SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF329 FitnessBrowser__psRCH2:GFF329 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0A799 Phosphoglycerate kinase; EC 2.7.2.3 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
71% identity, 100% coverage: 1:385/386 of query aligns to 1:385/387 of P0A799

query
sites
P0A799
M
|
M
T
 
S
V
 
V
L
 
I
K
 
K
M
 
M
T
 
T
D
 
D
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
F
I
 
I
R
 
R
E
 
A
D
 
D
L
 
L
N
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
V
K
 
T
S
 
S
D
 
D
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
R
A
 
A
S
 
S
L
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
K
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
L
 
M
V
 
V
C
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
E
Y
 
Y
S
 
N
E
 
E
E
 
E
D
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
S
 
K
K
 
D
A
x
K
L
 
L
G
 
S
R
 
N
E
 
P
V
 
V
P
 
R
L
 
L
I
 
V
K
 
K
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
D
V
 
V
Q
 
A
P
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
K
N
 
D
T
 
D
D
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
S
Q
 
K
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
M
 
M
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
G
 
A
S
 
S
T
 
T
H
 
H
G
 
G
V
 
I
A
 
G
K
 
K
F
 
F
A
 
A
K
 
D
V
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
T
 
E
P
 
P
A
 
A
K
 
R
P
 
P
M
 
M
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
 
G
S
 
S
K
 
K
V
 
V
S
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
D
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
S
D
 
K
V
 
I
C
 
A
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
N
T
 
T
F
 
F
L
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
Y
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
H
 
Y
E
 
E
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
D
 
D
T
 
E
A
 
A
K
 
K
A
 
R
I
 
L
A
 
L
A
 
T
K
 
T
V
 
C
A
 
N
V
 
I
P
 
P
L
 
V
P
 
P
V
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
R
V
 
V
A
 
A
K
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
S
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
P
A
 
A
T
 
T
V
 
L
K
 
K
A
 
S
I
 
V
A
 
N
D
 
D
V
 
V
A
 
K
D
 
A
D
 
D
D
 
E
M
 
Q
I
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
D
K
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
Q
M
 
E
F
 
L
G
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
L
K
 
K
S
 
N
S
 
A
Q
 
K
T
 
T
I
 
I
L
 
L
W
 
W
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
F
D
 
P
Q
 
N
F
 
F
G
 
R
N
 
K
G
 
G
T
 
T
K
 
E
V
 
I
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
D
S
 
S
P
 
E
A
 
A
F
 
F
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
K
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
I
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
V
 
V
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
V
E
 
A
V
 
M
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
R
 
R
A
 
A

1zmrA Crystal structure of the e. Coli phosphoglycerate kinase (see paper)
71% identity, 99% coverage: 2:385/386 of query aligns to 1:384/386 of 1zmrA

query
sites
1zmrA
T
 
S
V
 
V
L
 
I
K
 
K
M
 
M
T
 
T
D
 
D
L
 
L
D
 
D
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
F
I
 
I
R
 
R
E
 
A
D
 
D
L
 
L
N
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
V
K
 
T
S
 
S
D
 
D
A
 
A
R
|
R
I
 
I
L
 
R
A
 
A
S
 
S
L
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
I
K
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
K
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
L
 
M
V
 
V
C
 
T
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
E
Y
 
Y
S
 
N
E
 
E
E
 
E
D
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
S
x
K
K
 
D
A
 
K
L
|
L
G
 
S
R
 
N
E
 
P
V
 
V
P
 
R
L
 
L
I
 
V
K
 
K
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
D
V
 
V
Q
 
A
P
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
K
N
 
D
T
 
D
D
 
E
E
 
T
L
 
L
A
 
S
Q
 
K
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
M
 
M
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
G
 
A
S
 
S
T
 
T
H
 
H
G
 
G
V
 
I
A
 
G
K
 
K
F
 
F
A
 
A
K
 
D
V
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
T
 
E
P
 
P
A
 
A
K
 
R
P
 
P
M
 
M
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
 
G
S
 
S
K
|
K
V
 
V
S
 
S
T
 
T
K
 
K
L
 
L
D
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
D
S
 
S
L
 
L
A
 
S
D
 
K
V
 
I
C
 
A
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
N
T
 
T
F
 
F
L
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
Y
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
H
 
Y
E
 
E
A
 
A
D
|
D
L
 
L
L
 
V
D
|
D
T
 
E
A
 
A
K
 
K
A
 
R
I
 
L
A
 
L
A
 
T
K
 
T
V
 
C
A
 
N
V
 
I
P
 
P
L
 
V
P
 
P
V
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
R
V
 
V
A
 
A
K
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
S
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
P
A
 
A
T
 
T
V
 
L
K
 
K
A
 
S
I
 
V
A
 
N
D
 
D
V
 
V
A
 
K
D
 
A
D
 
D
D
 
E
M
 
Q
I
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
D
K
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
Q
M
 
E
F
 
L
G
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
L
K
 
K
S
 
N
S
 
A
Q
 
K
T
 
T
I
 
I
L
 
L
W
 
W
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
F
D
 
P
Q
 
N
F
 
F
G
 
R
N
 
K
G
 
G
T
 
T
K
 
E
V
 
I
L
 
V
A
 
A
Q
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
D
S
 
S
P
 
E
A
 
A
F
 
F
S
 
S
I
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
|
G
D
 
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
K
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
I
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
V
 
V
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
V
E
 
A
V
 
M
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
R
 
R
A
 
A

4feyA An x-ray structure of a putative phosphogylcerate kinase with bound adp from francisella tularensis subsp. Tularensis schu s4
61% identity, 100% coverage: 1:385/386 of query aligns to 1:390/392 of 4feyA

query
sites
4feyA
M
 
M
T
 
S
V
 
F
L
 
L
K
 
T
M
 
L
T
 
K
D
 
D
L
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
G
 
D
K
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
L
I
 
V
R
 
R
E
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
V
 
V
K
 
T
S
 
S
D
 
K
A
 
V
R
|
R
I
 
I
L
 
E
A
 
A
S
 
A
L
 
I
P
 
P
T
 
T
I
 
I
K
 
Q
L
 
Y
A
 
I
L
 
L
E
 
D
K
 
Q
G
 
G
A
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
I
V
 
L
C
 
M
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
E
Y
 
Y
S
 
D
E
 
S
E
 
Q
D
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
E
P
 
P
V
 
V
A
 
A
D
 
K
Y
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
E
A
 
I
L
 
I
G
 
N
R
 
K
E
 
P
V
 
V
P
 
K
L
 
F
I
 
A
K
 
K
D
 
D
Y
 
W
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
D
V
 
V
Q
 
K
P
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
V
 
V
L
 
M
L
 
C
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
F
 
F
N
 
N
K
 
S
G
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
K
N
 
S
T
 
T
D
 
D
E
 
D
L
 
L
A
 
S
Q
 
K
K
 
K
Y
 
I
A
 
A
A
 
S
L
 
L
C
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
V
M
 
M
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
A
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
G
 
A
S
 
S
T
 
T
H
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
A
K
 
K
F
 
Y
A
 
I
K
 
P
V
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
G
 
G
P
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
T
 
S
P
 
P
A
 
K
K
 
K
P
 
P
M
 
M
V
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
|
G
S
|
S
K
|
K
V
 
V
S
 
S
T
 
T
K
|
K
L
 
L
D
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
N
S
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
D
V
 
K
C
 
V
D
 
E
Q
 
I
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
N
T
 
T
F
 
F
L
 
I
A
 
K
A
 
A
A
 
E
G
 
G
Y
 
F
N
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
N
S
 
S
L
 
L
H
 
Y
E
 
E
A
 
Q
D
 
D
L
 
L
L
 
V
D
 
A
T
 
E
A
 
A
K
 
T
A
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
A
K
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
G
V
 
V
A
 
N
V
 
I
P
 
P
L
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
R
V
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
F
 
F
A
 
S
E
 
E
T
 
N
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
T
 
I
V
 
I
K
 
K
A
 
K
I
 
V
A
 
S
D
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
A
D
 
D
D
 
E
M
 
M
I
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
E
T
 
S
A
 
Q
A
 
K
M
 
I
F
 
I
G
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
K
 
K
S
 
S
S
 
A
Q
 
N
T
 
T
I
 
I
L
 
L
W
 
W
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
|
G
V
|
V
F
 
F
E
|
E
F
 
F
D
 
D
Q
 
N
F
 
F
G
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
S
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
S
 
S
P
 
H
A
 
A
F
 
F
S
 
S
I
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
|
G
D
|
D
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
I
A
 
K
E
 
D
Q
 
Q
I
 
V
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
A
G
 
G
G
|
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
V
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
I
E
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
R
 
K
A
 
A

4ng4B Structure of phosphoglycerate kinase (cbu_1782) from coxiella burnetii (see paper)
59% identity, 99% coverage: 4:385/386 of query aligns to 3:388/389 of 4ng4B

query
sites
4ng4B
L
 
L
K
 
S
M
 
M
T
 
S
D
 
N
L
 
L
D
 
N
L
 
L
Q
 
H
G
 
N
K
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
M
I
 
I
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
M
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
K
V
 
I
K
 
T
S
 
N
D
 
D
A
 
E
R
|
R
I
 
I
L
 
V
A
 
R
S
 
A
L
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
I
K
 
Q
L
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
E
K
 
Q
G
 
K
A
 
A
A
 
R
V
 
V
L
 
M
V
 
I
C
 
L
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
K
Y
 
F
S
 
E
E
 
K
E
 
E
D
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
D
 
R
Y
 
L
L
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
K
L
 
L
G
 
N
R
 
K
E
 
-
V
 
V
P
 
P
L
 
L
I
 
I
K
 
N
D
 
D
Y
 
W
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
A
V
 
V
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
Q
L
 
A
V
 
I
L
 
L
L
 
C
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
E
N
 
N
T
 
N
D
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
R
Y
 
M
A
 
A
A
 
E
L
 
L
C
 
C
D
 
D
V
 
I
F
 
F
V
 
V
M
 
M
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
A
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
G
 
A
S
 
S
T
 
T
H
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
K
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
V
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
A
 
I
A
 
S
E
 
E
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
S
K
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
E
T
 
N
P
 
P
A
 
Q
K
 
K
P
 
P
M
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
V
A
 
G
G
|
G
S
 
S
K
|
K
V
 
V
S
 
S
T
 
T
K
|
K
L
 
I
D
 
H
V
 
L
L
 
L
T
 
E
S
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
D
V
 
K
C
 
V
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
I
 
I
A
 
A
N
 
N
T
 
T
F
 
F
L
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
N
 
S
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
H
 
C
E
 
E
A
 
N
D
 
E
L
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
A
A
 
A
-
 
Q
-
 
Q
-
 
F
-
 
W
-
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
A
A
 
E
A
 
K
K
 
N
V
 
V
A
 
S
V
 
L
P
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
V
A
 
A
K
 
D
E
 
E
F
 
L
A
 
S
E
 
E
T
 
D
A
 
A
D
 
K
A
 
A
T
 
T
V
 
V
K
 
K
A
 
N
I
 
I
A
 
D
D
 
A
V
 
V
A
 
T
D
 
S
D
 
N
D
 
E
M
 
S
I
|
I
L
 
F
D
|
D
I
 
V
G
 
G
P
 
P
K
 
N
T
 
T
A
 
S
A
 
A
M
 
T
F
 
Y
G
 
A
E
 
K
M
 
L
L
 
M
K
 
A
S
 
Q
S
 
A
Q
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
V
W
 
W
N
|
N
G
|
G
P
|
P
V
 
I
G
|
G
V
|
V
F
 
F
E
|
E
F
 
I
D
 
E
Q
 
A
F
|
F
G
x
S
N
 
Q
G
 
G
T
|
T
K
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
S
 
S
P
 
T
A
 
A
F
 
Y
S
 
S
I
 
I
A
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
D
|
D
T
|
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
L
D
 
D
K
 
K
Y
 
F
G
 
N
V
 
L
A
 
T
E
 
D
Q
 
Q
I
 
M
S
 
S
Y
 
Y
I
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
A
G
 
G
G
|
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
E
F
 
F
V
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
I
E
 
K
V
 
I
L
 
L
E
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A

P40924 Phosphoglycerate kinase; EC 2.7.2.3 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
47% identity, 99% coverage: 1:384/386 of query aligns to 1:394/394 of P40924

query
sites
P40924
M
 
M
T
 
N
V
 
K
L
 
K
K
 
T
M
 
L
T
 
K
D
 
D
L
 
I
D
 
D
L
 
V
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
F
I
 
C
R
 
R
E
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
E
V
 
V
K
 
T
S
 
D
D
 
D
A
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
R
A
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
H
A
 
L
L
 
A
E
 
D
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
L
C
 
A
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
K
E
 
-
G
 
G
V
 
E
Y
 
V
S
 
V
E
 
E
E
 
E
D
 
L
S
 
R
L
 
L
K
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
D
 
A
Y
 
R
L
 
L
S
 
G
K
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
K
E
 
E
V
 
V
P
 
K
L
 
K
I
 
A
K
 
D
D
 
E
-
 
A
Y
 
Y
L
 
G
D
 
D
G
 
A
V
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
-
 
S
E
 
E
V
 
M
Q
 
K
P
 
D
G
 
G
E
 
D
L
 
V
V
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
F
 
F
N
 
Y
K
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
E
K
 
K
N
 
N
T
 
D
D
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
A
Y
 
F
A
 
A
A
 
E
L
 
L
C
 
A
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
V
 
V
M
 
N
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
A
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
Q
 
H
G
 
A
S
 
S
T
 
T
H
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
A
K
 
E
F
 
H
A
 
L
K
 
P
V
 
-
A
 
A
C
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
V
K
x
S
T
 
N
P
 
P
A
 
D
K
 
R
P
 
P
M
 
F
V
 
T
A
 
A
I
 
I
V
 
I
A
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
S
 
K
T
 
D
K
 
K
L
 
I
D
 
G
V
 
V
L
 
I
T
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
L
D
 
D
V
 
K
C
 
V
D
 
D
Q
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
A
N
 
Y
T
 
T
F
 
F
L
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
Y
 
Y
N
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
H
 
L
E
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
K
L
 
I
D
 
E
T
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
S
I
 
F
A
 
M
A
 
D
K
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
G
V
 
V
A
 
N
V
 
F
P
 
Y
L
 
M
P
 
P
V
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
V
A
 
A
K
 
D
E
 
D
F
 
F
A
 
S
E
 
N
T
 
D
A
 
A
D
 
N
A
 
V
T
 
K
V
 
I
K
 
V
A
 
P
I
 
I
A
 
S
D
 
E
V
 
I
A
 
P
D
 
S
D
 
D
D
 
L
M
 
E
I
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
T
K
 
K
T
|
T
A
 
R
A
 
E
M
 
T
F
 
Y
G
 
A
E
 
D
M
 
V
L
 
I
K
 
K
S
 
N
S
 
S
Q
 
K
T
 
L
I
 
V
L
 
V
W
 
W
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
I
D
 
D
Q
 
L
F
 
F
G
 
A
N
 
Q
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
S
 
A
P
 
K
-
 
D
A
 
T
F
 
Y
S
 
S
I
 
V
A
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
E
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
L
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
I
 
M
S
 
S
Y
 
H
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
F
V
 
M
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
V
E
 
A
V
 
A
L
 
L
E
 
N
Q
 
D
R
 
K

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
47% identity, 98% coverage: 1:378/386 of query aligns to 1:391/654 of P36204

query
sites
P36204
M
 
M
T
 
E
V
 
K
L
 
M
K
 
T
M
 
I
T
 
R
D
 
D
L
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
I
I
 
M
R
 
R
E
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
V
V
 
V
K
 
Q
S
 
D
D
 
D
A
 
T
R
|
R
I
 
I
L
 
R
A
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
L
C
 
L
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
-
E
 
K
G
 
G
V
 
E
Y
 
P
S
 
S
E
 
P
E
 
E
D
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
D
 
K
Y
 
R
L
 
L
S
 
S
K
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
K
E
 
E
V
 
V
P
 
K
L
 
F
I
 
V
K
 
P
D
 
A
Y
 
V
L
 
V
-
 
G
D
 
D
G
 
E
V
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
E
E
 
E
V
 
L
Q
 
K
P
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
V
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
T
R
|
R
F
 
F
N
 
H
K
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
T
K
 
K
N
 
N
T
 
D
D
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
F
Y
 
W
A
 
A
A
 
S
L
 
L
C
 
A
D
 
D
V
 
I
F
 
H
V
 
V
M
 
N
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
|
R
A
 
A
Q
 
H
G
 
A
S
 
S
T
 
N
H
 
V
G
 
G
V
 
I
A
 
A
K
 
Q
F
 
F
A
 
I
K
 
P
V
 
-
A
 
S
C
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
I
D
 
K
A
 
F
L
 
L
G
 
S
K
 
K
A
 
V
L
 
T
K
 
Y
T
 
N
P
 
P
A
 
E
K
 
K
P
 
P
M
 
Y
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
S
 
S
T
 
D
K
 
K
L
 
I
D
 
G
V
 
V
L
 
I
T
 
T
S
 
N
L
 
L
A
 
M
D
 
E
V
 
K
C
 
A
D
 
D
Q
 
R
L
 
I
I
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
A
I
 
M
A
 
M
N
 
F
T
 
T
F
 
F
L
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
Y
 
K
N
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
S
S
 
S
L
 
R
H
 
V
E
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
K
L
 
I
D
 
D
T
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
I
 
L
A
 
L
A
 
E
K
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
G
V
 
V
A
 
E
V
 
I
P
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
K
 
Q
E
 
K
F
 
I
A
 
E
E
 
P
T
 
G
A
 
V
D
 
E
A
 
K
T
 
K
V
 
V
K
 
V
A
 
R
I
 
I
A
 
D
D
 
D
-
 
G
V
 
I
A
 
P
D
 
E
D
 
G
D
 
W
M
 
M
I
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
E
T
 
T
A
 
I
A
 
E
M
 
L
F
 
F
G
 
K
E
 
Q
M
 
K
L
 
L
K
 
S
S
 
D
S
 
A
Q
 
K
T
 
T
I
 
V
L
 
V
W
 
W
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
F
 
I
D
 
D
Q
 
D
F
 
F
G
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
Q
L
 
V
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
T
Q
 
E
S
 
K
P
 
G
A
 
A
F
 
I
S
 
T
I
 
V
A
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
N
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
L
A
 
E
E
 
D
Q
 
K
I
 
F
S
 
S
Y
 
H
I
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
F
V
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
I

1vpeA Crystallographic analysis of phosphoglycerate kinase from the hyperthermophilic bacterium thermotoga maritima (see paper)
48% identity, 97% coverage: 5:378/386 of query aligns to 2:390/398 of 1vpeA

query
sites
1vpeA
K
 
K
M
 
M
T
 
T
-
 
I
-
 
R
D
 
D
L
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
I
I
 
M
R
 
R
E
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
V
V
 
V
K
 
Q
S
 
D
D
 
D
A
 
T
R
|
R
I
 
I
L
 
R
A
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
L
C
 
L
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
-
E
 
K
G
 
G
V
 
E
Y
 
P
S
 
S
E
 
P
E
 
E
D
 
F
S
 
S
L
 
L
K
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
D
 
K
Y
 
R
L
 
L
S
 
S
K
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
K
E
 
E
V
 
V
P
 
K
L
 
F
I
 
V
K
 
P
D
 
A
Y
 
V
L
 
V
-
 
G
D
 
D
G
 
E
V
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
E
E
 
E
V
 
L
Q
 
K
P
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
V
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
T
R
 
R
F
 
F
N
 
H
K
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
T
K
 
K
N
 
N
T
 
D
D
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
F
Y
 
W
A
 
A
A
 
S
L
 
L
C
 
A
D
 
D
V
 
I
F
 
H
V
 
V
M
 
N
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
Q
 
H
G
 
A
S
 
S
T
 
N
H
 
V
G
 
G
V
 
I
A
 
A
K
 
Q
F
 
F
A
 
I
K
 
P
V
 
-
A
 
S
C
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
I
D
 
K
A
 
F
L
 
L
G
 
S
K
 
K
A
 
V
L
 
T
K
 
Y
T
 
N
P
 
P
A
 
E
K
 
K
P
 
P
M
 
Y
V
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
L
A
 
G
G
|
G
S
x
A
K
|
K
V
 
V
S
 
S
T
 
D
K
|
K
L
 
I
D
 
G
V
 
V
L
 
I
T
 
T
S
 
N
L
 
L
A
 
M
D
 
E
V
 
K
C
 
A
D
 
D
Q
 
R
L
 
I
I
 
L
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
x
A
I
 
M
A
 
M
N
 
F
T
 
T
F
 
F
L
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
Y
 
K
N
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
S
S
 
S
L
 
R
H
 
V
E
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
K
L
 
I
D
 
D
T
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
I
 
L
A
 
V
A
 
E
K
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
G
V
 
V
A
 
E
V
 
I
P
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
K
 
Q
E
 
K
F
 
I
A
 
E
E
 
P
T
 
G
A
 
V
D
 
E
A
 
K
T
 
K
V
 
V
K
 
V
A
 
R
I
 
I
A
 
D
D
 
D
-
 
G
V
 
I
A
 
P
D
 
E
D
 
G
D
 
W
M
 
M
I
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
E
T
 
T
A
 
I
A
 
E
M
 
L
F
 
F
G
 
K
E
 
Q
M
 
K
L
 
L
K
 
S
S
 
D
S
 
A
Q
 
K
T
 
T
I
 
V
L
 
V
W
 
W
N
|
N
G
 
G
P
|
P
V
 
M
G
|
G
V
|
V
F
 
F
E
|
E
F
 
I
D
 
D
Q
 
D
F
 
F
G
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
Q
L
 
V
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
T
Q
 
E
S
 
K
P
 
G
A
 
A
F
 
I
S
 
T
I
 
V
A
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
D
|
D
T
x
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
N
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
L
A
 
E
E
 
D
Q
 
K
I
 
F
S
 
S
Y
 
H
I
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
F
V
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
I

1phpA Structure of the adp complex of the 3-phosphoglycerate kinase from bacillus stearothermophilus at 1.65 angstroms (see paper)
46% identity, 99% coverage: 1:384/386 of query aligns to 1:394/394 of 1phpA

query
sites
1phpA
M
 
M
T
 
N
V
 
K
L
 
K
K
 
T
M
 
I
T
 
R
D
 
D
L
 
V
D
 
D
L
 
V
Q
 
R
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
F
I
 
C
R
 
R
E
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
M
K
 
E
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
V
 
I
K
 
T
S
 
D
D
 
D
A
 
T
R
|
R
I
 
I
L
 
R
A
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
I
K
 
R
L
 
Y
A
 
L
L
 
I
E
 
E
K
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
L
C
 
A
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
K
E
 
-
G
 
G
V
 
K
Y
 
V
S
 
V
E
 
E
E
 
E
D
 
L
S
 
R
L
 
L
K
 
D
P
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
K
Y
 
R
L
 
L
S
 
G
K
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
E
R
 
R
E
 
P
V
 
V
P
 
A
L
 
K
I
 
T
K
 
N
D
 
E
Y
 
A
L
 
V
D
 
-
G
 
G
V
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
N
P
 
E
G
 
G
E
 
D
L
 
V
V
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
F
 
F
N
 
Y
K
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
E
K
 
K
N
 
N
T
 
D
D
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
A
Y
 
F
A
 
A
A
 
E
L
 
L
C
 
A
D
 
D
V
 
L
F
 
Y
V
 
V
M
 
N
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
A
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
Q
 
H
G
 
A
S
 
S
T
 
T
H
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
A
K
 
H
F
 
Y
A
 
L
K
 
P
V
 
-
A
 
A
C
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
D
K
 
R
P
 
P
M
 
F
V
 
T
A
 
A
I
 
I
V
 
I
A
 
G
G
|
G
S
 
A
K
|
K
V
 
V
S
 
K
T
 
D
K
|
K
L
 
I
D
 
G
V
 
V
L
 
I
T
 
D
S
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
E
V
 
K
C
 
V
D
 
D
Q
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
I
 
L
A
 
A
N
 
Y
T
 
T
F
 
F
L
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
Y
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
|
L
H
 
L
E
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
K
L
 
I
D
 
E
T
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
S
I
 
F
A
 
M
A
 
E
K
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
G
V
 
V
A
 
R
V
 
F
P
 
Y
L
 
M
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
K
 
D
E
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
N
T
 
D
A
 
A
D
 
N
A
 
T
T
 
K
V
 
V
K
 
V
A
 
P
I
 
I
A
 
D
D
 
A
V
 
I
A
 
P
D
 
A
D
 
D
D
 
W
M
 
S
I
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
K
T
 
T
A
 
R
A
 
E
M
 
L
F
 
Y
G
 
R
E
 
D
M
 
V
L
 
I
K
 
R
S
 
E
S
 
S
Q
 
K
T
 
L
I
 
V
L
 
V
W
 
W
N
|
N
G
 
G
P
|
P
V
 
M
G
|
G
V
|
V
F
 
F
E
|
E
F
 
M
D
 
D
Q
 
A
F
 
F
G
 
A
N
 
H
G
 
G
T
 
T
K
 
K
-
 
A
V
 
I
L
 
A
A
 
E
Q
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
E
Q
 
A
S
 
L
P
 
D
A
 
T
F
 
Y
S
 
S
I
 
V
A
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
D
|
D
T
x
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
E
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
L
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
I
 
M
S
 
D
Y
 
H
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
F
V
 
M
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
V
E
 
V
V
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
D
R
 
K

P18912 Phosphoglycerate kinase; EC 2.7.2.3 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
46% identity, 99% coverage: 1:384/386 of query aligns to 1:394/394 of P18912

query
sites
P18912
M
 
M
T
 
N
V
 
K
L
 
K
K
 
T
M
 
I
T
 
R
D
 
D
L
 
V
D
 
D
L
 
V
Q
 
R
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
F
I
 
C
R
 
R
E
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
M
K
 
E
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
V
 
I
K
 
T
S
 
D
D
 
D
A
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
R
A
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
I
K
 
R
L
 
Y
A
 
L
L
 
I
E
 
E
K
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
L
C
 
A
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
K
E
 
-
G
 
G
V
 
K
Y
 
V
S
 
V
E
 
E
E
 
E
D
 
L
S
 
R
L
 
L
K
 
D
P
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
K
Y
 
R
L
 
L
S
 
G
K
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
E
R
 
R
E
 
P
V
 
V
P
 
A
L
 
K
I
 
T
K
 
N
D
 
E
Y
 
A
L
 
V
D
 
-
G
 
G
V
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
N
P
 
E
G
 
G
E
 
D
L
 
V
V
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
F
 
F
N
 
Y
K
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
E
K
 
K
N
 
N
T
 
D
D
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
A
Y
 
F
A
 
A
A
 
E
L
 
L
C
 
A
D
 
D
V
 
L
F
 
Y
V
 
V
M
 
N
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
A
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
Q
 
H
G
 
A
S
 
S
T
 
T
H
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
A
K
 
H
F
 
Y
A
 
L
K
 
P
V
 
-
A
 
A
C
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
D
K
 
R
P
 
P
M
 
F
V
 
T
A
 
A
I
 
I
V
 
I
A
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
S
 
K
T
 
D
K
|
K
L
 
I
D
 
G
V
 
V
L
 
I
T
 
D
S
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
E
V
 
K
C
 
V
D
 
D
Q
 
N
L
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
L
A
 
A
N
 
Y
T
 
T
F
 
F
L
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
Y
 
H
N
 
D
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
H
 
L
E
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
K
L
 
I
D
 
E
T
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
S
I
 
F
A
 
M
A
 
E
K
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
G
V
 
V
A
 
R
V
 
F
P
 
Y
L
 
M
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
K
 
D
E
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
N
T
 
D
A
 
A
D
 
N
A
 
T
T
 
K
V
 
V
K
 
V
A
 
P
I
 
I
A
 
D
D
 
A
V
 
I
A
 
P
D
 
A
D
 
D
D
 
W
M
 
S
I
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
K
T
 
T
A
 
R
A
 
E
M
 
L
F
 
Y
G
 
R
E
 
D
M
 
V
L
 
I
K
 
R
S
 
E
S
 
S
Q
 
K
T
 
L
I
 
V
L
 
V
W
 
W
N
|
N
G
 
G
P
 
P
V
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
|
E
F
 
M
D
 
D
Q
 
A
F
 
F
G
 
A
N
 
H
G
 
G
T
 
T
K
 
K
-
 
A
V
 
I
L
 
A
A
 
E
Q
 
A
A
 
L
I
 
A
A
 
E
Q
 
A
S
 
L
P
 
D
A
 
T
F
 
Y
S
 
S
I
 
V
A
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
D
|
D
T
x
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
E
K
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
L
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
I
 
M
S
 
D
Y
 
H
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
F
V
 
M
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
V
E
 
V
V
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
D
R
 
K

3zlbA Crystal structure of phosphoglycerate kinase from streptococcus pneumoniae (see paper)
43% identity, 99% coverage: 1:384/386 of query aligns to 1:398/398 of 3zlbA

query
sites
3zlbA
M
|
M
T
 
A
V
 
K
L
 
L
K
 
T
M
 
V
T
 
K
D
|
D
L
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
L
I
 
V
R
 
R
E
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
V
V
 
I
K
 
T
S
 
N
D
 
D
A
 
N
R
|
R
I
 
I
L
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
I
K
 
K
L
 
Y
A
 
I
L
 
I
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
G
A
 
R
V
 
A
L
 
I
V
 
L
C
 
F
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
V
E
 
K
E
 
E
G
 
E
V
 
S
Y
 
D
S
 
K
E
 
A
E
 
G
D
 
K
S
 
S
L
 
L
K
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
D
 
A
Y
 
D
L
 
L
S
 
A
K
 
A
A
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
Q
E
 
D
V
 
V
P
 
-
L
 
V
I
 
F
K
 
P
D
 
G
Y
 
V
L
 
T
D
 
R
G
 
G
V
 
A
E
 
E
V
 
L
Q
 
E
P
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
D
G
 
G
E
 
Q
L
 
V
V
 
L
L
 
L
L
 
V
E
 
E
N
 
N
V
 
T
R
 
R
F
 
Y
N
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
G
K
 
K
G
 
K
E
 
E
K
 
S
K
 
K
N
 
N
T
 
D
D
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
G
Q
 
K
K
 
Y
Y
 
W
A
 
A
A
 
S
L
 
L
C
 
G
D
 
D
-
 
G
V
 
I
F
 
F
V
 
V
M
 
N
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
A
Q
 
H
G
 
A
S
 
S
T
 
N
H
 
V
G
 
G
V
 
I
A
 
S
K
 
A
F
 
N
A
 
V
K
 
E
V
 
K
A
 
A
C
 
V
A
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
A
A
 
Y
L
 
I
G
 
Q
K
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
E
K
 
R
P
 
P
M
 
F
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
L
A
 
G
G
|
G
S
|
S
K
|
K
V
 
V
S
 
S
T
 
D
K
 
K
L
 
I
D
 
G
V
 
V
L
 
I
T
 
E
S
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
E
V
 
K
C
 
A
D
 
D
Q
 
K
L
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
I
 
M
A
 
T
N
 
Y
T
 
T
F
 
F
L
 
Y
A
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
Y
 
I
N
 
E
V
 
I
G
 
G
K
 
N
S
 
S
L
 
L
H
 
V
E
 
E
A
 
E
D
 
D
L
 
K
L
 
L
D
 
D
T
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
L
A
 
E
K
 
K
V
 
A
-
 
N
-
 
G
A
 
K
V
 
L
P
 
I
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
S
V
 
K
V
 
E
A
 
A
K
 
N
E
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
G
T
 
Y
A
 
T
D
 
E
A
 
V
T
 
R
V
 
D
K
 
T
A
 
E
I
 
G
A
 
E
D
 
A
V
 
V
A
 
S
D
 
E
D
 
G
D
 
F
M
 
L
I
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
K
T
 
S
A
 
I
A
 
A
M
 
K
F
 
F
G
 
D
E
 
E
M
 
A
L
 
L
K
 
T
S
 
G
S
 
A
Q
 
K
T
 
T
I
 
V
L
 
V
W
 
W
N
|
N
G
 
G
P
|
P
V
 
M
G
|
G
V
|
V
F
 
F
E
|
E
F
 
N
D
 
P
Q
 
D
F
 
F
G
 
Q
N
 
A
G
 
G
T
 
T
K
 
I
V
 
G
L
 
V
A
 
M
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
V
Q
 
K
S
 
Q
P
 
P
A
 
G
F
 
V
-
 
K
S
 
S
I
 
I
A
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
D
|
D
T
x
S
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
A
D
 
I
K
 
N
Y
 
L
G
 
G
V
 
R
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
I
 
F
S
 
S
Y
 
W
I
 
I
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
 
A
F
 
S
L
 
M
E
 
E
F
 
L
V
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
L
E
 
A
V
 
A
L
 
L
E
 
T
Q
 
E
R
x
K

P07378 Phosphoglycerate kinase, glycosomal; Phosphoglycerate kinase C; EC 2.7.2.3 from Trypanosoma brucei brucei (see 2 papers)
40% identity, 98% coverage: 6:385/386 of query aligns to 9:420/440 of P07378

query
sites
P07378
M
 
I
T
 
N
D
 
E
L
 
C
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
V
D
|
D
L
x
F
N
|
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
K
V
 
I
K
 
T
S
 
N
D
 
D
A
 
Y
R
|
R
I
 
I
L
 
R
A
 
S
S
 
A
L
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
L
K
 
K
L
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
T
K
 
E
G
 
G
A
 
G
A
 
S
V
 
C
L
 
V
V
 
L
C
 
M
S
 
S
H
|
H
L
|
L
G
|
G
R
|
R
P
 
P
E
 
K
E
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
M
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
G
G
 
G
V
 
V
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
S
 
Q
E
 
Q
E
 
K
D
 
A
S
 
T
L
 
L
K
 
K
P
 
P
V
 
V
A
 
A
D
 
K
Y
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
L
R
 
R
E
 
P
V
 
V
P
 
T
L
 
F
I
 
A
K
 
P
D
 
D
Y
 
C
L
 
L
D
 
N
G
 
A
V
 
A
E
 
D
V
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
K
-
 
M
Q
 
S
P
 
P
G
 
G
E
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
|
R
F
 
F
N
 
Y
K
 
K
-
 
E
-
 
E
G
 
G
E
 
S
K
 
K
K
 
K
N
 
A
T
 
K
D
 
D
E
 
R
-
 
E
-
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
K
K
 
I
Y
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
Y
C
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
V
 
I
M
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
|
R
A
 
D
Q
 
S
G
 
A
S
 
T
T
 
M
H
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
P
K
 
K
F
 
I
A
 
L
K
 
G
V
 
N
A
 
G
C
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
I
D
 
S
A
 
Y
L
 
F
G
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
L
K
 
G
T
 
N
P
 
P
A
 
P
K
 
R
P
 
P
M
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
 
G
S
 
A
K
 
K
V
 
V
S
 
S
T
 
D
K
|
K
L
 
I
D
 
Q
V
 
L
L
 
L
T
 
D
S
 
N
L
 
M
A
 
L
D
 
Q
V
 
R
C
 
I
D
 
D
Q
 
Y
L
 
L
I
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
A
I
 
M
A
 
A
N
 
Y
T
 
T
F
 
F
L
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
N
 
S
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
K
H
 
C
E
 
E
A
 
E
D
 
S
L
 
K
L
 
L
D
 
E
T
 
F
A
 
A
K
 
R
A
 
S
I
 
L
A
 
L
A
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
K
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
P
 
I
L
 
L
P
 
P
V
 
I
D
 
D
V
 
H
V
 
V
V
 
C
A
 
H
K
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
K
E
 
A
T
 
V
A
 
D
D
 
S
A
 
P
T
 
L
V
 
I
K
 
T
A
 
E
I
 
D
A
 
Q
D
 
N
V
 
I
A
 
P
D
 
E
D
 
G
D
 
H
M
 
M
I
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
K
 
K
T
 
T
A
 
I
A
 
E
M
 
K
F
 
Y
G
 
V
E
 
Q
M
 
T
L
 
I
K
 
G
S
 
K
S
 
C
Q
 
K
T
 
S
I
 
A
L
 
I
W
 
W
N
|
N
G
 
G
P
 
P
V
 
M
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
|
E
F
 
M
D
 
V
Q
 
P
F
 
Y
G
 
S
N
 
K
G
 
G
T
 
T
K
 
F
V
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
A
 
G
Q
 
R
S
 
G
P
 
T
A
 
H
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
L
F
 
M
S
 
S
I
 
I
A
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
D
|
D
T
x
S
L
 
A
A
 
S
A
 
A
I
 
A
D
 
E
K
 
L
Y
 
S
G
 
G
V
 
E
A
 
A
E
 
K
Q
 
R
I
 
M
S
 
S
Y
 
H
I
 
V
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
S
L
 
L
E
 
E
F
 
L
V
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
D
Q
 
E
R
 
K
A
 
S

16pkA Phosphoglycerate kinase from trypanosoma brucei bisubstrate analog (see paper)
40% identity, 98% coverage: 6:384/386 of query aligns to 5:415/415 of 16pkA

query
sites
16pkA
M
 
I
T
 
N
D
 
E
L
 
C
D
 
D
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
V
D
 
D
L
 
F
N
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
K
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
K
V
 
I
K
 
T
S
 
N
D
 
D
A
 
Y
R
|
R
I
 
I
L
 
R
A
 
S
S
 
A
L
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
L
K
 
K
L
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
T
K
 
E
G
 
G
A
 
G
A
 
S
V
 
C
L
 
V
V
 
L
C
 
M
S
 
S
H
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
K
E
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
M
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
G
G
 
G
V
 
V
-
 
P
-
 
G
Y
 
F
S
 
Q
E
 
Q
E
 
K
D
 
A
S
 
T
L
 
L
K
 
K
P
 
P
V
 
V
A
 
A
D
 
K
Y
 
R
L
 
L
S
 
S
K
 
E
A
 
L
L
 
L
G
 
L
R
 
R
E
 
P
V
 
V
P
 
T
L
 
F
I
 
A
K
 
P
D
 
D
Y
 
C
L
 
L
D
 
N
G
 
A
V
 
A
E
 
D
V
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
K
-
 
M
Q
 
S
P
 
P
G
 
G
E
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
R
 
R
F
 
F
N
 
Y
K
 
K
-
 
E
-
 
E
G
 
G
E
 
S
K
 
K
K
 
K
N
 
A
T
 
K
D
 
D
E
 
R
-
 
E
-
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
K
K
 
I
Y
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
Y
C
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
V
 
I
M
 
S
D
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
A
H
 
H
R
 
R
A
 
D
Q
 
S
G
 
A
S
 
T
T
 
M
H
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
P
K
 
K
F
 
I
A
 
L
K
 
G
V
 
N
A
 
G
C
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
Y
L
 
L
L
 
M
A
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
I
D
 
S
A
 
Y
L
 
F
G
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
L
K
 
G
T
 
N
P
 
P
A
 
P
K
 
R
P
 
P
M
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
|
G
S
x
A
K
|
K
V
 
V
S
 
S
T
 
D
K
|
K
L
 
I
D
 
Q
V
 
L
L
 
L
T
 
D
S
 
N
L
 
M
A
 
L
D
 
Q
V
 
R
C
 
I
D
 
D
Q
 
Y
L
 
L
I
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
G