SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2998 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2998 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4gfiC Crystal structure of efi-502318, an enolase family member from agrobacterium tumefaciens with homology to dipeptide epimerases (bound sodium, l-ala-l-glu with ordered loop)
57% identity, 99% coverage: 3:321/321 of query aligns to 5:327/327 of 4gfiC

query
sites
4gfiC
I
 
L
S
 
Q
V
 
A
T
 
T
P
 
T
D
 
E
T
 
R
F
 
F
K
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
G
V
 
S
F
|
F
T
 
T
I
 
I
S
 
S
R
 
R
G
 
G
S
 
T
R
|
R
T
 
T
E
 
H
A
 
A
K
 
D
V
 
V
L
 
V
T
 
T
V
 
C
R
 
T
I
 
I
I
 
R
Q
 
D
D
 
G
G
 
S
V
 
F
T
 
T
G
 
G
C
 
I
G
 
G
E
 
E
C
 
C
V
 
V
P
 
P
Y
|
Y
A
 
P
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
I
E
 
E
S
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
A
E
 
D
I
 
I
E
 
E
G
 
A
L
 
M
P
 
A
E
 
D
T
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
G
F
 
L
N
 
T
R
 
R
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
V
L
 
M
P
 
K
A
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
D
C
 
C
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
Q
 
M
A
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
A
W
 
A
E
 
E
L
 
Q
A
 
V
G
 
L
L
 
G
P
 
Q
E
 
P
P
 
A
K
 
Q
P
 
P
E
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
|
T
L
 
I
S
 
S
L
 
L
D
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
D
N
 
T
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
Q
 
K
A
 
T
A
 
A
K
 
E
N
 
N
A
 
A
H
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
L
L
 
L
K
|
K
I
 
I
K
|
K
L
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
A
D
 
D
D
 
D
M
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
R
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
A
A
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
I
D
|
D
A
 
A
N
 
N
E
 
E
G
 
G
W
 
W
-
 
N
-
 
D
-
 
D
S
 
N
A
 
I
E
 
E
V
 
Y
Y
 
Y
A
 
L
D
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
A
R
 
E
L
 
L
G
 
K
V
 
I
D
 
S
L
|
L
V
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
M
L
 
L
L
 
A
G
 
R
M
 
I
E
 
E
R
 
H
P
 
P
V
 
V
P
 
L
V
 
I
C
|
C
A
 
A
D
|
D
E
 
E
S
 
S
C
 
V
H
 
H
D
 
S
R
 
T
E
 
E
S
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
R
G
 
D
K
 
R
Y
 
Y
D
 
D
V
 
A
I
 
I
N
 
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
D
K
 
K
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
V
L
 
M
R
 
K
D
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
T
V
 
I
M
 
M
V
 
V
G
 
G
C
|
C
M
 
M
V
 
L
G
 
G
S
 
T
S
 
S
L
 
L
A
 
G
M
 
M
A
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
V
 
A
V
 
F
T
 
A
D
|
D
L
 
L
D
|
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
D
 
D
R
 
R
E
 
D
E
 
P
P
 
G
L
 
L
D
 
V
F
 
Y
D
 
E
A
 
G
D
 
S
G
 
L
V
 
V
H
 
Y
P
 
P
P
 
A
K
 
R
A
 
P
A
 
E
L
 
L
W
 
W
G
 
G

3ijqA Structure of dipeptide epimerase from bacteroides thetaiotaomicron complexed with l-ala-d-glu; productive substrate binding. (see paper)
36% identity, 94% coverage: 1:301/321 of query aligns to 1:314/337 of 3ijqA

query
sites
3ijqA
M
 
M
Q
 
K
I
 
M
S
 
T
V
 
F
T
 
F
P
 
P
D
 
Y
T
 
E
F
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
R
Q
 
H
V
 
V
F
|
F
T
 
T
I
 
V
S
 
A
R
 
T
G
 
Y
S
 
S
R
|
R
T
 
T
E
 
T
A
 
T
K
 
P
V
 
D
L
 
V
T
 
Q
V
 
V
R
 
E
I
 
I
I
 
E
Q
 
Y
D
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
A
V
 
S
P
 
M
Y
x
P
A
 
P
R
x
Y
Y
 
L
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
V
E
 
E
S
 
S
V
 
V
T
 
M
-
 
N
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
K
A
 
V
E
 
N
I
 
L
E
 
E
G
 
Q
L
 
F
P
 
S
E
 
D
T
 
P
F
 
F
N
 
Q
R
 
L
A
 
E
E
 
D
L
 
I
Q
 
L
S
 
S
L
 
Y
L
 
V
P
 
D
A
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
K
-
 
D
G
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
H
D
 
D
L
 
L
E
 
V
A
 
G
K
 
K
Q
 
L
A
 
L
G
 
G
K
 
A
R
 
P
V
 
W
W
 
Y
E
 
K
L
 
I
A
 
W
G
 
G
L
 
L
P
 
N
E
 
K
P
 
E
K
 
K
P
 
T
E
 
P
I
 
S
T
 
T
A
 
T
Y
 
F
T
|
T
L
 
I
S
 
G
L
 
I
D
 
D
S
 
T
P
 
P
E
 
D
N
 
V
M
 
V
Q
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
T
A
 
K
K
 
E
N
 
C
A
 
A
H
 
G
-
 
L
R
 
F
P
 
N
L
 
I
L
|
L
K
|
K
I
 
V
K
|
K
L
 
L
G
 
G
T
 
R
A
 
D
D
 
N
D
 
D
M
 
K
A
 
E
R
 
M
L
 
I
E
 
E
A
 
T
V
 
I
R
 
R
A
 
S
G
 
-
A
 
V
P
 
T
E
 
D
A
 
L
R
 
P
I
 
I
I
 
A
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
G
W
 
W
S
 
K
A
 
D
E
 
R
V
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
-
 
L
D
 
D
L
 
M
A
 
I
P
 
H
H
 
W
L
 
L
V
 
K
R
 
E
L
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
V
L
 
M
V
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
M
P
 
P
A
 
K
G
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
D
D
 
D
A
 
I
A
 
A
L
 
W
L
 
V
G
 
T
M
 
Q
E
 
Q
R
 
S
P
 
P
V
 
L
P
 
P
V
 
V
C
 
F
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
 
S
C
 
L
H
 
Q
D
 
R
R
 
L
E
 
G
S
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
K
G
 
G
K
 
A
Y
 
F
D
 
T
V
 
G
I
 
I
N
 
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
C
G
 
T
G
 
G
L
 
M
T
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
W
K
 
K
L
 
M
R
 
V
D
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
H
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
R
V
 
V
M
 
M
V
 
V
G
|
G
C
|
C
M
|
M
V
 
T
G
 
E
S
 
T
S
 
S
L
 
C
A
 
A
M
 
I
A
 
S
P
 
A
A
 
A
T
 
S
L
 
Q
V
 
F
A
 
S
Q
 
P
G
 
A
A
 
V
V
x
D
V
 
F
T
x
A
D
|
D
L
|
L
D
|
D
G
 
G
P
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
I
A
 
S
E
 
N
D
 
D
R
 
R

Q8A861 L-Ala-D/L-Glu epimerase; AE epimerase; AEE; EC 5.1.1.20 from Bacteroides thetaiotaomicron (strain ATCC 29148 / DSM 2079 / JCM 5827 / CCUG 10774 / NCTC 10582 / VPI-5482 / E50) (see paper)
36% identity, 94% coverage: 1:301/321 of query aligns to 46:359/383 of Q8A861

query
sites
Q8A861
M
 
M
Q
 
K
I
 
M
S
 
T
V
 
F
T
 
F
P
 
P
D
 
Y
T
 
E
F
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
R
Q
 
H
V
 
V
F
 
F
T
 
T
I
 
V
S
 
A
R
 
T
G
 
Y
S
 
S
R
 
R
T
 
T
E
 
T
A
 
T
K
 
P
V
 
D
L
 
V
T
 
Q
V
 
V
R
 
E
I
 
I
I
 
E
Q
 
Y
D
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
A
V
 
S
P
 
M
Y
 
P
A
 
P
R
 
Y
Y
 
L
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
V
E
 
E
S
 
S
V
 
V
T
 
M
-
 
N
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
K
A
 
V
E
 
N
I
 
L
E
 
E
G
 
Q
L
 
F
P
 
S
E
 
D
T
 
P
F
 
F
N
 
Q
R
 
L
A
 
E
E
 
D
L
 
I
Q
 
L
S
 
S
L
 
Y
L
 
V
P
 
D
A
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
K
-
 
D
G
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
H
D
 
D
L
 
L
E
 
V
A
 
G
K
 
K
Q
 
L
A
 
L
G
 
G
K
 
A
R
 
P
V
 
W
W
 
Y
E
 
K
L
 
I
A
 
W
G
 
G
L
 
L
P
 
N
E
 
K
P
 
E
K
 
K
P
 
T
E
 
P
I
 
S
T
 
T
A
 
T
Y
 
F
T
 
T
L
 
I
S
 
G
L
 
I
D
 
D
S
 
T
P
 
P
E
 
D
N
 
V
M
 
V
Q
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
T
A
 
K
K
 
E
N
 
C
A
 
A
H
 
G
-
 
L
R
 
F
P
 
N
L
 
I
L
 
L
K
 
K
I
 
V
K
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
R
A
 
D
D
 
N
D
 
D
M
 
K
A
 
E
R
 
M
L
 
I
E
 
E
A
 
T
V
 
I
R
 
R
A
 
S
G
 
-
A
 
V
P
 
T
E
 
D
A
 
L
R
 
P
I
 
I
I
 
A
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
 
N
E
 
Q
G
 
G
W
 
W
S
 
K
A
 
D
E
 
R
V
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
-
 
L
D
 
D
L
 
M
A
 
I
P
 
H
H
 
W
L
 
L
V
 
K
R
 
E
L
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
V
L
 
M
V
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
M
P
 
P
A
 
K
G
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
D
D
 
D
A
 
I
A
 
A
L
 
W
L
 
V
G
 
T
M
 
Q
E
 
Q
R
 
S
P
 
P
V
 
L
P
 
P
V
 
V
C
 
F
A
 
A
D
|
D
E
 
E
S
 
S
C
 
L
H
 
Q
D
 
R
R
 
L
E
 
G
S
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
K
G
 
G
K
 
A
Y
 
F
D
 
T
V
 
G
I
 
I
N
 
N
I
 
I
K
 
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
C
G
 
T
G
 
G
L
 
M
T
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
W
K
 
K
L
 
M
R
 
V
D
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
H
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
R
V
 
V
M
 
M
V
 
V
G
 
G
C
 
C
M
 
M
V
 
T
G
 
E
S
 
T
S
 
S
L
 
C
A
 
A
M
 
I
A
 
S
P
 
A
A
 
A
T
 
S
L
 
Q
V
 
F
A
 
S
Q
 
P
G
 
A
A
 
V
V
 
D
V
 
F
T
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
D
G
 
G
P
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
I
A
 
S
E
 
N
D
 
D
R
 
R

3ijlA Structure of dipeptide epimerase from bacteroides thetaiotaomicron complexed with l-pro-d-glu; nonproductive substrate binding. (see paper)
36% identity, 93% coverage: 2:301/321 of query aligns to 1:313/336 of 3ijlA

query
sites
3ijlA
Q
 
K
I
 
M
S
 
T
V
 
F
T
 
F
P
 
P
D
 
Y
T
 
E
F
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
R
Q
 
H
V
 
V
F
|
F
T
 
T
I
x
V
S
 
A
R
 
T
G
 
Y
S
 
S
R
|
R
T
 
T
E
 
T
A
 
T
K
 
P
V
 
D
L
 
V
T
 
Q
V
 
V
R
 
E
I
 
I
I
 
E
Q
 
Y
D
 
E
G
 
G
V
 
V
T
 
T
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
A
V
 
S
P
 
M
Y
x
P
A
 
P
R
x
Y
Y
 
L
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
V
E
 
E
S
 
S
V
 
V
T
 
M
-
 
N
-
 
F
-
 
L
-
 
K
-
 
K
A
 
V
E
 
N
I
 
L
E
 
E
G
 
Q
L
 
F
P
 
S
E
 
D
T
 
P
F
 
F
N
 
Q
R
 
L
A
 
E
E
 
D
L
 
I
Q
 
L
S
 
S
L
 
Y
L
 
V
P
 
D
A
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
P
-
 
K
-
 
D
G
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
H
D
 
D
L
 
L
E
 
V
A
 
G
K
 
K
Q
 
L
A
 
L
G
 
G
K
 
A
R
 
P
V
 
W
W
 
Y
E
 
K
L
 
I
A
 
W
G
 
G
L
 
L
P
 
N
E
 
K
P
 
E
K
 
K
P
 
T
E
 
P
I
 
S
T
 
T
A
 
T
Y
 
F
T
|
T
L
 
I
S
 
G
L
 
I
D
 
D
S
 
T
P
 
P
E
 
D
N
 
V
M
 
V
Q
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
T
A
 
K
K
 
E
N
 
C
A
 
A
H
 
G
-
 
L
R
 
F
P
 
N
L
 
I
L
|
L
K
|
K
I
 
V
K
|
K
L
 
L
G
 
G
T
 
R
A
 
D
D
 
N
D
 
D
M
 
K
A
 
E
R
 
M
L
 
I
E
 
E
A
 
T
V
 
I
R
 
R
A
 
S
G
 
-
A
 
V
P
 
T
E
 
D
A
 
L
R
 
P
I
 
I
I
 
A
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
G
W
 
W
S
 
K
A
 
D
E
 
R
V
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
-
 
L
D
 
D
L
 
M
A
 
I
P
 
H
H
 
W
L
 
L
V
 
K
R
 
E
L
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
V
L
 
M
V
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
M
P
 
P
A
 
K
G
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
D
D
 
D
A
 
I
A
 
A
L
 
W
L
 
V
G
 
T
M
 
Q
E
 
Q
R
 
S
P
 
P
V
 
L
P
 
P
V
 
V
C
 
F
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
 
S
C
 
L
H
 
Q
D
 
R
R
 
L
E
 
G
S
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
K
G
 
G
K
 
A
Y
 
F
D
 
T
V
 
G
I
 
I
N
 
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
C
G
 
T
G
 
G
L
 
M
T
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
W
K
 
K
L
 
M
R
 
V
D
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
H
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
F
 
M
E
 
R
V
 
V
M
 
M
V
 
V
G
|
G
C
|
C
M
|
M
V
 
T
G
 
E
S
 
T
S
 
S
L
 
C
A
 
A
M
 
I
A
 
S
P
 
A
A
 
A
T
 
S
L
 
Q
V
 
F
A
 
S
Q
 
P
G
 
A
A
 
V
V
x
D
V
 
F
T
x
A
D
|
D
L
|
L
D
|
D
G
 
G
P
 
N
L
 
L
L
|
L
L
 
I
A
 
S
E
 
N
D
 
D
R
 
R

3q4dA Crystal structure of dipeptide epimerase from cytophaga hutchinsonii complexed with mg and dipeptide d-ala-l-ala (see paper)
30% identity, 93% coverage: 2:300/321 of query aligns to 5:328/368 of 3q4dA

query
sites
3q4dA
Q
 
Q
I
 
V
S
 
E
V
 
L
T
 
Y
P
 
K
D
 
S
T
 
P
F
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
V
 
P
F
|
F
T
 
K
I
 
I
S
 
S
R
 
L
G
 
G
S
 
I
R
 
L
T
 
T
E
 
H
A
 
A
K
 
N
V
 
N
L
 
V
T
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
I
-
 
H
I
 
T
Q
 
A
D
 
S
G
 
G
V
 
H
T
 
I
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
C
V
 
S
P
|
P
Y
 
F
A
 
M
R
x
T
-
 
I
Y
 
H
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
M
E
 
D
S
 
-
V
 
-
T
 
T
A
 
A
E
 
F
I
 
I
E
 
V
G
 
G
-
 
Q
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
S
-
 
C
L
 
L
P
 
D
E
 
I
T
 
V
F
 
S
N
 
N
R
 
S
A
 
L
E
 
L
L
 
M
Q
 
D
S
 
A
L
 
I
L
 
I
P
 
Y
A
 
G
G
 
N
A
 
S
A
 
C
-
 
I
R
 
K
N
 
S
A
 
A
V
 
F
D
 
N
C
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
A
A
 
A
K
 
Q
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
K
 
L
R
 
P
V
 
L
W
 
Y
E
 
A
L
 
F
A
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
K
E
 
K
P
 
D
K
 
K
P
 
I
E
 
I
I
 
Q
T
 
T
A
 
D
Y
 
Y
T
|
T
L
 
V
S
 
S
L
 
I
D
 
D
S
 
E
P
 
P
E
 
H
N
 
K
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
V
Q
 
Q
A
 
I
A
 
K
K
 
K
N
 
N
A
 
G
H
 
F
R
 
E
P
 
-
L
 
I
L
 
I
K
|
K
I
 
V
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
G
A
 
S
D
 
K
-
 
E
-
 
L
D
 
D
M
 
V
A
 
E
R
 
R
L
 
I
E
 
R
A
 
M
V
 
I
R
 
R
A
 
E
G
 
A
A
 
A
P
 
G
E
 
D
A
 
S
R
 
I
I
 
T
I
 
L
-
 
R
V
 
I
D
|
D
A
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
G
W
 
W
S
 
S
A
 
V
E
 
E
V
 
T
Y
 
A
A
 
I
D
 
E
L
 
T
A
 
L
P
 
T
H
 
L
L
 
L
V
 
E
R
 
P
L
 
Y
G
 
N
V
 
I
D
 
Q
L
 
H
V
 
C
E
|
E
Q
 
E
P
 
P
L
 
V
P
 
S
A
 
R
G
 
N
E
 
L
D
 
Y
A
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
P
G
 
K
M
 
I
E
 
R
R
 
Q
P
 
A
-
 
C
-
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
C
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
|
S
C
 
C
-
 
C
-
 
N
-
 
S
H
 
F
D
 
D
R
 
A
E
 
E
S
 
R
L
 
L
A
 
I
A
 
Q
L
 
I
E
 
Q
G
 
A
K
 
-
Y
 
C
D
 
D
V
 
S
I
 
F
N
 
N
I
 
L
K
|
K
L
 
L
D
 
S
K
 
K
T
 
S
G
 
A
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
N
A
 
A
L
 
L
K
 
N
L
 
I
R
 
I
D
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
E
A
 
Q
Q
 
A
G
 
H
F
 
M
E
 
P
V
 
V
M
 
Q
V
 
V
G
|
G
C
x
G
M
x
F
V
 
L
G
 
E
S
 
S
S
 
R
L
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
T
A
 
A
M
 
A
A
 
A
P
 
H
A
 
V
T
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
S
Q
 
K
G
 
T
A
 
I
V
 
C
V
 
Y
T
x
Y
D
|
D
L
x
F
D
|
D
G
x
T
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
F
A
 
E
E
 
A
D
 
D

3q45A Crystal structure of dipeptide epimerase from cytophaga hutchinsonii complexed with mg and dipeptide d-ala-l-val (see paper)
30% identity, 93% coverage: 2:300/321 of query aligns to 5:328/368 of 3q45A

query
sites
3q45A
Q
 
Q
I
 
V
S
 
E
V
 
L
T
 
Y
P
 
K
D
 
S
T
 
P
F
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
V
 
P
F
|
F
T
 
K
I
 
I
S
 
S
R
 
L
G
 
G
S
 
I
R
 
L
T
 
T
E
 
H
A
 
A
K
 
N
V
 
N
L
 
V
T
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
I
-
 
H
I
 
T
Q
 
A
D
 
S
G
 
G
V
 
H
T
 
I
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
C
V
 
S
P
|
P
Y
 
F
A
 
M
R
x
T
-
 
I
Y
 
H
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
M
E
 
D
S
 
-
V
 
-
T
 
T
A
 
A
E
 
F
I
 
I
E
 
V
G
 
G
-
 
Q
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
S
-
 
C
L
 
L
P
 
D
E
 
I
T
 
V
F
 
S
N
 
N
R
 
S
A
 
L
E
 
L
L
 
M
Q
 
D
S
 
A
L
 
I
L
 
I
P
 
Y
A
 
G
G
 
N
A
 
S
A
 
C
-
 
I
R
 
K
N
 
S
A
 
A
V
 
F
D
 
N
C
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
A
A
 
A
K
 
Q
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
K
 
L
R
 
P
V
 
L
W
 
Y
E
 
A
L
 
F
A
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
K
E
 
K
P
 
D
K
 
K
P
 
I
E
 
I
I
 
Q
T
 
T
A
 
D
Y
 
Y
T
|
T
L
 
V
S
 
S
L
 
I
D
 
D
S
 
E
P
 
P
E
 
H
N
 
K
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
V
Q
 
Q
A
 
I
A
 
K
K
 
K
N
 
N
A
 
G
H
 
F
R
 
E
P
 
-
L
 
I
L
 
I
K
|
K
I
 
V
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
G
A
 
S
D
 
K
-
 
E
-
 
L
D
 
D
M
 
V
A
 
E
R
 
R
L
 
I
E
 
R
A
 
M
V
 
I
R
 
R
A
 
E
G
 
A
A
 
A
P
 
G
E
 
D
A
 
S
R
 
I
I
 
T
I
 
L
-
 
R
V
 
I
D
|
D
A
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
G
W
 
W
S
 
S
A
 
V
E
 
E
V
 
T
Y
 
A
A
 
I
D
 
E
L
 
T
A
 
L
P
 
T
H
 
L
L
 
L
V
 
E
R
 
P
L
 
Y
G
 
N
V
 
I
D
 
Q
L
 
H
V
 
C
E
|
E
Q
 
E
P
 
P
L
 
V
P
 
S
A
 
R
G
 
N
E
 
L
D
 
Y
A
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
P
G
 
K
M
 
I
E
 
R
R
 
Q
P
 
A
-
 
C
-
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
C
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
|
S
C
 
C
-
 
C
-
 
N
-
 
S
H
 
F
D
 
D
R
 
A
E
 
E
S
 
R
L
 
L
A
 
I
A
 
Q
L
 
I
E
 
Q
G
 
A
K
 
-
Y
 
C
D
 
D
V
 
S
I
 
F
N
 
N
I
 
L
K
|
K
L
 
L
D
 
S
K
 
K
T
 
S
G
 
A
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
N
A
 
A
L
 
L
K
 
N
L
 
I
R
 
I
D
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
E
A
 
Q
Q
 
A
G
 
H
F
 
M
E
 
P
V
 
V
M
 
Q
V
 
V
G
|
G
C
x
G
M
x
F
V
 
L
G
 
E
S
 
S
S
 
R
L
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
T
A
 
A
M
 
A
A
 
A
P
 
H
A
 
V
T
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
S
Q
 
K
G
 
T
A
 
I
V
 
C
V
 
Y
T
x
Y
D
|
D
L
x
F
D
|
D
G
x
T
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
F
A
 
E
E
 
A
D
 
D

1tkkA The structure of a substrate-liganded complex of the l-ala-d/l-glu epimerase from bacillus subtilis (see paper)
32% identity, 90% coverage: 12:300/321 of query aligns to 15:331/359 of 1tkkA

query
sites
1tkkA
L
 
L
A
 
T
Q
 
K
V
 
P
F
|
F
T
 
K
I
 
T
S
 
A
R
 
L
G
x
R
S
 
T
R
 
V
T
 
Y
E
 
T
A
 
A
K
 
E
V
 
S
L
 
V
T
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
I
I
 
T
Q
 
Y
D
 
D
-
 
S
G
 
G
V
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
W
G
 
G
E
 
E
C
 
A
V
 
P
P
|
P
-
 
T
Y
 
L
A
x
V
R
 
I
Y
 
T
G
 
G
E
 
D
T
 
S
L
 
M
E
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
E
A
 
S
E
 
A
I
 
I
E
 
H
G
 
H
L
 
V
-
 
L
-
 
K
P
 
P
E
 
A
T
 
L
F
 
L
N
 
G
R
 
K
A
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
L
-
 
H
E
 
D
L
 
I
Q
 
Q
S
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
T
A
 
G
G
 
N
-
 
M
A
 
S
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
E
C
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
Y
D
 
D
L
 
G
E
 
W
A
 
A
K
 
Q
Q
 
M
A
 
C
G
 
G
K
 
L
R
 
P
V
 
L
W
 
Y
E
 
Q
L
 
M
A
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
Y
E
 
R
P
 
D
K
 
T
P
 
L
E
 
E
I
 
-
T
 
T
A
 
D
Y
 
Y
T
|
T
L
 
V
S
 
S
L
 
V
D
 
N
S
 
S
P
 
P
E
 
E
N
 
E
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
A
 
E
K
 
N
N
 
Y
A
 
L
H
 
K
R
 
Q
P
 
G
L
 
F
-
 
Q
-
 
T
L
 
L
K
|
K
I
 
I
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
K
A
 
D
D
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
T
D
 
D
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
I
E
 
Q
A
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
K
G
 
R
A
 
V
P
 
G
E
 
S
A
 
A
-
 
V
R
 
K
I
 
L
I
 
R
V
x
L
D
|
D
A
|
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
G
W
 
W
S
 
R
A
 
P
E
 
K
-
 
E
-
 
A
V
 
V
Y
 
T
A
 
A
D
 
I
L
 
R
A
 
K
P
 
M
H
 
E
L
 
D
V
 
A
R
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
E
L
 
L
V
 
V
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
H
A
 
K
G
 
D
E
 
D
D
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
K
G
 
K
M
 
V
E
 
T
-
 
D
-
 
A
R
 
T
P
 
D
V
 
T
P
 
P
V
 
I
C
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
|
S
C
 
V
H
 
F
D
 
T
-
 
P
R
 
R
E
 
Q
S
 
A
L
 
F
A
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
Q
G
 
T
K
 
R
Y
 
S
-
 
A
D
 
D
V
 
L
I
 
I
N
|
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
S
E
 
G
A
 
A
L
 
E
K
 
K
L
 
I
R
 
N
D
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
C
G
 
G
F
 
V
E
 
E
V
 
C
M
 
M
V
 
V
G
|
G
C
x
S
M
|
M
V
x
I
G
 
E
S
 
T
S
 
K
L
 
L
A
 
G
M
 
I
-
 
T
A
 
A
P
 
A
A
 
A
T
 
H
L
 
F
V
 
A
A
 
A
Q
 
S
G
 
K
A
 
R
V
 
N
V
 
I
T
 
T
-
 
R
-
x
F
D
|
D
L
x
F
D
|
D
G
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
T
D
 
D

1jpmA L-ala-d/l-glu epimerase (see paper)
32% identity, 90% coverage: 12:300/321 of query aligns to 15:331/359 of 1jpmA

query
sites
1jpmA
L
 
L
A
 
T
Q
 
K
V
 
P
F
|
F
T
 
K
I
 
T
S
 
A
R
 
L
G
 
R
S
 
T
R
 
V
T
 
Y
E
 
T
A
 
A
K
 
E
V
 
S
L
 
V
T
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
I
I
 
T
Q
 
Y
D
 
D
-
 
S
G
 
G
V
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
W
G
 
G
E
 
E
C
 
A
V
 
P
P
|
P
-
 
T
Y
 
L
A
x
V
R
 
I
Y
 
T
G
 
G
E
 
D
T
 
S
L
 
M
E
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
E
A
 
S
E
 
A
I
 
I
E
 
H
G
 
H
L
 
V
-
 
L
-
 
K
P
 
P
E
 
A
T
 
L
F
 
L
N
 
G
R
 
K
A
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
L
-
 
H
E
 
D
L
 
I
Q
 
Q
S
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
T
A
 
G
G
 
N
-
 
M
A
 
S
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
E
C
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
Y
D
 
D
L
 
G
E
 
W
A
 
A
K
 
Q
Q
 
M
A
 
C
G
 
G
K
 
L
R
 
P
V
 
L
W
 
Y
E
 
Q
L
 
M
A
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
Y
E
 
R
P
 
D
K
 
T
P
 
L
E
 
E
I
 
-
T
 
T
A
 
D
Y
 
Y
T
|
T
L
 
V
S
 
S
L
 
V
D
 
N
S
 
S
P
 
P
E
 
E
N
 
E
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
A
 
E
K
 
N
N
 
Y
A
 
L
H
 
K
R
 
Q
P
 
G
L
 
F
-
 
Q
-
 
T
L
 
L
K
|
K
I
 
I
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
K
A
 
D
D
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
T
D
 
D
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
I
E
 
Q
A
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
K
G
 
R
A
 
V
P
 
G
E
 
S
A
 
A
-
 
V
R
 
K
I
 
L
I
 
R
V
x
L
D
|
D
A
|
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
G
W
 
W
S
 
R
A
 
P
E
 
K
-
 
E
-
 
A
V
 
V
Y
 
T
A
 
A
D
 
I
L
 
R
A
 
K
P
 
M
H
 
E
L
 
D
V
 
A
R
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
E
L
 
L
V
 
V
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
H
A
 
K
G
 
D
E
 
D
D
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
K
G
 
K
M
 
V
E
 
T
-
 
D
-
 
A
R
 
T
P
 
D
V
 
T
P
 
P
V
 
I
C
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
|
S
C
 
V
H
 
F
D
 
T
-
 
P
R
 
R
E
 
Q
S
 
A
L
 
F
A
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
Q
G
 
T
K
 
R
Y
 
S
-
 
A
D
 
D
V
 
L
I
 
I
N
|
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
S
E
 
G
A
 
A
L
 
E
K
 
K
L
 
I
R
 
N
D
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
C
G
 
G
F
 
V
E
 
E
V
 
C
M
 
M
V
 
V
G
|
G
C
x
S
M
|
M
V
 
I
G
 
E
S
 
T
S
 
K
L
 
L
A
 
G
M
 
I
-
 
T
A
 
A
P
 
A
A
 
A
T
 
H
L
 
F
V
 
A
A
 
A
Q
 
S
G
 
K
A
 
R
V
 
N
V
 
I
T
 
T
-
 
R
-
x
F
D
|
D
L
x
F
D
 
D
G
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
T
D
 
D

O34508 L-Ala-D/L-Glu epimerase; AE epimerase; AEE; EC 5.1.1.20 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 2 papers)
32% identity, 90% coverage: 12:300/321 of query aligns to 15:331/366 of O34508

query
sites
O34508
L
 
L
A
 
T
Q
 
K
V
 
P
F
 
F
T
 
K
I
 
T
S
 
A
R
 
L
G
x
R
S
 
T
R
 
V
T
 
Y
E
 
T
A
 
A
K
 
E
V
 
S
L
 
V
T
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
I
I
 
T
Q
 
Y
D
 
D
-
 
S
G
 
G
V
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
W
G
 
G
E
 
E
C
 
A
V
 
P
P
 
P
-
 
T
Y
 
L
A
 
V
R
 
I
Y
 
T
G
 
G
E
 
D
T
 
S
L
 
M
E
 
D
S
 
S
V
 
I
T
 
E
A
 
S
E
 
A
I
 
I
E
 
H
G
 
H
L
 
V
-
 
L
-
 
K
P
 
P
E
 
A
T
 
L
F
 
L
N
 
G
R
 
K
A
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
L
-
 
H
E
 
D
L
 
I
Q
 
Q
S
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
T
A
 
G
G
 
N
-
 
M
A
 
S
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
E
C
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
Y
D
 
D
L
 
G
E
 
W
A
 
A
K
 
Q
Q
 
M
A
 
C
G
 
G
K
 
L
R
 
P
V
 
L
W
 
Y
E
 
Q
L
 
M
A
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
Y
E
 
R
P
 
D
K
 
T
P
 
L
E
 
E
I
 
-
T
 
T
A
 
D
Y
 
Y
T
|
T
L
 
V
S
 
S
L
 
V
D
 
N
S
 
S
P
 
P
E
 
E
N
 
E
M
 
M
Q
 
A
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
A
 
E
K
 
N
N
 
Y
A
 
L
H
 
K
R
 
Q
P
 
G
L
 
F
-
 
Q
-
 
T
L
 
L
K
|
K
I
 
I
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
K
A
 
D
D
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
T
D
 
D
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
I
E
 
Q
A
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
K
G
 
R
A
 
V
P
 
G
E
 
S
A
 
A
-
 
V
R
 
K
I
 
L
I
 
R
V
 
L
D
|
D
A
 
A
N
 
N
E
 
Q
G
 
G
W
 
W
S
 
R
A
 
P
E
 
K
-
 
E
-
 
A
V
 
V
Y
 
T
A
 
A
D
 
I
L
 
R
A
 
K
P
 
M
H
 
E
L
 
D
V
 
A
R
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
E
L
 
L
V
 
V
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
H
A
 
K
G
 
D
E
 
D
D
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
K
G
 
K
M
 
V
E
 
T
-
 
D
-
 
A
R
 
T
P
 
D
V
 
T
P
 
P
V
 
I
C
 
M
A
 
A
D
|
D
E
 
E
S
 
S
C
 
V
H
 
F
D
 
T
-
 
P
R
 
R
E
 
Q
S
 
A
L
 
F
A
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
Q
G
 
T
K
 
R
Y
 
S
-
 
A
D
 
D
V
 
L
I
 
I
N
 
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
S
E
 
G
A
 
A
L
 
E
K
 
K
L
 
I
R
 
N
D
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
C
G
 
G
F
 
V
E
 
E
V
 
C
M
 
M
V
 
V
G
 
G
C
x
S
M
 
M
V
x
I
G
 
E
S
 
T
S
 
K
L
 
L
A
 
G
M
 
I
-
 
T
A
 
A
P
 
A
A
 
A
T
 
H
L
 
F
V
 
A
A
 
A
Q
 
S
G
 
K
A
 
R
V
 
N
V
 
I
T
 
T
-
 
R
-
 
F
D
|
D
L
 
F
D
|
D
G
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
T
D
 
D

3kumA Crystal structure of dipeptide epimerase from enterococcus faecalis v583 complexed with mg and dipeptide l-arg-l-tyr (see paper)
33% identity, 83% coverage: 2:269/321 of query aligns to 5:293/354 of 3kumA

query
sites
3kumA
Q
 
Q
I
 
V
S
 
H
V
 
V
T
 
R
P
 
A
D
 
S
T
 
K
F
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
V
 
T
F
|
F
T
 
T
I
|
I
S
 
A
R
 
L
G
 
G
S
 
T
R
 
I
T
 
E
E
 
S
A
 
A
K
 
D
V
 
S
L
 
A
T
 
I
V
 
V
R
 
E
I
 
I
-
 
E
I
 
T
Q
 
E
D
 
E
G
 
G
V
 
L
T
 
V
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
G
V
 
G
P
|
P
-
 
G
Y
 
I
A
x
F
R
x
I
Y
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
A
S
 
G
V
 
T
T
 
L
A
 
E
E
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
L
L
 
F
P
 
G
E
 
Q
T
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
P
F
 
F
N
 
N
R
 
I
A
 
E
E
 
K
L
 
I
Q
 
H
S
 
E
L
 
V
L
 
M
-
 
D
-
 
K
-
 
I
-
 
S
-
 
A
P
 
F
A
 
A
G
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
C
W
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
M
A
 
G
K
 
Q
Q
 
K
A
 
A
G
 
Q
K
 
L
R
 
P
V
 
L
W
 
Y
E
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
Y
E
 
D
P
 
N
K
 
Q
P
 
V
E
 
-
I
 
I
T
 
T
A
 
D
Y
 
I
T
|
T
L
 
L
S
 
G
L
 
I
D
 
D
S
 
E
P
 
P
E
 
N
N
 
V
M
 
M
Q
 
A
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
E
N
 
K
A
 
V
H
 
K
R
 
L
P
 
G
L
 
F
-
 
D
-
 
T
L
 
L
K
|
K
I
 
I
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
A
 
G
-
 
I
-
 
E
D
 
A
D
 
D
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
V
E
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
R
-
 
E
A
 
A
G
 
V
A
 
G
P
 
F
E
 
D
A
 
I
R
 
K
I
 
L
I
 
R
V
 
L
D
|
D
A
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
A
W
 
W
S
 
T
A
 
P
E
 
K
V
 
D
Y
 
A
A
 
V
D
 
K
L
 
A
A
 
I
P
 
Q
H
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
D
L
 
Y
G
 
Q
V
 
I
D
 
E
L
 
L
V
 
V
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
K
A
 
R
G
 
R
E
 
D
D
 
L
A
 
E
A
 
G
L
 
L
L
 
K
G
 
Y
M
 
V
E
 
T
R
 
S
P
 
Q
V
 
V
-
 
N
-
 
T
P
 
T
V
 
I
C
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
|
S
C
 
C
H
 
F
D
 
D
R
 
A
E
 
Q
S
 
D
L
 
A
A
 
L
A
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
K
E
 
K
G
 
G
K
 
T
Y
 
V
D
 
D
V
 
V
I
 
I
N
|
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
I
R
 
N
D
 
Q
A
 
I
A
 
C
L
 
E
A
 
T
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
C
M
 
M
V
 
I
G
|
G
C
|
C
M
|
M

Sites not aligning to the query:

3k1gA Crystal structure of dipeptide epimerase from enterococcus faecalis v583 complexed with mg and dipeptide l-ser-l-tyr (see paper)
33% identity, 83% coverage: 2:269/321 of query aligns to 5:293/354 of 3k1gA

query
sites
3k1gA
Q
 
Q
I
 
V
S
 
H
V
 
V
T
 
R
P
 
A
D
 
S
T
 
K
F
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
V
 
T
F
|
F
T
 
T
I
|
I
S
 
A
R
 
L
G
 
G
S
 
T
R
 
I
T
 
E
E
 
S
A
 
A
K
 
D
V
 
S
L
 
A
T
 
I
V
 
V
R
 
E
I
 
I
-
 
E
I
 
T
Q
 
E
D
 
E
G
 
G
V
 
L
T
 
V
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
G
V
 
G
P
|
P
-
 
G
Y
 
I
A
x
F
R
 
I
Y
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
A
S
 
G
V
 
T
T
 
L
A
 
E
E
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
L
L
 
F
P
 
G
E
 
Q
T
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
P
F
 
F
N
 
N
R
 
I
A
 
E
E
 
K
L
 
I
Q
 
H
S
 
E
L
 
V
L
 
M
-
 
D
-
 
K
-
 
I
-
 
S
-
 
A
P
 
F
A
 
A
G
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
C
W
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
M
A
 
G
K
 
Q
Q
 
K
A
 
A
G
 
Q
K
 
L
R
 
P
V
 
L
W
 
Y
E
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
Y
E
 
D
P
 
N
K
 
Q
P
 
V
E
 
-
I
 
I
T
 
T
A
 
D
Y
 
I
T
|
T
L
 
L
S
 
G
L
 
I
D
 
D
S
 
E
P
 
P
E
 
N
N
 
V
M
 
M
Q
 
A
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
E
N
 
K
A
 
V
H
 
K
R
 
L
P
 
G
L
 
F
-
 
D
-
 
T
L
 
L
K
|
K
I
 
I
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
A
 
G
-
 
I
-
 
E
D
 
A
D
 
D
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
V
E
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
R
-
 
E
A
 
A
G
 
V
A
 
G
P
 
F
E
 
D
A
 
I
R
 
K
I
 
L
I
 
R
V
 
L
D
|
D
A
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
A
W
 
W
S
 
T
A
 
P
E
 
K
V
 
D
Y
 
A
A
 
V
D
 
K
L
 
A
A
 
I
P
 
Q
H
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
D
L
 
Y
G
 
Q
V
 
I
D
 
E
L
 
L
V
 
V
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
K
A
 
R
G
 
R
E
 
D
D
 
L
A
 
E
A
 
G
L
 
L
L
 
K
G
 
Y
M
 
V
E
 
T
R
 
S
P
 
Q
V
 
V
-
 
N
-
 
T
P
 
T
V
 
I
C
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
|
S
C
 
C
H
 
F
D
 
D
R
 
A
E
 
Q
S
 
D
L
 
A
A
 
L
A
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
K
E
 
K
G
 
G
K
 
T
Y
 
V
D
 
D
V
 
V
I
 
I
N
|
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
I
R
 
N
D
 
Q
A
 
I
A
 
C
L
 
E
A
 
T
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
C
M
 
M
V
 
I
G
|
G
C
|
C
M
|
M

Sites not aligning to the query:

3jvaB Crystal structure of dipeptide epimerase from enterococcus faecalis v583 (see paper)
33% identity, 83% coverage: 2:269/321 of query aligns to 5:293/354 of 3jvaB

query
sites
3jvaB
Q
 
Q
I
 
V
S
 
H
V
 
V
T
 
R
P
 
A
D
 
S
T
 
K
F
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
V
 
T
F
|
F
T
 
T
I
 
I
S
 
A
R
 
L
G
 
G
S
 
T
R
 
I
T
 
E
E
 
S
A
 
A
K
 
D
V
 
S
L
 
A
T
 
I
V
 
V
R
 
E
I
 
I
-
 
E
I
 
T
Q
 
E
D
 
E
G
 
G
V
 
L
T
 
V
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
G
V
 
G
P
|
P
-
 
G
Y
 
I
A
x
F
R
 
I
Y
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
A
S
 
G
V
 
T
T
 
L
A
 
E
E
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
L
L
 
F
P
 
G
E
 
Q
T
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
P
F
 
F
N
 
N
R
 
I
A
 
E
E
 
K
L
 
I
Q
 
H
S
 
E
L
 
V
L
 
M
-
 
D
-
 
K
-
 
I
-
 
S
-
 
A
P
 
F
A
 
A
G
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
C
W
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
M
A
 
G
K
 
Q
Q
 
K
A
 
A
G
 
Q
K
 
L
R
 
P
V
 
L
W
 
Y
E
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
Y
E
 
D
P
 
N
K
 
Q
P
 
V
E
 
-
I
 
I
T
 
T
A
 
D
Y
 
I
T
|
T
L
 
L
S
 
G
L
 
I
D
 
D
S
 
E
P
 
P
E
 
N
N
 
V
M
 
M
Q
 
A
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
E
N
 
K
A
 
V
H
 
K
R
 
L
P
 
G
L
 
F
-
 
D
-
 
T
L
 
L
K
|
K
I
 
I
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
A
 
G
-
 
I
-
 
E
D
 
A
D
 
D
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
V
E
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
R
-
 
E
A
 
A
G
 
V
A
 
G
P
 
F
E
 
D
A
 
I
R
 
K
I
 
L
I
 
R
V
 
L
D
|
D
A
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
A
W
 
W
S
 
T
A
 
P
E
 
K
V
 
D
Y
 
A
A
 
V
D
 
K
L
 
A
A
 
I
P
 
Q
H
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
D
L
 
Y
G
 
Q
V
 
I
D
 
E
L
 
L
V
 
V
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
K
A
 
R
G
 
R
E
 
D
D
 
L
A
 
E
A
 
G
L
 
L
L
 
K
G
 
Y
M
 
V
E
 
T
R
 
S
P
 
Q
V
 
V
-
 
N
-
 
T
P
 
T
V
 
I
C
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
|
S
C
 
C
H
 
F
D
 
D
R
 
A
E
 
Q
S
 
D
L
 
A
A
 
L
A
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
K
E
 
K
G
 
G
K
 
T
Y
 
V
D
 
D
V
 
V
I
 
I
N
|
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
I
R
 
N
D
 
Q
A
 
I
A
 
C
L
 
E
A
 
T
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
C
M
 
M
V
 
I
G
|
G
C
|
C
M
|
M

Sites not aligning to the query:

3jzuA Crystal structure of dipeptide epimerase from enterococcus faecalis v583 complexed with mg and dipeptide l-leu-l-tyr (see paper)
33% identity, 83% coverage: 2:269/321 of query aligns to 5:293/353 of 3jzuA

query
sites
3jzuA
Q
 
Q
I
 
V
S
 
H
V
 
V
T
 
R
P
 
A
D
 
S
T
 
K
F
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
V
 
T
F
|
F
T
 
T
I
|
I
S
 
A
R
 
L
G
 
G
S
 
T
R
x
I
T
 
E
E
 
S
A
 
A
K
 
D
V
 
S
L
 
A
T
 
I
V
 
V
R
 
E
I
 
I
-
 
E
I
 
T
Q
 
E
D
 
E
G
 
G
V
 
L
T
 
V
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
G
V
 
G
P
|
P
-
 
G
Y
 
I
A
x
F
R
 
I
Y
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
A
S
 
G
V
 
T
T
 
L
A
 
E
E
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
L
L
 
F
P
 
G
E
 
Q
T
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
P
F
 
F
N
 
N
R
 
I
A
 
E
E
 
K
L
 
I
Q
 
H
S
 
E
L
 
V
L
 
M
-
 
D
-
 
K
-
 
I
-
 
S
-
 
A
P
 
F
A
 
A
G
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
C
W
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
M
A
 
G
K
 
Q
Q
 
K
A
 
A
G
 
Q
K
 
L
R
 
P
V
 
L
W
 
Y
E
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
Y
E
 
D
P
 
N
K
 
Q
P
 
V
E
 
-
I
 
I
T
 
T
A
 
D
Y
 
I
T
|
T
L
 
L
S
 
G
L
 
I
D
 
D
S
 
E
P
 
P
E
 
N
N
 
V
M
 
M
Q
 
A
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
E
N
 
K
A
 
V
H
 
K
R
 
L
P
 
G
L
 
F
-
 
D
-
 
T
L
 
L
K
|
K
I
 
I
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
A
 
G
-
 
I
-
 
E
D
 
A
D
 
D
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
V
E
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
R
-
 
E
A
 
A
G
 
V
A
 
G
P
 
F
E
 
D
A
 
I
R
 
K
I
 
L
I
 
R
V
 
L
D
|
D
A
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
A
W
 
W
S
 
T
A
 
P
E
 
K
V
 
D
Y
 
A
A
 
V
D
 
K
L
 
A
A
 
I
P
 
Q
H
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
D
L
 
Y
G
 
Q
V
 
I
D
 
E
L
 
L
V
 
V
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
K
A
 
R
G
 
R
E
 
D
D
 
L
A
 
E
A
 
G
L
 
L
L
 
K
G
 
Y
M
 
V
E
 
T
R
 
S
P
 
Q
V
 
V
-
 
N
-
 
T
P
 
T
V
 
I
C
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
|
S
C
 
C
H
 
F
D
 
D
R
 
A
E
 
Q
S
 
D
L
 
A
A
 
L
A
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
K
E
 
K
G
 
G
K
 
T
Y
 
V
D
 
D
V
 
V
I
 
I
N
|
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
I
R
 
N
D
 
Q
A
 
I
A
 
C
L
 
E
A
 
T
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
C
M
 
M
V
 
I
G
|
G
C
|
C
M
|
M

Sites not aligning to the query:

3jw7A Crystal structure of dipeptide epimerase from enterococcus faecalis v583 complexed with mg and dipeptide l-ile-l-tyr (see paper)
33% identity, 83% coverage: 2:269/321 of query aligns to 5:293/353 of 3jw7A

query
sites
3jw7A
Q
 
Q
I
 
V
S
 
H
V
 
V
T
 
R
P
 
A
D
 
S
T
 
K
F
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
K
Q
 
E
V
 
T
F
|
F
T
 
T
I
 
I
S
 
A
R
 
L
G
 
G
S
 
T
R
 
I
T
 
E
E
 
S
A
 
A
K
 
D
V
 
S
L
 
A
T
 
I
V
 
V
R
 
E
I
 
I
-
 
E
I
 
T
Q
 
E
D
 
E
G
 
G
V
 
L
T
 
V
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
G
V
 
G
P
|
P
-
 
G
Y
 
I
A
x
F
R
x
I
Y
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
A
S
 
G
V
 
T
T
 
L
A
 
E
E
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
L
L
 
F
P
 
G
E
 
Q
T
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
P
F
 
F
N
 
N
R
 
I
A
 
E
E
 
K
L
 
I
Q
 
H
S
 
E
L
 
V
L
 
M
-
 
D
-
 
K
-
 
I
-
 
S
-
 
A
P
 
F
A
 
A
G
 
P
A
 
A
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
C
W
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
M
A
 
G
K
 
Q
Q
 
K
A
 
A
G
 
Q
K
 
L
R
 
P
V
 
L
W
 
Y
E
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
Y
E
 
D
P
 
N
K
 
Q
P
 
V
E
 
-
I
 
I
T
 
T
A
 
D
Y
 
I
T
|
T
L
 
L
S
 
G
L
 
I
D
 
D
S
 
E
P
 
P
E
 
N
N
 
V
M
 
M
Q
 
A
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
E
N
 
K
A
 
V
H
 
K
R
 
L
P
 
G
L
 
F
-
 
D
-
 
T
L
 
L
K
|
K
I
 
I
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
A
 
G
-
 
I
-
 
E
D
 
A
D
 
D
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
V
E
 
K
A
 
A
V
 
I
R
 
R
-
 
E
A
 
A
G
 
V
A
 
G
P
 
F
E
 
D
A
 
I
R
 
K
I
 
L
I
 
R
V
 
L
D
|
D
A
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
A
W
 
W
S
 
T
A
 
P
E
 
K
V
 
D
Y
 
A
A
 
V
D
 
K
L
 
A
A
 
I
P
 
Q
H
 
A
L
 
L
V
 
A
R
 
D
L
 
Y
G
 
Q
V
 
I
D
 
E
L
 
L
V
 
V
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
K
A
 
R
G
 
R
E
 
D
D
 
L
A
 
E
A
 
G
L
 
L
L
 
K
G
 
Y
M
 
V
E
 
T
R
 
S
P
 
Q
V
 
V
-
 
N
-
 
T
P
 
T
V
 
I
C
 
M
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
|
S
C
 
C
H
 
F
D
 
D
R
 
A
E
 
Q
S
 
D
L
 
A
A
 
L
A
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
K
E
 
K
G
 
G
K
 
T
Y
 
V
D
 
D
V
 
V
I
 
I
N
|
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
I
R
 
N
D
 
Q
A
 
I
A
 
C
L
 
E
A
 
T
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
C
M
 
M
V
 
I
G
|
G
C
|
C
M
|
M

Sites not aligning to the query:

2p8cA Crystal structure of n-succinyl arg/lys racemase from bacillus cereus atcc 14579 complexed with n-succinyl arg. (see paper)
31% identity, 89% coverage: 16:300/321 of query aligns to 19:330/369 of 2p8cA

query
sites
2p8cA
F
|
F
T
 
V
I
 
I
S
 
S
R
 
Y
G
 
G
S
 
S
R
x
Y
T
 
S
E
 
D
A
x
M
K
 
P
V
 
S
L
 
I
T
 
I
V
 
V
R
 
K
I
 
M
I
 
E
Q
 
T
D
 
D
-
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
G
V
 
V
P
 
-
Y
 
-
A
|
A
R
x
D
Y
 
D
G
x
H
E
 
V
T
 
T
L
 
G
E
 
E
S
 
S
V
 
W
T
 
E
A
 
S
E
 
T
I
 
F
E
 
H
G
 
T
L
 
L
P
 
K
E
 
H
T
 
T
F
 
L
N
 
T
R
 
P
A
 
A
E
 
L
L
 
I
-
 
G
-
 
Q
-
 
N
-
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
H
-
 
D
-
 
M
-
 
M
-
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
I
L
 
Y
P
 
G
A
 
V
G
 
P
A
 
T
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
C
W
 
F
D
 
D
L
 
I
E
 
M
A
 
G
K
 
K
Q
 
K
A
 
L
G
 
N
K
 
Q
R
 
P
V
 
V
W
 
Y
E
 
Q
L
 
L
A
 
I
G
 
G
L
 
G
P
 
R
E
 
Y
P
 
H
K
 
E
P
 
E
E
 
F
I
 
P
T
 
V
A
 
T
Y
 
H
T
x
V
L
 
L
S
 
S
L
 
I
D
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
N
 
N
M
 
M
Q
 
A
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
S
N
 
M
A
 
I
H
 
Q
R
 
K
P
 
G
L
 
Y
-
 
Q
-
 
S
L
x
F
K
|
K
I
x
M
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
-
 
N
-
 
V
A
 
K
D
 
E
D
 
D
M
 
V
A
 
K
R
 
R
L
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
R
A
 
V
-
 
G
P
 
N
E
 
D
A
 
I
R
 
A
I
 
I
I
 
R
V
 
V
D
|
D
A
 
V
N
|
N
E
 
Q
G
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
N
S
 
S
A
 
A
E
 
N
V
 
T
Y
 
L
A
 
T
D
 
A
L
 
L
A
 
R
P
 
S
H
 
-
L
 
L
V
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
W
V
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
I
A
 
A
G
 
D
E
 
D
D
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
M
L
 
A
G
 
H
M
 
I
E
 
R
R
 
S
P
 
K
-
 
T
-
 
D
V
 
L
P
 
P
V
 
L
C
 
M
A
 
I
D
|
D
E
|
E
-
x
G
-
 
L
-
 
K
S
 
S
C
 
S
H
 
R
D
 
E
R
 
M
E
 
R
S
 
Q
L
 
I
A
 
I
A
 
K
L
 
L
E
 
E
G
 
A
K
 
A
Y
 
-
D
 
D
V
 
K
I
 
V
N
|
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
Y
E
 
P
A
 
A
L
 
V
K
 
K
L
 
L
R
 
A
D
 
H
A
 
Q
A
 
A
L
 
E
A
 
M
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
C
M
 
Q
V
 
V
G
|
G
C
x
S
M
|
M
V
 
V
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
V
A
 
A
M
 
S
A
 
S
P
 
A
A
 
G
T
 
F
L
 
H
V
 
V
A
 
A
-
 
F
Q
 
S
G
 
K
A
 
K
V
 
I
V
 
I
T
 
T
-
 
S
-
x
V
D
x
E
L
|
L
D
x
T
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
L
 
F
A
 
T
E
 
K
D
 
D

2p8bA Crystal structure of n-succinyl arg/lys racemase from bacillus cereus atcc 14579 complexed with n-succinyl lys. (see paper)
31% identity, 89% coverage: 16:300/321 of query aligns to 19:330/369 of 2p8bA

query
sites
2p8bA
F
|
F
T
 
V
I
 
I
S
 
S
R
 
Y
G
 
G
S
 
S
R
x
Y
T
 
S
E
 
D
A
 
M
K
 
P
V
 
S
L
 
I
T
 
I
V
 
V
R
 
K
I
 
M
I
 
E
Q
 
T
D
 
D
-
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
G
V
 
V
P
 
-
Y
 
-
A
|
A
R
x
D
Y
 
D
G
x
H
E
 
V
T
 
T
L
 
G
E
 
E
S
 
S
V
 
W
T
 
E
A
 
S
E
 
T
I
 
F
E
 
H
G
 
T
L
 
L
P
 
K
E
 
H
T
 
T
F
 
L
N
 
T
R
 
P
A
 
A
E
 
L
L
 
I
-
 
G
-
 
Q
-
 
N
-
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
H
-
 
D
-
 
M
-
 
M
-
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
I
L
 
Y
P
 
G
A
 
V
G
 
P
A
 
T
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
C
W
 
F
D
 
D
L
 
I
E
 
M
A
 
G
K
 
K
Q
 
K
A
 
L
G
 
N
K
 
Q
R
 
P
V
 
V
W
 
Y
E
 
Q
L
 
L
A
 
I
G
 
G
L
 
G
P
 
R
E
 
Y
P
 
H
K
 
E
P
 
E
E
 
F
I
 
P
T
 
V
A
 
T
Y
 
H
T
x
V
L
 
L
S
 
S
L
 
I
D
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
N
 
N
M
 
M
Q
 
A
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
S
N
 
M
A
 
I
H
 
Q
R
 
K
P
 
G
L
 
Y
-
 
Q
-
 
S
L
x
F
K
|
K
I
x
M
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
-
 
N
-
 
V
A
 
K
D
 
E
D
 
D
M
 
V
A
 
K
R
 
R
L
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
R
A
 
V
-
 
G
P
 
N
E
 
D
A
 
I
R
 
A
I
 
I
I
 
R
V
 
V
D
|
D
A
 
V
N
|
N
E
 
Q
G
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
N
S
 
S
A
 
A
E
 
N
V
 
T
Y
 
L
A
 
T
D
 
A
L
 
L
A
 
R
P
 
S
H
 
-
L
 
L
V
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
W
V
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
I
A
 
A
G
 
D
E
 
D
D
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
M
L
 
A
G
 
H
M
 
I
E
 
R
R
 
S
P
 
K
-
 
T
-
 
D
V
 
L
P
 
P
V
 
L
C
 
M
A
 
I
D
|
D
E
|
E
-
x
G
-
 
L
-
 
K
S
 
S
C
 
S
H
 
R
D
 
E
R
 
M
E
 
R
S
 
Q
L
 
I
A
 
I
A
 
K
L
 
L
E
 
E
G
 
A
K
 
A
Y
 
-
D
 
D
V
 
K
I
 
V
N
|
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
Y
E
 
P
A
 
A
L
 
V
K
 
K
L
 
L
R
 
A
D
 
H
A
 
Q
A
 
A
L
 
E
A
 
M
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
C
M
 
Q
V
 
V
G
|
G
C
x
S
M
|
M
V
 
V
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
V
A
 
A
M
 
S
A
 
S
P
 
A
A
 
G
T
 
F
L
 
H
V
 
V
A
 
A
-
 
F
Q
 
S
G
 
K
A
 
K
V
 
I
V
 
I
T
 
T
-
 
S
-
x
V
D
x
E
L
|
L
D
x
T
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
L
 
F
A
 
T
E
 
K
D
 
D

2p88A Crystal structure of n-succinyl arg/lys racemase from bacillus cereus atcc 14579 (see paper)
31% identity, 89% coverage: 16:300/321 of query aligns to 19:330/369 of 2p88A

query
sites
2p88A
F
|
F
T
 
V
I
 
I
S
 
S
R
 
Y
G
 
G
S
 
S
R
 
Y
T
 
S
E
 
D
A
 
M
K
 
P
V
 
S
L
 
I
T
 
I
V
 
V
R
 
K
I
 
M
I
 
E
Q
 
T
D
 
D
-
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
G
V
 
V
P
 
-
Y
 
-
A
|
A
R
 
D
Y
 
D
G
x
H
E
 
V
T
 
T
L
 
G
E
 
E
S
 
S
V
 
W
T
 
E
A
 
S
E
 
T
I
 
F
E
 
H
G
 
T
L
 
L
P
 
K
E
 
H
T
 
T
F
 
L
N
 
T
R
 
P
A
 
A
E
 
L
L
 
I
-
 
G
-
 
Q
-
 
N
-
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
H
-
 
D
-
 
M
-
 
M
-
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
I
L
 
Y
P
 
G
A
 
V
G
 
P
A
 
T
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
C
W
 
F
D
 
D
L
 
I
E
 
M
A
 
G
K
 
K
Q
 
K
A
 
L
G
 
N
K
 
Q
R
 
P
V
 
V
W
 
Y
E
 
Q
L
 
L
A
 
I
G
 
G
L
 
G
P
 
R
E
 
Y
P
 
H
K
 
E
P
 
E
E
 
F
I
 
P
T
 
V
A
 
T
Y
 
H
T
x
V
L
 
L
S
 
S
L
 
I
D
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
N
 
N
M
 
M
Q
 
A
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
S
N
 
M
A
 
I
H
 
Q
R
 
K
P
 
G
L
 
Y
-
 
Q
-
 
S
L
x
F
K
|
K
I
x
M
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
-
 
N
-
 
V
A
 
K
D
 
E
D
 
D
M
 
V
A
 
K
R
 
R
L
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
R
A
 
V
-
 
G
P
 
N
E
 
D
A
 
I
R
 
A
I
 
I
I
 
R
V
 
V
D
|
D
A
 
V
N
|
N
E
 
Q
G
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
N
S
 
S
A
 
A
E
 
N
V
 
T
Y
 
L
A
 
T
D
 
A
L
 
L
A
 
R
P
 
S
H
 
-
L
 
L
V
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
W
V
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
I
A
 
A
G
 
D
E
 
D
D
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
M
L
 
A
G
 
H
M
 
I
E
 
R
R
 
S
P
 
K
-
 
T
-
 
D
V
 
L
P
 
P
V
 
L
C
 
M
A
 
I
D
|
D
E
|
E
-
x
G
-
 
L
-
 
K
S
 
S
C
 
S
H
 
R
D
 
E
R
 
M
E
 
R
S
 
Q
L
 
I
A
 
I
A
 
K
L
 
L
E
 
E
G
 
A
K
 
A
Y
 
-
D
 
D
V
 
K
I
 
V
N
|
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
Y
E
 
P
A
 
A
L
 
V
K
 
K
L
 
L
R
 
A
D
 
H
A
 
Q
A
 
A
L
 
E
A
 
M
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
C
M
 
Q
V
 
V
G
|
G
C
x
S
M
|
M
V
 
V
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
V
A
 
A
M
 
S
A
 
S
P
 
A
A
 
G
T
 
F
L
 
H
V
 
V
A
 
A
-
 
F
Q
 
S
G
 
K
A
 
K
V
 
I
V
 
I
T
 
T
-
 
S
-
x
V
D
x
E
L
|
L
D
 
T
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
L
 
F
A
 
T
E
 
K
D
 
D

Q81IL5 N-succinyl-L-Arg/Lys racemase; N-succinyl amino acid racemase; NSAR; EC 5.1.1.- from Bacillus cereus (strain ATCC 14579 / DSM 31 / CCUG 7414 / JCM 2152 / NBRC 15305 / NCIMB 9373 / NCTC 2599 / NRRL B-3711) (see paper)
31% identity, 89% coverage: 16:300/321 of query aligns to 19:330/369 of Q81IL5

query
sites
Q81IL5
F
 
F
T
 
V
I
 
I
S
 
S
R
 
Y
G
 
G
S
 
S
R
 
Y
T
 
S
E
 
D
A
 
M
K
 
P
V
 
S
L
 
I
T
 
I
V
 
V
R
 
K
I
 
M
I
 
E
Q
 
T
D
 
D
-
 
E
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
G
V
 
V
P
 
-
Y
 
-
A
 
A
R
 
D
Y
 
D
G
 
H
E
 
V
T
 
T
L
 
G
E
 
E
S
 
S
V
 
W
T
 
E
A
 
S
E
 
T
I
 
F
E
 
H
G
 
T
L
 
L
P
 
K
E
 
H
T
 
T
F
 
L
N
 
T
R
 
P
A
 
A
E
 
L
L
 
I
-
 
G
-
 
Q
-
 
N
-
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
H
-
 
D
-
 
M
-
 
M
-
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
I
L
 
Y
P
 
G
A
 
V
G
 
P
A
 
T
A
 
A
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
C
 
I
A
 
A
L
 
C
W
 
F
D
 
D
L
 
I
E
 
M
A
 
G
K
 
K
Q
 
K
A
 
L
G
 
N
K
 
Q
R
 
P
V
 
V
W
 
Y
E
 
Q
L
 
L
A
 
I
G
 
G
L
 
G
P
 
R
E
 
Y
P
 
H
K
 
E
P
 
E
E
 
F
I
 
P
T
 
V
A
 
T
Y
 
H
T
 
V
L
 
L
S
 
S
L
 
I
D
 
A
S
 
D
P
 
P
E
 
E
N
 
N
M
 
M
Q
 
A
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
S
N
 
M
A
 
I
H
 
Q
R
 
K
P
 
G
L
 
Y
-
 
Q
-
 
S
L
 
F
K
 
K
I
 
M
K
 
K
L
 
V
G
 
G
T
 
T
-
 
N
-
 
V
A
 
K
D
 
E
D
 
D
M
 
V
A
 
K
R
 
R
L
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
E
G
 
R
A
 
V
-
 
G
P
 
N
E
 
D
A
 
I
R
 
A
I
 
I
I
 
R
V
 
V
D
|
D
A
 
V
N
 
N
E
 
Q
G
 
G
W
 
W
-
 
K
-
 
N
S
 
S
A
 
A
E
 
N
V
 
T
Y
 
L
A
 
T
D
 
A
L
 
L
A
 
R
P
 
S
H
 
-
L
 
L
V
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
W
V
 
I
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
I
A
 
A
G
 
D
E
 
D
D
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
M
L
 
A
G
 
H
M
 
I
E
 
R
R
 
S
P
 
K
-
 
T
-
 
D
V
 
L
P
 
P
V
 
L
C
 
M
A
 
I
D
|
D
E
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
K
S
 
S
C
 
S
H
 
R
D
 
E
R
 
M
E
 
R
S
 
Q
L
 
I
A
 
I
A
 
K
L
 
L
E
 
E
G
 
A
K
 
A
Y
 
-
D
 
D
V
 
K
I
 
V
N
 
N
I
 
I
K
 
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
Y
E
 
P
A
 
A
L
 
V
K
 
K
L
 
L
R
 
A
D
 
H
A
 
Q
A
 
A
L
 
E
A
 
M
Q
 
A
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
C
M
 
Q
V
 
V
G
 
G
C
 
S
M
 
M
V
 
V
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
V
A
 
A
M
 
S
A
 
S
P
 
A
A
 
G
T
 
F
L
 
H
V
 
V
A
 
A
-
 
F
Q
 
S
G
 
K
A
 
K
V
 
I
V
 
I
T
 
T
-
 
S
-
 
V
D
 
E
L
 
L
D
 
T
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
L
 
F
A
 
T
E
 
K
D
 
D

3desA Crystal structure of dipeptide epimerase from thermotoga maritima complexed with l-ala-l-phe dipeptide (see paper)
27% identity, 93% coverage: 1:300/321 of query aligns to 3:325/341 of 3desA

query
sites
3desA
M
 
V
Q
 
N
I
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
S
P
 
L
D
 
K
T
 
R
F
 
Y
K
 
E
L
 
Y
A
 
E
Q
 
K
V
 
P
F
|
F
T
 
H
I
 
I
S
 
T
R
 
G
G
 
S
S
 
V
R
 
S
T
 
S
E
 
E
A
 
S
K
 
R
V
 
N
L
 
V
T
 
E
V
 
V
R
 
E
I
 
I
I
 
V
-
 
L
Q
 
E
D
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
K
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
A
V
 
S
P
 
P
Y
 
S
A
 
F
R
 
R
Y
 
V
-
 
N
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
V
E
 
E
S
 
A
V
 
L
T
 
L
A
 
A
E
 
I
I
 
E
E
 
N
G
 
A
L
 
V
P
 
R
E
 
E
T
 
M
F
 
I
N
 
T
R
 
G
A
 
I
E
 
D
L
 
V
Q
 
R
S
 
N
-
 
Y
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
F
-
 
E
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
R
L
 
L
L
 
F
P
 
G
A
 
F
G
 
P
A
 
S
A
 
L
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
C
 
F
A
 
A
L
 
T
W
 
L
D
 
D
L
 
A
E
 
L
A
 
S
K
 
Q
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
K
 
T
R
 
Q
V
 
V
W
 
C
E
 
Y
L
 
L
A
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
K
E
 
R
P
 
D
K
 
E
P
 
I
E
 
E
I
 
-
T
 
T
A
 
D
Y
 
K
T
|
T
L
 
V
S
 
G
L
 
I
D
 
D
S
 
T
P
 
V
E
 
E
N
 
N
M
 
R
Q
 
V
A
 
K
Q
 
E
A
 
A
A
 
K
K
 
K
N
 
I
A
 
F
H
 
E
R
 
E
P
 
G
L
 
F
-
 
R
-
 
V
L
 
I
K
|
K
I
 
I
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
E
-
 
N
-
 
L
A
 
K
D
 
E
D
 
D
M
 
I
A
 
E
R
 
A
L
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
I
R
 
A
A
 
K
G
 
V
A
 
T
P
 
R
E
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
Y
I
 
I
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
 
N
E
 
M
G
 
G
W
 
Y
S
 
T
A
 
Q
E
 
K
V
 
E
Y
 
A
A
 
V
D
 
E
L
 
F
A
 
A
P
 
R
H
 
A
L
 
V
V
 
Y
R
 
Q
L
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
I
-
 
A
-
 
V
V
 
Y
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
R
A
 
R
G
 
E
-
 
D
-
 
I
E
 
E
D
 
G
A
 
L
A
 
K
L
 
F
L
 
V
G
 
R
M
 
F
E
 
H
R
 
S
P
 
P
V
 
F
P
 
P
V
 
V
C
 
A
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
|
S
C
 
A
H
 
R
D
 
T
R
 
K
E
 
F
S
 
D
L
 
V
A
 
M
A
 
R
L
 
L
-
 
V
-
 
K
E
 
E
G
 
E
K
 
A
Y
 
V
D
 
D
V
 
Y
I
 
V
N
 
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
S
G
 
G
G
 
-
L
 
I
T
 
S
E
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
A
L
 
I
R
 
V
D
 
E
A
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
S
Q
 
S
G
 
G
F
 
L
E
 
K
V
 
L
M
 
M
V
 
I
G
|
G
C
|
C
M
|
M
V
 
G
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
G
M
 
I
A
 
N
P
 
Q
A
 
S
T
 
V
L
 
H
V
 
F
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
A
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
F
V
 
E
V
 
F
T
x
H
D
|
D
L
|
L
D
|
D
G
 
S
P
 
H
L
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
E
D
 
E

3derA Crystal structure of dipeptide epimerase from thermotoga maritima complexed with l-ala-l-lys dipeptide (see paper)
27% identity, 93% coverage: 1:300/321 of query aligns to 3:325/341 of 3derA

query
sites
3derA
M
 
V
Q
 
N
I
 
V
S
 
K
V
 
L
T
 
S
P
 
L
D
 
K
T
 
R
F
 
Y
K
 
E
L
 
Y
A
 
E
Q
 
K
V
 
P
F
|
F
T
 
H
I
 
I
S
 
T
R
 
G
G
 
S
S
 
V
R
 
S
T
 
S
E
 
E
A
 
S
K
 
R
V
 
N
L
 
V
T
 
E
V
 
V
R
 
E
I
 
I
I
 
V
-
 
L
Q
 
E
D
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
K
G
 
G
C
 
Y
G
 
G
E
 
E
C
 
A
V
 
S
P
 
P
Y
 
S
A
 
F
R
 
R
Y
 
V
-
 
N
G
 
G
E
 
E
T
 
R
L
 
V
E
 
E
S
 
A
V
 
L
T
 
L
A
 
A
E
 
I
I
 
E
E
 
N
G
 
A
L
 
V
P
 
R
E
 
E
T
 
M
F
 
I
N
 
T
R
 
G
A
 
I
E
 
D
L
 
V
Q
 
R
S
 
N
-
 
Y
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
F
-
 
E
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
R
L
 
L
L
 
F
P
 
G
A
 
F
G
 
P
A
 
S
A
 
L
R
 
K
N
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
C
 
F
A
 
A
L
 
T
W
 
L
D
 
D
L
 
A
E
 
L
A
 
S
K
 
Q
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
K
 
T
R
 
Q
V
 
V
W
 
C
E
 
Y
L
 
L
A
 
L
G
 
G
L
 
G
P
 
K
E
 
R
P
 
D
K
 
E
P
 
I
E
 
E
I
 
-
T
 
T
A
 
D
Y
 
K
T
|
T
L
 
V
S
 
G
L
 
I
D
 
D
S
 
T
P
 
V
E
 
E
N
 
N
M
 
R
Q
 
V
A
 
K
Q
 
E
A
 
A
A
 
K
K
 
K
N
 
I
A
 
F
H
 
E
R
 
E
P
 
G
L
 
F
-
 
R
-
 
V
L
 
I
K
|
K
I
 
I
K
|
K
L
 
V
G
 
G
T
 
E
-
 
N
-
 
L
A
 
K
D
 
E
D
 
D
M
 
I
A
 
E
R
 
A
L
 
V
E
 
E
A
 
E
V
 
I
R
 
A
A
 
K
G
 
V
A
 
T
P
 
R
E
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
Y
I
 
I
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
 
N
E
 
M
G
 
G
W
 
Y
S
 
T
A
 
Q
E
 
K
V
 
E
Y
 
A
A
 
V
D
 
E
L
 
F
A
 
A
P
 
R
H
 
A
L
 
V
V
 
Y
R
 
Q
L
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
I
-
 
A
-
 
V
V
 
Y
E
|
E
Q
 
Q
P
 
P
L
 
V
P
 
R
A
 
R
G
 
E
-
 
D
-
 
I
E
 
E
D
 
G
A
 
L
A
 
K
L
 
F
L
 
V
G
 
R
M
 
F
E
 
H
R
 
S
P
 
P
V
 
F
P
 
P
V
 
V
C
 
A
A
 
A
D
|
D
E
|
E
S
|
S
C
 
A
H
 
R
D
 
T
R
 
K
E
 
F
S
 
D
L
 
V
A
 
M
A
 
R
L
 
L
-
 
V
-
 
K
E
 
E
G
 
E
K
 
A
Y
 
V
D
 
D
V
 
Y
I
 
V
N
 
N
I
 
I
K
|
K
L
 
L
D
 
M
K
 
K
T
 
S
G
 
G
G
 
-
L
 
I
T
 
S
E
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
A
L
 
I
R
 
V
D
 
E
A
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
S
Q
 
S
G
 
G
F
 
L
E
 
K
V
 
L
M
 
M
V
 
I
G
|
G
C
|
C
M
|
M
V
 
G
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
G
M
 
I
A
 
N
P
 
Q
A
 
S
T
 
V
L
 
H
V
 
F
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
A
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
F
V
 
E
V
 
F
T
x
H
D
|
D
L
|
L
D
|
D
G
 
S
P
 
H
L
 
L
L
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
E
D
 
E

Query Sequence

>GFF2998 FitnessBrowser__Phaeo:GFF2998
MQISVTPDTFKLAQVFTISRGSRTEAKVLTVRIIQDGVTGCGECVPYARYGETLESVTAE
IEGLPETFNRAELQSLLPAGAARNAVDCALWDLEAKQAGKRVWELAGLPEPKPEITAYTL
SLDSPENMQAQAAKNAHRPLLKIKLGTADDMARLEAVRAGAPEARIIVDANEGWSAEVYA
DLAPHLVRLGVDLVEQPLPAGEDAALLGMERPVPVCADESCHDRESLAALEGKYDVINIK
LDKTGGLTEALKLRDAALAQGFEVMVGCMVGSSLAMAPATLVAQGAVVTDLDGPLLLAED
REEPLDFDADGVHPPKAALWG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory