SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2940 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2940 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6czmE Crystal structure of medicago truncatula atp-phosphoribosyltransferase in tense form (see paper)
27% identity, 99% coverage: 3:229/230 of query aligns to 10:235/342 of 6czmE

query
sites
6czmE
L
 
I
K
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
 
R
L
 
M
M
 
S
E
 
S
K
 
D
T
 
T
F
 
L
E
 
D
W
 
L
F
 
L
A
 
K
K
 
D
R
 
C
G
 
Q
I
 
L
T
 
S
L
 
V
S
 
K
R
 
Q
T
 
V
G
 
-
S
 
N
D
 
P
R
 
R
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
V
G
 
A
A
 
Q
V
 
I
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
D
 
S
G
 
N
I
 
L
D
 
E
L
 
V
V
 
W
L
 
F
L
 
Q
S
 
R
A
 
P
G
 
K
E
 
D
M
 
I
P
 
V
R
 
R
E
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
D
I
 
L
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
L
D
 
D
L
 
V
V
 
L
Q
 
T
E
 
E
K
 
F
L
 
G
P
 
Q
L
 
G
W
 
N
E
 
E
Q
 
D
Q
 
L
V
 
I
E
 
V
E
 
V
I
 
H
A
 
E
G
 
A
L
 
L
G
 
E
F
 
Y
G
 
G
H
 
D
A
x
C
D
 
R
L
 
L
I
 
S
L
 
I
A
 
A
V
 
I
P
 
P
Q
 
Q
I
 
Y
W
 
G
V
 
I
D
 
-
V
 
F
E
 
E
T
 
N
I
 
V
D
 
N
D
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
M
F
 
P
R
 
Q
A
 
W
K
 
T
H
 
E
G
 
D
H
 
K
R
 
P
L
 
L
R
 
R
I
 
V
A
 
A
T
 
T
K
 
G
Y
 
F
H
 
T
R
 
Y
L
 
L
V
 
G
R
 
P
E
 
K
Y
 
F
L
 
M
M
 
K
D
 
D
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
K
D
 
H
Y
 
V
Q
 
A
L
 
F
V
 
S
D
 
T
S
 
A
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
L
E
 
E
G
 
A
T
 
A
V
 
P
K
 
A
N
 
M
E
 
G
T
 
I
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
L
D
|
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
E
 
T
T
|
T
L
 
L
R
 
K
A
 
E
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
E
M
 
I
S
 
E
D
 
G
G
 
G
L
 
T
I
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
T
 
A
L
 
L
W
 
V
R
 
A
S
 
S
R
 
R
V
 
R
A
 
S
K
 
M
Y
 
I
S
 
G
A
 
R
K
 
K
E
 
G
K
 
V
-
 
L
A
 
E
T
 
T
L
 
T
G
 
H
D
 
E
L
 
M
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
H
 
E

Sites not aligning to the query:

2vd3A The structure of histidine inhibited hisg from methanobacterium thermoautotrophicum
29% identity, 93% coverage: 3:216/230 of query aligns to 5:196/289 of 2vd3A

query
sites
2vd3A
L
 
I
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
V
P
 
P
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
 
R
L
 
I
M
 
S
E
 
E
K
 
P
T
 
A
F
 
I
E
 
R
W
 
L
F
 
L
A
x
E
K
 
N
R
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
G
L
 
L
S
 
K
R
 
D
T
 
T
G
 
V
S
 
N
D
 
R
R
 
K
E
 
L
Y
 
F
A
 
S
G
 
K
A
 
T
V
x
Q
A
 
H
G
 
-
I
 
-
D
 
P
G
 
Q
I
 
I
D
 
E
L
 
V
V
 
M
L
 
F
L
 
S
S
 
R
A
 
A
G
 
A
E
 
D
M
 
I
P
 
P
R
 
E
E
 
F
L
 
V
A
 
A
A
 
D
G
 
G
R
 
A
I
 
A
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Y
D
 
D
L
 
L
V
 
I
Q
 
V
E
 
E
K
 
R
L
 
-
P
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
G
Q
 
S
Q
 
D
V
 
V
E
 
E
E
 
I
I
 
L
A
 
E
G
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
Y
G
 
G
H
 
R
A
 
A
D
 
S
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
Q
 
E
I
 
D
W
 
S
V
 
T
D
 
-
V
 
I
E
 
R
T
 
G
I
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
D
 
P
A
 
R
V
 
G
A
 
A
A
 
V
A
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
E
Y
 
F
H
 
P
R
 
G
L
 
I
V
 
T
R
 
E
E
 
N
Y
 
Y
L
 
L
M
 
R
D
 
E
A
 
H
G
 
G
V
 
I
A
 
-
D
 
D
Y
 
A
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
D
 
E
S
 
L
Q
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
T
E
 
E
G
 
I
T
 
A
V
 
P
K
 
F
N
 
I
E
 
G
T
 
V
A
 
A
E
 
D
M
 
L
V
 
I
A
 
T
D
|
D
I
x
L
T
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
M
N
 
N
H
 
H
L
 
L
K
 
R
L
 
V
M
 
I
S
 
D
D
 
-
G
 
-
L
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
E
S
 
S
Q
 
S
A
 
V
T
 
K
L
 
L
W
 
I
R
 
A
S
 
N
R
 
R
V
 
-
A
 
E
K
 
S
Y
 
Y
S
 
A
A
 
T
K
 
K

Sites not aligning to the query:

7dahC Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from vibrio cholerae in complex with atp and prpp
28% identity, 99% coverage: 3:230/230 of query aligns to 4:216/288 of 7dahC

query
sites
7dahC
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
I
P
x
Q
S
 
K
K
 
K
G
 
G
R
|
R
L
 
L
M
 
S
E
 
Q
K
 
E
T
 
C
F
 
Q
E
 
E
W
 
L
F
 
L
A
 
K
K
 
K
R
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
L
 
F
S
 
N
R
 
I
T
 
M
G
 
G
S
 
-
D
 
E
R
 
R
E
 
L
Y
 
V
A
 
V
G
 
H
A
 
S
V
 
L
A
 
N
G
 
M
I
 
-
D
 
-
G
 
P
I
 
I
D
 
D
L
 
L
V
 
L
L
 
L
L
 
V
S
x
R
A
x
D
G
x
D
E
 
D
M
 
I
P
 
P
R
 
G
E
 
L
L
 
I
A
 
M
A
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
V
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
F
T
 
V
G
 
G
T
 
E
D
x
N
L
 
V
V
 
L
Q
 
E
E
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
D
K
 
R
L
 
L
P
 
A
L
 
L
W
 
N
E
 
Q
Q
 
R
-
 
N
Q
 
E
V
 
F
E
 
T
E
 
T
I
 
L
A
 
R
G
 
R
L
 
M
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
x
G
A
x
C
D
 
R
L
 
L
I
 
S
L
 
I
A
 
A
V
 
I
P
 
E
Q
 
K
I
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
A
V
 
E
A
 
Y
A
 
R
A
 
G
F
 
P
R
 
Q
A
 
D
K
 
L
H
 
N
G
 
G
H
 
K
R
 
R
L
 
-
R
 
-
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
T
Y
 
Y
H
 
P
R
 
Q
L
 
L
V
 
L
R
 
K
E
 
A
Y
 
Y
L
 
M
M
 
D
D
 
R
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
-
D
 
D
Y
 
F
Q
 
S
L
 
T
V
 
C
D
 
M
S
 
L
Q
 
T
G
|
G
A
x
S
T
 
V
E
|
E
G
 
V
T
 
A
V
 
P
K
 
R
N
 
A
E
 
G
T
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
|
T
G
|
G
E
x
A
T
|
T
L
 
L
R
 
E
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
K
L
 
E
M
 
V
S
 
E
D
 
-
G
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
F
R
 
E
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
T
 
T
L
 
L
W
 
I
R
 
Q
S
 
-
R
 
R
V
 
P
A
 
G
K
 
A
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
K
 
D
E
 
K
K
 
A
A
 
A
T
 
L
L
 
I
G
 
D
D
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
T
R
 
R
L
 
M
H
 
H
G
 
G

5u99A Transition state analysis of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase (see paper)
28% identity, 85% coverage: 3:198/230 of query aligns to 4:177/278 of 5u99A

query
sites
5u99A
L
 
L
K
 
R
L
 
V
G
 
A
V
 
V
P
 
P
S
 
N
K
 
K
G
 
G
R
 
A
L
 
L
M
 
S
E
 
E
K
 
P
T
 
A
F
 
T
E
 
E
W
 
I
F
 
L
A
 
A
K
 
E
R
 
A
G
 
G
I
 
Y
T
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
R
T
 
R
G
 
R
S
 
T
D
 
D
R
 
S
E
 
K
Y
 
D
A
 
L
G
 
T
A
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
P
I
 
V
D
 
N
G
 
N
I
 
V
D
 
E
L
 
F
V
 
F
L
 
F
L
 
L
S
 
R
A
 
P
G
 
K
E
 
D
M
 
I
P
 
A
R
 
I
E
 
Y
L
 
V
A
 
G
A
 
S
G
 
G
R
 
E
I
 
L
H
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
R
D
|
D
L
 
L
V
 
V
Q
 
C
E
 
D
K
 
S
L
 
-
P
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
G
Q
 
A
Q
 
Q
V
 
V
E
 
R
E
 
E
I
 
R
A
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
S
A
x
S
D
 
S
L
 
F
I
 
R
L
 
Y
A
 
A
V
 
A
P
 
P
-
 
A
-
 
G
Q
 
R
I
 
N
W
 
W
V
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
T
I
 
T
D
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
A
A
 
G
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
M
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
A
Y
 
Y
H
 
P
R
 
N
L
 
L
V
 
V
R
 
R
E
 
K
Y
 
D
L
 
L
M
 
A
D
 
T
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
-
D
 
E
Y
 
A
Q
 
T
L
 
V
V
 
I
D
 
R
S
 
L
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
V
E
 
E
G
 
I
T
 
S
V
 
V
K
 
Q
N
 
L
E
 
G
T
 
V
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
D
I
x
V
T
 
V
S
 
G
T
 
S
G
 
G
E
 
R
T
 
T
L
 
L
R
 
S
A
 
Q
N
 
H
H
 
D
L
 
L
K
 
V
L
 
A
M
 
F
S
 
G
D
 
E
G
 
P
L
 
L
I
 
C

1nh8A Atp phosphoribosyltransferase (atp-prtase) from mycobacterium tuberculosis in complex with amp and histidine (see paper)
28% identity, 85% coverage: 3:198/230 of query aligns to 2:175/276 of 1nh8A

query
sites
1nh8A
L
 
L
K
 
R
L
 
V
G
 
A
V
 
V
P
 
P
S
 
N
K
 
K
G
 
G
R
 
A
L
 
L
M
 
S
E
 
E
K
 
P
T
 
A
F
 
T
E
 
E
W
 
I
F
 
L
A
 
A
K
 
E
R
 
A
G
 
G
I
 
Y
T
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
R
T
 
R
G
 
R
S
 
T
D
 
D
R
 
S
E
 
K
Y
 
D
A
 
L
G
 
T
A
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
P
I
 
V
D
 
N
G
 
N
I
 
V
D
 
E
L
 
F
V
 
F
L
 
F
L
 
L
S
 
R
A
 
P
G
 
K
E
 
D
M
 
I
P
 
A
R
 
I
E
 
Y
L
 
V
A
 
G
A
 
S
G
 
G
R
 
E
I
 
L
H
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
V
Q
 
C
E
 
D
K
 
S
L
 
-
P
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
G
Q
 
A
Q
 
Q
V
 
V
E
 
R
E
 
E
I
 
R
A
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
S
A
 
S
D
 
S
L
 
F
I
 
R
L
 
Y
A
 
A
V
 
A
P
 
P
-
 
A
-
 
G
Q
 
R
I
 
N
W
 
W
V
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
T
I
 
T
D
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
A
A
 
G
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
M
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
A
Y
 
Y
H
 
P
R
 
N
L
 
L
V
 
V
R
 
R
E
 
K
Y
 
D
L
 
L
M
 
A
D
 
T
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
-
D
 
E
Y
 
A
Q
 
T
L
 
V
V
 
I
D
 
R
S
 
L
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
V
E
 
E
G
 
I
T
 
S
V
 
V
K
 
Q
N
 
L
E
 
G
T
 
V
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
D
I
x
V
T
 
V
S
x
G
T
x
S
G
|
G
E
x
R
T
|
T
L
 
L
R
 
S
A
 
Q
N
 
H
H
 
D
L
 
L
K
 
V
L
 
A
M
 
F
S
 
G
D
 
E
G
 
P
L
 
L
I
 
C

Sites not aligning to the query:

5lhtA Atp phosphoribosyltransferase from mycobacterium tuberculosis in complex with the allosteric activator 3-(2-thienyl)-l-alanine (see paper)
28% identity, 85% coverage: 3:198/230 of query aligns to 2:175/284 of 5lhtA

query
sites
5lhtA
L
 
L
K
 
R
L
 
V
G
 
A
V
 
V
P
 
P
S
 
N
K
 
K
G
 
G
R
 
A
L
 
L
M
 
S
E
 
E
K
 
P
T
 
A
F
 
T
E
 
E
W
 
I
F
 
L
A
 
A
K
 
E
R
 
A
G
 
G
I
 
Y
T
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
R
T
 
R
G
 
R
S
 
T
D
 
D
R
 
S
E
 
K
Y
 
D
A
 
L
G
 
T
A
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
P
I
 
V
D
 
N
G
 
N
I
 
V
D
 
E
L
 
F
V
 
F
L
 
F
L
 
L
S
 
R
A
 
P
G
 
K
E
 
D
M
 
I
P
 
A
R
 
I
E
 
Y
L
 
V
A
 
G
A
 
S
G
 
G
R
 
E
I
 
L
H
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
V
Q
 
C
E
 
D
K
 
S
L
 
-
P
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
G
Q
 
A
Q
 
Q
V
 
V
E
 
R
E
 
E
I
 
R
A
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
S
A
 
S
D
 
S
L
 
F
I
 
R
L
 
Y
A
 
A
V
 
A
P
 
P
-
 
A
-
 
G
Q
 
R
I
 
N
W
 
W
V
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
T
I
 
T
D
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
A
A
 
G
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
M
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
A
Y
 
Y
H
 
P
R
 
N
L
 
L
V
 
V
R
 
R
E
 
K
Y
 
D
L
 
L
M
 
A
D
 
T
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
-
D
 
E
Y
 
A
Q
 
T
L
 
V
V
 
I
D
 
R
S
 
L
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
V
E
 
E
G
 
I
T
 
S
V
 
V
K
 
Q
N
 
L
E
 
G
T
 
V
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
V
T
 
V
S
 
G
T
 
S
G
 
G
E
 
R
T
 
T
L
 
L
R
 
S
A
 
Q
N
 
H
H
 
D
L
 
L
K
 
V
L
 
A
M
 
F
S
 
G
D
 
E
G
 
P
L
 
L
I
 
C

Sites not aligning to the query:

5ub9A Catalytic core domain of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni (see paper)
25% identity, 96% coverage: 3:223/230 of query aligns to 3:206/220 of 5ub9A

query
sites
5ub9A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
Q
S
 
K
K
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
M
 
S
E
 
K
K
 
E
T
 
S
F
 
I
E
 
E
W
 
L
F
 
L
A
 
S
K
 
E
R
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
L
 
M
S
x
H
R
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
I
D
x
H
R
 
E
E
 
Q
Y
 
S
A
 
L
G
 
I
A
 
A
V
 
F
A
 
S
G
 
T
I
 
N
D
 
L
G
 
P
I
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
L
L
 
R
L
 
V
S
 
R
A
 
D
G
 
D
E
 
D
M
 
I
P
 
P
R
 
G
E
 
L
L
 
I
A
 
F
A
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
V
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
T
 
E
D
 
N
L
 
V
V
 
L
Q
 
E
E
 
E
K
 
N
L
 
E
P
 
L
L
 
E
W
 
R
E
 
Q
Q
 
S
Q
 
L
V
 
G
E
 
E
E
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
I
 
L
A
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
Y
A
 
C
D
 
R
L
 
L
I
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
E
A
 
N
A
 
K
F
 
F
R
 
N
A
 
L
K
 
K
H
 
D
G
 
F
H
 
E
R
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
H
 
P
R
 
Q
L
 
L
V
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
L
 
M
M
 
K
D
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
-
D
 
N
Y
 
Y
Q
 
K
L
 
N
V
 
C
D
 
T
S
 
L
Q
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
V
T
 
A
V
 
P
K
 
R
N
 
A
E
 
N
T
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
C
D
 
D
I
 
L
T
 
V
S
 
S
T
 
S
G
 
G
E
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
E
M
 
V
S
 
K
D
 
-
G
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
E
S
 
S
Q
 
R
A
 
A
T
 
C
L
 
L
W
 
I
R
 
Q
S
 
K
R
 
E
V
 
N
A
 
A
K
 
-
Y
 
-
S
 
L
A
 
S
K
 
K
E
 
E
K
 
K
A
 
Q
T
 
A
L
 
L
G
 
V
D
 
D

5ubgA Catalytic core domain of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni with bound phosphoribosyl-atp (see paper)
25% identity, 96% coverage: 3:223/230 of query aligns to 4:208/222 of 5ubgA

query
sites
5ubgA
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
I
P
x
Q
S
 
K
K
 
S
G
|
G
R
|
R
L
 
L
M
 
S
E
 
K
K
 
E
T
 
S
F
 
I
E
 
E
W
 
L
F
 
L
A
 
S
K
 
E
R
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
L
 
M
S
x
H
R
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
I
D
x
H
R
 
E
E
 
Q
Y
 
S
A
 
L
G
 
I
A
 
A
V
 
F
A
 
S
G
 
T
I
 
N
D
 
L
G
 
P
I
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
L
L
 
R
L
 
V
S
x
R
A
x
D
G
x
D
E
 
D
M
 
I
P
 
P
R
 
G
E
 
L
L
 
I
A
 
F
A
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
V
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
T
 
E
D
x
N
L
 
V
V
 
L
Q
 
E
E
 
E
K
 
N
L
 
E
P
 
L
L
 
E
W
 
R
E
 
Q
Q
 
S
Q
 
L
V
 
G
E
 
E
E
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
I
 
L
A
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
Y
A
x
C
D
 
R
L
 
L
I
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
-
W
 
E
V
 
N
D
 
K
V
 
F
E
 
Q
T
 
N
I
 
L
D
 
K
D
 
D
L
 
F
D
 
E
A
 
G
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
H
 
P
R
 
Q
L
 
L
V
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
L
 
M
M
 
K
D
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
-
D
 
N
Y
 
Y
Q
 
K
L
 
N
V
 
C
D
 
T
S
 
L
Q
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
V
T
 
A
V
 
P
K
 
R
N
 
A
E
 
N
T
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
C
D
 
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
E
x
A
T
|
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
E
M
 
V
S
 
K
D
 
-
G
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
E
S
 
S
Q
 
R
A
 
A
T
 
C
L
 
L
W
 
I
R
 
Q
S
 
K
R
 
E
V
 
N
A
 
A
K
 
-
Y
 
-
S
 
L
A
 
S
K
 
K
E
 
E
K
 
K
A
 
Q
T
 
A
L
 
L
G
 
V
D
 
D

5ubiA Catalytic core domain of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni with bound prpp (see paper)
25% identity, 96% coverage: 3:223/230 of query aligns to 4:208/218 of 5ubiA

query
sites
5ubiA
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
Q
S
 
K
K
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
M
 
S
E
 
K
K
 
E
T
 
S
F
 
I
E
 
E
W
 
L
F
 
L
A
 
S
K
 
E
R
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
L
 
M
S
x
H
R
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
I
D
x
H
R
 
E
E
 
Q
Y
 
S
A
 
L
G
 
I
A
 
A
V
 
F
A
 
S
G
 
T
I
 
N
D
 
L
G
 
P
I
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
L
L
 
R
L
 
V
S
 
R
A
x
D
G
x
D
E
 
D
M
 
I
P
 
P
R
 
G
E
 
L
L
 
I
A
 
F
A
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
V
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
T
 
E
D
 
N
L
 
V
V
 
L
Q
 
E
E
 
E
K
 
N
L
 
E
P
 
L
L
 
E
W
 
R
E
 
Q
Q
 
S
Q
 
L
V
 
G
E
 
E
E
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
I
 
L
A
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
Y
A
 
C
D
 
R
L
 
L
I
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
-
W
 
E
V
 
N
D
 
K
V
 
F
E
 
Q
T
 
N
I
 
L
D
 
K
D
 
D
L
 
F
D
 
E
A
 
G
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
H
 
P
R
 
Q
L
 
L
V
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
L
 
M
M
 
K
D
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
-
D
 
N
Y
 
Y
Q
 
K
L
 
N
V
 
C
D
 
T
S
 
L
Q
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
V
T
 
A
V
 
P
K
 
R
N
 
A
E
 
N
T
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
C
D
 
D
I
x
L
T
x
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
E
 
A
T
|
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
E
M
 
V
S
 
K
D
 
-
G
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
E
S
 
S
Q
 
R
A
 
A
T
 
C
L
 
L
W
 
I
R
 
Q
S
 
K
R
 
E
V
 
N
A
 
A
K
 
-
Y
 
-
S
 
L
A
 
S
K
 
K
E
 
E
K
 
K
A
 
Q
T
 
A
L
 
L
G
 
V
D
 
D

4yb7A Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni in complex with atp (see paper)
25% identity, 96% coverage: 3:223/230 of query aligns to 4:208/296 of 4yb7A

query
sites
4yb7A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
I
P
x
Q
S
 
K
K
 
S
G
|
G
R
|
R
L
|
L
M
 
S
E
 
K
K
 
E
T
 
S
F
 
I
E
 
E
W
 
L
F
 
L
A
 
S
K
 
E
R
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
L
 
M
S
 
H
R
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
I
D
 
H
R
 
E
E
 
Q
Y
 
S
A
 
L
G
 
I
A
 
A
V
 
F
A
 
S
G
 
T
I
 
N
D
 
L
G
 
P
I
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
L
L
 
R
L
 
V
S
x
R
A
x
D
G
x
D
E
 
D
M
 
I
P
 
P
R
 
G
E
 
L
L
 
I
A
 
F
A
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
V
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
T
 
E
D
x
N
L
 
V
V
 
L
Q
 
E
E
 
E
K
 
N
L
 
E
P
 
L
L
 
E
W
 
R
E
 
Q
Q
 
S
Q
 
L
V
 
G
E
 
E
E
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
I
 
L
A
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
|
G
H
 
Y
A
x
C
D
 
R
L
 
L
I
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
-
W
 
E
V
 
N
D
 
K
V
 
F
E
 
Q
T
 
N
I
 
L
D
 
K
D
 
D
L
 
F
D
 
E
A
 
G
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
H
 
P
R
 
Q
L
 
L
V
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
L
 
M
M
 
K
D
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
-
D
 
N
Y
 
Y
Q
 
K
L
 
N
V
 
C
D
 
T
S
 
L
Q
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
V
T
 
A
V
 
P
K
 
R
N
 
A
E
 
N
T
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
C
D
 
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
 
S
G
 
G
E
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
E
M
 
V
S
 
K
D
 
-
G
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
E
S
 
S
Q
 
R
A
 
A
T
 
C
L
 
L
W
 
I
R
 
Q
S
 
K
R
 
E
V
 
N
A
 
A
K
 
-
Y
 
-
S
 
L
A
 
S
K
 
K
E
 
E
K
 
K
A
 
Q
T
 
A
L
 
L
G
 
V
D
 
D

4yb6A Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni in complex with the inhibitors amp and histidine (see paper)
25% identity, 96% coverage: 3:223/230 of query aligns to 4:208/296 of 4yb6A

query
sites
4yb6A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
Q
S
 
K
K
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
M
 
S
E
 
K
K
 
E
T
 
S
F
 
I
E
 
E
W
 
L
F
 
L
A
 
S
K
 
E
R
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
L
 
M
S
 
H
R
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
I
D
 
H
R
 
E
E
 
Q
Y
 
S
A
 
L
G
 
I
A
 
A
V
 
F
A
 
S
G
 
T
I
 
N
D
 
L
G
 
P
I
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
L
L
 
R
L
 
V
S
 
R
A
 
D
G
 
D
E
 
D
M
 
I
P
 
P
R
 
G
E
 
L
L
 
I
A
 
F
A
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
V
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
T
 
E
D
 
N
L
 
V
V
 
L
Q
 
E
E
 
E
K
 
N
L
 
E
P
 
L
L
 
E
W
 
R
E
 
Q
Q
 
S
Q
 
L
V
 
G
E
 
E
E
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
I
 
L
A
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
Y
A
 
C
D
 
R
L
 
L
I
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
-
W
 
E
V
 
N
D
 
K
V
 
F
E
 
Q
T
 
N
I
 
L
D
 
K
D
 
D
L
 
F
D
 
E
A
 
G
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
H
 
P
R
 
Q
L
 
L
V
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
L
 
M
M
 
K
D
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
-
D
 
N
Y
 
Y
Q
 
K
L
 
N
V
 
C
D
 
T
S
 
L
Q
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
V
T
 
A
V
 
P
K
 
R
N
 
A
E
 
N
T
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
C
D
 
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
E
 
A
T
|
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
E
M
 
V
S
 
K
D
 
-
G
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
E
S
 
S
Q
 
R
A
 
A
T
 
C
L
 
L
W
 
I
R
 
Q
S
 
K
R
 
E
V
 
N
A
 
A
K
 
-
Y
 
-
S
 
L
A
 
S
K
 
K
E
 
E
K
 
K
A
 
Q
T
 
A
L
 
L
G
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

4yb6E Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni in complex with the inhibitors amp and histidine (see paper)
25% identity, 96% coverage: 3:223/230 of query aligns to 4:205/293 of 4yb6E

query
sites
4yb6E
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
Q
S
 
K
K
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
M
 
S
E
 
K
K
 
E
T
 
S
F
 
I
E
 
E
W
 
L
F
 
L
A
 
S
K
 
E
R
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
L
 
M
S
 
H
R
 
I
T
 
S
G
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
E
 
-
Y
 
-
A
 
L
G
 
I
A
 
A
V
 
F
A
 
S
G
 
T
I
 
N
D
 
L
G
 
P
I
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
L
L
 
R
L
 
V
S
 
R
A
 
D
G
 
D
E
 
D
M
 
I
P
 
P
R
 
G
E
 
L
L
 
I
A
 
F
A
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
V
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
T
 
E
D
 
N
L
 
V
V
 
L
Q
 
E
E
 
E
K
 
N
L
 
E
P
 
L
L
 
E
W
 
R
E
 
Q
Q
 
S
Q
 
L
V
 
G
E
 
E
E
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
I
 
L
A
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
Y
A
 
C
D
 
R
L
 
L
I
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
-
W
 
E
V
 
N
D
 
K
V
 
F
E
 
Q
T
 
N
I
 
L
D
 
K
D
 
D
L
 
F
D
 
E
A
 
G
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
H
 
P
R
 
Q
L
 
L
V
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
L
 
M
M
 
K
D
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
-
D
 
N
Y
 
Y
Q
 
K
L
 
N
V
 
C
D
 
T
S
 
L
Q
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
V
T
 
A
V
 
P
K
 
R
N
 
A
E
 
N
T
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
C
D
 
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
E
 
A
T
|
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
E
M
 
V
S
 
K
D
 
-
G
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
E
S
 
S
Q
 
R
A
 
A
T
 
C
L
 
L
W
 
I
R
 
Q
S
 
K
R
 
E
V
 
N
A
 
A
K
 
-
Y
 
-
S
 
L
A
 
S
K
 
K
E
 
E
K
 
K
A
 
Q
T
 
A
L
 
L
G
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

4yb7C Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni in complex with atp (see paper)
25% identity, 96% coverage: 3:223/230 of query aligns to 4:208/294 of 4yb7C

query
sites
4yb7C
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
I
P
x
Q
S
 
K
K
 
S
G
|
G
R
|
R
L
 
L
M
 
S
E
 
K
K
 
E
T
 
S
F
 
I
E
 
E
W
 
L
F
 
L
A
 
S
K
 
E
R
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
L
 
M
S
 
H
R
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
I
D
 
H
R
 
E
E
 
Q
Y
 
S
A
 
L
G
 
I
A
 
A
V
 
F
A
 
S
G
 
T
I
 
N
D
 
L
G
 
P
I
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
L
L
 
R
L
 
V
S
x
R
A
x
D
G
x
D
E
 
D
M
 
I
P
 
P
R
 
G
E
 
L
L
 
I
A
 
F
A
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
V
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
T
 
E
D
x
N
L
 
V
V
 
L
Q
 
E
E
 
E
K
 
N
L
 
E
P
 
L
L
 
E
W
 
R
E
 
Q
Q
 
S
Q
 
L
V
 
G
E
 
E
E
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
I
 
L
A
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
Y
A
x
C
D
 
R
L
 
L
I
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
-
W
 
E
V
 
N
D
 
K
V
 
F
E
 
Q
T
 
N
I
 
L
D
 
K
D
 
D
L
 
F
D
 
E
A
 
G
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
H
 
P
R
 
Q
L
 
L
V
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
F
L
 
M
M
 
K
D
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
-
D
 
N
Y
 
Y
Q
 
K
L
 
N
V
 
C
D
 
T
S
 
L
Q
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
V
T
 
A
V
 
P
K
 
R
N
 
A
E
 
N
T
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
C
D
 
D
I
x
L
T
x
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
E
 
A
T
|
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
E
M
 
V
S
 
K
D
 
-
G
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
E
S
 
S
Q
 
R
A
 
A
T
 
C
L
 
L
W
 
I
R
 
Q
S
 
K
R
 
E
V
 
N
A
 
A
K
 
-
Y
 
-
S
 
L
A
 
S
K
 
K
E
 
E
K
 
K
A
 
Q
T
 
A
L
 
L
G
 
V
D
 
D

1q1kA Structure of atp-phosphoribosyltransferase from e. Coli complexed with pr-atp (see paper)
26% identity, 99% coverage: 3:230/230 of query aligns to 3:215/288 of 1q1kA

query
sites
1q1kA
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
M
P
 
Q
S
 
K
K
 
S
G
 
G
R
|
R
L
 
L
M
 
S
E
 
D
K
 
D
T
 
S
F
 
R
E
 
E
W
 
L
F
 
L
A
 
A
K
 
R
R
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
K
L
 
I
S
 
N
R
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
L
D
 
H
R
 
T
E
 
Q
Y
 
R
A
 
L
G
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
A
G
 
E
I
 
N
D
 
M
G
 
P
I
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
L
L
 
R
L
 
V
S
 
R
A
x
D
G
x
D
E
 
D
M
 
I
P
 
P
R
 
G
E
 
L
L
 
V
A
 
M
A
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
V
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
T
 
E
D
x
N
L
x
V
V
 
L
Q
 
E
E
 
E
K
 
E
L
 
L
P
 
L
L
 
N
W
 
R
E
 
R
Q
 
A
Q
 
Q
V
 
G
E
 
E
E
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
T
I
 
L
A
 
R
G
 
R
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
G
A
x
C
D
 
R
L
 
L
I
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
T
P
 
P
Q
 
-
I
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
V
D
 
D
D
 
E
L
 
A
D
 
W
A
 
D
V
 
G
A
 
P
A
 
L
A
 
S
F
 
L
R
 
N
A
 
G
K
 
K
H
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
|
Y
H
 
P
R
 
H
L
 
L
V
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
M
 
D
D
 
Q
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
S
D
 
-
Y
 
F
Q
 
K
L
 
S
V
 
C
D
 
L
S
 
L
Q
 
N
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
|
E
G
 
V
T
 
A
V
 
P
K
 
R
N
 
A
E
 
G
T
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
C
D
 
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
|
T
G
|
G
E
x
A
T
|
T
L
 
L
R
 
E
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
R
L
 
E
M
 
V
S
 
E
D
 
-
G
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
R
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
T
 
C
L
 
L
W
 
I
R
 
Q
S
 
-
R
 
R
V
 
D
A
 
G
K
 
E
Y
 
M
S
 
E
A
 
E
K
 
S
E
 
K
K
 
Q
A
 
Q
T
 
L
L
 
I
G
 
D
D
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
T
R
 
R
L
 
I
H
 
Q
G
 
G

1h3dA Structure of the e.Coli atp-phosphoribosyltransferase (see paper)
26% identity, 99% coverage: 3:230/230 of query aligns to 3:215/288 of 1h3dA

query
sites
1h3dA
L
 
L
K
 
R
L
 
I
G
 
A
V
 
M
P
 
Q
S
 
K
K
 
S
G
 
G
R
|
R
L
 
L
M
 
S
E
 
D
K
 
D
T
 
S
F
 
R
E
 
E
W
 
L
F
 
L
A
 
A
K
 
R
R
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
K
L
 
I
S
 
N
R
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
L
D
 
H
R
 
T
E
 
Q
Y
 
R
A
 
L
G
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
A
G
 
E
I
 
N
D
 
M
G
 
P
I
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
L
L
 
R
L
 
V
S
 
R
A
 
D
G
 
D
E
 
D
M
 
I
P
 
P
R
 
G
E
 
L
L
 
V
A
 
M
A
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
V
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
T
 
E
D
 
N
L
 
V
V
 
L
Q
 
E
E
 
E
K
 
E
L
 
L
P
 
L
L
 
N
W
 
R
E
 
R
Q
 
A
Q
 
Q
V
 
G
E
 
E
E
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
T
I
 
L
A
 
R
G
 
R
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
G
A
 
C
D
 
R
L
 
L
I
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
T
P
 
P
Q
 
-
I
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
V
D
 
D
D
 
E
L
 
A
D
 
W
A
 
D
V
 
G
A
 
P
A
 
L
A
 
S
F
 
L
R
 
N
A
 
G
K
 
K
H
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
H
 
P
R
 
H
L
 
L
V
 
L
R
 
K
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
M
 
D
D
 
Q
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
S
D
 
-
Y
 
F
Q
 
K
L
 
S
V
 
C
D
 
L
S
 
L
Q
 
N
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
|
E
G
 
V
T
 
A
V
 
P
K
 
R
N
 
A
E
 
G
T
 
L
A
 
A
E
 
D
M
 
A
V
 
I
A
 
C
D
|
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
|
T
G
|
G
E
x
A
T
|
T
L
 
L
R
 
E
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
R
L
 
E
M
 
V
S
 
E
D
 
-
G
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
R
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
T
 
C
L
 
L
W
 
I
R
 
Q
S
 
-
R
 
R
V
 
D
A
 
G
K
 
E
Y
 
M
S
 
E
A
 
E
K
 
S
E
 
K
K
 
Q
A
 
Q
T
 
L
L
 
I
G
 
D
D
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
T
R
 
R
L
 
I
H
 
Q
G
 
G

6czmF Crystal structure of medicago truncatula atp-phosphoribosyltransferase in tense form (see paper)
25% identity, 99% coverage: 3:229/230 of query aligns to 3:208/315 of 6czmF

query
sites
6czmF
L
 
I
K
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
 
R
L
 
M
M
 
S
E
 
S
K
 
D
T
 
T
F
 
L
E
 
D
W
 
L
F
 
L
A
 
K
K
 
D
R
 
C
G
 
Q
I
 
L
T
 
S
L
 
V
S
 
K
R
 
Q
T
 
V
G
 
-
S
 
N
D
 
P
R
 
R
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
V
G
 
A
A
 
Q
V
 
I
A
 
P
G
 
Q
I
 
I
D
 
S
G
 
N
I
 
L
D
 
E
L
 
V
V
 
W
L
 
F
L
 
Q
S
 
R
A
 
P
G
 
K
E
 
D
M
 
I
P
 
V
R
 
R
E
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
S
G
 
-
R
 
-
I
 
L
H
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
L
D
 
D
L
 
V
V
 
L
Q
 
T
E
 
E
K
 
F
L
 
G
P
 
Q
L
 
G
W
 
N
E
 
E
Q
 
D
Q
 
L
V
 
I
E
 
V
E
 
V
I
 
H
A
 
E
G
 
A
L
 
L
G
 
E
F
 
Y
G
 
G
H
 
D
A
 
C
D
 
R
L
 
L
I
 
S
L
 
I
A
 
A
V
 
I
P
 
P
Q
 
-
I
 
-
W
 
F
V
 
E
D
 
N
V
 
V
E
 
N
T
 
S
I
 
L
D
 
E
D
 
E
L
 
L
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
Q
A
 
W
K
 
T
H
 
E
G
 
D
H
 
K
R
 
P
L
 
L
R
 
R
I
 
V
A
 
A
T
 
T
K
 
G
Y
 
F
H
 
T
R
 
Y
L
 
L
V
 
G
R
 
P
E
 
K
Y
 
F
L
 
M
M
 
K
D
 
D
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
K
D
 
H
Y
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
A
S
 
F
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
L
E
 
E
G
 
A
T
 
A
V
 
-
K
 
-
N
 
-
E
 
P
T
 
A
A
 
M
E
 
G
M
 
A
V
 
I
A
 
L
D
 
D
I
 
L
T
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
E
 
T
T
|
T
L
 
L
R
 
K
A
 
E
N
 
N
H
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
M
 
I
S
 
E
D
 
G
G
 
G
L
 
T
I
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
T
 
A
L
 
L
W
 
V
R
 
A
S
 
S
R
 
R
V
 
R
A
 
S
K
 
M
Y
 
I
S
 
G
A
 
R
K
 
K
E
 
G
K
 
V
-
 
L
A
 
E
T
 
T
L
 
T
G
 
H
D
 
E
L
 
M
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
H
 
E

Sites not aligning to the query:

6fcyA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with prpp and adp
25% identity, 80% coverage: 9:191/230 of query aligns to 9:170/208 of 6fcyA

query
sites
6fcyA
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
|
R
L
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
E
T
 
T
F
 
M
E
 
P
W
 
L
F
 
L
A
 
R
K
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
E
L
 
L
S
 
L
R
 
E
T
 
D
G
 
P
S
 
E
D
 
A
R
 
S
E
 
R
Y
 
K
A
 
L
G
 
I
A
 
F
V
 
P
A
 
T
G
 
S
I
 
N
D
 
P
G
 
N
I
 
V
D
 
R
L
 
V
V
 
L
L
 
I
L
 
L
S
 
R
A
 
A
G
 
S
E
 
D
M
 
V
P
 
P
R
 
T
E
 
Y
L
 
V
A
 
E
A
 
H
G
 
G
R
 
A
I
 
A
H
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
A
G
 
G
T
 
K
D
|
D
L
 
V
V
 
L
Q
 
L
E
 
E
K
 
H
L
 
-
P
 
-
L
 
-
W
 
G
E
 
A
Q
 
N
Q
 
H
V
 
V
E
 
Y
E
 
E
I
 
L
A
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
x
A
H
 
Q
A
x
C
D
 
K
L
 
L
I
 
M
L
 
T
A
 
A
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
I
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
G
V
 
V
A
 
K
A
 
D
A
 
A
F
 
-
R
 
-
A
 
P
K
 
L
H
 
P
G
 
N
H
 
R
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
H
 
V
R
 
N
L
 
V
V
 
A
R
 
R
E
 
A
Y
 
Y
L
 
F
M
 
A
D
 
S
A
 
Q
G
 
G
V
 
-
A
 
Q
D
 
Q
Y
 
V
Q
 
D
L
 
V
V
 
I
D
 
K
S
 
L
Q
 
Y
G
 
G
A
 
S
T
 
M
E
 
E
G
 
L
T
 
A
V
 
P
K
 
L
N
 
V
E
 
G
T
 
L
A
 
G
E
 
D
M
 
L
V
 
I
A
 
V
D
 
D
I
x
V
T
 
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
E
 
N
T
|
T
L
 
L
R
 
R
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
E

6fd9A Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with amp
25% identity, 80% coverage: 9:191/230 of query aligns to 9:170/209 of 6fd9A

query
sites
6fd9A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
|
R
L
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
E
T
 
T
F
 
M
E
 
P
W
 
L
F
 
L
A
 
R
K
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
E
L
 
L
S
 
L
R
 
E
T
 
D
G
 
P
S
 
E
D
 
A
R
 
S
E
 
R
Y
 
K
A
 
L
G
 
I
A
 
F
V
 
P
A
 
T
G
 
S
I
 
N
D
 
P
G
 
N
I
 
V
D
 
R
L
 
V
V
 
L
L
 
I
L
 
L
S
 
R
A
 
A
G
 
S
E
 
D
M
 
V
P
 
P
R
 
T
E
 
Y
L
 
V
A
 
E
A
 
H
G
 
G
R
 
A
I
 
A
H
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
A
G
 
G
T
 
K
D
 
D
L
 
V
V
 
L
Q
 
L
E
 
E
K
 
H
L
 
-
P
 
-
L
 
-
W
 
G
E
 
A
Q
 
N
Q
 
H
V
 
V
E
 
Y
E
 
E
I
 
L
A
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
x
A
H
 
Q
A
x
C
D
 
K
L
 
L
I
 
M
L
 
T
A
 
A
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
I
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
G
V
 
V
A
 
K
A
 
D
A
 
A
F
 
-
R
 
-
A
 
P
K
 
L
H
 
P
G
 
N
H
 
R
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
H
 
V
R
 
N
L
 
V
V
 
A
R
 
R
E
 
A
Y
 
Y
L
 
F
M
 
A
D
 
S
A
 
Q
G
 
G
V
 
-
A
 
Q
D
 
Q
Y
 
V
Q
 
D
L
 
V
V
 
I
D
 
K
S
 
L
Q
 
Y
G
 
G
A
 
S
T
 
M
E
 
E
G
 
L
T
 
A
V
 
P
K
 
L
N
 
V
E
 
G
T
 
L
A
 
G
E
 
D
M
 
L
V
 
I
A
 
V
D
 
D
I
x
V
T
x
V
S
x
D
T
|
T
G
 
G
E
 
N
T
|
T
L
 
L
R
 
R
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
E

6fcwA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with pratp
25% identity, 80% coverage: 9:191/230 of query aligns to 9:170/209 of 6fcwA

query
sites
6fcwA
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
|
R
L
x
I
M
 
L
E
 
E
K
 
E
T
 
T
F
 
M
E
 
P
W
 
L
F
 
L
A
 
R
K
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
E
L
 
L
S
 
L
R
 
E
T
 
D
G
 
P
S
 
E
D
 
A
R
 
S
E
 
R
Y
 
K
A
 
L
G
 
I
A
 
F
V
 
P
A
 
T
G
 
S
I
 
N
D
 
P
G
 
N
I
 
V
D
 
R
L
 
V
V
 
L
L
 
I
L
 
L
S
 
R
A
 
A
G
 
S
E
 
D
M
 
V
P
 
P
R
 
T
E
 
Y
L
 
V
A
 
E
A
 
H
G
 
G
R
 
A
I
 
A
H
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
A
G
 
G
T
 
K
D
|
D
L
 
V
V
 
L
Q
 
L
E
 
E
K
 
H
L
 
-
P
 
-
L
 
-
W
 
G
E
 
A
Q
 
N
Q
 
H
V
 
V
E
 
Y
E
 
E
I
 
L
A
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
 
A
H
 
Q
A
x
C
D
 
K
L
 
L
I
 
M
L
 
T
A
 
A
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
I
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
G
V
 
V
A
 
K
A
 
D
A
 
A
F
 
-
R
 
-
A
 
P
K
 
L
H
 
P
G
 
N
H
 
R
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
H
 
V
R
 
N
L
 
V
V
 
A
R
 
R
E
 
A
Y
 
Y
L
 
F
M
 
A
D
 
S
A
 
Q
G
 
G
V
 
-
A
 
Q
D
 
Q
Y
 
V
Q
 
D
L
 
V
V
 
I
D
 
K
S
 
L
Q
 
Y
G
 
G
A
 
S
T
 
M
E
 
E
G
 
L
T
 
A
V
 
P
K
 
L
N
 
V
E
 
G
T
 
L
A
 
G
E
 
D
M
 
L
V
 
I
A
 
V
D
|
D
I
x
V
T
 
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
E
 
N
T
|
T
L
 
L
R
 
R
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
E

6fctA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with prpp and atp
25% identity, 80% coverage: 9:191/230 of query aligns to 9:170/209 of 6fctA

query
sites
6fctA
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
|
R
L
 
I
M
 
L
E
 
E
K
 
E
T
 
T
F
 
M
E
 
P
W
 
L
F
 
L
A
 
R
K
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
E
L
 
L
S
 
L
R
 
E
T
 
D
G
 
P
S
 
E
D
 
A
R
 
S
E
 
R
Y
 
K
A
 
L
G
 
I
A
 
F
V
 
P
A
 
T
G
 
S
I
 
N
D
 
P
G
 
N
I
 
V
D
 
R
L
 
V
V
 
L
L
 
I
L
 
L
S
 
R
A
 
A
G
 
S
E
 
D
M
 
V
P
 
P
R
 
T
E
 
Y
L
 
V
A
 
E
A
 
H
G
 
G
R
 
A
I
 
A
H
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
A
G
 
G
T
 
K
D
|
D
L
 
V
V
 
L
Q
 
L
E
 
E
K
 
H
L
 
-
P
 
-
L
 
-
W
 
G
E
 
A
Q
 
N
Q
 
H
V
 
V
E
 
Y
E
 
E
I
 
L
A
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
x
A
H
 
Q
A
x
C
D
 
K
L
 
L
I
 
M
L
 
T
A
 
A
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
I
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
G
V
 
V
A
 
K
A
 
D
A
 
A
F
 
-
R
 
-
A
 
P
K
 
L
H
 
P
G
 
N
H
 
R
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
H
 
V
R
 
N
L
 
V
V
 
A
R
 
R
E
 
A
Y
 
Y
L
 
F
M
 
A
D
 
S
A
 
Q
G
 
G
V
 
-
A
 
Q
D
 
Q
Y
 
V
Q
 
D
L
 
V
V
 
I
D
 
K
S
 
L
Q
 
Y
G
 
G
A
 
S
T
 
M
E
 
E
G
 
L
T
 
A
V
 
P
K
 
L
N
 
V
E
 
G
T
 
L
A
 
G
E
 
D
M
 
L
V
 
I
A
 
V
D
 
D
I
x
V
T
x
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
E
 
N
T
|
T
L
 
L
R
 
R
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
E

Query Sequence

>GFF2940 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2940
MSLKLGVPSKGRLMEKTFEWFAKRGITLSRTGSDREYAGAVAGIDGIDLVLLSAGEMPRE
LAAGRIHLGVTGTDLVQEKLPLWEQQVEEIAGLGFGHADLILAVPQIWVDVETIDDLDAV
AAAFRAKHGHRLRIATKYHRLVREYLMDAGVADYQLVDSQGATEGTVKNETAEMVADITS
TGETLRANHLKLMSDGLILRSQATLWRSRVAKYSAKEKATLGDLLERLHG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory