SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3160 FitnessBrowser__psRCH2:GFF3160 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2xf4A Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium ycbl (see paper)
38% identity, 93% coverage: 13:213/216 of query aligns to 6:209/210 of 2xf4A

query
sites
2xf4A
F
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
T
P
 
A
L
 
F
Q
 
S
C
 
Q
N
 
N
C
 
C
T
 
S
I
 
L
I
 
I
G
 
W
D
 
C
P
 
E
V
 
Q
S
 
T
K
 
R
K
 
L
A
 
A
I
 
A
V
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
D
P
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
I
M
 
K
A
 
Q
R
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
A
H
 
S
G
 
G
L
 
V
K
 
T
V
 
L
V
 
M
S
 
Q
I
 
I
I
 
L
H
 
L
T
 
T
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
L
D
|
D
H
|
H
F
 
V
L
 
G
A
 
A
S
 
A
G
 
S
R
 
E
M
 
L
K
 
A
E
 
Q
Q
 
H
T
 
Y
G
 
G
A
 
V
-
 
P
T
 
V
L
 
I
H
 
G
L
 
P
H
 
E
K
 
K
A
 
E
D
 
D
Q
 
E
F
 
F
L
 
W
W
 
L
D
 
Q
N
 
G
L
 
L
E
 
P
M
 
A
Q
 
Q
C
 
S
R
 
R
M
 
M
F
 
F
G
 
G
V
 
L
P
 
D
Y
 
E
T
 
C
P
 
Q
V
 
P
P
 
L
A
 
T
P
 
P
D
 
D
Q
 
R
W
 
W
L
 
L
A
 
N
D
 
D
D
 
G
E
 
D
E
 
R
L
 
V
A
 
S
C
 
V
G
 
G
C
 
N
G
 
V
V
 
T
-
 
L
-
 
Q
A
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
C
P
 
P
G
 
G
H
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
S
 
H
M
 
V
S
 
V
F
 
F
W
 
F
F
 
D
A
 
E
D
 
Q
A
 
S
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
V
L
 
I
F
 
F
R
 
K
R
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
S
D
 
D
L
 
F
W
 
P
G
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
H
A
 
T
S
 
Q
I
 
L
E
 
I
R
 
D
S
 
A
I
 
I
K
 
K
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
Y
 
L
T
 
P
L
 
L
D
 
G
E
 
D
E
 
D
A
 
V
T
 
T
V
 
F
V
 
I
T
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
L
T
 
S
R
 
T
L
 
L
G
 
G
D
 
Y
E
 
E
M
 
R
R
 
L
D
 
H
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
L
R
 
Q

7ev5A Crystal structure of bleg-1 b3 metallo-beta-lactamase (see paper)
35% identity, 94% coverage: 11:212/216 of query aligns to 3:207/209 of 7ev5A

query
sites
7ev5A
E
 
K
T
 
Q
F
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
I
Q
 
Q
C
 
T
N
 
N
C
 
A
T
 
Y
I
 
V
I
 
L
G
 
Y
D
 
N
P
 
D
V
 
-
S
 
D
K
 
K
K
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
I
V
 
F
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
D
P
 
A
E
 
E
K
 
A
I
 
L
M
 
I
A
 
T
R
 
W
L
 
L
D
 
K
V
 
R
H
 
E
G
 
Q
L
 
L
K
 
T
V
 
P
V
 
L
S
 
A
I
 
I
I
 
L
H
 
L
T
 
T
H
|
H
A
 
A
H
|
H
L
 
F
D
|
D
H
|
H
F
 
I
L
 
G
A
 
A
S
 
V
G
 
D
R
 
A
M
 
V
K
 
R
E
 
D
Q
 
T
T
 
F
G
 
S
A
 
I
T
 
P
L
 
V
H
 
Y
L
 
L
H
 
H
K
 
T
A
 
K
D
 
E
Q
 
R
F
 
H
L
 
W
W
 
L
D
 
E
N
 
D
-
 
P
-
 
A
L
 
L
E
 
N
M
 
G
Q
 
S
C
 
S
R
 
R
M
 
L
F
 
T
G
 
G
V
 
R
P
 
P
Y
 
I
T
 
T
P
 
T
V
 
A
P
 
K
A
 
P
P
 
A
D
 
D
Q
 
H
W
 
L
L
 
L
A
 
T
D
 
N
D
 
E
E
 
K
E
 
S
L
 
L
A
 
T
C
 
I
G
 
G
C
 
T
G
 
F
V
 
T
-
 
F
-
 
S
A
 
V
L
 
F
H
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
M
 
V
S
 
S
F
 
Y
W
 
Y
F
 
Y
A
 
Q
D
 
K
A
 
E
K
 
A
L
 
V
L
 
L
I
 
F
A
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
V
L
 
L
F
 
F
R
 
Q
R
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
W
 
R
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
H
A
 
T
S
 
L
I
 
L
E
 
L
R
 
A
S
 
S
I
 
I
K
 
H
Q
 
N
R
 
K
L
 
I
Y
 
L
T
 
P
L
 
L
D
 
P
E
 
E
E
 
R
A
 
T
T
 
I
V
 
V
V
 
A
T
 
S
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
L
T
 
T
R
 
T
L
 
I
G
 
G
D
 
Q
E
 
E
M
 
M
R
 
D
D
 
H
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
L

2zziA Crystal structure of ttha1623 in a di-iron-bound form (see paper)
37% identity, 93% coverage: 12:212/216 of query aligns to 1:198/198 of 2zziA

query
sites
2zziA
T
 
V
F
 
F
P
 
P
V
 
V
-
 
T
-
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
C
 
E
N
 
N
C
 
A
T
 
Y
I
 
L
I
 
V
G
 
E
D
 
-
P
 
-
V
 
T
S
 
G
K
 
E
K
 
G
A
 
P
I
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
D
D
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
I
 
L
M
 
L
A
 
A
R
 
L
L
 
F
D
 
Q
V
 
T
H
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
I
V
 
P
V
 
L
S
 
A
I
 
I
I
 
L
H
 
L
T
 
T
H
|
H
A
 
A
H
|
H
L
 
F
D
|
D
H
|
H
F
 
V
L
 
G
A
 
A
S
 
V
G
 
A
R
 
P
M
 
L
K
 
V
E
 
E
Q
 
A
T
 
L
G
 
D
A
 
L
T
 
P
L
 
V
H
 
Y
L
 
L
H
 
H
K
 
P
A
 
L
D
 
D
Q
 
L
F
 
P
L
 
L
W
 
Y
D
 
E
N
 
G
L
 
A
E
 
D
M
 
L
Q
 
A
C
 
A
R
 
R
M
 
A
F
 
W
G
 
G
V
 
L
P
 
A
Y
 
I
T
 
P
P
 
K
V
 
P
P
 
P
A
 
L
P
 
P
D
 
V
Q
 
R
W
 
P
L
 
L
A
 
E
D
 
E
D
 
G
E
 
M
E
 
R
L
 
L
A
 
-
C
 
F
G
 
G
C
 
F
G
 
Q
V
 
V
A
 
-
L
 
L
H
 
H
T
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
H
M
 
V
S
 
A
F
 
F
W
 
Y
F
 
D
A
 
P
D
 
E
A
 
G
K
 
A
L
 
Q
L
 
V
I
 
F
A
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
L
L
 
L
F
 
F
R
 
R
R
 
G
G
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
Y
D
 
D
L
 
L
W
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
Y
 
P
A
 
K
S
 
A
I
 
L
E
 
F
R
 
A
S
 
S
I
 
L
K
 
K
Q
 
-
R
 
R
L
 
L
Y
 
L
T
 
S
L
 
L
D
 
P
E
 
P
E
 
E
A
 
T
T
 
R
V
 
V
V
 
H
T
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
G
T
 
T
R
 
T
L
 
L
G
 
G
D
 
L
E
 
E
M
 
A
R
 
R
D
 
T
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
L

2zwrB Crystal structure of ttha1623 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
37% identity, 93% coverage: 12:212/216 of query aligns to 3:200/207 of 2zwrB

query
sites
2zwrB
T
 
V
F
 
F
P
 
P
V
 
V
-
 
T
-
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
C
 
E
N
 
N
C
 
A
T
 
Y
I
 
L
I
 
V
G
 
E
D
 
-
P
 
-
V
 
T
S
 
G
K
 
E
K
 
G
A
 
P
I
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
D
D
 
E
P
 
P
E
 
E
K
 
K
I
 
L
M
 
L
A
 
A
R
 
L
L
 
F
D
 
Q
V
 
T
H
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
I
V
 
P
V
 
L
S
 
A
I
 
I
I
 
L
H
 
L
T
 
T
H
|
H
A
 
A
H
|
H
L
 
F
D
|
D
H
|
H
F
 
V
L
 
G
A
 
A
S
 
V
G
 
A
R
 
P
M
 
L
K
 
V
E
 
E
Q
 
A
T
 
L
G
 
D
A
 
L
T
 
P
L
 
V
H
 
Y
L
 
L
H
 
H
K
 
P
A
 
L
D
 
D
Q
 
L
F
 
P
L
 
L
W
 
Y
D
 
E
N
 
G
L
 
A
E
 
D
M
 
L
Q
 
A
C
 
A
R
 
R
M
 
A
F
 
W
G
 
G
V
 
L
P
 
A
Y
 
I
T
 
P
P
 
K
V
 
P
P
 
P
A
 
L
P
 
P
D
 
V
Q
 
R
W
 
P
L
 
L
A
 
E
D
 
E
D
 
G
E
 
M
E
 
R
L
 
L
A
 
-
C
 
F
G
 
G
C
 
F
G
 
Q
V
 
V
A
 
-
L
 
L
H
 
H
T
 
L
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
H
M
 
V
S
 
A
F
 
F
W
 
Y
F
 
D
A
 
P
D
 
E
A
 
G
K
 
A
L
 
Q
L
 
V
I
 
F
A
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
L
L
 
L
F
 
F
R
 
R
R
 
G
G
 
S
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
Y
D
 
D
L
 
L
W
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
Y
 
P
A
 
K
S
 
A
I
 
L
E
 
F
R
 
A
S
 
S
I
 
L
K
 
K
Q
 
-
R
 
R
L
 
L
Y
 
L
T
 
S
L
 
L
D
 
P
E
 
P
E
 
E
A
 
T
T
 
R
V
 
V
V
 
H
T
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
G
T
 
T
R
 
T
L
 
L
G
 
G
D
 
L
E
 
E
M
 
A
R
 
R
D
 
T
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
L

7l0bA Crystal structure of hydroxyacyl glutathione hydrolase (glob) from staphylococcus aureus, apoenzyme (see paper)
33% identity, 93% coverage: 15:214/216 of query aligns to 9:202/202 of 7l0bA

query
sites
7l0bA
V
 
L
G
 
G
P
 
L
L
 
V
Q
 
D
C
 
T
N
 
N
C
 
T
T
 
Y
I
 
F
I
 
I
G
 
E
D
 
N
P
 
-
V
 
-
S
 
D
K
 
K
K
 
A
A
 
V
I
 
I
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
S
G
 
G
D
 
E
P
 
S
E
 
E
K
 
K
I
 
I
M
 
I
A
 
K
R
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
Q
H
 
I
G
 
N
L
 
K
K
 
P
V
 
L
V
 
K
S
 
A
I
 
I
I
 
L
H
 
L
T
 
T
H
|
H
A
 
A
H
|
H
L
 
F
D
|
D
H
|
H
F
 
I
L
 
G
A
 
A
S
 
V
G
 
D
R
 
D
M
 
I
K
 
V
E
 
D
Q
 
R
T
 
F
G
 
D
A
 
V
T
 
P
L
 
V
H
 
Y
L
 
M
H
 
H
K
 
E
A
 
A
D
 
E
-
 
F
Q
 
D
F
 
F
L
 
L
W
 
K
D
 
D
N
 
P
L
 
V
E
 
K
M
 
N
Q
 
G
C
 
A
R
 
D
M
 
K
F
 
-
G
 
-
V
 
L
P
 
P
Y
 
I
T
 
T
P
 
S
V
 
K
P
 
V
A
 
T
P
 
P
D
 
E
Q
 
K
W
 
L
L
 
N
A
 
E
D
 
G
D
 
S
E
 
T
E
 
E
L
 
I
A
 
E
C
 
G
G
 
F
C
 
K
G
 
F
V
 
N
A
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
M
 
L
S
 
T
F
 
Y
W
 
V
F
 
F
A
 
D
D
 
E
A
 
-
K
 
-
L
 
F
L
 
A
I
 
V
A
 
V
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
R
 
N
R
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
W
 
Y
G
 
K
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
A
 
E
S
 
T
I
 
L
E
 
V
R
 
D
S
 
S
I
 
I
K
 
Q
Q
 
D
R
 
K
L
 
I
Y
 
F
T
 
E
L
 
L
D
 
E
E
 
G
E
 
D
A
 
L
T
 
P
V
 
L
V
 
F
T
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
Y
T
 
T
R
 
T
L
 
V
G
 
D
D
 
D
E
 
E
M
 
Q
R
 
L
D
 
-
N
 
N
P
 
P
F
 
F
V
 
L
R
 
H
A
 
G

4ysbA Crystal structure of ethe1 from myxococcus xanthus (see paper)
29% identity, 88% coverage: 24:212/216 of query aligns to 17:190/225 of 4ysbA

query
sites
4ysbA
I
 
L
I
 
I
G
 
G
D
 
D
P
 
E
V
 
A
S
 
T
K
 
R
K
 
Q
A
 
A
I
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
 
L
D
 
E
P
 
Q
E
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
D
-
 
L
K
 
Q
I
 
M
M
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
L
D
 
D
V
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
T
V
 
L
V
 
T
S
 
H
I
 
V
I
 
F
H
 
D
T
 
T
H
|
H
A
 
V
H
|
H
L
 
A
D
|
D
H
|
H
F
 
I
L
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
A
M
 
L
K
 
R
E
 
E
Q
 
R
T
 
T
G
 
Q
A
 
A
T
 
T
L
 
V
H
 
-
L
 
V
H
 
G
K
 
S
A
 
V
D
 
N
Q
 
G
F
 
A
L
 
S
W
 
C
D
 
A
N
 
N
L
 
V
E
 
Q
M
 
V
Q
 
R
C
 
H
R
 
-
M
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
Q
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
G
D
 
D
D
 
E
E
 
V
E
 
R
L
 
V
A
 
G
C
 
Q
G
 
L
C
 
V
G
 
F
V
 
Q
A
 
V
L
 
L
H
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
G
 
D
S
 
S
M
 
I
S
 
S
F
 
Y
W
 
L
F
 
L
A
 
G
D
 
D
A
 
R
K
 
-
L
 
-
L
 
V
I
 
F
A
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
L
F
 
L
R
 
V
R
 
R
G
 
G
I
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
F
W
 
Q
G
 
N
G
 
G
D
 
N
Y
 
A
A
 
S
S
 
Q
I
 
L
E
 
Y
R
 
D
S
 
S
I
 
L
K
 
T
Q
 
R
R
 
V
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
P
E
 
D
E
 
E
A
 
T
T
 
L
V
 
V
V
 
Y
T
 
P
G
 
G
H
|
H
G
 
D
P
 
Y
D
 
K
-
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
V
T
 
T
R
 
S
L
 
I
G
 
A
D
 
E
E
 
E
M
 
K
R
 
R
D
 
H
N
 
N
P
 
P
F
 
R
V
 
V

4chlB Human ethylmalonic encephalopathy protein 1 (hethe1) (see paper)
25% identity, 88% coverage: 6:196/216 of query aligns to 6:179/237 of 4chlB

query
sites
4chlB
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
T
 
M
F
 
F
P
 
E
V
 
-
G
 
-
P
 
P
L
 
V
Q
 
S
C
 
C
N
 
T
C
 
F
T
 
T
-
 
Y
I
 
L
I
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
R
V
 
E
S
 
S
K
 
R
K
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
 
L
D
 
E
P
 
T
E
 
A
K
 
P
I
 
R
M
 
D
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
D
 
I
V
 
K
H
 
E
-
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
R
V
 
L
V
 
L
S
 
Y
I
 
A
I
 
V
H
 
N
T
 
T
H
|
H
A
 
C
H
|
H
L
 
A
D
|
D
H
|
H
F
 
I
L
 
T
A
 
G
S
 
S
G
 
G
R
 
L
M
 
L
K
 
R
E
 
S
Q
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
C
-
 
Q
-
 
S
-
 
V
-
 
I
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
G
T
 
A
G
 
Q
A
 
A
T
 
D
L
 
L
H
 
H
L
 
I
H
 
E
K
 
D
A
 
G
D
 
D
Q
 
S
F
 
I
L
 
R
W
 
F
D
 
G
N
 
R
L
 
F
E
 
A
M
 
L
Q
 
E
C
 
T
R
 
R
M
 
A
F
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
Q
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
C
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
S
 
C
M
 
V
S
 
T
F
 
F
W
 
V
F
 
L
A
 
N
D
 
D
A
 
H
K
 
S
L
 
M
L
 
A
I
 
F
A
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
L
F
 
L
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
F
W
 
Q
G
 
Q
G
 
G
D
 
C
Y
 
A
A
 
K
S
 
T
I
 
L
E
 
Y
R
 
H
S
 
S
I
 
V
K
 
H
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
P
E
 
G
E
 
D
A
 
C
T
 
L
V
 
I
V
 
Y
T
 
P
G
 
A
H
|
H

O95571 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial; Ethylmalonic encephalopathy protein 1; Hepatoma subtracted clone one protein; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
25% identity, 88% coverage: 6:196/216 of query aligns to 22:195/254 of O95571

query
sites
O95571
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
T
 
M
F
 
F
P
 
E
V
 
-
G
 
-
P
 
P
L
 
V
Q
 
S
C
 
C
N
 
T
C
 
F
T
 
T
-
 
Y
I
 
L
I
 
L
G
 
G
D
 
D
P
 
R
V
 
E
S
 
S
K
 
R
K
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
x
L
D
 
E
P
 
T
E
 
A
K
 
P
I
 
R
M
 
D
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
D
 
I
V
 
K
H
 
E
-
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
R
V
 
L
V
 
L
S
 
Y
I
 
A
I
 
V
H
 
N
T
 
T
H
|
H
A
 
C
H
 
H
L
 
A
D
 
D
H
 
H
F
 
I
L
 
T
A
 
G
S
 
S
G
 
G
R
 
L
M
 
L
K
 
R
E
 
S
Q
 
L
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
C
-
 
Q
-
 
S
-
 
V
-
 
I
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
G
T
 
A
G
 
Q
A
 
A
T
 
D
L
 
L
H
 
H
L
 
I
H
 
E
K
 
D
A
 
G
D
 
D
Q
 
S
F
 
I
L
 
R
W
 
F
D
 
G
N
 
R
L
 
F
E
 
A
M
 
L
Q
 
E
C
 
T
R
 
R
M
 
A
F
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
Q
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
C
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
S
 
C
M
 
V
S
 
T
F
 
F
W
 
V
F
 
L
A
 
N
D
 
D
A
 
H
K
 
S
L
 
M
L
 
A
I
 
F
A
x
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
L
F
 
L
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
|
T
D
 
D
L
 
F
W
 
Q
G
 
Q
G
 
G
D
 
C
Y
 
A
A
 
K
S
 
T
I
 
L
E
 
Y
R
 
H
S
 
S
I
 
V
K
 
H
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
P
E
 
G
E
 
D
A
 
C
T
 
L
V
 
I
V
 
Y
T
 
P
G
 
A
H
 
H

Sites not aligning to the query:

4efzA Crystal structure of a hypothetical metallo-beta-lactamase from burkholderia pseudomallei
28% identity, 80% coverage: 43:215/216 of query aligns to 52:241/295 of 4efzA

query
sites
4efzA
E
 
D
K
 
Q
I
 
L
M
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
V
D
 
A
V
 
A
H
 
L
G
 
G
L
 
A
K
 
R
V
 
V
V
 
R
S
 
W
I
 
L
I
 
L
H
 
E
T
 
T
H
|
H
A
 
V
H
|
H
L
 
A
D
|
D
H
|
H
F
 
L
L
 
S
A
 
A
S
 
A
G
 
P
R
 
Y
M
 
L
K
 
K
E
 
T
Q
 
R
T
 
V
G
 
G
A
 
G
T
 
E
L
 
I
H
 
A
L
 
I
H
 
G
K
 
R
A
 
H
D
 
V
Q
 
T
F
 
R
L
 
V
W
 
Q
D
 
D
N
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
Q
 
-
C
 
-
R
 
-
M
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
K
P
 
L
Y
 
F
T
 
N
P
 
A
V
 
G
P
 
P
A
 
A
-
 
F
-
 
A
-
 
H
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
Q
P
 
F
D
 
D
Q
 
R
W
 
L
L
 
L
A
 
D
D
 
D
D
 
G
E
 
D
E
 
T
L
 
L
A
 
A
C
 
L
G
 
G
C
 
A
G
 
L
V
 
S
-
 
I
-
 
R
A
 
A
L
 
M
H
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
C
M
 
M
S
 
T
F
 
Y
W
 
V
F
 
V
A
 
T
D
 
E
-
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
A
-
 
H
-
 
D
-
 
A
-
 
R
A
 
D
K
 
A
L
 
A
L
 
A
I
 
F
A
 
V
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
R
 
M
-
 
P
-
 
D
R
 
Y
G
 
G
I
 
T
G
 
A
R
 
R
T
 
C
D
 
D
L
 
F
W
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
A
A
 
R
S
 
S
I
 
L
E
 
Y
R
 
R
S
 
S
I
 
I
K
 
R
Q
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
T
 
M
L
 
C
D
 
H
E
 
D
E
 
Y
A
 
Q
T
 
P
V
 
A
V
 
I
T
 
Q
G
 
Y
H
 
A
G
 
-
P
 
-
D
 
-
T
 
S
R
 
T
L
 
V
G
 
A
D
 
D
E
 
E
M
 
L
R
 
R
D
 
E
N
 
N
P
 
V
F
 
H
V
 
I
R
 
R
A
 
E
G
 
G

4yslA Crystal structure of sdoa from pseudomonas putida in complex with glutathione (see paper)
32% identity, 65% coverage: 43:183/216 of query aligns to 54:200/294 of 4yslA

query
sites
4yslA
E
 
D
K
 
R
I
 
L
M
 
V
A
 
E
R
 
R
L
 
V
D
 
N
V
 
E
H
 
L
G
 
N
L
 
A
K
 
S
V
 
V
V
 
R
S
 
W
I
 
V
I
 
L
H
 
E
T
 
T
H
|
H
A
 
V
H
 
H
L
 
A
D
 
D
H
 
H
F
 
L
L
 
S
A
 
A
S
 
A
G
 
A
R
 
Y
M
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
K
T
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
-
L
 
-
H
 
-
L
 
-
H
 
H
K
 
T
A
 
A
D
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
I
W
 
G
D
 
A
N
 
H
L
 
I
E
 
T
M
 
Q
Q
 
V
C
 
Q
R
 
K
M
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
A
P
 
L
Y
 
F
T
 
N
P
 
A
V
 
E
P
 
P
A
 
G
P
 
F
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
Q
-
 
F
D
 
D
Q
 
V
W
 
L
L
 
L
A
 
E
D
 
D
D
 
E
E
 
E
E
 
G
L
 
F
A
 
R
C
 
I
G
 
G
C
 
N
-
 
L
-
 
Q
G
 
A
V
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
C
M
 
M
S
 
S
F
 
F
W
 
M
F
 
I
A
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
G
-
 
E
-
 
I
L
 
A
L
 
V
I
 
F
A
 
V
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
R
 
M
-
 
P
-
 
D
R
 
Y
G
 
G
I
 
T
G
x
A
R
|
R
T
 
C
D
 
D
L
 
F
W
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
Y
 
A
A
 
R
S
 
T
I
 
L
E
 
Y
R
 
R
S
 
S
I
 
I
K
 
R
Q
 
R
R
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4yskA Crystal structure of apo-form sdoa from pseudomonas putida (see paper)
32% identity, 65% coverage: 43:183/216 of query aligns to 54:200/294 of 4yskA

query
sites
4yskA
E
 
D
K
 
R
I
 
L
M
 
V
A
 
E
R
 
R
L
 
V
D
 
N
V
 
E
H
 
L
G
 
N
L
 
A
K
 
S
V
 
V
V
 
R
S
 
W
I
 
V
I
 
L
H
 
E
T
 
T
H
|
H
A
 
V
H
 
H
L
 
A
D
 
D
H
 
H
F
 
L
L
 
S
A
 
A
S
 
A
G
 
A
R
 
Y
M
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
K
T
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
-
L
 
-
H
 
-
L
 
-
H
 
H
K
 
T
A
 
A
D
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
I
W
 
G
D
 
A
N
 
H
L
 
I
E
 
T
M
 
Q
Q
 
V
C
 
Q
R
 
K
M
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
A
P
 
L
Y
 
F
T
 
N
P
 
A
V
 
E
P
 
P
A
 
G
P
 
F
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
Q
-
 
F
D
 
D
Q
 
V
W
 
L
L
 
L
A
 
E
D
 
D
D
 
E
E
 
E
E
 
G
L
 
F
A
 
R
C
 
I
G
 
G
C
 
N
-
 
L
-
 
Q
G
 
A
V
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
C
M
 
M
S
 
S
F
 
F
W
 
M
F
 
I
A
 
E
D
 
D
A
 
A
K
 
G
-
 
E
-
 
I
L
 
A
L
 
V
I
 
F
A
 
V
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
R
 
M
-
 
P
-
 
D
R
 
Y
G
 
G
I
 
T
G
 
A
R
 
R
T
 
C
D
 
D
L
 
F
W
 
P
G
 
G
G
 
A
D
 
D
Y
 
A
A
 
R
S
 
T
I
 
L
E
 
Y
R
 
R
S
 
S
I
 
I
K
 
R
Q
 
R
R
 
L
L
 
L

5ve5A Crystal structure of persulfide dioxygenase rhodanese fusion protein with rhodanese domain inactivating mutation (c314s) from burkholderia phytofirmans in complex with glutathione (see paper)
25% identity, 87% coverage: 24:210/216 of query aligns to 20:194/350 of 5ve5A

query
sites
5ve5A
I
 
L
I
 
L
G
 
A
D
 
D
P
 
S
V
 
T
S
 
T
K
x
R
K
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
 
F
D
 
E
P
 
Q
-
 
V
E
 
R
K
 
R
I
 
D
M
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
I
D
 
E
V
 
E
H
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
H
V
 
L
V
 
L
S
 
Y
I
 
T
I
 
I
H
 
D
T
 
T
H
|
H
A
 
V
H
|
H
L
 
A
D
|
D
H
|
H
F
 
V
L
 
T
A
 
G
S
 
A
G
 
W
R
 
M
M
 
L
K
 
N
E
 
R
Q
 
R
T
 
I
G
 
G
A
 
S
T
 
R
L
 
I
H
 
A
L
 
I
H
 
S
K
 
A
A
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
A
D
 
D
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
W
 
S
D
 
H
N
 
G
L
 
D
E
 
K
M
 
V
Q
 
E
C
 
-
R
 
-
M
 
-
F
 
F
G
 
G
V
 
T
P
 
R
Y
 
Y
T
 
L
P
 
T
V
 
V
P
 
R
A
 
A
P
 
-
D
 
-
Q
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
C
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
D
G
 
G
S
 
C
M
 
I
S
 
T
F
 
L
W
 
V
F
 
L
A
 
D
D
 
N
A
 
E
K
 
T
L
 
M
L
 
A
I
 
F
A
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
C
L
 
L
F
 
L
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
T
G
|
G
R
|
R
T
 
T
D
 
D
L
 
F
W
 
Q
G
 
R
G
 
G
D
 
D
Y
 
A
A
 
H
S
 
T
I
 
M
E
 
F
R
 
R
S
 
A
I
 
V
K
 
H
Q
 
G
R
 
Q
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
P
E
 
T
E
 
A
A
 
C
T
 
L
V
 
L
V
 
Y
T
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
P
x
Y
D
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
V
T
 
T
R
 
S
L
 
V
G
 
G
D
 
E
E
 
E
M
 
R
R
 
R
D
 
F
N
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3tp9A Crystal structure of alicyclobacillus acidocaldarius protein with beta-lactamase and rhodanese domains
26% identity, 89% coverage: 24:215/216 of query aligns to 19:217/473 of 3tp9A

query
sites
3tp9A
I
 
L
I
 
V
G
 
G
D
 
C
P
 
Q
V
 
E
S
 
T
K
 
G
K
 
E
A
 
A
I
 
C
V
 
V
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
A
G
 
R
D
 
D
P
 
V
E
 
E
K
 
P
I
 
Y
M
 
L
A
 
L
R
 
T
L
 
A
D
 
K
V
 
R
H
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
A
I
 
A
I
 
L
H
 
E
T
 
T
H
|
H
A
 
I
H
|
H
L
 
A
D
|
D
H
x
F
F
 
V
L
 
S
A
 
G
S
 
A
G
 
R
R
 
E
M
 
M
K
 
A
E
 
D
Q
 
R
T
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
A
L
 
I
H
 
C
L
 
V
H
 
S
K
 
D
A
 
E
D
 
G
Q
 
P
F
 
P
L
 
E
W
 
W
D
 
K
N
 
S
L
 
E
E
 
Y
M
 
V
Q
 
K
C
 
A
R
 
Y
M
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
D
 
H
Q
 
R
W
 
L
L
 
L
A
 
K
D
 
D
D
 
G
E
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
H
C
 
F
G
 
G
C
 
N
G
 
V
-
 
R
-
 
I
V
 
V
A
 
V
L
 
M
H
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
P
G
 
E
S
 
H
M
 
V
S
 
S
F
 
Y
W
 
L
F
 
L
A
 
Y
D
 
D
A
 
G
K
 
K
L
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
M
-
 
A
L
 
L
I
 
F
A
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
F
L
 
V
F
 
F
R
 
V
R
 
G
G
 
D
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
P
D
 
D
L
 
L
W
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
V
G
 
A
G
 
G
D
 
E
Y
 
S
A
 
G
S
 
S
I
 
S
E
 
E
R
 
A
S
 
L
I
 
A
K
 
R
Q
 
Q
-
 
M
-
 
F
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
R
R
 
K
L
 
F
Y
 
E
T
 
A
L
 
L
D
 
P
E
 
D
E
 
H
A
 
V
T
 
Q
V
 
V
V
 
L
T
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
G
P
 
A
D
 
G
T
 
S
R
 
A
L
 
C
G
 
G
D
 
K
E
 
A
M
 
L
R
 
G
D
 
A
N
 
V
P
 
P
F
 
S
V
 
S
R
 
T
A
 
V
G
 
G

2gcuA X-ray structure of gene product from arabidopsis thaliana at1g53580 (see paper)
25% identity, 83% coverage: 31:210/216 of query aligns to 28:201/244 of 2gcuA

query
sites
2gcuA
K
 
K
K
 
P
A
 
A
I
 
L
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
 
D
D
 
K
P
 
T
-
 
V
E
 
D
K
 
R
I
 
D
M
 
L
A
 
K
R
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
E
H
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
L
V
 
I
S
 
Y
I
 
A
I
 
M
H
 
N
T
 
T
H
|
H
A
 
V
H
|
H
L
 
A
D
|
D
H
|
H
F
 
V
L
 
T
A
 
G
S
 
T
G
 
G
R
 
L
M
 
L
K
 
K
E
 
T
Q
 
K
T
 
L
-
 
P
G
 
G
A
 
V
T
 
K
L
 
S
H
 
V
L
 
I
H
 
S
K
 
K
A
 
A
D
 
S
Q
 
G
F
 
S
L
 
K
W
 
A
D
 
D
N
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
Q
 
-
C
 
-
R
 
-
M
 
L
F
 
F
G
 
L
V
 
E
P
 
P
Y
 
G
T
 
D
P
 
K
V
 
V
P
 
S
A
 
I
P
 
G
D
 
D
Q
 
I
W
 
Y
L
 
L
A
 
E
D
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
C
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
V
L
 
R
H
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
A
G
 
G
S
 
C
M
 
V
S
 
T
F
 
Y
W
 
V
F
 
T
A
 
G
D
 
E
A
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
K
 
R
L
 
M
L
 
A
I
 
F
A
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
V
F
 
L
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
F
W
 
Q
G
 
E
G
 
G
D
 
S
Y
 
S
A
 
D
S
 
Q
I
 
L
E
 
Y
R
 
E
S
 
S
I
 
V
K
 
H
Q
 
S
R
 
Q
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
P
E
 
K
E
 
D
A
 
T
T
 
L
V
 
I
V
 
Y
T
 
P
G
 
A
H
|
H
G
 
D
P
 
Y
D
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
V
T
 
S
R
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
E
E
 
E
M
 
M
R
 
Q
D
 
H
N
 
N
P
 
P

6sg9FL uS3m (see paper)
25% identity, 88% coverage: 21:209/216 of query aligns to 65:294/320 of 6sg9FL

query
sites
6sg9FL
N
 
N
C
 
Q
T
x
Y
I
 
M
I
 
L
G
 
I
D
 
N
P
 
K
V
 
A
S
 
T
K
 
K
K
 
R
A
 
C
I
 
L
V
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
A
G
 
S
G
 
D
D
 
D
-
 
W
P
 
P
E
 
D
K
 
D
I
 
W
M
 
A
A
 
A
R
 
F
L
 
I
D
 
G
V
 
A
H
 
S
G
 
D
L
 
L
K
 
T
V
 
L
V
 
T
S
 
H
I
 
V
I
 
F
H
 
L
T
 
T
H
|
H
A
 
C
H
|
H
L
 
I
D
|
D
H
 
N
F
 
I
L
 
I
A
 
N
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
F
-
 
L
-
 
T
-
 
I
S
 
C
G
 
G
R
 
S
M
 
R
K
 
Q
E
 
K
Q
 
Q
T
 
D
G
 
E
A
 
I
T
 
G
L
 
V
H
 
M
L
 
W
H
 
C
K
 
P
A
 
A
D
 
E
Q
 
E
F
 
C
L
 
W
W
 
V
D
 
Q
N
 
N
L
 
F
E
 
K
M
 
R
Q
 
S
C
 
C
R
 
E
M
 
R
F
 
Y
G
 
G
-
 
R
-
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
M
-
 
H
-
 
Q
-
 
V
V
 
L
P
 
P
-
 
M
-
 
M
-
 
C
-
 
R
-
 
S
-
 
L
Y
 
Y
T
 
T
P
 
P
-
 
Q
-
 
H
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
P
V
 
V
P
 
R
A
 
N
P
 
A
D
 
R
Q
 
H
W
 
L
L
 
R
A
 
R
D
 
N
D
 
D
E
 
V
E
 
L
L
 
L
A
 
S
C
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
N
-
 
R
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
F
-
 
I
-
 
D
-
 
F
G
 
G
C
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
L
L
 
L
H
 
Y
-
 
Y
-
 
I
-
 
F
T
 
S
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
H
M
 
M
S
 
M
F
 
L
W
 
H
F
 
I
A
 
P
D
 
T
A
 
E
K
 
R
L
 
I
L
 
L
I
 
F
A
 
S
G
 
G
D
|
D
T
 
L
L
 
L
F
 
F
R
 
F
R
 
N
G
x
K
I
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
V
D
 
D
L
 
L
W
 
P
G
 
W
G
 
A
D
 
T
Y
 
G
A
 
V
S
 
R
I
 
L
E
 
A
R
 
E
S
 
S
I
 
L
K
 
R
Q
 
L
R
 
-
L
 
L
Y
 
E
T
 
A
L
 
L
D
 
P
E
 
D
E
 
N
A
 
T
T
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
P
G
 
G
H
|
H
G
|
G
P
x
R
D
 
M
T
 
T
R
 
T
L
 
L
G
 
G
D
 
R
E
 
E
M
 
R
R
 
R
D
 
E
N
 
N

Sites not aligning to the query:

Q9C8L4 Persulfide dioxygenase ETHE1 homolog, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; Sulfur dioxygenase ETHE1; EC 1.13.11.18 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
25% identity, 83% coverage: 31:210/216 of query aligns to 77:250/294 of Q9C8L4

query
sites
Q9C8L4
K
 
K
K
 
P
A
 
A
I
 
L
V
 
L
V
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
 
D
D
 
K
P
 
T
-
 
V
E
 
D
K
 
R
I
 
D
M
 
L
A
 
K
R
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
E
H
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
L
V
 
I
S
 
Y
I
 
A
I
 
M
H
 
N
T
 
T
H
|
H
A
 
V
H
 
H
L
 
A
D
 
D
H
 
H
F
 
V
L
 
T
A
 
G
S
 
T
G
 
G
R
 
L
M
 
L
K
 
K
E
 
T
Q
 
K
T
 
L
-
 
P
G
 
G
A
 
V
T
 
K
L
 
S
H
 
V
L
 
I
H
 
S
K
 
K
A
 
A
D
 
S
Q
 
G
F
 
S
L
 
K
W
 
A
D
 
D
N
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
Q
 
-
C
 
-
R
 
-
M
 
L
F
 
F
G
 
L
V
 
E
P
 
P
Y
 
G
T
 
D
P
 
K
V
 
V
P
 
S
A
 
I
P
 
G
D
 
D
Q
 
I
W
 
Y
L
 
L
A
 
E
D
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
C
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
V
L
 
R
H
 
A
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
A
G
 
G
S
 
C
M
 
V
S
 
T
F
 
Y
W
 
V
F
 
T
A
 
G
D
 
E
A
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
K
 
R
L
 
M
L
 
A
I
 
F
A
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
L
 
V
F
 
L
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
F
W
 
Q
G
 
E
G
 
G
D
 
S
Y
 
S
A
 
D
S
 
Q
I
 
L
E
 
Y
R
 
E
S
 
S
I
 
V
K
 
H
Q
 
S
R
 
Q
L
 
I
Y
 
F
T
 
T
L
 
L
D
 
P
E
 
K
E
 
D
A
 
T
T
 
L
V
 
I
V
 
Y
T
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
D
P
 
Y
D
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
V
T
 
S
R
 
T
L
 
V
G
 
G
D
 
E
E
 
E
M
 
M
R
 
Q
D
 
H
N
 
N
P
 
P

O24496 Hydroxyacylglutathione hydrolase cytoplasmic; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
28% identity, 85% coverage: 13:196/216 of query aligns to 4:174/258 of O24496

query
sites
O24496
F
 
F
P
 
H
V
 
V
G
 
P
P
 
C
L
 
L
Q
 
Q
C
 
D
N
 
N
C
 
Y
T
 
S
-
 
Y
I
 
L
I
 
I
G
 
I
D
 
D
P
 
E
V
 
S
S
 
T
K
 
G
K
 
D
A
 
A
I
 
A
V
 
V
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
V
G
 
-
D
 
D
P
 
P
E
 
E
K
 
K
I
 
V
M
 
I
A
 
A
R
 
S
L
 
A
D
 
E
V
 
K
H
 
H
G
 
Q
L
 
A
K
 
K
V
 
I
V
 
K
S
 
F
I
 
V
I
 
L
H
 
T
T
 
T
H
|
H
A
 
H
H
 
H
L
 
W
D
|
D
H
 
H
F
 
A
L
 
G
A
 
G
S
 
N
G
 
E
R
 
K
M
 
I
K
 
K
E
 
Q
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
H
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
W
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
L
E
 
V
M
 
P
Q
 
D
C
 
I
R
 
K
M
 
V
F
 
Y
G
 
G
V
 
G
P
 
S
Y
 
L
T
 
D
P
 
K
V
 
V
P
 
K
A
 
G
P
 
C
D
 
T
Q
 
D
W
 
A
L
 
V
A
 
D
D
 
N
D
 
G
E
 
D
E
 
K
L
 
L
A
 
T
C
 
L
G
 
G
C
 
Q
G
 
D
V
 
I
-
 
N
-
 
I
-
 
L
A
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
T
P
 
P
G
 
C
H
 
H
T
 
T
P
 
K
G
 
G
S
 
H
M
 
I
S
 
S
F
 
Y
W
 
Y
F
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
E
A
 
G
D
 
E
A
 
N
K
 
P
L
 
A
L
 
V
I
 
F
A
 
T
G
 
G
D
 
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
R
 
V
R
 
A
G
 
G
I
x
C
G
 
G
R
x
K
T
 
-
D
 
-
L
 
F
W
 
F
G
 
E
G
 
G
D
 
T
Y
 
A
A
 
E
S
 
Q
I
 
M
E
 
Y
R
 
Q
S
 
S
I
 
L
K
 
C
Q
 
V
R
 
T
L
 
L
Y
 
A
T
 
A
L
 
L
D
 
P
E
 
K
E
 
P
A
 
T
T
 
Q
V
 
V
V
 
Y
T
 
C
G
 
G
H
 
H

Sites not aligning to the query:

Q9SID3 Hydroxyacylglutathione hydrolase 2, mitochondrial; Glyoxalase II; Glx II; EC 3.1.2.6 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
26% identity, 75% coverage: 35:196/216 of query aligns to 97:239/324 of Q9SID3

query
sites
Q9SID3
V
 
V
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
S
G
 
-
D
 
E
P
 
A
E
 
E
K
 
P
I
 
I
M
 
I
A
 
D
R
 
S
L
 
L
D
 
K
V
 
R
H
 
S
G
 
G
L
 
R
K
 
N
V
 
L
V
 
T
S
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
N
T
 
T
H
|
H
A
 
H
H
|
H
L
 
Y
D
|
D
H
|
H
F
 
T
L
 
G
A
 
G
S
 
N
G
 
L
R
 
E
M
 
L
K
 
K
E
 
D
Q
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
V
H
 
I
L
 
G
H
 
S
K
 
A
A
 
M
D
 
D
Q
 
K
F
 
D
L
 
R
W
 
I
D
 
P
N
 
G
L
 
I
E
 
D
M
 
M
Q
 
A
C
 
L
R
 
K
M
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
D
P
 
G
D
 
D
Q
 
K
W
 
W
L
 
M
A
 
F
D
 
A
D
 
G
E
 
H
E
 
E
L
 
V
A
 
H
C
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
V
L
 
M
H
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
G
 
G
S
 
H
M
 
I
S
 
S
F
 
L
W
 
Y
F
 
F
A
 
P
D
 
G
A
 
S
K
 
R
L
 
A
L
 
I
I
 
F
A
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
M
F
 
F
R
 
S
R
 
L
G
 
S
I
 
C
G
 
G
R
 
K
T
 
-
D
 
-
L
 
L
W
 
F
G
 
E
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
A
 
K
S
 
Q
I
 
M
E
 
L
R
 
A
S
 
S
I
 
L
K
 
-
Q
 
Q
R
 
K
L
 
I
Y
 
T
T
 
S
L
 
L
D
 
P
E
 
D
E
 
D
A
 
T
T
 
S
V
 
I
V
 
Y
T
 
C
G
 
G
H
|
H

2q42A Ensemble refinement of the protein crystal structure of glyoxalase ii from arabidopsis thaliana gene at2g31350 (see paper)
26% identity, 75% coverage: 35:196/216 of query aligns to 27:169/254 of 2q42A

query
sites
2q42A
V
 
V
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
S
G
 
-
D
 
E
P
 
A
E
 
E
K
 
P
I
 
I
M
 
I
A
 
D
R
 
S
L
 
L
D
 
K
V
 
R
H
 
S
G
 
G
L
 
R
K
 
N
V
 
L
V
 
T
S
 
Y
I
 
I
I
 
L
H
 
N
T
 
T
H
|
H
A
 
H
H
|
H
L
 
Y
D
|
D
H
|
H
F
 
T
L
 
G
A
 
G
S
 
N
G
 
L
R
 
E
M
 
L
K
 
K
E
 
D
Q
 
R
T
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
V
H
 
I
L
 
G
H
 
S
K
 
A
A
 
M
D
 
D
Q
 
K
F
 
D
L
 
R
W
 
I
D
 
P
N
 
G
L
 
I
E
 
D
M
 
M
Q
 
A
C
 
L
R
 
K
M
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
D
P
 
G
D
 
D
Q
 
K
W
 
W
L
 
M
A
 
F
D
 
A
D
 
G
E
 
H
E
 
E
L
 
V
A
 
H
C
 
V
G
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
M
H
 
D
T
 
T
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
K
G
 
G
S
 
H
M
 
I
S
 
S
F
 
L
W
 
Y
F
 
F
A
 
P
D
 
G
A
 
S
K
 
R
L
 
A
L
 
I
I
 
F
A
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
M
F
 
F
R
 
S
R
 
L
G
 
S
I
 
C
G
 
G
R
 
K
T
 
-
D
 
-
L
 
L
W
 
F
G
 
E
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
A
 
K
S
 
Q
I
 
M
E
 
L
R
 
A
S
 
S
I
 
L
K
 
-
Q
 
Q
R
 
K
L
 
I
Y
 
T
T
 
S
L
 
L
D
 
P
E
 
D
E
 
D
A
 
T
T
 
S
V
 
I
V
 
Y
T
 
C
G
 
G
H
|
H

8ewoA Crystal structure of putative glyoxylase ii from pseudomonas aeruginosa
32% identity, 80% coverage: 24:196/216 of query aligns to 18:171/259 of 8ewoA

query
sites
8ewoA
I
 
L
I
 
L
G
 
Q
D
 
D
P
 
A
V
 
T
S
 
S
K
 
R
K
 
R
A
 
C
I
 
A
V
 
V
V
 
V
D
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
-
D
 
D
P
 
A
E
 
K
K
 
P
I
 
V
M
 
E
A
 
A
R
 
W
L
 
L
D
 
A
V
 
A
H
 
H
-
 
P
G
 
D
L
 
W
K
 
R
V
 
L
V
 
S
S
 
D
I
 
I
I
 
L
H
 
V
T
 
T
H
|
H
A
 
H
H
|
H
L
 
H
D
|
D
H
|
H
F
 
V
L
 
G
A
 
G
S
 
V
G
 
A
R
 
A
M
 
L
K
 
K
E
 
E
Q
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
-
L
 
-
H
 
-
L
 
-
H
 
-
K
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
W
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
Q
 
-
C
 
-
R
 
R
M
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
P
P
 
A
Y
 
N
T
 
E
P
 
K
V
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
R
D
 
D
Q
 
L
W
 
A
L
 
L
A
 
E
D
 
D
D
 
G
E
 
E
E
 
R
L
 
V
A
 
E
C
 
V
G
 
L
C
 
G
G
 
L
V
 
V
-
 
F
-
 
E
A
 
I
L
 
F
H
 
H
T
 
V
P
 
P
G
 
G
H
|
H
T
 
T
P
 
L
G
 
G
S
 
H
M
 
I
S
 
A
F
 
Y
W
 
Y
F
 
H
-
 
P
A
 
A
D
 
E
A
 
T
K
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
F
A
 
C
G
 
G
D
|
D
T
 
T
L
 
L
F
 
F
R
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
C
G
 
G
R
 
R
T
 
-
D
 
-
L
 
L
W
 
F
G
 
E
G
 
G
D
 
T
Y
 
P
A
 
A
S
 
Q
I
 
M
E
 
H
R
 
H
S
 
S
I
 
L
K
 
A
Q
 
-
R
 
R
L
 
L
Y
 
A
T
 
A
L
 
L
D
 
P
E
 
A
E
 
N
A
 
T
T
 
R
V
 
V
V
 
Y
T
 
C
G
 
T
H
|
H

Query Sequence

>GFF3160 FitnessBrowser__psRCH2:GFF3160
MAATQPLLIRETFPVGPLQCNCTIIGDPVSKKAIVVDPGGDPEKIMARLDVHGLKVVSII
HTHAHLDHFLASGRMKEQTGATLHLHKADQFLWDNLEMQCRMFGVPYTPVPAPDQWLADD
EELACGCGVALHTPGHTPGSMSFWFADAKLLIAGDTLFRRGIGRTDLWGGDYASIERSIK
QRLYTLDEEATVVTGHGPDTRLGDEMRDNPFVRAGA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory