SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3137 FitnessBrowser__Marino:GFF3137 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ywjA Crystal structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase (htpa reductase) from pseudomonas aeruginosa
67% identity, 100% coverage: 2:266/266 of query aligns to 3:268/268 of 4ywjA

query
sites
4ywjA
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
K
V
 
N
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
G
 
Q
T
 
T
E
 
G
G
 
G
L
 
A
E
 
A
-
 
G
L
 
L
G
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
x
D
E
x
R
P
 
P
G
 
D
S
 
S
S
 
T
L
 
L
I
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
L
T
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
K
 
R
T
 
I
G
 
G
V
 
V
K
 
P
M
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
D
L
 
L
A
 
G
D
 
K
V
 
V
K
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
F
 
H
P
 
P
D
 
S
L
x
V
T
 
T
L
 
L
E
 
K
N
 
N
A
 
I
E
 
E
F
 
Q
C
 
C
K
 
R
A
 
K
N
 
A
G
 
R
K
 
R
M
 
A
L
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
M
 
F
S
 
S
D
 
A
A
 
D
E
 
E
K
 
K
Q
 
L
Q
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
K
S
 
D
T
 
I
A
 
P
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
C
L
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
R
T
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
D
 
E
Y
 
V
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
R
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
Q
E
 
E
C
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
Q
T
 
T
G
 
G
E
 
A
R
 
R
T
 
A
R
 
R
K
 
E
E
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
T
I
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
H
 
H
T
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
A
E
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
E
V
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
|
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
K
 
R
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
E
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
L
K
 
R

1arzB Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
63% identity, 100% coverage: 1:266/266 of query aligns to 2:267/269 of 1arzB

query
sites
1arzB
M
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
A
G
|
G
A
 
A
A
x
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
R
V
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
A
D
 
L
G
 
A
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
V
x
E
E
 
R
P
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
L
T
 
A
G
 
G
I
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
V
K
 
T
M
 
V
A
 
Q
G
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
D
D
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
F
x
R
P
 
P
D
 
E
L
x
G
T
 
T
L
 
L
E
 
N
N
x
H
A
 
L
E
 
A
F
 
F
C
 
C
K
 
R
A
 
Q
N
 
H
G
 
G
K
 
K
M
 
G
L
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
M
 
F
S
 
D
D
 
E
A
 
A
E
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
A
S
 
D
T
 
I
A
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
M
L
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
E
T
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
D
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
D
R
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
P
K
 
G
E
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
T
I
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
A
 
A
T
 
D
E
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
V
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
N

1drvA Escherichia coli dhpr/acnadh complex (see paper)
63% identity, 100% coverage: 1:266/266 of query aligns to 3:268/270 of 1drvA

query
sites
1drvA
M
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
R
V
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
A
D
 
L
G
 
A
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
V
x
E
E
 
R
P
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
L
T
 
A
G
 
G
I
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
V
K
 
T
M
 
V
A
 
Q
G
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
D
D
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
F
x
R
P
 
P
D
 
E
L
x
G
T
 
T
L
 
L
E
 
N
N
 
H
A
 
L
E
 
A
F
 
F
C
 
C
K
 
R
A
 
Q
N
 
H
G
 
G
K
 
K
M
 
G
L
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
M
 
F
S
 
D
D
 
E
A
 
A
E
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
A
S
 
D
T
 
I
A
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
x
A
N
 
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
M
L
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
E
T
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
D
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
D
R
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
P
K
 
G
E
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
T
I
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
A
 
A
T
 
D
E
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
V
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
|
R
M
 
M
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
N

1druA Escherichia coli dhpr/nadh complex (see paper)
63% identity, 100% coverage: 1:266/266 of query aligns to 3:268/270 of 1druA

query
sites
1druA
M
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
R
V
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
A
D
 
L
G
 
A
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
V
x
E
E
x
R
P
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
L
T
 
A
G
 
G
I
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
V
K
 
T
M
 
V
A
 
Q
G
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
D
D
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
F
x
R
P
 
P
D
 
E
L
x
G
T
 
T
L
 
L
E
 
N
N
 
H
A
 
L
E
 
A
F
 
F
C
 
C
K
 
R
A
 
Q
N
 
H
G
 
G
K
 
K
M
 
G
L
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
M
 
F
S
 
D
D
 
E
A
 
A
E
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
A
S
 
D
T
 
I
A
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
M
L
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
E
T
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
D
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
D
R
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
P
K
 
G
E
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
T
I
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
A
 
A
T
 
D
E
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
V
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
N

1arzA Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
63% identity, 100% coverage: 1:266/266 of query aligns to 3:268/270 of 1arzA

query
sites
1arzA
M
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
K
 
R
V
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
A
D
 
L
G
 
A
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
V
 
E
E
 
R
P
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
L
T
 
A
G
 
G
I
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
V
K
 
T
M
 
V
A
 
Q
G
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
D
D
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
 
F
T
 
T
F
 
R
P
 
P
D
 
E
L
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
N
N
 
H
A
 
L
E
 
A
F
 
F
C
 
C
K
 
R
A
 
Q
N
 
H
G
 
G
K
 
K
M
 
G
L
 
M
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
M
 
F
S
 
D
D
 
E
A
 
A
E
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
A
S
 
D
T
 
I
A
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
A
N
 
N
M
 
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
M
L
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
E
T
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
D
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
D
R
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
P
K
 
G
E
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
T
I
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
A
 
A
T
 
D
E
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
V
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
N

P04036 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
63% identity, 100% coverage: 1:266/266 of query aligns to 6:271/273 of P04036

query
sites
P04036
M
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
R
V
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
A
D
 
L
G
 
A
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
V
x
E
E
x
R
P
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
L
T
 
A
G
 
G
I
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
V
K
 
T
M
 
V
A
 
Q
G
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
D
D
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
 
F
T
|
T
F
x
R
P
 
P
D
 
E
L
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
N
N
 
H
A
 
L
E
 
A
F
 
F
C
 
C
K
 
R
A
 
Q
N
 
H
G
 
G
K
 
K
M
 
G
L
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
M
 
F
S
 
D
D
 
E
A
 
A
E
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
A
S
 
D
T
 
I
A
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
|
A
P
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
M
L
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
E
T
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
D
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
D
R
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
P
K
 
G
E
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
T
I
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
A
 
A
T
 
D
E
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
V
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
|
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
N

1drwA Escherichia coli dhpr/nhdh complex (see paper)
63% identity, 100% coverage: 1:266/266 of query aligns to 5:270/272 of 1drwA

query
sites
1drwA
M
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
R
V
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
A
D
 
L
G
 
A
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
V
x
E
E
x
R
P
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
L
T
 
A
G
 
G
I
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
V
K
 
T
M
 
V
A
 
Q
G
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
D
D
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
F
x
R
P
 
P
D
 
E
L
 
G
T
 
T
L
 
L
E
 
N
N
 
H
A
 
L
E
 
A
F
 
F
C
 
C
K
 
R
A
 
Q
N
 
H
G
 
G
K
 
K
M
 
G
L
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
M
 
F
S
 
D
D
 
E
A
 
A
E
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
A
S
 
D
T
 
I
A
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
M
L
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
E
T
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
D
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
D
R
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
P
K
 
G
E
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
T
I
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
A
 
A
T
 
D
E
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
V
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
N

1dihA Three-dimensional structure of e. Coli dihydrodipicolinate reductase (see paper)
63% identity, 100% coverage: 1:266/266 of query aligns to 5:270/272 of 1dihA

query
sites
1dihA
M
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
R
V
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
V
 
A
D
 
L
G
 
A
T
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
V
 
E
E
x
R
P
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
L
T
 
A
G
 
G
I
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
V
K
 
T
M
 
V
A
 
Q
G
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
D
D
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
F
x
R
P
 
P
D
 
E
L
x
G
T
 
T
L
 
L
E
 
N
N
 
H
A
 
L
E
 
A
F
 
F
C
 
C
K
 
R
A
 
Q
N
 
H
G
 
G
K
 
K
M
 
G
L
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
M
 
F
S
 
D
D
 
E
A
 
A
E
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
A
S
 
D
T
 
I
A
 
A
V
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
P
 
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
M
L
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
E
T
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
D
 
Y
Y
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
D
R
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
V
R
 
P
K
 
G
E
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
T
I
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
A
 
A
T
 
D
E
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
V
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
|
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
P
 
E
A
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
M
 
M
Q
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
N

5temA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,6 pyridine dicarboxylic and nadh (see paper)
55% identity, 100% coverage: 1:265/266 of query aligns to 2:266/266 of 5temA

query
sites
5temA
M
 
V
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
V
I
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
R
V
 
N
L
 
L
I
 
V
E
 
K
A
 
A
V
 
A
D
 
H
G
 
H
T
 
N
E
 
P
G
 
V
L
 
A
E
 
K
L
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
S
V
x
E
E
x
R
P
 
P
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
L
T
 
C
G
 
G
I
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
F
G
 
D
V
 
V
K
 
V
M
 
V
A
 
C
G
 
D
S
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
K
V
 
Q
K
 
I
D
 
D
D
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
F
 
A
P
 
P
D
 
A
L
x
S
T
 
T
L
 
L
E
 
N
N
 
N
A
 
L
E
 
A
F
 
L
C
 
C
K
 
Q
A
 
Q
N
 
Y
G
 
G
K
 
K
M
 
S
L
 
I
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
M
 
F
S
 
T
D
 
E
A
 
E
E
 
Q
K
 
R
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
Q
S
 
Q
T
 
V
A
 
P
V
 
V
V
 
V
F
 
M
A
 
A
P
|
P
N
|
N
M
x
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
F
N
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
E
T
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
D
 
Y
Y
 
C
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
R
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
R
 
N
D
 
K
L
 
L
K
 
S
E
 
D
C
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
R
 
K
K
 
D
E
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
A
 
A
T
 
D
E
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
E
V
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
T
S
 
D
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
W
L
 
L
K
 
H
D
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
F
Y
 
Y
D
 
T
M
 
M
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
L

5tejB Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
55% identity, 100% coverage: 1:266/266 of query aligns to 2:267/269 of 5tejB

query
sites
5tejB
M
 
V
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
V
I
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
R
V
 
N
L
 
L
I
 
V
E
 
K
A
 
A
V
 
A
D
 
H
G
 
H
T
 
N
E
 
P
G
 
V
L
 
A
E
 
K
L
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
S
V
x
E
E
x
R
P
 
P
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
L
T
 
C
G
 
G
I
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
F
G
 
D
V
 
V
K
 
V
M
 
V
A
 
C
G
 
D
S
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
K
V
 
Q
K
 
I
D
 
D
D
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
F
 
A
P
 
P
D
 
A
L
x
S
T
 
T
L
 
L
E
 
N
N
 
N
A
 
L
E
 
A
F
 
L
C
 
C
K
 
Q
A
 
Q
N
 
Y
G
 
G
K
 
K
M
 
S
L
 
I
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
M
 
F
S
 
T
D
 
E
A
 
E
E
 
Q
K
 
R
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
Q
S
 
Q
T
 
V
A
 
P
V
 
V
V
 
V
F
 
M
A
 
A
P
|
P
N
|
N
M
x
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
F
N
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
E
T
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
D
 
Y
Y
 
C
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
R
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
R
 
N
D
 
K
L
 
L
K
 
S
E
 
D
C
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
R
 
K
K
 
D
E
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
A
 
A
T
 
D
E
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
E
V
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
T
S
 
D
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
W
L
 
L
K
 
H
D
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
F
Y
 
Y
D
 
T
M
 
M
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
L
K
 
N

5tejA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
55% identity, 100% coverage: 1:266/266 of query aligns to 2:267/269 of 5tejA

query
sites
5tejA
M
 
V
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
V
I
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
R
V
 
N
L
 
L
I
 
V
E
 
K
A
 
A
V
 
A
D
 
H
G
 
H
T
 
N
E
 
P
G
 
V
L
 
A
E
 
K
L
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
S
V
x
E
E
x
R
P
 
P
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
L
T
 
C
G
 
G
I
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
F
G
 
D
V
 
V
K
 
V
M
 
V
A
 
C
G
 
D
S
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
K
V
 
Q
K
 
I
D
 
D
D
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
F
 
A
P
 
P
D
 
A
L
x
S
T
 
T
L
 
L
E
 
N
N
 
N
A
 
L
E
 
A
F
 
L
C
 
C
K
 
Q
A
 
Q
N
 
Y
G
 
G
K
 
K
M
 
S
L
 
I
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
M
 
F
S
 
T
D
 
E
A
 
E
E
 
Q
K
 
R
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
Q
S
 
Q
T
 
V
A
 
P
V
 
V
V
 
V
F
 
M
A
 
A
P
|
P
N
 
N
M
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
V
L
 
F
N
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
E
T
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
D
 
Y
Y
 
C
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
R
 
N
D
 
K
L
 
L
K
 
S
E
 
D
C
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
F
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
T
 
T
R
 
K
K
 
D
E
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
A
L
 
M
F
 
F
A
 
A
T
 
D
E
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
E
V
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
T
S
 
D
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
 
F
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
A
M
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
W
L
 
L
K
 
H
D
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
F
Y
 
Y
D
 
T
M
 
M
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
L
K
 
N

3ijpB Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase from bartonella henselae at 2.0a resolution (see paper)
42% identity, 100% coverage: 1:266/266 of query aligns to 2:267/267 of 3ijpB

query
sites
3ijpB
M
 
M
R
 
R
V
 
L
A
 
T
I
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
N
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
K
 
R
V
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
T
A
 
A
V
x
I
D
x
Q
G
 
R
T
x
R
E
 
K
G
 
D
L
x
V
E
|
E
L
 
L
G
 
C
A
 
A
A
 
V
V
 
L
V
 
V
E
 
R
P
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
F
I
 
V
G
 
D
A
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
S
E
 
I
M
 
L
T
 
I
G
 
G
I
 
S
G
 
D
K
 
F
T
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
R
M
 
I
A
 
T
G
 
D
S
 
D
L
 
P
A
 
E
D
 
S
V
 
A
K
 
F
D
 
S
D
 
N
F
 
T
D
 
E
V
 
G
L
 
I
V
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
S
F
 
Q
P
 
P
D
 
Q
L
 
A
T
 
S
L
 
V
E
 
L
N
 
Y
A
 
A
E
 
N
F
 
Y
C
 
A
K
 
A
A
 
Q
N
 
K
G
 
S
K
 
L
M
 
I
L
 
H
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
M
 
F
S
 
S
D
 
K
A
 
T
E
 
E
K
 
E
Q
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
L
 
D
A
 
F
A
 
A
E
 
K
S
 
Y
T
 
T
A
 
T
V
 
I
V
 
V
F
 
K
A
 
S
P
 
G
N
 
N
M
 
M
S
 
S
V
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
L
L
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
V
R
 
K
T
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
A
L
 
L
G
 
D
D
 
D
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
Y
E
 
E
A
 
M
H
|
H
H
 
H
R
 
A
H
 
N
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
S
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
L
M
 
L
G
 
G
E
 
Q
V
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
G
L
 
R
G
 
N
R
 
I
D
 
M
L
 
L
K
 
K
E
 
N
C
 
V
A
 
S
V
 
V
Y
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
S
G
 
G
F
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
K
R
 
R
T
 
E
R
 
K
K
 
G
E
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
C
I
 
S
R
 
R
A
 
G
G
 
G
D
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
D
H
 
H
T
 
S
V
 
I
L
 
T
F
 
F
A
 
A
T
 
G
E
 
E
G
 
N
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
V
V
 
L
T
 
S
H
 
H
K
 
I
A
 
A
S
 
Q
S
 
E
R
 
R
M
 
S
T
 
I
F
 
F
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
A
M
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
A
K
 
K
D
 
N
K
 
H
P
 
E
A
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
S
M
 
M
Q
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
L
K
 
N

3ijpA Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase from bartonella henselae at 2.0a resolution (see paper)
42% identity, 100% coverage: 1:265/266 of query aligns to 2:266/266 of 3ijpA

query
sites
3ijpA
M
 
M
R
 
R
V
 
L
A
 
T
I
 
V
I
 
V
G
|
G
A
 
A
A
x
N
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
R
V
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
T
A
 
A
V
x
I
D
x
Q
G
 
R
T
x
R
E
 
K
G
 
D
L
x
V
E
 
E
L
 
L
G
 
C
A
 
A
A
 
V
V
 
L
V
 
V
E
x
R
P
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
F
I
 
V
G
 
D
A
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
S
E
 
I
M
 
L
T
 
I
G
 
G
I
 
S
G
 
D
K
 
F
T
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
R
M
 
I
A
 
T
G
 
D
S
 
D
L
 
P
A
 
E
D
 
S
V
 
A
K
 
F
D
 
S
D
 
N
F
 
T
D
 
E
V
 
G
L
 
I
V
 
L
D
 
D
F
|
F
T
x
S
F
x
Q
P
 
P
D
 
Q
L
x
A
T
 
S
L
 
V
E
 
L
N
 
Y
A
 
A
E
 
N
F
 
Y
C
 
A
K
 
A
A
 
Q
N
 
K
G
 
S
K
 
L
M
 
I
L
 
H
V
 
I
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
M
 
F
S
 
S
D
 
K
A
 
T
E
 
E
K
 
E
Q
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
L
 
D
A
 
F
A
 
A
E
 
K
S
 
Y
T
 
T
A
 
T
V
 
I
V
 
V
F
 
K
A
 
S
P
x
G
N
|
N
M
|
M
S
 
S
V
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
V
 
L
L
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
V
R
 
K
T
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
A
L
 
L
G
 
D
D
 
D
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
Y
E
 
E
A
 
M
H
|
H
H
 
H
R
 
A
H
 
N
K
|
K
K
 
V
D
 
D
A
 
S
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
L
M
 
L
G
 
G
E
 
Q
V
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
G
L
 
R
G
 
N
R
 
I
D
 
M
L
 
L
K
 
K
E
 
N
C
 
V
A
 
S
V
 
V
Y
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
S
G
 
G
F
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
K
R
 
R
T
 
E
R
 
K
K
 
G
E
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
T
 
C
I
 
S
R
 
R
A
 
G
G
 
G
D
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
D
H
 
H
T
 
S
V
 
I
L
 
T
F
 
F
A
 
A
T
 
G
E
 
E
G
 
N
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
V
V
 
L
T
 
S
H
 
H
K
 
I
A
 
A
S
 
Q
S
 
E
R
 
R
M
 
S
T
 
I
F
|
F
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
A
M
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
A
K
 
K
D
 
N
K
 
H
P
 
E
A
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
S
M
 
M
Q
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
L

Q9X1K8 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
33% identity, 99% coverage: 1:263/266 of query aligns to 1:212/216 of Q9X1K8

query
sites
Q9X1K8
M
 
M
R
 
K
V
 
Y
A
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
Y
A
x
S
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
Q
V
 
E
L
 
-
I
 
I
E
 
Q
A
 
K
V
 
V
D
 
F
G
 
S
T
 
E
E
 
K
G
 
G
L
 
H
E
 
E
L
 
L
G
 
V
A
 
L
A
 
K
V
 
V
V
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
D
M
 
V
T
 
N
G
 
G
I
 
V
G
 
E
K
 
E
T
 
L
G
 
-
V
 
-
K
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
D
D
 
S
F
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
F
 
F
T
 
S
F
 
S
P
 
P
D
 
E
L
 
A
T
 
L
L
 
P
E
 
K
N
 
T
A
 
V
E
 
D
F
 
L
C
 
C
K
 
K
A
 
K
N
 
Y
G
 
R
K
 
A
M
 
G
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
A
M
 
L
S
 
K
D
 
E
A
 
E
E
 
H
K
 
L
Q
 
Q
Q
 
M
L
 
L
A
 
R
L
 
E
A
 
L
A
 
S
E
 
K
S
 
E
T
 
V
A
 
P
V
 
V
V
 
V
F
 
Q
A
|
A
P
x
Y
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
V
V
 
L
L
 
K
N
 
R
L
 
F
L
 
L
R
 
S
T
 
E
A
 
L
A
 
V
A
 
K
T
 
V
L
 
L
G
 
-
D
 
E
D
 
D
Y
 
W
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
T
H
 
H
H
 
H
R
 
R
H
 
F
K
|
K
K
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
-
M
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
L
V
 
L
A
 
E
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
-
D
 
-
L
 
-
K
 
-
E
 
-
C
 
-
A
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
K
 
K
E
 
S
I
 
V
G
 
P
F
 
I
E
 
H
T
 
S
I
 
L
R
 
R
A
 
V
G
 
G
D
 
G
V
 
V
V
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
T
 
V
V
 
V
L
 
V
F
 
F
A
 
G
T
 
N
E
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
I
E
 
E
V
 
I
T
 
K
H
 
H
K
 
R
A
 
A
S
 
I
S
 
S
R
 
R
M
 
T
T
 
V
F
 
F
A
 
A
K
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
E
W
 
F
L
 
L
K
 
V
D
 
G
K
 
K
P
 
D
A
 
P
G
 
G
L
 
M
Y
 
Y
D
 
S
M
 
F
Q
 
E
D
 
E
V
 
V
L
 
I

1vm6B Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase (tm1520) from thermotoga maritima at 2.27 a resolution
33% identity, 99% coverage: 1:263/266 of query aligns to 6:217/218 of 1vm6B

query
sites
1vm6B
M
 
M
R
 
K
V
 
Y
A
 
G
I
 
I
I
 
V
G
|
G
A
 
Y
A
x
S
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
K
 
Q
V
 
E
L
 
-
I
 
I
E
 
Q
A
 
K
V
 
V
D
 
F
G
 
S
T
 
E
E
 
K
G
 
G
L
 
H
E
 
E
L
 
L
G
 
V
A
 
L
A
 
K
V
 
V
V
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
x
D
M
x
V
T
 
N
G
 
G
I
 
V
G
 
E
K
 
E
T
 
L
G
 
-
V
 
-
K
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
D
D
 
S
F
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
x
S
F
x
S
P
 
P
D
x
E
L
x
A
T
 
L
L
 
P
E
 
K
N
 
T
A
 
V
E
 
D
F
 
L
C
 
C
K
 
K
A
 
K
N
 
Y
G
 
R
K
 
A
M
 
G
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
A
M
 
L
S
 
K
D
 
E
A
 
E
E
 
H
K
 
L
Q
 
Q
Q
 
M
L
 
L
A
 
R
L
 
E
A
 
L
A
 
S
E
 
K
S
 
E
T
 
V
A
 
P
V
 
V
V
 
V
F
 
Q
A
 
A
P
x
Y
N
|
N
M
x
F
S
 
S
V
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
V
V
 
L
L
 
K
N
 
R
L
 
F
L
 
L
R
 
S
T
 
E
A
 
L
A
 
V
A
 
K
T
 
V
L
 
L
G
 
-
D
 
E
D
 
D
Y
 
W
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
T
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
F
K
|
K
K
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
-
M
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
L
V
 
L
A
 
E
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
-
D
 
-
L
 
-
K
 
-
E
 
-
C
 
-
A
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
K
 
K
E
 
S
I
 
V
G
 
P
F
 
I
E
 
H
T
 
S
I
 
L
R
 
R
A
 
V
G
 
G
D
 
G
V
 
V
V
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
T
 
V
V
 
V
L
 
V
F
 
F
A
 
G
T
 
N
E
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
I
E
 
E
V
 
I
T
 
K
H
 
H
K
 
R
A
 
A
S
 
I
S
 
S
R
 
R
M
 
T
T
 
V
F
|
F
A
 
A
K
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
E
W
 
F
L
 
L
K
 
V
D
 
G
K
 
K
P
 
D
A
 
P
G
 
G
L
 
M
Y
 
Y
D
 
S
M
 
F
Q
 
E
D
 
E
V
 
V
L
 
I

1p9lA Structure of m. Tuberculosis dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pdc (see paper)
30% identity, 100% coverage: 1:266/266 of query aligns to 1:245/245 of 1p9lA

query
sites
1p9lA
M
 
M
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
V
I
 
L
G
|
G
A
 
A
A
 
K
G
|
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
K
 
T
V
 
T
L
 
M
I
 
V
E
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
A
G
 
A
T
 
A
E
 
D
G
 
D
L
 
L
E
 
T
L
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
E
V
 
L
V
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
D
|
D
A
|
A
G
 
G
E
 
D
M
 
P
T
 
L
G
 
S
I
 
L
G
 
L
K
 
T
T
 
D
G
 
G
V
 
-
K
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
D
 
N
F
 
T
D
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
F
 
H
P
 
P
D
 
D
L
x
V
T
 
V
L
 
M
E
 
G
N
 
N
A
 
L
E
 
E
F
 
F
C
 
L
K
 
I
A
 
D
N
 
N
G
 
G
K
 
I
M
 
H
L
 
A
V
 
V
I
 
V
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
M
 
F
S
 
T
D
 
A
A
 
E
E
 
R
K
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
V
A
 
E
-
 
S
-
 
W
-
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
K
E
 
P
S
 
N
T
 
T
A
 
S
V
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
A
P
|
P
N
|
N
M
x
F
S
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
A
N
 
V
V
 
L
V
 
S
L
 
M
N
 
H
L
 
F
L
 
A
R
 
K
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
R
T
 
F
L
 
F
G
 
D
D
 
S
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
L
H
|
H
H
|
H
R
 
P
H
 
H
K
|
K
K
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
A
R
 
R
M
 
T
G
 
A
E
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
-
G
 
R
R
 
K
D
 
G
L
 
L
K
 
P
E
 
P
C
 
N
A
 
P
V
 
D
Y
 
A
G
 
T
R
 
S
E
 
T
G
 
S
F
 
L
T
 
P
G
 
G
E
 
A
R
 
R
T
 
G
R
 
A
K
 
D
E
 
V
-
 
D
-
 
G
I
 
I
G
 
P
F
 
V
E
 
H
T
 
A
I
 
V
R
 
R
A
 
L
G
 
A
D
 
G
V
 
L
V
 
V
G
x
A
D
 
H
H
 
Q
T
 
E
V
 
V
L
 
L
F
 
F
A
 
G
T
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
L
E
 
T
V
 
I
T
 
R
H
 
H
K
 
D
A
 
S
S
 
L
S
 
D
R
 
R
M
 
T
T
 
S
F
&