SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3129 HP15_3071 triosephosphate isomerase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5zfxB Crystal structure of triosephosphate isomerase from opisthorchis viverrini (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:247/252 of query aligns to 1:246/248 of 5zfxB

query
sites
5zfxB
R
 
R
R
 
K
K
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
D
 
K
L
 
E
A
 
N
Q
 
D
T
 
K
L
 
L
V
 
I
S
x
E
D
 
M
V
 
L
R
 
T
S
x
H
Q
 
-
A
 
-
A
 
A
S
 
K
L
 
I
D
 
D
N
 
P
G
 
N
V
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
L
I
 
V
I
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
A
I
 
L
Y
 
Y
V
 
L
P
 
P
D
 
S
V
 
V
V
 
R
A
 
E
S
 
K
A
 
L
G
 
D
D
 
K
V
 
R
L
 
F
S
 
H
V
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
Y
Q
 
K
W
 
V
A
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
A
 
P
D
 
A
M
 
M
A
 
L
L
 
K
D
 
D
Q
 
V
G
 
G
C
 
C
Q
 
D
Y
 
W
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
L
A
 
L
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
T
G
 
N
R
 
H
I
 
A
L
 
I
A
 
S
S
 
A
G
 
G
L
 
V
Q
 
N
A
 
V
M
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
E
 
E
T
 
E
V
 
V
V
 
C
A
 
F
A
 
R
Q
 
Q
V
 
M
K
 
E
A
 
A
G
 
I
L
 
R
A
 
K
T
 
N
V
 
L
A
 
S
S
 
S
-
 
A
E
 
D
Q
 
M
W
 
W
Q
 
N
R
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
|
A
I
 
I
G
|
G
T
|
T
G
 
G
K
|
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
E
Q
 
Q
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
L
S
 
A
I
 
V
R
 
R
Q
 
R
V
 
W
L
 
M
S
 
E
E
 
E
M
 
K
G
 
V
A
 
S
P
 
P
-
 
A
-
 
V
A
 
A
N
 
K
E
 
S
I
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
A
D
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
R
A
 
T
L
 
L
F
 
A
A
 
K
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
P
E
 
-
D
 
D
F
 
F
V
 
I
S
 
E
I
 
I
C
 
C
R
 
N
S
 
A

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
49% identity, 96% coverage: 2:244/252 of query aligns to 4:247/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
R
 
R
R
 
K
K
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
S
 
T
K
 
L
D
 
E
L
 
S
A
 
I
Q
 
K
T
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
E
D
 
T
V
 
L
R
 
N
S
 
S
Q
 
-
A
 
-
A
 
A
S
 
Q
L
 
L
D
 
D
N
 
P
G
 
N
V
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
P
 
P
D
 
F
V
 
A
V
 
R
A
 
S
S
 
K
A
 
L
G
 
K
D
 
K
V
 
P
-
 
K
-
 
E
L
 
I
S
 
Q
V
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
Y
Q
 
T
W
 
K
A
 
P
S
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
A
 
A
D
 
E
M
 
M
A
 
L
L
 
K
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
C
 
V
Q
 
P
Y
 
W
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
L
 
I
F
 
F
A
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
K
R
 
Y
I
 
A
L
 
L
A
 
D
S
 
Q
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
A
 
V
M
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
E
 
M
T
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
V
 
I
K
 
L
A
 
K
G
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
D
V
 
K
A
 
I
S
 
K
E
 
D
Q
 
-
W
 
W
Q
 
S
R
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
A
S
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
K
V
 
W
L
 
L
S
 
K
E
 
E
M
 
N
G
 
V
A
 
S
P
 
P
-
 
E
-
 
V
A
 
A
N
 
E
E
 
S
I
 
T
S
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
A
 
A
D
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
K
A
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
K
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
P
D
 
E
F
 
F
V
 
V
S
 
D
I
 
I

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:247/252 of query aligns to 8:253/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
R
 
R
R
 
K
K
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
R
D
 
D
L
 
D
A
 
N
Q
 
D
T
 
K
L
 
L
V
 
L
S
 
K
D
 
L
V
 
L
R
 
-
S
 
-
Q
 
S
A
 
E
A
 
A
S
 
H
L
 
F
D
 
D
N
 
D
G
 
N
V
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
L
I
 
I
I
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
S
I
 
V
Y
 
F
V
 
L
P
 
H
D
 
E
V
 
I
V
 
R
A
 
K
S
 
S
A
 
L
G
 
K
D
 
K
V
 
E
L
 
I
S
 
H
V
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
Y
Q
 
K
W
 
V
A
 
S
S
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
A
 
P
D
 
A
M
 
M
A
 
I
L
 
R
D
 
D
Q
 
I
G
 
G
C
 
C
Q
 
D
Y
 
W
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
L
 
I
F
 
F
A
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
Q
R
 
H
I
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
E
G
 
G
L
 
L
Q
 
S
A
 
V
M
 
I
V
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
N
K
 
K
A
 
T
E
 
E
T
 
E
V
 
V
V
 
C
A
 
V
A
 
R
Q
 
Q
V
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
I
L
 
A
A
 
N
T
 
K
V
 
I
A
 
K
S
 
S
-
 
A
E
 
D
Q
 
E
W
 
W
Q
 
K
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
Q
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
N
S
 
F
I
 
L
R
 
R
Q
 
K
V
 
W
L
 
F
S
 
-
E
 
K
M
 
T
G
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
N
-
 
G
-
 
V
-
 
D
N
 
E
E
 
K
I
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
A
D
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
K
A
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
Q
E
 
Q
P
 
H
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
P
E
 
E
D
 
-
F
 
F
V
 
T
S
 
E
I
 
I
C
 
C
R
 
K
S
 
A

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
47% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:251/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
M
 
M
R
 
R
R
 
H
K
 
P
I
 
L
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
R
D
 
H
L
 
M
A
 
V
Q
 
H
T
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
S
D
 
N
V
 
L
R
 
R
S
 
K
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
V
D
 
-
N
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
A
V
 
V
V
 
A
I
 
I
I
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
E
I
 
M
Y
 
Y
V
 
I
P
 
D
D
 
M
V
 
A
V
 
K
A
 
R
S
 
E
A
 
A
-
 
E
G
 
G
D
 
S
V
 
H
L
 
I
S
 
M
V
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
A
 
D
Q
 
L
W
 
N
A
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
A
 
A
D
 
A
M
 
M
A
 
L
L
 
K
D
 
D
Q
 
I
G
 
G
C
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
L
 
Y
F
 
H
A
 
K
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
K
K
 
K
V
 
F
G
 
A
R
 
V
I
 
L
L
 
K
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
P
M
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
E
E
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
E
 
E
T
 
E
V
 
V
V
 
C
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
V
 
I
K
 
D
A
 
A
G
 
V
L
 
L
A
 
K
T
 
T
V
 
Q
A
 
G
S
 
A
E
 
A
Q
 
A
W
 
F
Q
 
E
R
 
G
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
A
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
H
 
H
A
 
K
S
 
F
I
 
I
R
 
R
Q
 
D
V
 
H
L
 
I
S
 
A
E
 
K
M
 
V
G
 
D
A
 
A
P
 
N
-
 
I
A
 
A
N
 
E
E
 
Q
I
 
V
S
 
I
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
A
 
A
D
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
D
D
 
A
F
 
F
V
 
A
S
 
V
I
 
I
C
 
V
R
 
K
S
 
A
V
 
A
P
 
E
A
 
A

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
47% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:251/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
M
 
M
R
 
R
R
 
H
K
 
P
I
 
L
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
R
D
 
H
L
 
M
A
 
V
Q
 
H
T
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
S
D
 
N
V
 
L
R
 
R
S
 
K
Q
 
E
A
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
V
D
 
-
N
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
A
V
 
V
V
 
A
I
 
I
I
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
E
I
 
M
Y
 
Y
V
 
I
P
 
D
D
 
M
V
 
A
V
 
K
A
 
R
S
 
E
A
 
A
-
 
E
G
 
G
D
 
S
V
 
H
L
 
I
S
 
M
V
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
A
 
D
Q
 
L
W
 
N
A
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
A
 
A
D
 
A
M
 
M
A
 
L
L
 
K
D
 
D
Q
 
I
G
 
G
C
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
L
 
Y
F
 
H
A
 
K
E
 
E
T
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
K
K
 
K
V
 
F
G
 
A
R
 
V
I
 
L
L
 
K
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
P
M
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
E
E
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
E
 
E
T
 
E
V
 
V
V
 
C
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
V
 
I
K
 
D
A
 
A
G
 
V
L
 
L
A
 
K
T
 
T
V
 
Q
A
 
G
S
 
A
E
 
A
Q
 
A
W
 
F
Q
 
E
R
 
G
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
A
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
H
 
H
A
 
K
S
 
F
I
 
I
R
 
R
Q
 
D
V
 
H
L
 
I
S
 
A
E
 
K
M
 
V
G
 
D
A
 
A
P
 
N
-
 
I
A
 
A
N
 
E
E
 
Q
I
 
V
S
 
I
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
A
 
A
D
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
D
D
 
A
F
 
F
V
 
A
S
 
V
I
 
I
C
 
V
R
 
K
S
 
A
V
 
A
P
 
E
A
 
A

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
46% identity, 97% coverage: 2:246/252 of query aligns to 402:647/654 of P36204

query
sites
P36204
R
 
R
R
 
K
K
 
L
I
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
H
G
 
K
S
 
T
K
 
I
D
 
S
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
T
 
K
L
 
F
V
 
V
S
 
S
D
 
L
V
 
L
R
 
V
S
 
N
Q
 
E
A
 
L
A
 
H
S
 
D
L
 
V
D
 
K
N
 
E
G
 
-
V
 
F
E
 
E
V
 
I
V
 
V
I
 
V
I
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
F
I
 
T
Y
 
A
V
 
L
P
 
S
D
 
E
V
 
V
V
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
N
-
 
I
-
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
A
 
F
Q
 
Y
W
 
E
A
 
D
S
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
A
 
P
D
 
L
M
 
M
A
 
L
L
 
Q
D
 
E
Q
 
I
G
 
G
C
 
V
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
I
V
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
R
L
 
I
F
 
F
A
 
K
E
 
E
T
 
D
D
 
D
A
 
E
A
 
F
V
 
I
A
 
N
E
 
R
K
 
K
V
 
V
G
 
K
R
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
E
S
 
K
G
 
G
L
 
M
Q
 
T
A
 
P
M
 
I
V
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
K
 
L
A
 
T
E
 
F
T
 
C
V
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
K
Q
 
Q
V
 
V
K
 
R
A
 
E
G
 
G
L
 
F
A
 
Y
T
 
G
V
 
L
A
 
D
S
 
K
E
 
E
Q
 
E
W
 
A
Q
 
K
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
Q
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
A
S
 
F
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
V
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
M
 
M
-
 
Y
-
 
D
G
 
E
A
 
E
P
 
T
A
 
A
N
 
G
E
 
S
I
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
P
D
 
D
N
 
N
A
 
F
A
 
L
A
 
G
L
 
L
F
 
I
A
 
V
E
 
Q
P
 
K
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
E
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
I
S
 
E
I
 
L
C
 
A
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
47% identity, 97% coverage: 1:244/252 of query aligns to 1:246/253 of P27876

query
sites
P27876
M
 
M
R
 
R
R
 
K
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
S
 
T
K
 
L
D
 
G
L
 
E
A
 
A
Q
 
V
T
 
S
L
 
F
V
 
V
S
 
E
D
 
E
V
 
V
R
 
K
S
 
S
Q
 
S
A
 
I
A
 
P
S
 
A
L
 
A
D
 
D
N
 
K
G
 
A
V
 
-
E
 
E
V
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
L
Y
 
F
V
 
L
P
 
E
D
 
K
V
 
L
V
 
A
A
 
S
S
 
A
-
 
V
A
 
K
G
 
G
D
 
T
V
 
D
L
 
L
S
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
M
A
 
H
Q
 
F
W
 
E
A
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
A
A
 
L
L
 
K
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
C
 
V
Q
 
D
Y
 
Y
A
 
C
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
L
 
M
F
 
F
A
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
N
E
 
K
K
 
K
V
 
A
G
 
H
R
 
A
I
 
A
L
 
F
A
 
K
S
 
H
G
 
G
L
 
I
Q
 
V
A
 
P
M
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
E
 
N
T
 
D
V
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
D
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
G
V
 
L
A
 
S
S
 
E
E
 
E
Q
 
Q
W
 
V
Q
 
A
R
 
A
V
 
S
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
A
Q
 
K
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
D
M
 
V
H
 
C
A
 
A
S
 
H
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
V
 
T
L
 
V
S
 
A
E
 
E
M
 
S
G
 
F
A
 
S
P
 
Q
-
 
E
-
 
A
A
 
A
N
 
D
E
 
K
I
 
L
S
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
D
 
A
N
 
N
A
 
I
A
 
K
A
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
E
 
E
P
 
S
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
P
E
 
Q
D
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
Q
I
 
L

A0A1L5YRA2 Triosephosphate isomerase; TIM; Allergen Scy p 8; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; Allergen Scy p 8.0101; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Scylla paramamosain (Mud crab) (see paper)
47% identity, 96% coverage: 2:244/252 of query aligns to 5:243/248 of A0A1L5YRA2

query
sites
A0A1L5YRA2
R
 
R
R
 
K
K
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
S
 
D
K
 
K
D
 
A
L
 
A
A
 
I
Q
 
D
T
 
G
L
 
I
V
 
I
S
 
S
D
 
F
V
 
M
R
 
K
S
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
G
S
 
P
L
 
L
D
 
N
N
 
A
G
 
D
V
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
G
P
 
C
P
 
P
A
 
Q
I
 
C
Y
 
Y
V
 
L
P
 
M
D
 
Y
V
 
T
V
 
R
A
 
E
S
 
H
A
 
M
G
 
P
D
 
A
V
 
N
L
 
I
S
 
G
V
 
V
G
 
A
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
C
A
 
Y
Q
 
K
W
 
T
A
 
A
S
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
A
 
P
D
 
A
M
 
M
A
 
I
L
 
K
D
 
D
Q
 
C
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
Y
 
W
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
L
 
V
F
 
F
A
 
G
E
 
E
T
 
P
D
 
D
A
 
Q
A
 
L
V
 
I
A
 
S
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
G
R
 
H
I
 
A
L
 
L
A
 
E
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
A
 
V
M
 
I
V
 
P
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
N
K
 
R
A
 
T
E
 
E
T
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
F
A
 
A
Q
 
Q
V
 
M
K
 
K
A
 
A
G
 
L
L
 
V
A
 
P
T
 
N
V
 
I
A
 
S
S
 
D
E
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
|
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
|
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
D
x
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
D
M
 
V
H
 
H
A
 
A
S
 
K
I
 
L
R
 
R
Q
 
Q
V
 
W
L
 
L
S
 
R
E
 
D
M
 
N
G
 
V
A
 
S
P
 
P
-
 
Q
-
 
V
A
 
A
N
 
E
E
 
S
I
 
T
S
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
S
A
 
A
D
 
G
N
 
N
A
 
C
A
 
K
A
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
K
E
 
T
P
 
G
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
|
K
A
 
P
E
 
-
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
T
I
 
I

6oogA Crystal structure of triosephosphate isomerase from taenia solium in complex with 2pg (see paper)
46% identity, 96% coverage: 2:244/252 of query aligns to 5:247/252 of 6oogA

query
sites
6oogA
R
 
R
R
 
K
K
 
L
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
Y
D
 
S
L
 
H
A
 
I
Q
 
N
T
 
T
L
 
F
V
 
F
S
 
D
D
 
T
V
 
L
R
 
-
S
 
-
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
S
 
D
L
 
T
D
 
D
N
 
P
G
 
N
V
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
V
I
 
I
I
 
G
P
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
C
Y
 
Y
V
 
L
P
 
K
D
 
Y
V
 
A
V
 
Q
A
 
D
S
 
K
A
 
A
G
 
P
D
 
K
V
 
G
L
 
I
S
 
K
V
 
I
G
 
A
V
 
A
Q
 
E
N
 
N
V
 
C
A
 
Y
Q
 
K
W
 
V
A
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
A
 
T
D
 
E
M
 
M
A
 
I
L
 
K
D
 
D
Q
 
C
G
 
G
C
 
C
Q
 
E
Y
 
W
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
F
A
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
N
A
 
E
A
 
L
V
 
I
A
 
G
E
 
E
K
 
K
V
 
V
G
 
K
R
 
H
I
 
A
L
 
L
A
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
N
A
 
V
M
 
I
V
 
P
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
L
L
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
E
 
N
T
 
D
V
 
V
V
 
C
A
 
F
A
 
A
Q
 
Q
V
 
M
K
 
D
A
 
A
G
 
I
L
 
A
A
 
K
T
 
N
V
 
V
A
 
P
S
 
S
-
 
K
E
 
E
Q
 
A
W
 
W
Q
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
A
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
K
S
 
V
I
 
V
R
 
R
Q
 
D
V
 
W
L
 
I
S
 
R
E
 
K
M
 
H
-
 
V
-
 
D
G
 
A
A
 
G
P
 
I
A
 
A
N
 
D
E
 
K
I
 
V
S
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
A
D
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
K
A
 
D
L
 
L
F
 
G
A
 
T
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
P
E
 
-
D
 
D
F
 
F
V
 
I
S
 
T
I
 
I

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
44% identity, 98% coverage: 2:247/252 of query aligns to 2:248/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
R
 
R
R
 
K
K
 
K
I
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
T
S
 
T
K
 
L
D
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
T
 
A
L
 
L
V
 
G
S
 
A
D
 
A
V
 
V
R
 
A
S
 
K
Q
 
G
A
 
V
A
 
T
S
 
-
L
 
-
D
 
D
N
 
D
G
 
R
V
 
V
E
 
T
V
 
V
V
 
A
I
 
V
I
 
F
P
 
P
P
 
P
A
 
Y
I
 
P
Y
 
W
V
 
L
P
 
T
D
 
A
V
 
V
V
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
E
V
 
V
L
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
V
S
 
A
V
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
N
 
D
V
 
V
A
 
S
Q
 
S
W
 
E
A
 
K
S
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
A
 
P
D
 
A
M
 
M
A
 
L
L
 
L
D
 
E
Q
 
T
G
 
G
C
 
C
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
L
 
I
F
 
I
A
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
E
A
 
T
A
 
F
V
 
I
A
 
N
E
 
H
K
 
K
V
 
V
G
 
H
R
 
T
I
 
A
L
 
L
A
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
L
Q
 
S
A
 
V
M
 
V
V
 
L
C
 
C
V
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
A
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
K
 
L
A
 
Q
E
 
E
T
 
R
V
 
V
V
 
F
A
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
V
 
V
K
 
Y
A
 
A
G
 
A
L
 
C
A
 
A
T
 
G
V
 
L
A
 
T
S
 
D
E
 
E
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
G
R
 
R
V
 
I
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
E
M
 
A
H
 
H
A
 
A
S
 
F
I
 
V
R
 
R
Q
 
S
V
 
K
L
 
L
S
 
R
E
 
L
M
 
L
G
 
Y
A
 
G
P
 
D
-
 
K
-
 
I
A
 
A
N
 
D
E
 
S
I
 
T
S
 
P
L
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
P
D
 
D
N
 
N
A
 
T
A
 
V
A
 
G
L
 
L
F
 
M
A
 
S
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
D
D
 
S
F
 
F
V
 
L
S
 
A
I
 
I
C
 
V
R
 
K
S
 
A

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
45% identity, 97% coverage: 1:244/252 of query aligns to 1:246/253 of P00943

query
sites
P00943
M
 
M
R
 
R
R
 
K
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
x
H
G
x
K
S
 
T
K
 
L
D
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
V
T
 
Q
L
 
F
V
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
K
S
 
G
Q
 
H
A
 
V
A
 
P
S
 
P
L
 
A
D
 
D
N
 
E
G
 
V
V
 
I
E
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
C
I
 
A
P
 
P
P
 
F
A
 
L
I
 
F
Y
 
L
V
 
D
P
 
R
D
 
L
V
 
V
V
 
Q
A
 
A
S
 
A
A
 
D
G
 
G
D
 
T
V
 
D
L
 
L
S
 
K
V
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
N
 
T
V
 
M
A
 
H
Q
 
F
W
 
A
A
 
D
S
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
M
A
 
L
L
 
K
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
C
 
V
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
M
F
 
F
A
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
N
E
 
K
K
 
K
V
 
V
G
 
L
R
 
A
I
 
A
L
 
F
A
 
T
S
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
I
A
 
P
M
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
A
 
T
E
 
N
T
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
K
 
E
A
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
G
V
 
L
A
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
Q
W
 
V
Q
 
K
R
 
Q
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
S
M
 
V
H
 
C
A
 
G
S
 
H
I
 
I
R
 
R
Q
 
S
V
 
V
L
 
V
S
 
S
E
 
R
M
 
L
G
 
F
A
 
G
P
 
P
-
 
E
-
 
A
A
 
A
N
 
E
E
 
A
I
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
D
 
D
N
 
N
A
 
I
A
 
R
A
 
D
L
 
F
F
 
L
A
 
A
E
 
Q
P
 
Q
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
P
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
P
E
 
A
D
 
S
F
 
F
V
 
L
S
 
Q
I
 
L

Q07412 Triosephosphate isomerase; PfTIM; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Plasmodium falciparum (see 6 papers)
41% identity, 98% coverage: 2:247/252 of query aligns to 3:246/248 of Q07412

query
sites
Q07412
R
 
R
R
 
K
K
 
Y
I
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
A
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
C
N
 
N
G
 
G
S
 
T
K
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
L
S
 
E
D
 
S
V
 
I
R
 
K
S
 
S
Q
 
L
A
 
T
A
 
N
S
 
S
L
 
F
D
 
N
N
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
S
G
 
K
V
 
L
E
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
F
P
 
P
P
 
V
A
 
S
I
 
V
Y
 
H
V
 
Y
P
 
D
D
 
H
V
 
T
V
 
R
A
 
K
S
 
L
A
 
L
G
 
Q
D
 
S
V
 
K
L
 
F
S
 
S
V
 
T
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
A
 
S
Q
 
K
W
 
F
A
 
G
S
 
N
G
 
G
A
x
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
A
 
A
D
 
E
M
 
I
A
 
A
L
 
K
D
 
D
Q
 
L
G
 
N
C
 
I
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
x
F
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
K
L
 
Y
F
 
F
A
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
D
V
 
V
A
 
R
E
 
E
K
 
K
V
 
L
G
 
Q
R
 
A
I
 
S
L
 
L
A
 
K
S
 
N
G
 
N
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
Q
G
 
N
K
 
K
A
 
T
E
 
I
T
 
E
V
 
V
V
 
I
A
 
T
A
 
K
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
V
A
 
D
T
 
L
V
 
I
A
 
-
S
 
-
E
 
D
Q
 
N
W
 
F
Q
 
D
R
 
N
V
 
V
V
 
I
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
x
L
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
M
 
V
H
 
H
A
 
K
S
 
E
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
V
 
I
L
 
V
S
 
K
E
 
D
M
 
T
-
 
C
-
 
G
G
 
E
A
 
K
P
 
Q
A
 
A
N
 
N
E
 
Q
I
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
N
A
 
T
D
 
E
N
 
N
A
 
C
A
 
S
A
 
S
L
 
L
F
 
I
A
 
Q
E
 
Q
P
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
x
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
E
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
D
I
 
I
C
 
I
R
 
K
S
 
S

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
45% identity, 97% coverage: 1:244/252 of query aligns to 2:249/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
M
 
M
R
 
R
R
 
T
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
S
 
T
K
 
V
D
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
T
 
D
L
 
F
V
 
V
S
 
N
D
 
A
V
 
L
R
 
P
S
 
T
Q
 
L
A
 
P
A
 
D
S
 
S
L
 
K
D
 
E
N
 
-
G
 
-
V
 
V
E
 
E
V
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
Y
 
Q
V
 
L
P
 
-
D
 
D
V
 
A
V
 
L
A
 
T
S
 
T
A
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
G
 
A
D
 
Q
V
 
G
L
 
L
S
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
A
 
Y
Q
 
F
W
 
E
A
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
A
A
 
L
L
 
A
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
C
 
V
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
E
V
 
I
A
 
N
E
 
K
K
 
K
V
 
A
G
 
H
R
 
A
I
 
I
L
 
F
A
 
K
S
 
H
G
 
G
L
 
M
Q
 
T
A
 
P
M
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
E
 
N
T
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
G
V
 
L
A
 
S
S
 
E
E
 
D
Q
 
Q
W
 
L
Q
 
K
R
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
S
 
F
I
 
V
R
 
R
Q
 
Q
V
 
T
L
 
I
S
 
A
E
 
D
M
 
L
G
 
S
A
 
-
P
 
-
A
 
S
N
 
K
E
 
E
I
 
V
S
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
D
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
A
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
E
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
E
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
Q
I
 
L

3uwwA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid (see paper)
45% identity, 97% coverage: 1:244/252 of query aligns to 2:249/254 of 3uwwA

query
sites
3uwwA
M
 
M
R
 
R
R
 
T
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
S
 
T
K
 
V
D
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
T
 
D
L
 
F
V
 
V
S
 
N
D
 
A
V
 
L
R
 
P
S
 
T
Q
 
L
A
 
P
A
 
D
S
 
S
L
 
K
D
 
E
N
 
-
G
 
-
V
 
V
E
 
E
V
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
Y
 
Q
V
 
L
P
 
-
D
 
D
V
 
A
V
 
L
A
 
T
S
 
T
A
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
G
 
A
D
 
Q
V
 
G
L
 
L
S
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
A
 
Y
Q
 
F
W
 
E
A
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
A
A
 
L
L
 
A
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
C
 
V
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
E
V
 
I
A
 
N
E
 
K
K
 
K
V
 
A
G
 
H
R
 
A
I
 
I
L
 
F
A
 
K
S
 
H
G
 
G
L
 
M
Q
 
T
A
 
P
M
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
E
 
N
T
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
G
V
 
L
A
 
S
S
 
E
E
 
D
Q
 
Q
W
 
L
Q
 
K
R
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
S
 
F
I
 
V
R
 
R
Q
 
Q
V
 
T
L
 
I
S
 
A
E
 
D
M
 
L
G
 
S
A
 
-
P
 
-
A
 
S
N
 
K
E
 
E
I
 
V
S
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
D
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
A
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
E
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
E
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
Q
I
 
L

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
45% identity, 97% coverage: 1:244/252 of query aligns to 3:250/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
M
 
M
R
 
R
R
 
T
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
S
 
T
K
 
V
D
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
T
 
D
L
 
F
V
 
V
S
 
N
D
 
A
V
 
L
R
 
P
S
 
T
Q
 
L
A
 
P
A
 
D
S
 
S
L
 
K
D
 
E
N
 
-
G
 
-
V
 
V
E
 
E
V
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
Y
 
Q
V
 
L
P
 
-
D
 
D
V
 
A
V
 
L
A
 
T
S
 
T
A
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
G
 
A
D
 
Q
V
 
G
L
 
L
S
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
A
 
Y
Q
 
F
W
 
E
A
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
A
A
 
L
L
 
A
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
C
 
V
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
E
V
 
I
A
 
N
E
 
K
K
 
K
V
 
A
G
 
H
R
 
A
I
 
I
L
 
F
A
 
K
S
 
H
G
 
G
L
 
M
Q
 
T
A
 
P
M
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
E
 
N
T
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
G
V
 
L
A
 
S
S
 
E
E
 
D
Q
 
Q
W
 
L
Q
 
K
R
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
S
 
F
I
 
V
R
 
R
Q
 
Q
V
 
T
L
 
I
S
 
A
E
 
D
M
 
L
G
 
S
A
 
-
P
 
-
A
 
S
N
 
K
E
 
E
I
 
V
S
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
|
K
A
 
P
D
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
A
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
E
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
E
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
Q
I
 
L

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
45% identity, 97% coverage: 1:244/252 of query aligns to 1:248/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
M
 
M
R
 
R
R
 
T
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
S
 
T
K
 
V
D
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
T
 
D
L
 
F
V
 
V
S
 
N
D
 
A
V
 
L
R
 
P
S
 
T
Q
 
L
A
 
P
A
 
D
S
 
S
L
 
K
D
 
E
N
 
-
G
 
-
V
 
V
E
 
E
V
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
Y
 
Q
V
 
L
P
 
-
D
 
D
V
 
A
V
 
L
A
 
T
S
 
T
A
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
G
 
A
D
 
Q
V
 
G
L
 
L
S
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
A
 
Y
Q
 
F
W
 
E
A
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
A
A
 
L
L
 
A
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
C
 
V
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
E
V
 
I
A
 
N
E
 
K
K
 
K
V
 
A
G
 
H
R
 
A
I
 
I
L
 
F
A
 
K
S
 
H
G
 
G
L
 
M
Q
 
T
A
 
P
M
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
E
 
N
T
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
G
V
 
L
A
 
S
S
 
E
E
 
D
Q
 
Q
W
 
L
Q
 
K
R
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
S
 
F
I
 
V
R
 
R
Q
 
Q
V
 
T
L
 
I
S
 
A
E
 
D
M
 
L
G
 
S
A
 
-
P
 
-
A
 
S
N
 
K
E
 
E
I
 
V
S
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
D
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
A
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
E
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
E
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
Q
I
 
L

Q6GIL6 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
45% identity, 97% coverage: 1:244/252 of query aligns to 1:248/253 of Q6GIL6

query
sites
Q6GIL6
M
 
M
R
 
R
R
 
T
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
S
 
T
K
 
V
D
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
T
 
D
L
 
F
V
 
V
S
 
N
D
 
A
V
 
L
R
 
P
S
 
T
Q
 
L
A
 
P
A
 
D
S
 
S
L
 
K
D
 
E
N
 
-
G
 
-
V
 
V
E
 
E
V
 
S
V
 
V
I
 
I
I
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
Y
 
Q
V
 
L
P
 
-
D
 
D
V
 
A
V
 
L
A
 
T
S
 
T
A
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
G
 
A
D
 
Q
V
 
G
L
 
L
S
 
E
V
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
A
 
Y
Q
 
F
W
 
E
A
 
D
S
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
A
A
 
L
L
 
A
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
C
 
V
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
E
V
 
I
A
 
N
E
 
K
K
 
K
V
 
A
G
 
H
R
 
A
I
 
I
L
 
F
A
 
K
S
 
H
G
 
G
L
 
M
Q
 
T
A
 
P
M
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
E
 
N
T
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
G
V
 
L
A
 
S
S
 
E
E
 
D
Q
 
Q
W
 
L
Q
 
K
R
 
S
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
S
 
F
I
 
V
R
 
R
Q
 
Q
V
 
T
L
 
I
S
 
A
E
 
D
M
 
L
G
 
S
A
 
-
P
 
-
A
 
S
N
 
K
E
 
E
I
 
V
S
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
D
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
A
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
E
 
Q
P
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
V
E
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
Q
I
 
L

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
45% identity, 96% coverage: 2:244/252 of query aligns to 1:245/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
R
 
R
R
 
K
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
H
G
 
K
S
 
T
K
 
L
D
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
V
T
 
Q
L
 
F
V
 
V
S
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
K
S
 
G
Q
 
H
A
 
V
A
 
P
S
 
P
L
 
A
D
 
D
N
 
E
G
 
V
V
 
I
E
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
C
I
 
A
P
 
P
P
 
F
A
 
L
I
 
F
Y
 
L
V
 
D
P
 
R
D
 
L
V
 
V
V
 
Q
A
 
A
S
 
A
A
 
D
G
 
G
D
 
T
V
 
D
L
 
L
S
 
K
V
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
N
 
T
V
 
M
A
 
H
Q
 
F
W
 
A
A
 
D
S
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
M
A
 
L
L
 
K
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
C
 
V
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
M
F
 
F
A
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
N
E
 
K
K
 
K
V
 
V
G
 
L
R
 
A
I
 
A
L
 
F
A
 
T
S
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
I
A
 
P
M
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
A
 
T
E
 
N
T
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
Q
V
 
V
K
 
E
A
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
G
V
 
L
A
 
T
S
 
P
E
 
E
Q
 
Q
W
 
V
Q
 
K
R
 
Q
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
A
 
S
M
 
V
H
 
C
A
 
G
S
 
H
I
 
I
R
 
R
Q
 
S
V
 
V
L
 
V
S
 
S
E
 
R
M
 
L
G
 
F
A
 
G
P
 
P
-
 
E
-
 
A
A
 
A
N
 
E
E
 
A
I
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
D
 
D
N
 
N
A
 
I
A
 
R
A
 
D
L
 
F
F
 
L
A
 
A
E
 
Q
P
 
Q
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
P
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
A
 
P
E
 
A
D
 
S
F
 
F
V
 
L
S
 
Q
I
 
L

1o5xB Plasmodium falciparum tim complexed to 2-phosphoglycerate (see paper)
41% identity, 98% coverage: 2:247/252 of query aligns to 1:244/246 of 1o5xB

query
sites
1o5xB
R
 
R
R
 
K
K
 
Y
I
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
A
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
C
N
 
N
G
 
G
S
 
T
K
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
L
S
 
E
D
 
S
V
 
I
R
 
K
S
 
S
Q
 
L
A
 
T
A
 
N
S
 
S
L
 
F
D
 
N
N
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
S
G
 
K
V
 
L
E
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
F
P
 
P
P
 
V
A
 
S
I
 
V
Y
 
H
V
 
Y
P
 
D
D
 
H
V
 
T
V
 
R
A
 
K
S
 
L
A
 
L
G
 
Q
D
 
S
V
 
K
L
 
F
S
 
S
V
 
T
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
A
 
S
Q
 
K
W
 
F
A
 
G
S
 
N
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
A
 
A
D
 
E
M
 
I
A
 
A
L
 
K
D
 
D
Q
 
L
G
 
N
C
 
I
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
F
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
K
L
 
Y
F
 
F
A
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
D
V
 
V
A
 
R
E
 
E
K
 
K
V
 
L
G
 
Q
R
 
A
I
 
S
L
 
L
A
 
K
S
 
N
G
 
N
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
Q
G
 
N
K
 
K
A
 
T
E
 
I
T
 
E
V
 
V
V
 
I
A
 
T
A
 
K
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
V
A
 
D
T
 
L
V
 
I
A
 
-
S
 
-
E
 
D
Q
 
N
W
 
F
Q
 
D
R
 
N
V
 
V
V
 
I
V
 
L
A
 
V
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
L
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
M
 
V
H
 
H
A
 
K
S
 
E
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
V
 
I
L
 
V
S
 
K
E
 
D
M
 
T
G
 
C
A
 
G
P
 
E
-
 
K
-
 
Q
A
 
A
N
 
N
E
 
Q
I
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
|
V
K
 
N
A
 
T
D
 
E
N
 
N
A
 
C
A
 
S
A
 
S
L
 
L
F
 
I
A
 
Q
E
 
Q
P
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
x
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
E
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
D
I
 
I
C
 
I
R
 
K
S
 
S

1o5xA Plasmodium falciparum tim complexed to 2-phosphoglycerate (see paper)
41% identity, 98% coverage: 2:247/252 of query aligns to 1:244/246 of 1o5xA

query
sites
1o5xA
R
 
R
R
 
K
K
 
Y
I
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
A
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
C
N
 
N
G
 
G
S
 
T
K
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
L
S
 
E
D
 
S
V
 
I
R
 
K
S
 
S
Q
 
L
A
 
T
A
 
N
S
 
S
L
 
F
D
 
N
N
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
S
G
 
K
V
 
L
E
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
F
P
 
P
P
 
V
A
 
S
I
 
V
Y
 
H
V
 
Y
P
 
D
D
 
H
V
 
T
V
 
R
A
 
K
S
 
L
A
 
L
G
 
Q
D
 
S
V
 
K
L
 
F
S
 
S
V
 
T
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
A
 
S
Q
 
K
W
 
F
A
 
G
S
 
N
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
A
 
A
D
 
E
M
 
I
A
 
A
L
 
K
D
 
D
Q
 
L
G
 
N
C
 
I
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
V
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
x
F
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
K
L
 
Y
F
 
F
A
 
H
E
 
E
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
D
V
 
V
A
 
R
E
 
E
K
 
K
V
 
L
G
 
Q
R
 
A
I
 
S
L
 
L
A
 
K
S
 
N
G
 
N
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
Q
G
 
N
K
 
K
A
 
T
E
 
I
T
 
E
V
 
V
V
 
I
A
 
T
A
 
K
Q
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
V
A
 
D
T
 
L
V
 
I
A
 
-
S
 
-
E
 
D
Q
 
N
W
 
F
Q
 
D
R
 
N
V
 
V
V
 
I
V
 
L
A
 
V
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
L
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
Q
 
E
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
M
 
V
H
 
H
A
 
K
S
 
E
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
V
 
I
L
 
V
S
 
K
E
 
D
M
 
T
G
 
C
A
 
G
P
 
E
-
 
K
-
 
Q
A
 
A
N
 
N
E
 
Q
I
 
I
S
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
A
 
T
D
 
E
N
 
N
A
 
C
A
 
S
A
 
S
L
 
L
F
 
I
A
 
Q
E
 
Q
P
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
x
N
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
-
E
 
E
D
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
D
I
 
I
C
 
I
R
 
K
S
 
S

Query Sequence

>GFF3129 HP15_3071 triosephosphate isomerase
MRRKIVAGNWKMNGSKDLAQTLVSDVRSQAASLDNGVEVVIIPPAIYVPDVVASAGDVLS
VGVQNVAQWASGAYTGEISADMALDQGCQYALVGHSERRQLFAETDAAVAEKVGRILASG
LQAMVCVGETLEEREAGKAETVVAAQVKAGLATVASEQWQRVVVAYEPVWAIGTGKTATA
QDAQAMHASIRQVLSEMGAPANEISLLYGGSVKADNAAALFAEPDIDGGLIGGASLKAED
FVSICRSVPAGT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory