SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3280 FitnessBrowser__Marino:GFF3280 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2vqdA Crystal structure of biotin carboxylase from pseudomonas aeruginosa complexed with ampcp (see paper)
74% identity, 99% coverage: 3:444/448 of query aligns to 1:442/447 of 2vqdA

query
sites
2vqdA
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
L
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
S
 
S
Q
 
T
V
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
H
V
 
L
R
 
S
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
S
 
S
V
 
V
C
 
C
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
A
S
 
P
A
 
A
T
 
T
D
 
Q
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
Q
I
 
I
P
 
P
T
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
D
 
G
S
 
A
V
 
T
G
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
I
E
 
E
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
T
F
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
K
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
V
I
 
I
R
 
R
L
 
L
M
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
I
 
K
N
 
D
A
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
T
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
D
 
P
D
 
E
D
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
T
T
 
A
L
 
L
R
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
E
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
M
x
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
A
 
A
S
 
G
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
|
G
R
 
R
G
 
G
M
 
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
Y
S
 
D
E
 
E
A
 
S
A
 
E
L
 
L
L
 
I
K
 
K
G
 
S
V
 
A
Q
 
K
I
 
L
T
 
T
Q
 
R
S
 
T
E
 
E
A
 
A
K
 
G
N
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
D
 
N
P
|
P
T
 
M
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
K
 
K
F
|
F
L
|
L
E
 
T
A
 
N
P
 
P
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
S
D
 
D
M
 
G
H
 
Q
G
 
G
N
 
N
C
 
A
I
 
I
H
 
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
M
 
L
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
G
I
 
I
N
 
D
P
 
E
E
 
K
S
 
A
R
 
R
E
 
Q
R
 
E
T
 
V
L
 
F
K
 
A
A
 
R
C
 
C
T
 
V
D
 
Q
A
 
A
C
 
C
K
 
I
E
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
S
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
V
R
 
K
E
 
E
Q
 
M
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
E
P
 
K
L
 
L
Q
 
S
Y
 
I
T
 
R
Q
 
Q
D
 
E
D
 
D
I
 
V
R
 
V
I
 
I
S
 
R
G
 
G
H
 
H
A
 
A
M
 
L
E
 
E
C
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
F
I
 
M
P
 
P
S
 
S
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
K
H
 
H
F
 
F
H
 
H
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
N
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
D
 
D
S
 
S
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
T
 
S
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
N
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
G
K
 
K
L
 
V
I
 
I
T
 
T
W
 
Y
G
 
G
D
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
I
 
E
A
 
A
R
 
L
R
 
A
R
 
R
M
 
M
K
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
V
 
V
E
 
D
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
Q
 
T
P
 
E
L
 
L
H
 
H
R
 
K
K
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
A
G
 
A
F
 
F
K
 
C
Q
 
K
V
 
G
D
 
G
F
 
V
T
 
N
I
|
I
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
K
 
K

4mv4A Crystal structure of biotin carboxylase from haemophilus influenzae in complex with amppcp and mg2 (see paper)
68% identity, 99% coverage: 3:446/448 of query aligns to 1:441/442 of 4mv4A

query
sites
4mv4A
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
S
 
S
Q
 
T
V
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
L
 
L
M
 
K
H
 
H
V
 
V
R
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
I
C
 
C
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
A
S
 
P
A
 
S
T
 
A
D
 
K
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
I
 
I
P
 
P
T
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
D
 
G
S
 
A
V
 
D
G
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
T
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
T
A
 
A
E
 
D
T
 
V
I
 
I
R
 
R
L
 
L
M
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
I
 
I
N
 
K
A
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
C
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
V
D
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
I
E
 
A
R
 
K
T
 
N
L
 
K
R
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
M
 
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
G
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
 
-
R
 
-
G
 
-
M
|
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
R
S
 
S
E
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
E
K
 
E
G
 
S
V
 
I
Q
 
A
I
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
N
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
N
D
 
N
P
x
D
T
 
M
V
 
V
Y
 
Y
L
 
M
E
|
E
K
 
K
F
x
Y
L
|
L
E
 
E
A
 
N
P
 
P
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
T
H
 
H
G
 
G
N
 
N
C
 
A
I
 
V
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
G
I
 
I
N
 
T
P
 
E
E
 
E
S
 
V
R
 
R
E
 
R
R
 
D
T
 
I
L
 
G
K
 
S
A
 
R
C
 
C
T
 
A
D
 
N
A
 
A
C
 
C
K
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
T
E
 
E
M
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
I
Q
 
S
Y
 
F
T
 
K
Q
 
Q
D
 
E
D
 
D
I
 
I
R
 
K
I
 
V
S
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
A
M
 
M
E
 
E
C
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
F
I
 
L
P
 
P
S
 
S
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
N
H
 
H
F
 
L
H
 
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
N
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
W
D
 
D
S
 
S
H
 
H
L
 
V
Y
 
Y
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
M
V
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
T
W
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
T
R
 
R
D
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
I
R
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
Q
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
S
E
 
E
L
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
D
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
Q
 
I
P
 
P
L
 
L
H
 
H
R
 
E
K
 
L
L
 
I
V
 
L
R
 
E
D
 
D
G
 
E
G
 
N
F
 
F
K
 
Q
Q
 
K
V
 
G
D
 
G
F
 
T
T
 
N
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
K
M
 
L

6oi8A Crystal structure of haemophilus influenzae biotin carboxylase complexed with 7-((1r,5s,6s)-6-amino-3-azabicyclo[3.1.0]hexan-3-yl)- 6-(2-chloro-6-(pyridin-3-yl)phenyl)pyrido[2,3-d]pyrimidin-2-amine (see paper)
68% identity, 99% coverage: 3:446/448 of query aligns to 1:439/440 of 6oi8A

query
sites
6oi8A
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
S
 
S
Q
 
T
V
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
L
 
L
M
 
K
H
 
H
V
 
V
R
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
I
C
 
C
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
A
S
 
P
A
 
S
T
 
A
D
 
K
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
I
 
I
P
 
P
T
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
D
 
G
S
 
A
V
 
D
G
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
T
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
T
A
 
A
E
 
D
T
 
V
I
 
I
R
 
R
L
 
L
M
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
I
 
I
N
 
K
A
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
C
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
V
D
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
I
E
 
A
R
 
K
T
 
N
L
 
K
R
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
M
x
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
G
G
 
G
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
M
|
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
R
S
 
S
E
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
E
K
 
E
G
 
S
V
 
I
Q
 
A
I
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
N
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
N
D
 
N
P
x
D
T
 
M
V
 
V
Y
 
Y
L
 
M
E
|
E
K
 
K
F
x
Y
L
|
L
E
 
E
A
 
N
P
 
P
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
T
H
 
H
G
 
G
N
 
N
C
 
A
I
 
V
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
M
 
M
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
G
I
 
I
N
 
T
P
 
E
E
 
E
S
 
V
R
 
R
E
 
R
R
 
D
T
 
I
L
 
G
K
 
S
A
 
R
C
 
C
T
 
A
D
 
N
A
 
A
C
 
C
K
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
T
E
 
E
M
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
I
Q
 
S
Y
 
F
T
 
K
Q
 
Q
D
 
E
D
 
D
I
 
I
R
 
K
I
 
V
S
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
A
M
 
M
E
 
E
C
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
F
I
 
L
P
 
P
S
 
S
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
N
H
 
H
F
 
L
H
 
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
N
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
W
D
 
D
S
 
S
H
 
H
L
 
V
Y
 
Y
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
M
V
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
T
W
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
T
R
 
R
D
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
I
R
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
Q
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
S
E
 
E
L
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
D
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
Q
 
I
P
 
P
L
 
L
H
 
H
R
 
E
K
 
L
L
 
I
V
 
L
R
 
E
D
 
D
G
 
E
G
 
N
F
 
F
K
 
Q
Q
 
K
V
 
G
D
 
G
F
 
T
T
 
N
I
|
I
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
K
M
 
L

4mv3A Crystal structure of biotin carboxylase from haemophilus influenzae in complex with amppcp and bicarbonate (see paper)
68% identity, 99% coverage: 3:444/448 of query aligns to 1:436/439 of 4mv3A

query
sites
4mv3A
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
S
 
S
Q
 
T
V
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
L
 
L
M
 
K
H
 
H
V
 
V
R
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
I
C
 
C
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
A
S
 
P
A
 
S
T
 
A
D
 
K
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
I
 
I
P
 
P
T
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
D
 
G
S
 
A
V
 
D
G
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
T
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
T
A
 
A
E
 
D
T
 
V
I
 
I
R
 
R
L
 
L
M
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
I
 
I
N
 
K
A
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
C
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
V
D
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
I
E
 
A
R
 
K
T
 
N
L
 
K
R
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
M
 
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
M
|
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
R
S
 
S
E
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
E
K
 
E
G
 
S
V
 
I
Q
 
A
I
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
N
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
N
D
 
N
P
x
D
T
 
M
V
 
V
Y
 
Y
L
 
M
E
|
E
K
 
K
F
x
Y
L
|
L
E
 
E
A
 
N
P
 
P
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
T
H
 
H
G
 
G
N
 
N
C
 
A
I
 
V
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
G
I
 
I
N
 
T
P
 
E
E
 
E
S
 
V
R
 
R
E
 
R
R
 
D
T
 
I
L
 
G
K
 
S
A
 
R
C
 
C
T
 
A
D
 
N
A
 
A
C
 
C
K
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
|
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
T
E
 
E
M
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
I
Q
 
S
Y
 
F
T
 
K
Q
 
Q
D
 
E
D
 
D
I
 
I
R
 
K
I
 
V
S
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
A
M
 
M
E
 
E
C
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
F
I
 
L
P
 
P
S
 
S
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
N
H
 
H
F
 
L
H
 
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
N
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
W
D
 
D
S
 
S
H
 
H
L
 
V
Y
 
Y
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
M
V
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
T
W
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
T
R
 
R
D
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
I
R
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
Q
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
S
E
 
E
L
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
D
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
Q
 
I
P
 
P
L
 
L
H
 
H
R
 
E
K
 
L
L
 
I
V
 
L
R
 
E
D
 
D
G
 
E
G
 
N
F
 
F
K
 
Q
Q
 
K
V
 
G
D
 
G
F
 
T
T
 
N
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
K
 
K

2vr1A Crystal structure of biotin carboxylase from e. Coli in complex with atp analog, adpcf2p. (see paper)
68% identity, 99% coverage: 3:444/448 of query aligns to 1:440/444 of 2vr1A

query
sites
2vr1A
M
 
M
L
 
L
E
 
D
K
 
K
V
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
S
 
S
Q
 
S
V
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
L
 
L
M
 
K
H
 
H
V
 
V
R
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
V
C
 
C
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
A
S
 
P
A
 
S
T
 
V
D
 
K
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
I
 
I
P
 
P
T
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
I
T
 
T
D
 
G
S
 
A
V
 
V
G
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
A
D
 
N
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
I
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
 
A
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
L
 
L
M
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
I
 
I
N
 
A
A
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
C
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
D
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
M
E
 
D
R
 
K
T
 
N
L
 
R
R
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
M
 
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
|
R
G
 
G
M
|
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
R
S
 
G
E
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
A
K
 
Q
G
 
S
V
 
I
Q
 
S
I
 
M
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
N
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
D
 
N
P
x
D
T
 
M
V
 
V
Y
 
Y
L
 
M
E
 
E
K
 
K
F
x
Y
L
|
L
E
 
E
A
 
N
P
 
P
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
G
H
 
Q
G
 
G
N
 
N
C
 
A
I
 
I
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
G
I
 
I
N
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
L
R
 
R
E
 
R
R
 
Y
T
 
I
L
 
G
K
 
E
A
 
R
C
 
C
T
 
A
D
 
K
A
 
A
C
 
C
K
 
V
E
 
D
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
Y
 
F
Q
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
T
E
 
E
M
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
I
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
Q
 
S
Y
 
I
T
 
K
Q
 
Q
D
 
E
D
 
E
I
 
V
R
 
H
I
 
V
S
 
R
G
 
G
H
 
H
A
 
A
M
 
V
E
 
E
C
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
N
T
 
T
F
 
F
I
 
L
P
 
P
S
 
S
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
T
H
 
R
F
 
F
H
 
H
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
N
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
W
D
 
E
S
 
S
H
 
H
L
 
I
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
M
V
 
I
A
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
C
W
 
Y
G
 
G
D
 
E
D
 
N
R
 
R
D
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
I
R
 
A
R
 
R
M
 
M
K
 
K
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
V
 
I
E
 
D
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
Q
 
V
P
 
D
L
 
L
H
 
Q
R
 
I
K
 
R
L
 
I
V
 
M
R
 
N
D
 
D
G
 
E
G
 
N
F
 
F
K
 
Q
Q
 
H
V
 
G
D
 
G
F
 
T
T
 
N
I
|
I
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
K
 
K

6ojhA Crystal structure of haemophilus influenzae biotin carboxylase complexed with (r)-7-(3-aminopyrrolidin-1-yl)-6-(naphthalen-1-yl) pyrido[2,3-d]pyrimidin-2-amine
69% identity, 99% coverage: 3:446/448 of query aligns to 1:444/445 of 6ojhA

query
sites
6ojhA
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
S
 
S
Q
 
T
V
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
L
 
L
M
 
K
H
 
H
V
 
V
R
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
I
C
 
C
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
A
S
 
P
A
 
S
T
 
A
D
 
K
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
I
 
I
P
 
P
T
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
D
 
G
S
 
A
V
 
D
G
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
T
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
T
A
 
A
E
 
D
T
 
V
I
 
I
R
 
R
L
 
L
M
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
I
 
I
N
 
K
A
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
C
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
V
D
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
I
E
 
A
R
 
K
T
 
N
L
 
K
R
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
M
 
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
R
S
 
S
E
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
E
K
 
E
G
 
S
V
 
I
Q
 
A
I
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
N
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
N
D
 
N
P
x
D
T
 
M
V
 
V
Y
 
Y
L
 
M
E
|
E
K
 
K
F
x
Y
L
|
L
E
 
E
A
 
N
P
 
P
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
T
H
 
H
G
 
G
N
 
N
C
 
A
I
 
V
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
G
I
 
I
N
 
T
P
 
E
E
 
E
S
 
V
R
 
R
E
 
R
R
 
D
T
 
I
L
 
G
K
 
S
A
 
R
C
 
C
T
 
A
D
 
N
A
 
A
C
 
C
K
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
T
E
 
E
M
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
I
Q
 
S
Y
 
F
T
 
K
Q
 
Q
D
 
E
D
 
D
I
 
I
R
 
K
I
 
V
S
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
A
M
 
M
E
 
E
C
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
F
I
 
L
P
 
P
S
 
S
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
N
H
 
H
F
 
L
H
 
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
N
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
W
D
 
D
S
 
S
H
 
H
L
 
V
Y
 
Y
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
M
V
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
T
W
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
T
R
 
R
D
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
I
R
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
Q
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
S
E
 
E
L
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
D
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
Q
 
I
P
 
P
L
 
L
H
 
H
R
 
E
K
 
L
L
 
I
V
 
L
R
 
E
D
 
D
G
 
E
G
 
N
F
 
F
K
 
Q
Q
 
K
V
 
G
D
 
G
F
 
T
T
 
N
I
|
I
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
K
M
 
L

P43873 Biotin carboxylase; Acetyl-coenzyme A carboxylase biotin carboxylase subunit A; EC 6.3.4.14 from Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) (see paper)
69% identity, 99% coverage: 3:444/448 of query aligns to 1:442/448 of P43873

query
sites
P43873
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
S
 
S
Q
 
T
V
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
L
 
L
M
 
K
H
 
H
V
 
V
R
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
I
C
 
C
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
A
S
 
P
A
 
S
T
 
A
D
 
K
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
I
 
I
P
 
P
T
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
D
 
G
S
 
A
V
 
D
G
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
T
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
T
A
 
A
E
 
D
T
 
V
I
 
I
R
 
R
L
 
L
M
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
I
 
I
N
 
K
A
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
C
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
V
D
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
I
E
 
A
R
 
K
T
 
N
L
 
K
R
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
M
 
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
 
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
R
S
 
S
E
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
E
K
 
E
G
 
S
V
 
I
Q
 
A
I
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
N
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
N
D
 
N
P
 
D
T
 
M
V
 
V
Y
 
Y
L
 
M
E
|
E
K
|
K
F
x
Y
L
|
L
E
 
E
A
 
N
P
 
P
R
 
R
H
 
H
V
 
V
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
T
H
 
H
G
 
G
N
 
N
C
 
A
I
 
V
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
G
I
 
I
N
 
T
P
 
E
E
 
E
S
 
V
R
 
R
E
 
R
R
 
D
T
 
I
L
 
G
K
 
S
A
 
R
C
 
C
T
 
A
D
 
N
A
 
A
C
 
C
K
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
 
R
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
T
E
 
E
M
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
I
Q
 
S
Y
 
F
T
 
K
Q
 
Q
D
 
E
D
 
D
I
 
I
R
 
K
I
 
V
S
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
A
M
 
M
E
 
E
C
 
C
R
 
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
F
I
 
L
P
 
P
S
 
S
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
N
H
 
H
F
 
L
H
 
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
N
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
W
D
 
D
S
 
S
H
 
H
L
 
V
Y
 
Y
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
M
V
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
T
W
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
T
R
 
R
D
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
I
R
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
Q
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
S
E
 
E
L
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
D
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
Q
 
I
P
 
P
L
 
L
H
 
H
R
 
E
K
 
L
L
 
I
V
 
L
R
 
E
D
 
D
G
 
E
G
 
N
F
 
F
K
 
Q
Q
 
K
V
 
G
D
 
G
F
 
T
T
 
N
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
K
 
K

4mv1A Crystal structure of biotin carboxylase from haemophilus influenzae in complex with adp and phosphate (see paper)
67% identity, 99% coverage: 3:444/448 of query aligns to 1:428/430 of 4mv1A

query
sites
4mv1A
M
 
M
L
 
L
E
 
E
K
 
K
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
S
 
S
Q
 
T
V
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
L
 
L
M
 
K
H
 
H
V
 
V
R
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
I
C
 
C
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
A
S
 
P
A
 
S
T
 
A
D
 
K
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
I
 
I
P
 
P
T
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
D
 
G
S
 
A
V
 
D
G
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
T
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
T
A
 
A
E
 
D
T
 
V
I
 
I
R
 
R
L
 
L
M
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
I
 
I
N
 
K
A
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
C
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
V
D
 
S
D
 
N
D
 
D
E
 
I
E
 
A
R
 
K
T
 
N
L
 
K
R
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
M
 
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
M
 
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
R
S
 
S
E
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
E
K
 
E
G
 
S
V
 
I
Q
 
A
I
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
A
E
x
D
A
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
T
 
M
V
 
V
Y
 
Y
L
 
M
E
|
E
K
|
K
F
x
Y
L
|
L
E
 
E
A
 
N
P
 
P
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
T
H
 
H
G
 
G
N
 
N
C
 
A
I
 
V
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
M
 
M
Q
 
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
H
Q
 
Q
K
|
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
G
I
 
I
N
 
T
P
 
E
E
 
E
S
 
V
R
 
R
E
 
R
R
 
D
T
 
I
L
 
G
K
 
S
A
 
R
C
 
C
T
 
A
D
 
N
A
 
A
C
 
C
K
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
|
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
T
E
 
E
M
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
I
Q
 
S
Y
 
F
T
 
K
Q
 
Q
D
 
E
D
 
D
I
 
I
R
 
K
I
 
V
S
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
A
M
 
M
E
 
E
C
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
F
I
 
L
P
 
P
S
 
S
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
N
H
 
H
F
 
L
H
 
H
A
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
N
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
W
D
 
D
S
 
S
H
 
H
L
 
V
Y
 
Y
S
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
M
V
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
T
W
 
Y
G
 
G
D
 
D
D
 
T
R
 
R
D
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
I
R
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
Q
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
S
E
 
E
L
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
D
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
Q
 
I
P
 
P
L
 
L
H
 
H
R
 
E
K
 
L
L
 
I
V
 
L
R
 
E
D
 
D
G
 
E
G
 
N
F
 
F
K
 
Q
Q
 
K
V
 
G
D
 
G
F
 
T
T
 
N
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
K
 
K

3rupA Crystal structure of e.Coli biotin carboxylase in complex with two adp and two ca ions (see paper)
68% identity, 99% coverage: 3:444/448 of query aligns to 1:442/444 of 3rupA

query
sites
3rupA
M
 
M
L
 
L
E
 
D
K
 
K
V
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
S
 
S
Q
 
S
V
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
L
 
L
M
 
K
H
 
H
V
 
V
R
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
V
C
 
C
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
A
S
 
P
A
 
S
T
 
V
D
 
K
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
I
 
I
P
 
P
T
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
I
T
 
T
D
 
G
S
 
A
V
 
V
G
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
|
G
F
 
F
L
 
L
A
 
S
E
|
E
N
 
N
A
 
A
D
 
N
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
I
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
 
A
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
L
 
L
M
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
I
 
I
N
 
A
A
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
C
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
D
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
M
E
 
D
R
 
K
T
 
N
L
 
R
R
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
M
 
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
G
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
R
|
R
G
 
G
M
|
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
R
S
 
G
E
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
A
K
 
Q
G
 
S
V
 
I
Q
 
S
I
 
M
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
N
 
A
A
 
A
F
|
F
G
 
S
D
 
N
P
x
D
T
 
M
V
 
V
Y
 
Y
L
 
M
E
|
E
K
|
K
F
x
Y
L
|
L
E
 
E
A
 
N
P
 
P
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
G
H
 
Q
G
 
G
N
 
N
C
 
A
I
 
I
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
M
 
M
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
|
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
G
I
 
I
N
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
L
R
 
R
E
 
R
R
 
Y
T
 
I
L
 
G
K
 
E
A
 
R
C
 
C
T
 
A
D
 
K
A
 
A
C
 
C
K
 
V
E
 
D
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
Y
 
F
Q
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
 
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
T
E
 
E
M
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
I
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
Q
 
S
Y
 
I
T
 
K
Q
 
Q
D
 
E
D
 
E
I
 
V
R
 
H
I
 
V
S
 
R
G
 
G
H
 
H
A
 
A
M
 
V
E
 
E
C
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
K
 
N
T
 
T
F
 
F
I
 
L
P
 
P
S
 
S
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
T
H
 
R
F
 
F
H
 
H
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
N
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
W
D
 
E
S
 
S
H
 
H
L
 
I
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
V
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
D
|
D
S
 
S
L
 
M
V
 
I
A
 
G
K
 
K
L
 
L
I
 
I
T
 
C
W
 
Y
G
 
G
D
 
E
D
 
N
R
 
R
D
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
I
R
 
A
R
 
R
M
 
M
K
 
K
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
I
V
 
I
E
 
D
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
N
 
N
Q
 
V
P
 
D
L
 
L
H
 
Q
R
 
I
K
 
R
L
 
I
V
 
M
R
 
N
D
 
D
G
 
E
G
 
N
F
 
F
K
 
Q
Q
 
H
V
 
G
D
 
G
F
 
T
T
 
N
I
|
I
H
 
H
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
K
 
K

3g8cA Crystal structure of biotin carboxylase in complex with biotin, bicarbonate, adp and mg ion (see paper)
68% identity, 99% coverage: 3:444/448 of query aligns to 1:442/444 of 3g8cA

query
sites
3g8cA
M
 
M
L
 
L
E
 
D
K
 
K
V
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
A
C
 
C
K
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
S
 
S
Q
 
S
V
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
L
 
L
M
 
K
H
 
H
V
 
V
R
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
S
 
T
V
 
V
C
 
C
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
A
S
 
P
A
 
S
T
 
V
D
 
K
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
I
 
I
P
 
P
T
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
I
T
 
T
D
 
G
S
 
A
V
 
V
G
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
F
|
F
L
 
L
A
 
S
E
 
E
N
 
N
A
 
A
D
 
N
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
I
F
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
K
A
 
A
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
L
 
L
M
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
V
 
V
S
 
S
A
 
A
I
 
I
N
 
A
A
 
A
M
 
M
I
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
C
V
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
S
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
D
 
G
D
 
D
D
 
D
E
 
M
E
 
D
R
 
K
T
 
N
L
 
R
R
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
M
x
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
G
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
H
 
R
S
 
G
E
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
A
K
 
Q
G
 
S
V
 
I
Q
 
S
I
 
M
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
N
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
D
 
N
P
x
D
T
 
M
V
 
V
Y
 
Y
L
 
M
E
|
E
K
|
K
F
x
Y
L
|
L
E
 
E
A
 
N
P
 
P
R
 
R
H
|
H
V
 
V
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
G
H
 
Q
G
 
G
N
 
N
C
 
A
I
 
I
H
 
Y
L
 
L
G
 
A
D
 
E
R
 
R
D
 
D
C
 
C
S
 
S
M
 
M
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
|
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
P
 
P
A
 
A
P
 
P
N
 
G
I
 
I
N
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
L
R
 
R
E
 
R
R
 
Y
T
 
I
L
 
G
K
 
E
A
 
R
C
 
C
T
 
A
D
 
K
A
 
A
C
 
C
K
 
V
E
 
D
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
V
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
Y
 
F
Q
 
E
D
 
N
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
I
 
I
E
|
E
M
 
M
N
|
N
T
 
T
R
|
R
V
 
I
Q
|
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
P
 
P
V
 
V
S
 
T
E
 
E
M
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
V
 
I
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
L</