SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF305 FitnessBrowser__psRCH2:GFF305 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3du4A Crystal structure of 7-keto-8-aminopelargonic acid bound 7,8- diaminopelargonic acid synthase in bacillus subtilis (see paper)
42% identity, 92% coverage: 15:444/467 of query aligns to 13:440/448 of 3du4A

query
sites
3du4A
L
 
L
W
 
W
H
 
L
P
 
P
C
x
F
T
 
T
Q
 
Q
M
 
M
K
 
K
D
 
D
H
 
Y
E
 
D
Q
 
E
L
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
P
 
-
I
 
I
R
 
E
R
 
S
G
 
G
D
 
T
G
 
G
V
 
I
W
 
K
L
 
V
E
 
K
D
 
D
F
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
F
S
 
S
S
 
S
W
 
V
W
 
W
V
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
R
N
 
K
P
 
K
R
 
E
I
 
L
N
 
D
Q
 
D
R
 
A
I
 
I
K
 
K
D
 
K
Q
 
Q
V
 
L
D
 
G
Q
 
K
L
 
I
E
 
A
H
 
H
V
 
S
M
 
T
L
 
L
A
x
L
G
 
G
F
 
M
S
 
T
H
 
N
Q
 
V
P
 
P
V
 
A
V
 
T
E
 
Q
L
 
L
S
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
V
 
I
A
 
D
L
 
I
T
 
S
P
 
P
A
 
K
G
 
K
L
 
L
D
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
T
 
S
D
 
D
N
x
S
G
|
G
S
x
A
T
 
E
G
 
A
I
 
M
E
 
E
V
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
F
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
K
N
 
N
S
 
I
G
 
G
R
 
K
G
 
P
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
R
 
K
F
 
F
V
 
I
T
 
A
L
 
M
T
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
G
A
 
A
M
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
D
 
S
V
 
I
A
 
E
L
 
L
F
 
F
T
 
H
D
 
H
T
 
V
Y
 
Y
K
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
F
D
 
E
T
 
S
F
 
Y
K
 
K
V
 
A
P
 
P
S
 
I
P
 
P
D
 
Y
C
 
V
Y
 
Y
L
 
-
R
 
R
P
 
S
D
 
E
G
 
S
V
 
G
S
 
D
W
 
P
E
 
D
E
 
E
H
 
C
S
 
R
R
 
D
Q
 
Q
M
 
C
F
 
L
A
 
R
H
 
E
M
 
L
E
 
A
Q
 
Q
T
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
E
H
 
H
H
 
H
Q
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
S
V
 
I
E
|
E
P
 
S
L
 
M
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
M
 
M
R
 
I
M
 
V
Y
 
M
H
 
P
P
 
E
V
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
A
L
 
G
L
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
L
C
 
C
D
 
T
R
 
T
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
H
 
L
L
 
M
I
 
I
H
 
V
D
|
D
E
 
E
I
x
V
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
M
 
M
F
 
F
A
 
A
C
 
C
E
 
E
Q
 
H
A
 
E
G
 
N
I
 
V
T
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
L
L
 
M
C
 
A
L
 
A
S
 
G
K
|
K
A
 
G
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
M
 
I
A
 
A
A
 
V
V
 
T
L
 
F
T
 
A
T
 
T
D
 
E
R
 
D
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
Y
 
Y
S
 
E
T
 
N
L
 
L
R
 
K
A
 
T
F
 
F
L
 
F
H
 
H
S
x
G
H
|
H
T
x
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
Q
L
 
L
A
 
G
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
E
T
 
N
L
 
L
D
 
A
I
 
L
F
 
F
A
 
E
E
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
Q
N
 
V
K
 
A
P
 
E
L
 
K
A
 
S
A
 
K
R
 
K
M
 
L
A
 
H
S
 
F
A
 
L
T
 
L
A
 
Q
H
 
D
L
 
L
V
 
H
D
 
A
H
 
L
P
 
P
H
 
H
V
 
V
A
 
G
E
 
D
V
 
I
R
 
R
Q
 
Q
T
 
L
G
 
G
M
 
F
A
 
M
L
 
C
A
 
G
I
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
V
Q
 
R
D
 
S
K
 
K
A
 
E
S
 
T
R
 
K
T
 
E
A
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
A
Q
 
D
E
 
R
R
 
R
R
 
I
G
 
G
L
 
Y
K
 
K
V
 
V
Y
 
S
Q
 
L
H
 
K
A
 
M
L
 
R
E
 
E
R
 
L
G
 
G
A
 
M
L
 
L
L
 
T
R
|
R
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
I
Y
x
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
L
C
 
A
I
 
S
T
 
T
E
 
A
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
D
 
S
F
 
E
L
 
M
A
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
M
T
 
K
E
 
Q
G
 
A
I
 
I

P53555 L-Lysine--8-amino-7-oxononanoate transaminase; 7,8-diamino-pelargonic acid aminotransferase; DAPA AT; DAPA aminotransferase; 7,8-diaminononanoate synthase; DANS; Diaminopelargonic acid synthase; L-Lysine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase; EC 2.6.1.105 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
42% identity, 92% coverage: 15:444/467 of query aligns to 13:440/448 of P53555

query
sites
P53555
L
 
L
W
 
W
H
 
L
P
 
P
C
 
F
T
 
T
Q
 
Q
M
 
M
K
 
K
D
 
D
H
 
Y
E
 
D
Q
 
E
L
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
P
 
-
I
 
I
R
 
E
R
 
S
G
 
G
D
 
T
G
 
G
V
 
I
W
 
K
L
 
V
E
 
K
D
 
D
F
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
F
S
 
S
S
 
S
W
 
V
W
 
W
V
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
R
N
 
K
P
 
K
R
 
E
I
 
L
N
 
D
Q
 
D
R
 
A
I
 
I
K
 
K
D
 
K
Q
 
Q
V
 
L
D
 
G
Q
 
K
L
 
I
E
 
A
H
 
H
V
 
S
M
 
T
L
 
L
A
 
L
G
 
G
F
 
M
S
 
T
H
 
N
Q
 
V
P
 
P
V
 
A
V
 
T
E
 
Q
L
 
L
S
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
V
 
I
A
 
D
L
 
I
T
 
S
P
 
P
A
 
K
G
 
K
L
 
L
D
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
T
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
x
A
T
 
E
G
 
A
I
 
M
E
 
E
V
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
F
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
K
N
 
N
S
 
I
G
 
G
R
 
K
G
 
P
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
R
 
K
F
 
F
V
 
I
T
 
A
L
 
M
T
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
G
A
 
A
M
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
D
 
S
V
 
I
A
 
E
L
 
L
F
 
F
T
 
H
D
 
H
T
 
V
Y
 
Y
K
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
M
L
 
F
D
 
E
T
 
S
F
 
Y
K
 
K
V
 
A
P
 
P
S
 
I
P
 
P
D
 
Y
C
 
V
Y
 
Y
L
 
-
R
 
R
P
 
S
D
 
E
G
 
S
V
 
G
S
 
D
W
 
P
E
 
D
E
 
E
H
 
C
S
 
R
R
 
D
Q
 
Q
M
 
C
F
 
L
A
 
R
H
 
E
M
 
L
E
 
A
Q
 
Q
T
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
E
H
 
H
H
 
H
Q
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
S
V
 
I
E
 
E
P
 
S
L
 
M
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
M
 
M
R
 
I
M
 
V
Y
 
M
H
 
P
P
 
E
V
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
A
L
 
G
L
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
L
C
 
C
D
 
T
R
 
T
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
H
 
L
L
 
M
I
 
I
H
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
M
 
M
F
 
F
A
 
A
C
 
C
E
 
E
Q
 
H
A
 
E
G
 
N
I
 
V
T
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
L
L
 
M
C
 
A
L
 
A
S
 
G
K
|
K
A
 
G
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
M
 
I
A
 
A
A
 
V
V
 
T
L
 
F
T
 
A
T
 
T
D
 
E
R
 
D
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
Y
 
Y
S
 
E
T
 
N
L
 
L
R
 
K
A
 
T
F
 
F
L
 
F
H
 
H
S
x
G
H
|
H
T
x
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
Q
L
 
L
A
 
G
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
E
T
 
N
L
 
L
D
 
A
I
 
L
F
 
F
A
 
E
E
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
Q
N
 
V
K
 
A
P
 
E
L
 
K
A
 
S
A
 
K
R
 
K
M
 
L
A
 
H
S
 
F
A
 
L
T
 
L
A
 
Q
H
 
D
L
 
L
V
 
H
D
 
A
H
 
L
P
 
P
H
 
H
V
 
V
A
 
G
E
 
D
V
 
I
R
 
R
Q
 
Q
T
 
L
G
 
G
M
 
F
A
 
M
L
 
C
A
 
G
I
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
V
Q
 
R
D
 
S
K
 
K
A
 
E
S
 
T
R
 
K
T
 
E
A
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
A
Q
 
D
E
 
R
R
 
R
R
 
I
G
 
G
L
 
Y
K
 
K
V
 
V
Y
 
S
Q
 
L
H
 
K
A
 
M
L
 
R
E
 
E
R
 
L
G
 
G
A
 
M
L
 
L
L
 
T
R
|
R
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
I
Y
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
L
C
 
A
I
 
S
T
 
T
E
 
A
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
D
 
S
F
 
E
L
 
M
A
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
M
T
 
K
E
 
Q
G
 
A
I
 
I

6wnnA Bacillus subtilis bioa in complex with amino donor l-lys
40% identity, 92% coverage: 15:444/467 of query aligns to 10:412/420 of 6wnnA

query
sites
6wnnA
L
 
L
W
 
W
H
 
L
P
 
P
C
x
F
T
 
T
Q
 
Q
M
 
M
K
 
K
D
 
D
H
 
Y
E
 
D
Q
 
E
L
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
P
 
-
I
 
I
R
 
E
R
 
S
G
 
G
D
 
T
G
 
G
V
 
I
W
 
K
L
 
V
E
 
K
D
 
D
F
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
F
S
 
S
S
 
S
W
 
V
W
|
W
V
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
R
N
 
K
P
 
K
R
 
E
I
 
L
N
 
D
Q
 
D
R
 
A
I
 
I
K
 
K
D
 
K
Q
 
Q
V
 
L
D
 
G
Q
 
K
L
 
I
E
 
A
H
 
H
V
 
S
M
 
T
L
 
L
A
 
L
G
 
G
F
 
M
S
 
T
H
 
N
Q
 
V
P
 
P
V
 
A
V
 
T
E
 
Q
L
 
L
S
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
V
 
I
A
 
D
L
 
I
T
 
S
P
 
P
A
 
K
G
 
K
L
 
L
D
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
T
 
S
D
 
D
N
x
S
G
|
G
S
x
A
T
 
E
G
 
A
I
 
M
E
 
E
V
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
F
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
K
N
 
N
S
 
I
G
 
G
R
 
K
G
 
P
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
R
 
K
F
 
F
V
 
I
T
 
A
L
 
M
T
 
K
N
 
N
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
-
E
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
S
F
 
Y
K
 
K
V
 
A
P
 
P
S
 
I
P
 
P
D
 
Y
C
 
V
Y
 
Y
L
 
-
R
 
R
P
 
S
D
 
E
G
 
S
V
 
G
S
 
D
W
 
P
E
 
D
E
 
E
H
 
C
S
 
R
R
 
D
Q
 
Q
M
 
C
F
 
L
A
 
R
H
 
E
M
 
L
E
 
A
Q
 
Q
T
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
E
H
 
H
H
 
H
Q
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
S
V
 
I
E
 
E
P
 
S
L
 
M
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
M
 
M
R
 
I
M
 
V
Y
 
M
H
 
P
P
 
E
V
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
A
L
 
G
L
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
L
C
 
C
D
 
T
R
 
T
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
H
 
L
L
 
M
I
 
I
H
 
V
D
|
D
E
 
E
I
x
V
A
 
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
M
 
M
F
 
F
A
 
A
C
 
C
E
 
E
Q
 
H
A
 
E
G
 
N
I
 
V
T
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
L
L
 
M
C
 
A
L
 
A
S
 
G
K
|
K
A
 
G
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
M
 
I
A
 
A
A
 
V
V
 
T
L
 
F
T
 
A
T
 
T
D
 
E
R
 
D
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
Y
 
Y
S
 
E
T
 
N
L
 
L
R
 
K
A
 
T
F
 
F
L
 
F
H
 
H
S
 
G
H
|
H
T
x
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
Q
L
 
L
A
 
G
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
E
T
 
N
L
 
L
D
 
A
I
 
L
F
 
F
A
 
E
E
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
Q
N
 
V
K
 
A
P
 
E
L
 
K
A
 
S
A
 
K
R
 
K
M
 
L
A
 
H
S
 
F
A
 
L
T
 
L
A
 
Q
H
 
D
L
 
L
V
 
H
D
 
A
H
 
L
P
 
P
H
 
H
V
 
V
A
 
G
E
 
D
V
 
I
R
 
R
Q
 
Q
T
 
L
G
 
G
M
 
F
A
 
M
L
 
C
A
 
G
I
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
V
Q
 
R
D
 
S
K
 
K
A
 
E
S
 
T
R
 
K
T
 
E
A
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
A
Q
 
D
E
 
R
R
 
R
R
 
I
G
 
G
L
 
Y
K
 
K
V
 
V
Y
 
S
Q
 
L
H
 
K
A
 
M
L
 
R
E
 
E
R
 
L
G
 
G
A
 
M
L
 
L
L
 
T
R
|
R
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
I
Y
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
L
C
 
A
I
 
S
T
 
T
E
 
A
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
D
 
S
F
 
E
L
 
M
A
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
M
T
 
K
E
 
Q
G
 
A
I
 
I

6zhkA Crystal structure of adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase from methanocaldococcus jannaschii dsm 2661
39% identity, 96% coverage: 2:447/467 of query aligns to 3:436/438 of 6zhkA

query
sites
6zhkA
S
 
N
L
 
L
N
 
L
D
 
E
S
 
K
W
 
W
M
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
D
L
 
K
A
 
E
V
 
Y
L
 
I
W
 
W
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
T
Q
 
Q
M
 
M
K
 
K
D
 
E
H
 
Y
E
 
R
Q
 
E
L
 
S
P
 
K
L
 
N
I
 
L
P
 
I
I
 
I
R
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
E
G
 
G
V
 
N
W
 
Y
L
 
L
E
 
I
D
 
D
F
 
I
D
 
Y
G
 
G
K
 
N
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
V
S
 
S
S
 
S
W
 
I
W
 
W
V
 
C
N
 
N
V
 
L
F
 
F
G
 
G
H
 
H
A
 
S
N
 
R
P
 
K
R
 
E
I
 
I
N
 
I
Q
 
E
R
 
A
I
 
I
K
 
K
D
 
N
Q
 
Q
V
 
A
D
 
D
Q
 
K
L
 
I
E
 
C
H
 
H
V
 
S
M
 
T
L
 
L
A
 
L
G
 
G
F
 
C
S
 
G
H
 
N
Q
 
V
P
 
P
V
 
S
V
 
I
E
 
L
L
 
L
S
 
A
E
 
K
R
 
K
L
 
L
V
|
V
A
 
D
L
 
I
T
|
T
P
|
P
A
 
K
G
 
H
L
|
L
D
 
T
R
 
K
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
T
 
S
D
 
E
N
 
D
G
 
G
S
 
A
T
 
E
G
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
I
A
 
A
L
 
I
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
Y
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
Y
R
 
V
N
 
L
S
 
R
G
 
G
R
 
D
G
 
K
Q
 
G
K
 
R
Q
 
T
R
 
K
F
 
F
V
 
I
T
 
S
L
 
V
T
 
K
N
 
E
S
 
G
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
G
 
G
D
 
G
V
 
S
A
 
E
L
 
L
F
 
F
T
 
H
D
 
G
T
 
V
Y
 
F
K
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
F
D
 
K
T
 
G
F
 
Y
K
 
H
V
 
A
P
 
N
S
 
P
P
 
P
D
 
-
C
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
-
E
 
-
H
 
Y
S
 
E
R
 
M
Q
 
E
M
 
C
F
 
L
A
 
N
H
 
E
M
 
M
E
 
I
Q
 
S
T
 
L
L
 
I
A
 
E
E
 
K
H
 
H
H
 
A
Q
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
F
A
 
C
V
 
V
I
 
I
V
 
L
E
 
E
P
 
G
L
 
G
I
 
I
Q
 
M
G
 
G
A
 
S
G
 
A
G
 
G
M
 
M
R
 
I
M
 
P
Y
 
Y
H
 
P
P
 
D
V
 
G
Y
 
Y
L
 
I
K
 
E
L
 
G
L
 
V
R
 
A
E
 
K
A
 
A
C
 
C
D
 
K
R
 
E
Y
 
N
E
 
D
V
 
V
H
 
I
L
 
F
I
 
I
H
 
L
D
|
D
E
 
E
I
 
V
A
 
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
M
 
M
F
 
F
A
 
F
C
 
C
E
 
D
Q
 
N
A
 
E
G
 
E
I
 
L
T
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
K
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
L
C
 
C
L
 
L
S
 
G
K
|
K
A
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
M
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
T
T
 
T
D
 
D
R
 
E
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
N
A
 
Q
F
 
F
Y
 
L
D
 
G
D
 
E
Y
 
F
S
 
G
T
 
E
L
 
S
R
 
K
A
 
Q
F
 
L
L
 
Y
H
 
H
S
 
G
H
 
H
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
Q
L
 
L
A
 
L
C
 
C
A
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
E
I
 
I
F
 
F
A
 
E
E
 
K
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
N
N
 
I
K
 
Q
P
 
P
L
 
K
A
 
I
A
 
K
R
 
L
M
 
F
A
 
H
S
 
K
A
 
E
T
 
L
A
 
R
H
 
K
L
 
L
V
 
K
D
 
E
H
 
L
P
 
E
H
 
H
V
 
V
A
 
G
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
G
T
 
R
G
 
G
M
 
F
A
 
M
L
 
V
A
 
G
I
 
I
E
 
E
M
 
L
V
 
V
Q
 
K
D
 
D
K
 
K
A
 
E
S
 
T
R
 
K
T
 
E
A
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
Y
Q
 
G
E
 
Y
R
 
K
R
 
A
G
 
G
L
 
Y
K
 
R
V
 
V
Y
 
A
Q
 
E
H
 
K
A
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
K
G
 
G
A
 
I
L
 
Y
L
 
M
R
 
R
P
 
P
L
 
I
G
 
G
S
 
N
V
 
V
V
 
I
Y
 
I
F
 
L
L
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
L
C
 
S
I
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
K
Q
 
E
I
 
I
D
 
I
F
 
Y
L
 
L
A
 
C
A
 
D
V
 
A
A
 
L
T
 
Y
E
 
E
G
 
A
I
 
I
D
 
K
I
 
E
A
 
A

3dodA Crystal structure of plp bound 7,8-diaminopelargonic acid synthase in bacillus subtilis (see paper)
39% identity, 92% coverage: 15:444/467 of query aligns to 11:409/417 of 3dodA

query
sites
3dodA
L
 
L
W
 
W
H
 
L
P
 
P
C
x
F
T
 
T
Q
 
Q
M
 
M
K
 
K
D
 
D
H
 
Y
E
 
D
Q
 
E
L
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
P
 
-
I
 
I
R
 
E
R
 
S
G
 
G
D
 
T
G
 
G
V
 
I
W
 
K
L
 
V
E
 
K
D
 
D
F
 
I
D
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
E
Y
 
Y
L
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
F
S
 
S
S
 
S
W
 
V
W
|
W
V
 
L
N
 
N
V
 
V
F
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
R
N
 
K
P
 
K
R
 
E
I
 
L
N
 
D
Q
 
D
R
 
A
I
 
I
K
 
K
D
 
K
Q
 
Q
V
 
L
D
 
G
Q
 
K
L
 
I
E
 
A
H
 
H
V
 
S
M
 
T
L
 
L
A
 
L
G
 
G
F
 
M
S
 
T
H
 
N
Q
 
V
P
 
P
V
 
A
V
 
T
E
 
Q
L
 
L
S
 
A
E
 
E
R
 
T
L
 
L
V
 
I
A
 
D
L
 
I
T
 
S
P
 
P
A
 
K
G
 
K
L
 
L
D
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
Y
 
Y
T
 
S
D
 
D
N
x
S
G
|
G
S
x
A
T
 
E
G
 
A
I
 
M
E
 
E
V
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
F
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
K
N
 
N
S
 
I
G
 
G
R
 
K
G
 
P
Q
 
E
K
 
K
Q
 
Q
R
 
K
F
 
F
V
 
I
T
 
A
L
 
M
T
 
K
N
 
-
S
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
S
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
S
F
 
Y
K
 
K
V
 
A
P
 
P
S
 
I
P
 
P
D
 
Y
C
 
V
Y
 
Y
L
 
-
R
 
R
P
 
S
D
 
E
G
 
S
V
 
G
S
 
D
W
 
P
E
 
D
E
 
E
H
 
C
S
 
R
R
 
D
Q
 
Q
M
 
C
F
 
L
A
 
R
H
 
E
M
 
L
E
 
A
Q
 
Q
T
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
E
H
 
H
H
 
H
Q
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
S
V
 
I
E
|
E
P
 
S
L
 
M
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
M
 
M
R
 
I
M
 
V
Y
 
M
H
 
P
P
 
E
V
 
G
Y
 
Y
L
 
L
K
 
A
L
 
G
L
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
L
C
 
C
D
 
T
R
 
T
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
H
 
L
L
 
M
I
 
I
H
 
V
D
|
D
E
 
E
I
x
V
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
M
 
M
F
 
F
A
 
A
C
 
C
E
 
E
Q
 
H
A
 
E
G
 
N
I
 
V
T
 
Q
P
 
P
D
 
D
F
 
L
L
 
M
C
 
A
L
 
A
S
 
G
K
|
K
A
 
G
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
M
 
I
A
 
A
A
 
V
V
 
T
L
 
F
T
 
A
T
 
T
D
 
E
R
 
D
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
Y
 
Y
S
 
E
T
 
N
L
 
L
R
 
K
A
 
T
F
 
F
L
 
F
H
 
H
S
 
G
H
|
H
T
x
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
N
 
N
P
 
Q
L
 
L
A
 
G
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
E
T
 
N
L
 
L
D
 
A
I
 
L
F
 
F
A
 
E
E
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
Q
N
 
V
K
 
A
P
 
E
L
 
K
A
 
S
A
 
K
R
 
K
M
 
L
A
 
H
S
 
F
A
 
L
T
 
L
A
 
Q
H
 
D
L
 
L
V
 
H
D
 
A
H
 
L
P
 
P
H
 
H
V
 
V
A
 
G
E
 
D
V
 
I
R
 
R
Q
 
Q
T
 
L
G
 
G
M
 
F
A
 
M
L
 
C
A
 
G
I
 
A
E
 
E
M
 
L
V
 
V
Q
 
R
D
 
S
K
 
K
A
 
E
S
 
T
R
 
K
T
 
E
A
 
P
Y
 
Y
P
 
P
W
 
A
Q
 
D
E
 
R
R
 
R
R
 
I
G
 
G
L
 
Y
K
 
K
V
 
V
Y
 
S
Q
 
L
H
 
K
A
 
M
L
 
R
E
 
E
R
 
L
G
 
G
A
 
M
L
 
L
L
 
T
R
 
R
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
I
Y
x
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
L
C
 
A
I
 
S
T
 
T
E
 
A
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
D
 
S
F
 
E
L
 
M
A
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
M
T
 
K
E
 
Q
G
 
A
I
 
I

6ed7A Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase bound to inhibitor mac13772
41% identity, 92% coverage: 15:444/467 of query aligns to 13:421/429 of 6ed7A

query
sites
6ed7A
L
 
I
W
 
W
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
T
Q
 
S
M
 
M
K
 
T
D
 
S
H
 
-
E
 
-
Q
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
Y
P
 
P
I
 
V
R
 
V
R
 
S
G
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
C
W
 
E
L
 
L
E
 
I
D
 
L
F
 
S
D
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
G
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
A
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
Y
A
 
N
N
 
H
P
 
P
R
 
Q
I
 
L
N
 
N
Q
 
A
R
 
A
I
 
M
K
 
K
D
 
S
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
Q
 
A
L
 
M
E
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
I
S
 
T
H
 
H
Q
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
C
E
 
R
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
G
 
P
L
 
L
D
 
E
R
 
C
V
 
V
F
 
F
Y
 
L
T
 
A
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
Q
N
 
A
S
 
K
G
 
G
R
 
E
G
 
A
Q
 
-
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
F
T
 
R
N
 
N
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
E
x
D
T
 
T
V
 
F
A
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
G
 
C
D
 
D
V
 
P
-
 
D
A
 
N
L
 
S
F
 
M
T
 
H
D
 
S
T
 
L
Y
 
W
K
 
K
P
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
P
D
 
E
T
 
N
F
 
L
K
 
F
V
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
D
 
Q
C
 
S
Y
 
-
L
 
-
R
 
R
P
 
M
D
 
D
G
 
G
V
 
-
S
 
E
W
 
W
E
 
D
E
 
E
H
 
R
S
 
D
R
 
M
Q
 
V
M
 
G
F
 
F
A
 
A
H
 
R
M
 
L
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
M
A
 
A
E
 
A
H
 
H
H
 
R
Q
 
H
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
I
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
M
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
V
 
E
Y
 
W
L
 
L
K
 
K
L
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
K
A
 
I
C
 
C
D
 
D
R
 
R
Y
 
E
E
 
G
V
 
I
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
 
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
C
E
 
E
Q
 
H
A
 
A
G
 
E
I
 
I
T
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
L
C
 
C
L
 
L
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
L
 
M
P
 
T
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
T
T
 
T
D
 
R
R
 
E
I
 
V
Y
 
A
Q
 
E
A
 
T
F
 
I
Y
 
S
D
 
N
D
 
G
Y
 
E
S
 
A
T
 
G
L
 
-
R
 
-
A
 
C
F
 
F
L
 
M
H
 
H
S
 
G
H
 
P
T
 
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
N
A
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
E
E
 
S
D
 
G
N
 
D
V
 
W
I
 
Q
E
 
Q
A
 
Q
N
 
V
K
 
A
P
 
D
L
 
I
A
 
E
A
 
V
R
 
Q
M
 
L
A
 
R
S
 
E
A
 
Q
T
 
L
A
 
A
H
 
P
L
 
A
V
 
R
D
 
D
H
 
A
P
 
E
H
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
L
G
 
G
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
I
 
I
E
 
G
M
 
V
V
 
V
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
T
A
 
T
Y
 
H
P
 
P
W
 
V
Q
 
N
E
 
M
R
 
A
R
 
A
G
 
L
L
 
Q
K
 
K
V
 
F
Y
 
F
Q
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
I
R
|
R
P
 
P
L
x
F
G
 
G
S
 
K
V
 
L
V
 
I
Y
 
Y
F
 
L
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
I
T
 
L
E
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
D
 
Q
F
 
R
L
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
A
A
 
V
T
 
N
E
 
R
G
 
A
I
 
V

P12995 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase; 7,8-diamino-pelargonic acid aminotransferase; DAPA AT; DAPA aminotransferase; 7,8-diaminononanoate synthase; DANS; Diaminopelargonic acid synthase; EC 2.6.1.62 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
41% identity, 93% coverage: 15:448/467 of query aligns to 13:425/429 of P12995

query
sites
P12995
L
 
I
W
 
W
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
T
Q
 
S
M
 
M
K
 
T
D
 
S
H
 
-
E
 
-
Q
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
Y
P
 
P
I
 
V
R
 
V
R
 
S
G
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
C
W
 
E
L
 
L
E
 
I
D
 
L
F
 
S
D
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
G
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
A
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
Y
A
 
N
N
 
H
P
 
P
R
 
Q
I
 
L
N
 
N
Q
 
A
R
 
A
I
 
M
K
 
K
D
 
S
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
Q
 
A
L
 
M
E
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
I
S
 
T
H
 
H
Q
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
C
E
 
R
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
G
 
P
L
 
L
D
 
E
R
 
C
V
 
V
F
 
F
Y
 
L
T
 
A
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
Q
N
 
A
S
 
K
G
 
G
R
 
E
G
 
A
Q
 
-
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
F
T
 
R
N
 
N
S
 
G
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
E
x
D
T
 
T
V
 
F
A
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
G
 
C
D
 
D
V
 
P
-
 
D
A
 
N
L
 
S
F
 
M
T
 
H
D
 
S
T
 
L
Y
 
W
K
 
K
P
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
P
D
 
E
T
 
N
F
 
L
K
 
F
V
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
D
 
Q
C
 
S
Y
 
-
L
 
-
R
 
R
P
 
M
D
 
D
G
 
G
V
 
-
S
 
E
W
 
W
E
 
D
E
 
E
H
 
R
S
 
D
R
 
M
Q
 
V
M
 
G
F
 
F
A
 
A
H
 
R
M
 
L
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
M
A
 
A
E
 
A
H
 
H
H
 
R
Q
 
H
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
I
E
 
E
P
 
P
L
 
I
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
M
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
V
 
E
Y
 
W
L
 
L
K
 
K
L
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
K
A
 
I
C
 
C
D
 
D
R
 
R
Y
 
E
E
 
G
V
 
I
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
A
D
|
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
C
E
 
E
Q
 
H
A
 
A
G
 
E
I
 
I
T
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
L
C
 
C
L
 
L
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
L
 
M
P
 
T
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
T
T
 
T
D
 
R
R
 
E
I
 
V
Y
 
A
Q
 
E
A
 
T
F
 
I
Y
 
S
D
 
N
D
 
G
Y
 
E
S
 
A
T
 
G
L
 
-
R
 
-
A
 
C
F
 
F
L
 
M
H
 
H
S
x
G
H
x
P
T
|
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
N
A
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
E
E
 
S
D
 
G
N
 
D
V
 
W
I
 
Q
E
 
Q
A
 
Q
N
 
V
K
 
A
P
 
D
L
 
I
A
 
E
A
 
V
R
 
Q
M
 
L
A
 
R
S
 
E
A
 
Q
T
 
L
A
 
A
H
 
P
L
 
A
V
 
R
D
 
D
H
 
A
P
 
E
H
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
L
G
 
G
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
I
 
I
E
 
G
M
 
V
V
 
V
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
T
A
 
T
Y
 
H
P
 
P
W
 
V
Q
 
N
E
 
M
R
 
A
R
 
A
G
 
L
L
 
Q
K
 
K
V
 
F
Y
 
F
Q
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
I
R
|
R
P
 
P
L
 
F
G
 
G
S
 
K
V
 
L
V
 
I
Y
 
Y
F
 
L
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
I
T
 
L
E
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
D
 
Q
F
 
R
L
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
A
A
 
V
T
 
N
E
 
R
G
 
A
I
 
V
D
 
Q
I
 
D
A
 
E
T
 
T

1dtyA Crystal structure of adenosylmethionine-8-amino-7-oxonanoate aminotransferase with pyridoxal phosphate cofactor.
41% identity, 92% coverage: 15:444/467 of query aligns to 13:421/429 of 1dtyA

query
sites
1dtyA
L
 
I
W
 
W
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
T
Q
 
S
M
 
M
K
 
T
D
 
S
H
 
-
E
 
-
Q
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
Y
P
 
P
I
 
V
R
 
V
R
 
S
G
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
C
W
 
E
L
 
L
E
 
I
D
 
L
F
 
S
D
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
G
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
V
 
A
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
Y
A
 
N
N
 
H
P
 
P
R
 
Q
I
 
L
N
 
N
Q
 
A
R
 
A
I
 
M
K
 
K
D
 
S
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
Q
 
A
L
 
M
E
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
E
F
 
I
S
 
T
H
 
H
Q
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
C
E
 
R
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
G
 
P
L
 
L
D
 
E
R
 
C
V
 
V
F
 
F
Y
 
L
T
 
A
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
D
N
 
A
S
 
K
G
 
G
R
 
E
G
 
A
Q
 
-
K
 
R
Q
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
F
T
 
R
N
 
N
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
F
A
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
G
 
C
D
 
D
V
 
P
-
 
D
A
 
N
L
 
S
F
 
M
T
 
H
D
 
S
T
 
L
Y
 
W
K
 
K
P
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
P
D
 
E
T
 
N
F
 
L
K
 
F
V
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
D
 
Q
C
 
S
Y
 
-
L
 
-
R
 
R
P
 
M
D
 
D
G
 
G
V
 
-
S
 
E
W
 
W
E
 
D
E
 
E
H
 
R
S
 
D
R
 
M
Q
 
V
M
 
G
F
 
F
A
 
A
H
 
R
M
 
L
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
M
A
 
A
E
 
A
H
 
H
H
 
R
Q
 
H
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
I
E
|
E
P
 
P
L
 
I
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
M
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
V
 
E
Y
 
W
L
 
L
K
 
K
L
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
K
A
 
I
C
 
C
D
 
D
R
 
R
Y
 
E
E
 
G
V
 
I
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
C
E
 
E
Q
 
H
A
 
A
G
 
E
I
 
I
T
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
L
C
 
C
L
 
L
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
L
 
M
P
 
T
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
T
T
 
T
D
 
R
R
 
E
I
 
V
Y
 
A
Q
 
E
A
 
T
F
 
I
Y
 
S
D
 
D
D
 
G
Y
 
E
S
 
A
T
 
G
L
 
-
R
 
-
A
 
C
F
 
F
L
 
M
H
 
H
S
 
G
H
 
P
T
 
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
N
A
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
E
E
 
S
D
 
G
N
 
D
V
 
W
I
 
Q
E
 
Q
A
 
Q
N
 
V
K
 
A
P
 
D
L
 
I
A
 
E
A
 
V
R
 
Q
M
 
L
A
 
R
S
 
E
A
 
Q
T
 
L
A
 
A
H
 
P
L
 
A
V
 
R
D
 
D
H
 
A
P
 
E
H
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
L
G
 
G
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
I
 
I
E
 
G
M
 
V
V
 
V
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
T
A
 
T
Y
 
H
P
 
P
W
 
V
Q
 
N
E
 
M
R
 
A
R
 
A
G
 
L
L
 
Q
K
 
K
V
 
F
Y
 
F
Q
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
I
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
G
S
 
K
V
 
L
V
 
I
Y
|
Y
F
 
L
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
I
T
 
L
E
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
D
 
Q
F
 
R
L
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
A
A
 
V
T
 
N
E
 
R
G
 
A
I
 
V

1mlzA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase in complex with the trans-isomer of amiclenomycin. (see paper)
40% identity, 92% coverage: 17:444/467 of query aligns to 15:420/427 of 1mlzA

query
sites
1mlzA
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
T
Q
 
S
M
 
M
K
 
T
D
 
S
H
 
-
E
 
-
Q
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
Y
P
 
P
I
 
V
R
 
V
R
 
S
G
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
C
W
 
E
L
 
L
E
 
I
D
 
L
F
 
S
D
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
G
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
V
 
A
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
Y
A
 
N
N
 
H
P
 
P
R
 
Q
I
 
L
N
 
N
Q
 
A
R
 
A
I
 
M
K
 
K
D
 
S
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
Q
 
A
L
 
M
E
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
I
S
 
T
H
 
H
Q
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
C
E
 
R
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
G
 
P
L
 
L
D
 
E
R
 
C
V
 
V
F
 
F
Y
 
L
T
 
A
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
Q
N
 
A
S
 
K
G
 
G
R
 
E
G
 
A
Q
 
-
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
F
T
 
R
N
 
N
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
F
A
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
G
 
C
D
 
D
V
 
P
-
 
D
A
 
N
L
 
S
F
 
M
T
 
H
D
 
S
T
 
L
Y
 
W
K
 
K
P
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
P
D
 
E
T
 
N
F
 
L
K
 
F
V
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
D
 
Q
C
 
S
Y
 
R
L
 
M
R
 
G
P
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
E
W
 
W
E
 
D
E
 
E
H
 
R
S
 
D
R
 
M
Q
 
V
M
 
G
F
 
F
A
 
A
H
 
R
M
 
L
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
M
A
 
A
E
 
A
H
 
H
H
 
R
Q
 
H
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
I
E
|
E
P
 
P
L
 
I
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
M
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
V
 
E
Y
 
W
L
 
L
K
 
K
L
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
K
A
 
I
C
 
C
D
 
D
R
 
R
Y
 
E
E
 
G
V
 
I
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
C
E
 
E
Q
 
H
A
 
A
G
 
E
I
 
I
T
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
L
C
 
C
L
 
L
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
L
 
M
P
 
T
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
T
T
 
T
D
 
R
R
 
E
I
 
V
Y
 
A
Q
 
E
A
 
T
F
 
I
Y
 
S
D
 
N
D
 
G
Y
 
E
S
 
A
T
 
G
L
 
-
R
 
-
A
 
C
F
 
F
L
 
M
H
 
H
S
 
G
H
x
P
T
|
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
N
A
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
E
E
 
S
D
 
G
N
 
D
V
 
W
I
 
Q
E
 
Q
A
 
Q
N
 
V
K
 
A
P
 
D
L
 
I
A
 
E
A
 
V
R
 
Q
M
 
L
A
 
R
S
 
E
A
 
Q
T
 
L
A
 
A
H
 
P
L
 
A
V
 
R
D
 
D
H
 
A
P
 
E
H
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
L
G
 
G
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
I
 
I
E
 
G
M
 
V
V
 
V
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
T
A
 
T
Y
 
H
P
 
P
W
 
V
Q
 
N
E
 
M
R
 
A
R
 
A
G
 
L
L
 
Q
K
 
K
V
 
F
Y
 
F
Q
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
I
R
|
R
P
 
P
L
x
F
G
 
G
S
 
K
V
 
L
V
 
I
Y
|
Y
F
 
L
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
I
T
 
L
E
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
D
 
Q
F
 
R
L
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
A
A
 
V
T
 
N
E
 
R
G
 
A
I
 
V

1mlyA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase in complex with the cis isomer of amiclenomycin (see paper)
40% identity, 92% coverage: 17:444/467 of query aligns to 15:420/427 of 1mlyA

query
sites
1mlyA
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
T
Q
 
S
M
 
M
K
 
T
D
 
S
H
 
-
E
 
-
Q
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
Y
P
 
P
I
 
V
R
 
V
R
 
S
G
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
C
W
 
E
L
 
L
E
 
I
D
 
L
F
 
S
D
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
G
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
V
 
A
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
Y
A
 
N
N
 
H
P
 
P
R
 
Q
I
 
L
N
 
N
Q
 
A
R
 
A
I
 
M
K
 
K
D
 
S
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
Q
 
A
L
 
M
E
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
I
S
 
T
H
 
H
Q
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
C
E
 
R
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
G
 
P
L
 
L
D
 
E
R
 
C
V
 
V
F
 
F
Y
 
L
T
 
A
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
Q
N
 
A
S
 
K
G
 
G
R
 
E
G
 
A
Q
 
-
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
F
T
 
R
N
 
N
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
F
A
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
G
 
C
D
 
D
V
 
P
-
 
D
A
 
N
L
 
S
F
 
M
T
 
H
D
 
S
T
 
L
Y
 
W
K
 
K
P
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
P
D
 
E
T
 
N
F
 
L
K
 
F
V
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
D
 
Q
C
 
S
Y
 
R
L
 
M
R
 
G
P
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
E
W
 
W
E
 
D
E
 
E
H
 
R
S
 
D
R
 
M
Q
 
V
M
 
G
F
 
F
A
 
A
H
 
R
M
 
L
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
M
A
 
A
E
 
A
H
 
H
H
 
R
Q
 
H
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
I
E
|
E
P
 
P
L
 
I
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
M
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
V
 
E
Y
 
W
L
 
L
K
 
K
L
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
K
A
 
I
C
 
C
D
 
D
R
 
R
Y
 
E
E
 
G
V
 
I
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
C
E
 
E
Q
 
H
A
 
A
G
 
E
I
 
I
T
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
L
C
 
C
L
 
L
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
L
 
M
P
 
T
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
T
T
 
T
D
 
R
R
 
E
I
 
V
Y
 
A
Q
 
E
A
 
T
F
 
I
Y
 
S
D
 
N
D
 
G
Y
 
E
S
 
A
T
 
G
L
 
-
R
 
-
A
 
C
F
 
F
L
 
M
H
 
H
S
 
G
H
x
P
T
|
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
N
A
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
E
E
 
S
D
 
G
N
 
D
V
 
W
I
 
Q
E
 
Q
A
 
Q
N
 
V
K
 
A
P
 
D
L
 
I
A
 
E
A
 
V
R
 
Q
M
 
L
A
 
R
S
 
E
A
 
Q
T
 
L
A
 
A
H
 
P
L
 
A
V
 
R
D
 
D
H
 
A
P
 
E
H
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
L
G
 
G
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
I
 
I
E
 
G
M
 
V
V
 
V
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
T
A
 
T
Y
 
H
P
 
P
W
 
V
Q
 
N
E
 
M
R
 
A
R
 
A
G
 
L
L
 
Q
K
 
K
V
 
F
Y
 
F
Q
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
I
R
|
R
P
 
P
L
x
F
G
 
G
S
 
K
V
 
L
V
 
I
Y
|
Y
F
 
L
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
I
T
 
L
E
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
D
 
Q
F
 
R
L
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
A
A
 
V
T
 
N
E
 
R
G
 
A
I
 
V

1qj3A Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase in complex with 7-keto-8-aminopelargonic acid (see paper)
40% identity, 92% coverage: 15:444/467 of query aligns to 13:409/416 of 1qj3A

query
sites
1qj3A
L
 
I
W
 
L
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
T
Q
 
S
M
 
M
K
 
T
D
 
S
H
 
-
E
 
-
Q
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
Y
P
 
P
I
 
V
R
 
V
R
 
S
G
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
C
W
 
E
L
 
L
E
 
I
D
 
L
F
 
S
D
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
R
Y
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
G
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
A
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
Y
A
 
N
N
 
H
P
 
P
R
 
Q
I
 
L
N
 
N
Q
 
A
R
 
A
I
 
M
K
 
K
D
 
S
Q
 
Q
V
 
I
D
 
D
Q
 
A
L
 
M
E
 
S
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
I
S
 
T
H
 
H
Q
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
C
E
 
R
R
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
G
 
P
L
 
L
D
 
E
R
 
C
V
 
V
F
 
F
Y
 
L
T
 
A
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
Q
N
 
A
S
 
K
G
 
G
R
 
E
G
 
A
Q
 
-
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
F
T
 
R
N
 
N
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
E
 
D
T
 
T
V
 
F
A
 
G
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
G
 
C
D
 
D
V
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
T
 
P
D
 
D
T
 
N
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
L
L
 
P
D
 
E
T
 
N
F
 
L
K
 
F
V
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
D
 
Q
C
 
S
Y
 
R
L
 
M
R
 
G
P
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
E
W
 
W
E
 
D
E
 
E
H
 
R
S
 
D
R
 
M
Q
 
V
M
 
G
F
 
F
A
 
A
H
 
R
M
 
L
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
M
A
 
A
E
 
A
H
 
H
H
 
R
Q
 
H
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
V
 
I
E
|
E
P
 
P
L
 
I
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
M
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
V
 
E
Y
 
W
L
 
L
K
 
K
L
 
R
L
 
I
R
 
R
E
 
K
A
 
I
C
 
C
D
 
D
R
 
R
Y
 
E
E
 
G
V
 
I
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
C
E
 
E
Q
 
H
A
 
A
G
 
E
I
 
I
T
 
A
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
L
C
 
C
L
 
L
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
T
L
 
M
P
 
T
M
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
T
T
 
T
D
 
R
R
 
E
I
 
V
Y
 
A
Q
 
E
A
 
T
F
 
I
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
Y
 
-
S
 
S
T
 
N
L
 
G
R
 
G
A
 
C
F
 
F
L
 
M
H
 
H
S
 
G
H
 
P
T
 
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
N
A
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
E
E
 
S
D
 
G
N
 
D
V
 
W
I
 
Q
E
 
Q
A
 
Q
N
 
V
K
 
A
P
 
D
L
 
I
A
 
E
A
 
V
R
 
Q
M
 
L
A
 
R
S
 
E
A
 
Q
T
 
L
A
 
A
H
 
P
L
 
A
V
 
R
D
 
D
H
 
A
P
 
E
H
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
L
G
 
G
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
A
I
 
I
E
 
G
M
 
V
V
 
V
Q
 
E
D
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
T
A
 
T
Y
 
H
P
 
P
W
 
V
Q
 
N
E
 
M
R
 
A
R
 
A
G
 
L
L
 
Q
K
 
K
V
 
F
Y
 
F
Q
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
V
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
I
R
|
R
P
 
P
L
x
F
G
 
G
S
 
K
V
 
L
V
 
I
Y
|
Y
F
 
L
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
I
T
 
L
E
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
D
 
Q
F
 
R
L
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
A
A
 
V
T
 
N
E
 
R
G
 
A
I
 
V

6erkA Crystal structure of diaminopelargonic acid aminotransferase from psychrobacter cryohalolentis (see paper)
38% identity, 90% coverage: 15:436/467 of query aligns to 14:405/420 of 6erkA

query
sites
6erkA
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
A
Q
 
S
M
 
L
K
 
P
D
 
-
H
 
-
E
 
P
Q
 
T
L
 
Y
P
 
P
L
 
N
I
 
I
P
 
V
I
 
I
R
 
D
R
 
R
G
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
I
W
 
Y
L
 
I
E
 
V
D
 
T
F
 
E
D
 
D
G
 
G
K
 
T
R
 
R
Y
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
V
 
A
N
 
S
V
 
V
F
 
H
G
 
G
H
 
Y
A
 
N
N
 
H
P
 
P
R
 
K
I
 
L
N
 
N
Q
 
A
R
 
A
I
 
M
K
 
I
D
 
E
Q
 
Q
V
 
L
D
 
G
Q
 
K
L
 
M
E
 
A
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
Q
 
Q
P
 
P
V
 
A
V
 
I
E
 
D
L
 
L
S
 
G
E
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
S
L
 
I
T
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
A
V
 
I
F
 
F
Y
 
Y
T
 
A
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
I
G
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
L
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
Q
R
 
I
N
 
A
S
 
A
G
 
K
R
 
R
G
 
P
Q
 
S
K
 
K
Q
 
C
R
 
Q
F
 
F
V
 
A
T
 
S
L
 
T
T
 
H
N
 
S
S
 
G
Y
|
Y
H
x
Y
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
W
A
 
H
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
V
G
 
C
D
 
D
V
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
Y
 
-
K
 
K
P
 
Q
L
 
L
L
 
P
L
 
M
D
 
Q
T
 
H
F
 
F
K
 
V
V
 
A
P
 
A
S
 
P
P
 
P
D
 
M
C
 
G
Y
 
F
L
 
E
R
 
R
P
 
D
D
 
L
G
 
T
V
 
Q
S
 
S
W
 
E
E
 
R
E
 
E
H
 
A
S
 
L
R
 
T
Q
 
E
M
 
F
F
 
F
A
 
-
H
 
-
M
 
-
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
V
E
 
K
H
 
N
H
 
S
Q
 
D
D
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
F
I
 
I
V
 
I
E
|
E
P
 
P
L
 
I
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
Y
 
Y
H
 
S
P
 
P
V
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
K
A
 
L
C
 
C
D
 
D
R
 
E
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
A
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
 
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
S
G
 
G
T
 
K
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
C
E
 
E
Q
 
H
A
 
A
G
 
A
I
 
I
T
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
M
C
 
T
L
 
I
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
M
P
 
T
M
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
S
T
 
T
D
 
R
R
 
E
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
A
 
T
F
 
I
Y
 
-
D
 
-
D
 
S
Y
 
Q
S
 
S
T
 
D
L
 
Y
R
 
P
A
 
A
F
 
L
L
 
M
H
 
H
S
 
G
H
 
P
T
 
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
C
A
 
A
T
 
S
L
 
I
D
 
D
I
 
L
F
 
I
A
 
V
E
 
S
D
 
Y
N
 
D
V
 
I
I
 
E
E
 
A
A
 
R
N
 
T
K
 
E
P
 
N
L
 
M
A
 
Q
A
 
A
R
 
I
M
 
M
A
 
N
S
 
E
A
 
Q
T
 
L
A
 
A
H
 
P
L
 
A
V
 
V
D
 
S
H
 
L
P
 
E
H
 
G
V
 
V
A
 
K
E
 
E
V
 
V
R
 
R
Q
 
C
T
 
L
G
 
G
M
 
A
A
 
V
L
 
A
A
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
L
V
 
-
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
W
 
-
Q
 
N
E
 
E
R
 
A
R
 
V
G
 
D
L
 
M
K
 
P
V
 
I
Y
 
F
Q
 
Q
H
 
T
A
 
L
L
 
L
-
 
I
E
 
N
R
 
N
G
 
G
A
 
I
L
 
W
L
 
V
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
G
S
 
K
V
 
L
V
 
V
Y
 
Y
F
 
I
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
V
I
 
I
T
 
T
E
 
D
E
 
D
Q
 
E
I
 
L
D
 
T
F
 
T
L
 
L

3tfuA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, post-reaction complex with a 3,6- dihydropyrid-2-one heterocycle inhibitor (see paper)
38% identity, 93% coverage: 11:442/467 of query aligns to 11:412/417 of 3tfuA

query
sites
3tfuA
D
 
D
L
 
G
A
 
A
V
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
S
Q
 
S
M
 
I
K
 
G
D
 
-
H
 
R
E
 
E
Q
 
A
L
 
V
P
 
S
L
 
P
I
 
V
P
 
V
I
 
A
R
 
V
R
 
A
G
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
W
 
W
L
 
L
E
 
T
D
 
L
F
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
-
 
P
-
 
I
R
 
E
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
N
 
H
P
 
P
R
 
A
I
 
L
N
 
D
Q
 
Q
R
 
A
I
 
L
K
 
T
D
 
T
Q
 
Q
V
 
L
D
 
R
Q
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
Q
 
E
P
 
P
V
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
T
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
N
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
P
Q
 
G
K
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
V
 
M
T
 
T
L
 
W
T
 
R
N
 
G
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
D
 
D
V
 
P
A
 
H
L
 
L
F
 
A
T
 
A
D
 
Q
T
 
V
Y
 
F
K
 
A
P
 
P
L
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
-
F
 
-
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
S
 
-
P
 
-
D
 
-
C
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
R
E
 
D
H
 
Y
S
 
D
R
 
P
Q
 
A
M
 
Y
F
 
S
A
 
A
H
 
A
M
 
F
E
 
E
Q
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
H
 
H
H
 
A
Q
 
G
D
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
V
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
H
L
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
I
C
 
C
D
 
R
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
E
 
D
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
C
T
 
T
D
 
A
R
 
D
I
 
V
Y
 
A
Q
 
H
A
 
T
F
 
I
Y
 
-
D
 
-
D
 
S
Y
 
A
S
 
G
T
 
A
L
 
A
R
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
M
H
 
H
S
 
G
H
x
P
T
|
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
L
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
V
D
 
E
I
 
L
F
 
L
A
 
L
E
 
G
D
 
Q
N
 
D
V
 
W
I
 
R
E
 
T
A
 
R
N
 
I
K
 
T
P
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
G
M
 
L
A
 
T
S
 
A
A
 
G
T
 
L
A
 
D
H
 
T
L
 
A
V
 
R
D
 
A
H
 
L
P
 
P
H
 
A
V
 
V
A
 
T
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
C
G
 
G
M
 
A
A
 
I
L
 
G
A
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
V
 
D
Q
 
R
D
 
P
K
 
V
A
 
D
S
 
L
R
 
A
T
 
V
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
S
 
N
V
 
L
V
 
V
Y
|
Y
F
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
C
T
 
T
E
 
P
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
D
 
T
F
 
Q
L
 
I
A
 
T
A
 
S
V
 
A
A
 
M
T
 
V
E
 
E

4cxqA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with substrate kapa (see paper)
38% identity, 93% coverage: 11:442/467 of query aligns to 10:420/427 of 4cxqA

query
sites
4cxqA
D
 
D
L
 
G
A
 
A
V
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
S
Q
 
S
M
 
I
K
 
G
D
 
-
H
 
R
E
 
E
Q
 
V
L
 
S
P
 
P
L
 
V
I
 
V
P
 
A
I
 
V
R
 
A
R
 
-
G
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
W
 
W
L
 
L
E
 
T
D
 
L
F
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
-
 
P
-
 
I
R
 
E
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
N
 
H
P
 
P
R
 
A
I
 
L
N
 
D
Q
 
Q
R
 
A
I
 
L
K
 
T
D
 
T
Q
 
Q
V
 
L
D
 
R
Q
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
Q
 
E
P
 
P
V
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
T
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
N
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
P
Q
 
G
K
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
V
 
M
T
 
T
L
 
W
T
 
R
N
 
G
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
E
 
D
T
 
T
V
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
D
 
D
V
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
H
A
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
D
 
D
T
 
V
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
A
L
 
A
D
 
Q
T
 
V
F
 
F
K
 
A
V
 
P
P
 
Q
S
 
V
P
 
P
D
 
-
C
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
R
E
 
D
H
 
Y
S
 
D
R
 
P
Q
 
A
M
 
Y
F
 
S
A
 
A
H
 
A
M
 
F
E
 
E
Q
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
H
 
H
H
 
A
Q
 
G
D
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
V
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
H
L
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
I
C
 
C
D
 
R
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
E
 
D
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
C
T
 
T
D
 
A
R
 
D
I
 
V
Y
 
A
Q
 
H
A
 
T
F
 
I
Y
 
-
D
 
-
D
 
S
Y
 
A
S
 
G
T
 
A
L
 
A
R
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
M
H
 
H
S
x
G
H
x
P
T
|
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
L
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
V
D
 
E
I
 
L
F
 
L
A
 
L
E
 
G
D
 
Q
N
 
D
V
 
W
I
 
R
E
 
T
A
 
R
N
 
I
K
 
T
P
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
G
M
 
L
A
 
T
S
 
A
A
 
G
T
 
L
A
 
D
H
 
T
L
 
A
V
 
R
D
 
A
H
 
L
P
 
P
H
 
A
V
 
V
A
 
T
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
C
G
 
G
M
 
A
A
 
I
L
 
G
A
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
V
 
D
Q
 
R
D
 
P
K
 
V
A
 
D
S
 
L
R
 
A
T
 
V
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
L
R
|
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
S
 
N
V
 
L
V
 
V
Y
|
Y
F
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
C
T
 
T
E
 
P
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
D
 
T
F
 
Q
L
 
I
A
 
T
A
 
S
V
 
A
A
 
M
T
 
V
E
 
E

4w1vA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a thiazole inhibitor (see paper)
38% identity, 93% coverage: 11:442/467 of query aligns to 10:418/425 of 4w1vA

query
sites
4w1vA
D
 
D
L
 
G
A
 
A
V
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
C
x
Y
T
 
S
Q
 
S
M
 
I
K
 
G
D
 
-
H
 
-
E
 
-
Q
 
R
L
 
S
P
 
P
L
 
V
I
 
V
P
 
A
I
 
V
R
 
A
R
 
-
G
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
W
 
W
L
 
L
E
 
T
D
 
L
F
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
-
 
P
-
 
I
R
 
E
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
N
 
H
P
 
P
R
 
A
I
 
L
N
 
D
Q
 
Q
R
 
A
I
 
L
K
 
T
D
 
T
Q
 
Q
V
 
L
D
 
R
Q
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
L
 
F
A
x
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
Q
 
E
P
 
P
V
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
T
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
N
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
P
Q
 
G
K
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
V
 
M
T
 
T
L
 
W
T
 
R
N
 
G
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
D
 
D
V
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
H
A
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
D
 
D
T
 
V
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
A
L
 
A
D
 
Q
T
 
V
F
 
F
K
 
A
V
 
P
P
 
Q
S
 
V
P
 
P
D
 
-
C
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
R
E
 
D
H
 
Y
S
 
D
R
 
P
Q
 
A
M
 
Y
F
 
S
A
 
A
H
 
A
M
 
F
E
 
E
Q
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
H
 
H
H
 
A
Q
 
G
D
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
V
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
H
L
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
I
C
 
C
D
 
R
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
E
 
D
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
C
T
 
T
D
 
A
R
 
D
I
 
V
Y
 
A
Q
 
H
A
 
T
F
 
I
Y
 
-
D
 
-
D
 
S
Y
 
A
S
 
G
T
 
A
L
 
A
R
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
M
H
 
H
S
x
G
H
x
P
T
|
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
L
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
V
D
 
E
I
 
L
F
 
L
A
 
L
E
 
G
D
 
Q
N
 
D
V
 
W
I
 
R
E
 
T
A
 
R
N
 
I
K
 
T
P
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
G
M
 
L
A
 
T
S
 
A
A
 
G
T
 
L
A
 
D
H
 
T
L
 
A
V
 
R
D
 
A
H
 
L
P
 
P
H
 
A
V
 
V
A
 
T
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
C
G
 
G
M
 
A
A
 
I
L
 
G
A
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
V
 
D
Q
 
R
D
 
P
K
 
V
A
 
D
S
 
L
R
 
A
T
 
V
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
x
F
G
 
R
S
 
N
V
 
L
V
 
V
Y
|
Y
F
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
C
T
 
T
E
 
P
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
D
 
T
F
 
Q
L
 
I
A
 
T
A
 
S
V
 
A
A
 
M
T
 
V
E
 
E

4cxrA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with 1-(1,3- benzothiazol-2-yl)methanamine (see paper)
38% identity, 93% coverage: 11:442/467 of query aligns to 10:418/425 of 4cxrA

query
sites
4cxrA
D
 
D
L
 
G
A
 
A
V
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
S
Q
 
S
M
 
I
K
 
G
D
 
-
H
 
-
E
 
-
Q
 
R
L
 
S
P
 
P
L
 
V
I
 
V
P
 
A
I
 
V
R
 
A
R
 
-
G
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
W
 
W
L
 
L
E
 
T
D
 
L
F
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
-
 
P
-
 
I
R
 
E
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
V
 
T
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
N
 
H
P
 
P
R
 
A
I
 
L
N
 
D
Q
 
Q
R
 
A
I
 
L
K
 
T
D
 
T
Q
 
Q
V
 
L
D
 
R
Q
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
Q
 
E
P
 
P
V
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
T
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
N
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
P
Q
 
G
K
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
V
 
M
T
 
T
L
 
W
T
 
R
N
 
G
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
D
 
D
V
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
H
A
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
D
 
D
T
 
V
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
A
L
 
A
D
 
Q
T
 
V
F
 
F
K
 
A
V
 
P
P
 
Q
S
 
V
P
 
P
D
 
-
C
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
R
E
 
D
H
 
Y
S
 
D
R
 
P
Q
 
A
M
 
Y
F
 
S
A
 
A
H
 
A
M
 
F
E
 
E
Q
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
H
 
H
H
 
A
Q
 
G
D
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
V
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
H
L
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
I
C
 
C
D
 
R
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
E
 
D
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
C
T
 
T
D
 
A
R
 
D
I
 
V
Y
 
A
Q
 
H
A
 
T
F
 
I
Y
 
-
D
 
-
D
 
S
Y
 
A
S
 
G
T
 
A
L
 
A
R
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
M
H
 
H
S
 
G
H
x
P
T
|
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
L
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
V
D
 
E
I
 
L
F
 
L
A
 
L
E
 
G
D
 
Q
N
 
D
V
 
W
I
 
R
E
 
T
A
 
R
N
 
I
K
 
T
P
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
G
M
 
L
A
 
T
S
 
A
A
 
G
T
 
L
A
 
D
H
 
T
L
 
A
V
 
R
D
 
A
H
 
L
P
 
P
H
 
A
V
 
V
A
 
T
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
C
G
 
G
M
 
A
A
 
I
L
 
G
A
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
V
 
D
Q
 
R
D
 
P
K
 
V
A
 
D
S
 
L
R
 
A
T
 
V
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
S
 
N
V
 
L
V
 
V
Y
|
Y
F
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
C
T
 
T
E
 
P
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
D
 
T
F
 
Q
L
 
I
A
 
T
A
 
S
V
 
A
A
 
M
T
 
V
E
 
E

4wyaA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a fragment hit (see paper)
38% identity, 93% coverage: 11:442/467 of query aligns to 11:415/420 of 4wyaA

query
sites
4wyaA
D
 
D
L
 
G
A
 
A
V
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
|
P
C
x
Y
T
 
S
Q
 
S
M
 
I
K
 
G
D
 
-
H
 
R
E
 
E
Q
 
A
L
 
V
P
 
S
L
 
P
I
 
V
P
 
V
I
 
A
R
 
V
R
 
A
G
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
W
 
W
L
 
L
E
 
T
D
 
L
F
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
-
 
P
-
 
I
R
 
E
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
N
 
H
P
 
P
R
 
A
I
 
L
N
 
D
Q
 
Q
R
 
A
I
 
L
K
 
T
D
 
T
Q
 
Q
V
 
L
D
 
R
Q
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
Q
 
E
P
 
P
V
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
T
 
S
D
 
D
N
x
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
N
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
P
Q
 
G
K
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
V
 
M
T
 
T
L
 
W
T
 
R
N
 
G
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
D
 
D
V
 
P
A
 
H
L
 
G
F
 
G
T
 
T
D
 
D
T
 
V
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
A
L
 
A
D
 
Q
T
 
V
F
 
F
K
 
A
V
 
P
P
 
Q
S
 
V
P
 
P
D
 
-
C
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
R
E
 
D
H
 
Y
S
 
D
R
 
P
Q
 
A
M
 
Y
F
 
S
A
 
A
H
 
A
M
 
F
E
 
E
Q
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
H
 
H
H
 
A
Q
 
G
D
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
V
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
H
L
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
I
C
 
C
D
 
R
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
E
 
D
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
C
T
 
T
D
 
A
R
 
D
I
 
V
Y
 
A
Q
 
H
A
 
T
F
 
I
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
Y
 
-
S
 
S
T
 
A
L
 
G
R
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
M
H
 
H
S
 
G
H
x
P
T
|
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
L
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
V
D
 
E
I
 
L
F
 
L
A
 
L
E
 
G
D
 
Q
N
 
D
V
 
W
I
 
R
E
 
T
A
 
R
N
 
I
K
 
T
P
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
G
M
 
L
A
 
T
S
 
A
A
 
G
T
 
L
A
 
D
H
 
T
L
 
A
V
 
R
D
 
A
H
 
L
P
 
P
H
 
A
V
 
V
A
 
T
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
C
G
 
G
M
 
A
A
 
I
L
 
G
A
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
V
 
D
Q
 
R
D
 
P
K
 
V
A
 
D
S
 
L
R
 
A
T
 
V
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
x
F
G
 
R
S
 
N
V
 
L
V
 
V
Y
|
Y
F
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
C
T
 
T
E
 
P
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
D
 
T
F
 
Q
L
 
I
A
 
T
A
 
S
V
 
A
A
 
M
T
 
V
E
 
E

P9WQ81 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase; 7,8-diamino-pelargonic acid aminotransferase; DAPA AT; DAPA aminotransferase; 7,8-diaminononanoate synthase; DANS; 7,8-diaminopelargonic acid synthase; DAPAS; Diaminopelargonic acid synthase; EC 2.6.1.62 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
38% identity, 93% coverage: 11:442/467 of query aligns to 17:428/437 of P9WQ81

query
sites
P9WQ81
D
 
D
L
 
G
A
 
A
V
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
S
Q
 
S
M
 
I
K
 
G
D
 
-
H
 
R
E
 
E
Q
 
A
L
 
V
P
 
S
L
 
P
I
 
V
P
 
V
I
 
A
R
 
V
R
 
A
G
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
W
 
W
L
 
L
E
 
T
D
 
L
F
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
-
 
P
-
 
I
R
 
E
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
N
 
H
P
 
P
R
 
A
I
 
L
N
 
D
Q
 
Q
R
 
A
I
 
L
K
 
T
D
 
T
Q
 
Q
V
 
L
D
 
R
Q
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
Q
 
E
P
 
P
V
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
T
 
S
D
 
D
N
 
S
G
 
G
S
 
S
T
 
V
G
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
N
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
P
Q
 
G
K
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
V
 
M
T
 
T
L
 
W
T
 
R
N
 
G
S
 
G
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
D
 
D
V
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
H
A
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
D
 
D
T
 
V
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
A
L
 
A
D
 
Q
T
 
V
F
 
F
K
 
A
V
 
P
P
 
Q
S
 
V
P
 
P
D
 
-
C
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
R
E
 
D
H
 
Y
S
 
D
R
 
P
Q
 
A
M
 
Y
F
 
S
A
 
A
H
 
A
M
 
F
E
 
E
Q
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
H
 
H
H
 
A
Q
 
G
D
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
L
 
V
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
V
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
H
L
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
I
C
 
C
D
 
R
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
F
D
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
E
 
D
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
C
T
 
T
D
 
A
R
 
D
I
 
V
Y
 
A
Q
 
H
A
 
T
F
 
I
Y
 
-
D
 
-
D
 
S
Y
 
A
S
 
G
T
 
A
L
 
A
R
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
M
H
 
H
S
x
G
H
 
P
T
 
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
L
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
V
D
 
E
I
 
L
F
 
L
A
 
L
E
 
G
D
 
Q
N
 
D
V
 
W
I
 
R
E
 
T
A
 
R
N
 
I
K
 
T
P
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
G
M
 
L
A
 
T
S
 
A
A
 
G
T
 
L
A
 
D
H
 
T
L
 
A
V
 
R
D
 
A
H
 
L
P
 
P
H
 
A
V
 
V
A
 
T
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
C
G
 
G
M
 
A
A
 
I
L
 
G
A
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
V
 
D
Q
 
R
D
 
P
K
 
V
A
 
D
S
 
L
R
 
A
T
 
V
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
S
 
N
V
 
L
V
 
V
Y
 
Y
F
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
C
T
 
T
E
 
P
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
D
 
T
F
 
Q
L
 
I
A
 
T
A
 
S
V
 
A
A
 
M
T
 
V
E
 
E

5te2A Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a mechanism-based inhibitor (see paper)
38% identity, 93% coverage: 11:442/467 of query aligns to 10:421/428 of 5te2A

query
sites
5te2A
D
 
D
L
 
G
A
 
A
V
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
S
Q
 
S
M
 
I
K
 
G
D
 
-
H
 
R
E
 
E
Q
 
A
L
 
V
P
 
S
L
 
P
I
 
V
P
 
V
I
 
A
R
 
V
R
 
A
G
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
W
 
W
L
 
L
E
 
T
D
 
L
F
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
-
 
P
-
 
I
R
 
E
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
N
 
H
P
 
P
R
 
A
I
 
L
N
 
D
Q
 
Q
R
 
A
I
 
L
K
 
T
D
 
T
Q
 
Q
V
 
L
D
 
R
Q
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
M
 
M
L
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
Q
 
E
P
 
P
V
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
T
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
N
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
P
Q
 
G
K
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
V
 
M
T
 
T
L
 
W
T
 
R
N
 
G
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
E
 
D
T
 
T
V
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
D
 
D
V
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
H
A
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
D
 
D
T
 
V
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
A
L
 
A
D
 
Q
T
 
V
F
 
F
K
 
A
V
 
P
P
 
Q
S
 
V
P
 
P
D
 
-
C
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
R
E
 
D
H
 
Y
S
 
D
R
 
P
Q
 
A
M
 
Y
F
 
S
A
 
A
H
 
A
M
 
F
E
 
E
Q
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
H
 
H
H
 
A
Q
 
G
D
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
V
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
H
L
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
I
C
 
C
D
 
R
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
E
 
D
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
C
T
 
T
D
 
A
R
 
D
I
 
V
Y
 
A
Q
 
H
A
 
T
F
 
I
Y
 
-
D
 
-
D
 
S
Y
 
A
S
 
G
T
 
A
L
 
A
R
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
M
H
 
H
S
x
G
H
x
P
T
|
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
L
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
V
D
 
E
I
 
L
F
 
L
A
 
L
E
 
G
D
 
Q
N
 
D
V
 
W
I
 
R
E
 
T
A
 
R
N
 
I
K
 
T
P
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
G
M
 
L
A
 
T
S
 
A
A
 
G
T
 
L
A
 
D
H
 
T
L
 
A
V
 
R
D
 
A
H
 
L
P
 
P
H
 
A
V
 
V
A
 
T
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
C
G
 
G
M
 
A
A
 
I
L
 
G
A
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
V
 
D
Q
 
R
D
 
P
K
 
V
A
 
D
S
 
L
R
 
A
T
 
V
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
S
 
N
V
 
L
V
 
V
Y
|
Y
F
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
C
T
 
T
E
 
P
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
D
 
T
F
 
Q
L
 
I
A
 
T
A
 
S
V
 
A
A
 
M
T
 
V
E
 
E

5kgtA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead: 1-[4-[4-(3-chlorophenyl)carbonylpiperidin-1- yl]phenyl]ethanone (see paper)
38% identity, 93% coverage: 11:442/467 of query aligns to 10:421/429 of 5kgtA

query
sites
5kgtA
D
 
D
L
 
G
A
 
A
V
 
H
L
 
L
W
 
W
H
 
H
P
 
P
C
x
Y
T
 
S
Q
 
S
M
 
I
K
 
G
D
 
-
H
 
R
E
 
E
Q
 
A
L
 
V
P
 
S
L
 
P
I
 
V
P
 
V
I
 
A
R
 
V
R
 
A
G
 
A
D
 
H
G
 
G
V
 
A
W
 
W
L
 
L
E
 
T
D
 
L
F
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
-
 
P
-
 
I
R
 
E
Y
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
V
 
I
F
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
N
 
H
P
 
P
R
 
A
I
 
L
N
 
D
Q
 
Q
R
 
A
I
 
L
K
 
T
D
 
T
Q
 
Q
V
 
L
D
 
R
Q
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
M
|
M
L
 
F
A
x
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
Q
 
E
P
 
P
V
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
D
L
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
Y
 
F
T
 
S
D
 
D
N
x
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
G
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
S
 
A
F
 
L
H
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
R
 
R
N
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
P
Q
 
G
K
 
K
Q
 
R
R
 
R
F
 
L
V
 
M
T
 
T
L
 
W
T
 
R
N
 
G
S
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
E
 
D
T
 
T
V
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
D
 
D
V
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
H
A
 
S
L
 
L
F
 
W
T
 
T
D
 
D
T
 
V
Y
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
A
L
 
A
D
 
Q
T
 
V
F
 
F
K
 
A
V
 
P
P
 
Q
S
 
V
P
 
P
D
 
-
C
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
W
 
-
E
 
R
E
 
D
H
 
Y
S
 
D
R
 
P
Q
 
A
M
 
Y
F
 
S
A
 
A
H
 
A
M
 
F
E
 
E
Q
 
A
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
H
 
H
H
 
A
Q
 
G
D
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
I
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
Y
 
H
H
 
D
P
 
P
V
 
R
Y
 
Y
L
 
L
K
 
H
L
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
A
 
I
C
 
C
D
 
R
R
 
R
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
H
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
F
D
|
D
E
 
E
I
|
I
A
|
A
V
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
T
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
E
 
D
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
S
P
 
P
D
 
D
F
 
I
L
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
T
L
 
L
T
 
C
T
 
T
D
 
A
R
 
D
I
 
V
Y
 
A
Q
 
H
A
 
T
F
 
I
Y
 
-
D
 
-
D
 
S
Y
 
A
S
 
G
T
 
A
L
 
A
R
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
M
H
 
H
S
x
G
H
 
P
T
|
T
Y
 
F
T
 
M
G
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
L
 
V
A
 
A
T
 
S
L
 
V
D
 
E
I
 
L
F
 
L
A
 
L
E
 
G
D
 
Q
N
 
D
V
 
W
I
 
R
E
 
T
A
 
R
N
 
I
K
 
T
P
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
G
M
 
L
A
 
T
S
 
A
A
 
G
T
 
L
A
 
D
H
 
T
L
 
A
V
 
R
D
 
A
H
 
L
P
 
P
H
 
A
V
 
V
A
 
T
E
 
D
V
 
V
R
 
R
Q
 
V
T
 
C
G
 
G
M
 
A
A
 
I
L
 
G
A
 
V
I
 
I
E
 
E
M
 
C
V
 
D
Q
 
R
D
 
P
K
 
V
A
 
D
S
 
L
R
 
A
T
 
V
A
 
A
Y
 
T
P
 
P
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
H
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
S
 
N
V
 
L
V
 
V
Y
|
Y
F
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
I
 
C
T
 
T
E
 
P
E
 
A
Q
 
E
I
 
I
D
 
T
F
 
Q
L
 
I
A
 
T
A
 
S
V
 
A
A
 
M
T
 
V
E
 
E

Query Sequence

>GFF305 FitnessBrowser__psRCH2:GFF305
MSLNDSWMQRDLAVLWHPCTQMKDHEQLPLIPIRRGDGVWLEDFDGKRYLDAVSSWWVNV
FGHANPRINQRIKDQVDQLEHVMLAGFSHQPVVELSERLVALTPAGLDRVFYTDNGSTGI
EVALKMSFHYWRNSGRGQKQRFVTLTNSYHGETVAAMSVGDVALFTDTYKPLLLDTFKVP
SPDCYLRPDGVSWEEHSRQMFAHMEQTLAEHHQDIAAVIVEPLIQGAGGMRMYHPVYLKL
LREACDRYEVHLIHDEIAVGFGRTGTMFACEQAGITPDFLCLSKALTGGYLPMAAVLTTD
RIYQAFYDDYSTLRAFLHSHTYTGNPLACAAALATLDIFAEDNVIEANKPLAARMASATA
HLVDHPHVAEVRQTGMALAIEMVQDKASRTAYPWQERRGLKVYQHALERGALLRPLGSVV
YFLPPYCITEEQIDFLAAVATEGIDIATRETSVSVASGSYPGFRDPG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory