A
x
H
T
|
T
P
 
P
G
 
L
G
 
L
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
T